View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19912_low_1 (Length: 258)

Name: NF19912_low_1
Description: NF19912
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19912_low_1
NF19912_low_1
[»] chr5 (97 HSPs)
chr5 (1-241)||(30687905-30688145)
chr5 (1-241)||(29302095-29302335)
chr5 (1-241)||(15808927-15809167)
chr5 (1-241)||(4736751-4736987)
chr5 (1-241)||(17604998-17605236)
chr5 (1-224)||(11448706-11448929)
chr5 (1-241)||(33026184-33026424)
chr5 (1-210)||(1951424-1951632)
chr5 (1-241)||(1921417-1921656)
chr5 (1-241)||(33282213-33282451)
chr5 (9-241)||(3960637-3960867)
chr5 (1-233)||(26905862-26906090)
chr5 (1-238)||(37282142-37282375)
chr5 (1-239)||(30667572-30667806)
chr5 (1-229)||(17209865-17210091)
chr5 (44-241)||(33833087-33833284)
chr5 (1-148)||(37249351-37249498)
chr5 (11-241)||(6436377-6436603)
chr5 (112-241)||(14795648-14795777)
chr5 (11-241)||(4737886-4738112)
chr5 (86-239)||(27005155-27005308)
chr5 (104-241)||(30486066-30486203)
chr5 (11-241)||(14369721-14369947)
chr5 (11-241)||(25912044-25912270)
chr5 (1-238)||(37468502-37468729)
chr5 (11-241)||(13711033-13711261)
chr5 (11-241)||(17421648-17421874)
chr5 (1-122)||(17559215-17559335)
chr5 (33-241)||(31240268-31240472)
chr5 (7-241)||(2528721-2528953)
chr5 (11-241)||(12910024-12910250)
chr5 (16-241)||(10951009-10951230)
chr5 (109-241)||(7014482-7014614)
chr5 (11-241)||(28747716-28747943)
chr5 (11-241)||(33696007-33696233)
chr5 (11-228)||(4083705-4083918)
chr5 (1-238)||(2695088-2695320)
chr5 (92-241)||(3038841-3038988)
chr5 (11-228)||(7944254-7944467)
chr5 (38-134)||(38661242-38661337)
chr5 (1-116)||(1807474-1807587)
chr5 (92-241)||(39548921-39549068)
chr5 (11-241)||(22701746-22701972)
chr5 (11-182)||(31752128-31752296)
chr5 (112-190)||(1797420-1797498)
chr5 (11-241)||(17232918-17233140)
chr5 (1-98)||(22282203-22282301)
chr5 (13-241)||(39038473-39038698)
chr5 (78-239)||(8410685-8410844)
chr5 (11-241)||(6260993-6261219)
chr5 (11-191)||(9124705-9124884)
chr5 (1-69)||(7014630-7014698)
chr5 (148-241)||(40234211-40234302)
chr5 (11-137)||(857945-858070)
chr5 (11-242)||(22800642-22800864)
chr5 (176-240)||(38661179-38661243)
chr5 (92-227)||(17233353-17233486)
chr5 (184-241)||(39999193-39999250)
chr5 (11-180)||(4150976-4151148)
chr5 (161-241)||(22213127-22213207)
chr5 (161-241)||(31752400-31752479)
chr5 (1-60)||(25912180-25912239)
chr5 (11-182)||(33832728-33832898)
chr5 (1-60)||(4737917-4737976)
chr5 (1-60)||(14369752-14369811)
chr5 (11-74)||(32736377-32736440)
chr5 (203-241)||(4736983-4737021)
chr5 (1-55)||(25593288-25593342)
chr5 (110-191)||(17232868-17232949)
chr5 (204-241)||(26906087-26906124)
chr5 (81-156)||(31752182-31752257)
chr5 (178-241)||(857863-857925)
chr5 (1-60)||(3038872-3038931)
chr5 (11-74)||(11351820-11351883)
chr5 (1-60)||(12910160-12910219)
chr5 (1-60)||(22701881-22701940)
chr5 (1-60)||(31240382-31240441)
chr5 (203-238)||(37282371-37282406)
chr5 (203-238)||(37468725-37468760)
chr5 (1-60)||(40234212-40234271)
chr5 (203-241)||(1921652-1921690)
chr5 (203-241)||(15809163-15809201)
chr5 (11-69)||(17210138-17210195)
chr5 (203-241)||(29302061-29302099)
chr5 (203-241)||(30667538-30667576)
chr5 (203-241)||(30687871-30687909)
chr5 (1-47)||(33696051-33696097)
chr5 (203-241)||(37249494-37249532)
chr5 (133-182)||(8318124-8318173)
chr5 (78-142)||(26905963-26906027)
chr5 (1-46)||(27365812-27365857)
chr5 (203-235)||(1951396-1951428)
chr5 (1-60)||(7944272-7944332)
chr5 (78-137)||(15809038-15809097)
chr5 (78-137)||(17209936-17209995)
chr5 (78-137)||(38661246-38661305)
chr5 (108-184)||(38952198-38952273)
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (1-241)||(39906271-39906511)
chr2 (1-241)||(39904620-39904859)
chr2 (1-241)||(44542814-44543053)
chr2 (1-241)||(7682007-7682245)
chr2 (1-241)||(6332278-6332517)
chr2 (1-239)||(2586348-2586585)
chr2 (1-241)||(38986926-38987164)
chr2 (1-241)||(20939712-20939951)
chr2 (1-238)||(4293206-4293442)
chr2 (1-238)||(9689377-9689614)
chr2 (1-233)||(44257431-44257664)
chr2 (1-241)||(30406463-30406702)
chr2 (1-228)||(22301980-22302206)
chr2 (1-241)||(22711035-22711274)
chr2 (12-241)||(9690171-9690399)
chr2 (1-241)||(15554024-15554263)
chr2 (3-238)||(33173467-33173700)
chr2 (45-213)||(324933-325101)
chr2 (11-241)||(34082566-34082792)
chr2 (108-241)||(3769419-3769552)
chr2 (11-241)||(16513043-16513266)
chr2 (1-118)||(3769653-3769769)
chr2 (11-241)||(8386696-8386925)
chr2 (11-233)||(11675151-11675370)
chr2 (11-241)||(13001991-13002217)
chr2 (11-241)||(18370231-18370457)
chr2 (11-238)||(1750161-1750383)
chr2 (11-241)||(29512044-29512272)
chr2 (1-171)||(1297592-1297746)
chr2 (12-241)||(16075014-16075237)
chr2 (106-238)||(8741601-8741733)
chr2 (11-158)||(33739546-33739691)
chr2 (11-241)||(37169556-37169781)
chr2 (11-241)||(42850015-42850241)
chr2 (11-191)||(23387144-23387322)
chr2 (1-102)||(19630754-19630855)
chr2 (1-102)||(19827655-19827756)
chr2 (128-241)||(23234017-23234130)
chr2 (33-241)||(29403914-29404118)
chr2 (99-239)||(17265356-17265494)
chr2 (11-238)||(23664747-23664971)
chr2 (11-185)||(768568-768740)
chr2 (6-125)||(23387063-23387181)
chr2 (11-185)||(1576652-1576823)
chr2 (166-241)||(33740105-33740179)
chr2 (167-241)||(41527828-41527901)
chr2 (176-241)||(27337055-27337119)
chr2 (185-241)||(41927549-41927604)
chr2 (1-60)||(11675288-11675347)
chr2 (1-60)||(34082702-34082761)
chr2 (203-241)||(19630720-19630758)
chr2 (203-241)||(19827621-19827659)
chr2 (203-241)||(23175360-23175398)
chr2 (203-241)||(23586617-23586655)
chr2 (11-170)||(43660694-43660857)
chr2 (203-241)||(44257660-44257698)
chr2 (11-47)||(324757-324793)
chr2 (1-60)||(18370367-18370426)
chr2 (11-74)||(29511965-29512028)
chr2 (1-60)||(29512075-29512134)
chr2 (203-241)||(7681973-7682011)
chr2 (203-241)||(9689343-9689381)
chr2 (2-60)||(16513074-16513132)
chr2 (203-241)||(17264897-17264935)
chr2 (203-241)||(30406429-30406467)
chr2 (1-47)||(37169691-37169737)
chr2 (203-241)||(38987160-38987198)
chr2 (102-188)||(43660829-43660915)
chr2 (203-241)||(44543049-44543087)
chr2 (1-46)||(4206529-4206574)
chr2 (78-142)||(33173575-33173639)
chr2 (204-241)||(39906237-39906274)
chr2 (161-194)||(41528057-41528090)
chr2 (11-60)||(45629736-45629785)
chr2 (161-194)||(45629737-45629770)
chr2 (78-137)||(2586457-2586516)
chr2 (78-137)||(7682076-7682135)
chr2 (142-194)||(20939705-20939756)
chr2 (78-137)||(22302049-22302108)
chr2 (203-235)||(22711007-22711039)
chr2 (102-142)||(44288809-44288849)
chr2 (78-137)||(44542925-44542984)
chr2 (205-241)||(45629690-45629726)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (1-241)||(31132867-31133107)
chr6 (1-241)||(29646183-29646422)
chr6 (1-241)||(27828298-27828542)
chr6 (1-236)||(9955786-9956021)
chr6 (1-241)||(15962728-15962969)
chr6 (1-241)||(1369890-1370129)
chr6 (1-229)||(11100371-11100599)
chr6 (1-233)||(10777934-10778166)
chr6 (1-241)||(4184252-4184491)
chr6 (1-241)||(8171843-8172082)
chr6 (1-241)||(16599060-16599300)
chr6 (1-241)||(5187761-5187999)
chr6 (1-171)||(26667856-26668026)
chr6 (71-241)||(20755416-20755586)
chr6 (11-241)||(33730487-33730710)
chr6 (1-241)||(26211270-26211507)
chr6 (1-103)||(15881917-15882018)
chr6 (11-241)||(4898447-4898673)
chr6 (11-241)||(14488264-14488490)
chr6 (1-110)||(11210288-11210396)
chr6 (1-98)||(10196574-10196671)
chr6 (11-241)||(4838241-4838473)
chr6 (11-241)||(18102654-18102881)
chr6 (1-98)||(24022847-24022944)
chr6 (114-241)||(10315306-10315434)
chr6 (30-241)||(30525374-30525581)
chr6 (146-241)||(15882021-15882116)
chr6 (8-99)||(35001995-35002085)
chr6 (11-238)||(3437994-3438217)
chr6 (11-241)||(4898128-4898355)
chr6 (11-241)||(25061627-25061845)
chr6 (78-241)||(18154510-18154671)
chr6 (11-241)||(15718174-15718401)
chr6 (11-241)||(11742288-11742514)
chr6 (11-217)||(21969895-21970097)
chr6 (1-173)||(9406615-9406785)
chr6 (28-238)||(11009932-11010140)
chr6 (161-241)||(32194181-32194260)
chr6 (16-83)||(33311671-33311738)
chr6 (109-190)||(32889636-32889715)
chr6 (1-60)||(4898583-4898642)
chr6 (11-181)||(11100081-11100251)
chr6 (148-235)||(228035-228119)
chr6 (203-241)||(8172078-8172116)
chr6 (203-241)||(11100337-11100375)
chr6 (203-241)||(15881883-15881921)
chr6 (161-194)||(3881411-3881444)
chr6 (1-113)||(8062106-8062216)
chr6 (188-241)||(27902280-27902335)
chr6 (1-60)||(33730518-33730577)
chr6 (1-47)||(3438130-3438176)
chr6 (203-241)||(9955752-9955790)
chr6 (203-241)||(29646418-29646456)
chr6 (203-241)||(31132833-31132871)
chr6 (204-241)||(16599026-16599063)
chr6 (204-241)||(20755363-20755400)
chr6 (200-241)||(26211236-26211277)
chr6 (50-157)||(30525393-30525498)
chr6 (11-55)||(5703853-5703897)
chr6 (1-45)||(30525491-30525535)
[»] chr1 (105 HSPs)
chr1 (1-241)||(20411185-20411425)
chr1 (1-241)||(14494357-14494597)
chr1 (1-236)||(27255640-27255875)
chr1 (1-241)||(36817638-36817878)
chr1 (1-241)||(12864249-12864487)
chr1 (1-240)||(39424257-39424495)
chr1 (1-241)||(13385689-13385931)
chr1 (1-241)||(1804945-1805184)
chr1 (1-233)||(27389453-27389686)
chr1 (1-214)||(16960271-16960483)
chr1 (1-241)||(32716363-32716598)
chr1 (1-241)||(43236142-43236390)
chr1 (1-241)||(32374497-32374736)
chr1 (1-201)||(47130911-47131111)
chr1 (81-241)||(14387468-14387628)
chr1 (1-241)||(52772234-52772466)
chr1 (1-224)||(51464996-51465217)
chr1 (1-241)||(28094388-28094614)
chr1 (102-241)||(13943351-13943490)
chr1 (1-138)||(20201757-20201894)
chr1 (11-241)||(26842998-26843224)
chr1 (11-241)||(10764565-10764794)
chr1 (11-241)||(16005533-16005760)
chr1 (11-241)||(13157557-13157786)
chr1 (11-238)||(34515129-34515354)
chr1 (78-241)||(463378-463539)
chr1 (11-241)||(28454672-28454900)
chr1 (1-200)||(27348119-27348313)
chr1 (78-241)||(8642965-8643126)
chr1 (11-241)||(50559250-50559476)
chr1 (11-239)||(6192424-6192650)
chr1 (11-225)||(16073438-16073650)
chr1 (38-241)||(13264502-13264699)
chr1 (1-98)||(28646750-28646847)
chr1 (1-106)||(12010567-12010674)
chr1 (11-241)||(23413606-23413830)
chr1 (79-241)||(27787867-27788028)
chr1 (11-185)||(36389459-36389630)
chr1 (11-240)||(51431815-51432042)
chr1 (11-228)||(34306440-34306657)
chr1 (14-241)||(158417-158640)
chr1 (78-241)||(24770695-24770856)
chr1 (11-241)||(32155952-32156178)
chr1 (11-241)||(41146219-41146445)
chr1 (92-241)||(32994250-32994397)
chr1 (78-241)||(3979443-3979605)
chr1 (151-241)||(12010480-12010569)
chr1 (11-241)||(45818751-45818976)
chr1 (11-141)||(13157281-13157411)
chr1 (11-216)||(42199847-42200048)
chr1 (11-216)||(42208715-42208916)
chr1 (92-238)||(5491681-5491825)
chr1 (11-171)||(3273370-3273528)
chr1 (19-241)||(4158116-4158336)
chr1 (11-241)||(14387255-14387480)
chr1 (8-187)||(24190751-24190929)
chr1 (1-138)||(50797653-50797788)
chr1 (1-47)||(2965334-2965380)
chr1 (11-137)||(33676084-33676209)
chr1 (1-74)||(3099558-3099631)
chr1 (130-238)||(33675794-33675899)
chr1 (101-212)||(47130797-47130907)
chr1 (11-130)||(20201700-20201817)
chr1 (78-156)||(32151931-32152009)
chr1 (11-119)||(28704439-28704545)
chr1 (200-241)||(52772200-52772241)
chr1 (1-60)||(463449-463508)
chr1 (1-60)||(5491738-5491797)
chr1 (1-60)||(13157696-13157755)
chr1 (1-60)||(27787937-27787996)
chr1 (1-60)||(34515267-34515326)
chr1 (203-241)||(13385927-13385965)
chr1 (203-241)||(27389682-27389720)
chr1 (47-156)||(32144028-32144135)
chr1 (83-137)||(32151995-32152049)
chr1 (1-47)||(34306580-34306626)
chr1 (1-46)||(158551-158596)
chr1 (11-60)||(10558212-10558261)
chr1 (1-58)||(34825554-34825611)
chr1 (78-137)||(47130983-47131042)
chr1 (4-47)||(6192565-6192608)
chr1 (1-60)||(13264531-13264590)
chr1 (1-101)||(16005525-16005623)
chr1 (1-60)||(16073576-16073635)
chr1 (1-60)||(26843134-26843193)
chr1 (11-74)||(28764549-28764612)
chr1 (92-139)||(32144130-32144177)
chr1 (1-60)||(42199853-42199912)
chr1 (1-60)||(42208721-42208780)
chr1 (203-241)||(2965376-2965414)
chr1 (1-47)||(4158244-4158290)
chr1 (108-142)||(9005219-9005253)
chr1 (161-223)||(13157416-13157477)
chr1 (203-241)||(20201890-20201928)
chr1 (203-241)||(20411151-20411189)
chr1 (203-241)||(27255606-27255644)
chr1 (1-47)||(33675834-33675880)
chr1 (203-241)||(47131107-47131145)
chr1 (11-60)||(463018-463067)
chr1 (161-194)||(3977973-3978006)
chr1 (11-60)||(32994185-32994234)
chr1 (78-137)||(1805056-1805115)
chr1 (205-241)||(10558271-10558307)
chr1 (168-212)||(28704371-28704414)
chr1 (78-137)||(39424326-39424385)
[»] chr3 (101 HSPs)
chr3 (1-241)||(6114744-6114984)
chr3 (1-241)||(7848490-7848729)
chr3 (1-241)||(21727608-21727848)
chr3 (1-241)||(6109156-6109396)
chr3 (1-241)||(11460113-11460352)
chr3 (1-241)||(47461657-47461897)
chr3 (1-241)||(6748642-6748881)
chr3 (1-241)||(8815295-8815533)
chr3 (31-241)||(26158254-26158464)
chr3 (1-241)||(4043591-4043838)
chr3 (1-241)||(7521321-7521561)
chr3 (1-241)||(12896600-12896840)
chr3 (15-241)||(37504504-37504729)
chr3 (9-241)||(45059532-45059764)
chr3 (1-241)||(27728154-27728396)
chr3 (1-241)||(26152189-26152430)
chr3 (1-232)||(995020-995251)
chr3 (1-238)||(994714-994951)
chr3 (1-241)||(51148004-51148242)
chr3 (1-241)||(3544251-3544490)
chr3 (1-241)||(51952173-51952405)
chr3 (1-241)||(38797939-38798182)
chr3 (1-241)||(17065691-17065928)
chr3 (1-125)||(26152502-26152626)
chr3 (44-229)||(2868198-2868383)
chr3 (105-241)||(17226270-17226406)
chr3 (1-227)||(27800441-27800649)
chr3 (11-241)||(53581518-53581744)
chr3 (11-241)||(31039564-31039790)
chr3 (11-241)||(13349094-13349320)
chr3 (11-241)||(1376004-1376231)
chr3 (138-241)||(21408611-21408714)
chr3 (11-241)||(33837816-33838047)
chr3 (11-241)||(53467358-53467584)
chr3 (1-110)||(3269225-3269333)
chr3 (11-241)||(36823914-36824140)
chr3 (11-241)||(50913007-50913233)
chr3 (1-132)||(52654387-52654517)
chr3 (11-241)||(3800155-3800382)
chr3 (11-241)||(27317598-27317825)
chr3 (11-241)||(8814737-8814963)
chr3 (11-241)||(32203113-32203334)
chr3 (11-241)||(27359956-27360180)
chr3 (144-241)||(48649299-48649396)
chr3 (1-76)||(17226194-17226269)
chr3 (11-178)||(12127562-12127726)
chr3 (11-241)||(48765217-48765446)
chr3 (11-184)||(50801589-50801759)
chr3 (11-184)||(50874121-50874291)
chr3 (37-241)||(26103649-26103848)
chr3 (1-75)||(30347766-30347840)
chr3 (11-235)||(3269334-3269555)
chr3 (1-97)||(48649399-48649496)
chr3 (162-241)||(17604891-17604969)
chr3 (161-241)||(22894903-22894982)
chr3 (183-241)||(45293131-45293189)
chr3 (11-158)||(17605513-17605658)
chr3 (1-44)||(42856964-42857007)
chr3 (78-227)||(34277553-34277700)
chr3 (11-139)||(22894554-22894679)
chr3 (1-41)||(52945489-52945529)
chr3 (1-60)||(3800186-3800245)
chr3 (11-241)||(29239601-29239824)
chr3 (1-60)||(31039700-31039759)
chr3 (203-241)||(6748608-6748646)
chr3 (203-241)||(7848725-7848763)
chr3 (11-124)||(8815062-8815173)
chr3 (11-69)||(54244748-54244806)
chr3 (204-241)||(30347732-30347769)
chr3 (204-241)||(45059490-45059527)
chr3 (203-239)||(8815529-8815565)
chr3 (1-45)||(13349140-13349184)
chr3 (78-137)||(51952276-51952335)
chr3 (99-191)||(53455661-53455757)
chr3 (109-196)||(3269185-3269271)
chr3 (203-238)||(12127516-12127551)
chr3 (1-60)||(22894892-22894951)
chr3 (1-60)||(27317629-27317688)
chr3 (1-60)||(36823945-36824004)
chr3 (1-44)||(53467494-53467537)
chr3 (1-60)||(53581549-53581608)
chr3 (203-241)||(6109122-6109160)
chr3 (203-241)||(6114980-6115018)
chr3 (203-241)||(11460348-11460386)
chr3 (203-241)||(12896836-12896874)
chr3 (203-241)||(17065924-17065962)
chr3 (203-241)||(17226160-17226198)
chr3 (203-241)||(21727844-21727882)
chr3 (203-241)||(26152468-26152506)
chr3 (203-241)||(38798178-38798216)
chr3 (203-241)||(47461893-47461931)
chr3 (204-241)||(994680-994717)
chr3 (119-156)||(29950657-29950694)
chr3 (119-156)||(29999811-29999848)
chr3 (204-241)||(48649493-48649530)
chr3 (198-231)||(48765182-48765215)
chr3 (161-194)||(50801725-50801758)
chr3 (161-194)||(50874122-50874155)
chr3 (78-137)||(7848601-7848660)
chr3 (78-142)||(27360064-27360127)
chr3 (78-130)||(51148081-51148132)
[»] scaffold0068 (3 HSPs)
scaffold0068 (1-241)||(57862-58102)
scaffold0068 (102-196)||(58056-58149)
scaffold0068 (203-241)||(58098-58136)
[»] chr7 (97 HSPs)
chr7 (1-241)||(20516889-20517129)
chr7 (1-241)||(38876156-38876396)
chr7 (1-241)||(4655014-4655258)
chr7 (1-239)||(15230036-15230273)
chr7 (1-241)||(27811911-27812150)
chr7 (1-230)||(12080679-12080907)
chr7 (1-239)||(14777898-14778134)
chr7 (1-241)||(28605412-28605649)
chr7 (1-241)||(11327565-11327805)
chr7 (1-241)||(14718983-14719221)
chr7 (1-241)||(48454533-48454773)
chr7 (1-241)||(24720230-24720469)
chr7 (1-207)||(45225396-45225602)
chr7 (12-241)||(7437798-7438027)
chr7 (1-241)||(8047962-8048197)
chr7 (1-241)||(14770043-14770283)
chr7 (1-241)||(15220494-15220734)
chr7 (1-241)||(26380064-26380304)
chr7 (1-241)||(18199537-18199781)
chr7 (1-241)||(22479176-22479414)
chr7 (1-241)||(34986495-34986734)
chr7 (1-179)||(32852888-32853065)
chr7 (1-241)||(27596989-27597241)
chr7 (1-241)||(18123070-18123301)
chr7 (86-241)||(45225229-45225384)
chr7 (40-241)||(48193122-48193323)
chr7 (1-240)||(43711881-43712122)
chr7 (1-164)||(37138924-37139087)
chr7 (11-241)||(938865-939091)
chr7 (11-241)||(25818454-25818681)
chr7 (11-241)||(28912052-28912278)
chr7 (113-241)||(33889051-33889179)
chr7 (11-241)||(454074-454300)
chr7 (11-235)||(18352315-18352536)
chr7 (11-241)||(2936610-2936837)
chr7 (14-241)||(41407312-41407535)
chr7 (11-241)||(2509321-2509546)
chr7 (12-241)||(27168254-27168479)
chr7 (1-120)||(33889847-33889965)
chr7 (11-241)||(38367856-38368082)
chr7 (78-241)||(6736575-6736737)
chr7 (11-241)||(19069366-19069592)
chr7 (118-224)||(1325335-1325441)
chr7 (11-235)||(2633892-2634110)
chr7 (1-119)||(18829785-18829906)
chr7 (11-241)||(6559327-6559550)
chr7 (31-241)||(41037328-41037535)
chr7 (11-241)||(38796823-38797051)
chr7 (11-227)||(2362736-2362946)
chr7 (11-200)||(9401656-9401842)
chr7 (33-138)||(32577615-32577719)
chr7 (11-241)||(11766093-11766317)
chr7 (132-241)||(32577474-32577583)
chr7 (11-200)||(15957214-15957400)
chr7 (1-60)||(32577719-32577778)
chr7 (11-187)||(23740061-23740235)
chr7 (25-98)||(17317370-17317443)
chr7 (120-238)||(3512711-3512827)
chr7 (1-54)||(48193343-48193396)
chr7 (1-68)||(3407138-3407205)
chr7 (122-184)||(18829697-18829759)
chr7 (78-156)||(27168292-27168370)
chr7 (200-241)||(48454499-48454540)
chr7 (1-101)||(27168389-27168487)
chr7 (1-60)||(938896-938955)
chr7 (1-60)||(2936641-2936700)
chr7 (1-60)||(6559358-6559417)
chr7 (1-60)||(38367992-38368051)
chr7 (203-241)||(8047928-8047966)
chr7 (203-241)||(11327801-11327839)
chr7 (203-241)||(12080903-12080941)
chr7 (203-241)||(18199777-18199815)
chr7 (203-241)||(24720465-24720503)
chr7 (203-241)||(34986730-34986768)
chr7 (203-241)||(37138890-37138928)
chr7 (200-241)||(7437752-7437793)
chr7 (204-241)||(26380030-26380067)
chr7 (78-137)||(12080779-12080838)
chr7 (1-61)||(41037358-41037418)
chr7 (1-60)||(15957350-15957409)
chr7 (1-60)||(28912083-28912142)
chr7 (1-60)||(41407343-41407402)
chr7 (148-194)||(454266-454312)
chr7 (203-241)||(4655254-4655292)
chr7 (1-47)||(7835361-7835407)
chr7 (1-47)||(18352452-18352498)
chr7 (203-241)||(20517125-20517163)
chr7 (203-241)||(27597237-27597275)
chr7 (203-241)||(27812146-27812184)
chr7 (203-241)||(32577774-32577812)
chr7 (203-241)||(32853061-32853099)
chr7 (203-241)||(45225598-45225636)
chr7 (204-241)||(22479411-22479448)
chr7 (1-46)||(27131093-27131138)
chr7 (144-196)||(7437781-7437833)
chr7 (78-137)||(20517000-20517059)
chr7 (78-137)||(24720341-24720400)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-241)||(26042-26282)
[»] chr8 (106 HSPs)
chr8 (1-241)||(21442119-21442358)
chr8 (1-241)||(9483640-9483879)
chr8 (1-241)||(31071545-31071783)
chr8 (1-235)||(14826264-14826497)
chr8 (1-238)||(19971401-19971637)
chr8 (6-238)||(21021181-21021412)
chr8 (1-241)||(1782993-1783218)
chr8 (1-238)||(30577859-30578096)
chr8 (1-241)||(41942850-41943086)
chr8 (13-241)||(5642487-5642706)
chr8 (13-241)||(5644428-5644647)
chr8 (11-238)||(8258293-8258516)
chr8 (1-112)||(3154165-3154276)
chr8 (11-241)||(26042909-26043135)
chr8 (11-241)||(27545762-27545988)
chr8 (11-241)||(13468269-13468496)
chr8 (11-241)||(2823570-2823796)
chr8 (11-238)||(25127871-25128096)
chr8 (11-241)||(35550560-35550786)
chr8 (11-241)||(32069024-32069248)
chr8 (11-241)||(3369714-3369939)
chr8 (11-241)||(30633033-30633259)
chr8 (11-241)||(32486895-32487122)
chr8 (11-214)||(5946782-5946981)
chr8 (11-225)||(10616293-10616503)
chr8 (118-241)||(42556441-42556562)
chr8 (32-241)||(29125678-29125883)
chr8 (11-241)||(30207169-30207395)
chr8 (17-241)||(39934369-39934590)
chr8 (11-241)||(34103002-34103228)
chr8 (11-228)||(1201671-1201884)
chr8 (147-241)||(3154074-3154168)
chr8 (11-196)||(13269246-13269429)
chr8 (1-93)||(4018650-4018742)
chr8 (11-241)||(26630031-26630250)
chr8 (11-190)||(9483938-9484115)
chr8 (114-241)||(25281053-25281179)
chr8 (1-98)||(14819298-14819394)
chr8 (11-235)||(25123380-25123600)
chr8 (11-227)||(10776977-10777187)
chr8 (89-163)||(21442395-21442469)
chr8 (92-241)||(1281852-1281999)
chr8 (134-241)||(2178674-2178780)
chr8 (14-241)||(26867891-26868115)
chr8 (11-142)||(23544857-23544987)
chr8 (11-214)||(184108-184308)
chr8 (1-90)||(1775514-1775602)
chr8 (17-200)||(13290504-13290684)
chr8 (162-238)||(36901237-36901312)
chr8 (92-241)||(32512114-32512261)
chr8 (19-227)||(45299571-45299774)
chr8 (102-238)||(18804880-18805014)
chr8 (161-241)||(23053818-23053897)
chr8 (121-241)||(23161287-23161405)
chr8 (11-241)||(9413810-9414036)
chr8 (1-72)||(25280987-25281058)
chr8 (11-158)||(36899739-36899886)
chr8 (161-241)||(17952598-17952677)
chr8 (11-123)||(39922359-39922469)
chr8 (161-241)||(29377850-29377929)
chr8 (11-133)||(17691217-17691337)
chr8 (1-75)||(21352391-21352465)
chr8 (11-137)||(35067001-35067127)
chr8 (78-200)||(44874142-44874263)
chr8 (1-58)||(18804313-18804370)
chr8 (144-214)||(9869570-9869640)
chr8 (11-122)||(25123661-25123770)
chr8 (106-238)||(42556757-42556887)
chr8 (1-60)||(26042940-26042999)
chr8 (1-60)||(27545898-27545957)
chr8 (1-60)||(29125709-29125768)
chr8 (1-60)||(35550591-35550650)
chr8 (203-241)||(4018738-4018776)
chr8 (204-241)||(1775599-1775636)
chr8 (11-60)||(7089976-7090025)
chr8 (204-241)||(9483606-9483643)
chr8 (200-241)||(21442085-21442126)
chr8 (204-241)||(42556378-42556415)
chr8 (1-38)||(42556412-42556449)
chr8 (11-60)||(42556684-42556733)
chr8 (127-187)||(29377540-29377600)
chr8 (203-238)||(1782962-1782997)
chr8 (1-44)||(2823617-2823660)
chr8 (1-60)||(3369849-3369908)
chr8 (1-60)||(5946786-5946845)
chr8 (1-60)||(10616429-10616488)
chr8 (1-60)||(13269233-13269292)
chr8 (1-60)||(23161318-23161377)
chr8 (1-60)||(25128009-25128068)
chr8 (203-241)||(3154272-3154310)
chr8 (204-242)||(5643100-5643138)
chr8 (204-242)||(5645041-5645079)
chr8 (1-47)||(10777111-10777157)
chr8 (203-241)||(14819264-14819302)
chr8 (203-241)||(19971633-19971671)
chr8 (1-47)||(30633077-30633123)
chr8 (7-60)||(184251-184304)
chr8 (78-142)||(31071608-31071672)
chr8 (78-137)||(1783062-1783121)
chr8 (78-137)||(9483709-9483768)
chr8 (78-137)||(14826369-14826428)
chr8 (78-137)||(19971509-19971568)
chr8 (78-137)||(21021245-21021304)
chr8 (144-188)||(30400529-30400572)
chr8 (203-235)||(31071517-31071549)
chr8 (1-41)||(32486945-32486985)
[»] chr4 (116 HSPs)
chr4 (1-241)||(13211803-13212042)
chr4 (1-241)||(14202860-14203100)
chr4 (1-241)||(12584276-12584516)
chr4 (1-241)||(5046631-5046870)
chr4 (1-241)||(6213971-6214211)
chr4 (1-241)||(13621086-13621325)
chr4 (1-241)||(42807901-42808141)
chr4 (1-241)||(7630045-7630285)
chr4 (1-241)||(48559986-48560225)
chr4 (1-241)||(578747-578989)
chr4 (1-241)||(17180938-17181180)
chr4 (1-241)||(17377481-17377721)
chr4 (1-241)||(21519719-21519959)
chr4 (1-241)||(34683038-34683278)
chr4 (1-241)||(5156985-5157225)
chr4 (1-241)||(41172398-41172637)
chr4 (1-241)||(17745138-17745373)
chr4 (1-241)||(51783959-51784200)
chr4 (1-241)||(30820479-30820719)
chr4 (1-241)||(50182163-50182400)
chr4 (1-241)||(49970583-49970821)
chr4 (3-241)||(26958527-26958762)
chr4 (1-174)||(10216242-10216414)
chr4 (1-241)||(13371206-13371438)
chr4 (1-241)||(13381407-13381639)
chr4 (1-171)||(30258117-30258286)
chr4 (72-241)||(13621375-13621544)
chr4 (1-185)||(3818788-3818973)
chr4 (1-222)||(52437427-52437647)
chr4 (77-241)||(10981367-10981531)
chr4 (1-241)||(47382150-47382379)
chr4 (87-241)||(18470245-18470399)
chr4 (11-235)||(40496156-40496377)
chr4 (11-241)||(26335712-26335938)
chr4 (11-241)||(9744146-9744372)
chr4 (42-241)||(6946616-6946811)
chr4 (11-241)||(16553396-16553622)
chr4 (11-241)||(38425666-38425892)
chr4 (11-241)||(46106645-46106871)
chr4 (11-241)||(52306739-52306965)
chr4 (42-241)||(14862944-14863138)
chr4 (78-241)||(6137578-6137739)
chr4 (18-241)||(4490636-4490856)
chr4 (11-238)||(4712631-4712855)
chr4 (11-241)||(45875731-45875956)
chr4 (11-241)||(6192969-6193196)
chr4 (28-241)||(29101956-29102165)
chr4 (11-232)||(33105892-33106109)
chr4 (11-241)||(54742419-54742649)
chr4 (102-240)||(45801793-45801934)
chr4 (11-183)||(49425774-49425943)
chr4 (11-241)||(14948094-14948319)
chr4 (17-171)||(20458852-20459004)
chr4 (92-241)||(33811016-33811163)
chr4 (11-173)||(11777510-11777669)
chr4 (11-182)||(15725208-15725376)
chr4 (11-142)||(23383940-23384066)
chr4 (78-235)||(6137474-6137630)
chr4 (28-141)||(43639068-43639181)
chr4 (101-241)||(49605990-49606128)
chr4 (11-137)||(142692-142816)
chr4 (115-241)||(43638948-43639072)
chr4 (145-214)||(56532591-56532659)
chr4 (148-241)||(13211626-13211717)
chr4 (92-241)||(36955331-36955475)
chr4 (160-233)||(40496396-40496468)
chr4 (1-60)||(16553427-16553486)
chr4 (175-241)||(49426124-49426189)
chr4 (168-241)||(142605-142677)
chr4 (204-241)||(12584242-12584279)
chr4 (200-241)||(48560218-48560259)
chr4 (175-238)||(4505567-4505629)
chr4 (1-60)||(26335743-26335802)
chr4 (11-117)||(102261-102366)
chr4 (203-241)||(5046597-5046635)
chr4 (11-69)||(13211554-13211612)
chr4 (203-241)||(13621321-13621359)
chr4 (203-241)||(21519955-21519993)
chr4 (203-241)||(30258083-30258121)
chr4 (203-241)||(34683004-34683042)
chr4 (203-241)||(41172633-41172671)
chr4 (203-241)||(42807867-42807905)
chr4 (203-241)||(47382375-47382413)
chr4 (203-241)||(50182396-50182434)
chr4 (161-214)||(30258343-30258396)
chr4 (148-241)||(50677914-50678004)
chr4 (120-156)||(2722807-2722843)
chr4 (181-241)||(20459163-20459222)
chr4 (78-137)||(30820548-30820607)
chr4 (1-60)||(4712659-4712718)
chr4 (1-60)||(6946647-6946706)
chr4 (1-60)||(14862975-14863034)
chr4 (1-60)||(26958558-26958617)
chr4 (11-74)||(38425573-38425636)
chr4 (1-44)||(50677961-50678003)
chr4 (102-196)||(578700-578793)
chr4 (203-241)||(578713-578751)
chr4 (203-241)||(3818969-3819007)
chr4 (203-241)||(5157221-5157259)
chr4 (203-241)||(7630281-7630319)
chr4 (1-47)||(9744282-9744328)
chr4 (203-241)||(14202826-14202864)
chr4 (203-241)||(17377717-17377755)
chr4 (203-241)||(17745369-17745407)
chr4 (203-241)||(32012838-32012876)
chr4 (1-47)||(40496293-40496339)
chr4 (1-47)||(43638992-43639038)
chr4 (10-60)||(52306770-52306820)
chr4 (200-241)||(13371431-13371472)
chr4 (200-241)||(13381632-13381673)
chr4 (78-125)||(578831-578878)
chr4 (78-137)||(10216311-10216370)
chr4 (78-137)||(13211914-13211973)
chr4 (203-235)||(30820451-30820483)
chr4 (1-45)||(46106691-46106735)
chr4 (78-137)||(48560097-48560156)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-241)||(452357-452596)
[»] scaffold0119 (2 HSPs)
scaffold0119 (1-171)||(2767-2937)
scaffold0119 (1-171)||(14822-14992)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (11-241)||(20620-20847)
scaffold0217 (1-60)||(20757-20816)
[»] scaffold0418 (3 HSPs)
scaffold0418 (11-235)||(5658-5878)
scaffold0418 (160-233)||(5567-5639)
scaffold0418 (1-47)||(5696-5742)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (11-241)||(9733-9959)
scaffold0015 (1-60)||(9870-9929)
[»] scaffold0325 (2 HSPs)
scaffold0325 (11-241)||(6508-6734)
scaffold0325 (1-60)||(6539-6598)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (18-235)||(22624-22838)
[»] scaffold0627 (2 HSPs)
scaffold0627 (11-227)||(4043-4254)
scaffold0627 (4-60)||(4060-4116)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-98)||(82733-82830)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (1-109)||(14829-14937)
scaffold0069 (204-241)||(14934-14971)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (11-217)||(557-759)
[»] scaffold0778 (2 HSPs)
scaffold0778 (1-52)||(6262-6313)
scaffold0778 (203-241)||(6228-6266)
[»] scaffold1717 (1 HSPs)
scaffold1717 (11-74)||(1381-1443)
[»] scaffold1527 (1 HSPs)
scaffold1527 (11-74)||(1627-1689)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-60)||(65951-66010)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (207-241)||(1-35)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 97)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 30687905 - 30688145
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30687905 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 30688004  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30688005 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 30688104  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30688105 tgctaaaacactcccacataaaaactagttggtgtgttcta 30688145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 29302095 - 29302335
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29302095 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgagtgtgttctagcaaatc 29302194  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29302195 ctataggcatttgctagaatacacccgcttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaggtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 29302294  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29302295 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 29302335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15809167 - 15808927
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15809167 tttagcaagttacaacttaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 15809068  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15809067 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctt 15808968  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15808967 tgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 15808927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4736987 - 4736751
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4736987 tttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaaaaaa-caagtgggtgtgttatagcaaatc 4736889  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4736888 ctataggcatttgctagaatacatccacttattttttaggag---tattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 4736792  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4736791 tgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttcta 4736751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17605236 - 17604998
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17605236 tttagcaagttataactaaaaatttaataaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 17605138  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17605137 ctataggcatttgctggaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag-tgtagctt 17605039  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17605038 tgctaaaagactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 17604998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11448929 - 11448706
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11448929 tttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgttataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 11448830  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11448829 ctataggcatttgctaggatacatccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaatatctaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 11448730  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaa 224  Q
    | ||||||||||||||| ||||||    
T  11448729 tgctaaaacactcccacataaaaa 11448706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33026424 - 33026184
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaa-gttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat 99  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33026424 tttaacaagttacaactaaaaaagttaataaatacatcttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttcaagcaaat 33026326  T
Q  100 cctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  33026325 cctataggcatttgctagaatacaccgacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagtggttaaatacaccctaagatgtagtt 33026226  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  33026225 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 33026184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 1951424 - 1951632
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1951424 tttagcaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaagaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 1951522  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1951523 ctataggcatatgttagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 1951622  T
Q  201 tactaaaaca 210  Q
    | ||||||||    
T  1951623 tgctaaaaca 1951632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1921656 - 1921417
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  1921656 tttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatattgttataacacatcttctaacaaaaataagtgagtgtgttctagcaaatc 1921557  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  1921556 ctataggcatttgctcggatacacccacttagtttttaaaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagc-t 1921458  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1921457 tgctaaaacactcccacataaaaactagtaggtgtgttcta 1921417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33282451 - 33282213
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33282451 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 33282353  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | ||||||    
T  33282352 caataggcatttgctagaatgcacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtagttaaata-aacttaaggtatagctt 33282254  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33282253 tgctaagacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 33282213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 3960637 - 3960867
Alignment:
Q  9 gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  3960637 gttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtgctctagcaaatcctacatgc 3960735  T
Q  109 atttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaa 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  3960736 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaa 3960835  T
Q  209 cactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||  | |||| |||| |||||||||||    
T  3960836 cactcccatat-aaaattagtaggtgtgttcta 3960867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26906090 - 26905862
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26906090 tttaacaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa--caagtgggtgtgttctagcaaatc 26905993  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  26905992 ctataggcatttgctagaatacagccacttattttttt--aggagtattttagcaaatgaataactaaaaagttgttaaatacaccctaaggtgtagctt 26905895  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggt 233  Q
    | ||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  26905894 tgctaaaacactcccacataaaaattaatgggt 26905862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37282375 - 37282142
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaa-gttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37282375 tttagcaagttataactaaaaaagttaacaaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaat 37282277  T
Q  100 cctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||    
T  37282276 cctataggcatttgctaaaatacactcacttatttttt---aggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt-aatagacttcaagatgtagct 37282181  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37282180 ttggtaaaacactcccatataaaaactagtgggtgtgtt 37282142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 30667572 - 30667806
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||     
T  30667572 tttagcaagttatgactaaaaagttaataaatacaccataagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa--aagtgagtgtgttctagcaaatt 30667669  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||    
T  30667670 ctataggcatttgctagaatacac--acatattttttagaatgagtattttagcaagtgaaaaattaaaaagtgattaaatacactttaacgtgtagctt 30667767  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttc 239  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30667768 tgctaaaacactcctacataaaaactagtgggtgtgttc 30667806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 17209865 - 17210091
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaag--ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  17209865 tttagcaagttgtaactaaaaagagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtgttcaagcaaa 17209963  T
Q  99 tcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  17209964 tcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt---aggagtattttagcaaatcaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagc 17210060  T
Q  199 tttactaaaacactcccacgtaaaaactagt 229  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17210061 tttgctaaaacactcccacataaaaattagt 17210091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 241
Target Start/End: Original strand, 33833087 - 33833284
Alignment:
Q  44 tgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaaga 143  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  33833087 tgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctaacaaatcctatatacatttgctaggatacacccacttagtttttagaagg 33833186  T
Q  144 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33833187 agtattttagttagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 33833284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 37249498 - 37249351
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37249498 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 37249399  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  37249398 ctataggcatttgctagaatacacccatttattttttaaaaggagtat 37249351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6436603 - 6436377
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||   |||||| ||| |  |||||| ||||||||||||    
T  6436603 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacaaacattctaaaaaat--aagtggttgtatgttagcaactcctataggcat 6436506  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||  || |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  6436505 ttgctaggattcacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tacaactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 6436408  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6436407 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 6436377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 112 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14795777 - 14795648
Alignment:
Q  112 tgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacac 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14795777 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataaaccttaaggtgtagctttgctaaaacac 14795678  T
Q  212 tcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14795677 tcccacataaaaactagtgagtgtgttcta 14795648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4738112 - 4737886
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| || |   |||||||||| |  |||||| || ||| |||||    
T  4738112 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactcatatgggcat 4738015  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  4738014 ttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttg-ctaaaaca 4737917  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4737916 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 4737886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 239
Target Start/End: Original strand, 27005155 - 27005308
Alignment:
Q  86 gtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27005155 gtgttctagcaaatcctttagacatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatagac 27005254  T
Q  186 cttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttc 239  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27005255 cttaaggtgtagctttgctaaaatactctcacataaaaattagtgggtgcgttc 27005308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30486203 - 30486066
Alignment:
Q  104 taggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttac 203  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  30486203 taggcatttgctaggatacatccacttagtttttagaatgagtattttagcaattgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgc 30486104  T
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30486103 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 30486066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14369947 - 14369721
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  14369947 tataactaaaaagttgttaactacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 14369850  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  14369849 ttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 14369752  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  14369751 ctcccacatgaaaactagcgggtgtcttcta 14369721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 25912044 - 25912270
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  25912044 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaaggttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 25912141  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | || ||||||||    
T  25912142 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 25912239  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25912240 ctcccacataaaaactagtaggtgtgttcta 25912270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37468729 - 37468502
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  |||||||||    
T  37468729 tttagcaagttataactaaaaagttgataaatacaccttgagttgtatgtttctataacacaccttcta-aaaaaataagtgggtgtatgttagcaaatc 37468631  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtga-ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||       || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||     
T  37468630 ctataggaatttgctagaatacacc--cttttt-------aggagtattttagcaagtgataacactaaaaagtggttaaatgcaccctaaggtgtagc- 37468541  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37468540 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgtt 37468502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 13711033 - 13711261
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  13711033 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacattcattcta-aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 13711131  T
Q  111 ttgctagaatacacctac-ttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| |||  ||| |||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  13711132 ttgctagaatacacccactttttttttttgaatgagtgttttagcaagt-tataatcaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaac 13711229  T
Q  210 actcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13711230 actctcacataaaaaccagtgggtgtgttcta 13711261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17421874 - 17421648
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||| || |  ||||||| ||||   |||||||||| |  ||| || |||||||| |||    
T  17421874 tataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaatactcattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagaaactcctatagacat 17421777  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| || ||||| ||    
T  17421776 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccataaggcgtagc-ttgctaaatca 17421679  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17421678 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 17421648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 17559215 - 17559335
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17559215 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatc 17559313  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatac 122  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  17559314 ctatagacatttgctagaatac 17559335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 241
Target Start/End: Original strand, 31240268 - 31240472
Alignment:
Q  33 acaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttat 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| || |   |||||||||| |  |||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31240268 acaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactcttataggcatttgctaggatacacccacttat 31240365  T
Q  133 tttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtggg 232  Q
    ||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  31240366 tttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaacactctcacataaaaactagtgga 31240463  T
Q  233 tgtgttcta 241  Q
    |||||||||    
T  31240464 tgtgttcta 31240472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2528953 - 2528721
Alignment:
Q  7 aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatag 106  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  2528953 aagttataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct-taaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatag 2528855  T
Q  107 gcatttgctagaatacacctactta-ttttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttacta 205  Q
     |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  || |||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||| | || | || |||    
T  2528854 acatttgctagaatacatccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactgaaaagtagttaaatgcaccttaaggtata-ccttgcta 2528757  T
Q  206 aaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2528756 aaacactcccacataaaaactagtggatgtgttcta 2528721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 12910024 - 12910250
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||| || |||| |||||||| || |   ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  12910024 tataattaaaaaattgttaaatacatcttaaggtgaatgttgttaaaacacacattctaaaatat--aagtgagtgtatgttagcaactcctataggcat 12910121  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    | |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  12910122 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgtatgttttagcatgtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttg-ctaaaaca 12910219  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12910220 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 12910250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10951230 - 10951009
Alignment:
Q  16 ctaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgct 115  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||  ||||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| |    
T  10951230 ctaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtttctaaaacacacattc--gaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgat 10951133  T
Q  116 agaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactccc 215  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  10951132 ataatacacctacttattttttataaggtgtgttttagcaagt-tatatctaaaaagtagctaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaacactccc 10951035  T
Q  216 acgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || | ||||||||||| |||||||||    
T  10951034 acattaaaactagtggatgtgttcta 10951009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7014614 - 7014482
Alignment:
Q  109 atttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaa 208  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  7014614 atttgctagaacacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaa 7014515  T
Q  209 cactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  7014514 cactcccacataaaaattaatgggtgtgttcta 7014482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28747943 - 28747716
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||  | ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  28747943 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaagcactccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 28747845  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||   || |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  28747844 ttgctagaatacacccacttaatttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacaccctaaggtgtagc-ttgctaaaaca 28747747  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28747746 ctctcacataaaaacaagtgggtgtgttcta 28747716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33696233 - 33696007
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||| |||| |||| || ||||| || |   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  33696233 tataactaaaaagttgttaaatacaccttatggtgaatgtagctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 33696136  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
T  33696135 ttgctagaatacacccacttattttttagaagttatgttttagcatgt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgttaaaaca 33696038  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |  |||| |||||||||||| || |||||||    
T  33696037 caaccacataaaaactagtgagtttgttcta 33696007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4083918 - 4083705
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||| || |   ||||||||||    |||||| ||||||||||||    
T  4083918 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtcgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtacgttagcaactcctataggcat 4083821  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||    
T  4083820 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgtagc-ttgttaaaaca 4083723  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactag 228  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  4083722 ctcccacataaaaactag 4083705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 2695088 - 2695320
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||    
T  2695088 tttagcaaaatataactaaaatgttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactc 2695185  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  2695186 ctataggcatttgctaggata-acccacttacattttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-t 2695282  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    | |||||| | |||||| |||||||||||  |||||||    
T  2695283 tgctaaaatattcccacataaaaactagtttgtgtgtt 2695320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3038988 - 3038841
Alignment:
Q  92 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 191  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3038988 tagcaactcctataggcatttgttaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacatcttaag 3038890  T
Q  192 atgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
     |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3038889 gtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtatgttcta 3038841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7944467 - 7944254
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || | ||| ||| |   ||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  7944467 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaaata---agtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 7944371  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagt-ggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| | || |||||||    
T  7944370 ttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaagttaaatacaccttaaagtgtaac-ttgctaaaac 7944273  T
Q  210 actcccacgtaaaaactag 228  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  7944272 actcccacataaaaactag 7944254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38661337 - 38661242
Alignment:
Q  38 ttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38661337 ttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattt 38661242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 1807587 - 1807474
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||     
T  1807587 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatatatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaacaagt-ggtgtgttccagcaaatt 1807490  T
Q  101 ctataggcatttgcta 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  1807489 ctataggcatttgcta 1807474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Original strand, 39548921 - 39549068
Alignment:
Q  92 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 191  Q
    |||||| | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39548921 tagcaacttctatagccatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatataccttaag 39549019  T
Q  192 atgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| || |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  39549020 atgtagc-ttgctaaaacactcctacataaaaactaggaggtgtgttcta 39549068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 22701746 - 22701972
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   ||| ||||||    |||||| || |||| ||||    
T  22701746 tataactaaaaagttgtgaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagcgggtgtacgttagcaactcttataagcat 22701843  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | || ||||||||    
T  22701844 ttgctagaatacacccactta-tttttggaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 22701940  T
Q  211 ctcccacgtaaaa-actagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22701941 ctcccacataaaacactagtgggtgtgttcta 22701972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 31752296 - 31752128
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||| ||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  31752296 tataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtaggtgtatgttagcaactcctataggcat 31752199  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 182  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  31752198 ttgctagaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaata 31752128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1797498 - 1797420
Alignment:
Q  112 tgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1797498 tgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 1797420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 17232918 - 17233140
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| | || || ||||| ||||   || ||  ||| |  |||||| ||||||||||||    
T  17232918 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaagcacaccttctaaaaaat--aaatgaatgtatgttagcaactcctataggcat 17233015  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||||||    || |||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  17233016 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaaat-tataactaaaa----gtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 17233109  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17233110 ctcctacataaaaactagtgggtgtgttcta 17233140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 22282203 - 22282301
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtg-ttctagcaaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22282203 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgctgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgtttctagcaaa 22282301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39038698 - 39038473
Alignment:
Q  13 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 112  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |  ||||| |||||  |||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||    
T  39038698 taactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaaat-aagtgggtctatgttagcaactcctatatgcattt 39038600  T
Q  113 gctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacact 212  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | || ||||||||||    
T  39038599 gctaggatatacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagttaaataaaccttaaggtgtaac-ttgctaaaacact 39038502  T
Q  213 cccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |  || |||||| |||| |||||||||||    
T  39038501 catacataaaaattagtaggtgtgttcta 39038473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 239
Target Start/End: Original strand, 8410685 - 8410844
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 177  Q
    ||||| |||| | ||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  8410685 aagtgagtgtatcctagcaactcctataaacatttgctaggatacatcaacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagtt 8410783  T
Q  178 aaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttc 239  Q
    ||| | || ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8410784 aaacatacattaaggtgtagcttg-ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 8410844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 6260993 - 6261219
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| || |||| || || || ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  6260993 tataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttttaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 6261090  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||| ||| | | | || || ||||||||    
T  6261091 ttgctaggatatacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataattaaaaaatagttaaatacactttacggtatggc-ttgctaaaaca 6261188  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  6261189 ctctcacataaaaaatagtaggtgtgttcta 6261219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9124884 - 9124705
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||||| |  || ||| | ||||||||||    
T  9124884 tataactaaaaatttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct-taaaaaataagtgggtgtatgttaacaacttctataggcat 9124786  T
Q  111 ttgctagaatacacctactta-ttttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  9124785 ttgctagaatacatccacttatttttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatatttaaatacaccttaag 9124705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7014698 - 7014630
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattcta 69  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7014698 tttagcaagctctaactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattcta 7014630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 241
Target Start/End: Original strand, 40234211 - 40234302
Alignment:
Q  148 ttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40234211 ttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacactttaaggtgtag-tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 40234302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 858070 - 857945
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca- 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||   |||||||||| |  |||||| ||||||| |||     
T  858070 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctagaaaa--taagtgggtgtctgttagcaactcctatatgcat 857973  T
Q  110 tttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  857972 tttgctagaatacacccacttacttttt 857945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 22800642 - 22800864
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  | || || |||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || |||    
T  22800642 tataattaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctacaacactccttttaaaaaaag-aagtgggtgtatgttagcaactcctacagacat 22800740  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||| ||| |  ||||||||||||| | |||||||||       ||||  ||| ||||||||    
T  22800741 ttgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagctaaatacac------gtgta-atttgctaaaaca 22800832  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttctat 242  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22800833 ctctcacgtaaaaactagtggatttgttctat 22800864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38661243 - 38661179
Alignment:
Q  176 ttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttct 240  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38661243 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttct 38661179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 227
Target Start/End: Original strand, 17233353 - 17233486
Alignment:
Q  92 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  || ||||| ||| |  |||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  17233353 tagcaactcctataggcatttgctagaacacactcacttattttttagaagttgtgttttaccaaat-tataattaaaaagtagttaaatactccttaag 17233451  T
Q  192 atgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaacta 227  Q
     |||| | || |||||||||| |||| |||||||||    
T  17233452 gtgtaac-ttgctaaaacacttccacataaaaacta 17233486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39999250 - 39999193
Alignment:
Q  184 accttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39999250 accttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 39999193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4151148 - 4150976
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtg--tgttctagcaaatc---ctata 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || || ||||   |||||||||  ||||   |||| ||    ||||    
T  4151148 tataactaaaaaattaataaatacatcttgaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaa---aagtgggtgtatgttagcgcaactcttattata 4151052  T
Q  106 ggcatttgctagaatacacctactta-ttttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 180  Q
     |||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4151051 tgcatatgctagaatactccaacttatttttttaaaaagagtattttaacaagtgaataactaaaaagtgattaaa 4150976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 241
Target Start/End: Original strand, 22213127 - 22213207
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22213127 ataattaaaaagtggttaaatacaccctaaattgtagctttgttaaaacactctcacttaaaaattagtgggtgtgttcta 22213207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31752479 - 31752400
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||| | |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31752479 ataactaaaaactagttaaatgtaccttaagatgtag-tttgctaaaacactcccacataaaaactagtggttgtgttcta 31752400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 25912180 - 25912239
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  25912180 tttagcaagttataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaaca 25912239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33832898 - 33832728
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||| ||| |||| || ||||| |||||  || || |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  33832898 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaacgtttctaaaacacaccttctaaaaaaataaa-tgagtgtatgttagcaactcctataggcat 33832800  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttatt-ttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 182  Q
    ||| |||||  |||| ||||||| |||| ||||  || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  33832799 ttgttagaacgcacccacttattgttttggaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaata 33832728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 4737976 - 4737917
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  4737976 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 4737917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14369811 - 14369752
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  14369811 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 14369752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 32736440 - 32736377
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaa 74  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  32736440 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 32736377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 4736983 - 4737021
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4736983 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 4737021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 25593288 - 25593342
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcta 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  25593288 tttagcaagttataactaaaaagtggataattacaccttaaggtgtgagttgcta 25593342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 191
Target Start/End: Original strand, 17232868 - 17232949
Alignment:
Q  110 tttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 191  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17232868 tttgctaggatacacctactaatttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 17232949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 26906087 - 26906124
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26906087 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 26906124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 156
Target Start/End: Original strand, 31752182 - 31752257
Alignment:
Q  81 tgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaa 156  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  31752182 tgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 31752257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 857925 - 857863
Alignment:
Q  178 aaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  857925 aaatgcaccttaaggtgtaacttg-ctaaaacactcccacatacaaactagtgggtgtgttcta 857863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 3038931 - 3038872
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  3038931 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaaca 3038872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 11351820 - 11351883
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaa 74  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  11351820 tataattaaaaagttattgaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 11351883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 12910160 - 12910219
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  12910160 tttagcatgttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 12910219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 22701881 - 22701940
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  22701881 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtaacttgctaaaaca 22701940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 31240382 - 31240441
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  31240382 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagcttgctaaaaca 31240441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Original strand, 37282371 - 37282406
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37282371 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgtt 37282406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Original strand, 37468725 - 37468760
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37468725 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgtt 37468760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 40234212 - 40234271
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  40234212 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacactttaaggtgtagtttgctaaaaca 40234271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 1921652 - 1921690
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1921652 ctaaaacactcccacataaaaactagtaggtgtgttcta 1921690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 15809163 - 15809201
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15809163 ctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttcta 15809201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17210195 - 17210138
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattcta 69  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  17210195 tataactaaaaagttg-taaatacaccttaaggtgaatgttggtaaaacacacattcta 17210138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29302099 - 29302061
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29302099 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 29302061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30667576 - 30667538
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30667576 ctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttcta 30667538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30687909 - 30687871
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30687909 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 30687871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 33696097 - 33696051
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33696097 tttagcatgttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 33696051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 37249494 - 37249532
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37249494 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 37249532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8318173 - 8318124
Alignment:
Q  133 tttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  8318173 tttttataagaagtattttagcaaagatataactaaaaagtggttaaata 8318124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 142
Target Start/End: Original strand, 26905963 - 26906027
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaag 142  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  26905963 aagtggctgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgttttttagaag 26906027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 27365812 - 27365857
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  27365812 tttagcaagttataactaaaaagttgataatcacaccttgaggtgt 27365857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1951428 - 1951396
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1951428 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 1951396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 7944332 - 7944272
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagtta-ataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||  |||||| ||||    
T  7944332 tttagcaagttataactaaaaagtaagttaaatacaccttaaagtgtaacttgctaaaaca 7944272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 15809038 - 15809097
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  15809038 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 15809097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17209995 - 17209936
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  17209995 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgcttgaacacacccacttatttttt 17209936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 38661246 - 38661305
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  38661246 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 38661305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38952273 - 38952198
Alignment:
Q  108 catttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 184  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  38952273 catttgctaaaatacacccacttattttttataaggagtgttttggcatgt-cataactaaaaagtagctaaataca 38952198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 39906271 - 39906511
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906271 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 39906370  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39906371 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 39906470  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39906471 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 39906511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39904859 - 39904620
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39904859 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 39904760  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39904759 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 39904660  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39904659 tgct-aaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 39904620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44543053 - 44542814
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44543053 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 44542955  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44542954 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaggagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 44542855  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44542854 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 44542814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 7682007 - 7682245
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  7682007 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaaaaag-aagtgggtgtattttagcaaatc 7682105  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7682106 ctataggcatttgctagaatacacccactt-ttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 7682204  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7682205 tgctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttcta 7682245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 6332278 - 6332517
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6332278 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 6332376  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  6332377 ctatagacatttgctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagctt 6332476  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6332477 tgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 6332517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2586585 - 2586348
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  2586585 tttagcaagttataactaaaaaactaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaat-aagttggtgtgttctagcaaatc 2586487  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2586486 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataacaaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctt 2586387  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttc 239  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2586386 tgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttc 2586348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38987164 - 38986926
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38987164 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctacaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 38987065  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38987064 ctataggcatttgctagaatacatccacttacattttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaattggttaaatacaccttaaggtgtagctt 38986965  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  38986964 tgctaaaacact--cacataaaaactagtgggtgtgttcta 38986926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 20939712 - 20939951
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20939712 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgcatgttgctataacacactttctaaataaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 20939810  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20939811 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtagctt 20939910  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||    
T  20939911 tgctaaaacactcctacataaaaactagtgagagtgttcta 20939951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 4293206 - 4293442
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  4293206 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaaaaaa-caagtgggtgtgttatagcaaatt 4293304  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4293305 atataggtatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtgattaaatacaccctaagatgtagctt 4293404  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  4293405 tgctaaaacactcctacataaaaattagtgggtgtgtt 4293442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 9689377 - 9689614
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  9689377 tttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgagtgtattctagcaaatc 9689476  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9689477 ctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaattactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 9689576  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  9689577 tgctaaaacactcccacataaaaaccagtggatgtgtt 9689614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44257664 - 44257431
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaa-gcaagtgggtgtgttctagcaaat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  44257664 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaaaaaaaagcaagtgggtgtgttctaacaaat 44257565  T
Q  100 cctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  44257564 cttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaaatggttcaatacaccttaaggtgtagct 44257465  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggt 233  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44257464 ttgctaaaacactcccacataaaaactaatgggt 44257431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 30406463 - 30406702
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30406463 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 30406561  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30406562 ctataggcacttgctacaatacacccacttattttttagatggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctt 30406661  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  30406662 tgctaaaacactcccacataaaaattagtaggtgtgttcta 30406702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22301980 - 22302206
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22301980 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacacct-aaggtgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 22302078  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22302079 ctataggcatttgctagaatacacccacttattgtttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 22302178  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactag 228  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22302179 tgctaaaacactcccacataaaagctag 22302206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 22711035 - 22711274
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| || ||||||    
T  22711035 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaaaaaataaa-tgggtgtgttataacaaatc 22711133  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22711134 ctataggcatttgctagaatacatccacttattttttagaaggagtattttagtaaataaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 22711233  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22711234 tgttaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 22711274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 9690171 - 9690399
Alignment:
Q  12 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9690171 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaaa-caagtgagtgtgttctagcaaatcttataggcatt 9690269  T
Q  112 tgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacac 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||| ||    
T  9690270 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaaatcaataactaaaaagtggttaaatacatcctaaggtgtagctttgttaaaatac 9690369  T
Q  212 tcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9690370 tcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 9690399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 15554024 - 15554263
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15554024 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttcctataacacacattctaaaaaaa-caaatgggtgtgttctagcaaatc 15554122  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| |||    
T  15554123 ctattgacatttgttagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaagttattaaatacaccttaaagtgtaactt 15554222  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  15554223 tgctaaaacactcccacataaaaactaatggatgtgttcta 15554263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33173700 - 33173467
Alignment:
Q  3 tagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  33173700 tagcaagttataactaaaaagttaataaataaaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttccaaaaaat--aagtgggtgtgttctagcaaatcct 33173603  T
Q  103 ataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagcttta 202  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||     
T  33173602 atagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaatgtgtagctttg 33173503  T
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||    
T  33173502 ctaaaacactcccacataaaaattagtagatgtgtt 33173467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 213
Target Start/End: Original strand, 324933 - 325101
Alignment:
Q  45 gtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaa 144  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  324933 gtatgttgctataacacacattctaaacaaaacaagtgagtgtgttctagcaaattttataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaagga 325032  T
Q  145 gtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactc 213  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  325033 gtattttaacaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccataaggtgtagctttgctaaaacactc 325101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 34082566 - 34082792
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  34082566 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 34082663  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  34082664 ttgctaggatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 34082761  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34082762 ctaccacataaaaactagtgggtgtgttcta 34082792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3769552 - 3769419
Alignment:
Q  108 catttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaa 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3769552 catttgctagaacacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 3769453  T
Q  208 acactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3769452 gcactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 3769419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16513266 - 16513043
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||  || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  16513266 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacgcaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 16513169  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||  |   ||| ||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  16513168 ttgctaggatacacccacttattttttaggtg---tatgttagcaaatta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttg-ctaaaaca 16513074  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16513073 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 16513043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 3769769 - 3769653
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3769769 tttagcaagttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 3769671  T
Q  101 ctataggcatttgctaga 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3769670 ctataggcatttgctaga 3769653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 8386696 - 8386925
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  | ||||| ||||||    ||||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  8386696 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacactccttctaaaaaaagtggttgggtgtatgttagcaactcctatatgcat 8386795  T
Q  111 ttgctagaatacacctactta-ttttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  8386796 ttgctagaatacacccacttatttttttacaagatatgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccctaagatgtagcttga-taaaac 8386893  T
Q  210 actcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8386894 actcccacataaaaactaatgggtgtgttcta 8386925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 11675151 - 11675370
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||| || |   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  11675151 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 11675248  T
Q  111 ttgctagaatacacctactta-ttttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  11675249 ttgctaggatacacccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaac 11675346  T
Q  210 actcccacgtaaaaactagtgggt 233  Q
    || ||||| || ||||||||||||    
T  11675347 acacccacatagaaactagtgggt 11675370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13002217 - 13001991
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  | |  || | ||   |||| ||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  13002217 tataactaaaaagttgttaaatacaccctaaggtgaatgttgctaaaacactcctcgtaaacaat--aagtaggtgtatgttagcaactcctataggcat 13002120  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||    
T  13002119 ttgctaaaatacaccctcttattttttagaaggagtgttttagcaagtg-ataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagc-atgctaaaaca 13002022  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  13002021 ctcccacataaaaattagtcggtgtgttcta 13001991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 18370231 - 18370457
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||  || ||||| ||||   |||||||||| |  ||| || || ||||| |||    
T  18370231 tataactaaaaaattgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacgcaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagaaactcttatagtcat 18370328  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  18370329 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttg-ctaaaaca 18370426  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18370427 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 18370457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1750383 - 1750161
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| | ||||   |||||| ||| |  |||||| ||||| | ||||    
T  1750383 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttccaaaaaat--aagtgg-tgtatgttagcaactcctacatgcat 1750287  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  1750286 ttgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 1750189  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1750188 ctctcacctaaaaactagtgggtgtgtt 1750161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29512272 - 29512044
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||  ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||| | |  |||||| | |||||| |||    
T  29512272 tataactaaaaaattgttaaatacattttatggtgaatgttgctaaaacacacattctagaaaat--aagtgggtatatgttagcaacttctatagacat 29512175  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttatttttt--agaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaa 208  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||  |||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  29512174 ttactaggatacacccacttattttttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtggttaaatacactttaaggtgtagc-ttgctaaaa 29512077  T
Q  209 cactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29512076 cacttccacataaaaactagtggatgtgttcta 29512044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 1297592 - 1297746
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1297592 tttagcaaattataactaaaaagttaataaataaaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaacaagtgagtgtgttctagcaaatc 1297690  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 171  Q
                ||||||||||| | |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1297691 ------------gctagaatacaaccacttatttttt---aggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 1297746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16075237 - 16075014
Alignment:
Q  12 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 111  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||   |||| ||||| |  |||||| |||| ||||||||    
T  16075237 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagttggtgtatgttagcaactcctgtaggcatt 16075140  T
Q  112 tgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacac 211  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |    
T  16075139 tactaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaaatagttaaatacacattaaggtgtagcttg-ctaaaactc 16075042  T
Q  212 tcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |  ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  16075041 ttaca--taaaaactaatgggtgtgttcta 16075014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 238
Target Start/End: Original strand, 8741601 - 8741733
Alignment:
Q  106 ggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttacta 205  Q
    |||||||| ||| ||||  || |||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||    
T  8741601 ggcatttgttaggatacgtctgcttaatttttaagaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatatactttaaggtgtagctttgcta 8741700  T
Q  206 aaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8741701 aaacactcctacataaaaactagtaggtgtgtt 8741733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 33739546 - 33739691
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  33739546 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 33739643  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagt 158  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  33739644 ttgctagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt 33739691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 37169556 - 37169781
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | || || ||| |   ||||||||| |  ||||||  | |||||||||    
T  37169556 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacactccttttaaaaata---agtgggtgtatgttagcaacccatataggcat 37169652  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||  ||| |||    
T  37169653 ttgctagaatacaccctcttattttttaaaaggtgcgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagc-ttgttaagaca 37169750  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  37169751 ctcccacataaaaattagtggatgtgttcta 37169781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 42850015 - 42850241
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  | ||||| | ||   |  ||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  42850015 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacactccttctaaagaataga--tgggtgtatgttagcaattcctataggcat 42850112  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||   || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| || ||||||||    
T  42850113 ttgctagaatacatccacttattttttaaaaagtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccctaaagtgtagc-ttgctaaaaca 42850210  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  42850211 ctcccacataaaaactaatgggtgtattcta 42850241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23387322 - 23387144
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||| || |||| |||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  23387322 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatcttgttaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 23387225  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac-accttaag 191  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23387224 ttgttaggatacacctacttattttttagaaggtgtatcttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacgaccttaag 23387144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 19630754 - 19630855
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19630754 tttagcaagttataactaaaaaattaataaatacacattaaggtatatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatc 19630853  T
Q  101 ct 102  Q
    ||    
T  19630854 ct 19630855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 19827655 - 19827756
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19827655 tttagcaagttataactaaaaaattaataaatacacattaaggtatatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatc 19827754  T
Q  101 ct 102  Q
    ||    
T  19827755 ct 19827756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23234130 - 23234017
Alignment:
Q  128 cttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaacta 227  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  23234130 cttattttttagaaggggtactttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacatcctgaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaatta 23234031  T
Q  228 gtgggtgtgttcta 241  Q
    || |||||||||||    
T  23234030 gtaggtgtgttcta 23234017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29404118 - 29403914
Alignment:
Q  33 acaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttat 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||   ||||||||||    |||||| ||  | | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  29404118 acaccttaaggtgaatgttgctaaaacactaattctagaaaat--aagtgggtgtaagttagcaactctcacaagcatttgctaaaatacacccacttat 29404021  T
Q  133 tttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtggg 232  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29404020 tttttagaatgagtgttttagcaaatga-taactaaaaaatggttcaatgcaccctaaggtgtagcttg-ctaaaatactcccacataaaaactagtggg 29403923  T
Q  233 tgtgttcta 241  Q
    |||||||||    
T  29403922 tgtgttcta 29403914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Original strand, 17265356 - 17265494
Alignment:
Q  99 tcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagc 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||  ||    
T  17265356 tcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatg-ataactaagaagtagttaagtacaccttaaggtgatgc 17265454  T
Q  199 tttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttc 239  Q
     || ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  17265455 -ttgctaaaacactcccacataaaaattggtggatgtgttc 17265494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 23664747 - 23664971
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||  |||||||| |||||| || |||| || ||||| |||||  || || |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  23664747 tataattaaaaaattgttaaatacattttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaaataaa-tgagtgtatgttagcaactcctataggcat 23664845  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || || |||||    
T  23664846 ttgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagttaaatacactttaagatatagc-ttgctgaaaca 23664943  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  23664944 ctcacaagtaaaaattagtggatgtgtt 23664971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 768740 - 768568
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataac-atacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 109  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  768740 tataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaaatacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 768643  T
Q  110 tttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 185  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |  ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  768642 tttgctacgatacaccaacttattttttagaaggtgcgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacac 768568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23387181 - 23387063
Alignment:
Q  6 caagttataactaaaaagttaataaatac-accttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctat 104  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||    
T  23387181 caagttataactaaaaagtagttaaatacgaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctat 23387084  T
Q  105 aggcatttgctagaatacacc 125  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  23387083 aggcatttgctaggatacacc 23387063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 1576652 - 1576823
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| || |||| || |||| ||||||  |||||||||| |  |||||| |||||||  |||    
T  1576652 tataactaaaaagttgttgaatacaccttaaggtgaatgttgataaaacacaccttct-gaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataatcat 1576749  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 185  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||   || |||||| || |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  1576750 ttgctaggatgcacccacttattttttagaatgtgtgttttaggaaat-tataactaaaaagtagttaaatacac 1576823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Original strand, 33740105 - 33740179
Alignment:
Q  166 taaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33740105 taaaaagtagttaaatgtaccttaaggtgtagcttg-ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 33740179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41527901 - 41527828
Alignment:
Q  167 aaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41527901 aaaaagtagttaaatacactctaaggtgtagtttt-ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 41527828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27337119 - 27337055
Alignment:
Q  176 ttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27337119 ttaaatacaccttaaggcgtagcttg-ctaaaacactcccacataaaaaccagtgggtgtgttcta 27337055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Original strand, 41927549 - 41927604
Alignment:
Q  185 ccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41927549 ccttaaggtgtagcttg-ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 41927604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 11675288 - 11675347
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  11675288 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 11675347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 34082702 - 34082761
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  34082702 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 34082761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19630758 - 19630720
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19630758 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 19630720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19827659 - 19827621
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19827659 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 19827621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23175398 - 23175360
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23175398 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 23175360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23586655 - 23586617
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23586655 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 23586617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43660857 - 43660694
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||| ||  | | ||||| ||||| ||| |||||||    ||| || ||||| | || |    
T  43660857 tataactaaaaagtggttaaatacaccttgaggtgcatgttgctaaaa--ttccttctaaaaaaaacaaatgggtgtaagttagtaactcctacaagcgt 43660760  T
Q  111 ttgctagaatacacctac----ttattttttagaagaagtattttagcaagtga--ataactaaaa 170  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  43660759 ttgctagaatacacctagctagttattttttagaaggagtattttagcatgtgatgataactaaaa 43660694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 44257660 - 44257698
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44257660 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 44257698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 47
Target Start/End: Original strand, 324757 - 324793
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324757 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 324793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 18370367 - 18370426
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  18370367 tttagcaagttataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaaca 18370426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 29511965 - 29512028
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaa 74  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  29511965 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctagaaaa 29512028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29512134 - 29512075
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  29512134 tttagcaagttataactaaaaagtggttaaatacactttaaggtgtagcttgctaaaaca 29512075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7682011 - 7681973
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7682011 ctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttcta 7681973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9689381 - 9689343
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9689381 ctaaaacactcccacataaaaactagcgggtgtgttcta 9689343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16513132 - 16513074
Alignment:
Q  2 ttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  16513132 ttagcaaattataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 16513074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17264935 - 17264897
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17264935 ctaaaacactcctacataaaaactagtgggtgtgttcta 17264897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30406467 - 30406429
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30406467 ctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttcta 30406429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 37169691 - 37169737
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||    
T  37169691 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgta 37169737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 38987160 - 38987198
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38987160 ctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttcta 38987198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43660915 - 43660829
Alignment:
Q  102 tataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacctt 188  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| | || |||||||  || |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43660915 tatagggatttgctaagatacacccaattgttttttatgaggagtattttaggaaagatataactaaaaagtggttaaatacacctt 43660829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 44543049 - 44543087
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44543049 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgctcta 44543087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 4206529 - 4206574
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  4206529 tttagcaagttataactaaaaagtggataatcacaccttaaggtgt 4206574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 142
Target Start/End: Original strand, 33173575 - 33173639
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatc-ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaag 142  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  33173575 aagtgggtgtattctagcaaatgtctatagg-atttgctagaacacacccacttattttttggaag 33173639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39906274 - 39906237
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39906274 taaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 39906237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41528090 - 41528057
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41528090 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 41528057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 45629736 - 45629785
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  45629736 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaaca 45629785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 194
Target Start/End: Original strand, 45629737 - 45629770
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45629737 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 45629770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 2586457 - 2586516
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2586457 aagtaggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacaccaacttatttttt 2586516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7682135 - 7682076
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7682135 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctaaaatacacccacttctttttt 7682076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Original strand, 20939705 - 20939756
Alignment:
Q  142 gaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 194  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  20939705 gaagtattttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatg 20939756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22302108 - 22302049
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  22302108 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 22302049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22711039 - 22711007
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22711039 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 22711007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44288849 - 44288809
Alignment:
Q  102 tataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaag 142  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  44288849 tataggcatttgctaaaatactcccacttattttttagaag 44288809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 44542925 - 44542984
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  44542925 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 44542984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45629726 - 45629690
Alignment:
Q  205 aaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45629726 aaaacactcccacataaaaactagtgggtgtattcta 45629690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 31132867 - 31133107
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31132867 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctatagcacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 31132966  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31132967 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 31133066  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31133067 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 31133107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29646422 - 29646183
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29646422 tttagcaagttataactaaaaa-ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 29646324  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29646323 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 29646224  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29646223 tgttaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 29646183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 27828298 - 27828542
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataa----catacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828298 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataagtaacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 27828397  T
Q  97 aatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27828398 aatcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgta 27828497  T
Q  197 gctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27828498 gctttgctaaaacactcccacataaaagctagtgggtgtgttcta 27828542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 9955786 - 9956021
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9955786 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 9955885  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9955886 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaagagtattttaacaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 9955985  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtg 236  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9955986 tgctaaaacactcctacataaaaactagtgggtgtg 9956021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 15962728 - 15962969
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15962728 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatt 15962827  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15962828 ctataggcattttctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgtataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 15962927  T
Q  201 tactaaaacactcccacgt-aaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15962928 tgctaaaacactcccacataaaaaactagtgggtgtgttcta 15962969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 1369890 - 1370129
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1369890 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctaacaaatc 1369988  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1369989 ctatagacatttgctagaatacatccatttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 1370088  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1370089 tgctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttcta 1370129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 11100371 - 11100599
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11100371 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 11100470  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11100471 ctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 11100570  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagt 229  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11100571 tgctaaaacactcccacataaaaactagt 11100599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 10777934 - 10778166
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10777934 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctaacaaatc 10778033  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10778034 ctatagacatttgctaggatacacccacttggtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgtttaaatacaccttaagatgtagctt 10778133  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggt 233  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10778134 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggt 10778166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 4184252 - 4184491
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4184252 tttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt--acgttgttataacgcaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 4184349  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4184350 ctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 4184449  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaa-ctagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  4184450 tgctaaaacactcccacataaaaacctagtggatgtgttcta 4184491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8172082 - 8171843
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8172082 tttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 8171984  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||    
T  8171983 ttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaataaataactaaacagtggttaaatacactctaagttatagctt 8171884  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  8171883 tgctaaaacactcccacataaaaattagtggatgtgttcta 8171843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16599060 - 16599300
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||  ||||    
T  16599060 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagttggtgtgttttagtgaatc 16599159  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  16599160 ctataggcatttactagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtagctt 16599259  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16599260 tggtaaaacactcccacataaaaactagtgagtgtgttcta 16599300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 5187761 - 5187999
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  5187761 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaaat-aagtgggtgtgttctagcaaaac 5187859  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  5187860 ctacaggcatttgctagaatacacccacttattttttagattgagtattttaacaaatgaataactaaaaagtgattaaatacacc-taagatgtagatt 5187958  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  5187959 tgctaaaacacttccacataaaaattaatgggtgtgttcta 5187999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 26667856 - 26668026
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26667856 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatt 26667955  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26667956 ctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 26668026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 71 - 241
Target Start/End: Original strand, 20755416 - 20755586
Alignment:
Q  71 aaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaa 170  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20755416 aaaaaacaagtgaatgtgttctagcaaatcctatagacgtttgctagaatacacgcacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaa 20755515  T
Q  171 agtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20755516 agtggttaaatacaccttaaggtatattttttctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 20755586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33730710 - 33730487
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||  |   | || ||||  ||||| ||||||||||||    
T  33730710 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataa---gagtatgtt--agcaactcctataggcat 33730616  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  33730615 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 33730518  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33730517 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 33730487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 26211270 - 26211507
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||| ||||   || ||||||| |  |||||| ||    
T  26211270 tttagtaagttatagctaaaaagttgataaatacacctcggggcgtatgttgctataacatacgttctaaaaaat--aaatgggtgtatgttagcaattc 26211367  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||| |    
T  26211368 ttgtaggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaaatg-ataattaaaaagtagtcaagtacaccttaaggtgtagc-t 26211465  T
Q  201 tactaaaacactcccacgt-aaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||||||||    
T  26211466 tgctaaaacactcccatataaaaaactagtgaatgtgttcta 26211507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 15881917 - 15882018
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15881917 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 15882015  T
Q  101 cta 103  Q
    |||    
T  15882016 cta 15882018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 4898447 - 4898673
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || || || ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  4898447 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttttaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 4898544  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  4898545 ttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 4898642  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||  || |||||| |||||| |||||||||    
T  4898643 ctcatacataaaaattagtggatgtgttcta 4898673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14488490 - 14488264
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||| ||||   ||||| |||| |  |||||| || |||||||||    
T  14488490 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactcattctaaaaaat--aagtgagtgtatgttagcaactcatataggcat 14488393  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||| |||||||||||    
T  14488392 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacattctaaggtgtagc-ttactaaaaca 14488295  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| || ||||| |||||||  ||||||||    
T  14488294 ctcctacataaaatctagtggacgtgttcta 14488264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 11210288 - 11210396
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  11210288 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaataagtgggtgcgttctagcaaatc 11210386  T
Q  101 ctataggcat 110  Q
    ||||||||||    
T  11210387 ctataggcat 11210396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 10196671 - 10196574
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaa 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10196671 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctagaaaaagcaagtgggtgtattctagcaaa 10196574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4838473 - 4838241
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  4838473 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 4838376  T
Q  111 ttgctagaa------tacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttact 204  Q
    || |||| |      |||||| |||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||  ||    
T  4838375 ttactaggaataggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaaatacttagatacaccttaaggtgtagcttg-ct 4838278  T
Q  205 aaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4838277 aaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 4838241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18102881 - 18102654
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || |||| || || || |||||  |||| ||||| |   ||||| | ||||||||||    
T  18102881 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgttaaaacacaccttttaaaaaaat-aagttggtgtatgtcagcaacttctataggcat 18102783  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  18102782 ttgctatgatacacccacttattttttagaatgtgtattttagcaagt-tataactaaagagtagttaaatacaccttcaggtgtagc-ttgctaaaaca 18102685  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  18102684 ctcccacataaaaactagtcgatgtgttcta 18102654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24022944 - 24022847
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24022944 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctaccaaa 24022847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Original strand, 10315306 - 10315434
Alignment:
Q  114 ctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaa-taactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacact 212  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  10315306 ctagaatacactcacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaaataactaaaaggttgttaaatacaccctaatgtgtagctttgctaaaacact 10315405  T
Q  213 cccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10315406 cccacataaaaactagcgggtgtgttcta 10315434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 241
Target Start/End: Original strand, 30525374 - 30525581
Alignment:
Q  30 aatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctact 129  Q
    |||||||||||||||| || |||||| || | || ||||| || |   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  30525374 aatacaccttaaggtgaatcttgctaaaatacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacactcact 30525471  T
Q  130 tattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagt 229  Q
    ||||||||||||    | ||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  30525472 tattttttagaaagtatgttttagcaaatta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgcagcttg-ctaaaacactcccacataaaaactaat 30525569  T
Q  230 gggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||    
T  30525570 gggtgtgttcta 30525581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 241
Target Start/End: Original strand, 15882021 - 15882116
Alignment:
Q  146 tattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15882021 tattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcataaggtgtagctttgttaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 15882116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 35002085 - 35001995
Alignment:
Q  8 agttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  35002085 agttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattcta-acaaaacaagtgggtgtgttctagcaaat 35001995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 3437994 - 3438217
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| || | |  ||||| ||||   | |||||||| |  || ||| || |||||||||    
T  3437994 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgctgctaaaatacaacttctaaaaaat--atgtgggtgtatgttaccaactcttataggcat 3438091  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    |||| || ||| ||| |||||||||||||||   || ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3438092 ttgcaaggatatacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt-actaaaaca 3438189  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  3438190 cttccacataaaaactagtgggtgtgtt 3438217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 4898128 - 4898355
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||    |||||| |||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||   |||| ||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  4898128 tataactaaaaagttgtccaatacatcttaagatgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagttggtgtatgttagcaactcctataggcat 4898225  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttatttttta-gaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||  || |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||| || ||||||     
T  4898226 ttgctagaatacactcacttattttttattaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaattgttaaatacacctcatggtgtagc-ttgctaaaat 4898323  T
Q  210 actcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4898324 actcccacataaaaagtagtgggtgtgttcta 4898355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25061845 - 25061627
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  25061845 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaag-tgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 25061749  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| || ||||||||    
T  25061748 ttgctaggatacaccaacttatttgttagaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaataca-tttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 25061652  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||      |||||||||||||||||||||    
T  25061651 ctcc------aaaactagtgggtgtgttcta 25061627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18154671 - 18154510
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 177  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |  || ||||||||||| | |||| ||||| | |||    
T  18154671 aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgttaggatacacccacttattttatagacggtgtgttttagcaagtta-taacaaaaaaatagtt 18154573  T
Q  178 aaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18154572 aaatacaccttaaggtgtagcttg-ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 18154510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15718401 - 15718174
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||  ||||||||||    |||||| ||||||||||||    
T  15718401 tataacgaaaaatttgttaaatacattttaaggtgaatgttgctaaaacacactttcta-aaaaattaagtgggtgtaagttagcaactcctataggcat 15718303  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||| ||||||||| | |||||| |||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15718302 ttgttagaatacatccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 15718205  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
     |||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  15718204 ttcccacataaaaactattgagtgtgttcta 15718174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11742514 - 11742288
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  11742514 tataactaaaaagttgttaaatacattttaaggtgtattttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 11742417  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||||  |||  || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  11742416 ttgctaggatacacccatttaattttttaaaggtgtgttttagcaggt-tataactaaaaaatagtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 11742319  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || || | |||||| ||||||||||||||||    
T  11742318 cttcctcataaaaattagtgggtgtgttcta 11742288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 21969895 - 21970097
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||| || || |||  ||||| ||||   |||||||||| |  || ||| || ||||  |||    
T  21969895 tataactaaaatgttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaatataatttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttaccaactcttataaacat 21969992  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21969993 ttgctagaatacatctacttattttttataaggtgtattttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaaca 21970090  T
Q  211 ctcccac 217  Q
    || ||||    
T  21970091 cttccac 21970097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9406785 - 9406615
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |  |||| || ||||| |||||  || | ||||| |  |||||| ||    
T  9406785 tttagcaagttataactaaaaagttgataaatacactttgaggtgcatgttgttgcaacacaccttctaaaaaaataaa-taggtgtatattagcaattc 9406687  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagt 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  9406686 ctatatgcatttgctagaatacacccacttattgtttacaatgagtgtttcagcaagtgaa-aactaaaaagt 9406615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Original strand, 11009932 - 11010140
Alignment:
Q  28 taaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccta 127  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| || |  ||||||| ||||   |||||||| | |  || ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  11009932 taaatataccttaaggtgaatgttgctaaaagactcattctaaaaaat--aagtgggtctatgttaacaactcctatatgcatttgctagaatacactca 11010029  T
Q  128 cttattttttagaa--gaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaac 225  Q
    ||| ||||||      ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  11010030 ctttttttttttttttgaagtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccatataaaaac 11010127  T
Q  226 tagtgggtgtgtt 238  Q
    |||||||||||||    
T  11010128 tagtgggtgtgtt 11010140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32194260 - 32194181
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||    
T  32194260 ataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttactaaaacacttccacatgaaaactagtggatgtgttcta 32194181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 33311671 - 33311738
Alignment:
Q  16 ctaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgg 83  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  33311671 ctaaaaaattaataaatacaccttaaagtatatgttgctataacacatcttctagaaaaagcaagtgg 33311738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 190
Target Start/End: Original strand, 32889636 - 32889715
Alignment:
Q  109 atttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32889636 atttgctagaatacacccacttattttttaaaagaagtattttaacaaagatataact--aaagtggttaaatacaccttaa 32889715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 4898583 - 4898642
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  4898583 tttagcaagttataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 4898642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11100251 - 11100081
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||| ||||  || ||||| |||||| || ||||||||| ||||  |||| || ||||||  | ||| ||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  11100251 tataactaaatagttgttacatacagcttaagatgaatgttgctaaaacactcattttaaaaaaagtgaatggttgtatattagcaactcctatatgcat 11100152  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttatt-ttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 181  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  11100151 ttgctagaatgcacccacttatttttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaat 11100081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Original strand, 228035 - 228119
Alignment:
Q  148 ttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgt 235  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  228035 ttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatataccttaa-atgtagc-ttgctaaaacacttccacatgaaaactagtgggtgt 228119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 8172078 - 8172116
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8172078 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 8172116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11100375 - 11100337
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11100375 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 11100337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15881921 - 15881883
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15881921 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 15881883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3881444 - 3881411
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3881444 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 3881411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 8062106 - 8062216
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| |||| || ||||   ||||   ||||| ||| ||||| ||||||    
T  8062106 tttaacaagttataattaaaaagtgaataaatacactttcacgtgtatgttgctaaaacaaaccttct--taaaaattagtggatgtcttctaacaaatc 8062203  T
Q  101 ctataggcatttg 113  Q
     ||||||||||||    
T  8062204 ttataggcatttg 8062216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27902335 - 27902280
Alignment:
Q  188 taagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaa--actagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  27902335 taaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaacactagtgggtgtgttcta 27902280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 33730577 - 33730518
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  33730577 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 33730518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 3438130 - 3438176
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  3438130 tttagcaagttataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 3438176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9955790 - 9955752
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9955790 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 9955752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 29646418 - 29646456
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29646418 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 29646456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31132871 - 31132833
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31132871 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 31132833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16599063 - 16599026
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16599063 taaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 16599026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20755400 - 20755363
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20755400 taaaacactcccgcataaaaactagtgggtgtgttcta 20755363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26211277 - 26211236
Alignment:
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  26211277 ttactaaaacactcccacataaaaactagtaggtatgttcta 26211236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 30525498 - 30525393
Alignment:
Q  50 ttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtat 148  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||   ||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||| |||||| |||||||||  ||||    
T  30525498 ttgctaaaacatactttctaaaaaat--aagtgagtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttatattttagaaggtgtat 30525402  T
Q  149 tttagcaag 157  Q
    |||||||||    
T  30525401 tttagcaag 30525393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 55
Target Start/End: Original strand, 5703853 - 5703897
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcta 55  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||    
T  5703853 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtagatgttgcta 5703897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 30525491 - 30525535
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtg 45  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  30525491 tttagcaaattataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtg 30525535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 105)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 20411185 - 20411425
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20411185 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 20411284  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20411285 ctatagtcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatcttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 20411384  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20411385 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 20411425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 14494357 - 14494597
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14494357 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 14494456  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14494457 ctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataaaccttaaggtgtagctt 14494556  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14494557 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 14494597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 27255640 - 27255875
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27255640 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttttagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 27255739  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27255740 ctataggcatttgctagaatacaccctcttattttttaaaaggagtattttaggaagtaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 27255839  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtg 236  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27255840 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtg 27255875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 36817638 - 36817878
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36817638 tttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctacaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 36817737  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36817738 ctataggaatttgctagaatacacacacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaattcaccttaaggtgtagctt 36817837  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36817838 tgctaaaacactctcacataaaaactagtgagtgtgttcta 36817878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12864487 - 12864249
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |   | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12864487 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgctataacacaccta--aaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 12864390  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12864389 atataggcatttgctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 12864290  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12864289 tgctaaaacactcccacataaaaactactgggtgtgttcta 12864249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 39424257 - 39424495
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39424257 tttagcaagatataattaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtgttctagcaaatc 39424355  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39424356 ctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 39424455  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttct 240  Q
    | |||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  39424456 tgctaaagtacttccacataaaaactagtgggtgtattct 39424495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13385931 - 13385689
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13385931 tttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatc 13385832  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13385831 ctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaattgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtaactt 13385732  T
Q  201 t--actaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13385731 tgcgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtatgttcta 13385689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1805184 - 1804945
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1805184 tttagcaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttttaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 1805086  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  1805085 ctataggcatttgctagaatacacccacttatcttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaatacatcctaaggtgtagctt 1804986  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  1804985 tgctaaaacactcccacataaaaattaatgggtgtgttcta 1804945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27389686 - 27389453
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27389686 tttagcaagttatgactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa--caagtgggtgtgttctagcaaatc 27389589  T
Q  101 ----ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 196  Q
        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27389588 aatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgta 27389489  T
Q  197 gctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggt 233  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27389488 gctttgctaaaaca-tcccacataaaaactagtgggt 27389453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16960271 - 16960483
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16960271 tttagcaagatataactaaaaatttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttatagcaaatc 16960369  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16960370 atataggcatttgctagaatacactcacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 16960469  T
Q  201 tactaaaacactcc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  16960470 tgctaaaacactcc 16960483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32716598 - 32716363
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32716598 tttatcaagttataactaaaaagttaataaatacatat----gtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 32716504  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32716503 ttataggcatttgctagaatacacccacttatttttaagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 32716404  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  32716403 tgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttcta 32716363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 43236142 - 43236390
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttct-------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| || |||||            
T  43236142 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtggatgcgttctaggcttct 43236241  T
Q  93 agcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaga 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  43236242 agcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaagtggataactaaaaagtggttaaatacaccttaatg 43236341  T
Q  193 tgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43236342 tgttgctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 43236390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32374736 - 32374497
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32374736 tttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatc 32374637  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  32374636 ctatagacatttgttacgatacacccacttagtttgtagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtaac-t 32374538  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32374537 tgctaaaacacttccacataaaaactagtgggtgtgttcta 32374497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 47131111 - 47130911
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  47131111 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatc 47131013  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctactta-ttttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  47131012 ctataggcatttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagct 47130913  T
Q  200 tt 201  Q
    ||    
T  47130912 tt 47130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 241
Target Start/End: Original strand, 14387468 - 14387628
Alignment:
Q  81 tgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14387468 tgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttggcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 14387567  T
Q  181 tacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14387568 tacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcacacggaaaaactagtgggtgtgttcta 14387628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 52772234 - 52772466
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaag-caagtgggtgtgttctagcaaat 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  52772234 tttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg-tataacacatcttctaaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaat 52772332  T
Q  100 cctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||    
T  52772333 cttataggcatttgctagaatacacccacttatttttcagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaat--------aggtgtagct 52772424  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || |||||||||||| || |||||| || |||||||||||||    
T  52772425 ttgctaaaacactcctacataaaaattaatgggtgtgttcta 52772466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51465217 - 51464996
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  51465217 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtggatgtgttatagcaaatc 51465119  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| |||    
T  51465118 ttacaggcaattgctagaatacacc-acttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaaatggttaaatacagcctaaggtgtaactt 51465020  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaa 224  Q
    | ||||||||||||||| ||||||    
T  51465019 tgctaaaacactcccacataaaaa 51464996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28094614 - 28094388
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28094614 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaaacaagtggatgtgttctagcaaatc 28094515  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||||              |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  28094514 ctatagg--------------cacccacttatttttaagaaggagtattttagtaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctt 28094429  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28094428 tgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 28094388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 241
Target Start/End: Original strand, 13943351 - 13943490
Alignment:
Q  102 tataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagcttt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13943351 tataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagcttt 13943450  T
Q  202 actaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13943451 gttaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 13943490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20201894 - 20201757
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20201894 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatagaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 20201795  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttatttttta 138  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20201794 ctatagacatttgctataatacacccacttatttttta 20201757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 26842998 - 26843224
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||  |||   ||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  26842998 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacacattctaataaat--aagtgggtgtgtgttagcaactcctataggcat 26843095  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  26843096 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaagttgtagc-ttgctaaaaca 26843193  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26843194 ctcacacataaaaactagttggtgtgttcta 26843224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10764794 - 10764565
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| || ||||| |||    
T  10764794 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcttatagacat 10764696  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    || |||||||||||| ||| ||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||    
T  10764695 tttctagaatacacccactcattttttagaaggtgtgttatagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgttaaaaca 10764596  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10764595 ctctcacataaaaactagtgggtgtcttcta 10764565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16005760 - 16005533
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||| |||| || ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  16005760 tataactaaaaagttgttaaatacacctcaagctgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 16005662  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  16005661 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgttaaaaca 16005564  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||    
T  16005563 cttctacataaaaactagtgggtgtgttcta 16005533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 13157557 - 13157786
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaa---atcctatagg 107  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  ||||||   |||||||||     
T  13157557 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactgatcctataga 13157654  T
Q  108 catttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaa 207  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  13157655 catttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaa 13157752  T
Q  208 acactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13157753 acactcccacataaaaactagtaggtgtgttcta 13157786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 34515129 - 34515354
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| || |||  |  ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  34515129 tataactaaaaagttgtaaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacgcatcttcttaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 34515228  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| |||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  34515229 ttgttagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 34515326  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34515327 ctcccacataaaaactagtgggtgtgtt 34515354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Original strand, 463378 - 463539
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 177  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  463378 aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtt 463476  T
Q  178 aaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  463477 aaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 463539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28454900 - 28454672
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||||| |||| || ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  28454900 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaagctgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaa--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 28454803  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| | |||||| |||||| || ||||||||    
T  28454802 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaacagtagttaaatataacttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 28454705  T
Q  211 ctcccacgt--aaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  28454704 ctcccacataaaaaaactagtgggtgtgctcta 28454672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 27348119 - 27348313
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||   || ||||| |||  |||||| ||    
T  27348119 tttatcaagttataactaaaaagttgataaatacaccttaaggtgtat-ttgctataacacaccttataaaaaat--aaatgggtatgtgttagcaactc 27348215  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  27348216 ttatag-catttgttagaatacaccaacttattttttagaagaagtattttagcaaatg-ataactaaaaaatagttaagtacatcttaagttgtagctt 27348313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8643126 - 8642965
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 177  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||| |||    
T  8643126 aagtgggtgtatgttagcaactcctatacgcatttgctataatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataaccaaaaagtagtt 8643028  T
Q  178 aaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8643027 aaatgcgccttaagatgtagc-ttgctaaaacactcccatataaaaactagtgggtgtgttcta 8642965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 50559250 - 50559476
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||   || | | ||| |  |||||| ||||||||||||    
T  50559250 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aaatagatgtatgttagcaactcctataggcat 50559347  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||| ||| |||| || ||||||||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||| | |||| || ||||||||    
T  50559348 ttgttaggatacgcccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtttagc-ttgctaaaaca 50559445  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  50559446 ctcctacataaaaactagtgggtgtgttcta 50559476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 6192424 - 6192650
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgt--atgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggc 108  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |  ||||| ||||   ||||||||||||  |||||| ||||||| ||    
T  6192424 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggggtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaat--aagtgggtgtgtgttagcaactcctatatgc 6192521  T
Q  109 atttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaa 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  6192522 atttgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgtttcagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaa 6192619  T
Q  209 cactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttc 239  Q
     |||   || ||||||||||||| |||||||    
T  6192620 tactatgacataaaaactagtggatgtgttc 6192650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 16073438 - 16073650
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || | ||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||| ||||||    
T  16073438 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaaaaaataagtgggtgtttgttagcaactcctacaggcat 16073537  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||| ||  ||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||    
T  16073538 ttgttatgatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacgttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 16073635  T
Q  211 ctcccacgtaaaaac 225  Q
    | ||||| |||||||    
T  16073636 cacccacataaaaac 16073650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13264699 - 13264502
Alignment:
Q  38 ttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||| ||| |  |||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13264699 ttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaat--aagtggatgtatgttagcaactcatataggcatttgctaggatacacccacttatttttt 13264602  T
Q  138 agaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgt 237  Q
    |||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  13264601 agaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccac--taaaactagtgggtgtgt 13264506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 28646750 - 28646847
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  28646750 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaaacaaacaagtgggtgtgttctagcaaa 28646847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12010674 - 12010567
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtg--tatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12010674 tttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaa 12010575  T
Q  99 tcctatag 106  Q
    ||||||||    
T  12010574 tcctatag 12010567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23413830 - 23413606
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |  ||||||||||| |  |||||| ||||||   |||    
T  23413830 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaata--caagtgggtgtatgttagcaactcctatgaacat 23413733  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||   ||  ||  ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  23413732 ttgctagaatacatccacttattttttt--aggtgtgctttaggaattta-taactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 23413637  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23413636 cccccacataaaaactagtgggtgtcttcta 23413606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 27787867 - 27788028
Alignment:
Q  79 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtta 178  Q
    ||||||||| |  |||||| || |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27787867 agtgggtgtatgttagcaactcttataggaatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtta 27787965  T
Q  179 aatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgt-aaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  27787966 aatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaaaatagtgggtgtgttcta 27788028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 36389459 - 36389630
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  36389459 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 36389556  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 185  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  36389557 ttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacac 36389630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 51432042 - 51431815
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||||||||| |  ||| || |||||||| |||    
T  51432042 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggttaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttaggaactcctatagacat 51431944  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataact-aaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |  |||||| |||||   ||||||| ||||||||| |||| | || |||||||    
T  51431943 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaaat-tataactaaaaaaacagttaaatgcaccttaaggtgtaac-ttgctaaaac 51431846  T
Q  210 actcccacgtaaaaactagtgggtgtgttct 240  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  51431845 actccaacataaaaactagtgggtgtgttct 51431815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 34306440 - 34306657
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||| ||||   ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  34306440 tataattaaaaagttgctaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacactcattctaaaaaat--aagtgagtgtatgttagcaactcctataggcat 34306537  T
Q  111 ttgctagaatacac----ctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaa 206  Q
    ||||||||||||||    | ||||||||||||||||  ||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || || |    
T  34306538 ttgctagaatacactcacccacttattttttagaagttgtgctttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttcctga 34306635  T
Q  207 aacactcccacgtaaaaactag 228  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  34306636 aacactccgacataaaaactag 34306657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 158417 - 158640
Alignment:
Q  14 aactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttg 113  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||  || ||| ||| |  |||||| ||||||||| |||||    
T  158417 aactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctt-aaaaattaaatggatgtatgttagcaactcctataggaatttg 158515  T
Q  114 ctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactc 213  Q
    ||| ||| |||| ||||||||| ||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||    
T  158516 ctataattcacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagctaaatacaccttaaggtgttgc-ttgctaaaacactc 158613  T
Q  214 ccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||   |||||| ||||||||||||||||    
T  158614 cc-tataaaaattagtgggtgtgttcta 158640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Original strand, 24770695 - 24770856
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 177  Q
    |||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  24770695 aagtgggtgtatgttagcaacccctataggcatttgctaggatacacccacttattcttttgaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtg 24770793  T
Q  178 aaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24770794 aaatgcaccttaagatgtagc-ttgctaaaacactctcacataaaaactagtgagtgtgttcta 24770856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32156178 - 32155952
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||    ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||| || ||||    
T  32156178 tataactaaaaaattgttaaatgcaccttaagatgaatgttgctaaaacaccgtttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctgtatgcat 32156081  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||| || ||||||||    
T  32156080 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtgttttagcaagt-tataaataaaaagtagttaaatacatcctaaggtgtagc-ttgctaaaaca 32155983  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
     || ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  32155982 ttcacacataaaaactaatgggtgtgttcta 32155952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41146445 - 41146219
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||  |||   ||||||| || |  || ||| ||| |||| |||    
T  41146445 tataactaaaaggttgctaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattctaagaaat--aagtgggcgtatgttaacaactccaatagacat 41146348  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  41146347 ttgctaggatatacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagcttg-ctaaaaca 41146250  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  41146249 ctcccatataaaaactagtgggtgttttcta 41146219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Original strand, 32994250 - 32994397
Alignment:
Q  92 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 191  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||| | || ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  32994250 tagcaaatcatatggccatttgctagaatacactcatttattttttagaatatgtgttttagcaagtta-taattaaaaagtagttaaatgcatcttaag 32994348  T
Q  192 atgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
     ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32994349 gtgtagcttg-ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 32994397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Original strand, 3979443 - 3979605
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 177  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||  |||| |||||  ||||||||||||| |||    
T  3979443 aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttaacaagt-tataactaaaaagtagtt 3979541  T
Q  178 aaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccac-gtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| ||| ||||||||||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3979542 aaaaacatcttaagatgtag-attgctaaaacactcccacaataaaaactagtgggtgtgttcta 3979605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12010569 - 12010480
Alignment:
Q  151 tagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12010569 tagcaagtaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaa-actcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 12010480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45818976 - 45818751
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||||| ||| |  |||||| || ||||| |||    
T  45818976 tataactaaaatgttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaat-aagtgg-tgtatgttagcaactcatatagacat 45818879  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||| || | | |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  45818878 ttgctataatacacccacttattttttagaagttgtgctttagaaaatta-taactaaaaagaagttaaaaacaccttaag-tgtagcttg-ctaaaaca 45818782  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  45818781 ctccgacataaaaactagtgggtgtattcta 45818751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Original strand, 13157281 - 13157411
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||   |||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  13157281 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacactaattctaaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 13157380  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaa 141  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  13157381 ttgctataattcacccacttattttttagaa 13157411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42200048 - 42199847
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |  || || ||||   |||| ||||| |  |||||| || || ||||||    
T  42200048 tataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtaaatgttgctaaaacacatcttttaaaaaat--aagtaggtgtatgttagcaactcttacaggcat 42199951  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  42199950 ttgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 42199853  T
Q  211 ctccca 216  Q
    ||||||    
T  42199852 ctccca 42199847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42208916 - 42208715
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |  || || ||||   |||| ||||| |  |||||| || || ||||||    
T  42208916 tataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtaaatgttgctaaaacacatcttttaaaaaat--aagtaggtgtatgttagcaactcttacaggcat 42208819  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  42208818 ttgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 42208721  T
Q  211 ctccca 216  Q
    ||||||    
T  42208720 ctccca 42208715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Original strand, 5491681 - 5491825
Alignment:
Q  92 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 191  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5491681 tagcaactcctatagacatttactagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccctaag 5491779  T
Q  192 atgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
     |||| | || ||||||||| || |  |||||| |||||||||||||    
T  5491780 gtgtatc-ttgctaaaacacacctatataaaaattagtgggtgtgtt 5491825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3273528 - 3273370
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  3273528 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaagcactcattctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 3273430  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 171  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||| |||  || |||||| ||||  |||||||||||    
T  3273429 ttgttagaatgcacccacttattttttaaaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaa 3273370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 4158116 - 4158336
Alignment:
Q  19 aaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaga 118  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||| ||| |  |||||| ||||||| ||||||| |||     
T  4158116 aaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtggatgtatgttagcaactcctataagcatttgttagg 4158213  T
Q  119 atacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacg 218  Q
    | ||||| |||||||||||| |||  || |||||||| ||  ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||     
T  4158214 aaacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaggt-tataactaaaaaataattaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaacactcccaca 4158312  T
Q  219 t-aaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||| | ||||||||||    
T  4158313 taaaaaactagcgagtgtgttcta 4158336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 14387255 - 14387480
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||| ||||   || ||||||  |  |||||  |||||||| |||    
T  14387255 tataactaaaaagttgttgaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaat--aaatgggtgcatgttagcagctcctatagccat 14387352  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    || |||||||||| | | |||||||| |||||  || ||||| ||||| | |||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||| |||    
T  14387353 ttactagaatacatccatttattttt-agaaggtgtgttttaacaagtta-taactaaaaaatagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaacaca 14387449  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  14387450 ctcccacataagaactaatgggtgtgttcta 14387480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24190929 - 24190751
Alignment:
Q  8 agttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagg 107  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||  ||||  |||| |  |||||  | ||||| |    
T  24190929 agttataattaagaagttcataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacaccttct--aaaaaataagtaagtgtatattagcatcttctatatg 24190832  T
Q  108 catttgctagaatacacctact--tattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacct 187  Q
    |||||||||||||| | | |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| |||||    
T  24190831 catttgctagaatagaacgacttatattttttagaaggagtattttatcaagtgaa-aactaaaaaatgattaaatgcacct 24190751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 50797653 - 50797788
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||| ||||||  || ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| ||    
T  50797653 tttagcaagttataactaaaaagttaacaaatactccttgagatgtatgttgttataacccaccttct--aaaaaataagtgggtgtatgatagcaactc 50797750  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttatttttta 138  Q
    ||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  50797751 ctataagcacttgttagaatatacccacttatttttta 50797788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 2965380 - 2965334
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2965380 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 2965334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 33676209 - 33676084
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| || |||| || ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||| |||    
T  33676209 tataattaataagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgctagcaactcctatagacat 33676111  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  33676110 ttgttaggatacacccacttatttttt 33676084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 3099558 - 3099631
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaa 74  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3099558 tttatcaagttaaaactaaaaagttgataaatacaccttaaaatgtatgttgctataacacacattctaaaaaa 3099631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33675899 - 33675794
Alignment:
Q  130 tattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagt 229  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| || |||||| || ||||| |||||||||||    
T  33675899 tattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaatac-cccacataaaaactagt 33675803  T
Q  230 gggtgtgtt 238  Q
    |||||||||    
T  33675802 gggtgtgtt 33675794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 47130797 - 47130907
Alignment:
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||   |  |||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  47130797 ctatgggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaatgtgcgttttagcaggtta-taactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagctt 47130895  T
Q  201 tactaaaacact 212  Q
    | ||||||||||    
T  47130896 tgctaaaacact 47130907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 20201700 - 20201817
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggca 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  || |||||  |||||||||| || ||||||||  ||||||| |    
T  20201700 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacat--tataaaaaataagtgggtgtattatagcaaatgtctatagg-a 20201796  T
Q  110 tttgctagaatacacctactt 130  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  20201797 tttgctagaacacacccactt 20201817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 156
Target Start/End: Original strand, 32151931 - 32152009
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaa 156  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||    
T  32151931 aagtgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 32152009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 28704545 - 28704439
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||  |||||  || || |||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  28704545 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattct--aaaaaataaatgagtgtatattagcaactcctataagcat 28704448  T
Q  111 ttgctagaa 119  Q
    |||||||||    
T  28704447 ttgctagaa 28704439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 52772241 - 52772200
Alignment:
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52772241 ttactaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 52772200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 463449 - 463508
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  463449 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 463508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 5491738 - 5491797
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  5491738 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtatcttgctaaaaca 5491797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 13157696 - 13157755
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  13157696 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 13157755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 27787937 - 27787996
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  27787937 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 27787996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 34515267 - 34515326
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  34515267 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 34515326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 13385927 - 13385965
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13385927 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 13385965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 27389682 - 27389720
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27389682 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 27389720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Original strand, 32144028 - 32144135
Alignment:
Q  47 atgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagt 146  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||   |||||||||| |  |||||| || |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  32144028 atgttgctaaaacacatattctagaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcttatatgcatttgctgggatacacccacttattttttagaaggtgt 32144125  T
Q  147 attttagcaa 156  Q
    | ||||||||    
T  32144126 aatttagcaa 32144135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Original strand, 32151995 - 32152049
Alignment:
Q  83 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32151995 ggtgtgttttagcaactcctatagacatttgctaggatacacccacttatttttt 32152049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 34306580 - 34306626
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34306580 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 34306626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 158551 - 158596
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  158551 tttagcaagttataactaaaaagtagctaaatacaccttaaggtgt 158596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 10558212 - 10558261
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10558212 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 10558261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 34825611 - 34825554
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataa 58  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  34825611 tttagcaaattatcactaaaaagttgataaatacatattgaggtgtatgttgctataa 34825554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 47130983 - 47131042
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  47130983 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttatttttt 47131042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 47
Target Start/End: Original strand, 6192565 - 6192608
Alignment:
Q  4 agcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  6192565 agcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 6192608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13264590 - 13264531
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  13264590 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 13264531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16005623 - 16005525
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctaga-aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||  ||| || ||||    ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||    
T  16005623 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagcttgttaaaaca---cttctacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaat 16005527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 16073576 - 16073635
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  16073576 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacacgttaaggtgtaacttgctaaaaca 16073635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 26843134 - 26843193
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  26843134 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaagttgtagcttgctaaaaca 26843193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 28764549 - 28764612
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaa 74  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  28764549 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaa 28764612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 139
Target Start/End: Original strand, 32144130 - 32144177
Alignment:
Q  92 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttag 139  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32144130 tagcaactcctatagacatttgctaggatacacccacttattttttag 32144177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 42199912 - 42199853
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  42199912 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 42199853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 42208780 - 42208721
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  42208780 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 42208721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 2965376 - 2965414
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2965376 ctaaaacactccgacataaaaactagtgggtgtgttcta 2965414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 4158244 - 4158290
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  4158244 tttagcaggttataactaaaaaataattaaatacaccttaaggtgta 4158290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 142
Target Start/End: Original strand, 9005219 - 9005253
Alignment:
Q  108 catttgctagaatacacctacttattttttagaag 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9005219 catttgctaaaatacacctacttattttttagaag 9005253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Original strand, 13157416 - 13157477
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaa 223  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  13157416 ataactaaaaaatagttaaatacaccctaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaa 13157477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 20201890 - 20201928
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20201890 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 20201928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20411189 - 20411151
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20411189 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 20411151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27255644 - 27255606
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27255644 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 27255606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 33675880 - 33675834
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  33675880 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgta 33675834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 47131107 - 47131145
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47131107 ctaaaacactcacacataaaaactagtgggtgtgttcta 47131145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 463018 - 463067
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  463018 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttcctaaaaca 463067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 194
Target Start/End: Original strand, 3977973 - 3978006
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3977973 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 3978006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 32994185 - 32994234
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32994185 tataactaaaaagttgttaagtacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 32994234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 1805056 - 1805115
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  1805056 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 1805115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 10558271 - 10558307
Alignment:
Q  205 aaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10558271 aaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttcta 10558307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28704414 - 28704371
Alignment:
Q  168 aaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacact 212  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28704414 aaaagtggttaaatgcatcttaagatgtagc-ttactaaaacact 28704371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39424385 - 39424326
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39424385 aagttggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttatttttt 39424326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 101)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6114984 - 6114744
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6114984 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 6114885  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6114884 ctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 6114785  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6114784 tgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 6114744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7848729 - 7848490
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7848729 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 7848631  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7848630 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 7848531  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7848530 tgctaaaacactcctacataaaaactagtgggtgtgttcta 7848490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21727848 - 21727608
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21727848 tttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttataaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 21727749  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21727748 ctacaggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 21727649  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21727648 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 21727608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 6109156 - 6109396
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6109156 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 6109255  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  6109256 atataggcatttgctagaatacacccatttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagcgt 6109355  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6109356 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 6109396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11460352 - 11460113
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  11460352 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgagtgtgctctagcaaatc 11460254  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11460253 ctataggcatttgctagaatgcacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 11460154  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11460153 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 11460113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47461897 - 47461657
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  47461897 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctattaaaattaagtgggtgtgttctagcaaatc 47461798  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47461797 ctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 47461698  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47461697 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 47461657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 6748642 - 6748881
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6748642 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 6748740  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  6748741 ctataagcatttgctagaatacacccacttcttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtaactt 6748840  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6748841 tgctaaaacacttccacataaaaactagtgggtgtgttcta 6748881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8815533 - 8815295
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8815533 tttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttttagcaaatc 8815435  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8815434 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttt-agaaggagtattttcgcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 8815336  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8815335 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 8815295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 241
Target Start/End: Original strand, 26158254 - 26158464
Alignment:
Q  31 atacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctactt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26158254 atacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctactt 26158353  T
Q  131 attttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtg 230  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26158354 attttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagatttgctaaaacactcccacataaaaactagtg 26158453  T
Q  231 ggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||    
T  26158454 ggtgtgttcta 26158464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4043838 - 4043591
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc----- 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |         
T  4043838 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctaacttcta 4043739  T
Q  96 --aaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagat 193  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4043738 acaaatcctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 4043639  T
Q  194 gtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4043638 gtagatttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 4043591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7521561 - 7521321
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7521561 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtattctagcaaatc 7521462  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7521461 ctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaagaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 7521362  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7521361 tgctaaaacaaacccacataaaaactagtgggtgtattcta 7521321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12896840 - 12896600
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12896840 tttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 12896741  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12896740 ctataggcatttgctaggatacacccacttaatttttggaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 12896641  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12896640 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtttgttcta 12896600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37504729 - 37504504
Alignment:
Q  15 actaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  37504729 actaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgt 37504631  T
Q  115 tagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcc 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  37504630 tagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagaaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaacacttc 37504531  T
Q  215 cacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  37504530 cacataaaaactagtgggtgtgttcta 37504504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 45059532 - 45059764
Alignment:
Q  9 gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45059532 gttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgttataacacacattctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctatagac 45059631  T
Q  109 atttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaa 208  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  45059632 atttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacactttaaggtgtagctttgctaaaa 45059731  T
Q  209 cactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45059732 cactcccaaataaaaactagtgggtgtgttcta 45059764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27728396 - 27728154
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacataca--ttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||  ||||  ||||||||||||| |||||||    
T  27728396 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttttagcaaa 27728297  T
Q  99 tcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagc 198  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27728296 tcctataggcatttgcttagatacacccacttagtttttagaaggaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagc 27728197  T
Q  199 tttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27728196 tttgctaaaacactcccacataataactagtgggtgtgttcta 27728154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 26152189 - 26152430
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  26152189 tttagctagttataactaaaaagttaataaatataccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagcaggtgtgttctatcaaatc 26152288  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagc-t 199  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  26152289 ctataggcatttggtaagatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 26152388  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26152389 ttactaaaacactcccacataaaaactagtgggtatgttcta 26152430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 995020 - 995251
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  995020 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtatgttctagcaaatc 995118  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttatttt-ttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  995119 ctataggcatttgctagaatacaaccacttatttttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccataaggtgtagct 995218  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtggg 232  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  995219 ttgctaaaacattcccacataaaaactagtggg 995251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 994714 - 994951
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  994714 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgctgctataacacaccttctaaaaaaa-caattgggtgtgttctaccaaatc 994812  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac-cttaagatgtagct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||    
T  994813 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacactctaagggtgtagct 994912  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    || |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  994913 ttgctaaaacattcccacataaaaattagtgggtgtgtt 994951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 51148004 - 51148242
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  51148004 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaagaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 51148103  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  51148104 ctata-gaatttgctagaacgcacccacttattttttagaatgagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaacttaaggtgtagctt 51148202  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||||||||| || | ||||| |||| ||||||||||    
T  51148203 tgctaaaacactcctacat-aaaaccagtgagtgtgttcta 51148242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3544490 - 3544251
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||| | || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  3544490 tttagcaaattataactaaaaagataataaatacatcttaaggtgtatgttgatataaca--cgttcaaaaataaacaagtgggtgtattctagcaaatc 3544393  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt-agaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3544392 ttataggcatttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagtgaagaattaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagct 3544293  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3544292 ttactaaaacactcccacataaaaactagtgagtgtgttcta 3544251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 51952405 - 51952173
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51952405 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatc 51952306  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttatt-ttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||          ||||||    
T  51952305 ctataggcatttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaataggttaaatac---------cgtagct 51952215  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51952214 ttactaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttcta 51952173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38798182 - 38797939
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaag-caagtgggtgtgttctagcaaat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38798182 tttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaagtgtatgttgcgataacacaccttctaaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaat 38798083  T
Q  100 cctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  38798082 cctataggcatttgctaaaatacatccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacattaaggtatagct 38797983  T
Q  200 ttactaaaaca--ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||  |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38797982 ttgttaaaacactctctcacataaaaactagtgagtgtgttcta 38797939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17065928 - 17065691
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17065928 tttagcaagttataactaagaagttaataaatacgtcttaaggtgtatgttattataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 17065830  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17065829 ctatagacatttgctagaatgtacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacacccgaagatgtagctt 17065730  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17065729 tgctaaaacact--cacataaaaattagtgggtgtgttcta 17065691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 26152502 - 26152626
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26152502 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 26152601  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26152602 ctataggcatttgctagaatacacc 26152626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 229
Target Start/End: Original strand, 2868198 - 2868383
Alignment:
Q  44 tgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaaga 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||      
T  2868198 tgtatgttgctataacacacattctaacaaaattaagtgggtgttttctagcaaatcatataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatg 2868297  T
Q  144 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagt 229  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  2868298 agtgttttagcaagtgaataaataaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacacttcaacataaaaactagt 2868383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 17226270 - 17226406
Alignment:
Q  105 aggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttact 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  17226270 aggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagaaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgct 17226369  T
Q  205 aaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17226370 aaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttcta 17226406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27800649 - 27800441
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27800649 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaagtgtatgttgctataacacaccttgtaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 27800550  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||                  |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27800549 cta------------------cacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactt 27800468  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaacta 227  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||    
T  27800467 tgctaaaacacttccacataaaaacta 27800441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 53581744 - 53581518
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  53581744 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct--aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 53581647  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  53581646 ttgctaagatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 53581549  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53581548 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 53581518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 31039564 - 31039790
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||   ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  31039564 tataactaaaaatttgttcaatacaccttaaggtgaatgatgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtgcgtgtatgttagcaactcctataggcat 31039661  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  31039662 ttgctaggatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 31039759  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31039760 ctcctacataaaaactagtgggtgtgttcta 31039790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13349320 - 13349094
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| || |   |||||||||| |  |||||| ||| ||||||||    
T  13349320 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactccaataggcat 13349223  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| || ||||||||    
T  13349222 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggcgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtggagc-ttgctaaaaca 13349125  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13349124 ctcccacataaaaaccagtgggtgtgttcta 13349094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 1376004 - 1376231
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  1376004 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 1376102  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||    
T  1376103 ttgctaggatacatccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatatacctgaaggtgtagc-tagctaaaaca 1376200  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1376201 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 1376231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Original strand, 21408611 - 21408714
Alignment:
Q  138 agaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgt 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21408611 agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgt 21408710  T
Q  238 tcta 241  Q
    ||||    
T  21408711 tcta 21408714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 33837816 - 33838047
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  33837816 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 33837914  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaag---tgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaa 207  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||   | | ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  33837915 ttgctaggatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaa 33838013  T
Q  208 acactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  33838014 acactcctacataaaaactagtgcgtgtgttcta 33838047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 53467358 - 53467584
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |   |||| ||||| |  |||||| || | |||||||    
T  53467358 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacacacattctaaaatat--aagttggtgtatgttagcaactcatgtaggcat 53467455  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || | ||  |||||||    
T  53467456 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtataac-ttgttaaaaca 53467553  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  53467554 ctcccacataaaaactagtaggtatgttcta 53467584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 3269225 - 3269333
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3269225 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 3269323  T
Q  101 ctataggcat 110  Q
    ||||||||||    
T  3269324 ctataggcat 3269333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36824140 - 36823914
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||| ||||   |||||||||| |  ||| || ||| ||||||||    
T  36824140 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagtaactccaataggcat 36824043  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    |||||||||||||   |||| |||||||||||  || ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  36824042 ttgctagaatacaagaacttgttttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttg-ctaaaaca 36823945  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  36823944 ctcccacataaaaactagttggtgtgttcta 36823914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 50913007 - 50913233
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||| ||||   || ||||||| |  |||||| ||||| ||||||    
T  50913007 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgataaaacacatattctaaaaaat--aaatgggtgtatgttagcaactcctacaggcat 50913104  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  |||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  50913105 ttgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagggagt-tataactaaaaagtagttaaatgtaccttaagatgtagc-ttgctaaaaca 50913202  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  50913203 ctcccacataaaaactagtaggtgtgctcta 50913233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 52654517 - 52654387
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||     
T  52654517 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtatatgttgctataacacaccttcta-aaaaaataagtgagtgtgttctagcaaatt 52654419  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttat 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  52654418 ctataggcatttgctaaaatacacccacttat 52654387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3800382 - 3800155
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| || | || ||||| ||||   |||||||||| |  || |||   ||||| ||||    
T  3800382 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaatacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttaacaacatctataagcat 3800285  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaa-gtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  3800284 tttctaggatacacccacttattttttagaaggttgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttg-ctaaaac 3800187  T
Q  210 actcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3800186 actcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 3800155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27317825 - 27317598
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacat-acattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 109  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||| || |  || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  27317825 tataactaaaaatttattaaatacaccttagagtgaatgttgctaaaaaaacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 27317728  T
Q  110 tttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||    
T  27317727 tttgctagaatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaac 27317630  T
Q  210 actcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  27317629 actcccacgaaaaaactagcgagtgtgttcta 27317598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8814963 - 8814737
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  8814963 tataactaaaaaattgttaaatacatcctaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaacttctataagcat 8814866  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||  || | |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  8814865 ttgctagaatacacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagt-tatgattaaaaagtagttcaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 8814768  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  8814767 ctcccacataaatcctagtgggtgtgttcta 8814737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32203334 - 32203113
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| || |||||||||    
T  32203334 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgt----tgctaaaacatacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcttataggcat 32203241  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||| || ||||||||    
T  32203240 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactagaaagtagttaaatgca-cttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 32203144  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  32203143 ctcccacataaacactagtgagtgtgttcta 32203113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27360180 - 27359956
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| || |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  27360180 tataactaaaaagttattaaatacaccttagagtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctatag-cat 27360084  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||  || ||||||||||| | ||||||||| || |||||||  |||||||| | ||||||  ||||||||    
T  27360083 ttgctagaatacatccacttattttttataaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaa-gtagttaaatgtaccttaaggtatagcttg-ctaaaaca 27359987  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27359986 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 27359956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48649396 - 48649299
Alignment:
Q  144 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  48649396 agtattttagcaagtaaataactaaaaagtggtcaaatacaccttatgatgtagctttgctaaaatactcccacataaaaactagtaggtgtgttcta 48649299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 17226194 - 17226269
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaag 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17226194 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaag 17226269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12127726 - 12127562
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  12127726 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 12127629  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtta 178  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  12127628 tttctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcatgt-tataactaaaaagtagtta 12127562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 48765217 - 48765446
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctat---aacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagg 107  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||    |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  || ||| |||||| |     
T  48765217 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctactaaaacacactttctacaaaat--aagtgggtgtatgttaacaactcctatgga 48765314  T
Q  108 catttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaa 207  Q
     |||||||| |||||||| | ||||||||||||||  || |||||| |||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||||    
T  48765315 tatttgctaaaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagtaagtta-taactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaa 48765412  T
Q  208 acactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  48765413 atactcacacataaaaactagtgggtgtgttcta 48765446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 50801759 - 50801589
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |  ||||| ||||   || || |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  50801759 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttctataaaat--aaatgagtgtatgttagcaactcctataggcat 50801662  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 184  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  50801661 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 50801589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Original strand, 50874121 - 50874291
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |  ||||| ||||   || || |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  50874121 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttctataaaat--aaatgagtgtatgttagcaactcctataggcat 50874218  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 184  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  50874219 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 50874291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 241
Target Start/End: Original strand, 26103649 - 26103848
Alignment:
Q  37 cttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttt 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||| | |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| || |  |||| ||||||||||    
T  26103649 cttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttccaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgccagga--cacccacttattttt 26103745  T
Q  137 tagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtg 236  Q
    ||||||  || ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| |||||| | ||    
T  26103746 tagaaggtgtcttttagcaagtta-taactaaaaaatagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaacactcccaaataaaaattagtggatatg 26103843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 30347766 - 30347840
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaa 75  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  30347766 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 30347840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3269555 - 3269334
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||| ||||| |  || ||| ||||||| ||||    
T  3269555 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagttggtgtatgttaccaactcctatatgcat 3269458  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataact-aaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||    | |||||||| ||  |||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| || |||||||    
T  3269457 ttgctaggatacacacacttattttttagaatgtctgttttagcatgt-tataactaaaaaaatagttaaatacactttaaggtgcagc-ttgctaaaac 3269360  T
Q  210 actcccacgtaaaaactagtgggtgt 235  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||    
T  3269359 acttccacataaaaactagtgggtgt 3269334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 48649496 - 48649399
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacacctta-aggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaa 97  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||    
T  48649496 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacatctttgaggtgtatgttgctataacacacattctaacaaaaataagtgggtgtgttttagcaa 48649399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17604969 - 17604891
Alignment:
Q  162 taactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17604969 taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttg-ctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttcta 17604891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 241
Target Start/End: Original strand, 22894903 - 22894982
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  22894903 ataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtattcta 22894982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 241
Target Start/End: Original strand, 45293131 - 45293189
Alignment:
Q  183 caccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45293131 caccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 45293189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17605658 - 17605513
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  || |||| |  ||||| ||||   ||||||| || |  |||||| ||||||| ||||    
T  17605658 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtttttaaaacacatcttctaaaaaat--aagtgggggtatgttagcaactcctatatgcat 17605561  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagt 158  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  17605560 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtttgttttagcaagt 17605513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 42856964 - 42857007
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42856964 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 42857007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 227
Target Start/End: Original strand, 34277553 - 34277700
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataact-aaaaagtggt 176  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||| ||||    
T  34277553 aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacgtttg-tagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaacg-ataactaaaaaaatggt 34277650  T
Q  177 taaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaacta 227  Q
    |||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||  || |||||||||    
T  34277651 taaatacactctaaggtgtag-tttgctaaaacattcatacataaaaacta 34277700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Original strand, 22894554 - 22894679
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||  |||    
T  22894554 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacacat-ctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacat 22894650  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttag 139  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22894651 ttgctaggatacacccacttattttttag 22894679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 52945489 - 52945529
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaa 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52945489 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatataccttaa 52945529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 3800245 - 3800186
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  3800245 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 3800186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 29239601 - 29239824
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||    | || ||||| |  |||||| || |||||||||    
T  29239601 tataactaaaaagctgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacactcattctaaaaa----atgtaggtgtatgttagcaactcgtataggcat 29239696  T
Q  111 ttgctagaatacacctactta-ttttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    ||| || |||||||| || || ||||||||||   || ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| ||  |||| |||||| || |||||||    
T  29239697 ttgttaaaatacacccacatatttttttagaatgtgtgttttaccaagt-tataactaaaaagtagttagatatactctaaggtgtagc-ttgctaaaac 29239794  T
Q  210 actcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |  | ||||||||||||||  |||||||||    
T  29239795 aat--ctcgtaaaaactagtgaatgtgttcta 29239824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 31039700 - 31039759
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  31039700 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 31039759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6748646 - 6748608
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6748646 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 6748608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 7848725 - 7848763
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7848725 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 7848763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 8815173 - 8815062
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| | ||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  8815173 tataactaaaaaattgttaaatacatcctaaggtgaatgttgctaaaacacacgttct--aaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttctataagcat 8815076  T
Q  111 ttgctagaatacac 124  Q
    ||||||||||||||    
T  8815075 ttgctagaatacac 8815062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 54244806 - 54244748
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattcta 69  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  54244806 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 54244748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30347769 - 30347732
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30347769 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 30347732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45059527 - 45059490
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45059527 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 45059490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 239
Target Start/End: Original strand, 8815529 - 8815565
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttc 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8815529 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 8815565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 13349184 - 13349140
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  13349184 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtg 13349140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 51952276 - 51952335
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  51952276 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttatttttt 51952335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 191
Target Start/End: Original strand, 53455661 - 53455757
Alignment:
Q  99 tcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtg------aataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   || ||||||||| ||| ||      |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53455661 tcctataggcatttgctagaatacacccacttctttttt--taggagtattttaacaactgataagtaataactaaaaagtggttaaatgcaccctaag 53455757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 196
Target Start/End: Original strand, 3269185 - 3269271
Alignment:
Q  109 atttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 196  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  | ||| ||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  3269185 atttgctagaacacacctactaatttttatgtgggagtgttttagcaagtta-taactaaaaagttaataaatacaccttaagatgta 3269271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12127551 - 12127516
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12127551 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgtt 12127516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 22894892 - 22894951
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  22894892 tttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 22894951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 27317688 - 27317629
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  27317688 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 27317629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 36824004 - 36823945
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  36824004 tttagcaagttataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 36823945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 53467494 - 53467537
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  53467494 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggt 53467537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 53581608 - 53581549
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  53581608 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaaca 53581549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6109160 - 6109122
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6109160 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 6109122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 6114980 - 6115018
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6114980 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 6115018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 11460348 - 11460386
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11460348 ctaaaacattcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 11460386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 12896836 - 12896874
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12896836 ctaaaacacttccacataaaaactagtgggtgtgttcta 12896874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 17065924 - 17065962
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17065924 ctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttcta 17065962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17226198 - 17226160
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17226198 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 17226160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 21727844 - 21727882
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21727844 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 21727882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26152506 - 26152468
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26152506 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 26152468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 38798178 - 38798216
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38798178 ctaaaacactcccgcataaaaactagtgggtgtgttcta 38798216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 47461893 - 47461931
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47461893 ctaaaacattcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 47461931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 994717 - 994680
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  994717 taaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 994680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 156
Target Start/End: Original strand, 29950657 - 29950694
Alignment:
Q  119 atacacctacttattttttagaagaagtattttagcaa 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29950657 atacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaa 29950694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 156
Target Start/End: Original strand, 29999811 - 29999848
Alignment:
Q  119 atacacctacttattttttagaagaagtattttagcaa 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29999811 atacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaa 29999848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 48649493 - 48649530
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  48649493 taaaacactcccacataaaaactagagggtgtgttcta 48649530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48765215 - 48765182
Alignment:
Q  198 ctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgg 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48765215 ctttactaaaacactcccacataaaaactagtgg 48765182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 50801758 - 50801725
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50801758 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 50801725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 194
Target Start/End: Original strand, 50874122 - 50874155
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50874122 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 50874155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 7848601 - 7848660
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  7848601 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 7848660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 142
Target Start/End: Original strand, 27360064 - 27360127
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaag 142  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  27360064 aagtggatgtattctagcaaatgctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaag 27360127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 51148132 - 51148081
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctactt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  51148132 aagtgggtgcgttctagcaaattctatagg-atttgctagaacacacccactt 51148081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 58102 - 57862
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  58102 tttagcaagttataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagttggtgttttctagcaaatc 58003  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  58002 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccttaaggtgtagctt 57903  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  57902 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 57862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 58149 - 58056
Alignment:
Q  102 tataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 196  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||  |  | ||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  58149 tatagggatttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgta 58056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 58098 - 58136
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  58098 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 58136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 97)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20517129 - 20516889
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20517129 tttagcaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 20517030  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20517029 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 20516930  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20516929 tgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 20516889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 38876156 - 38876396
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38876156 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 38876255  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38876256 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtagctt 38876355  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |  |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  38876356 tgttaaaacactcccatataaaaattagtgagtgtgttcta 38876396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4655258 - 4655014
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataa----catacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4655258 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataagtaacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 4655159  T
Q  97 aatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 196  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4655158 aatcctataagcatttgctaaaatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgta 4655059  T
Q  197 gctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4655058 gctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 4655014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15230273 - 15230036
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15230273 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaacaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 15230175  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15230174 ctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctt 15230075  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttc 239  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15230074 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 15230036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27812150 - 27811911
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27812150 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 27812052  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27812051 ctgtaggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt 27811952  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27811951 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 27811911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12080907 - 12080679
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12080907 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtgttctagcaaatc 12080809  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12080808 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctt 12080709  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtg 230  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12080708 tgctaaaacactcccacataaaaactagtg 12080679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14778134 - 14777898
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14778134 tttagcaagttataactaaaa-gttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaacaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 14778037  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14778036 ctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctt 14777937  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttc 239  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14777936 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 14777898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28605649 - 28605412
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||     
T  28605649 tttagcaagttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacataccttctaaaaaa--caagtgggtgtgttttagcaaatt 28605552  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28605551 ctataggtatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctt 28605452  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28605451 tactaaagcactcccacataaaaactagt-ggtgtgttcta 28605412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11327805 - 11327565
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11327805 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatc 11327706  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11327705 ctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtatagctt 11327606  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  11327605 tgctaaaacacttccacataaaaaccagtaggtgtgttcta 11327565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 14718983 - 14719221
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14718983 tttagcaagttataactaaaattttaataaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 14719081  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14719082 ctataggcatttgctggaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag-tgtagctt 14719180  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14719181 tgctaaaagactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 14719221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 48454533 - 48454773
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  48454533 tttagtaagttataactaaaaagataataaatacaccttaaggtatatgttgatataacacaccttctaaaataaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 48454632  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  48454633 ctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaagaactaaaaagtggttaaatgcaccctaaggtgtagctt 48454732  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48454733 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 48454773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24720469 - 24720230
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  24720469 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccattaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaaaaaataaa-tgggtgtgttctagcaaatc 24720371  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24720370 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaataaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 24720271  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  24720270 tgctaaaacactcctacataaaaattagtgggtgtgttcta 24720230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 45225602 - 45225396
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  45225602 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatt 45225503  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45225502 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 45225403  T
Q  201 tactaaa 207  Q
    | |||||    
T  45225402 tgctaaa 45225396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 7437798 - 7438027
Alignment:
Q  12 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7437798 ataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgtatgttgctataacacaccttccaaaaaaaacaagtgggtgtgttatagtaaatcctataggcatt 7437897  T
Q  112 tgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacac 211  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7437898 tgctagaatacacccaattattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacccaccttaaggtgtagctttgctaaaacac 7437997  T
Q  212 tcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  7437998 tcccacataaaaatgagtggatgtgttcta 7438027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 8047962 - 8048197
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||  |     ||||||| |||||||||    
T  8047962 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaaataa-----gtgtgttatagcaaatc 8048056  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  8048057 ctacagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctt 8048156  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8048157 tgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 8048197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14770283 - 14770043
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  14770283 tttagcaagttataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgagtgtgttatagcaaatc 14770185  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtg-aataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| ||||| |    
T  14770184 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttcgcaagtgaaataattaaaaggtgattaaatgcaccctaaggtgtagtt 14770085  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14770084 ttgctaaaatactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 14770043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15220734 - 15220494
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  15220734 tttagcaagttataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgagtgtgttatagcaaatc 15220636  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtg-aataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| ||||| |    
T  15220635 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttcgcaagtgaaataattaaaaggtgattaaatgcaccctaaggtgtagtt 15220536  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15220535 ttgctaaaatactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 15220494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 26380064 - 26380304
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || |||||  |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  26380064 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtatatgtttctataacacaccttctaacaaaaacaagtgaatgtgttctagcaaatc 26380163  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  26380164 ctataggcatttgctaggatacacccgcttagtttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaacttaaggtgtaactt 26380263  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  26380264 tgctaaaacactcccacataaaaactaatggatgtgttcta 26380304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18199781 - 18199537
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18199781 tttagcaagttataactacaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaacttctataaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 18199682  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatac----acctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 196  Q
    |||||| |   ||   |  | |    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18199681 ctatagactagtgggtgtgttctataacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgta 18199582  T
Q  197 gctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18199581 gctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 18199537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22479414 - 22479176
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22479414 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataggacaccttcgaaaaaaa-caagtgggtgtgttctatcaaatc 22479316  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  22479315 ctatatacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaattcaccctaag-tgtagctt 22479217  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||    
T  22479216 tgctaaaacacttccacataaaaattagtgagtgtcttcta 22479176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34986734 - 34986495
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || || || ||  |||||  ||||||||||||||||    
T  34986734 tttagcaagttataattaaaaagataataaatacaccttaaggtgtatgttgatataacacaccttataaaataaataagtgaatgtgttctagcaaatc 34986635  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||    
T  34986634 ttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaagagtattttagcaagtgaagaactaaaaagtggttaaatacacctaaag-cgtaactt 34986536  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  34986535 tgctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttcta 34986495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32853065 - 32852888
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32853065 tttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttatagcaaatc 32852967  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 179  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32852966 ctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 32852888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27597241 - 27596989
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27597241 tttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 27597143  T
Q  101 ctataggcattt-------------gctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacct 187  Q
    ||||||||||||             ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27597142 ctataggcatttcctatagacatttgctagaatacatccacttattttttagaatgagtattttagcaaataaataactaaaaagtggttaaatacacct 27597043  T
Q  188 taagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  27597042 taaggtgtagctttgctaaaacactataacataaaaactagtgggtgtgttcta 27596989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 18123070 - 18123301
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18123070 tttaccaaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctgacaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 18123169  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  18123170 ctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaat---------ggtgtagctt 18123260  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  18123261 tgctaaaacactcccacataaaaactaattggtgtgttcta 18123301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45225384 - 45225229
Alignment:
Q  86 gtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45225384 gtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaagtggttaaatacac 45225285  T
Q  186 cttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45225284 cttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 45225229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48193323 - 48193122
Alignment:
Q  40 aaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttag 139  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  48193323 aaggtgtatgttgctataacacatcttctaataaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttag 48193224  T
Q  140 aagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttc 239  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  48193223 aaggagtattttaacaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccccaagatgtagctttgctaaaatactcccatctaaaaattagtgggtgtgttc 48193124  T
Q  240 ta 241  Q
    ||    
T  48193123 ta 48193122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43712122 - 43711881
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaag-ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43712122 tttagcaagttataattaaaaaaattaataaatatagtttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaat 43712024  T
Q  100 cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt-agaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagc 198  Q
     |||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  43712023 actatatacatttgctagaatatacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacactttaaagtgtagt 43711924  T
Q  199 tttactaaaacactcccacgt-aaaaactagtgggtgtgttct 240  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  43711923 tttgctaaaacactcccacataaaaaactaatgggtgtgttct 43711881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 37138924 - 37139087
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  37138924 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaaataagtgggtgtgttctaacaaatc 37139023  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataa 164  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37139024 ctatagacatttgctaaaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataa 37139087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 939091 - 938865
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||  ||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  939091 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaagtaagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 938994  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  938993 ttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 938896  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  938895 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 938865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25818681 - 25818454
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  25818681 tataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 25818583  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  25818582 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagcagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 25818485  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25818484 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 25818454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28912278 - 28912052
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||||| |||||    
T  28912278 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctatgggcat 28912181  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||    
T  28912180 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggcgtagc-ttgctaaaaca 28912083  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  28912082 ctcctacataaaaactagtgagtgtgttcta 28912052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33889179 - 33889051
Alignment:
Q  113 gctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacact 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33889179 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaggggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacact 33889080  T
Q  213 cccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  33889079 ccgacataaaaactagtgggtgtgttcta 33889051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 454300 - 454074
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  454300 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 454203  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  454202 ttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtattttagcaagt-tttaactaaaaagtagttaattacaccttaagatgtagc-ttgctaaaaca 454105  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  454104 ctcctacataaaaaatagtgggtgtgttcta 454074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 18352315 - 18352536
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  18352315 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 18352413  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||    
T  18352414 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgttaaaaca 18352511  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgt 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  18352512 ctcccacataaaaactagtgggtgt 18352536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2936837 - 2936610
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |  |||||| |||||| |||||    
T  2936837 tataactaaaatgttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaaaataagtgg-tgtatgttagcaactcctattggcat 2936739  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||    
T  2936738 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 2936641  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||  || ||||||||| |||||||||||||    
T  2936640 ctcaaacataaaaactaatgggtgtgttcta 2936610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41407535 - 41407312
Alignment:
Q  14 aactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttg 113  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||| || |   |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||    
T  41407535 aactaaaaagttgttatatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttg 41407438  T
Q  114 ctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactc 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  41407437 ctagaatacacccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaatgtgtagc-ttgctaaaacactc 41407340  T
Q  214 ccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  41407339 ccacataaaaactaataggtgtgttcta 41407312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 2509321 - 2509546
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||| |  |||||||||| |  || ||| ||||||| ||||    
T  2509321 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct--aaagaataagtgggtgtatgttaacaactcctatatgcat 2509418  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||||    
T  2509419 ttgctagaatacacccactta-tttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtggttaaatgtaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 2509515  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  2509516 ctcccacatcaaaactagtggatgtgttcta 2509546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 27168254 - 27168479
Alignment:
Q  12 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcat 110  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| | ||| ||||| |||||||| |     
T  27168254 ataattaaaaagttcttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatcctaccaaatgcctatagg-ag 27168350  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  27168351 ttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 27168448  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27168449 ctcacacataaaaactagtgggtgtgttcta 27168479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 33889965 - 33889847
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33889965 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgtatgttgctataacgcaccttcta-aaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 33889867  T
Q  101 ctataggcatttgctagaat 120  Q
     |||||||||||||||||||    
T  33889866 atataggcatttgctagaat 33889847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 38367856 - 38368082
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  || |||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |  ||| ||||||||||||    
T  38367856 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatcttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttgacaactcctataggcat 38367953  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||    
T  38367954 ttgctagaatacagccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 38368051  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38368052 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 38368082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Original strand, 6736575 - 6736737
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctactta-ttttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 176  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||| ||    
T  6736575 aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagt 6736673  T
Q  177 taaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6736674 taagtacaccttaaggtgtagc-ttactaaaacactcccacataaaaactagtgggtgcgttcta 6736737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19069592 - 19069366
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| || |   |||||||| | |  |||||| ||||||||  ||    
T  19069592 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtttatgttagcaactcctatagctat 19069495  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  19069494 ttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataattaaaaactagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 19069397  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  19069396 ctcttacataaaaactagtgggtgtgttcta 19069366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 224
Target Start/End: Original strand, 1325335 - 1325441
Alignment:
Q  118 aatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1325335 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtagttaaatgcacgttaagatgtagctttgctaaaacactcccac 1325434  T
Q  218 gtaaaaa 224  Q
     ||||||    
T  1325435 ataaaaa 1325441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 2633892 - 2634110
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| | || || |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  2633892 tataacgaaaaagttgttaaatacaccttacgatgaatattgctaaaacacacattctagaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 2633990  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||  || |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||    
T  2633991 ttgctagaatacacctacttatttttt---aggtgtgttttagcaagt-tataaccaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgttaaaaca 2634085  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgt 235  Q
     |||||| || ||||||||||||||    
T  2634086 atcccacatataaactagtgggtgt 2634110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18829906 - 18829785
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattct---agaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   | |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18829906 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaaaaataagtgggtgcgttctagcaa 18829807  T
Q  98 atcctataggcatttgctagaa 119  Q
    || ||||| |||||||||||||    
T  18829806 attctataagcatttgctagaa 18829785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6559550 - 6559327
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |     |||||  |||||||||| |  || ||| || |||||||||    
T  6559550 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct-----aaaaaataagtgggtgtatgttaacaactcatataggcat 6559456  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||||    | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  6559455 ttgctataatacacccgcttattttatagaatgtatgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 6559358  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6559357 ctcccacatcaaaactagtgggtgtgttcta 6559327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41037535 - 41037328
Alignment:
Q  31 atacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctactt 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||| ||||    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  41037535 atacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaat-aagtgagtgtaagttagcaactcctataggcatttgctaaaatacacccagtt 41037437  T
Q  131 attttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtg 230  Q
    || ||| ||||   || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  41037436 atatttaagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacattcccacataaaaactagtg 41037339  T
Q  231 ggtgtgttcta 241  Q
    | |||||||||    
T  41037338 gatgtgttcta 41037328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 38796823 - 38797051
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| | ||| ||||||| |||||  |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  38796823 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaagcattcattcta-aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 38796921  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataact-aaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||  || ||||| |||||  |||||| ||||| | ||||| |||||| |||| |||| | || |||||||    
T  38796922 ttgctagaatacacccgcttattttttaaaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaaaatagttaattacaccctaaggtgtaac-ttgctaaaac 38797019  T
Q  210 actcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38797020 acttccacataaaaacaagtgggtgtgttcta 38797051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2362946 - 2362736
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |  |||||| |||||||| |||    
T  2362946 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacataccttcta-aaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctatagacat 2362848  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||   ||  || |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| | || | || ||||||||    
T  2362847 ttgctaggatacacccacttatttttt---aggtgtgttttagcaagt-tatcactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtataac-ttgctaaaaca 2362753  T
Q  211 ctcccacgtaaaaacta 227  Q
    ||||||| |||||||||    
T  2362752 ctcccacataaaaacta 2362736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Original strand, 9401656 - 9401842
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||| || |   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  9401656 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtagctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 9401753  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  9401754 ttgctagaatacacccacttattttttagatggtgtgttttagcatgt-tataattaaaaagtagttaaatataccttaaggtgtagctt 9401842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 32577719 - 32577615
Alignment:
Q  33 acaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32577719 acaccttaaggtgtatgttgctataacacgccttccaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatcctataagcatttgctagaatacacccacttat 32577621  T
Q  133 ttttta 138  Q
    ||||||    
T  32577620 ttttta 32577615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11766317 - 11766093
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||   ||||||  || |  |||||| || |||| ||||    
T  11766317 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtggacgtatgttagcaactcttatatgcat 11766220  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||| || ||||||||    
T  11766219 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaata-aatttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 11766123  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11766122 ct-ccacataaaaattagtgggtgtgttcta 11766093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32577583 - 32577474
Alignment:
Q  132 ttttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgg 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  32577583 ttttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagttgttaaatacatcctaaggtgtagctttgctaaaacactcccatataaaaattagtgg 32577484  T
Q  232 gtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||    
T  32577483 gtgtgttcta 32577474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Original strand, 15957214 - 15957400
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| || ||||   ||||  |||||||||| |  || ||| |||||||| |||    
T  15957214 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaacgttgctaaaacacaccttct---aaaaataagtgggtgtatgttaacaactcctatagacat 15957310  T
Q  111 ttgctagaatacacctactta-ttttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  15957311 ttgctaggatacaccaacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagctt 15957400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 32577778 - 32577719
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32577778 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 32577719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23740235 - 23740061
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| || ||||  | ||||| ||||   ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  23740235 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatattgttaaaacactccttctaaaaaat--aagtgtgtgtatgttagcaactcctataggcat 23740138  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttatt-ttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacct 187  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23740137 ttgttagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtggttaaatacacct 23740061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17317443 - 17317370
Alignment:
Q  25 taataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17317443 taataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaa 17317370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 238
Target Start/End: Original strand, 3512711 - 3512827
Alignment:
Q  120 tacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgt 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| | |||||||||||| || |||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |    
T  3512711 tacacccacttattttttagaagatgtgttttagtaagtta-taactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacat 3512808  T
Q  220 aaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||||| |||||| ||||||    
T  3512809 aaaaattagtggatgtgtt 3512827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 48193396 - 48193343
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48193396 tttagcaagttataaataaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgct 48193343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 3407205 - 3407138
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattct 68  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||    
T  3407205 tttagcaagttataactaaaaagtgaataaatacaccttgaagtgtgtgttgctaaaatatacattct 3407138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18829759 - 18829697
Alignment:
Q  122 cacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 184  Q
    |||| |||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18829759 cacccacttatttttttaaaagagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 18829697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27168370 - 27168292
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaa 156  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||    
T  27168370 aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttggtaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 27168292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48454540 - 48454499
Alignment:
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48454540 ttactaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 48454499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 27168389 - 27168487
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||  ||  | | ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27168389 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcacac-ataaaaa-ctagtgggtgtgttctagcaaatc 27168486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 938955 - 938896
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  938955 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 938896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2936700 - 2936641
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  2936700 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaaca 2936641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6559417 - 6559358
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  6559417 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 6559358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 38367992 - 38368051
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  38367992 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaaca 38368051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8047966 - 8047928
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8047966 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 8047928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 11327801 - 11327839
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11327801 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 11327839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 12080903 - 12080941
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12080903 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 12080941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 18199777 - 18199815
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18199777 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 18199815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 24720465 - 24720503
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24720465 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 24720503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 34986730 - 34986768
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34986730 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 34986768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37138928 - 37138890
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37138928 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 37138890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7437793 - 7437752
Alignment:
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7437793 ttactaaaatactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 7437752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26380067 - 26380030
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26380067 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 26380030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 12080779 - 12080838
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12080779 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttatttttt 12080838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 41037418 - 41037358
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  41037418 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacat 41037358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 15957350 - 15957409
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  15957350 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaaca 15957409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 28912142 - 28912083
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||  |||||| ||||    
T  28912142 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggcgtagcttgctaaaaca 28912083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 41407402 - 41407343
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  |||||| ||||    
T  41407402 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaatgtgtagcttgctaaaaca 41407343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 454312 - 454266
Alignment:
Q  148 ttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 194  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  454312 ttttagcaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 454266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 4655254 - 4655292
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4655254 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 4655292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 7835361 - 7835407
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  7835361 tttagcaagttataactaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgta 7835407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 18352452 - 18352498
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  18352452 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgta 18352498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 20517125 - 20517163
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20517125 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 20517163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 27597237 - 27597275
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27597237 ctaaaacactcccacataaatactagtgggtgtgttcta 27597275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 27812146 - 27812184
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27812146 ctaaaacactcccatataaaaactagtgggtgtgttcta 27812184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 32577774 - 32577812
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32577774 ctaaaacattcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 32577812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 32853061 - 32853099
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32853061 ctaaaacattcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 32853099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 45225598 - 45225636
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  45225598 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 45225636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 22479411 - 22479448
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22479411 taaaacacacccacataaaaactagtgggtgtgttcta 22479448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 27131093 - 27131138
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  27131093 tttagcaagttataactaaaaagttgataatcacaccttgaggtgt 27131138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 196
Target Start/End: Original strand, 7437781 - 7437833
Alignment:
Q  144 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||    
T  7437781 agtattttagtaagtgaataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgta 7437833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 20517000 - 20517059
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  20517000 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 20517059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 24720341 - 24720400
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  24720341 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccatttatttttt 24720400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 26042 - 26282
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26042 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 26141  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26142 ttataggcatttgctagaatacacccacttatattttagaatgagtattttagcaaataaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 26241  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26242 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 26282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 106)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 21442119 - 21442358
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21442119 tttagtaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 21442218  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21442219 ctataggcatttgctagaatacacc-acttgttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagatt 21442317  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21442318 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 21442358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 9483640 - 9483879
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9483640 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatagacattaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 9483738  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9483739 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 9483838  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9483839 tgctaaaatactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 9483879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 31071545 - 31071783
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31071545 tttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgtcgctataacacaccttctaaaaaa--caagtgggtgtgttctagcaaatc 31071642  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31071643 ctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctt 31071742  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31071743 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 31071783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14826497 - 14826264
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14826497 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtaggtgtgttctagcaaatc 14826399  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14826398 ctataagcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgaatatttttgcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 14826299  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgt 235  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14826298 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 14826264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19971637 - 19971401
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  19971637 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtgttctaacaaatc 19971539  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19971538 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctt 19971439  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19971438 tgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgtt 19971401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 21021181 - 21021412
Alignment:
Q  6 caagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctata 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21021181 caagttataaataaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtgttctaacaaatcctata 21021279  T
Q  106 ggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttacta 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  21021280 ggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctttgcta 21021379  T
Q  206 aaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21021380 aaacactcccacataaaaattagtgggtgtgtt 21021412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 1782993 - 1783218
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1782993 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 1783091  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              || |||    
T  1783092 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtgttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa--------------taactt 1783177  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1783178 tactaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 1783218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 30577859 - 30578096
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||     
T  30577859 tttagcaagttataactgaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataggtgggtgtgttctagcaaatt 30577958  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30577959 ctataggcatttgctaggatacacccgcttattttttagaatgagtattttagcaggtgaataactaaaaagtggttaaatacaccataaggtgtagctt 30578058  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  30578059 tgctaaaacactcccacataaaaattagtggatgtgtt 30578096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 41942850 - 41943086
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  41942850 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccctaaggtgtatcttgctataacacaccttctaaaaaa--caagtggg-gtgttctagcaaatc 41942946  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  41942947 ctataggcatt-gctagaatacacccacttattttttaggaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacactttaaggtgtaactt 41943045  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  41943046 tgctaaaacactcccacataaaaactaatggatgtgttcta 41943086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5642706 - 5642487
Alignment:
Q  13 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  5642706 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaataa-caagtgggtgt-----agcaaatcctataggcattt 5642613  T
Q  113 gctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacact 212  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  5642612 gctagaatacacccactttttttgtaggag---tattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctagaacact 5642516  T
Q  213 cccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5642515 cccacataaaaactagtgggtgtgttcta 5642487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5644647 - 5644428
Alignment:
Q  13 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  5644647 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaataa-caagtgggtgt-----agcaaatcctataggcattt 5644554  T
Q  113 gctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacact 212  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  5644553 gctagaatacacccactttttttgtaggag---tattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctagaacact 5644457  T
Q  213 cccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5644456 cccacataaaaactagtgggtgtgttcta 5644428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8258516 - 8258293
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | || || ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  8258516 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacattccttataaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 8258419  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  8258418 ttgctagaatacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaaat-tataaccaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 8258321  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8258320 ctcccacataaaaactagtgggtgtgtt 8258293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 3154276 - 3154165
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3154276 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 3154177  T
Q  101 ctataggcattt 112  Q
     |||||||||||    
T  3154176 ttataggcattt 3154165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26043135 - 26042909
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| || | || ||||| ||||   |||||||||| |  || ||| ||||||||||||    
T  26043135 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaatacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttaacaactcctataggcat 26043038  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  26043037 ttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 26042940  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26042939 ctcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 26042909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 27545762 - 27545988
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| || |   |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  27545762 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataagcat 27545859  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  27545860 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtag-attgctaaaaca 27545957  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27545958 ctaccacataaaaactagcgggtgtgttcta 27545988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13468496 - 13468269
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  13468496 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 13468398  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| || |||||| |    
T  13468397 ttgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatactccttaaggtatagc-ttgctaaaata 13468300  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13468299 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 13468269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2823796 - 2823570
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||  || ||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  2823796 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct--aaaaaataattgggtgtatgttagcaactcctatagacat 2823699  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  2823698 ttgctaggatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtatagc-ttgctaaaaca 2823601  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2823600 cttccacataaaaactagtgggtgtgttcta 2823570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 25127871 - 25128096
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||| || |||    
T  25127871 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaaaccttctaaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctacagacat 25127970  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    |||||||||||| |  ||||| ||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  25127971 ttgctagaatactctcacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 25128068  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25128069 ctcccacataaaaactaatgggtgtgtt 25128096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35550786 - 35550560
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||| || |   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  35550786 tataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacactttctaaaatat--aagtgggtgtatattagcaactcctataggcat 35550689  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  35550688 ttgctaggatacactcacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 35550591  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35550590 ctcccacataaaaactagtggatgtgttcta 35550560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 32069024 - 32069248
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  32069024 tataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 32069121  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  32069122 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataact--aaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 32069217  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  32069218 ctcacacatgaaaactagtgggtgtggtcta 32069248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 3369714 - 3369939
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  3369714 tatagctaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct--aaaatataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 3369811  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||| |||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  3369812 ttgctaggatacacccactta-tttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatataccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 3369908  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  3369909 ctcccacataaaaactagtatgtgtgttcta 3369939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30633259 - 30633033
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| | ||| | ||||    
T  30633259 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagtgggtgtttgttagcaacttctacatgcat 30633162  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  30633161 ttgctagaatacacccatttaatttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttactaaaaca 30633064  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30633063 ctctcacataaaaactaatgggtgtgttcta 30633033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32487122 - 32486895
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| |  || ||| || |||| || || || |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  32487122 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaagataaatcttggtaaaacacacctt-taaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 32487024  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||    
T  32487023 ttgctaggatacacccacttattttttagaaagtgtattttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgcagc-ttgctaaaaca 32486926  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32486925 ctcccacgtaaaaaccagtgggtgtgttcta 32486895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5946981 - 5946782
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |  |||| || ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| |||||| |||||    
T  5946981 tataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgttgaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctatcggcat 5946883  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5946882 ttgctaggatacacc-acttattttttagaagatgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaaca 5946786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 10616293 - 10616503
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||| || |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  10616293 tataactaaaaagttgttaaatatacattaaggtgaatattgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 10616390  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  10616391 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtag-tttgctaaaaca 10616488  T
Q  211 ctcccacgtaaaaac 225  Q
    ||||||| |||||||    
T  10616489 ctcccacataaaaac 10616503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 241
Target Start/End: Original strand, 42556441 - 42556562
Alignment:
Q  118 aatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||||||||| |||||    
T  42556441 aatacacctacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtatc-ttgctaaaacac-cccac 42556538  T
Q  218 gtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  42556539 ataaaaactagtgggtgtgttcta 42556562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29125883 - 29125678
Alignment:
Q  32 tacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctactta 131  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||  |||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  29125883 tacaccttaaggtgaatgttactaaaacacaccttctaagaaat--aagtgggtgtatcttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccaccta 29125786  T
Q  132 ttttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgg 231  Q
    |||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29125785 ttttttggaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgg 29125688  T
Q  232 gtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||    
T  29125687 gtgtgttcta 29125678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 30207169 - 30207395
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  30207169 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccatctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 30207266  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaaga-agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||| |  |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||| | || |||||||    
T  30207267 ttgctagaatacacccacttatttttta-aagagtgtgttttagcaaat-tataattaaaaagtagttaaatgcacattaaggtgtaac-ttgctaaaac 30207363  T
Q  210 actcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30207364 actcccacataaaaactagtggatgtgttcta 30207395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39934590 - 39934369
Alignment:
Q  17 taaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgcta 116  Q
    |||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||  |||| || |||||  |||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  39934590 taaaaagttgttaaatataccttaatgtgaatgttgctaaaacactcatt-taaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctacaggcatttgcta 39934492  T
Q  117 gaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactccca 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  39934491 gaatacaccaacttattttttagaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaggtagttaaatacaccctaaggtgtaacttga-taaaacactccca 39934394  T
Q  217 cgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  39934393 aataaaaactagtgggtgtgttcta 39934369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 34103002 - 34103228
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||||| |  |||||| | |||||||| |    
T  34103002 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct--aaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttctataggctt 34103099  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||  ||||| | | ||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||    
T  34103100 ttgctatgatacatccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacactttaacgtgtagc-ttgctaaaaca 34103197  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34103198 atcccacatgaaaactagtgggtgtgttcta 34103228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 1201671 - 1201884
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  1201671 tataactaaaaagttgtaaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 1201768  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
T  1201769 ttgctaggatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgttaaaaca 1201866  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactag 228  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  1201867 ctcccacataaaaactag 1201884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3154168 - 3154074
Alignment:
Q  147 attttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3154168 attttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagttttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 3154074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13269429 - 13269246
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||||| |  |||||| |||||||  |||    
T  13269429 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacat 13269331  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 196  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  13269330 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgta 13269246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 4018742 - 4018650
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttcta 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4018742 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttcta 4018650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 26630031 - 26630250
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  26630031 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 26630128  T
Q  111 tt-gctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||         ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||| || || ||||    
T  26630129 ttagctaggatacacccacttatttttttgaagatgtgtttt---------ataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctcaaac 26630218  T
Q  210 actcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26630219 actcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 26630250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9484115 - 9483938
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  9484115 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttcta-aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcat 9484017  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 190  Q
    ||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9484016 ttgttaagatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacaccttaa 9483938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Original strand, 25281053 - 25281179
Alignment:
Q  114 ctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactc 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25281053 ctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaataaataactaaaaagtgcttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactc 25281152  T
Q  214 ccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
     ||| |||||| || | |||||||||||    
T  25281153 acacataaaaattact-ggtgtgttcta 25281179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 14819298 - 14819394
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14819298 tttagcaagttataactaaaaagttaataaacacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaacaagtggatgtgttctagcaaa 14819394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 25123380 - 25123600
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   || ||| ||| |  ||||||  ||||||| |||    
T  25123380 tataactaaaaaattgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aaatggttgtatgttagcaacgcctatagacat 25123477  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  25123478 ttgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcacctgaagacgtagc-ttgctaaaaca 25123575  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgt 235  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||    
T  25123576 ctctcacataaaaactagtgggtgt 25123600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 10776977 - 10777187
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  10776977 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacacattcta-aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcat 10777075  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||  ||||| | |||||||||||   ||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |    
T  10777076 ttgctaagatacatccacttatttttt---aggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgtag-tttgctaaaata 10777170  T
Q  211 ctcccacgtaaaaacta 227  Q
    || |||| |||||||||    
T  10777171 cttccacataaaaacta 10777187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21442469 - 21442395
Alignment:
Q  89 ttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaata 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21442469 ttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaata 21442395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1281999 - 1281852
Alignment:
Q  92 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 191  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  1281999 tagcaacttctataggcatttggtagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaatgtagttaaatacactttaag 1281901  T
Q  192 atgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
     |||| | || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1281900 gtgtaac-ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 1281852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2178780 - 2178674
Alignment:
Q  134 ttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggt 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  2178780 ttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag-tgtaggtttgctaaaacactcccatataaaaaccagtggat 2178682  T
Q  234 gtgttcta 241  Q
    || |||||    
T  2178681 gtcttcta 2178674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26868115 - 26867891
Alignment:
Q  14 aactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttg 113  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||  |||||  ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||     
T  26868115 aactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgccaaaacacaccttctt-aaaaattaagtgcgtgtatgttagcaactcctataggcattta 26868017  T
Q  114 ctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactc 213  Q
    ||| || ||||| ||||||||| ||||||  || |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| || |||||  ||||    
T  26868016 ctataacacacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagt-tatatctaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagc-ttgctaaattactc 26867919  T
Q  214 ccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| |||||| || ||| |||||||||    
T  26867918 ccacataaaaattattggatgtgttcta 26867891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23544987 - 23544857
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  23544987 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 23544889  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaag 142  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23544888 ttgttagaatacacccacttattttttagaag 23544857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 184108 - 184308
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||||||||| |  ||||||  | ||||| |||    
T  184108 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagtgggtgtatgttagcaacccatatagacat 184205  T
Q  111 ttgctagaatacacctactta-ttttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaac 209  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||   || |||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  184206 ttgctaggatacacccacttatttttttagaatgtgtgttttaataagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaac 184303  T
Q  210 actcc 214  Q
    |||||    
T  184304 actcc 184308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 1775602 - 1775514
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgtt 90  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1775602 tttaacaagttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct-taaaaaacaagtgggtgtgtt 1775514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Original strand, 13290504 - 13290684
Alignment:
Q  17 taaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgcta 116  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||| ||| |  |||||| || || | ||||||| ||    
T  13290504 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacagacattct--aaaaaataagtggatgtatgttagcaactcttacatgcatttgtta 13290601  T
Q  117 gaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  13290602 gaatacatccacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcactttaaggtgtagctt 13290684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 238
Target Start/End: Original strand, 36901237 - 36901312
Alignment:
Q  162 taactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36901237 taactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgtt 36901312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Original strand, 32512114 - 32512261
Alignment:
Q  92 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 191  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||  ||| ||||||||| || |||| |||||| | |||||||||| |||||     
T  32512114 tagcaactcttataggcatttgctataatacatttatttattttttagaatgagtgttttagcaaatg-ataaataaaaaatagttaaatacatcttaaa 32512212  T
Q  192 atgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
     |||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32512213 gtgtagc-ttgctaaaacactctcacataaaaactagtggatgtgttcta 32512261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45299774 - 45299571
Alignment:
Q  19 aaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaga 118  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||     
T  45299774 aaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgctagcaactcttataggcatttgctagg 45299677  T
Q  119 atacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacg 218  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||| |  |||| |||||| | || |||| || |||||| |||||| || || ||||||||||||     
T  45299676 atacacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaaat-tataattaaaaaatagtgaaatgca-cttaaggtgtagc-ttgctcaaacactcccaca 45299580  T
Q  219 taaaaacta 227  Q
    |||||||||    
T  45299579 taaaaacta 45299571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 238
Target Start/End: Original strand, 18804880 - 18805014
Alignment:
Q  102 tataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagcttt 201  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||    
T  18804880 tatagccatttgttagaataaacccacatattttttagaaggactattttaacaaatga-taactaaaaagtagttaagtacaccttaaggtatagc-tt 18804977  T
Q  202 actaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
     |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18804978 gctaaaataatcccacataaaaactagtgggtgtgtt 18805014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23053897 - 23053818
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23053897 ataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtatagcttg-ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 23053818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23161405 - 23161287
Alignment:
Q  121 acacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgta 220  Q
    ||||| |||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| |     
T  23161405 acacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacatg 23161308  T
Q  221 aaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  23161307 aaaactagtgggtatgttcta 23161287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 9413810 - 9414036
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||||| || ||||||||| |||  || |||||  |||   |||||| ||| |  |||||| |||||||| |||    
T  9413810 tataactaaaaaattgttaaatacatcttaagatgaatgttgctaaaactcaccttctaacaaat--aagtggatgtatgttagcaactcctatagacat 9413907  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||   | |||||||||||  |||| |||||||| | | |||| | |||||| |||||| || ||||||||    
T  9413908 ttgctagaatacatctacttattttttaaaaggtatgttttagcaagt-tataattaaaaagtcggtgaatataacttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 9414005  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| || |||||||||||| | ||||||||    
T  9414006 ctcctacataaaaactagtgagcgtgttcta 9414036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 25280987 - 25281058
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaa 72  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  25280987 tttaacaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttctagaa 25281058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 36899739 - 36899886
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacac--cttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggc 108  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| || |   |||||||||| |  |||||| ||||||| ||    
T  36899739 tataactaaaaagttgttaaatacacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactcctatacgc 36899836  T
Q  109 atttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagt 158  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  36899837 atttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt 36899886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17952677 - 17952598
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17952677 ataactaaaaagtagttaaatacaccctaaaatgtagcttg-ctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttcta 17952598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 39922469 - 39922359
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||  ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  39922469 tataactaaaaagttgttaaatacacctcaaggtgaatgttgctaaaacacacattct--aaaaaataagtgagtgtatgttagcaactcctataggcat 39922372  T
Q  111 ttgctagaataca 123  Q
    ||||||| |||||    
T  39922371 ttgctaggataca 39922359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29377929 - 29377850
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29377929 ataactgaaaagttgttaaatacaccttaaggtgtaacttg-ctaaaacactcccacataaaaactagggggtgtgttcta 29377850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 17691217 - 17691337
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| | |||||| |||    
T  17691217 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttctatagacat 17691314  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttatt 133  Q
    ||| || |||||||| |||||||    
T  17691315 ttgttataatacacccacttatt 17691337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 21352465 - 21352391
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaa 75  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  21352465 tttaacaagttataactaaaaattcgataaatacacattaaggtgtatgttgttataacacacattctaaaaaaa 21352391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Original strand, 35067001 - 35067127
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||||| |  |||||| |||| |||| ||    
T  35067001 tataattaaaaagttgttaattacaccttaagataaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctttaggtat 35067100  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  35067101 ttgctagaatacgcccacttatttttt 35067127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 44874263 - 44874142
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 177  Q
    |||||||||| |  || ||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||| | ||| | | |||||||||||| |||    
T  44874263 aagtgggtgtatgttaacaactcctacagacaattgctagaatacacccacttattttttagaaagtgtgtttcaccaactta-taactaaaaagtagtt 44874165  T
Q  178 aaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44874164 aaatacaccttaagatgtagctt 44874142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 18804313 - 18804370
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataa 58  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18804313 tttaacaagttataattaaaaagttgataaatacaccttgaggtgtatgttgctataa 18804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9869640 - 9869570
Alignment:
Q  144 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcc 214  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||  |||||||||||    
T  9869640 agtattttagcatgtaaataactaaaaagtggttaaatacacctttacgtgtatctttcataaaacactcc 9869570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 25123661 - 25123770
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||||| |  || ||| || ||||  |||    
T  25123661 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct--aaaaaataagtgggtgtatgttaacaactcttataaacat 25123758  T
Q  111 ttgctagaatac 122  Q
    ||||||||||||    
T  25123759 ttgctagaatac 25123770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 238
Target Start/End: Original strand, 42556757 - 42556887
Alignment:
Q  106 ggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttacta 205  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||   || |||||||||||  ||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||| || |||    
T  42556757 ggcatttgctaggatacactcacttatttttttgaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagcagtgaaatgtaccttaaggtgtagc-ttgcta 42556854  T
Q  206 aaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  42556855 aaacactcttacataaaaactagtggatgtgtt 42556887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26042999 - 26042940
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  26042999 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 26042940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 27545898 - 27545957
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  27545898 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagattgctaaaaca 27545957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29125768 - 29125709
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  29125768 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 29125709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 35550650 - 35550591
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  35550650 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 35550591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 4018738 - 4018776
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4018738 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 4018776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 1775599 - 1775636
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1775599 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 1775636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 7090025 - 7089976
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7090025 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 7089976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9483643 - 9483606
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9483643 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 9483606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21442126 - 21442085
Alignment:
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21442126 ttactaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 21442085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42556415 - 42556378
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42556415 taaaacactcccacgtaaaaactagcgggtgtgttcta 42556378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 42556412 - 42556449
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacacct 38  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42556412 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacacct 42556449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 42556684 - 42556733
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42556684 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 42556733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 187
Target Start/End: Original strand, 29377540 - 29377600
Alignment:
Q  127 acttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacct 187  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29377540 acttgttttttagaataagtattttagcaaaaatataattaaaaagtggttaaatacacct 29377600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1782997 - 1782962
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1782997 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgtt 1782962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 2823660 - 2823617
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  2823660 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggt 2823617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 3369849 - 3369908
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  3369849 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatataccttaaggtgtagcttgctaaaaca 3369908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 5946845 - 5946786
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  5946845 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagcttgctaaaaca 5946786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 10616429 - 10616488
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  10616429 tttagcaagttataactaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtagtttgctaaaaca 10616488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13269292 - 13269233
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  13269292 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtaacttgctaaaaca 13269233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 23161377 - 23161318
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  23161377 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaggtgtagcttgctaaaaca 23161318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 25128009 - 25128068
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  25128009 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 25128068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 3154272 - 3154310
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3154272 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 3154310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 242
Target Start/End: Original strand, 5643100 - 5643138
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttctat 242  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5643100 taaaacacttccacgtaaaaactagtgggtgtattctat 5643138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 242
Target Start/End: Original strand, 5645041 - 5645079
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttctat 242  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5645041 taaaacacttccacgtaaaaactagtgggtgtattctat 5645079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 10777111 - 10777157
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  10777111 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgta 10777157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14819302 - 14819264
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14819302 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 14819264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 19971633 - 19971671
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19971633 ctaaaacactccaacataaaaactagtgggtgtgttcta 19971671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 30633123 - 30633077
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  30633123 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgta 30633077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 184251 - 184304
Alignment:
Q  7 aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  184251 aagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 184304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31071672 - 31071608
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaag 142  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  31071672 aagttggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgttttttagaag 31071608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1783121 - 1783062
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  1783121 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 1783062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9483768 - 9483709
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  9483768 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 9483709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 14826369 - 14826428
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcct-ataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14826369 aagtgggtgtattctagcaaatgcttatagg-atttgctagaacacacctacttgtttttt 14826428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 19971509 - 19971568
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  19971509 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgttagaacacacccacttatttttt 19971568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 21021304 - 21021245
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21021304 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgttagaacacacccacttatttttt 21021245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 188
Target Start/End: Original strand, 30400529 - 30400572
Alignment:
Q  144 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacctt 188  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30400529 agtattttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacctt 30400572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31071549 - 31071517
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31071549 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 31071517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 32486985 - 32486945
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaa 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  32486985 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaa 32486945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 116)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13212042 - 13211803
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13212042 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 13211944  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13211943 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtcaaatacaccttaaggtgtagctt 13211844  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13211843 tgctaaagcactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 13211803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 14202860 - 14203100
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14202860 tttagcgagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgagtgtgttctagcaaatc 14202959  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14202960 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtggataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 14203059  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14203060 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 14203100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 12584276 - 12584516
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  12584276 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtatgttctagcaaatt 12584375  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12584376 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 12584475  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12584476 tgctagaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 12584516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 5046631 - 5046870
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5046631 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 5046729  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  5046730 ctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaatggttaaatacaccttaaggtgtaactt 5046829  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5046830 tgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttcta 5046870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6214211 - 6213971
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6214211 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccctctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 6214112  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6214111 ctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 6214012  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6214011 tgctaaaacactctcacataaaaactagtggatgtgttcta 6213971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13621325 - 13621086
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13621325 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatactccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 13621226  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  13621225 ctataggcatttgctaggatacacc-acttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaatttttagctt 13621127  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13621126 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 13621086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 42807901 - 42808141
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42807901 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatc 42808000  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42808001 ctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 42808100  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  42808101 tgctaaaacacttccacataaaaattagtgggtgtgttcta 42808141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7630285 - 7630045
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7630285 tttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 7630186  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7630185 ctataggcatttgctaggatacacccacttagattttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 7630086  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7630085 tgctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttcta 7630045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48560225 - 48559986
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48560225 tttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgttttaacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 48560127  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48560126 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaatttaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 48560027  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  48560026 tgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 48559986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 578747 - 578989
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctata--acatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  578747 tttagcaagttataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctatataacacaccttctagaaaaagcaaatgggtgtattctagcaaa 578846  T
Q  99 tcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  578847 tcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagc 578946  T
Q  199 tttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  578947 tttgctaaaacactcatacataaaaactagtgggtgtattcta 578989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17181180 - 17180938
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaag--caagtgggtgtgttctagcaaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||   |||||||||| |||||||||||    
T  17181180 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaacttaaggtgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaaacaagtgggtgcgttctagcaaa 17181081  T
Q  99 tcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17181080 tcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatttttgcaatttaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagc 17180981  T
Q  199 tttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17180980 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 17180938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17377721 - 17377481
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17377721 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 17377622  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17377621 ctataggcttttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaatagtttaatacaccttaaggtgtagctt 17377522  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17377521 tgctaaaacactcccgcataaaaactagtgggtgtgttcta 17377481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21519959 - 21519719
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21519959 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttttaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagtaaatc 21519860  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  21519859 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggagtagctt 21519760  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || || | ||||||||    
T  21519759 tactaaaacactcccacataaaaattaatgagcgtgttcta 21519719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 34683038 - 34683278
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34683038 tttagcaagttataactaaaaagttaacaaatacagcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatc 34683137  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  34683138 atataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaattaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtaactc 34683237  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34683238 tgctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 34683278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5157225 - 5156985
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5157225 tttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caaatgggtgtgttctagcaaatc 5157127  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5157126 ctataggcctttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 5157027  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaact-agtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||    
T  5157026 tgctaaaacactttcacataaaaactaaatgggtgtgttcta 5156985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41172637 - 41172398
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  41172637 tttagcaagatataactaaaaagttaataaatacattttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataaa-tgggtgtgttctagcaaatc 41172539  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41172538 ttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacactttaaggtgtagctt 41172439  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41172438 tgctaaagcactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 41172398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17745373 - 17745138
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17745373 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttcaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtggatgtgttctagcaaatc 17745275  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17745274 ctataggcat--gctagaatacacccacctattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaatggttaaatacaccttaaggtgtagctt 17745177  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  17745176 tgctaaaacacttcca--taaaaactagtgggtgtgttcta 17745138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 51783959 - 51784200
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51783959 tttagcaagtaataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaataaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 51784057  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacc-tacttattttttagaaga-agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51784058 ctataggcatttgctagaatacaccctacttattttttagaagggagtattttagtaaataaataactaaaaagtgattaaatacaccttaaggtgtagc 51784157  T
Q  199 tttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51784158 tttgctaaaatactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 51784200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 30820479 - 30820719
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  || ||| ||| ||||||||||||    
T  30820479 tttagcaaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataaattgg-tgtattctagcaaatc 30820577  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttatttt-ttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30820578 ctataggcatttgctagaagacacccacttatttttttagaaggagtattttaccaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagct 30820677  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30820678 ttgctaaaacacttccacataaaaactagtgggtgtgttcta 30820719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50182400 - 50182163
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  50182400 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaat- 50182303  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50182302 -tataggcatttgttagaatacactcacttattttttagaagcagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 50182204  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | |||||| |||  ||| |||||| || |||||||||||||    
T  50182203 tgctaaaatactttcacataaaaattaatgggtgtgttcta 50182163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49970821 - 49970583
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  49970821 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctactaaaaaaa-caagtgggtgtgtt-tagcaaatc 49970724  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||    
T  49970723 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagaaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaatgtgtagatt 49970624  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  49970623 tgctaaaacactcccaaataaaaattagtgggtgtgttcta 49970583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26958762 - 26958527
Alignment:
Q  3 tagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26958762 tagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcat 26958664  T
Q  103 ataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagcttta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||     
T  26958663 ataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaaat-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttg 26958566  T
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26958565 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 26958527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 10216242 - 10216414
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10216242 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 10216340  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10216341 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 10216414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13371438 - 13371206
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13371438 tttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 13371340  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||      || ||||||||    
T  13371339 ctataggcatttgctagaatacaaccacttatgttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggtaaaatac------aggtgtagctt 13371246  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13371245 tgctaaaacactcccacataaaaactagt-ggtgtgttcta 13371206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13381639 - 13381407
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13381639 tttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatc 13381541  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||      || ||||||||    
T  13381540 ctataggcatttgctagaatacaaccacttatgttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggtaaaatac------aggtgtagctt 13381447  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13381446 tgctaaaacactcccacataaaaactagt-ggtgtgttcta 13381407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 30258117 - 30258286
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30258117 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacgcattctaaaaaaa-caagtgagtgtgttctagcaaatc 30258215  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30258216 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaa 30258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 241
Target Start/End: Original strand, 13621375 - 13621544
Alignment:
Q  72 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13621375 aaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaa 13621474  T
Q  172 gtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13621475 gtggttaaatacaccacaagatgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttcta 13621544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3818973 - 3818788
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagc-aagtgggtgtgttctagcaaat 99  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  3818973 tttagcaaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacatcttctaaaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaat 3818874  T
Q  100 cctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 185  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3818873 cctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 3818788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 52437427 - 52437647
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattct-agaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| | |||||  |||||||||||||||||||| |    
T  52437427 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaaaaagtgggtgtgttctagcaact 52437526  T
Q  100 cctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  52437527 cctatagacatttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtag-t 52437624  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaa 222  Q
    || ||||||||||||||| ||||    
T  52437625 ttgctaaaacactcccacataaa 52437647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 77 - 241
Target Start/End: Original strand, 10981367 - 10981531
Alignment:
Q  77 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10981367 caagtgggtgtgttctaacaaattttataggcatttgctagaatacatccacttattttctagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 10981466  T
Q  177 taaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10981467 taaatacacattaaggtgtagctttgctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttcta 10981531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47382379 - 47382150
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattct-agaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  47382379 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgatataacacaccttctaaaaaaaaacaagtggatgtgttctaacaaat 47382280  T
Q  100 cctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagct 199  Q
    ||||||||||| ||||| ||||           |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47382279 cctataggcatatgctaaaata-----------tttttagaaagagtattttagcaagtgaataaccaaaaagtgattaaatacaccttaaggtgtagct 47382191  T
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47382190 ttgctaaaac-ctgccacataaaaactagtgggtgtgttcta 47382150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 87 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18470399 - 18470245
Alignment:
Q  87 tgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacc 186  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18470399 tgttctagtaaattctatagccatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacc 18470300  T
Q  187 ttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18470299 ttaaggtgtagttttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 18470245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 40496156 - 40496377
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||  ||||||||||    |||||| |||||||| |||    
T  40496156 tataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtaagttagcaactcctatagacat 40496254  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  40496255 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatataccttaaggtgtagc-ttactaaaaca 40496352  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  40496353 ctcccacgtaaaaactagtgggtgt 40496377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26335938 - 26335712
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  26335938 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 26335841  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  26335840 ttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 26335743  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26335742 ctcccacataaaaactagttggtgtgttcta 26335712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 9744146 - 9744372
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  9744146 tataactaaaaagttgttagatacaccttaaggtgaatgttgctacaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatattagcaactcctataggcat 9744243  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||| |    
T  9744244 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataaataaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaata 9744341  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9744342 ctctcacataaaaactagtggatgtgttcta 9744372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6946811 - 6946616
Alignment:
Q  42 ggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaa 141  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6946811 ggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaa 6946714  T
Q  142 gaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6946713 gatgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacactttaaggtgtagc-ttgctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttcta 6946616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16553622 - 16553396
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| || |   |||| ||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  16553622 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtaggtgtatgttagcaactcctataggcat 16553525  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||   || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  16553524 ttgctagaatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 16553427  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16553426 cttccacataaaaactagtgggtgtattcta 16553396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 38425666 - 38425892
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| || ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  38425666 tataactgaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattttaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 38425763  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||| || ||||||||    
T  38425764 ttgctagaacacacccatttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaacttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 38425861  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38425862 ctcccacataaaaactcgtgggtgtgttcta 38425892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46106871 - 46106645
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || | ||| || |   |||||||||| |  |||||| ||| ||||||||    
T  46106871 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactccaataggcat 46106774  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| || ||||||||    
T  46106773 ttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttgaatacaccttaaggtggagc-ttgctaaaaca 46106676  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46106675 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 46106645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 52306965 - 52306739
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || || ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  52306965 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttataaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 52306868  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || || || ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  52306867 ttgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttataacaact-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtag-gttgctaaaaca 52306770  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  52306769 ctctcccataaaaactagtgggtgtgttcta 52306739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14863138 - 14862944
Alignment:
Q  42 ggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaa 141  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14863138 ggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaa 14863041  T
Q  142 gaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |  || |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14863040 g-tgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 14862944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Original strand, 6137578 - 6137739
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 177  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||  ||||||||||||| |||    
T  6137578 aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaagtagtt 6137676  T
Q  178 aaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| ||||||||| | |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6137677 aaatgcaccttaaggtatagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 6137739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4490856 - 4490636
Alignment:
Q  18 aaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctag 117  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||     
T  4490856 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctt-aaaaattaagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctat 4490758  T
Q  118 aatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccac 217  Q
    |||||||| ||||||||  || || | || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  4490757 aatacacccacttatttcctaaaatatgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacgctaagatgtagcttgt-taaaacactcccac 4490660  T
Q  218 gtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
T  4490659 ataaaaattagtgggtgtgttcta 4490636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4712855 - 4712631
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| || | || ||||| |||||  ||||||||||    |||||| ||||||||||||    
T  4712855 tataactagaaatttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaatacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtaagttagcaactcctataggcat 4712757  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  4712756 tcgctaaaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 4712659  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  4712658 ctcccacataaaaaccaatgggtgtgtt 4712631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45875956 - 45875731
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  45875956 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattttaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 45875859  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||   || ||||||||| |  ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||  |||||||    
T  45875858 ttgctaggatacacccacttatttttttgaatgtgtgttttagcaaat-tataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgttaaaaca 45875761  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  45875760 ctcccacataaaaacta-tgggtgtgttcta 45875731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 6192969 - 6193196
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||| || |||||  | |||||||| |  ||||||  |||||| ||||    
T  6192969 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacactcattttaaaaaaatga-gtgggtgtatgttagcaacacctataagcat 6193067  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  6193068 ttgctagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataacaaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagc-ttgctaaaaca 6193165  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  6193166 ctccaacataaaaactagtatgtgtgttcta 6193196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29102165 - 29101956
Alignment:
Q  28 taaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccta 127  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| | || || ||||| ||||  |||||| |||| |  || ||| |||||||  |||||||||| ||||||| |    
T  29102165 taaatacactttaaggtaaatgttgctaaatcacaccttctacaaaa--caagtgagtgtatgttaacaactcctataaacatttgctaggatacaccca 29102068  T
Q  128 cttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaacta 227  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  29102067 cttattttttataagatgtgttttagcaagtta-taattaaaaagtagttaaatacacattaagatgtagctt-actaaaacactcctacataaaaacta 29101970  T
Q  228 gtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||    
T  29101969 gtgggtgtgttcta 29101956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33106109 - 33105892
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  33106109 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct--aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 33106012  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||| |||  || |||||||||||  ||||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||||| |    
T  33106011 ttgctaggatacgcccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataatcaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaata 33105914  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtggg 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  33105913 ctcccacataaaaactagtggg 33105892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 54742649 - 54742419
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttc--tagcaaatcctataggc 108  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||    || ||| || |||||||    
T  54742649 tataacgaaaaatttgttaaatacatcttaagatgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaaataagtgggtgtgtaagttaacaactcttataggc 54742550  T
Q  109 atttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaa 208  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||   || ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||    
T  54742549 atttgctaaaatacacccacttatattttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactagaaagtagttaaatgcactttaaggtgtagcttg-ctaaaa 54742452  T
Q  209 cactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54742451 cattcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 54742419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45801934 - 45801793
Alignment:
Q  102 tataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataac---taaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagc 198  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||  ||||||    
T  45801934 tataggcatttgttagaatacatccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaataaaaagtggttaaatacactctaatgtgtagc 45801835  T
Q  199 tttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttct 240  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  45801834 tttgttaaaacactcccacataaaaactaatagatgtgttct 45801793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 183
Target Start/End: Original strand, 49425774 - 49425943
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   ||||||||||    |||||| | ||||||||||    
T  49425774 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtacgttagcaacttctataggcat 49425871  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  49425872 ttgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaact-tataactaaaaagtagttaaatac 49425943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14948319 - 14948094
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  |||||  |||||||||| |  |||||| || | ||| |||    
T  14948319 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacgcattct--aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcatttagacat 14948222  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||| ||| || |||| |||||||||||| |||  || |||||  ||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  14948221 ttgttaggattcacccacttattttttaaaaggtgtgttttaataagt-tataact-aaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaacc 14948125  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14948124 ctcctacataaaaactagtgggtgtgttcta 14948094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Original strand, 20458852 - 20459004
Alignment:
Q  17 taaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgcta 116  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||  | ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  20458852 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgcta 20458950  T
Q  117 gaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 171  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  20458951 gaatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaa 20459004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33811163 - 33811016
Alignment:
Q  92 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 191  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33811163 tagcaactcctacaggcatttgctataatacacccacttaatttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaag 33811065  T
Q  192 atgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
     | |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33811064 gtatagc-ttgttaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttcta 33811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 11777510 - 11777669
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||  |||||  || ||||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  11777510 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatattct--aaaaaataattgggtgtatgttagcaactcctataagcat 11777607  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagt 173  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  11777608 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaagt 11777669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15725376 - 15725208
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| || |||| || ||||| ||||   ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  15725376 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgagtgtatgttagcaactcctataggcat 15725279  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 182  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  15725278 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaaatagttaaata 15725208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Original strand, 23383940 - 23384066
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |     |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  23383940 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct-----aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 23384034  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaag 142  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23384035 ttgctaggatacacccacttattttttagaag 23384066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6137630 - 6137474
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 176  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  6137630 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaag-gtataactaaaaagtagt 6137533  T
Q  177 taaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgt 235  Q
    ||||| ||||||||| | || |||| ||||||||| ||    |||||||||||||||||    
T  6137532 taaatgcaccttaaggtatatctttgctaaaacacgccttaataaaaactagtgggtgt 6137474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43639181 - 43639068
Alignment:
Q  28 taaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccta 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||||||  |||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  43639181 taaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctagaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctatagacatttgttagaatacaccca 43639082  T
Q  128 cttattttttagaa 141  Q
    ||||||||||||||    
T  43639081 cttattttttagaa 43639068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49606128 - 49605990
Alignment:
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  49606128 ctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgcgttttagcaagtta-tagataaaaagtagttaaatacactttaaagtgtagctt 49606030  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  49606029 gt-taaaacactcccacctaaaaactagtgggtatgttcta 49605990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 142816 - 142692
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| || | || ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  142816 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaagacactttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 142719  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  142718 ttgctaggatacacccacttatttttt 142692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43639072 - 43638948
Alignment:
Q  115 tagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcc 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| |    
T  43639072 tagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaagcagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaatacttc 43638975  T
Q  215 cacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||| |||||| || ||  |||||||||    
T  43638974 cacataaaaattaatgaatgtgttcta 43638948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 214
Target Start/End: Original strand, 56532591 - 56532659
Alignment:
Q  145 gtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56532591 gtattttagcaagtgaataactaaaaaatggttaaataca-tttaagatgtagcttttctaaaacactcc 56532659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 241
Target Start/End: Original strand, 13211626 - 13211717
Alignment:
Q  148 ttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  13211626 ttttagcaagtta-taactaaaaaatagttaaatgcaccttaaggtgtagcttg-ctaaaacactcccacatcaaaactagtgagtgtgttcta 13211717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36955475 - 36955331
Alignment:
Q  92 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa-tacaccttaa 190  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||        
T  36955475 tagcaactcatataggcatttgctagaatacactcacttattttttataatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaattacacc---- 36955381  T
Q  191 gatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||    
T  36955380 gttgtag-tttgctaaaacactcccatataaaaactagtgaatgtgttcta 36955331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40496468 - 40496396
Alignment:
Q  160 aataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggt 233  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40496468 aataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttattaaaacattctcacgtaaaaactagtgggt 40496396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16553486 - 16553427
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  16553486 tttagcaagttataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 16553427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 241
Target Start/End: Original strand, 49426124 - 49426189
Alignment:
Q  175 gttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  49426124 gttaaatacaccttaaggtgtaggttg-ctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttcta 49426189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 142677 - 142605
Alignment:
Q  168 aaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||| || |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  142677 aaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagcttg-ctaaaacactccaacataaaaactagtgggtgtgttcta 142605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12584279 - 12584242
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12584279 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 12584242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Original strand, 48560218 - 48560259
Alignment:
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48560218 ttactaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 48560259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 238
Target Start/End: Original strand, 4505567 - 4505629
Alignment:
Q  175 gttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgtt 238  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4505567 gttaaatacacccaaaggtgtagcttg-ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgtt 4505629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26335802 - 26335743
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  26335802 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 26335743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Original strand, 102261 - 102366
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| || |||| || ||||  |||||  |||||||| | |  |||||| ||||||||||||    
T  102261 tataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-taaaaaataagtgggtttatgttagcaactcctataggcat 102359  T
Q  111 ttgctag 117  Q
    |||||||    
T  102360 ttgctag 102366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5046635 - 5046597
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5046635 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 5046597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 13211554 - 13211612
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattcta 69  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  13211554 tataactaaaaagttgttaaatacacctttaggtgaatgttgctaaaacataccttcta 13211612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 13621321 - 13621359
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13621321 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 13621359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 21519955 - 21519993
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21519955 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 21519993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30258121 - 30258083
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30258121 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 30258083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34683042 - 34683004
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34683042 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 34683004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 41172633 - 41172671
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41172633 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 41172671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42807905 - 42807867
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42807905 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 42807867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 47382375 - 47382413
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47382375 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 47382413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 50182396 - 50182434
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50182396 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 50182434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30258396 - 30258343
Alignment:
Q  161 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  30258396 ataactaaaaagtggttaaatacatcctaaggtgtagctttgctaaaatactcc 30258343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50678004 - 50677914
Alignment:
Q  148 ttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  50678004 ttttagcaagtta-taactaaaaagta-ttaaatacaccttaaggtatagcatga-taaaacactcctacataaaaactagtgggtgtattcta 50677914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 156
Target Start/End: Original strand, 2722807 - 2722843
Alignment:
Q  120 tacacctacttattttttagaagaagtattttagcaa 156  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2722807 tacacctatttattttttagaagaagtattttagcaa 2722843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Original strand, 20459163 - 20459222
Alignment:
Q  181 tacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20459163 tacaccctaaggtgtagcttg-ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtattcta 20459222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30820607 - 30820548
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30820607 aagtgggtgtcttctagcaaatgcctatagg-atttgctagaatacaccaatttatttttt 30820548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 4712718 - 4712659
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  4712718 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 4712659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6946706 - 6946647
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  6946706 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacactttaaggtgtagcttgctaaaaca 6946647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14863034 - 14862975
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  14863034 tttagcaagttataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 14862975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26958617 - 26958558
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  26958617 tttagcaaattataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 26958558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 38425573 - 38425636
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaa 74  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || |||| || ||||| ||||    
T  38425573 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 38425636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 50678003 - 50677961
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 44  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  50678003 tttagcaagttataactaaaaag-tattaaatacaccttaaggt 50677961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 196
Target Start/End: Original strand, 578700 - 578793
Alignment:
Q  102 tataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 196  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||  |  | ||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  578700 tatagggatttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgta 578793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 578751 - 578713
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  578751 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 578713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 3818969 - 3819007
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3818969 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 3819007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 5157221 - 5157259
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5157221 ctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttcta 5157259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 7630281 - 7630319
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7630281 ctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttcta 7630319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 9744282 - 9744328
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9744282 tttagcaagttataaataaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 9744328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14202864 - 14202826
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14202864 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 14202826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 17377717 - 17377755
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17377717 ctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttcta 17377755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 17745369 - 17745407
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17745369 ctaaaacactcccacataaaaactagtgagtgtgttcta 17745407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 32012838 - 32012876
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32012838 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 32012876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 40496293 - 40496339
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  40496293 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatataccttaaggtgta 40496339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 43639038 - 43638992
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  43639038 tttagcaagttataactaaaaagcagttaaatacaccttaaggtgta 43638992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 52306820 - 52306770
Alignment:
Q  10 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  52306820 ttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaggttgctaaaaca 52306770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Original strand, 13371431 - 13371472
Alignment:
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  13371431 ttactaaaacactcccacataaaaaccagcgggtgtgttcta 13371472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Original strand, 13381632 - 13381673
Alignment:
Q  200 ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  13381632 ttactaaaacactcccacataaaaaccagcgggtgtgttcta 13381673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 578878 - 578831
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacc 125  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  578878 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaatacacc 578831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10216370 - 10216311
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  10216370 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 10216311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 13211914 - 13211973
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  13211914 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 13211973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30820483 - 30820451
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30820483 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 30820451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 46106735 - 46106691
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  46106735 tttagcaagttataactaaaaagtagttgaatacaccttaaggtg 46106691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 48560097 - 48560156
Alignment:
Q  78 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  48560097 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 48560156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 452357 - 452596
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  452357 tttagcaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaat-aagtgcgtgtgttctagcaaatc 452455  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctt 200  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  452456 gtataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtatataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 452555  T
Q  201 tactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  452556 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 452596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2937 - 2767
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  2937 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatt 2838  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2837 ctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 2767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14992 - 14822
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  14992 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatt 14893  T
Q  101 ctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14892 ctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 14822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 20620 - 20847
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  20620 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 20718  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||    
T  20719 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtatgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtatc-ttgctaaaaca 20816  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20817 ctcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 20847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 20757 - 20816
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20757 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtatcttgctaaaaca 20816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5878 - 5658
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   ||||||||||    |||||| |||||||| |||    
T  5878 tataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtaagttagcaactcctatagacat 5781  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  5780 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatataccttaaggtgtagc-ttactaaaaca 5683  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5682 ctcccacgtaaaaactagtgggtgt 5658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 233
Target Start/End: Original strand, 5567 - 5639
Alignment:
Q  160 aataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggt 233  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5567 aataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttattaaaacattctcacgtaaaaactagtgggt 5639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 5742 - 5696
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  5742 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatataccttaaggtgta 5696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 9733 - 9959
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||    
T  9733 tataactaaaaagttgttaaatacacctcaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggcgtatgttagcaactcctataggcat 9831  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  9832 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 9929  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  9930 ctcctacataaaaactagt-ggtgtgttcta 9959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 9870 - 9929
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  9870 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 9929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6734 - 6508
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||| || || ||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||   || |||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  6734 tataactaaaaagttgttaaatatactttgaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aattgggtgtgtgttagcaactcctataggcat 6637  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  6636 ttgctaggatacatctatttattttttagaaggtgtattttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 6539  T
Q  211 ctcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6538 cttccacataaaaactagtgggtgtgttcta 6508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6598 - 6539
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  6598 tttagcaagttataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 6539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 22624 - 22838
Alignment:
Q  18 aaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctag 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||| |  |||||| |  |||| |  |||| |||    
T  22624 aaaaagttaataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacactttt--gaaaaaacaagtgggtgtatgttagcaagttttatatgtgtttgttag 22721  T
Q  118 aatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaacactcccac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| ||||    
T  22722 aatacacccacttattttttagaaggagtcatttggtaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagc-ttgctaaaacacttccac 22820  T
Q  218 gtaaaaactagtgggtgt 235  Q
     || |||||| |||||||    
T  22821 atagaaactattgggtgt 22838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4254 - 4043
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||  |||||| ||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  4254 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctataagcat 4157  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||    
T  4156 ttgcta-aatacacccacttattttttagaaggtgtgtttgagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 4060  T
Q  211 ctcccacgtaaaaacta 227  Q
    |||| || |||||||||    
T  4059 ctcctacataaaaacta 4043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 4116 - 4060
Alignment:
Q  4 agcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  4116 agcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaaca 4060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 82733 - 82830
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  82733 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaa 82830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 14937 - 14829
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||| || || || | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  14937 tttaacaagttataactaaaaagttattaaacacaccttactgtgtatgttgctataacacaccttgtatagaaaataagtgggtgtgttctagcaaatc 14838  T
Q  101 ctataggca 109  Q
    |||||||||    
T  14837 ctataggca 14829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 14934 - 14971
Alignment:
Q  204 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14934 taaaacactcccacgtaaaaagtagtgggtgtgttcta 14971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 759 - 557
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 110  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||| | ||| |||| |||||||| || |   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  759 tataactaaaaagttgttaattacaccttaagatgaatgcttctaaaacacacattctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 662  T
Q  111 ttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttactaaaaca 210  Q
    || |||| ||||||| |||||||||| |||||   | ||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||    
T  661 tttctaggatacacccacttatttttcagaaggtatgttttagcaag-ctataactaaaaagtagttaaaaacaccttaaggtgtagc-ttgctagaaca 564  T
Q  211 ctcccac 217  Q
    |||||||    
T  563 ctcccac 557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0778 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0778
Description:

Target: scaffold0778; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 6262 - 6313
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6262 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg 6313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0778; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6266 - 6228
Alignment:
Q  203 ctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6266 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttcta 6228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1717 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1717
Description:

Target: scaffold1717; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 1381 - 1443
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaa 74  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  1381 tataactaaaaagttgttaaataca-cttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaa 1443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1527 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1527
Description:

Target: scaffold1527; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 1627 - 1689
Alignment:
Q  11 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacatacattctagaaaa 74  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  1627 tataactaaaaagttgttaaataca-cttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaa 1689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 65951 - 66010
Alignment:
Q  1 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 60  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| | | || ||||||||||||||| ||||    
T  65951 tttagcaatttataactaaaaagttgataaatgctctttgaggtgtatgttgctacaaca 66010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 241
Target Start/End: Original strand, 1 - 35
Alignment:
Q  207 aacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttcta 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1 aacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University