View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19889_low_12 (Length: 346)

Name: NF19889_low_12
Description: NF19889
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19889_low_12
NF19889_low_12
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (1-194)||(29938059-29938253)
chr8 (1-186)||(18594544-18594729)
chr8 (1-196)||(14422699-14422895)
chr8 (1-186)||(144401-144586)
chr8 (1-186)||(2042539-2042724)
chr8 (1-186)||(10836770-10836955)
chr8 (1-194)||(35118046-35118240)
chr8 (1-186)||(24113181-24113366)
chr8 (1-186)||(39206593-39206778)
chr8 (1-186)||(13110411-13110596)
chr8 (1-186)||(22260645-22260830)
chr8 (1-186)||(7791418-7791603)
chr8 (1-186)||(33278407-33278592)
chr8 (1-186)||(34679472-34679657)
chr8 (1-186)||(38167170-38167355)
chr8 (1-183)||(7774774-7774956)
chr8 (1-183)||(7812005-7812187)
chr8 (1-186)||(34842380-34842565)
chr8 (1-186)||(39218784-39218969)
chr8 (1-186)||(41575520-41575705)
chr8 (1-186)||(4035854-4036039)
chr8 (1-186)||(6144288-6144473)
chr8 (1-182)||(44804959-44805140)
chr8 (1-194)||(5320562-5320756)
chr8 (9-185)||(34998919-34999095)
chr8 (2-186)||(8021726-8021902)
chr8 (1-186)||(42571601-42571783)
chr8 (37-186)||(40117903-40118052)
chr8 (1-182)||(28639289-28639472)
chr8 (194-329)||(43803916-43804051)
chr8 (37-186)||(33287076-33287225)
chr8 (1-186)||(36491164-36491349)
chr8 (54-186)||(26783801-26783933)
chr8 (1-114)||(9807339-9807452)
chr8 (1-183)||(66194-66377)
chr8 (42-186)||(2322068-2322212)
chr8 (65-186)||(5005173-5005294)
chr8 (42-182)||(39220267-39220407)
chr8 (106-186)||(9806880-9806960)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (1-186)||(8042609-8042794)
chr3 (2-196)||(25999379-25999574)
chr3 (1-186)||(37698144-37698329)
chr3 (1-186)||(32244122-32244307)
chr3 (1-186)||(20842349-20842534)
chr3 (1-186)||(38856095-38856280)
chr3 (1-186)||(42307906-42308091)
chr3 (1-186)||(15520143-15520328)
chr3 (1-186)||(29445490-29445675)
chr3 (1-186)||(54870175-54870360)
chr3 (1-182)||(12117659-12117840)
chr3 (1-186)||(22174991-22175176)
chr3 (1-186)||(46452163-46452348)
chr3 (4-186)||(21581044-21581226)
chr3 (1-186)||(35226449-35226634)
chr3 (1-186)||(38933948-38934132)
chr3 (1-186)||(44609334-44609519)
chr3 (1-186)||(50528931-50529116)
chr3 (1-196)||(25494286-25494482)
chr3 (1-184)||(42104972-42105155)
chr3 (4-186)||(26122816-26122998)
chr3 (1-186)||(32359261-32359446)
chr3 (1-183)||(34700346-34700528)
chr3 (1-186)||(15520638-15520823)
chr3 (1-186)||(20699151-20699336)
chr3 (1-186)||(48925004-48925187)
chr3 (1-186)||(54534329-54534512)
chr3 (36-186)||(35643219-35643369)
chr3 (5-186)||(24835704-24835885)
chr3 (1-144)||(16354390-16354533)
chr3 (1-164)||(44688785-44688947)
chr3 (17-182)||(2895191-2895356)
chr3 (1-186)||(53028227-53028404)
chr3 (3-164)||(12915931-12916091)
chr3 (54-186)||(50529827-50529959)
chr3 (1-72)||(24366145-24366216)
chr3 (60-186)||(49128051-49128177)
chr3 (1-67)||(13696914-13696980)
chr3 (1-32)||(50528883-50528914)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (1-196)||(33359095-33359291)
chr7 (1-182)||(933295-933476)
chr7 (1-196)||(22649699-22649895)
chr7 (1-186)||(3511329-3511514)
chr7 (1-186)||(5280866-5281051)
chr7 (1-186)||(43067978-43068163)
chr7 (3-186)||(30181031-30181214)
chr7 (1-186)||(7164190-7164375)
chr7 (1-186)||(12097595-12097780)
chr7 (1-186)||(12101183-12101368)
chr7 (1-186)||(20346494-20346679)
chr7 (1-186)||(24792337-24792522)
chr7 (1-186)||(42965001-42965186)
chr7 (2-186)||(32041548-32041732)
chr7 (1-194)||(25748484-25748678)
chr7 (1-186)||(33846534-33846714)
chr7 (1-183)||(6394760-6394942)
chr7 (1-186)||(42204160-42204346)
chr7 (1-186)||(1803032-1803217)
chr7 (1-186)||(4477326-4477511)
chr7 (1-186)||(9452596-9452781)
chr7 (1-186)||(43156719-43156904)
chr7 (1-186)||(15655918-15656103)
chr7 (1-160)||(48865662-48865824)
chr7 (5-186)||(8630672-8630853)
chr7 (1-186)||(38866550-38866735)
chr7 (3-186)||(4347279-4347462)
chr7 (1-186)||(36890835-36891019)
chr7 (1-186)||(42673471-42673652)
chr7 (1-186)||(46891344-46891530)
chr7 (1-186)||(46134309-46134494)
chr7 (4-160)||(16894515-16894671)
chr7 (5-198)||(17753593-17753787)
chr7 (1-186)||(43021585-43021766)
chr7 (47-182)||(19828280-19828415)
chr7 (42-186)||(37005857-37006001)
chr7 (97-186)||(37704986-37705075)
chr7 (42-182)||(43405030-43405170)
chr7 (58-186)||(20163825-20163953)
chr7 (49-136)||(36849590-36849677)
chr7 (42-186)||(15655458-15655602)
chr7 (42-196)||(30075277-30075429)
chr7 (98-182)||(27691428-27691512)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (1-186)||(3347538-3347723)
chr6 (1-186)||(26946891-26947076)
chr6 (1-186)||(6086614-6086799)
chr6 (1-186)||(9459570-9459755)
chr6 (1-186)||(2837552-2837737)
chr6 (1-186)||(11167247-11167432)
chr6 (1-186)||(30691858-30692043)
chr6 (1-186)||(26704354-26704539)
chr6 (2-186)||(3955782-3955966)
chr6 (1-183)||(1153603-1153785)
chr6 (1-186)||(17261088-17261273)
chr6 (1-186)||(18613545-18613730)
chr6 (1-176)||(21893472-21893647)
chr6 (1-196)||(20726787-20726979)
chr6 (1-186)||(16307023-16307208)
chr6 (1-186)||(34887307-34887492)
chr6 (1-186)||(30698944-30699129)
chr6 (7-182)||(35198295-35198469)
chr6 (37-186)||(52843-52992)
chr6 (1-186)||(28199523-28199709)
chr6 (1-123)||(33464399-33464521)
chr6 (1-100)||(53001-53100)
chr6 (115-186)||(33463708-33463779)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (1-186)||(1165616-1165801)
chr5 (1-186)||(1579044-1579229)
chr5 (1-186)||(1605586-1605771)
chr5 (2-186)||(9008073-9008257)
chr5 (1-186)||(24105686-24105871)
chr5 (1-186)||(27420866-27421051)
chr5 (1-186)||(3386501-3386686)
chr5 (1-186)||(8374354-8374538)
chr5 (1-186)||(16069361-16069546)
chr5 (1-182)||(16737462-16737643)
chr5 (5-186)||(27679188-27679369)
chr5 (1-186)||(31883152-31883337)
chr5 (1-186)||(4120945-4121130)
chr5 (1-186)||(33491211-33491396)
chr5 (1-182)||(33991152-33991333)
chr5 (2-186)||(38598466-38598650)
chr5 (2-196)||(5202969-5203164)
chr5 (5-186)||(19358534-19358715)
chr5 (1-186)||(35782659-35782844)
chr5 (3-182)||(20992163-20992342)
chr5 (1-186)||(3921589-3921774)
chr5 (1-160)||(26602957-26603116)
chr5 (1-145)||(27025005-27025149)
chr5 (1-186)||(31410484-31410669)
chr5 (59-186)||(20992354-20992485)
chr5 (53-186)||(33284642-33284775)
chr5 (58-164)||(31638175-31638281)
chr5 (59-128)||(41818536-41818605)
chr5 (1-40)||(35420439-35420478)
chr5 (42-183)||(25634593-25634732)
chr5 (60-144)||(19516044-19516128)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (1-186)||(20877052-20877237)
chr4 (1-195)||(19913633-19913828)
chr4 (1-186)||(15241031-15241216)
chr4 (1-197)||(38055150-38055347)
chr4 (1-186)||(1756767-1756952)
chr4 (1-186)||(14987797-14987982)
chr4 (1-186)||(23704212-23704397)
chr4 (1-186)||(53717467-53717652)
chr4 (1-186)||(54189550-54189735)
chr4 (2-186)||(23776463-23776647)
chr4 (1-198)||(50353793-50353991)
chr4 (1-186)||(1617089-1617274)
chr4 (1-186)||(50055104-50055289)
chr4 (1-183)||(28032715-28032897)
chr4 (1-186)||(6611363-6611548)
chr4 (1-186)||(16700786-16700971)
chr4 (1-182)||(33703850-33704031)
chr4 (1-182)||(37464730-37464911)
chr4 (1-186)||(45424537-45424722)
chr4 (1-186)||(53875662-53875847)
chr4 (1-186)||(54412633-54412818)
chr4 (1-186)||(11639581-11639766)
chr4 (1-186)||(15669188-15669373)
chr4 (1-186)||(27488651-27488836)
chr4 (1-186)||(30423568-30423752)
chr4 (1-186)||(44379190-44379375)
chr4 (1-181)||(8591095-8591275)
chr4 (1-176)||(31969696-31969871)
chr4 (1-186)||(19164976-19165160)
chr4 (1-186)||(2481411-2481596)
chr4 (1-186)||(30171585-30171770)
chr4 (1-182)||(40428723-40428904)
chr4 (1-186)||(43289963-43290148)
chr4 (1-186)||(44784920-44785105)
chr4 (5-186)||(48909851-48910032)
chr4 (1-186)||(52139208-52139393)
chr4 (3-186)||(35490778-35490961)
chr4 (1-183)||(37968760-37968942)
chr4 (1-186)||(27536107-27536288)
chr4 (1-186)||(6688630-6688809)
chr4 (1-186)||(47632039-47632225)
chr4 (1-186)||(40680041-40680226)
chr4 (3-169)||(16703843-16704009)
chr4 (1-186)||(44375850-44376035)
chr4 (1-186)||(8932181-8932366)
chr4 (20-186)||(28360435-28360602)
chr4 (1-186)||(53353060-53353253)
chr4 (2-182)||(38071327-38071504)
chr4 (5-186)||(27583639-27583820)
chr4 (1-182)||(55344828-55345009)
chr4 (42-186)||(50053448-50053592)
chr4 (5-114)||(23269053-23269162)
chr4 (106-186)||(23265865-23265945)
chr4 (43-125)||(51780763-51780845)
chr4 (1-72)||(53408138-53408210)
chr4 (42-177)||(44548185-44548320)
chr4 (1-89)||(9595905-9595982)
chr4 (1-49)||(23261889-23261937)
chr4 (42-184)||(17493340-17493482)
chr4 (1-32)||(50055304-50055335)
chr4 (58-196)||(46257269-46257407)
chr4 (47-100)||(55344724-55344777)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-186)||(36710-36895)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (1-186)||(6174843-6175028)
chr2 (1-186)||(42937724-42937910)
chr2 (1-197)||(31517230-31517427)
chr2 (1-186)||(3873259-3873444)
chr2 (1-186)||(18806899-18807084)
chr2 (1-186)||(33906062-33906247)
chr2 (6-193)||(1108277-1108464)
chr2 (1-186)||(4016044-4016229)
chr2 (1-186)||(4232157-4232342)
chr2 (1-186)||(26323201-26323386)
chr2 (1-186)||(39635457-39635642)
chr2 (1-183)||(5733407-5733589)
chr2 (5-186)||(30270698-30270879)
chr2 (1-182)||(16066309-16066490)
chr2 (1-177)||(19383950-19384126)
chr2 (1-186)||(28329854-28330037)
chr2 (1-186)||(19901153-19901337)
chr2 (1-186)||(16588791-16588976)
chr2 (42-186)||(30420223-30420367)
chr2 (4-183)||(1482921-1483099)
chr2 (1-144)||(2178784-2178927)
chr2 (1-186)||(851002-851187)
chr2 (1-144)||(429863-430006)
chr2 (1-182)||(44947564-44947738)
chr2 (42-186)||(42446625-42446769)
chr2 (49-144)||(22101210-22101305)
chr2 (42-144)||(3585337-3585439)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (1-186)||(33510489-33510674)
chr1 (1-186)||(38829074-38829259)
chr1 (1-194)||(42370810-42371004)
chr1 (1-186)||(1170459-1170644)
chr1 (1-186)||(16052101-16052286)
chr1 (1-186)||(20089476-20089661)
chr1 (1-186)||(29078521-29078706)
chr1 (5-186)||(1168508-1168689)
chr1 (1-186)||(1940762-1940947)
chr1 (1-186)||(19715176-19715361)
chr1 (1-186)||(25897379-25897564)
chr1 (1-186)||(26663263-26663448)
chr1 (1-186)||(39260361-39260546)
chr1 (2-186)||(40092496-40092680)
chr1 (1-186)||(29288154-29288337)
chr1 (4-186)||(46760971-46761153)
chr1 (1-186)||(5215390-5215575)
chr1 (1-186)||(8120874-8121059)
chr1 (1-186)||(26580285-26580470)
chr1 (1-186)||(52753162-52753347)
chr1 (2-186)||(41928511-41928695)
chr1 (1-186)||(2347661-2347847)
chr1 (1-182)||(23498469-23498650)
chr1 (1-186)||(52696796-52696981)
chr1 (1-186)||(17591696-17591878)
chr1 (5-194)||(970543-970735)
chr1 (5-186)||(6765464-6765645)
chr1 (5-186)||(8079728-8079909)
chr1 (1-186)||(43905659-43905844)
chr1 (3-186)||(32671584-32671767)
chr1 (1-186)||(12682825-12683010)
chr1 (1-160)||(40149494-40149653)
chr1 (1-194)||(51359232-51359425)
chr1 (1-186)||(2473727-2473912)
chr1 (1-186)||(7145212-7145397)
chr1 (1-175)||(17587520-17587694)
chr1 (4-186)||(49146177-49146359)
chr1 (1-186)||(13996738-13996923)
chr1 (2-196)||(15203106-15203301)
chr1 (1-186)||(15717790-15717974)
chr1 (1-186)||(46409440-46409627)
chr1 (25-186)||(29695680-29695842)
chr1 (1-186)||(15554167-15554344)
chr1 (1-182)||(38171841-38172009)
chr1 (43-178)||(23322897-23323032)
chr1 (62-186)||(52086272-52086396)
chr1 (42-186)||(5217840-5217983)
chr1 (120-186)||(5675110-5675176)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (1-186)||(22966-23151)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (1-186)||(310-495)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (1-186)||(3715-3900)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-186)||(145260-145445)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (1-186)||(10243-10428)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (1-182)||(21-202)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-186)||(21-207)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29938253 - 29938059
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29938253 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 29938154  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggcca 194  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29938153 gctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 29938059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18594729 - 18594544
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594729 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 18594630  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18594629 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 18594544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14422895 - 14422699
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14422895 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 14422796  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccata 196  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14422795 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggccata 14422699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 144586 - 144401
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  144586 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 144487  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  144486 actatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatccaa 144401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 2042539 - 2042724
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042539 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 2042638  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2042639 gctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 2042724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 10836770 - 10836955
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10836770 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 10836869  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10836870 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 10836955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 35118046 - 35118240
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118046 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 35118145  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggcca 194  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35118146 gctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 35118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 24113181 - 24113366
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113181 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 24113280  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24113281 tctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 24113366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 39206778 - 39206593
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39206778 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 39206679  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39206678 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 39206593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13110596 - 13110411
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13110596 gaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactatgataa 13110497  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13110496 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 13110411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 22260645 - 22260830
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22260645 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaggataa 22260744  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22260745 gctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 22260830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7791603 - 7791418
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7791603 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 7791504  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7791503 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaa 7791418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33278592 - 33278407
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33278592 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 33278493  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  || |||  ||||||||||||||||||||    
T  33278492 actatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatccaa 33278407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 34679472 - 34679657
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34679472 gaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataa 34679571  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  34679572 actatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 34679657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 38167170 - 38167355
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38167170 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 38167269  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  38167270 actagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaa 38167355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7774956 - 7774774
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7774956 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 7774857  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 183  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | | |||| ||||||||||||||||||    
T  7774856 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagccaatc 7774774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7812187 - 7812005
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7812187 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 7812088  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 183  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  7812087 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatc 7812005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 34842380 - 34842565
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34842380 gaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 34842479  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34842480 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 34842565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 39218969 - 39218784
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39218969 gaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctatgataa 39218870  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39218869 accatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 39218784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41575705 - 41575520
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41575705 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 41575606  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41575605 gcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaa 41575520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4036039 - 4035854
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4036039 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 4035940  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  4035939 gctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaa 4035854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 6144288 - 6144473
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6144288 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 6144387  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  6144388 gctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 6144473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 44804959 - 44805140
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44804959 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 44805058  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  44805059 gctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagccaat 44805140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5320756 - 5320562
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5320756 gaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactatgataa 5320657  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggcca 194  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5320656 attatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 5320562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Original strand, 34998919 - 34999095
Alignment:
Q  9 ataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34998919 ataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaagataagctatttt 34999018  T
Q  109 tatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  34999019 tatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatcca 34999095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8021902 - 8021726
Alignment:
Q  2 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 101  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8021902 aggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 8021811  T
Q  102 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  8021810 ctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 8021726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 42571783 - 42571601
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571783 gaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 42571686  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42571685 gctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 42571601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118052
Alignment:
Q  37 gaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 136  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  137 ggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 40118052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28639472 - 28639289
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28639472 gaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 28639375  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt----atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    || | |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28639374 actatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaat 28639289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 194 - 329
Target Start/End: Original strand, 43803916 - 43804051
Alignment:
Q  194 atatagtctttagataatataaaaggagatgattgcggcttttcaatatttgttgagatgggattaatgagagatatcaagtctacctcattatttgtnn 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  43803916 atatagtctttagataatataaaaggagatgattgcggcttttcaatatttattgagatgggattaatgagagatatcaagtctacctcattatttgtaa 43804015  T
Q  294 nnnnnntatccaggtttttcttgataggttagaaag 329  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43804016 aaaaaatatccaggtttttcttgataggttagaaag 43804051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 33287076 - 33287225
Alignment:
Q  37 gaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33287076 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaa 33287175  T
Q  137 ggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || ||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33287176 agcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaa 33287225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36491349 - 36491164
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36491349 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataa 36491250  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | || |||| | |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36491249 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatccaa 36491164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 186
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783933
Alignment:
Q  54 ttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatat 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  154 aagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 26783933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 9807452 - 9807339
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9807452 gaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctatgataa 9807353  T
Q  101 actatttttattta 114  Q
     |||||||||||||    
T  9807352 gctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 66194 - 66377
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccgga-ggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgata 99  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  66194 gaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactattata 66293  T
Q  100 aactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 183  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | || ||||||  ||| |  |||||||||||||||||    
T  66294 agttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatc 66377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 186
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322212
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  142 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||  |||| ||||   || ||| ||||  |||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaa 2322212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005173
Alignment:
Q  65 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacata 164  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| | ||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  165 tgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||| || ||||||||||||||    
T  5005194 agcttaagataagccaatccaa 5005173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220267
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  142 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    ||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaat 39220267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806880
Alignment:
Q  106 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||  ||||||||||| ||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaa 9806880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8042794 - 8042609
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8042794 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 8042695  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8042694 actatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatccaa 8042609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25999574 - 25999379
Alignment:
Q  2 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  25999574 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 25999475  T
Q  102 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccata 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25999474 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccata 25999379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 37698144 - 37698329
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698144 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 37698243  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37698244 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 37698329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32244307 - 32244122
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32244307 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 32244208  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32244207 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaa 32244122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 20842349 - 20842534
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20842349 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactatgataa 20842448  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20842449 gttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 20842534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38856280 - 38856095
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38856280 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 38856181  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  38856180 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 38856095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 42307906 - 42308091
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42307906 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 42308005  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42308006 gctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 42308091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 15520143 - 15520328
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15520143 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataa 15520242  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15520243 gttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 15520328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29445675 - 29445490
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29445675 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatgataa 29445576  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29445575 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaa 29445490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 54870175 - 54870360
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54870175 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgatgataa 54870274  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  54870275 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatccaa 54870360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 12117659 - 12117840
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12117659 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataa 12117758  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12117759 actatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaat 12117840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 22174991 - 22175176
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22174991 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 22175090  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22175091 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 22175176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 46452163 - 46452348
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  46452163 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataa 46452262  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||  |||||||||||||    
T  46452263 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaa 46452348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21581226 - 21581044
Alignment:
Q  4 gttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21581226 gttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagtt 21581127  T
Q  104 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21581126 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 21581044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35226634 - 35226449
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35226634 gaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 35226535  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35226534 gctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatccaa 35226449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38934132 - 38933948
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934132 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 38934033  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38934032 gctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataagc-cacataagctcaaaataagccaatccaa 38933948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 44609334 - 44609519
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44609334 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 44609433  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44609434 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaa 44609519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 50529116 - 50528931
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50529116 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 50529017  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  50529016 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 50528931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 25494286 - 25494482
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25494286 gaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 25494385  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccata 196  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25494386 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccata 25494482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 42104972 - 42105155
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42104972 gaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 42105071  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc 184  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  42105072 actatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 42105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26122998 - 26122816
Alignment:
Q  4 gttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaact 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26122998 gttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagct 26122899  T
Q  104 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26122898 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 26122816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32359446 - 32359261
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32359446 gaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 32359347  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| || ||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32359346 actatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaa 32359261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34700528 - 34700346
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34700528 gaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 34700429  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 183  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||    
T  34700428 gctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatc 34700346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15520823 - 15520638
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15520823 gaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 15520724  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15520723 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 15520638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20699336 - 20699151
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20699336 gaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 20699237  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20699236 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20699151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 48925004 - 48925187
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48925004 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataa 48925103  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| |||| | || |||  ||| ||||||||||||||||    
T  48925104 actatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagccaatccaa 48925187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 54534329 - 54534512
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  54534329 gaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagcttat-aaaccatgataa 54534426  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  54534427 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 54534512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35643369 - 35643219
Alignment:
Q  36 ggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 135  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35643369 ggagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaa 35643270  T
Q  136 aggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35643269 aggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaa 35643219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 24835704 - 24835885
Alignment:
Q  5 ttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaacta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  24835704 ttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagcta 24835803  T
Q  105 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||   | ||| |||||||||||  ||||||||    
T  24835804 tttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaa 24835885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16354533 - 16354390
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16354533 gaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgataa 16354434  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 144  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16354433 gttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatg 16354390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44688947 - 44688785
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44688947 gaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatgaaactatgataa 44688849  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacata 164  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  44688848 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacata 44688785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2895356 - 2895191
Alignment:
Q  17 ataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatt 116  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  2895356 ataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatttttttttatttatt 2895257  T
Q  117 tacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  2895256 tacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaat 2895191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 53028404 - 53028227
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  53028404 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatatgataa 53028305  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||        |||| ||||||| ||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  53028304 gctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 53028227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12916091 - 12915931
Alignment:
Q  3 ggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaac 102  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12916091 ggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatgaaattatgataaac 12915992  T
Q  103 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacata 164  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||    
T  12915991 tatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttatgg-agtaaataagcccacata 12915931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 186
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529959
Alignment:
Q  54 ttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatat 153  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  154 aagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||  ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatccaa 50529959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24366216 - 24366145
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatg 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24366216 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatg 24366145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128051
Alignment:
Q  60 ttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctc 159  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| |    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  160 acatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||| | | |||||||| ||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaa 49128051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 13696980 - 13696914
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaa 67  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13696980 gaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 50528883 - 50528914
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaa 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528883 gaggttacataaattcataagctccttgttaa 50528914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 33359095 - 33359291
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33359095 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 33359194  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccata 196  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33359195 gctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccata 33359291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 933476 - 933295
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  933476 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 933377  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  933376 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaat 933295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 22649699 - 22649895
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22649699 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataa 22649798  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaa-tccaacggggccata 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22649799 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggccata 22649895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3511514 - 3511329
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3511514 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3511415  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3511414 gctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaa 3511329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5281051 - 5280866
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5281051 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 5280952  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5280951 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 5280866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 43067978 - 43068163
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43067978 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactatgataa 43068077  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  43068078 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 43068163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 30181031 - 30181214
Alignment:
Q  3 ggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaac 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30181031 ggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 30181130  T
Q  103 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30181131 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 30181214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7164375 - 7164190
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7164375 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 7164276  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  7164275 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 7164190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 12097595 - 12097780
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12097595 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactatgataa 12097694  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  12097695 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatccaa 12097780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 12101183 - 12101368
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12101183 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 12101282  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12101283 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 12101368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20346679 - 20346494
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20346679 gaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 20346580  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20346579 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20346494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 24792337 - 24792522
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24792337 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 24792436  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||  |||||||||||||    
T  24792437 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaa 24792522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 42965001 - 42965186
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42965001 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 42965100  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42965101 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 42965186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32041732 - 32041548
Alignment:
Q  2 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32041732 aggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataag 32041633  T
Q  102 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  32041632 ctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaa 32041548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25748678 - 25748484
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25748678 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 25748579  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggcca 194  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || | ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  25748578 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcca 25748484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 33846534 - 33846714
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33846534 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgataa 33846628  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33846629 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 33846714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6394942 - 6394760
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6394942 gaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataa 6394843  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6394842 actatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 6394760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 42204346 - 42204160
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42204346 gaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 42204247  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacaccttta-aaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42204246 gctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 42204160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1803217 - 1803032
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  1803217 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactatgataa 1803118  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1803117 gctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 1803032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 4477326 - 4477511
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4477326 gaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataa 4477425  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4477426 gctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 4477511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9452781 - 9452596
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  9452781 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactatgataa 9452682  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9452681 actatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaa 9452596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43156904 - 43156719
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43156904 gaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactatgataa 43156805  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43156804 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 43156719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15656103 - 15655918
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15656103 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 15656004  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15656003 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 15655918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 48865824 - 48865662
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48865824 gaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 48865725  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacaccttta---aaaaggcttatggaagtatataagctca 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48865724 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagctca 48865662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8630853 - 8630672
Alignment:
Q  5 ttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaacta 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630853 ttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaacta 8630754  T
Q  105 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||  |||||||||| | |||||||    
T  8630753 tttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatccaa 8630672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38866735 - 38866550
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38866735 gaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataa 38866636  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  38866635 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcgatccaa 38866550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4347462 - 4347279
Alignment:
Q  3 ggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4347462 ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 4347363  T
Q  103 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  4347362 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatccaa 4347279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 36890835 - 36891019
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36890835 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataa 36890934  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  36890935 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaa 36891019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 42673652 - 42673471
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42673652 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 42673553  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  42673552 gctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatccaa 42673471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 46891344 - 46891530
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  46891344 gaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgacaa 46891443  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  46891444 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatccaa 46891530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 46134309 - 46134494
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  46134309 gaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataa 46134408  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  46134409 actatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatccaa 46134494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 16894515 - 16894671
Alignment:
Q  4 gttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894515 gttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaact 16894614  T
Q  104 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctca 160  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16894615 atttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataagctca 16894671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17753787 - 17753593
Alignment:
Q  5 ttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaacta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17753787 ttacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgttaagcta 17753688  T
Q  105 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccatata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||||   ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  17753687 tttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatccaaacggggtcatata 17753593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 43021585 - 43021766
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |  |    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  43021585 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagcttatgaaactataataa 43021680  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||  || |||||||||||||||||    
T  43021681 gttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatccaa 43021766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828280
Alignment:
Q  47 tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  147 agtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    |||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaat 19828280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 186
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006001
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  142 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    || |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaa 37006001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704986
Alignment:
Q  97 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaa 37704986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405030
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||   | || || ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  142 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    || | |||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaat 43405030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163825
Alignment:
Q  58 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagc 157  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||| | || | ||||| |||||   ||| ||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaacgcattcacaaaggattatgttggtaaataagc 20163854  T
Q  158 tcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  20163853 tcatataagcccaaaataagtcaatccaa 20163825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 136
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849677
Alignment:
Q  49 aaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 136  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaa 36849677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 186
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655602
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||  |||||||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  142 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||  |||| | ||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaa 15655602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 196
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075429
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||   | | ||| |||||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctattttta-ttatttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  142 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccata 196  Q
    |||  |||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggccata 30075429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 182
Target Start/End: Original strand, 27691428 - 27691512
Alignment:
Q  98 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| || |||   ||||||||| |||||    
T  27691428 taaaatatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaaccaat 27691512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 3347538 - 3347723
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347538 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 3347637  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3347638 gctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 3347723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 26946891 - 26947076
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946891 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 26946990  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  26946991 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 26947076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 6086614 - 6086799
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086614 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 6086713  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6086714 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 6086799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9459755 - 9459570
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9459755 gaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 9459656  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9459655 gctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatccaa 9459570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2837737 - 2837552
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2837737 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactatgataa 2837638  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2837637 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 2837552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11167432 - 11167247
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167432 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 11167333  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11167332 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatccaa 11167247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30692043 - 30691858
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30692043 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 30691944  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30691943 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 30691858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 26704354 - 26704539
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26704354 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 26704453  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||||||    
T  26704454 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatccaa 26704539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 3955782 - 3955966
Alignment:
Q  2 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  3955782 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataag 3955881  T
Q  102 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3955882 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 3955966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1153785 - 1153603
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1153785 gaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 1153686  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 183  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  1153685 tctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 17261088 - 17261273
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17261088 gaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaaatattataa 17261187  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17261188 gctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 17261273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18613730 - 18613545
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18613730 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactatgataa 18613631  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  18613630 gctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatccaa 18613545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21893647 - 21893472
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21893647 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 21893548  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataa 176  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  21893547 gctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 21893472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20726979 - 20726787
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20726979 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 20726880  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccata 196  Q
      ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20726879 gttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccata 20726787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 16307023 - 16307208
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16307023 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 16307122  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16307123 gctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaa 16307208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 34887307 - 34887492
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34887307 gaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataa 34887406  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34887407 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaa 34887492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 30698944 - 30699129
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  30698944 gaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactatgataa 30699043  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  30699044 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataagtcaatccaa 30699129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35198469 - 35198295
Alignment:
Q  7 acataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35198469 acataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35198370  T
Q  107 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  35198369 tttatttatttacccaaacacctttaaaaa-gcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaat 35198295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 52992 - 52843
Alignment:
Q  37 gaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52992 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 52893  T
Q  137 ggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52892 tgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 52843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 28199523 - 28199709
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28199523 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgataa 28199621  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga--agtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28199622 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaa 28199709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33464521 - 33464399
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33464521 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 33464422  T
Q  101 actatttttatttatttacccaa 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  33464421 actatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 53100 - 53001
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53100 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463708
Alignment:
Q  115 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 33463708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 1165616 - 1165801
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1165616 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataa 1165715  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1165716 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaa 1165801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1579229 - 1579044
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1579229 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 1579130  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  1579129 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 1579044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 1605586 - 1605771
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1605586 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 1605685  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  1605686 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 1605771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 9008073 - 9008257
Alignment:
Q  2 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9008073 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 9008172  T
Q  102 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9008173 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 9008257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 24105686 - 24105871
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105686 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 24105785  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24105786 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 24105871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27421051 - 27420866
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27421051 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 27420952  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  27420951 actatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 27420866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 3386501 - 3386686
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3386501 gaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3386600  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3386601 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaa 3386686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 8374354 - 8374538
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8374354 gaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 8374452  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  8374453 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatccaa 8374538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16069546 - 16069361
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16069546 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 16069447  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16069446 gctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 16069361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 16737462 - 16737643
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16737462 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 16737561  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  16737562 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaat 16737643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 27679188 - 27679369
Alignment:
Q  5 ttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaacta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27679188 ttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 27679287  T
Q  105 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27679288 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 27679369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31883337 - 31883152
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883337 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 31883238  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31883237 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaa 31883152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4121130 - 4120945
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4121130 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 4121031  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4121030 attatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattccaa 4120945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 33491211 - 33491396
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  33491211 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatgataa 33491310  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33491311 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 33491396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33991333 - 33991152
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33991333 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataa 33991234  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||||||||| ||||    
T  33991233 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaat 33991152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 38598466 - 38598650
Alignment:
Q  2 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  38598466 aggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 38598565  T
Q  102 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  38598566 ctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatccaa 38598650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5203164 - 5202969
Alignment:
Q  2 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5203164 aggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 5203065  T
Q  102 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccata 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |  |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5203064 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggccata 5202969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19358715 - 19358534
Alignment:
Q  5 ttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaacta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19358715 ttacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 19358616  T
Q  105 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19358615 tttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatccaa 19358534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 35782659 - 35782844
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35782659 gaggttacataaattcataagctccttgtaagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 35782758  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35782759 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatccaa 35782844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Original strand, 20992163 - 20992342
Alignment:
Q  3 ggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  20992163 ggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatgaaactatgatatgc 20992262  T
Q  103 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  20992263 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaat 20992342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3921774 - 3921589
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3921774 gaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3921675  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||  ||||||||||  ||||||||    
T  3921674 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatccaa 3921589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 26602957 - 26603116
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26602957 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 26603056  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctca 160  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26603057 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctca 26603116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27025149 - 27025005
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27025149 gaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactatgataa 27025050  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 145  Q
     |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  27025049 gctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgg 27025005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31410669 - 31410484
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31410669 gaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactatgataa 31410570  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| | || |||  ||||||||||  ||||||||    
T  31410569 gctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaa 31410484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 186
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992485
Alignment:
Q  59 cttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagct 158  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  159 c----acatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaa 20992485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 186
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284775
Alignment:
Q  53 tttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtata 152  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  153 taagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638175
Alignment:
Q  58 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagc 157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||  |||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||  |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  158 tcacata 164  Q
    |||||||    
T  31638181 tcacata 31638175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Original strand, 41818536 - 41818605
Alignment:
Q  59 cttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacc 128  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41818536 cttattaaaatacaatataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 35420439 - 35420478
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagg 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  35420439 gaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagg 35420478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634593
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||  |||||| |||||||||| | | |||| |||||||   ||||||||||||||   ||| |||  ||||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttt--attatttacccaaacgtatttgaaagagctt 25634635  T
Q  142 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 183  Q
    |||  |||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  25634634 atgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatc 25634593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 144
Target Start/End: Original strand, 19516044 - 19516128
Alignment:
Q  60 ttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 144  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |   |||| |||||||||||  |||  |||||| || |||||||| ||||||    
T  19516044 ttattaaaatattacataagcagtttatgaaattgatataagctatttttattactttgtccaaacgccgttaaaaagacttatg 19516128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20877237 - 20877052
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20877237 gaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 20877138  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20877137 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20877052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 19913633 - 19913828
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913633 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 19913732  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccat 195  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19913733 gctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccat 19913828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 15241031 - 15241216
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241031 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 15241130  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15241131 actgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 15241216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38055347 - 38055150
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38055347 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 38055248  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccatat 197  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  38055247 aatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccatat 38055150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 1756767 - 1756952
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1756767 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 1756866  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  1756867 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 1756952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14987982 - 14987797
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987982 gaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 14987883  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14987882 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 14987797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 23704212 - 23704397
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23704212 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataa 23704311  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23704312 actatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaa 23704397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 53717467 - 53717652
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  53717467 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactatgataa 53717566  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53717567 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaa 53717652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 54189735 - 54189550
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54189735 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 54189636  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  54189635 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 54189550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 23776463 - 23776647
Alignment:
Q  2 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  23776463 aggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 23776562  T
Q  102 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23776563 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 23776647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50353991 - 50353793
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  50353991 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatcataa 50353892  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccatata 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  50353891 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaaacggggccttata 50353793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1617274 - 1617089
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1617274 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataa 1617175  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1617174 gttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 1617089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 50055104 - 50055289
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  50055104 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataa 50055203  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  50055204 gctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 50055289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 28032715 - 28032897
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28032715 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatactatgataa 28032814  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 183  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  28032815 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 28032897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 6611363 - 6611548
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6611363 gaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataa 6611462  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6611463 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaa 6611548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16700971 - 16700786
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16700971 gaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 16700872  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16700871 gctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 16700786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33704031 - 33703850
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33704031 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 33703932  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  33703931 gttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaat 33703850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 37464911 - 37464730
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37464911 gaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 37464812  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37464811 actgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaat 37464730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 45424537 - 45424722
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45424537 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 45424636  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45424637 actatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaa 45424722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 53875847 - 53875662
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53875847 gaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactatgataa 53875748  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  53875747 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatccaa 53875662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 54412818 - 54412633
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54412818 gaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 54412719  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  54412718 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 54412633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 11639581 - 11639766
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11639581 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 11639680  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | ||||||||| |||||||||    
T  11639681 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaa 11639766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15669373 - 15669188
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669373 gaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaactatgataa 15669274  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15669273 gctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 15669188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 27488651 - 27488836
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27488651 gaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 27488750  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||  |||||||||||||    
T  27488751 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaa 27488836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 30423568 - 30423752
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30423568 gaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 30423666  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30423667 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaa 30423752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 44379190 - 44379375
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44379190 gaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataa 44379289  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |||  ||||||||||| ||||||||    
T  44379290 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatccaa 44379375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 8591095 - 8591275
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8591095 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 8591194  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaa 181  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||    
T  8591195 gctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaa 8591275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31969871 - 31969696
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31969871 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataa 31969772  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataa 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  31969771 actatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 31969696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 19164976 - 19165160
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19164976 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatgataa 19165073  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19165074 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 19165160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 2481411 - 2481596
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2481411 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 2481510  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2481511 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 2481596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30171770 - 30171585
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30171770 gaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataa 30171671  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30171670 gctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 30171585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 40428723 - 40428904
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40428723 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataa 40428822  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  40428823 gctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaat 40428904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 43289963 - 43290148
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43289963 gaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 43290062  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||    
T  43290063 gctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaa 43290148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 44784920 - 44785105
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44784920 gaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataa 44785019  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44785020 gctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 44785105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 48910032 - 48909851
Alignment:
Q  5 ttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaacta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48910032 ttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 48909933  T
Q  105 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  48909932 tttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 48909851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 52139393 - 52139208
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52139393 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 52139294  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  52139293 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaa 52139208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 35490778 - 35490961
Alignment:
Q  3 ggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  35490778 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagc 35490877  T
Q  103 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  35490878 tatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 35490961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 37968760 - 37968942
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37968760 gaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 37968859  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 183  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  37968860 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatc 37968942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 27536107 - 27536288
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27536107 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 27536206  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  27536207 actatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatccaa 27536288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 6688630 - 6688809
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||||    
T  6688630 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcag------aaactatgataa 6688723  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  6688724 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaa 6688809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 47632225 - 47632039
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  47632225 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgagaa 47632126  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacc-tttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47632125 gctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatccaa 47632039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 40680041 - 40680226
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40680041 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 40680140  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  40680141 gctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataagtcaatccaa 40680226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16704009 - 16703843
Alignment:
Q  3 ggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaac 102  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16704009 ggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaac 16703910  T
Q  103 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctc 169  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  16703909 tatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc 16703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44376035 - 44375850
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44376035 gaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgataa 44375936  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa-ggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||| || |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44375935 actatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaa-tagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaa 44375850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 8932181 - 8932366
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  8932181 gaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgttaa 8932280  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  8932281 gctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaa 8932366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360435
Alignment:
Q  20 agctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaata-tgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttattta 118  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  119 cccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 28360435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 53353253 - 53353060
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttat----taaaatatgacataagcagcttatgaaactatg 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53353253 gaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 53353154  T
Q  97 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcaca----tatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| || |    || |||||||||||||||||||||    
T  53353153 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagccaatccaa 53353060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Original strand, 38071327 - 38071504
Alignment:
Q  2 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071327 aggttacataaattcataagctccttgttaagccccg---taaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 38071423  T
Q  102 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  38071424 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 27583639 - 27583820
Alignment:
Q  5 ttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaacta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  27583639 ttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatgataagtta 27583738  T
Q  105 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27583739 tttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 27583820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 55344828 - 55345009
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || || ||| || ||||||||    
T  55344828 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatgcaaatatgataa 55344927  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  55344928 gctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaat 55345009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053448
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  142 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||| |||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaa 50053448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 114
Target Start/End: Original strand, 23269053 - 23269162
Alignment:
Q  5 ttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaacta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23269053 ttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataagcta 23269152  T
Q  105 tttttattta 114  Q
    ||||||||||    
T  23269153 tttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 186
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265945
Alignment:
Q  106 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 23265945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 125
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  43 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaac 125  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 53408210 - 53408138
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccgg-aggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatg 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53408210 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatg 53408138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 177
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548320
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  142 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataag 177  Q
    |||  |||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataag 44548320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 9595905 - 9595982
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595905 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag-----------agtttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 23261889 - 23261937
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctga 49  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23261889 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493340
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  142 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc 184  Q
    || | |||| ||| | ||| |||   |||||||||| ||||||    
T  17493382 ataggagtagatatgttcatataaattcaaaataagtcaatcc 17493340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 50055335 - 50055304
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaa 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055335 gaggttacataaattcataagctccttgttaa 50055304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 196
Target Start/End: Original strand, 46257269 - 46257407
Alignment:
Q  58 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagc 157  Q
    |||||||||| |||   |||| |||||||||||| | ||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||  ||| |||||||  |||| |||| |    
T  46257269 gcttattaaactatagaataaacagcttatgaaattgtgataaactctttcaattgatttacccaaacaattttgtaaatgcttatgtcagtagataaac 46257368  T
Q  158 tcacatatgctcaaaataagccaatccaacggggccata 196  Q
    | |||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  46257369 ttacataaacttaaaataagccaattcaatcgggccata 46257407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344777
Alignment:
Q  47 tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || |||||| ||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataa 55344777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36895 - 36710
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36895 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 36796  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36795 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 36710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 6174843 - 6175028
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6174843 gaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 6174942  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6174943 aatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 6175028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 42937910 - 42937724
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggctt-attaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42937910 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 42937811  T
Q  100 aactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42937810 aactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaa 42937724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 31517230 - 31517427
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31517230 gaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 31517329  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccatat 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31517330 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggggccatat 31517427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 3873259 - 3873444
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3873259 gaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3873358  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3873359 gctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 3873444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 18806899 - 18807084
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18806899 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataa 18806998  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18806999 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaa 18807084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 33906062 - 33906247
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33906062 gaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 33906161  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  33906162 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatccaa 33906247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108277
Alignment:
Q  6 tacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  106 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaacggggcc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccatccaaacggggcc 1108277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4016229 - 4016044
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  4016229 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatac 4016130  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4016129 gttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaa 4016044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 4232157 - 4232342
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4232157 gaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 4232256  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  4232257 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaa 4232342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 26323201 - 26323386
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26323201 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 26323300  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26323301 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaa 26323386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 39635642 - 39635457
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39635642 gaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 39635543  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39635542 gctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaa 39635457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5733589 - 5733407
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5733589 gaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 5733490  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 183  Q
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  5733489 gttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatc 5733407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 30270698 - 30270879
Alignment:
Q  5 ttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaacta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30270698 ttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaacta 30270797  T
Q  105 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  30270798 ttttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatccaa 30270879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 16066309 - 16066490
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16066309 gaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 16066408  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16066409 gctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaat 16066490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 19383950 - 19384126
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  19383950 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactatgataa 19384049  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataag 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||| |||  |||||||||||    
T  19384050 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 28329854 - 28330037
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28329854 gaggttacataaattcatatgctccttgttaagct--agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 28329951  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28329952 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 28330037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 19901153 - 19901337
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19901153 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 19901252  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19901253 gctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 19901337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 16588791 - 16588976
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16588791 gaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 16588890  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  16588891 gctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaa 16588976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 186
Target Start/End: Original strand, 30420223 - 30420367
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420223 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 30420322  T
Q  142 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30420323 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 30420367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 1482921 - 1483099
Alignment:
Q  4 gttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  1482921 gttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacaataataagct 1483020  T
Q  104 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1483021 atttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttatgg-agtagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 1483099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 2178784 - 2178927
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2178784 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 2178883  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 144  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2178884 gctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatg 2178927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 851187 - 851002
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  851187 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattatgataa 851088  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  851087 gctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatccaa 851002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 430006 - 429863
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |   |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  430006 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataa 429907  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 144  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  429906 gctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatg 429863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 44947564 - 44947738
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44947564 gaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 44947656  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | || |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  44947657 actatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaat 44947738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 186
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446769
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  142 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||  |||| ||||| || ||||  |||  |||||||||||||||    
T  42446725 atgttagtagataagttcgcataaactccgaataagccaatccaa 42446769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101305
Alignment:
Q  49 aaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 144  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatg 22101305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585337
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  142 atg 144  Q
    |||    
T  3585339 atg 3585337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33510674 - 33510489
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33510674 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 33510575  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33510574 actatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaa 33510489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38829259 - 38829074
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  38829259 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgataa 38829160  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38829159 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatccaa 38829074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 42370810 - 42371004
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42370810 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataa 42370909  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggcca 194  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42370910 gttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcca 42371004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 1170459 - 1170644
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170459 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 1170558  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  1170559 gctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaa 1170644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16052286 - 16052101
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16052286 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 16052187  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16052186 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaa 16052101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20089661 - 20089476
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089661 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 20089562  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20089561 gctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20089476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29078706 - 29078521
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29078706 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 29078607  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29078606 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 29078521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1168689 - 1168508
Alignment:
Q  5 ttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaacta 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1168689 ttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 1168590  T
Q  105 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1168589 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 1168508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 1940762 - 1940947
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1940762 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatgataa 1940861  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  1940862 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 1940947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 19715176 - 19715361
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19715176 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaatgataa 19715275  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19715276 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatccaa 19715361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25897564 - 25897379
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25897564 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 25897465  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25897464 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 25897379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26663448 - 26663263
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26663448 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataa 26663349  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26663348 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 26663263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 39260361 - 39260546
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39260361 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataa 39260460  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39260461 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 39260546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40092680 - 40092496
Alignment:
Q  2 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  40092680 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 40092581  T
Q  102 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  40092580 atatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatccaa 40092496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29288337 - 29288154
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29288337 gaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 29288240  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29288239 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 29288154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 46761153 - 46760971
Alignment:
Q  4 gttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  46761153 gttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagct 46761054  T
Q  104 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  46761053 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaa 46760971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5215575 - 5215390
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5215575 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataa 5215476  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5215475 gctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 5215390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8121059 - 8120874
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8121059 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 8120960  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8120959 actgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaa 8120874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 26580285 - 26580470
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26580285 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 26580384  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26580385 gctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 26580470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 52753162 - 52753347
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  52753162 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataa 52753261  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52753262 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 52753347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 41928511 - 41928695
Alignment:
Q  2 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928511 aggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 41928610  T
Q  102 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  41928611 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatccaa 41928695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2347847 - 2347661
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatgacataagcagcttatgaaactatgata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2347847 gaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgata 2347748  T
Q  100 aactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||  |||||||||| | |||||||    
T  2347747 aactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatccaa 2347661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23498650 - 23498469
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  23498650 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatga 23498551  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  23498550 actatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaat 23498469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 52696981 - 52696796
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52696981 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 52696882  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52696881 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 52696796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17591878 - 17591696
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591878 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 17591779  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||    
T  17591778 gctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataagc-cacataagctc--aataagccaatccaa 17591696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Original strand, 970543 - 970735
Alignment:
Q  5 ttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac--tatgataaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  970543 ttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatatgataatc 970642  T
Q  103 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggcca 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  970643 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcca 970735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6765645 - 6765464
Alignment:
Q  5 ttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaacta 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6765645 ttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatatgataaacta 6765546  T
Q  105 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6765545 tttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaa 6765464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 8079728 - 8079909
Alignment:
Q  5 ttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaacta 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8079728 ttacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagcta 8079827  T
Q  105 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8079828 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 8079909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43905844 - 43905659
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43905844 gaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 43905745  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  43905744 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaa 43905659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32671767 - 32671584
Alignment:
Q  3 ggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  32671767 ggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagc 32671668  T
Q  103 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32671667 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaa 32671584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12683010 - 12682825
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12683010 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 12682911  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  12682910 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaa 12682825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 40149653 - 40149494
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40149653 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgataa 40149554  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctca 160  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  40149553 attatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagctca 40149494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 51359232 - 51359425
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51359232 gaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatgaaactatgataa 51359331  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggcca 194  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51359332 gctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 51359425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2473912 - 2473727
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2473912 gaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactataataa 2473813  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  2473812 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaa 2473727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7145397 - 7145212
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7145397 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 7145298  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctc-aaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||   |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  7145297 actatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatccaa 7145212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 17587520 - 17587694
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17587520 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaatatgataa 17587619  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaata 175  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||| ||||||||||    
T  17587620 gctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 49146359 - 49146177
Alignment:
Q  4 gttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaact 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49146359 gttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 49146260  T
Q  104 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  49146259 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatccaa 49146177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 13996738 - 13996923
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  13996738 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataa 13996837  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||   |||||||||||||||||||    
T  13996838 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatccaa 13996923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15203301 - 15203106
Alignment:
Q  2 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  15203301 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataag 15203202  T
Q  102 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaa-tccaacggggccata 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||| | ||| |||||||| ||| || ||||||||||||    
T  15203201 ctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattcaaacggggccata 15203106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15717974 - 15717790
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  15717974 gaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactatga-aa 15717876  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| ||  |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  15717875 gctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatccaa 15717790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 46409627 - 46409440
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaac--cggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46409627 gaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 46409528  T
Q  99 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  46409527 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaa 46409440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695680
Alignment:
Q  25 cttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaa 124  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  125 cacctttaaaaaggc-ttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||    |||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 29695680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 15554167 - 15554344
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||   |||        
T  15554167 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaa---atg---- 15554259  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||  |||||||||||||    
T  15554260 -ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaa 15554344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38172009 - 38171841
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38172009 gaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggc-------------acataagcagcttatgaaactatgataa 38171923  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||   |||||||||| ||||    
T  38171922 actgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataagtcaat 38171841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 178
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323032
Alignment:
Q  43 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 142  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||| | |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  143 tggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagc 178  Q
    ||| |||| ||||||  | ||| |||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086272
Alignment:
Q  62 attaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcac 161  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||| | |||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  162 atatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaa 52086272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 186
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217983
Alignment:
Q  42 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 141  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |   |||| ||||||||||| |||||||||||    ||| |||  ||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctatttttatt-atttacccaaatgtatttgaaagagctt 5217938  T
Q  142 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    |||  |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  5217939 atgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaa 5217983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675110
Alignment:
Q  120 ccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||  |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaa 5675110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 22966 - 23151
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22966 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 23065  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  23066 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 23151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 310 - 495
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  310 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 409  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  410 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaa 495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3900 - 3715
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3900 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3801  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | ||||||||| |||||||||    
T  3800 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaa 3715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 145260 - 145445
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145260 gaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 145359  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  145360 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaa 145445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10428 - 10243
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10428 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataa 10329  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||| | || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  10328 actatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatccaa 10243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 21 - 202
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 120  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 182  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||  |||||  |||||||||    
T  121 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaat 202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 21 - 207
Alignment:
Q  1 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgataa 119  T
Q  101 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga--agtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 186  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  120 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaa 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University