View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19921_high_14 (Length: 375)

Name: NF19921_high_14
Description: NF19921
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19921_high_14
NF19921_high_14
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (1-358)||(10593213-10593570)
chr5 (1-357)||(25078076-25078433)
chr5 (1-357)||(25136045-25136402)
chr5 (1-357)||(40380048-40380403)
chr5 (1-357)||(40382259-40382614)
chr5 (1-357)||(29720320-29720673)
chr5 (1-357)||(29722480-29722833)
chr5 (1-357)||(16544365-16544723)
chr5 (3-357)||(16546587-16546943)
chr5 (1-357)||(29751018-29751372)
chr5 (26-357)||(22536174-22536499)
chr5 (24-355)||(9789104-9789434)
chr5 (24-355)||(18441524-18441858)
chr5 (25-355)||(16409433-16409764)
chr5 (45-355)||(26177841-26178150)
chr5 (45-355)||(26170732-26171030)
chr5 (28-313)||(25412761-25413042)
chr5 (45-313)||(30182588-30182852)
chr5 (26-313)||(13343060-13343344)
chr5 (125-294)||(37439161-37439328)
chr5 (26-313)||(36073927-36074213)
chr5 (37-294)||(13239771-13240025)
chr5 (145-313)||(213465-213633)
chr5 (45-313)||(32636824-32637088)
chr5 (145-313)||(40147261-40147428)
chr5 (133-313)||(28278316-28278494)
chr5 (141-313)||(42428427-42428598)
chr5 (141-313)||(13488203-13488374)
chr5 (145-313)||(5058047-5058212)
chr5 (125-310)||(31182976-31183157)
chr5 (128-313)||(533769-533952)
chr5 (122-295)||(8565926-8566095)
chr5 (147-313)||(27637615-27637781)
chr5 (125-295)||(33831699-33831866)
chr5 (125-259)||(16452135-16452266)
chr5 (125-313)||(13695672-13695859)
chr5 (126-313)||(28750638-28750823)
chr5 (141-310)||(39468546-39468714)
chr5 (141-313)||(42426232-42426403)
chr5 (126-310)||(30682906-30683086)
chr5 (141-310)||(538028-538196)
chr5 (141-213)||(19806463-19806534)
chr5 (145-228)||(27015609-27015690)
chr5 (145-294)||(16640941-16641086)
chr5 (150-210)||(4160702-4160762)
chr5 (156-259)||(9049354-9049455)
chr5 (125-294)||(3075640-3075806)
chr5 (141-309)||(38747009-38747176)
chr5 (143-307)||(316769-316933)
chr5 (143-259)||(33906028-33906144)
chr5 (141-259)||(42309932-42310048)
chr5 (144-189)||(38882340-38882384)
chr5 (125-165)||(15464517-15464557)
chr5 (145-189)||(18596881-18596924)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (1-357)||(3617405-3617762)
chr3 (1-357)||(25637384-25637742)
chr3 (1-357)||(45282939-45283297)
chr3 (1-357)||(54635081-54635434)
chr3 (1-357)||(4598379-4598735)
chr3 (1-357)||(10211351-10211707)
chr3 (1-357)||(4600600-4600956)
chr3 (1-357)||(6716456-6716811)
chr3 (1-357)||(10209131-10209487)
chr3 (1-357)||(10056175-10056531)
chr3 (1-357)||(10058397-10058753)
chr3 (1-357)||(10060619-10060975)
chr3 (1-357)||(10062841-10063197)
chr3 (1-357)||(10065063-10065419)
chr3 (1-350)||(7779864-7780208)
chr3 (24-355)||(801049-801376)
chr3 (25-315)||(23200020-23200308)
chr3 (27-315)||(23197823-23198109)
chr3 (211-357)||(10067285-10067431)
chr3 (28-313)||(9636010-9636295)
chr3 (1-184)||(10067435-10067618)
chr3 (28-313)||(45095164-45095445)
chr3 (28-310)||(19683774-19684054)
chr3 (26-313)||(5258028-5258313)
chr3 (125-313)||(37408458-37408645)
chr3 (25-313)||(5260206-5260492)
chr3 (141-313)||(7762265-7762437)
chr3 (125-302)||(7764476-7764651)
chr3 (141-306)||(9581290-9581454)
chr3 (126-313)||(34491212-34491397)
chr3 (133-313)||(49199457-49199638)
chr3 (125-313)||(29196368-29196555)
chr3 (279-357)||(6718640-6718718)
chr3 (133-313)||(43401789-43401970)
chr3 (145-313)||(4569952-4570120)
chr3 (141-310)||(39153358-39153526)
chr3 (133-309)||(30236129-30236304)
chr3 (137-313)||(43403736-43403913)
chr3 (141-313)||(40734498-40734669)
chr3 (141-313)||(44331545-44331716)
chr3 (126-313)||(40735383-40735568)
chr3 (145-313)||(41819523-41819691)
chr3 (125-310)||(760850-761033)
chr3 (145-313)||(6095600-6095767)
chr3 (125-228)||(16499115-16499215)
chr3 (126-295)||(51398833-51398999)
chr3 (152-310)||(22835010-22835167)
chr3 (125-311)||(31314447-31314631)
chr3 (133-228)||(40913379-40913472)
chr3 (141-313)||(44700476-44700646)
chr3 (145-313)||(54593704-54593871)
chr3 (126-313)||(5236440-5236624)
chr3 (141-310)||(29682362-29682530)
chr3 (141-294)||(29813083-29813234)
chr3 (133-294)||(46173377-46173536)
chr3 (145-313)||(46860474-46860642)
chr3 (126-293)||(29810889-29811053)
chr3 (125-295)||(32744418-32744584)
chr3 (125-295)||(9666448-9666616)
chr3 (152-313)||(53921511-53921671)
chr3 (145-253)||(55301972-55302079)
chr3 (133-225)||(47304340-47304430)
chr3 (152-311)||(32891105-32891264)
chr3 (125-228)||(23391891-23391991)
chr3 (153-212)||(27305719-27305777)
chr3 (125-308)||(4055745-4055926)
chr3 (145-213)||(2075076-2075143)
chr3 (241-313)||(5433971-5434046)
chr3 (125-228)||(23410311-23410411)
chr3 (184-313)||(51352150-51352278)
chr3 (178-313)||(36018852-36018987)
[»] chr1 (66 HSPs)
chr1 (1-357)||(9036373-9036727)
chr1 (1-357)||(44203589-44203944)
chr1 (24-357)||(40282333-40282664)
chr1 (1-357)||(21053914-21054265)
chr1 (2-357)||(20622097-20622450)
chr1 (1-357)||(9987158-9987509)
chr1 (25-300)||(51765408-51765684)
chr1 (26-314)||(13316236-13316521)
chr1 (28-310)||(8550670-8550952)
chr1 (125-313)||(3189330-3189517)
chr1 (125-313)||(3198147-3198334)
chr1 (125-313)||(3206986-3207173)
chr1 (125-313)||(20762671-20762859)
chr1 (145-313)||(37168297-37168465)
chr1 (133-313)||(42297963-42298143)
chr1 (145-313)||(13547090-13547257)
chr1 (127-313)||(28220210-28220394)
chr1 (125-310)||(834149-834332)
chr1 (125-313)||(4552619-4552805)
chr1 (145-313)||(13549001-13549168)
chr1 (125-294)||(28265536-28265702)
chr1 (145-313)||(29136247-29136415)
chr1 (145-313)||(47255340-47255508)
chr1 (126-313)||(3156865-3157050)
chr1 (126-313)||(44455160-44455345)
chr1 (145-313)||(7482231-7482399)
chr1 (145-313)||(11348698-11348865)
chr1 (126-313)||(37503540-37503722)
chr1 (126-313)||(49918350-49918535)
chr1 (141-313)||(37033068-37033241)
chr1 (145-295)||(31925708-31925856)
chr1 (125-228)||(13659318-13659418)
chr1 (127-313)||(28223405-28223589)
chr1 (145-313)||(47115171-47115340)
chr1 (141-313)||(45644351-45644523)
chr1 (125-313)||(50169192-50169378)
chr1 (145-228)||(28242391-28242472)
chr1 (145-259)||(193666-193778)
chr1 (143-313)||(19754494-19754664)
chr1 (141-313)||(31659238-31659409)
chr1 (125-228)||(46065004-46065104)
chr1 (125-313)||(50167157-50167343)
chr1 (149-295)||(34603595-34603740)
chr1 (125-310)||(3847103-3847286)
chr1 (165-313)||(23555286-23555433)
chr1 (126-313)||(37559850-37560037)
chr1 (168-313)||(1833522-1833667)
chr1 (125-228)||(36683766-36683866)
chr1 (125-313)||(41360914-41361101)
chr1 (141-313)||(19752685-19752857)
chr1 (141-294)||(196904-197056)
chr1 (145-228)||(37876767-37876848)
chr1 (169-308)||(22079322-22079461)
chr1 (165-295)||(15820326-15820455)
chr1 (141-228)||(13137973-13138058)
chr1 (125-259)||(16455676-16455807)
chr1 (126-313)||(30476429-30476614)
chr1 (125-228)||(40122178-40122280)
chr1 (145-292)||(927977-928123)
chr1 (237-295)||(32736952-32737009)
chr1 (171-259)||(6808507-6808595)
chr1 (156-213)||(8871074-8871130)
chr1 (213-308)||(12318589-12318685)
chr1 (144-189)||(15916626-15916671)
chr1 (144-189)||(31422862-31422906)
chr1 (141-213)||(10925326-10925397)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (1-357)||(25421261-25421618)
chr6 (1-357)||(16554825-16555179)
chr6 (1-357)||(16631381-16631735)
chr6 (1-357)||(16653068-16653422)
chr6 (1-357)||(16578376-16578730)
chr6 (1-357)||(16616650-16617004)
chr6 (1-357)||(6027204-6027558)
chr6 (1-357)||(34167036-34167392)
chr6 (1-357)||(33341959-33342317)
chr6 (1-333)||(13153893-13154227)
chr6 (1-357)||(34164814-34165170)
chr6 (1-357)||(27647819-27648163)
chr6 (45-357)||(412057-412369)
chr6 (24-355)||(3072639-3072970)
chr6 (43-355)||(6097349-6097650)
chr6 (24-313)||(2171409-2171699)
chr6 (50-313)||(5406109-5406367)
chr6 (50-313)||(5410434-5410692)
chr6 (28-310)||(31404561-31404839)
chr6 (28-313)||(5413281-5413561)
chr6 (28-313)||(16452214-16452498)
chr6 (125-313)||(30834517-30834705)
chr6 (125-313)||(33160333-33160521)
chr6 (145-313)||(21588931-21589098)
chr6 (145-313)||(21593664-21593831)
chr6 (136-313)||(3808699-3808877)
chr6 (28-228)||(5408956-5409151)
chr6 (127-313)||(9183015-9183199)
chr6 (145-310)||(17758026-17758191)
chr6 (145-313)||(2972940-2973107)
chr6 (145-313)||(17762990-17763158)
chr6 (125-327)||(16569022-16569208)
chr6 (145-311)||(26830124-26830289)
chr6 (145-313)||(22424826-22424995)
chr6 (141-310)||(26954283-26954450)
chr6 (145-313)||(28137409-28137576)
chr6 (145-293)||(5043648-5043795)
chr6 (1-58)||(6136159-6136216)
chr6 (141-313)||(33211182-33211353)
chr6 (145-259)||(26800642-26800755)
chr6 (137-259)||(603081-603201)
chr6 (168-313)||(3038926-3039071)
chr6 (195-313)||(4045423-4045542)
chr6 (125-189)||(21356021-21356084)
chr6 (145-189)||(19643894-19643938)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (1-357)||(18392052-18392407)
chr7 (1-357)||(18388616-18388971)
chr7 (1-357)||(32060178-32060537)
chr7 (1-357)||(6594414-6594769)
chr7 (1-357)||(6592196-6592551)
chr7 (1-357)||(20343853-20344207)
chr7 (1-236)||(1560521-1560757)
chr7 (79-357)||(24789797-24790074)
chr7 (25-327)||(39731355-39731656)
chr7 (1-355)||(43504015-43504365)
chr7 (45-313)||(35853914-35854180)
chr7 (125-295)||(25766940-25767110)
chr7 (243-357)||(1562103-1562215)
chr7 (125-313)||(29991054-29991240)
chr7 (28-313)||(23555039-23555323)
chr7 (141-313)||(34310712-34310884)
chr7 (125-313)||(48408802-48408992)
chr7 (28-333)||(25615836-25616137)
chr7 (126-313)||(22269973-22270158)
chr7 (125-313)||(41317416-41317602)
chr7 (127-313)||(14069817-14070001)
chr7 (127-313)||(14379845-14380029)
chr7 (29-313)||(4178774-4179054)
chr7 (125-259)||(19502233-19502365)
chr7 (126-313)||(27347817-27348002)
chr7 (125-294)||(41648993-41649158)
chr7 (145-313)||(8359316-8359485)
chr7 (133-295)||(2390301-2390461)
chr7 (141-313)||(30024729-30024900)
chr7 (145-259)||(32358055-32358167)
chr7 (147-313)||(29608737-29608902)
chr7 (126-313)||(18126644-18126829)
chr7 (145-313)||(3258995-3259162)
chr7 (149-313)||(6431971-6432134)
chr7 (141-313)||(8153342-8153513)
chr7 (165-313)||(48491579-48491727)
chr7 (145-313)||(48599335-48599502)
chr7 (125-313)||(4253510-4253697)
chr7 (126-313)||(48489431-48489616)
chr7 (143-313)||(43864244-43864413)
chr7 (141-295)||(31732966-31733118)
chr7 (145-313)||(4508707-4508874)
chr7 (125-313)||(36146390-36146576)
chr7 (150-313)||(2360978-2361140)
chr7 (126-313)||(26417316-26417501)
chr7 (126-313)||(47673927-47674111)
chr7 (126-313)||(47676119-47676304)
chr7 (125-310)||(38671204-38671387)
chr7 (141-313)||(4586161-4586332)
chr7 (125-310)||(495965-496148)
chr7 (152-294)||(23565069-23565210)
chr7 (133-259)||(6359941-6360065)
chr7 (125-228)||(24525484-24525584)
chr7 (125-292)||(1113679-1113843)
chr7 (142-288)||(2759195-2759339)
chr7 (1-83)||(24790230-24790309)
chr7 (145-310)||(31105394-31105558)
chr7 (125-228)||(31518988-31519089)
chr7 (145-259)||(4510549-4510661)
chr7 (145-259)||(4512391-4512503)
chr7 (143-213)||(30814536-30814605)
chr7 (125-209)||(12097849-12097931)
chr7 (145-213)||(18396418-18396486)
chr7 (150-292)||(22328395-22328538)
chr7 (241-313)||(23343975-23344048)
chr7 (242-313)||(24525992-24526065)
chr7 (124-259)||(36574497-36574629)
chr7 (125-165)||(47263663-47263703)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (1-357)||(12647242-12647597)
chr2 (1-333)||(13655885-13656220)
chr2 (1-357)||(6266647-6266999)
chr2 (25-315)||(4484211-4484502)
chr2 (25-315)||(30833342-30833633)
chr2 (25-355)||(32289523-32289853)
chr2 (26-294)||(4503017-4503280)
chr2 (28-313)||(45099754-45100036)
chr2 (125-313)||(5723237-5723423)
chr2 (28-295)||(36987961-36988225)
chr2 (125-313)||(2334399-2334586)
chr2 (28-313)||(36205551-36205832)
chr2 (125-294)||(6594987-6595154)
chr2 (125-295)||(34139752-34139920)
chr2 (145-313)||(45726929-45727096)
chr2 (125-295)||(723726-723893)
chr2 (141-313)||(29867869-29868040)
chr2 (125-295)||(14633807-14633975)
chr2 (145-294)||(35446885-35447032)
chr2 (125-313)||(36773562-36773748)
chr2 (141-313)||(38312240-38312411)
chr2 (125-313)||(11151573-11151759)
chr2 (125-313)||(36317991-36318177)
chr2 (126-228)||(17057352-17057451)
chr2 (126-228)||(17085335-17085434)
chr2 (147-313)||(1631735-1631900)
chr2 (133-313)||(24398055-24398238)
chr2 (145-308)||(33648176-33648340)
chr2 (165-310)||(42362355-42362500)
chr2 (125-295)||(11067324-11067491)
chr2 (125-295)||(33162432-33162599)
chr2 (145-259)||(17490149-17490261)
chr2 (145-313)||(26353184-26353351)
chr2 (141-310)||(11690504-11690672)
chr2 (141-213)||(39284936-39285007)
chr2 (179-313)||(13121769-13121901)
chr2 (134-313)||(42288101-42288278)
chr2 (141-213)||(17450678-17450748)
chr2 (195-313)||(7815323-7815441)
chr2 (145-228)||(7451204-7451284)
chr2 (125-189)||(1345590-1345653)
chr2 (156-208)||(28672036-28672088)
chr2 (144-189)||(42064725-42064770)
chr2 (168-213)||(42412118-42412162)
chr2 (133-189)||(2838079-2838134)
chr2 (125-165)||(28259249-28259289)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (1-357)||(2460-2815)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1-357)||(3582-3937)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (1-357)||(7124857-7125214)
chr4 (1-357)||(8393352-8393707)
chr4 (1-357)||(8395561-8395916)
chr4 (1-357)||(7122638-7122995)
chr4 (1-357)||(5138246-5138603)
chr4 (1-356)||(5136022-5136378)
chr4 (24-355)||(31495188-31495527)
chr4 (125-327)||(13992274-13992475)
chr4 (145-313)||(29999806-29999974)
chr4 (125-313)||(56178618-56178805)
chr4 (125-313)||(52095344-52095530)
chr4 (133-309)||(2209717-2209894)
chr4 (125-313)||(48143042-48143230)
chr4 (28-299)||(5369968-5370237)
chr4 (126-313)||(9927441-9927626)
chr4 (148-313)||(41964415-41964580)
chr4 (125-313)||(47038393-47038577)
chr4 (133-313)||(26364236-26364415)
chr4 (126-313)||(12739533-12739718)
chr4 (126-294)||(12743908-12744073)
chr4 (126-294)||(12745297-12745462)
chr4 (145-313)||(46703500-46703669)
chr4 (133-313)||(54883020-54883199)
chr4 (126-313)||(26175619-26175804)
chr4 (126-313)||(34570397-34570582)
chr4 (125-311)||(46147373-46147557)
chr4 (145-295)||(6655975-6656123)
chr4 (145-313)||(12073392-12073560)
chr4 (141-313)||(36463386-36463557)
chr4 (145-313)||(40632445-40632612)
chr4 (145-313)||(41639426-41639593)
chr4 (125-313)||(45687164-45687351)
chr4 (125-259)||(48893620-48893751)
chr4 (133-259)||(50262689-50262814)
chr4 (145-259)||(50673848-50673960)
chr4 (133-293)||(12119559-12119719)
chr4 (143-313)||(36994524-36994693)
chr4 (145-295)||(379399-379548)
chr4 (145-306)||(5207843-5208003)
chr4 (125-294)||(6542161-6542328)
chr4 (145-313)||(8648139-8648306)
chr4 (165-313)||(8665408-8665556)
chr4 (145-313)||(37229722-37229890)
chr4 (143-313)||(37740625-37740794)
chr4 (141-313)||(5429679-5429850)
chr4 (141-313)||(27416962-27417133)
chr4 (126-313)||(54199890-54200074)
chr4 (128-313)||(5871820-5872003)
chr4 (125-295)||(52467336-52467503)
chr4 (145-259)||(4588014-4588126)
chr4 (125-259)||(31474206-31474337)
chr4 (153-259)||(35662496-35662600)
chr4 (125-313)||(52082645-52082825)
chr4 (185-294)||(12744087-12744195)
chr4 (150-287)||(26699447-26699585)
chr4 (126-228)||(29254580-29254679)
chr4 (183-313)||(12747794-12747924)
chr4 (141-238)||(13009441-13009535)
chr4 (185-295)||(12745476-12745585)
chr4 (141-228)||(3913534-3913618)
chr4 (169-259)||(33989899-33989989)
chr4 (145-313)||(51337064-51337231)
chr4 (125-191)||(24969787-24969851)
chr4 (195-313)||(24969112-24969230)
chr4 (133-189)||(5396720-5396775)
chr4 (171-223)||(33089970-33090021)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (1-357)||(6230-6587)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (1-357)||(25689911-25690265)
chr8 (1-357)||(3439460-3439811)
chr8 (1-357)||(15290480-15290836)
chr8 (1-357)||(15470849-15471205)
chr8 (1-357)||(42575181-42575536)
chr8 (25-355)||(2627693-2628024)
chr8 (26-313)||(31218256-31218541)
chr8 (28-313)||(34254217-34254498)
chr8 (28-313)||(17982652-17982935)
chr8 (28-313)||(34256393-34256674)
chr8 (45-313)||(42498193-42498459)
chr8 (28-313)||(44303853-44304137)
chr8 (26-313)||(19945243-19945529)
chr8 (125-294)||(1746200-1746366)
chr8 (126-313)||(15212786-15212971)
chr8 (145-313)||(42434992-42435159)
chr8 (126-313)||(43036423-43036608)
chr8 (145-313)||(4283524-4283691)
chr8 (141-313)||(33352150-33352321)
chr8 (141-311)||(40321082-40321251)
chr8 (125-313)||(3303652-3303838)
chr8 (125-240)||(4743196-4743308)
chr8 (145-313)||(18655400-18655567)
chr8 (141-313)||(27811278-27811449)
chr8 (141-295)||(12702631-12702783)
chr8 (125-259)||(1345353-1345484)
chr8 (141-259)||(5689326-5689442)
chr8 (133-228)||(10930188-10930281)
chr8 (141-313)||(40221745-40221916)
chr8 (126-313)||(4731658-4731843)
chr8 (141-310)||(6598975-6599143)
chr8 (141-310)||(6674428-6674596)
chr8 (126-307)||(30143346-30143525)
chr8 (125-313)||(30291606-30291794)
chr8 (171-310)||(40328782-40328922)
chr8 (141-259)||(41366612-41366727)
chr8 (151-313)||(18141821-18141981)
chr8 (142-313)||(9765745-9765914)
chr8 (145-295)||(11384004-11384152)
chr8 (125-313)||(1292446-1292631)
chr8 (125-313)||(19491680-19491867)
chr8 (126-228)||(4733792-4733891)
chr8 (145-313)||(8965692-8965859)
chr8 (125-259)||(10015136-10015265)
chr8 (183-310)||(44353796-44353923)
chr8 (145-295)||(4162516-4162663)
chr8 (150-259)||(18106087-18106191)
chr8 (156-228)||(8153844-8153914)
chr8 (145-228)||(3073875-3073955)
chr8 (152-213)||(7597715-7597776)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (25-315)||(11042-11333)
scaffold0491 (25-315)||(8616-8907)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (1-177)||(1-177)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (125-313)||(11557-11745)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (45-313)||(434532-434798)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (26-315)||(913-1200)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (141-313)||(114602-114774)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (145-294)||(18004-18151)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (125-228)||(149079-149179)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (145-313)||(7327-7494)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (126-313)||(20398-20583)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (145-257)||(10546-10656)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (156-213)||(27453-27510)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (125-165)||(8491-8531)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10593570 - 10593213
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593570 ggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 10593471  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593470 gataaacaaggagagggaagtagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctcc 10593371  T
Q  201 aatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10593370 aatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttctc 10593271  T
Q  301 ccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593270 ccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttct 10593213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25078433 - 25078076
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25078433 ggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 25078334  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078333 agata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 25078236  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078235 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 25078136  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078135 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 25078076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25136402 - 25136045
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25136402 ggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 25136303  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136302 agata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 25136205  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136204 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 25136105  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136104 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 25136045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40380403 - 40380048
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40380403 ggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 40380304  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  40380303 agataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactct 40380206  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380205 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 40380106  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40380105 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 40380048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40382614 - 40382259
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40382614 ggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 40382515  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  40382514 agataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactct 40382417  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40382416 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaacttctacccct 40382317  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40382316 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 40382259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29720673 - 29720320
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  29720673 ggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtacaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaa 29720575  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctcc 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29720574 gataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctcc 29720477  T
Q  201 aatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  29720476 aatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccctttt 29720378  T
Q  300 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29720377 cccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttc 29720320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29722833 - 29722480
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  29722833 ggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtacaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaa 29722735  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctcc 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722734 gataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctcc 29722637  T
Q  201 aatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  29722636 aatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccctttt 29722538  T
Q  300 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29722537 cccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttc 29722480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16544723 - 16544365
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcac 98  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||    
T  16544723 ggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacac 16544626  T
Q  99 aagataaacaa-ggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16544625 aagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtact 16544526  T
Q  197 ctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544525 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttatgagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 16544426  T
Q  295 cctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16544425 cctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 16544365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16546943 - 16546587
Alignment:
Q  3 taaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcacaa 100  Q
    |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||||    
T  16546943 taaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctaaatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaa 16546846  T
Q  101 gataaacaa-ggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16546845 gataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactct 16546746  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546745 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 16546646  T
Q  297 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16546645 tttcctaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 16546587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 29751018 - 29751372
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| ||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  29751018 ggtaaccaccaaacaatgtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatataatctagaaaacaagtgagaaacacagtacacaatcacaa 29751116  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 199  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751117 gataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 29751214  T
Q  200 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  29751215 caatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt 29751313  T
Q  299 tcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29751314 tcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttc 29751372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Original strand, 22536174 - 22536499
Alignment:
Q  26 tgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22536174 tgcaagcaacaatcaacaaaaaac-acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacacaatcacaagataaa--aggggagggaagaagaa 22536270  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22536271 aacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaa-gagttcttac 22536369  T
Q  226 aaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536370 aaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga 22536469  T
Q  326 ttctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  22536470 ttctctc--tgcagggtgtttcccatgttttc 22536499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 355
Target Start/End: Original strand, 9789104 - 9789434
Alignment:
Q  24 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaag 123  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    
T  9789104 tgtgcaagcaaaaatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaatacacaagcacaagataaac--ggagagggaagagg 9789201  T
Q  124 aaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 222  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9789202 aaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttct 9789300  T
Q  223 tacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 320  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9789301 tacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccttaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactc 9789399  T
Q  321 aatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 355  Q
    ||||||| || ||   |||||||||||||||||||    
T  9789400 aatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgttt 9789434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 355
Target Start/End: Original strand, 18441524 - 18441858
Alignment:
Q  24 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaa----cacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaa 119  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||    |||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18441524 tgtgcaagcaataatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaaaaaacacaatacacaagcacaagataaac--ggagagggaa 18441621  T
Q  120 gaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 218  Q
    || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18441622 gaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgag 18441720  T
Q  219 ttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 316  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18441721 ttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagac 18441819  T
Q  317 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 355  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||    
T  18441820 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgttt 18441858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16409764 - 16409433
Alignment:
Q  25 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 122  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||     
T  16409764 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--aggagagggaagag 16409667  T
Q  123 gaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 221  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16409666 gaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc 16409568  T
Q  222 ttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacact 319  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16409567 ttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacact 16409469  T
Q  320 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 355  Q
    |||||||| || ||   |||||||||| ||||||||    
T  16409468 caatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgttt 16409433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 45 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26178150 - 26177841
Alignment:
Q  45 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gag 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  26178150 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagag 26178053  T
Q  143 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag- 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  26178052 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaga 26177954  T
Q  242 gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaag 340  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||    
T  26177953 gttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaag 26177856  T
Q  341 gtgtttcccatgttt 355  Q
    |||||| ||||||||    
T  26177855 gtgtttaccatgttt 26177841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26171030 - 26170732
Alignment:
Q  45 aacaccacctagatctaatctaggaaacaag-tgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gag 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||  || || ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  26171030 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagag 26170933  T
Q  143 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |    
T  26170932 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaag----------ag 26170844  T
Q  243 ttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaagg 341  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||    
T  26170843 ttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaagg 26170746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25413042 - 25412761
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||| || |||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| | |  || |||||| ||||| || ||||||||  |||||||  ||||   |    
T  25413042 caagcaataatcaacaataacagcacctatatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagaga 25412947  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25412946 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 25412849  T
Q  226 aaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25412848 -aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 25412761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30182852 - 30182588
Alignment:
Q  45 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagaga 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||  |||||||  ||||   ||||||| ||||||| |||    
T  30182852 aacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaa--aggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-aga 30182758  T
Q  144 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-gg 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| || | ||    
T  30182757 ttgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatagaaaaggg 30182660  T
Q  243 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30182659 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 30182588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13343344 - 13343060
Alignment:
Q  26 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaag 123  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||| || || |||||  |||||||  ||||      
T  13343344 tgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaa--aggagag--aagaga 13343249  T
Q  124 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
     ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13343248 gaaacaaacacatcaa-agattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt 13343151  T
Q  224 acaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 313  Q
       |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  13343150 --caaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa 13343060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37439328 - 37439161
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37439328 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 37439231  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    | |||| ||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  37439230 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 313
Target Start/End: Original strand, 36073927 - 36074213
Alignment:
Q  26 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaag 123  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||| || || |||||  |||||||  ||||      
T  36073927 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaacataaa--aggagag--aagaga 36074022  T
Q  124 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36074023 gaaacaaacacaccaa-agattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt 36074120  T
Q  224 acaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc----ctttcccaatctcaccaa 313  Q
       |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  36074121 --caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaa 36074213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13240025 - 13239771
Alignment:
Q  37 aacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaata 133  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||  |||||||  ||||   ||||||| |    
T  13240025 aacaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagagaaacaaaca 13239930  T
Q  134 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggga 233  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  13239929 caccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaga 13239833  T
Q  234 tacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  13239832 tacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccctaatttctacc 13239771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213465
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 213536  T
Q  244 tacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  213535 tacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 32637088 - 32636824
Alignment:
Q  45 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaag-cacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 142  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||  |||| ||||  ||||| |||||||||||    | |||||||||   ||||||| ||||||| ||    
T  32637088 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaatcacaagcacaagataaa----gggagggaagagagaaacaaacacaccaa-ag 32636994  T
Q  143 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagag 241  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||  |    
T  32636993 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgg 32636897  T
Q  242 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32636896 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 32636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147261
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 40147332  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40147331 tacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28278494 - 28278316
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |    
T  28278494 acaccaaga-attgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagag 28278399  T
Q  233 atac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28278398 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Original strand, 42428427 - 42428598
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  42428427 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 42428523  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42428524 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 42428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13488374 - 13488203
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  13488374 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 13488278  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13488277 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 13488203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5058212 - 5058047
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  ||     
T  5058212 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatggga 5058116  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||||   |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5058115 tacaagaaaatagcttcaacaagctcac--agaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5058047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31183157 - 31182976
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31183157 aaacaaacacaccaa-agaatgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaa-tgagttctta 31183061  T
Q  225 caaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac 310  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||  |||| | |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31183060 caaa-gggatacaaatggttacaagaaattaacttaaacaaactcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttccaatctcac 31182976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 533952 - 533769
Alignment:
Q  128 caaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaa 227  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  533952 caaagacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttcttac-a 533857  T
Q  228 aagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  533856 aagagatacaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaag-accaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 533769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 295
Target Start/End: Original strand, 8565926 - 8566095
Alignment:
Q  122 agaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 221  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8565926 agaaaacaaacacaccaaga--ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc 8566021  T
Q  222 ttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||| | |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  8566022 ttac-agagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaagttctaccc 8566095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 313
Target Start/End: Original strand, 27637615 - 27637781
Alignment:
Q  147 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggtt 244  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||    
T  27637615 ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggtt 27637711  T
Q  245 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||  | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  27637712 acaagaaattagtttaaacaagctcataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 27637781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33831866 - 33831699
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33831866 aaacaaaaacaccaa-agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 33831770  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  33831769 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 33831699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16452266 - 16452135
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16452266 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactat-gaatgagttctta 16452170  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt 259  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  16452169 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 16452135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 13695672 - 13695859
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||| || |||||||||     
T  13695672 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacctagtttggtccaag-ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaa-tgagttcttt 13695768  T
Q  225 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
      |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13695769 acaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Original strand, 28750638 - 28750823
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28750638 aacaaacacaccaa-agattattgacccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 28750734  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||  ||||| ||  ||||||| ||||||| |||  |||| ||||  | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28750735 aaaa-agatacaaatgggttacaggaaattaacttcaacaatttcataaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 28750823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Original strand, 39468546 - 39468714
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  39468546 agattgttgacccagttcagtccaat-ttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 39468642  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39468643 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 39468714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Original strand, 42426232 - 42426403
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  42426232 agattgttgacctagttcagtccaa-cttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 42426328  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  42426329 gggttgcaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 42426403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 310
Target Start/End: Original strand, 30682906 - 30683086
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag--ttctt 223  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  30682906 aacaaacacaccaa-agattgttgacc-agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtattctt 30683001  T
Q  224 acaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
    || ||||  |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30683002 ac-aaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcac----aaagaaccctaatttctaccctttttcccaatctcac 30683086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 538196 - 538028
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  538196 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 538100  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  538099 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagagc-aaccttaatttctacccattttcccaatctcac 538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19806534 - 19806463
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19806534 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 19806463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27015690 - 27015609
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27015690 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatc-aatgagttcttacaaa 27015609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 294
Target Start/End: Original strand, 16640941 - 16641086
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    ||||||||| |||| ||||||| || ||    
T  16640941 tgtttacccagttcggcccta-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca----agttcttac-aaagagatacaaaagagt 16641034  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    ||  |||||| |||||  ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||    
T  16641035 tatcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctacc 16641086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  150 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 210  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 259
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049455
Alignment:
Q  156 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaatt 254  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  9049354 ttcggtccaa-cttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaatt 9049450  T
Q  255 agctt 259  Q
    |||||    
T  9049451 agctt 9049455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 294
Target Start/End: Original strand, 3075640 - 3075806
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  3075640 aaacaaacacaccaagaaat-gttcacccaatttggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatc-aacgaattctta 3075736  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    |||||  ||||| ||  |||||||||||||||| || | |||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  3075737 caaaa-agatacaaatgggttacaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 3075806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38747176 - 38747009
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| || | |||| ||||| ||     
T  38747176 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatc-aatgagtt-tttccaaagagatacaaat 38747080  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctca 309  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38747079 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 38747009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 316933 - 316769
Alignment:
Q  143 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg 242  Q
    |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  | |||| ||||| |||| |||||||||||   |||| ||||||| |||    
T  316933 attgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatc-aatgagttctttacaaagagatacaaaagg 316835  T
Q  243 -ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatct 307  Q
     |||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||    
T  316834 attacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaa-cctaatttctacctttttctcaatct 316769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 259
Target Start/End: Original strand, 33906028 - 33906144
Alignment:
Q  143 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg 242  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| | | ||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||   |||| ||||||| |||    
T  33906028 attgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatc-aatgagttctttacaaagagatacaaaagg 33906126  T
Q  243 -ttacaagaaattagctt 259  Q
     ||||||||| |||||||    
T  33906127 attacaagaagttagctt 33906144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 42309932 - 42310048
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    |||||||| | ||| ||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||  ||| | ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| |    
T  42309932 agattgtttatccaattcggtc-aaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatc-aataagttcttac-aaagagatacaaaa 42310028  T
Q  241 g-gttacaagaaattagctt 259  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  42310029 gagttacaagaaattagctt 42310048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38882384 - 38882340
Alignment:
Q  144 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38882384 ttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 38882340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 15464517 - 15464557
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaa 165  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15464517 aaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 15464557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18596924 - 18596881
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 189  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18596924 tgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 18596881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3617762 - 3617405
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3617762 ggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 3617663  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617662 agata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 3617565  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617564 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 3617465  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617464 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 3617405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25637742 - 25637384
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca--caatcac 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25637742 ggtaaccacctaacaaagtgtattgtgcaagcaggaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaaacaatcac 25637643  T
Q  99 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637642 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 25637543  T
Q  198 tccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637542 tccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 25637443  T
Q  297 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25637442 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 25637384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 45283297 - 45282939
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||    
T  45283297 ggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaactagtgagaaacacaatacacaatcacaa 45283199  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283198 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctcc 45283099  T
Q  201 aatccactatcaaatgagttcttac---aaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45283098 aatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccctt 45282999  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45282998 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttgcaaggtgtttcccatgttttc 45282939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54635434 - 54635081
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  54635434 ggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaa 54635336  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 199  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54635335 gataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctc 54635238  T
Q  200 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  54635237 caatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 54635139  T
Q  300 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635138 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 54635081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 4598379 - 4598735
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  4598379 ggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaataaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcaca 4598476  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4598477 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactct 4598576  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598577 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 4598676  T
Q  297 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  4598677 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacagggtgtttcccatgttttc 4598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10211707 - 10211351
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  10211707 ggtaaccaccaatcaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcaca 10211610  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10211609 agataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactct 10211510  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211509 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 10211410  T
Q  297 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10211409 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 10211351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 4600600 - 4600956
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||    
T  4600600 ggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagccagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca-aatcaacaatcacaa 4600698  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4600699 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctc 4600798  T
Q  200 caatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600799 caatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 4600898  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4600899 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 4600956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6716811 - 6716456
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaac-aaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcac 98  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  6716811 ggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaaccaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaactcaaaaatacaatcac 6716713  T
Q  99 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 197  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6716712 aagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactc 6716615  T
Q  198 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  6716614 tccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctt 6716516  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716515 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 6716456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10209487 - 10209131
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  10209487 ggtaaccaccaatcaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcaca 10209390  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10209389 agataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactct 10209290  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209289 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 10209190  T
Q  297 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10209189 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 10209131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10056531 - 10056175
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcac 98  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||    
T  10056531 ggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacac 10056435  T
Q  99 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10056434 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactc 10056335  T
Q  198 tccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056334 tccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 10056235  T
Q  296 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10056234 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 10056175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10058753 - 10058397
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcac 98  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||    
T  10058753 ggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacac 10058657  T
Q  99 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10058656 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactc 10058557  T
Q  198 tccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058556 tccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 10058457  T
Q  296 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10058456 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 10058397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10060975 - 10060619
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcac 98  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||    
T  10060975 ggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacac 10060879  T
Q  99 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10060878 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactc 10060779  T
Q  198 tccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060778 tccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 10060679  T
Q  296 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10060678 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 10060619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10063197 - 10062841
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcac 98  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||    
T  10063197 ggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacac 10063101  T
Q  99 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10063100 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactc 10063001  T
Q  198 tccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10063000 tccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 10062901  T
Q  296 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10062900 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 10062841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10065419 - 10065063
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcac 98  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||    
T  10065419 ggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacac 10065323  T
Q  99 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10065322 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactc 10065223  T
Q  198 tccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065222 tccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 10065123  T
Q  296 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10065122 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 10065063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 7779864 - 7780208
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaa-caccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaa-cacaaagcacaatcac 98  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| |||    
T  7779864 ggtaaccacc-aacaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaagtgaaaaaacacaatacacaagcac 7779959  T
Q  99 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7779960 aagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactct 7780057  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  7780058 ccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctaccctt 7780155  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 350  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  7780156 ttcccaatctcacgaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 24 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 801376 - 801049
Alignment:
Q  24 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacac--cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaat-cacaagataaacaaggagagggaag 120  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     |||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  801376 tgtgcaagcaataatcaacaaaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaagtg-gaaaaaca-----caatacacaagataaa--aggagagggaag 801285  T
Q  121 aagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  801284 aagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc-aatgagtt 801186  T
Q  221 cttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 317  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  801185 cttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagaca 801087  T
Q  318 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 355  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  801086 ctcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgttt 801049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 315
Target Start/End: Original strand, 23200020 - 23200308
Alignment:
Q  25 gtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag-tgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaag 123  Q
    |||||||||| || |||||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||    
T  23200020 gtgcaagcaataatcaacaataaaacacctagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaaccacaagcataagataaa--aggagagggaagaag 23200117  T
Q  124 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23200118 aaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttctt 23200215  T
Q  224 acaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaaga 315  Q
    ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23200216 acaaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaaga 23200308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 315
Target Start/End: Original strand, 23197823 - 23198109
Alignment:
Q  27 gcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag-tgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    |||||||| || |||||| | | ||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  23197823 gcaagcaataatcaacaataaaacacatagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaaccacaagcacaagataaa--aggagagagaagaggaa 23197920  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23197921 aacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttcttac 23198018  T
Q  226 aaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaaga 315  Q
    ||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23198019 aaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaaga 23198109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 211 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10067431 - 10067285
Alignment:
Q  211 caaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 308  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067431 caaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 10067332  T
Q  309 accaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10067331 accaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 10067285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 9636010 - 9636295
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||  ||| ||| | |||   |    
T  9636010 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaatcacaagcacaagataaa--agg-gagagcagagaga 9636106  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9636107 aacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac 9636205  T
Q  226 aaaagggatacaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||  ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  9636206 aaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa 9636295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10067618 - 10067435
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcac 98  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||    
T  10067618 ggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacac 10067522  T
Q  99 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067521 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45095445 - 45095164
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||   |||   |    
T  45095445 caagcaataatcaacaataacagcacatagatctaatctatgaatcaaagagtaaaacacaaaccacaagcaaaagataaa--aggagagaatagag--a 45095350  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45095349 aacaaatacgccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 45095252  T
Q  226 aaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45095251 -aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 45095164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 310
Target Start/End: Original strand, 19683774 - 19684054
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaa-acaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 124  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||| | |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  19683774 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagag 19683869  T
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19683870 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 19683967  T
Q  225 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19683968 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 19684054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 313
Target Start/End: Original strand, 5258028 - 5258313
Alignment:
Q  26 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaag 123  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||| || || |||||  |||||||  ||||      
T  5258028 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaa--aggagag--aagaga 5258123  T
Q  124 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5258124 gaaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt 5258221  T
Q  224 acaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  5258222 -ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa 5258313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37408645 - 37408458
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37408645 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 37408548  T
Q  225 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37408547 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 37408458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 313
Target Start/End: Original strand, 5260206 - 5260492
Alignment:
Q  25 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 122  Q
    |||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  || |||||| ||||| || || |||||  |||||||  ||||     
T  5260206 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaa--aggagag--aagag 5260301  T
Q  123 gaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 222  Q
      ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5260302 agaaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttct 5260399  T
Q  223 tacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  5260400 t-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa 5260492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7762437 - 7762265
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  7762437 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaa 7762340  T
Q  241 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  7762339 gagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 7762265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7764651 - 7764476
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7764651 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatc-aatgagttctta 7764554  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttccc 302  Q
    | |||| ||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7764553 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttccc 7764476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9581454 - 9581290
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||     
T  9581454 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaat 9581357  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatc 306  Q
     ||||| |||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9581356 gggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttccgaatc 9581290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34491397 - 34491212
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34491397 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 34491301  T
Q  226 aaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| |||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34491300 -aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 49199457 - 49199638
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  49199457 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 49199554  T
Q  233 atacaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  49199555 atacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 29196368 - 29196555
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29196368 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 29196464  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29196465 c-aaagagatacaaatgggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 279 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718640
Alignment:
Q  279 aaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 6718640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 43401789 - 43401970
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  43401789 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 43401886  T
Q  233 atacaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||| || |   ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43401887 ataaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4570120 - 4569952
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||    
T  4570120 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 4570023  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4570022 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Original strand, 39153358 - 39153526
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||      
T  39153358 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttctta-taaagggatacaaat 39153454  T
Q  241 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39153455 gagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 39153526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30236304 - 30236129
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  30236304 acaccaagaaattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 30236208  T
Q  233 atac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctca 309  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30236207 atacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 30236129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Original strand, 43403736 - 43403913
Alignment:
Q  137 caagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||     
T  43403736 caagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagataa 43403833  T
Q  237 aaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    || |   |||||||||||| |||||  ||||| |||| | |||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43403834 aacatgagttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaac-aagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43403913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40734669 - 40734498
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||      
T  40734669 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaat 40734573  T
Q  241 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | ||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40734572 gtgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40734498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44331716 - 44331545
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||      
T  44331716 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttcttac-aaagagatacaaat 44331620  T
Q  241 gg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  44331619 ggcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 44331545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40735568 - 40735383
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40735568 aacaaatacaccaa-agattgctgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 40735472  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  40735471 -aaagagatacaaactggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 40735383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 41819523 - 41819691
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--gg 242  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |  ||    
T  41819523 tgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaatggg 41819619  T
Q  243 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41819620 ttacaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 761033 - 760850
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  761033 aaacaaacacaccaa-agattgttaacccatttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 760937  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
    | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  760936 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaga-cctaatttctacccattttcccaatctcac 760850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 6095600 - 6095767
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  6095600 tgttcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 6095696  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||| |||  | ||||| || | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  6095697 tacaagaaattaacttcaagaagtttacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 6095767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16499215 - 16499115
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16499215 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16499119  T
Q  225 caaa 228  Q
    ||||    
T  16499118 caaa 16499115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51398999 - 51398833
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51398999 aacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 51398903  T
Q  226 aaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
     |||| |||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  51398902 -aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaac-aaccctaatttctaccc 51398833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835167
Alignment:
Q  152 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaaga 250  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaaga 22835106  T
Q  251 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22835107 aattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 22835167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31314631 - 31314447
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31314631 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 31314535  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 311  Q
    |||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  31314534 caaaa-agatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacc 31314447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40913472 - 40913379
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40913472 acaccaagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttcttacaaa 40913379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Original strand, 44700476 - 44700646
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||     
T  44700476 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaat 44700571  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44700572 aggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44700646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54593871 - 54593704
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  54593871 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 54593775  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  54593774 tacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaa 54593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Original strand, 5236440 - 5236624
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  5236440 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagtttggtccaaa-ttgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaa-tgagttcttac 5236535  T
Q  226 aaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||| | |||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5236536 aaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5236624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29682530 - 29682362
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||     
T  29682530 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaat 29682434  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
     ||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29682433 gggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctcac 29682362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29813234 - 29813083
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||     
T  29813234 agattgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttac-aaagagatgcaaat 29813138  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  29813137 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 29813083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 46173536 - 46173377
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    ||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |    
T  46173536 acaccaagaaattgttgatctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgaattcttac-aaagag 46173440  T
Q  233 atac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  46173439 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 46173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 46860642 - 46860474
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||  |||    
T  46860642 tgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattac-aaagagatacaaatgggt 46860545  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  46860544 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 46860474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29811053 - 29810889
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29811053 aacaaacacaccaa-agattgttgacccaattcggtttaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 29810957  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 293  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  29810956 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aactctaatttctac 29810889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Original strand, 32744418 - 32744584
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32744418 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaa-gagttctta 32744514  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    | |||| |||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||||    
T  32744515 c-aaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa--ctaatttctaccc 32744584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Original strand, 9666448 - 9666616
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9666448 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtcc-aactttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaa-gaattctta 9666544  T
Q  225 caaa-agggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||||    
T  9666545 caaagaggtataaatga-gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctaccc 9666616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921671
Alignment:
Q  152 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaaga 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  | |||||||||    
T  53921511 ccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-tgatacaaatgagttacaaga 53921607  T
Q  251 aattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||| || ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  53921608 aattagctttaacaagctcacaaacaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 53921671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 253
Target Start/End: Original strand, 55301972 - 55302079
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| || ||||    
T  55301972 tgttcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgaattcttac-aaagagatacaaataggt 55302069  T
Q  244 tacaagaaat 253  Q
    ||||||||||    
T  55302070 tacaagaaat 55302079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47304430 - 47304340
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47304430 acaccaataaattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 47304340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32891105
Alignment:
Q  152 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaaga 250  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||  | |||||||||    
T  32891264 ccagttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaaga 32891168  T
Q  251 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 311  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  32891167 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcacc 32891105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 23391891 - 23391991
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  23391891 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaa-gagttcttg 23391987  T
Q  225 caaa 228  Q
    ||||    
T  23391988 caaa 23391991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  153 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatca 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 308
Target Start/End: Original strand, 4055745 - 4055926
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac-tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt-ct 222  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||| |||||||  |  |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  4055745 aaacaaatacaccaagatttggtt-acccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagaga--gatctcttcaatccactatcaa-tgagtttct 4055840  T
Q  223 tacaaaagggatacaa--gaggttacaagaaattagcttg-acaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 308  Q
    |||||| | |||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||| | | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4055841 tacaaa-gagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaacaa--cctaatttctacccatttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Original strand, 2075076 - 2075143
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 213  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2075076 tgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaa 2075143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 313
Target Start/End: Original strand, 5433971 - 5434046
Alignment:
Q  241 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  5433971 ggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaa 5434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 23410311 - 23410411
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||||||||||| |||| || |||||||||    
T  23410311 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccaattcgttccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaa-gagttctta 23410407  T
Q  225 caaa 228  Q
    ||||    
T  23410408 caaa 23410411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 313
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352278
Alignment:
Q  184 gagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaacc 282  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| ||| | || | |||| |||||||||||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaa-tgagttattacaaa-gaaatacaaatggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaacc 51352247  T
Q  283 ctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||| ||||| |  ||||| |||||||||||    
T  51352248 ctaacttctatcattttcctaatctcaccaa 51352278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36018987 - 36018852
Alignment:
Q  178 ctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatg 274  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |   |||||||||||||| |||  ||||| |||| | |    
T  36018987 ctgggggagagattgacctctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaag 36018891  T
Q  275 aacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  36018890 aac-aaccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaa 36018852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 66)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9036727 - 9036373
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036727 ggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 9036629  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9036628 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttc 9036529  T
Q  201 aatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttc 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9036528 aatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttc 9036430  T
Q  301 ccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036429 ccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 9036373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44203944 - 44203589
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44203944 ggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 44203845  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203844 agata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 44203747  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203746 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 44203647  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44203646 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 44203589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40282664 - 40282333
Alignment:
Q  24 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaag 123  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40282664 tgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaag 40282567  T
Q  124 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40282566 aaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt 40282468  T
Q  224 acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaa 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40282467 acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaa 40282368  T
Q  323 tgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40282367 tgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttc 40282333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21054265 - 21053914
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  21054265 ggtaaccaccaaactaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaa 21054169  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctcc 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21054168 gataaa--aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctcc 21054071  T
Q  201 aatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  21054070 aatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacactttt 21053972  T
Q  300 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21053971 cccaatctcaccaagacactcaatgattttttctctacaaggtgtttcccatgttttc 21053914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 357
Target Start/End: Original strand, 20622097 - 20622450
Alignment:
Q  2 gtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaag 101  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  20622097 gtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaag 20622195  T
Q  102 ataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctcca 201  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622196 ataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctcca 20622293  T
Q  202 atccactatcaaatgagttcttac--aaaagggatacaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20622294 atccactatcaaa-gagttcttacaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttt 20622391  T
Q  299 tcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  20622392 tcccaatctcaccaagacagtcaatgattttccctctacaaggtgtttcccatgttttc 20622450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9987509 - 9987158
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| | ||||||||   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  9987509 ggtaaccaccaatcaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacactatacacaatcacaa 9987413  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 199  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987412 gataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 9987315  T
Q  200 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9987314 caatccactatc-aatgagttcttgcaaaagggatacaaaaggttgcaagaaattagattagacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttt 9987217  T
Q  299 tcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9987216 tcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttc 9987158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51765684 - 51765408
Alignment:
Q  25 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 122  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||     
T  51765684 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaagag 51765587  T
Q  123 gaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 222  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51765586 gaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttct 51765489  T
Q  223 tacaaaagggatac--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttc 300  Q
    |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    ||||||||||||||||| ||||    
T  51765488 tacaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 51765408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 314
Target Start/End: Original strand, 13316236 - 13316521
Alignment:
Q  26 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaag 123  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||| || || |||||  |||||||  ||||      
T  13316236 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaa--aggagag--aagaga 13316331  T
Q  124 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
     |||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13316332 gaaacaaactcactaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt 13316429  T
Q  224 acaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaag 314  Q
     | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13316430 -ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 310
Target Start/End: Original strand, 8550670 - 8550952
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaag-cacaatcacaagataaacaaggagagggaaga-ag 123  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||  ||||| ||||||||||| |  |||| | |||| ||    
T  8550670 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaaga--gagaag-aagagag 8550766  T
Q  124 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8550767 aaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 8550864  T
Q  224 acaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
    || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8550865 ac-aaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 8550952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3189517 - 3189330
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3189517 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3189420  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||  ||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3189419 caaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3189330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3198334 - 3198147
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3198334 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3198237  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||  ||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3198236 caaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3198147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3207173 - 3206986
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3207173 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3207076  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||  ||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3207075 caaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3206986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20762859 - 20762671
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20762859 aaacaaacacaccaa-agattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 20762762  T
Q  225 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |  ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||    
T  20762761 c-gaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaa 20762671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168297
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--gg 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |  ||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatggg 37168369  T
Q  243 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37168368 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 42297963 - 42298143
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  42297963 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 42298060  T
Q  233 atacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  42298061 atacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 42298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547257
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 13547186  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13547187 tacaagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 313
Target Start/End: Original strand, 28220210 - 28220394
Alignment:
Q  127 acaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 226  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28220210 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 28220305  T
Q  227 aaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28220306 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaa 28220394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 310
Target Start/End: Original strand, 834149 - 834332
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  834149 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttctta 834245  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcac 310  Q
    | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  834246 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcac 834332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 4552619 - 4552805
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4552619 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttctta 4552715  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  4552716 c-aaagggatacaaaggggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 4552805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549168
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 13549097  T
Q  244 tacaagaaatta-gcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||| ||||||| | || ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13549098 tacatgaaattaggtttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13549168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 294
Target Start/End: Original strand, 28265536 - 28265702
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28265536 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 28265632  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28265633 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 28265702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29136415 - 29136247
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||| ||  |||    
T  29136415 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggt 29136318  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29136317 tccaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 47255340 - 47255508
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 47255437  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  47255438 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3157050 - 3156865
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3157050 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 3156954  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  3156953 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 3156865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44455345 - 44455160
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44455345 aacaaacacaccaa-agatcgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 44455249  T
Q  226 aaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||  |||||||  | ||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44455248 aaaa-agatacaaatgagttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44455160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 7482231 - 7482399
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--gg 242  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |  ||    
T  7482231 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatggg 7482327  T
Q  243 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7482328 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11348865 - 11348698
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||  |||    
T  11348865 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta-gaaagagatacaaatgggt 11348769  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11348768 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 11348698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Original strand, 37503540 - 37503722
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37503540 aacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcgatccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 37503636  T
Q  226 aaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  37503637 -aaagagataca--aggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 37503722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 49918535 - 49918350
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49918535 aacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 49918439  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  49918438 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 49918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033241
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatgcaaaa 37033165  T
Q  241 --ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
      | |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37033166 tggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Original strand, 31925708 - 31925856
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  31925708 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 31925804  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  31925805 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-atccctaatttctaccc 31925856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 13659318 - 13659418
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13659318 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 13659414  T
Q  225 caaa 228  Q
    ||||    
T  13659415 caaa 13659418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 313
Target Start/End: Original strand, 28223405 - 28223589
Alignment:
Q  127 acaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 226  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28223405 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 28223500  T
Q  227 aaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||  | || | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28223501 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatc-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28223589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 47115340 - 47115171
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--gg 242  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||| |  ||    
T  47115340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtttttac-aaagagatacaaaatggg 47115243  T
Q  243 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  47115242 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Original strand, 45644351 - 45644523
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||      
T  45644351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 45644447  T
Q  241 g-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  45644448 gagttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaa 45644523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 50169192 - 50169378
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  50169192 aaacaaacacaccaa-agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagtactta 50169288  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| |||||||  | |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  50169289 c-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 50169378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28242472 - 28242391
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28242472 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaa 28242391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 193778 - 193666
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||  | ||    
T  193778 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattac-aaagagatacaaatgagt 193682  T
Q  244 tacaagaaattagctt 259  Q
    ||||||||||||||||    
T  193681 tacaagaaattagctt 193666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19754664 - 19754494
Alignment:
Q  143 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagag 241  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |    
T  19754664 attgttgacccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatcg 19754568  T
Q  242 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||    
T  19754567 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaa 19754494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31659409 - 31659238
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||     
T  31659409 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttcttac-aaagagatacaaat 31659313  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  31659312 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-agccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 31659238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46065104 - 46065004
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46065104 aaacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttctta 46065008  T
Q  225 caaa 228  Q
    ||||    
T  46065007 caaa 46065004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 50167157 - 50167343
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  50167157 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttttta 50167253  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  50167254 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataac-aaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaa 50167343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 149 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603595
Alignment:
Q  149 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggttac 246  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| || |  ||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaa-tgagttcttacaaa-gagataaaaaatgggttac 34603644  T
Q  247 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  34603643 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 34603595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 310
Target Start/End: Original strand, 3847103 - 3847286
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3847103 aaacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3847199  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
    | |||||||||| ||  |||||||| || |||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3847200 c-aaagggatacaaatgggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 3847286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555433
Alignment:
Q  165 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gac 262  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||| |||||||||| ||  ||    
T  23555286 aacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaac 23555382  T
Q  263 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  23555383 aagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 23555433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Original strand, 37559850 - 37560037
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-ggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  37559850 aacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaac-gagttctta 37559946  T
Q  225 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagctt--gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||||||||||   |||||||||| | |||| ||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  37559947 caaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 37560037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1833667 - 1833522
Alignment:
Q  168 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagcttgacaag- 265  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||| ||||||| |  ||     
T  1833667 ttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaataga 1833570  T
Q  266 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1833569 ttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 1833522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36683866 - 36683766
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36683866 aaacaaacacaccaagagat-gtttactcagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatc-aatgagttctta 36683770  T
Q  225 caaa 228  Q
    ||||    
T  36683769 caaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41361101 - 41360914
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||||  ||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  41361101 aaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtcc-aatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatc-aacgagttctta 41361004  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41361003 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41360914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19752857 - 19752685
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  19752857 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 19752761  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt--cccaatctcaccaa 313  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| || | | |||| ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||    
T  19752760 cggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaac-aaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaa 19752685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Original strand, 196904 - 197056
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaag 239  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  196904 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaa 197000  T
Q  240 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
     | |||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  197001 tgagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 197056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 37876767 - 37876848
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 228  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37876767 tgttcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttattacaaa 37876848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  169 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 266  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||   |||| ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||     
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatc-aatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagc 22079363  T
Q  267 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 308  Q
    |||| | ||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||    
T  22079362 tcacaaagaacaaa-cataatttctaccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15820455 - 15820326
Alignment:
Q  165 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gac 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||  ||    
T  15820455 aacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatc-aatgagttctta-aaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaac 15820358  T
Q  263 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    ||| |||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  15820357 aagctcacaaagaacaaa-cctaatttttaccc 15820326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 228
Target Start/End: Original strand, 13137973 - 13138058
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13137973 agattgttgacccagttcggtccaatat-gacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatc-aatgtgttcttacaaa 13138058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16455807 - 16455676
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||  |||||| ||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16455807 aaacaaatacaccaagaaat-gtttacacagtttggtccaat-ttgaccgactatgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16455711  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt 259  Q
    | | || ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  16455710 c-acagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 16455676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Original strand, 30476429 - 30476614
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  | ||| | ||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30476429 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtcc-aacttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaatccagtatc-aatgagttcttac 30476525  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||| |||||| |||  |||||||||  | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30476526 -aaagagatacaaatgggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 30476614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 40122178 - 40122280
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac--tatcaaatgagttct 222  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  40122178 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaa-gagttct 40122274  T
Q  223 tacaaa 228  Q
    ||||||    
T  40122275 tacaaa 40122280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Original strand, 927977 - 928123
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg-t 243  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | |||| |||  ||||| |||||||||| || |||||| ||||||| | ||| ||| ||| |    
T  927977 tgtttacccagttcggtctaa-cttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaa-tgagtttttacaaa-gagatccaaaagggt 928073  T
Q  244 tacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttcta 292  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  928074 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 928123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32737009 - 32736952
Alignment:
Q  237 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  32737009 aagaggttacaaaaaattagcttaa-aagttcataaagaacaaaccctaatttctaccc 32736952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6808595 - 6808507
Alignment:
Q  171 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 259  Q
    ||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||| || |||||||||| |||||||    
T  6808595 acctactctgaggaagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagctt 6808507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 213
Target Start/End: Original strand, 8871074 - 8871130
Alignment:
Q  156 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 213  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8871074 ttcggtccaa-cttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 308
Target Start/End: Original strand, 12318589 - 12318685
Alignment:
Q  213 aatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 308  Q
    |||||||||||| | |||  |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12318589 aatgagttcttaaagaagacatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaa-cctaatttctacccatttccaaatctc 12318685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15916671 - 15916626
Alignment:
Q  144 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15916671 ttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagaga 15916626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 189
Target Start/End: Original strand, 31422862 - 31422906
Alignment:
Q  144 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 189  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31422862 ttgttcacccagctcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 31422906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10925397 - 10925326
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 213  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10925397 agattgttgacccagttcgatccaa-ctttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaa 10925326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25421618 - 25421261
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25421618 ggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 25421519  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421518 agataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 25421421  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421420 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 25421321  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421320 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 25421261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16555179 - 16554825
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555179 ggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 16555083  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  16555082 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctc 16554983  T
Q  200 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16554982 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 16554883  T
Q  300 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554882 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 16554825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16631735 - 16631381
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631735 ggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 16631639  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  16631638 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctc 16631539  T
Q  200 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16631538 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 16631439  T
Q  300 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631438 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 16631381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16653422 - 16653068
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653422 ggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 16653326  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16653325 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctc 16653226  T
Q  200 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16653225 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttaccctttt 16653126  T
Q  300 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653125 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 16653068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 16578376 - 16578730
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578376 ggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 16578472  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16578473 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctc 16578572  T
Q  200 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16578573 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctaccctttt 16578672  T
Q  300 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16578673 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcccatgttttc 16578730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16617004 - 16616650
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16617004 ggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 16616908  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16616907 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctc 16616808  T
Q  200 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16616807 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctaccctttt 16616708  T
Q  300 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16616707 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcccatgttttc 16616650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6027558 - 6027204
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcaca 99  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6027558 ggtaaccacctaacaaggtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 6027459  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6027458 agataaa-atg--gagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactct 6027362  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027361 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 6027262  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6027261 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 6027204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34167392 - 34167036
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| ||||||   ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34167392 ggtaaccaccaaacaaaaaatattgagcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatcaaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 34167293  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34167292 agata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactct 34167195  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34167194 ccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 34167095  T
Q  297 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34167094 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 34167036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 33341959 - 33342317
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcac 98  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||   || |||    
T  33341959 ggtaaccaccaaacaaagcttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaaca--aagcaactaaacac 33342056  T
Q  99 aagataaacaa-ggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33342057 aagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtact 33342156  T
Q  197 ctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342157 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagtacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 33342256  T
Q  295 cctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33342257 cctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 33342317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13154227 - 13153893
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13154227 ggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 13154128  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13154127 agata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactct 13154030  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154029 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 13153930  T
Q  297 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153929 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 13153893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34165170 - 34164814
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcac 98  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||    
T  34165170 ggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacac 34165074  T
Q  99 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34165073 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactc 34164974  T
Q  198 tccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164973 tccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 34164874  T
Q  296 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34164873 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 34164814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27648163 - 27647819
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||          
T  27648163 ggtaaccaccgaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaatacacaa------ 27648071  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctcc 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27648070 gataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctcc 27647973  T
Q  201 aatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttc 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27647972 aatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttc 27647874  T
Q  301 ccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  27647873 ccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacatggtgtttcccatgttttc 27647819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 45 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 412369 - 412057
Alignment:
Q  45 aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gaga 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  412369 aacagcacctagatctaatctaggtaacaagtgaaaaacacaatacacaagcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagaga 412272  T
Q  144 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--g 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |       
T  412271 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaaga 412173  T
Q  242 gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaag 340  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  412172 gttacaagaaattagatttgataagttcacaatgaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaag 412074  T
Q  341 gtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||    
T  412073 gtgtttcccatgttttc 412057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 355
Target Start/End: Original strand, 3072639 - 3072970
Alignment:
Q  24 tgtgcaagcaagaaacaacaaaac-accacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||  || || ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||     
T  3072639 tgtgcaagcaataatcaacaaaaatagcacatagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--aggagagggaagag 3072736  T
Q  123 gaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3072737 gaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttct 3072835  T
Q  223 tacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacact 319  Q
    |||||||| ||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3072836 tacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaagacact 3072934  T
Q  320 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 355  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  3072935 caatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgttt 3072970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Original strand, 6097349 - 6097650
Alignment:
Q  43 aaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaa-cacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-g 140  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  6097349 aaaacagcaccttgatctaatctaggtaacaagtggaaaaacacaatacacaatcacaagata--caaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 6097446  T
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||              
T  6097447 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaag---------- 6097535  T
Q  241 ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 339  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||   |||    
T  6097536 agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctaccatttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcactcaccaa 6097634  T
Q  340 ggtgtttcccatgttt 355  Q
    ||||||| ||||||||    
T  6097635 ggtgtttaccatgttt 6097650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Original strand, 2171409 - 2171699
Alignment:
Q  24 tgtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaa---cacaaagcacaatcacaagataaacaaggagaggga 118  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||   || ||| ||||| |||||||||||  ||| ||| ||    
T  2171409 tgtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaacataaaacacaagcacaagataaa--agg-gagaga 2171505  T
Q  119 agaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 218  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2171506 agagataaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgag 2171604  T
Q  219 ttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  2171605 ttcttac-aaagagatacaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 2171699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 313
Target Start/End: Original strand, 5406109 - 5406367
Alignment:
Q  50 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |  || |||||| ||||| || ||||||||  |||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||||||||    
T  5406109 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaaacaaaagataaa--aggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgtt 5406203  T
Q  149 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttaca 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||    
T  5406204 cacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttaca 5406301  T
Q  248 agaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5406302 agaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 5406367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 313
Target Start/End: Original strand, 5410434 - 5410692
Alignment:
Q  50 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |  || |||||| ||||| || ||||||||  |||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||||||||    
T  5410434 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaaacaaaagataaa--aggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgtt 5410528  T
Q  149 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttaca 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||    
T  5410529 cacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttaca 5410626  T
Q  248 agaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5410627 agaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 5410692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 310
Target Start/End: Original strand, 31404561 - 31404839
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaa-cacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    |||| |||||| ||||| || ||||||||  |||||||  ||||   |    
T  31404561 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagaggaaagcacaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagaga 31404656  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31404657 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 31404754  T
Q  226 aaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac 310  Q
     |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31404755 -aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcac 31404839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 5413281 - 5413561
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |  || |||||| ||||| || ||||||||  |||||||  ||||   |    
T  5413281 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagaga 5413376  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5413377 aacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 5413473  T
Q  226 aaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5413474 -aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 5413561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 16452214 - 16452498
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||| || || ||| | ||||||||  ||||   |    
T  16452214 caagcaataatcaacaataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaa-atataaaaggagag--aagagaga 16452310  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16452311 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-c 16452407  T
Q  226 aaaagggata-caagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16452408 caaagagatatgaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa 16452498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 30834517 - 30834705
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30834517 aaacaaacacaccaa-agattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 30834613  T
Q  225 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30834614 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa 30834705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 33160333 - 33160521
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33160333 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatc-aatgagttctta 33160430  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  33160431 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 33160521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21588931
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 21589002  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21589001 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593664
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 21593735  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21593734 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 313
Target Start/End: Original strand, 3808699 - 3808877
Alignment:
Q  136 ccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggata 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  3808699 ccaagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagata 3808796  T
Q  236 caaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||| |  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3808797 caaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 3808877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Original strand, 5408956 - 5409151
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |  || |||||| ||||| || ||||||||  |||||||  ||||   |    
T  5408956 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagaga 5409051  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5409052 aacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 5409148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 313
Target Start/End: Original strand, 9183015 - 9183199
Alignment:
Q  127 acaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 226  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9183015 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 9183110  T
Q  227 aaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  9183111 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 9183199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17758191 - 17758026
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  17758191 tgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 17758094  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17758093 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 2972940 - 2973107
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  2972940 tgttcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 2973036  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2973037 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17763158 - 17762990
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||  | ||    
T  17763158 tgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatc-aatgagttcttccaaaa-agatacaaatgagt 17763061  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  17763060 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16569208 - 16569022
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16569208 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16569112  T
Q  225 caaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagacactcaa 322  Q
    |||            ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||   ||||||||||||    
T  16569111 caa------------aggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaa 16569027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 311
Target Start/End: Original strand, 26830124 - 26830289
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg-t 243  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  || |    
T  26830124 tgttcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatggat 26830220  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 311  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  26830221 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccatttttccaatctcacc 26830289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 22424826 - 22424995
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga---g 241  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |   |    
T  22424826 tgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaaatgg 22424922  T
Q  242 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22424923 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Original strand, 26954283 - 26954450
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||       
T  26954283 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacagat 26954379  T
Q  241 g-gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac 310  Q
    | |||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26954380 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttataccaatttcccaatctcac 26954450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 28137409 - 28137576
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||  |||    
T  28137409 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggt 28137505  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  28137506 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 28137576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5043795 - 5043648
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||    
T  5043795 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 5043698  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 293  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  5043697 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 5043648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 6136159 - 6136216
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6136159 ggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagat 6136216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Original strand, 33211182 - 33211353
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||      
T  33211182 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttcttacaaa-gagatacaaat 33211278  T
Q  241 g-gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 313  Q
    | | |||||||||||| ||| | |||| |||| | |||||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  33211279 gagctacaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaacaa-ccataatttctaccaattttcccaatctcaccaa 33211353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26800755 - 26800642
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag--g 242  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |   |    
T  26800755 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaa-gagatacaaaattag 26800659  T
Q  243 ttacaagaaattagctt 259  Q
    |||||||||||||||||    
T  26800658 ttacaagaaattagctt 26800642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 259
Target Start/End: Original strand, 603081 - 603201
Alignment:
Q  137 caagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||    
T  603081 caagagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatac 603177  T
Q  237 -aagaggttacaagaaattagctt 259  Q
     ||  |||||||||||||||||||    
T  603178 aaatgggttacaagaaattagctt 603201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 313
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039071
Alignment:
Q  168 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaag 265  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  | |||    
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaag 3039023  T
Q  266 ttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3039024 ctcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 3039071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4045542 - 4045423
Alignment:
Q  195 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttcta 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||   |||| |||| || | | ||||||||||||||||| | |||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  4045542 ctctccaatccactatcaa-tgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttcta 4045444  T
Q  293 cccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||  |||||||||||| ||||    
T  4045443 ccattttcccaatctctccaa 4045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 189
Target Start/End: Original strand, 21356021 - 21356084
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 189  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  21356021 aaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctggaggagaga 21356084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19643938 - 19643894
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 189  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19643938 tgtttaccaagttcggtccaaatttgacctactctgaaggagaga 19643894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 18392052 - 18392407
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18392052 ggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 18392151  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392152 agata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 18392249  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392250 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 18392349  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18392350 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 18392407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 18388616 - 18388971
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18388616 ggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 18388715  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388716 agata--caaagagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 18388813  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388814 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 18388913  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18388914 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 18388971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 32060178 - 32060537
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32060178 ggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 32060277  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060278 agataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 32060375  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaa--gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060376 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 32060475  T
Q  296 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060476 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 32060537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 6594414 - 6594769
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6594414 ggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 6594513  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6594514 agataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactct 6594611  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594612 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 6594711  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6594712 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 6594769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 6592196 - 6592551
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6592196 ggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 6592295  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6592296 agaaaaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactct 6592393  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6592394 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccat 6592493  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6592494 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 6592551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20344207 - 20343853
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacca---cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatca 97  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||| || | |||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20344207 ggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaatcgacaaaaaaccagcacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacacaatca 20344111  T
Q  98 caagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 196  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20344110 caagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtact 20344014  T
Q  197 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20344013 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccct 20343914  T
Q  297 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343913 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 20343853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 1560521 - 1560757
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1560521 ggtaaccaccgaacagagtatattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 1560620  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560621 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggttacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 1560720  T
Q  200 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560721 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 1560757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24790074 - 24789797
Alignment:
Q  79 gaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaa-caaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790074 gaaacacaatgcacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 24789977  T
Q  178 ctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaa 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24789976 ctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaa-gagtttttacaaaagggatacaaaatgttacaagaaattagctttgacaagttcacaatgaa 24789878  T
Q  277 caaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24789877 caaaccctaatttttacccttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttc 24789797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39731656 - 39731355
Alignment:
Q  25 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 122  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||     
T  39731656 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaagag 39731559  T
Q  123 gaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 222  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39731558 gaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttct 39731461  T
Q  223 tacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagct-tgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 320  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  39731460 tacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactc 39731362  T
Q  321 aatgatt 327  Q
    |||||||    
T  39731361 aatgatt 39731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 43504015 - 43504365
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||||   || |||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| ||||| ||||    
T  43504015 ggtaaccacc-aacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaaa--cagctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaacacaagcaca 43504110  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 199  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43504111 agataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctc 43504208  T
Q  200 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 296  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  43504209 caattcactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctaccct 43504306  T
Q  297 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43504307 tttcccaatctcaccaagacactcgatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgttt 43504365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35854180 - 35853914
Alignment:
Q  45 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagaga 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||   ||||||| |||||||||||    
T  35854180 aacagcacctagatctaatctaggaagcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--agg-gagagaagagagaaacaaacacaccaagaga 35854084  T
Q  144 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-gg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | ||    
T  35854083 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaggg 35853986  T
Q  243 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35853985 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 35853914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Original strand, 25766940 - 25767110
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  25766940 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 25767037  T
Q  225 caaaagggatac--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  25767038 caaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 25767110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 243 - 357
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562215
Alignment:
Q  243 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggt 1562200  T
Q  343 gtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||    
T  1562201 gtttcccatgttttc 1562215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29991240 - 29991054
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  29991240 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttatta 29991143  T
Q  225 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
      |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29991142 -gaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaa 29991054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23555323 - 23555039
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaa-agcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 124  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||||| | ||||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  23555323 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtaaaaaacacaataccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagag 23555228  T
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23555227 aaacaaacacatcaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 23555130  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| | ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  23555129 c-aaagaggtacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaa 23555039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Original strand, 34310712 - 34310884
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||      
T  34310712 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaat 34310809  T
Q  241 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | ||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34310810 gtgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48408992 - 48408802
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  48408992 aaacaaacacaccaagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatc-aatgagttattt 48408894  T
Q  225 caaaagggatac--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48408893 caaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaac-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 48408802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25616137 - 25615836
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 124  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||| | |||| |||||||||||      ||| ||||||||    
T  25616137 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaagataaa------gagagaagaaga 25616044  T
Q  125 ---aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 221  Q
       ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25616043 gagaaacaaacacaccaa-agattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc 25615946  T
Q  222 ttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagacac 318  Q
    ||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||  |||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||    
T  25615945 ttacaaaa-tgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagacac 25615851  T
Q  319 tcaatgattctctct 333  Q
    ||||||||| |||||    
T  25615850 tcaatgattttctct 25615836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22270158 - 22269973
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22270158 aacaaacacaccaagagat-gttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatcagttcttac 22270062  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22270061 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 41317416 - 41317602
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41317416 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 41317512  T
Q  225 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  41317513 c-aaagggatacaaatggattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 127 - 313
Target Start/End: Original strand, 14069817 - 14070001
Alignment:
Q  127 acaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 226  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14069817 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 14069912  T
Q  227 aaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14069913 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14070001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 127 - 313
Target Start/End: Original strand, 14379845 - 14380029
Alignment:
Q  127 acaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 226  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14379845 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 14379940  T
Q  227 aaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14379941 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14380029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4179054 - 4178774
Alignment:
Q  29 aagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaa 126  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||| || || |||||  |||||||  ||||   ||    
T  4179054 aagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaa--aggagag--aagagagaa 4178959  T
Q  127 acaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 226  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||       
T  4178958 acaaacacaccaa-agattgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatc-aatgagttctt--c 4178863  T
Q  227 aaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  4178862 aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttcccaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaa 4178774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19502365 - 19502233
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19502365 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 19502268  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 259  Q
    | |||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19502267 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 19502233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27348002 - 27347817
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27348002 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttcttac 27347906  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27347905 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 294
Target Start/End: Original strand, 41648993 - 41649158
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41648993 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 41649089  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    | |||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41649090 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagctaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 41649158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 8359316 - 8359485
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--gg 242  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |  ||    
T  8359316 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatggg 8359413  T
Q  243 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  8359414 ttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaa 8359485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2390461 - 2390301
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |    
T  2390461 acaccaagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-atatgagttattac-aaagag 2390365  T
Q  233 atac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  2390364 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 2390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Original strand, 30024729 - 30024900
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||     
T  30024729 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaat 30024825  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  30024826 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30024900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358167
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 32358151  T
Q  244 tacaagaaattagctt 259  Q
    ||||||||||||||||    
T  32358152 tacaagaaattagctt 32358167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29608902 - 29608737
Alignment:
Q  147 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gtta 245  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||||    
T  29608902 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtta 29608806  T
Q  246 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29608805 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18126829 - 18126644
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18126829 aacaaacacaccaa-agattgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatc-aatgagttcttac 18126733  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagcttg-acaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  18126732 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaa 18126644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3259162 - 3258995
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||  | ||    
T  3259162 tgttcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtttttac-aaagagatacaaatgagt 3259066  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  3259065 tacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 3258995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431971
Alignment:
Q  149 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttaca 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||  |||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttaca 6432038  T
Q  248 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | |||| || ||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  6432037 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 6431971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8153513 - 8153342
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||      
T  8153513 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattac-aaagagatacaaat 8153417  T
Q  241 g-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||||||||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  8153416 gagttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 8153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491579
Alignment:
Q  165 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gac 262  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctttc-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 48491630  T
Q  263 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48491629 aagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48491579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 48599335 - 48599502
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||  | ||    
T  48599335 tgttcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagctctt-ccaaagagatacaaatgagt 48599431  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  48599432 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaa 48599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 4253510 - 4253697
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||     
T  4253510 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaa-tgagttcttt 4253606  T
Q  225 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| |||| || ||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  4253607 ccaaagagatataaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48489616 - 48489431
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  48489616 aacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttattgc 48489520  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||  | | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48489519 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48489431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43864413 - 43864244
Alignment:
Q  143 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagag 241  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| ||  |    
T  43864413 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aattagtttttac-aaagagatacaaatgg 43864317  T
Q  242 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43864316 gttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaa 43864244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 295
Target Start/End: Original strand, 31732966 - 31733118
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  31732966 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 31733062  T
Q  240 aggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  31733063 gggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 31733118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 4508707 - 4508874
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  4508707 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 4508803  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  4508804 tacaagaaattagcttcaataagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 4508874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 36146390 - 36146576
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36146390 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaa-tgagttctta 36146486  T
Q  225 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||| | |||||||  || ||||| ||||||||||| | |||| |||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36146487 caaa-gagatacaaatgggttaca-gaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36146576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Original strand, 2360978 - 2361140
Alignment:
Q  150 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaa 248  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||    
T  2360978 acccagttcggttcaa-cttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaa 2361074  T
Q  249 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2361075 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2361140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26417501 - 26417316
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26417501 aacaaacacaccaagaaattgttgacccagtttggtccaat-ttgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac 26417405  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26417404 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26417316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Original strand, 47673927 - 47674111
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47673927 aacaaacacaccaa-agattgttgattcagttcggtccaa-cttgacttaatatgg-ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 47674022  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  47674023 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 47674111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Original strand, 47676119 - 47676304
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  47676119 aacaaacacaccaa-agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatc-attgagttcttac 47676215  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  47676216 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 47676304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 310
Target Start/End: Original strand, 38671204 - 38671387
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  38671204 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtcc-aacttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 38671300  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
    | |||| |||||||  | ||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38671301 c-aaagtgatacaaatgtgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 38671387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4586332 - 4586161
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggat-acaag 239  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||     
T  4586332 agattgtcgacccagttcggtccaag-ttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagataaaaat 4586236  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4586235 gggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4586161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 310
Target Start/End: Original strand, 495965 - 496148
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  495965 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccggttctgtccaa-cttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 496061  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
      |||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||  ||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  496062 -taaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-taccctaatttctacccattttcccaatctcac 496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 294
Target Start/End: Original strand, 23565069 - 23565210
Alignment:
Q  152 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaaga 250  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||    
T  23565069 ccagttcagtccaa-cttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaaga 23565165  T
Q  251 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    |||||| ||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||||||    
T  23565166 aattagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacc 23565210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 259
Target Start/End: Original strand, 6359941 - 6360065
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  6359941 acaccaagaaattgttgacccagttcgatccaa-cttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatc-aatgagttcttac-aaagag 6360037  T
Q  233 atac-aagaggttacaagaaattagctt 259  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  6360038 atacaaatgggttacaagaaattagctt 6360065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 24525484 - 24525584
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24525484 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 24525580  T
Q  225 caaa 228  Q
    ||||    
T  24525581 caaa 24525584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1113843 - 1113679
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1113843 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcaattcggtc-aaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttctta 1113747  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 292  Q
    | |||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  1113746 c-aaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 1113679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 288
Target Start/End: Original strand, 2759195 - 2759339
Alignment:
Q  142 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag 241  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||  |    
T  2759195 gattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatataaatg 2759291  T
Q  242 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatt 288  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  2759292 agttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 24790309 - 24790230
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaac 83  Q
    |||||||||| |||||||||    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24790309 ggtaaccaccaaacaaagtgc---gtgcaagtaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaggtgagaaac 24790230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 310
Target Start/End: Original strand, 31105394 - 31105558
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||  |||    
T  31105394 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaatgggt 31105490  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | ||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31105491 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaatctaatttctacccattttcccaatctcac 31105558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31519089 - 31518988
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggag-gagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  31519089 aaacaaacacaccaagaaat-gtttatccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtc-aatgagttctt 31518993  T
Q  224 acaaa 228  Q
    |||||    
T  31518992 acaaa 31518988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Original strand, 4510549 - 4510661
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||  |||    
T  4510549 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttctta-taaagagatacaaatgggt 4510645  T
Q  244 tacaagaaattagctt 259  Q
    ||||||||||||||||    
T  4510646 tacaagaaattagctt 4510661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Original strand, 4512391 - 4512503
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||  |||    
T  4512391 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttctta-taaagagatacaaatgggt 4512487  T
Q  244 tacaagaaattagctt 259  Q
    ||||||||||||||||    
T  4512488 tacaagaaattagctt 4512503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30814605 - 30814536
Alignment:
Q  143 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 213  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30814605 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 30814536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 209
Target Start/End: Original strand, 12097849 - 12097931
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccacta 209  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||    
T  12097849 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta 12097931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396418
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 213  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaa 18396418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 292
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328538
Alignment:
Q  150 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaa 248  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||| ||| |   |||| ||||||| || |||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactat-taatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaa 22328493  T
Q  249 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 292  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||||||| ||||||||||    
T  22328494 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttcta 22328538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23344048 - 23343975
Alignment:
Q  241 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23344048 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 313
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526065
Alignment:
Q  242 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 24526065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 259
Target Start/End: Original strand, 36574497 - 36574629
Alignment:
Q  124 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||  |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36574497 aaaacaaacacatcaagaaat-gtttacccagtttggtccaaa-ttgacctactctag-ggatggattgatctctccaaaccactatcaa-tgagttctt 36574592  T
Q  224 acaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagctt 259  Q
       |||| |||| || ||| |||||||||||||||||    
T  36574593 tacaaagagatataaaagggttacaagaaattagctt 36574629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 47263663 - 47263703
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaa 165  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  47263663 aaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 47263703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 12647242 - 12647597
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12647242 ggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 12647341  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647342 agata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 12647439  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647440 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 12647539  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12647540 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 12647597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 13655885 - 13656220
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13655885 ggtaaccaccgaacagagtatattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 13655984  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13655985 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 13656084  T
Q  198 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656085 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 13656184  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656185 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 13656220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6266999 - 6266647
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||| |||||    
T  6266999 ggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgtaagcaaaaatcaacaaaacaacacctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaatacacaagcacaa 6266903  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266902 gataaac--ggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 6266805  T
Q  200 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6266804 caatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt 6266706  T
Q  299 tcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6266705 tcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttc 6266647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 315
Target Start/End: Original strand, 4484211 - 4484502
Alignment:
Q  25 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 122  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  4484211 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcaaaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaagaa 4484308  T
Q  123 gaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 222  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4484309 gaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttct 4484406  T
Q  223 tacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaaga 315  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  4484407 tacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaaga 4484502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30833633 - 30833342
Alignment:
Q  25 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 122  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||     
T  30833633 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaagag 30833536  T
Q  123 gaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 222  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30833535 gaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttct 30833438  T
Q  223 tacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaaga 315  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  30833437 tacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 30833342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32289853 - 32289523
Alignment:
Q  25 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 122  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||     
T  32289853 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--aggagagggaagag 32289756  T
Q  123 gaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 221  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||| |||||||||    
T  32289755 gaaaacaaggacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatc-aatgagttc 32289657  T
Q  222 ttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacact 319  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32289656 ttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacact 32289559  T
Q  320 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 355  Q
    |||||||| || ||   |||||||||| ||||||||    
T  32289558 caatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgttt 32289523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Original strand, 4503017 - 4503280
Alignment:
Q  26 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaag 123  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||  |||||||  ||||      
T  4503017 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaa--aggagag--aagaga 4503112  T
Q  124 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4503113 gaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt 4503210  T
Q  224 acaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
       |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  4503211 --caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 4503280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45100036 - 45099754
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||| || || |||||  |||||||  ||||   |    
T  45100036 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaatataaa--aggagag--aagagaga 45099941  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  45099940 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-- 45099845  T
Q  226 aaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  45099844 caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa 45099754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 5723237 - 5723423
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5723237 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5723334  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5723335 c-aaagagatacaaaaaggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaa 5723423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 36987961 - 36988225
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 124  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  36987961 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagag 36988056  T
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36988057 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 36988154  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    | |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||    
T  36988155 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaac-aaccctaatttctaccc 36988225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 2334399 - 2334586
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2334399 aaacaaacacaccaa-agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 2334496  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2334497 c-aaagagatacaaaagagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aacccttatttctacccattttcccaatctcaccaa 2334586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 36205551 - 36205832
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| ||||| || || |||||  |||||||  ||||   |    
T  36205551 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcagaaaccacaagcaaaatataaa--aggagag--aagagaga 36205646  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||||      
T  36205647 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtc-aatgagttctt-- 36205742  T
Q  226 aaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  36205743 caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 36205832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 125 - 294
Target Start/End: Original strand, 6594987 - 6595154
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6594987 aaacaaacacaccaa-agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttctta 6595084  T
Q  225 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    | |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  6595085 c-aaagagattcaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 6595154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Original strand, 34139752 - 34139920
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34139752 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 34139848  T
Q  225 caaaagggataca-agaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  34139849 caaaagggatacatatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 34139920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45726929
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggt 45727000  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45726999 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Original strand, 723726 - 723893
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  723726 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 723822  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  723823 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 723893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29868040 - 29867869
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||     
T  29868040 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaat 29867944  T
Q  240 aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29867943 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29867869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Original strand, 14633807 - 14633975
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14633807 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-tatgagttctta 14633903  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| || ||||||||||||||    
T  14633904 caaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctaccc 14633975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 294
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35447032
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 35446981  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  35446982 tacaagaaattagattcaacaagatcacaaagaac-aaccctaatttctacc 35447032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36773748 - 36773562
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36773748 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 36773652  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| |||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  36773651 c-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaa 36773562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38312411 - 38312240
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||     
T  38312411 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagatcttac-aaagagatacaaat 38312315  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38312314 gggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 38312240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 11151573 - 11151759
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11151573 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaa-gagttctta 11151669  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  11151670 c-aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 11151759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 36317991 - 36318177
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36317991 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 36318087  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||| ||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  36318088 c-aaagagatacaaatgggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 36318177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 17057352 - 17057451
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17057352 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 17057448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 17085335 - 17085434
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17085335 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 17085431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 313
Target Start/End: Original strand, 1631735 - 1631900
Alignment:
Q  147 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggtta 245  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||||    
T  1631735 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtta 1631831  T
Q  246 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||| | |||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  1631832 caagatattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 1631900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24398238 - 24398055
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||   |||| |    
T  24398238 acaccaagtaattgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttctttacaaagag 24398140  T
Q  233 atacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct--ttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  24398139 atacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaa 24398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33648340 - 33648176
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggt 243  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||  |||||| | |||    
T  33648340 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatc-aatgagttctttacaaagaaatacaaaagggt 33648242  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 308  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  33648241 tacaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362355
Alignment:
Q  165 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gac 262  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaac 42362403  T
Q  263 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
    ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42362402 aagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 42362355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11067491 - 11067324
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  11067491 aaacaaacacaccaa-agattgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattat-aaatgagttctta 11067395  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    | |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| | | || ||| |||||||||||||    
T  11067394 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtac-aacactaatttctaccc 11067324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Original strand, 33162432 - 33162599
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33162432 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctta 33162528  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    | | || ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  33162529 c-agagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 33162599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Original strand, 17490149 - 17490261
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| || ||    
T  17490149 tgtttacccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagttacaaaagagt 17490245  T
Q  244 tacaagaaattagctt 259  Q
    ||||||||||||||||    
T  17490246 tacaagaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26353351 - 26353184
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| || ||    
T  26353351 tgtttacccggttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagtacttacaaaa-agatacaaaagtgt 26353255  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | ||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  26353254 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttcaatctcaccaa 26353184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11690672 - 11690504
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| || | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| ||     
T  11690672 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatc-aacgatttcttac-aaagggatacaaat 11690576  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11690575 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 11690504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39285007 - 39284936
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 39284936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121769
Alignment:
Q  179 tggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaac 277  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| | ||||    
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaa-tgagtttctacaaa-gagatacaa-aggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac 13121805  T
Q  278 aaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  13121804 aaaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 313
Target Start/End: Original strand, 42288101 - 42288278
Alignment:
Q  134 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggga 233  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||  |    
T  42288101 caccaagaaattattgacccagttcggtcc-aacttgacctaatctgg-ggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagctcttac-aaagaaa 42288196  T
Q  234 tac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||| ||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42288197 tacaaatgggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 42288278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17450748 - 17450678
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17450748 agattgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgt-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 17450678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Original strand, 7815323 - 7815441
Alignment:
Q  195 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||  ||||| |    | ||||||||||||||||| |    
T  7815323 ctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaa 7815420  T
Q  293 cccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||  |||| ||||||||||||    
T  7815421 cctttttctcaatctcaccaa 7815441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7451284 - 7451204
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 228  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7451284 tgttcacccagttcg-tccaa-cttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttattacaaa 7451204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1345653 - 1345590
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 189  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  1345653 aaacaaacacaccaagaaattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctactctgggggagaga 1345590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28672036
Alignment:
Q  156 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 208  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccact 28672036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42064770 - 42064725
Alignment:
Q  144 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  42064770 ttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagaga 42064725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42412162 - 42412118
Alignment:
Q  168 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42412162 ttgacctactctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 42412118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2838134 - 2838079
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 189  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  2838134 acaccaagaaattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctactctgggggagaga 2838079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28259289 - 28259249
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaa 165  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28259289 aaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 28259249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 2460 - 2815
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2460 ggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 2559  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2560 agata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 2657  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2658 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 2757  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2758 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 2815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 3582 - 3937
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3582 ggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 3681  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3682 agata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactct 3779  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3780 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 3879  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3880 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 3937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7125214 - 7124857
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7125214 ggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 7125115  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125114 agataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactct 7125017  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125016 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 7124917  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124916 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 7124857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8393707 - 8393352
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8393707 ggtaaccaccaaacgaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 8393608  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393607 agataca-atggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 8393509  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8393508 ccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttt 8393409  T
Q  299 tcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8393408 tcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 8393352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8395916 - 8395561
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8395916 ggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 8395817  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395816 agataca-atggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 8395718  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8395717 ccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttt 8395618  T
Q  299 tcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8395617 tcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 8395561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7122995 - 7122638
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7122995 ggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 7122896  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7122895 agataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagaaattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactct 7122798  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122797 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 7122698  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122697 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 7122638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5138603 - 5138246
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacaca--aagcacaatcac 98  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || || || |||    
T  5138603 ggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagagacaacaaaacatcac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaaccaaaa-cac 5138506  T
Q  99 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5138505 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactc 5138406  T
Q  198 tccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138405 tccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 5138306  T
Q  296 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  5138305 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtatttcccatgttttc 5138246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5136378 - 5136022
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacaca--aagcacaatcac 98  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || || || |||    
T  5136378 ggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagagacaacaaaacatcac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaaccaaaa-cac 5136281  T
Q  99 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5136280 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactc 5136181  T
Q  198 tccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136180 tccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 5136081  T
Q  296 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtttt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  5136080 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtatttcccatgtttt 5136022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 355
Target Start/End: Original strand, 31495188 - 31495527
Alignment:
Q  24 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaac------aaggagagg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||       |||||||||    
T  31495188 tgtgcaagcaataatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggataaaaggagagg 31495287  T
Q  117 gaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 216  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  31495288 gaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatc-aatg 31495386  T
Q  217 agttcttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31495387 agttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aatcctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 31495485  T
Q  314 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 355  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  31495486 gacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgttt 31495527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 125 - 327
Target Start/End: Original strand, 13992274 - 13992475
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13992274 aaacaaacacaccaa-agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 13992371  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaagacactc 320  Q
    |  ||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  13992372 c--aagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactc 13992468  T
Q  321 aatgatt 327  Q
    |||||||    
T  13992469 aatgatt 13992475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 29999806 - 29999974
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||    
T  29999806 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagt 29999904  T
Q  244 tacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29999905 tacaagaaattagctttgacatgttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 29999974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 56178618 - 56178805
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56178618 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 56178715  T
Q  225 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  56178716 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 56178805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 52095344 - 52095530
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  52095344 aaacaaacacaccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gatttctta 52095440  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  52095441 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 52095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 133 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2209894 - 2209717
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  2209894 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 2209797  T
Q  233 atacaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctca 309  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2209796 atacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctca 2209717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48143230 - 48143042
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48143230 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 48143133  T
Q  225 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 313  Q
       ||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  48143132 -tgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 48143042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 5369968 - 5370237
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 124  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| | |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  5369968 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagat 5370063  T
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  5370064 aaacaaacacatcaa-agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatc-aatgagttctta 5370161  T
Q  225 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc--ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 299  Q
    | |||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5370162 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctcttt 5370237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Original strand, 9927441 - 9927626
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9927441 aacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 9927537  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9927538 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9927626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964415
Alignment:
Q  148 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggtta 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaaatgggtta 41964484  T
Q  246 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  41964483 caataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 47038393 - 47038577
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  47038393 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtcctta 47038489  T
Q  225 caaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||  |||||||  | |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47038490 c-aaacagatacaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccaatctcaccaa 47038577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26364415 - 26364236
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |    
T  26364415 acaccaagaaattgttgacccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-taatgagttcttac-aaagag 26364319  T
Q  233 atacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26364318 atacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Original strand, 12739533 - 12739718
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  12739533 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcatac 12739629  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||  ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12739630 -aaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12739718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Original strand, 12743908 - 12744073
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12743908 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 12744004  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
     |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12744005 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Original strand, 12745297 - 12745462
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12745297 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 12745393  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
     |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12745394 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 46703669 - 46703500
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--gg 242  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |  ||    
T  46703669 tgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttac-aaagagatacaaaatggg 46703572  T
Q  243 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  46703571 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54883199 - 54883020
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  54883199 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 54883103  T
Q  233 atac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54883102 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Original strand, 26175619 - 26175804
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26175619 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 26175715  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  26175716 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaa 26175804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Original strand, 34570397 - 34570582
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34570397 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 34570493  T
Q  226 aaaagggatacaa-gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| |||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  34570494 -aaagagatacaattgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 34570582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 311
Target Start/End: Original strand, 46147373 - 46147557
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46147373 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaa-gagttctta 46147469  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 311  Q
    | |||| |||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  46147470 c-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6656123 - 6655975
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||    
T  6656123 tgttcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 6656027  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  6656026 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccc 6655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12073560 - 12073392
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||    
T  12073560 tgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 12073463  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12073462 tacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Original strand, 36463386 - 36463557
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||| ||     
T  36463386 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaat 36463482  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36463483 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40632612 - 40632445
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  40632612 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggt 40632516  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40632515 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41639593 - 41639426
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||||| ||  |||    
T  41639593 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttcttac-aaatagatacaaatgggt 41639497  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  41639496 tacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 45687164 - 45687351
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45687164 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaa-tgagttctta 45687260  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 313  Q
    ||||  | ||||||  | |||| ||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  45687261 caaatag-atacaaatgagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 259
Target Start/End: Original strand, 48893620 - 48893751
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48893620 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 48893716  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 259  Q
    | |||| |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  48893717 c-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 48893751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 259
Target Start/End: Original strand, 50262689 - 50262814
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  50262689 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatc-aatgagttcttac-aaagag 50262786  T
Q  233 atac-aagaggttacaagaaattagctt 259  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  50262787 atacaaatgggttacaagaaattagctt 50262814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Original strand, 50673848 - 50673960
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||    
T  50673848 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 50673944  T
Q  244 tacaagaaattagctt 259  Q
    ||||||||||||||||    
T  50673945 tacaagaaattagctt 50673960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12119719 - 12119559
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 232  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |    
T  12119719 acaccaagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctttacaaagag 12119622  T
Q  233 atacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 293  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12119621 atacaaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctac 12119559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36994693 - 36994524
Alignment:
Q  143 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagag 241  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  |    
T  36994693 attgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgg 36994597  T
Q  242 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36994596 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 379548 - 379399
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  379548 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aattagttcttac-aaagcgatacaaatgggt 379451  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  379450 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 379399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 306
Target Start/End: Original strand, 5207843 - 5208003
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa-agggatacaagaggt 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||    
T  5207843 tgtttacccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaa-tgagttcttacaaatagatatacaag-ggt 5207939  T
Q  244 tacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatc 306  Q
    | ||| |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5207940 tgcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatc 5208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 294
Target Start/End: Original strand, 6542161 - 6542328
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6542161 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttctta 6542257  T
Q  225 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    | |||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  6542258 c-aaagagatacaaaaggctaacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctacc 6542328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8648306 - 8648139
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  8648306 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 8648210  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    || |||||||||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  8648209 tataagaaattagcttcaacaaactcacaatgaac-aaccctaatttctatccattttcccattctcaccaa 8648139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665408
Alignment:
Q  165 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 8665459  T
Q  263 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||| || | | |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  8665458 aagctctcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 8665408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 37229722 - 37229890
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa-agggatacaagaggt 243  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||    
T  37229722 tgtttacctagttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaagagatataaaaagggt 37229819  T
Q  244 tacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||| ||||| |||| | |||| |||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37229820 tacaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37740794 - 37740625
Alignment:
Q  143 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagag 241  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |    
T  37740794 attgttgacacagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgg 37740698  T
Q  242 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  37740697 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 37740625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5429850 - 5429679
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| ||     
T  5429850 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatagatacaaat 5429754  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  5429753 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaa-taaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 5429679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Original strand, 27416962 - 27417133
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||     
T  27416962 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagagatacaaat 27417058  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  27417059 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaa 27417133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Original strand, 54199890 - 54200074
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  54199890 aacaaacacaccaaaa-attgttgacccagttcg-tccaa-cttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatc-aatgagttcttac 54199985  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54199986 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54200074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5872003 - 5871820
Alignment:
Q  128 caaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaa 227  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | |    
T  5872003 caaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaa-gagttcttgc-a 5871908  T
Q  228 aagggat-acaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||| ||| | ||  |||||||||||||| ||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  5871907 aagtgataaaaatgggttacaagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 5871820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Original strand, 52467336 - 52467503
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  52467336 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-aagttatta 52467432  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  52467433 c-aaagtgatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 52467503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4588126 - 4588014
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggt 243  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |||    
T  4588126 tgtttacccagtttggtccaa-cttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 4588030  T
Q  244 tacaagaaattagctt 259  Q
    ||||||||||||||||    
T  4588029 tacaagaaattagctt 4588014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31474337 - 31474206
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31474337 aaacaaacacaccaagatat-gtttacccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaa-tgagttctta 31474241  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 259  Q
    |||| | |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  31474240 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagctt 31474206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662496
Alignment:
Q  153 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaa 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaa 35662504  T
Q  252 attagctt 259  Q
    ||||||||    
T  35662503 attagctt 35662496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 52082645 - 52082825
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |       |||||||||||| || ||||||    
T  52082645 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatc-------tccactatcaaa-gatttctta 52082735  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  52082736 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 52082825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 294
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  185 agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaacc 282  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aacc 12744183  T
Q  283 ctaatttctacc 294  Q
    ||||||||||||    
T  12744184 ctaatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 287
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699585
Alignment:
Q  150 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaa 248  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||   |||| ||||||| || |||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaa 26699545  T
Q  249 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaat 287  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  26699546 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaat 26699585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29254679 - 29254580
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29254679 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac 29254583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12747924
Alignment:
Q  183 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaa 280  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcatacaaatag-atacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aa 12747890  T
Q  281 ccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12747891 ccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12747924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 238
Target Start/End: Original strand, 13009441 - 13009535
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaa 238  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13009441 agattgttgacacagttcggtctaa-cttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaa 13009535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745585
Alignment:
Q  185 agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaacc 282  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aacc 12745572  T
Q  283 ctaatttctaccc 295  Q
    |||||||||||||    
T  12745573 ctaatttctaccc 12745585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3913618 - 3913534
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 228  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||| || |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3913618 agattgttgacccagttcgatacaa-ctttacatactctag-ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 3913534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989899
Alignment:
Q  169 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagctt 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| ||   |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactat-taacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 51337231 - 51337064
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggt 243  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||    
T  51337231 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatc-aatgagttctta-aaaagagatacaaaagggt 51337135  T
Q  244 tacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaa-ccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    || || |||||| ||| | ||| |||| | ||||||| || ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  51337134 tataataaattatctt-aaaagctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 51337064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24969851 - 24969787
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 191  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  24969851 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggatagatt 24969787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24969230 - 24969112
Alignment:
Q  195 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 292  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  ||||||||||    
T  24969230 ctctccaatccactatc-aattagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttcta 24969134  T
Q  293 ccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||  ||| |||||||||||||    
T  24969133 cccatttttccaatctcaccaa 24969112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5396775 - 5396720
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 189  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  5396775 acaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctggaggagaga 5396720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089970
Alignment:
Q  171 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctt 33089970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6587 - 6230
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6587 ggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 6488  T
Q  100 agataaa-caaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6487 agataaaacaaggagagggaagaagaaaacaataacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactct 6388  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6387 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagggcttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct 6288  T
Q  298 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6287 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 6230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25690265 - 25689911
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  25690265 ggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaagaatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacacactcacaa 25690167  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25690166 gataaa--aggggagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactct 25690069  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  25690068 ccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttt 25689970  T
Q  299 tcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689969 tcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 25689911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3439811 - 3439460
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  3439811 ggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacacaatcacaa 3439715  T
Q  101 gataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 199  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439714 gataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctc 3439617  T
Q  200 caatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  3439616 caatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgccaagttcataatgaacaaaccctaatttctaccctttt 3439518  T
Q  300 cccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439517 cccaatctcaccaagacactcaatgattttctctttacaaggtgtttcccatgttttc 3439460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15290836 - 15290480
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15290836 ggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 15290737  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15290736 agata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactct 15290639  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290638 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 15290539  T
Q  297 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15290538 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 15290480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15471205 - 15470849
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15471205 ggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 15471106  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactct 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15471105 agata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactct 15471008  T
Q  199 ccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471007 ccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccc 15470908  T
Q  297 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15470907 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 15470849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 42575181 - 42575536
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca--caatcac 98  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| |||    
T  42575181 ggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaaccaaacac 42575278  T
Q  99 aagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42575279 aagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactc 42575376  T
Q  198 tccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42575377 tccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctaccc 42575476  T
Q  296 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42575477 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttc 42575536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2628024 - 2627693
Alignment:
Q  25 gtgcaagcaagaaa-caacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 122  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||     
T  2628024 gtgcaagcaaaaaatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--aggagagggaagag 2627927  T
Q  123 gaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2627926 gaaaacaaagacaccaagagattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttct 2627828  T
Q  223 tacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacact 319  Q
    |||| ||| ||||||| |   ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2627827 tacacaagagatacaaaaagagttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacact 2627729  T
Q  320 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 355  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  2627728 caatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgttt 2627693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31218541 - 31218256
Alignment:
Q  26 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaag 123  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| || || |||||||||||  |||||||  ||||      
T  31218541 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacataagcacaagataaa--aggagag--aagaga 31218446  T
Q  124 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31218445 gaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatc-aatgagttctt 31218348  T
Q  224 acaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 313  Q
     | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  31218347 -ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaa 31218256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 34254217 - 34254498
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |  || |||||| ||||| || ||||||||  |||||||  ||||   |    
T  34254217 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagaga 34254312  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34254313 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttcttac 34254410  T
Q  226 aaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34254411 -aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 34254498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17982935 - 17982652
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||| || || |||||  |||||||  ||||   |    
T  17982935 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaa--aggagag--aagagaga 17982840  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17982839 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-c 17982743  T
Q  226 aaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  17982742 caaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa 17982652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 34256393 - 34256674
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |  || |||||| ||||| || ||||||||  |||||||  ||||   |    
T  34256393 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagaga 34256488  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34256489 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 34256586  T
Q  226 aaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  34256587 -aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaa 34256674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42498459 - 42498193
Alignment:
Q  45 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||  |||||||  |||| | ||||||| ||||||| ||    
T  42498459 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagggaaacaaacacaccaa-ag 42498365  T
Q  143 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-g 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| | |    
T  42498364 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaaagg 42498267  T
Q  242 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  42498266 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 42498193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44304137 - 44303853
Alignment:
Q  28 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 125  Q
    ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||  || |||||| ||||| || ||||||||  |||||||  ||||   |    
T  44304137 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagaga 44304042  T
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44304041 aacaaacacaccaa-agattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta- 44303945  T
Q  226 aaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc---ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  44303944 aaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaa 44303853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 313
Target Start/End: Original strand, 19945243 - 19945529
Alignment:
Q  26 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaag 123  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||| ||||| || || |||||  |||||||  ||||      
T  19945243 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaa--aggagag--aagaga 19945338  T
Q  124 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
     ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19945339 gaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt 19945436  T
Q  224 acaaaagggatac--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     | |||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  19945437 -ccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaa 19945529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 294
Target Start/End: Original strand, 1746200 - 1746366
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1746200 aaacaaacacaccaac-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 1746296  T
Q  225 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
      |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  1746297 -caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 1746366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15212971 - 15212786
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15212971 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttcttac 15212875  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15212874 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 15212786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 42434992 - 42435159
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  42434992 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 42435088  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  42435089 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 42435159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43036608 - 43036423
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43036608 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaa-tgagttcttac 43036512  T
Q  226 aaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 313  Q
    ||| | |||||||  |  |||||||||||||| || | ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43036511 aaa-gagatacaaatgaattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43036423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4283691 - 4283524
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  4283691 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 4283595  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4283594 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33352321 - 33352150
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  33352321 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 33352225  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  33352224 gggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 33352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40321251 - 40321082
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||     
T  40321251 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagtttttac-aaagagatactaat 40321155  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 311  Q
     ||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40321154 gggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 3303652 - 3303838
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3303652 aaacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 3303748  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| |||||||  | ||||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3303749 c-aaagagatacaaatgagttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 3303838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 240
Target Start/End: Original strand, 4743196 - 4743308
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4743196 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 4743292  T
Q  225 caaaagggatacaaga 240  Q
    |||| ||| |||||||    
T  4743293 caaatgggttacaaga 4743308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18655567 - 18655400
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  18655567 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 18655471  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  18655470 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 18655400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27811449 - 27811278
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||     
T  27811449 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgggttcttac-aaagagatacaaat 27811353  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27811352 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27811278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 295
Target Start/End: Original strand, 12702631 - 12702783
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || |||| |    
T  12702631 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttcttac-aaagagacacaaaa 12702727  T
Q  241 -ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  12702728 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 12702783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 259
Target Start/End: Original strand, 1345353 - 1345484
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  1345353 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatc-aatgagttcttt 1345449  T
Q  225 caaaagggataca-agaggttacaagaaattagctt 259  Q
    | |||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  1345450 c-aaagagatacatatgggttacaagaaattagctt 1345484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5689442 - 5689326
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  5689442 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 5689346  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt 259  Q
     |||||||||||||||||||    
T  5689345 gggttacaagaaattagctt 5689326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 10930188 - 10930281
Alignment:
Q  133 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 228  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10930188 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgtgttcttacaaa 10930281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40221916 - 40221745
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||     
T  40221916 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaat 40221820  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40221819 gggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaa 40221745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4731843 - 4731658
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4731843 aacaaacacaccaa-agattgttgacccaattcggtccaa-cttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 4731747  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | || | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4731746 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagc-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4731658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6599143 - 6598975
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||     
T  6599143 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-gtatacaaat 6599047  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6599046 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcac 6598975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6674596 - 6674428
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||     
T  6674596 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-gtatacaaat 6674500  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6674499 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcac 6674428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30143525 - 30143346
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||| || ||| ||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30143525 aacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcagttcaa-cttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 30143429  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatct 307  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30143428 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatct 30143346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30291794 - 30291606
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 223  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||    
T  30291794 aaacaaacacaccaa-agattgttgattcagttcggtccaa-cttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gaattctt 30291698  T
Q  224 acaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    || |||| |||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  30291697 ac-aaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30291606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328782
Alignment:
Q  171 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagtt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |   ||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagct 40328825  T
Q  268 cactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40328824 cacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 40328782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 41366612 - 41366727
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 239  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||     
T  41366612 agattgttgtcccagttcggtccaa-cttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttac-aaagggatacaaat 41366707  T
Q  240 aggttacaagaaattagctt 259  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  41366708 aggttaaaagaaattagctt 41366727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141821
Alignment:
Q  151 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaag 249  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagtgatacaaatgggttacaag 18141885  T
Q  250 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  18141884 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa--cctaatttctacccattttcacaatctcaccaa 18141821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765745
Alignment:
Q  142 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgta-ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||      
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagaga--gcagctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaat 9765820  T
Q  241 gg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9765819 gggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9765745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11384152 - 11384004
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||  | ||    
T  11384152 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatc-aatgggttcttac-aaagagatacaaatgagt 11384056  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  11384055 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 11384004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 1292446 - 1292631
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1292446 aaacaaacacaccaagaaat-gtttgcccagttcggtccaa-cttgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaa-tgagttctta 1292541  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    |||| | |||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  1292542 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 1292631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 19491680 - 19491867
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||||  ||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  19491680 aaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtcc-aatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatc-aacgagttctta 19491777  T
Q  225 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19491778 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 19491867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4733891 - 4733792
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4733891 aacaaacacaccaa-agactgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgaattcttac 4733795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 8965692 - 8965859
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa-agggatacaagaggt 243  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||| |||    
T  8965692 tgtttacccagttcggtcc-aacttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatc-aatgagttcttacaaagagatataaaag-ggt 8965788  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 313  Q
    || ||||||||| |||  ||||  |||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8965789 tataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10015265 - 10015136
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  10015265 aaacaaatacaccaagaaatgatt-acccagttcggtccaa-cttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatc-aatgagttcct- 10015171  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 259  Q
     ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  10015170 -aaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 10015136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353796
Alignment:
Q  183 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 280  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aa 44353827  T
Q  281 ccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 310  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44353826 ccctaatttctacccattttcccaatctcac 44353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4162663 - 4162516
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||    
T  4162663 tgtttacccaattcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 4162568  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 295  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||    
T  4162567 tacaagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaa-cctaacttctaccc 4162516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 259
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106191
Alignment:
Q  150 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaa 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||||  |||||||  | |||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaa-cttgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaa-tgagttcttacaaaa--gatacaaatgagttacaa 18106180  T
Q  249 gaaattagctt 259  Q
    |||||||||||    
T  18106181 gaaattagctt 18106191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153844
Alignment:
Q  156 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8153914 ttcggtccaa-cttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatc-aatgagttcttacaaa 8153844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 3073875 - 3073955
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 228  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  3073875 tgtttacccagttcggcccaa-cttgacctactatgg-ggagagattgatctctccaagccattatcaa-tgagttcttacaaa 3073955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7597776 - 7597715
Alignment:
Q  152 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 213  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7597776 ccagttcggtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 7597715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 315
Target Start/End: Original strand, 11042 - 11333
Alignment:
Q  25 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 122  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||     
T  11042 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaagag 11139  T
Q  123 gaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 222  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  11140 gaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttct 11237  T
Q  223 tacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaaga 315  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  11238 tacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 11333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 315
Target Start/End: Original strand, 8616 - 8907
Alignment:
Q  25 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 122  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||  || ||||||||||     
T  8616 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaa--agaagagggaagag 8713  T
Q  123 gaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 222  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  8714 gaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttct 8811  T
Q  223 tacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaaga 315  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  || | |||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  8812 tacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttataagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 8907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 177 - 1
Alignment:
Q  1 ggtaaccaccgaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcaca 99  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  177 ggtaaccacctaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcaca 78  T
Q  100 agataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 177  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77 agat--acaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11745 - 11557
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11745 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 11647  T
Q  225 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11646 c-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 434798 - 434532
Alignment:
Q  45 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagaga 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||   ||||||| ||||||| | |    
T  434798 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaa--agg-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-ata 434703  T
Q  144 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-gg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | ||    
T  434702 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaggg 434605  T
Q  243 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt--cccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  434604 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaa 434532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1200 - 913
Alignment:
Q  26 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaaga-a 122  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  || |||||| ||||| || |  |||||  |||||||  |||| |    
T  1200 tgcaagcaataatcaacaataacaccacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaagtataaa--aggagag--aagaga 1105  T
Q  123 gaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 222  Q
    ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1104 gaaacaaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttgt 1007  T
Q  223 tacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaaga 315  Q
    |   |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  1006 t--caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaaga 913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 114774 - 114602
Alignment:
Q  141 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  114774 agattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaa 114677  T
Q  241 g-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  114676 gcgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 114602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 294
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18151
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||  | ||    
T  18004 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-ttac-aaagagatacaaatgagt 18100  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 294  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18101 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 18151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 149079 - 149179
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  149079 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 149175  T
Q  225 caaa 228  Q
    ||||    
T  149176 caaa 149179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7327
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  7494 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 7398  T
Q  244 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  7397 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaa 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Original strand, 20398 - 20583
Alignment:
Q  126 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 225  Q
    |||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20398 aacaaacacaccaaaa-attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaa-gagttcttac 20494  T
Q  226 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 313  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  20495 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaa-cctaatttctgctcattttcccaatctcaccaa 20583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10546
Alignment:
Q  145 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggt 243  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| | |||    
T  10656 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaaatggt 10560  T
Q  244 tacaagaaattagc 257  Q
    ||||| ||||||||    
T  10559 tacaataaattagc 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 213
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27510
Alignment:
Q  156 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 213  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27453 ttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 27510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8531 - 8491
Alignment:
Q  125 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaa 165  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8531 aaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 8491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University