View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19914_low_19 (Length: 209)

Name: NF19914_low_19
Description: NF19914
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19914_low_19
NF19914_low_19
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (5-209)||(66294-66498)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (5-209)||(53588-53792)
scaffold0031 (75-209)||(36041-36169)
scaffold0031 (56-122)||(36352-36419)
scaffold0031 (176-209)||(65856-65889)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (5-209)||(11312671-11312875)
chr7 (5-209)||(12318150-12318354)
chr7 (1-209)||(13635344-13635552)
chr7 (5-209)||(15605151-15605356)
chr7 (1-209)||(16583279-16583486)
chr7 (16-209)||(15580714-15580907)
chr7 (5-209)||(70644-70848)
chr7 (5-209)||(74753-74957)
chr7 (19-209)||(12714887-12715077)
chr7 (19-209)||(12718691-12718881)
chr7 (19-209)||(16114264-16114454)
chr7 (19-209)||(16117417-16117607)
chr7 (19-209)||(16907094-16907284)
chr7 (19-209)||(18283389-18283579)
chr7 (19-209)||(39722289-39722479)
chr7 (19-209)||(18279426-18279616)
chr7 (19-209)||(26292418-26292608)
chr7 (5-209)||(33130-33334)
chr7 (19-209)||(12704552-12704742)
chr7 (19-209)||(12723602-12723792)
chr7 (5-209)||(9593369-9593572)
chr7 (5-209)||(18937-19140)
chr7 (1-209)||(11987235-11987443)
chr7 (3-209)||(14429909-14430122)
chr7 (5-155)||(9644384-9644535)
chr7 (4-209)||(12321619-12321832)
chr7 (73-209)||(9751703-9751845)
chr7 (5-208)||(13149179-13149381)
chr7 (12-209)||(8917450-8917646)
chr7 (56-209)||(13918710-13918861)
chr7 (56-209)||(1859016-1859167)
chr7 (4-208)||(6801237-6801440)
chr7 (56-209)||(25927433-25927584)
chr7 (73-209)||(2832389-2832532)
chr7 (81-209)||(16457312-16457439)
chr7 (5-209)||(2760157-2760369)
chr7 (98-209)||(7519331-7519439)
chr7 (77-209)||(2530342-2530473)
chr7 (5-209)||(3271849-3272061)
chr7 (5-209)||(13461784-13461988)
chr7 (1-209)||(16724506-16724712)
chr7 (1-209)||(17701520-17701726)
chr7 (98-206)||(18425464-18425566)
chr7 (73-209)||(39267847-39267990)
chr7 (75-209)||(45169961-45170089)
chr7 (23-91)||(2530040-2530108)
chr7 (5-209)||(15728348-15728551)
chr7 (6-209)||(14216938-14217140)
chr7 (5-149)||(20569474-20569619)
chr7 (161-209)||(16275515-16275563)
chr7 (5-77)||(16438913-16438985)
chr7 (4-209)||(18556996-18557200)
chr7 (162-209)||(35151629-35151676)
chr7 (52-122)||(45170268-45170339)
chr7 (167-209)||(42204020-42204062)
chr7 (77-209)||(9446110-9446249)
chr7 (5-44)||(48593335-48593374)
chr7 (176-209)||(19649547-19649580)
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (5-209)||(17804220-17804424)
chr6 (5-209)||(25767047-25767251)
chr6 (16-209)||(22429920-22430113)
chr6 (5-209)||(14472294-14472497)
chr6 (19-209)||(1644728-1644918)
chr6 (19-209)||(19870613-19870803)
chr6 (5-209)||(22862969-22863173)
chr6 (19-209)||(11566885-11567075)
chr6 (19-209)||(23395091-23395281)
chr6 (19-209)||(8243884-8244074)
chr6 (19-209)||(23989943-23990133)
chr6 (5-209)||(18955642-18955846)
chr6 (19-209)||(18917159-18917349)
chr6 (19-209)||(12618738-12618927)
chr6 (5-209)||(12706713-12706916)
chr6 (5-208)||(16741231-16741433)
chr6 (3-209)||(18907137-18907351)
chr6 (56-209)||(23414669-23414820)
chr6 (56-209)||(27556427-27556578)
chr6 (1-85)||(27415817-27415901)
chr6 (56-209)||(5616745-5616897)
chr6 (4-209)||(19662794-19662997)
chr6 (5-208)||(22592683-22592884)
chr6 (5-208)||(9482172-9482374)
chr6 (5-208)||(12496333-12496535)
chr6 (6-209)||(2685199-2685400)
chr6 (71-209)||(16523330-16523474)
chr6 (5-209)||(19790657-19790870)
chr6 (19-155)||(21834782-21834916)
chr6 (75-206)||(16624158-16624283)
chr6 (75-209)||(31477765-31477893)
chr6 (5-209)||(20907860-20908072)
chr6 (56-209)||(27416124-27416269)
chr6 (75-206)||(16760321-16760446)
chr6 (98-209)||(27325581-27325701)
chr6 (75-209)||(22949131-22949259)
chr6 (75-209)||(22953087-22953215)
chr6 (75-209)||(23871575-23871703)
chr6 (75-209)||(23875531-23875659)
chr6 (77-209)||(18180520-18180658)
chr6 (45-124)||(15894347-15894427)
chr6 (98-209)||(21766721-21766839)
chr6 (56-149)||(31478076-31478169)
chr6 (5-209)||(1587610-1587813)
chr6 (5-209)||(20803432-20803636)
chr6 (4-124)||(21739899-21740020)
chr6 (157-209)||(19848034-19848086)
chr6 (56-141)||(1644462-1644548)
chr6 (167-209)||(23657470-23657512)
chr6 (167-209)||(27553620-27553662)
chr6 (161-206)||(1644314-1644359)
chr6 (161-206)||(31478265-31478310)
chr6 (157-209)||(15041589-15041641)
chr6 (157-209)||(23992457-23992509)
chr6 (3-54)||(16523279-16523330)
chr6 (56-122)||(16760068-16760135)
chr6 (56-122)||(22948881-22948948)
chr6 (56-122)||(22952837-22952904)
chr6 (56-122)||(23871325-23871392)
chr6 (56-122)||(23875281-23875348)
chr6 (167-209)||(15894487-15894529)
chr6 (167-209)||(27567658-27567700)
chr6 (176-209)||(19863004-19863037)
chr6 (176-209)||(19873146-19873179)
chr6 (161-209)||(21702311-21702359)
chr6 (77-141)||(22408255-22408319)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (4-209)||(15482686-15482891)
chr3 (5-209)||(20461379-20461583)
chr3 (1-209)||(327039-327248)
chr3 (5-209)||(7793228-7793433)
chr3 (5-209)||(30065972-30066176)
chr3 (5-209)||(2897702-2897906)
chr3 (19-209)||(15617400-15617590)
chr3 (5-209)||(11070094-11070298)
chr3 (5-209)||(11165408-11165612)
chr3 (5-209)||(11854759-11854963)
chr3 (5-209)||(55022893-55023097)
chr3 (19-209)||(7109724-7109914)
chr3 (19-209)||(7113659-7113849)
chr3 (19-209)||(22336745-22336935)
chr3 (19-209)||(27409537-27409727)
chr3 (19-209)||(28949750-28949940)
chr3 (19-209)||(22321690-22321880)
chr3 (5-209)||(14499351-14499555)
chr3 (5-209)||(31097433-31097638)
chr3 (5-209)||(15849964-15850165)
chr3 (5-154)||(11300390-11300539)
chr3 (3-209)||(18383793-18384006)
chr3 (3-209)||(19725788-19726001)
chr3 (3-209)||(322618-322831)
chr3 (6-209)||(16797934-16798136)
chr3 (3-209)||(12496283-12496497)
chr3 (3-209)||(11862819-11863033)
chr3 (6-209)||(16808761-16808963)
chr3 (3-209)||(11298405-11298618)
chr3 (5-209)||(3402834-3403047)
chr3 (56-209)||(5223088-5223239)
chr3 (56-209)||(15464889-15465040)
chr3 (5-208)||(38814409-38814611)
chr3 (73-209)||(14665427-14665570)
chr3 (73-209)||(14668583-14668726)
chr3 (5-209)||(17241997-17242199)
chr3 (5-208)||(3833699-3833901)
chr3 (5-209)||(3389814-3390027)
chr3 (14-209)||(11851607-11851810)
chr3 (56-209)||(12339490-12339641)
chr3 (3-209)||(1982687-1982901)
chr3 (45-209)||(12037871-12038042)
chr3 (75-206)||(16750543-16750668)
chr3 (112-209)||(8489459-8489553)
chr3 (56-209)||(11300696-11300847)
chr3 (5-209)||(11595017-11595230)
chr3 (75-209)||(4111204-4111332)
chr3 (75-209)||(15964995-15965123)
chr3 (75-209)||(15968919-15969047)
chr3 (75-209)||(15972843-15972971)
chr3 (75-209)||(19775791-19775919)
chr3 (75-209)||(4107352-4107480)
chr3 (75-209)||(37439591-37439719)
chr3 (102-209)||(11854441-11854545)
chr3 (45-124)||(12172924-12173004)
chr3 (3-109)||(15060427-15060534)
chr3 (167-209)||(12172822-12172864)
chr3 (56-141)||(4589039-4589125)
chr3 (56-149)||(19775515-19775608)
chr3 (5-149)||(42326035-42326180)
chr3 (3-105)||(15051655-15051758)
chr3 (3-109)||(16909885-16909992)
chr3 (167-209)||(11557433-11557475)
chr3 (159-209)||(12511087-12511137)
chr3 (167-209)||(23053136-23053178)
chr3 (159-209)||(46822295-46822345)
chr3 (161-206)||(4589228-4589273)
chr3 (176-209)||(14878574-14878607)
chr3 (161-206)||(19775374-19775419)
chr3 (46-110)||(23052996-23053061)
chr3 (133-208)||(15941912-15941985)
chr3 (161-209)||(16696809-16696857)
chr3 (5-65)||(26190887-26190947)
chr3 (56-122)||(15964745-15964812)
chr3 (56-122)||(15968669-15968736)
chr3 (56-122)||(15972593-15972660)
chr3 (167-209)||(42325967-42326009)
chr3 (133-208)||(1598487-1598560)
chr3 (176-209)||(15051534-15051567)
chr3 (176-209)||(15060310-15060343)
chr3 (176-209)||(15878109-15878142)
chr3 (176-209)||(17525216-17525249)
chr3 (176-209)||(30029870-30029903)
chr3 (46-109)||(16369543-16369607)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (5-209)||(24735426-24735630)
chr2 (5-209)||(10101524-10101728)
chr2 (19-209)||(24649380-24649570)
chr2 (19-209)||(12901405-12901595)
chr2 (19-209)||(27379326-27379516)
chr2 (19-209)||(27383372-27383562)
chr2 (19-209)||(27601819-27602009)
chr2 (19-209)||(24628372-24628562)
chr2 (5-149)||(19688635-19688779)
chr2 (19-209)||(41530903-41531087)
chr2 (19-124)||(15477711-15477816)
chr2 (3-209)||(25963593-25963806)
chr2 (4-209)||(22461067-22461270)
chr2 (5-208)||(19928381-19928583)
chr2 (5-209)||(22811789-22812002)
chr2 (4-209)||(23187099-23187303)
chr2 (4-209)||(23598362-23598566)
chr2 (56-209)||(31344901-31345052)
chr2 (5-209)||(25961413-25961625)
chr2 (5-208)||(18855340-18855541)
chr2 (8-209)||(40428489-40428699)
chr2 (75-209)||(30344946-30345074)
chr2 (75-209)||(1283412-1283540)
chr2 (45-209)||(21327485-21327658)
chr2 (5-209)||(24716409-24716619)
chr2 (4-124)||(24673697-24673818)
chr2 (74-209)||(21318584-21318727)
chr2 (96-209)||(21916069-21916189)
chr2 (3-94)||(21918192-21918284)
chr2 (96-209)||(37524701-37524821)
chr2 (102-209)||(41666973-41667078)
chr2 (167-209)||(24869906-24869948)
chr2 (5-209)||(24174826-24175038)
chr2 (167-209)||(22799175-22799217)
chr2 (3-125)||(22758591-22758715)
chr2 (5-209)||(60840-61042)
chr2 (5-209)||(24655217-24655429)
chr2 (157-209)||(25616215-25616267)
chr2 (162-209)||(27263296-27263343)
chr2 (167-203)||(23019755-23019791)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (5-209)||(12927-13131)
scaffold0044 (8-209)||(19211-19412)
scaffold0044 (105-209)||(62284-62386)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (5-209)||(36133841-36134045)
chr4 (5-209)||(17810295-17810499)
chr4 (19-209)||(9556553-9556743)
chr4 (5-209)||(14757301-14757505)
chr4 (19-209)||(4561227-4561417)
chr4 (19-209)||(5756831-5757021)
chr4 (5-209)||(27534049-27534253)
chr4 (19-209)||(33742401-33742590)
chr4 (5-209)||(1951640-1951843)
chr4 (5-209)||(18222257-18222460)
chr4 (73-208)||(22634369-22634504)
chr4 (5-209)||(18228732-18228935)
chr4 (13-209)||(17152374-17152568)
chr4 (3-209)||(16487954-16488168)
chr4 (5-208)||(19757480-19757682)
chr4 (5-208)||(19782124-19782326)
chr4 (1-209)||(3412822-3413027)
chr4 (3-209)||(16356829-16357042)
chr4 (5-208)||(16243279-16243481)
chr4 (5-208)||(26243544-26243746)
chr4 (56-209)||(43256343-43256494)
chr4 (5-208)||(23139296-23139497)
chr4 (1-85)||(43256036-43256120)
chr4 (3-209)||(16348541-16348754)
chr4 (1-207)||(9530460-9530664)
chr4 (56-209)||(18236915-18237067)
chr4 (73-209)||(20157407-20157550)
chr4 (5-208)||(2014803-2015005)
chr4 (73-209)||(13812966-13813109)
chr4 (75-209)||(10712876-10713004)
chr4 (75-209)||(10926646-10926774)
chr4 (5-209)||(5338859-5339072)
chr4 (3-124)||(12570142-12570264)
chr4 (75-209)||(14954122-14954250)
chr4 (75-209)||(25689893-25690021)
chr4 (5-149)||(25555599-25555744)
chr4 (5-149)||(11250439-11250584)
chr4 (1-96)||(18602620-18602715)
chr4 (75-209)||(12487734-12487862)
chr4 (104-209)||(28569423-28569526)
chr4 (5-209)||(15353185-15353398)
chr4 (1-77)||(18609214-18609290)
chr4 (161-209)||(14708668-14708716)
chr4 (93-208)||(45938173-45938284)
chr4 (6-114)||(44675762-44675872)
chr4 (167-209)||(25555506-25555548)
chr4 (161-206)||(15224821-15224866)
chr4 (13-114)||(23843608-23843711)
chr4 (5-209)||(42997328-42997532)
chr4 (56-122)||(14954433-14954500)
chr4 (56-122)||(25689643-25689710)
chr4 (167-209)||(11250610-11250652)
chr4 (167-209)||(12570040-12570082)
chr4 (75-149)||(15224962-15225035)
chr4 (176-209)||(15093801-15093834)
chr4 (176-209)||(23843504-23843537)
chr4 (45-102)||(15125071-15125130)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (5-209)||(3754-3958)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (5-209)||(1010746-1010950)
chr1 (5-209)||(16080323-16080527)
chr1 (5-209)||(36819187-36819392)
chr1 (19-209)||(20228702-20228892)
chr1 (16-209)||(24782990-24783183)
chr1 (19-209)||(16375351-16375541)
chr1 (19-209)||(21407378-21407568)
chr1 (19-209)||(52639564-52639754)
chr1 (5-209)||(19211891-19212094)
chr1 (1-209)||(23819174-23819381)
chr1 (43-209)||(18182037-18182211)
chr1 (5-209)||(20138107-20138310)
chr1 (3-209)||(22449142-22449356)
chr1 (1-85)||(33797680-33797764)
chr1 (4-209)||(12646895-12647098)
chr1 (56-209)||(33797306-33797457)
chr1 (5-206)||(46975494-46975694)
chr1 (45-209)||(3472843-3473013)
chr1 (5-207)||(18882393-18882594)
chr1 (5-143)||(18393842-18393981)
chr1 (75-209)||(1925084-1925212)
chr1 (75-209)||(20924098-20924226)
chr1 (3-116)||(21022767-21022881)
chr1 (5-146)||(45310245-45310387)
chr1 (5-152)||(8761511-8761658)
chr1 (75-206)||(39244096-39244221)
chr1 (75-206)||(39247651-39247776)
chr1 (75-206)||(41388196-41388321)
chr1 (5-149)||(45489621-45489766)
chr1 (4-124)||(22831255-22831375)
chr1 (4-124)||(6151976-6152097)
chr1 (77-209)||(17678538-17678676)
chr1 (56-141)||(20229075-20229161)
chr1 (3-114)||(42865087-42865200)
chr1 (167-209)||(3705113-3705155)
chr1 (167-209)||(18394014-18394056)
chr1 (167-209)||(33050074-33050116)
chr1 (167-209)||(45310417-45310459)
chr1 (157-209)||(21788081-21788133)
chr1 (175-209)||(21313151-21313185)
chr1 (167-209)||(45489792-45489834)
chr1 (176-209)||(20135217-20135250)
chr1 (176-209)||(22468754-22468787)
[»] scaffold0029 (5 HSPs)
scaffold0029 (19-209)||(61505-61695)
scaffold0029 (19-209)||(65421-65611)
scaffold0029 (5-209)||(80738-80939)
scaffold0029 (77-149)||(80462-80533)
scaffold0029 (161-206)||(80321-80366)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (5-209)||(18511-18715)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (1-209)||(23535464-23535670)
chr5 (1-209)||(15236655-15236863)
chr5 (19-209)||(20295870-20296060)
chr5 (19-209)||(19472613-19472803)
chr5 (71-209)||(17410463-17410601)
chr5 (3-209)||(21366542-21366755)
chr5 (5-209)||(18774227-18774431)
chr5 (16-209)||(42805444-42805636)
chr5 (5-207)||(20232577-20232777)
chr5 (16-209)||(26742636-26742828)
chr5 (5-209)||(18784070-18784274)
chr5 (56-209)||(20911101-20911252)
chr5 (5-208)||(33409253-33409455)
chr5 (6-209)||(26666011-26666212)
chr5 (6-209)||(26937608-26937809)
chr5 (1-85)||(18356474-18356558)
chr5 (73-207)||(24767493-24767634)
chr5 (5-208)||(16674177-16674379)
chr5 (56-209)||(18355981-18356132)
chr5 (16-209)||(24532938-24533129)
chr5 (1-85)||(20910675-20910759)
chr5 (3-209)||(20805578-20805790)
chr5 (5-209)||(23451374-23451584)
chr5 (5-208)||(17718318-17718520)
chr5 (146-209)||(40723607-40723670)
chr5 (75-209)||(10753387-10753515)
chr5 (20-149)||(22757219-22757349)
chr5 (5-209)||(12028443-12028656)
chr5 (1-209)||(123180-123396)
chr5 (5-209)||(21340646-21340848)
chr5 (5-209)||(23458618-23458828)
chr5 (5-209)||(23462879-23463089)
chr5 (8-209)||(20767000-20767207)
chr5 (77-209)||(1858929-1859067)
chr5 (19-209)||(21885082-21885271)
chr5 (56-149)||(10753111-10753204)
chr5 (167-209)||(26680608-26680650)
chr5 (167-209)||(26952215-26952257)
chr5 (19-209)||(26172488-26172677)
chr5 (167-209)||(17919200-17919242)
chr5 (167-209)||(31342173-31342215)
chr5 (8-114)||(14079278-14079386)
chr5 (157-209)||(17517240-17517292)
chr5 (5-209)||(25229285-25229488)
chr5 (5-209)||(25293441-25293644)
chr5 (77-149)||(31342219-31342291)
chr5 (162-209)||(4036243-4036290)
chr5 (56-122)||(11220521-11220588)
chr5 (56-122)||(11228930-11228997)
chr5 (56-122)||(11230919-11230986)
chr5 (77-209)||(24221903-24222042)
chr5 (57-122)||(11226940-11227006)
chr5 (161-206)||(10752970-10753015)
chr5 (176-209)||(14079175-14079208)
chr5 (176-209)||(21873280-21873313)
chr5 (176-209)||(23201386-23201419)
chr5 (5-33)||(17410646-17410674)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (19-209)||(4994-5184)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (19-209)||(43251836-43252026)
chr8 (19-209)||(19278176-19278366)
chr8 (19-209)||(21972478-21972668)
chr8 (19-209)||(21976563-21976753)
chr8 (5-209)||(16231354-16231557)
chr8 (19-179)||(22111904-22112064)
chr8 (5-209)||(22044908-22045111)
chr8 (1-154)||(18619555-18619709)
chr8 (3-209)||(20465915-20466129)
chr8 (3-209)||(30643167-30643382)
chr8 (9-141)||(22028647-22028780)
chr8 (5-209)||(23834196-23834400)
chr8 (5-208)||(23846894-23847096)
chr8 (3-209)||(17926583-17926796)
chr8 (5-209)||(30308633-30308835)
chr8 (3-209)||(15602893-15603107)
chr8 (3-209)||(16410131-16410344)
chr8 (3-209)||(15611345-15611559)
chr8 (56-209)||(14398039-14398190)
chr8 (5-208)||(15538473-15538675)
chr8 (5-208)||(15531914-15532115)
chr8 (7-209)||(20856305-20856515)
chr8 (75-209)||(21387097-21387228)
chr8 (75-209)||(18862600-18862728)
chr8 (75-209)||(21827969-21828097)
chr8 (82-209)||(21383677-21383801)
chr8 (3-109)||(377414-377521)
chr8 (3-124)||(24755842-24755964)
chr8 (80-209)||(21410973-21411096)
chr8 (80-209)||(21805465-21805588)
chr8 (3-109)||(19259458-19259565)
chr8 (77-209)||(39094875-39095015)
chr8 (42-209)||(32605234-32605400)
chr8 (77-209)||(16861277-16861415)
chr8 (157-209)||(18678141-18678193)
chr8 (157-209)||(32121762-32121814)
chr8 (5-208)||(17828462-17828663)
chr8 (167-209)||(22010723-22010765)
chr8 (42-209)||(32598702-32598868)
chr8 (172-209)||(17055424-17055461)
chr8 (8-114)||(19983223-19983331)
chr8 (56-122)||(18862911-18862978)
chr8 (56-122)||(21828280-21828347)
chr8 (167-209)||(377297-377339)
chr8 (3-114)||(19899225-19899338)
chr8 (5-126)||(22010557-22010678)
chr8 (167-209)||(23776884-23776926)
chr8 (167-209)||(24755740-24755782)
chr8 (176-209)||(17354001-17354034)
chr8 (176-209)||(19983119-19983152)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (5-209)||(12445-12649)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (5-207)||(13366-13568)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (19-209)||(58612-58802)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (19-209)||(35836-36025)
scaffold0109 (5-209)||(6968-7171)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-209)||(228248-228455)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (5-209)||(173315-173517)
scaffold0001 (5-209)||(422410-422622)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (5-209)||(2552-2755)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (5-209)||(19896-20099)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (1-209)||(9540-9748)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (5-209)||(18239-18442)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (5-209)||(3409-3612)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (9-127)||(10467-10585)
scaffold0004 (176-209)||(69820-69853)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (3-209)||(185-400)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (5-209)||(24847-25051)
scaffold0012 (75-209)||(189332-189460)
scaffold0012 (56-122)||(189643-189710)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (5-209)||(4456-4668)
scaffold0676 (75-209)||(473-602)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (3-209)||(419-633)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (3-209)||(42653-42862)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (3-209)||(1520-1733)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (5-159)||(1-156)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (5-209)||(5612-5823)
scaffold0476 (5-209)||(6807-7018)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (45-209)||(6227-6399)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (3-209)||(18532-18746)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (1-209)||(23240-23447)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (19-132)||(901-1014)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (71-209)||(17056-17202)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (4-209)||(46604-46817)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (5-209)||(6136-6339)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (5-209)||(15113-15324)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (5-208)||(9928-10130)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (3-209)||(9539-9751)
scaffold0104 (3-209)||(1856-2069)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (3-209)||(1960-2175)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (5-208)||(63878-64080)
scaffold0042 (8-208)||(75762-75961)
scaffold0042 (3-124)||(34786-34908)
scaffold0042 (167-209)||(34968-35010)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (3-155)||(21445-21597)
scaffold0037 (77-141)||(80642-80706)
scaffold0037 (161-206)||(80810-80855)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (13-209)||(1376-1580)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (1-85)||(71460-71544)
scaffold0003 (77-209)||(71092-71215)
scaffold0003 (5-208)||(139736-139937)
scaffold0003 (1-208)||(413925-414140)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (56-209)||(207768-207931)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (5-208)||(18379-18581)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (73-207)||(9990-10131)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (56-209)||(6704-6855)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (56-209)||(30908-31059)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (3-209)||(44107-44320)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (5-208)||(9445-9647)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (73-207)||(2933-3074)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (56-209)||(20395-20546)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (3-209)||(923-1136)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (5-152)||(19170-19317)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (83-209)||(73725-73857)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (3-209)||(6292-6505)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (5-208)||(36331-36532)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (5-209)||(8586-8799)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (13-209)||(35397-35602)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (75-209)||(11456-11584)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (5-146)||(4103-4245)
scaffold0184 (167-209)||(4275-4317)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (75-209)||(14042-14170)
scaffold0141 (56-122)||(14353-14420)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (8-209)||(19613-19823)
scaffold0017 (8-209)||(15091-15301)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (5-209)||(5879-6082)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (1-85)||(15293-15376)
[»] scaffold1552 (2 HSPs)
scaffold1552 (1-96)||(490-584)
scaffold1552 (162-209)||(392-439)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (3-109)||(6954-7061)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (8-149)||(192198-192340)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (19-209)||(77064-77253)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (1-209)||(7497-7713)
[»] scaffold0158 (4 HSPs)
scaffold0158 (45-124)||(2960-3040)
scaffold0158 (45-124)||(6626-6706)
scaffold0158 (167-209)||(2858-2900)
scaffold0158 (167-209)||(6524-6566)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (3-114)||(3872-3985)
scaffold0149 (3-114)||(8303-8416)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (35-124)||(13985-14075)
scaffold0056 (167-209)||(14135-14177)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (102-209)||(16640-16745)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (75-190)||(439-548)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (5-209)||(315-517)
[»] scaffold0111 (3 HSPs)
scaffold0111 (45-125)||(32554-32636)
scaffold0111 (161-209)||(8523-8571)
scaffold0111 (161-209)||(15667-15715)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (16-209)||(30634-30833)
scaffold0008 (102-209)||(1900-2005)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (75-209)||(32615-32743)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (161-209)||(9358-9406)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (161-207)||(15363-15409)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (155-209)||(4841-4895)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (167-209)||(38528-38570)
[»] scaffold1220 (2 HSPs)
scaffold1220 (5-125)||(1909-2029)
scaffold1220 (170-209)||(1818-1857)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (3-125)||(15545-15669)
scaffold0297 (176-209)||(15737-15770)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (176-209)||(16406-16439)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (77-149)||(11472-11544)
scaffold0410 (167-209)||(2194-2236)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (167-209)||(6121-6163)
[»] scaffold0439 (4 HSPs)
scaffold0439 (5-122)||(2314-2432)
scaffold0439 (167-209)||(2485-2527)
scaffold0439 (5-122)||(10174-10292)
scaffold0439 (167-209)||(10345-10387)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (167-209)||(7319-7361)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (176-209)||(21861-21894)
scaffold0210 (176-209)||(29753-29786)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (96-152)||(33639-33694)


Alignment Details
Target: scaffold0036 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 66294 - 66498
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66294 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 66393  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  66394 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 66493  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  66494 catga 66498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 53792 - 53588
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53792 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 53693  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53692 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 53593  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  53592 catga 53588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 36041 - 36169
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  36041 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 36134  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  36135 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 36169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 36352 - 36419
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  36352 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 36419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 65856 - 65889
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  65856 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 65889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11312875 - 11312671
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312875 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 11312776  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11312775 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 11312676  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  11312675 catga 11312671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12318354 - 12318150
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318354 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 12318255  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12318254 cttgaattattattgaatgattaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 12318155  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  12318154 catga 12318150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 13635344 - 13635552
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635344 aaccttaggtactaatgaggcctatttaagatattaacagagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 13635443  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13635444 attacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 13635543  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  13635544 gttgcatga 13635552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 15605151 - 15605356
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605151 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 15605250  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  15605251 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaaaat 15605350  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  15605351 gcatga 15605356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16583486 - 16583279
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16583486 aaccttaggtactaatgagacctatataagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttat-gattgattgc 16583388  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16583387 attacttgaattattgttgaatgatcgagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactac 16583288  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  16583287 gttgcatga 16583279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15580907 - 15580714
Alignment:
Q  16 tgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 115  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15580907 tgagacctatttaggatgttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattatt 15580808  T
Q  116 attgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15580807 attgaatgataaaaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatcgttatttaactaagttgcatga 15580714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 70644 - 70848
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70644 ttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 70743  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  70744 cttgaattattattgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttg 70843  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  70844 catga 70848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 74753 - 74957
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74753 ttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 74852  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  74853 cttgaattattattgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttg 74952  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  74953 catga 74957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12715077 - 12714887
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12715077 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 12714978  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12714977 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 12714887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12718881 - 12718691
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718881 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 12718782  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12718781 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 12718691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16114454 - 16114264
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114454 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 16114355  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16114354 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 16114264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16117607 - 16117417
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117607 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 16117508  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16117507 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 16117417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 16907094 - 16907284
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907094 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 16907193  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16907194 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 16907284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18283579 - 18283389
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283579 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 18283480  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18283479 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 18283389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39722479 - 39722289
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||  | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39722479 gacctattaaagataaggattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattaattgcattacttgaattattatt 39722380  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39722379 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgagttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 39722289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18279616 - 18279426
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279616 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 18279517  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18279516 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 18279426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26292608 - 26292418
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26292608 gacctattaaagataatgattgtgacttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattaattgaattattatt 26292509  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292508 gaatgataaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 26292418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33334 - 33130
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33334 ttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 33235  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33234 cttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgttccgattatgctgttattgttatttaactcagttg 33135  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  33134 catga 33130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 12704552 - 12704742
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12704552 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgaatgcattacttgaattattatt 12704651  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12704652 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgctgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 12704742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12723792 - 12723602
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723792 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 12723693  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12723692 gaatgatcaggaagttgttgaaaataaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgatattgttatttaactaagttacatga 12723602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9593572 - 9593369
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || | |||| ||||||||||| ||    
T  9593572 ttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcattt 9593473  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9593472 acttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 9593375  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  9593374 gcatga 9593369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 18937 - 19140
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| | ||    
T  18937 ttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtattt 19036  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19037 acttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 19134  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  19135 gcatga 19140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11987443 - 11987235
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaa-gataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  | |||| |||| |||||||||    
T  11987443 aaccttaggtactagtgagacctattaaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaataataagtgaattatggattgattg 11987344  T
Q  100 catt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11987343 catttacttgatttattattgaatgatcaagaaactgttgaaaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaact 11987246  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  11987245 aagttgcatga 11987235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14430122 - 14429909
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14430122 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgca 14430023  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||       ||  |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14430022 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtatactgttgttgtgatctgattatgcggctattgttattt 14429924  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  14429923 aactaagttgcatga 14429909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9644535 - 9644384
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || | |||| ||||||||||| ||    
T  9644535 ttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcattt 9644436  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9644435 acttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttatta 9644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 12321619 - 12321832
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcat 102  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||  | ||||||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12321619 cttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaaactgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcat 12321718  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12321719 tacttgaaatattatggaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattt 12321817  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||    
T  12321818 aactacgttgcatga 12321832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Original strand, 9751703 - 9751845
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgat 165  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| |       ||||||||    
T  9751703 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttggaa-tgaattgatattatgaattatactgttgat 9751801  T
Q  166 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9751802 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 9751845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13149381 - 13149179
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | ||    
T  13149381 ttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgccttt 13149282  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13149281 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 13149184  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  13149183 gcatg 13149179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8917646 - 8917450
Alignment:
Q  12 ctaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaa 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| | || ||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  8917646 ctaatgagacctattaaagatattgaccgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcatttacttgaa 8917547  T
Q  111 ttattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  8917546 ttattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatga 8917450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 13918710 - 13918861
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  13918710 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 13918808  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13918809 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 13918861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 1859016 - 1859167
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  1859016 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgttatt 1859114  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||  ||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1859115 aagc--ttgttgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 1859167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6801440 - 6801237
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattg-ca 101  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| | ||| | |||| ||||||||| |     
T  6801440 cttaggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagccattatgatatattaagtgattatgaagtgaaattatggattgattgccc 6801341  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  6801340 ttacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacatgatttgattatgctgcaattgttattaaactatg 6801244  T
Q  202 ttgcatg 208  Q
    |||||||    
T  6801243 ttgcatg 6801237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 25927433 - 25927584
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||    
T  25927433 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaatttttatt 25927531  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||   ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25927532 aag--tttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 25927584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Original strand, 2832389 - 2832532
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||   |||      ||||||    
T  2832389 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttatattgttga 2832487  T
Q  165 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2832488 tgggatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 2832532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 16457312 - 16457439
Alignment:
Q  81 gtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatg 179  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  16457312 gtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatg 16457409  T
Q  180 ctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  16457410 ctgcaattgttattaaactatgttgcatga 16457439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2760369 - 2760157
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || | |||| ||||||||||  ||||||| | |||||| ||| || | || |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  2760369 ttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 2760271  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |         ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2760270 acttgagatattattgaatgatcatgatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttcgttattta 2760171  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  2760170 actaagttgcatga 2760157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Original strand, 7519331 - 7519439
Alignment:
Q  98 tgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaac 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7519331 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaac 7519427  T
Q  198 taagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||||    
T  7519428 taagttggatga 7519439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Original strand, 2530342 - 2530473
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgat-atgatctgat 175  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    
T  2530342 taatgtgatttaatgattaaatgcattactcaaaaaattatggaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagct--tgattatgatttgat 2530439  T
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2530440 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 2530473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3272061 - 3271849
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||  ||| ||| |  ||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  3272061 ttaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttactgattaattgcatt 3271962  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||         ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3271961 acttgaa-tattattgaataatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttattt 3271864  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    ||| |||||||||||    
T  3271863 aaccaagttgcatga 3271849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13461988 - 13461784
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattg-cat 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||| | ||| | |||| |||||||||   |    
T  13461988 ttaggtgctaatgagacctattaaagatgttgactgagaactctgaagcttttatgaattgttaattgattatgaagtgaaattatggattgattgtttt 13461889  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |    
T  13461888 tacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgtaattaaactaatt 13461791  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  13461790 tgcatga 13461784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16724506 - 16724712
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg-attg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||     
T  16724506 aaccttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaatta 16724604  T
Q  100 ca-ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
     | ||| |||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  16724605 tatttatttgaattattgttgaatgatcaagaa-ctattgagaatgacttgttatttaac--ctgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaact 16724701  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  16724702 aagttgcatga 16724712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17701520 - 17701726
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg-attg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||     
T  17701520 aaccttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaatta 17701618  T
Q  100 ca-ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
     | ||| |||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  17701619 tatttatttgaattattgttgaatgatcaagaa-ctattgagaatgacttgttatttaac--ctgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaact 17701715  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  17701716 aagttgcatga 17701726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18425566 - 18425464
Alignment:
Q  98 tgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaac 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  18425566 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaac 18425473  T
Q  198 taagttgca 206  Q
    |||||||||    
T  18425472 taagttgca 18425464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Original strand, 39267847 - 39267990
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |         |||||     
T  39267847 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatagtattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttttaatgttgt 39267945  T
Q  165 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39267946 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 39267990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 45169961 - 45170089
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  45169961 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 45170054  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  45170055 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 45170089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 91
Target Start/End: Original strand, 2530040 - 2530108
Alignment:
Q  23 tatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattg 91  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2530040 tatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgatatattg 2530108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15728551 - 15728348
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga--ttgcat 102  Q
    |||||| ||||||||||||| | | |||| | |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | |||| |||| ||||||  |    |    
T  15728551 ttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggattgaaatatact 15728453  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15728452 tgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagt 15728355  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  15728354 tgcatga 15728348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14217140 - 14216938
Alignment:
Q  6 taggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga--ttgcatt 103  Q
    ||||| ||||||||||||| | | |||| | ||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| ||||||  |    ||    
T  14217140 taggtgctaatgagacctaataatgatattgactaagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgagttatggattgaaatatactt 14217042  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14217041 gcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattgaactaagtt 14216944  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  14216943 gcatga 14216938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Original strand, 20569474 - 20569619
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  || |||| |  ||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  20569474 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagctgatacatgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 20569573  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  20569574 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 20569619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16275563 - 16275515
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16275563 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 16275515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Original strand, 16438913 - 16438985
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattat 77  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  16438913 ttaggtgctagtgagacctattaaagatatggactgagaactgtgaagcttatatgaaatgttaagtgattat 16438985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18557200 - 18556996
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt-gcat 102  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||  || ||||||||||  |  ||| ||||   |||||| | ||    
T  18557200 cttaggtgctagtgagacctattaaagatattatctgagaactgtgaagcc-ttatgagttgttaagtgattaagaaatgaattatgatttgatttgtat 18557102  T
Q  103 t-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    | |||||||||||| || |||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18557101 ttacttgaattattgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttgctattgaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 18557004  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  18557003 ttgcatga 18556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35151676 - 35151629
Alignment:
Q  162 tgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35151676 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 35151629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Original strand, 45170268 - 45170339
Alignment:
Q  52 gctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  45170268 gctattatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 45170339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42204062 - 42204020
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42204062 tgatctgattatgctgctgttgttgtttaactaagttgcatga 42204020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Original strand, 9446110 - 9446249
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatg 168  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  || |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| | ||    
T  9446110 taatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtg 9446208  T
Q  169 atctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9446209 atctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 9446249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 44
Target Start/End: Original strand, 48593335 - 48593374
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaa 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48593335 ttaggtactactgagacctatttaagatattaactgagaa 48593374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 19649547 - 19649580
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19649547 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 19649580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17804424 - 17804220
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804424 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 17804325  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17804324 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 17804225  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  17804224 catga 17804220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 25767047 - 25767251
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25767047 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaaactattatgaaatgctaagtgattataatgtaatttattgattgattgcatta 25767146  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25767147 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttggtgtgatctgattatgctgctattgttacttaactaagttg 25767246  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  25767247 catga 25767251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 22429920 - 22430113
Alignment:
Q  16 tgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 115  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22429920 tgagacctatttaagatgttagctgagaactgtgaagttattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 22430019  T
Q  116 attgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22430020 attaaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatagttaattaactaagttgcatga 22430113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14472497 - 14472294
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14472497 ttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 14472398  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14472397 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgtta-ttaactaagttg 14472299  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  14472298 catga 14472294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1644918 - 1644728
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644918 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 1644819  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1644818 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatga 1644728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19870803 - 19870613
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870803 gacctatttaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 19870704  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19870703 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 19870613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22863173 - 22862969
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863173 ttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 22863074  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22863073 cttgaattattattgaatgattagaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttg 22862974  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  22862973 catga 22862969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11567075 - 11566885
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11567075 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 11566976  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11566975 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 11566885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23395281 - 23395091
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23395281 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 23395182  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23395181 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 23395091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8244074 - 8243884
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8244074 gacctattaaagataatgattgtgaattgtggagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 8243975  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8243974 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 8243884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23990133 - 23989943
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23990133 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 23990034  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23990033 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtaataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 23989943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 18955642 - 18955846
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18955642 ttaggtactaatgagacctatataagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattgattgattgattgcatta 18955741  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18955742 cttgaattattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttg 18955841  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  18955842 catga 18955846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 18917159 - 18917349
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18917159 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattatt 18917258  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917259 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattgggctgttgatatgatataattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18917349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 12618738 - 12618927
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12618738 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 12618837  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12618838 gaatgatcagggagttgttg-aaatgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 12618927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12706916 - 12706713
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||| ||    
T  12706916 ttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaaatgaattatggattgattgcattt 12706817  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12706816 acttgaattatttttgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 12706719  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  12706718 gcatga 12706713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16741433 - 16741231
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||    
T  16741433 ttaggtactagtgagacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgcattt 16741334  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  16741333 acttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgacagtgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctacaattgttattaaactaagtt 16741236  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  16741235 gcatg 16741231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18907351 - 18907137
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtg-attataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||  |  ||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18907351 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttcattataatgtgatttaatgattaattgca 18907252  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907251 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatt 18907153  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    |||||||| |||||||    
T  18907152 taactaagctgcatga 18907137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23414820 - 23414669
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  23414820 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 23414722  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23414721 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 23414669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27556578 - 27556427
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  27556578 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 27556480  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27556479 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 27556427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 27415817 - 27415901
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27415817 aaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 27415901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 5616745 - 5616897
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  5616745 ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgagaatgatttgttatt 5616844  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || ||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5616845 aaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 5616897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19662997 - 19662794
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |    
T  19662997 cttaggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccct 19662898  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  19662897 tacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgt 19662801  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  19662800 tgcatga 19662794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 22592683 - 22592884
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | ||    
T  22592683 ttaggtactaatgtgacctattaaagataataactgtgaactgtgaag-ttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgccttt 22592781  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  22592782 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctacaaatgttatttaactaagt 22592878  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  22592879 tgcatg 22592884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 9482172 - 9482374
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  ||| |||| ||||||||| | ||    
T  9482172 ttaggtactaatgtgaactattaaagataatgactgtaaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattatgaaatgaattatagattgattgccttt 9482271  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| || ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9482272 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgcttatgctgcaaatgttatttaactaagtt 9482369  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  9482370 gcatg 9482374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12496535 - 12496333
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | ||    
T  12496535 ttaggtagttatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttaggaactgttaagagattatgaactgaaatatggattgattgccttt 12496436  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||  || ||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12496435 acttgaaatattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttatagaacctgttg---tgatctgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 12496339  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  12496338 tgcatg 12496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Original strand, 2685199 - 2685400
Alignment:
Q  6 taggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catta 104  Q
    ||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||    
T  2685199 taggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccctta 2685298  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||| | || |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  2685299 cttgaattattgtcgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttg 2685395  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  2685396 catga 2685400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 209
Target Start/End: Original strand, 16523330 - 16523474
Alignment:
Q  71 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttg 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||       ||    ||||    
T  16523330 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacctgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataaagttg 16523428  T
Q  164 atatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523429 ttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 16523474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 19790657 - 19790870
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  19790657 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 19790756  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19790757 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgatgttgtgatctgattatgctgctgttgttattta 19790856  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  19790857 actaagttgcatga 19790870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 21834782 - 21834916
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattat 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  21834782 gacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgttt--aactgctaagttgattataatgtgatttaatgattaaatgtattacttgaaatattat 21834879  T
Q  118 tgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 155  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  21834880 tgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21834916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16624283 - 16624158
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||| |  ||||||||  |||    
T  16624283 tatattgtgaattaatgattaaatgcattacttgaagtattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagtt--tgatatgaattga 16624190  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16624189 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 16624158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 31477765 - 31477893
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  31477765 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 31477858  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  31477859 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 31477893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 20907860 - 20908072
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaa-ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcat 102  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||| |||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | |||||    
T  20907860 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaact-agaatctgggaagttgttaagaattgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcat 20907958  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20907959 tacttgaattattcttgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttattt 20908057  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  20908058 aactaagttgcatga 20908072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 27416124 - 27416269
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | |||||||||  || ||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  27416124 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactctaaatattaatgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 27416222  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||  |||||      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27416223 aagc--ttgat------tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 27416269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16760446 - 16760321
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  16760446 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 16760353  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  16760352 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgca 16760321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Original strand, 27325581 - 27325701
Alignment:
Q  98 tgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgtt-gaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattg 188  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| |        |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27325581 tgcattacttgaaatattatggaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatattatgaagttatactgttgatgtgatatgattatgctgctattg 27325680  T
Q  189 ttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  27325681 ttaattaactaagttgcatga 27325701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22949259 - 22949131
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  22949259 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattga 22949166  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  22949165 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 22949131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22953215 - 22953087
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  22953215 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattga 22953122  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  22953121 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 22953087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23871703 - 23871575
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  23871703 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattga 23871610  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  23871609 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 23871575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23875659 - 23875531
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  23875659 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattga 23875566  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  23875565 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 23875531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18180658 - 18180520
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatga 169  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| | |||    
T  18180658 taatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtga 18180560  T
Q  170 tctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18180559 tctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 18180520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Original strand, 15894347 - 15894427
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  15894347 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 15894427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21766839 - 21766721
Alignment:
Q  98 tgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgt 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| | |||||||  |||| |||||||||    
T  21766839 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgt 21766741  T
Q  190 tatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21766740 tatttaactaagttgcatga 21766721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Original strand, 31478076 - 31478169
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  31478076 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 31478169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 1587610 - 1587813
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga--ttgcat 102  Q
    |||||| ||||||||||||| | | |||| | |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | |||| |||| ||||||  |    |    
T  1587610 ttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggattgaaatatact 1587708  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1587709 tgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagt 1587806  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  1587807 tgcatga 1587813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 20803432 - 20803636
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--attgcat 102  Q
    |||||| ||||||||||||| | | |||| | ||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||  ||    |    
T  20803432 ttaggtgctaatgagacctaataatgatattgacttagaactgtgaagcttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatact 20803531  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  20803532 tgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagc 20803629  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  20803630 tgcatga 20803636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 21739899 - 21740020
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcat 102  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || |||  ||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21739899 cttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctggttataatgtgacttaatgattaattgcat 21739998  T
Q  103 tacttgaattattattgaatga 124  Q
    |||||||| | ||| |||||||    
T  21739999 tacttgaaatgttaatgaatga 21740020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 19848034 - 19848086
Alignment:
Q  157 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19848034 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 19848086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1644548 - 1644462
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 141  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  1644548 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatatttttgaatgatcaagatgttgttgaaa 1644462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 23657470 - 23657512
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23657470 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 23657512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 27553620 - 27553662
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27553620 tgatctgattatgctgctgttgttctttaactaagttgcatga 27553662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1644359 - 1644314
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1644359 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 1644314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Original strand, 31478265 - 31478310
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31478265 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 31478310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 15041589 - 15041641
Alignment:
Q  157 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15041589 gctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatga 15041641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23992509 - 23992457
Alignment:
Q  157 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23992509 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatga 23992457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 54
Target Start/End: Original strand, 16523279 - 16523330
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagct 54  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  16523279 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagct 16523330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16760135 - 16760068
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  16760135 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 16760068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22948948 - 22948881
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22948948 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 22948881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22952904 - 22952837
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22952904 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 22952837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23871392 - 23871325
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  23871392 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 23871325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23875348 - 23875281
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  23875348 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 23875281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 15894487 - 15894529
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15894487 tgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 15894529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 27567658 - 27567700
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  27567658 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgtatga 27567700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19863037 - 19863004
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19863037 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 19863004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19873179 - 19873146
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19873179 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 19873146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21702359 - 21702311
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21702359 ttgatgtgatttgattttgctgcaattgttatttaattaagttgcatga 21702311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Original strand, 22408255 - 22408319
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 141  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  22408255 taatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattcttgaatgatctagatgttgttgaaa 22408319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15482891 - 15482686
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15482891 cttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 15482792  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15482791 acttgaattattattgaatgctcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 15482692  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  15482691 gcatga 15482686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 20461379 - 20461583
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461379 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 20461478  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20461479 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 20461578  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  20461579 catga 20461583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 327039 - 327248
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  327039 aaccttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 327138  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga-ttatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  327139 attacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatcttagttatgctgctattgttaattaacta 327238  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  327239 agttgcatga 327248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 7793228 - 7793433
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7793228 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttgttgattgattgcatta 7793327  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctg-attatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7793328 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgaattatgctgctattgttaattaactaagtt 7793427  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  7793428 gcatga 7793433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30066176 - 30065972
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066176 ttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 30066077  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066076 cttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 30065977  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  30065976 catga 30065972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 2897702 - 2897906
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2897702 ttaggtaatagtgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 2897801  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2897802 ctggaattattattgaatgatcaagaagttgatgaaaataaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 2897901  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  2897902 catga 2897906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15617590 - 15617400
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15617590 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattacattacttgaattattatt 15617491  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617490 gaatgatcaggaacttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 15617400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11070298 - 11070094
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11070298 ttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatatcgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 11070199  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11070198 cttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttg 11070099  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  11070098 catga 11070094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 11165408 - 11165612
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11165408 ttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaaactatattgaaatgccaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 11165507  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11165508 cttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtta 11165607  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  11165608 catga 11165612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11854963 - 11854759
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11854963 ttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 11854864  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11854863 cttgaattattattgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatgttaagttgttgatatgatctgattatgctgctattgttattaaactaagttg 11854764  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  11854763 catga 11854759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 55023097 - 55022893
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55023097 ttagatactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 55022998  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  55022997 cttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatactgctattgttatttaactaagtta 55022898  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  55022897 catga 55022893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7109914 - 7109724
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109914 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 7109815  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7109814 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 7109724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7113849 - 7113659
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113849 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 7113750  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7113749 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 7113659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22336935 - 22336745
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336935 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 22336836  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22336835 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 22336745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 27409537 - 27409727
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27409537 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 27409636  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27409637 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 27409727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28949940 - 28949750
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949940 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 28949841  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28949840 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 28949750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22321880 - 22321690
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321880 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 22321781  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22321780 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctattgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 22321690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14499555 - 14499351
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14499555 ttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaattgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 14499456  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14499455 cttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgataagatctgattatgcggttattgttatttaactaagttg 14499356  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  14499355 catga 14499351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 31097433 - 31097638
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatga-aatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || |    
T  31097433 ttaggtactactgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgagaatgctaagtgattatgttgtgatatattgattgattccact 31097532  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  31097533 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagctattgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactatgtt 31097632  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  31097633 gcatga 31097638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 15849964 - 15850165
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |    
T  15849964 ttaggtactaatgagacctatttaagatatttaatgagatcggtgaagcttttatgaaatgctaaatgattatattgtgatatatggattgattgcataa 15850063  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15850064 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattg-tgaaaatgaattgttattaaac--ttgatatgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttg 15850160  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  15850161 catga 15850165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 11300390 - 11300539
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  || ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11300390 ttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtaaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 11300489  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11300490 cttgaattattattgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatatt 11300539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 18383793 - 18384006
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  18383793 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatcagtgaagctgttatgaactgttaagctgattttaatgtgatttaatgattaattgca 18383892  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18383893 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattt 18383991  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  18383992 aactaagttgcatga 18384006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 19725788 - 19726001
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||   |||||| | ||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  19725788 ccttaggtagtaatgtgacccatttaagatgtcaactgaaatctgtgaaactgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattaca 19725887  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-------aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||       | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19725888 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgagtcatgctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattt 19725986  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  19725987 aactaagttgcatga 19726001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 322831 - 322618
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  322831 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactaagatctgtgaagctgttatgaagtgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgca 322732  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||       ||   | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  322731 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatattgttgtgatctgattatgccgctattgttattt 322633  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  322632 aactaagttgcatga 322618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Original strand, 16797934 - 16798136
Alignment:
Q  6 taggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tta 104  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||    
T  16797934 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 16798033  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  |||||||| ||||| ||||    
T  16798034 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaactatgttg 16798131  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  16798132 catga 16798136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12496497 - 12496283
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||    
T  12496497 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 12496399  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||         ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  12496398 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttat 12496300  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||    
T  12496299 ttaactaagttgcatga 12496283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11863033 - 11862819
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| | ||||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  11863033 ccttaggtattaatgtgacctatttaagatgttatttgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgca 11862934  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt--tgata------tgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||| |  ||  | |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  11862933 ttacttgaaatattattgaatgaccaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttataatattttggtgatctgattatgctgctattgttatt 11862835  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  11862834 taactaagttgcatga 11862819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Original strand, 16808761 - 16808963
Alignment:
Q  6 taggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tta 104  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||    
T  16808761 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 16808860  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||| |||  |||||||| |||||  |||    
T  16808861 cttgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgcaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaactatattg 16808958  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  16808959 catga 16808963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 11298405 - 11298618
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||    
T  11298405 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatttgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 11298503  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  11298504 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatt 11298602  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  11298603 taactaagttgcatga 11298618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 3402834 - 3403047
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  3402834 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctattatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 3402933  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
     ||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3402934 ccttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctattgttattta 3403033  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  3403034 actaagttgcatga 3403047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5223239 - 5223088
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  5223239 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 5223141  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5223140 aagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgtatga 5223088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15465040 - 15464889
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  15465040 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 15464942  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15464941 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 15464889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38814611 - 38814409
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| || |||||| | ||    
T  38814611 ttaggtactaatgcgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggaatgattgccttt 38814512  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  38814511 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 38814415  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  38814414 tgcatg 38814409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14665570 - 14665427
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||   |||     |||||||    
T  14665570 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattttaaagttatactgttga 14665472  T
Q  165 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665471 tgtgatctgattatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 14665427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14668726 - 14668583
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta---ag-----ctgttga 164  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   ||     |||||||    
T  14668726 attataatatgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatactgttga 14668628  T
Q  165 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668627 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 14668583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17242199 - 17241997
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||    
T  17242199 ttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccctt 17242100  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  17242099 acttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgtt 17242003  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  17242002 gcatga 17241997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3833901 - 3833699
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | ||    
T  3833901 ttaggtactaatgtgacctattaaagatgatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgccttt 3833802  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3833801 acttgaattattgttgaatgatcaagcaattgttgagaatgacttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 3833705  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  3833704 tgcatg 3833699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 3389814 - 3390027
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  3389814 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 3389913  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||| ||||| |||||  | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3389914 acttgatttattcttgaaaaaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgttgttattta 3390013  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  3390014 actaagttgcatga 3390027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11851810 - 11851607
Alignment:
Q  14 aatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaatt 112  Q
    |||| ||||||||||||||  || |||| |  |||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  11851810 aatgtgacctatttaagatgttatctgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 11851711  T
Q  113 attattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    |||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||| |         ||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11851710 attattgaatgaacaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctaattatgctactatcgttatttaactaagttg 11851612  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  11851611 catga 11851607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12339641 - 12339490
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  12339641 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 12339543  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || |  |||||  ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12339542 aaac--ttgatgagaattgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 12339490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 1982687 - 1982901
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcat 102  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||  |  ||||||| | ||||||| || ||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||    
T  1982687 ccttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaactgcaatatgtgaagttgttatgaactgttaagttattgtaatgtgatttaatgattaaatgcat 1982786  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    |||||||| |||| |||||||| |   | |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1982787 tacttgaactatttttgaatgacctatatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttatagtgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttattt 1982886  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  1982887 aactaagttgcatga 1982901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 12037871 - 12038042
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaat 143  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  12037871 ctgtgaaaccattttgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaat 12037969  T
Q  144 gaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||        ||| ||||   ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12037970 gaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaactaagttgcatga 12038042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Original strand, 16750543 - 16750668
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  16750543 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 16750636  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16750637 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 16750668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 209
Target Start/End: Original strand, 8489459 - 8489553
Alignment:
Q  112 tattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8489459 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 8489553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 11300696 - 11300847
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  11300696 ttatgaactgctaagttgtttgtaatttgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 11300794  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || | ||| || |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11300795 aaac-gtt-atgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagttgcatga 11300847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 11595017 - 11595230
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  11595017 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 11595116  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11595117 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 11595216  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  11595217 actaagttgcatga 11595230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 4111204 - 4111332
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  4111204 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 4111297  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  4111298 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 4111332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15965123 - 15964995
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  15965123 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 15965030  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  15965029 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 15964995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15969047 - 15968919
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  15969047 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 15968954  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  15968953 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 15968919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15972971 - 15972843
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  15972971 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 15972878  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  15972877 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 15972843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19775919 - 19775791
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  19775919 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 19775826  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  19775825 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 19775791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 4107352 - 4107480
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  4107352 tatactgtgaattaatgattaaatgcattagttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 4107445  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  4107446 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 4107480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 37439591 - 37439719
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  37439591 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 37439684  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  37439685 ttatgctacaattgttgttaaactaagttgcatga 37439719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11854545 - 11854441
Alignment:
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| | || |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11854545 ttactcgaaatattattgaaagattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgccgcaattgttatttaactaag 11854449  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  11854448 ttgcatga 11854441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12173004 - 12172924
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 124  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  12173004 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 12172924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15060534 - 15060427
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  15060534 ccttaggtagtattgtgacctatataagatggtaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttca 15060435  T
Q  102 ttacttga 109  Q
    ||||||||    
T  15060434 ttacttga 15060427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12172864 - 12172822
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172864 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 12172822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 141
Target Start/End: Original strand, 4589039 - 4589125
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 141  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4589039 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 4589125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19775608 - 19775515
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  19775608 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 19775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 42326180 - 42326035
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa-gtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||| | ||| ||| || |||  || || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  42326180 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacttgtgaagttgttaagaactgttaacttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 42326081  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    |||||||||||| | |||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  42326080 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 42326035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 15051758 - 15051655
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||||  ||||||  |  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  15051758 ccttaggtagtattgtgacctatataagatgttaactgcaatttgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttca 15051659  T
Q  102 ttac 105  Q
    ||||    
T  15051658 ttac 15051655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16909992 - 16909885
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||||  | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |    
T  16909992 ccttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagcttttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttta 16909893  T
Q  102 ttacttga 109  Q
    ||||||||    
T  16909892 ttacttga 16909885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 11557433 - 11557475
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11557433 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 11557475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12511137 - 12511087
Alignment:
Q  159 tgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 12511087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 23053136 - 23053178
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23053136 tgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 23053178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 46822345 - 46822295
Alignment:
Q  159 tgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822345 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 46822295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Original strand, 4589228 - 4589273
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4589228 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 4589273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 14878574 - 14878607
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14878574 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 14878607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19775419 - 19775374
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19775419 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 19775374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 110
Target Start/End: Original strand, 23052996 - 23053061
Alignment:
Q  46 tgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 110  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  23052996 tgtgaagctattatgaaattttaagttgtttataatgtgatttaattattaattgcattacttgaa 23053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 208
Target Start/End: Original strand, 15941912 - 15941985
Alignment:
Q  133 ttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 208  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  |  |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15941912 ttgttgaaaatgatttgttattaaatt--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 15941985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16696857 - 16696809
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16696857 ttgatgtgatttgtttatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 16696809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 65
Target Start/End: Original strand, 26190887 - 26190947
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatg 65  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  26190887 ttaggtagtaatgagacctatttaagatgttaactgaaaattgtgaacctattttgaaatg 26190947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15964812 - 15964745
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15964812 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15964745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15968736 - 15968669
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15968736 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15968669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15972660 - 15972593
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15972660 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15972593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42326009 - 42325967
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  42326009 tgatctgattatgctgctgctgttttttaactaagttgcatga 42325967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 208
Target Start/End: Original strand, 1598487 - 1598560
Alignment:
Q  133 ttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 208  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||  |||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1598487 ttgttgaaaatgatttgttatttaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaat-gttatttaactaagttgcatg 1598560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15051567 - 15051534
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15051567 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 15051534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15060343 - 15060310
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15060343 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 15060310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 15878109 - 15878142
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15878109 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 15878142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 17525216 - 17525249
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17525216 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 17525249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30029903 - 30029870
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30029903 tatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16369607 - 16369543
Alignment:
Q  46 tgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttga 109  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  16369607 tgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatcattaatttcattacttga 16369543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 5e-98; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24735630 - 24735426
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24735630 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatcgcatta 24735531  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24735530 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 24735431  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  24735430 catga 24735426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 10101524 - 10101728
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101524 ttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 10101623  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101624 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 10101723  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  10101724 catga 10101728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24649570 - 24649380
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649570 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 24649471  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24649470 gaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 24649380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 12901405 - 12901595
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901405 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 12901504  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12901505 gaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 12901595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 27379326 - 27379516
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27379326 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattatt 27379425  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379426 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 27379516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 27383372 - 27383562
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27383372 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattatt 27383471  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383472 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 27383562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27602009 - 27601819
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602009 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 27601910  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27601909 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 27601819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 24628372 - 24628562
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24628372 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattatt 24628471  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24628472 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttaatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 24628562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Original strand, 19688635 - 19688779
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688635 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 19688734  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  19688735 cttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattg 19688779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 41530903 - 41531087
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41530903 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 41531002  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  41531003 gaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 41531087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15477816 - 15477711
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15477816 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 15477717  T
Q  119 gaatga 124  Q
    ||||||    
T  15477716 gaatga 15477711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 25963593 - 25963806
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||    
T  25963593 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 25963691  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  25963692 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatt 25963790  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
     |||||||||||||||    
T  25963791 gaactaagttgcatga 25963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 22461067 - 22461270
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |    
T  22461067 cttaggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccct 22461166  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  22461167 tacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgt 22461263  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  22461264 tgcatga 22461270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 19928381 - 19928583
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || || | |||||| |  |||  ||| ||||||||| | ||    
T  19928381 ttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaggagattatgaaatgaaatatggattgattgtcttt 19928480  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19928481 atttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 19928578  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  19928579 gcatg 19928583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 22811789 - 22812002
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattga-ttgcat 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||| | ||||||||||  |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  22811789 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaagtgaaatctgtgaagctgctatgaactattaagttgattataatgtgatttaatgattaaattgcat 22811888  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||        |||   ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22811889 tacctgaagtattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatgatgaagttataatgttgttgtgatttgattatgctgctattgttattt 22811987  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  22811988 aactaagttgcatga 22812002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23187303 - 23187099
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-t 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | |||| || | |||| |||| | |    
T  23187303 cttaggtactaatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggattaattgtatt 23187204  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||  |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  23187203 tacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ctgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagt 23187106  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    | |||||    
T  23187105 tccatga 23187099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23598566 - 23598362
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-t 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | |||| || | |||| |||| | |    
T  23598566 cttaggtactaatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggattaattgtatt 23598467  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||  |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  23598466 tacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ctgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagt 23598369  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    | |||||    
T  23598368 tccatga 23598362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31345052 - 31344901
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||  ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  31345052 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttcatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 31344954  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31344953 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattattatttaactaagttgcatga 31344901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 25961413 - 25961625
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  || |||  |  ||||||  | ||||||| || |||||  || |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  25961413 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagctgcaatatgtgaatttgttatgaactgttaagttgttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatta 25961512  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25961513 cttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaa 25961612  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  25961613 ctaagttgcatga 25961625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 18855340 - 18855541
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt- 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |  |||  |||  | ||||||| ||     
T  18855340 ttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaaatgaaatatgaagtgattgccttt 18855439  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| || | |||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  18855440 acttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttgtttaactaagtt 18855536  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  18855537 gcatg 18855541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40428699 - 40428489
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  40428699 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 40428600  T
Q  107 tgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
    ||| ||||| || ||| | |  || |||||||||||||||||| ||||| |         | ||| | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  40428599 tgatttattcttaaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatattgttgtgatctgaatatgctgcttttgttattgaact 40428500  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  40428499 aagttgcatga 40428489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 30344946 - 30345074
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  30344946 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 30345039  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  30345040 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 30345074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1283540 - 1283412
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  1283540 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 1283447  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || | |||||||||||||    
T  1283446 ttatgctgcaattgttgttaatctaagttgcatga 1283412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 21327485 - 21327658
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaat 143  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||| || ||||| | ||||    
T  21327485 ctgtgaagctgttatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaataatcaagatgttgtag-aaat 21327583  T
Q  144 gaattgata---------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||         ||| |||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21327584 gaattgataattatgaagttatgctgctgctgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 21327658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 24716409 - 24716619
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||| || |||| |||||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  24716409 ttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaacctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 24716507  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||| ||  |||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24716508 actagacatattattgaatgattatgatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaa 24716606  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    | |||||||||||    
T  24716607 ccaagttgcatga 24716619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24673818 - 24673697
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcat 102  Q
    |||| ||| ||||| ||||||| || |||  ||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  24673818 cttaagtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcgatctgtgaagctattatgaaatgttaagctgattatactgtgatttaatgattaattgcat 24673719  T
Q  103 tacttgaattattattgaatga 124  Q
    |||||||| | ||| |||||||    
T  24673718 tacttgaaatgttaatgaatga 24673697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 209
Target Start/End: Original strand, 21318584 - 21318727
Alignment:
Q  74 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttga 164  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||         ||| |||| ||     
T  21318584 ttatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaataatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgctgt 21318682  T
Q  165 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21318683 tgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 21318727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 209
Target Start/End: Original strand, 21916069 - 21916189
Alignment:
Q  96 attgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctatt 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||        ||| ||| ||| | ||||||||||||| || | ||    
T  21916069 attgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaatttatgcttttgttgtgatctgattatgttgttttt 21916167  T
Q  188 gttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21916168 gttatttaactaagttgcatga 21916189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 21918192 - 21918284
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgatt 94  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21918192 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgatt 21918284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37524821 - 37524701
Alignment:
Q  96 attgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatatgatctgattatgctgctatt 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| | ||| |         ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37524821 attgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttattgaaa-tgaattgttgttatgaagttacaatgttgatgtgatctgattatgctgctttt 37524723  T
Q  188 gttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  37524722 gttatttaaccaagttgcatga 37524701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41667078 - 41666973
Alignment:
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41667078 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 41666981  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  41666980 ttgcatga 41666973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24869948 - 24869906
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24869948 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 24869906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24175038 - 24174826
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  || | |  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  24175038 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 24174939  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24174938 acttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 24174840  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  24174839 actaagttgcatga 24174826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 22799175 - 22799217
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22799175 tgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 22799217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Original strand, 22758591 - 22758715
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||   ||| ||| ||||||| || ||||| |||||    
T  22758591 ccttgggtagtaatgagacctatataagaaattaactgcaatctatgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgc 22758690  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgat 125  Q
    |||||||||||||| | ||||||||    
T  22758691 attacttgaattatgaatgaatgat 22758715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 61042 - 60840
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga--ttgcat 102  Q
    |||||| ||||||||||||| | | |||| | || ||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| ||||||  |    |    
T  61042 ttaggtgctaatgagacctaataatgatattgaccgagaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatact 60944  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  60943 tgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgat-tgattatgctgcaattgttattaaactaagt 60847  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  60846 tgcatga 60840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 24655217 - 24655429
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  || | |  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  24655217 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 24655316  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  24655317 acttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttattta 24655415  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  24655416 actaagttgcatga 24655429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25616267 - 25616215
Alignment:
Q  157 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25616267 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatga 25616215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27263343 - 27263296
Alignment:
Q  162 tgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27263343 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 27263296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 203
Target Start/End: Original strand, 23019755 - 23019791
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019755 tgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagtt 23019791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 173; Significance: 3e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13131 - 12927
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 13032  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13031 cttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttg 12932  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  12931 catga 12927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19412 - 19211
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactt 107  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19412 ggtactaatgagatatatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactt 19313  T
Q  108 gaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 207  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19312 taattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcat 19213  T
Q  208 ga 209  Q
    ||    
T  19212 ga 19211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 62386 - 62284
Alignment:
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  62386 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgagttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttg 62289  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  62288 catga 62284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 3e-93; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 36133841 - 36134045
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36133841 ttaggtattaatgagacctatttaagatattaactgggaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 36133940  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36133941 cttgagttattattgaatgatcaggaagttgttgaagatgaatggatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 36134040  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  36134041 catga 36134045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17810499 - 17810295
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810499 ttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgttaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 17810400  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810399 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 17810300  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  17810299 catga 17810295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9556743 - 9556553
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9556743 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattagtatt 9556644  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556643 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 9556553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 14757301 - 14757505
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14757301 ttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 14757400  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14757401 cttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttg 14757500  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  14757501 catga 14757505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 4561227 - 4561417
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561227 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 4561326  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4561327 gaatgattaggaagttgttgaaaataaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 4561417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 5756831 - 5757021
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5756831 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 5756930  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5756931 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaactaagttacatga 5757021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27534253 - 27534049
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||  || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27534253 ttaggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagttgttataatgtgatttattgattgattgcatta 27534154  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27534153 cttgaatcattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttattaaactaagttg 27534054  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  27534053 catga 27534049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33742590 - 33742401
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33742590 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 33742491  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33742490 gaatgatcagggagttgttg-aaatgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 33742401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 1951640 - 1951843
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || | |||| ||||||||||| ||    
T  1951640 ttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcattt 1951739  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1951740 acttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 1951837  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  1951838 gcatga 1951843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 18222257 - 18222460
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| | ||    
T  18222257 ttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtattt 18222356  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18222357 acttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 18222454  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  18222455 gcatga 18222460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 208
Target Start/End: Original strand, 22634369 - 22634504
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatct 172  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22634369 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatct 22634468  T
Q  173 gattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22634469 gattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 22634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 18228732 - 18228935
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| | ||    
T  18228732 ttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttacgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtcttt 18228831  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||| ||||  ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18228832 acttgaattattattgaatgatcaaggaattgttggaaatgaattgttatgaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaatttttatttaactaagtt 18228929  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  18228930 gcatga 18228935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 17152374 - 17152568
Alignment:
Q  13 taatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaat 111  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  17152374 taatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagattttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaat 17152473  T
Q  112 tattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17152474 tattattgaatgatcaaggaattgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 17152568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 16487954 - 16488168
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  16487954 ccttaggtagtaatgtgtcctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgca 16488053  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||        ||| |||| |  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16488054 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgcttttgtgatctgattatgctgctattgttatt 16488152  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  16488153 taactaagttgcatga 16488168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 19757480 - 19757682
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | ||    
T  19757480 ttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgccttt 19757579  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19757580 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 19757676  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  19757677 tgcatg 19757682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19782326 - 19782124
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | ||    
T  19782326 ttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgccttt 19782227  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19782226 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 19782130  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  19782129 tgcatg 19782124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3413027 - 3412822
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg-attg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||     
T  3413027 aaccttaggtactaatgagacctattaaagatattga-tgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaatta 3412930  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     |||  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3412929 tatttattgaattattgttgaatgatcaagaaattattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgctattgttattaaacta 3412832  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  3412831 agttgcatga 3412822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 16356829 - 16357042
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-taatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||  ||  |||||||||||| ||||| | ||||    
T  16356829 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttttttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 16356927  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16356928 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatt 16357026  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  16357027 taactaagttgcatga 16357042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 16243279 - 16243481
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||| | |  |||  ||| ||||||||| | ||    
T  16243279 ttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattgtgaaatgaaatatggattgattgccttt 16243378  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16243379 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 16243476  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  16243477 gcatg 16243481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 26243544 - 26243746
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt- 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| || ||||||| ||     
T  26243544 ttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggaatgattgccttt 26243643  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26243644 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 26243741  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  26243742 gcatg 26243746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 43256343 - 43256494
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  43256343 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 43256441  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43256442 aagc--ttgatgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagttgcatga 43256494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23139497 - 23139296
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |  |    
T  23139497 ttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccat 23139398  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| || | |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23139397 acttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 23139301  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  23139300 gcatg 23139296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 43256036 - 43256120
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43256036 aaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 43256120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 16348541 - 16348754
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| || | || |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||    
T  16348541 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 16348639  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16348640 ttacttaaaatattattgaattatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatt 16348738  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  16348739 taactaagttgcatga 16348754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9530664 - 9530460
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||  |  |||  ||| || ||||||     
T  9530664 aaccttaggtactaatgagacctattaaagataatgaccgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattaggaaatgaaatatggagtgattgc 9530565  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | ||||| |||||||| || | |||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||    
T  9530564 ctttactcgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttattattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgtcatttaacta 9530468  T
Q  200 agttgcat 207  Q
    ||||||||    
T  9530467 agttgcat 9530460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18237067 - 18236915
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||| ||||    
T  18237067 ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgattaagaaattgttgagaatgatttgttatt 18236968  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || |   |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18236967 aaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 18236915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Original strand, 20157407 - 20157550
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||   |||     | |||||    
T  20157407 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatctagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttataccgttga 20157505  T
Q  165 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20157506 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaatttgcatga 20157550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2015005 - 2014803
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt- 103  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  ||||| |  |||  ||| |||||||||| ||     
T  2015005 ttaggtactaaggtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagaaattatgaaatgaaatatggattgattgccttt 2014906  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2014905 acttgaattattgtggaatgatcaagaaattgttgcgaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 2014808  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  2014807 gcatg 2014803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Original strand, 13812966 - 13813109
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |         |||||     
T  13812966 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttttaatgttgt 13813064  T
Q  165 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813065 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 13813109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10713004 - 10712876
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  10713004 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 10712911  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  10712910 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 10712876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10926774 - 10926646
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  10926774 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 10926681  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  10926680 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 10926646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 5338859 - 5339072
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||  ||| ||| | ||| |||||| |||||||    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5338859 ttaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgagaagctgttatgaaccattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcatt 5338958  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||         ||| ||||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  5338959 acttgagatattattgaataatcaagattttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgtgctgttattgttattt 5339057  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    ||||| | |||||||    
T  5339058 aactatgatgcatga 5339072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12570264 - 12570142
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    |||| |||| ||||| ||||||| || |||  ||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12570264 ccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca 12570165  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatga 124  Q
    ||||||||| | ||| |||||||    
T  12570164 ttacttgaaatgttaatgaatga 12570142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 14954122 - 14954250
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  14954122 tatattgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattga 14954215  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  14954216 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 14954250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25690021 - 25689893
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  25690021 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattga 25689928  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  25689927 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 25689893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25555744 - 25555599
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  25555744 ttaggtagtaatgaaacttatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 25555645  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  25555644 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 25555599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Original strand, 11250439 - 11250584
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  11250439 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctatgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 11250538  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    || ||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  11250539 acatgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 11250584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 18602620 - 18602715
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaag-ataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 96  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  18602620 aaccttaggtactaataagacctattaaagaatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 18602715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12487862 - 12487734
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| ||||||||  |||| ||||  |||    
T  12487862 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgacatgaattga 12487769  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  12487768 ttatgctgtaattgttgttaaactaagttgcatga 12487734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 209
Target Start/End: Original strand, 28569423 - 28569526
Alignment:
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| |   |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28569423 acttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaa--gttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 28569520  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  28569521 gcatga 28569526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 15353185 - 15353398
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||  ||||||  |  ||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  15353185 ttaggtagtaatgaaacctatctaagatgttaactggaatttgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 15353284  T
Q  104 acttgaattattattgaatgat-caggaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    |||||| ||||| |||||| || |  || ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  15353285 acttgatttattcttgaataatccttgatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgttgctgctgttattt 15353383  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  15353384 aactaagttgcatga 15353398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 18609214 - 18609290
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaag-ataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattat 77  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  18609214 aaccttaggtactaataagacctattaaagaatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattat 18609290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Original strand, 14708668 - 14708716
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14708668 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 14708716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45938284 - 45938173
Alignment:
Q  93 ttgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || | |||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  45938284 ttgattgccttacttga-ttattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 45938189  T
Q  193 ttaactaagttgcatg 208  Q
    ||||||||| ||||||    
T  45938188 ttaactaagatgcatg 45938173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 44675872 - 44675762
Alignment:
Q  6 taggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||   ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  44675872 taggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcatt 44675773  T
Q  104 acttgaattat 114  Q
    |||||| ||||    
T  44675772 acttgagttat 44675762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25555548 - 25555506
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25555548 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 25555506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15224866 - 15224821
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15224866 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 15224821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23843711 - 23843608
Alignment:
Q  13 taatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 110  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||     
T  23843711 taatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgttttaatgattaattgtattacttgag 23843612  T
Q  111 ttat 114  Q
    ||||    
T  23843611 ttat 23843608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 42997328 - 42997532
Alignment:
Q  5 ttaggtact-aatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca- 101  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  |     
T  42997328 ttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatac 42997426  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  42997427 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactgag 42997524  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  42997525 ttgcatga 42997532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 14954433 - 14954500
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  14954433 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 14954500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25689710 - 25689643
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  25689710 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 25689643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 11250610 - 11250652
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11250610 tgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 11250652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12570082 - 12570040
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12570082 tgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 12570040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15225035 - 15224962
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    |||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  15225035 tataatatgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgaccaagatgttgtt-aaaatgaattg 15224962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15093834 - 15093801
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15093834 tatgctgctattgttctttaactaagttgcatga 15093801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23843537 - 23843504
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23843537 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 23843504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 102
Target Start/End: Original strand, 15125071 - 15125130
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcat 102  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15125071 ctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcat 15125130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 3754 - 3958
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3754 ttaggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 3853  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3854 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 3953  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  3954 catga 3958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1010950 - 1010746
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010950 ttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 1010851  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010850 cttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 1010751  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  1010750 catga 1010746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 16080323 - 16080527
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080323 ttaggtactaatgagacctatttaagagattaactgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 16080422  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16080423 cttgaattattattggatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgataataagttattgatgtgatctgattatgctgctatttttaattaactaagttg 16080522  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  16080523 catga 16080527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 36819187 - 36819392
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  36819187 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattatattgtgatttatttattgattgcattt 36819286  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36819287 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctggtgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 36819386  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  36819387 gcatga 36819392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 20228702 - 20228892
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20228702 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 20228801  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20228802 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatga 20228892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 24782990 - 24783183
Alignment:
Q  16 tgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 115  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24782990 tgagacctacttaagatgttaactgaaaattgtgaagctgttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattaattgcattacttgaattatt 24783089  T
Q  116 attgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24783090 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttcatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 24783183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 16375351 - 16375541
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16375351 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 16375450  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16375451 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 16375541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21407568 - 21407378
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407568 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 21407469  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21407468 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 21407378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52639754 - 52639564
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639754 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 52639655  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  52639654 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaactaagttacatga 52639564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19212094 - 19211891
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||    
T  19212094 ttaggtactaatgagacctataaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattt 19211995  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19211994 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 19211897  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  19211896 gcatga 19211891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 23819174 - 23819381
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||     
T  23819174 aaccttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattgattgt 23819273  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  23819274 ctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaacga 23819371  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  23819372 agttgcatga 23819381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 18182037 - 18182211
Alignment:
Q  43 aactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 141  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  18182037 aactgtgaagctgttatgagatgctaagttgtttataatgtgattcaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aa 18182135  T
Q  142 atgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || ||||||||        ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182136 ataaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18182211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20138310 - 20138107
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||| | |  |||  ||| ||||| |||| ||     
T  20138310 ttaggtactaatgagacctattaaagataataactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattttgaaatgaaatatggattggttgccttt 20138211  T
Q  105 -cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
     ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20138210 gcttgaattattgttgaatgttcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 20138113  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  20138112 gcatga 20138107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 22449142 - 22449356
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||  ||||||  | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  22449142 ccttaggtagtaatgtgacatatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttca 22449241  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaa----tga-at--tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    ||| ||  ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22449242 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaagtattgatattatgaaattatgctcttgttgtgatctgattatgctgctactattattt 22449341  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  22449342 aactaagttgcatga 22449356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 33797764 - 33797680
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33797764 aaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 33797680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12647098 - 12646895
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |    
T  12647098 cttaggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccct 12646999  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  12646998 tacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgt 12646902  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  12646901 tgcatga 12646895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33797457 - 33797306
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  33797457 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattaatcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 33797359  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33797358 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 33797306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 46975694 - 46975494
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| | ||||||  || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | ||    
T  46975694 ttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgacctgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgtcttt 46975595  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  46975594 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 46975498  T
Q  203 tgca 206  Q
    ||||    
T  46975497 tgca 46975494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 3472843 - 3473013
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaat 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||  |    
T  3472843 ctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgtttgaaatgtgatttaatgattaaatgaattacttgaaatattgttgaatgatcaagatgttgttgaag-t 3472941  T
Q  144 gaattgatattaagctgttgata------tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || ||||||||| |  ||| |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3472942 gatttgatattatgaagttaatactcttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 3473013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18882594 - 18882393
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt- 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| || |||| |||||| |   ||  ||| || | ||||| ||     
T  18882594 ttaggtgctagtgagacctattagagatattaactgagaattgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaaagaaatatggaataattgccttt 18882495  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  18882494 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgataatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgaaaatgttatttaactaagtt 18882397  T
Q  204 gcat 207  Q
    ||||    
T  18882396 gcat 18882393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 143
Target Start/End: Original strand, 18393842 - 18393981
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  18393842 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 18393941  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaat 143  Q
    |||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||||    
T  18393942 acttgatttattcttgaataaccttgaagttgttgaaaat 18393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 1925084 - 1925212
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  1925084 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 1925177  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  1925178 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 1925212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 20924098 - 20924226
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  20924098 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 20924191  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  20924192 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 20924226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 21022881 - 21022767
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  21022881 ccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagctgattataatgtgaattaatgattaattgca 21022782  T
Q  102 ttacttgaattatta 116  Q
    ||||||||| |||||    
T  21022781 ttacttgaaatatta 21022767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 45310245 - 45310387
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  45310245 ttaggtagtaatgtggcctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 45310344  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaa 146  Q
     ||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  45310345 gcttgatttattcttgaataaccttgaagttgttgaaaatgaa 45310387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 8761511 - 8761658
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || ||| |||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||| ||||||| |  |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8761511 ttaggtagtagtgaaacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctaattatgatgtgatttattgattaattgcatt 8761610  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata 152  Q
    ||||||  ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  8761611 acttgagatattattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgata 8761658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Original strand, 39244096 - 39244221
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||  ||||||| |  ||||||||  |||    
T  39244096 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaagtt--tgatatgaattga 39244189  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39244190 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 39244221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Original strand, 39247651 - 39247776
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||  ||||||| |  ||||||||  |||    
T  39247651 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaagtt--tgatatgaattga 39247744  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39247745 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 39247776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Original strand, 41388196 - 41388321
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||  |||||||||  ||||| ||  |||    
T  41388196 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaatttttattaagct--tgatacgaattga 41388289  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41388290 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 41388321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Original strand, 45489621 - 45489766
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  45489621 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 45489720  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    |||||||||||| | |||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  45489721 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 45489766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 22831255 - 22831375
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || |||  ||| ||  | |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22831255 cttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 22831354  T
Q  104 acttgaattattattgaatga 124  Q
    ||||||| | ||| |||||||    
T  22831355 acttgaaatgttaatgaatga 22831375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6152097 - 6151976
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcat 102  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || |||  ||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6152097 cttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgtttataatgtgatttaatgattaattgcat 6151998  T
Q  103 tacttgaattattattgaatga 124  Q
    |||||||| | ||| |||||||    
T  6151997 tacttgaaatgttagtgaatga 6151976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Original strand, 17678538 - 17678676
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatatga 169  Q
    |||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| | ||| |        ||||| | |||    
T  17678538 taatgttatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtga 17678636  T
Q  170 tctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17678637 tctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 17678676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 141
Target Start/End: Original strand, 20229075 - 20229161
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 141  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20229075 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 20229161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 114
Target Start/End: Original strand, 42865087 - 42865200
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||| |||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||| |||||||| | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42865087 ccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaaggttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgc 42865186  T
Q  101 attacttgaattat 114  Q
    ||||||||| ||||    
T  42865187 attacttgagttat 42865200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 3705113 - 3705155
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3705113 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 3705155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 18394014 - 18394056
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18394014 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 18394056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 33050074 - 33050116
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33050074 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 33050116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 45310417 - 45310459
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45310417 tgatctgattatgctgctgtcgttatttaactaagttgcatga 45310459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 21788081 - 21788133
Alignment:
Q  157 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21788081 gctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatga 21788133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21313185 - 21313151
Alignment:
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21313185 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatga 21313151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 45489792 - 45489834
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  45489792 tgatctgattatgctgctgctattatttaactaagttgcatga 45489834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20135250 - 20135217
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20135250 tatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 22468754 - 22468787
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22468754 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 22468787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 159; Significance: 7e-85; HSPs: 5)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 61505 - 61695
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61505 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 61604  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61605 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 61695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 65421 - 65611
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65421 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 65520  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65521 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 65611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 80939 - 80738
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  80939 ttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgattgcatta 80840  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  80839 cttgaattattattgaatgatcaggaagatgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaactaagttg 80743  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  80742 catga 80738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 80533 - 80462
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  80533 taatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 80462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 80366 - 80321
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  80366 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 80321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 18511 - 18715
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511 ttaggtactgctgagacctattaaagatattgaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 18610  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18611 cttgaattatttttgaatgatcaagaaattattgaaaatgaattgttattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttacctaagttg 18710  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  18711 catga 18715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 23535464 - 23535670
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  23535464 aaccttaggtactaatgagacctgtttaagatattaaatgagaactgtgaagcttctatgaaatgctaagtgattatac-gtgatttattgatagattgc 23535562  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23535563 attactttaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaa-tgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 23535661  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  23535662 gttgcatga 23535670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15236655 - 15236863
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15236655 aacctttggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgattgc 15236754  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15236755 attacttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaa 15236854  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  15236855 gttgcatga 15236863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20296060 - 20295870
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20296060 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 20295961  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20295960 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 20295870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 19472613 - 19472803
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19472613 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttaaattattatt 19472712  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19472713 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 19472803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 71 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17410601 - 17410463
Alignment:
Q  71 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgat 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17410601 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtcgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgat 17410502  T
Q  171 ctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17410501 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatga 17410463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 21366542 - 21366755
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21366542 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgca 21366641  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366642 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattt 21366740  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  21366741 aactaagttgcatga 21366755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18774431 - 18774227
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattgca-t 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| | ||| | |||| ||||||||| | |    
T  18774431 ttaggtgctaatgagacctattaaagatattacctgagaactgtgaagcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattgattgtatt 18774332  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  18774331 tacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgt 18774234  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  18774233 tgcatga 18774227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42805636 - 42805444
Alignment:
Q  16 tgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattat 114  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  42805636 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattttatttacttgaattat 42805537  T
Q  115 tattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| |||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  42805536 tattaaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaaccaagttgcatga 42805444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20232777 - 20232577
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||    
T  20232777 ttaggtactaataagacctatttaagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccttt 20232678  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  20232677 acttgaattattgttgattgatcaataa-ttgttgagaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgtt 20232581  T
Q  204 gcat 207  Q
    ||||    
T  20232580 gcat 20232577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 26742636 - 26742828
Alignment:
Q  16 tgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattat 114  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| | ||||||| | ||||| |||||||    
T  26742636 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatattaagtgattataaagtgaattatggtttgattgtatttactcgaattat 26742735  T
Q  115 tattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||| ||||||||   |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26742736 tattgaatgatcaaggaattgttgagaatgagttgttattaagc--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 26742828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18784274 - 18784070
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat-ttattgattgattgcatt 103  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| || | ||||||||| | ||||  |||| ||||||||| |||    
T  18784274 ttaggtgctaatgagaccaattaaagatattgactgagaactgtgaggcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattgattgtatt 18784175  T
Q  104 -acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
     |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  18784174 tacttgaattattgttgaatgataaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgt 18784077  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  18784076 tgcatga 18784070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 20911101 - 20911252
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  20911101 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 20911199  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20911200 aagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 20911252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33409455 - 33409253
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | ||    
T  33409455 ttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgccttt 33409356  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33409355 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 33409259  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  33409258 tgcatg 33409253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Original strand, 26666011 - 26666212
Alignment:
Q  6 taggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catta 104  Q
    ||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||    
T  26666011 taggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccctta 26666110  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  26666111 cttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttg 26666207  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  26666208 catga 26666212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Original strand, 26937608 - 26937809
Alignment:
Q  6 taggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catta 104  Q
    ||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||    
T  26937608 taggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccctta 26937707  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  26937708 cttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttg 26937804  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  26937805 catga 26937809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18356558 - 18356474
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18356558 aaccttagatactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 18356474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 207
Target Start/End: Original strand, 24767493 - 24767634
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||   |||     || ||||    
T  24767493 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttatactattga 24767591  T
Q  165 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24767592 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 24767634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16674379 - 16674177
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt- 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||| || |||| || ||| |  |||  ||| |||||||||| ||     
T  16674379 ttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtaaagtttttatgaactgttaagagactatgaaatgaaatatagattgattgccttt 16674280  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16674279 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 16674183  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  16674182 tgcatg 16674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18356132 - 18355981
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  18356132 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 18356034  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || |  ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18356033 aaac--ttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatga 18355981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 24532938 - 24533129
Alignment:
Q  16 tgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattat 114  Q
    |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  24532938 tgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatactaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattat 24533037  T
Q  115 tattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    | |||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  24533038 tgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgttgcaattgttattaaactatgttgcatga 24533129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 20910675 - 20910759
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 85  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20910675 aaccctaggtactaatgagacctatttaagatgttatctgaggactgtgaagctattgtgaaatgctaagtgattataatgtgat 20910759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20805790 - 20805578
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-taatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||| || |||| |||||||| |||  |||||||||||| ||||| | ||||    
T  20805790 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttattggtaatgtgatttaatgattaaatgca 20805692  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||||| |         ||||  | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  20805691 ttacttgaaatgttattgaatgatctagatgttgttg--aatgaattgatattatgaaattattttgttcttgtgatctgcctatgctgctattgttatt 20805594  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  20805593 taactaagttgcatga 20805578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23451584 - 23451374
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||| || |||| |||||||| | || ||| ||||||||  |||| | ||||||    
T  23451584 ttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaaagtgatttaacgattaaatgcatt 23451486  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||| |        ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23451485 acttgaaatattattgaatgattatgatgttgttgaaaa-gaattgatgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaa 23451387  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    | |||||||||||    
T  23451386 ccaagttgcatga 23451374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 17718318 - 17718520
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgcatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || | || |||||| |  |||  |||  ||||| || | ||    
T  17718318 ttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgtttagagattatgaaatgaaatatgaattgatttccttt 17718417  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  || |||| | |   |||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  17718418 acttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatctgttattgaac--atgatgtgatttgattatgcggcaaatgttatttaactaagtt 17718515  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  17718516 gcatg 17718520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 209
Target Start/End: Original strand, 40723607 - 40723670
Alignment:
Q  146 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40723607 attgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 40723670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10753515 - 10753387
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  10753515 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 10753422  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  10753421 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 10753387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22757349 - 22757219
Alignment:
Q  20 acctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||| | || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  22757349 acctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattatt 22757250  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    |||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  22757249 gaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 22757219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 12028443 - 12028656
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  12028443 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 12028542  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| | |||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12028543 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 12028642  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  12028643 actaagttgcatga 12028656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 123180 - 123396
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||| | ||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||   || ||||||||||||  |||| | |||    
T  123180 aaccttaggtagtaatatgacctatgtgagatgttaactgagatctgtgaggctgttatgaattgttaagctgttgtaatgtgatttaaagattaaatgc 123279  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    ||||||||||||||| |||||| |    || ||||||||||||||||        ||| ||||   ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||    
T  123280 attacttgaattattcttgaataactttgatgttgttgaaaatgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttat 123379  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||    
T  123380 ttaactaagttgcatga 123396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 21340646 - 21340848
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt- 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  || |||| || |||| |||||| |  |||  ||| || ||||||| ||     
T  21340646 ttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgggaactgtgaagcctttttgaattgttaagggattatgaaatgaaatatggagtgattgccttt 21340745  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||| |||||||| || | |||||| ||| ||||| | ||||| ||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21340746 actcgaattattgttaattgatcaagaa-ttgtttagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 21340842  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  21340843 gcatga 21340848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23458828 - 23458618
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||| || |||| |||||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  23458828 ttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 23458730  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23458729 acttgaaatattattgaatgattatgatgctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaa 23458631  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    | |||||||||||    
T  23458630 ccaagttgcatga 23458618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23463089 - 23462879
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||| || |||| |||||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  23463089 ttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 23462991  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23462990 acttgaaatattattgaatgattatgatgctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaa 23462892  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    | |||||||||||    
T  23462891 ccaagttgcatga 23462879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20767207 - 20767000
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-taatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||| || |||| | ||||||  ||  |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  20767207 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactactaagttgttggtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 20767109  T
Q  107 tgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
    |||| | |||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||        ||| | ||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  20767108 tgaaatgttattgaatgatctagatgttgttg--aatgaattgatattatgaacttatgttgttgttgtgatttgcctatgctgctattgttatttaact 20767011  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  20767010 aagttgcatga 20767000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Original strand, 1858929 - 1859067
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatatga 169  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| | ||| |        ||||| | |||    
T  1858929 taatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtga 1859027  T
Q  170 tctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1859028 tctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 1859067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 21885082 - 21885271
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattatta 116  Q
    |||||||| |||||||| | |  ||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| ||     
T  21885082 gacctattaaagataattattatgaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttg 21885180  T
Q  117 ttgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21885181 ttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 21885271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10753204 - 10753111
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  10753204 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 10753111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26680650 - 26680608
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26680650 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 26680608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26952257 - 26952215
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26952257 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 26952215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26172677 - 26172488
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattatta 116  Q
    |||||||| |||||||| | |  ||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| |||||| || || ||||||||||| ||     
T  26172677 gacctattaaagataatgattatgaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaattacacttacttgaattgttg 26172579  T
Q  117 ttgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||| |||  | |||| || || ||| |||| | ||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26172578 ttgaatgatcaagaaactattgagaacgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgaatga 26172488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 17919200 - 17919242
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17919200 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 17919242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31342215 - 31342173
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31342215 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 31342173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14079386 - 14079278
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||   ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14079386 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctcttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattac 14079287  T
Q  106 ttgaattat 114  Q
    |||| ||||    
T  14079286 ttgagttat 14079278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 17517240 - 17517292
Alignment:
Q  157 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17517240 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 17517292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 25229285 - 25229488
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga--ttgcat 102  Q
    |||||| ||||||||||||| | | |||| | ||||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| ||||||  |    |    
T  25229285 ttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgagaagtt-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatact 25229383  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    | ||||||||||| |||||||||||  ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25229384 tgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagt 25229481  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  25229482 tgcatga 25229488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 25293441 - 25293644
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga--ttgcat 102  Q
    |||||| ||||||||||||| | | |||| | ||||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| ||||||  |    |    
T  25293441 ttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgagaagtt-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatact 25293539  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    | ||||||||||| |||||||||||  ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25293540 tgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagt 25293637  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  25293638 tgcatga 25293644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 31342291 - 31342219
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  31342291 taatgtgatttaacgattaattgcattacttgaattatccttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 31342219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4036290 - 4036243
Alignment:
Q  162 tgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4036290 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 4036243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11220588 - 11220521
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11220588 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11220521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11228997 - 11228930
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11228997 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11228930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11230986 - 11230919
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11230986 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11230919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24222042 - 24221903
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatg 168  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  || |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| | ||    
T  24222042 taatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtg 24221944  T
Q  169 atctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  24221943 atctgattatgctgctgctgttatttaactaggttgcatga 24221903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11227006 - 11226940
Alignment:
Q  57 tatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11227006 tatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11226940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10753015 - 10752970
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10753015 ttgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 10752970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14079208 - 14079175
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14079208 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 14079175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21873313 - 21873280
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21873313 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatga 21873280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23201419 - 23201386
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23201419 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 23201386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 17410674 - 17410646
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagata 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410674 ttaggtactaatgagacctatttaagata 17410646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 4994 - 5184
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4994 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 5093  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5094 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgagctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 5184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43252026 - 43251836
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43252026 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 43251927  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43251926 gaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 43251836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 19278176 - 19278366
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278176 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 19278275  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19278276 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 19278366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 21972478 - 21972668
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21972478 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 21972577  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21972578 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 21972668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 21976563 - 21976753
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21976563 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 21976662  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21976663 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 21976753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 16231354 - 16231557
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||    
T  16231354 ttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgcattt 16231453  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16231454 acttgaattattattgaatgatcaagaatttgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 16231551  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  16231552 gcatga 16231557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22112064 - 22111904
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22112064 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 22111965  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22111964 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatg 22111904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22045111 - 22044908
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||    
T  22045111 ttagatactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgcattt 22045012  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||    
T  22045011 acttgaattattatggaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatcaaactaagtt 22044914  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  22044913 gcatga 22044908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18619709 - 18619555
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||     
T  18619709 aaccttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattgattgt 18619610  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  18619609 ctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattganatt 18619555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 20465915 - 20466129
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||   ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20465915 ccttaggtagtaatgtgacctatataagaggttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca 20466014  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  20466015 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcctatactgctattgttatt 20466113  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  20466114 taactaagttgcatga 20466129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 30643167 - 30643382
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaa-gctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||  | ||||||| ||| ||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  30643167 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatctgtgaaagctgttacgaactgttaagttgattataatatgatttaatgattaattgc 30643266  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30643267 attacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttat 30643365  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||    
T  30643366 ttaactaagttgcatga 30643382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22028780 - 22028647
Alignment:
Q  9 gtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttactt 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  22028780 gtactaatgagacctattgaagatattgactaagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgcatttactt 22028681  T
Q  108 gaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 141  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22028680 gaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaa 22028647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23834400 - 23834196
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattgca-t 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| | ||| |||||| || |||||| | |    
T  23834400 ttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaatcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaatttatggactgattgtatt 23834301  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||    
T  23834300 tacttgaattattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgactatgatgcaattgttattaaactatgt 23834203  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  23834202 tgcatga 23834196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 23846894 - 23847096
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | ||    
T  23846894 ttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgccttt 23846993  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23846994 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaatctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 23847090  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  23847091 tgcatg 23847096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 17926583 - 17926796
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||    
T  17926583 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 17926681  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||    
T  17926682 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattgtgaaattatgctgttgttttgatctgcctatgctactattgttatt 17926780  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  17926781 taactaagttgcatga 17926796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 30308633 - 30308835
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||    
T  30308633 ttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatta 30308732  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||| ||||||     ||||  ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||    
T  30308733 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaa--atctgatgggatttgattatgttgcaattgttattaaactaatttg 30308830  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  30308831 catga 30308835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 15602893 - 15603107
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtgat-tataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||  | | |||||||||||| ||||| | |||    
T  15602893 ccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactgctaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgc 15602991  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||         ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15602992 attacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaatcgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttat 15603090  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15603091 ttaaccaagttgcatga 15603107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 16410131 - 16410344
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||    
T  16410131 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 16410229  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||        ||| |||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16410230 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatt 16410328  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    | ||||||||||||||    
T  16410329 tcactaagttgcatga 16410344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 15611345 - 15611559
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtgat-tataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| || ||||| | ||||||  | | |||||||||||| ||||| | |||    
T  15611345 ccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactactaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgc 15611443  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  15611444 attacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctggttttgttat 15611542  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15611543 ttaaccaagttgcatga 15611559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 14398039 - 14398190
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||    
T  14398039 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagttgttgttgaaa-tgaattgttatt 14398137  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |  ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14398138 aagcttt--atgcgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 14398190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15538675 - 15538473
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt- 103  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||| | ||||||| || |||| ||| || |  |||  ||| |||||||||| ||     
T  15538675 ttaggtgctaatgagacctattagagataatgactgtgaacagtgaagattttatgaactgttaagggataatgaaatgaaatatggattgattgccttt 15538576  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15538575 acttgagttattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 15538479  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  15538478 tgcatg 15538473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15532115 - 15531914
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt- 103  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| | |||| || || |||| ||| || |  |||  ||| |||||||||| ||     
T  15532115 ttaggtgctaatgagacctattagagataatgactgtgaactatgaagattttat-aactgttaagggataatgaaatgaaatatggattgattgccttt 15532017  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15532016 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 15531920  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  15531919 tgcatg 15531914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 20856305 - 20856515
Alignment:
Q  7 aggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||  || |||||| ||||||| || ||||||| ||||||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  20856305 aggtagtaatgtgacctattaaagatgttagctgagatctgtgaacctgttatgaattgctaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattac 20856404  T
Q  106 ttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaac 197  Q
    |||||||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||| | ||| |         | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20856405 ttgaattattcttgaataacctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatattgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaac 20856503  T
Q  198 taagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||    
T  20856504 taagttgcatga 20856515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21387228 - 21387097
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||  | ||| || ||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||| |||    
T  21387228 tatactgtgatttaatgattaaatgcattgttcgaaatagtatcgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttga 21387132  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21387131 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 21387097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 18862600 - 18862728
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  18862600 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 18862693  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  18862694 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 18862728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 21827969 - 21828097
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  21827969 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 21828062  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  21828063 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 21828097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21383801 - 21383677
Alignment:
Q  82 tgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgct 181  Q
    ||||||| ||||| | |||||| || ||| || ||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||| |    
T  21383801 tgatttaatgattaaatgcattgctcgaaatagtattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgtt 21383705  T
Q  182 gctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  21383704 gcaattgttatttaactaagttgcatga 21383677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 377521 - 377414
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  377521 ccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgatcataatgtgatttaatgattaattgca 377422  T
Q  102 ttacttga 109  Q
    ||||||||    
T  377421 ttacttga 377414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24755964 - 24755842
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    |||| |||| ||||| ||||||| || |||  ||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24755964 ccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca 24755865  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatga 124  Q
    ||||||||| | ||| |||||||    
T  24755864 ttacttgaaatgttaatgaatga 24755842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21411096 - 21410973
Alignment:
Q  80 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatg 179  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  21411096 tgtgaattaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatg 21411003  T
Q  180 ctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||    
T  21411002 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 21410973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21805588 - 21805465
Alignment:
Q  80 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatg 179  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  21805588 tgtgaattaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatg 21805495  T
Q  180 ctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||    
T  21805494 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 21805465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 19259458 - 19259565
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||||  | |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  19259458 ccttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttca 19259557  T
Q  102 ttacttga 109  Q
    ||||||||    
T  19259558 ttacttga 19259565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Original strand, 39094875 - 39095015
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatatg 168  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||| ||||| |         ||||| | ||    
T  39094875 taatgtaatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatgttgttgtg 39094974  T
Q  169 atctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39094975 atctgaatatgctgcttttgttatttaactaagttgcatga 39095015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32605400 - 32605234
Alignment:
Q  42 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttga 139  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||| |||  | ||||    
T  32605400 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattga 32605302  T
Q  140 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
     ||||| ||| |||| | ||  |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32605301 gaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 32605234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Original strand, 16861277 - 16861415
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatga 169  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| | |||    
T  16861277 taatgtgatttaatgattaaatacattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaatataatgttgttgtga 16861375  T
Q  170 tctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  16861376 tctgattatgctgcttttgttatttaaccgagttgcatga 16861415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 18678141 - 18678193
Alignment:
Q  157 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18678141 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18678193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32121814 - 32121762
Alignment:
Q  157 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121814 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 32121762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 17828462 - 17828663
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgatt-gattg-cat 102  Q
    |||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||  || |||| ||| || |  |||  ||| |||| ||||| | |    
T  17828462 ttaggtgctaacgagacctattagagataatgactgtgaactgtgaagattttatgatttgttaagggataatgaaatgaaatatggatttgattgtctt 17828561  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||| ||||| || | |||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  17828562 tacttga-ttattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttaattaactaagt 17828657  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  17828658 tgcatg 17828663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 22010723 - 22010765
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22010723 tgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 22010765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32598868 - 32598702
Alignment:
Q  42 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttga 139  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||| |||  | ||||    
T  32598868 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattga 32598770  T
Q  140 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
     ||||| ||| ||||   ||  |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32598769 gaatgatttgttatttgact--tgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 32598702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 209
Target Start/End: Original strand, 17055424 - 17055461
Alignment:
Q  172 tgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17055424 tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 17055461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 19983331 - 19983223
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||   ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19983331 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattac 19983232  T
Q  106 ttgaattat 114  Q
    |||| ||||    
T  19983231 ttgagttat 19983223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 18862911 - 18862978
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  18862911 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 18862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 21828280 - 21828347
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  21828280 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 21828347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 377339 - 377297
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  377339 tgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatga 377297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 19899338 - 19899225
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||   ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||| |    
T  19899338 ccttgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaatttc 19899239  T
Q  101 attacttgaattat 114  Q
    ||||||||| ||||    
T  19899238 attacttgagttat 19899225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 22010557 - 22010678
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || | |||| ||||||||||  ||||||| | |||||| | | || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  22010557 ttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatctgtgaggttgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 22010655  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatc 126  Q
    ||||||| |||| ||||||||||    
T  22010656 acttgaaatattcttgaatgatc 22010678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 23776884 - 23776926
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23776884 tgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatga 23776926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24755782 - 24755740
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24755782 tgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 24755740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 17354001 - 17354034
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17354001 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 17354034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19983152 - 19983119
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19983152 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 19983119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12649 - 12445
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649 ttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatta 12550  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12549 cttgaattattattaaatgattgggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtta 12450  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  12449 catga 12445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Original strand, 13366 - 13568
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13366 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgataactgtgtagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 13465  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||    
T  13466 ctttaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatcgattgatattaagttgttgatgtgatctgattattctgttattgttaattaactgagttg 13565  T
Q  205 cat 207  Q
    |||    
T  13566 cat 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 58612 - 58802
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58612 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 58711  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  58712 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 58802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 35836 - 36025
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35836 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 35935  T
Q  119 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35936 gaatgatcaggaagttgttg-aaattaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 36025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7171 - 6968
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt- 103  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||| | |||| |||| ||||||||| |||     
T  7171 ttaggtgctaatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattgtattt 7072  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||| |||||| ||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  7071 acttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgtt 6974  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  6973 gcatga 6968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 228248 - 228455
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  228248 aaccttaggtactaatgagacctacttaagatattaactgagaactgtgaagtttttatgaaatgctaagtgattatatagtgatttattgattgattgc 228347  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  228348 atttacttgaattattattgaatgatcaagaaatagttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattatgctgcaattgttatttaacta 228445  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  228446 agttgcatga 228455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 173517 - 173315
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  173517 ttaggtactaaagagacctattaaagatattaactgagaactttgaagctattatgaaatgctaagtgattatattgtgatatattgattgattgcatta 173418  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  173417 cttgaattattattgaatgataaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttg 173320  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  173319 catga 173315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 422410 - 422622
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaa-ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcat 102  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||||| | ||| ||| |  ||||| | || ||||||||||||  || | | |||||    
T  422410 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaact-agaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgactaaatgcat 422508  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  422509 tacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctaattatgctgctgctgttattt 422607  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  422608 aactaagttgcatga 422622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 2552 - 2755
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  2552 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaattgtgaagcttttatgaactgctaagtgattatattgtgatatattgattgattggatta 2651  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2652 cttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttg-aaatgaattgttattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactaagttg 2750  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  2751 catga 2755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 19896 - 20099
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19896 ttaggtactaatgagacctattaaagatattaattgagaactgtgaagcttttatgaaacgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattt 19995  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  19996 acttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattatgttgcaattgttattaaactaagtt 20093  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  20094 gcatga 20099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 9540 - 9748
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9540 aaccttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgattataatgtgatttattgattgatcgc 9639  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgtt-gaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9640 atttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttattaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattacgctgcaattgttaattaact 9737  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    | |||||||||    
T  9738 atgttgcatga 9748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 18239 - 18442
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| |||| |||| ||||||||| | ||    
T  18239 ttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaaaataaagtgaattatggattgattgtattt 18338  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18339 acttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 18436  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  18437 gcatga 18442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 3409 - 3612
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||| ||    
T  3409 ttaggtactaatgagacccattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatatagagtgaattatggattgattgcattt 3508  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3509 acttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatactgcaattgttatttaactaagtt 3606  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  3607 gcatga 3612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Original strand, 10467 - 10585
Alignment:
Q  9 gtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10467 gtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatactaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttg 10566  T
Q  109 aattattattgaatgatca 127  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10567 aattattattgaatgatca 10585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 69853 - 69820
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  69853 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 69820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 400 - 185
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||| || | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  400 ccttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaacggaaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgactaattgca 301  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||        ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  300 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatt 201  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  200 taactaagttgcatga 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 24847 - 25051
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||    
T  24847 ttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttaggaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgcattt 24946  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatc--aggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||  ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  24947 acttgaattattattgaatgatcaaaggaa-ttattgaaaatgtgttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactgag 25043  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  25044 ttgcatga 25051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 189332 - 189460
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  189332 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 189425  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  189426 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 189460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 189643 - 189710
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  189643 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 189710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 97; Significance: 7e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4668 - 4456
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||   ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4668 ttaggtagtagtgagacctatataagaagttaactgtaaactgtgaaactattatgaaatgctaagttgattataatgtgatttattgattaattgcatt 4569  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4568 acttgaaatattatcgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgctgccattgttattta 4470  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  4469 actaagttgcatga 4456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 602 - 473
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  602 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 509  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaact-aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  508 ttatgctgctattgttatttaactaaagttgcatga 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 419
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  633 ccttaggtagtaatgcgacctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgca 534  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||        ||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  533 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgtcgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgctattgttatt 435  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  434 taactaagttgcatga 419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42862 - 42653
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||    
T  42862 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaactgttaagctgattctaatgtgatttaatgattaaatgca 42763  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||||||||| |       ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42762 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgatattatgaagttaatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattta 42667  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  42666 actaagttgcatga 42653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1733 - 1520
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1733 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgca 1634  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||       ||    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1633 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataaagttgttgtgatctgattatgctgctattgttattt 1535  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  1534 aactaagttgcatga 1520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 1
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||    
T  156 ttaggtactaatgagacttattaaaaatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgcattt 57  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagct 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  56 acttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaagct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5823 - 5612
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||| || ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  5823 ttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgcatt 5725  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||       || ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5724 acttgagatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaa 5625  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  5624 ctaagttgcatga 5612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7018 - 6807
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||| || ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  7018 ttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgcatt 6920  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||       || ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6919 acttgagatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaa 6820  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  6819 ctaagttgcatga 6807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 6227 - 6399
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaat 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6227 ctgtgaagctattatgaaatgttaagttgtttatattgtgatttaattattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagaagttgttg-aaat 6325  T
Q  144 gaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||        ||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6326 gaattgatattatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 6399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 18532 - 18746
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||  | |||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  18532 ccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatggtatgttgattataatgtgatttaatgattaattcca 18631  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |        |||||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  18632 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaacgaattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatt 18730  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  18731 taactaagttgcatga 18746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23447 - 23240
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| |||||||||     
T  23447 aaccttagttactaatgagacctattcaagatattgactgagaactatgaagcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgt 23348  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||| |||||    
T  23347 atttacttgaattattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattaagctgcaattattattaaacta 23250  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
     ||| |||||    
T  23249 tgtttcatga 23240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Original strand, 901 - 1014
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||||  | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  901 gacctattaaagataaggattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 1000  T
Q  119 gaatgatcaggaag 132  Q
    ||||||||||||||    
T  1001 gaatgatcaggaag 1014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 209
Target Start/End: Original strand, 17056 - 17202
Alignment:
Q  71 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgtt 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||    
T  17056 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgttcaagatgttgttggaaatgaattgatattatgaagttatgctgtt 17155  T
Q  163 gatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17156 gatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatga 17202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 46604 - 46817
Alignment:
Q  4 cttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcat 102  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||   ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  46604 cttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcat 46703  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||        ||| ||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||| |    
T  46704 tacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaagttatgctattgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgt 46802  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  46803 aactaagttgcatga 46817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 6136 - 6339
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt- 103  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||| | |||| |||| ||||||||| |||     
T  6136 ttaggtgctaatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattgtattt 6235  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||| |||||| ||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  6236 acttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgtt 6333  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  6334 gcatga 6339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15324 - 15113
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||| | ||||||  ||||||  | |||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15324 ttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttataaaaagttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 15225  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt-------tgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |  ||       || | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15224 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgtgttgtgatctgattatgctgttattgttatttaa 15126  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  15125 ctaagttgcatga 15113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10130 - 9928
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | ||    
T  10130 ttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgccttt 10031  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10030 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 9933  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  9932 gcatg 9928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9751 - 9539
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||| || | ||||||| || || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||    
T  9751 ccttagggagtaatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 9653  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata-------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||       ||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  9652 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgagttatgctgttgatgtgatctgattatgttgttattgttattt 9554  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  9553 aactaagttgcatga 9539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2069 - 1856
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||| || | ||||||| || || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||    
T  2069 ccttagggagtaatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 1971  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  |||||||| |||||||||    
T  1970 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgttatt 1872  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  1871 taactaagttgcatga 1856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 1960 - 2175
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatg-aaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||| || || |||||| ||||| ||||| | |||    
T  1960 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatgtgaagctgttatgaaaatgctaagttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgc 2059  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||        ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2060 attacttgaaatttcattgaatgatcaagatgttgttg-aaatggattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttat 2158  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||    
T  2159 ttaactaagttgcatga 2175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 64080 - 63878
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt- 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| |||||||||| ||     
T  64080 ttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactatgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgccttt 63981  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  63980 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 63884  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  63883 tgcatg 63878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 75961 - 75762
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt-act 106  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||| |||||| || |||    
T  75961 ggtactaatgtgacatattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggatagattgcctttact 75862  T
Q  107 tgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgc 205  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  75861 tgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgaaaatgttatttaactaagttgc 75765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Original strand, 34786 - 34908
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    |||| |||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34786 ccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca 34885  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatga 124  Q
    ||||||||| | ||| |||||||    
T  34886 ttacttgaaatgttaatgaatga 34908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 34968 - 35010
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34968 tgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 35010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 70; Significance: 9e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Original strand, 21445 - 21597
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  21445 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgta 21544  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  21545 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Original strand, 80642 - 80706
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 141  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  80642 taatgtgatttaatgattaaatgcattgctcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 80706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Original strand, 80810 - 80855
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  80810 ttgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 80855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 1376 - 1580
Alignment:
Q  13 taatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 111  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| |||  || | |||||||||||||||     
T  1376 taatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgacttaacgaataattgcattacttgaaa 1475  T
Q  112 tattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | ||| |         ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1476 tattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttggttatttaactaagtt 1574  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  1575 gcatga 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 71544 - 71460
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  71544 aaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 71460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 71215 - 71092
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgatt 176  Q
    |||||||||||  ||||| | ||||||| || || |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||  |||||      |||||    
T  71215 taatgtgattttatgattaaatgcattattttaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgat------tgatt 71125  T
Q  177 atgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  71124 atgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 71092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 139937 - 139736
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt- 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| || ||||||| ||     
T  139937 ttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaaggctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggagtgattgccttt 139838  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||| ||||||||  | | |||||| ||| ||||||| ||||| ||| | |||||||  |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  139837 actcgaattattgattattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttgttaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 139741  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  139740 gcatg 139736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 413925 - 414140
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| ||| || || ||| ||||||  ||||||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||    
T  413925 aaccttaggtagtaaagaaacatatataagatgttaactggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatg 414024  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatatgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||  |||||| | ||| |         ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  414025 cattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaac-gaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgtta 414123  T
Q  192 tttaactaagttgcatg 208  Q
    |||||||||||||||||    
T  414124 tttaactaagttgcatg 414140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 207768 - 207931
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttg-ttgaaaatgaattgatat 153  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  207768 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatat 207867  T
Q  154 taag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || |        ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  207868 tatgaagttatactgttgatatgatatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 207931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18581 - 18379
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| | ||||||| || |||| |||||| |  ||| |||| || |||||| | ||    
T  18581 ttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgaattgttaagagattattaaatgaattatggactgattgccttt 18482  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| || ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18481 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgtttatgctgcaaatgttatttaactaagtt 18384  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  18383 gcatg 18379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 207
Target Start/End: Original strand, 9990 - 10131
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||   |||     || ||||    
T  9990 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttatactattga 10088  T
Q  165 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10089 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 10131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6855 - 6704
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  6855 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatagaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 6757  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  ||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756 aagct--tgatgagatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 6704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31059 - 30908
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  31059 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 30961  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||  |||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30960 aagc--ttgatgagatttgattatgctgtaattgttatttaactaagttgcatga 30908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44320 - 44107
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| || | || |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||    
T  44320 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 44222  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  44221 ttacttaaaatattattgaattatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatt 44123  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  44122 taactaagttgcatga 44107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9647 - 9445
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt- 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | | ||||| || |||| |||||| |  |||  |||  ||||||||| ||     
T  9647 ttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagttttcatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatgaattgattgccttt 9548  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  9547 acttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttatgatttaattatactgcaaatgttatttaactaagtt 9450  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  9449 gcatg 9445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3074 - 2933
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||   || |     |||||    
T  3074 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatt-aattgatattataaagttatattgttga 2976  T
Q  165 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2975 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 2933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 20395 - 20546
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||  ||| ||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||| ||||    
T  20395 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacacgaaatattattgaataatcaagatgttgatgaaa-tgaattgttatt 20493  T
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20494 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 20546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1136 - 923
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||| || |||  |||||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||    
T  1136 ccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgacctgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgca 1038  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  1037 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatt 939  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
     |||||||||||||||    
T  938 gaactaagttgcatga 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 19170 - 19317
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19170 ttaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcatt 19269  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata 152  Q
    ||||||  ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  19270 acttgagatattattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgata 19317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 73725 - 73857
Alignment:
Q  83 gatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatatgatctgat 175  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| | |        ||||| | |||||||||    
T  73725 gatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaa-tgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgat 73823  T
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73824 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 73857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 6292 - 6505
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||| || |||| |||||| | | || |||||||||||| ||||| | ||||    
T  6292 ccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatatgtgaagctgtt-tgaactgctaacttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 6390  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||| ||| | ||||||   ||||||||||||||||||    
T  6391 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctattgttgtgatcttcctatgctgctattgttatt 6489  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    |||||| |||||||||    
T  6490 taactatgttgcatga 6505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36532 - 36331
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | ||||  ||| ||||||||| ||||    
T  36532 ttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaaatatggattgattgccatt 36433  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||   |||| || || | |||||| ||| ||||| | ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  36432 acccaaattgttgttaattgatcaagaa-ttgttaagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaattaagtt 36336  T
Q  204 gcatg 208  Q
    |||||    
T  36335 gcatg 36331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8799 - 8586
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  8799 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 8700  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8699 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 8600  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  8599 actaagttgcatga 8586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 35397 - 35602
Alignment:
Q  13 taatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| |  |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||||||||| |    
T  35397 taatgtgacctatttgagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattattaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatt 35496  T
Q  112 tattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35497 tattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagtt 35596  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  35597 gcatga 35602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 11456 - 11584
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  11456 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 11549  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  11550 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 11584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 4103 - 4245
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| || ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  4103 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatatgtgaatctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 4202  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaa 146  Q
    |||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  4203 acttgatttattcttgaataaccttgaagttgttgaaaatgaa 4245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 4275 - 4317
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4275 tgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 14042 - 14170
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  14042 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 14135  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  14136 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 14170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 14353 - 14420
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  14353 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 14420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 19613 - 19823
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  | || |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  19613 ggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 19712  T
Q  107 tgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
     |  ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19713 gggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgctgcttttgttatttaact 19812  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  19813 aagttgcatga 19823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 15091 - 15301
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  | || |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  15091 ggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 15190  T
Q  107 tgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
     |  ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| | |||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  15191 gggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgatgcttttgttatttaact 15290  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  15291 aagttgcatga 15301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 5879 - 6082
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--attgcat 102  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||| ||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||  ||    |    
T  5879 ttaggtactaatgagacctaataatgatattgactgagaattgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattattaagtgaattatggattgaaatatact 5977  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5978 tacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagt 6075  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  6076 tgcatga 6082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 15293 - 15376
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 85  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15293 aacctttggtactaatgagacatattaaa-atgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgataagtgattataatgtgat 15376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 584 - 490
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  584 aaccttaggtactaatgaaacctattaaagatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 392
Alignment:
Q  162 tgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  439 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaattaagttgcatga 392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 6954 - 7061
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  6954 ccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgagatttaatgattaattgca 7053  T
Q  102 ttacttga 109  Q
    ||||||||    
T  7054 ttacttga 7061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Original strand, 192198 - 192340
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  192198 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagttgttatgaatttttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 192297  T
Q  107 tgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  192298 tgatttattcttgaattaccttgatgttgttgaaaatgaattg 192340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 77064 - 77253
Alignment:
Q  19 gacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattatta 116  Q
    |||||||| |||||||| | |  ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| ||     
T  77064 gacctattaaagataatgattatgaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttg 77162  T
Q  117 ttgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  77163 ttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 77253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7713 - 7497
Alignment:
Q  1 aaccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||||||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||| ||||||  || | | ||    
T  7713 aaccttaggtagtaatgaaacctatataagatgttaactggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgcgatttaacgaataaatg 7614  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||    
T  7613 cattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgctgctgctgtta 7515  T
Q  192 tttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7514 tttaactaagttgcatga 7497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3040 - 2960
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 124  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  3040 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 2960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6706 - 6626
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 124  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  6706 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 6626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2900 - 2858
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2900 tgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatga 2858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6566 - 6524
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6566 tgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatga 6524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 3985 - 3872
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3985 ccttgggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgc 3886  T
Q  101 attacttgaattat 114  Q
    ||||||||| ||||    
T  3885 attacttgagttat 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8416 - 8303
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8416 ccttgggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgc 8317  T
Q  101 attacttgaattat 114  Q
    ||||||||| ||||    
T  8316 attacttgagttat 8303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Original strand, 13985 - 14075
Alignment:
Q  35 taactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 124  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  13985 taactgaaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgaattacttgaaatgttaatgaatga 14075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 14135 - 14177
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14135 tgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 14177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Original strand, 16640 - 16745
Alignment:
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| |   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16640 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaa--gttgatatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 16737  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    | ||||||    
T  16738 tcgcatga 16745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 548 - 439
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    
T  548 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 455  T
Q  175 ttatgctgctattgtt 190  Q
    ||||||||| ||||||    
T  454 ttatgctgcaattgtt 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 315
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||| |           ||| | ||||||||    
T  517 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattaca-----------tgaataattgcatt 429  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaa----ttgatattaagct-----gttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    |||| || |||||||||||||||| || |||||||||| ||||    ||| ||| ||| |     |||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  428 actttaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaaattgttgttatgaagttatattgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttattt 330  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  329 aactaagttgcatga 315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 32636 - 32554
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 125  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  32636 ctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgaatgat 32554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8571 - 8523
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8571 ttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatga 8523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15715 - 15667
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15715 ttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatga 15667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 30634 - 30833
Alignment:
Q  16 tgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattat 114  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||| | || |||| | |||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  30634 tgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtaaagttgtt-tgaacttctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatat 30732  T
Q  115 tattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 207  Q
    ||||||||||| | || || |||| |||||||||| | ||| |        ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30733 tattgaatgataaagatgtagttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatccgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcat 30831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2005 - 1900
Alignment:
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  |||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2005 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgtgatttaactaag 1908  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  1907 ttgcatga 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 32615 - 32743
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| ||||||||  |||| ||||  |||    
T  32615 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgacatgaattga 32708  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  32709 ttatgctgtaattgttgttaaactaagttgcatga 32743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9406 - 9358
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9406 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 9358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15409 - 15363
Alignment:
Q  161 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 207  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15409 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcat 15363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Original strand, 4841 - 4895
Alignment:
Q  155 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4841 aagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatga 4895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 38528 - 38570
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528 tgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 38570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2029 - 1909
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||  ||| ||| |  ||||| ||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  2029 ttaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 1931  T
Q  104 acttgaattattattgaatgat 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  1930 acttgaaatattattgaatgat 1909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1857 - 1818
Alignment:
Q  170 tctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1857 tctgattatgctgcctttgttatttaactaagttgcatga 1818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Original strand, 15545 - 15669
Alignment:
Q  3 ccttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||   ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| ||||||  || ||||| |||||    
T  15545 ccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagataatgattaattgc 15644  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgat 125  Q
    |||||||||||||| | ||||||||    
T  15645 attacttgaattatgaatgaatgat 15669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 15737 - 15770
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15737 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 15770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 16406 - 16439
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16406 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 16439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11544 - 11472
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  11544 taatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 11472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2236 - 2194
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2236 tgatttgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 2194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6163 - 6121
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6163 tgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 6121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Original strand, 2314 - 2432
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||| | ||||  ||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | | ||||    
T  2314 ttaggtagtaatgaaacctatcttagatgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacatt 2413  T
Q  104 acttgaattattattgaat 122  Q
    |||||| ||||| ||||||    
T  2414 acttgatttattcttgaat 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 2485 - 2527
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2485 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatga 2527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Original strand, 10174 - 10292
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagataataactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||| | ||||  ||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | | ||||    
T  10174 ttaggtagtaatgaaacctatcttagatgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacatt 10273  T
Q  104 acttgaattattattgaat 122  Q
    |||||| ||||| ||||||    
T  10274 acttgatttattcttgaat 10292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 10345 - 10387
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  10345 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatga 10387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 7319 - 7361
Alignment:
Q  167 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7319 tgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 7361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 21861 - 21894
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21861 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 21894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 29753 - 29786
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29753 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 29786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33694 - 33639
Alignment:
Q  96 attgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata 152  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  33694 attgcattacttgagatattattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgata 33639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University