View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19929_high_41 (Length: 400)

Name: NF19929_high_41
Description: NF19929
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19929_high_41
NF19929_high_41
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (15-384)||(4078607-4078983)
chr8 (27-225)||(34501095-34501290)
chr8 (22-225)||(33817508-33817707)
chr8 (22-225)||(26426778-26426977)
chr8 (22-225)||(37233486-37233690)
chr8 (22-225)||(21405721-21405920)
chr8 (22-225)||(21800213-21800412)
chr8 (22-225)||(29601133-29601333)
chr8 (22-225)||(10953580-10953784)
chr8 (22-225)||(10961585-10961789)
chr8 (228-384)||(4101360-4101528)
chr8 (22-144)||(10582187-10582309)
chr8 (27-225)||(33317602-33317795)
chr8 (25-225)||(14123217-14123412)
chr8 (22-225)||(14122253-14122451)
chr8 (26-144)||(10334599-10334717)
chr8 (165-225)||(10582098-10582158)
chr8 (172-225)||(10334730-10334783)
[»] chr6 (5 HSPs)
chr6 (22-225)||(23219415-23219615)
chr6 (27-225)||(14206579-14206774)
chr6 (27-225)||(4486624-4486819)
chr6 (28-221)||(31715348-31715537)
chr6 (165-225)||(34527062-34527122)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (15-225)||(24596242-24596461)
chr3 (22-225)||(10695808-10696007)
chr3 (22-225)||(43171577-43171776)
chr3 (22-225)||(14242764-14242968)
chr3 (22-225)||(53175754-53175950)
chr3 (22-225)||(39625355-39625554)
chr3 (22-225)||(45906057-45906256)
chr3 (22-225)||(52722456-52722654)
chr3 (22-225)||(10475822-10476028)
chr3 (22-225)||(52553327-52553524)
chr3 (22-225)||(8034381-8034583)
chr3 (25-144)||(40690582-40690701)
chr3 (22-225)||(4970965-4971170)
chr3 (22-144)||(38572773-38572895)
chr3 (22-225)||(50517063-50517263)
chr3 (22-144)||(26406941-26407063)
chr3 (22-225)||(24656930-24657129)
chr3 (22-225)||(38834461-38834654)
chr3 (33-144)||(54244984-54245095)
chr3 (165-225)||(38572924-38572984)
chr3 (165-225)||(40690497-40690557)
chr3 (165-225)||(17332083-17332143)
chr3 (90-126)||(24656833-24656869)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (27-225)||(46940019-46940213)
chr7 (26-225)||(6587596-6587791)
chr7 (22-225)||(38150390-38150589)
chr7 (22-225)||(16188985-16189187)
chr7 (22-225)||(1783559-1783758)
chr7 (22-225)||(36333000-36333205)
chr7 (22-225)||(29665970-29666168)
chr7 (22-225)||(19893490-19893691)
chr7 (22-225)||(32801636-32801834)
chr7 (22-225)||(3175995-3176191)
chr7 (22-225)||(27895084-27895282)
chr7 (22-225)||(47748918-47749117)
chr7 (22-144)||(7835080-7835200)
chr7 (22-225)||(38098353-38098552)
chr7 (22-225)||(28147055-28147254)
chr7 (40-225)||(29172246-29172427)
chr7 (26-222)||(23979916-23980111)
chr7 (33-144)||(7118146-7118257)
chr7 (22-144)||(44073833-44073956)
chr7 (165-225)||(7835239-7835299)
chr7 (165-225)||(47262807-47262867)
chr7 (168-225)||(7118278-7118335)
chr7 (172-225)||(35407125-35407178)
chr7 (165-225)||(38075804-38075864)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (22-225)||(45463549-45463751)
chr2 (22-225)||(4391667-4391867)
chr2 (22-225)||(5003456-5003656)
chr2 (22-225)||(34599573-34599771)
chr2 (22-224)||(16492421-16492619)
chr2 (22-225)||(25459479-25459675)
chr2 (22-225)||(28439785-28439983)
chr2 (22-225)||(12131377-12131577)
chr2 (22-225)||(15381814-15382009)
chr2 (22-223)||(38903352-38903551)
chr2 (162-225)||(38033634-38033697)
chr2 (21-124)||(34132343-34132448)
chr2 (99-144)||(38033576-38033621)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (22-225)||(46580291-46580490)
chr4 (22-225)||(43100399-43100603)
chr4 (22-225)||(53227976-53228176)
chr4 (24-225)||(13229633-13229831)
chr4 (27-225)||(1121327-1121520)
chr4 (22-221)||(6890972-6891171)
chr4 (22-225)||(28714301-28714501)
chr4 (22-225)||(40219016-40219217)
chr4 (22-144)||(575885-576007)
chr4 (26-144)||(1124163-1124281)
chr4 (22-225)||(21629417-21629616)
chr4 (22-225)||(26619165-26619365)
chr4 (22-144)||(50435899-50436021)
chr4 (22-144)||(48832892-48833014)
chr4 (53-225)||(32129155-32129324)
chr4 (22-227)||(56038079-56038280)
chr4 (167-225)||(48833042-48833100)
chr4 (171-225)||(50435833-50435887)
chr4 (168-225)||(576023-576080)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (27-225)||(25764210-25764404)
chr5 (22-225)||(3466328-3466530)
chr5 (22-225)||(19858117-19858316)
chr5 (22-225)||(21145723-21145921)
chr5 (22-221)||(794517-794711)
chr5 (23-225)||(22527444-22527642)
chr5 (23-225)||(3514314-3514512)
chr5 (165-225)||(9717281-9717341)
chr5 (165-225)||(15927351-15927411)
chr5 (165-225)||(41284480-41284540)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (22-232)||(13832669-13832876)
chr1 (22-225)||(37350509-37350709)
chr1 (30-230)||(7351310-7351510)
chr1 (22-225)||(42434537-42434736)
chr1 (22-225)||(9411951-9412151)
chr1 (22-213)||(40535510-40535697)
chr1 (22-225)||(29824192-29824397)
chr1 (26-225)||(31924483-31924677)
chr1 (22-225)||(40977012-40977210)
chr1 (165-225)||(40535445-40535505)
chr1 (158-225)||(27286058-27286125)
chr1 (165-225)||(1804238-1804298)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (23-225)||(30373-30572)
[»] scaffold0208 (1 HSPs)
scaffold0208 (29-225)||(2925-3119)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4078983 - 4078607
Alignment:
Q  15 taaataagtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4078983 taaataagtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagat 4078884  T
Q  115 atataaccattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnn------ttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaac 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4078883 atataaccattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaaaaaaaaaaattattttaggccccaaaaaattgaaggcccggtatcgttgcccagcctcgac 4078784  T
Q  209 gggctatgggccggcccagactaaggaacaatgaatgaaataaacttgcacaaagtaacaaacaattcaaattcatgctaacatcctaacaaagtcataa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4078783 gggctatgggccggcccagactaaggaacaatgaatgaaataaacttgcacaaagtaacaaacaattcaaattcatgctaacatcctaacaaagtcataa 4078684  T
Q  309 atatataccttgaaatttgc-aaatcatcacaatcattccctgctattgattgatcatatccctagccatttaaact 384  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4078683 atatataacttgaaatttgcaaaatcatcacaatcattccctgctattgatagatcacatccctagccatttaaact 4078607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Original strand, 34501095 - 34501290
Alignment:
Q  27 tcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccatta 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34501095 tcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataaccatta 34501194  T
Q  127 tattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    | |||||| |||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34501195 ttttcgtggcttacatataaaaaaaaaa---tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccc 34501290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 33817508 - 33817707
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33817508 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagttgtcacaccactaaagcaagctgtacaaatttaattaatttgcttttaatagatatataac 33817607  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||             |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33817608 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaa----tatttcgggccccaaaaaattagaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 33817703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 26426778 - 26426977
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26426778 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtgaccatgccactaaagcaagctgtacagattgaattaatttgcttttaatagatatataac 26426877  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||| || |||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26426878 cattattttcatggcttacatataaaaaaaaa----tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 26426973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37233690 - 37233486
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37233690 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagcaagctttacaaatcaaattaatttgcttttaatagatatataac 37233591  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttat-tttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggcc 220  Q
    |||||| |||||| |||||||||              || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  37233590 cattattttcgtggcttacatataaaaataaaaaaaaatatttgggccccaaaaaattggaggcccagtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatggacc 37233491  T
Q  221 ggccc 225  Q
    |||||    
T  37233490 ggccc 37233486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 21405721 - 21405920
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21405721 gtgggtcttgaacacatgacctcacacttaacaaaaagtggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaaaaaatttgcttttaatagatatataac 21405820  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||             |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  21405821 cattattttcatgtcttacatataaaaaaaaa----tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgttgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 21405916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 21800213 - 21800412
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21800213 gtgggtcttgaacacatgacctcacacttaacaaaaagtggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaaaaaatttgcttttaatagatatataac 21800312  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||             |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  21800313 cattattttcatgtcttacatataaaaaaaaa----tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgttgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 21800408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 29601133 - 29601333
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  29601133 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatagccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaataaatttgcttttaatagatatataat 29601232  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||             |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29601233 cattattttcgtgtcttacatataaaaaaaata---tattttgggccccaaaaaattggagacccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 29601329  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  29601330 gccc 29601333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 10953580 - 10953784
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953580 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataac 10953679  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat-nnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggcc 220  Q
    |||||| |||||| |||||||||               | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  10953680 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaataaaaaaatttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatggacc 10953779  T
Q  221 ggccc 225  Q
    |||||    
T  10953780 ggccc 10953784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 10961585 - 10961789
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10961585 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataac 10961684  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat-nnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggcc 220  Q
    |||||| |||||| |||||||||               | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  10961685 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaataaaaaaatttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatggacc 10961784  T
Q  221 ggccc 225  Q
    |||||    
T  10961785 ggccc 10961789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4101528 - 4101360
Alignment:
Q  228 actaaggaacaatgaatgaaataaacttgcacaaagtaacaaacaattcaaattcatgctaacatcctaacaaagtcataaatatataccttgaaatttg 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4101528 actaaggaacaatggatgaaataaacttgatcaaagtaacaaacaattcaaattcatgctaacatcctaacaaagtcataaacatataccttgacatttg 4101429  T
Q  328 ca------------aatcatcacaatcattccctgctattgattgatcatatccctagccatttaaact 384  Q
    ||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4101428 caaatcctcatacaaatcatcacaatcattccctgctattgattgatcatatccctagccatttaaact 4101360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10582309 - 10582187
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10582309 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtagctgcgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataac 10582210  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat 144  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  10582209 cattattttcgtggcttacatat 10582187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33317795 - 33317602
Alignment:
Q  27 tcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccatta 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33317795 tcttgaacacatgacctcacactcaataaatattggccacgccactgaagcaagctgtacaaattagaataatttgcttttaatacatatataaccatta 33317696  T
Q  127 tattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    | ||| |||||||||| |             |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33317695 ttttcatgtcttacatttaaaaaaaa-----tattttgggcctcaaaaaattggaggcgcggtgtcgtcgcccagcctcaacgggctataggccggccc 33317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 225
Target Start/End: Original strand, 14123217 - 14123412
Alignment:
Q  25 ggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccat 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14123217 ggtcttgaacatatgacctcacactcaacaaaaagcagccttgccactaaagcaagctgcacatattgaaataatttgcttttaatagatatataacaat 14123316  T
Q  125 tatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggcc 224  Q
    ||| || ||||||| |||||             |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14123317 tatttttgtgtcttgcatataaaaaaaa-----tattttgggccccaaaaaattggaggcctggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggcc 14123411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 14122253 - 14122451
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||||| |||||||||| ||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  14122253 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagcgacaatgccactgaagcaagctgcacaaattgaaatagttttcttttaatagatatataac 14122352  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||||||| |||||             |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  14122353 cattattttcgtgtcttgcatataaaaaaaa-----tattttgggtcccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcacccagcctcgacgggctatgggccg 14122447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 144
Target Start/End: Original strand, 10334599 - 10334717
Alignment:
Q  26 gtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccatt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10334599 gtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccatgccactaaagcaaactgtacaatttgaattaatttgcttttaatagatatataaccatt 10334698  T
Q  126 atattcgtgtcttacatat 144  Q
    || ||| || |||||||||    
T  10334699 attttcatggcttacatat 10334717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10582158 - 10582098
Alignment:
Q  165 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10582158 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccc 10582098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Original strand, 10334730 - 10334783
Alignment:
Q  172 aaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10334730 aaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgaagggctatgggccggccc 10334783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 23219415 - 23219615
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23219415 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataac 23219514  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||             ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  23219515 cattattttcgtgtcttacatataaaaaaaata---tattttgtgccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgaagggctatgggccg 23219611  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  23219612 gccc 23219615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14206774 - 14206579
Alignment:
Q  27 tcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccatta 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14206774 tcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataaccatta 14206675  T
Q  127 tattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    | |||||| |||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14206674 ttttcgtggcttacatataaaaaaaaaa---tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccc 14206579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Original strand, 4486624 - 4486819
Alignment:
Q  27 tcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccatta 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4486624 tcttgaacacatgatctcacactcaacaaaaagtggccatgcctctaaagcaaacggtacaaattgaataaacttgcttttaatagatatataaccatta 4486723  T
Q  127 tattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    | ||||||||||||||||              ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4486724 ttttcgtgtcttacatataaaaaaaaaaa---attttggaccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccaacctcgacgggctatgggccggccc 4486819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31715537 - 31715348
Alignment:
Q  28 cttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccattat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| |||||||| | || |   |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31715537 cttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaggggccacgccactgtagcaagttgtacaaactgaaatggattgcttttgatagatatataaacattat 31715438  T
Q  128 attcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
     ||||||||||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31715437 tttcgtgtcttacatataaaaaaaaa----tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 31715348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 34527062 - 34527122
Alignment:
Q  165 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34527062 ggcccccaaaaatttgaggcccagtgtcgtcgcccagccccgacgggctatgggccggccc 34527122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24596461 - 24596242
Alignment:
Q  15 taaataagtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24596461 taaataagtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagat 24596362  T
Q  115 atataaccattatattcgtgtcttacatat---------nnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctc 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||                     || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24596361 atataaccattattttcgtgtcttacatataaatatatatatatatatatttttttttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 24596262  T
Q  206 aacgggctatgggccggccc 225  Q
     |||||||||||||||||||    
T  24596261 gacgggctatgggccggccc 24596242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 10695808 - 10696007
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  10695808 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaagcaagctg-acaaattaaattaattcgcttttaatagatatataat 10695906  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10695907 cattattttcgtgtcttacatattaaaaaaaaa---tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 10696003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43171776 - 43171577
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43171776 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgtttttaatagatatataac 43171677  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
     ||||| |||||| |||||||||              |  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  43171676 tattattttcgtggcttacatataaaaaaataa----aaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 43171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 14242764 - 14242968
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14242764 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacacgactaaagcaagctgtacagattgaattaatttgcttttaatagatatataac 14242863  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat-nnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggcc 220  Q
    |||||| |||||| |||||||||              ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14242864 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaataaaataaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggcc 14242963  T
Q  221 ggccc 225  Q
    |||||    
T  14242964 ggccc 14242968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 53175950 - 53175754
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  53175950 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagtaagctgtacaaattgaactaatttgcttttaatagatatataac 53175851  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||              | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  53175850 cattattttcgtggcttacatataaaaaaa-------aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgagctatgggccg 53175758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39625554 - 39625355
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  39625554 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggtcatgccactaaagcaagctatacaaattgaataaatttgcttttaatagatatataat 39625455  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||             |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  39625454 cattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaa----tattttgggccccaaaaaattgaaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 39625359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 45906256 - 45906057
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  45906256 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatgatcacaccactaaagcaagctgtacagattgaataaatttgcttttaatagatatataat 45906157  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||             |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45906156 cattattttcgtgtcttacatataaaaataaa----tattttggaccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 45906061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 52722456 - 52722654
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52722456 gtgggtcttgaacacatgacttcacactcaacaaaaagtggtcatgccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 52722555  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||              ||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  52722556 cattattttcgtggcttacatattaaaaaaaaaa---attt--gggcccaaaaaattggagacccggtgtcgtcgcccagcctcgaccggctatgggccg 52722650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10476028 - 10475822
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10476028 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaataaaaagtggccatgccactaaagcaagctatacaaattgaattgatttgcttttaatagatatataac 10475929  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnt---tattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatggg 218  Q
    |||||| |||||| |||||||||            |   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  10475928 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaatatatatatattttgggccccaaaaaattggaggcccgatgtcgtcgcccagcctcgaccggctatggg 10475829  T
Q  219 ccggccc 225  Q
     ||||||    
T  10475828 tcggccc 10475822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52553524 - 52553327
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52553524 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggtcattc-actaaagcaagctgtacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataac 52553426  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||              | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  52553425 cattattttcgtgacttacatataaaaaaaaa-----aatttgggccccaaaaaattggagacccgatgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 52553331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 8034381 - 8034583
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8034381 gtgggtcttaaacacatgacctcacactcatcaaaaagcggccacgccactaaagcaagctgtacagattgaattaattcgcttttaatagatatataac 8034480  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||              |  || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8034481 cattattttcgtggcttacatataaaaaataaaaa-aaaattgggccccaaaaaattagaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 8034579  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  8034580 gccc 8034583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40690701 - 40690582
Alignment:
Q  25 ggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40690701 ggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacgccacaaaagtaagctgtacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataaccat 40690602  T
Q  125 tatattcgtgtcttacatat 144  Q
    ||| |||||| |||||||||    
T  40690601 tattttcgtggcttacatat 40690582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 4970965 - 4971170
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4970965 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtaaccatgccactaaagcaagctatacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataac 4971064  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat--nnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggc 219  Q
    |||||| |||||| |||||||||                |  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4971065 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaaaaaaaaaatttgaccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggc 4971164  T
Q  220 cggccc 225  Q
    ||||||    
T  4971165 cggccc 4971170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Original strand, 38572773 - 38572895
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38572773 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtgactacgccactaaagcaagctgtacagattgaattaatttgcttttaatagatatataac 38572872  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat 144  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  38572873 cattattttcgtggcttacatat 38572895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 50517063 - 50517263
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||     
T  50517063 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaacagccatgccactaaagcaagttgtataaattgaataactttgcttttaatagatatataat 50517162  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||| ||||||||||             |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  50517163 cattattttcgtatcttacatataaaaaaaaaa---tattttggaccccaaaaaattggaagcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 50517259  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  50517260 gccc 50517263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26407063 - 26406941
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26407063 gtgggtcttgaacacatgaccttacattcatcaaaaagtggctacgccactaaagcaagctgtacaaattgaactaagttgcttttaatagatatataac 26406964  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat 144  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  26406963 cattattttcgtggcttacatat 26406941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 24656930 - 24657129
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || | ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  24656930 gtgggtcatgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaacactgaagtaagctgtaaaattcaaaatagtatgcttttaatagatatataac 24657029  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||              |  || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |    
T  24657030 cattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaaa----aaattgggccccaaaaaattggaggcacggtgtcgtcgcccaacttcaacgggctatgggctg 24657125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 38834461 - 38834654
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||       ||||||||    
T  38834461 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccatgccactaaagcaagctgtccaaattgaaaaaatttgcttt-------tatataac 38834553  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||             |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  38834554 cattattttcatgtcttacatataaaaaaaata---tattttgggccccaaaatattgaaagcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 38834650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Original strand, 54244984 - 54245095
Alignment:
Q  33 acacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccattatattcg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  54244984 acacatgacctcacactcaacaaaaaatgaccacgccactaaagcaagctatacagattgaataaattcgcttttaatagatatataatcattattttcg 54245083  T
Q  133 tgtcttacatat 144  Q
    ||||||||||||    
T  54245084 tgtcttacatat 54245095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 38572924 - 38572984
Alignment:
Q  165 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38572924 ggccccaaaaaattggaggcctggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccc 38572984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40690557 - 40690497
Alignment:
Q  165 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40690557 ggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccc 40690497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 17332083 - 17332143
Alignment:
Q  165 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17332083 ggcccccaaaaatttgaggcccagtgtggtcgcccagccccgacgggctatgggccggccc 17332143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 126
Target Start/End: Original strand, 24656833 - 24656869
Alignment:
Q  90 ttaaattaatttgcttttaatagatatataaccatta 126  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24656833 ttaaaatagtttgcttttaatagatatataaccatta 24656869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46940213 - 46940019
Alignment:
Q  27 tcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccatta 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46940213 tcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataaccatta 46940114  T
Q  127 tattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    | |||||| |||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46940113 ttttcgtggcttacatataaaaaaaaa----tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccc 46940019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 6587596 - 6587791
Alignment:
Q  26 gtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccatt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6587596 gtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaagcaagctatacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataaccatt 6587695  T
Q  126 atattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    || |||||| |||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6587696 attttcgtggcttacatataaaaaaaaa----tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccc 6587791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38150589 - 38150390
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  38150589 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaagcaagctg-acaaattaaattaattcgcttttaatagatatataat 38150491  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  38150490 cattattttcgtgtcttacatattaaaaaaaaa---tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 38150394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 16188985 - 16189187
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16188985 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagttgccacgccactaaagcaagctgtacaaatttaattaatttgcttttaatagatatataac 16189084  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||             || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16189085 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaataaaata-tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 16189183  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  16189184 gccc 16189187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1783758 - 1783559
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1783758 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacgccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 1783659  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||              | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  1783658 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaa----aatttgggccccaaaaagttggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggcca 1783563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 36333000 - 36333205
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36333000 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 36333099  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat--nnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggc 219  Q
    |||||| |||||| |||||||||                |  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  36333100 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaaaaaaaaaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagtctcgacgggctatgggc 36333199  T
Q  220 cggccc 225  Q
    ||||||    
T  36333200 cggccc 36333205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29666168 - 29665970
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29666168 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaaatggccacgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataac 29666069  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||              | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29666068 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaa-----aatttgggccccaaaaagttggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 29665974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 19893490 - 19893691
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  19893490 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggtcacgccactaaagcaagttgtacaaattaaaaaaatttgcttttaatagatatataat 19893589  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||            ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  19893590 cattattttcatgtcttacatat--aaaaaaaaaattattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgttgtcgcccatcctcgacgggctatgggccg 19893687  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  19893688 gccc 19893691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 32801636 - 32801834
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32801636 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaagcaagctgtacaaattgaaaaaatttgcttttaatagatatataac 32801735  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||             |||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  32801736 cattattttcatgtcttacatataaaaaaaa-----tattttgggtcccaaaaaattggagacccagtgtcgtcgcccagcctcgacgggttatgggccg 32801830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 3175995 - 3176191
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||     
T  3175995 gtgggtcttgaacac--gacctcacactcaacaaaaaatggtcacgccactaaagcaagctgtacagattgaataaattcgcttttaatagatatataat 3176092  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3176093 cattattttcgtgtcttacatataaaaaaaa-----tattttaggccccataaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 3176187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27895282 - 27895084
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27895282 gtgggtcttgaacacatgaccttacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagcaagctatacatattaaattagttcgcttttaatagatatataac 27895183  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||              |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27895182 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaa-----aaattgagccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 27895088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 47748918 - 47749117
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||     
T  47748918 gtggatcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatagccacgccactaaggcaagctgcacaaattgattaaatttgcttttaatagatatataat 47749017  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||             |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  47749018 cattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaa----tattttgggccgcaaaaaattggaggcccggtgtcatcgcccagcctcgacgggctatgggccg 47749113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Original strand, 7835080 - 7835200
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7835080 gtgggtcttgaacacatgacctcac--tcatcaaaaagcggccacgccactaaaacaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 7835177  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat 144  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  7835178 cattattttcgtggcttacatat 7835200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 38098353 - 38098552
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38098353 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatgtaggaacgccactgaagcaagatatacaaattaaaataatttgcttttaatagatatataac 38098452  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||| | |||||||||||||||              |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  38098453 cattcttttcgtgtcttacata----aaaaataaaatattttgggccccaaaaaattggtggcccgatgtcgtctcccagcctcgacgggctatgggccg 38098548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28147254 - 28147055
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| ||||||||     
T  28147254 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaattaccatgccactaaagcaagctgtgtaaattaaatagatttgcttttaatatatatataat 28147155  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||  ||||||||||||||||             |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  28147154 cattactttcgtgtcttacatattaaaaaaaa----tattttgggccccaaaaaattggaggcccgatgtcgtcgctcagcctcgacgggctataggccg 28147059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 225
Target Start/End: Original strand, 29172246 - 29172427
Alignment:
Q  40 acctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccattatattcgtgtctta 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29172246 acctcacactcaacaaaaaatggccacgccactaaagcaagttgtacaaattaaaataatttgcttttaatagatatataatcattattttcgtgtctta 29172345  T
Q  140 catatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||             ||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||    
T  29172346 catataaaaaatata---tattttagattccaaaaaattggaggcccggtgtcatcgcccagcttcgac-ggctatgggccggccc 29172427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 222
Target Start/End: Original strand, 23979916 - 23980111
Alignment:
Q  26 gtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaatta---aattaatttgcttttaatagatatataacc 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| | | ||   || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23979916 gtcttgaacacatgatctcacactcaacaaaaagtggccatgccactaaaacaaggtgtatagactactaaaataatttgcttttaataaatatataacc 23980015  T
Q  123 attatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccgg 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||             |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23980016 attattttcgtgtcttacatataaaaaaata----tattttggaccccaaaaaattggaggcccggtatcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccgg 23980111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Original strand, 7118146 - 7118257
Alignment:
Q  33 acacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccattatattcg 132  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7118146 acacatgacctgacactcaataaaaagtgaccatgccactaaagcaagttgtacaaattgaaataatttgcttttaatagatatataactattattttcg 7118245  T
Q  133 tgtcttacatat 144  Q
    ||||||||||||    
T  7118246 tgtcttacatat 7118257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 44073956 - 44073833
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaa-gtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||||| ||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  44073956 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaagtgaccatgccactcaagcaaggtgtccaaattgaaataaattgcttttaatagatatataa 44073857  T
Q  121 ccattatattcgtgtcttacatat 144  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  44073856 ctattattttcgtgtcttacatat 44073833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 7835239 - 7835299
Alignment:
Q  165 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7835239 ggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcccagccttgacgggctatgggccggccc 7835299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 47262807 - 47262867
Alignment:
Q  165 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47262807 ggcccccaaaaatttgaggcccagtgtcgtcgcccagccccgacgggctatgggccggccc 47262867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Original strand, 7118278 - 7118335
Alignment:
Q  168 cccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  7118278 cccaaaaaattgaaggtccggtgtcgtcgcccaacctcgatgggctataggccggccc 7118335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Original strand, 35407125 - 35407178
Alignment:
Q  172 aaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  35407125 aaaaatttgaggcccagtgtcgtcgcccagccccgacgggctatgggtcggccc 35407178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 38075804 - 38075864
Alignment:
Q  165 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    ||||||||| || | || |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38075804 ggccccaaataaatcgaagcccggtggcatagcccagcctcaatgggctatgggccggccc 38075864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 45463549 - 45463751
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  45463549 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacaaattaaataaatttgcttttaatagatatataat 45463648  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||            ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45463649 cattattttcgtgtcttacatat-taaaaaaaaaattattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 45463747  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  45463748 gccc 45463751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4391867 - 4391667
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  4391867 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggtcacaccactaaagcaagctgtacaaattgaataaatttgcttttaatagatatataat 4391768  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| || |||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4391767 cattatttttgtgtcttacatataaaaaaaaaa---tattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 4391671  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  4391670 gccc 4391667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 5003456 - 5003656
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5003456 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggcgacgccactaaagcaagctgtacaaattcaaaaaatttgcttttaatagatatataac 5003555  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  5003556 cattattttcatgtcttacatataaaaaaaaaa---tattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 5003652  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  5003653 gccc 5003656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 34599573 - 34599771
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34599573 gtgggtcttgaacacataacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaaacaagctgtacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataac 34599672  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||              |  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34599673 cattattttcgtggcttacatataataaaaaa-----aaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 34599767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16492619 - 16492421
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  16492619 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccatgccactgaagcaagctgtatagattgaataaatttgcttttaatagatatataat 16492520  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16492519 cattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaa----tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 16492424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 25459479 - 25459675
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25459479 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggtcacaccactaaagcaagctatacagattgaattaatttgcttttaatagatatataac 25459578  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||              | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25459579 cattattttcgtggcttacatataaaaaaa-------aatttgggccccaaaaaattggaggcccgatgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 25459671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 28439785 - 28439983
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28439785 gtggatcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccgcgctactaaagcaagctgtacaaataaaattaatttgcttttaatagatatataac 28439884  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||  |||||||||             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  28439885 cattattttcgtagcttacatataaaaaaaa-----tattttaggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcccaacctcgacggactatgggccg 28439979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 12131377 - 12131577
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaa-agtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12131377 gtgggtcttgaacacatgacctcacacttaacaaaaaagtggccatgccactcaagcaaggtgtacaaatcaaaataatttgcttttaatagatatataa 12131476  T
Q  121 ccattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggcc 220  Q
    ||||||| |||||||||| |||||             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12131477 ccattattttcgtgtcttgcatataaaaaaaaa----tattttaggccccaaataattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggcc 12131572  T
Q  221 ggccc 225  Q
    |||||    
T  12131573 ggccc 12131577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 15381814 - 15382009
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15381814 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtagccatgccactaaagcaagctgtacagattaaattaattcgcttttaataaatatataac 15381913  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||              |  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15381914 cattattttcgtggcttacatataaaaaa--------aaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 15382005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38903551 - 38903352
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaa-gtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataa 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38903551 gtgggtcttgaacacttgacctcacactcaacaaaaaagtggcaataccactcaagcaaggtgtataaacaaaaataacttgcttttaatagatatataa 38903452  T
Q  121 ccattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggcc 220  Q
    ||| |||  || ||||||||||||             |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  38903451 ccactattgtcatgtcttacatataaaaaaaaaa---tattttgggccccaaataattggaggtccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggcc 38903355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Original strand, 38033634 - 38033697
Alignment:
Q  162 ttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38033634 ttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccc 38033697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Original strand, 34132343 - 34132448
Alignment:
Q  21 agtgggtcttga--acacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatat 118  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||   ||| | | ||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  34132343 agtgggtcttgagaacgcatgacctcacactcaacaaaaacaagcctcgcaactgaagcaagctgtaaagattgaaataattcacttttaatagatatat 34132442  T
Q  119 aaccat 124  Q
    ||||||    
T  34132443 aaccat 34132448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 144
Target Start/End: Original strand, 38033576 - 38033621
Alignment:
Q  99 tttgcttttaatagatatataaccattatattcgtgtcttacatat 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  38033576 tttgcttttaatagatatataactattattttcgtggcttacatat 38033621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46580490 - 46580291
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  46580490 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggtcacaccactaaagcaagctgtacaaattgaataaatttgcttttaatagatatataat 46580391  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| || |||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  46580390 cattatttttgtgtcttacatataaaaaaaaa----tattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 46580295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 43100399 - 43100603
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43100399 gtgggtcttgaacacatgacttcacactcaacaaaaagtgaccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaaataatttgcttttaatagatatataac 43100498  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat-nnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||             | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  43100499 cattattttcgtgtcttacatataaaaataaataaataaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacaggctatgggcc 43100598  T
Q  221 ggccc 225  Q
    |||||    
T  43100599 ggccc 43100603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 53227976 - 53228176
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||     
T  53227976 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggtcacgccactaaagcaagctgtacaaattgaataaattcgcttttaatagatatataat 53228075  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||             |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  53228076 cattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaaa---tattttgggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcccagcctcgacggactatgggccg 53228172  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  53228173 gccc 53228176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 13229633 - 13229831
Alignment:
Q  24 gggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataacca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13229633 gggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacaaatttaattaatttgcttttaatagatatataacca 13229732  T
Q  124 ttatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggc 223  Q
    |||| |||||| |||||||||              | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13229733 ttattttcgtgacttacatataaaaaaaaaaa---aatttggaccccaaaaaattggaggcccggtgccgtcgcctagcctcgacgggctatgggccggc 13229829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Original strand, 1121327 - 1121520
Alignment:
Q  27 tcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccatta 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1121327 tcttgaacacatgacctcatactcaacaaaaa-tgaccacaccactaaagcaagctgtacagattgaattaatttgcttttaatagatatataaccatca 1121425  T
Q  127 tattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    | |||||| |||||||||              | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1121426 ttttcgtggcttacatataaaaaaaaaa----aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccatcctcgacgggctatgggccggccc 1121520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6891171 - 6890972
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6891171 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaaatggccacgccactaaagcaaactgtacaaattaaattaattttcttttaattgatatataac 6891072  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||              | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  6891071 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaataaaaatttgggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcccaacctcgacggactatgggccg 6890972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28714501 - 28714301
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||     
T  28714501 gtggatcttgaacacatgacctcacactcaacaaatagtggccacgccactaaagcaagctgtacaaattgaataaattcgtttttaatagatatataat 28714402  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| || || ||||||||||             |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  28714401 cattatttttgtatcttacatataaaaaaaaaa---tattttggaccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccaacctcgacgggctatgggccg 28714305  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  28714304 gccc 28714301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 40219016 - 40219217
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  40219016 gtgggtctagaacacatgaccacacattcaacaaaaattggccatgccactaaagcaagctgtacagattaaataaatttacttttaatagatatataat 40219115  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||| ||||||||||             |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  40219116 cattattttcgtatcttacatattaaaaaaaaaa--tattttggaccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 40219213  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  40219214 gccc 40219217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Original strand, 575885 - 576007
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  575885 gtggatcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctatacaaattgaattaattcgcttttaatagttatataac 575984  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat 144  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  575985 cattattttcgtggcttacatat 576007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 144
Target Start/End: Original strand, 1124163 - 1124281
Alignment:
Q  26 gtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccatt 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1124163 gtcttgaacacatggcctcacactcaacaaaaaatggccacaccactaaagcaagctgtacaaattgaattaattttcttttaatagatatataaccatt 1124262  T
Q  126 atattcgtgtcttacatat 144  Q
    || |||||| |||||||||    
T  1124263 attttcgtggcttacatat 1124281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21629616 - 21629417
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21629616 gtggatcttgaacacatgacttcacactcaacaaaaagtgaccatgccactaaagcaagttgtacaaattgaaataaattgcttttaatagatatataac 21629517  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
     ||||| ||||||||||||||||             |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  21629516 aattattttcgtgtcttacatataaaaaaaata---tatttt-gggcccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccaacctcgacgggctatgggccg 21629421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26619365 - 26619165
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |   ||  ||||||||||||| |||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  26619365 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaatagaaaataaacatgccactaaagcaagttgtacaaattgaaatattttgattttaatagatatataac 26619266  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26619265 cattattttcgtgtcttacatataaaaaaaata---tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 26619169  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  26619168 gccc 26619165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 50436021 - 50435899
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50436021 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtgaccatgccactaaagcaagctgtacagattaaattaatttacttttaatagatatataac 50435922  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat 144  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  50435921 cattattttcgtggcttacatat 50435899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Original strand, 48832892 - 48833014
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48832892 gtgggtcttgaacacatgacatcacactcatcaaaaagtggccacgccactaaagcaaactgtacagattgaattaattcgcttttaatagatatataac 48832991  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat 144  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  48832992 cattattttcgtggcttacatat 48833014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32129324 - 32129155
Alignment:
Q  53 caaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnn 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||            
T  32129324 caaaaagtggccacgccactaaaataagctgtacaaattgaaaaaatttgcttttaatagatatataaccattatttacatgttttacatataaaaaaaa 32129225  T
Q  153 nnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
         |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32129224 ta---tattttagaccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccc 32129155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 56038280 - 56038079
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||     
T  56038280 gtgggtttagaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggccacgtcactaaagcaagctatacagattgaataaacttacttttaatagatatataat 56038181  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||| ||||||||||              | |||   ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  56038180 cattattttcgtatcttacatattaaaaaaaaa----aatttgaaccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgtccagcctcgacgggctatgggccg 56038085  T
Q  222 gcccag 227  Q
    ||||||    
T  56038084 gcccag 56038079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 48833042 - 48833100
Alignment:
Q  167 ccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48833042 ccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacggcctatgggccggccc 48833100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50435887 - 50435833
Alignment:
Q  171 aaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50435887 aaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccc 50435833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Original strand, 576023 - 576080
Alignment:
Q  168 cccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  576023 cccaaaaaactggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggctggccc 576080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Original strand, 25764210 - 25764404
Alignment:
Q  27 tcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccatta 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25764210 tcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttgcttttaatagatatataaccatta 25764309  T
Q  127 tattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    | |||||| |||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25764310 ttttcgtggcttacatataaaaaaaaa----tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccc 25764404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3466530 - 3466328
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3466530 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacaaattaaataaatttgcttttaatagatatataat 3466431  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3466430 cattattttcatgtcttacatattaaaaaaatata-tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 3466332  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  3466331 gccc 3466328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 19858117 - 19858316
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858117 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagttgtcacaccactaaagcaagctgtacaaatttaattaatttgcttttaatagatatataac 19858216  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||             |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19858217 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaa----tatttcgggccccaaaaaattagaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 19858312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 21145723 - 21145921
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21145723 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaaatggccacatcactaaagcaagctatacagattgaattaattcgcttttaatagatatataac 21145822  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||              | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21145823 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaa-----aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcaacgggctatgggccg 21145917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 794711 - 794517
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||     
T  794711 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggccacgctactaaagcaagctttacaaatttaatatattttcttttaatagatatataat 794612  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||            ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  794611 cattattttcgtgtcttacatat-----aaaaaaattattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctataggccg 794517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Original strand, 22527444 - 22527642
Alignment:
Q  23 tgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataacc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |    
T  22527444 tgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggtcatgtcactaaagcaagctgtacaaattaaataattttgcttttaaaagatatataatc 22527543  T
Q  123 attatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccgg 222  Q
    ||||| || |||||||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22527544 attatttttgtgtcttacatataaaaaaaaa----tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccgg 22527639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Original strand, 3514314 - 3514512
Alignment:
Q  23 tgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataacc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3514314 tgggtcttgaacacatgacctcatactcaacaaaaaatgaccacaccactaaagcaagctatacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataacc 3514413  T
Q  123 attatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccgg 222  Q
    || || || ||| |||||||||              | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  3514414 atcatttttgtggcttacatataaaaaaaaaa----aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccatcctcgatgggctatgggccgg 3514509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9717341 - 9717281
Alignment:
Q  165 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9717341 ggcccccaaaaatttgaggcccagtgtcgtcgcccagccccgacgggctatgggccggccc 9717281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15927411 - 15927351
Alignment:
Q  165 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15927411 ggcccccaaaaatttgaggcccagtgtcgtcgcccagccccgacgggctatgggccggccc 15927351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 41284480 - 41284540
Alignment:
Q  165 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41284480 ggcccccaaaaatttgaggcccgatgtcatcgcccagccccgacgggctatgggccggccc 41284540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13832876 - 13832669
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13832876 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggtcacaccactaaagcaagctgtacaaattgaataaatttgcttttaatagatatataat 13832777  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| || |||||||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13832776 cattatttttgtgtcttacatataaaaaaaaaa---tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 13832680  T
Q  222 gcccagactaa 232  Q
    |||| ||||||    
T  13832679 gccctgactaa 13832669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 37350509 - 37350709
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  37350509 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggtcacaccactaaagcaagctgtacaaattgaataaatttgcttttaatagatatataat 37350608  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| || |||||||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37350609 cattatttttgtgtcttacatataaaaaaaaaa---tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 37350705  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  37350706 gccc 37350709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 7351310 - 7351510
Alignment:
Q  30 tgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccattatat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7351310 tgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacagattaaataaatttgcttttaatagatatataatcattattt 7351409  T
Q  130 tcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggcccagac 229  Q
    |||||||||||||||             |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  7351410 tcgtgtcttacatattaaaaaatatatatattttgggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctgac 7351509  T
Q  230 t 230  Q
    |    
T  7351510 t 7351510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 42434537 - 42434736
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42434537 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagcaatctatacaaattgaattaatttgtttttaatagatatataac 42434636  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||              |  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  42434637 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaa----aaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 42434732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9412151 - 9411951
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9412151 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaataaaaagtgatcttgccactaaagcaagctgtacaaattgaaataatttgcttttaatagatatataac 9412052  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
    |||||| ||||| ||||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9412051 cattattttcgtatcttacatataaaaaaataa---tattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 9411955  T
Q  222 gccc 225  Q
    ||||    
T  9411954 gccc 9411951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40535697 - 40535510
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40535697 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagttgtcacaccactaaagcaagctgtacaaatttaattaatttgcttttaatagatatataac 40535598  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggct 213  Q
    |||||| |||||| |||||||||             |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40535597 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaa----tatttcgggccccaaaaaattagaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggct 40535510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29824397 - 29824192
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29824397 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattgaattaattcgcttttaatagatatataac 29824298  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatat--nnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggc 219  Q
    |||||| |||||| |||||||||                |  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  29824297 cattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaaaaaaaaaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgagctatgggc 29824198  T
Q  220 cggccc 225  Q
    ||||||    
T  29824197 cggccc 29824192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31924677 - 31924483
Alignment:
Q  26 gtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccatt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31924677 gtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaagcaagctgtacaaattgaattgatttgcttttaatagatatataaccatt 31924578  T
Q  126 atattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    || |||||| |||||||||              ||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31924577 attttcgtggcttacatataaaaaaaaa-----attttggatcccaaaaaattagaggtccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccc 31924483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 40977012 - 40977210
Alignment:
Q  22 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40977012 gtgggtcttgaacatatgacctcacactcctcaaaaagtggccacaccactaaagcaagctatacaaattaaattaattttcttttaatagatatataac 40977111  T
Q  122 cattatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccg 221  Q
     ||||| |||||| |||||||||              | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  40977112 tattattttcgtggcttacatataaaaaaaaa-----aatttgggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcccaacctcgacgggctatgggccg 40977206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40535505 - 40535445
Alignment:
Q  165 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40535505 ggccccaaaaaattagaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccc 40535445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27286125 - 27286058
Alignment:
Q  158 tattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | || ||||||| ||||||    
T  27286125 tattttaggccctaaaaaatttgaggcccggtgtcatagcccagcctcgaaggactatgggtcggccc 27286058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 1804238 - 1804298
Alignment:
Q  165 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  1804238 ggcccccaaaaatttgaggcccagtgtcgtcgcctagtcccaacgggctatgggccggccc 1804298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30572 - 30373
Alignment:
Q  23 tgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataacc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  30572 tgggtcttgaacacatgacctcacacttcacaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacaaattaaataaatttgtttttaatagatatataatc 30473  T
Q  123 attatattcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccgg 222  Q
    ||||| ||| ||||||||||||            ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  30472 attattttcatgtcttacatat---aaaaagaaattattttggaccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgtccagcctcgacgggctatgggccgg 30376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Original strand, 2925 - 3119
Alignment:
Q  29 ttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataaccattata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2925 ttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaaacaaactgcatagatagaattaatttgcttttaatagatatataatcattatt 3024  T
Q  129 ttcgtgtcttacatatnnnnnnnnnnnnttattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgttgcccagcctcaacgggctatgggccggccc 225  Q
    ||||||||||||||||             |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3025 ttcgtgtcttacatataaaaaaaaaaa--tattttgggccccaaaaatttagaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatggaccggccc 3119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University