View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19906_low_23 (Length: 436)

Name: NF19906_low_23
Description: NF19906
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19906_low_23
NF19906_low_23
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (1-436)||(1838063-1838497)
chr6 (1-436)||(19664887-19665320)
chr6 (1-436)||(14790208-14790642)
chr6 (1-436)||(14795236-14795670)
chr6 (7-436)||(20527385-20527812)
chr6 (1-436)||(32704476-32704909)
chr6 (7-436)||(16883272-16883699)
chr6 (1-436)||(13017411-13017845)
chr6 (1-436)||(22247149-22247583)
chr6 (1-436)||(22221314-22221748)
chr6 (1-235)||(15534678-15534912)
chr6 (1-317)||(32426958-32427271)
chr6 (26-436)||(12983601-12984012)
chr6 (62-436)||(12980714-12981089)
chr6 (279-435)||(15534923-15535079)
chr6 (227-354)||(15538036-15538163)
chr6 (1-187)||(15537873-15538039)
chr6 (26-417)||(7769629-7770031)
chr6 (314-436)||(30978433-30978556)
chr6 (351-403)||(15540527-15540579)
chr6 (392-436)||(27649082-27649126)
chr6 (392-436)||(32427281-32427325)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (1-436)||(26062915-26063349)
chr4 (1-436)||(647425-647859)
chr4 (1-436)||(650697-651132)
chr4 (7-436)||(26060183-26060611)
chr4 (5-436)||(12171576-12172007)
chr4 (1-436)||(2541475-2541908)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (1-436)||(22159333-22159768)
chr5 (1-436)||(14616650-14617084)
chr5 (1-435)||(34405438-34405871)
chr5 (11-436)||(26712564-26712991)
chr5 (11-436)||(26982302-26982729)
chr5 (5-436)||(33574682-33575113)
chr5 (5-436)||(15532422-15532852)
chr5 (5-436)||(15542604-15543034)
chr5 (7-306)||(11989169-11989467)
chr5 (42-436)||(7650163-7650562)
chr5 (138-243)||(23993447-23993552)
chr5 (392-436)||(11989087-11989133)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (9-436)||(36843159-36843585)
chr7 (1-436)||(17863316-17863750)
chr7 (1-436)||(17866575-17867009)
chr7 (1-436)||(294454-294888)
chr7 (1-436)||(6966737-6967171)
chr7 (1-436)||(24782995-24783432)
chr7 (5-426)||(11279086-11279505)
chr7 (5-436)||(46846534-46846961)
chr7 (25-436)||(23107601-23108011)
chr7 (1-436)||(33312584-33313018)
chr7 (1-436)||(9765387-9765825)
chr7 (1-436)||(23759830-23760264)
chr7 (42-436)||(36222530-36222918)
chr7 (1-406)||(3862150-3862551)
chr7 (1-185)||(23313674-23313857)
chr7 (1-141)||(35773047-35773187)
chr7 (245-436)||(23313482-23313673)
chr7 (152-306)||(2719283-2719437)
chr7 (265-305)||(27796687-27796727)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (1-436)||(13492852-13493286)
chr1 (1-436)||(13495577-13496011)
chr1 (1-436)||(27282329-27282763)
chr1 (1-436)||(32506076-32506509)
chr1 (1-436)||(34065934-34066368)
chr1 (1-436)||(1936217-1936650)
chr1 (1-385)||(23990361-23990743)
chr1 (145-436)||(39545975-39546266)
chr1 (1-436)||(16190399-16190832)
chr1 (26-436)||(22456714-22457123)
chr1 (26-416)||(21152871-21153259)
chr1 (152-378)||(22453415-22453641)
chr1 (74-346)||(22104683-22104952)
chr1 (127-382)||(15297047-15297302)
chr1 (322-436)||(10764829-10764943)
chr1 (1-105)||(10759711-10759814)
chr1 (339-436)||(49147825-49147921)
chr1 (26-95)||(49147722-49147791)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (6-436)||(23673566-23673995)
chr2 (1-436)||(36326514-36326950)
chr2 (1-427)||(13709661-13710085)
chr2 (62-436)||(16294550-16294922)
chr2 (1-436)||(40017567-40018003)
chr2 (1-436)||(31527979-31528413)
chr2 (61-436)||(31626199-31626573)
chr2 (1-436)||(32575908-32576341)
chr2 (181-259)||(8426766-8426844)
chr2 (1-40)||(31626137-31626176)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (1-436)||(6032-6465)
[»] chr8 (6 HSPs)
chr8 (1-436)||(12575521-12575955)
chr8 (1-436)||(13096620-13097044)
chr8 (18-436)||(44007909-44008319)
chr8 (176-435)||(41778964-41779216)
chr8 (15-116)||(41779218-41779318)
chr8 (219-261)||(14418355-14418397)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-422)||(7228-7648)
[»] chr3 (7 HSPs)
chr3 (13-436)||(39563732-39564153)
chr3 (1-436)||(22626532-22626968)
chr3 (1-436)||(11138790-11139224)
chr3 (1-436)||(13979080-13979510)
chr3 (62-435)||(35366028-35366398)
chr3 (26-436)||(47411806-47412206)
chr3 (308-436)||(46731390-46731518)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (1-422)||(2281-2703)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-436)||(2825-3263)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (1-301)||(1-300)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (98-436)||(24404-24743)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (156-436)||(9606-9887)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (219-261)||(321-363)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 1838063 - 1838497
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1838063 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgttaaatgctttttgtattgttt 1838162  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1838163 atcatcgactactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctgacttttgactctgatctaggtaataggtt 1838262  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1838263 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 1838362  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1838363 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactaaataatcgttgattgaactag 1838462  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1838463 gagtgcgaatta-cataggagaacttcggaggattc 1838497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 19665320 - 19664887
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19665320 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcatttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgttaaatgctttttgtattgttt 19665221  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19665220 atcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgatcactaaccctgacttttaattctgatctaggtaataggtt 19665121  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19665120 taacctaagtaatcaagatagagatagatca-tattaggttatgacatagggattaacgttctattaaaatctccaatgatttcgaattcacttaagaga 19665022  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  19665021 ttaaggggatgttacttgcggggagaactctaggtcaagatattgggtagagttactttgttaatctgtcg-tgaactagataatcattgattgaattag 19664923  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19664922 gagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattc 19664887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 14790208 - 14790642
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  14790208 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattactttatgttttatgctttttgtat-gttt 14790306  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14790307 atcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtt 14790406  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14790407 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagaga 14790506  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||    
T  14790507 ttaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaattag 14790606  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14790607 gagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattc 14790642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 14795236 - 14795670
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  14795236 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattactttatgttttatgctttttgtat-gttt 14795334  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14795335 atcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtt 14795434  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14795435 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagaga 14795534  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||    
T  14795535 ttaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaattag 14795634  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14795635 gagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattc 14795670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 7 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20527812 - 20527385
Alignment:
Q  7 tatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatc 106  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20527812 tatgggaaccttaatgtgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctaatctttattcatattactttatatttaatgctttttgtat-gtttatcatc 20527714  T
Q  107 gactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacct 206  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20527713 gactcctaaccctagctttatgaatatgcaaattgattttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgaactaggtaataagtttaacct 20527614  T
Q  207 aagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaagg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20527613 aagtaatcaagctagagatagatcattattagattatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcaaattcacttaagagattaagg 20527514  T
Q  307 agttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgc 406  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20527513 -gttgttacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtaaagttaatttgttaatctgtcgtgaagttagataatcattgattgaattaggagtgc 20527415  T
Q  407 gaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20527414 aaattaccataggagaacttcggaggattc 20527385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 32704909 - 32704476
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  32704909 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaagtca-attactttatgtttaatgttttttgtat-gttt 32704812  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  32704811 atcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaagtaataagtt 32704712  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32704711 taacctaagtaatcaagatagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagaga 32704612  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||    
T  32704611 ttaaggggttgtcacatgcggggagaattctatttcaagagattgggtagaattactctgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaattag 32704512  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32704511 gagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattc 32704476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 7 - 436
Target Start/End: Original strand, 16883272 - 16883699
Alignment:
Q  7 tatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatc 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16883272 tatgagaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtctttattcatgttactttatctttaatgctttttgtat-gtttatcatc 16883370  T
Q  107 gactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacct 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16883371 gactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctcacttttgactctgaactaggtaataagtttaacct 16883470  T
Q  207 aagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaagg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  16883471 aagtaatcaagctagagatagatcattattaggtgatg-catagggattaatgttctgttaaaacctccaacggttttgaattcacataagagattaagg 16883569  T
Q  307 agttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaac-tagataatcgttgattgaactaggagtg 405  Q
     ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  16883570 ggttgccacttgtggggagaattctaggtcaagagattgggtagggttattgtgttaatctttcg-tgaacatagataatcattgtttgaattagtagtg 16883668  T
Q  406 cgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16883669 caaattaccataggagaacttcgaaggattc 16883699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13017845 - 13017411
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||    
T  13017845 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacataaatgaaagtttagtttttattcatattactttgtgcttaatgccttatgtac-gttt 13017747  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    || || ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  13017746 atgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctcttaactctgaattaggtaataggtt 13017647  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13017646 taacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-cgttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagaga 13017548  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgat-tgaacta 399  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||  ||||| |||||| |||||   |  ||    
T  13017547 ttaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcatattta 13017448  T
Q  400 ggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13017447 ggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattc 13017411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 22247149 - 22247583
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22247149 taatcctatgg-aaccctaatttgttgaactcttttgaacatcaatgaaagtttggtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtat-gttt 22247246  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    || || ||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  22247247 atgatagactattaaccatagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaaccaggtaataggtt 22247346  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaat-ctccaatggtttcaaattcacttaagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  22247347 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatatggattaacgtt-tgtttaattcctctaatggtttcgaattcacttgagag 22247445  T
Q  300 attaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattg-aact 398  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||   |||| |||||| ||||||| |  |    
T  22247446 attaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgatactaaataatcattgattgtattt 22247545  T
Q  399 aggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22247546 aagagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattc 22247583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 22221314 - 22221748
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22221314 taatcctatgg-aaccctaatttgttgaactcttttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtat-gttt 22221411  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    || || ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |   ||||||||||||    
T  22221412 atgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaaatctaaaaaaggtaataggtt 22221511  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaat-ctccaatggtttcaaattcacttaagag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  22221512 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatatggattaacgtt-tgtttaattcctctaatggtttcgaattcacttgagag 22221610  T
Q  300 attaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattg-aact 398  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||   |||| |||||| ||||||| |  |    
T  22221611 attaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgatactaaataatcattgattgtattt 22221710  T
Q  399 aggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22221711 aagagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattc 22221748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15534678 - 15534912
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15534678 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgttaaatgctttttgtattgttt 15534777  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15534778 atcatcgactactaaccctagctttatgaatatgaaaattgatgttagagattgagtgaccactaaacttgacttttaactctgatcttggtaataggtt 15534877  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattat 235  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15534878 taacataagtaatcaagctagtgatagatcattat 15534912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 32426958 - 32427271
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32426958 taatcctatgagaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaatttatattactttatgtttaatgctttttgtat-gttt 32427056  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  32427057 atcatcgaccactaaccctggctttaggagtatgcaaatcgatcttagagattgaatgaccactaactctggattttgact--gatctaggtaataagtt 32427154  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  32427155 taacctaagtaatcaatctagagatagatcattattatgttatgacatagggattaacattctgttaatacctccaacggttttgaattcacttaagaga 32427254  T
Q  301 ttaaggagttgttactt 317  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  32427255 ttaaggggttgtcactt 32427271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12984012 - 12983601
Alignment:
Q  26 tgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatc--gactactaactctagc- 122  Q
    |||||||| || ||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| ||   || ||||| | |||||     
T  12984012 tgaactcccttaaattttaatggaagtctagttttaattcatattaccttgtgtttaatgctgtctgtat-gtttattatattgagtactagcactagcg 12983914  T
Q  123 tttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctaga 222  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12983913 tttttgaatatgcaaactgatcttagaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgatctaggtaatatgtttaacctaagtaattaagctaga 12983814  T
Q  223 gatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggg 322  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  12983813 gatagaaaattattaggttatgacacatggattaacggactgttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcgga 12983714  T
Q  323 gagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggaga 422  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||| |||| || |  |||  |||||||||    
T  12983713 gagaattcaaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagacgaacattgattgaa-taggggtacagattttcataggaga 12983615  T
Q  423 actttggaggattc 436  Q
    |||| |||||||||    
T  12983614 acttcggaggattc 12983601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 62 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12981089 - 12980714
Alignment:
Q  62 attcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatc--gactactaactctagc-tttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatg 158  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | | ||||| |||||| ||   |||||||| | ||||| ||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||    
T  12981089 attcatattaccttgtgtttaatgttgtctgtat-gtttattatattgactactagcactagcgtttttgaatatgcaaactgatcttagaacttgaatg 12980991  T
Q  159 accactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaac 258  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12980990 accactagccctgacttttgactctgatctaggtaatatgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaagtattaggttatgactcatggattaac 12980891  T
Q  259 gttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactt 358  Q
    |   |||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12980890 ggactgttaaaacctccaacaatttcgaattcacttaagagattaagcggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtagaattactt 12980791  T
Q  359 tgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||| |||| || | ||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  12980790 tgttaatctgtcgttaaactagacgaacattgattgaa-taggggtacaaattttcataggagaacttcggaggattc 12980714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 279 - 435
Target Start/End: Original strand, 15534923 - 15535079
Alignment:
Q  279 ggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaact 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534923 ggtttcgaattcacttaagagattaagaggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattggttagagttactttgttaatctgtcgttgaact 15535022  T
Q  379 agataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggatt 435  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15535023 agataatcattgattgaattaggaatgcaaattaccataggaaaacttcggaggatt 15535079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 227 - 354
Target Start/End: Original strand, 15538036 - 15538163
Alignment:
Q  227 gatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggaga 326  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15538036 gatcattattaagttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggtgttgttacttgcggggaga 15538135  T
Q  327 actctaggtcaagagattgggtagagtt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15538136 actctaggtcaagagattgggtatagtt 15538163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 15537873 - 15538039
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||     
T  15537873 taatcatatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatagtactttatg-ttaatgctttttgtattgtt- 15537970  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatc 187  Q
                      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  15537971 ------------------tagttttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgatcactaacccttgcttttaactctgatc 15538039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 7770031 - 7769629
Alignment:
Q  26 tgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaactctagcttt 125  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||||||||   | ||||| |||||| ||  ||||||| | ||||| |     
T  7770031 tgaactcccttgaatatcaatgaaagtctagttta-attcatatttccttgtgtttaatgacatatgtat-gtttatgattaactactagcactagcatc 7769934  T
Q  126 atgaatatgcaaattgatgttagaga--ttgaatgaccactaaccctg----gcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagct 219  Q
     ||||| || ||||| || ||| |||  |||||||||||||| || ||    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |    
T  7769933 ttgaatgtgtaaatttatcttatagaacttgaatgaccactagccatgcatggcttttgaatctgatctaggaaatatgtttaacctaagtaattaagtt 7769834  T
Q  220 agagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaat---tcacttaagagattaaggagttgttact 316  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  || |||||||||   |||||||| |||||| | |||| |||   ||||| |||||||||||| |||   |||    
T  7769833 agagatagacaattattaggttatgatttagggattaacggactgttaaaacctccaaagatttcgaattcatcactgaagagattaaggggttagcact 7769734  T
Q  317 tgcggggagaact----ctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaatta 412  Q
    ||| | ||||| |    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || | | ||||||||| |  | |||| |||||    
T  7769733 tgcagagagaattatagctaggtcaaaagattgagtagaattactttgttaatatgtcgttaaactaaatgaacattgattgaattgagggtgcaaatta 7769634  T
Q  413 ccata 417  Q
    |||||    
T  7769633 ccata 7769629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 30978556 - 30978433
Alignment:
Q  314 acttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattg-aactaggagtgcgaatta 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||  ||||| |||||| ||||| | |  ||||||||| |||||    
T  30978556 acttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaatta 30978457  T
Q  413 ccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  30978456 ccataggagagctttggaggattc 30978433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 403
Target Start/End: Original strand, 15540527 - 15540579
Alignment:
Q  351 agttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  15540527 agttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcattgattaaattaggag 15540579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 436
Target Start/End: Original strand, 27649082 - 27649126
Alignment:
Q  392 ttgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27649082 ttgaattagaagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattc 27649126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 436
Target Start/End: Original strand, 32427281 - 32427325
Alignment:
Q  392 ttgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32427281 ttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattc 32427325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 26063349 - 26062915
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26063349 taatcatatgggaaccctgatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 26063250  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26063249 atcatcgactaataaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 26063150  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26063149 -aacctaagtaatcaagctagagattgatcattattaggttatgacatatggataaacgttctgttaaaacctccaatggtttcgaattcacttaagaga 26063051  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26063050 ttaaggggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcattgattgaattag 26062951  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26062950 gagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattc 26062915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 647859 - 647425
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  647859 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattactttatgttttatgctttttgtat-gttt 647761  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  647760 atcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatggccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtt 647661  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  647660 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagaga 647561  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||    
T  647560 ttaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaattag 647461  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  647460 gagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattc 647425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 651132 - 650697
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccc-taatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  651132 taatcctatgggaacccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattactttatgttttatgctttttgtat-gtt 651034  T
Q  100 tatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggt 199  Q
    |||||| |  | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  651033 tatcattgtttcctaaccctaactttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatggccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagt 650934  T
Q  200 ttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagag 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  650933 ttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagag 650834  T
Q  300 attaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaacta 399  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||    
T  650833 attaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaatta 650734  T
Q  400 ggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  650733 ggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattc 650697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 436
Target Start/End: Original strand, 26060183 - 26060611
Alignment:
Q  7 tatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatc 106  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26060183 tatgagaatcctagtttgttgaactcttttgaatatcaataaaagtctagattttattcatattactttatgtttaatgctttttgtat-gtttatcatc 26060281  T
Q  107 gactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacct 206  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  26060282 gactactaaccctagcttcatgaatatacaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccatgacttttgactctgatctaggtaatatgtttaactt 26060381  T
Q  207 aagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaagg 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26060382 aagtaatcaagctagagatagaccattattaggttatgacatagggattaacgttctattaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagacattaagg 26060481  T
Q  307 agttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgc 406  Q
     ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  26060482 ggttgttatttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctatcgggaagctagataatcattgcttgaattaggagtgc 26060581  T
Q  407 gaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26060582 aaattaccataggagaacttcggaggattc 26060611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 436
Target Start/End: Original strand, 12171576 - 12172007
Alignment:
Q  5 cctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatca 104  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  12171576 cctattggaacccaaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtat-gtttatga 12171674  T
Q  105 tcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaac 204  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||||||||    
T  12171675 tagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaattcttaattaggtaataggtttaac 12171774  T
Q  205 ctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12171775 ctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaa 12171874  T
Q  305 ggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattg-aactaggag 403  Q
    || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||  ||||| |||||| ||||||| |  ||||||    
T  12171875 ggggttgtcacttgcggggagaattgtaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggag 12171974  T
Q  404 tgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||| |||||||||||| || ||| ||| |||||    
T  12171975 tgcaaattaccataggcgagcttcggaagattc 12172007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 2541475 - 2541908
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||    
T  2541475 taatcttatgggaactctaatttgttgaattcctttca-tatcaataaaagtctagtttttattcatattatcttgtgtttaatgattttcgtat-gttt 2541572  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    || || |||||| |   ||||||| || | | ||||   |||| |||||  |||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||   | |||    
T  2541573 attattgactacaagtcctagcttgataagtttgcaggctgatcttagaacttgattgaccactaacaccggcttttaactctgaactaggtggaatgtt 2541672  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||    
T  2541673 taacctaagtaattaagctagagatagacaattattaggttatgatatagggattaacggactgttaaaaccttcaatggttttgaattcatttaagaga 2541772  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||| |  |||||| || || | |||| | |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||    
T  2541773 ttaatggattgttatttccgagaagaattttaggtcaagagattggataaaattactttgttaatctgtcgtttaactagataatcattgcttgaaatag 2541872  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  2541873 gagtacaaattaccataagagaacttcagaggattc 2541908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 22159333 - 22159768
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22159333 taatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 22159432  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22159433 atcatcgactactaaccatagctttatgaatatacaaattgatgttagagattgaatgaccattaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 22159532  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22159533 taacctaagtaatcaaactagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaatggtttcgaattcacttaagaga 22159632  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22159633 ttaaggggttgttacttgtggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctatcgttgaactagatagtcattgattgaactag 22159732  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22159733 gagtgcgatttaccataggagaacttcggaggattc 22159768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 14617084 - 14616650
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14617084 taatcctatgagaaccctagtttgttgaactcctttaaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtat-gttt 14616986  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14616985 atcatcgaatactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccatggcttttgactctgatctaggtaataagtt 14616886  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  14616885 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttttgttaaaacctccaacggtttcgaattcactcaagaga 14616786  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  14616785 ttaagggcttgtcacttgcggggagaattataggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgattgaattag 14616686  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14616685 gagtgaaaattaccataggagaacttcggaggattc 14616650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 34405438 - 34405871
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  34405438 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattactttatgttttatgctttttgtat-gttt 34405536  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34405537 atcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtt 34405636  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  34405637 taacttaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgagatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggttttgaattcacttaagaga 34405736  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||    
T  34405737 ttaaggggttgtcacatgcgaggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaattag 34405836  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggatt 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  34405837 gagtgcaaattaccataggagaacttcagaggatt 34405871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 26712991 - 26712564
Alignment:
Q  11 ggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgact 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  26712991 ggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttatgtat-gtttatcattgact 26712893  T
Q  111 actaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagt 210  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26712892 attaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagt 26712793  T
Q  211 aatcaagctagagatagatcat---tattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaagga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  26712792 aatcaagctagagatagatcatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggg 26712693  T
Q  308 gttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcg 407  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||||||||     
T  26712692 gttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattgaattaggagtgca 26712593  T
Q  408 aattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||| ||||||||| | | |||||||||    
T  26712592 aattatcataggagagcgtcggaggattc 26712564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 26982729 - 26982302
Alignment:
Q  11 ggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgact 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  26982729 ggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttatgtat-gtttatcattgact 26982631  T
Q  111 actaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagt 210  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26982630 attaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagt 26982531  T
Q  211 aatcaagctagagatagatcat---tattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaagga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  26982530 aatcaagctagagatagatcatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggg 26982431  T
Q  308 gttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcg 407  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||||||||     
T  26982430 gttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattgaattaggagtgca 26982331  T
Q  408 aattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||| ||||||||| | | |||||||||    
T  26982330 aattatcataggagagcgtcggaggattc 26982302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 436
Target Start/End: Original strand, 33574682 - 33575113
Alignment:
Q  5 cctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatca 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  33574682 cctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtat-gtttatga 33574780  T
Q  105 tcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaac 204  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  33574781 tagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctaacttttaactctgaattaggtaataggtttaac 33574880  T
Q  205 ctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||   |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33574881 ctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacattcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaa 33574980  T
Q  305 ggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattg-aactaggag 403  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||  ||||| |||||| ||||||| || ||||||    
T  33574981 ggggttgtcacttgcggggagaattctagatcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtaattaggag 33575080  T
Q  404 tgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33575081 tgcaaattaccataggagagcttcggaggattc 33575113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15532852 - 15532422
Alignment:
Q  5 cctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatca 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||  |||||| |    
T  15532852 cctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcttattactttgtgcttaatgccttatgtac-gtttatga 15532754  T
Q  105 tcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaac 204  Q
    | ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  15532753 tagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaac 15532654  T
Q  205 ctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15532653 ctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-cgttaatacctccattggtttcgaattcacttaagagattaa 15532555  T
Q  305 ggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattg-aactaggag 403  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||| |||||| ||||| | |  ||||||    
T  15532554 ggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggag 15532455  T
Q  404 tgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15532454 tgcaaattaccacaggagagctttagaggattc 15532422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15543034 - 15542604
Alignment:
Q  5 cctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatca 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||  |||||| |    
T  15543034 cctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcttattactttgtgcttaatgccttatgtac-gtttatga 15542936  T
Q  105 tcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaac 204  Q
    | ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  15542935 tagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaac 15542836  T
Q  205 ctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15542835 ctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-cgttaatacctccattggtttcgaattcacttaagagatcaa 15542737  T
Q  305 ggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattg-aactaggag 403  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||| |||||| ||||| | |  ||||||    
T  15542736 ggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggag 15542637  T
Q  404 tgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15542636 tgcaaattaccacaggagagctttagaggattc 15542604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11989467 - 11989169
Alignment:
Q  7 tatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11989467 tatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtttttattcatattactttatgtttaatgctttttgtat-gtttatcatc 11989369  T
Q  107 gactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacct 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11989368 gactactaaccctagctttatgaatatacaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccttcgcttttgactctgatctaggtattaggtttaacct 11989269  T
Q  207 aagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaagg 306  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11989268 atgtaatcaagttagagatagatcattattaggttttaacatagagattaacgttctattaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaagg 11989169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 7650562 - 7650163
Alignment:
Q  42 tcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattg 141  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7650562 tcaatgaaagtctagtctttattcatgttactttatgtttaatgttttttgtat-gtttatcatcgactactaaccctaactttatgaatatgcaaattg 7650464  T
Q  142 atgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcatta------- 234  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||           
T  7650463 atcttagagattgaataaccactaacc---gcttttgactcagaactaggtaataagtttaacctaaaaaatcaagctagagatagatcattattaggtt 7650367  T
Q  235 --ttaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactcta 332  Q
      ||||||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||  | |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7650366 atttaggttatgacatagggattaaccttctattaaaacctccagcgatttcgaattcactcaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattcta 7650267  T
Q  333 ggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggagg 432  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||    
T  7650266 ggtaaagagattgagtagaattaccttgttaatctatctttaaactagataatcattgattgaattaggagtgcaaattaccatagaagaacttcgtagg 7650167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23993552 - 23993447
Alignment:
Q  138 attgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattatta 237  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  23993552 attgatcttagaacttgaatgaccactagccatgacttttgaatctgatctaggaaatatggttaacctaagaaattaagctagagatagacaattatta 23993453  T
Q  238 ggttat 243  Q
    ||||||    
T  23993452 ggttat 23993447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 11989133 - 11989087
Alignment:
Q  392 ttgaactaggagtgcgaattaccata--ggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11989133 ttgaactaggagtgcaaattaccatataggagaactttggaggattc 11989087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 36843585 - 36843159
Alignment:
Q  9 tgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcga 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  36843585 tgggaactctaatttgttgaactc-tttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgtttaatgctttttatattgtttatcattga 36843487  T
Q  109 ctactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaa 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36843486 ctactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaatcctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaa 36843387  T
Q  209 gtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggag 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  36843386 gtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaagggg 36843287  T
Q  309 ttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcga 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36843286 ttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttaatttgttaatctgtcgttgaactagataatcattgattgaagtaggagtgcga 36843187  T
Q  409 attaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36843186 attaccataggagaacttcggaggattc 36843159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17863750 - 17863316
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  17863750 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattactttatgttttatgctttttgtat-gttt 17863652  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17863651 atcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtt 17863552  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17863551 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagaga 17863452  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||    
T  17863451 ttaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaattag 17863352  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17863351 gagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattc 17863316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17867009 - 17866575
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  17867009 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattactttatgttttatgctttttgtat-gttt 17866911  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17866910 atcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtt 17866811  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17866810 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagaga 17866711  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||    
T  17866710 ttaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaattag 17866611  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17866610 gagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattc 17866575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 294454 - 294888
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  294454 taatcctatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtataattttaattcatattactttatgtttaatgcttattgtat-gttt 294552  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  294553 atcatgaactattaactctagttttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtt 294652  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||    
T  294653 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttttgttaaaacatccaacagtttcgaattcacttaagaga 294752  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||    
T  294753 ttaaggggttgtcacttatggggagaattctagttcaagagattgggtataattactttgttaatctgtcgttgaattagataatcattgattgcattag 294852  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  294853 gagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattc 294888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 6966737 - 6967171
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  6966737 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattactttatgttttatgctttttgtat-gttt 6966835  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6966836 atcattgactactaaccctagctttatgaatattcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtt 6966935  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  6966936 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagaga 6967035  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||    
T  6967036 ttaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactttgttaatctatcgttaaactagataatcattgcttgaattag 6967135  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6967136 gagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattc 6967171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 24782995 - 24783432
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  24782995 taatcctatgggaaccgtagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaatccatattactttatgtttgatgctttttgtat-gttt 24783093  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24783094 atcatcgactactaaccatagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtt 24783193  T
Q  201 taacctaagtaat---caagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaag 297  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24783194 taacctaagtaataatcaagctagagatatatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaatctccaacggtttcgaattcacttaag 24783293  T
Q  298 agattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaac 397  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||     
T  24783294 agattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtataattactttgttaatctctcgttaaactagataatcattgattgaat 24783393  T
Q  398 taggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24783394 taggaatgaaaattaccatatgagaacttcggaggattc 24783432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 426
Target Start/End: Original strand, 11279086 - 11279505
Alignment:
Q  5 cctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatca 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11279086 cctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtttagtctttattcatattaccttgtgcttaatgctttttgtat-gtttatca 11279184  T
Q  105 tcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaac 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11279185 tcgactactaaccctagctttatgaacatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaac 11279284  T
Q  205 ctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11279285 ctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaacgtt-cattaatacctccaacggtttcagattcacttaagagattaa 11279383  T
Q  305 ggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagt 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  11279384 ggggttgtcacttgcggggagaatcctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcatttattgaactaggagt 11279483  T
Q  405 gcgaattaccataggagaactt 426  Q
    || |||||||| ||||||||||    
T  11279484 gcaaattaccagaggagaactt 11279505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 46846961 - 46846534
Alignment:
Q  5 cctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatca 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46846961 cctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtat-gtttatca 46846863  T
Q  105 tcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaac 204  Q
    ||||||| |||| |||||||   ||| ||||| ||||||  | || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  46846862 tcgactattaaccctagctt---gaacatgcatattgatcatggaaattgaatgatcactaaccctgacttttaactctgaactaagtaataggtttaac 46846766  T
Q  205 ctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaa 304  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||    
T  46846765 ctaagtaatcaagttagagatagattattattaggttatgacatagggattaacgatcttttaaaacctccaacgttttcgaattcagttaagagattaa 46846666  T
Q  305 ggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagt 404  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  46846665 ggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattattaggttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattgaactaggagt 46846566  T
Q  405 gcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  46846565 gcaaattaccatagaagaacttcggaggattc 46846534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 436
Target Start/End: Original strand, 23107601 - 23108011
Alignment:
Q  25 ttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaactctagctt 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| | |    
T  23107601 ttgaactcctttgaatttcaatgaaagtttagtctttattcatattactttttgtttaatgctttttgcat-gtttatcatcgactattaaccctaacgt 23107699  T
Q  125 tatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagaga 224  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23107700 tatgaatatgcaaattgatagtagagattgaatgaccactgacccagacttttgactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagttagaga 23107799  T
Q  225 tagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcgggga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| ||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23107800 tagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctcaaacaatttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcgggga 23107899  T
Q  325 gaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggagaac 424  Q
    ||| | ||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  23107900 gaattatagctcaaggaattgggtagagttactaagttaatctgttgtgaaactaaataatcattgtttgaactaggagtgcaaattaccataggagagc 23107999  T
Q  425 tttggaggattc 436  Q
    || ||| |||||    
T  23108000 ttcggatgattc 23108011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 33312584 - 33313018
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||| | || | |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  33312584 taatcctacgggaaccctaatttgttgaactccattgaacattaatgaaaatttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtat-gttt 33312682  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  33312683 atcatcgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctgacttttaactctgaactaggtaatatgtt 33312782  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||   |||||| |||||| ||||||||    
T  33312783 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttcttttaatacctccgccggtttcgaattcatttaagaga 33312882  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||  |||||  ||||| |||||| ||||||||| |||    
T  33312883 ttaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaaagattgggtagaattactaagttaattcgtcgtgaaactaaataatcattgattgaattag 33312982  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||  || ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  33312983 gaaagcaaattaccataggagagcttcagaggattc 33313018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 9765387 - 9765825
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||    
T  9765387 taatcctatgagaaccctaatttgttgaacttctttgaatatgaataaaagtctagtttttattcatattactttatgtttaatgcgttttgcat-gttt 9765485  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  9765486 accatcgactattaaccctagctttatggatatgcaaattgatc-----gattgaatgaccactaaccctgacttttgactctggtctaggtaataagtt 9765580  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9765581 taacttaagtaatcaagctagagatagatgattattaggttatgacataaggactaatgttttgttaaaacctctaatggtttcgaattcacttaagaga 9765680  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctg---------tcgttgaactagataatcgttga 391  Q
    ||||||   | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||  |||||||||||| |||     
T  9765681 ttaagggtattttacttgcagggagaattataggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgccgtgaaactcgtgaaactagataatcattgc 9765780  T
Q  392 ttgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9765781 ttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattc 9765825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 23760264 - 23759830
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||  ||||    
T  23760264 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacattaatgaaagtttagtttttattcatattactttgtgcttagtaccttatgtac-gttt 23760166  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    || || ||||| |||  ||||| |  |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  23760165 atgatagactattaatcctagcgtcgtgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactccgaattaggtaataggtt 23760066  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23760065 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-cgttaatacctccaatggttttgaattcacttaagaga 23759967  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattg-aacta 399  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||  ||||| |||||| ||||| | |  ||    
T  23759966 ttaaggggttgtcacttgcggggagaattctagggcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtattta 23759867  T
Q  400 ggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23759866 ggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattc 23759830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 36222918 - 36222530
Alignment:
Q  42 tcaatgaaagtctaattttta-ttcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaatt 140  Q
    ||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||    
T  36222918 tcaatgaaagtttagtctttaattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtat-gtttatcatcgactactagccctagctttatgaacatgcatatt 36222820  T
Q  141 gatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggt 240  Q
    |||  | || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36222819 gatcatggaaattgaatgaccactaaccctcgcttttaactctgaactagctaatagatttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggt 36222720  T
Q  241 tatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaaga 340  Q
    |||||||||  |||||||||| | | || |  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||     |||||| ||||||||||||    
T  36222719 tatgacatagagattaacgttct-taaatacttccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcact-----ggagaattctaggtcaaga 36222626  T
Q  341 gattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||| |||| | |||||  |||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36222625 gattaggtaaaattactaagttaatttgtagtgaaactaaataatcattgattgaactaggagtgaaaattaccataggagaacttcggaggattc 36222530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3862551 - 3862150
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| |  |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3862551 taatcttatgagaaccctaatttgttgaactcctttaaatatcaatgaaagtctagtttttatttatatcatcttgtttttaatgctttgtgtat-gttt 3862453  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    || || |||||||| | |       || ||| |||| | || | |||||  || | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |  |||    
T  3862452 attattgactactagccc-------ataaatttgcagactggtcttagaacttaattgaccactaaccctggctttaaactctgaactaggtggtgtgtt 3862360  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |    |||||||  |||||  ||||  ||||||||||||| |    
T  3862359 taacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatgatatagggattaaaggacggttaaaacttccaacagttttgaattcacttaagaca 3862260  T
Q  301 ttaa----ggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaa 396  Q
    ||||    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  3862259 ttaattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttgaactagataatcatttcttgaa 3862160  T
Q  397 ctaggagtgc 406  Q
     |||||||||    
T  3862159 ttaggagtgc 3862150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23313857 - 23313674
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23313857 taatcttatgggaactctaatttgttaaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtctttattcatgttactttatgtttaatgctttttgtat-gttt 23313759  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctga 185  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23313758 atcatcgactacaaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccttggcttttgactctga 23313674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35773187 - 35773047
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    |||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35773187 taatcctataagaactctaatttgttgaactcatttgaatgtcaatgaaagtttagtttttattcatattactttgtgttaaatgctttttgtattgttt 35773088  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattg 141  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  35773087 atcatcaactactaaccctaactttatgaatatgtaaattg 35773047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 23313673 - 23313482
Alignment:
Q  245 acatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagatt 344  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23313673 acataggggttaacgttctgttaaaacctccaacgattttgaattcacttaagagattaaggggtttccacttgcggggagaattctaggccaagagatt 23313574  T
Q  345 gggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23313573 gggtagagttacagtgttaatatgttgtgaacctagataatcattgtttgaattagtagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattc 23313482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Original strand, 2719283 - 2719437
Alignment:
Q  152 ttgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatg 251  Q
    ||||||||| |||| |||| |  ||||| ||||||||| |||||  | ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||| ||| |||||||  |||     
T  2719283 ttgaatgactactagccctagtgtttgaatctgatctaagtaatccgattaacttaattaattaagctagagatagacaattgttaagttatgatttata 2719382  T
Q  252 gattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaagg 306  Q
    |||||||| | | | |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  2719383 gattaacgatctataaaaacctccaacggttttgaattcacttaagagattaagg 2719437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 305
Target Start/End: Original strand, 27796687 - 27796727
Alignment:
Q  265 ttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaag 305  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27796687 ttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaag 27796727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 13492852 - 13493286
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13492852 taatcttatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtat-gttt 13492950  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13492951 atcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtt 13493050  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13493051 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagaga 13493150  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||    
T  13493151 ttaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaattag 13493250  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13493251 gagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattc 13493286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 13495577 - 13496011
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13495577 taatcctatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtat-gttt 13495675  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13495676 atcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctagcttttgactctgatctaggtaataagtt 13495775  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13495776 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgctaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagaga 13495875  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||    
T  13495876 ttaaggggttgtcacttgcgggtagaattctaggtcaagagattggatataattactttcttaatctgtcgttaaagtagataatcattgattgaattag 13495975  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13495976 gagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattc 13496011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27282763 - 27282329
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||    
T  27282763 taatcctatgggaaccctaatttgttgaacacctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatcctttttgtatc-ttt 27282665  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27282664 atcatcgactactaaccctagctttatgaatatgaaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctggattttgactctgatctaggtaataagtt 27282565  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| | |||  |||||||||||||||    
T  27282564 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacgattttgaattcacttaagaga 27282465  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  27282464 ttaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatcggtcgttgaactagataatcattgcttgaattag 27282365  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27282364 gagtgcaaattaccataggagaacttcggagaattc 27282329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 32506509 - 32506076
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactccttt--gaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgt 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| |   |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  32506509 taatcctatgggaaccctagtttgttgaactcctttttgaatatcaatgaaagtctagttttaa---atattactttatgtttaatgttttttgtat-gt 32506414  T
Q  99 ttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaatagg 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  32506413 ttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaatcgatcttagagattgaatgaccactaaccctgacttttgactctgatctaggtaataag 32506314  T
Q  199 tttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaaga 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| |||||| |||||||||||||    
T  32506313 tttaacttaagtaatcaagctagagataggtcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaatacctccaacggtttcgaattcacttaaga 32506214  T
Q  299 gattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaact 398  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |    
T  32506213 gattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaatt 32506114  T
Q  399 aggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32506113 aggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattc 32506076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 34065934 - 34066368
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||    
T  34065934 taatcttatgggaatcctaatttgttgaacttttttgaatatcaatgaaaatctagttttaattcatattacgttatgtttaatgctttttgtac-gttt 34066032  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34066033 atcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactctgacctaggtaataagtt 34066132  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34066133 taacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacatagagattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagaga 34066232  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  34066233 ttaaggggttgtcacttgcggagagaattcaaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctatcgttaaactagataatcattgattgaattag 34066332  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34066333 gagtgcaaattatcataggagaacttcggaggattc 34066368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 1936217 - 1936650
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1936217 taatcttatgggaaccataatttgttgaactcctttgaatatcaatggaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtat-gttt 1936315  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| |||    
T  1936316 atcatcgactactaaccctaactttatgaatatgaaaattgatcttagagattaaatgaccactaaccatggctttcgaatttgatccaggtaataagtt 1936415  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || | |||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  1936416 taacctaagtaatcatgctagagatagatcattattaggttatgacatagggaataacattcttttaaaacct-caaacgtttcaaattcacttaagaga 1936514  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||    
T  1936515 ttaagggattgttacttgcggggagaactataaatcaagagatttggtagagttactttgttaatctttcgtgaagctagataatcattgattgaactag 1936614  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1936615 gagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattc 1936650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23990743 - 23990361
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |  | ||||||||| |||| ||||| ||||  || | || |||| ||||||||| ||||    
T  23990743 taatcttatgggaacactaatttgttgaactcctctgaatatttaagaaagtctagttttaattcacattatattatcttcaatgttttttgtat-gttt 23990645  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgtta----gagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaata 196  Q
    ||||| |||||||||     ||||||||||||||||||||||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23990644 atcattgactactaa-----gctttatgaatatgcaaattgatctaattaagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaata 23990550  T
Q  197 ggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaa 296  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  23990549 agtttaacctaagtaatcaagctagagattgatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaa 23990450  T
Q  297 gagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataat 385  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23990449 gagtttaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagtgattgggtagaattactttgttaatctgtcgttgaactagataat 23990361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 145 - 436
Target Start/End: Original strand, 39545975 - 39546266
Alignment:
Q  145 ttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatg 244  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39545975 ttagagaatgaatgacaactaacaatggattttgactctgatctaggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatg 39546074  T
Q  245 acatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagatt 344  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39546075 acatagggattaacgttctattaaaacctccaacgatttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaattctaggtcaagagatt 39546174  T
Q  345 gggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39546175 gggtagagttactttgttaatctgtcgtgaaactagataatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaggattc 39546266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16190832 - 16190399
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactccttt-----gaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtat 95  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||     |||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16190832 taatcttataggaaccctaatttgttgaactcctttaatttgaatatcaatgaaagtctagttttaatttatattactttatgtttaatgctttttgtat 16190733  T
Q  96 tgtttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaat 195  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16190732 -gtttatcatcgactactaaccttagctttatgaatatgcaaattgatcctagagattggatgaccactaaccttggcttttaactctgatctaggtaat 16190634  T
Q  196 aggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcactta 295  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||           |||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  16190633 aagtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcaatattaggttatgacataggga-----------ttaaaacctccaacggtttcgaattcactta 16190545  T
Q  296 agag----attaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtaga-gttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttg 390  Q
    ||||    ||||||| ||||| ||| | |||||||| | | ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  16190544 agagattaattaaggggttgtcactcgtggggagaattatgggtcaagagattgggtatatattattttgttaatttgtcgttaaactagataatcattg 16190445  T
Q  391 attgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
     ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16190444 cttgaattaagagtgcaaattatcataggagaacttcggaggattc 16190399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22457123 - 22456714
Alignment:
Q  26 tgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatc--gactactaactctagc- 122  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||| | ||||||| |||||| ||   |||||||| | |||||     
T  22457123 tgaactcccttgaattttaatggaagtctagttttaattcatattacctt-tgttcaatgttgtttgtat-gtttattatattgactactagcactagcg 22457026  T
Q  123 tttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctaga 222  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22457025 tttttgaatatgcaaactgatcttagaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgttttaggtaataggtttaacctaagtaattaagcaaga 22456926  T
Q  223 gatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggg 322  Q
    ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  22456925 gatagaaaattattaggttatgactcatggattaacggactgttaaaacctccaacagtttcgaattcacttaagagattaa-gagttgtcacttgcgga 22456827  T
Q  323 gagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggaga 422  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  | | ||||||||| |||| || | |||| ||||||||||    
T  22456826 gagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttagtctgtcgttaaactagacgaacattgattgaa-taggggtacaaatttccataggaga 22456728  T
Q  423 actttggaggattc 436  Q
    |||| |||||||||    
T  22456727 acttcggaggattc 22456714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 416
Target Start/End: Original strand, 21152871 - 21153259
Alignment:
Q  26 tgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaactctagcttt 125  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| | || ||||||||| | ||| ||| |||||| || |||||||| | ||||| |     
T  21152871 tgaactcccttgaatatcaatgaaagtctagttta-attcatatttccttctgtttaatgttgtttatat-gtttatgattgactactagcactagcatc 21152968  T
Q  126 atgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagat 225  Q
     ||||| || |||||||  |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21152969 ttgaatgtgtaaattgaacttagaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgatctagggaatatatttaacctaagtaattaagctagagat 21153068  T
Q  226 agatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggag 325  Q
    |||   ||||||||||||||  || |||||||||   | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  21153069 agacagttattaggttatgatttagggattaacggactattaaaacctccaaaggtttcaaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagag 21153168  T
Q  326 aactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccat 416  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || | | ||||||||| | || |||| |||||||||    
T  21153169 aattctaggtcaagagattgagtagaattactgtgttaatctgtcgttaaactaaatgaacattgattgaattgggggtgcaaattaccat 21153259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22453641 - 22453415
Alignment:
Q  152 ttgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatg 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  22453641 ttgaatgaccactagccctggcttttgactctgatttaggtaataggtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatgactcatg 22453542  T
Q  252 gattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtaga 351  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22453541 gattaacggactgttaaaacctccaacagtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtaga 22453442  T
Q  352 gttactttgttaatctgtcgttgaact 378  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22453441 attactttgttaatctgtcgttaaact 22453415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 74 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22104952 - 22104683
Alignment:
Q  74 ttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggc 173  Q
    |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||     
T  22104952 ttgtgtttaatgttttgtgtag-gtttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaattctggt 22104854  T
Q  174 ttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatct 273  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||    
T  22104853 ttttaactctgaactatgtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct-ttaatacct 22104755  T
Q  274 ccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgg 346  Q
    |||| | |||  |||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22104754 ccaacgattttgaattcacttaagagattaagg-tctgtcacttacggggagaattctaggtcaagagattgg 22104683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 15297047 - 15297302
Alignment:
Q  127 tgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagata 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15297047 tgaatatgcaaattgatcttagaacttgaatgaccactagctctggcttttgaatctgatctaggtaatagttttaacctaagtaattaagttagagata 15297146  T
Q  227 gatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggaga 326  Q
    ||  ||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| | ||||    
T  15297147 gaaaattattaggttatgactcatggattaacggactgttaaaacctccaacagtttcaaattcacttaagagatttaagggttgtcacttgcagagaga 15297246  T
Q  327 actctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagat 382  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15297247 attctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagat 15297302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 322 - 436
Target Start/End: Original strand, 10764829 - 10764943
Alignment:
Q  322 ggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggag 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  10764829 ggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaattaggagtgcaagttaccataggag 10764928  T
Q  422 aactttggaggattc 436  Q
    |||||  ||||||||    
T  10764929 aacttcagaggattc 10764943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 10759711 - 10759814
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  10759711 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattactttatgttttatgctttttgta-tgttt 10759809  T
Q  101 atcat 105  Q
    |||||    
T  10759810 atcat 10759814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 436
Target Start/End: Original strand, 49147825 - 49147921
Alignment:
Q  339 gagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||| |||| || | |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  49147825 gagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagacgaacattgattgaa-taggggtacaaatttccataggagaacttcggaggattc 49147921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 95
Target Start/End: Original strand, 49147722 - 49147791
Alignment:
Q  26 tgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtat 95  Q
    |||| ||| |||||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  49147722 tgaattcccttgaattttaatggaagtctagttttaattcatattaccttgtgtttaatgttgtttgtat 49147791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 6 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 23673995 - 23673566
Alignment:
Q  6 ctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcat 105  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23673995 ctatgggaaccttaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtat-gtttatcat 23673897  T
Q  106 cgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacc 205  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23673896 cgactactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactatccctgacttttgactctgatctaggtaataagtttaacc 23673797  T
Q  206 taagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaag 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23673796 taagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaactgtttcgaattcacttaagagattaag 23673697  T
Q  306 gagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtg 405  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23673696 gggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatttgtcgttaaactagataatcattgattgaattaggagtg 23673597  T
Q  406 cgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23673596 caaattaccataggagaacttcggaggattc 23673566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 36326514 - 36326950
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||    
T  36326514 taatcctatgggaaccctagtttgttgaactcatttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgt---gttt 36326610  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  36326611 atcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaatcgatcttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactttgatctaggtaataagtt 36326710  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttca----aattcacttaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||    |||||||||||    
T  36326711 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggctatgacacagggattaacgttctgttaatacctccaacagtttcaaattaattcacttaa 36326810  T
Q  297 gagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaa 396  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||    
T  36326811 gagattaaggagttgtcacttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctatcgttaaattagataatcattgcttgaa 36326910  T
Q  397 ctaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36326911 ttaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaggattc 36326950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 13709661 - 13710085
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13709661 taatcctatgtgaaccctaatttgttgaacttcaa-gaatatcaatgaaagtctaattttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtat-gttt 13709758  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||    
T  13709759 atcatcgactactaaccctagctttatgaatatgtaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctggattttgactctgacctaggtgataagtt 13709858  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||    
T  13709859 taacccaagtaatcaagctagatatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttttgttaaaacctccaacgatttcgaattcactaaagaga 13709958  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | || |||    
T  13709959 ttatggggttgtcacttgaggggagaattatgggtcaagagatcgggtagaattactttgttaatctgttgttgaactagataatcattgcctaaattag 13710058  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaacttt 427  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  13710059 gagtgcaaattatcataggagagcttt 13710085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 62 - 436
Target Start/End: Original strand, 16294550 - 16294922
Alignment:
Q  62 attcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgacc 161  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||    
T  16294550 attcatattaccttgtgtttaatgctttgtgtat-gtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacc 16294648  T
Q  162 actaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgtt 261  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16294649 actaactctggcttttaactctgaactatgtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgtt 16294748  T
Q  262 atgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgt 361  Q
     | |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  16294749 ct-ttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagt 16294847  T
Q  362 taatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16294848 taatctgtcgtgaaactaaataatcattgattaaactaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattc 16294922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 40017567 - 40018003
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  40017567 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatttcaatgaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtat-gttt 40017665  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  40017666 atcatcgactactgaccctatctttatgaatatgcaaattgatcgtagagattgaatgaccactgaccctggcttttgactttgaactaggtaataagtt 40017765  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  40017766 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggtcatgacatatgaattaacgttcttttaatacctccaacagtttcgaattcacttaagaga 40017865  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaac---tagataatcgttgattgaac 397  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||  ||||  |||||||||||||  |||   || |||||| ||| |||||     
T  40017866 ataagg-gttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaaggattggggagaagtactgagttaatctgtcgtaaaacttataaataatcattggttgaat 40017964  T
Q  398 taggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||    
T  40017965 taggagtgcaaattaccataggagagtttcggaggattc 40018003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 31527979 - 31528413
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||  ||||    
T  31527979 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcttattactttgtgcttaatgccttatgtac-gttt 31528077  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    || || ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  31528078 atgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtt 31528177  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31528178 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-cgttaatacctccattggtttcgaattcacttaagaga 31528276  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattg-aacta 399  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||| |||||| ||||| | |  ||    
T  31528277 ttaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtattta 31528376  T
Q  400 ggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  31528377 ggagtgcaaattaccacaggagagctttagaggattc 31528413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 61 - 436
Target Start/End: Original strand, 31626199 - 31626573
Alignment:
Q  61 tattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgac 160  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||    
T  31626199 tattcatattaccctgtgtttaatgttttatgtat-gtttatcatcgactattaaccctagctttatgaatatacatattgattatagaaattgaatgac 31626297  T
Q  161 cactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgt 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31626298 cactaaccctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttataacataaggattaacgt 31626397  T
Q  261 tatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttg 360  Q
    | | |||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  31626398 tcttttaatacctccaacgatttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaag 31626497  T
Q  361 ttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31626498 ttaatctgtcgtgaaactaaataataattgattgaattaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattc 31626573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 32576341 - 32575908
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  32576341 taatcctataggaaccctaatttgttgaactcctttgaatttcaatgaaagtttagtctttatccatattactttttgtt-aatgctttttgcat-gttt 32576244  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  32576243 atcattgactactgatcctaactttatgaatatgcaaattgatcgtatagattgaatgatcactgaccctgtcttttgactatgaactaggtaatatgtt 32576144  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| | ||||||   |||| |||||| | ||||||    
T  32576143 taacctaaataatcaagctaaagatagatctttattaggttacgacatagggattaacgttcttttaatacctccaacaatttcgaattcagtcaagaga 32576044  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||    
T  32576043 ttaaggggttgtcacttgtggggagaattctaggtcaagggatttggtagagttactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattttttgaactag 32575944  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  32575943 gagtgcaaattatcataggagagcttcggaggattc 32575908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 259
Target Start/End: Original strand, 8426766 - 8426844
Alignment:
Q  181 tctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacg 259  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  || |||||||||    
T  8426766 tctgatctaggaaacatgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatgatttagggattaacg 8426844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 31626137 - 31626176
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaat 40  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31626137 taatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaat 31626176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6465 - 6032
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6465 taatcttatgggaaccttaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtc-agtgtttattcatgttactttatgtttaatgctttttgtat-gttt 6368  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6367 atcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctgacttttgactctgaactaggtaataagtt 6268  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||    
T  6267 taatctaagtaatcaacctagagatagatcattattaggttatgacatagggtttaacgttctgttaaaacctccaatgattttgaattcacttaagaga 6168  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||| |||    
T  6167 ttaaggggttgccacttgcggggagaattctagatcaagagattgggtagagttattgtgttaatctgtcgtgaacctagataatcattgtttgaattag 6068  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
     ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6067 tagtgcaaattaccataggagaacctcggaggattc 6032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12575955 - 12575521
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||    
T  12575955 taatcctataggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgttcaacgctttttgtatc-ttt 12575857  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||| || |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12575856 atcatcaacaactagccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgactactaaccttggcttttgactttgatcaaggtaataggtt 12575757  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12575756 taacataagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgatataaggattaacgtattgttaaaacctccaatggtttctaattcacttaagaga 12575657  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctagg-tcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaacta 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||    
T  12575656 ttaagg-gttgttacttgcggggagaattctaggtttaagagattaggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagattatcattgcttgaatta 12575558  T
Q  400 ggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  12575557 ggagtgcaaattaccataagaaaacttcggaggattc 12575521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 13096620 - 13097044
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||          ||||||||||||| |||| ||||    
T  13096620 taatcctatgggaaccctgatttattgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattgat----------gtttaatgctttt-gtat-gttt 13096707  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaac-cctggc-ttttgactctgatctaggtaatagg 198  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| |    
T  13096708 atcatcgactactatccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgatcactaactcctggccttttaactctgacctaggtaataag 13096807  T
Q  199 tttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaaga 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  13096808 tttaagctaagtaatcaagctagagatagatcattattagattatgacatagggatttacgttctgttaaaacctcccacggtttcaaattcacttaaga 13096907  T
Q  299 gattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaact 398  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| || || |    
T  13096908 cattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggccaagagattgggtagaattactttgttaatctttcattgaactagataatcattgcttaaatt 13097007  T
Q  399 aggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  13097008 aggagtgcaaatta-cataggataacttcggaggattc 13097044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 436
Target Start/End: Original strand, 44007909 - 44008319
Alignment:
Q  18 taatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaact 117  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||     
T  44007909 taatttgttgaactcctttgaatttcaattaaagtttagtctttattcttattactctttgtttaatgcttttt-tat-gtttatcatcgactattgacc 44008006  T
Q  118 ctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaag 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44008007 ctagctttatgaaaatgcaaattgaccgtagagattgaatgaacactgactctggcttttgattctgaactaggtaataagtttaacctaactaatcaag 44008106  T
Q  218 ctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttactt 317  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| | |||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44008107 ctagaaatagatcattgttaggttacgacacagggattaacgttcttttaatacctccaacgatttcaaattcacttatgagattaaggagttgtcactt 44008206  T
Q  318 gcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccata 417  Q
    || ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||     |||||| ||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| |    
T  44008207 gc-gggagaattctaggtcgagggatttggtagagttac-----taatctatcgtgaaactaaataatcattgtttgaactaggagtgcagattaccaaa 44008300  T
Q  418 ggagaactttggaggattc 436  Q
    || || ||| |||||||||    
T  44008301 ggcgagcttcggaggattc 44008319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 176 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41779216 - 41778964
Alignment:
Q  176 ttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctcc 275  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||   || || |      
T  41779216 ttgactctgaactaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattgacataat---aacattt-- 41779122  T
Q  276 aatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttga 375  Q
      ||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |    
T  41779121 --tggttttgaattcacttaagatattaaggggttgccacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagagttattgtgttaatctgtcgtgaa 41779024  T
Q  376 actagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggatt 435  Q
     |||||||||| ||| ||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  41779023 cctagataatcattgtttgaattactagtgcaaattagcataggagaacttcggaagatt 41778964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 41779318 - 41779218
Alignment:
Q  15 ccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactacta 114  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41779318 ccctaatttgttgaactcctttaaatatcaatgaaagtttagtctttatccatgttactttatgtttaatgctttttgta-tgtttatcatcgaccacta 41779220  T
Q  115 ac 116  Q
    ||    
T  41779219 ac 41779218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 261
Target Start/End: Original strand, 14418355 - 14418397
Alignment:
Q  219 tagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgtt 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  14418355 tagagatagatcattattagattatgatatagggattaacgtt 14418397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7648 - 7228
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  7648 taatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacataaatgaaagtttagtttttattcatattactttgagtttaatgctttatgtat-gttt 7550  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  7549 atcatcgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaatttgattgaccactaaccctggctttttactcagaactaggtaataggtt 7450  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7449 taacctaagtaataaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagaga 7350  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||    
T  7349 ttaaggggttgtcacttgcggggagaattctaagtcaagagattgaatagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattgaattag 7250  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggaga 422  Q
    |||| | |||||||||||||||    
T  7249 gagtacaaattaccataggaga 7228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 7)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 39564153 - 39563732
Alignment:
Q  13 aaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactac 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||     
T  39564153 aaccctaatttgttgaactcctttgaacattaatgaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttatgtat-gtttatcattgactat 39564055  T
Q  113 taactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaa 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39564054 taaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctgacttttaa-tctgaactaggtaataggtttaacctaagtaa 39563956  T
Q  213 tcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39563955 tcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgt 39563856  T
Q  313 tacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaatta 412  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||||    
T  39563855 cacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataaccattgattgaattaggagtgcaaatta 39563756  T
Q  413 ccataggagaactttggaggattc 436  Q
     ||||||||| | | |||||||||    
T  39563755 tcataggagagcgtcggaggattc 39563732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22626968 - 22626532
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||    
T  22626968 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattactttgtgcttaatgccttatgtat-gttt 22626870  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    || || ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  22626869 atgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtt 22626770  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagata-gatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagag 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22626769 taacctaagtaatcaagctagagataagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagag 22626670  T
Q  300 attaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattg-aact 398  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||  ||||| |||||| ||||| | |  |    
T  22626669 attaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattggatagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtattt 22626570  T
Q  399 aggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22626569 aggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattc 22626532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 11139224 - 11138790
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||    
T  11139224 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattactttgtgcttaatgccttatgtat-gttt 11139126  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    || ||  |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  11139125 atgataaactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatggccactaaccctggcttttaactctgaaatag-taataggtt 11139027  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11139026 taacctcagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctcctatggtttcgaattcacttaagaga 11138927  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattg-aacta 399  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||  ||||| |||||| ||||| | |  ||    
T  11138926 ttaaggagttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattggatagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtattta 11138827  T
Q  400 ggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11138826 ggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattc 11138790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 13979080 - 13979510
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||        
T  13979080 taatcttatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatttaaatgaaagtttagtcttttttcatattactttttgtttaatgtttttcgtatt---- 13979175  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  13979176 atcatcgactactgaccctagctttatgaa-atgcaaattgatcgtagagattgaatgaccactgaccctgactttcgactctgaactaggtaatagttt 13979274  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| || | |||| |||||||||||||||    
T  13979275 taacttaagtaatcaagttggagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctcgaacgatttcgaattcacttaagaga 13979374  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactag 400  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| |  ||||| |||||| ||| ||||||| |    
T  13979375 ttaagaggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagggattggatagagttactaagttaatctgtcatgaaactaaataatcattgtttgaacttg 13979474  T
Q  401 gagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13979475 gagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattc 13979510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 62 - 435
Target Start/End: Original strand, 35366028 - 35366398
Alignment:
Q  62 attcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgacc 161  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||| || |||||||| | ||||| |  ||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  35366028 attcatattaccttgtgtttaatgttgttt-tat-gtttattattgactactagcactagcatcgtgaatgtgcaaattgatcttaaaacttgaatgacc 35366125  T
Q  162 actaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgtt 261  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||      
T  35366126 actagccttggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaattaagttagagatagaaaattattaggctatgactcatggattaacgga 35366225  T
Q  262 atgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgt 361  Q
     |||||||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||    
T  35366226 ctgttaaaacctccaagagtcttgaattcacttaagagattaagggattgtcactcgcggagagagttctaggtcaagagattgagtagaattatcttgt 35366325  T
Q  362 taatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggatt 435  Q
    |||| ||||||| || || || | | ||||||||| | || |||| ||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  35366326 taatttgtcgttaaattatatgaacattgattgaa-ttggggtgcaaattaccgtagaagaacattagaggatt 35366398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 436
Target Start/End: Original strand, 47411806 - 47412206
Alignment:
Q  26 tgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaactctagcttt 125  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| || |||||||| | ||| |||     
T  47411806 tgaactcccttgaatatcaatgaaagtctagttta-attcatattaccttgtgtttaatgttgtttgtat-gtttattattgactactagcactaacttc 47411903  T
Q  126 atgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagat 225  Q
     |||||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  47411904 ttgaatatgaaaattgatcttagaacttgaatgatcactagtcctgccttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaattaagttagagat 47412003  T
Q  226 agatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggag 325  Q
    |||  |||||||| || ||||  |  |||||||    |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||        |||| |||||||| |||    
T  47412004 agaaaattattagattgtgactcagagattaacagactgttaaaatctctaatagtcccgaattcacttaagaga--------ttgtcacttgcggagag 47412095  T
Q  326 aactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcgaattaccataggagaact 425  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||||| ||| || ||||| | | ||||||||| |  | |||| ||||||| ||| |||||     
T  47412096 aattctaggtcaagagattgagtagaattatcgtgttaatctgttgttaaattagatgaacattgattgaattgtgggtgcaaattaccgtagaagaaca 47412195  T
Q  426 ttggaggattc 436  Q
    || ||||||||    
T  47412196 ttagaggattc 47412206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 308 - 436
Target Start/End: Original strand, 46731390 - 46731518
Alignment:
Q  308 gttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaactaggagtgcg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  46731390 gttgttacttgcggggagaactccaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatatgtcgttgaactagataatcattgattgaattaggagtgca 46731489  T
Q  408 aattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  46731490 aattaccatatgagaacttcggaggattc 46731518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 2281 - 2703
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2281 taatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacttcaatgaaagtttagtctttattcatattactttgtgtttaatgctttatgtat-gttt 2379  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2380 atcatcaactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaaataaatgaccactaaccctggctttttactctgaactaggtaataggtt 2479  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2480 tgacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggatcaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagaga 2579  T
Q  301 ttaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtaga--gttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaact 398  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||  |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |    
T  2580 tttaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgagtagaatattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattgaatt 2679  T
Q  399 aggagtgcgaattaccataggaga 422  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  2680 aggagtgcaagttaccataggaga 2703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 3263 - 2825
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactt---tgtgtttaatgctttttgtattg 97  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| || | |||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |    
T  3263 taatcttatggaaatcctaatttgttgaactcatttgaatttaaatgaaagtttagtctttactcatattacttctttgtgtttaatgttttttgtat-g 3165  T
Q  98 tttatcatcgactactaactctagcttt-atgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaata 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||  |||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||    
T  3164 tttatcatcgactactaaccctagcttttatgaatatgcaaattgatcacagaatttgaatgaacactaaccatggctttcaactctgaactaggtaata 3065  T
Q  197 ggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaa 296  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | |||| | ||||||| ||||  |||||||||||    
T  3064 cgtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattagattatgacacaaggattaacgttcttttaatacctccaatagttttgaattcacttaa 2965  T
Q  297 gagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattgaa 396  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||| ||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  2964 gagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagatttggtagaattactaccttaatctttcgtgaaactatataatcattgattgaa 2865  T
Q  397 ctaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2864 ctaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattc 2825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 300 - 1
Alignment:
Q  1 taatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  300 taatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattactttatgttttatgctttttgtat-gttt 202  T
Q  101 atcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  201 atcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgactactaaccctggtttttgactctgatctaggtaataagtt 102  T
Q  201 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagaga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  101 taacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagaga 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 98 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24743 - 24404
Alignment:
Q  98 tttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaatag 197  Q
    ||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  24743 tttatgatagactattaaccatagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaaccaggtaatag 24644  T
Q  198 gtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||   ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24643 gtttaacctaagtaatcaagctagagatatatcattattaggttatgatatagggattaacgtttatttaattcctccaatggtttcgaattcacataag 24544  T
Q  298 agattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattg-aa 396  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||   |||| |||||| || |||| |     
T  24543 agattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgatactaaataatcatttattgtat 24444  T
Q  397 ctaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24443 ttaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattc 24404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 156 - 436
Target Start/End: Original strand, 9606 - 9887
Alignment:
Q  156 atgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggatt 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  9606 atgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctaaagatagatcattattaggttatgatatagggatt 9705  T
Q  256 aacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagtta 355  Q
    ||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9706 aacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaatta 9805  T
Q  356 ctttgttaatctgtcgttgaactagataatcgttgattg-aactaggagtgcgaattaccataggagaactttggaggattc 436  Q
    ||  ||||||| |||||  ||||| |||||| ||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  9806 ctaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattc 9887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 363 - 321
Alignment:
Q  219 tagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgtt 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  363 tagagatagatcattattagattatgatatagggattaacgtt 321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University