View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19922_high_12 (Length: 385)

Name: NF19922_high_12
Description: NF19922
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19922_high_12
NF19922_high_12
[»] chr7 (98 HSPs)
chr7 (1-375)||(35355703-35356081)
chr7 (181-365)||(25893917-25894101)
chr7 (180-364)||(33423276-33423460)
chr7 (181-367)||(33839713-33839899)
chr7 (180-369)||(17855426-17855615)
chr7 (181-374)||(22979638-22979831)
chr7 (181-367)||(46913108-46913296)
chr7 (182-367)||(47066975-47067160)
chr7 (181-365)||(33695821-33696005)
chr7 (178-365)||(23393051-23393238)
chr7 (184-367)||(49171360-49171543)
chr7 (180-365)||(27018114-27018299)
chr7 (182-366)||(35328068-35328252)
chr7 (203-367)||(36389377-36389541)
chr7 (185-365)||(45690097-45690277)
chr7 (181-365)||(47740331-47740515)
chr7 (181-365)||(48609677-48609861)
chr7 (181-367)||(2341659-2341846)
chr7 (182-369)||(40670563-40670750)
chr7 (184-365)||(20165814-20165995)
chr7 (180-365)||(33411258-33411443)
chr7 (180-367)||(45482656-45482843)
chr7 (181-367)||(33332788-33332973)
chr7 (182-367)||(35757018-35757203)
chr7 (182-367)||(31586848-31587033)
chr7 (182-366)||(37846015-37846199)
chr7 (182-365)||(10028488-10028673)
chr7 (181-365)||(19563446-19563630)
chr7 (185-356)||(15877553-15877724)
chr7 (178-365)||(43499481-43499668)
chr7 (182-367)||(26579715-26579900)
chr7 (184-353)||(41990870-41991039)
chr7 (199-367)||(5183823-5183991)
chr7 (181-365)||(5712167-5712351)
chr7 (184-366)||(31625706-31625887)
chr7 (182-371)||(31429469-31429658)
chr7 (181-365)||(45063357-45063539)
chr7 (182-367)||(35767481-35767659)
chr7 (180-364)||(33870243-33870424)
chr7 (182-366)||(10618298-10618475)
chr7 (207-365)||(29446863-29447020)
chr7 (177-331)||(33720070-33720224)
chr7 (182-367)||(35752032-35752206)
chr7 (228-365)||(28233936-28234073)
chr7 (234-366)||(30076526-30076658)
chr7 (181-367)||(46898014-46898189)
chr7 (182-371)||(24923018-24923196)
chr7 (180-368)||(7876325-7876502)
chr7 (182-365)||(43489218-43489390)
chr7 (184-366)||(37127939-37128110)
chr7 (181-366)||(46817420-46817594)
chr7 (181-365)||(36816845-36817018)
chr7 (200-341)||(44564356-44564497)
chr7 (181-366)||(44003369-44003543)
chr7 (182-366)||(48085858-48086031)
chr7 (180-366)||(24228539-24228714)
chr7 (182-364)||(33393328-33393499)
chr7 (249-368)||(41904272-41904391)
chr7 (178-365)||(7257377-7257553)
chr7 (246-367)||(44405412-44405533)
chr7 (182-356)||(26941541-26941704)
chr7 (182-365)||(2332019-2332191)
chr7 (179-370)||(26371046-26371226)
chr7 (180-369)||(44659842-44660019)
chr7 (183-364)||(45502817-45502987)
chr7 (184-368)||(45237530-45237703)
chr7 (182-365)||(21718117-21718288)
chr7 (182-365)||(29610635-29610807)
chr7 (181-363)||(15643948-15644119)
chr7 (181-367)||(25037506-25037681)
chr7 (180-290)||(16482847-16482957)
chr7 (182-363)||(39453484-39453647)
chr7 (182-365)||(498188-498360)
chr7 (183-370)||(29098752-29098924)
chr7 (180-331)||(32556640-32556780)
chr7 (182-368)||(47906755-47906931)
chr7 (184-365)||(47460772-47460942)
chr7 (182-274)||(39323616-39323708)
chr7 (184-361)||(41855061-41855228)
chr7 (224-369)||(37443598-37443732)
chr7 (184-274)||(39866667-39866757)
chr7 (188-364)||(46103127-46103291)
chr7 (181-363)||(35484635-35484807)
chr7 (184-283)||(29863017-29863116)
chr7 (184-274)||(33455098-33455188)
chr7 (178-283)||(7720574-7720679)
chr7 (181-245)||(35823289-35823353)
chr7 (182-247)||(30077043-30077108)
chr7 (182-250)||(35557730-35557798)
chr7 (194-367)||(38448446-38448608)
chr7 (297-367)||(39323712-39323781)
chr7 (230-291)||(26456157-26456218)
chr7 (307-351)||(39866762-39866806)
chr7 (1-40)||(35381714-35381753)
chr7 (181-290)||(21649442-21649552)
chr7 (181-219)||(42272150-42272188)
chr7 (300-365)||(42272180-42272244)
chr7 (307-371)||(33455201-33455265)
[»] chr1 (114 HSPs)
chr1 (180-371)||(31307998-31308189)
chr1 (181-367)||(44661968-44662154)
chr1 (180-365)||(45538150-45538335)
chr1 (181-365)||(3611134-3611318)
chr1 (182-367)||(17994949-17995134)
chr1 (183-370)||(21139407-21139594)
chr1 (182-367)||(5981169-5981354)
chr1 (181-365)||(25058686-25058870)
chr1 (182-365)||(25678259-25678442)
chr1 (182-365)||(37620192-37620375)
chr1 (185-359)||(4068689-4068863)
chr1 (181-367)||(6327546-6327731)
chr1 (181-367)||(23984753-23984939)
chr1 (185-363)||(43251713-43251891)
chr1 (182-367)||(31040708-31040893)
chr1 (181-365)||(24245025-24245209)
chr1 (181-365)||(26277175-26277359)
chr1 (183-366)||(33884088-33884271)
chr1 (183-366)||(33959981-33960164)
chr1 (182-365)||(36566329-36566512)
chr1 (184-366)||(38790196-38790378)
chr1 (182-367)||(23932507-23932692)
chr1 (183-368)||(26524886-26525071)
chr1 (180-365)||(33112818-33113002)
chr1 (181-365)||(26085398-26085581)
chr1 (182-366)||(39646567-39646751)
chr1 (181-365)||(47671584-47671768)
chr1 (180-369)||(35692659-35692849)
chr1 (180-366)||(41999812-41999998)
chr1 (184-366)||(50774218-50774400)
chr1 (180-364)||(3285399-3285582)
chr1 (181-367)||(38331857-38332043)
chr1 (182-368)||(49253972-49254158)
chr1 (182-367)||(24885500-24885685)
chr1 (180-361)||(26794301-26794482)
chr1 (184-365)||(47317316-47317497)
chr1 (182-365)||(5980067-5980250)
chr1 (182-365)||(46967041-46967224)
chr1 (183-365)||(47383732-47383914)
chr1 (181-366)||(46616547-46616732)
chr1 (182-361)||(23220939-23221112)
chr1 (181-365)||(51057069-51057253)
chr1 (182-365)||(35273595-35273778)
chr1 (182-365)||(49398988-49399171)
chr1 (179-337)||(31844372-31844530)
chr1 (183-365)||(46784423-46784605)
chr1 (181-367)||(47187103-47187289)
chr1 (185-352)||(42863867-42864034)
chr1 (184-362)||(28888582-28888760)
chr1 (181-367)||(48373502-48373679)
chr1 (184-367)||(36003131-36003317)
chr1 (182-367)||(42313359-42313548)
chr1 (181-365)||(27983603-27983771)
chr1 (184-321)||(25518815-25518952)
chr1 (181-368)||(33073209-33073385)
chr1 (182-365)||(41467632-41467804)
chr1 (183-348)||(51403034-51403189)
chr1 (181-367)||(10928065-10928240)
chr1 (221-365)||(51045596-51045740)
chr1 (218-365)||(2450529-2450676)
chr1 (183-364)||(6626025-6626195)
chr1 (181-365)||(2657301-2657474)
chr1 (181-368)||(29770668-29770844)
chr1 (237-368)||(4808699-4808830)
chr1 (182-369)||(26685855-26686031)
chr1 (181-368)||(42234838-42235013)
chr1 (181-341)||(2556879-2557030)
chr1 (182-367)||(2954854-2955028)
chr1 (185-302)||(31979998-31980115)
chr1 (185-362)||(45475848-45476014)
chr1 (181-359)||(26472185-26472352)
chr1 (181-365)||(33187338-33187505)
chr1 (182-365)||(38716247-38716419)
chr1 (180-365)||(4243490-4243664)
chr1 (180-365)||(30289910-30290084)
chr1 (186-365)||(1388476-1388644)
chr1 (184-367)||(4953053-4953225)
chr1 (179-370)||(10920196-10920376)
chr1 (181-366)||(5961266-5961440)
chr1 (183-359)||(34752320-34752485)
chr1 (233-367)||(47772170-47772304)
chr1 (234-366)||(4156438-4156577)
chr1 (179-365)||(52323934-52324110)
chr1 (185-365)||(41895164-41895333)
chr1 (276-365)||(13312531-13312620)
chr1 (181-277)||(24649799-24649895)
chr1 (182-368)||(51155587-51155761)
chr1 (181-365)||(39475783-39475955)
chr1 (181-279)||(13313249-13313349)
chr1 (182-349)||(27924674-27924830)
chr1 (185-274)||(32448650-32448739)
chr1 (184-365)||(7561528-7561712)
chr1 (195-365)||(48683330-48683489)
chr1 (183-339)||(13281588-13281733)
chr1 (184-274)||(44544126-44544216)
chr1 (183-274)||(46428333-46428424)
chr1 (182-367)||(52367882-52368056)
chr1 (182-273)||(39637899-39637986)
chr1 (185-274)||(35991679-35991768)
chr1 (181-369)||(44293451-44293628)
chr1 (182-242)||(4156188-4156248)
chr1 (218-365)||(38718167-38718309)
chr1 (246-365)||(31286504-31286612)
chr1 (179-235)||(10919313-10919369)
chr1 (328-369)||(31844818-31844859)
chr1 (309-362)||(32448754-32448807)
chr1 (296-342)||(24215865-24215911)
chr1 (181-214)||(23994846-23994879)
chr1 (226-274)||(24215806-24215854)
chr1 (306-346)||(39359504-39359544)
chr1 (293-348)||(35991616-35991671)
chr1 (185-222)||(12891401-12891438)
chr1 (182-223)||(31286606-31286647)
chr1 (184-212)||(47772306-47772334)
[»] chr2 (82 HSPs)
chr2 (182-365)||(746464-746647)
chr2 (182-370)||(4034590-4034778)
chr2 (181-368)||(17600833-17601020)
chr2 (181-367)||(6594456-6594642)
chr2 (185-365)||(23901780-23901960)
chr2 (181-365)||(27400400-27400584)
chr2 (182-377)||(2324878-2325072)
chr2 (179-370)||(13815213-13815404)
chr2 (182-365)||(45370988-45371171)
chr2 (183-369)||(34518366-34518552)
chr2 (183-365)||(38997100-38997282)
chr2 (178-362)||(10424589-10424773)
chr2 (181-365)||(26710342-26710526)
chr2 (182-366)||(27651033-27651217)
chr2 (182-366)||(40635216-40635400)
chr2 (182-369)||(6430471-6430658)
chr2 (182-365)||(11184970-11185153)
chr2 (183-366)||(14660445-14660628)
chr2 (184-367)||(33427645-33427828)
chr2 (182-365)||(10244582-10244765)
chr2 (184-365)||(32327361-32327542)
chr2 (182-367)||(1091949-1092134)
chr2 (183-365)||(5726128-5726310)
chr2 (183-369)||(7892684-7892870)
chr2 (182-368)||(27024413-27024599)
chr2 (173-367)||(40037132-40037325)
chr2 (178-365)||(14697537-14697724)
chr2 (184-365)||(4609626-4609807)
chr2 (181-368)||(32608377-32608559)
chr2 (183-365)||(32948445-32948626)
chr2 (184-365)||(2914138-2914319)
chr2 (181-365)||(37620867-37621054)
chr2 (181-365)||(40735461-40735645)
chr2 (180-366)||(37255336-37255517)
chr2 (198-369)||(32856432-32856603)
chr2 (184-366)||(9444683-9444875)
chr2 (187-365)||(11159625-11159802)
chr2 (184-338)||(12842103-12842257)
chr2 (181-359)||(15925077-15925255)
chr2 (181-339)||(8432942-8433100)
chr2 (235-367)||(25294886-25295018)
chr2 (181-364)||(39103044-39103216)
chr2 (178-368)||(21734897-21735076)
chr2 (183-363)||(145281-145450)
chr2 (185-331)||(41172459-41172605)
chr2 (182-304)||(42899913-42900035)
chr2 (181-366)||(1229632-1229810)
chr2 (184-365)||(35158050-35158220)
chr2 (182-367)||(44481826-44482000)
chr2 (182-365)||(28641292-28641464)
chr2 (182-365)||(29687039-29687211)
chr2 (258-365)||(447633-447740)
chr2 (181-365)||(12333497-12333668)
chr2 (181-368)||(2688726-2688902)
chr2 (182-365)||(4258488-4258659)
chr2 (183-365)||(19428426-19428598)
chr2 (184-367)||(27331298-27331474)
chr2 (182-368)||(12730059-12730234)
chr2 (181-367)||(13543622-13543797)
chr2 (179-365)||(27764863-27765037)
chr2 (184-365)||(39301197-39301367)
chr2 (182-365)||(43898971-43899142)
chr2 (182-360)||(35126778-35126945)
chr2 (181-263)||(12814611-12814693)
chr2 (181-275)||(2000416-2000510)
chr2 (184-368)||(34249265-34249438)
chr2 (181-360)||(28566703-28566871)
chr2 (258-365)||(12827137-12827243)
chr2 (182-365)||(43356097-43356266)
chr2 (181-274)||(40544156-40544249)
chr2 (178-274)||(3266290-3266386)
chr2 (255-327)||(28014856-28014928)
chr2 (215-368)||(3711664-3711806)
chr2 (183-348)||(8056625-8056779)
chr2 (181-366)||(30545818-30545992)
chr2 (183-250)||(10176558-10176625)
chr2 (181-227)||(28019959-28020005)
chr2 (307-363)||(3266399-3266455)
chr2 (191-290)||(38985342-38985439)
chr2 (310-367)||(42900781-42900837)
chr2 (307-365)||(40544085-40544143)
chr2 (184-222)||(1897130-1897168)
[»] chr8 (69 HSPs)
chr8 (181-367)||(32984075-32984261)
chr8 (182-365)||(24079901-24080084)
chr8 (181-378)||(5946045-5946242)
chr8 (182-367)||(33981661-33981846)
chr8 (182-366)||(43328706-43328890)
chr8 (183-365)||(40435153-40435335)
chr8 (184-365)||(10646124-10646305)
chr8 (182-367)||(33730639-33730824)
chr8 (182-367)||(37956420-37956605)
chr8 (180-365)||(41862217-41862402)
chr8 (183-367)||(9303572-9303756)
chr8 (184-361)||(31830959-31831136)
chr8 (182-367)||(41231945-41232130)
chr8 (182-366)||(6365985-6366169)
chr8 (181-365)||(41653893-41654077)
chr8 (184-367)||(17718720-17718903)
chr8 (183-365)||(9734255-9734435)
chr8 (182-364)||(37301326-37301508)
chr8 (180-366)||(45236564-45236750)
chr8 (181-365)||(37419938-37420122)
chr8 (183-369)||(9013684-9013869)
chr8 (181-367)||(13356118-13356304)
chr8 (184-365)||(2714550-2714730)
chr8 (181-366)||(25185897-25186082)
chr8 (180-364)||(22878388-22878572)
chr8 (183-370)||(2275913-2276099)
chr8 (188-363)||(32114254-32114429)
chr8 (182-367)||(13760644-13760831)
chr8 (182-365)||(35628776-35628959)
chr8 (180-342)||(29048426-29048588)
chr8 (181-364)||(41639912-41640095)
chr8 (184-362)||(44088446-44088624)
chr8 (183-367)||(45066590-45066774)
chr8 (181-365)||(25248037-25248215)
chr8 (183-366)||(45258510-45258692)
chr8 (239-367)||(12032986-12033114)
chr8 (232-365)||(3904126-3904258)
chr8 (184-353)||(42701301-42701471)
chr8 (182-366)||(4447294-4447467)
chr8 (249-370)||(41981534-41981655)
chr8 (181-365)||(10378307-10378480)
chr8 (184-369)||(3211207-3211380)
chr8 (252-374)||(31336163-31336285)
chr8 (181-369)||(33896839-33897015)
chr8 (182-365)||(31940314-31940485)
chr8 (184-365)||(117329-117499)
chr8 (182-365)||(41843252-41843424)
chr8 (180-365)||(2379137-2379311)
chr8 (178-367)||(3490397-3490575)
chr8 (182-365)||(9713688-9713857)
chr8 (183-290)||(39915887-39915994)
chr8 (183-365)||(40458772-40458943)
chr8 (178-292)||(31148953-31149066)
chr8 (185-360)||(4975412-4975576)
chr8 (182-366)||(9509399-9509572)
chr8 (181-274)||(27243219-27243312)
chr8 (181-274)||(27254794-27254887)
chr8 (188-359)||(32373733-32373892)
chr8 (181-367)||(26196315-26196489)
chr8 (204-285)||(41981454-41981535)
chr8 (195-359)||(40649837-40649990)
chr8 (183-348)||(38631652-38631806)
chr8 (184-365)||(33622467-33622635)
chr8 (189-274)||(164728-164812)
chr8 (182-219)||(12032951-12032988)
chr8 (300-365)||(39901674-39901739)
chr8 (290-365)||(41425429-41425503)
chr8 (184-227)||(39901574-39901617)
chr8 (306-366)||(31148890-31148950)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (182-367)||(5882505-5882690)
chr6 (182-368)||(26377201-26377387)
chr6 (181-361)||(14891383-14891563)
chr6 (181-365)||(22551061-22551245)
chr6 (182-366)||(24168090-24168274)
chr6 (183-371)||(959898-960086)
chr6 (181-365)||(8615238-8615422)
chr6 (184-363)||(2892189-2892368)
chr6 (179-368)||(19415530-19415719)
chr6 (182-367)||(34527860-34528045)
chr6 (186-370)||(18101490-18101674)
chr6 (181-367)||(7393584-7393770)
chr6 (180-365)||(28947084-28947269)
chr6 (182-366)||(10507907-10508091)
chr6 (180-367)||(2593850-2594037)
chr6 (196-366)||(11988973-11989143)
chr6 (182-363)||(7345114-7345295)
chr6 (180-370)||(599889-600079)
chr6 (181-366)||(1970709-1970894)
chr6 (184-365)||(33452572-33452753)
chr6 (181-356)||(16703364-16703539)
chr6 (196-368)||(22341785-22341959)
chr6 (182-364)||(19281056-19281238)
chr6 (184-368)||(30743445-30743629)
chr6 (184-367)||(5294799-5294982)
chr6 (184-367)||(5299351-5299534)
chr6 (183-365)||(24224070-24224253)
chr6 (182-312)||(30467656-30467786)
chr6 (215-367)||(23261927-23262079)
chr6 (180-365)||(7167579-7167753)
chr6 (181-365)||(28948845-28949018)
chr6 (181-358)||(13329379-13329545)
chr6 (182-366)||(15965432-15965605)
chr6 (184-367)||(3291009-3291181)
chr6 (177-265)||(929653-929741)
chr6 (184-365)||(4487528-4487698)
chr6 (180-365)||(1398550-1398724)
chr6 (183-365)||(3786749-3786920)
chr6 (181-271)||(375807-375897)
chr6 (290-365)||(18661830-18661905)
chr6 (189-279)||(1939579-1939669)
chr6 (181-239)||(11743070-11743128)
chr6 (306-368)||(34262342-34262404)
chr6 (290-367)||(24913094-24913171)
chr6 (194-290)||(13844847-13844943)
chr6 (306-363)||(375729-375786)
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (181-365)||(24253380-24253564)
chr5 (181-365)||(43326379-43326563)
chr5 (178-366)||(7722044-7722232)
chr5 (184-364)||(15398483-15398663)
chr5 (182-366)||(35626037-35626221)
chr5 (180-366)||(3466680-3466866)
chr5 (181-363)||(6901797-6901979)
chr5 (182-371)||(39932578-39932767)
chr5 (181-365)||(27501055-27501239)
chr5 (182-365)||(5184971-5185154)
chr5 (182-365)||(40886028-40886210)
chr5 (181-366)||(739703-739888)
chr5 (184-365)||(18479668-18479849)
chr5 (181-365)||(27938895-27939080)
chr5 (181-366)||(43262182-43262367)
chr5 (183-365)||(12648797-12648979)
chr5 (183-365)||(15683791-15683973)
chr5 (181-366)||(25831519-25831703)
chr5 (180-367)||(28424793-28424978)
chr5 (184-365)||(2484292-2484473)
chr5 (182-364)||(27278474-27278660)
chr5 (194-365)||(31938908-31939079)
chr5 (185-365)||(13504742-13504922)
chr5 (179-366)||(5137711-5137898)
chr5 (181-366)||(890904-891088)
chr5 (181-365)||(40278858-40279041)
chr5 (224-369)||(29789291-29789436)
chr5 (191-368)||(38756484-38756662)
chr5 (181-363)||(40110232-40110413)
chr5 (225-365)||(34451292-34451432)
chr5 (183-368)||(763723-763908)
chr5 (182-367)||(33617584-33617758)
chr5 (181-365)||(27503377-27503550)
chr5 (180-370)||(13957667-13957846)
chr5 (176-346)||(4149687-4149847)
chr5 (184-369)||(38015510-38015684)
chr5 (181-365)||(19295728-19295901)
chr5 (173-367)||(23195246-23195429)
chr5 (180-367)||(5497270-5497446)
chr5 (184-365)||(31293989-31294170)
chr5 (180-367)||(38637908-38638084)
chr5 (182-364)||(9424593-9424764)
chr5 (183-367)||(6973063-6973236)
chr5 (182-370)||(24167779-24167956)
chr5 (181-368)||(1402502-1402678)
chr5 (182-327)||(40632498-40632634)
chr5 (181-356)||(42658671-42658835)
chr5 (182-365)||(2585461-2585633)
chr5 (181-294)||(12558090-12558202)
chr5 (184-365)||(9374502-9374672)
chr5 (182-366)||(36365444-36365617)
chr5 (180-371)||(18327167-18327347)
chr5 (181-290)||(36472348-36472457)
chr5 (182-366)||(27390596-27390769)
chr5 (184-367)||(40686900-40687071)
chr5 (184-365)||(14971979-14972149)
chr5 (181-271)||(42247865-42247955)
chr5 (194-352)||(5120036-5120182)
chr5 (210-365)||(3656568-3656712)
chr5 (182-342)||(6206883-6207032)
chr5 (186-268)||(9171111-9171193)
chr5 (188-364)||(33623940-33624105)
chr5 (209-368)||(612754-612900)
chr5 (209-363)||(36948492-36948633)
chr5 (184-250)||(9527124-9527190)
chr5 (217-365)||(38492647-38492783)
chr5 (207-274)||(3940411-3940478)
chr5 (194-265)||(15300962-15301033)
chr5 (307-366)||(42247790-42247849)
chr5 (216-282)||(20207088-20207154)
chr5 (182-243)||(27584384-27584447)
chr5 (187-243)||(28756082-28756138)
chr5 (331-366)||(40633525-40633560)
chr5 (291-368)||(9171032-9171108)
chr5 (336-365)||(21786003-21786032)
[»] chr3 (115 HSPs)
chr3 (182-367)||(47257792-47257977)
chr3 (180-369)||(49330034-49330223)
chr3 (180-367)||(42291839-42292026)
chr3 (178-368)||(38416721-38416911)
chr3 (181-367)||(40130957-40131143)
chr3 (181-365)||(24100281-24100464)
chr3 (181-367)||(7855112-7855298)
chr3 (182-367)||(47809594-47809780)
chr3 (180-365)||(22399094-22399278)
chr3 (180-365)||(28048392-28048577)
chr3 (180-369)||(43612043-43612232)
chr3 (181-365)||(41464350-41464534)
chr3 (181-364)||(51170034-51170217)
chr3 (181-367)||(32234396-32234581)
chr3 (181-366)||(29625826-29626011)
chr3 (182-366)||(40419834-40420018)
chr3 (181-365)||(51102378-51102562)
chr3 (183-378)||(27066965-27067160)
chr3 (180-366)||(48739232-48739418)
chr3 (183-368)||(39634569-39634753)
chr3 (182-371)||(40643799-40643988)
chr3 (182-366)||(2665999-2666183)
chr3 (181-365)||(37324539-37324723)
chr3 (192-363)||(48609732-48609903)
chr3 (182-365)||(52628953-52629135)
chr3 (181-364)||(55453245-55453428)
chr3 (182-367)||(53943586-53943770)
chr3 (181-365)||(37313397-37313581)
chr3 (184-366)||(40804509-40804691)
chr3 (182-368)||(44806683-44806869)
chr3 (182-367)||(7755305-7755489)
chr3 (182-371)||(20754387-20754576)
chr3 (181-370)||(43125829-43126017)
chr3 (182-366)||(35748310-35748494)
chr3 (181-365)||(41732526-41732710)
chr3 (181-365)||(44222827-44223011)
chr3 (183-367)||(51452749-51452932)
chr3 (188-363)||(43183917-43184092)
chr3 (182-367)||(39053393-39053578)
chr3 (184-365)||(46134357-46134538)
chr3 (180-367)||(35594118-35594305)
chr3 (185-367)||(41293317-41293498)
chr3 (179-364)||(43021710-43021896)
chr3 (181-367)||(52638840-52639026)
chr3 (184-367)||(52215077-52215260)
chr3 (206-368)||(46126010-46126171)
chr3 (182-367)||(41216454-41216639)
chr3 (183-363)||(53832486-53832666)
chr3 (182-365)||(36368938-36369120)
chr3 (184-366)||(18946904-18947086)
chr3 (182-340)||(24376572-24376730)
chr3 (181-365)||(5560025-5560216)
chr3 (182-365)||(51146215-51146398)
chr3 (181-363)||(54159000-54159172)
chr3 (182-363)||(47894822-47895003)
chr3 (183-332)||(53637841-53637990)
chr3 (181-371)||(48546834-48547013)
chr3 (180-367)||(25641643-25641819)
chr3 (181-368)||(51415967-51416143)
chr3 (181-329)||(37758927-37759075)
chr3 (182-369)||(42589829-42590005)
chr3 (187-348)||(46949379-46949538)
chr3 (181-368)||(49130576-49130752)
chr3 (182-365)||(55379984-55380156)
chr3 (181-366)||(25353552-25353726)
chr3 (182-367)||(53115446-53115620)
chr3 (181-366)||(54707219-54707393)
chr3 (181-365)||(34279721-34279894)
chr3 (183-365)||(38156632-38156803)
chr3 (182-367)||(54401186-54401360)
chr3 (182-367)||(55000176-55000350)
chr3 (182-369)||(41635796-41635972)
chr3 (180-365)||(47510940-47511114)
chr3 (184-368)||(31286790-31286963)
chr3 (181-365)||(37028721-37028894)
chr3 (250-367)||(33550465-33550582)
chr3 (182-367)||(39141123-39141298)
chr3 (181-367)||(30251499-30251674)
chr3 (243-367)||(52864550-52864673)
chr3 (184-364)||(51143818-51143987)
chr3 (182-363)||(45058882-45059052)
chr3 (181-340)||(17665549-17665697)
chr3 (183-365)||(24688114-24688285)
chr3 (182-364)||(42998790-42998960)
chr3 (184-365)||(43176738-43176908)
chr3 (184-360)||(40022075-40022240)
chr3 (182-368)||(44945932-44946101)
chr3 (181-365)||(51224038-51224210)
chr3 (181-294)||(2227995-2228108)
chr3 (181-366)||(21597147-21597321)
chr3 (184-282)||(41882063-41882161)
chr3 (185-365)||(50731914-50732083)
chr3 (185-365)||(50780773-50780942)
chr3 (232-314)||(47182049-47182131)
chr3 (192-294)||(47402810-47402911)
chr3 (181-282)||(28576184-28576285)
chr3 (182-282)||(48726070-48726170)
chr3 (184-365)||(40165653-40165822)
chr3 (290-369)||(48534003-48534082)
chr3 (184-366)||(177162-177333)
chr3 (211-365)||(52756067-52756214)
chr3 (182-259)||(52434138-52434216)
chr3 (278-366)||(30429226-30429314)
chr3 (183-259)||(48752085-48752161)
chr3 (180-235)||(37741432-37741487)
chr3 (185-294)||(8847718-8847827)
chr3 (214-366)||(41609098-41609239)
chr3 (182-227)||(51942543-51942588)
chr3 (313-369)||(40688431-40688487)
chr3 (323-366)||(41882010-41882053)
chr3 (306-359)||(52434291-52434344)
chr3 (324-364)||(37760346-37760386)
chr3 (306-364)||(48752226-48752284)
chr3 (322-363)||(43260841-43260882)
chr3 (182-210)||(33550581-33550609)
[»] chr4 (128 HSPs)
chr4 (177-365)||(23437586-23437774)
chr4 (183-367)||(34276547-34276731)
chr4 (185-365)||(21366609-21366789)
chr4 (182-365)||(9798464-9798647)
chr4 (181-367)||(237475-237661)
chr4 (181-366)||(42085205-42085390)
chr4 (184-364)||(6019929-6020109)
chr4 (180-364)||(32366661-32366845)
chr4 (178-366)||(39077540-39077728)
chr4 (182-366)||(55056258-55056442)
chr4 (181-368)||(53461813-53462000)
chr4 (182-365)||(53854430-53854612)
chr4 (181-366)||(2826681-2826865)
chr4 (182-367)||(42765840-42766024)
chr4 (182-370)||(31070069-31070256)
chr4 (181-365)||(31532135-31532319)
chr4 (185-365)||(44984763-44984943)
chr4 (181-365)||(51363005-51363188)
chr4 (181-365)||(54574940-54575124)
chr4 (182-365)||(27373075-27373257)
chr4 (183-365)||(18462013-18462195)
chr4 (181-363)||(41702461-41702643)
chr4 (180-369)||(19387684-19387873)
chr4 (182-371)||(43471689-43471878)
chr4 (182-371)||(50457804-50457993)
chr4 (183-367)||(146427-146611)
chr4 (181-365)||(26091258-26091442)
chr4 (181-365)||(29478358-29478542)
chr4 (181-365)||(47344654-47344838)
chr4 (182-369)||(2243457-2243644)
chr4 (181-368)||(50233998-50234185)
chr4 (177-363)||(397396-397582)
chr4 (182-365)||(41949381-41949566)
chr4 (184-368)||(22618511-22618693)
chr4 (183-362)||(6285307-6285486)
chr4 (179-366)||(31914194-31914380)
chr4 (180-367)||(45797476-45797663)
chr4 (182-365)||(55519826-55520009)
chr4 (180-367)||(55776042-55776228)
chr4 (180-367)||(55840220-55840406)
chr4 (181-371)||(3170624-3170814)
chr4 (182-368)||(3692207-3692393)
chr4 (182-368)||(29777254-29777440)
chr4 (184-365)||(42222292-42222473)
chr4 (180-365)||(49881059-49881248)
chr4 (181-365)||(54086408-54086590)
chr4 (182-365)||(407753-407934)
chr4 (186-365)||(31972336-31972515)
chr4 (182-365)||(41560327-41560510)
chr4 (182-365)||(54607961-54608144)
chr4 (182-368)||(38591667-38591849)
chr4 (177-365)||(54424976-54425163)
chr4 (184-347)||(22468788-22468951)
chr4 (182-365)||(23609086-23609269)
chr4 (181-368)||(47662099-47662286)
chr4 (182-365)||(56022998-56023181)
chr4 (183-361)||(35446506-35446683)
chr4 (184-361)||(50534632-50534809)
chr4 (181-365)||(42033173-42033357)
chr4 (181-367)||(14017374-14017558)
chr4 (182-367)||(1932762-1932947)
chr4 (180-367)||(48657822-48658002)
chr4 (182-365)||(48313556-48313737)
chr4 (179-364)||(53834055-53834240)
chr4 (181-365)||(41632007-41632190)
chr4 (181-361)||(50536628-50536808)
chr4 (181-365)||(54805614-54805802)
chr4 (182-348)||(39587796-39587962)
chr4 (184-367)||(48654815-48655004)
chr4 (185-356)||(33897504-33897675)
chr4 (184-369)||(48259508-48259691)
chr4 (182-367)||(36532828-36533003)
chr4 (224-371)||(52728301-52728447)
chr4 (184-363)||(51951683-51951861)
chr4 (182-365)||(9997931-9998103)
chr4 (181-367)||(37239088-37239263)
chr4 (181-365)||(45633779-45633952)
chr4 (182-365)||(15060289-15060461)
chr4 (183-367)||(54715035-54715208)
chr4 (181-368)||(34835175-34835351)
chr4 (184-367)||(43890929-43891101)
chr4 (182-372)||(38547594-38547773)
chr4 (184-371)||(20351836-20352012)
chr4 (183-365)||(5117438-5117609)
chr4 (182-365)||(34552318-34552490)
chr4 (182-369)||(46720024-46720203)
chr4 (184-366)||(14335100-14335271)
chr4 (182-367)||(27873548-27873720)
chr4 (182-368)||(31881311-31881486)
chr4 (183-369)||(47811906-47812081)
chr4 (180-365)||(54216736-54216910)
chr4 (181-365)||(22620591-22620764)
chr4 (268-370)||(35595772-35595874)
chr4 (182-361)||(27398607-27398775)
chr4 (182-365)||(33289702-33289873)
chr4 (181-363)||(54216311-54216482)
chr4 (182-367)||(4486579-4486753)
chr4 (182-366)||(46708740-46708913)
chr4 (182-365)||(52688348-52688520)
chr4 (238-365)||(42509351-42509478)
chr4 (183-367)||(6371247-6371420)
chr4 (181-365)||(49014096-49014269)
chr4 (182-367)||(1662259-1662431)
chr4 (184-367)||(27580120-27580292)
chr4 (182-366)||(52461365-52461535)
chr4 (182-365)||(573802-573974)
chr4 (182-282)||(43231502-43231601)
chr4 (184-267)||(42557583-42557666)
chr4 (181-274)||(3293103-3293196)
chr4 (181-274)||(11972209-11972302)
chr4 (292-364)||(33048990-33049062)
chr4 (231-321)||(52396774-52396865)
chr4 (184-347)||(33557960-33558112)
chr4 (263-364)||(35344868-35344968)
chr4 (288-369)||(48259700-48259780)
chr4 (184-289)||(49057933-49058038)
chr4 (211-365)||(27872607-27872750)
chr4 (260-368)||(42558270-42558370)
chr4 (181-234)||(17555617-17555670)
chr4 (297-368)||(3291802-3291873)
chr4 (224-365)||(51981479-51981609)
chr4 (194-268)||(18206608-18206682)
chr4 (182-271)||(43478059-43478147)
chr4 (1-40)||(19685675-19685714)
chr4 (207-242)||(54710005-54710040)
chr4 (324-365)||(18206512-18206553)
chr4 (233-273)||(47105108-47105148)
chr4 (182-222)||(47105318-47105358)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (182-368)||(13759-13945)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (182-367)||(39554-39739)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (185-365)||(1871-2051)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (185-365)||(11133-11312)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (182-365)||(2432-2615)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (182-367)||(75242-75427)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (182-367)||(278005-278192)
scaffold0007 (195-366)||(176666-176837)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (182-369)||(18850-19037)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (182-337)||(32560-32715)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (184-365)||(4596-4771)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (184-366)||(3089-3262)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (182-365)||(7089-7262)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (183-365)||(20477-20648)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (181-365)||(14742-14915)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (181-365)||(4554-4728)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (181-365)||(3390-3564)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (181-365)||(100-272)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (182-331)||(17905-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (194-268)||(19228-19302)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 98)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 35355703 - 35356081
Alignment:
Q  1 tggagcaaaggtgataagtttaggacttttaaatcaggtattttcacactccccttctattaatttagtaaatatt---------agaattaatattttc 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  35355703 tggagcaaaggtgataagtttaggacttttaaatcaggtattttcacactccccttctattaatttagtaaatatttagatcattagaattaatattttc 35355802  T
Q  92 ttctaattaagaatgttacttcatactaggctggatcatannnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaggaaaaatattagtattgttggtaataggttttttct 191  Q
    ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35355803 ttctaa----gaatgttacttcatactaggctggatcatattttttctattgttcttt-gaaaggaaaaatattagtattgttggtaataggttttttct 35355897  T
Q  192 agattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaat 291  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35355898 agattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaat 35355997  T
Q  292 gtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataagaat 375  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35355998 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacctaataagaat 35356081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25894101 - 25893917
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25894101 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 25894002  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25894001 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25893917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 180 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33423460 - 33423276
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33423460 taggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 33423361  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423360 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33839899 - 33839713
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33839899 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 33839800  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33839799 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 33839713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 180 - 369
Target Start/End: Original strand, 17855426 - 17855615
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17855426 taggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 17855525  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17855526 ctacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 17855615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 181 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22979831 - 22979638
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22979831 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 22979732  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataagaa 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22979731 cacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccataaaagaa 22979638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Original strand, 46913108 - 46913296
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46913108 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 46913207  T
Q  281 cacttaaaaa--tgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913208 cacttaaaaatgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 46913296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47067160 - 47066975
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47067160 ggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 47067061  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47067060 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 47066975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33696005 - 33695821
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33696005 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 33695906  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33695905 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 33695821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 178 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23393238 - 23393051
Alignment:
Q  178 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23393238 aatagattttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 23393139  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393138 taccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23393051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49171543 - 49171360
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49171543 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 49171444  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49171443 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 49171360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 27018114 - 27018299
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27018114 taggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggata 27018213  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27018214 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 27018299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35328252 - 35328068
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35328252 ggttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 35328153  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35328152 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 35328068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 203 - 367
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389541
Alignment:
Q  203 gaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 302  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  303 gccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 36389541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 45690277 - 45690097
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45690277 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 45690178  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45690177 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47740515 - 47740331
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  47740515 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatat 47740416  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47740415 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 47740331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 48609861 - 48609677
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  48609861 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtatac 48609762  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609761 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48609677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2341846 - 2341659
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2341846 aggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 2341747  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-gggtaccctagttgtcacctt 367  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2341746 aacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtcacctt 2341659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 182 - 369
Target Start/End: Original strand, 40670563 - 40670750
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40670563 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 40670662  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40670663 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcaccttat 40670750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20165995 - 20165814
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20165995 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 20165896  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20165895 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 20165814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 33411258 - 33411443
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33411258 taggttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 33411357  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33411358 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 33411443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 45482656 - 45482843
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45482656 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 45482755  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
     ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45482756 tcacttaaaaatatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 45482843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Original strand, 33332788 - 33332973
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33332788 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gatac 33332886  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33332887 cacttaaaaatatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 33332973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35757203 - 35757018
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35757203 ggttttttctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gatacc 35757105  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggtt-ggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35757104 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 35757018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 31586848 - 31587033
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31586848 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 31586947  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  31586948 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtaccctagttctcacctt 31587033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 37846199 - 37846015
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  37846199 ggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggatacc 37846100  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37846099 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 37846015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 10028488 - 10028673
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10028488 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacc 10028587  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg--taccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10028588 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtataccctagttgtcacc 10028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 19563446 - 19563630
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  19563446 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatat 19563545  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19563546 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtcacc 19563630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 185 - 356
Target Start/End: Original strand, 15877553 - 15877724
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15877553 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 15877652  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877653 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 15877724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 178 - 365
Target Start/End: Original strand, 43499481 - 43499668
Alignment:
Q  178 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43499481 aataggttttttttagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 43499580  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43499581 taccacttaaaaatatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttctcacc 43499668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26579900 - 26579715
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  26579900 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtatacc 26579801  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26579800 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 26579715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41991039 - 41990870
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41991039 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 41990940  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacc 353  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41990939 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggtacc 41990870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 199 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5183991 - 5183823
Alignment:
Q  199 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgctta 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5183991 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 5183892  T
Q  299 tgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5183891 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttatcacctt 5183823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 5712167 - 5712351
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || |||||    
T  5712167 aggttttttctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggatac 5712266  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5712267 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 5712351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 184 - 366
Target Start/End: Original strand, 31625706 - 31625887
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31625706 ttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 31625805  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31625806 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacct 31625887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 182 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31429658 - 31429469
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  31429658 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggatacc 31429559  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  31429558 acttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtcaccatataa 31429469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 45063539 - 45063357
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  45063539 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggatac 45063440  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  45063439 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtcacc 45063357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 35767481 - 35767659
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35767481 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggta-------ccccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 35767573  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35767574 acttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 35767659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 364
Target Start/End: Original strand, 33870243 - 33870424
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  33870243 taggttttttctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 33870342  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  33870343 ccatttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct---atgggtactctagttgtcac 33870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 10618298 - 10618475
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||    
T  10618298 ggttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-------atagttcatgaatacc 10618390  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10618391 acttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacct 10618475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 207 - 365
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29447020
Alignment:
Q  207 aatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggcca 306  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  307 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29446963 atgtgtattggttggagt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 177 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33720224 - 33720070
Alignment:
Q  177 taataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatag 276  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  33720224 taataggttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatgg 33720125  T
Q  277 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattac 331  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33720124 ataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35752206 - 35752032
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  35752206 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 35752115  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  35752114 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 35752032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 228 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233936
Alignment:
Q  228 caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaa 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  328 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28233973 ctacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 28233936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 234 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076526
Alignment:
Q  234 atgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattaccc 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  334 accattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30076558 atcattcttccatggataccctagttgtcacct 30076526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46898189 - 46898014
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  |||     
T  46898189 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata- 46898091  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
              |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46898090 ----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 46898014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 182 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24923196 - 24923018
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||            
T  24923196 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattca-------- 24923105  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24923104 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtcaccttataa 24923018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 180 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7876502 - 7876325
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||          
T  7876502 taggttgtttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca------ 7876409  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
         | || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  7876408 -----tgaatatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtcacctta 7876325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 43489218 - 43489390
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  43489218 ggttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 43489309  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  43489310 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 43489390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 366
Target Start/End: Original strand, 37127939 - 37128110
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||              
T  37127939 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 37128028  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
     |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37128029 -taaatatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacct 37128110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 46817594 - 46817420
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||           
T  46817594 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 46817502  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
        | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  46817501 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacct 46817420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36817018 - 36816845
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  36817018 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 36816926  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
        | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  36816925 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 36816845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 341
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564497
Alignment:
Q  200 tttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttat 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  300 gtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct 341  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44003543 - 44003369
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  44003543 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatac 44003444  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||| |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44003443 cacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacct 44003369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 48085858 - 48086031
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||            
T  48085858 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca-------- 48085949  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||    
T  48085950 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattatcacct 48086031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Original strand, 24228539 - 24228714
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||          
T  24228539 taggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------ 24228632  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
         | || || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24228633 -----tgaatatatgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacct 24228714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 364
Target Start/End: Original strand, 33393328 - 33393499
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33393328 ggttttttctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 33393427  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    || ||||||           ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33393428 acctaaaaa-----------ggttaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 249 - 368
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904391
Alignment:
Q  249 ttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  349 gtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtcacctta 41904391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 178 - 365
Target Start/End: Original strand, 7257377 - 7257553
Alignment:
Q  178 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |    
T  7257377 aataggttttttctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaa 7257476  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||| |||||| |||           ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7257477 taccacctaaaaaggtg-----------aatgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 7257553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 246 - 367
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405533
Alignment:
Q  246 aatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttcca 345  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  346 tgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  44405512 tgggtattctagttgtcacctt 44405533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 182 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26941704 - 26941541
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  26941704 ggttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 26941613  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 356  Q
       | || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  26941612 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 26941541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 2332019 - 2332191
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||            
T  2332019 ggttttttctaaattatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttca-------- 2332110  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2332111 ---tgaatatgtgcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtcacc 2332191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 370
Target Start/End: Original strand, 26371046 - 26371226
Alignment:
Q  179 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagat 278  Q
    |||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||         
T  26371046 atagattttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttca----- 26371140  T
Q  279 accacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 370  Q
          | || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  26371141 ------tgaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccaccatata 26371226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 180 - 369
Target Start/End: Original strand, 44659842 - 44660019
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||          
T  44659842 taggttttttctaaattacctttgaagaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttca------ 44659934  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
         | || || |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  44659935 -----tgaatatatgcttatgtggctaatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggtagcctagttgccaccttat 44660019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45502987 - 45502817
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||           |||||||    
T  45502987 gttttttctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaa-----------gatacca 45502899  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
     |||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45502898 tttaaaaatatgcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtcac 45502817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45237703 - 45237530
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||              
T  45237703 ttttttctaaattacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattca---------- 45237614  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
     | || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  45237613 -tgaatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcacctta 45237530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 21718117 - 21718288
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  21718117 ggttttttctaaattacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 21718208  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  21718209 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccattatt-tttcatgggtagcctagttgtcacc 21718288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 29610635 - 29610807
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||            
T  29610635 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttca-------- 29610726  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  29610727 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcatagttgccacc 29610807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15644119 - 15643948
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  15644119 aggttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatac 15644020  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    ||| |||||| |||           ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  15644019 cacctaaaaaggtg-----------aatgtttattgattggggtaaattacccaccattttttcatgggtacactagttgtca 15643948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25037681 - 25037506
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||           
T  25037681 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttca------- 25037589  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
        | || |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  25037588 ----tgaatatgtgcttatgtggctgatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaggtgccacctt 25037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16482957 - 16482847
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||    
T  16482957 taggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggata 16482858  T
Q  280 ccacttaaaaa 290  Q
    |||| ||||||    
T  16482857 ccacctaaaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 39453647 - 39453484
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||              
T  39453647 ggttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt---------- 39453558  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
            ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39453557 --------atgtgtttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 498360 - 498188
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||            
T  498360 ggttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 498269  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  498268 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatggctagcctagttgccacc 498188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 183 - 370
Target Start/End: Original strand, 29098752 - 29098924
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||            
T  29098752 gttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat-------- 29098843  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 370  Q
           || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||| ||| ||||    
T  29098844 -------atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgttaccatata 29098924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32556780 - 32556640
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||          
T  32556780 taggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttca------ 32556687  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattac 331  Q
         | || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32556686 -----tgaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47906931 - 47906755
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||            
T  47906931 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca-------- 47906840  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggt-aaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| |||| || ||||| || |||||||| |||||||    
T  47906839 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaaattacccatcattttttcatggatagcctagttgccacctta 47906755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47460942 - 47460772
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  47460942 ttttttttagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 47460843  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     ||||||  ||           ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  47460842 ctaaaaagatg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacc 47460772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 274
Target Start/End: Original strand, 39323616 - 39323708
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39323616 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcat 39323708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 361
Target Start/End: Original strand, 41855061 - 41855228
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||              
T  41855061 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttca---------- 41855150  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtac-cctagttgt 361  Q
     |||| || |||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41855151 -taaatatatgcttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatggatactcctagttgt 41855228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 224 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37443732 - 37443598
Alignment:
Q  224 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggg 323  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||    
T  37443732 ccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgggg 37443644  T
Q  324 taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37443643 taaattacccaccatttttttatgggtaccctagttgtcaccttat 37443598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 274
Target Start/End: Original strand, 39866667 - 39866757
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39866667 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 39866757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 364
Target Start/End: Original strand, 46103127 - 46103291
Alignment:
Q  188 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaa 287  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||           | |    
T  46103127 ttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaattta-ccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttca-----------tga 46103214  T
Q  288 aaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  46103215 atatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggtagtctagttgtcac 46103291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 363
Target Start/End: Original strand, 35484635 - 35484807
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaa-tttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||          
T  35484635 aggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttca------ 35484728  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
         | || ||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35484729 -----tgaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattgtca 35484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 283
Target Start/End: Original strand, 29863017 - 29863116
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||| ||||||||| ||||||||    
T  29863017 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggataccac 29863116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 274
Target Start/End: Original strand, 33455098 - 33455188
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33455098 ttttttctaaattacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcat 33455188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 178 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7720679 - 7720574
Alignment:
Q  178 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | | | |||| |||||||||||| ||    
T  7720679 aataagttttttcttgattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatgga 7720580  T
Q  278 taccac 283  Q
    ||||||    
T  7720579 taccac 7720574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Original strand, 35823289 - 35823353
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 245  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35823289 aggttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30077108 - 30077043
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30077108 ggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 250
Target Start/End: Original strand, 35557730 - 35557798
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 250  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35557730 ggttttttttagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448446
Alignment:
Q  194 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 293  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T
Q  294 gcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |           ||| | ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  38448508 g-----------aatatttattgattggggtaaattatccaccatttttccataagtaccctaattgtcacctt 38448446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 39323712 - 39323781
Alignment:
Q  297 tatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  39323712 tatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcacctt 39323781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 291
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456218
Alignment:
Q  230 accaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaat 291  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatacttcttaaaaat 26456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 351
Target Start/End: Original strand, 39866762 - 39866806
Alignment:
Q  307 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 351  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39866762 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggta 39866806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 35381714 - 35381753
Alignment:
Q  1 tggagcaaaggtgataagtttaggacttttaaatcaggta 40  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35381714 tggagcaaaggtgataagtctaggacttttaaatcaggta 35381753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21649552 - 21649442
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaa-tggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||   |  |||||||||||||||||||||| || || |  | ||||||||| || ||||    
T  21649552 aggttttttttagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaatttattagtagatttaagatagtttatggata 21649453  T
Q  280 ccacttaaaaa 290  Q
    |||| ||||||    
T  21649452 ccacctaaaaa 21649442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 219
Target Start/End: Original strand, 42272150 - 42272188
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42272150 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggctaat 42272188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 365
Target Start/End: Original strand, 42272180 - 42272244
Alignment:
Q  300 gtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42272180 gtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccataattcttccat-gataccctagttgtcacc 42272244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 371
Target Start/End: Original strand, 33455201 - 33455265
Alignment:
Q  307 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  33455201 atgtgtattggtttgggtaaattgtccatcattctttcataggtagcctagttgtcacctaataa 33455265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 114)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 180 - 371
Target Start/End: Original strand, 31307998 - 31308189
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31307998 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 31308097  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308098 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 31308189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Original strand, 44661968 - 44662154
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44661968 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 44662067  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44662068 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 44662154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 45538150 - 45538335
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45538150 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 45538249  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538250 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45538335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 3611134 - 3611318
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3611134 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 3611233  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3611234 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3611318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17995134 - 17994949
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17995134 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacc 17995035  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17995034 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacctt 17994949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21139594 - 21139407
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21139594 gttttttctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 21139495  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 370  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21139494 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccatata 21139407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 5981169 - 5981354
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5981169 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 5981268  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981269 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 5981354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 25058686 - 25058870
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  25058686 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggatac 25058785  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058786 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25058870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25678442 - 25678259
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25678442 ggttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 25678343  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25678342 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 25678259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37620375 - 37620192
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37620375 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 37620276  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37620275 acttaaaaatgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtcacc 37620192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 185 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4068863 - 4068689
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4068863 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 4068764  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4068763 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 4068689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6327731 - 6327546
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6327731 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 6327632  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327631 cacttaaaaatgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 6327546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Original strand, 23984753 - 23984939
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23984753 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 23984852  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23984853 cacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 23984939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 185 - 363
Target Start/End: Original strand, 43251713 - 43251891
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  43251713 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccact 43251812  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251813 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 43251891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 31040708 - 31040893
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31040708 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 31040807  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31040808 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtcacctt 31040893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24245209 - 24245025
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24245209 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 24245110  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24245109 cacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 24245025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 26277175 - 26277359
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26277175 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 26277274  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26277275 cacttaaaaatttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26277359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 366
Target Start/End: Original strand, 33884088 - 33884271
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884088 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 33884187  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  33884188 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacct 33884271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33960164 - 33959981
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33960164 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 33960065  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  33960064 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacct 33959981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 36566329 - 36566512
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36566329 ggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 36566428  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566429 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36566512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 184 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 38790378 - 38790196
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  38790378 ttttttctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 38790279  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38790278 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 38790196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23932692 - 23932507
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23932692 ggttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacacc 23932593  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23932592 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 23932507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 183 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26525071 - 26524886
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26525071 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagatacca 26524972  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26524971 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtcacctta 26524886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33113002 - 33112818
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33113002 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 33112903  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33112902 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat-ggtaccctagttgtcacc 33112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26085581 - 26085398
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  26085581 aggtttttactagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatac 26085483  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085482 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26085398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 39646567 - 39646751
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39646567 ggttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggatacc 39646666  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39646667 acttaaaaatgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 39646751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 47671584 - 47671768
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  47671584 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggatac 47671683  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47671684 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47671768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 180 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35692849 - 35692659
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcc-accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35692849 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 35692750  T
Q  279 accacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35692749 accgcttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtcaccttat 35692659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Original strand, 41999812 - 41999998
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41999812 taggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggata 41999911  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41999912 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacct 41999998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 184 - 366
Target Start/End: Original strand, 50774218 - 50774400
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50774218 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 50774317  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50774318 ttaaaaatatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtcacct 50774400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 180 - 364
Target Start/End: Original strand, 3285399 - 3285582
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3285399 taggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 3285498  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3285499 ccactt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 3285582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38332043 - 38331857
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  38332043 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatat 38331944  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38331943 cacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacctt 38331857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 182 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 49254158 - 49253972
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  49254158 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacc 49254059  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  49254058 acttaaaaatgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattatcacctta 49253972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 24885500 - 24885685
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24885500 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 24885599  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24885600 acttaaaaatatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 24885685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 180 - 361
Target Start/End: Original strand, 26794301 - 26794482
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26794301 taggttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggata 26794400  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794401 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Original strand, 47317316 - 47317497
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  47317316 ttttttttatattacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 47317415  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47317416 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47317497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 5980067 - 5980250
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5980067 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggatacc 5980166  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  5980167 acttaaaaattagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctagctgtcacc 5980250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 46967224 - 46967041
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46967224 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 46967125  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46967124 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 46967041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47383914 - 47383732
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47383914 gttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 47383815  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47383814 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtcacc 47383732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Original strand, 46616547 - 46616732
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  46616547 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatat 46616646  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  46616647 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacct 46616732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 182 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23221112 - 23220939
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23221112 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 23221013  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221012 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg------tatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 23220939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 51057069 - 51057253
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  51057069 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggatac 51057168  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51057169 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 51057253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 35273595 - 35273778
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35273595 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 35273694  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273695 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35273778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 49399171 - 49398988
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||    
T  49399171 ggttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggatacc 49399072  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49399071 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtcacc 49398988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 31844372 - 31844530
Alignment:
Q  179 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  31844372 ataggttttttctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggat 31844471  T
Q  279 accacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844472 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 31844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Original strand, 46784423 - 46784605
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| |||||||    
T  46784423 gttttttctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggatacca 46784522  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46784523 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtcacc 46784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Original strand, 47187103 - 47187289
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  47187103 aggttttttctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatac 47187202  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47187203 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtcacctt 47187289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 352
Target Start/End: Original strand, 42863867 - 42864034
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  42863867 tttttctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactact 42863966  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtac 352  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42863967 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtac 42864034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 184 - 362
Target Start/End: Original strand, 28888582 - 28888760
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28888582 ttttttctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 28888681  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 362  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28888682 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Original strand, 48373502 - 48373679
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48373502 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggatac 48373601  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48373602 cacttaaaaatgtgctt---------atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtcacctt 48373679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Original strand, 36003131 - 36003317
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36003131 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccac 36003230  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc---catgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  36003231 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtcacctt 36003317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42313548 - 42313359
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgg----gtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  42313548 ggttttttctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaa 42313449  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42313448 taccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 42313359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27983771 - 27983603
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||    
T  27983771 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggg----------------atac 27983688  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27983687 catttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27983603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Original strand, 25518815 - 25518952
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25518815 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25518914  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgg 321  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25518915 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Original strand, 33073209 - 33073385
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||     
T  33073209 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata- 33073307  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
              |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33073308 ----------tgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 33073385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 41467804 - 41467632
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  41467804 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 41467713  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41467712 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41467632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 183 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 51403189 - 51403034
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51403189 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 51403090  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 348  Q
    ||| |||||||||||         || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51403089 ctt-aaaatgtgctt---------atatgtattggttgggataaattactcaccattcttccatgg 51403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Original strand, 10928065 - 10928240
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||           
T  10928065 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttca------- 10928157  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
        | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10928158 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 10928240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 221 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 51045740 - 51045596
Alignment:
Q  221 tatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  51045740 tatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatta 51045641  T
Q  321 gggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  51045640 gggtaaattacccaccattcttctacgggtatcctagttgtcacc 51045596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 218 - 365
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450676
Alignment:
Q  218 atttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattgg 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  318 ttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2450676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 183 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6626195 - 6626025
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||             
T  6626195 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca--------- 6626105  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
      | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6626104 --tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 2657301 - 2657474
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  2657301 aggttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 2657393  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
        | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2657394 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Original strand, 29770668 - 29770844
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  29770668 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 29770760  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
        | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  29770761 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagcctagttgccacctta 29770844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 368
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808830
Alignment:
Q  237 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 336  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  337 attcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtcacctta 4808830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 182 - 369
Target Start/End: Original strand, 26685855 - 26686031
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  26685855 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacc 26685954  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    || |||||| |||           ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26685955 acctaaaaaagtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccttat 26686031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Original strand, 42234838 - 42235013
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  42234838 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 42234930  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
        | || ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42234931 ----tgaatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctta 42235013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2557030 - 2556879
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2557030 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaatac 2556931  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct 341  Q
    |||||||||||||| ||         ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2556930 cacttaaaaatgtgttt---------atgtgtattggttggggtaaattacccactattct 2556879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 2954854 - 2955028
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2954854 ggttttttctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggatacc 2954953  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||| |||           | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2954954 acttaaaaaggtg-----------attgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 2955028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 185 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31980115 - 31979998
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31980115 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccact 31980016  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtg 302  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  31980015 taaaaatgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 185 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 45476014 - 45475848
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  45476014 tttttctagattacctttgaagaatggt--------tacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccact 45475923  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 362  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  45475922 tacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccattctttc--tggtaccctagttgtc 45475848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26472352 - 26472185
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  26472352 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 26472260  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 359  Q
        | || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||    
T  26472259 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagtt 26472185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 33187338 - 33187505
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  33187338 aggttttttctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagatac 33187437  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||                 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33187438 cacttaaa-----------------aatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33187505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38716419 - 38716247
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  38716419 ggttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacc 38716320  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    || |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38716319 acctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccttgttgtcacc 38716247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4243664 - 4243490
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |          
T  4243664 taggttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttta------ 4243571  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
         | || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  4243570 -----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtcacc 4243490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 30290084 - 30289910
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||          
T  30290084 taggtgttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttca------ 30289991  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
         | || ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30289990 -----tgaatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtcacc 30289910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 365
Target Start/End: Original strand, 1388476 - 1388644
Alignment:
Q  186 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccactt 285  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  1388476 ttttctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacct 1388575  T
Q  286 aaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||| |||           ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1388576 aaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 1388644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Original strand, 4953053 - 4953225
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||              
T  4953053 ttttctctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca---------- 4953142  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
     | || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  4953143 -tgaatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacctt 4953225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 370
Target Start/End: Original strand, 10920196 - 10920376
Alignment:
Q  179 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagat 278  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  10920196 ataggttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggat 10920295  T
Q  279 accacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 370  Q
    ||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  10920296 accacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtcaccatata 10920376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5961440 - 5961266
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  5961440 aggttttttctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatac 5961341  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||| |||||| |||           ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5961340 cacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacct 5961266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34752485 - 34752320
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||             
T  34752485 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttca--------- 34752395  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 359  Q
      | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  34752394 --tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagtt 34752320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 233 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772170
Alignment:
Q  233 aatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacc 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  333 caccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47772204 caccattcttccatgggtaccttaattgtcacctt 47772170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 234 - 366
Target Start/End: Original strand, 4156438 - 4156577
Alignment:
Q  234 atgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-------tagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaa 326  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4156438 atgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 4156537  T
Q  327 attacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4156538 attacccatcatttttccatgggtactctagttgtcacct 4156577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 365
Target Start/End: Original strand, 52323934 - 52324110
Alignment:
Q  179 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagat 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||  ||    
T  52323934 ataggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaat 52324033  T
Q  279 accacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||| |||||| |||           |||||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52324034 accacctaaaaaggtg----------aaatgttcattgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtcacc 52324110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 41895333 - 41895164
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||  |||         
T  41895333 tttttctaaattacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaata----- 41895239  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
          |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41895238 ------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41895164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 276 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13312620 - 13312531
Alignment:
Q  276 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13312620 gataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 13312531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24649895 - 24649799
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24649895 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcataga 24649799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 51155761 - 51155587
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||            
T  51155761 ggttttttctaaattacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttca-------- 51155670  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
       | || ||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  51155669 ---tgaatatgtgtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccttagctgtcacctta 51155587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39475955 - 39475783
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  39475955 aggttttttctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggt-gggtcaagatagtttatggatac 39475857  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||| ||||||||||           || || ||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39475856 cacctaaaaatgtg-----------aacgtttattggttgggataaataacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 39475783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13313349 - 13313249
Alignment:
Q  181 aggttttttctagatta--cctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagat 278  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13313349 aggttttttctagattatacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggat 13313250  T
Q  279 a 279  Q
    |    
T  13313249 a 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27924830 - 27924674
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  27924830 ggttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacc 27924731  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg 349  Q
    || |||||| |||           ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27924730 acctaaaaaggtg-----------aatggttattggttggggtaaattacccaccattttttcatggg 27924674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 274
Target Start/End: Original strand, 32448650 - 32448739
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32448650 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 32448739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7561712 - 7561528
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa-----gatagttcatagat 278  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||      ||| || |||| |    
T  7561712 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatagtt 7561613  T
Q  279 accacttaaaaatgtgctta--tgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
        | | || |||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7561612 ----catgaatatgtgcttacgtggggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 7561528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 48683489 - 48683330
Alignment:
Q  195 ttacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtg 294  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  ||    
T  48683489 ttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg 48683390  T
Q  295 cttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
               ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48683389 -----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48683330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13281733 - 13281588
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||             
T  13281733 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttca--------- 13281643  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 339  Q
      | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  13281642 --tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcatt 13281588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44544216 - 44544126
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44544216 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 44544126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 46428424 - 46428333
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  46428424 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcat 46428333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 52367882 - 52368056
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  52367882 ggttttttctggattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacc 52367981  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    || |||||| |||           ||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  52367982 acctaaaaaggtg-----------aatgtttattgatttagataaattacccatcatttttccataggtaccctagttgtcacctt 52368056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 182 - 273
Target Start/End: Original strand, 39637899 - 39637986
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttca 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39637899 ggttttttctagattacctatgaagaatggtgggtaattt----acccaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttca 39637986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35991768 - 35991679
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35991768 tttttttaaattacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 35991679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44293628 - 44293451
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||           
T  44293628 aggtttttttaaaattacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 44293536  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
        | || |||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  44293535 ----tgaatatgtacttatgtggctaatatatattagttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgccaccttat 44293451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 182 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4156248 - 4156188
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4156248 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38718309 - 38718167
Alignment:
Q  218 atttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattgg 317  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||| |||     | || ||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  38718309 atttatccaccgaccaataaaaatgaacaatttatttgtggcatcaagatagttcataaata-----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtatatcgg 38718215  T
Q  318 ttggg-gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  38718214 ttgggagtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 38718167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31286612 - 31286504
Alignment:
Q  246 aatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttcca 345  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  31286612 aatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttcta 31286524  T
Q  346 tgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31286523 tgggtaccctagttgtcacc 31286504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10919369 - 10919313
Alignment:
Q  179 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaat 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10919369 ataggttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Original strand, 31844818 - 31844859
Alignment:
Q  328 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844818 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 31844859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 362
Target Start/End: Original strand, 32448754 - 32448807
Alignment:
Q  309 gtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  32448754 gtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 32448807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 342
Target Start/End: Original strand, 24215865 - 24215911
Alignment:
Q  296 ttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 342  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24215865 ttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 24215911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 214
Target Start/End: Original strand, 23994846 - 23994879
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23994846 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgg 23994879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 24215806 - 24215854
Alignment:
Q  226 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  24215806 accaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcat 24215854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 346
Target Start/End: Original strand, 39359504 - 39359544
Alignment:
Q  306 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39359504 aatgtgtattggttggggtaaattacccacaattattccat 39359544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 293 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35991671 - 35991616
Alignment:
Q  293 tgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 348  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  35991671 tgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattagctatcattctttcatgg 35991616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 12891401 - 12891438
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattta 222  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12891401 tttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaattta 12891438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31286647 - 31286606
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttat 223  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  31286647 ggttttttctagattacttttaaaaaatggtgggtaatttat 31286606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47772334 - 47772306
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47772334 ttttttctagattacctttgaagaatggt 47772306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 82)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 746464 - 746647
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746464 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 746563  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746564 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 746647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Original strand, 4034590 - 4034778
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4034590 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacc 4034689  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034690 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 4034778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Original strand, 17600833 - 17601020
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17600833 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 17600932  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17600933 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 17601020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6594642 - 6594456
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6594642 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 6594543  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6594542 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 6594456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 23901780 - 23901960
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23901780 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 23901879  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23901880 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23901960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 27400400 - 27400584
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27400400 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 27400499  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27400500 cacttaaaaatgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 27400584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 182 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2325072 - 2324878
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2325072 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 2324973  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataagaataa 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2324972 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt-taagaataa 2324878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 179 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13815404 - 13815213
Alignment:
Q  179 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13815404 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 13815305  T
Q  279 accacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13815304 accacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcaccatata 13815213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 45370988 - 45371171
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  45370988 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggatacc 45371087  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45371088 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45371171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Original strand, 34518366 - 34518552
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34518366 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 34518465  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34518466 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 34518552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Original strand, 38997100 - 38997282
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38997100 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 38997199  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38997200 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 38997282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 362
Target Start/End: Original strand, 10424589 - 10424773
Alignment:
Q  178 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10424589 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 10424688  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424689 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 26710342 - 26710526
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26710342 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 26710441  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26710442 cacttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 26710526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27651217 - 27651033
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27651217 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 27651118  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651117 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 27651033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 40635216 - 40635400
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40635216 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 40635315  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40635316 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40635400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 182 - 369
Target Start/End: Original strand, 6430471 - 6430658
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6430471 ggttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 6430570  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6430571 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttattaccttat 6430658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 11184970 - 11185153
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11184970 ggttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 11185069  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185070 acttaaaaatgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11185153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 366
Target Start/End: Original strand, 14660445 - 14660628
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14660445 gttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 14660544  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14660545 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacct 14660628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33427828 - 33427645
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33427828 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 33427729  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33427728 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 33427645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10244765 - 10244582
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10244765 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 10244666  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10244665 acttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Original strand, 32327361 - 32327542
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32327361 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 32327460  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32327461 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 32327542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1092134 - 1091949
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1092134 ggttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 1092035  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1092034 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 1091949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Original strand, 5726128 - 5726310
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  5726128 gttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttacca 5726227  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5726228 cttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 5726310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7892870 - 7892684
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  7892870 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggatacca 7892771  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7892770 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcaccttat 7892684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 182 - 368
Target Start/End: Original strand, 27024413 - 27024599
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27024413 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 27024512  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024513 acttaaaaatatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 27024599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 173 - 367
Target Start/End: Original strand, 40037132 - 40037325
Alignment:
Q  173 ttggtaataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttc 272  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40037132 ttggaaattggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttc 40037231  T
Q  273 atagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  40037232 atagataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtcacctt 40037325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 178 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14697724 - 14697537
Alignment:
Q  178 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  14697724 aataggttttttttagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatgga 14697625  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14697624 taccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 14697537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Original strand, 4609626 - 4609807
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4609626 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 4609725  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4609726 ttaaaaatgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4609807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Original strand, 32608377 - 32608559
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  32608377 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtatac 32608476  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||||||||| ||||| ||||||||    
T  32608477 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt-----atgggtaccttagttatcacctta 32608559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Original strand, 32948445 - 32948626
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32948445 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggatacca 32948543  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32948544 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtcacc 32948626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2914319 - 2914138
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2914319 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 2914220  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2914219 ttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtcacc 2914138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37621054 - 37620867
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggt---caagatagttcataga 277  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||    
T  37621054 aggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatgga 37620955  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37620954 taccacttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 37620867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 40735461 - 40735645
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40735461 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatac 40735560  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40735561 cacttaaaaatgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtcacc 40735645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 37255517 - 37255336
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37255517 taggttttttctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggata 37255423  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37255422 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacct 37255336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 198 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856432
Alignment:
Q  198 cctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgctt 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  298 atgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccttat 32856432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 366
Target Start/End: Original strand, 9444683 - 9444875
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatc-------caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatag 276  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  9444683 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatgg 9444782  T
Q  277 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccacc---attcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9444783 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtcacct 9444875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 11159625 - 11159802
Alignment:
Q  187 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccactta 286  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  11159625 tttcttgattacctttgaaaaatggtgg-taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccactta 11159723  T
Q  287 aaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11159724 aaaatgtgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 11159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 338
Target Start/End: Original strand, 12842103 - 12842257
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||     
T  12842103 ttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaa 12842202  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 338  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12842203 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat 12842257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 181 - 359
Target Start/End: Original strand, 15925077 - 15925255
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15925077 aggttttttctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggatac 15925176  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 359  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||    
T  15925177 cacttaaaaatatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagataccctagtt 15925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 181 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8433100 - 8432942
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8433100 aggttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggatac 8433001  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 339  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8433000 cactttaaaatatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 235 - 367
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295018
Alignment:
Q  235 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattaccca 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  335 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtcccctt 25295018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 181 - 364
Target Start/End: Original strand, 39103044 - 39103216
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  |||     
T  39103044 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata- 39103142  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
              |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39103143 ----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 178 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21735076 - 21734897
Alignment:
Q  178 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||        
T  21735076 aataggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttca---- 21734981  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
           | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21734980 -------tgaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctta 21734897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 183 - 363
Target Start/End: Original strand, 145281 - 145450
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||      
T  145281 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac-- 145378  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
             ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  145379 ---------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Original strand, 41172459 - 41172605
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  41172459 tttttttaaattacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccact 41172558  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattac 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41172559 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Original strand, 42899913 - 42900035
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42899913 ggttttttctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 42900012  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggc 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  42900013 acttaaaaatgcgcttatgtggc 42900035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Original strand, 1229632 - 1229810
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||        ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1229632 aggttttttctagattacctttaaagaatggtaggtaatttgtc--------aatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatac 1229723  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg-taccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1229724 cacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattacccaccattcttccatgggttacccaagttgtcacct 1229810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 35158220 - 35158050
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||              
T  35158220 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 35158131  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     | || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35158130 -tgaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35158050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 44481826 - 44482000
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44481826 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 44481925  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    || |||||| |||           || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44481926 acctaaaaaggtg-----------aaagtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacctt 44482000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 28641464 - 28641292
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  28641464 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 28641373  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28641372 ---tgaatatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28641292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 29687039 - 29687211
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  29687039 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 29687130  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29687131 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 29687211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 447740 - 447633
Alignment:
Q  258 gggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctag 357  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  447740 gggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctag 447641  T
Q  358 ttgtcacc 365  Q
    ||||||||    
T  447640 ttgtcacc 447633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12333668 - 12333497
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  ||      
T  12333668 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat-- 12333571  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
             ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  12333570 ---------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 12333497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2688902 - 2688726
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||           
T  2688902 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttca------- 2688810  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
        | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  2688809 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacctta 2688726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 4258488 - 4258659
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||            
T  4258488 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgt-gggtcaagatagttca-------- 4258578  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  4258579 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcacc 4258659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19428598 - 19428426
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacc-tttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||            
T  19428598 gttttttctaaattaccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttca-------- 19428507  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  19428506 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 19428426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Original strand, 27331298 - 27331474
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |          
T  27331298 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaa------ 27331391  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
     || | ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  27331392 -tatatatgtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacctt 27331474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 182 - 368
Target Start/End: Original strand, 12730059 - 12730234
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  12730059 ggttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 12730150  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
       |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  12730151 ---taaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacctta 12730234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13543797 - 13543622
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |||     
T  13543797 aggttctttttaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata- 13543699  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
              |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13543698 ----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 13543622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27765037 - 27764863
Alignment:
Q  179 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagat 278  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||         
T  27765037 ataggttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttca----- 27764943  T
Q  279 accacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
          | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27764942 ------tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaaccatca-tctttcatgggtagcctagttgccacc 27764863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39301367 - 39301197
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||              
T  39301367 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 39301278  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     | || |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  39301277 -tgaatatgtgcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 39301197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43899142 - 43898971
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||            
T  43899142 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttca-------- 43899051  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  43899050 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 43898971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 360
Target Start/End: Original strand, 35126778 - 35126945
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35126778 ggttttttctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 35126877  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttg 360  Q
    || |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  35126878 acctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatagataccctagttg 35126945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Original strand, 12814611 - 12814693
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814611 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2000510 - 2000416
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcata 275  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  2000510 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcata 2000416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 184 - 368
Target Start/End: Original strand, 34249265 - 34249438
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |              
T  34249265 ttttttttaaattatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttta---------- 34249354  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
     | || ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34249355 -tgaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctta 34249438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28566871 - 28566703
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||           
T  28566871 aggttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttca------- 28566779  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttg 360  Q
        | || ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  28566778 ----tgaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttg 28566703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Original strand, 12827137 - 12827243
Alignment:
Q  258 gggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctag 357  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||    
T  12827137 gggttaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccacaggtgctctag 12827235  T
Q  358 ttgtcacc 365  Q
    ||||||||    
T  12827236 ttgtcacc 12827243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 43356097 - 43356266
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  43356097 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 43356185  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  43356186 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtcacc 43356266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40544249 - 40544156
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40544249 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 40544156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 274
Target Start/End: Original strand, 3266290 - 3266386
Alignment:
Q  178 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  3266290 aatagattttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcat 3266386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 255 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  255 gtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaa 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 3711664 - 3711806
Alignment:
Q  215 gtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtat 314  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||           |||||||||| ||| |||||||||    
T  3711664 gtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgcggctaatgtgtat 3711752  T
Q  315 tggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  3711753 tggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctta 3711806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 348
Target Start/End: Original strand, 8056625 - 8056779
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||| || ||||||||||||  |||       
T  8056625 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatgaata--- 8056721  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 348  Q
            || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||    
T  8056722 --------tgcgcttatgtagctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgg 8056779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Original strand, 30545818 - 30545992
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  30545818 aggttttttttagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatac 30545917  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
     |  ||||||| ||           |||||  |||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  30545918 aatctaaaaatatg-----------aatgttcattggttcaggtaaattacccatcattcctccatagataccctagttgtcacct 30545992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 250
Target Start/End: Original strand, 10176558 - 10176625
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 250  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  10176558 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattt 10176625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28020005 - 28019959
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccac 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28020005 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 28019959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 363
Target Start/End: Original strand, 3266399 - 3266455
Alignment:
Q  307 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3266399 atgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 3266455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38985439 - 38985342
Alignment:
Q  191 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaa 290  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  38985439 tagattacatttga-gaacggtgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgat-atgtcaagatagttcatggataccacctaaaaa 38985342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 367
Target Start/End: Original strand, 42900781 - 42900837
Alignment:
Q  310 tgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42900781 tgtattggttgagataaattacccaccattcttccatgtgta-cctagttgtcacctt 42900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40544143 - 40544085
Alignment:
Q  307 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  40544143 atgtgtattggttgaggtaaattacacatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 40544085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 222
Target Start/End: Original strand, 1897130 - 1897168
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattta 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1897130 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataattta 1897168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 69)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32984261 - 32984075
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32984261 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 32984162  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984161 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 32984075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24080084 - 24079901
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24080084 ggttttttgtagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 24079985  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24079984 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 24079901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 181 - 378
Target Start/End: Original strand, 5946045 - 5946242
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5946045 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatac 5946144  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataagaataat 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5946145 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtcacctaataataataat 5946242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33981846 - 33981661
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33981846 ggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 33981747  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33981746 acttaaaaatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 33981661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 43328706 - 43328890
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43328706 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 43328805  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43328806 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 43328890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40435335 - 40435153
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40435335 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggatacca 40435236  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40435235 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 40435153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Original strand, 10646124 - 10646305
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10646124 ttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10646223  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646224 ttaaaaatgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 10646305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33730824 - 33730639
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33730824 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 33730725  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33730724 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 33730639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 37956420 - 37956605
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37956420 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 37956519  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  37956520 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtcacctt 37956605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 41862217 - 41862402
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41862217 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 41862316  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  41862317 tcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 41862402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9303756 - 9303572
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9303756 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 9303657  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303656 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 9303572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31831136 - 31830959
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31831136 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31831037  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31831036 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 41231945 - 41232130
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41231945 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 41232044  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41232045 acttaaaaatgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtcacctt 41232130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 6365985 - 6366169
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6365985 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggatacc 6366084  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6366085 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtcacct 6366169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 41653893 - 41654077
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||    
T  41653893 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggatac 41653992  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41653993 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 41654077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17718903 - 17718720
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17718903 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccac 17718804  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17718803 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacctt 17718720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Original strand, 9734255 - 9734435
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  9734255 gttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ca 9734353  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9734354 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 182 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 37301508 - 37301326
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  37301508 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggatacc 37301409  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37301408 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcac 37301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 45236750 - 45236564
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45236750 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggata 45236651  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  45236650 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtcacct 45236564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 37419938 - 37420122
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37419938 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 37420037  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37420038 tacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 37420122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Original strand, 9013684 - 9013869
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9013684 gttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatacca 9013783  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9013784 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 9013869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13356304 - 13356118
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13356304 aggttttttttagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 13356205  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13356204 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtcacctt 13356118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Original strand, 2714550 - 2714730
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2714550 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccac 2714649  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  2714650 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtactttagttgtcacc 2714730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Original strand, 25185897 - 25186082
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25185897 aggtattttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatac 25185996  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  25185997 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctaatcgtcacct 25186082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 180 - 364
Target Start/End: Original strand, 22878388 - 22878572
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22878388 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggata 22878487  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22878488 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtcac 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 183 - 370
Target Start/End: Original strand, 2275913 - 2276099
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2275913 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 2276012  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 370  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2276013 ctt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggtagactagttgtcaccttata 2276099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 188 - 363
Target Start/End: Original strand, 32114254 - 32114429
Alignment:
Q  188 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaa 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32114254 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaa 32114353  T
Q  288 aaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32114354 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13760831 - 13760644
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13760831 ggttttttcaagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 13760732  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg--gtaccctagttgtcacctt 367  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13760731 atttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtgtaccctagttgtcacctt 13760644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 35628776 - 35628959
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  35628776 ggttttttttagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaatacc 35628875  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35628876 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtcacc 35628959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29048588 - 29048426
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29048588 taggttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggata 29048489  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29048488 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 181 - 364
Target Start/End: Original strand, 41639912 - 41640095
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41639912 aggttttttttagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagatac 41640011  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    | ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41640012 cgcttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 184 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44088624 - 44088446
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44088624 ttttttctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 44088525  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 362  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  44088524 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctaattgtc 44088446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 183 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45066774 - 45066590
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45066774 gttttttatagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 45066675  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  45066674 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccatgggtaccctaattctcacctt 45066590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 25248037 - 25248215
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25248037 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 25248130  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25248131 cactttaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtcacc 25248215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 183 - 366
Target Start/End: Original strand, 45258510 - 45258692
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45258510 gttttttttagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggatacca 45258609  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
     ||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  45258610 tttaaaaatgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttatcacct 45258692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 239 - 367
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033114
Alignment:
Q  239 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  339 tcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtcacctt 12033114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904258
Alignment:
Q  232 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattac 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  332 ccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3904225 ccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 3904258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42701471 - 42701301
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42701471 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccac 42701372  T
Q  284 tta---aaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacc 353  Q
    |||   ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42701371 ttaaaaaaaatgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggtacc 42701301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4447467 - 4447294
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||      
T  4447467 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata-- 4447370  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
             |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4447369 ---------tgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 4447294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 249 - 370
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981655
Alignment:
Q  249 ttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  349 gtaccctagttgtcaccttata 370  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  41981634 ataccctagttgtcaccatata 41981655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 10378307 - 10378480
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||           
T  10378307 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttca------- 10378399  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
        | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10378400 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 10378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 369
Target Start/End: Original strand, 3211207 - 3211380
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||        
T  3211207 ttttttctaaattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgaata---- 3211301  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
           |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3211302 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcaccttat 3211380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 252 - 374
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336285
Alignment:
Q  252 ttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  352 ccctagttgtcaccttataagaa 374  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  31336263 ccctagttgtcaccttaaaagaa 31336285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 181 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33897015 - 33896839
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33897015 aggttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagatac 33896917  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||| ||||||  ||           ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33896916 cacctaaaaagatg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcaccttat 33896839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 31940314 - 31940485
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  31940314 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 31940405  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  31940406 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 31940485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 117499 - 117329
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||              
T  117499 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 117410  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     | || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  117409 -tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 117329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 41843252 - 41843424
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||            
T  41843252 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttca-------- 41843343  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  41843344 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcttagttatcacc 41843424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 2379137 - 2379311
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||          
T  2379137 taggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttca------ 2379230  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
         | || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2379231 -----tgaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2379311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3490575 - 3490397
Alignment:
Q  178 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |     
T  3490575 aataggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggt 3490476  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||| |||||| |||           ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  3490475 taccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacctt 3490397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 9713688 - 9713857
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||            
T  9713688 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattta---cccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca-------- 9713776  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9713777 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9713857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 183 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39915994 - 39915887
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39915994 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 39915895  T
Q  283 cttaaaaa 290  Q
    ||||||||    
T  39915894 cttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40458943 - 40458772
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||             
T  40458943 gttttttctcaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca--------- 40458853  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
      | || ||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  40458852 --tgaatatgtgtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 40458772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31149066 - 31148953
Alignment:
Q  178 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| ||    
T  31149066 aataggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-ga 31148968  T
Q  278 taccacttaaaaatg 292  Q
    |||||||||||||||    
T  31148967 taccacttaaaaatg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 185 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4975576 - 4975412
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||               
T  4975576 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca----------- 4975488  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttg 360  Q
    | || |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  4975487 tgaatatgtgcttatatggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttg 4975412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9509572 - 9509399
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||            
T  9509572 ggttttttctaaattacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttca-------- 9509481  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
       | || ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  9509480 ---tgaatatgtgtttatgtggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttttcacct 9509399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27243312 - 27243219
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  27243312 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcat 27243219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27254887 - 27254794
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  27254887 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcat 27254794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32373892 - 32373733
Alignment:
Q  188 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaa 287  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||           | |    
T  32373892 ttctaaattacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttca-----------tga 32373804  T
Q  288 aaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 359  Q
    | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  32373803 atatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccatggataacctagtt 32373733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26196489 - 26196315
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  26196489 aggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatac 26196391  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||| |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  26196390 cacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacctt 26196315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 285
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981535
Alignment:
Q  204 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccactt 285  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649837
Alignment:
Q  195 ttacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtg 294  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||  |||           ||||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaata-----------tgtg 40649902  T
Q  295 cttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  40649901 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggtagcctagtt 40649837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 348
Target Start/End: Original strand, 38631652 - 38631806
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||       
T  38631652 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatgaata--- 38631748  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 348  Q
            | |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  38631749 --------tatgcttatgtggttaatatgtattggttgggataaattatccaccattcttcaatgg 38631806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33622635 - 33622467
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  | ||||||| ||||||||              
T  33622635 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttat-gggtcaaaatagttca---------- 33622547  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     | || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  33622546 -tgaatatgtggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcat-ggtagcctagttgtcacc 33622467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 274
Target Start/End: Original strand, 164728 - 164812
Alignment:
Q  189 tctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||    
T  164728 tctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttg-tggtggagtctaaatagttcat 164812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 219
Target Start/End: Original strand, 12032951 - 12032988
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12032951 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 12032988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 365
Target Start/End: Original strand, 39901674 - 39901739
Alignment:
Q  300 gtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  39901674 gtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtcacc 39901739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 41425503 - 41425429
Alignment:
Q  290 atgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  41425503 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattatccataattcttttatgggtagcctagttgccacc 41425429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 39901574 - 39901617
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccac 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  39901574 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttacccac 39901617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31148950 - 31148890
Alignment:
Q  306 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  31148950 aatgtttattgattgagataaattatccaccatccttccatagataccctagttgtcacct 31148890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 5882505 - 5882690
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5882505 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 5882604  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882605 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 5882690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 182 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26377387 - 26377201
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26377387 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 26377288  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377287 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 26377201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 181 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14891563 - 14891383
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14891563 aggttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 14891464  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14891463 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22551245 - 22551061
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22551245 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatac 22551146  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22551145 cacctaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22551061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 24168090 - 24168274
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24168090 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 24168189  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24168190 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 24168274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 960086 - 959898
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  960086 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagatacca 959987  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  959986 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccatataa 959898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 8615238 - 8615422
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8615238 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 8615337  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615338 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 8615422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 363
Target Start/End: Original strand, 2892189 - 2892368
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2892189 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2892288  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2892289 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 2892368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 179 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19415719 - 19415530
Alignment:
Q  179 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  19415719 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggat 19415620  T
Q  279 accacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19415619 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 19415530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34528045 - 34527860
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34528045 ggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacc 34527946  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34527945 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 34527860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 186 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18101674 - 18101490
Alignment:
Q  186 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccactt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18101674 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactt 18101575  T
Q  286 aaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18101574 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtcaccatata 18101490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7393770 - 7393584
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7393770 aggttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 7393671  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7393670 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtcacctt 7393584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 28947084 - 28947269
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  28947084 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtata 28947183  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28947184 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28947269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10508091 - 10507907
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10508091 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 10507992  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10507991 acttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtcacct 10507907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2594037 - 2593850
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2594037 taggttttttctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 2593938  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2593937 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 2593850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 196 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11988973
Alignment:
Q  196 tacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  296 ttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 11988973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 182 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7345295 - 7345114
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7345295 ggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatacc 7345196  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  7345195 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtctaccttagttgtca 7345114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 180 - 370
Target Start/End: Original strand, 599889 - 600079
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  599889 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 599988  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  599989 ccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccatata 600079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Original strand, 1970709 - 1970894
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  1970709 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatat 1970808  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1970809 cacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactttagttgtcacct 1970894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33452753 - 33452572
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33452753 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccac 33452654  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33452653 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 33452572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 181 - 356
Target Start/End: Original strand, 16703364 - 16703539
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16703364 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatac 16703463  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  16703464 cacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtatccta 16703539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 196 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341785
Alignment:
Q  196 tacctttgaagaatggtgggtaatttatccacca--accaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  294 gcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctta 22341785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 182 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19281238 - 19281056
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  19281238 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatc 19281139  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  19281138 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 30743629 - 30743445
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  30743629 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccac 30743530  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||    
T  30743529 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggataccctaattatcacctta 30743445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5294982 - 5294799
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5294982 ttttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 5294883  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5294882 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 5294799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5299534 - 5299351
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5299534 ttttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 5299435  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5299434 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 5299351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24224253 - 24224070
Alignment:
Q  183 gttttttctagatt-acctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24224253 gttttttctagatttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatacc 24224154  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  24224153 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtcacc 24224070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30467786 - 30467656
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30467786 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 30467687  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgt 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30467686 acttaaacatgtgcttatgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 215 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261927
Alignment:
Q  215 gtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtat 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||    
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  315 tggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtcacctt 23261927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 7167579 - 7167753
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  7167579 taggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggata 7167678  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||| |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7167679 ccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 7167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 28949018 - 28948845
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||           
T  28949018 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattca------- 28948926  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
        | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28948925 ----tgaatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28948845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 358
Target Start/End: Original strand, 13329379 - 13329545
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||           
T  13329379 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca------- 13329471  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagt 358  Q
        |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  13329472 ----taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagt 13329545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 15965432 - 15965605
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||            
T  15965432 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttca-------- 15965523  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
       | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15965524 ---tgaatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacct 15965605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Original strand, 3291009 - 3291181
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||              
T  3291009 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca---------- 3291098  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
     |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  3291099 -taaatatgtgcttatgtggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacctt 3291181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 265
Target Start/End: Original strand, 929653 - 929741
Alignment:
Q  177 taataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  929653 taataggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Original strand, 4487528 - 4487698
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||              
T  4487528 ttttttttaaatttcctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 4487617  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     | || |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  4487618 -tgaatatgtactcatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 4487698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 1398550 - 1398724
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |          
T  1398550 taggttttttctaaattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttga------ 1398643  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
         | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  1398644 -----tgaatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 1398724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Original strand, 3786749 - 3786920
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||             
T  3786749 gttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttca--------- 3786839  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
      | || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3786840 --tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3786920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 375897 - 375807
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 271  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  375897 aggttttttttagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtt 375807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 290 - 365
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661905
Alignment:
Q  290 atgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 18661905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1939669 - 1939579
Alignment:
Q  189 tctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  1939669 tctaaattatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11743128 - 11743070
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11743128 aggttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaa 11743070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 368
Target Start/End: Original strand, 34262342 - 34262404
Alignment:
Q  306 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34262342 aatgtttattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctta 34262404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24913171 - 24913094
Alignment:
Q  290 atgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  24913171 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgagtagcttagttgtcacctt 24913094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 13844847 - 13844943
Alignment:
Q  194 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaa 290  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  13844847 attacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcataaataccacctaaaaa 13844943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 375786 - 375729
Alignment:
Q  306 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  375786 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccttaattgtca 375729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 24253380 - 24253564
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24253380 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 24253479  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253480 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24253564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43326563 - 43326379
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43326563 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 43326464  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43326463 cacttaaaaatgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 43326379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 366
Target Start/End: Original strand, 7722044 - 7722232
Alignment:
Q  178 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7722044 aataggttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 7722143  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7722144 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 7722232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 184 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15398663 - 15398483
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15398663 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 15398564  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15398563 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtcac 15398483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 35626037 - 35626221
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35626037 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 35626136  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35626137 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacct 35626221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3466866 - 3466680
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3466866 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 3466767  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3466766 ccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtcacct 3466680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 363
Target Start/End: Original strand, 6901797 - 6901979
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6901797 aggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatac 6901896  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6901897 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 6901979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 182 - 371
Target Start/End: Original strand, 39932578 - 39932767
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39932578 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 39932677  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  39932678 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtcacctaataa 39932767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27501239 - 27501055
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27501239 aggttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 27501140  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501139 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 5184971 - 5185154
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5184971 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacc 5185070  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5185071 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 5185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40886210 - 40886028
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40886210 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 40886111  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40886110 actt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttttcacc 40886028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 739888 - 739703
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  739888 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 739789  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  739788 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacct 739703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18479849 - 18479668
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18479849 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 18479750  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  18479749 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagtagtcacc 18479668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 27938895 - 27939080
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27938895 aggttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 27938994  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg-taccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27938995 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtcacc 27939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43262367 - 43262182
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43262367 aggttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 43262268  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43262267 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacct 43262182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Original strand, 12648797 - 12648979
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12648797 gttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 12648896  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12648897 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 12648979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Original strand, 15683791 - 15683973
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15683791 gttttttctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 15683890  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15683891 cttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Original strand, 25831519 - 25831703
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25831519 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggatac 25831617  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  25831618 caattaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtcacct 25831703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28424978 - 28424793
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28424978 taggttttttctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 28424881  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28424880 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacctt 28424793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2484473 - 2484292
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2484473 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactac 2484374  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2484373 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2484292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 182 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27278660 - 27278474
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatag----ttcataga 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||    
T  27278660 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatgga 27278561  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27278560 taccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 194 - 365
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939079
Alignment:
Q  194 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 293  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  294 gcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    | |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 31939079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13504922 - 13504742
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13504922 tttttctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 13504823  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13504822 taaaaatgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 13504742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 179 - 366
Target Start/End: Original strand, 5137711 - 5137898
Alignment:
Q  179 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5137711 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 5137810  T
Q  279 accacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || | |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  5137811 accacttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccattaataccctagttgtcacct 5137898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Original strand, 890904 - 891088
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  890904 aggttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggatac 891003  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  891004 cactt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtcacct 891088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40279041 - 40278858
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  40279041 aggtttttttta-attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggatac 40278943  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40278942 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtcacc 40278858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 224 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29789436 - 29789291
Alignment:
Q  224 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  29789436 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggga 29789337  T
Q  324 taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29789336 taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 29789291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756484
Alignment:
Q  191 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  291 tgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt-ccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtcacctta 38756484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 181 - 363
Target Start/End: Original strand, 40110232 - 40110413
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40110232 aggttttttctatattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatagatac 40110330  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  40110331 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatgagtatcctaattgtca 40110413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 225 - 365
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451432
Alignment:
Q  225 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  325 aaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34451392 aaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 34451432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 183 - 368
Target Start/End: Original strand, 763723 - 763908
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||    
T  763723 gttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatca 763822  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  763823 cttaaaaatgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtcacctta 763908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 33617584 - 33617758
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||            
T  33617584 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttca-------- 33617675  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
       | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33617676 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 33617758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 27503377 - 27503550
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  27503377 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 27503469  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
        | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27503470 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 27503550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 180 - 370
Target Start/End: Original strand, 13957667 - 13957846
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||          
T  13957667 taggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------ 13957760  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 370  Q
         | || ||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13957761 -----tgaatatgcgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttata 13957846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 176 - 346
Target Start/End: Original strand, 4149687 - 4149847
Alignment:
Q  176 gtaataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcata 275  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          | ||     
T  4149687 gtaaaaggttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggg----------ttatg 4149776  T
Q  276 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4149777 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 4149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 184 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 38015684 - 38015510
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||              
T  38015684 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 38015595  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
     | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  38015594 -tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttat 38015510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 19295728 - 19295901
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||      
T  19295728 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtat-- 19295825  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19295826 ---------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 19295901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23195429 - 23195246
Alignment:
Q  173 ttggtaataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttc 272  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23195429 ttggcaattggttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttc 23195330  T
Q  273 atagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |           | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23195329 a-----------tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 23195246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 5497270 - 5497446
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||          
T  5497270 taggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttca------ 5497363  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
         | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5497364 -----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 5497446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31294170 - 31293989
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||| |||  |||||||    
T  31294170 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccac 31294071  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||| |||||| |||    |||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31294070 ttaaaaatatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtcacc 31293989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38638084 - 38637908
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  38638084 taggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggata 38637985  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||  |||||| |||           ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38637984 ccaactaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 38637908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 182 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9424764 - 9424593
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||            
T  9424764 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 9424673  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
       | || || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9424672 ---tgaatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 367
Target Start/End: Original strand, 6973063 - 6973236
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||             
T  6973063 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttca--------- 6973153  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
      | || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  6973154 --tgaatatgtgcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgacacctt 6973236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24167956 - 24167779
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24167956 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 24167857  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 370  Q
    || |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24167856 acctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtcaccatata 24167779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1402678 - 1402502
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  1402678 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggatac 1402579  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||  ||||| |||           ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1402578 cacccaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttatcacctta 1402502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 327
Target Start/End: Original strand, 40632498 - 40632634
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40632498 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 40632597  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaa 327  Q
              ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40632598 ---------ggtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 40632634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 181 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42658835 - 42658671
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  42658835 aggttttttcaaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 42658743  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 356  Q
        | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  42658742 ----tgaatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 42658671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 2585461 - 2585633
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2585461 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 2585560  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |  ||||||  ||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  2585561 atctaaaaagttg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtcacc 2585633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12558202 - 12558090
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  12558202 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gatac 12558104  T
Q  281 cacttaaaaatgtg 294  Q
    ||||||||||||||    
T  12558103 cacttaaaaatgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9374672 - 9374502
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||              
T  9374672 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttca---------- 9374583  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     | || ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9374582 -tgaatatgtgtttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 36365617 - 36365444
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||            
T  36365617 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 36365526  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||| |||||    
T  36365525 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctttcatggatagtctagttgccacct 36365444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18327347 - 18327167
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  18327347 taggttttttctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggata 18327248  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
    |||| |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  18327247 ccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccttagttatcaccatataa 18327167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 181 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36472457 - 36472348
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  36472457 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatac 36472358  T
Q  281 cacttaaaaa 290  Q
    ||||| ||||    
T  36472357 cactttaaaa 36472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 27390596 - 27390769
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27390596 ggttatttttagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 27390695  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    || |||||| |||           |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27390696 acctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacct 27390769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Original strand, 40686900 - 40687071
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||     
T  40686900 ttttttctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccat 40686999  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40687000 ctaaaaa-gtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtcacctt 40687071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Original strand, 14971979 - 14972149
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |              
T  14971979 ttttttttaaattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttta---------- 14972068  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     | || ||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14972069 -tgaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 14972149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42247955 - 42247865
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42247955 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 42247865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 194 - 352
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120182
Alignment:
Q  194 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatat 5120134  T
Q  294 gcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtac 352  Q
    |           ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5120135 g-----------aatgtttattggttgaggtaaattatccaccattctttcatgggtac 5120182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656568
Alignment:
Q  210 ggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatg 309  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  |||           |||||||||||||| ||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatg 3656624  T
Q  310 tgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3656623 tgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3656568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 342
Target Start/End: Original strand, 6206883 - 6207032
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||            
T  6206883 ggttttttttaaattacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttca-------- 6206974  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 342  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6206975 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9171193 - 9171111
Alignment:
Q  186 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagata 268  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9171193 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 9171111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 188 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33624105 - 33623940
Alignment:
Q  188 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaa 287  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| | ||            
T  33624105 ttctaaattacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggta-------- 33624014  T
Q  288 aaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
       |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  33624013 ---tgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtcac 33623940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 612900 - 612754
Alignment:
Q  209 tggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaat 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||             |||||||||||| |||    
T  612900 tggtgggtaatttaaccaccaacca-tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgata-------------tgcttatgtggctaat 612815  T
Q  309 gtgtattggttggg-gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  612814 gtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtcacctta 612754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 36948633 - 36948492
Alignment:
Q  209 tggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaat 308  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||    
T  36948633 tggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggata-----------tgtgcttatgtggctaat 36948546  T
Q  309 gtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  36948545 gtgtattggtaggg-taaattacccaccattcttgcatgagtaccctagctgtca 36948492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9527190 - 9527124
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9527190 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 365
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492783
Alignment:
Q  217 aatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattg 316  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||           |||||||||||| | |||||||||||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  317 gttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  38492736 gttggggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgccacc 38492783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940411
Alignment:
Q  207 aatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300962
Alignment:
Q  194 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag 265  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaatttatcggtggagtcaag 15300962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 42247849 - 42247790
Alignment:
Q  307 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  42247849 atgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgacacct 42247790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20207154 - 20207088
Alignment:
Q  216 taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || | | |||||||||||| |||||||    
T  20207154 taatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggatacca 20207088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 243
Target Start/End: Original strand, 27584384 - 27584447
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggg--taatttatccaccaaccaatgaaaatga 243  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| |||||||||    
T  27584384 ggttttttctatatttcctttgaagaatggtgggtatagtttacccaccaaccagtgaaaatga 27584447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Original strand, 28756082 - 28756138
Alignment:
Q  187 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatga 243  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28756082 tttctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatga 28756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 366
Target Start/End: Original strand, 40633525 - 40633560
Alignment:
Q  331 cccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40633525 cccaccattcttccatggataccctagttgtcacct 40633560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9171108 - 9171032
Alignment:
Q  291 tgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  9171108 tgtgcttatgtggttaatgtgtattgattggg-taaattacttgtcattctttcataggtagcctagttgtcacctta 9171032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 365
Target Start/End: Original strand, 21786003 - 21786032
Alignment:
Q  336 cattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21786003 cattcttccatgggtaccctagttgtcacc 21786032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 115)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 47257792 - 47257977
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  47257792 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacc 47257891  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47257892 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 47257977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 180 - 369
Target Start/End: Original strand, 49330034 - 49330223
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49330034 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 49330133  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330134 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 49330223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 42291839 - 42292026
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42291839 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 42291938  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42291939 ccacttgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 42292026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 178 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 38416911 - 38416721
Alignment:
Q  178 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38416911 aatagattttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 38416812  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38416811 taccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 38416721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40131143 - 40130957
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  40131143 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggatac 40131044  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40131043 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 40130957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 24100281 - 24100464
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24100281 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gatac 24100379  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24100380 cacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24100464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7855298 - 7855112
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7855298 aggttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggatac 7855199  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7855198 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 7855112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47809780 - 47809594
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47809780 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 47809681  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggtt-ggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47809680 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 47809594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 22399094 - 22399278
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22399094 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaa 22399193  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22399194 ccactt-aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22399278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 28048577 - 28048392
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28048577 taggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 28048478  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28048477 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28048392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 180 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 43612232 - 43612043
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  43612232 taggttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggata 43612133  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43612132 ccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 43612043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 41464350 - 41464534
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41464350 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatac 41464449  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41464450 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtcacc 41464534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 51170217 - 51170034
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51170217 aggttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 51170118  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51170117 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32234581 - 32234396
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32234581 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 32234482  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32234481 cactt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 32234396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29626011 - 29625826
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29626011 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 29625912  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  29625911 cacttaaaaatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattatcacct 29625826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 40419834 - 40420018
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40419834 ggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 40419933  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40419934 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40420018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 51102562 - 51102378
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  51102562 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatat 51102463  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  51102462 cacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 183 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27067160 - 27066965
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  27067160 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 27067061  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataagaataat 378  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27067060 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacctaataataataat 27066965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 48739418 - 48739232
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48739418 taggttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggata 48739319  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48739318 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 48739232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 183 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 39634753 - 39634569
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  39634753 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggatacca 39634655  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39634654 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 39634569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 182 - 371
Target Start/End: Original strand, 40643799 - 40643988
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  40643799 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatc 40643898  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40643899 atttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatataa 40643988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 2665999 - 2666183
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2665999 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 2666098  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2666099 acttaaaactgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtcacct 2666183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 37324539 - 37324723
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  37324539 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtatac 37324638  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37324639 cacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 192 - 363
Target Start/End: Original strand, 48609732 - 48609903
Alignment:
Q  192 agattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaat 291  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48609732 agattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 48609831  T
Q  292 gtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609832 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 52628953 - 52629135
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52628953 ggtttattctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 52629052  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52629053 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 52629135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 181 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 55453428 - 55453245
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55453428 aggttttttctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatac 55453329  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55453328 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 55453245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 53943770 - 53943586
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53943770 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 53943671  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  53943670 acttaaaaatatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttgtcacctt 53943586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 37313397 - 37313581
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  37313397 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatat 37313496  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37313497 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacc 37313581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 184 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40804691 - 40804509
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  40804691 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccac 40804592  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40804591 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacct 40804509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 182 - 368
Target Start/End: Original strand, 44806683 - 44806869
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  44806683 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggatacc 44806782  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44806783 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtcacctta 44806869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7755489 - 7755305
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  7755489 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggatacc 7755390  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7755389 actt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtcacctt 7755305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 182 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20754576 - 20754387
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |    
T  20754576 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatc 20754477  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20754476 acttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtcaccttataa 20754387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 181 - 370
Target Start/End: Original strand, 43125829 - 43126017
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43125829 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatac 43125928  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 370  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  43125929 cacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttataggta-cctagttgtcaccttata 43126017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35748494 - 35748310
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35748494 ggttttttttagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 35748395  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35748394 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacct 35748310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 41732526 - 41732710
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41732526 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggatac 41732625  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41732626 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtcacc 41732710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 44222827 - 44223011
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  44222827 aggttttttctaaattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaatac 44222926  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44222927 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44223011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 183 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51452932 - 51452749
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  51452932 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 51452833  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51452832 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat-ggtaccctaattgtcacctt 51452749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 188 - 363
Target Start/End: Original strand, 43183917 - 43184092
Alignment:
Q  188 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43183917 ttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaa 43184016  T
Q  288 aaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43184017 aaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 39053393 - 39053578
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  39053393 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatacc 39053492  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  39053493 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatttttttatggatactctagttgtcacctt 39053578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Original strand, 46134357 - 46134538
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46134357 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46134456  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  46134457 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtcacc 46134538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 35594118 - 35594305
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  35594118 taggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggata 35594217  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35594218 tcacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgttacctt 35594305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 185 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41293498 - 41293317
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  41293498 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccact 41293399  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41293398 t-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtcacctt 41293317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 179 - 364
Target Start/End: Original strand, 43021710 - 43021896
Alignment:
Q  179 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggg-tcaagatagttcataga 277  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  43021710 atagtttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaa 43021809  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43021810 taccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Original strand, 52638840 - 52639026
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  52638840 aggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggatac 52638939  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  52638940 cacttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtcacctt 52639026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Original strand, 52215077 - 52215260
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  52215077 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 52215176  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || |||||||    
T  52215177 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatgggtgccttaattatcacctt 52215260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 206 - 368
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126171
Alignment:
Q  206 gaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggcc 305  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  306 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacctta 46126171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 41216454 - 41216639
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  41216454 ggttttttctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggatacc 41216553  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41216554 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtcacctt 41216639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 183 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 53832666 - 53832486
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  53832666 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggatacca 53832567  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
     ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  53832566 attaaaaaggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgtgttccctagttgtca 53832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 36368938 - 36369120
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36368938 ggttttttctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 36369037  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  36369038 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccacca-tcttccatgggtgctctagttatcacc 36369120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 184 - 366
Target Start/End: Original strand, 18946904 - 18947086
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  18946904 ttttttctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccag 18947003  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18947004 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtcacct 18947086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 182 - 340
Target Start/End: Original strand, 24376572 - 24376730
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24376572 ggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 24376671  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24376672 acttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5560216 - 5560025
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatga-----aaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcata 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5560216 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatg 5560117  T
Q  276 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggc--caatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5560116 gataccacttaaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5560025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 51146398 - 51146215
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51146398 ggttttttctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 51146299  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51146298 acttaaaaatttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgccacc 51146215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 181 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 54159172 - 54159000
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54159172 aggttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagatac 54159073  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54159072 cacttaaaaatgtgctta---------tgtgtattggttggggt-aattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54159000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 182 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 47895003 - 47894822
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47895003 ggttttttttagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 47894904  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47894903 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47894822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 332
Target Start/End: Original strand, 53637841 - 53637990
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  53637841 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggatacca 53637940  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacc 332  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  53637941 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 181 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 48547013 - 48546834
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  48547013 aggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaa-atagttcatggatac 48546916  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
    |||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  48546915 cacttaaaaatgtgctt---------atgtgtattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcatcttataa 48546834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 25641643 - 25641819
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||          
T  25641643 taggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------ 25641736  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
         |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  25641737 -----taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 25641819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Original strand, 51415967 - 51416143
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||      
T  51415967 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat-- 51416064  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
             ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51416065 ---------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctta 51416143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 181 - 329
Target Start/End: Original strand, 37758927 - 37759075
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  37758927 aggttttttctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagatac 37759026  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaatt 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37759027 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 369
Target Start/End: Original strand, 42589829 - 42590005
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  42589829 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 42589920  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  42589921 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttat 42590005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 187 - 348
Target Start/End: Original strand, 46949379 - 46949538
Alignment:
Q  187 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccactta 286  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  46949379 tttctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccactta 46949477  T
Q  287 aaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 348  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  46949478 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccatgg 46949538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Original strand, 49130576 - 49130752
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||     
T  49130576 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatgaata- 49130674  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
              |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  49130675 ----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtctcctta 49130752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 55379984 - 55380156
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  55379984 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 55380083  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    || |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55380084 acctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 55380156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Original strand, 25353552 - 25353726
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  25353552 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatac 25353651  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||| |||||| |||           |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25353652 cacctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 25353726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 53115446 - 53115620
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  53115446 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 53115545  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53115546 acttaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtcacctt 53115620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 54707393 - 54707219
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||           
T  54707393 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 54707301  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
        | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  54707300 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacct 54707219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34279894 - 34279721
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  34279894 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 34279802  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
        | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  34279801 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 34279721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38156803 - 38156632
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||             
T  38156803 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttca--------- 38156713  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
      | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38156712 --tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 54401186 - 54401360
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  54401186 ggttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 54401277  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  54401278 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattgccacctt 54401360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 55000350 - 55000176
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||            
T  55000350 ggttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttca-------- 55000259  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  55000258 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 55000176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 182 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41635972 - 41635796
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||            
T  41635972 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 41635881  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  41635880 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtcaccttat 41635796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47511114 - 47510940
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||          
T  47511114 taggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------ 47511021  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
         | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47511020 -----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 47510940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31286963 - 31286790
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||              
T  31286963 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 31286874  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
     | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  31286873 -tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtcacctta 31286790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 37028721 - 37028894
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||           
T  37028721 aggttttttttaaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttca------- 37028813  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
        | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  37028814 ----tgaatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 37028894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550465
Alignment:
Q  250 tgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg 349  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  350 taccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33550482 taccctagttgtcacctt 33550465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39141298 - 39141123
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||       
T  39141298 ggttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat--- 39141202  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
          | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  39141201 ------atatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcat-ggtaacctagttatcacctt 39141123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30251674 - 30251499
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  30251674 aggttttttctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatac 30251575  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||| |||||| |||           |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30251574 cacctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 30251499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864673
Alignment:
Q  243 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggtt-gagtaaattacccaccattctt 52864648  T
Q  343 ccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  52864649 ccatgggtaccctagttgtcacctt 52864673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 184 - 364
Target Start/End: Original strand, 51143818 - 51143987
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  51143818 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccac 51143917  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  51143918 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcac 51143987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 182 - 363
Target Start/End: Original strand, 45058882 - 45059052
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  45058882 ggttttttttaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 45058973  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
       | || |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  45058974 ---tgaatatgtgcttatgttgctaatgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatgggcagcctagttgtca 45059052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 181 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17665697 - 17665549
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  17665697 aggttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 17665605  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattc 340  Q
        | || || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17665604 ----tgaatatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 17665549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Original strand, 24688114 - 24688285
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||             
T  24688114 gttttttctaaattacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttca--------- 24688204  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
      | || ||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24688205 --tgaatatgtgtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtcacc 24688285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 182 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42998960 - 42998790
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42998960 ggttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 42998862  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    || |||||| |||           ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  42998861 acctaaaaaggtg-----------aatgcttattggttgggataaattacccaccatttttccatgagtaccttagttgtcac 42998790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43176908 - 43176738
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||    
T  43176908 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccac 43176809  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     |||||| |||            |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43176808 ctaaaaaggtg-----------gatgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 43176738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 184 - 360
Target Start/End: Original strand, 40022075 - 40022240
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||              
T  40022075 ttttttctaaattacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 40022164  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttg 360  Q
     | || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||||    
T  40022165 -tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagcgtagttg 40022240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 44946101 - 44945932
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||                
T  44946101 ggttttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatag------------ 44946014  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
         || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  44946013 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcacctta 44945932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 51224210 - 51224038
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  51224210 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 51224119  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
        | || ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  51224118 ----tgaatatgtgcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 51224038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2228108 - 2227995
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  2228108 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatat 2228009  T
Q  281 cacttaaaaatgtg 294  Q
    ||||| ||||||||    
T  2228008 cacttcaaaatgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21597321 - 21597147
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  21597321 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatac 21597222  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||  |||||| |||           ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  21597221 caactaaaaaggtg-----------aatgtttattggtttgggtaaattatccactatttttccatgggtactttagttgtcacct 21597147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41882161 - 41882063
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41882161 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 50732083 - 50731914
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||      
T  50732083 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatc 50731984  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||  |||           |||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50731983 taaaacggtg-----------aatgttcgttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50731914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 50780773 - 50780942
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||      
T  50780773 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatc 50780872  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||  |||           |||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50780873 taaaacggtg-----------aatgttcgttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50780942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 232 - 314
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182131
Alignment:
Q  232 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 47182131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402810
Alignment:
Q  192 agattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaat 291  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaat 47402813  T
Q  292 gtg 294  Q
    |||    
T  47402812 gtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28576285 - 28576184
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  28576285 aggttttttctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatac 28576186  T
Q  281 ca 282  Q
    ||    
T  28576185 ca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48726170 - 48726070
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||    
T  48726170 ggttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggatacc 48726071  T
Q  282 a 282  Q
    |    
T  48726070 a 48726070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Original strand, 40165653 - 40165822
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||  ||| ||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  40165653 ttttttctaaattatctttgaaaaataatgg-taatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 40165751  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40165752 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacc 40165822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 290 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48534082 - 48534003
Alignment:
Q  290 atgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  48534082 atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttat 48534003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 366
Target Start/End: Original strand, 177162 - 177333
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||    
T  177162 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatacaac 177261  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||    
T  177262 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggagcaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacct 177333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 52756214 - 52756067
Alignment:
Q  211 gtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaat-- 308  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |||           |||||||||||||| |||      
T  52756214 gtgggttatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatta 52756126  T
Q  309 --gtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
      ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  52756125 atgtgtattggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 52756067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 259
Target Start/End: Original strand, 52434138 - 52434216
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaa-tttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  52434138 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429226
Alignment:
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtcacct 30429226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 48752085 - 48752161
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 259  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  48752085 gttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 235
Target Start/End: Original strand, 37741432 - 37741487
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaat 235  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37741432 taggttttttttagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8847827 - 8847718
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||  |||||||   |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||   ||||||||    
T  8847827 tttttttaaattacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccact 8847728  T
Q  285 taaaaatgtg 294  Q
    ||||||||||    
T  8847727 taaaaatgtg 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 366
Target Start/End: Original strand, 41609098 - 41609239
Alignment:
Q  214 ggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgta 313  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || |||| || || ||||||||| ||||| || ||||||||||           |||||  |    
T  41609098 ggtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg-----------aatgttca 41609186  T
Q  314 ttggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41609187 ttggttgaggtaaattatccgtcattcttccatgggtacattagttgtcacct 41609239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51942588 - 51942543
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccac 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  51942588 ggttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccac 51942543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 313 - 369
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688487
Alignment:
Q  313 attggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcaccttat 40688487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 41882053 - 41882010
Alignment:
Q  323 gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41882053 gtaaattatccaccattcttccacgggtaccctagttgtcacct 41882010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 52434291 - 52434344
Alignment:
Q  306 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 359  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  52434291 aatgtttattggttggagtaaattacccaccatttttctataggtaccctagtt 52434344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 364
Target Start/End: Original strand, 37760346 - 37760386
Alignment:
Q  324 taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37760346 taaattacccaccattcttccataggtaccctagttatcac 37760386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 364
Target Start/End: Original strand, 48752226 - 48752284
Alignment:
Q  306 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | || ||||||||||||    
T  48752226 aatgtttattggttgggataaattacccacaatttttccatagatatcctagttgtcac 48752284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 43260882 - 43260841
Alignment:
Q  322 ggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43260882 ggtaaattacccactatttttccatggataccctagttgtca 43260841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33550609 - 33550581
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33550609 ggttttttctagattacctttgaagaatg 33550581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 128)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 177 - 365
Target Start/End: Original strand, 23437586 - 23437774
Alignment:
Q  177 taataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatag 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23437586 taataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 23437685  T
Q  277 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437686 ataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23437774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 183 - 367
Target Start/End: Original strand, 34276547 - 34276731
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34276547 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 34276646  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34276647 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 34276731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21366789 - 21366609
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21366789 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 21366690  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366689 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 21366609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 9798464 - 9798647
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9798464 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 9798563  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9798564 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9798647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Original strand, 237475 - 237661
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  237475 aggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataa 237574  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  237575 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacctt 237661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Original strand, 42085205 - 42085390
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42085205 aggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 42085304  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42085305 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacct 42085390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 184 - 364
Target Start/End: Original strand, 6019929 - 6020109
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6019929 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 6020028  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020029 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 6020109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 180 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32366845 - 32366661
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32366845 taggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 32366746  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366745 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 32366661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 366
Target Start/End: Original strand, 39077540 - 39077728
Alignment:
Q  178 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcataga 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  39077540 aataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatgga 39077639  T
Q  278 taccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39077640 taccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacct 39077728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 55056442 - 55056258
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  55056442 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataca 55056343  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  55056342 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccttgttgtcacct 55056258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 53462000 - 53461813
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53462000 aggttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 53461901  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53461900 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctta 53461813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 53854612 - 53854430
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53854612 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 53854513  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53854512 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 53854430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2826865 - 2826681
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2826865 aggttttttctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 2826766  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2826765 cacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacct 2826681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42766024 - 42765840
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42766024 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gatacc 42765926  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42765925 acttaaaaatgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 42765840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31070256 - 31070069
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  31070256 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcat-gatacc 31070158  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 370  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31070157 acttaaaaatgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 31070069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31532319 - 31532135
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31532319 aggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 31532220  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31532219 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31532135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 44984763 - 44984943
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44984763 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 44984862  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44984863 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44984943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 51363005 - 51363188
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  51363005 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatac 51363104  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51363105 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 51363188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 54575124 - 54574940
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  54575124 aggttttttctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggatac 54575025  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54575024 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54574940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 27373075 - 27373257
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373075 ggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 27373174  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  27373175 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctaattgtcacc 27373257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18462195 - 18462013
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18462195 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatca 18462096  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18462095 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 18462013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 181 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41702643 - 41702461
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41702643 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggatac 41702544  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41702543 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 41702461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 180 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19387873 - 19387684
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19387873 taggttttttctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggata 19387774  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19387773 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 19387684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 182 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 43471878 - 43471689
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43471878 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggatacc 43471779  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43471778 acttaaaaatgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctaataa 43471689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 182 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 50457993 - 50457804
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50457993 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 50457894  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50457893 acttaaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcatcttataa 50457804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 183 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 146611 - 146427
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  146611 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 146512  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  146511 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtcacctt 146427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26091442 - 26091258
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26091442 aggttttttctaaattatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 26091343  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26091342 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26091258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 29478358 - 29478542
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29478358 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 29478457  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29478458 cacttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 29478542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 47344654 - 47344838
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47344654 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 47344753  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47344754 cacttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 182 - 369
Target Start/End: Original strand, 2243457 - 2243644
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2243457 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggatacc 2243556  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2243557 acttaaaaatgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccttat 2243644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Original strand, 50233998 - 50234185
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  50233998 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggatac 50234097  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  50234098 cacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtcacctta 50234185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 177 - 363
Target Start/End: Original strand, 397396 - 397582
Alignment:
Q  177 taataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatag 276  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  397396 taattggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 397495  T
Q  277 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  397496 ataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 397582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 41949381 - 41949566
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41949381 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 41949480  T
Q  282 acttaaaaatgtgct--tatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41949481 acttaaaaatgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcacc 41949566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22618693 - 22618511
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22618693 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccac 22618595  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22618594 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 22618511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 362
Target Start/End: Original strand, 6285307 - 6285486
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6285307 gttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggatacca 6285406  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 362  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6285407 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 6285486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 179 - 366
Target Start/End: Original strand, 31914194 - 31914380
Alignment:
Q  179 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagat 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31914194 ataggttttttttagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 31914293  T
Q  279 accacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31914294 accacttaaaaatgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacct 31914380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 45797476 - 45797663
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45797476 taggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 45797575  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45797576 ccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 45797663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 55519826 - 55520009
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  55519826 ggttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggatacc 55519925  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55519926 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 55520009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 55776042 - 55776228
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  55776042 taggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggata 55776140  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  55776141 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacctt 55776228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 55840220 - 55840406
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  55840220 taggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggata 55840318  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  55840319 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacctt 55840406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 181 - 371
Target Start/End: Original strand, 3170624 - 3170814
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  3170624 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatat 3170723  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  3170724 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacctaataa 3170814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 182 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3692393 - 3692207
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||    
T  3692393 ggttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgatacc 3692294  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3692293 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 3692207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 182 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29777440 - 29777254
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  29777440 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggatacc 29777341  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29777340 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctta 29777254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Original strand, 42222292 - 42222473
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42222292 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccac 42222391  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42222392 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 42222473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 49881248 - 49881059
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  49881248 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggata 49881149  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggg----taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49881148 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 49881059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 54086408 - 54086590
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  54086408 aggttttttctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatac 54086505  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54086506 cgcttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54086590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 407753 - 407934
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  407753 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-c 407851  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  407852 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 407934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 186 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31972515 - 31972336
Alignment:
Q  186 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccactt 285  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31972515 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactt 31972416  T
Q  286 aaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31972415 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtcacc 31972336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 41560327 - 41560510
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41560327 ggttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 41560426  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41560427 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacc 41560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 54607961 - 54608144
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  54607961 ggttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtatacc 54608060  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  54608061 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggataccctagtagtcacc 54608144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 182 - 368
Target Start/End: Original strand, 38591667 - 38591849
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38591667 ggttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 38591766  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    | |    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38591767 att----aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 38591849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 365
Target Start/End: Original strand, 54424976 - 54425163
Alignment:
Q  177 taataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatag 276  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54424976 taataggttttatctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatag 54425075  T
Q  277 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  54425076 ataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccat-ggtacactagttgtcacc 54425163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 184 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22468951 - 22468788
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22468951 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccac 22468852  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 347  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22468851 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccatg 22468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 23609086 - 23609269
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23609086 ggttttttctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggatacc 23609185  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23609186 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtcacc 23609269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47662286 - 47662099
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| || |||||    
T  47662286 aggttttttctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggatac 47662187  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47662186 cacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacctta 47662099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 56023181 - 56022998
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  56023181 ggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggatacc 56023082  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  56023081 acttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 56022998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 361
Target Start/End: Original strand, 35446506 - 35446683
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  35446506 gttttttctagattaccttttaagaatggtgggtaattta-ccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatca 35446604  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 361  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35446605 cttaaaaatgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35446683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 361
Target Start/End: Original strand, 50534632 - 50534809
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50534632 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 50534731  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 361  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50534732 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgt 50534809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 42033173 - 42033357
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42033173 aggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatac 42033272  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033273 cacttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 42033357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14017558 - 14017374
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14017558 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 14017459  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14017458 cactt--aagtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 14017374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 1932762 - 1932947
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1932762 ggttttttctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagatacc 1932861  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  1932862 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtaccctagttatcacctt 1932947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 48657822 - 48658002
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48657822 taggtttttt-tagattacctttgaagaatggtgggtc------ccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 48657914  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48657915 ccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 48658002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 48313556 - 48313737
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  48313556 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggatacc 48313654  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||| ||||| ||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48313655 actt-aaaatatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48313737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 179 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 53834240 - 53834055
Alignment:
Q  179 ataggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagat 278  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  53834240 atagattttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggat 53834141  T
Q  279 accacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53834140 accacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcac 53834055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 41632190 - 41632007
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  41632190 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggatat 41632092  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41632091 cgcttaaaaatgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtcacc 41632007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 181 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 50536808 - 50536628
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  50536808 aggttttttttagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggatac 50536709  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 361  Q
    ||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50536708 cacttaaaaatatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgt 50536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 54805802 - 54805614
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  54805802 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagatac 54805703  T
Q  281 cacttaaaaatgtg----cttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  54805702 cacttaaaaatgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtaccctagatgtcacc 54805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 182 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39587962 - 39587796
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39587962 ggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 39587863  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 348  Q
    |||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39587862 acttaaaaatgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccatgg 39587796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Original strand, 48654815 - 48655004
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  48654815 ttttttttagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccac 48654914  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggcca------atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    |||||||||| |||||||||| |      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48654915 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtcacctt 48655004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 185 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33897675 - 33897504
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33897675 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33897576  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 356  Q
    ||||||| || |||| |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33897575 taaaaatatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggtacccta 33897504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48259691 - 48259508
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  48259691 ttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccac 48259592  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    || |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  48259591 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctacttatcaccttat 48259508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36533003 - 36532828
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36533003 ggttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaattta--caccac--------aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 36532914  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36532913 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacctt 36532828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 224 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 52728447 - 52728301
Alignment:
Q  224 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||    
T  52728447 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgagg 52728348  T
Q  324 taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  52728347 taaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccctataa 52728301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 363
Target Start/End: Original strand, 51951683 - 51951861
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||     
T  51951683 ttttttctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcag 51951782  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  51951783 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt-gtgtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 51951861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9998103 - 9997931
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||      
T  9998103 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata-- 9998006  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9998005 ---------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9997931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37239263 - 37239088
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  37239263 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 37239171  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
        | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  37239170 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 37239088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 45633952 - 45633779
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  45633952 aggttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 45633860  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
        | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45633859 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15060461 - 15060289
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  15060461 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 15060370  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15060369 ---tgaatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15060289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 183 - 367
Target Start/End: Original strand, 54715035 - 54715208
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||             
T  54715035 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttca--------- 54715125  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
      | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54715126 --tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacctt 54715208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Original strand, 34835175 - 34835351
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  34835175 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatac 34835274  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||  |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835275 catctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctta 34835351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Original strand, 43890929 - 43891101
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||  |||        
T  43890929 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatgaata---- 43891024  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
           |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43891025 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcacctt 43891101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 38547773 - 38547594
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  38547773 ggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 38547674  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataag 372  Q
    || |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  38547673 acctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacctaataag 38547594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 184 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20352012 - 20351836
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||              
T  20352012 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttca---------- 20351923  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttataa 371  Q
     | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20351922 -tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcaccttataa 20351836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5117609 - 5117438
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||             
T  5117609 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca--------- 5117519  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
      | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  ||||||||||||    
T  5117518 --tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttaatggatagtctagttgtcacc 5117438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 34552318 - 34552490
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||            
T  34552318 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttca-------- 34552409  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34552410 ---tgaatatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 34552490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 369
Target Start/End: Original strand, 46720024 - 46720203
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  46720024 ggttttttctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggatacc 46720123  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    || |||||| |||  |||       |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46720124 acctaaaaaggtg-atat-------atgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgttaccttat 46720203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14335271 - 14335100
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14335271 ttttttctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccac 14335172  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
     |||||| |||           ||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14335171 ctaaaaaggtg-----------aatgctcattgtttgaggtaaattacccaccattctttcatgggtactctagttgtcacct 14335100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27873720 - 27873548
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||            
T  27873720 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttca-------- 27873629  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  27873628 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt--ttgggtagcctagttgtcacctt 27873548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31881486 - 31881311
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  31881486 ggttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 31881395  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
       | || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  31881394 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgccacctta 31881311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Original strand, 47811906 - 47812081
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||  |||       
T  47811906 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaata--- 47812002  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  47812003 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcaccttat 47812081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 54216910 - 54216736
Alignment:
Q  180 taggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||          
T  54216910 taggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttca------ 54216817  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
         | || |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  54216816 -----tgaatatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggataccctagttatcacc 54216736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 22620591 - 22620764
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  22620591 aggttttttctaaattatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 22620683  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
        | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  22620684 ----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 22620764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 268 - 370
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595874
Alignment:
Q  268 agttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccat 35595871  T
Q  368 ata 370  Q
    |||    
T  35595872 ata 35595874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27398775 - 27398607
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27398775 ggttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 27398676  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 361  Q
    ||||||||||||            ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  27398675 acttaaaaatgt-----------aaatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcattggtaccctagttgt 27398607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 33289702 - 33289873
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||  ||||     
T  33289702 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac- 33289800  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
              ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  33289801 ----------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta-ttgtcacc 33289873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 363
Target Start/End: Original strand, 54216311 - 54216482
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||           
T  54216311 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca------- 54216403  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 363  Q
        | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  54216404 ----tgaatatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagttgtca 54216482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4486753 - 4486579
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||            
T  4486753 ggttttttctaaattatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattca-------- 4486662  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||  ||||||||||||||    
T  4486661 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatagatagtctagttgtcacctt 4486579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 46708913 - 46708740
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  46708913 ggttatttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 46708822  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
       | || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  46708821 ---tgaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtcacct 46708740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 52688348 - 52688520
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||            
T  52688348 ggttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttca-------- 52688439  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
       | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  52688440 ---tgaatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 52688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 238 - 365
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509478
Alignment:
Q  238 aaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 337  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  338 ttcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42509451 ttcttccatgagtaccctagttatcacc 42509478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6371420 - 6371247
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |  | |||||    
T  6371420 gttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttacca 6371321  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    | |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  6371320 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacctt 6371247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 49014096 - 49014269
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||           
T  49014096 aggttttttttaaatcacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 49014188  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
        | || |||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  49014189 ----tgaatatgtacttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 49014269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1662431 - 1662259
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1662431 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 1662332  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    || ||||||  |             ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1662331 acctaaaaagat-------------atgttcattggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtcacctt 1662259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Original strand, 27580120 - 27580292
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27580120 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27580219  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
     ||||||  ||           ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||    
T  27580220 ctaaaaagatg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccatcatttttccatgggtatcttatttgtcacctt 27580292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 52461365 - 52461535
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||            
T  52461365 ggttttttctaaattacctttgaa---tggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 52461453  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
       | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  52461454 ---tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacct 52461535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 573802 - 573974
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  573802 ggttgtttctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 573901  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    || |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  573902 acctaaaaaagtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtcacc 573974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 282
Target Start/End: Original strand, 43231502 - 43231601
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  43231502 ggttttttctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 43231600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 267
Target Start/End: Original strand, 42557583 - 42557666
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagat 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42557583 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3293196 - 3293103
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3293196 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 3293103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11972302 - 11972209
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11972302 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcat 11972209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 292 - 364
Target Start/End: Original strand, 33048990 - 33049062
Alignment:
Q  292 gtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 364  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33048990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 231 - 321
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  231 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa-gatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33558112 - 33557960
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||              
T  33558112 ttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttca---------- 33558023  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 347  Q
     | || ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33558022 -tgaatatgtatttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatg 33557960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 263 - 364
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344968
Alignment:
Q  263 aagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 362  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-tggtaaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtc 35344966  T
Q  363 ac 364  Q
    ||    
T  35344967 ac 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259700
Alignment:
Q  288 aaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccttat 48259700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 49058038 - 49057933
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||     
T  49058038 ttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccat 49057939  T
Q  284 ttaaaa 289  Q
    ||||||    
T  49057938 ttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 365
Target Start/End: Original strand, 27872607 - 27872750
Alignment:
Q  211 gtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgt 310  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |||           |||||    
T  27872607 gtggataatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgt 27872695  T
Q  311 gtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27872696 ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtcacc 27872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 368
Target Start/End: Original strand, 42558270 - 42558370
Alignment:
Q  260 gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  42558270 gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtg--------gctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagtt 42558361  T
Q  360 gtcacctta 368  Q
    |||||||||    
T  42558362 gtcacctta 42558370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17555670 - 17555617
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17555670 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291802
Alignment:
Q  297 tatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtcacctta 3291802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 51981609 - 51981479
Alignment:
Q  224 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggg 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||           | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51981609 ccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtgggattaagatagttca-----------tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggg 51981521  T
Q  324 taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||||  |||||| |||||    
T  51981520 taaattactcatcattctttcattggtagactagttatcacc 51981479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206608
Alignment:
Q  194 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagata 268  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |   ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagata 18206608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 271
Target Start/End: Original strand, 43478059 - 43478147
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||   ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  43478059 ggttttttctagattactttcaaagaaccatgggtaatttatcgatcaaccaatg-aaatgagcaatttattagtgtggtcaagatagtt 43478147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 19685675 - 19685714
Alignment:
Q  1 tggagcaaaggtgataagtttaggacttttaaatcaggta 40  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19685675 tggagtaaaggtgataagtctaggacttttaaatcaggta 19685714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 54710040 - 54710005
Alignment:
Q  207 aatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54710040 aatggtgggtaatttatccaccaaccaataaaaatg 54710005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18206553 - 18206512
Alignment:
Q  324 taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18206553 taaattacccatcatttttccatgggtaccttagttgtcacc 18206512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47105148 - 47105108
Alignment:
Q  233 aatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttca 273  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47105148 aatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttca 47105108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47105358 - 47105318
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattta 222  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  47105358 ggttttttttagattatctttaaagaatggtgggtaattta 47105318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 182 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13945 - 13759
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13945 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 13846  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13845 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 13759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39739 - 39554
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39739 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 39640  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39639 acttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 39554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2051
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1871 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 1970  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1971 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 2051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11312 - 11133
Alignment:
Q  185 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11312 tttttctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 11214  T
Q  285 taaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11213 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2615 - 2432
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2615 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatacc 2516  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2515 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttatcacc 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 75427 - 75242
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  75427 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcatacc 75328  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  75327 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtcacctt 75242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 278005 - 278192
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata-- 279  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  278005 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 278104  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278105 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 278192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 195 - 366
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176837
Alignment:
Q  195 ttacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  295 cttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtcacct 176837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 182 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19037 - 18850
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19037 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacc 18938  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 369  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18937 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 18850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 182 - 337
Target Start/End: Original strand, 32560 - 32715
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32560 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 32659  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 337  Q
    | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32660 atttaaaaatgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4771 - 4596
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||      ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  4771 ttttttctagattaactttgaataatggtgggtaa------caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccac 4678  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4677 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 366
Target Start/End: Original strand, 3089 - 3262
Alignment:
Q  184 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  3089 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcac 3179  T
Q  284 ttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 366  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  3180 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatggataccttagttgtcacct 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 182 - 365
Target Start/End: Original strand, 7089 - 7262
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||           
T  7089 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 7181  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
        | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7182 ----tgaatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 7262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20648 - 20477
Alignment:
Q  183 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  20648 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 20549  T
Q  283 cttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    | |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20548 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 20477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 14742 - 14915
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  14742 aggttttgtctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatac 14841  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14842 cacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 14915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4728 - 4554
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4728 aggttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggata 4629  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||| ||||||| |||           |||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4628 ccatttaaaaaggtg-----------aatgttcattggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 4554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 3390 - 3564
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 279  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3390 aggttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggata 3489  T
Q  280 ccacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||| ||||||| |||           |||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3490 ccatttaaaaaggtg-----------aatgttcattggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 3564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 100 - 272
Alignment:
Q  181 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||    
T  100 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaatac 199  T
Q  281 cacttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 365  Q
    ||| |||||| |||           |||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  200 cacctaaaaaggtg-----------aatgttaattggttgaggtaaatt-cccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 182 - 331
Target Start/End: Original strand, 17905 - 18043
Alignment:
Q  182 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||| ||| || ||  ||||     
T  17905 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatac- 18003  T
Q  282 acttaaaaatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttggggtaaattac 331  Q
              ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18004 ----------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 268
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19302
Alignment:
Q  194 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagata 268  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |   ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagata 19302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University