View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19934_high_3 (Length: 545)

Name: NF19934_high_3
Description: NF19934
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19934_high_3
NF19934_high_3
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (209-383)||(526907-527081)
chr1 (211-383)||(46845666-46845838)
chr1 (209-383)||(39858347-39858521)
chr1 (210-382)||(13276473-13276645)
chr1 (210-380)||(40314095-40314265)
chr1 (209-383)||(49430482-49430646)
chr1 (209-383)||(1994953-1995136)
chr1 (297-383)||(6487728-6487814)
chr1 (209-383)||(44797465-44797648)
chr1 (210-383)||(27325626-27325810)
chr1 (212-377)||(29731194-29731369)
chr1 (209-383)||(32267463-32267647)
chr1 (210-381)||(47571562-47571743)
chr1 (297-381)||(26040972-26041056)
chr1 (212-377)||(48489455-48489630)
chr1 (209-376)||(19989246-19989420)
chr1 (209-383)||(2402923-2403107)
chr1 (281-381)||(7178193-7178291)
chr1 (291-380)||(15225081-15225170)
chr1 (290-383)||(40294820-40294913)
chr1 (303-379)||(29637312-29637388)
chr1 (304-383)||(1673369-1673448)
chr1 (210-361)||(15066019-15066181)
chr1 (211-381)||(33502524-33502704)
chr1 (210-278)||(40030902-40030969)
chr1 (337-383)||(40030838-40030884)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (207-383)||(23915972-23916148)
chr6 (210-383)||(9045833-9046015)
chr6 (211-383)||(34792651-34792833)
chr6 (209-383)||(14313985-14314168)
chr6 (290-380)||(1244645-1244735)
chr6 (209-383)||(9521810-9521999)
chr6 (211-382)||(16717991-16718179)
chr6 (310-377)||(29429590-29429657)
chr6 (208-377)||(12748217-12748397)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (209-383)||(15285329-15285503)
chr5 (214-383)||(35905994-35906163)
chr5 (414-528)||(42031760-42031874)
chr5 (10-210)||(42031518-42031706)
chr5 (210-383)||(13988247-13988430)
chr5 (209-381)||(12248275-12248457)
chr5 (210-384)||(36890376-36890559)
chr5 (282-381)||(33687649-33687748)
chr5 (211-381)||(43100208-43100388)
chr5 (209-383)||(11247192-11247376)
chr5 (307-380)||(1447853-1447926)
chr5 (210-274)||(8076374-8076438)
chr5 (322-383)||(8378344-8378405)
chr5 (209-278)||(20151490-20151558)
chr5 (383-416)||(42031697-42031730)
chr5 (314-383)||(20151384-20151453)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (211-383)||(3121610-3121782)
chr2 (214-383)||(24475714-24475883)
chr2 (210-383)||(33299979-33300154)
chr2 (209-383)||(14945734-14945918)
chr2 (211-380)||(36272661-36272840)
chr2 (210-383)||(32599247-32599430)
chr2 (211-382)||(13696965-13697146)
chr2 (211-386)||(17823576-17823761)
chr2 (306-383)||(4434695-4434772)
chr2 (290-383)||(5562936-5563029)
chr2 (209-383)||(36709190-36709373)
chr2 (210-381)||(40216411-40216592)
chr2 (209-383)||(33555360-33555545)
chr2 (290-383)||(40095263-40095356)
chr2 (279-382)||(42061307-42061412)
chr2 (342-383)||(23860305-23860346)
chr2 (306-383)||(25333144-25333221)
chr2 (210-274)||(14242523-14242586)
chr2 (313-383)||(14242627-14242697)
chr2 (211-248)||(23860198-23860235)
chr2 (314-375)||(37914359-37914419)
chr2 (207-239)||(31220716-31220748)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (222-383)||(2599531-2599692)
chr8 (211-383)||(28897995-28898167)
chr8 (210-393)||(45413554-45413730)
chr8 (244-383)||(10391348-10391487)
chr8 (210-383)||(14342186-14342371)
chr8 (211-381)||(11904855-11905035)
chr8 (209-382)||(43065903-43066085)
chr8 (303-375)||(8368473-8368545)
chr8 (300-383)||(1993739-1993822)
chr8 (279-382)||(27497174-27497276)
chr8 (208-380)||(35200559-35200741)
chr8 (297-378)||(41075693-41075774)
chr8 (299-375)||(45502670-45502746)
chr8 (297-378)||(31774729-31774810)
chr8 (295-378)||(16465706-16465789)
chr8 (317-381)||(12142083-12142147)
chr8 (282-349)||(10592010-10592077)
chr8 (301-363)||(41880209-41880271)
chr8 (209-278)||(4076767-4076835)
chr8 (342-383)||(4077102-4077143)
chr8 (297-381)||(31523608-31523692)
chr8 (314-382)||(44081068-44081136)
chr8 (208-279)||(41075593-41075663)
chr8 (207-279)||(31774841-31774912)
chr8 (219-279)||(42354443-42354503)
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (209-383)||(31741043-31741217)
chr7 (211-381)||(42974395-42974558)
chr7 (209-383)||(46576240-46576424)
chr7 (211-383)||(38754897-38755077)
chr7 (206-381)||(38349454-38349639)
chr7 (210-381)||(28713679-28713860)
chr7 (207-383)||(30922706-30922892)
chr7 (233-300)||(6220185-6220252)
chr7 (304-385)||(47480116-47480196)
chr7 (311-383)||(48460659-48460731)
chr7 (210-383)||(33496499-33496682)
chr7 (281-376)||(11752604-11752699)
chr7 (213-381)||(37536317-37536495)
chr7 (208-278)||(43359087-43359157)
chr7 (303-383)||(51938-52018)
chr7 (313-379)||(43068765-43068831)
chr7 (227-275)||(36675940-36675988)
chr7 (212-275)||(52056-52118)
chr7 (215-278)||(48460768-48460830)
chr7 (297-378)||(43970964-43971044)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (209-383)||(50498210-50498384)
chr4 (209-383)||(22364469-22364643)
chr4 (210-383)||(42179148-42179319)
chr4 (215-382)||(32290215-32290377)
chr4 (211-383)||(5817380-5817562)
chr4 (211-383)||(37605691-37605873)
chr4 (211-382)||(25164471-25164652)
chr4 (278-380)||(51579323-51579425)
chr4 (210-383)||(17044003-17044185)
chr4 (210-383)||(55281208-55281391)
chr4 (210-383)||(25783908-25784090)
chr4 (211-383)||(45995895-45996076)
chr4 (266-383)||(20107110-20107228)
chr4 (306-383)||(32525127-32525204)
chr4 (210-384)||(43749091-43749277)
chr4 (211-380)||(3287087-3287262)
chr4 (211-381)||(48525328-48525508)
chr4 (306-383)||(51579581-51579657)
chr4 (304-383)||(24059236-24059315)
chr4 (290-378)||(41277220-41277308)
chr4 (337-383)||(39631274-39631320)
chr4 (209-274)||(14149958-14150023)
chr4 (208-276)||(14786733-14786801)
chr4 (307-379)||(36851231-36851303)
chr4 (297-377)||(26719997-26720077)
chr4 (209-278)||(9118513-9118582)
chr4 (209-278)||(39631008-39631076)
chr4 (209-276)||(24059133-24059199)
chr4 (349-383)||(14786853-14786887)
chr4 (209-251)||(20107230-20107272)
chr4 (314-375)||(25437008-25437068)
chr4 (210-259)||(51293081-51293130)
chr4 (208-276)||(51579698-51579765)
[»] chr3 (18 HSPs)
chr3 (210-382)||(23004757-23004938)
chr3 (278-383)||(8330669-8330774)
chr3 (213-382)||(12224006-12224184)
chr3 (211-380)||(38247801-38247979)
chr3 (303-383)||(50989203-50989283)
chr3 (303-383)||(51092335-51092415)
chr3 (278-379)||(33288136-33288238)
chr3 (209-383)||(9271110-9271296)
chr3 (211-288)||(44092433-44092510)
chr3 (277-377)||(39947233-39947333)
chr3 (211-381)||(36674519-36674699)
chr3 (211-361)||(40725869-40726029)
chr3 (210-379)||(46135531-46135708)
chr3 (307-375)||(54713532-54713600)
chr3 (211-383)||(48034808-48034991)
chr3 (303-383)||(8496706-8496786)
chr3 (337-383)||(29915095-29915141)
chr3 (337-383)||(29964248-29964294)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (208-276)||(52929-52997)
scaffold0005 (349-383)||(52843-52877)
scaffold0005 (268-323)||(52869-52927)
[»] scaffold0933 (1 HSPs)
scaffold0933 (209-274)||(3054-3118)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (211-383)||(10232-10413)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 526907 - 527081
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccac 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  526907 aaggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccacttccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggggaccac 527006  T
Q  309 atggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  527007 atggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 211 - 383
Target Start/End: Original strand, 46845666 - 46845838
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacat 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46845666 ggataatgtttcatgaacacccttttctgcatacacattatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggggaccacat 46845765  T
Q  311 ggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46845766 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtacatgccatctaaggtggtctatgtatcactactc 46845838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 39858521 - 39858347
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccac 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39858521 aaggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagagtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtgtggggaccac 39858422  T
Q  309 atggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858421 atggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 39858347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 210 - 382
Target Start/End: Original strand, 13276473 - 13276645
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  13276473 aggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtgtgggtaccaca 13276572  T
Q  310 tggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 382  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13276573 tggacacatgtcataattgtgtatgagtgtataagtggtacataccacctaaggtggtctatgtatcactact 13276645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 210 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 40314265 - 40314095
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  40314265 aggataatgtttcatgaacaccattttttccatacatactatataccactcccatatgagagtgtgtgaatgtgagttttttgtgtgtgtggggaccaca 40314166  T
Q  310 tggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  40314165 tggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataaatggtacatactacctaaggtggtttatgtatcacta 40314095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 49430482 - 49430646
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccac 308  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||          |||||||||||| |||||||||||     
T  49430482 aaggataatatttcatgaacactcttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgaaagtg----------agtttcttgtgtgtgtggagaccag 49430571  T
Q  309 atggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49430572 atggacacatgtcacaattgtgtattgatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcaccactc 49430646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1995136 - 1994953
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgtgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||          |||||||||| || ||| ||    
T  1995136 aaggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagtttttt-tgtgtg 1995039  T
Q  299 tggag-accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1995038 tggaggaccacaaagacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 1994953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 297 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 6487814 - 6487728
Alignment:
Q  297 tgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6487814 tgtggggaccacgtggacacatgtcacaattgtgtgtggatgtacaagtggtacatgccacctaaattggtctatgtatcactactc 6487728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 44797465 - 44797648
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttctt-gtgtat 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||          |||||||||| || |||| |    
T  44797465 aaggataatgtttcatgtacacacttttttctatacacacattgtaccacttc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagtttttttgtgttt 44797563  T
Q  298 gtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    | || ||||||| |||||| | ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44797564 gggg-gaccacaaggacacttatcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 44797648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 210 - 383
Target Start/End: Original strand, 27325626 - 27325810
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtga-gagtgtgtga----------atgtgagtttctt-gtgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||          |||||| ||| || |||| |    
T  27325626 aggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgaagagtgtgtgagagacaatacatgtgactttttttgtgtgt 27325724  T
Q  298 gtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    | ||  |||||| |||||| | ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27325725 gggggaaccacaaggacacttatcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 27325810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29731369 - 29731194
Alignment:
Q  212 gataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatg----------tgagtttcttgtgtatgtgg 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||||| |||  |          ||| |||||||||| ||| |    
T  29731369 gataatgtttcatgaacacccttttctctatacacacattgtatcacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatgaatttcttgtgtgtgtag 29731270  T
Q  302 agaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatca 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29731269 ggaccacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtactagtggtatatgccacctaaggtggtttatgtatca 29731194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 32267463 - 32267647
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgtgtatg 298  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||          |||||||||| || ||||||    
T  32267463 aaggataatatttcatgtacacacttttttccatacacacattgtactactcc-atgtgagagtgtgtgagagccaatacatgtgagtttttt-tgtatg 32267560  T
Q  299 tgga--gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32267561 tggaaggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaaattgtacatgccacttaagatggtctatgtatcactactc 32267647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 381
Target Start/End: Original strand, 47571562 - 47571743
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatg----------tgagtttcttgtgtatgt 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |          |||||||||| ||| |||    
T  47571562 aggataatgtttcatgaacaccctttcctctatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttatgtgtgt 47571661  T
Q  300 ggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47571662 agggaccacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggcatatgtcacctaaggtggtttatatatcactac 47571743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 297 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 26041056 - 26040972
Alignment:
Q  297 tgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26041056 tgtggggaccacgtggacacatgtcacaattgtatgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtttgtgtatcactac 26040972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 48489630 - 48489455
Alignment:
Q  212 gataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatg----------tgagtttcttgtgtatgtgg 301  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||| |||  |          ||||||||||||||  || |    
T  48489630 gataatgtttcatgaacaccattttctctatacatacattgtaccacttccatgtgatagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttgtgtgcgtag 48489531  T
Q  302 agaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatca 377  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  48489530 ggaccacatggacagatgtcacaattatatatggatgtacaagtggtatatgccacctaaggtgatttatgtatca 48489455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19989420 - 19989246
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgtgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||          |||| ||||| || |||  |    
T  19989420 aaggataatgtttcatagacactcttttctc-atacacacattgtaccactctcatgtgagagtgtgtgagagacacaaaatgtaagttttttatgt--g 19989324  T
Q  299 tggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatc 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||    
T  19989323 tggaaaccacatggacacatgtcacacttgtatgtggatgtacaagtggtatatgtcatctaaggtggtttatgtatc 19989246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 2402923 - 2403107
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgt-gtat 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||          |||||||||| || | || |    
T  2402923 aaggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccattcc-atgtgagagtgtgcgagagacaatacatgtgagtttttttttgtgt 2403021  T
Q  298 gtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    | || ||||||| | |||| | ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2403022 ggggggaccacaagaacacttttcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccatctaagatggtctatgtatcactactc 2403107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 381
Target Start/End: Original strand, 7178193 - 7178291
Alignment:
Q  281 gtgagtttcttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 380  Q
    |||||||| ||||||  || |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7178193 gtgagttttttgtgt--gtcgagaccacatagacacttgtcacaattgtatgtgggtgtacaaatggtacatgtcacctaaggtggtctatgtatcacta 7178290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 380
Target Start/End: Original strand, 15225081 - 15225170
Alignment:
Q  291 tgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 380  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15225081 tgtgtgtgtggggaccatgtggacatatgtcacaattgcatgtgggtgtataagttgtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 15225170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 383
Target Start/End: Original strand, 40294820 - 40294913
Alignment:
Q  290 ttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||| ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||| | || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40294820 ttgtgtgtgtgaggaccacatagatacatgtcacaattgtgtataggtggacaagtggtacgtgccacctaaagtggtctatgtatcactactc 40294913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 303 - 379
Target Start/End: Original strand, 29637312 - 29637388
Alignment:
Q  303 gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcact 379  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29637312 gaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaagatggtctatgtatcact 29637388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1673448 - 1673369
Alignment:
Q  304 accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||| |||||| | ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1673448 accacaaggacacttatcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaagatggtctatgtatcactactc 1673369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 361
Target Start/End: Original strand, 15066019 - 15066181
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtg----------aatgtgagtttc-ttgtgtatg 298  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||          ||| |||||||| || ||| ||    
T  15066019 aggataatgtttcatgaacactcttttttccatacatacaatgtaccactctcatgtgagagtgtgtgagagacaataaatatgagtttctttttgtgtg 15066118  T
Q  299 tggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaa 361  Q
    |   || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||    
T  15066119 tacggatcacatggacacatgtcacaattgtgtatgaatgtacaaatgatacatgctacctaa 15066181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 381
Target Start/End: Original strand, 33502524 - 33502704
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaa----------tgtgagtttcttgtgtatgtg 300  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| ||  ||||||||  | |||||||||||||||||          ||||||||| |||||| ||||    
T  33502524 ggataatgtttcatgaacatccttttcttcgtacatacattgtaccacctctatgtgagagtgtgtgaaagatataaaatgtgagttttttgtgtgtgtg 33502623  T
Q  301 gagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
    |||||||  || ||| ||||||||||||  | | | |||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  33502624 gagaccatgtgaacatatgtcacaattgcatgtaggtgtacaagtggtacatgtcatctaatgtggtctatgtatcactac 33502704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 40030969 - 40030902
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40030969 aggataatgtttcatgtacacactttttttcatacacacattgtaccact-ccatgtgagagtgtgtga 40030902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 337 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 40030884 - 40030838
Alignment:
Q  337 tgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40030884 tgtacaagtggtacatgctacctaaggtggtctatgtatcactactc 40030838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 153; Significance: 8e-81; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 207 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23916148 - 23915972
Alignment:
Q  207 ataaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagacc 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23916148 ataaggataatgtttcatgaacacccttttctgcatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggggacc 23916049  T
Q  307 acatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23916048 acatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtacatgccatctaaggtgatctatgtatcactactc 23915972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 9046015 - 9045833
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgtgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||          |||| ||||| |||||| |||    
T  9046015 aggataatgtttcatgtacacactttttttcatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtaagttt-ttgtgtgtgt 9045918  T
Q  300 ggag-accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||| |||||| | |||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9045917 ggaggaccacaagaacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtgatacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 9045833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 211 - 383
Target Start/End: Original strand, 34792651 - 34792833
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgtgtatgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||          |||||||||| |||||| |||     
T  34792651 ggataatgtttcatgtacacacttttttgcatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagttt-ttgtgtgtgta 34792748  T
Q  301 gaga--ccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||  ||||| |||||| ||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34792749 gagagaccacaaggacacttgtcaaaattatatgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 34792833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 14313985 - 14314168
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttctt-gtgtat 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||          |||||| ||| || |||| |    
T  14313985 aaggataatgtttcatgtacacactttt-tccatacacacattgtaccacttt-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgactttttttgtgtgt 14314082  T
Q  298 gtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    | ||  |||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14314083 gggggaaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 14314168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 380
Target Start/End: Original strand, 1244645 - 1244735
Alignment:
Q  290 ttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 380  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1244645 ttgtgtgtggggggaccacaaggacacttgccaaaattgtgtgtggatgtacaagtggtacatgccacttaaggtggtctatgtatcacta 1244735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 9521810 - 9521999
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtg----------aatgtgagtttcttgtgt--- 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||           ||| ||||||| ||||||       
T  9521810 aaggataatgtttcatgtacatccttttctccatacacacattgtacca-tcccatgtaaaagtgtgtaggagacaataaatatgagttttttgtgtgtg 9521908  T
Q  296 -atgtggagaccacatggacacatgtcacaatt--gtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
     |||||| || |||||| | | |||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9521909 tatgtggggatcacatgaatatatgtcacaattatgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtgatctatgtattactactc 9521999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16718179 - 16717991
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtg----------aatgtgagtttcttgtgtatgtg 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||          ||  |||||||||||||| |||     
T  16718179 ggataatgtttcatgaacacccttttctctatacacacattgtaccacttccatgtgatagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttgtgtgtgta 16718080  T
Q  301 gagaccacatggaca-----catgtcacaat--tgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 382  Q
    | ||||| |||||||     |||||||||||  | ||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16718079 gggaccaaatggacacatgtcatgtcacaattatatgtgtgggtgtacaagtggtatatgccacctaaggtggtttatgtatcactact 16717991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29429657 - 29429590
Alignment:
Q  310 tggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatca 377  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  29429657 tggacacatgtcacaattgtatgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtagtctgtgtatca 29429590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12748397 - 12748217
Alignment:
Q  208 taaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtg----------aatgtgagtttcttgtgtat 297  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||          ||  ||| ||| |||||| |    
T  12748397 taaggataatgtttcataaacacccttttctttatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatga-ttttttgtgtgt 12748299  T
Q  298 gtggag--accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatca 377  Q
    ||| ||  |||||||||||| ||||||||||| | | ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12748298 gtgtaggaaccacatggacagatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggtatatgccacctaaagtggtttatgtatca 12748217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15285503 - 15285329
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccac 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15285503 aaggataatgtttcatgaacacccttttctgcatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggggaccac 15285404  T
Q  309 atggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15285403 atggacacatgtcacaattgtgtatgagtgtataagtggtacatgccatctaaggtggtctatgtatcactactc 15285329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 214 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 35906163 - 35905994
Alignment:
Q  214 taatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacatgga 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  35906163 taatgtttcatgaacacccttttctccatacatactatgtaccactctcatgtgagagtgtgtaaaagtgagtttcttgtgtgtgtagggactacatgga 35906064  T
Q  314 cacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35906063 cacatgtcacaattgtatatgggtgtataagtgatacataccacctaaggtggtctatgtatcattactc 35905994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 414 - 528
Target Start/End: Original strand, 42031760 - 42031874
Alignment:
Q  414 tacggaagaagcaacaactcaccaacaatgcaaacaaatccgacgggagtatcattgtcaccccacgctacgcaaatatatgataccacatttggctagc 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42031760 tacggaagaagcaacaactcaccaacaatgcaaacaaatccgacgggagtatcattgtcaccccacgctacgcaaatatatgataccacatttggctatc 42031859  T
Q  514 gagcaatctgaatct 528  Q
    |||||||||||||||    
T  42031860 gagcaatctgaatct 42031874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 210
Target Start/End: Original strand, 42031518 - 42031706
Alignment:
Q  10 aagaatataaggaactcctacaaatcacctatctagccatacaatccatcgagttgataaaccactcgtacnnnnnnnggatggtacacctatttgttta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||    
T  42031518 aagaaaattaggaactcctacaaatcacctatctagccatacaatccatcgagttgataaaccactcgtacaaaaaaaggatggtgcacctatttgttta 42031617  T
Q  110 cc----caaaaaccattgccaagagatgctattgattgcgtgaacaacctatgtaggcgacgtcactttttgagagaagattgaatcattacgagccttc 205  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||| |||                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42031618 cccaaacaaaaaccattgccaagagatgctcttg----------------atgtaggcgacgtcactttttgagagaagattgaatcattacgagccttc 42031701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 210 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13988430 - 13988247
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttctt-gtgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||          |||||| ||| || |||| ||    
T  13988430 aggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgactttttttgtgtgtg 13988332  T
Q  299 tggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
     || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988331 gggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 13988247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 209 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12248457 - 12248275
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatg----------tgagtttcttgtgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||  |          |||||||||||||  ||    
T  12248457 aaggataatgtttcatgaacacccttttctctatacacacattgtaccacttccatgtgatagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttgtgcgtg 12248358  T
Q  299 tggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12248357 tagggaccacatggacacatgtcacaattatatgtggatgtacaagtggtatatgccacctaaggtgatttatgtatcactac 12248275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36890559 - 36890376
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgtgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||          |||||||||| || ||| |||    
T  36890559 aggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcg-atgtgagagtgtatgagagacaatacatgtgagtttttt-tgtgtgt 36890462  T
Q  300 ggag-accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcc 384  Q
    || | |||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890461 gggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcc 36890376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 282 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33687748 - 33687649
Alignment:
Q  282 tgagtttcttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  33687748 tgagtttcttgtgtgtgtagagatcacatggacacatgtcacaattatatatggatgtacaagtggtatatgccacctaagatgatttatgtatcactac 33687649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 381
Target Start/End: Original strand, 43100208 - 43100388
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatg----------tgagtttcttgtgtatgtg 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||| ||||| |||  |          ||| |||||||||| |||     
T  43100208 ggataatgtttcatgaacacccttttctctatacacacattgtaccactttcatgtgatagtgtttgagagacacaaaagatgaatttcttgtgtgtgta 43100307  T
Q  301 gagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43100308 gagaccacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggtatataccacctaagatggtttatgtatcactac 43100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11247376 - 11247192
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgag-tttcttgtgtat 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||          ||||||| ||| |||||| |    
T  11247376 aaggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccact-ccatgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagtttttttgtgtgt 11247278  T
Q  298 gtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
      || || ||||  ||||  ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11247277 agggggatcacaaagacatttgtcaaaattgtgtgtggatgtacaagtagtatatgccatctaaggtagtctatgtatcactactc 11247192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 307 - 380
Target Start/End: Original strand, 1447853 - 1447926
Alignment:
Q  307 acatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 380  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||    
T  1447853 acatggacatatgtcacaattgtgcgtggatgtataagtggtacatgccacctaaagttgtctatatataacta 1447926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8076438 - 8076374
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgt 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  8076438 aggataatgtttcatgaacacccttttctctatacatacattgtaccacttccatgtgagagtgt 8076374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 322 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 8378405 - 8378344
Alignment:
Q  322 acaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8378405 acaactgtgtgtggatgtacaaatggtacatgtcatctaaggtggtctatgtatcaccactc 8378344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20151558 - 20151490
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||    
T  20151558 aaggataatatttcatgtacacctttttttccatacatacattataccac-cccatgtgagagtgtgtga 20151490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 383 - 416
Target Start/End: Original strand, 42031697 - 42031730
Alignment:
Q  383 ccttccataatgaccacaccattgtgtgccatac 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42031697 ccttccataatgaccacaccattgtgtgccatac 42031730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20151453 - 20151384
Alignment:
Q  314 cacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||||| |||| ||| ||| |||  |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20151453 cacatgtcataattatgtgtgggtgttcaagtggtatatgctacctaaagtggtctatgtatcattactc 20151384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 211 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 3121782 - 3121610
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacat 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3121782 ggataatgtttcatgaacacccttttctgcatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggggaccacat 3121683  T
Q  311 ggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3121682 ggacacatgtcacaattgtgtatgagtgtataagtggtacatgccatctaaggtggtctatgtatcactactc 3121610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 214 - 383
Target Start/End: Original strand, 24475714 - 24475883
Alignment:
Q  214 taatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacatgga 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24475714 taatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccacttccacgtgagagtgtgtaaaagtgagtttcttgtgtgtgtggggactacatgga 24475813  T
Q  314 cacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24475814 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtgatacataccacctaaggtggtctatgtatcattactc 24475883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 210 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 33300154 - 33299979
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttctt--gtgtatgtggagacca 307  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||    
T  33300154 aggataatgtttcatgaacaccgtattcttcatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtgtgtggggacca 33300055  T
Q  308 catggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33300054 catgaacacatgtcacaattgtatatgggtgtataaatggtacatgccacttaaggtggtctatgtatcactactc 33299979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 14945734 - 14945918
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgag----------tttcttgtgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||          ||| || | | ||    
T  14945734 aaggataatgtttcatgaacacccttttcttcatacacattatgtaccactcctatgtgagagtgcgtgaatgtgagttttttttttttttttttttgtg 14945833  T
Q  299 tggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||| ||||| ||  |||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14945834 tggggaccaaataaacacatgttacatttgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 14945918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 380
Target Start/End: Original strand, 36272661 - 36272840
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaa----------tgtgagtttctt-gtgtatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||          ||||||||| || |||| |||    
T  36272661 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatatacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgaaagacaatacatgtgagtttttttgtgtgtgt 36272759  T
Q  300 ggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 380  Q
    || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36272760 ggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 36272840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 210 - 383
Target Start/End: Original strand, 32599247 - 32599430
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgtgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||          |||||||||| || ||| |||    
T  32599247 aggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgacagacaatacatgtgagtttttt-tgtgtgt 32599344  T
Q  300 ggag--accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||  |||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599345 ggagggaccacaaggacacttgtcaaaattatgtgtggatgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 32599430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 211 - 382
Target Start/End: Original strand, 13696965 - 13697146
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttctt-gtgtatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||          |||||| ||| || |||| ||     
T  13696965 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgactttttttgtgtgtgg 13697063  T
Q  300 ggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 382  Q
    ||  |||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13697064 gggaaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 13697146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17823761 - 17823576
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgag-tttcttgtgtatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||          ||||||| ||| |||||| ||     
T  17823761 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccact-ccatgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagtttttttgtgtgtgg 17823663  T
Q  300 ggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcctt 386  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||| | ||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17823662 ggggaccacaaggacacttatcaaaattgtatgtgggtgtacaagtgatacataccatctaaggtggtttatgtatcactactcctt 17823576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 306 - 383
Target Start/End: Original strand, 4434695 - 4434772
Alignment:
Q  306 cacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4434695 cacatggacacatgtcacaatagtgtgtggaagtacaagtggtacatgccacataaggtggtctatatatcactactc 4434772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 290 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5563029 - 5562936
Alignment:
Q  290 ttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  5563029 ttgtgtgtgtggagaccacatcgacacatgtcaaaattatatatgaatgtataaatggtacatgccacctaaaatagtctatgtatcactactc 5562936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 36709190 - 36709373
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgtgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||  ||||||||||| || ||||| |||||||          |||||||||| |||||| ||    
T  36709190 aaggataatgtttcatgtacacatttttttccatacaaacattgtaccactcc-atatgagaatgtgtgacagacaatacatgtgagttttttgtgtgtg 36709288  T
Q  299 tggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
     || |||||||  ||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36709289 gggggaccacaatgacatttgtcaaaattgtgtgtgggtgtataagtggtacataccacctaagatggtctatgtatcagtactc 36709373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 40216592 - 40216411
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtg----------aatgtgagtttcttgtgtatgt 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||          ||  |||||||||| ||| |||    
T  40216592 aggataatgtttcatgaacaccctttcctctatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacataaaagatgagtttcttatgtgtgt 40216493  T
Q  300 ggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||| ||  || |||||||||| ||| |||||||||    
T  40216492 agggaccacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggtatatatcatctaaggtggtttatatatcactac 40216411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 33555360 - 33555545
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgag--tttcttgtgta 296  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||          |||||||  ||| || |||     
T  33555360 aaggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccact-ccatgtgagaatgtgtgacagacaatacatgtgagttttttttttgtg 33555458  T
Q  297 tgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    || || |||||||  ||||| ||||| |||||||| |   |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33555459 tggggggaccacaatgacacttgtcaaaattgtgtgtaagtgtacaagtggtacatgccacttaaggtgatctatgtatcactactc 33555545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 40095356 - 40095263
Alignment:
Q  290 ttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||| || || |||||||  ||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  40095356 ttgtgtgtggggggaccacaatgacacttgtcaaaattgtatgtggatgtacaagtggtacatgtcatctaaggtggtctatgtatcactactc 40095263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 382
Target Start/End: Original strand, 42061307 - 42061412
Alignment:
Q  279 atgtgagtttcttgtgtatgtggag--accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatc 376  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |  |||||| |||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  42061307 atgtgagttttttgtgtgtgtggggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtatgtgggtgtacaagtggtacatgccacccaaagtgctctatgtatc 42061406  T
Q  377 actact 382  Q
    ||||||    
T  42061407 actact 42061412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 383
Target Start/End: Original strand, 23860305 - 23860346
Alignment:
Q  342 aagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23860305 aagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 23860346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25333221 - 25333144
Alignment:
Q  306 cacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||    
T  25333221 cacatgaacacatgtcacaaatgtgtgttgatgtacaagtggtacatgcgatccaaggtggtctatgtataactactc 25333144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 274
Target Start/End: Original strand, 14242523 - 14242586
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgt 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  14242523 aggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccact-ccatgtgagagtgt 14242586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Original strand, 14242627 - 14242697
Alignment:
Q  313 acacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14242627 acacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaggtggtacataccacctaagatggtctatgtatcactactc 14242697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 248
Target Start/End: Original strand, 23860198 - 23860235
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacac 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23860198 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacac 23860235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 375
Target Start/End: Original strand, 37914359 - 37914419
Alignment:
Q  314 cacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtat 375  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  37914359 cacatgtcacaaatgtgtgtggatgtaaaag-ggtgtatgccacctaaggtggtttatgtat 37914419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31220748 - 31220716
Alignment:
Q  207 ataaggataatgtttcatgtacacccttttctc 239  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31220748 ataaggataatgtttcatggacacccttttctc 31220716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 222 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 2599692 - 2599531
Alignment:
Q  222 catgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtc 321  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2599692 catgaacaccctttttttcatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggggaccacatgaacacatgtc 2599593  T
Q  322 acaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2599592 acaattgtgtatgggtgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 2599531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 211 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 28898167 - 28897995
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacat 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28898167 ggataatgtttcatgaacaccattttctccatacacactatgtaccactctcatatgagagtgtgtgaaagggagtttcttgtgtgtgtggggaccacat 28898068  T
Q  311 ggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28898067 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 28897995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 210 - 393
Target Start/End: Original strand, 45413554 - 45413730
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccaca 309  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||        |||||||| ||||| ||||| |    
T  45413554 aggacaatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgcaccactcctatgtgagggtgcgtgaaa-------tcttgtgtgtgtggggaccata 45413646  T
Q  310 tggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactccttccataat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45413647 tggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcattctataat 45413730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 383
Target Start/End: Original strand, 10391348 - 10391487
Alignment:
Q  244 cacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataa 343  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10391348 cacattatgtactactcccatgtgagagtgtgtgaaagtgagtttcttatgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataa 10391447  T
Q  344 gtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  10391448 gtggcacatgccacctaagatgatctatgtatcattactc 10391487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 210 - 383
Target Start/End: Original strand, 14342186 - 14342371
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttctt--gtgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||          |||||| ||| ||  ||||||    
T  14342186 aggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgaattttttttgtgtat 14342284  T
Q  298 gtggagaccacatggacacatgtcacaa-ttgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    | || ||||||| |||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14342285 ggggggaccacaaggacacttgtcaaaaattgtgtgtgggtgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 14342371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 211 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 11905035 - 11904855
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatg----------tgagtttcttgtgtatgtg 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |          ||||||||||||||  ||     
T  11905035 ggataatgtttcatgaacacccttttctctatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttgtgtgagta 11904936  T
Q  301 gagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11904935 gggaccacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggtatatgccacctaaggtggtttatgtatcactac 11904855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 382
Target Start/End: Original strand, 43065903 - 43066085
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgtgtatg 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||          |||||||||| || ||| ||    
T  43065903 aaggataatgttttatgtacacatttttttccatacatacattgtaccattcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagtttttt-tgtgtg 43066000  T
Q  299 tggag-accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 382  Q
    ||| | |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43066001 tgggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtggatgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 43066085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Original strand, 8368473 - 8368545
Alignment:
Q  303 gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtat 375  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8368473 gaccacgtggacacatgtcacaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtat 8368545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 383
Target Start/End: Original strand, 1993739 - 1993822
Alignment:
Q  300 ggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1993739 ggagaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtgatacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 1993822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 279 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27497276 - 27497174
Alignment:
Q  279 atgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcac 378  Q
    |||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27497276 atgtgagttttttgtgtgtatggaaaccacatgaacacatgtcgcaattgtctgtggatgtacaagtggtacatgccacctaaagtggtct-tgtatcac 27497178  T
Q  379 tact 382  Q
    ||||    
T  27497177 tact 27497174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 35200741 - 35200559
Alignment:
Q  208 taaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatg----------tgagtttcttgtgtat 297  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |          |||||||||||| | |    
T  35200741 taaggataatgtttgatgaacacccttttctctatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttgtatgt 35200642  T
Q  298 gtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 380  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35200641 gtagggaccgcatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtaatatatgccacctaaggtggtttatgtatcacta 35200559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 378
Target Start/End: Original strand, 41075693 - 41075774
Alignment:
Q  297 tgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcac 378  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41075693 tgtggggaccacatgaacacatgtcacaattgtatgtgggtgtacaagtggtacatgtcacctaaggtggtctatgtatcac 41075774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 299 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45502746 - 45502670
Alignment:
Q  299 tggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtat 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  45502746 tggagaccacatggacacatgtcacaattgtatatgaatgtacaagtggtacataccacttaaggtggtttatgtat 45502670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31774810 - 31774729
Alignment:
Q  297 tgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcac 378  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31774810 tgtggggaccacatgaacacatgtcacaattgtatgtgagtgtacaagtggtacatgtcacctaaggtggtctatgtatcac 31774729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 16465706 - 16465789
Alignment:
Q  295 tatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcac 378  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16465706 tatgtagagaccacgtagacacatgtcacaattgtatgtgggtatacaagtggtacatgccgtctaaggtggtctatgtatcac 16465789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12142147 - 12142083
Alignment:
Q  317 atgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
    ||||||||||| | | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12142147 atgtcacaattatatgtggatgtacaagtggtatatgccacctaaggtggtttatgtatcactac 12142083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10592077 - 10592010
Alignment:
Q  282 tgagtttcttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggta 349  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||||||    
T  10592077 tgagtttcttgtgtgtgtagagaccacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggta 10592010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 363
Target Start/End: Original strand, 41880209 - 41880271
Alignment:
Q  301 gagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaagg 363  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  41880209 gagaccacatagatacgtgtcacaattgtgtatagatgtacaaatggtacatgccacctaagg 41880271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 278
Target Start/End: Original strand, 4076767 - 4076835
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4076767 aaggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacatattgtaccact-ctatgtgagagtgtgtga 4076835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 383
Target Start/End: Original strand, 4077102 - 4077143
Alignment:
Q  342 aagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4077102 aagtggtacatgccacctaaggtggtctatatatcactactc 4077143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 381
Target Start/End: Original strand, 31523608 - 31523692
Alignment:
Q  297 tgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| | ||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  31523608 tgtggagatcacatggacacttatcacaattatatatagatgtacaagtgatacatgtcatctaagatggtctatctatcactac 31523692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44081136 - 44081068
Alignment:
Q  314 cacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 382  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44081136 cacatgtcacaattacgtgtggatgtacaaatgatacatgccatctaaggtggtgtatgtatcactact 44081068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 41075593 - 41075663
Alignment:
Q  208 taaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaa 279  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41075593 taaggataatgtttcgtagacaccattttctc-atacacacattgtaccactatcatgtgagagtgtgtgaa 41075663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31774912 - 31774841
Alignment:
Q  207 ataaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaa 279  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  ||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31774912 ataaggataatgtttcgtagacactattttctc-atacacacattgtaccactatcatgtgagagtgtgtgaa 31774841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 279
Target Start/End: Original strand, 42354443 - 42354503
Alignment:
Q  219 tttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaa 279  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  42354443 tttcatggacacctttttctccatacacatattgtaccacctccatgtgagagtatgtgaa 42354503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 31741217 - 31741043
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccac 308  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||    
T  31741217 aaggataatgtttcatgaacatccttttttctatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtgtggggagcac 31741118  T
Q  309 atggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31741117 atagacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcattactc 31741043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 381
Target Start/End: Original strand, 42974395 - 42974558
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacat 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||      |||| |||||| ||||| ||||| ||    
T  42974395 ggataatgtttcatgaacacctttgtttccatacacacattgtac-actcccatgtaagagtgtgtga------gttttttgtgtgtgtggggaccatat 42974487  T
Q  311 ggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
    | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42974488 gaacacatgtcacaattgtatgtgggtgtataagtggtacatgccacctaaggtggtttatgtatcactac 42974558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 46576240 - 46576424
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttctt-gtgtat 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||          |||||| ||| || |||| |    
T  46576240 aaggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgactttttttgtgtgt 46576338  T
Q  298 gtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    | ||  |||||| |||||| ||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46576339 gggggaaccacaaggacacttgttaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 46576424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 211 - 383
Target Start/End: Original strand, 38754897 - 38755077
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgtgtatgtg 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||          |||||||||| || ||| ||||    
T  38754897 ggataatatttcatgtacacctttttttccatacatacattataccac-cccatgtgagagtgtgtgagagacaataaatgtgagtttttt-tgtgtgtg 38754994  T
Q  301 gagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    | || ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38754995 gggatcacatggacacatgtcataattatgtatgggtgttcaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcattactc 38755077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 206 - 381
Target Start/End: Original strand, 38349454 - 38349639
Alignment:
Q  206 cataaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatg----------tgagtttcttgtgt 295  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |          |||||||||| |||    
T  38349454 cataaggataatgtttcatgaacaccctttcctctatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttatgt 38349553  T
Q  296 atgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
     ||| | || |||||||||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38349554 gtgtagggaacacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggtatatgccacctaagatggtttatgtatcactac 38349639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 210 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 28713860 - 28713679
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatg----------tgagtttcttgtgtatgt 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||||  ||||||||||||| |||  |          |||||||||| ||| |||    
T  28713860 aggataatgtttcatgaacacccttttctctatacacatattgtaccactttcatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttatgtgtgt 28713761  T
Q  300 ggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
     | || |||||||||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28713760 agggaacacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggtatatgccacctaaggtggtttatgtatcactac 28713679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 383
Target Start/End: Original strand, 30922706 - 30922892
Alignment:
Q  207 ataaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgag-tttcttgtgt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||          ||||||| ||| ||||||    
T  30922706 ataaggataatgtttcatgtacatacttttttccatacacacattgtaccact-ccatgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagtttttttgtgt 30922804  T
Q  296 atgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
     || || ||| ||| |||||| ||||| |||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30922805 gtggggggactacaaggacacttgtcaaaattatgtgtgaatgtacatgtggtacataccacctaaggtgatctatgtatcactactc 30922892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 300
Target Start/End: Original strand, 6220185 - 6220252
Alignment:
Q  233 ttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6220185 ttttttccatacacactatgtaccactctcatgtgagagtgtgtgaatgtgagttttttttgtatgtg 6220252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 304 - 385
Target Start/End: Original strand, 47480116 - 47480196
Alignment:
Q  304 accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcct 385  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47480116 accatatggacacatgtcacaattgtat-tgggtgtacaaatggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcattactcct 47480196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 48460731 - 48460659
Alignment:
Q  311 ggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48460731 ggacacttgtcaaaattgtatgtggatgtacaaatggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 48460659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 210 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 33496682 - 33496499
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgag-tttcttgtgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||          || |||| ||| |||||| ||    
T  33496682 aggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattataccact-ccatgtgagagtgtgtgagagacaatacatatgagtttttttgtgtgtg 33496584  T
Q  299 tggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
     || || ||||  ||||| ||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33496583 gggggatcacaaagacacttgtcaaaattatatgtgggtgtacaagtggtacatgtcacctaaggtggtctatgtatccctactc 33496499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11752699 - 11752604
Alignment:
Q  281 gtgagtttcttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatc 376  Q
    |||||||| || ||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| | | | | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11752699 gtgagttttttatgtgtgtggggaccacgtgaacacatgtcacaattatatgtaggtgtacaagtgatacatgccacctaaggtggtctatgtatc 11752604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 381
Target Start/End: Original strand, 37536317 - 37536495
Alignment:
Q  213 ataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatg----------tgagtttcttgtgtatgtgga 302  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||  |          |||||||||||||| ||| |     
T  37536317 ataatgtttcatgaacaccattttctctatacacacattgtaccactttcatgtgagagtgtttgagagatacaaaagatgagtttcttgtgtgtgtagg 37536416  T
Q  303 gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | ||| |||| | ||| || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  37536417 gaccgcatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacatgtgatatatgccacctaagatgatttatgtatcactac 37536495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43359157 - 43359087
Alignment:
Q  208 taaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga 278  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  43359157 taaggataatgtttcattgacaccattttctccatacacacaatgtatcaccctcatgtgagagtgtgtga 43359087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 52018 - 51938
Alignment:
Q  303 gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||| ||| || ||| | |||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52018 gaccacaaggatacttgttaaaattgtatatagatgtacaaatagtacataccacctaaggtggtctatgtatcactactc 51938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 379
Target Start/End: Original strand, 43068765 - 43068831
Alignment:
Q  313 acacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcact 379  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  43068765 acacatgtcaaaattatgtgtggaggtttaagtggtacatgcgacctaaggtggtatgtgtatcact 43068831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36675988 - 36675940
Alignment:
Q  227 acacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtg 275  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36675988 acacccttttctccatatatactatgtatcacttccatgtgagagtgtg 36675940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 52118 - 52056
Alignment:
Q  212 gataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtg 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||    
T  52118 gataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccact-acatatgagagtgtg 52056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 48460830 - 48460768
Alignment:
Q  215 aatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga 278  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48460830 aatgttttatgtacacacttttttccacacacacattgtaccact-ccatgtgagagtgtgtga 48460768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43971044 - 43970964
Alignment:
Q  297 tgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcac 378  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||  | |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43971044 tgtggggaccacgtggacacat-tcaaaattgtgtgtggagttttaaagggtgtatgccacctaaggtggtctatgtatcac 43970964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 50498384 - 50498210
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccac 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  50498384 aaggataatgtttcatgaacaccattttctccatacatactatataccactcccatatgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtgtgtggggaccac 50498285  T
Q  309 atggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  50498284 atggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtacatactacctaaggtgatctatgtatcactactc 50498210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 22364469 - 22364643
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccac 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |  || ||||||    
T  22364469 aaggataatgtttcatgaacacccttttctccatacatattatgtaccactcccatgtgagagtgtataaaagtgagtttcttgtgtgttaggggaccac 22364568  T
Q  309 atggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  22364569 atggacacatatcacaattgtatatgggtgtataagtggtatatgccacctaagttgatttatgtatcactactc 22364643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 210 - 383
Target Start/End: Original strand, 42179148 - 42179319
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  || |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  42179148 aggataatgtttcatgaacatcctttttttcatacacactatgtaccactcctatgtgagagtctg--aaagtgagttttttgtgtgtgtggggaccaca 42179245  T
Q  310 tggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42179246 tggacacatgtcacaattgtgcatgggtgtataagtggtacataccacctaaggtggtctatgtatcattactc 42179319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 215 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 32290377 - 32290215
Alignment:
Q  215 aatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacatggac 314  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||||      
T  32290377 aatgtttcatgaacactcttttctccatacatactatgtaccactcccatgtgagagtgtatgaaagtgaatttcttgtgtgtgtgaggaccacatgg-- 32290280  T
Q  315 acatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 382  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32290279 ---tgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtacatgccacctaagatggtctatgtatcactact 32290215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 383
Target Start/End: Original strand, 5817380 - 5817562
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtg----------aatgtgagtttcttg-tgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||           ||| ||||||| ||| ||| |||    
T  5817380 ggataatgtttcatgtacatccttttctccatacacacattgtaccac-cccatgtaaaagtgtgtaggagacaataaatatgagttttttggtgtgtgt 5817478  T
Q  300 ggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5817479 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaagatggtctatgtatcactactc 5817562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 211 - 383
Target Start/End: Original strand, 37605691 - 37605873
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttctt-gtgtatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||          |||||| ||| || |||| ||     
T  37605691 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagggacaatacatgtgactttttttgtgtgtgg 37605789  T
Q  300 ggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37605790 ggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 37605873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 211 - 382
Target Start/End: Original strand, 25164471 - 25164652
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgtgtatgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||          |||||||||| || ||| ||||    
T  25164471 ggataatgtttcatgtacacacttttttgcatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagtttttt-tgtgtgtg 25164568  T
Q  301 gag--accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 382  Q
    |||  |||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25164569 gaggaaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 25164652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 51579425 - 51579323
Alignment:
Q  278 aatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatca 377  Q
    ||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51579425 aatgtgagttttttgtatgtgtgggaaccacatggacacatgtcacaattgtatgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatca 51579326  T
Q  378 cta 380  Q
    |||    
T  51579325 cta 51579323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17044185 - 17044003
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgtgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||          ||| || ||| || ||| |||    
T  17044185 aggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgggactttttt-tgtgtgt 17044088  T
Q  300 ggaga-ccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    || || ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17044087 ggggaaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 17044003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 55281391 - 55281208
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttctt-gtgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||          |||||| ||| || |||| ||    
T  55281391 aggataatgtttcatgtacacacttttttccatacatacattgtaccactcc-atgtgagaatgtgtgagagacaatacatgtgactttttttgtgtgtg 55281293  T
Q  299 tggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
     || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55281292 gggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 55281208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 210 - 383
Target Start/End: Original strand, 25783908 - 25784090
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtg----------aatgtgagtttcttgtgtatgt 299  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||          || |||||||| ||||||||||    
T  25783908 aggataatgtttcatgaacatctttttttctatacacacgttgtacca-tcctatgtgagagtgtgtgtgaaacaataaaagtgagttttttgtgtatgt 25784006  T
Q  300 ggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25784007 ggggactacatgaatacatgtcacaattatgtgtggatgtacaagtggtacatgccacctaagatgatctatgtatcactactc 25784090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 383
Target Start/End: Original strand, 45995895 - 45996076
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttcttgtgtatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||          |||||||||| || ||| ||||    
T  45995895 ggataatgtttcatgtacacatttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagtttttt-tgtgtgtg 45995992  T
Q  301 g-agaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    | |||||||| | |||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45995993 ggagaccacaagaacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaagatggtctatgtatcactactc 45996076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20107228 - 20107110
Alignment:
Q  266 tgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgga-tgtataagtggtacatgccacctaaggt 364  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20107228 tgagagtgtgtgaatgcgagttttttatgcgcgtgggaaccacatggacacatgtcacaattgtgtgcggggtgtacaagtggtacatgccacctaaggt 20107129  T
Q  365 ggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20107128 ggtctatgtatcactactc 20107110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 306 - 383
Target Start/End: Original strand, 32525127 - 32525204
Alignment:
Q  306 cacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32525127 cacatagacacatatcacaattgtgtgtggatgtataagtggtatatgccacctaagatggtctatgtatcactactc 32525204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 210 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43749277 - 43749091
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgag-tttcttgtgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |   ||||||||||| |||| |||||||||||          ||||||| ||| |||||| ||    
T  43749277 aggataatgtttcatgtacacactttttttcatacatatattgtaccactcc-atgtaagagtgtgtgagggacaatatatgtgagcttttttgtgtgtg 43749179  T
Q  299 tggag--accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcc 384  Q
    |||||  |||||| |||||| ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43749178 tggagggaccacaaggacacttgtcaaaattatgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcc 43749091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3287262 - 3287087
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttct-ccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga------atgtgagtttcttgtgtatgtggag 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||      ||  |||||| || ||| ||  |||    
T  3287262 ggataatgtttcatgtacacactttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagataatacgagttttttttgtgtggagag 3287164  T
Q  304 accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 380  Q
    |||||| |||| | ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3287163 accacaaggactcttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacataccatctaaggtggtttatgtatcacta 3287087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 48525508 - 48525328
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatg----------tgagtttcttgtgtatgtg 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |          | |||||||| ||| |||     
T  48525508 ggataatgtttcatgaacaccctttcctctatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagataagtttcttatgtgtgta 48525409  T
Q  301 gagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
    | || |||||| ||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48525408 gggaacacatgaacacatgtcacaattatatgtggatgtacaagtggtatatgccacctaaagtggtttatgtatcactac 48525328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 306 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 51579657 - 51579581
Alignment:
Q  306 cacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51579657 cacatggacacatgtcacaattgtatttgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtct-tgtatcactactc 51579581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 383
Target Start/End: Original strand, 24059236 - 24059315
Alignment:
Q  304 accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24059236 accacatggacacatgtcacaattgtatgtgggtgtacaaatgatacatgccatctaaggtggtctatgtatcactactc 24059315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41277308 - 41277220
Alignment:
Q  290 ttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcac 378  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41277308 ttgtgtgtgtggggaccacatgaacacatgtcacaattgtatgtgggtgtacaggtggtacatgtcacctaaggtgatctatgtatcac 41277220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 383
Target Start/End: Original strand, 39631274 - 39631320
Alignment:
Q  337 tgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39631274 tgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 39631320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Original strand, 14149958 - 14150023
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||    
T  14149958 aaggataatgtttcatgaacacccttttctctatacacacattgtaccacttccatgtgaaagtgt 14150023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 276
Target Start/End: Original strand, 14786733 - 14786801
Alignment:
Q  208 taaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14786733 taaggataatgtttcatggacaccatttttttcatacacattatgtaccactctcatgtgagattgtgt 14786801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36851303 - 36851231
Alignment:
Q  307 acatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcact 379  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36851303 acatggacacatgtcacaatcatgcgtgggtgtacaagtggtacatgccacttaaggtggtctatgcatcact 36851231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Original strand, 26719997 - 26720077
Alignment:
Q  297 tgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatca 377  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||||||  | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26719997 tgtggggaccacaaagacacatgttacaattgaatgtgggtgtagaagtggtacacgccacctaaggtggtttatgtatca 26720077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 278
Target Start/End: Original strand, 9118513 - 9118582
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga 278  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  9118513 aaggataatatttcatgaacaccctttcctccatacatacaatgtaccacattcatgtgagagtgcgtga 9118582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 278
Target Start/End: Original strand, 39631008 - 39631076
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga 278  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39631008 aaggataatgtttcatgtacatacttttttccatatacacattgtaccact-ctatgtgagagtgtgtga 39631076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 276
Target Start/End: Original strand, 24059133 - 24059199
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgt 276  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||    
T  24059133 aaggataatgttttatgtacacactttcttccatacacacattgtaccac-cccatgtaagagtgtgt 24059199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 383
Target Start/End: Original strand, 14786853 - 14786887
Alignment:
Q  349 acatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14786853 acatgtcacctaaggtggtctatgtatcactactc 14786887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20107272 - 20107230
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactat 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  20107272 aaggataatgtttcatgaacaccctttttttcatacacactat 20107230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 375
Target Start/End: Original strand, 25437008 - 25437068
Alignment:
Q  314 cacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtat 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  25437008 cacatgtcacaattgtgtatggatgt-taaaaggtgtatgtcacctaaggtggtccatgtat 25437068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 259
Target Start/End: Original strand, 51293081 - 51293130
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccact 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||||    
T  51293081 aggataatgtttcatgtacacactttttttcatacacacattgtaccact 51293130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 51579765 - 51579698
Alignment:
Q  208 taaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgt 276  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||  | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  51579765 taaggataatgttttatgtaaacactttctttcatacacacattgtaccac-cccatgtgagagtgtgt 51579698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 18)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 210 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23004938 - 23004757
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaa----------tgtgagtttcttgtgtatgt 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||          ||||||||| || ||| |||    
T  23004938 aggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgcaccacttccatgtgagagtgtgtgaaagtgtgtgaatgtgagttt-ttatgtgtgt 23004840  T
Q  300 ggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 382  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23004839 ggggaccacatgaatacatgtcacaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 23004757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 383
Target Start/End: Original strand, 8330669 - 8330774
Alignment:
Q  278 aatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatca 377  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8330669 aatgtgagttttttgtgcatatggggaccacatggacatatatcacaattgtgtgtgaatgtacaagtggtacatgccatctaaggtggtctatgtatca 8330768  T
Q  378 ctactc 383  Q
    ||||||    
T  8330769 ctactc 8330774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 382
Target Start/End: Original strand, 12224006 - 12224184
Alignment:
Q  213 ataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagttt-cttgtgtatgtgg 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||          |||||||||| ||||||| || ||    
T  12224006 ataatgtttcatgtacacacttttttccatacacact-tgtaccacttc-aggtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagttttcttgtgtgtgagg 12224103  T
Q  302 agaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 382  Q
     ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12224104 ggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaaatggtacatgccacctaaggtggtttatgtatcactact 12224184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 38247979 - 38247801
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttctt-gtgtatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||          |||||| ||| || |||| ||     
T  38247979 ggataatgtttcatgtacacactttt-tccatacacacattgtaccactct-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgactttttttgtgtgtgg 38247882  T
Q  300 ggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 380  Q
    ||  |||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38247881 gggaaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 38247801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 303 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 50989283 - 50989203
Alignment:
Q  303 gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50989283 gaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 50989203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 303 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 51092415 - 51092335
Alignment:
Q  303 gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51092415 gaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 51092335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33288238 - 33288136
Alignment:
Q  278 aatgtgagtttctt-gtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatc 376  Q
    ||||||||||| || |||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33288238 aatgtgagtttttttgtgtgtgtgaggaccacatagacacatatcacaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacataccacctaaggtggtctatgtatc 33288139  T
Q  377 act 379  Q
    |||    
T  33288138 act 33288136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 9271296 - 9271110
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttctt-gtgtat 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |   ||||||||| | |||| |||||||||||          |||||||||| || |||| |    
T  9271296 aaggataatgtttcatgtacacactttttttcatacatatattgtaccacttc-atgtaagagtgtgtgagggacaatacatgtgagtttttttgtgtgt 9271198  T
Q  298 gtggag--accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||||  |||||| |||||| ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9271197 gtggagggaccacaaggacacttgtcaaaattatgtgtgggtgtacaagtggtacatgccatctaaggtggtctatgtatcactactc 9271110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 288
Target Start/End: Original strand, 44092433 - 44092510
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagttt 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44092433 ggataatgtttcatgaacacccttttctctctacaaactatgtaccactctcatgtaagagtgtgtgaatgagagttt 44092510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 377
Target Start/End: Original strand, 39947233 - 39947333
Alignment:
Q  277 gaatgtgagtttcttgtgtatgtggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatc 376  Q
    |||||||||||| ||  || |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  39947233 gaatgtgagtttttttggtgtgtgaagatcacatggacacatatcacaattgtatgtgggtgtataagtggtacatgtcacttaaggtggtctatatatc 39947332  T
Q  377 a 377  Q
    |    
T  39947333 a 39947333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 381
Target Start/End: Original strand, 36674519 - 36674699
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatg----------tgagtttcttgtgtatgtg 300  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  |          |||||||||| ||| |||     
T  36674519 ggattatgtttcatgaacatccttttctctatacacacattgtaccacttccatatgagagtgtttgagagacataaaagatgagtttcttatgtgtgta 36674618  T
Q  301 gagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 381  Q
    | || |||||||||||||||||||||| | | ||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36674619 gtgatcacatggacacatgtcacaattatatgtgagtgtacaagtggtatatgtcacctaaggtggtttatgtatcactac 36674699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 40726029 - 40725869
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactccca----------tgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtg 300  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||| |||||| |          ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||| ||    
T  40726029 ggataatgtttcatggacacattttttttcatacacactatgtatcactcctatgtgagaatgtgtgagagtgtatgaatgtgatttttttttgtatttg 40725930  T
Q  301 gagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaa 361  Q
    | ||||| ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40725929 gggaccatataaacacatgtaacaattgtatatggatgtacaagtggtacataccacctaa 40725869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 46135708 - 46135531
Alignment:
Q  210 aggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtg--------aatgtgagtttcttgtgtatgtgg 301  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||        ||  ||||||| |||||||| |||    
T  46135708 aggataatgtttcatgaacatcattttctccatacacacattgtaccacccctatgtgagagtgtgtgagagatataaaatgagttttttgtgtatatgg 46135609  T
Q  302 agaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcact 379  Q
      ||||   ||||||||||||||||||| | | | |||| || || |||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  46135608 gaaccatgcggacacatgtcacaattgtatgtaggtgtacaaatgatacatgccatttaagatggtctatgtatcact 46135531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 54713600 - 54713532
Alignment:
Q  307 acatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtat 375  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54713600 acatggacacatgtcataattatgtgtggatgttcaagtggtacatgccacctaacgtggtctatgtat 54713532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 383
Target Start/End: Original strand, 48034808 - 48034991
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttctt-gtgtatgt 299  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||          || ||||||| || |||| ||     
T  48034808 ggataatgttttatgtacacacttttttccatacacacattgtaccacttc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatttgagtttttttgtgtgtgg 48034906  T
Q  300 ggag-accacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    || | |||||| |||||| ||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48034907 gggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtatgtgggtgtacaagtggtacatgtcacctaaggtggtttatgtatcaccactc 48034991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 8496786 - 8496706
Alignment:
Q  303 gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8496786 gaccacaaagacacttgtcaaaattgtatgtgggtggacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcaatactc 8496706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 383
Target Start/End: Original strand, 29915095 - 29915141
Alignment:
Q  337 tgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29915095 tgtacaagtggtatatgccacataaggtggtctatgtatcactactc 29915141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 383
Target Start/End: Original strand, 29964248 - 29964294
Alignment:
Q  337 tgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29964248 tgtacaagtggtatatgccacataaggtggtctatgtatcactactc 29964294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 52997 - 52929
Alignment:
Q  208 taaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  52997 taaggataatgtttcatggacaccatttttttcatacacattatgtaccactctcatgtgagattgtgt 52929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 52877 - 52843
Alignment:
Q  349 acatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52877 acatgtcacctaaggtggtctatgtatcactactc 52843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 52927 - 52869
Alignment:
Q  268 agagtgtgtgaatgtgagtttctt---gtgtatgtggagaccacatggacacatgtcac 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  52927 agagtgtgtgaatgtgagtttttttgtgtgtgtgtggagtccatatggacacatgtcac 52869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0933 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0933
Description:

Target: scaffold0933; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Original strand, 3054 - 3118
Alignment:
Q  209 aaggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgt 274  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  3054 aaggataatgtttcatatacacacttttttccatacacacattgtaccact-ccatgtgagagtgt 3118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 383
Target Start/End: Original strand, 10232 - 10413
Alignment:
Q  211 ggataatgtttcatgtacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtga----------atgtgagtttctt-gtgtatgt 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||          |||||||||| || |||| ||     
T  10232 ggataatgtttcatgtacgcactttt-tccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtatgtgagagacaatacatgtgagtttttttgtgtgtga 10329  T
Q  300 ggagaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 383  Q
    |  ||||||| |||||| ||||| |||| | | || || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10330 gaggaccacaaggacacttgtcaaaattatatgtgaatatacaagtagtacatgtcacctaaggtggtctatgtattactactc 10413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University