View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19926_high_2 (Length: 374)

Name: NF19926_high_2
Description: NF19926
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19926_high_2
NF19926_high_2
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (31-352)||(2041-2362)
scaffold0234 (31-352)||(10932-11253)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (31-352)||(17684189-17684510)
chr6 (31-352)||(27380972-27381293)
chr6 (31-352)||(27471355-27471676)
chr6 (31-352)||(11651889-11652210)
chr6 (31-352)||(17691160-17691481)
chr6 (31-352)||(29309056-29309377)
chr6 (31-352)||(29316016-29316336)
chr6 (31-352)||(188697-189018)
chr6 (31-270)||(27296877-27297116)
chr6 (31-304)||(16394165-16394438)
chr6 (35-272)||(25536915-25537152)
chr6 (32-253)||(16559193-16559414)
chr6 (48-356)||(13359010-13359314)
chr6 (248-352)||(16566257-16566361)
chr6 (41-335)||(2669476-2669768)
chr6 (31-338)||(16789071-16789373)
chr6 (31-338)||(22859888-22860190)
chr6 (31-338)||(27508347-27508649)
chr6 (31-338)||(1586108-1586410)
chr6 (45-338)||(27527947-27528235)
chr6 (31-338)||(14074480-14074782)
chr6 (75-338)||(18019885-18020143)
chr6 (53-346)||(10359073-10359359)
chr6 (31-338)||(8612915-8613221)
chr6 (209-337)||(27925935-27926062)
chr6 (134-337)||(17850321-17850521)
chr6 (116-268)||(20736413-20736562)
chr6 (215-320)||(28172754-28172859)
chr6 (214-346)||(20553492-20553622)
chr6 (100-285)||(8510155-8510338)
chr6 (31-144)||(33317055-33317167)
chr6 (31-270)||(17120505-17120740)
chr6 (300-352)||(25537148-25537200)
chr6 (243-338)||(13995151-13995245)
chr6 (128-270)||(21994655-21994794)
chr6 (128-340)||(19218427-19218630)
chr6 (203-324)||(19347092-19347212)
chr6 (159-339)||(22560311-22560487)
chr6 (109-172)||(28172899-28172963)
chr6 (48-187)||(28756145-28756283)
chr6 (116-263)||(5758565-5758709)
chr6 (128-340)||(4073574-4073781)
chr6 (302-338)||(20736594-20736630)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (31-352)||(18262378-18262699)
chr4 (31-352)||(18269239-18269560)
chr4 (31-352)||(55612849-55613170)
chr4 (31-352)||(26963806-26964127)
chr4 (31-352)||(26970629-26970950)
chr4 (31-352)||(868763-869084)
chr4 (31-352)||(19926480-19926801)
chr4 (31-352)||(5707486-5707807)
chr4 (31-352)||(5714114-5714435)
chr4 (31-352)||(8858333-8858654)
chr4 (31-352)||(10621053-10621374)
chr4 (31-346)||(10628132-10628447)
chr4 (31-352)||(28392854-28393175)
chr4 (31-352)||(8845369-8845690)
chr4 (31-352)||(4426336-4426645)
chr4 (31-346)||(35223732-35224047)
chr4 (31-342)||(5667849-5668156)
chr4 (27-352)||(20311458-20311781)
chr4 (31-263)||(10677303-10677534)
chr4 (31-263)||(10890943-10891174)
chr4 (31-338)||(15461497-15461799)
chr4 (31-338)||(34975551-34975853)
chr4 (31-338)||(2677013-2677315)
chr4 (31-338)||(15815021-15815323)
chr4 (31-338)||(18111043-18111345)
chr4 (31-338)||(3369023-3369325)
chr4 (31-338)||(17299959-17300261)
chr4 (31-338)||(18163162-18163464)
chr4 (31-338)||(20243937-20244239)
chr4 (31-338)||(26531613-26531915)
chr4 (31-338)||(4675983-4676285)
chr4 (206-342)||(56516232-56516368)
chr4 (31-337)||(5870419-5870720)
chr4 (132-282)||(21453961-21454110)
chr4 (47-338)||(19365519-19365806)
chr4 (31-338)||(1941724-1942026)
chr4 (31-317)||(32646523-32646807)
chr4 (48-270)||(19362477-19362695)
chr4 (31-263)||(9487625-9487853)
chr4 (133-338)||(32636484-32636685)
chr4 (47-270)||(5528495-5528714)
chr4 (47-346)||(5616387-5616681)
chr4 (256-334)||(24700213-24700291)
chr4 (31-251)||(30040489-30040705)
chr4 (47-263)||(9538033-9538244)
chr4 (116-338)||(4546080-4546298)
chr4 (31-248)||(11421096-11421309)
chr4 (109-159)||(24701361-24701411)
chr4 (128-282)||(33888594-33888743)
chr4 (294-346)||(10677538-10677590)
chr4 (294-346)||(10891178-10891230)
chr4 (164-291)||(34777850-34777975)
chr4 (280-350)||(9937933-9938003)
chr4 (59-140)||(9937745-9937826)
chr4 (170-261)||(9937830-9937923)
chr4 (302-338)||(11421016-11421052)
chr4 (302-346)||(30040740-30040784)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (31-352)||(6110230-6110551)
chr3 (31-352)||(16482203-16482524)
chr3 (31-352)||(10579075-10579396)
chr3 (31-352)||(15600604-15600925)
chr3 (31-352)||(15607149-15607470)
chr3 (31-352)||(10572312-10572633)
chr3 (31-352)||(15341939-15342260)
chr3 (31-352)||(18520141-18520462)
chr3 (31-337)||(8490676-8490982)
chr3 (35-345)||(18522836-18523146)
chr3 (31-352)||(15357306-15357627)
chr3 (31-352)||(17780838-17781159)
chr3 (31-352)||(13211468-13211789)
chr3 (31-346)||(13248779-13249094)
chr3 (31-352)||(32056619-32056941)
chr3 (27-352)||(17199900-17200225)
chr3 (31-352)||(13516977-13517294)
chr3 (31-346)||(1647241-1647556)
chr3 (31-352)||(17136525-17136840)
chr3 (31-352)||(29925137-29925458)
chr3 (31-352)||(29974290-29974611)
chr3 (31-321)||(16200627-16200917)
chr3 (31-338)||(21034238-21034540)
chr3 (31-338)||(15846536-15846838)
chr3 (31-338)||(20147554-20147856)
chr3 (31-338)||(21398792-21399094)
chr3 (49-346)||(24253130-24253423)
chr3 (31-338)||(14890391-14890693)
chr3 (31-338)||(55427021-55427323)
chr3 (31-338)||(12299911-12300212)
chr3 (31-270)||(25978728-25978963)
chr3 (129-346)||(14147013-14147226)
chr3 (65-263)||(15526827-15527021)
chr3 (31-189)||(28088251-28088408)
chr3 (31-270)||(11787654-11787889)
chr3 (31-335)||(15317176-15317472)
chr3 (170-299)||(28953965-28954093)
chr3 (300-352)||(19089734-19089786)
chr3 (105-297)||(32280313-32280507)
chr3 (253-346)||(9504455-9504548)
chr3 (227-342)||(8251933-8252048)
chr3 (69-184)||(30464147-30464261)
chr3 (279-352)||(16200291-16200363)
chr3 (128-192)||(36138033-36138097)
chr3 (207-259)||(4189223-4189275)
chr3 (128-192)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (31-352)||(18252196-18252517)
chr1 (31-352)||(18532234-18532555)
chr1 (31-352)||(27131130-27131450)
chr1 (31-352)||(27310297-27310618)
chr1 (31-352)||(16358755-16359076)
chr1 (31-346)||(3855639-3855954)
chr1 (31-346)||(36816354-36816668)
chr1 (31-312)||(22641594-22641871)
chr1 (31-346)||(27277278-27277592)
chr1 (159-352)||(21171081-21171274)
chr1 (31-338)||(19706439-19706741)
chr1 (31-338)||(43802365-43802667)
chr1 (31-338)||(28134723-28135025)
chr1 (198-352)||(22657108-22657262)
chr1 (31-322)||(23507096-23507385)
chr1 (31-338)||(9456116-9456418)
chr1 (31-224)||(9916497-9916689)
chr1 (109-346)||(12014084-12014319)
chr1 (31-338)||(20391239-20391541)
chr1 (31-338)||(20779645-20779947)
chr1 (31-338)||(22670257-22670559)
chr1 (31-338)||(42816989-42817291)
chr1 (31-338)||(22612492-22612794)
chr1 (51-347)||(633925-634216)
chr1 (229-345)||(9917837-9917952)
chr1 (31-338)||(8727667-8727969)
chr1 (31-338)||(47667485-47667776)
chr1 (47-270)||(29096789-29097008)
chr1 (206-338)||(35930582-35930713)
chr1 (233-322)||(12006461-12006550)
chr1 (31-144)||(28145723-28145835)
chr1 (131-263)||(21881475-21881604)
chr1 (118-283)||(24301691-24301855)
chr1 (204-330)||(26923553-26923678)
chr1 (210-263)||(51997353-51997406)
chr1 (98-178)||(12006332-12006413)
chr1 (133-192)||(10852402-10852461)
chr1 (170-249)||(31236402-31236478)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (32-352)||(21940831-21941151)
chr8 (31-352)||(22171653-22171974)
chr8 (31-352)||(6094289-6094610)
chr8 (31-352)||(24642815-24643135)
chr8 (31-294)||(15326422-15326685)
chr8 (31-294)||(15506791-15507054)
chr8 (31-172)||(28548393-28548534)
chr8 (98-341)||(14983710-14983950)
chr8 (31-346)||(8371253-8371563)
chr8 (31-338)||(21969333-21969635)
chr8 (146-343)||(24797224-24797419)
chr8 (31-338)||(12562123-12562425)
chr8 (31-338)||(27007517-27007819)
chr8 (31-338)||(27014660-27014962)
chr8 (31-338)||(27880487-27880789)
chr8 (31-338)||(28020668-28020970)
chr8 (47-346)||(38232115-38232412)
chr8 (31-338)||(22130609-22130911)
chr8 (31-338)||(25611195-25611497)
chr8 (31-337)||(22659494-22659795)
chr8 (31-338)||(21916676-21916978)
chr8 (31-338)||(45534273-45534575)
chr8 (31-338)||(26240484-26240786)
chr8 (128-346)||(18835342-18835556)
chr8 (211-350)||(32872741-32872880)
chr8 (31-270)||(6430953-6431188)
chr8 (116-262)||(8781959-8782102)
chr8 (229-315)||(2375214-2375300)
chr8 (41-138)||(24796731-24796826)
chr8 (47-193)||(20535226-20535371)
chr8 (31-270)||(2962932-2963171)
chr8 (241-335)||(29645537-29645631)
chr8 (26-144)||(36970439-36970556)
chr8 (27-144)||(2375411-2375528)
chr8 (231-338)||(36970265-36970371)
chr8 (58-180)||(29645675-29645797)
chr8 (239-291)||(10920427-10920479)
chr8 (264-319)||(24535514-24535569)
chr8 (317-352)||(28555049-28555084)
chr8 (31-92)||(8968015-8968076)
chr8 (43-91)||(41368106-41368154)
chr8 (43-91)||(41375077-41375125)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (31-346)||(24695186-24695501)
chr5 (31-352)||(19714218-19714539)
chr5 (31-352)||(19706939-19707259)
chr5 (31-352)||(18569581-18569904)
chr5 (153-352)||(39538754-39538953)
chr5 (31-322)||(17298621-17298912)
chr5 (31-322)||(17285470-17285759)
chr5 (118-346)||(18806843-18807069)
chr5 (27-193)||(27347252-27347417)
chr5 (31-138)||(24701950-24702057)
chr5 (31-338)||(20941027-20941329)
chr5 (31-338)||(25805385-25805687)
chr5 (31-338)||(31899-32201)
chr5 (31-338)||(12789663-12789965)
chr5 (31-338)||(22941250-22941552)
chr5 (31-338)||(23545922-23546224)
chr5 (207-341)||(22546912-22547046)
chr5 (31-338)||(24933306-24933608)
chr5 (43-336)||(20100255-20100543)
chr5 (31-338)||(31096816-31097118)
chr5 (31-338)||(12764990-12765296)
chr5 (31-338)||(5097651-5097953)
chr5 (31-338)||(7865430-7865736)
chr5 (31-338)||(9811733-9812039)
chr5 (31-338)||(12703874-12704180)
chr5 (118-256)||(18806483-18806619)
chr5 (118-256)||(18806663-18806799)
chr5 (258-346)||(27347425-27347513)
chr5 (27-116)||(28719471-28719558)
chr5 (31-280)||(18829281-18829530)
chr5 (31-338)||(26245102-26245404)
chr5 (27-270)||(26129689-26129928)
chr5 (31-112)||(39538954-39539035)
chr5 (206-335)||(33477193-33477321)
chr5 (293-337)||(39535465-39535509)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (31-352)||(7273-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (31-352)||(6654-6975)
scaffold0390 (31-352)||(13670-13991)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (35-352)||(15152609-15152926)
chr7 (31-352)||(29327950-29328271)
chr7 (31-352)||(11535782-11536103)
chr7 (31-352)||(11542700-11543021)
chr7 (31-357)||(12750987-12751313)
chr7 (31-352)||(12738702-12739023)
chr7 (31-352)||(18561173-18561485)
chr7 (31-342)||(13392326-13392637)
chr7 (25-343)||(18257559-18257874)
chr7 (31-338)||(2204552-2204854)
chr7 (31-338)||(8464999-8465301)
chr7 (31-338)||(18400104-18400406)
chr7 (31-338)||(18407088-18407390)
chr7 (31-338)||(48808496-48808798)
chr7 (31-338)||(15729751-15730053)
chr7 (31-338)||(18139338-18139640)
chr7 (31-338)||(19230888-19231190)
chr7 (43-338)||(30254138-30254428)
chr7 (31-271)||(2365169-2365407)
chr7 (31-270)||(41680968-41681203)
chr7 (31-338)||(10668901-10669204)
chr7 (43-338)||(47166871-47167161)
chr7 (53-337)||(24443349-24443628)
chr7 (31-263)||(34128647-34128875)
chr7 (116-346)||(19388544-19388774)
chr7 (31-338)||(28130561-28130863)
chr7 (229-319)||(10235361-10235451)
chr7 (53-340)||(25845498-25845780)
chr7 (53-340)||(25845917-25846199)
chr7 (69-338)||(19393462-19393726)
chr7 (31-270)||(18259124-18259359)
chr7 (229-337)||(47833875-47833983)
chr7 (297-352)||(15148308-15148363)
chr7 (238-347)||(19859113-19859221)
chr7 (42-179)||(39112138-39112275)
chr7 (205-343)||(3132849-3132986)
chr7 (215-333)||(7662569-7662686)
chr7 (31-263)||(14591924-14592153)
chr7 (31-263)||(16011515-16011744)
chr7 (117-256)||(31190524-31190660)
chr7 (260-346)||(7396361-7396450)
chr7 (131-263)||(22969024-22969153)
chr7 (105-180)||(22948499-22948574)
chr7 (31-219)||(15169290-15169474)
chr7 (215-273)||(7396469-7396527)
chr7 (249-304)||(29983179-29983234)
chr7 (238-341)||(39111989-39112092)
chr7 (300-342)||(2365070-2365112)
chr7 (121-185)||(29984308-29984372)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (31-352)||(18454-18774)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (27-352)||(25706-26031)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (31-352)||(21329968-21330289)
chr2 (31-352)||(18796672-18796993)
chr2 (25-346)||(18619976-18620296)
chr2 (31-346)||(36270338-36270650)
chr2 (31-346)||(22183206-22183518)
chr2 (31-302)||(20978091-20978360)
chr2 (45-343)||(6991847-6992146)
chr2 (43-352)||(18822249-18822556)
chr2 (31-338)||(30174377-30174679)
chr2 (31-338)||(24250032-24250334)
chr2 (31-338)||(24229215-24229517)
chr2 (206-346)||(19279460-19279600)
chr2 (229-337)||(18851977-18852085)
chr2 (43-270)||(15342014-15342237)
chr2 (29-337)||(29800468-29800775)
chr2 (31-194)||(17241034-17241196)
chr2 (229-332)||(36801899-36802003)
chr2 (116-338)||(19616435-19616653)
chr2 (98-178)||(36799745-36799826)
chr2 (129-263)||(40301034-40301164)
chr2 (229-336)||(28741220-28741326)
chr2 (31-98)||(41661694-41661761)
chr2 (56-261)||(41316305-41316506)
chr2 (128-263)||(21626824-21626955)
chr2 (116-192)||(28740910-28740986)
chr2 (204-267)||(28718943-28719006)
chr2 (229-346)||(24763751-24763867)
chr2 (302-342)||(12098609-12098649)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (50-352)||(1159-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (27-352)||(5695-6013)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (31-287)||(230111-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (31-338)||(183-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (31-338)||(3675-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (31-338)||(119730-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (43-338)||(12961-13251)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (69-338)||(130262-130526)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (31-338)||(67374-67676)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (31-338)||(39988-40290)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (128-338)||(8305-8511)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (31-270)||(26609-26844)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (229-346)||(90033-90151)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (59-346)||(8723-9005)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (31-221)||(102-288)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (31-263)||(11526-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (128-263)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (31-337)||(53766-54066)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (208-299)||(45956-46051)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (302-346)||(15089-15133)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 2041 - 2362
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2041 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 2140  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2141 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 2240  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2241 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 2340  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  2341 atagtctctatgctttaatgat 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 10932 - 11253
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10932 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11031  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11032 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11131  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11132 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11231  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11232 atagtctctatgctttaatgat 11253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 17684189 - 17684510
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684189 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17684288  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17684289 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17684388  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684389 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17684488  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  17684489 atagtctctatgctttaatgat 17684510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 27380972 - 27381293
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380972 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27381071  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27381072 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27381171  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381172 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27381271  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27381272 atagtctctatgctttaatgat 27381293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 27471355 - 27471676
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471355 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27471454  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27471455 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27471554  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471555 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27471654  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27471655 atagtctctatgctttaatgat 27471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11652210 - 11651889
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652210 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11652111  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11652110 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11652011  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11652010 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 11651911  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11651910 atagtctctatgctttaatgat 11651889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 17691160 - 17691481
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691160 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17691259  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17691260 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17691359  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17691459  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  17691460 atagtctttatgctttaatgat 17691481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29309377 - 29309056
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29309377 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacat 29309278  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29309277 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29309178  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29309078  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29309077 atagtctctatgctttaatgat 29309056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29316336 - 29316016
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29316336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacat 29316238  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29316237 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29316138  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316137 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29316038  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29316037 atagtctctatgctttaatgat 29316016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 188697 - 189018
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188697 catgatttatggagtatccatcaatcaactttatagtcattctgttacagacaatatttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 188796  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  188797 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 188896  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  188897 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 188996  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  188997 atagtctctatgctttaatgat 189018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27297116 - 27296877
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297116 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27297017  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27297016 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27296917  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27296916 aatccaatataaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 304
Target Start/End: Original strand, 16394165 - 16394438
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16394165 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacat 16394264  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  16394265 agtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtc 16394364  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16394365 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgatatgtga 16394438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 35 - 272
Target Start/End: Original strand, 25536915 - 25537152
Alignment:
Q  35 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25536915 attcatggagtacccatcaaccaactttataatcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtg 25537014  T
Q  135 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25537015 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 25537114  T
Q  235 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtga 272  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25537115 caatataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Original strand, 16559193 - 16559414
Alignment:
Q  32 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16559193 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacata 16559292  T
Q  132 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16559293 gcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatca 16559392  T
Q  232 atccaatataaatattactcct 253  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559393 atccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 356
Target Start/End: Original strand, 13359010 - 13359314
Alignment:
Q  48 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13359010 ccatcaaccgactttatagtcatcctgttacggacgatgtttgtacggcaacaaaatactcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaa 13359109  T
Q  148 gggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||  ||| | |||||||||  |||||  |   |||| |||||||||||     
T  13359110 gggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataa--ttttcaatgtagtat--tcatggtgagacaattcaatataaatac 13359204  T
Q  247 tactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  13359205 tacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgatttgcgagatgtgatcatcagtctatccatataatagtctctacgcttt 13359304  T
Q  347 gatgatgtcc 356  Q
     ||| |||||    
T  13359305 aatgttgtcc 13359314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 248 - 352
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566361
Alignment:
Q  248 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttg 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 16566356  T
Q  348 atgat 352  Q
    |||||    
T  16566357 atgat 16566361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2669768 - 2669476
Alignment:
Q  41 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 140  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |   |||||| ||  |||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  2669768 ggagtaccaatcaactgactttatagtcatcctgttatagataacatttgaacgacaacaaagtaccggactcctacatctagagtacataatgatttca 2669669  T
Q  141 ggtcgaagggtggaatacaccacta-tcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaata 239  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||   | ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||| ||||    
T  2669668 ggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatacttaa-acaacatt--ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaata 2669572  T
Q  240 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  2669571 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgattcatgagatgtgatcatcaatctacccatataatagt 2669476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16789373 - 16789071
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  16789373 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 16789275  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  16789274 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 16789178  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  16789177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 16789079  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  16789078 atagtctc 16789071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 22859888 - 22860190
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22859888 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 22859986  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  22859987 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22860083  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22860084 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22860182  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  22860183 atagtctc 22860190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 27508347 - 27508649
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27508347 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 27508445  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  27508446 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27508542  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27508543 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27508641  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    | ||||||    
T  27508642 acagtctc 27508649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 1586108 - 1586410
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  1586108 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 1586206  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  1586207 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 1586303  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  1586304 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 1586402  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  1586403 atagtctc 1586410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 338
Target Start/End: Original strand, 27527947 - 27528235
Alignment:
Q  45 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 144  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  27527947 tacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtc 27528045  T
Q  145 gaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaat 244  Q
     ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||| ||||    
T  27528046 taagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaat 27528142  T
Q  245 attactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27528143 attactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataacagtctc 27528235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14074782 - 14074480
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  14074782 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaaaggcaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 14074684  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||||   ||||| | ||| |||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  14074683 agtggtttcaggtctaagagcaatatacacttttatcattgtgaaaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14074587  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  14074586 aatccattataaatattactcccaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 14074488  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  14074487 atagtctc 14074480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 338
Target Start/End: Original strand, 18019885 - 18020143
Alignment:
Q  75 ttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatga 174  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || || | ||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||    
T  18019885 ttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcga-catctagagatcatagtgatttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtga 18019983  T
Q  175 gaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaag 274  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18019984 gaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatag 18020080  T
Q  275 acttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 338  Q
    |||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18020081 acttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 18020143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 346
Target Start/End: Original strand, 10359073 - 10359359
Alignment:
Q  53 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 152  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  10359073 aaccaacttaatggttatcctgttacggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtg 10359171  T
Q  153 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 252  Q
    | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||| ||| |  || || ||||| ||||||||||||       
T  10359172 gtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattaccta 10359267  T
Q  253 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||   || ||||| |  ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  10359268 taatatttatatctatgtatagacttaatatctc-acattcatga-ccatgagatgtggtcatcactctacatatataatagtctctacgcttt 10359359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8613221 - 8612915
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  8613221 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 8613123  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | |||||   |||||||||||||||||| |  ||    
T  8613122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 8613025  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 327  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8613024 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8612926  T
Q  328 ataatagtctc 338  Q
    |||||||||||    
T  8612925 ataatagtctc 8612915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27926062 - 27925935
Alignment:
Q  209 tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatg 308  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27926062 tgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatatctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatccgtgagatg 27925964  T
Q  309 tgatcatcagtctacctacataatagtct 337  Q
     |||||||||| || | ||||||||||||    
T  27925963 agatcatcagtttatccacataatagtct 27925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 337
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850521
Alignment:
Q  134 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt-tataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 232  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||   || |||     | |||||||||||| | |  || ||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaataacttatgatacttacataaaacc----caatgtagtattcttaaggagggtcaa 17850416  T
Q  233 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 332  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| || || ||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||    
T  17850417 tccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatctataagatatgatcatcagtctacccatataat 17850516  T
Q  333 agtct 337  Q
    |||||    
T  17850517 agtct 17850521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Original strand, 20736413 - 20736562
Alignment:
Q  116 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 215  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |  | |||||||||    
T  20736413 acatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagta 20736509  T
Q  216 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 268  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20736510 ttctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat 20736562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28172859 - 28172754
Alignment:
Q  215 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 314  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28172859 attctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgtaagatgtgatca 28172760  T
Q  315 tcagtc 320  Q
    ||||||    
T  28172759 tcagtc 28172754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 346
Target Start/End: Original strand, 20553492 - 20553622
Alignment:
Q  214 tattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 313  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20553492 tattctcatgatgggtcaatc-aatataaatattattcttaatatt-atatctatgtgaatgtttgatatttctttatcgatgatatgtgagatgtgatc 20553589  T
Q  314 atcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  20553590 atcagtctaccaacataaaaatctttatgcttt 20553622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8510338 - 8510155
Alignment:
Q  100 aaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataa 199  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||| || || ||||||| ||  ||||    
T  8510338 aaagtactcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacac-ttacataa 8510240  T
Q  200 cttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataact 285  Q
    | ||  |||||||||||| ||||    | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  8510239 catt--ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattttttatctatatgaagaaatgataact 8510155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 33317167 - 33317055
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  33317167 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 33317069  T
Q  131 agtggtttcaggtc 144  Q
    ||||||||||||||    
T  33317068 agtggtttcaggtc 33317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 17120505 - 17120740
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| |||| |||||  |||    
T  17120505 catgattcatcaagcacccatcaaccaacgttatggttatcctttgacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatatagggatcat 17120603  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||| ||| |||||||    || ||    
T  17120604 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgggtc 17120700  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 270  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17120701 aatccagtataaatactactcctagtatttatacctatgt 17120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 300 - 352
Target Start/End: Original strand, 25537148 - 25537200
Alignment:
Q  300 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25537148 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgat 25537200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 338
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995245
Alignment:
Q  243 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13995151 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 13995245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994655
Alignment:
Q  128 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||||||||||  ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 270  Q
     ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994697 gtcattccagtataaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19218630 - 19218427
Alignment:
Q  128 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||| | || ||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  19218630 catagtggtttcaggtctaagagtagtatatatcattatcattctgagaatatcttatgaaa-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgg 19218534  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 327  Q
     |||||     |||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| ||| | || ||||| |  |||| |||| |||||||||||| |||    
T  19218533 gtcaat-----ataaattttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctcat-attcatgacccatgaggtgtggtcatcagtctacatac 19218440  T
Q  328 ataatagtctcta 340  Q
    |||||||||||||    
T  19218439 ataatagtctcta 19218427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 324
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347212
Alignment:
Q  203 ttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 302  Q
    ||||||||||||||||| ||| | | |||||||| || |||||||| || |||| ||||||  |||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatattattc-taatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T
Q  303 gagatgtgatcatcagtctacc 324  Q
    ||||| || |||||| ||||||    
T  19347191 gagatatggtcatcaatctacc 19347212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 339
Target Start/End: Original strand, 22560311 - 22560487
Alignment:
Q  159 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 258  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| |||||||    | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22560311 accattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaatat 22560407  T
Q  259 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct 339  Q
    ||| | ||||||  | |||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  22560408 ttaaacctatgtataaacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatgcataatagtctct 22560487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28172963 - 28172899
Alignment:
Q  109 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactat 172  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28172963 gactcctatatctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactat 28172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 187
Target Start/End: Original strand, 28756145 - 28756283
Alignment:
Q  48 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 147  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||||| |||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  |    
T  28756145 ccatcaaccgactttataggcatcttgttacatacaacatttga-tggtgataaagtacatgactcctacatatatggtacacagtggtttcaggtcata 28756243  T
Q  148 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatga 187  Q
    || ||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  28756244 ggatgagataaatcattatcactatgagaatattttatga 28756283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 263
Target Start/End: Original strand, 5758565 - 5758709
Alignment:
Q  116 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 215  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||| || | |  ||||| |  |||||||||||    
T  5758565 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatggcaatctc-ataacgt--actatgtagta 5758661  T
Q  216 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
    ||||||    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5758662 ttctcacagtggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4073781 - 4073574
Alignment:
Q  128 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||| | |  ||||||||||||||| |   |    
T  4073781 catagtggttttaggtctaagattggtatacatcgttatcattatgagaatatcttatgaa--ttttcataacatat--tatgtagtattctcacggtag 4073686  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 327  Q
     |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  |||||  |||||| ||| |||  ||| ||||| || || ||||||||| ||| |||||  ||    
T  4073685 gtcaatcaaatataaatattacctctaatatttacacttatgtatagacttaatatctc-atattcatgacctatgggatgtgatcctcaatctacaaac 4073587  T
Q  328 ataatagtctcta 340  Q
    |||||||||||||    
T  4073586 ataatagtctcta 4073574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 338
Target Start/End: Original strand, 20736594 - 20736630
Alignment:
Q  302 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 338  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20736594 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 20736630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18262699 - 18262378
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262699 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18262600  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18262599 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18262500  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262499 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18262400  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18262399 atagtctctatgctttaatgat 18262378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18269560 - 18269239
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269560 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18269461  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18269460 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18269361  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18269261  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18269260 atagtctctatgctttaatgat 18269239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 55613170 - 55612849
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613170 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 55613071  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55613070 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 55612971  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612970 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 55612871  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  55612870 atagtctctatgctttaatgat 55612849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26964127 - 26963806
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964127 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26964028  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26964027 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26963928  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963927 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 26963828  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  26963827 atagtctctatgctttaatgat 26963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26970950 - 26970629
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26970851  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26970850 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26970751  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970750 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 26970651  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  26970650 atagtctctatgctttaatgat 26970629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 869084 - 868763
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869084 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 868985  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  868984 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 868885  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868884 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 868785  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  868784 atagtctctatgctttaatgat 868763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 19926480 - 19926801
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926480 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19926579  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19926580 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19926679  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926680 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 19926779  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19926780 atagtctctatgctttaatgat 19926801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5707807 - 5707486
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707807 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5707708  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5707707 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5707608  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707607 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 5707508  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5707507 atagtctctatgctttaatgat 5707486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5714435 - 5714114
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714435 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5714336  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5714335 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5714236  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714235 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 5714136  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5714135 atagtctctatgctttaatgat 5714114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8858654 - 8858333
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8858555  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8858554 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8858455  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8858454 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacata 8858355  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  8858354 atagtctctatgctttaatgat 8858333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 10621053 - 10621374
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621053 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10621152  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10621153 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10621252  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621253 aatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10621352  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10621353 atagtctctatgctttaatgat 10621374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 10628132 - 10628447
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628132 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10628231  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10628232 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10628331  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628332 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10628431  T
Q  331 atagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  10628432 atagtctctatgcttt 10628447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 28392854 - 28393175
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392854 catgattcatggagtactcatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28392953  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28392954 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 28393053  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28393054 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 28393153  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  28393154 atagtctctatgctttaatgat 28393175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8845690 - 8845369
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845690 catgattcatggagtacccatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8845591  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8845590 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8845491  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8845490 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacata 8845391  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  8845390 atagtctctatgctttaatgat 8845369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 4426336 - 4426645
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 4426435  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4426436 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaa------------cttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatc 4426523  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4426524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 4426623  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  4426624 atagtctctatgctttaatgat 4426645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35224047 - 35223732
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35224047 catgattcgtggagtacacatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacat 35223948  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  35223947 cgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttc 35223848  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35223847 aatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatccgtctacccacata 35223748  T
Q  331 atagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||| ||||||||    
T  35223747 atagtctatatgcttt 35223732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 342
Target Start/End: Original strand, 5667849 - 5668156
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5667849 catgattcgtggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgac--caacatctagggtacat 5667946  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  5667947 agtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtc 5668046  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||| | |||||    
T  5668047 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatgatccgtgaga--tgatcatcggtctatccacata 5668144  T
Q  331 atagtctctatg 342  Q
    ||||||||||||    
T  5668145 atagtctctatg 5668156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20311781 - 20311458
Alignment:
Q  27 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 126  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  20311781 tcatcatgattcgtggagtaccgattaaccgactttatagtcatcctgctacggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggt 20311682  T
Q  127 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgac 225  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| | ||   |||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  20311681 aaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgatagttac-ataactgt--ctatgtagtattctcatgac 20311585  T
Q  226 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 325  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||     
T  20311584 aggtcaatccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccatgatatgtgatcatcaatctaccc 20311485  T
Q  326 acataatagtctctatgctttgatgat 352  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20311484 acaaaatagtctctatgctttaatgat 20311458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 263
Target Start/End: Original strand, 10677303 - 10677534
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10677303 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10677401  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || ||    
T  10677402 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10677501  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677502 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 263
Target Start/End: Original strand, 10890943 - 10891174
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10890943 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10891041  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || ||    
T  10891042 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10891141  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891142 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15461799 - 15461497
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  15461799 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 15461701  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  15461700 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15461604  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15461603 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15461505  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  15461504 atagtctc 15461497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34975853 - 34975551
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  34975853 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 34975755  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  34975754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 34975658  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  34975657 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 34975559  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  34975558 atagtctc 34975551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2677315 - 2677013
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2677315 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2677217  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  2677216 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2677120  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  2677119 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 2677021  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  2677020 atagtctc 2677013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15815323 - 15815021
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15815323 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15815225  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  15815224 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15815128  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15815127 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15815029  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  15815028 atagtctc 15815021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 18111043 - 18111345
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18111043 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18111141  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  18111142 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18111238  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18111239 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18111337  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  18111338 atagtctc 18111345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 3369023 - 3369325
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||| || |  |||    
T  3369023 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catcaagagatcat 3369121  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  3369122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3369218  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3369219 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 3369317  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  3369318 atagtctc 3369325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 17299959 - 17300261
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  17299959 catgattcatcaagtgctcatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 17300057  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  17300058 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 17300154  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  17300155 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 17300253  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  17300254 atagtctc 17300261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18163464 - 18163162
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18163464 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18163366  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |     
T  18163365 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtg 18163269  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18163268 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcgatcatcagtctacatacata 18163170  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  18163169 atagtctc 18163162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20244239 - 20243937
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20244239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20244141  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  20244140 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20244044  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20244043 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20243945  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  20243944 atagtctc 20243937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26531915 - 26531613
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  26531915 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 26531817  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  26531816 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 26531720  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  26531719 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtatagccttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 26531621  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  26531620 atagtctc 26531613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 4675983 - 4676285
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  4675983 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttataatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 4676081  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  4676082 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 4676178  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  4676179 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 4676277  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  4676278 atagtctc 4676285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 206 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516232
Alignment:
Q  206 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 305  Q
    ||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtgag 56516269  T
Q  306 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 342  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  56516268 atttgatcattaatctacctacataatagtctctatg 56516232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5870720 - 5870419
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  5870720 catgattcatcaagtactcatcaaccaacgttattgttatcctattatagacaacgttagaatgacaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 5870622  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  5870621 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 5870525  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  5870524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 5870426  T
Q  331 atagtct 337  Q
    |||||||    
T  5870425 atagtct 5870419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 282
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454110
Alignment:
Q  132 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 231  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||  ||||||  || |||||||||||||||||  || |||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  232 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 282  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21454060 attcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19365806 - 19365519
Alignment:
Q  47 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 146  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| |    
T  19365806 cccattaactaacgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtcta 19365708  T
Q  147 agggtggaatacaccactatcacta-tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 245  Q
    || |||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||    
T  19365707 agagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaata 19365611  T
Q  246 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| || ||| |||  ||  ||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  19365610 ttactcctaatatttatacctatgtatagatttaatatctc-atactcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacgtatataatagtctc 19365519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1942026 - 1941724
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  1942026 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacattagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 1941928  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || |     
T  1941927 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtt 1941831  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  ||||||    
T  1941830 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacata 1941732  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  1941731 atagtctc 1941724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 317
Target Start/End: Original strand, 32646523 - 32646807
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| | |   |||||| || ||||||  ||||| ||| ||||     
T  32646523 catgattcatccggtacccatcaaccgacttcataatcatcctgttatggatgacgtttgtacgacaacaaagtacccgactcatacatccaggatacag 32646622  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 229  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||| || | ||||  | |  ||||| |||  ||||||| ||||| |||   | |    
T  32646623 agttgtttcaggtcgaagggtaaaatacaccacttatcactacgggaatgtcatgtgact-tatacataaccttt--tatgtagcattcttatggtaggt 32646719  T
Q  230 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatca 317  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32646720 caatccaatgtaaatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatccgtgagatgtgatcatca 32646807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19362695 - 19362477
Alignment:
Q  48 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 147  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||| |  | |||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  19362695 ccattaaccaccgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcatttaagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtttaa 19362597  T
Q  148 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 247  Q
    | |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  19362596 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatatt 19362500  T
Q  248 actcctaatatttatatctatgt 270  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  19362499 actcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9487853 - 9487625
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||   |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  9487853 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatcctattacagacaacgttataatgacaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 9487755  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  9487754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagtattctcacgatgggtc 9487658  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9487657 tatccagtataaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636484
Alignment:
Q  133 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 232  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacattgggtcaa 32636589  T
Q  233 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 332  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    ||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  32636588 tccaatataaatattactcataatatttatacctatgcatggacttaatatctc-gtattcatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 32636490  T
Q  333 agtctc 338  Q
    ||||||    
T  32636489 agtctc 32636484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 270
Target Start/End: Original strand, 5528495 - 5528714
Alignment:
Q  47 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 146  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||  |||||||||  |    
T  5528495 cccattaaccaacattatggttatcctgttacagataacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagcagtttcaggtata 5528593  T
Q  147 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 246  Q
    || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||  | ||||| || ||||||||| |  || | ||| ||||||||||||    
T  5528594 agagtgttatacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaatat 5528690  T
Q  247 tactcctaatatttatatctatgt 270  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  5528691 cactcctaatatttatacctatgt 5528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5616681 - 5616387
Alignment:
Q  47 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 146  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| || |    
T  5616681 cccattaaccaacgttacagttatcttgttacaaacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatcta 5616583  T
Q  147 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 246  Q
    ||  ||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||  |  ||| ||||||||||||| |   | |||||||| |||||||||    
T  5616582 agattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgacac-tttcataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaatat 5616486  T
Q  247 tactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||  | |||| | | |||  |||  |||| |  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5616485 tacttctaatatttatacctacgtatatacttaacatctc-atatttatgacccatgagatgtggtcatcaatctacatacataatagtctcaatgcttt 5616387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700213
Alignment:
Q  256 tatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgtaagatgtgattatcagtctacccacataatag 24700213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 251
Target Start/End: Original strand, 30040489 - 30040705
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| || |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  30040489 catgattcatcaagtactcattaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacattagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 30040587  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||| |||||||  || ||    
T  30040588 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcatggtgggtc 30040684  T
Q  231 aatccaatataaatattactc 251  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  30040685 aatctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9538244 - 9538033
Alignment:
Q  47 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 146  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||| |||| | ||  ||| ||||||| ||||| |    
T  9538244 cccattaaccaacgttatggttatcctgttacggacaatgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catccaaggatcatggtggtttgaggtcta 9538146  T
Q  147 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 246  Q
    ||  ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||    
T  9538145 agactggac-acgccattatcattgtgagaatatcttatgacactttc-ataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatat 9538050  T
Q  247 tactcctaatatttata 263  Q
    ||||||||| |||||||    
T  9538049 tactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4546298 - 4546080
Alignment:
Q  116 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 215  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  4546298 acatctagggatcatagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 4546202  T
Q  216 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 315  Q
    |||||| |  || ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| ||| ||    
T  4546201 ttctcacggtgggtctgtccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcgattat 4546103  T
Q  316 cagtctacctacataatagtctc 338  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  4546102 cagtcaacatacataatagtctc 4546080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11421309 - 11421096
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   | |||||||| || | || |||||| ||  |||    
T  11421309 catgattcatcgagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaataaagcacttgagtaca-catctacggatcat 11421211  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| | | |||  |||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| | |  || ||    
T  11421210 agtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctaacggtgggtc 11421114  T
Q  231 aatccaatataaatatta 248  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11421113 aatccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701361
Alignment:
Q  109 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 159  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888594
Alignment:
Q  128 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||  |||| |  |  ||||| ||||| |||||  ||    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattatcttatcacactttacataaatcat--tatgtggtattatcatggtgg 33888646  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 282  Q
     ||||| ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33888645 gtcaattca---taaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgata 33888594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Original strand, 10677538 - 10677590
Alignment:
Q  294 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10677538 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatacttt 10677590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Original strand, 10891178 - 10891230
Alignment:
Q  294 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10891178 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatacttt 10891230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 291
Target Start/End: Original strand, 34777850 - 34777975
Alignment:
Q  164 tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |   | | |||||||||||||||  || |||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  34777850 tatcactatcaaaatatcttatgacactttacataagtc--aatgtgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttata 34777947  T
Q  264 tctatgtgaagacttgataactctttat 291  Q
      ||| |||||||||||||||| |||||    
T  34777948 catatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 350
Target Start/End: Original strand, 9937933 - 9938003
Alignment:
Q  280 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatg 350  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  9937933 ataactctttattcatgatttatgagatgtgatcatgactctacccacacaatagtctatatgcttcgatg 9938003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 140
Target Start/End: Original strand, 9937745 - 9937826
Alignment:
Q  59 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 140  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  || |||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  9937745 ctttatagtcatccttttacgaacaatgtttgaacgacgataaagtattcgactcttacatctagggtacatagtgatttca 9937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 261
Target Start/End: Original strand, 9937830 - 9937923
Alignment:
Q  170 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttacta---tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatattta 261  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |  |||||    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9937830 tatgagaatatcttatggcacatttcataattcatactaagtagtagtattctcatgacgg-tcactgcaatataaatattacttctattattta 9937923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11421052 - 11421016
Alignment:
Q  302 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 338  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11421052 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 11421016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Original strand, 30040740 - 30040784
Alignment:
Q  302 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  30040740 tgagatgtggtcatcagtctatatacataatagtctcgatgcttt 30040784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 6110551 - 6110230
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110551 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6110452  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6110451 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6110352  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110351 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 6110252  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6110251 atagtctctatgctttaatgat 6110230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 16482203 - 16482524
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482203 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16482302  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16482303 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16482402  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482403 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 16482502  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16482503 atagtctctatgctttaatgat 16482524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 10579075 - 10579396
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579075 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10579174  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10579175 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 10579274  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579275 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10579374  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10579375 atagtctctatgctttaatgat 10579396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 15600604 - 15600925
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600604 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15600703  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15600704 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15600803  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600804 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15600903  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15600904 atagtctctatgctttaatgat 15600925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 15607149 - 15607470
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607149 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15607248  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15607249 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15607348  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607349 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15607448  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15607449 atagtctctatgctttaatgat 15607470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 10572312 - 10572633
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10572312 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 10572411  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10572412 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10572511  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572512 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10572611  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10572612 atagtctctatgctttaatgat 10572633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 15341939 - 15342260
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15342038  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342039 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatc 15342138  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342139 aatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15342238  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  15342239 atagtctctatgttttaatgat 15342260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18520462 - 18520141
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520462 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18520363  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18520362 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18520263  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520262 aatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18520163  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18520162 atagtctctatgctttaatgat 18520141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8490982 - 8490676
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490982 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8490883  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8490882 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8490783  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 8490683  T
Q  331 atagtct 337  Q
    || ||||    
T  8490682 atcgtct 8490676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 35 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18523146 - 18522836
Alignment:
Q  35 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523146 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 18523047  T
Q  135 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatc 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18523046 gtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatc 18522947  T
Q  235 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522946 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 18522847  T
Q  335 tctctatgctt 345  Q
    |||||||||||    
T  18522846 tctctatgctt 18522836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 15357306 - 15357627
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357306 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15357405  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15357406 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15357505  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357506 aacccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15357605  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  15357606 atagtctctatgttttaatgat 15357627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 17780838 - 17781159
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780838 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17780937  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17780938 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatc 17781037  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781038 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17781137  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  17781138 atagtctctatgctttaatgat 17781159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13211789 - 13211468
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13211789 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13211690  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13211689 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatc 13211590  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13211589 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacata 13211490  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  13211489 atagtctctatgctttaatgat 13211468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13249094 - 13248779
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13249094 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13248995  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  13248994 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatc 13248895  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13248894 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacata 13248795  T
Q  331 atagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  13248794 atagtctctatgcttt 13248779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 32056619 - 32056941
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056619 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 32056718  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32056719 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 32056818  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32056819 aatccaatataaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcattagtctacccacat 32056918  T
Q  330 aatagtctctatgctttgatgat 352  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  32056919 aatagtctctatgctttaatgat 32056941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Original strand, 17199900 - 17200225
Alignment:
Q  27 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17199900 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgatacgaacaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggt 17199999  T
Q  127 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  17200000 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcg 17200099  T
Q  227 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 326  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17200100 ggtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccca 17200199  T
Q  327 cataatagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  17200200 cataatagtctctatgctttaatgat 17200225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13517294 - 13516977
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517294 catgattcatggagtacccatctaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacat 13517195  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13517194 agtggtttcaggtcgaagggtgggg----ccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatc 13517099  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13517098 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 13516999  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  13516998 atagtctctgtgctttaatgat 13516977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 1647241 - 1647556
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1647241 catgattcatggagtactcatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatat 1647340  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||    
T  1647341 agtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtc 1647440  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1647441 aatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 1647540  T
Q  331 atagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  1647541 atagtctctatgcttt 1647556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17136840 - 17136525
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136840 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacat 17136741  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  17136740 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 17136641  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17136640 aatccaatataaatattactccta------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatgtgatcatcagtctacccacata 17136547  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  17136546 atagtctctatgttttaatgat 17136525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29925458 - 29925137
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29925458 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29925359  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  || ||    
T  29925358 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29925259  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||    
T  29925258 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacata 29925159  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||| ||| ||||||| |||||    
T  29925158 atagcctccatgctttaatgat 29925137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29974611 - 29974290
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29974611 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29974512  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  || ||    
T  29974511 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29974412  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||    
T  29974411 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacata 29974312  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||| ||| ||||||| |||||    
T  29974311 atagcctccatgctttaatgat 29974290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16200917 - 16200627
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16200917 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacat 16200818  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||  || ||    
T  16200817 agtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtc 16200718  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtct 321  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16200717 aatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtct 16200627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21034540 - 21034238
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21034540 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21034442  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  21034441 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21034345  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21034344 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21034246  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  21034245 atagtctc 21034238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 15846536 - 15846838
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  15846536 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcat 15846634  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  15846635 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15846731  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15846732 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15846830  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  15846831 atagtctc 15846838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 20147554 - 20147856
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20147554 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20147652  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  20147653 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20147749  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20147750 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20147848  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  20147849 atagtctc 20147856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21399094 - 21398792
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  21399094 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 21398996  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | | |||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  21398995 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21398899  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  21398898 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgaggtcataagtctacatacata 21398800  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  21398799 atagtctc 21398792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 346
Target Start/End: Original strand, 24253130 - 24253423
Alignment:
Q  49 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 148  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||| |  ||||| ||||||| |   |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  24253130 catcaactaactttatggtcactctgtaattgacaatgtttgaacgacaacaaagtactcgagtcatacatctaaggtacatagtggttttaggtcgaat 24253229  T
Q  149 ggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatta 248  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| ||  ||||| | ||||||||||  || |||| ||||||||||||| |    
T  24253230 g-tggaatacaccgttatcactatgagaataacttatgatccttaa-ataacatt--ctatgcattattctcatggagggtcaaaccaatataaatataa 24253325  T
Q  249 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    ||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24253326 ctcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccataattcgtgagatatgatcattagtctaccgacataatagtctctatgcttt 24253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14890693 - 14890391
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  ||     
T  14890693 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttataattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcac 14890595  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||| ||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  14890594 agtgctttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14890498  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  14890497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 14890399  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  14890398 atagtctc 14890391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 55427323 - 55427021
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  55427323 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 55427225  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  55427224 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 55427128  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  55427127 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 55427029  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  55427028 atagtctc 55427021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12300212 - 12299911
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  12300212 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaatcacttgagtcca-catctagagatcat 12300114  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  12300113 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12300017  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12300016 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatg-atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12299919  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  12299918 atagtctc 12299911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 25978728 - 25978963
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  25978728 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 25978826  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || ||    
T  25978827 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 25978923  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 270  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25978924 tatccagtataaatattactcctaataattatacctatgt 25978963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147013
Alignment:
Q  129 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 228  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||| ||||||| | | |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  229 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 328  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |    
T  14147129 tcaatccagtataaatattcctcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatata 14147031  T
Q  329 taatagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  14147030 taatagtctctgtgcttt 14147013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15527021 - 15526827
Alignment:
Q  65 agtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact 164  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||| || ||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  15527021 agtcatgctgttacagacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcca-catgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccatt 15526923  T
Q  165 atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
    | || | | |||||||||||||||| |||| ||| |   |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15526922 aacattgtaagaatatcttatgaca-ttttcatagc--atactatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28088408 - 28088251
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||| || || |||| |||||||||  |||    
T  28088408 catgattcatcaagtatccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcca-catctagggatcat 28088310  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 189  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28088309 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca 28088251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11787889 - 11787654
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |  |  ||||||||  |||    
T  11787889 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccatttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgattatag-atctagggatcat 11787791  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||| | | |  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  11787790 aatggtttcaggtctaagagcgatatacaatattatcattgtgagaatatcttatgaaaatatc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 11787694  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 270  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11787693 tatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 11787654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 15317176 - 15317472
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  15317176 catgattcatcaagtacccgtcaaccaacgttatgattatccgtttacagacaacgttagaatg---acaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 15317271  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |   ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  ||||| |  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  15317272 agtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15317368  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||| ||||| ||||||    
T  15317369 tatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcaatctacatacata 15317467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953965
Alignment:
Q  170 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctat 268  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| || | ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||  |||    
T  28954093 tatgagaatatcatatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacatat 28953996  T
Q  269 gtgaagacttgataactctttatccatgatc 299  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28953995 gtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 300 - 352
Target Start/End: Original strand, 19089734 - 19089786
Alignment:
Q  300 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19089734 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgatttaatgat 19089786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32280507 - 32280313
Alignment:
Q  105 actcgactccaacatctagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataac 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  || |||  |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  32280507 actcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac 32280408  T
Q  201 ttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 297  Q
      | |||||||| |||||||||   || |||| | | | ||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32280407 --tcactatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattatacctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 253 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9504548 - 9504455
Alignment:
Q  253 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  9504548 taatatttttatgtatgttaatacttgataactccttatccatgacccgtgagataagattatcagtctacccacataatagtttctatccttt 9504455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 342
Target Start/End: Original strand, 8251933 - 8252048
Alignment:
Q  227 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 326  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| | | |    
T  8251933 gatcaatcaaatataaatattactcgaaatatgtaaatttatgtaaagatttgataacattttattcatgatccgtaagatgtgatcttcagtccatcca 8252032  T
Q  327 cataatagtctctatg 342  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  8252033 catgatagtctatatg 8252048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30464261 - 30464147
Alignment:
Q  69 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 168  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||   | ||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||    
T  30464261 atccttttacagacaacgtttgaatgtcaataaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatca 30464163  T
Q  169 ctatgagaatatctta 184  Q
     |||||||||||||||    
T  30464162 ttatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16200363 - 16200291
Alignment:
Q  279 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  16200363 gataactctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-aatagtctccatgctttaatgat 16200291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 192
Target Start/End: Original strand, 36138033 - 36138097
Alignment:
Q  128 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36138033 catagtgatttcaggttgaagggtggtatacaccattatcactttggaaatatcttatggcactt 36138097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4189275 - 4189223
Alignment:
Q  207 tatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatt 259  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  4189275 tatgtaatattctcatgacagatcaatatagtataaatattactcataatatt 4189223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36142880 - 36142816
Alignment:
Q  128 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36142880 catagtggtttcaggttgaagggtgacatacatcattatcactttggaaatatcttatggcactt 36142816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18252517 - 18252196
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252517 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18252418  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18252417 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18252318  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252317 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18252218  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18252217 atagtctctatgctttaatgat 18252196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 18532234 - 18532555
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532234 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18532333  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18532334 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18532433  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18532434 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatctacata 18532533  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18532534 atagtctctatgctttaatgat 18532555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 27131130 - 27131450
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131130 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacat 27131228  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27131229 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27131328  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131329 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27131428  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  27131429 atagtctttatgctttaatgat 27131450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 27310297 - 27310618
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310297 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27310396  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27310397 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27310496  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27310497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 27310596  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27310597 atagtctctatgctttaatgat 27310618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 16358755 - 16359076
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358755 catgattcatggagtacccatcaaccaactttaaagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16358854  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16358855 ggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16358954  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16358955 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 16359054  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16359055 atagtctctatgctttaatgat 16359076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 3855639 - 3855954
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3855639 catgattcatggagtaccggtcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacat 3855738  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  3855739 agtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtc 3855838  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  3855839 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacccacgta 3855938  T
Q  331 atagtctctatgcttt 346  Q
    |||||||| |||||||    
T  3855939 atagtctccatgcttt 3855954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 36816354 - 36816668
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36816354 catgatttgtggagtacctatcaaccaactttatagttatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacat 36816453  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  36816454 agtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataattt-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 36816552  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  36816553 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 36816652  T
Q  331 atagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  36816653 atagtctctatgcttt 36816668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 22641594 - 22641871
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22641594 catgattcgtggagtacccatcgaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 22641693  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  22641694 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtc 22641792  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 312  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22641793 aatctagtataaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatctatgagatgtgat 22641871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 27277278 - 27277592
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27277278 catgatttatggagtacccttcaaccaactttatggtcatcttgttacaaacaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacat 27277377  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| | |||||| |||  || ||    
T  27277378 agtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggcac-tttcatgacttttactatgcaatattcttatggtgggtc 27277476  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27277477 aatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggtctacccacata 27277576  T
Q  331 atagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  27277577 atagtctctatgcttt 27277592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171274
Alignment:
Q  159 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 21171180  T
Q  259 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  21171181 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgttatcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgat 21171274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 19706439 - 19706741
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  19706439 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 19706537  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  19706538 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 19706634  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19706635 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 19706733  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  19706734 atagtctc 19706741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 43802365 - 43802667
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  43802365 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 43802463  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  43802464 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 43802560  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  43802561 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 43802659  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  43802660 atagtctc 43802667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 28134723 - 28135025
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  |||    
T  28134723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcat 28134821  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  |||||    
T  28134822 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtggatc 28134918  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  28134919 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 28135017  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    || |||||    
T  28135018 attgtctc 28135025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 198 - 352
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657262
Alignment:
Q  198 aacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T
Q  298 tctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 352  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  22657208 gctatgagatgtgatcatcagtctatccacatgatagtctctatgctttaatgat 22657262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23507385 - 23507096
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||| |||    |||| ||| | |||||| |||| | ||  ||||||||||||||     
T  23507385 catgatttatggagtacccataaatcgaatttatagtcatcctattacagacggtatttgtatgataacaaagtactcaaatcttacatctagggtacac 23507286  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||| |     | || ||||| ||||| |||  || |    
T  23507285 agtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg---ctttttacacaacgttctctgtagcattctaatggtgggt 23507189  T
Q  230 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 322  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23507188 taatccaatataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatccgtgagatgtgatcatcagtcta 23507096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9456418 - 9456116
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  9456418 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 9456320  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  9456319 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 9456223  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  9456222 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 9456124  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  9456123 atagtctc 9456116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Original strand, 9916497 - 9916689
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9916497 catgattcgtggagaactcataaactaactttatagtcaccttgttacggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacat 9916596  T
Q  131 agtgg-tttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatga 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9916597 agtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatga 9916689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Original strand, 12014084 - 12014319
Alignment:
Q  109 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttact 207  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||   |||||| |  || | ||    
T  12014084 gactcctacatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtga---tttttacatattgttct 12014180  T
Q  208 atgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 307  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  12014181 atgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatccgtgagat 12014280  T
Q  308 gtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||| || |||||    
T  12014281 gtgatcatcattctacccacataatggtctttacgcttt 12014319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 20391239 - 20391541
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  20391239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 20391337  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||  | ||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||    || ||    
T  20391338 agtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatga-aaatttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 20391434  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20391435 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20391533  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  20391534 atagtctc 20391541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 20779645 - 20779947
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20779645 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20779743  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  20779744 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20779840  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20779841 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20779939  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  20779940 atagtctc 20779947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 22670257 - 22670559
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22670257 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22670355  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  22670356 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22670452  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22670453 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22670551  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  22670552 atagtctc 22670559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 42816989 - 42817291
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  42816989 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 42817087  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  42817088 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 42817184  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  42817185 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 42817283  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  42817284 atagtctc 42817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22612794 - 22612492
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22612794 catgattcatcaagtagccatcaaccaacgttatgattatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcat 22612696  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  22612695 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22612599  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  ||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22612598 aatccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgatatatc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22612500  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  22612499 atagtctc 22612492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 634216 - 633925
Alignment:
Q  51 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg 150  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  634216 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagag 634118  T
Q  151 tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattact 250  Q
     |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || | |||||| |||||||||||||    
T  634117 cgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattact 634021  T
Q  251 cctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttg 347  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  || | |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  634020 cctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atagctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttg 633925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 229 - 345
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9917952
Alignment:
Q  229 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccacgagatgtgatcatcaacctaccgaca 9917935  T
Q  329 taatagtctctatgctt 345  Q
    || || |||||||||||    
T  9917936 tagtattctctatgctt 9917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8727969 - 8727667
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||  |||||||||  |||    
T  8727969 catgattcatcaagtacccattagccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcat 8727871  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||| |||||| ||| |||  ||||||   |||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  |||||    
T  8727870 agtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatatcttatggta-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtggatc 8727774  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||  |||||||||||| || |||    
T  8727773 aatccagtataaatattacttctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatagata 8727675  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  8727674 atagtctc 8727667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 47667485 - 47667776
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  47667485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 47667583  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||           ||| |  || ||    
T  47667584 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--act-----------tcacggtgggtc 47667669  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  47667670 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 47667768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29097008 - 29096789
Alignment:
Q  47 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 146  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||| |||| || ||||||||||| |  | ||| |||| || ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  29097008 cccattaaccaacgttatggttatcctattacagataacgtttgaatcgaaataaaacacttgagtccat-atctagggatcatagtggtttcatgtcta 29096910  T
Q  147 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 246  Q
    || |||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||    
T  29096909 agagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atgctatgtagtattcacacggtggatcaatctagtataaatat 29096813  T
Q  247 tactcctaatatttatatctatgt 270  Q
    || ||||||||| |||| ||||||    
T  29096812 tattcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930582
Alignment:
Q  206 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 305  Q
    |||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgag 35930615  T
Q  306 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 338  Q
    ||| | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  35930614 atgcggtcatcagtctatatacataatagtctc 35930582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 322
Target Start/End: Original strand, 12006461 - 12006550
Alignment:
Q  233 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 322  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||  || || ||||||||||||||||    
T  12006461 tccagtataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgattcgtaagttgtgatcatcagtcta 12006550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 28145723 - 28145835
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  28145723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 28145821  T
Q  131 agtggtttcaggtc 144  Q
    ||||||||||||||    
T  28145822 agtggtttcaggtc 28145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 263
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  21881572 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 283
Target Start/End: Original strand, 24301691 - 24301855
Alignment:
Q  118 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtatt 217  Q
    ||||||||  |||| || ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||  | ||||||| |||||    
T  24301691 atctagggatcataatgattttaggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaatgtcttatgatacttaacataac--tcactatgtggtatt 24301788  T
Q  218 ctcatgacggatcaatccaata-taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataa 283  Q
    ||| ||| || |   || ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  24301789 ctcgtgatgggtatttctaatagcaaatattactcctaatatgtatacctatgtgaaatcttgataa 24301855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 330
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923678
Alignment:
Q  204 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 303  Q
    |||||||||||||||||| |  || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatattcataccaatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatg 26923651  T
Q  304 agatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26923652 agatgtggtcatcagtctacatacata 26923678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 51997406 - 51997353
Alignment:
Q  210 gtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
    ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51997406 gtagtattctcatggtgggtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 178
Target Start/End: Original strand, 12006332 - 12006413
Alignment:
Q  98 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 178  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12006332 acaaagtacttgacttctacatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccacttatcagtatgagaat 12006413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 192
Target Start/End: Original strand, 10852402 - 10852461
Alignment:
Q  133 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 192  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10852402 tggtttcaggttgaagggtgacatacaccattatcactttaaaaatatcttatgacactt 10852461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 249
Target Start/End: Original strand, 31236402 - 31236478
Alignment:
Q  170 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  31236402 tatgagaatatcttacgacactttc-ataa--tatactatgtagtattctcatgatagatcaattcagtataagtattac 31236478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 32 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21941151 - 21940831
Alignment:
Q  32 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941151 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 21941052  T
Q  132 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21941051 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 21940952  T
Q  232 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940951 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 21940852  T
Q  332 tagtctctatgctttgatgat 352  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  21940851 tagtctctatgctttaatgat 21940831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22171974 - 22171653
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171974 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 22171875  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22171874 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 22171775  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171774 aatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcagtctacctacata 22171675  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22171674 atagtctctatgctttaatgat 22171653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 6094610 - 6094289
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094610 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacgaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6094511  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6094510 agtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatc 6094411  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  6094410 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcactctacccatata 6094311  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6094310 atagtctctatgctttaatgat 6094289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24643135 - 24642815
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24643135 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagaccacgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacat 24643036  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24643035 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatc 24642937  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24642936 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 24642837  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  24642836 atagtctctatactttaatgat 24642815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 31 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15326685 - 15326422
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326685 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15326586  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15326585 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15326486  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15326485 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 31 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15507054 - 15506791
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15507054 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15506955  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15506954 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15506855  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15506854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28548534 - 28548393
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548534 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcaccctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28548435  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548434 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 341
Target Start/End: Original strand, 14983710 - 14983950
Alignment:
Q  98 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttta 196  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |    
T  14983710 acaaagtactcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttaca 14983808  T
Q  197 taacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 296  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14983809 taacttt--ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccatg 14983905  T
Q  297 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 341  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  14983906 atccgtgagatatgatcattagtctacccacataatagtccctat 14983950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 8371253 - 8371563
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  8371253 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgatcatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 8371351  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  8371352 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8371448  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  8371449 aatccaatataaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 8371547  T
Q  331 atagtctctatgcttt 346  Q
    |||||||| |||||||    
T  8371548 atagtctcgatgcttt 8371563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21969635 - 21969333
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21969635 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21969537  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  21969536 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21969440  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21969439 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgatccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21969341  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  21969340 atagtctc 21969333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 343
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797419
Alignment:
Q  146 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 245  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaatt 24797322  T
Q  246 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 343  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| | || ||||||||| |  ||||||||  |||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  24797323 ttactcataatatttatacctacgtgaagacatgatatc-ctatatccatgacccatgagatgtagtcatcaatatactcacataatagtctctatgc 24797419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12562425 - 12562123
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  12562425 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 12562327  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  12562326 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 12562230  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12562229 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12562131  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  12562130 atagtctc 12562123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 27007517 - 27007819
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27007517 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27007615  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  27007616 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27007712  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27007713 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27007811  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  27007812 atagtctc 27007819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 27014660 - 27014962
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27014660 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27014758  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  27014759 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27014855  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27014856 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27014954  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  27014955 atagtctc 27014962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 27880487 - 27880789
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27880487 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27880585  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  27880586 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27880682  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27880683 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27880781  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  27880782 atagtctc 27880789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 28020668 - 28020970
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  28020668 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 28020766  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  28020767 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 28020863  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  28020864 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 28020962  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  28020963 atagtctc 28020970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 346
Target Start/End: Original strand, 38232115 - 38232412
Alignment:
Q  47 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 146  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| | |   |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |    ||||| |||      
T  38232115 cccatcaaccaactttataaccatcatgtcacggacaacgtttgtacgacaacaaagtactcgacttctacatcaagggtacacatcaatttcaagtctg 38232214  T
Q  147 agggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 245  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| | | ||||| |||  ||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38232215 aggatggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaata 38232311  T
Q  246 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 345  Q
    |||| | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | |||||||    
T  38232312 ttacccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatccgtgagatgtgattatcagtctacccacaaaatagtttttatgctt 38232411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 22130609 - 22130911
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22130609 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22130707  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  22130708 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22130804  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22130805 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22130903  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  22130904 atagtctc 22130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25611497 - 25611195
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  25611497 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacactatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 25611399  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  25611398 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagtttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25611302  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| ||||||    
T  25611301 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacata 25611203  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  25611202 atagtctc 25611195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 337
Target Start/End: Original strand, 22659494 - 22659795
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  22659494 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22659592  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  22659593 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22659689  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| ||||||    
T  22659690 aatccagtatacatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacata 22659788  T
Q  331 atagtct 337  Q
    |||||||    
T  22659789 atagtct 22659795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21916978 - 21916676
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21916978 catgattcatcaagtgcccatcaaccaaagttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21916880  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  || ||||||||||||||    || ||    
T  21916879 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--acaatgtagtattctcacagtgggtc 21916783  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21916782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgcatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21916684  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  21916683 atagtctc 21916676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 45534273 - 45534575
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  45534273 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 45534371  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  45534372 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 45534468  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  45534469 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 45534567  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  45534568 atagtctc 45534575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26240786 - 26240484
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||  |||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  26240786 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacaaacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 26240688  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||| ||||| ||| | |  |||||  |  |||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  26240687 agtggttttaggtctaagagcgatatacattataatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 26240591  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||| | ||||||    
T  26240590 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatatacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtcttcatacata 26240492  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  26240491 atagtctc 26240484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835342
Alignment:
Q  128 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgaca-tttttaaaacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 327  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||| | |||||||||| |||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtaatcagtctacatac 18835361  T
Q  328 ataatagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  18835360 ataatagtctcgatgcttt 18835342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 350
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872880
Alignment:
Q  211 tagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtgagataag 32872840  T
Q  311 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatg 350  Q
    ||| | |||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  32872841 atcgtgagtccagccgcataatagtctctatgctttgatg 32872880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6431188 - 6430953
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  6431188 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 6431090  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||| |||||||||  || | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || ||    
T  6431089 agtgatttcaggtcttagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 6430993  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 270  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6430992 tatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 262
Target Start/End: Original strand, 8781959 - 8782102
Alignment:
Q  116 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 215  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    |||||||||||    
T  8781959 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--agactatgtagta 8782055  T
Q  216 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttat 262  Q
    |||||| |  ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  8782056 ttctcacggtggatcaatcaagtataaatattagtcctaatatttat 8782102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 229 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2375300 - 2375214
Alignment:
Q  229 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  2375300 tcaatccaatatacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatccatgatacgtgtgatgtgatcat 2375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 138
Target Start/End: Original strand, 24796731 - 24796826
Alignment:
Q  41 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24796731 ggagtacccatcaaccaattttatagccattatattacaga--acgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 193
Target Start/End: Original strand, 20535226 - 20535371
Alignment:
Q  47 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 146  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||| || ||||  || || ||  |||||||||| |||||| |    
T  20535226 cccattaaccaacattatggttatcctgttatagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtccat-atttaaggatcatagtggttccaggtcta 20535324  T
Q  147 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 193  Q
    || |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20535325 agagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt 20535371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 2962932 - 2963171
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| || |||||||  |||    
T  2962932 catgattcatcaagtaaccatcaaccaacgttatggttatccttttgcagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acgtctagggatcat 2963030  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | ||||  | |||||||||||||||||  |   |    
T  2963031 agtggtttcaggtctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataa--tgtactatgtagtattctcgcggtag 2963128  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 270  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2963129 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 2963171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645537
Alignment:
Q  241 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 335  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatgaaccatgagatgtggtcatcagtttacccacgtaatagt 29645537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36970556 - 36970439
Alignment:
Q  26 atcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggg 125  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||  | |||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  36970556 atcagcatgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttacccttttacatataacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctaggg 36970458  T
Q  126 tacatagtggtttcaggtc 144  Q
      |||||||||||||||||    
T  36970457 atcatagtggtttcaggtc 36970439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2375528 - 2375411
Alignment:
Q  27 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 126  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||  | ||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  2375528 tcatcataattcatggagcacccatcaaccgactttatagttatccaattgcggatgatgtttgtatagcaacaaagtactcgactcctacatctatggt 2375429  T
Q  127 acatagtggtttcaggtc 144  Q
    | ||| | ||||||||||    
T  2375428 aaataatagtttcaggtc 2375411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36970371 - 36970265
Alignment:
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||| ||||| |||||     
T  36970371 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcaatctacatacatg 36970273  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  36970272 atagtctc 36970265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 29645797 - 29645675
Alignment:
Q  58 actttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaata 157  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |   |||||| | | || ||| | ||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||| | ||    
T  29645797 actttatagtcatccttttacaaacaacatttgaacgtctacaaagaaattgaatcctatatctaggatacgtagaagtttcaggtcgaatggtgaagta 29645698  T
Q  158 caccactatcactatgagaatat 180  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  29645697 catcactatcactatgagaatat 29645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  239 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 291  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24535569 - 24535514
Alignment:
Q  264 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 319  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||||||||||    
T  24535569 tctatgtgaaaacttgataactcattattcatgatccgtaagatatgatcatcagt 24535514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 317 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28555049
Alignment:
Q  317 agtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 28555049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 92
Target Start/End: Original strand, 8968015 - 8968076
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaa 92  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  8968015 catgatttatggagtacccatcagtcgactttataatcatctttttatggacaacgtttgaa 8968076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 91
Target Start/End: Original strand, 41368106 - 41368154
Alignment:
Q  43 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 91  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41368106 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41368154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 91
Target Start/End: Original strand, 41375077 - 41375125
Alignment:
Q  43 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 91  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41375077 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41375125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 24695186 - 24695501
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695186 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24695285  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24695286 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 24695385  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695386 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 24695485  T
Q  331 atagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  24695486 atagtctctatgcttt 24695501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 19714218 - 19714539
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714218 catgattcatgtagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19714317  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19714318 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19714417  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19714418 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 19714517  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19714518 atagtctctatgctttaatgat 19714539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 19706939 - 19707259
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19706939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacat 19707038  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19707039 agttatt-caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19707137  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19707138 aatccaatataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 19707237  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19707238 atagtctctatgctttaatgat 19707259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 18569581 - 18569904
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18569581 catgattcatgaagtacccatcaaccaattttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacat 18569680  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18569681 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtc 18569780  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctt--tatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18569781 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttatatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctaccaaca 18569880  T
Q  329 taatagtctctatgctttgatgat 352  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  18569881 taatagtctttatgctttaatgat 18569904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538754
Alignment:
Q  153 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcc 39538854  T
Q  253 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  39538853 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatatgaccatcagtctacccacataatagtcttcatgctttaatgat 39538754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 17298621 - 17298912
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||    
T  17298621 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacat 17298720  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 229  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||||||||  || |    
T  17298721 attggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggt 17298817  T
Q  230 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga--tgtgatcatcagtcta 322  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||    
T  17298818 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatgacccgtgatatgtgtgatcatcagtcta 17298912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 17285470 - 17285759
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  17285470 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaaagtttgtacggaaacaaagtactcgaatcctaaacctagggtacat 17285569  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 229  Q
    | || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| | | |  ||||||||  |||||||||||||||||   || |    
T  17285570 attgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattgtgggt 17285666  T
Q  230 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 322  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17285667 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtgatatgtgatcatcagtcta 17285759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 118 - 346
Target Start/End: Original strand, 18806843 - 18807069
Alignment:
Q  118 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||   | ||||||  |||||||  ||    
T  18806843 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgacagttacaa-aacttt--ctatgtatcat 18806939  T
Q  217 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatc 316  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  18806940 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatatgaaatgtgatcatc 18807039  T
Q  317 agtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18807040 agtctacccgcataatagtctctatgcttt 18807069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 27347252 - 27347417
Alignment:
Q  27 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27347252 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttaaagataacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 27347350  T
Q  127 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 193  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347351 acatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttt 27347417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 138
Target Start/End: Original strand, 24701950 - 24702057
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24702049  T
Q  131 agtggttt 138  Q
    ||||||||    
T  24702050 agtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20941329 - 20941027
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  20941329 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 20941231  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  20941230 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 20941134  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20941133 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20941035  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  20941034 atagtctc 20941027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 25805385 - 25805687
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  25805385 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 25805483  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||  ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  25805484 agtggtttcaggtgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25805580  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  25805581 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 25805679  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  25805680 atagtctc 25805687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32201 - 31899
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  32201 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 32103  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  32102 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 32006  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  32005 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 31907  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  31906 atagtctc 31899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 12789663 - 12789965
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  12789663 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 12789761  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |  | |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  12789762 agtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12789858  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12789859 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12789957  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  12789958 atagtctc 12789965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22941552 - 22941250
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  22941552 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22941454  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  22941453 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22941357  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||  |||| |||| |  ||||||  | |||||||||||| ||||||    
T  22941356 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtataaacttgatatctc-atatctatgacccatgagatacggtcatcagtctacatacata 22941258  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  22941257 atagtctc 22941250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23546224 - 23545922
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  23546224 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 23546126  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  23546125 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 23546029  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  23546028 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 23545930  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  23545929 atagtctc 23545922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 207 - 341
Target Start/End: Original strand, 22546912 - 22547046
Alignment:
Q  207 tatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga 306  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22546912 tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatatgaaaacttgataactctttatccatgatttgtgaga 22547011  T
Q  307 tgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 341  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  22547012 tgtgatcatcggtctatccacataatagtctctat 22547046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 24933306 - 24933608
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24933306 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 24933404  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  24933405 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24933501  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  24933502 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24933600  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  24933601 atagtctc 24933608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 336
Target Start/End: Original strand, 20100255 - 20100543
Alignment:
Q  43 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 142  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||| |||  ||||||||||||| |    
T  20100255 agtacccatcaaccaacattatggttatccttttacagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catcttgggatcatagtggtttcatg 20100353  T
Q  143 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 242  Q
    || ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||| |||||| |  || |||| ||| |||||    
T  20100354 tctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtataa 20100450  T
Q  243 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtc 336  Q
     |||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20100451 gtattactcctaatattgatacctatctatagacttaatatctc-atattcatgacccatgagatgtgatcatcagtctacatacataatagtc 20100543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31097118 - 31096816
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  31097118 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattcca-catctagggatcat 31097020  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  31097019 aatggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 31096923  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  31096922 aatccaatataaatattactcctataatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 31096824  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  31096823 atagtctc 31096816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 12764990 - 12765296
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||    
T  12764990 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12765088  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| ||  |   |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  12765089 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataactt--actatgtagtattctcacggtgg 12765186  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  12765187 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 12765285  T
Q  328 ataatagtctc 338  Q
    |||||||||||    
T  12765286 ataatagtctc 12765296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5097953 - 5097651
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||| |||  |||    
T  5097953 catgattcatcatgtacccatcaacaaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctcgggatcat 5097855  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| |||  ||||| |  ||||||||||||||||| |  || |     
T  5097854 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgacaatttc-ataacat--actatgtagtattctcacggtgggtt 5097758  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  5097757 aatccaatataaatattactcataatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatacata 5097659  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  5097658 atagtctc 5097651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 7865430 - 7865736
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  7865430 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 7865528  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | |||||   |||||||||||||||||| |  ||    
T  7865529 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 7865626  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 327  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  7865627 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 7865725  T
Q  328 ataatagtctc 338  Q
    |||||||||||    
T  7865726 ataatagtctc 7865736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 9811733 - 9812039
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||    
T  9811733 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 9811831  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  9811832 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 9811929  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  9811930 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 9812028  T
Q  328 ataatagtctc 338  Q
    ||| |||||||    
T  9812029 atagtagtctc 9812039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 12703874 - 12704180
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||    
T  12703874 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12703972  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  12703973 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 12704070  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  12704071 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 12704169  T
Q  328 ataatagtctc 338  Q
    ||| |||||||    
T  12704170 atagtagtctc 12704180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Original strand, 18806483 - 18806619
Alignment:
Q  118 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806483 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806579  T
Q  217 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 256  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806580 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Original strand, 18806663 - 18806799
Alignment:
Q  118 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806663 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806759  T
Q  217 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 256  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806760 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 346
Target Start/End: Original strand, 27347425 - 27347513
Alignment:
Q  258 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  27347425 tttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtgagatgtgatcatcggcctatccacaaaatagtctctatgcttt 27347513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 116
Target Start/End: Original strand, 28719471 - 28719558
Alignment:
Q  27 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaa 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  28719471 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttacagacaacgtttg-acggtgataaagcactcgactccaa 28719558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 280
Target Start/End: Original strand, 18829281 - 18829530
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaa---ccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggta 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||  ||  || |||| | |   |||||| || ||||||  ||||| || |||    
T  18829281 catgatccatggagtacccatcaataaccaactttatagtcatcattttatagatgacatttgtacgacaacaaagtacacgactctcacatc-agtgta 18829379  T
Q  128 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 226  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||   ||||||||  |||||||  |||||||||  |    
T  18829380 catagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaacttac-ataacttt--ctatgtatcattctcatggtg 18829476  T
Q  227 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 280  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18829477 ggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatgagaacacttga 18829530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26245404 - 26245102
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||||||||  | ||||  |||||| |  |||    
T  26245404 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgctatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttaagtccat-atctagagatcat 26245306  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||| | || || | |||||||||||||||||| |||  ||||| |  |||||| |||||||| |    |||||    
T  26245305 aatggtttcaggtctaagagcgatatacactattaacattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacat--actatgcagtattctgacagtggatc 26245209  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  26245208 aatcaagtataaatattactcctaatatttatacctatgtataaacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcaatcatcagtctacatacata 26245110  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  26245109 atagtctc 26245102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 26129689 - 26129928
Alignment:
Q  27 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 126  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||| | |||  ||||| ||| ||||||  | |||||||| || |||| ||||||| |     
T  26129689 tcatcatgattcattaagtacccattagccaacgttatggttatctttttatagacaatgttagaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagtga 26129787  T
Q  127 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 226  Q
     ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||| ||||| ||| |  |    
T  26129788 tcatagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtggtattttcacggtg 26129884  T
Q  227 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 270  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129885 ggtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 39539035 - 39538954
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgact 112  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39539035 catgattcgtggagtacctaccaaccaactttataatcatcctattccaaacaacatttgaatggtgataaagcactcgact 39538954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 335
Target Start/End: Original strand, 33477193 - 33477321
Alignment:
Q  206 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 305  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||  ||  ||||||||| || |||     
T  33477193 ctatgtagtattcttatggcagatcaattatgtataaatattactcttaatattaatatttatttgtagatttgatatttc-atatccatgacctttgat 33477291  T
Q  306 atgtgatcatcagtctacctacataatagt 335  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  33477292 atgtgattatcagtttactcacataatagt 33477321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39535509 - 39535465
Alignment:
Q  293 catgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 337  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39535509 catgacctatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 39535465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7594 - 7273
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7594 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 7495  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7494 agttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 7395  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 7295  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  7294 atagtctctatgctttaatgat 7273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 6654 - 6975
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6753  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6754 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6853  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 6953  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6954 atagtctctatgctttaatgat 6975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 13670 - 13991
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13670 catgattcatggagtaaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 13769  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13770 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 13869  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13870 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 13969  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  13970 atagtctttatgctttaatgat 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 35 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15152926 - 15152609
Alignment:
Q  35 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152926 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 15152827  T
Q  135 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15152826 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 15152727  T
Q  235 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152726 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 15152627  T
Q  335 tctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||| |||||    
T  15152626 tctctatgctttaatgat 15152609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29328271 - 29327950
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328271 catgattcatggagtacccatcaagcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 29328172  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29328171 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29328072  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328071 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29327972  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29327971 atagtctctatgctttaatgat 29327950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 11535782 - 11536103
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535782 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11535881  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11535882 agtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11535981  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535982 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11536081  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11536082 atagtctctatgctttaatgat 11536103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 11542700 - 11543021
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11542700 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacat 11542799  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11542800 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatc 11542899  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542900 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11542999  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11543000 atagtctctatgctttaatgat 11543021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12751313 - 12750987
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12751313 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacct 12751214  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12751213 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12751114  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12751113 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 12751014  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgatgtcca 357  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12751013 atagtctctatgctttaatgatatcca 12750987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12739023 - 12738702
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12739023 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacat 12738924  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12738923 agtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12738824  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12738823 aatccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcttcagtctacccacata 12738724  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  12738723 atagtctctatgctttaatgat 12738702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18561485 - 18561173
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18561485 catgattcgtgcagtacctatcaatcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacat 18561386  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||    
T  18561385 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtc 18561295  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18561294 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 18561195  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18561194 atagtctctatgctttaatgat 18561173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13392637 - 13392326
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  13392637 catgattcatggagtacccatcaaccaattttatagtcatcttgttacaaacaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacat 13392538  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||  || ||    
T  13392537 agtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtc 13392438  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| | | |    
T  13392437 aatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcgatctaccaataca 13392338  T
Q  331 atagtctctatg 342  Q
    ||||||||||||    
T  13392337 atagtctctatg 13392326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 343
Target Start/End: Original strand, 18257559 - 18257874
Alignment:
Q  25 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 124  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||    
T  18257559 catcaacatgattcttcaagtacccatcaaccaactttatagttatcttgttacacacaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagg 18257657  T
Q  125 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatga 224  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| || || |  |||||||| |||||| | |     
T  18257658 gatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacgg 18257755  T
Q  225 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 324  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18257756 tgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcaatctatc 18257855  T
Q  325 tacataatagtctctatgc 343  Q
     |||||||||||| |||||    
T  18257856 cacataatagtctttatgc 18257874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2204854 - 2204552
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2204854 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2204756  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  2204755 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2204659  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  2204658 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 2204560  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  2204559 atagtctc 2204552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8465301 - 8464999
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||| ||  |||    
T  8465301 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctaaggatcat 8465203  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  8465202 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8465106  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  8465105 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 8465007  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  8465006 atagtctc 8464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18400406 - 18400104
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18400406 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18400308  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  18400307 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18400211  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18400210 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18400112  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  18400111 atagtctc 18400104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18407390 - 18407088
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18407390 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18407292  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  18407291 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18407195  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18407194 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18407096  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  18407095 atagtctc 18407088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 48808496 - 48808798
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  48808496 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 48808594  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  48808595 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 48808691  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  48808692 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 48808790  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  48808791 atagtctc 48808798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15730053 - 15729751
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15730053 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15729955  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  15729954 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15729858  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15729857 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15729759  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  15729758 atagtctc 15729751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 18139338 - 18139640
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18139338 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 18139436  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  18139437 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18139533  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18139534 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacctgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18139632  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  18139633 atagtctc 18139640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19231190 - 19230888
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||| |||||  |||    
T  19231190 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catttagggatcat 19231092  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||||| |  ||||||||||||||| |  || ||    
T  19231091 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacttat--tatgtagtattctcacggtgggtc 19230995  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19230994 aatccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 19230896  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  19230895 atagtctc 19230888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30254428 - 30254138
Alignment:
Q  43 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||| |    
T  30254428 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaag 30254330  T
Q  143 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 242  Q
    || ||| ||   |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||    
T  30254329 tctaagagtaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaa 30254233  T
Q  243 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30254232 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 30254138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2365407 - 2365169
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |   |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2365407 catgattcgttgagcactcatcaaccgactttatagtcaatctgttacggacgacgtttgtacgacaacaaagtacttgactccaaggtctagggtacat 2365308  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 229  Q
    ||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||   |||||||| ||| |||||  || |    
T  2365307 agtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataacttc--ctatgtagcattttcatggtgggt 2365211  T
Q  230 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2365210 caatccaatgtaaatattactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 41680968 - 41681203
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  41680968 catgattcatcaagtaccaatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 41681066  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  41681067 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 41681163  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 270  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41681164 aatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 10668901 - 10669204
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || |||| ||| || ||  |||    
T  10668901 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcca-catttacggatcat 10668999  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat-gagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| |   ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |    
T  10669000 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggt 10669096  T
Q  230 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 329  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  10669097 caatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacat 10669195  T
Q  330 aatagtctc 338  Q
    |||||||||    
T  10669196 aatagtctc 10669204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 338
Target Start/End: Original strand, 47166871 - 47167161
Alignment:
Q  43 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 142  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  47166871 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 47166969  T
Q  143 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 242  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || || ||| | |||||    
T  47166970 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataa 47167066  T
Q  243 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 338  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47167067 atattactcataatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 47167161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 337
Target Start/End: Original strand, 24443349 - 24443628
Alignment:
Q  53 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 152  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    | |||||||| || ||| ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  24443349 aaccaacgttatggtcatcctgttacacacaacgtttgaataacaataaagcacttgagtcc-acatctagggatcataatggtttcaagtctaagagtg 24443447  T
Q  153 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 252  Q
      |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||   |||||||||||| ||||| |  || | |||| | |||||||||||||||    
T  24443448 ttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcacggtgggttaatctagtataaatattactcc 24443544  T
Q  253 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 337  Q
    ||||||| ||| ||||||  | |||| ||| || | ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24443545 taatattcatacctatgtataaacttaatatct-tatattcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 24443628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34128875 - 34128647
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  34128875 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 34128777  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  | | |||||   ||||||||||||||||||  | |||||    
T  34128776 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacaatggatc 34128680  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34128679 tatccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388544
Alignment:
Q  116 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactt--ttactatgtag 213  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  |   |||||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacactttc-ataacatactatatatgtag 19388676  T
Q  214 tattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 313  Q
    |||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||| ||| |||  ||| ||||| | ||||||| || ||    
T  19388675 tattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctttgtacaaacttaatatctc-atattcatgacccgtgagatatggtc 19388577  T
Q  314 atcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19388576 atcaatctatatacataataatctctatgcttt 19388544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28130863 - 28130561
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| ||||||| ||  |||    
T  28130863 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatctacggatcat 28130765  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||| ||||||||| |||  ||  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  ||| |||||   ||||||||| ||||||||    || ||    
T  28130764 agtgatttcaggtctaagaatgatatacactattattattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtaatattctcacagtgggtc 28130668  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||| | |||||||||||| | ||||    
T  28130667 aatccagtataaatattactcctgatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatttatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatgcata 28130569  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  28130568 atagtctc 28130561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10235451 - 10235361
Alignment:
Q  229 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 319  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10235451 tcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtgagatgtgatcatcagt 10235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 340
Target Start/End: Original strand, 25845498 - 25845780
Alignment:
Q  53 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 152  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845498 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25845596  T
Q  153 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 252  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||||||| |  |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25845597 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25845693  T
Q  253 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 340  Q
    ||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25845694 taatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25845780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 340
Target Start/End: Original strand, 25845917 - 25846199
Alignment:
Q  53 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 152  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845917 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25846015  T
Q  153 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 252  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||||||| |  |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25846016 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25846112  T
Q  253 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 340  Q
    ||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25846113 taatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25846199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 338
Target Start/End: Original strand, 19393462 - 19393726
Alignment:
Q  69 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 168  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| ||| |||||||||| || || |||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | |||||    
T  19393462 atccttttacagacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatca 19393560  T
Q  169 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 268  Q
     | |||||||||||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| |   | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19393561 ttgtgagaatatcttatgaga-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctat 19393657  T
Q  269 gtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 338  Q
    ||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19393658 gtatagacttaatatctc-atatttatgacccatgaaatgtggtcattagtctacatacataatagtctc 19393726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 18259124 - 18259359
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  18259124 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 18259222  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |  ||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  |||||||| |||||||||| |  || ||    
T  18259223 aagggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgcagtattctcacggtgggtc 18259319  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 270  Q
     ||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  18259320 tatccagtataaatattactttcaatatttatacctatgt 18259359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 229 - 337
Target Start/End: Original strand, 47833875 - 47833983
Alignment:
Q  229 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 328  Q
    |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||     
T  47833875 tcaatcaaatataaatattatgagtaatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatcggtgagatctgatcaccagcctacctacg 47833974  T
Q  329 taatagtct 337  Q
    |||||||||    
T  47833975 taatagtct 47833983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15148363 - 15148308
Alignment:
Q  297 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15148363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 15148308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859113
Alignment:
Q  238 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtct 19859123  T
Q  338 ctatgctttg 347  Q
    | | ||||||    
T  19859122 cgacgctttg 19859113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39112275 - 39112138
Alignment:
Q  42 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcag 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   |||||  ||| || ||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  39112275 gagtacctatcaaccaactttatagtcaccttattacagacaacgtttgaacgacaacaaaatacttgattcctacatctagagtacatagtgatttcat 39112176  T
Q  142 gtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 179  Q
    || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112175 gttgaataatggaatacaccactatcactaagagaata 39112138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132849
Alignment:
Q  205 actatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 304  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |  ||  | |||| |||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta-acataataattatacatatgtgaagacttgatatctcatattcatttatctatga 3132888  T
Q  305 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 343  Q
    ||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||    
T  3132887 gatgtgatcatcagtctaatcacattgtagtctctatgc 3132849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 333
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662686
Alignment:
Q  215 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 314  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  || |||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgattcgtaagatatgatca 7662667  T
Q  315 tcagtctacctacataata 333  Q
    ||||| || | ||||||||    
T  7662668 tcagtgtatccacataata 7662686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14592153 - 14591924
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  | |||| | |  |   | |||| |||||  |||    
T  14592153 catgattcatcaagtacccattagccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaataaagaaatgtaagtccacatatagggatcat 14592054  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| ||||||||||||| |  || ||    
T  14592053 agtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtgggtc 14591957  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14591956 aatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16011744 - 16011515
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  | |||| | |  |   | |||| |||||  |||    
T  16011744 catgattcatcaagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaataaagaaatgtaagtccacatatagggatcat 16011645  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| | |||||||||||||  || ||    
T  16011644 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtgggtc 16011548  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16011547 aatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 256
Target Start/End: Original strand, 31190524 - 31190660
Alignment:
Q  117 catctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 216  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||   ||| |||||||||    
T  31190524 catctagggatcttagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataac--atacaatgtagtat 31190620  T
Q  217 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 256  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31190621 tctcatggtgggtcaatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 7396450 - 7396361
Alignment:
Q  260 tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc---tacataatagtctctatgcttt 346  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||    |||||||||||||||||||||    
T  7396450 tatatttatgtgaatacttgataattctttattcatgatatgtgagatgtgatcatcagttcaccctgcacataatagtctctatgcttt 7396361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  22969056 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 180
Target Start/End: Original strand, 22948499 - 22948574
Alignment:
Q  105 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 180  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948499 actcaactcctacatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 219
Target Start/End: Original strand, 15169290 - 15169474
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||| |||| || |||||||||  || |||||||||||||  | |||||| |  | |||| ||||| |||  |||    
T  15169290 catgattcatcaagtgcctatcaaccaacgttatggttatcctgttatagataacgtttgaatggcaataaagcatttaagtcca-catcttgggatcat 15169388  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattct 219  Q
    |||||||| ||| | ||| || | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||    
T  15169389 agtggttttaggactaagagtagcatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattct 15169474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7396527 - 7396469
Alignment:
Q  215 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 273  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  7396527 attcttatgacgggttaatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtgaa 7396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29983234 - 29983179
Alignment:
Q  249 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 304  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29983234 ctcctaatatttatacatatgtgaaaatttgttaactctttatccatgatccgtga 29983179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39112092 - 39111989
Alignment:
Q  238 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 337  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||  |  ||||||||||||||||| || || ||| | | ||| ||||||||   ||||||||||    
T  39112092 tataaataatactcctaatatttatgtatatatgaagaaattgtaactctttatccatgacctatgtgatattaccattagtctacccttataatagtct 39111993  T
Q  338 ctat 341  Q
    ||||    
T  39111992 ctat 39111989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2365112 - 2365070
Alignment:
Q  300 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  2365112 tgtgagatgtgatcatcagtcgacccacatgatagtctctatg 2365070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29984372 - 29984308
Alignment:
Q  121 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttat 185  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||  || || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29984372 tagggtacatggtggtttcaagttgaagggtgatatgcatcacttccactatgagaatatcttat 29984308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18774 - 18454
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18774 catgattcatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18676  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18675 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18576  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18575 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18476  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18475 atagtctctatgctttaatgat 18454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Original strand, 25706 - 26031
Alignment:
Q  27 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25706 tcatcatgatttatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 25805  T
Q  127 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25806 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 25905  T
Q  227 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25906 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 26005  T
Q  327 cataatagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||    
T  26006 cataatagtcgctatgctttaatgat 26031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 21329968 - 21330289
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329968 catgattcatggagtccccatcaacctactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 21330067  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21330068 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 21330167  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21330168 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtccacctacata 21330267  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  21330268 atagtctctatgctttaatgat 21330289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18796993 - 18796672
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796993 catgattcatggtgtacccatcaacaaactttatagtcatcctgttacgtacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacat 18796894  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  18796893 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatc 18796794  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18796793 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 18796694  T
Q  331 atagtctctatgctttgatgat 352  Q
    |||||||| ||||||| |||||    
T  18796693 atagtctcaatgctttaatgat 18796672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18620296 - 18619976
Alignment:
Q  25 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 124  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18620296 catcagcatgattagtggagtacccatcaaccaactttatggtcatcttgttacatacataatgtgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagg 18620197  T
Q  125 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatga 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18620196 gtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgacactttc-ataacttttactatgtagtattctcatgg 18620098  T
Q  225 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 324  Q
     || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  18620097 tgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggcctacc 18619998  T
Q  325 tacataatagtctctatgcttt 346  Q
     |||||||||||| ||||||||    
T  18619997 cacataatagtctatatgcttt 18619976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36270650 - 36270338
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||  |||||| | |||||||  ||||||||||| |||    
T  36270650 catgattcattgagtacccaacaaccgactttatagtcatcctgttacgaacgacttttgtacggcaacaaagtattcgactcatacatctagggtgcat 36270551  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 229  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||  |||| |||  |||||||  ||||||||| ||  |    
T  36270550 ggtggttttaggtcgaagggtg-aatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataatttt--ctatgtaacattctcatggcgagt 36270455  T
Q  230 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||| |||     
T  36270454 caatccaatataaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactctttctctatgactcgtgagatgtgatcatcagtctacccacac 36270355  T
Q  330 aatagtctctatgcttt 346  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  36270354 aatagtctttatacttt 36270338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 22183206 - 22183518
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |     |||||| |||||||||| ||||| || |||||     
T  22183206 catgattcatcaaatacccatcaatcgactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgtacaacaacaaagtactcgactcctacatcaagagtacac 22183305  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 229  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||  |||  ||||| ||   ||||||  ||| ||||| ||| |    
T  22183306 gttggtttcaggtcaaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgact-tttacataacatta--tatgtaacattgtcatggcgggt 22183402  T
Q  230 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 329  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |    
T  22183403 caatccaatataa-tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtgagatttgatcatcaatctacccacgt 22183501  T
Q  330 aatagtctctatgcttt 346  Q
    |||||||||||| ||||    
T  22183502 aatagtctctatacttt 22183518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20978360 - 20978091
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  20978360 catgatttgtggagtatccatcaatcgactttatagttatcatgttacggactacgtttatatgacatcaaagtactcgaatcctacatctagggtacat 20978261  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 229  Q
    ||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||  | || ||  ||||||||| ||| |    
T  20978260 agtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcataatttt--ccatataaaattctcatggcgggt 20978164  T
Q  230 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20978163 caatccaatataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 6991847 - 6992146
Alignment:
Q  45 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaa-gcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggt 143  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |  ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||     
T  6991847 tacccatcaaccgactttatagtcatcgtgtcatagacaacgtttaaacagaaacaaaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggc 6991946  T
Q  144 cgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||   |||| |||  ||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||    
T  6991947 cgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcacttac-ataatttt--ctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataa 6992043  T
Q  243 atattactcctaatatttatatctatgtgaag--acttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 340  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| ||    
T  6992044 atattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttatttataatctgtgagatatgatcattagtctacccatataataatcttta 6992143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18822556 - 18822249
Alignment:
Q  43 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  |||   | |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18822556 agtacccattaaccaactttatagtcattgtgttacggatgacgtttatatgacaaaaaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcagg 18822457  T
Q  143 tcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatata 241  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||  ||||  ||||| |||  ||||||  | ||||||| | |||||||||||||||    
T  18822456 tcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgagat-ctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatata 18822360  T
Q  242 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 341  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| | |    
T  18822359 aatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatccgtgatatgtgatcatcagtctattgacataataatctatct 18822260  T
Q  342 gctttgatgat 352  Q
    ||||| |||||    
T  18822259 gctttaatgat 18822249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30174679 - 30174377
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  30174679 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 30174581  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  30174580 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 30174484  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  30174483 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 30174385  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  30174384 atagtctc 30174377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 24250032 - 24250334
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24250032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 24250130  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  24250131 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24250227  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  24250228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24250326  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  24250327 atagtctc 24250334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 24229215 - 24229517
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  24229215 catgattcatcaagtacccttcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 24229313  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||| | | ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  24229314 agtggtttcaaggctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 24229410  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  24229411 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgaaccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24229509  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  24229510 atagtctc 24229517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 206 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279460
Alignment:
Q  206 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 305  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgatacgtgag 19279501  T
Q  306 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    |||||||||| |||| ||   ||||||||||| ||||||||    
T  19279500 atgtgatcattagtcaactcgcataatagtctttatgcttt 19279460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 229 - 337
Target Start/End: Original strand, 18851977 - 18852085
Alignment:
Q  229 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  18851977 tcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatccgtgagatgggatcattagtctaccgaca 18852076  T
Q  329 taatagtct 337  Q
    |||||||||    
T  18852077 taatagtct 18852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 270
Target Start/End: Original strand, 15342014 - 15342237
Alignment:
Q  43 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 142  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||  ||||||| |  | |||||| | || | || |||||||||  |||||||||||||||    
T  15342014 agtacccattaaccaacgttatggtcatcctgttacaaacaatttttgaattgcaataaagcatttgagttca-catctagggatcatagtggtttcagg 15342112  T
Q  143 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 242  Q
    || ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||| ||| |  || | |||||| |||||    
T  15342113 tctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagtattttcacggtgggttaatccagtataa 15342209  T
Q  243 atattactcctaatatttatatctatgt 270  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342210 atattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 29800775 - 29800468
Alignment:
Q  29 atcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtac 128  Q
    |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  |    
T  29800775 atcatgattcgtcaagtgcccattaaccaacattatgattatcctgttacagacaatgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatc 29800677  T
Q  129 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 228  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  ||     
T  29800676 atagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtggg 29800580  T
Q  229 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactcttt---atccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||| || | | | |   |||||||| |  || ||||||||||||||||||| |    
T  29800579 tcaatccagtataaatattactcctaatatttatacccatgtatatacttaattaatatctcacatccatgacccatgggatgtgatcatcagtctacat 29800480  T
Q  326 acataatagtct 337  Q
    ||||||||||||    
T  29800479 acataatagtct 29800468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17241196 - 17241034
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||| |||||| |||||  ||| ||| | ||||||| | || ||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||||  ||||||    
T  17241196 catgtttcatgaagtacatatctaccgattttataggcttcatgttacacacaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacat 17241097  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt 194  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17241096 agtggttttaggtcgaa-ggtgaaatacaccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 229 - 332
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36802003
Alignment:
Q  229 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatct-atgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 327  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  36801899 tcaattcaatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtgaggtgtgatcatcagtctactcac 36801998  T
Q  328 ataat 332  Q
    |||||    
T  36801999 ataat 36802003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616435
Alignment:
Q  116 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 215  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    ||||||||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataa--aatactatgtagta 19616557  T
Q  216 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 315  Q
    |||||| |  || ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| ||   |||  ||||    ||||||||| ||||    
T  19616556 ttctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatct-aatatttatgactcatgagatgtggtcat 19616458  T
Q  316 cagtctacctacataatagtctc 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  19616457 cagtctacatacataatagtctc 19616435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 178
Target Start/End: Original strand, 36799745 - 36799826
Alignment:
Q  98 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 178  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36799745 acaaagtacttgactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 263
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301164
Alignment:
Q  129 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 228  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| | |  |||||||||||||||||  ||     
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacac--ttcataacatgt--tatgtagtattctcatggtggg 40301129  T
Q  229 tcaatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
    ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40301130 tcaatctggtataaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 336
Target Start/End: Original strand, 28741220 - 28741326
Alignment:
Q  229 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 328  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| ||| | || |||||    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28741220 tcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtacatacttaatatctcat-attcatgacgcatgagatgtgatcatcagtctacataca 28741318  T
Q  329 taatagtc 336  Q
    ||||||||    
T  28741319 taatagtc 28741326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 41661761 - 41661694
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtga 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  41661761 catgtttcatggagtacccatcaaccaactttatgatcatcttattatagacaacgtttgaatggtga 41661694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 261
Target Start/End: Original strand, 41316305 - 41316506
Alignment:
Q  56 caactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaa 155  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   | ||||| ||  | |||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |    
T  41316305 caactttatagttatcctgttacagataacgtttgaatgacaataaagcccttaagtcca-catctagggatcatagtggattcaggtctaagaatggta 41316403  T
Q  156 tacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaa 255  Q
    | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||| || ||||||||||  || || ||  | |||||||||||||| |||    
T  41316404 ttctccgttatcagtatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatataatattctcatggtgggtcgattaagtataaatattactcataa 41316500  T
Q  256 tattta 261  Q
    ||||||    
T  41316501 tattta 41316506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626824
Alignment:
Q  128 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||   |||||||||||||||  ||    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atagcgtgtagtattctcatggtgg 21626859  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21626858 -tcaattcaatataaatattactcatattatttata 21626824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740986
Alignment:
Q  116 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 192  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719006
Alignment:
Q  204 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcta 267  Q
    |||| ||||||||||||| || |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatcta 28719006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 346
Target Start/End: Original strand, 24763751 - 24763867
Alignment:
Q  229 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 328  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| | ||| |||  | || |||| |  ||||| ||| |||||||||||| || |    
T  24763751 tcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgtatagacgtaatatctc-atgtctatgacccatgagacgtggtcatcagtctacataaa 24763849  T
Q  329 taatagtctctatgcttt 346  Q
    |||||||||| |||||||    
T  24763850 taatagtctcgatgcttt 24763867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 12098609 - 12098649
Alignment:
Q  302 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12098609 tgagatctgatcatcagtctacatacataatagtctctatg 12098649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 50 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1159
Alignment:
Q  50 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 149  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1461 atcaaccaactttatatttatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 1362  T
Q  150 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1361 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattac 1262  T
Q  250 tcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgat 349  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1261 tcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 1162  T
Q  350 gat 352  Q
    |||    
T  1161 gat 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 6013 - 5695
Alignment:
Q  27 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6013 tcatcatgattgatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggt 5914  T
Q  127 acatagtggtttcaggtcgaaggg-tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt-ataacttttactatgtagtattctcatga 224  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5913 acatagtggtttcatgtcgaaaggatggaatgcac---------tatgagaatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatgg 5823  T
Q  225 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5822 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtgagatgtgatcatcagtctacc 5723  T
Q  325 tacataatagtctctatgctttgatgat 352  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||    
T  5722 cacataatagtctttatgctttaatgat 5695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 230111 - 230367
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230111 catgattcatggtgtatccaccaaccaactttattgtcatcttgttacagacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 230210  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  230211 aatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatc 230310  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230311 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 183
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 387  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  386 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 290  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  289 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtcatcagtcgacatacata 191  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  190 atagtctc 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 3675 - 3977
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  3675 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 3773  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  3774 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3870  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3871 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 3969  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  3970 atagtctc 3977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 120032 - 119730
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  120032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 119934  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  119933 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 119837  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  119836 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacgtacata 119738  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  119737 atagtctc 119730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 338
Target Start/End: Original strand, 12961 - 13251
Alignment:
Q  43 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 142  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||| | || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  12961 agtacccatcaaccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 13059  T
Q  143 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 242  Q
    || ||| |||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||    
T  13060 tctaagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataa 13156  T
Q  243 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13157 atattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatacataatagtctc 13251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 338
Target Start/End: Original strand, 130262 - 130526
Alignment:
Q  69 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 168  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | |||||    
T  130262 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatca 130360  T
Q  169 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 268  Q
     | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130361 ttgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 130457  T
Q  269 gtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 338  Q
    ||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  130458 gtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 130526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 67374 - 67676
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  67374 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 67472  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || ||    
T  67473 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 67569  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  ||||||    
T  67570 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacata 67668  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  67669 atagtctc 67676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 39988 - 40290
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  |||| |||| | |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||||  || |||||  |||    
T  39988 catgattcatcaagtaaccattagccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcat 40086  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||| ||| ||| ||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||    || ||    
T  40087 agtggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacagtgggtc 40183  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  40184 aatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggccatcagtctacatacata 40282  T
Q  331 atagtctc 338  Q
    ||||||||    
T  40283 atagtctc 40290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8305
Alignment:
Q  128 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8415  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 327  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8414 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8316  T
Q  328 ataatagtctc 338  Q
    |||||||||||    
T  8315 ataatagtctc 8305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26844 - 26609
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||  ||||   | ||||||||||| |||| ||| |||||  |||    
T  26844 catgattcatcgagtacccattatccaacgttatggttatccttttacagacaacattaaaatgacaataaagcactcgagtcca-catatagggatcat 26746  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| |  || ||    
T  26745 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatatagtattctcaaggtgggtc 26649  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26648 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 346
Target Start/End: Original strand, 90033 - 90151
Alignment:
Q  229 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactc-tttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 327  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  90033 tcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttttacccatgatccgtgagatgtgattatcagtctatctac 90132  T
Q  328 ataatagtctctatgcttt 346  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  90133 atagtagtctttatgcttt 90151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9005 - 8723
Alignment:
Q  59 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatac 158  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||   | ||| |||| ||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||| | | |||| ||||    
T  9005 ctttatagttatcatgttacagagaacgtttgaatgacaataaaacacttgactcca-catttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatac 8907  T
Q  159 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 258  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||   ||||| |||||||||||||   || |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8906 accattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatattactcctaatat 8810  T
Q  259 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    ||| |  ||||   |  ||| ||| |||  |||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  8809 ttacacatatgcatatccttaatatctc-atatctatgacatgtgagacgtgatcatcaatctacatacatattagtctctacgcttt 8723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 102
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  ||     
T  288 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcag 190  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctca 221  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  189 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 263
Target Start/End: Original strand, 11526 - 11758
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  ||     
T  11526 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcaa 11624  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |   |||||   ||||| | |||||||||||||||||| ||  |   |||||   ||||||||||||||||||    ||    
T  11625 agtggtttcaggtctaagagcgatgtacactgttatcattgtgagaatatcttatgacaattaatcacataac--gtactatgtagtattctcacagtgg 11722  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11723 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 263
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  128 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 227  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||   |||||||||||||||||||   ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgacac-cttcgtaac--atactatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  228 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 263  Q
     |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  83208 gtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 54066 - 53766
Alignment:
Q  31 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||| ||| ||||||  |||    
T  54066 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatgg-cataaagcacttgagtcc-acacctagggatcat 53969  T
Q  131 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||| || | || ||   ||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  53968 agtggtttcaggtctaagagcaatataaactattaacatgttgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 53872  T
Q  231 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 330  Q
    || ||| | | |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| || ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||| ||||| ||||||    
T  53871 aacccagtgtgaatattactcttaatatttatacctatgtatagaattaatacctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcaatctacatacata 53773  T
Q  331 atagtct 337  Q
    |||||||    
T  53772 atagtct 53766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 46051 - 45956
Alignment:
Q  208 atgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat----ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 299  Q
    |||||| ||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||| |||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  46051 atgtagcattctaatggtgggtcaattcaatataaatattactcataatatatatttatatctatatgaatatttgacaactttttatccatgatc 45956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Original strand, 15089 - 15133
Alignment:
Q  302 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 346  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15089 tgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgatgcttt 15133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University