View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19956_high_3 (Length: 377)

Name: NF19956_high_3
Description: NF19956
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19956_high_3
NF19956_high_3
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (7-339)||(20394597-20394929)
chr8 (7-347)||(22375917-22376257)
chr8 (7-347)||(23887001-23887345)
chr8 (7-339)||(22246897-22247229)
chr8 (115-339)||(22988715-22988939)
chr8 (7-338)||(22422356-22422687)
chr8 (7-338)||(18858563-18858894)
chr8 (7-348)||(23652017-23652358)
chr8 (7-347)||(21920212-21920552)
chr8 (7-338)||(22118639-22118970)
chr8 (7-338)||(22127423-22127754)
chr8 (7-338)||(20016727-20017058)
chr8 (7-338)||(30311608-30311939)
chr8 (9-347)||(23656904-23657242)
chr8 (7-334)||(17672487-17672814)
chr8 (7-338)||(22131505-22131836)
chr8 (9-347)||(21927404-21927743)
chr8 (9-347)||(22052840-22053178)
chr8 (87-347)||(21252921-21253181)
chr8 (9-347)||(20008387-20008725)
chr8 (101-347)||(29301984-29302230)
chr8 (87-340)||(21392405-21392658)
chr8 (87-340)||(21782964-21783217)
chr8 (87-340)||(21786899-21787152)
chr8 (9-347)||(21323745-21324082)
chr8 (87-347)||(19864637-19864898)
chr8 (7-339)||(32602129-32602462)
chr8 (7-338)||(19979953-19980284)
chr8 (9-339)||(19861420-19861750)
chr8 (105-338)||(15535369-15535602)
chr8 (183-338)||(19114676-19114831)
chr8 (7-334)||(19482528-19482855)
chr8 (9-322)||(31414935-31415248)
chr8 (7-338)||(21165002-21165333)
chr8 (7-347)||(16269688-16270028)
chr8 (131-347)||(20390076-20390292)
chr8 (7-338)||(22041813-22042144)
chr8 (105-335)||(16875657-16875887)
chr8 (105-335)||(21848899-21849129)
chr8 (7-347)||(6605635-6605975)
chr8 (9-338)||(31569308-31569637)
chr8 (22-347)||(27356513-27356838)
chr8 (7-153)||(28983082-28983228)
chr8 (7-153)||(28988301-28988447)
chr8 (7-347)||(4984019-4984359)
chr8 (7-151)||(22522719-22522863)
chr8 (105-347)||(22372908-22373150)
chr8 (22-347)||(14567119-14567444)
chr8 (9-80)||(19984424-19984495)
chr8 (9-79)||(20390331-20390401)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (7-347)||(22210-22549)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (7-339)||(15626433-15626765)
chr7 (15-347)||(48813290-48813621)
chr7 (7-347)||(14041595-14041935)
chr7 (7-347)||(14351625-14351965)
chr7 (7-339)||(15146914-15147247)
chr7 (7-338)||(11235243-11235574)
chr7 (7-338)||(15159087-15159418)
chr7 (166-347)||(11770430-11770611)
chr7 (7-338)||(8709514-8709845)
chr7 (9-347)||(11386439-11386777)
chr7 (105-338)||(14334305-14334538)
chr7 (7-338)||(11551132-11551463)
chr7 (9-347)||(13675353-13675691)
chr7 (105-338)||(14956463-14956696)
chr7 (9-347)||(12204810-12205148)
chr7 (12-334)||(44789386-44789708)
chr7 (9-347)||(15100613-15100951)
chr7 (9-347)||(15342332-15342670)
chr7 (13-347)||(19149112-19149445)
chr7 (7-338)||(12689411-12689742)
chr7 (13-347)||(20748511-20748844)
chr7 (7-338)||(10872599-10872930)
chr7 (9-347)||(14262255-14262592)
chr7 (9-347)||(16948482-16948820)
chr7 (9-347)||(16070307-16070643)
chr7 (9-338)||(14139589-14139918)
chr7 (7-347)||(26092806-26093146)
chr7 (7-338)||(15380-15711)
chr7 (105-335)||(7825812-7826042)
chr7 (105-335)||(27105902-27106132)
chr7 (105-335)||(27172193-27172423)
chr7 (7-347)||(49154202-49154542)
chr7 (9-347)||(13023258-13023596)
chr7 (9-347)||(13966678-13967016)
chr7 (9-347)||(19614576-19614914)
chr7 (7-337)||(18179655-18179985)
chr7 (7-347)||(26116598-26116938)
chr7 (9-347)||(11301223-11301561)
chr7 (13-267)||(13688021-13688275)
chr7 (9-347)||(14284386-14284724)
chr7 (9-338)||(18051963-18052292)
chr7 (9-338)||(23503880-23504209)
chr7 (243-338)||(14213583-14213678)
chr7 (7-243)||(18588201-18588437)
chr7 (9-347)||(12458541-12458879)
chr7 (257-338)||(8200537-8200618)
chr7 (289-338)||(13687973-13688022)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (7-339)||(2849-3181)
scaffold0647 (7-347)||(7683-8023)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (33-347)||(9084-9398)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (7-347)||(20466302-20466642)
chr5 (7-347)||(23473070-23473410)
chr5 (7-339)||(26736930-26737262)
chr5 (7-342)||(21337497-21337832)
chr5 (22-347)||(21408980-21409302)
chr5 (7-338)||(37289699-37290030)
chr5 (7-338)||(14997942-14998273)
chr5 (7-338)||(19771812-19772143)
chr5 (7-338)||(22331090-22331421)
chr5 (7-338)||(22136520-22136851)
chr5 (87-347)||(25428276-25428536)
chr5 (7-338)||(27612206-27612537)
chr5 (7-334)||(40710636-40710963)
chr5 (7-338)||(41772694-41773025)
chr5 (7-338)||(27520258-27520589)
chr5 (7-338)||(16358354-16358685)
chr5 (7-338)||(29474276-29474607)
chr5 (7-338)||(34568346-34568677)
chr5 (105-334)||(27666791-27667020)
chr5 (7-338)||(22349771-22350102)
chr5 (7-338)||(27683603-27683934)
chr5 (7-338)||(18780966-18781297)
chr5 (9-339)||(28893147-28893477)
chr5 (9-339)||(28921973-28922303)
chr5 (105-335)||(21935489-21935719)
chr5 (9-347)||(22234125-22234463)
chr5 (7-347)||(25849900-25850240)
chr5 (9-339)||(20777746-20778076)
chr5 (105-335)||(23507521-23507751)
chr5 (7-347)||(22504504-22504844)
chr5 (7-338)||(20801249-20801580)
chr5 (9-338)||(22463785-22464114)
chr5 (7-339)||(20344115-20344447)
chr5 (12-280)||(21562232-21562500)
chr5 (7-347)||(24796600-24796940)
chr5 (31-339)||(28914640-28914948)
chr5 (31-339)||(28929908-28930216)
chr5 (7-347)||(37541584-37541924)
chr5 (9-339)||(20823286-20823616)
chr5 (238-347)||(21679212-21679321)
chr5 (105-335)||(24583047-24583277)
chr5 (9-338)||(17267539-17267868)
chr5 (7-347)||(14885194-14885534)
chr5 (209-347)||(24618700-24618838)
chr5 (209-347)||(24714931-24715069)
chr5 (209-347)||(24747959-24748097)
chr5 (294-338)||(23442060-23442104)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (34-347)||(1900-2213)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (7-347)||(5054-5393)
scaffold0074 (9-214)||(11196-11401)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (7-342)||(10765-11100)
scaffold0018 (12-342)||(16962-17292)
scaffold0018 (33-339)||(24348-24654)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (7-342)||(24818791-24819126)
chr2 (7-347)||(30010745-30011085)
chr2 (7-347)||(30209478-30209819)
chr2 (7-338)||(27372820-27373151)
chr2 (9-347)||(23098581-23098919)
chr2 (9-347)||(23112278-23112616)
chr2 (7-347)||(23073405-23073745)
chr2 (7-338)||(24711585-24711916)
chr2 (7-347)||(23106289-23106629)
chr2 (7-335)||(41606946-41607274)
chr2 (7-338)||(24875311-24875642)
chr2 (27-347)||(22734355-22734675)
chr2 (7-334)||(10870405-10870732)
chr2 (7-338)||(24263921-24264252)
chr2 (7-334)||(16926915-16927242)
chr2 (7-334)||(17000555-17000882)
chr2 (7-338)||(21143602-21143933)
chr2 (7-338)||(9485767-9486098)
chr2 (7-334)||(27219571-27219898)
chr2 (7-334)||(44384131-44384458)
chr2 (171-338)||(22323581-22323748)
chr2 (220-347)||(45534482-45534609)
chr2 (33-347)||(23278318-23278632)
chr2 (120-338)||(24706156-24706374)
chr2 (9-347)||(19650613-19650951)
chr2 (27-336)||(21323847-21324156)
chr2 (13-338)||(23189470-23189794)
chr2 (174-347)||(25264596-25264769)
chr2 (7-338)||(24677040-24677371)
chr2 (9-347)||(24950132-24950470)
chr2 (9-338)||(27789291-27789620)
chr2 (7-347)||(1065293-1065633)
chr2 (22-338)||(12575904-12576220)
chr2 (7-347)||(31832200-31832540)
chr2 (105-335)||(24829847-24830077)
chr2 (7-262)||(9337209-9337464)
chr2 (9-347)||(19717580-19717918)
chr2 (165-347)||(23295477-23295659)
chr2 (115-335)||(22279659-22279879)
chr2 (9-154)||(25255654-25255799)
chr2 (253-342)||(27208979-27209068)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (14-347)||(494959-495293)
scaffold0001 (9-347)||(453239-453577)
scaffold0001 (9-347)||(515379-515717)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (7-347)||(14503-14843)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (7-347)||(3856-4196)
scaffold0010 (7-347)||(40357-40697)
scaffold0010 (209-347)||(45626-45763)
scaffold0010 (9-184)||(45453-45628)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (14-339)||(14418-14743)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (7-339)||(5913-6245)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (7-347)||(24557-24897)
scaffold0011 (9-347)||(150511-150849)
scaffold0011 (253-347)||(193974-194068)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (12-347)||(22647-22982)
scaffold0042 (7-338)||(37844-38175)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (7-347)||(16819-17158)
scaffold0040 (270-347)||(111775-111852)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (27-347)||(14849147-14849467)
chr4 (15-347)||(14696024-14696356)
chr4 (9-347)||(8707822-8708160)
chr4 (7-338)||(23957667-23957998)
chr4 (7-338)||(8051384-8051715)
chr4 (7-338)||(27713256-27713587)
chr4 (7-338)||(40474960-40475291)
chr4 (7-347)||(14161381-14161721)
chr4 (7-338)||(12478520-12478851)
chr4 (7-338)||(19776554-19776885)
chr4 (7-338)||(14301740-14302071)
chr4 (7-334)||(8388336-8388663)
chr4 (120-338)||(14682487-14682705)
chr4 (105-347)||(15323128-15323370)
chr4 (13-338)||(15145652-15145977)
chr4 (7-347)||(18225207-18225547)
chr4 (12-347)||(16149622-16149957)
chr4 (12-347)||(16153768-16154103)
chr4 (9-347)||(15072270-15072608)
chr4 (7-347)||(3262815-3263155)
chr4 (9-347)||(15001388-15001725)
chr4 (7-347)||(44659887-44660227)
chr4 (9-347)||(27902297-27902635)
chr4 (9-338)||(51604815-51605144)
chr4 (7-262)||(16234753-16235008)
chr4 (171-338)||(18613749-18613916)
chr4 (9-347)||(1647300-1647638)
chr4 (9-347)||(15357143-15357481)
chr4 (7-347)||(29451558-29451898)
chr4 (228-347)||(1640322-1640441)
chr4 (7-262)||(17092910-17093165)
chr4 (105-335)||(15291277-15291507)
chr4 (7-165)||(16218323-16218481)
chr4 (7-165)||(16221643-16221801)
chr4 (7-190)||(11205253-11205436)
chr4 (270-338)||(29037428-29037496)
chr4 (9-196)||(15257990-15258177)
chr4 (7-73)||(23443290-23443356)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (7-347)||(15245-15585)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (13-339)||(15261168-15261494)
chr3 (22-335)||(15014031-15014344)
chr3 (7-347)||(17491380-17491720)
chr3 (7-338)||(15723194-15723525)
chr3 (7-338)||(10007139-10007470)
chr3 (7-338)||(48426986-48427317)
chr3 (105-278)||(11889638-11889811)
chr3 (7-338)||(10907749-10908080)
chr3 (7-338)||(13254229-13254560)
chr3 (7-334)||(15346505-15346832)
chr3 (7-338)||(20060314-20060645)
chr3 (9-342)||(11950159-11950492)
chr3 (7-334)||(5108871-5109198)
chr3 (7-334)||(5423190-5423517)
chr3 (9-347)||(15229143-15229481)
chr3 (9-347)||(15235011-15235349)
chr3 (9-347)||(17187914-17188252)
chr3 (7-335)||(16805207-16805535)
chr3 (9-348)||(12358778-12359117)
chr3 (15-338)||(15400785-15401108)
chr3 (7-338)||(16637312-16637643)
chr3 (105-338)||(15340808-15341041)
chr3 (7-334)||(3687486-3687813)
chr3 (7-334)||(12888252-12888579)
chr3 (7-338)||(15587652-15587983)
chr3 (7-334)||(16754961-16755288)
chr3 (105-337)||(6602276-6602508)
chr3 (7-347)||(28755858-28756198)
chr3 (7-334)||(53383278-53383605)
chr3 (105-338)||(12499787-12500020)
chr3 (87-338)||(14874839-14875090)
chr3 (105-338)||(16693703-16693936)
chr3 (105-335)||(30139358-30139588)
chr3 (105-335)||(30148909-30149139)
chr3 (22-347)||(31693449-31693774)
chr3 (7-347)||(47125484-47125824)
chr3 (24-347)||(11959435-11959758)
chr3 (9-347)||(13970371-13970709)
chr3 (9-347)||(14088213-14088551)
chr3 (9-347)||(18132597-18132935)
chr3 (105-335)||(8272757-8272987)
chr3 (105-335)||(13965710-13965941)
chr3 (9-339)||(10418296-10418626)
chr3 (22-347)||(31940443-31940768)
chr3 (9-338)||(41179071-41179400)
chr3 (203-347)||(12179878-12180022)
chr3 (105-335)||(15611655-15611885)
chr3 (9-342)||(16327911-16328244)
chr3 (9-338)||(16379179-16379508)
chr3 (9-338)||(16834761-16835090)
chr3 (9-153)||(13943758-13943902)
chr3 (9-153)||(44778981-44779125)
chr3 (105-313)||(15948828-15949036)
chr3 (9-347)||(13318753-13319091)
chr3 (7-135)||(10407720-10407848)
chr3 (129-347)||(10385211-10385429)
chr3 (9-217)||(12269880-12270088)
chr3 (7-94)||(11888614-11888701)
chr3 (9-79)||(8745641-8745711)
chr3 (22-76)||(12510747-12510801)
chr3 (9-63)||(14291783-14291837)
chr3 (9-79)||(24189112-24189182)
chr3 (9-64)||(12180167-12180222)
chr3 (9-63)||(16826532-16826586)
chr3 (7-55)||(14579668-14579716)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (18-347)||(27283-27611)
scaffold0058 (9-347)||(21062-21400)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (7-347)||(217444-217784)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (9-280)||(23085939-23086210)
chr6 (145-348)||(18965599-18965802)
chr6 (31-347)||(23080244-23080560)
chr6 (132-339)||(18196024-18196231)
chr6 (101-347)||(25608121-25608367)
chr6 (27-347)||(20634126-20634446)
chr6 (40-339)||(18450286-18450585)
chr6 (101-347)||(18406204-18406450)
chr6 (7-347)||(22760621-22760961)
chr6 (7-335)||(24293948-24294276)
chr6 (45-341)||(19487486-19487772)
chr6 (7-334)||(2872969-2873296)
chr6 (7-338)||(22828521-22828852)
chr6 (120-339)||(16961761-16961980)
chr6 (9-342)||(19454804-19455137)
chr6 (7-339)||(5837385-5837717)
chr6 (9-341)||(14378084-14378416)
chr6 (9-341)||(14379634-14379966)
chr6 (7-334)||(25114340-25114667)
chr6 (105-334)||(28261461-28261690)
chr6 (105-334)||(28284226-28284455)
chr6 (105-334)||(28340210-28340439)
chr6 (7-339)||(16925804-16926136)
chr6 (9-347)||(18796465-18796803)
chr6 (7-149)||(18963254-18963396)
chr6 (120-338)||(27564112-27564330)
chr6 (27-334)||(27189224-27189531)
chr6 (27-334)||(27259709-27260016)
chr6 (9-347)||(25769619-25769957)
chr6 (105-335)||(16380637-16380867)
chr6 (9-347)||(19881073-19881411)
chr6 (9-347)||(19436777-19437115)
chr6 (9-347)||(21473376-21473713)
chr6 (105-338)||(19866471-19866704)
chr6 (117-338)||(22435653-22435874)
chr6 (117-338)||(22444051-22444272)
chr6 (7-347)||(24366187-24366527)
chr6 (105-335)||(16648233-16648463)
chr6 (87-338)||(25763474-25763725)
chr6 (9-339)||(15461119-15461449)
chr6 (9-347)||(10467017-10467355)
chr6 (105-335)||(23998035-23998265)
chr6 (238-347)||(34643983-34644092)
chr6 (9-153)||(28280981-28281125)
chr6 (105-335)||(1647078-1647308)
chr6 (7-137)||(18183533-18183663)
chr6 (9-347)||(21568159-21568497)
chr6 (9-79)||(24516576-24516646)
chr6 (208-339)||(5295573-5295704)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (9-347)||(201494-201832)
scaffold0004 (9-347)||(324646-324984)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (6-347)||(939-1280)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (22-347)||(84558-84883)
scaffold0007 (9-339)||(268558-268888)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (7-347)||(91-431)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (7-339)||(16002-16333)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (7-347)||(7962-8302)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (7-347)||(103175-103515)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (15-337)||(3533-3855)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (7-347)||(42131-42471)
scaffold0035 (9-347)||(4691-5029)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (7-347)||(86711-87050)
scaffold0023 (15-347)||(2537-2869)
scaffold0023 (7-347)||(151052-151392)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (7-342)||(7111-7446)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (173-342)||(115171-115340)
scaffold0037 (7-108)||(115062-115163)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (7-335)||(5825-6153)
scaffold0270 (7-335)||(12955-13283)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (7-348)||(3373-3714)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (13-337)||(839-1163)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (7-347)||(55697-56037)
scaffold0022 (7-347)||(40574-40914)
scaffold0022 (7-347)||(74294-74634)
scaffold0022 (105-335)||(8948-9178)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (7-347)||(50618491-50618831)
chr1 (6-337)||(21750876-21751207)
chr1 (7-335)||(51331586-51331914)
chr1 (7-334)||(33389122-33389449)
chr1 (102-347)||(20140009-20140254)
chr1 (87-347)||(430289-430549)
chr1 (7-347)||(22360337-22360677)
chr1 (7-338)||(21832237-21832568)
chr1 (7-338)||(21838885-21839216)
chr1 (7-333)||(21862466-21862792)
chr1 (7-338)||(17043108-17043439)
chr1 (9-347)||(20833995-20834333)
chr1 (9-347)||(21743647-21743985)
chr1 (7-334)||(16348688-16349016)
chr1 (105-338)||(19108303-19108536)
chr1 (9-338)||(20854855-20855184)
chr1 (7-347)||(31538090-31538430)
chr1 (7-338)||(21233824-21234155)
chr1 (7-334)||(41351755-41352082)
chr1 (9-347)||(19661231-19661569)
chr1 (13-218)||(16378150-16378355)
chr1 (7-347)||(48424830-48425170)
chr1 (7-347)||(52987698-52988038)
chr1 (7-338)||(24792709-24793040)
chr1 (105-335)||(20829583-20829813)
chr1 (171-347)||(41308599-41308775)
chr1 (7-347)||(38910919-38911259)
chr1 (9-347)||(20938158-20938496)
chr1 (9-347)||(24097698-24098036)
chr1 (9-347)||(19856231-19856569)
chr1 (9-347)||(20296338-20296676)
chr1 (7-347)||(37679006-37679346)
chr1 (171-338)||(21026108-21026275)
chr1 (7-326)||(22503382-22503701)
chr1 (259-339)||(16378076-16378156)
chr1 (9-338)||(21952844-21953173)
chr1 (105-322)||(20927005-20927222)
chr1 (238-347)||(23196573-23196682)
chr1 (9-64)||(41310766-41310821)
chr1 (306-347)||(22116839-22116880)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (9-347)||(10770-11108)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (105-347)||(38070-38312)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (13-347)||(176374-176708)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (7-348)||(803-1141)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (7-347)||(85254-85594)
scaffold0008 (7-331)||(85820-86144)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (87-347)||(1-261)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (9-347)||(11735-12073)
scaffold0309 (7-347)||(16583-16923)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (7-347)||(17596-17931)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (7-347)||(20180-20520)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (7-347)||(30887-31227)
scaffold0026 (9-340)||(50759-51090)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (7-338)||(8889-9220)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (101-347)||(7163-7409)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (87-347)||(1486-1746)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (7-347)||(708-1048)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (7-347)||(24969-25309)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (9-348)||(6691-7030)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (7-334)||(45106-45433)
scaffold0028 (7-335)||(10428-10756)
scaffold0028 (7-335)||(16890-17218)
scaffold0028 (9-347)||(48540-48878)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (9-347)||(4118-4459)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (9-347)||(1811-2149)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (9-347)||(33276-33614)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (9-347)||(2658-2996)
scaffold0079 (7-338)||(35446-35778)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (9-339)||(50206-50536)
scaffold0067 (9-339)||(59240-59570)
scaffold0067 (9-339)||(65628-65958)
scaffold0067 (9-347)||(28564-28902)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (9-347)||(2979-3317)
scaffold0034 (9-347)||(69312-69650)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (9-347)||(99588-99926)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (22-347)||(55886-56211)
scaffold0053 (9-347)||(47060-47398)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (88-347)||(6436-6695)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (7-338)||(11263-11594)
scaffold0080 (120-347)||(50032-50259)
scaffold0080 (87-289)||(53635-53837)
scaffold0080 (87-338)||(30833-31084)
scaffold0080 (87-338)||(36298-36550)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (9-347)||(10083-10421)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (13-347)||(49905-50239)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (9-347)||(262166-262504)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (7-334)||(16113-16440)
scaffold0044 (105-334)||(2375-2605)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (9-347)||(2298-2636)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (9-347)||(16054-16392)
scaffold0266 (105-335)||(7983-8213)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (9-347)||(21541-21879)
scaffold0261 (9-347)||(13362-13700)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (9-339)||(19302-19632)
scaffold0244 (238-335)||(25032-25129)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (9-347)||(29311-29649)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (9-347)||(49046-49384)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (9-347)||(52987-53325)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (9-347)||(109572-109910)
scaffold0031 (12-338)||(55020-55346)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (7-337)||(107835-108165)
scaffold0029 (9-347)||(114501-114839)
scaffold0029 (9-79)||(94920-94990)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (9-341)||(5115-5447)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (7-336)||(9319-9648)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (13-338)||(40104-40429)
scaffold0109 (120-338)||(14261-14480)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (87-347)||(7991-8251)
scaffold0358 (87-347)||(17187-17447)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (87-347)||(393-652)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (12-347)||(24156-24491)
scaffold0104 (9-347)||(44443-44781)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (87-338)||(20553-20804)
scaffold0081 (87-338)||(35977-36228)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (27-338)||(195531-195842)
scaffold0017 (7-338)||(57966-58297)
scaffold0017 (238-338)||(18321-18422)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (9-347)||(169-506)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (9-347)||(1511-1849)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (9-342)||(880-1213)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (87-347)||(8314-8574)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (9-347)||(5377-5714)
scaffold0149 (9-347)||(9808-10145)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (186-338)||(44846-44998)
scaffold0130 (51-347)||(8876-9172)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (12-339)||(13240-13567)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (87-337)||(23178-23428)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (9-339)||(31345-31675)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (9-347)||(9487-9821)
scaffold0235 (9-347)||(19701-20035)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (9-347)||(860-1198)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (105-335)||(25348-25578)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (9-347)||(28467-28805)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (105-335)||(14862-15092)
scaffold0162 (105-322)||(11296-11513)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (9-347)||(250562-250900)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (114-335)||(64639-64860)
scaffold0054 (9-79)||(64545-64615)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (7-251)||(2637-2881)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (87-347)||(18445-18705)
scaffold0114 (9-61)||(22102-22154)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (87-338)||(444-695)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (9-347)||(41639-41976)
scaffold0102 (27-262)||(51389-51624)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (9-347)||(31703-32041)
scaffold0076 (114-335)||(42212-42433)
scaffold0076 (9-79)||(54437-54507)
scaffold0076 (232-347)||(55149-55264)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (114-347)||(936-1169)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (238-347)||(195182-195291)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (120-338)||(4145-4363)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (105-335)||(7107-7337)
scaffold0302 (105-335)||(165-395)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (141-347)||(33911-34117)
scaffold0180 (253-347)||(510-604)
scaffold0180 (253-347)||(4830-4924)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (129-338)||(7839-8048)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (15-347)||(619-951)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (186-338)||(3556-3708)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (232-347)||(1794-1909)
scaffold0476 (7-148)||(10307-10448)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (9-347)||(588-925)
scaffold0420 (9-79)||(7824-7894)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (9-339)||(10812-11142)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (9-347)||(37590-37928)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (9-339)||(79857-80187)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (22-347)||(40-365)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (182-338)||(28770-28926)
scaffold0215 (106-262)||(28586-28742)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (9-342)||(25060-25393)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (238-347)||(36055-36164)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (203-347)||(14142-14286)
scaffold0124 (144-335)||(5969-6160)
scaffold0124 (9-64)||(14431-14486)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (180-338)||(1003-1161)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (9-347)||(9003-9341)
scaffold0222 (9-79)||(1515-1585)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (9-347)||(42859-43196)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (257-347)||(20791-20881)
scaffold0090 (257-347)||(24953-25043)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (253-347)||(546-640)
scaffold0089 (56-347)||(14786-15077)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (9-283)||(19660-19934)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (13-166)||(3-156)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (243-347)||(23339-23443)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (253-347)||(1825-1919)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (33-339)||(12349-12655)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (105-335)||(34039-34269)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (264-342)||(5974-6052)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (9-153)||(9900-10044)
scaffold0348 (253-339)||(10159-10245)
scaffold0348 (9-79)||(18509-18579)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (15-338)||(7965-8288)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (253-339)||(243-329)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (9-347)||(28875-29212)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (105-322)||(2074-2291)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (264-347)||(16430-16513)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (105-236)||(21298-21429)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (226-347)||(3868-3989)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (9-217)||(572-780)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (123-322)||(943-1141)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (105-250)||(1743-1888)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (9-319)||(922-1232)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (265-335)||(2218-2288)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (253-339)||(4606-4692)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (243-339)||(44733-44829)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (253-339)||(1274-1360)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (9-59)||(11188-11238)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (226-299)||(9215-9288)
[»] scaffold0708 (2 HSPs)
scaffold0708 (23-79)||(6185-6241)
scaffold0708 (253-341)||(6415-6503)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Original strand, 20394597 - 20394929
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  20394597 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcaatgatgccttttagtgctacaaa 20394696  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20394697 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgctttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 20394796  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20394797 tctgaagaagaacatgccgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaata 20394896  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20394897 aggtgagttttcttggccatattatttctggta 20394929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 22375917 - 22376257
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||   || |||||||||||    ||||||    
T  22375917 atcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattattaatataaagtgatgcctttcagcattacaaa 22376016  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  22376017 tgcaccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatatttttatatactccaag 22376116  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | | |||||||||||||      
T  22376117 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaactataaattctggttgaaat 22376216  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22376217 agatgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 22376257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23887345 - 23887001
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| || || |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||  || ||| ||    
T  23887345 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcataagacggcctttaggacacgttatggacattacgagtattcagtgatgcctttcggtgttactaa 23887246  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23887245 tgcgccagatgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactctaag 23887146  T
Q  207 tctgaagaagaa----aatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttg 302  Q
    ||| ||||||||     |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23887145 tctaaagaagaacatgtatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctagttg 23887046  T
Q  303 aatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  23887045 aatgaggtgagttttcttggccatgttatttttcgtagtggtatt 23887001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Original strand, 22246897 - 22247229
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  22246897 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaccgcttttagaacaagttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 22246996  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22246997 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcctgcgtttttggatcgtttcatggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 22247096  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||||| |||| |||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  22247097 attgaaggagaacatgttgagcatttgtagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattttcaaagtgtgaattctggttgaaag 22247196  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22247197 aggcgagttttcatggccatgttatttctggta 22247229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 115 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22988939 - 22988715
Alignment:
Q  115 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22988939 gtgtgtttatggaatacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatattccaagactgaaga 22988840  T
Q  215 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 314  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22988839 agaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagt 22988740  T
Q  315 tttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  22988739 tttcttggccatgttatttctggta 22988715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 22422356 - 22422687
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  || || || || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  22422356 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatagcattcagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 22422455  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  22422456 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttgatttactccaag 22422555  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    || ||||||||| |||   | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  22422556 tccgaagaagaacatgttgaacatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattatggttgaaag 22422655  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22422656 aggtgagtttccttggccatgttatttctggt 22422687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18858894 - 18858563
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  18858894 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 18858795  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||    
T  18858794 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaag 18858695  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18858694 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 18858595  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18858594 aagtgagttttcttggccatgttatttctggt 18858563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23652358 - 23652017
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  ||||||||   || ||||||    
T  23652358 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaggtttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttttggtgttacaaa 23652259  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||    
T  23652258 tgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatactttgatttactccaag 23652159  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  23652158 actgaagaggaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaag 23652059  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatta 348  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||    
T  23652058 aggtaagttttcttggccatgtcatttctggtaatggtatta 23652017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 21920212 - 21920552
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||    | |||| | |||  || ||||||    
T  21920212 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgtcgttcggtgttacaaa 21920311  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  21920312 tgcacatggagtatttatggagtacatgaattgtatctttcaagcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttacttcaag 21920411  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  21920412 actgaagaagaatatgctgagcatttgaagttagttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 21920511  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21920512 aagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 21920552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 22118639 - 22118970
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || |  |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  22118639 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 22118738  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  22118739 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 22118838  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     |||||||||||  |||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  22118839 actgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtcgaaag 22118938  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22118939 aggtgagttttctaggccatgttatttctggt 22118970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 22127423 - 22127754
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || |  |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  22127423 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 22127522  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  22127523 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 22127622  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     |||||||||||  |||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  22127623 actgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtcgaaag 22127722  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22127723 aggtgagttttctaggccatgttatttctggt 22127754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 20016727 - 20017058
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||  | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  20016727 atcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 20016826  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  20016827 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 20016926  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20016927 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 20017026  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20017027 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 20017058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 30311608 - 30311939
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  30311608 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 30311707  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||    
T  30311708 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgttgttgtgtttattgacgatattttaatttactccaag 30311807  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  30311808 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 30311907  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30311908 aagtaagttttcttggccatgttatttctggt 30311939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23657242 - 23656904
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  23657242 catcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 23657143  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||| | ||||| || ||||| |||||| | ||||| |||||| |    
T  23657142 cgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctaatatattctaagac 23657043  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||     
T  23657042 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttatggttaagtgaa 23656943  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23656942 gtaagttttcttggccatattatttatggtagtggtatt 23656904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 17672487 - 17672814
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  17672487 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 17672586  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  17672587 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 17672686  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17672687 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 17672786  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  17672787 aagtgagttttctaggccatgttatttc 17672814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 22131505 - 22131836
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || | |||||| || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  22131505 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttaagaacgcattacggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 22131604  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||  |||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  22131605 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcgattctttgttgtgtttatcgatgatattttgatctactccaag 22131704  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22131705 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 22131804  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22131805 aagtaagttttcttggccatgttatttctggt 22131836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21927743 - 21927404
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||| || ||| ||||    
T  21927743 catcagattaaggtgaaggatgagcatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatg 21927644  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |    
T  21927643 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagac 21927544  T
Q  209 tgaagaagaaaatgcca-agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatga 307  Q
    |||||||||  ||  || ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  21927543 tgaagaagagcattgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtga 21927444  T
Q  308 ggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21927443 agtaagatttcttggccatattatttctggtagtggtatt 21927404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22053178 - 22052840
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  22053178 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaataccaggtgatgcctttcggtgttactaatg 22053079  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| | | | |||   ||||| | ||| |||||||| |||||  | || || |||||| |    
T  22053078 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcctttctggataagtttgtgggtgtattcattgatgatatcctaatttattctaagac 22052979  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||| | |||     
T  22052978 tgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgttgaaatgtgaattctggttaagtgaa 22052879  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22052878 gtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 22052840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21253181 - 21252921
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |  ||||| || || || |    
T  21253181 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgaggttgtttttatcgatg 21253082  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  21253081 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttctgcaagtattgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 21252982  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21252981 gtgagaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 21252921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 20008387 - 20008725
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  20008387 catcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 20008486  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| | ||| |||||  | || || ||||||      
T  20008487 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttagtgatgatatcctaatttattctaagaa 20008586  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||     
T  20008587 tgaagaagagcatgcagagcatatgaagattgtgttgcaactgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaa 20008686  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20008687 gtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 20008725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 347
Target Start/End: Original strand, 29301984 - 29302230
Alignment:
Q  101 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |  |||||||  |||||||| || || ||||| || ||| |||| |||    
T  29301984 tacaaatgcacctggggtatttatggagtacatgaacagaatttttcatgcattcttagatcagtttgttgtggtatttattgatgacattctgatttac 29302083  T
Q  201 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 300  Q
    |||||| | |||||| || ||||  | || |||||| |||| || |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29302084 tctaagaccgaagaataacatgcagaacacttgaagattgtgttacaagtgttgaaagagaggaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggt 29302183  T
Q  301 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  29302184 tgagtgaagtaagttttcttggccacgttatttctggtagtggtatt 29302230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 340
Target Start/End: Original strand, 21392405 - 21392658
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||| | || || ||||| || || || |    
T  21392405 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatg 21392504  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  21392505 atatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaa 21392604  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtag 340  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  21392605 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtag 21392658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 340
Target Start/End: Original strand, 21782964 - 21783217
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||| | || || ||||| || || || |    
T  21782964 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatg 21783063  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  21783064 atatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaa 21783163  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtag 340  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  21783164 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtag 21783217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 340
Target Start/End: Original strand, 21786899 - 21787152
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||| | || || ||||| || || || |    
T  21786899 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatg 21786998  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  21786999 atatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaa 21787098  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtag 340  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  21787099 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtag 21787152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 21323745 - 21324082
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  21323745 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaatgtgatgcctttcggtgttactaatg 21323844  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| || || || ||| |||| || || ||| |    
T  21323845 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttatcgatgacattctgatctattcaaagac 21323944  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  21323945 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaa-gttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 21324043  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21324044 gtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 21324082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 347
Target Start/End: Original strand, 19864637 - 19864898
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||| | ||  | ||||| |||||||| |    
T  19864637 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatctcatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatg 19864736  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttg-caagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaa 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||  | |||||  |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |    
T  19864737 atattttgatttactctaagtctgaagaagaacatattgagcatttgaaactggtttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtcta 19864836  T
Q  286 agtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  19864837 agtgcgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 19864898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 32602462 - 32602129
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |  ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  32602462 atcaccagattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 32602363  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  32602362 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 32602263  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattc-tggttgaat 305  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||     
T  32602262 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattcttggttgaaa 32602163  T
Q  306 gaggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    || || |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32602162 gaagtaagtttttttggccatgttatttctggta 32602129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19980284 - 19979953
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||  || || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  19980284 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgtagaagacaactttcagaacactgtatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 19980185  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||    
T  19980184 tgcgcctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaag 19980085  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  || || ||||| |||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| || || || |||| ||| ||||||||||| |    
T  19980084 actgaagaagaacatgctgagaatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattatctaagtatgatttctggttgaaag 19979985  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19979984 aggtaagttttcttggccatgttatttctggt 19979953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19861750 - 19861420
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    |  ||||| |||  || ||| ||||    
T  19861750 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtaatgcccttcggtgttactaatg 19861651  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||| | || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||      
T  19861650 cgcctggtgtgtttatgaagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaa 19861551  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||| |||  ||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||     
T  19861550 tgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgagttgcaagtgttgaaataaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaa 19861451  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19861450 gtaagttttcttggccatattatttctggta 19861420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15535602 - 15535369
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  15535602 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactcca 15535503  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15535502 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 15535403  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
     || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15535402 agaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 15535369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19114831 - 19114676
Alignment:
Q  183 gacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgt 282  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||    
T  19114831 gacgatattttgatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgt 19114732  T
Q  283 caaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19114731 ctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 19114676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 19482528 - 19482855
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  19482528 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaa 19482627  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||  || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  19482628 tgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 19482727  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  19482728 actgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 19482827  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||    
T  19482828 aagtgagttttcttggtcatgttatttc 19482855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 31414935 - 31415248
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  31414935 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 31415034  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||| |    
T  31415035 cgcctggggtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagac 31415134  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
     ||||| ||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||     
T  31415135 cgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtaagttctggttaagtgaa 31415234  T
Q  309 gtgagttttcttgg 322  Q
    |||| |||||||||    
T  31415235 gtgaattttcttgg 31415248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 21165002 - 21165333
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  21165002 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacgaa 21165101  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| |  || ||||| || || ||||| || ||  | |||||||| || ||||| |||    
T  21165102 tgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattcttggatcgattcgtggttgtttttatctatgatattttaatttactccaag 21165201  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| |    
T  21165202 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatccaagtgtgagttctggttgaaag 21165301  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21165302 aggtaagttttcttggccatgttatttctggt 21165333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 16269688 - 16270028
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  16269688 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 16269787  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
     |  || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||    
T  16269788 cgggcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgttcattgatgatatcttgatttattccaag 16269887  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      |||||| ||  ||||  ||||  |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||    
T  16269888 aatgaagaggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtg 16269987  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  16269988 aagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 16270028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20390292 - 20390076
Alignment:
Q  131 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 230  Q
    ||||||| | ||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||||  |||||    
T  20390292 catgaatagaattttccatgctttcttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcggagcat 20390193  T
Q  231 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatta 330  Q
    || ||| |||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||| |  |||||||||||||||||||    
T  20390192 ttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaaaaagttgtatgccaagttgtccaaatttgaattctagttaagtgaagcaagttttcttggccatatta 20390093  T
Q  331 tttctggtagtgatatt 347  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  20390092 tttatggtagtggtatt 20390076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22042144 - 22041813
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||  |||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  22042144 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 22042045  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    | |||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  22042044 ttcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttgatgtactccaag 22041945  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||  | ||||| || || || ||||| |||||||||||||| |    
T  22041944 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagcgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgagaattctggttgaaag 22041845  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |  | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22041844 aaataagttttcttggccatgttatttctggt 22041813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 16875657 - 16875887
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  16875657 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 16875756  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  16875757 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 16875856  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  16875857 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 16875887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 21848899 - 21849129
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  21848899 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 21848998  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  21848999 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgggagttttggttgaa 21849098  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  21849099 ggaagtgagttttcttggtcatgtgatttct 21849129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6605975 - 6605635
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  6605975 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 6605876  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| || || ||||| |||||||| || || || |||    
T  6605875 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattttaatctattccaag 6605776  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||| ||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||    
T  6605775 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaggtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaagtg 6605676  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  6605675 aagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 6605635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 31569308 - 31569637
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  31569308 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 31569407  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  31569408 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagac 31569507  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| | | |||     
T  31569508 tgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaa 31569607  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31569608 gtgagtttccttggtcatattatttctggt 31569637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27356838 - 27356513
Alignment:
Q  22 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 121  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  27356838 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 27356739  T
Q  122 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 221  Q
    |||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  |||||| ||  ||    
T  27356738 tatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaagaggagcat 27356639  T
Q  222 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 321  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  27356638 gcagagcatctgagaattgtattgcaagttttaaaagagaagaggttgtatgcgaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 27356539  T
Q  322 gccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||    
T  27356538 gtcatattatttttggtagtggtatt 27356513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28983228 - 28983082
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  28983228 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 28983129  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 153  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  28983128 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgctt 28983082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28988447 - 28988301
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  28988447 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 28988348  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 153  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  28988347 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgctt 28988301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4984359 - 4984019
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  ||  || ||    
T  4984359 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgtaactaa 4984260  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||| | |||||   |||||||| ||||||||| | ||||  ||||| || || |||    
T  4984259 agcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattaatgataccttgatttattccaag 4984160  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
       || |||||  ||||  ||||| |||   | || ||||||||| | || |||||    || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| | ||    
T  4984159 aacgaggaagagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttaaaggagaagcgattgtatgttaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtg 4984060  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  4984059 aagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 4984019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22522863 - 22522719
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  22522863 atcaccagaataaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcttttagaacacgttatcgacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 22522764  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgc 151  Q
    ||| || || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22522763 tgcgccaggagtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgc 22522719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22373150 - 22372908
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| | ||| |||||  | || || ||||    
T  22373150 aatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttactgatgatatcctaatttattcta 22373051  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||  |||||||||  ||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||       
T  22373050 agaatgaagaagaccatgcagagcatcttaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagtggtccaaatgtgaattatggttacg 22372951  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  22372950 tgaagtaagttttcttggtcacattatttttggtagtggtatt 22372908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14567444 - 14567119
Alignment:
Q  22 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 121  Q
    |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  14567444 tgaaggatgaggatttgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaaggcgcctggtgtttt 14567345  T
Q  122 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 221  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  ||| || ||  ||    
T  14567344 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggagcat 14567245  T
Q  222 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 321  Q
    || |||||  | ||  | || ||||||||| |||| || || |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  14567244 gcaaagcacctaaaaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 14567145  T
Q  322 gccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  14567144 gtcacattatttctggtagtggtatt 14567119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19984495 - 19984424
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataa 80  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  19984495 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaataa 19984424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 20390401 - 20390331
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 79  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  20390401 catcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacaaata 20390331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 22210 - 22549
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  || ||| ||    
T  22210 atcatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgcctttcg-tgttactaa 22308  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22309 tgcaccgggtgtatttacggaatacatgaattgcatttctcatgcttatttagatcgcattgttgttgtgttcattgatgatattttgatatactctaag 22408  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22409 tctgaagaagaacacgccaagcatttgaagattgttttgcaagtgctgcaagagaaaacgttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 22508  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22509 aggtgagtttttttggccatattatttctggtagtggtatt 22549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15626765 - 15626433
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| || ||| ||    
T  15626765 atcaccagattaaactgaaagatgaagatacgaagaagacggcttttaggacacgttacagacattacgaatattcggtgatgcctttcagtgttactaa 15626666  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||    
T  15626665 tgcaccaggtgtatttatggagtacatgaaccgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgcgttcatcgatgatattttaatatactataag 15626566  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15626565 tctgaagaagaacatgtcgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 15626466  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15626465 aggtgagtttccttggccatattatttctggta 15626433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 48813290 - 48813621
Alignment:
Q  15 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 114  Q
    |||||| |||| || || |||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||| ||      
T  48813290 attaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaa 48813389  T
Q  115 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 214  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48813390 gtgtgtttatggagtacatgaattgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctgaaga 48813489  T
Q  215 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 314  Q
    |||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48813490 agaacatgctgagcatttgaagattgtgttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaa-ttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 48813588  T
Q  315 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  48813589 tttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 48813621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14041935 - 14041595
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  14041935 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcggtgttacaaa 14041836  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  14041835 tgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatttactccaag 14041736  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     |||| |||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || |||||||||||||||| |||||| |    
T  14041735 actgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctagttgaaag 14041636  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||    
T  14041635 aggtgagttttcttggacatgttactactggtagtggtatt 14041595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14351965 - 14351625
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  14351965 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcggtgttacaaa 14351866  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  14351865 tgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatttactccaag 14351766  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     |||| |||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || |||||||||||||||| |||||| |    
T  14351765 actgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctagttgaaag 14351666  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||    
T  14351665 aggtgagttttcttggacatgttactactggtagtggtatt 14351625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Original strand, 15146914 - 15147247
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  || || || ||||||||||| ||   ||  ||||||||   || ||||||    
T  15146914 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaaaacgcgatatggacattacgagtataaagttatgccttttggtgttacaaa 15147013  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgc-ttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 205  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| || || ||| | |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  15147014 tgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgcattttccatgcattttttggatcggttcgtggtttttttcattgatgatatttttatctactccaa 15147113  T
Q  206 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaat 305  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||     
T  15147114 gactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaa 15147213  T
Q  306 gaggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15147214 gaggtaagttttcttggccatgttatttctggta 15147247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 11235243 - 11235574
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  11235243 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 11235342  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  11235343 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 11235442  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  11235443 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 11235542  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11235543 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 11235574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 15159087 - 15159418
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  15159087 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 15159186  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  15159187 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 15159286  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     |||| |||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15159287 actgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 15159386  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15159387 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 15159418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 347
Target Start/End: Original strand, 11770430 - 11770611
Alignment:
Q  166 ttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaa 265  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11770430 ttgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactccaagtctgagggagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaa 11770529  T
Q  266 gttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11770530 gttatatgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 11770611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8709845 - 8709514
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  8709845 atcaccagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 8709746  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  8709745 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttatggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 8709646  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  8709645 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 8709546  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8709545 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 8709514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 11386439 - 11386777
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  11386439 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggactttaggacacgttgtggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 11386538  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || |||||||||||||| || | |||  | ||||||||||||| | | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |    
T  11386539 cgccaggtgtatttatggagtataagaacagaatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatattttaatttattctaagac 11386638  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||| ||||| ||| | |||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||     
T  11386639 tgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaa 11386738  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11386739 gtgagttttctcggccacattatttctggtagtggtatt 11386777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14334538 - 14334305
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  14334538 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 14334439  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14334438 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 14334339  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14334338 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 14334305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 11551132 - 11551463
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  11551132 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 11551231  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || || |||    
T  11551232 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttattccaag 11551331  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  11551332 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 11551431  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11551432 aagtgagttttcttggccatgttatttctggt 11551463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13675691 - 13675353
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  13675691 catcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 13675592  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| ||||| || ||||| || ||| |||| || || ||| |    
T  13675591 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgacattctgatttattcaaagac 13675492  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  13675491 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaatgagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 13675392  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13675391 gtgagttatcttggccacattatttctggtagtggtatt 13675353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14956696 - 14956463
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  14956696 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactcca 14956597  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14956596 agactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 14956497  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14956496 agaagtgagttttcttggccatgttatttctggt 14956463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 12204810 - 12205148
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  12204810 catcagattaaggtgaagtatgaagatatgcagaaaacggcctttaggatacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 12204909  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   | ||| || ||||| ||||| ||||| || || || | |||| |    
T  12204910 cgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatctgtggtcgtgtttattgatgatatcttaatttattttaagac 12205009  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||     
T  12205010 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 12205109  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12205110 gtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 12205148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 334
Target Start/End: Original strand, 44789386 - 44789708
Alignment:
Q  12 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 111  Q
    ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||    
T  44789386 cagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcac 44789485  T
Q  112 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 211  Q
    | || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  44789486 ctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttgatctactccaagactga 44789585  T
Q  212 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtg 311  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  44789586 agaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtg 44789685  T
Q  312 agttttcttggccatattatttc 334  Q
    ||||| ||||||||| |||||||    
T  44789686 agtttccttggccatgttatttc 44789708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 15100613 - 15100951
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| || || |||||| ||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  15100613 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15100712  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  15100713 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 15100812  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| | || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||     
T  15100813 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 15100912  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15100913 gtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 15100951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15342670 - 15342332
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  15342670 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15342571  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||| ||||  | | | |||   ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || |||||| |    
T  15342570 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcctaatttattctaagac 15342471  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    | |||| ||  ||||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||     
T  15342470 taaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaa 15342371  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15342370 gtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 15342332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19149445 - 19149112
Alignment:
Q  13 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 112  Q
    |||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||    
T  19149445 agattaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcc 19149347  T
Q  113 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 212  Q
     ||||| |||||||| || |||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||     
T  19149346 tggtgtgtttatggagtatatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgat 19149247  T
Q  213 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga 312  Q
    |||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| | || ||||||||| || |||||||||||||| | ||| || |    
T  19149246 gaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaa 19149147  T
Q  313 gttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19149146 gttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 19149112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12689742 - 12689411
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||| | || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  12689742 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctctgagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 12689643  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||  | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  12689642 tgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaag 12689543  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  12689542 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 12689443  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12689442 aagtgagttttcttggccatgttatttctggt 12689411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20748844 - 20748511
Alignment:
Q  13 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 112  Q
    |||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||    
T  20748844 agattaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcc 20748746  T
Q  113 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 212  Q
     ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||     
T  20748745 tggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgat 20748646  T
Q  213 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga 312  Q
    |||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| | || ||||||||| || |||||||||||||| | ||| || |    
T  20748645 gaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaa 20748546  T
Q  313 gttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20748545 gttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 20748511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10872930 - 10872599
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  10872930 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 10872831  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  10872830 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggtcgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 10872731  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10872730 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 10872631  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10872630 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 10872599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 14262255 - 14262592
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||  || || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  14262255 catcatattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacaatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14262354  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||| | |    
T  14262355 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcta-gac 14262453  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||     
T  14262454 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaa 14262553  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14262554 gtaagttttcttggccatattatttctagtagtggtatt 14262592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 16948482 - 16948820
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   | ||||||||||  || ||| ||||    
T  16948482 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 16948581  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||       
T  16948582 cgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaaaat 16948681  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
     ||||| ||  | ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | |||     
T  16948682 cgaagaggagcacgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagctgtcaaagtgtgagttttggttaagtgaa 16948781  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16948782 gtgagttttctgggccacattatttctggtagtggtatt 16948820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 16070307 - 16070643
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  16070307 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 16070406  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | ||  ||||  ||||||| || |||||  | ||||| ||||  ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| |    
T  16070407 cgcctagtgt--ttatggagtatatgaacagaattttccatgtctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctcatttattctaagac 16070504  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  || || ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||     
T  16070505 tgaagaagagcatgcagagtatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaa 16070604  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  16070605 gtaagttttctgggtcatattatttctggtagtggtatt 16070643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14139918 - 14139589
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  14139918 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 14139819  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  14139818 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatttattctaagac 14139719  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | | |||     
T  14139718 tgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaa 14139619  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14139618 gtaagtttccttggtcatattatttctggt 14139589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 26092806 - 26093146
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  26092806 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 26092905  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  26092906 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 26093005  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  26093006 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 26093105  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  26093106 aagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 26093146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 15380 - 15711
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  |  ||    
T  15380 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtaaacaa 15479  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| ||  | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  15480 tgcgcctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgcgtttatcgacgatattttgatttactccaag 15579  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15580 actgaagaagaacatgctgagcatctgatgattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 15679  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | || ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15680 aagtaagttttcttggccatgttatttttggt 15711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7826042 - 7825812
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  7826042 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 7825943  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  7825942 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 7825843  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  7825842 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 7825812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 27105902 - 27106132
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  27105902 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 27106001  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  27106002 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 27106101  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  27106102 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 27106132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27172423 - 27172193
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  27172423 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 27172324  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  27172323 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 27172224  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  27172223 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 27172193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 49154542 - 49154202
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  49154542 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 49154443  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||  |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  49154442 tgcgcctggtgtttttatggggtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 49154343  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  49154342 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 49154243  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  49154242 aagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 49154202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13023596 - 13023258
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  13023596 catcagataaaggtgaatgatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 13023497  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||| | || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||||| |    
T  13023496 cgcctggtgtttttatgtattatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgataatttgatttattctaagac 13023397  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||     
T  13023396 tgaagaggagcatgcagaacatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttgtggttaagtgaa 13023297  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  13023296 gtgagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 13023258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 13966678 - 13967016
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  13966678 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 13966777  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||      
T  13966778 cgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaa 13966877  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||     
T  13966878 tgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 13966977  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  13966978 gtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 13967016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19614914 - 19614576
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  19614914 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19614815  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |    
T  19614814 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaac 19614715  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||     
T  19614714 tgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaa 19614615  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19614614 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 19614576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18179985 - 18179655
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  18179985 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactacgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 18179886  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||  | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||| | || ||  ||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||    
T  18179885 tgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtaattgtgtttatcgaccatattttgatttactccaag 18179786  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa--aaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||| || |||||| |||| |||||  | | || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  18179785 actgaagaagaacatgccgagcatctcaagattgtcttacaagtgttgaa-gagaangacactt-tatgccaaattgtctaagtatgaattctggttgaa 18179688  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 337  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18179687 agaggtgagttttcttggccatgttatttctgg 18179655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 26116598 - 26116938
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  26116598 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacattatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 26116697  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   ||| |||| ||||| |||||||||||||| || || || |||    
T  26116698 cgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttcttgtggtgtttattgacgatattttaatctattccaag 26116797  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||    
T  26116798 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtg 26116897  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||    
T  26116898 aagtgagctttctgggtcacattatttttggtagtgatatt 26116938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 11301223 - 11301561
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  11301223 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatg 11301322  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||      
T  11301323 cgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaa 11301422  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||| || ||  ||||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||     
T  11301423 tgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagatctggttaaatgaa 11301522  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  11301523 gtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 11301561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13688275 - 13688021
Alignment:
Q  13 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 112  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || |  || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||    
T  13688275 agattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtccctatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacc 13688176  T
Q  113 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 212  Q
     || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  13688175 tggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgac 13688076  T
Q  213 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagt 267  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13688075 gaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagt 13688021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 14284386 - 14284724
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  14284386 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttattgtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14284485  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || || || || ||||| || || ||  | |||||||||||||   | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||| |    
T  14284486 cgcctggcgtgttcatggagtatataaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggttgtattcattgatgacattttgatttattctaagac 14284585  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  || |  | ||| ||| | || | ||||||||  |||||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||| ||| | |||     
T  14284586 tgaagaggagcatacagaacatctgaggattatattgcaagtattgaaagagaagaagctgtatgctaagttgtcgaaatgtgagttctagttaagtgaa 14284685  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14284686 gtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 14284724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 18051963 - 18052292
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  18051963 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 18052062  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| || ||| |||| || || ||| |    
T  18052063 cgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatttattcgaagac 18052162  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||  |||| || ||||| || ||| | | |||     
T  18052163 tgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaa 18052262  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18052263 gtgagtttccttggtcatattatttctggt 18052292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 23503880 - 23504209
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  23503880 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 23503979  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  23503980 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagac 23504079  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||  |||| || ||||| || ||| | | |||     
T  23504080 tgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaa 23504179  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23504180 gtgagtttccttggtcatattatttctggt 23504209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14213678 - 14213583
Alignment:
Q  243 ttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14213678 ttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 14213583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 18588201 - 18588437
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || ||| |   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  18588201 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaaaataaagttatgccttttggtgttaccaa 18588300  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  18588301 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaattgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 18588400  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttt 243  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  18588401 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttt 18588437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12458879 - 12458541
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  12458879 catcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 12458780  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| ||  ||||    || || ||||||| | | |||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||      
T  12458779 cgcctggtgtgttcatggagtatttgaacataatcttccatgcttttctggataatttcgttgttgtgtttattgatgatattttaatctattccaagaa 12458680  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||     
T  12458679 tgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 12458580  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  12458579 gtgagatttctgggacacattatttctggtagtggtatt 12458541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8200618 - 8200537
Alignment:
Q  257 agagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8200618 agagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 8200537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13688022 - 13687973
Alignment:
Q  289 gtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13688022 gtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 13687973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3181 - 2849
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  || ||| ||    
T  3181 atcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgcctttcggtgttactaa 3082  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  3081 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatataatctaag 2982  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2981 tctgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctcaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 2882  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2881 aggtgagtttccgtggccatattatttctggta 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 7683 - 8023
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  7683 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgctttcagaacgggttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaa 7782  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  7783 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcatagttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 7882  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  7883 tctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtatgaattctggttgaaag 7982  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
      ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  7983 gagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 8023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 33 - 347
Target Start/End: Original strand, 9084 - 9398
Alignment:
Q  33 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  9084 gatatggagaagacggcttttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtaca 9183  T
Q  133 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  9184 tgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgtttcgtggttgtgttcatggatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgttgagcattt 9283  T
Q  233 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 332  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9284 gaggattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagctgtcaaagtgtgaattctggttggatgaggtgagttttcttggccatgttatt 9383  T
Q  333 tctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||| ||||    
T  9384 tctggtagtggtatt 9398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 20466302 - 20466642
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| || || |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||   || ||| ||    
T  20466302 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttttggtgttactaa 20466401  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  20466402 tgcaccgggtgtgtttatgaagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgatcatcgatgatattttgatatactctaag 20466501  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20466502 tctgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatg 20466601  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20466602 aggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 20466642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23473410 - 23473070
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  23473410 atcatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 23473311  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  23473310 tgcgccaggtgtgtctatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatgtactcaaag 23473211  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23473210 tctgaagaagaacatgctgagcgtttaaaagttgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgagttctagttgaatg 23473111  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  23473110 aggtgagttttcttggccatgttatttctggtggtggtatt 23473070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Original strand, 26736930 - 26737262
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  26736930 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacaatatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 26737029  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  26737030 tgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcaaatttttcatgcatttttagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 26737129  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    || ||||||||| ||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  26737130 tccgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagataagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaag 26737229  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26737230 aggtaagttttcttggccatgttatttctggta 26737262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 21337497 - 21337832
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||| |||| |||||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  21337497 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagcttttagaacacgttatggatattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacgaa 21337596  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  21337597 tgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatagcttagtggttgtattcatcgacgatattttgatttactccaag 21337696  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    | |||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  21337697 tttgaagaagaacatgctgagcacttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaag 21337796  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  21337797 aggtgagttttctcggccacgttatttctggtagtg 21337832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21409302 - 21408980
Alignment:
Q  22 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 121  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||||||  || ||  ||||| || || |||||    
T  21409302 tgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacattacggacataacgaatattctgtgatgcctttcggtgttattaatgcgccaggagtatt 21409203  T
Q  122 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 221  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||| || ||| ||    
T  21409202 tatggaatatatgaattgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattctgaaatactctaagtctgaggaggaacat 21409103  T
Q  222 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 321  Q
    ||| |||||||||   ||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21409102 gccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctga---agaagaatttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttcttg 21409006  T
Q  322 gccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  21409005 gtcatattatttctggtagtggtatt 21408980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 37289699 - 37290030
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  37289699 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 37289798  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  37289799 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 37289898  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  37289899 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 37289998  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  37289999 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 37290030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 14997942 - 14998273
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  14997942 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 14998041  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  14998042 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 14998141  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||| ||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14998142 actgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 14998241  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14998242 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 14998273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19772143 - 19771812
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  19772143 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 19772044  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  19772043 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgacgatatcttgatttactccaag 19771944  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  19771943 actgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 19771844  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  19771843 aagtgagttttctaggccatgttatttttggt 19771812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 22331090 - 22331421
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  22331090 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 22331189  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  22331190 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 22331289  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22331290 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 22331389  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22331390 aagtgagttttctaggctatgttatttctggt 22331421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22136851 - 22136520
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  22136851 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttactaa 22136752  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||  || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||    
T  22136751 tgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaag 22136652  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | | ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22136651 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 22136552  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22136551 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 22136520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25428536 - 25428276
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| || || || || ||||| || ||||| |    
T  25428536 atgcctttcggtgttacaaatgcacctggactatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggaccgattcgtggttgtttttattgatg 25428437  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  25428436 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaatctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 25428337  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  25428336 gtgtgaattctagttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 25428276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27612537 - 27612206
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  27612537 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 27612438  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  27612437 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 27612338  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27612337 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 27612238  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27612237 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 27612206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40710963 - 40710636
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  40710963 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 40710864  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  40710863 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 40710764  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  40710763 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 40710664  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  40710663 aggtgagtttccttggccatgttatttc 40710636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41773025 - 41772694
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  41773025 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 41772926  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||  | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||    
T  41772925 tgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatatcttgatttactccaag 41772826  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  41772825 actgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaatttttatgctaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaag 41772726  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  41772725 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 41772694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27520589 - 27520258
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  27520589 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 27520490  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  27520489 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttaatttactccaag 27520390  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27520389 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 27520290  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27520289 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 27520258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16358685 - 16358354
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||| |||  ||  || ||    
T  16358685 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaa 16358586  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  16358585 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 16358486  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16358485 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 16358386  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16358385 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 16358354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 29474276 - 29474607
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  29474276 atcaccagattaaagtaaaggatggagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 29474375  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||  ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  29474376 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 29474475  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||  || || || |||||||||||||||||||| |    
T  29474476 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgataaattatcgaagtgtgaattctggttgaaag 29474575  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29474576 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 29474607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34568677 - 34568346
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||| |||  ||  || ||    
T  34568677 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaa 34568578  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  34568577 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 34568478  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  34568477 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 34568378  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34568377 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 34568346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 27666791 - 27667020
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  27666791 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatatcttgatttactcca 27666890  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27666891 agactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 27666990  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  27666991 tgaagtgagtttccttggccatgttatttc 27667020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22350102 - 22349771
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  22350102 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 22350003  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  22350002 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaag 22349903  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  22349902 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 22349803  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22349802 aagtgagttttcttggccatgttatttatggt 22349771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 27683603 - 27683934
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  27683603 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 27683702  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || | |||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||    
T  27683703 tgcacctggagtgtctatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacaatattttgatttactccaag 27683802  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     |||| |||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  27683803 actgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgagagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttcaaag 27683902  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  27683903 aagtgagttttctaggccatgttatctctggt 27683934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18781297 - 18780966
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  18781297 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 18781198  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
     ||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||    
T  18781197 cgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaag 18781098  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | | ||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  18781097 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgcgaaattgtctaagtgtgaattctgattgaagg 18780998  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18780997 aagtaagttttcttggccatgttatttctggt 18780966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Original strand, 28893147 - 28893477
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  28893147 catcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 28893246  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  |    
T  28893247 cgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaac 28893346  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||     
T  28893347 tgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 28893446  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  28893447 gtgagttttctaggccatgtcatttctggta 28893477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Original strand, 28921973 - 28922303
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  28921973 catcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 28922072  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  |    
T  28922073 cgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaac 28922172  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||     
T  28922173 tgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 28922272  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  28922273 gtgagttttctaggccatgtcatttctggta 28922303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 21935489 - 21935719
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  21935489 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 21935588  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21935589 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 21935688  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  21935689 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 21935719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 22234125 - 22234463
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  22234125 catcagattaaggtgatggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 22234224  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| ||| |||| || |||||    ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |    
T  22234225 cgcctggtgtgtttgtggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagac 22234324  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| | |||     
T  22234325 tgaagaagagcatgcagatcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttatcaaaatgtgaattctggttaagtgaa 22234424  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22234425 gtaagttttcttggccatattatttctagtagtggtatt 22234463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25850240 - 25849900
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  25850240 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 25850141  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
     || || |||||||||||||| |||||||| |  || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||    
T  25850140 cgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccaaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtagtgttcattgatgatatcttgatttattcgaag 25850041  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      |||||| ||  ||||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||    
T  25850040 aatgaagaggagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtg 25849941  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  25849940 aagtgagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 25849900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20778076 - 20777746
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  20778076 catcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 20777977  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||       
T  20777976 cgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatattttgatctattctaaaat 20777877  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||| | ||||| ||  | ||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||     
T  20777876 tgaagaggaacacgccaaacacctaaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 20777777  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  20777776 gtgagtttcctaggccatgttacttctggta 20777746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23507751 - 23507521
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  23507751 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 23507652  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  ||| || ||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  23507651 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagtgatgtgcaaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 23507552  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  23507551 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 23507521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22504844 - 22504504
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  22504844 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 22504745  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
     |  || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||    
T  22504744 cgagcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattctaag 22504645  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
       ||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||    
T  22504644 aacgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtg 22504545  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  22504544 aagtgagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 22504504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20801580 - 20801249
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || |  ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  20801580 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 20801481  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| | || || || |||||||| || ||||| |||    
T  20801480 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttctttatcgatgatattttaatttactccaag 20801381  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| |    
T  20801380 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaag 20801281  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  20801280 aggtaagtttccttggccatgtcatttctggt 20801249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22464114 - 22463785
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  22464114 catcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 22464015  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||| | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||||||||| || |||||  |    
T  22464014 cgcctggtatgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaaaac 22463915  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  | || |||||| |||| |||||  |  |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| | |||     
T  22463914 tgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtacgagttctggttaagtgaa 22463815  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22463814 gtgagttttctaggccatgttatttctggt 22463785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20344447 - 20344115
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  20344447 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 20344348  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
     |  || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||    
T  20344347 cgtgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaag 20344248  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      |||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||    
T  20344247 aatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtg 20344148  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  20344147 aagtgagctttctgggtcacattatttctggta 20344115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 280
Target Start/End: Original strand, 21562232 - 21562500
Alignment:
Q  12 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 111  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||| |||||      
T  21562232 cagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgt 21562331  T
Q  112 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 211  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||  |||| || |||||| ||||    
T  21562332 ctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcctatttagattggtttgtagttgtgtttatagatgacatcctgatttattctaagactga 21562431  T
Q  212 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagtt 280  Q
    ||||||  ||||  ||||||| ||  |||| || |||||| |||| || |||||| | |||||||||||    
T  21562432 agaagagcatgcagagcatttaaaaattgtgtttcaagtgttgaaggaaaaaaagctgtatgccaagtt 21562500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 24796600 - 24796940
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  24796600 atcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 24796699  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||| | || || || |||    
T  24796700 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattctaatttattccaag 24796799  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||    
T  24796800 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaattctggttacatg 24796899  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  24796900 aagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 24796940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 339
Target Start/End: Original strand, 28914640 - 28914948
Alignment:
Q  31 aagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaata 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||||||| || ||||| ||    
T  28914640 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28914739  T
Q  131 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 230  Q
     ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||||| ||| | ||| | ||     
T  28914740 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28914839  T
Q  231 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatta 330  Q
     ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |||||| | |    
T  28914840 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtca 28914939  T
Q  331 tttctggta 339  Q
    |||||||||    
T  28914940 tttctggta 28914948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 339
Target Start/End: Original strand, 28929908 - 28930216
Alignment:
Q  31 aagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaata 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||||||| || ||||| ||    
T  28929908 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28930007  T
Q  131 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 230  Q
     ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||||| ||| | ||| | ||     
T  28930008 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28930107  T
Q  231 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatta 330  Q
     ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |||||| | |    
T  28930108 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtca 28930207  T
Q  331 tttctggta 339  Q
    |||||||||    
T  28930208 tttctggta 28930216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 37541584 - 37541924
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  37541584 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 37541683  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | | | |||   |||||||| || || ||||| |||||| | || || || |||    
T  37541684 tgcgcctggtgtttttatggaatacatgaatcgaattttccatgcctttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattctaatctattccaag 37541783  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||| | ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  37541784 aatgaggaggaacacgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 37541883  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||| || || ||||||| |||||||| ||||    
T  37541884 aagtaagttttctgggtcacattatttatggtagtggtatt 37541924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20823616 - 20823286
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  20823616 catcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 20823517  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| || || ||||| ||||| || || ||  |    
T  20823516 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatatattgatctattcaaaaac 20823417  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||     
T  20823416 tgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 20823317  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  20823316 gtgagtttcctcggccacgttatttctggta 20823286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 347
Target Start/End: Original strand, 21679212 - 21679321
Alignment:
Q  238 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 337  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679212 ttgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctgg 21679311  T
Q  338 tagtgatatt 347  Q
    ||||| ||||    
T  21679312 tagtggtatt 21679321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24583277 - 24583047
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  24583277 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 24583178  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||| ||| |||||  ||||  |||||||||   |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  24583177 agtttgaggaagagcatgctgagcatttgagaattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 24583078  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  24583077 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 24583047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 17267539 - 17267868
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  17267539 catcaaattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 17267638  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| | | | |||   ||||| || || || ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  17267639 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaatttgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcaaagac 17267738  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||  |||   |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||| | || ||| | | |||     
T  17267739 tgaagaagagcatgcagaacacctgagaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtaagttttggctaagtgaa 17267838  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17267839 gtgagtttccttggtcatattatttctggt 17267868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 14885194 - 14885534
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  14885194 atcatcagataaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 14885293  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || ||||| ||||| || || || || |||    
T  14885294 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatatcttaatttattccaag 14885393  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||| | ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  14885394 aatgaggaggaacacgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaaatg 14885493  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || ||||| || || || |||||||||||||||| ||||    
T  14885494 aagtaagtttcctgggtcacattatttctggtagtggtatt 14885534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 347
Target Start/End: Original strand, 24618700 - 24618838
Alignment:
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || || |||||||| | |||     
T  24618700 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24618799  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24618800 gtaagttttctgggccatattattcctggtagtggtatt 24618838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 347
Target Start/End: Original strand, 24714931 - 24715069
Alignment:
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || || |||||||| | |||     
T  24714931 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24715030  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24715031 gtaagttttctgggccatattattcctggtagtggtatt 24715069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 347
Target Start/End: Original strand, 24747959 - 24748097
Alignment:
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || || |||||||| | |||     
T  24747959 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24748058  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24748059 gtaagttttctgggccatattattcctggtagtggtatt 24748097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23442104 - 23442060
Alignment:
Q  294 ttctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23442104 ttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgtcatttctggt 23442060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 347
Target Start/End: Original strand, 1900 - 2213
Alignment:
Q  34 atatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacat 133  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||  || ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  1900 atatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatatgcagtgatggctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgtttatggagtacat 1999  T
Q  134 gaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttg 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||    
T  2000 gaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctcaagaagaacatgttgagcatttg 2099  T
Q  234 aagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattattt 333  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2100 aagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttaaatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggtcatgttattt 2199  T
Q  334 ctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||| ||||    
T  2200 ctggtagtggtatt 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5393 - 5054
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || | ||| ||||| |||| ||||||||||  || ||| ||    
T  5393 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgttatgggctttatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacgaa 5294  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5293 tgcgccaggtgtgttcatg-agtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgctttgtggttgtgttcattgacgatattttgatatactccaag 5195  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5194 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgcaaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatg 5095  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  5094 aggtgagttttcttggccatgttatttctgctagtggtatt 5054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11401 - 11196
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||| ||||||  |||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  11401 catctgattaaggtgaaggattaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 11302  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| ||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| |    
T  11301 cacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagac 11202  T
Q  209 tgaaga 214  Q
    ||||||    
T  11201 tgaaga 11196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 10765 - 11100
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||    
T  10765 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaa 10864  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10865 tgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaag 10964  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10965 actgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatg 11064  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11065 aagtaagttttcttggccatgttatttctggtagtg 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 16962 - 17292
Alignment:
Q  12 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 111  Q
    ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| |    
T  16962 cagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgc 17061  T
Q  112 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 211  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17062 caggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactga 17161  T
Q  212 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtg 311  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  17162 agaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatgaagta 17261  T
Q  312 agttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17262 agttttcttggccatgttatttctggtagtg 17292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 33 - 339
Target Start/End: Original strand, 24348 - 24654
Alignment:
Q  33 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 132  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||  |||| |||| ||||||||||  || |||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  24348 gatatgcagaagacaacttttagaacacgttattgacactataaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaacgcgccaagtgtgtttatggagtaca 24447  T
Q  133 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 232  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||    ||||||    
T  24448 tgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgacattttgatatactctaagactgaagaagaacttgttgcgcattt 24547  T
Q  233 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 332  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24548 gaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaaatgtgaattctggttgaatgaggtgagttttctaggccatgttatt 24647  T
Q  333 tctggta 339  Q
    |||||||    
T  24648 tctggta 24654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 24818791 - 24819126
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||    
T  24818791 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaa 24818890  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24818891 tgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaag 24818990  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24818991 actgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatg 24819090  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24819091 aagtaagttttcttggccatgttatttctggtagtg 24819126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 30010745 - 30011085
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| || ||| ||    
T  30010745 atcaccagattaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattctgtgatgcctttcagtgttactaa 30010844  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || || || |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  30010845 tgcgccaggagtgtttatgaaatatatgaatcgtatttttcatacttatctggatcgttttgttgtcgtgtttatagatgatattttgatatactccaag 30010944  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    || || || ||| ||| | |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |    
T  30010945 tccgaggaggaacatgtcgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgcaagagaagaagttatatgccaagttatcgatgtgcgaattctggttgaacg 30011044  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30011045 aagtgagttttctcggtcatattatttctggtagtgatatt 30011085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 30209478 - 30209819
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |  | ||||||||||  || ||| ||    
T  30209478 atcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacagacattacaaatattttgtgatgcctttcggtgttactaa 30209577  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| | ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  30209578 tgcgctgggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatacttatctggatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattttgatatactccaag 30209677  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    || || || ||| ||| | | |||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  30209678 tccgaggaggaacatgtcgaacatttgagaattgtttttcaagtgctgaaagagaagaagttatctgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacg 30209777  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatatta-tttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  30209778 aagtgagttttctcgatcatattattttctggtagtgttatt 30209819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27373151 - 27372820
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  27373151 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 27373052  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  27373051 tgcacctggagtgtttatggaatatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 27372952  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27372951 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 27372852  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27372851 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 27372820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 23098581 - 23098919
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  23098581 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatagaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 23098680  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| | | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |    
T  23098681 cgcctggtgtatttatggagtatatgaataggatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatattttaatttattctaagac 23098780  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||| ||||| ||| | |||| || || || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||     
T  23098781 tgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaatgttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaa 23098880  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23098881 gtgagttttctcggccacattatttctggtagtggtatt 23098919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23112616 - 23112278
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||| ||||    
T  23112616 catcagattaaggtgaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttaggacgcgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatg 23112517  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | ||  |||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |    
T  23112516 cgcctagtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggatcagtttgtagttgtgtttattgatgatatcttgatttattctaagac 23112417  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||     
T  23112416 tgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 23112317  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23112316 gtaagttttcttggccatattatttctagtagtggtatt 23112278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23073745 - 23073405
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||| |||||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  23073745 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggccattatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacaaa 23073646  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| | ||| ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  23073645 tgcacctggagtatttatggagtacatgaaccgcatctttcatgcatttttggaatgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaag 23073546  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| || | |  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  23073545 tctgaagaagaacatactagccatttgaagttggttttccaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 23073446  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  23073445 aagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 23073405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24711916 - 24711585
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  24711916 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 24711817  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  24711816 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcattttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 24711717  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24711716 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 24711617  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24711616 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 24711585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 23106289 - 23106629
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || || || || || ||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  23106289 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacgaa 23106388  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  23106389 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaag 23106488  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  23106489 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattatggttaaaag 23106588  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  23106589 aagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 23106629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 41606946 - 41607274
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  41606946 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 41607045  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  41607046 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 41607145  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  41607146 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 41607245  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41607246 aagtgagttttctaggccatgttatttct 41607274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 24875311 - 24875642
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  24875311 atcatcagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 24875410  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  24875411 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcattgatgatattttgatttactccaag 24875510  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  24875511 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 24875610  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24875611 aagtgagttttcttggccatgttatttctggt 24875642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 347
Target Start/End: Original strand, 22734355 - 22734675
Alignment:
Q  27 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 126  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || || ||||||||| || |||||||||     
T  22734355 gatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttataaatgcacctggagtatttatgt 22734454  T
Q  127 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 226  Q
    | ||||||||||| || |||||||  | ||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  22734455 agtacatgaatcgcatctttcatgaatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatttactccaagtctgaagaagaacatgctga 22734554  T
Q  227 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 326  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  22734555 gcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtaaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacat 22734654  T
Q  327 attatttctggtagtgatatt 347  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  22734655 gttatttctggtagtggtatt 22734675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10870732 - 10870405
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  10870732 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 10870633  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  10870632 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 10870533  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10870532 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 10870433  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  10870432 aagtgagttttctaggccatgttatttc 10870405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24264252 - 24263921
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  24264252 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 24264153  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  24264152 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 24264053  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||| ||| |||   ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24264052 actgaagaggaacatgttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 24263953  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24263952 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 24263921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16927242 - 16926915
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  16927242 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 16927143  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  16927142 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 16927043  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16927042 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 16926943  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16926942 aggtgagtttccttggccatgttatttc 16926915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17000882 - 17000555
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  17000882 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 17000783  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  17000782 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 17000683  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17000682 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 17000583  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17000582 aggtgagtttccttggccatgttatttc 17000555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 21143602 - 21143933
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||  ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  21143602 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatacagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 21143701  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  21143702 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 21143801  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  21143802 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 21143901  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21143902 aagtgagttttcttggccatgttatttctggt 21143933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9486098 - 9485767
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||| |||  ||  || ||    
T  9486098 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaa 9485999  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  9485998 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 9485899  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  9485898 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 9485799  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9485798 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 9485767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27219898 - 27219571
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  27219898 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 27219799  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  27219798 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 27219699  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27219698 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 27219599  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  27219598 aagtgagttttctaggccatgttatttc 27219571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 44384131 - 44384458
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  44384131 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 44384230  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  44384231 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatctactccaag 44384330  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  44384331 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 44384430  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  44384431 aagtgagttttctaggccatgttatttc 44384458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 338
Target Start/End: Original strand, 22323581 - 22323748
Alignment:
Q  171 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 270  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  22323581 gttgtgtttatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagcttt 22323680  T
Q  271 atgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  22323681 atgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttgtttctggt 22323748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45534609 - 45534482
Alignment:
Q  220 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 319  Q
    ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  45534609 atgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttct 45534510  T
Q  320 tggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||    
T  45534509 cggtcatattatttctggtagtggtatt 45534482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23278632 - 23278318
Alignment:
Q  33 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 132  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| || ||||| || |    
T  23278632 gatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 23278533  T
Q  133 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 232  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | |||  ||| || ||||| || ||||| || ||| |||| || |||||| ||||||||||  ||||  | ||| |    
T  23278532 tgaaccgaattttccatgcttatctggataatttcgtggttgtttttattgatgacattctgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatct 23278433  T
Q  233 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 332  Q
    |||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  23278432 gaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacattatt 23278333  T
Q  333 tctggtagtgatatt 347  Q
    | |||||||| ||||    
T  23278332 tttggtagtggtatt 23278318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 338
Target Start/End: Original strand, 24706156 - 24706374
Alignment:
Q  120 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 219  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| || | ||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  24706156 tttatggagtacatgaatcatatctttcacgcatttttggatcggttcgtggctgttttcattgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 24706255  T
Q  220 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 319  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24706256 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaaatgtgagttctggttgaaagaggtaagttttct 24706355  T
Q  320 tggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  24706356 tggccatgttatttctggt 24706374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 19650613 - 19650951
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || || |||||||| ||    | ||||||||||  ||  || || |    
T  19650613 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgtcactaacg 19650712  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||| ||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| |    
T  19650713 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagac 19650812  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
     ||||| ||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| | |||     
T  19650813 cgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctagttaagtgaa 19650912  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19650913 gtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 19650951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 336
Target Start/End: Original strand, 21323847 - 21324156
Alignment:
Q  27 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 126  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || || ||   ||  ||||||||   || ||| ||| |||| || ||||||||||    
T  21323847 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggccactatgagtataaagttatgccttttggtgttaccaatacacctggagtatttatgg 21323946  T
Q  127 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 226  Q
    | || |||||||| || || ||||| | ||| ||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  21323947 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgttttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctga 21324046  T
Q  227 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 326  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21324047 gcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccat 21324146  T
Q  327 attatttctg 336  Q
     | |||||||    
T  21324147 gtcatttctg 21324156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23189794 - 23189470
Alignment:
Q  13 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 112  Q
    |||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||    
T  23189794 agattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacc 23189695  T
Q  113 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 212  Q
     || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  23189694 tggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatagacgatattttgatttactccaagactgag 23189595  T
Q  213 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga 312  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||  | || |    
T  23189594 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtg-attctggttgaagaaagtaa 23189496  T
Q  313 gttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||    
T  23189495 gttttctgggccatgttatttctggt 23189470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25264769 - 25264596
Alignment:
Q  174 gtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatg 273  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||    
T  25264769 gtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatg 25264670  T
Q  274 ccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25264669 ccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 25264596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24677371 - 24677040
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||  ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  24677371 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacgaa 24677272  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| |  || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| | ||||| || |||||||| || ||||| |||    
T  24677271 tgcacctgtagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggtttttttcatcgatgatattttaatttactccaag 24677172  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| |    
T  24677171 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaag 24677072  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24677071 aggtaagttttctgggccatgttatttctggt 24677040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24950470 - 24950132
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  24950470 catcagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 24950371  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||  ||||| ||  |||| |||||| |||| || || ||| |    
T  24950370 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgcggttgtatttgttgatgatattctgatttattcaaagac 24950271  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| | |||     
T  24950270 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttatggttaagtgaa 24950171  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||| |||||| ||||    
T  24950170 gtgagtcttcttggccaccttacttctcgtagtggtatt 24950132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27789620 - 27789291
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  27789620 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 27789521  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  27789520 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagac 27789421  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| | | |||     
T  27789420 tgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaa 27789321  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27789320 gtgagtttccttggtcatattatttctggt 27789291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1065633 - 1065293
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  1065633 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 1065534  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   ||||| || || || ||||| |||||||| || || || |||    
T  1065533 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattttaatctattccaag 1065434  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  1065433 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctgattaaatg 1065334  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  1065333 aagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 1065293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12576220 - 12575904
Alignment:
Q  22 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 121  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  12576220 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtatt 12576121  T
Q  122 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 221  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||   || || || || || ||||| || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  12576120 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 12576021  T
Q  222 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 321  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||  |||| || |||||||| ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  12576020 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgaattttggctaagtgaagtgagtttccttg 12575921  T
Q  322 gccatattatttctggt 338  Q
    | |||||||||||||||    
T  12575920 gtcatattatttctggt 12575904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31832540 - 31832200
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    | ||||||||||  || ||| ||    
T  31832540 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgttactaa 31832441  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||    
T  31832440 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaag 31832341  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||    
T  31832340 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtg 31832241  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  31832240 aagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 31832200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 24829847 - 24830077
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  24829847 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 24829946  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| |||||| |  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  24829947 agtctgaggaagagcatgcggagcatttgaggattgtgttgcaattcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttcaa 24830046  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  24830047 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 24830077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9337464 - 9337209
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||| |||  ||  || ||    
T  9337464 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaa 9337365  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  9337364 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 9337265  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 262  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  9337264 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaa 9337209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 19717580 - 19717918
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  19717580 catcagatcaagttgaaggatgaggatatgcacaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaag 19717679  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||   |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| |    
T  19717680 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattttgggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagac 19717779  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||||||  |  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  19717780 tgaagatcagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagctgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 19717879  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19717880 gtaagatttctaggccacattatttctggtagtggtatt 19717918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23295659 - 23295477
Alignment:
Q  165 tttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaa 264  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||  |||| || || ||| ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| || |||||  ||||||||||||    
T  23295659 tttgtggttgtgtttattgatgacatcctgatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaa 23295560  T
Q  265 agttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  23295559 agttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaattgaagtgagttttctgggccacattattttgggtagtggtatt 23295477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22279879 - 22279659
Alignment:
Q  115 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 214  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || ||| || ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || || ||  | ||    
T  22279879 gtgtctttatggaatacatgaatagaatattttatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaaatcgaagga 22279780  T
Q  215 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 314  Q
     ||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  22279779 ggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagt 22279680  T
Q  315 tttcttggccatattatttct 335  Q
    || ||||| ||| | ||||||    
T  22279679 ttccttggtcatgtgatttct 22279659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25255799 - 25255654
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  25255799 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 25255700  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctta 154  Q
    | |  ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  25255699 cgcttggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgctta 25255654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 253 - 342
Target Start/End: Original strand, 27208979 - 27209068
Alignment:
Q  253 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  27208979 tgaaagagagaaagttgtatgccaacttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttctggtagtg 27209068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 495293 - 494959
Alignment:
Q  14 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 113  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  495293 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 495194  T
Q  114 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 213  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  495193 ggtgtgtttattgagtacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtctgaag 495094  T
Q  214 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 313  Q
    ||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  495093 aagaacatgctgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtctgagttctggttgaatgaggtgag 494994  T
Q  314 ttttcttggccat-attatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  494993 ttttcttggccatgtttatttctggtagtggtatt 494959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 453239 - 453577
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  453239 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatg 453338  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |  ||| |    
T  453339 cgcctggtgtgtttatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttatttgaagac 453438  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| || |||||  |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| | |||     
T  453439 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagagaagaagttgtatgtcaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 453538  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  453539 gtaagatttcttggccacattatttctggtagtggtatt 453577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 515379 - 515717
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  515379 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgattacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 515478  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || |||      
T  515479 cgcctggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtcgttgtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaa 515578  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||| | ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||     
T  515579 tgaagaggaacacgcagagcatctgagaattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 515678  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  515679 gtgagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 515717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 14503 - 14843
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  14503 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 14602  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14603 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatagtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 14702  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      |||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  14703 attgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctagttgaaag 14802  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14803 aggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 14843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4196 - 3856
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||   || |||| |||||  || ||||||    
T  4196 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatagacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaa 4097  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    | | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4096 tacgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 3997  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  3996 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtattgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaag 3897  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  3896 aggtgagttttcttggcaatgttatttctggtagtggtatt 3856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 40357 - 40697
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  40357 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 40456  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  40457 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 40556  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  40557 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 40656  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  40657 aagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 40697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 347
Target Start/End: Original strand, 45626 - 45763
Alignment:
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  |||| || ||| ||||| |||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  45626 tgaagaagagcatgcaaaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaagaagttgtatgctaa-ttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 45724  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  45725 gtaagttttcttggccacattatttctggttgtggtatt 45763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 184
Target Start/End: Original strand, 45453 - 45628
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||||||  || ||| ||||    
T  45453 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattaagaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 45552  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattga 184  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||    
T  45553 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttacttggataaatttgtggttgtgtttattga 45628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14743 - 14418
Alignment:
Q  14 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 113  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||   || |||||||||| ||| |||||| |||||     
T  14743 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgacttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgatgttacaaaggcacct 14644  T
Q  114 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14643 ggtgtgtttatggaatacatgaatcgaatttttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtccgaag 14544  T
Q  214 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 313  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14543 aagagcatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatattctaaattgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggttag 14444  T
Q  314 ttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14443 ttttcttggccatgttatttcgggta 14418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Original strand, 5913 - 6245
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||  ||||| | |||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| || | ||||||||||  || ||||||    
T  5913 atcaccagattaaagtgaaggacgacaatatgcaaaagacggcttttagaacacgacatggacattaggaatattcggtgatgcctttcggtgttacaaa 6012  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6013 cgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtattttccatgcatatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactctaag 6112  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6113 gctgaagaagaacatgctgagcaattgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 6212  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6213 aggtcatttttcttggtcatgttatttctggta 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 24557 - 24897
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  24557 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 24656  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  24657 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggaacgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaag 24756  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  24757 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaag 24856  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  24857 aggtaagttttcttggccatgttatttctagtagtggtatt 24897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 150849 - 150511
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  150849 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatg 150750  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | ||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||  | ||||  || ||||| || |||||||| || |||||| |    
T  150749 cgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcatggttgaatttattgatgacattttgatttattctaagac 150650  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  150649 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttaagtgag 150550  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  150549 gtaagttttcttggccacattatttctggaagtggtatt 150511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 347
Target Start/End: Original strand, 193974 - 194068
Alignment:
Q  253 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||| || ||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  193974 tgaaagaaaagaagtcgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 194068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22982 - 22647
Alignment:
Q  12 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 111  Q
    ||||||||| |||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||  || ||||| ||| |    
T  22982 cagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcggtgatgcctttcgttgttacaactgcgc 22883  T
Q  112 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 211  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22882 caggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcacttcgtggttgtgttcatcaatgatattttgatatactctaagtctga 22783  T
Q  212 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtg 311  Q
    ||||||| |  |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22782 agaagaacacactgagcatttgaagattgttttgcaagtgccgaaggaaaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggta 22683  T
Q  312 agttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  22682 agttttcttggccatgttatttttggtagtggtatt 22647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 37844 - 38175
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  37844 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacgaa 37943  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || || ||||| || || ||||| | ||| ||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  37944 tgcacctggagtgtttatggagtatataaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgcggttgttttcatcgatgatattttgatttactccaag 38043  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| |    
T  38044 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaag 38143  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  38144 aggtaagttttcttggccatgttatttctggt 38175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17158 - 16819
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| || || |||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||  || ||| ||    
T  17158 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacattatgaatattcagtgat-cctttcggtgttaccaa 17060  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17059 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 16960  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  16959 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgccaaattgtcaaagtgtcaattctgattgaaag 16860  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16859 aggtgagtgtttttggcaatgttatttctggtagtgatatt 16819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 347
Target Start/End: Original strand, 111775 - 111852
Alignment:
Q  270 tatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  111775 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatattatttctggtggtggtatt 111852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 347
Target Start/End: Original strand, 14849147 - 14849467
Alignment:
Q  27 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| || ||||| |||||||    
T  14849147 gatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagagatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatgg 14849246  T
Q  127 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||   |    
T  14849247 agtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagtccgaagaagaacatgttga 14849346  T
Q  227 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 326  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  14849347 gcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccaa 14849446  T
Q  327 attatttctggtagtgatatt 347  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  14849447 gttatttctggtagtggtatt 14849467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14696356 - 14696024
Alignment:
Q  15 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 114  Q
    |||||| |||| ||| | |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||   || ||||||||| || |    
T  14696356 attaaagtgaaagataaggatatgcagaagacggcctttagaacgcgttatggacattattaatattcagtgatgccttttggtgttacaaatgcgccag 14696257  T
Q  115 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 214  Q
    |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14696256 gtgtgtttatggagtacatgaactctatttttcatgcgtatttggattgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactcgaagtccgaaga 14696157  T
Q  215 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 314  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14696156 agaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaatttatatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggtgagt 14696057  T
Q  315 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  14696056 tttcttggccatgttatttctagtagtggtatt 14696024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8708160 - 8707822
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| || |    
T  8708160 catcatattaaagtaaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttagcacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaacg 8708061  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | | |||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  8708060 cgcggggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagtc 8707961  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||     
T  8707960 tgaagaagagcatgcagagcattagaaagttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaa 8707861  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8707860 gtaagttttattggccatattatttctggtagtggtatt 8707822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23957998 - 23957667
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  23957998 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 23957899  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  23957898 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 23957799  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  23957798 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 23957699  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23957698 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 23957667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 8051384 - 8051715
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  8051384 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 8051483  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  8051484 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 8051583  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  8051584 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 8051683  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8051684 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 8051715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27713587 - 27713256
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  27713587 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 27713488  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  27713487 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 27713388  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  27713387 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctagttgaaag 27713288  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27713287 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 27713256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40475291 - 40474960
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  40475291 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcataagacagctttcagaacccgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 40475192  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  40475191 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 40475092  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  40475091 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcgaagtgtgaattctggttgaaag 40474992  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  40474991 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 40474960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14161721 - 14161381
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||| | | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||  || | | ||    
T  14161721 atcaccagattagagtaaagaatgaagatatacagaagacggcttttaggacacgttacagacattatgaattttcagtgatgcctttcggtgtttctaa 14161622  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||| | |||   || || ||||| || ||||| |||||  | || || ||| ||    
T  14161621 tgcacctggagtatttatggagtatatgaacagaatttttcatgcttatctggataagttcgtagttgtatttattgatgatatcctaatttattctgag 14161522  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     | ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| | || ||| |||| || |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14161521 acagaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttctacaggtgttgaaggaaagtaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgaattctggttgaatg 14161422  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  14161421 aggtgagttttcttggccacattatctctggtagtggtatt 14161381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12478851 - 12478520
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  12478851 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 12478752  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  12478751 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 12478652  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  12478651 accgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 12478552  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12478551 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 12478520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 19776554 - 19776885
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  19776554 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 19776653  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  19776654 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 19776753  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  19776754 accgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 19776853  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19776854 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 19776885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 14301740 - 14302071
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  14301740 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 14301839  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  14301840 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 14301939  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14301940 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 14302039  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14302040 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 14302071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8388663 - 8388336
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  8388663 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 8388564  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  8388563 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttaatttactccaag 8388464  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8388463 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaatg 8388364  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  8388363 aggtgagtttccttggccatgttatttc 8388336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14682705 - 14682487
Alignment:
Q  120 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 219  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||     
T  14682705 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaaaaagaac 14682606  T
Q  220 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 319  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14682605 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttct 14682506  T
Q  320 tggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  14682505 tggccatgttatttctggt 14682487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15323370 - 15323128
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||||    
T  15323370 aatgcgcctggtgtgtttatggaatacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattgtaatttattcta 15323271  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||  |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |     
T  15323270 agagtgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaag 15323171  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15323170 tgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 15323128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Original strand, 15145652 - 15145977
Alignment:
Q  13 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 112  Q
    |||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||    
T  15145652 agattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttaccaatgcacc 15145751  T
Q  113 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 212  Q
     || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  15145752 tggagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttggatcgattcgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagactgaa 15145851  T
Q  213 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga 312  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||  ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  15145852 gaagaacatgctgagcatctgaacattgtcttgcaagtgttgaaagagaggaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaa 15145951  T
Q  313 gttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  15145952 gttttcttggccatgttatttctggt 15145977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 18225207 - 18225547
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  18225207 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 18225306  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| ||  | |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||    
T  18225307 tgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgacattttgatttactccaag 18225406  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18225407 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 18225506  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||   ||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  18225507 aagtaccttttcttggccatgttatttctggtgatgatatt 18225547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16149957 - 16149622
Alignment:
Q  12 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 111  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| |||||||    
T  16149957 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcac 16149858  T
Q  112 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 211  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || || | | ||||    
T  16149857 ctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattctgatttattcaatgactga 16149758  T
Q  212 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtg 311  Q
    ||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||     
T  16149757 agaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgagttctggttaagtgaagta 16149658  T
Q  312 agttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16149657 agttttctttgccacattatttctggtagtggtatt 16149622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16154103 - 16153768
Alignment:
Q  12 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 111  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| |||||||    
T  16154103 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcac 16154004  T
Q  112 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 211  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || || | | ||||    
T  16154003 ctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattctgatttattcaatgactga 16153904  T
Q  212 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtg 311  Q
    ||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||     
T  16153903 agaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgagttctggttaagtgaagta 16153804  T
Q  312 agttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16153803 agttttcttagccacattatttctggtagtggtatt 16153768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15072608 - 15072270
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  15072608 catcaaattaaggtgaaggatgaagatacgcaaaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15072509  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||      
T  15072508 cgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagagttttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaa 15072409  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||| ||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||     
T  15072408 tgaataagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 15072309  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || ||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||    
T  15072308 gtaagttttcttggtcacattatttcttgtagtggtatt 15072270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 3262815 - 3263155
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  3262815 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 3262914  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  3262915 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 3263014  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  3263015 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 3263114  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  3263115 aagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 3263155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 15001388 - 15001725
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  15001388 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgatactaatg 15001487  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || | ||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||      
T  15001488 cgcctgttgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagat 15001587  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||  || |||| | ||||||| | |||     
T  15001588 tgaagaagagcatgcagaacatctgaggattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtttaaatgtg-agtctggttaagtgaa 15001686  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15001687 gtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 15001725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 44659887 - 44660227
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  44659887 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 44659986  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||    
T  44659987 cgcgcctggtgtatttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgacgatattttaatctattccaag 44660086  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||| | | ||    
T  44660087 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggctaagtg 44660186  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| ||||| |  || |||||||||||||||| ||||    
T  44660187 aagtgagctttctggatcacattatttctggtagtggtatt 44660227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27902635 - 27902297
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  27902635 catcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaag 27902536  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || || || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||   | |||   || || || || || |||||  |||||||||| || |||||| |    
T  27902535 cgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcgtggtggtatttattgatcatattttgatttattctaagac 27902436  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||     
T  27902435 tgaagaggagcatgcagaacacatgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctagttaaatgaa 27902336  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27902335 gtgagttttctaggccacattatttctggtagtggtatt 27902297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 51604815 - 51605144
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  51604815 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 51604914  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  51604915 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagac 51605014  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| | | |||     
T  51605015 tgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaa 51605114  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51605115 gtgagtttccttggtcatattatttctggt 51605144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 262
Target Start/End: Original strand, 16234753 - 16235008
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  16234753 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 16234852  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    | |||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  16234853 tacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 16234952  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 262  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16234953 actgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaa 16235008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 338
Target Start/End: Original strand, 18613749 - 18613916
Alignment:
Q  171 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 270  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |    
T  18613749 gttgtgtttattgacgacattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttt 18613848  T
Q  271 atgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||| |||| ||||||    
T  18613849 atgcaaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaaaagtaagttttctaggccatgttatatctggt 18613916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 1647300 - 1647638
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  1647300 catcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggactcgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 1647399  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||| | ||||| ||||||| | | |||   || || || || |||||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  1647400 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaataggattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtattcattgatgatattttgatttattctaagac 1647499  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  | ||  ||||| |||| ||||   | |||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| | |||     
T  1647500 tgaagaggagcatgcagaacacctgaagattgtgttgcggattctgaaagaaagaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 1647599  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  1647600 gtgagttttgttggccacgtgatttctggtagtggtatt 1647638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 15357143 - 15357481
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  15357143 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15357242  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || |  ||||| || ||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  15357243 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataagttcgcggttgtatttattgatgacattctgatttattctaagac 15357342  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| || |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||     
T  15357343 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaa 15357442  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15357443 ttaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 15357481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 29451558 - 29451898
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  29451558 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 29451657  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| || || ||||| |||||||| || || || |||    
T  29451658 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattttaatctattccaag 29451757  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  | ||| |||   |||| ||||||||| |||| || || |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||    
T  29451758 aatgaggaggagcatgcagatcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtg 29451857  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  29451858 aagtgagctttctgggtcatattatttctggtagtggtatt 29451898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 347
Target Start/End: Original strand, 1640322 - 1640441
Alignment:
Q  228 catttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccata 327  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||     
T  1640322 catttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttagccatg 1640421  T
Q  328 ttatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||  |||||||    
T  1640422 ttatttctggtgatgatatt 1640441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 262
Target Start/End: Original strand, 17092910 - 17093165
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  17092910 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 17093009  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  17093010 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 17093109  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 262  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  17093110 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaa 17093165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 15291277 - 15291507
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| | || | |||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  15291277 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaataaaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 15291376  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  15291377 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 15291476  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  15291477 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 15291507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16218481 - 16218323
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   || |||||| |||  || ||||||    
T  16218481 atcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttcggtgttacaaa 16218382  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgtt 165  Q
    ||   | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  16218381 tgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtt 16218323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16221801 - 16221643
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   || |||||| |||  || ||||||    
T  16221801 atcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttcggtgttacaaa 16221702  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgtt 165  Q
    ||   | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  16221701 tgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtt 16221643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 11205253 - 11205436
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  11205253 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 11205352  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatat 190  Q
     || || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11205353 cgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatat 11205436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Original strand, 29037428 - 29037496
Alignment:
Q  270 tatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29037428 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 29037496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15258177 - 15257990
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  15258177 catcagatcaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15258078  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgat 196  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  ||   ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15258077 cgcctggtgtgttcatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctgaataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttgat 15257990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23443356 - 23443290
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacatta 73  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  23443356 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcataagacaacttttagaacacgttatggacatta 23443290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 15245 - 15585
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||   || ||| ||||||  || ||||||    
T  15245 atcatcggattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacttgttatagacattatgaatataaagtgattcctttcggtgttacaaa 15344  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15345 tgcgccaggtatctttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtgattgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 15444  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15445 actgaagaagaacaagctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctaaaagagaaaaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctagttgaaag 15544  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  15545 aggtgagttttcttggccatgtaatttctggtagtggtatt 15585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15261494 - 15261168
Alignment:
Q  13 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || || |||||| ||    
T  15261494 agattaaactgaaagatgaagatatgcagaagatggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttagaaatgcgcc 15261395  T
Q  113 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 212  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| |||||    
T  15261394 aggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtattcatcgatgatattttgatatattccaagactgaa 15261295  T
Q  213 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga 312  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15261294 gaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaaattgtaaaagtgtgaattctggttgaaagaggtga 15261195  T
Q  313 gttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15261194 gttttcttggccatgttatttctggta 15261168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Original strand, 15014031 - 15014344
Alignment:
Q  22 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 121  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||||  || ||| || || || || || ||    
T  15014031 tgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacatgttatggacattacgaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggagtgtt 15014130  T
Q  122 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||| | || || ||| ||    
T  15014131 tatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgatttgttgttgtgtttatagatgatattctaatatactctaagaccgaggaggaacat 15014230  T
Q  222 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 321  Q
    ||| ||||||  |   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15014231 gccgagcattgtagaattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttcttg 15014330  T
Q  322 gccatattatttct 335  Q
    ||||||||||||||    
T  15014331 gccatattatttct 15014344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17491720 - 17491380
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||| || ||||||    
T  17491720 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcagtgttacaaa 17491621  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||||||||| || |||||| | | ||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||    
T  17491620 tgcacctggagtatttatgaagtacatgaatcgcatctttcattcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatttactccaag 17491521  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17491520 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 17491421  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17491420 aagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 17491380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 15723194 - 15723525
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  15723194 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 15723293  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  15723294 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 15723393  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15723394 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcgaagtgtgaattctggttgaaag 15723493  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15723494 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 15723525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10007470 - 10007139
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  10007470 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 10007371  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  10007370 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 10007271  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10007270 actgaagaagaacattctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 10007171  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10007170 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 10007139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48427317 - 48426986
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  48427317 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 48427218  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  48427217 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 48427118  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  48427117 actgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 48427018  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  48427017 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 48426986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 278
Target Start/End: Original strand, 11889638 - 11889811
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11889638 aatgcgccaggtgtgttcatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactcta 11889737  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaag 278  Q
    ||| | | |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11889738 agtttaaggaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaag 11889811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10908080 - 10907749
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  10908080 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 10907981  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  10907980 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 10907881  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10907880 actgaagaagaacattttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 10907781  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10907780 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 10907749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13254560 - 13254229
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  13254560 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 13254461  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  13254460 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 13254361  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13254360 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 13254261  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13254260 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 13254229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 15346505 - 15346832
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  15346505 atcaccagcttaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 15346604  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  15346605 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 15346704  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15346705 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 15346804  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  15346805 aagtgagttttctaggccatgttatttc 15346832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 20060314 - 20060645
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  20060314 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 20060413  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  20060414 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 20060513  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  20060514 actgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaag 20060613  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20060614 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 20060645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 11950159 - 11950492
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  11950159 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggggatgcctttcggtgttactaatg 11950258  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||| |    
T  11950259 cgcctggtgtgttcatggagtagatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagac 11950358  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  11950359 tgaagaagagcatgcagaacatttgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 11950458  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11950459 gtgagttttcttggccacattatttctggtagtg 11950492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 5108871 - 5109198
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  5108871 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 5108970  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  5108971 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatatcttgatttactccaag 5109070  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  5109071 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 5109170  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  5109171 aagtgagttttctaggccatgttatttc 5109198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 5423190 - 5423517
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  5423190 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 5423289  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  5423290 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttatgttcatcgacgatatcttgatttactctaag 5423389  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5423390 actgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattcttgttgaatg 5423489  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  5423490 aagtgagtttccttggccatgttatttc 5423517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15229481 - 15229143
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||   | ||| ||||    
T  15229481 catcagattaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatg 15229382  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | ||  |||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||   ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||| |    
T  15229381 cgcctagtgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagac 15229282  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||| | |||     
T  15229281 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaa 15229182  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15229181 gtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 15229143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15235349 - 15235011
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||   | ||| ||||    
T  15235349 catcagattaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatg 15235250  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | ||  |||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||   ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||| |    
T  15235249 cgcctagtgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagac 15235150  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||| | |||     
T  15235149 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaa 15235050  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15235049 gtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 15235011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17188252 - 17187914
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  17188252 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatg 17188153  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| |||||||| || ||| |||| || || | | |    
T  17188152 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatttggataaatttgtggttgtattcattgatgacattctgatttattcaaggac 17188053  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  17188052 tgaggaagagcatgcagaacatctgaaaattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 17187953  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17187952 gtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 17187914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 16805207 - 16805535
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  16805207 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagcacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 16805306  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||    
T  16805307 tgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaag 16805406  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     |||||| |||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16805407 actgaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 16805506  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
    | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  16805507 aagtaagttttcttggccatgttatttct 16805535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Original strand, 12358778 - 12359117
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  12358778 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaag 12358877  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || ||||| || ||||| || ||| |||| || || ||| |    
T  12358878 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattagtggttgtatttattgatgacattctgatttattcaaagac 12358977  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  12358978 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 12359077  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatta 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12359078 gtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatta 12359117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 338
Target Start/End: Original strand, 15400785 - 15401108
Alignment:
Q  15 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 114  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| |||||||  |    
T  15400785 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacttg 15400884  T
Q  115 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 214  Q
    | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15400885 gagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaaga 15400984  T
Q  215 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 314  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  15400985 agaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagt 15401084  T
Q  315 tttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  15401085 tttcttggccatgttatttctggt 15401108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16637643 - 16637312
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||| |||  ||  || ||    
T  16637643 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaa 16637544  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  16637543 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 16637444  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16637443 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 16637344  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16637343 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 16637312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15341041 - 15340808
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  15341041 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactcca 15340942  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15340941 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 15340842  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15340841 agaagtgagttttcttggccatgttatttctggt 15340808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3687813 - 3687486
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  3687813 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 3687714  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  3687713 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 3687614  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| |    
T  3687613 actgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 3687514  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | ||||||||||| || ||| |||||||    
T  3687513 aagtgagttttctaggtcatgttatttc 3687486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12888579 - 12888252
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  12888579 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 12888480  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  12888479 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtagtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 12888380  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  12888379 actgaagaagaacatgccgagcacctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 12888280  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  12888279 aagtgagtttacttggccatgttatttc 12888252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 15587652 - 15587983
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  15587652 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 15587751  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  15587752 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 15587851  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| |||   ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15587852 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 15587951  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15587952 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 15587983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 16754961 - 16755288
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  16754961 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaa 16755060  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16755061 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttattgacgatattttgatttactccaag 16755160  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||    ||||||||||||||||||||    
T  16755161 actgaagaagaacatgcggaacatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtttgtgtgtgaattctggttgaatg 16755260  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  16755261 aagtgagtttccttggccatgttatttc 16755288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6602508 - 6602276
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  6602508 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 6602409  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    || | ||||||||| ||||  ||||| ||| | |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6602408 agaccgaagaagaacatgctgagcatctgacgattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 6602309  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 337  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6602308 tgaagtgagtttccttggccatgttatttctgg 6602276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28756198 - 28755858
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  28756198 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 28756099  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||    
T  28756098 tgcgccgggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaag 28755999  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  28755998 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 28755899  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  28755898 aagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 28755858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 53383278 - 53383605
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  53383278 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaa 53383377  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  53383378 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 53383477  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||| || || ||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53383478 actgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaggtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaatg 53383577  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  53383578 aagtgagtttccttggccatgttatttc 53383605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12500020 - 12499787
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  12500020 aatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactcca 12499921  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||  | ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  12499920 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgatagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaa 12499821  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12499820 agaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 12499787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 338
Target Start/End: Original strand, 14874839 - 14875090
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || |    
T  14874839 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtattcatggagtacatgaatcgcatctttcatgcctttttggatcgattcgtggttgtttttatcgatg 14874938  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || ||    
T  14874939 atattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaa 14875038  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| | |||||||||||    
T  14875039 gtgtgagttctggttgaaagaagtaagttttcttggccttgttatttctggt 14875090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16693936 - 16693703
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  16693936 aatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatagacgaaattttgatatactcca 16693837  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16693836 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 16693737  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
     || || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16693736 agaagtaagttttcttggtcatgttatttctggt 16693703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30139588 - 30139358
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  30139588 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 30139489  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  30139488 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 30139389  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  30139388 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 30139358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30149139 - 30148909
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  30149139 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 30149040  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  30149039 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 30148940  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  30148939 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 30148909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 31693449 - 31693774
Alignment:
Q  22 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 121  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31693449 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 31693548  T
Q  122 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 221  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   || || ||||| || ||||| || ||  |||| || |  ||| ||||||||||  ||    
T  31693549 tatggagtatatgaactgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatactgatttatttaaagactgaagaagagcat 31693648  T
Q  222 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 321  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  31693649 gcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 31693748  T
Q  322 gccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  31693749 gccacattatttatggtagtggtatt 31693774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47125824 - 47125484
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  47125824 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 47125725  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||| | || || || |||    
T  47125724 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattctaatctattccaag 47125625  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||    
T  47125624 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaattctggttacatg 47125525  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  47125524 aagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 47125484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 347
Target Start/End: Original strand, 11959435 - 11959758
Alignment:
Q  24 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 123  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||||    
T  11959435 aaggatgaggatatgcagaagacgacttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttta 11959534  T
Q  124 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 223  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||||| | | |||   ||| | |||||||| ||||| |||||||| || || || |||  |||||| ||  ||||    
T  11959535 tggaatatatgaataggattttccatgcttttctggataaatttctagttgtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaagaggagcatgc 11959634  T
Q  224 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 323  Q
      ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||     
T  11959635 agagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttctgggt 11959734  T
Q  324 catattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || ||||||| |||||||| ||||    
T  11959735 cacattatttgtggtagtggtatt 11959758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 13970371 - 13970709
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  13970371 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 13970470  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |    
T  13970471 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaac 13970570  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||     
T  13970571 tgaggaagagcatgcagaacatctgagggttgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaa 13970670  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13970671 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 13970709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14088551 - 14088213
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  14088551 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14088452  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |    
T  14088451 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaac 14088352  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||     
T  14088351 tgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaa 14088252  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14088251 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 14088213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 18132597 - 18132935
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  18132597 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 18132696  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||  | |||   ||||| |||||||| |||||||||||  | || || || ||| |    
T  18132697 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatatcctaatttattcaaagac 18132796  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||   | |  | ||| ||| | || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || | |||     
T  18132797 tgaagaggagcttacggaacatctgaggattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctgattaagtgaa 18132896  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18132897 gtgacttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 18132935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 8272757 - 8272987
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  8272757 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 8272856  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  8272857 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 8272956  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  8272957 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 8272987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 13965710 - 13965941
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  13965710 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 13965809  T
Q  205 agtctgaagaagaa-aatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttga 303  Q
    ||||||| ||||||  ||||  ||||||||| | |||| |||||||   ||||||||||  |||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  13965810 agtctgaggaagaagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagacttgaaagagaaccagttgtctgccaatttgtctaagtgtgagttttggttga 13965909  T
Q  304 atgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
    | || |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  13965910 aggaagtgagttttcttggtcatgtgatttct 13965941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Original strand, 10418296 - 10418626
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  10418296 catcaaattaaagtgaaggacgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 10418395  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||  |    
T  10418396 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatcttgatctattcaaaaac 10418495  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||| |  |||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||     
T  10418496 tgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaggaagttgtatgccaagctgtcgaagtgcgagttctggttaaatgaa 10418595  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  10418596 gtgagttttctaggccacgttatttctggta 10418626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31940768 - 31940443
Alignment:
Q  22 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 121  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| || | |||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31940768 tgaaggatgaggatatgcataagacagcctttaggacacgatatgcacattatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 31940669  T
Q  122 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 221  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   || || ||||| || ||||| || ||  |||| || || ||| |||||||| |  ||    
T  31940668 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatactgatttattcaaagactgaagaatagcat 31940569  T
Q  222 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 321  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  31940568 gcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 31940469  T
Q  322 gccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  31940468 gccacattatttatggtagtggtatt 31940443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41179400 - 41179071
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  41179400 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 41179301  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  41179300 cacccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagac 41179201  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  || |  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| | | |||     
T  41179200 tgaagaagagcattcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaa 41179101  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41179100 gtgagtttccttggtcatattatttctggt 41179071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12180022 - 12179878
Alignment:
Q  203 taagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttg 302  Q
    |||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||     
T  12180022 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 12179923  T
Q  303 aatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12179922 attgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 12179878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15611885 - 15611655
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  15611885 aatgcaccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 15611786  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||| ||   ||| | |||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  15611785 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagttttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagcgtgagttttggttgaa 15611686  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  15611685 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 15611655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 16327911 - 16328244
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  ||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| || || |||||||| ||    | ||||||||||  || ||| ||      
T  16327911 catcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaaaacgacttttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgttactaaca 16328010  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| | |   |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||      
T  16328011 cgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcctttccggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattctaagaa 16328110  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| |||||||   |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | |||     
T  16328111 tgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagatttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttatggttaagtgaa 16328210  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16328211 gtgagttttctgggtcatattatttctggtagtg 16328244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 16379179 - 16379508
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  16379179 catcaaattaaggtgaatgatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 16379278  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| | | | |||   ||  | || || || ||||| |||||| |||| || |||||| |    
T  16379279 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaattcctggtggtatttattgatgatattctgatttattctaagac 16379378  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    | |||||||  ||||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | | |||     
T  16379379 ttaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaa 16379478  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16379479 gtaagtttccttggtcatattatttctggt 16379508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 16834761 - 16835090
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  16834761 catcaaattaaggtgaaggatggagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgtatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 16834860  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| | | | |||   ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || |||||| |    
T  16834861 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcatttctggataagtttgtggttgtatttattgatgacatcctaatttattctaagac 16834960  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||| || ||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | | |||     
T  16834961 tgacgaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaa 16835060  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16835061 gtgagtttccttggccatattatttctggt 16835090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13943902 - 13943758
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  13943902 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 13943803  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 153  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  13943802 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgctt 13943758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44779125 - 44778981
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  44779125 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 44779026  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 153  Q
    | || |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  44779025 cgcccggtgtattcatggagtttatgaatcgaatttttcatgctt 44778981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 313
Target Start/End: Original strand, 15948828 - 15949036
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||||| || || ||||| || || ||||| || ||||||||| | || || |    
T  15948828 aatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccgatttgtggtggttttcatagatgatattttggtgtattcga 15948927  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  |||   ||||| ||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15948928 agtctgaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgagccaagttgtctaagtgtgaattttggttgaa 15949027  T
Q  305 tgaggtgag 313  Q
     || |||||    
T  15949028 ggaagtgag 15949036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 13318753 - 13319091
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||    | |||||| |||  || ||| ||||    
T  13318753 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgccattcggtgttactaatg 13318852  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||| | | |||   ||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||| |    
T  13318853 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtggtggtatttattgatgatattttaatttattccaagac 13318952  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    | |||| ||  ||||  | ||| ||||| || | |||||| |  ||||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||     
T  13318953 taaagaggagcatgcagaacatctgaagattatgttgcaaattttgaaagagagaaatttgtatgctaaattgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 13319052  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  13319053 gtgagttttctaggctacgttatttctggtagtggtatt 13319091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10407848 - 10407720
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  10407848 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtaatgcctttctgtgttactaa 10407749  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatga 135  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  10407748 tgcgcctggtgtttttatggagtacatga 10407720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10385429 - 10385211
Alignment:
Q  129 tacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagc 228  Q
    ||||||||||| || || ||||||| | |||||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||   || |||||  ||||   ||    
T  10385429 tacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattgatgatatcttgatttattccaagaacgaggaagagcatgcagggc 10385330  T
Q  229 atttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatat 328  Q
    || |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| || || ||    
T  10385329 atctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgggtcacat 10385230  T
Q  329 tatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  10385229 tatttctggtagtggtatt 10385211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12270088 - 12269880
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  12270088 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 12269989  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
      || | ||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || |||      
T  12269988 ttcctgatgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatcttgataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagat 12269889  T
Q  209 tgaagaaga 217  Q
    |||||||||    
T  12269888 tgaagaaga 12269880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 94
Target Start/End: Original strand, 11888614 - 11888701
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgccttt 94  Q
    |||| ||||||||| |||| || || |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||    
T  11888614 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgttatggacattatgaatattcggtgatgccttt 11888701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 8745641 - 8745711
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 79  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8745641 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgccctttaggacacgatacggtcattacgaata 8745711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 76
Target Start/End: Original strand, 12510747 - 12510801
Alignment:
Q  22 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacga 76  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  12510747 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcatttaggacacgttatggtcattacga 12510801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 63
Target Start/End: Original strand, 14291783 - 14291837
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtt 63  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14291783 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtt 14291837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24189182 - 24189112
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 79  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24189182 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaata 24189112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 12180222 - 12180167
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtta 64  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12180222 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtta 12180167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 63
Target Start/End: Original strand, 16826532 - 16826586
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtt 63  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  16826532 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgtt 16826586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 55
Target Start/End: Original strand, 14579668 - 14579716
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttag 55  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14579668 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttag 14579716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 347
Target Start/End: Original strand, 27283 - 27611
Alignment:
Q  18 aaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtg 117  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||| ||  ||||||| |||||||||| |||| ||||| || | ||||||||||  || ||| ||||| ||||| |    
T  27283 aaactgaaagatgaggacattcagaagatggactttaggatacgttacggaaattatgaatattctgtgatgcctttcggtgttactaatgcgccgggag 27382  T
Q  118 tatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaaga 217  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||| || ||    
T  27383 tatttgtggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatatcctgatatactctaagtctgaggagga 27482  T
Q  218 aaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttt 317  Q
    | ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  27483 acatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgagaattctggttgaacga-gtgagtttt 27581  T
Q  318 cttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27582 cttggtcatattatttctggtagtggtatt 27611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21400 - 21062
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||    | ||| ||||||  || ||| ||||    
T  21400 catcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgacacggtcattatgaatagaaggtgatacctttcggtgttactaatg 21301  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||| | | |||   ||||| ||||| ||  |||| |||||| | || || |||||| |    
T  21300 cgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtagttgtatttcttgatgatattctaatttattctaagac 21201  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| || ||||  || ||| | || ||||| | | |     
T  21200 tgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaataagttgtatgctaaattgttgaaatgttagttttggttaagtaaa 21101  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  21100 gtaagttttcttggtcacattatttctggtagtggtatt 21062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 217444 - 217784
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| || || |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  217444 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacgtcctttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 217543  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  217544 tgccccaggtgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcgttttttgatcgtttcgtggttgtgatcattgatgatattttgatatactcgaag 217643  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |  ||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  217644 ttcgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgttaaattgtcaaagtgtgagttctagttgaatg 217743  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  217744 aggtgagttttcttggccacgttatttctggtagtggtatt 217784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 280
Target Start/End: Original strand, 23085939 - 23086210
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||    
T  23085939 catcagattaaagtaaaagatgaagatatctagaagacggcctttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatg 23086038  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  23086039 cgccgggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagta 23086138  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagtt 280  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||| |||||    
T  23086139 tgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctggaggagaagaagctttatgctaagtt 23086210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Original strand, 18965599 - 18965802
Alignment:
Q  145 ttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgtttt 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  18965599 ttcatgcttatttagatcgctttgttgttttgttcattgatgatattttgatatatgctaagtctgaagaagaacattctgagcatttgaagattgtttt 18965698  T
Q  245 gcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgat 344  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  18965699 tcaagtgatgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttccttggccatattatttctggtaatggt 18965798  T
Q  345 atta 348  Q
    ||||    
T  18965799 atta 18965802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23080560 - 23080244
Alignment:
Q  31 aagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaata 130  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||   || |||| |||||  || |||||||||||| || || |||||||| ||    
T  23080560 aagatatgcagaagacggattttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagta 23080461  T
Q  131 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 230  Q
    ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||  |||||    
T  23080460 catgaatcgcatttttcatgcatttctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagtctgaggaagaacatgctgagcat 23080361  T
Q  231 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatta 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  23080360 ttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtttgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtta 23080261  T
Q  331 tttctggtagtgatatt 347  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  23080260 tttttggtagtggtatt 23080244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 132 - 339
Target Start/End: Original strand, 18196024 - 18196231
Alignment:
Q  132 atgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatt 231  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  18196024 atgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatttatgatattttgatatactccaagtccgaagaagagcatgctaagcatt 18196123  T
Q  232 tgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattat 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||    
T  18196124 tgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtatgaattttggttgaaagatgtgaattttcttggccatgttat 18196223  T
Q  332 ttctggta 339  Q
    ||||||||    
T  18196224 ttctggta 18196231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 101 - 347
Target Start/End: Original strand, 25608121 - 25608367
Alignment:
Q  101 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  25608121 tacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaattgcatctttcatgcatttttggatcgattcgtagttgtttttattgatgatattttgatttac 25608220  T
Q  201 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 300  Q
    || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25608221 tccaagtctgaagaagaagatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggt 25608320  T
Q  301 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25608321 tgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 25608367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 347
Target Start/End: Original strand, 20634126 - 20634446
Alignment:
Q  27 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 126  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||    
T  20634126 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatgg 20634225  T
Q  127 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 226  Q
    | ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||  |    
T  20634226 agtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtctaaagaagaacatgctga 20634325  T
Q  227 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 326  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  20634326 gcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacat 20634425  T
Q  327 attatttctggtagtgatatt 347  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  20634426 gttatttctggtagtggtatt 20634446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18450585 - 18450286
Alignment:
Q  40 agaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcg 139  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |  | ||||||||||  || ||| ||||| | ||| |||||||||||||| || || ||    
T  18450585 agaagacgacctttaggacacgttacagaaattacgaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgggagtatttatggaatatattaaccg 18450486  T
Q  140 tatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagttt 239  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |   | || ||| ||| | |||||||||   ||    
T  18450485 tatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattctgatatactctaaattcaaggaggaacatgtcgagcatttgagaatt 18450386  T
Q  240 gttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18450385 gttttgcaagtgctgaaggggaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagggagttttcttggtcatattatttctggta 18450286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 347
Target Start/End: Original strand, 18406204 - 18406450
Alignment:
Q  101 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  18406204 tacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttac 18406303  T
Q  201 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 300  Q
    || ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  18406304 tccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaaactggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactatatgctaaattgtttaagtgtgaattctggt 18406403  T
Q  301 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  18406404 tgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 18406450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 22760621 - 22760961
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| | ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  22760621 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcacaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaa 22760720  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||    
T  22760721 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattaatgatattttgatttactccaag 22760820  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22760821 tctgaagaagagcatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 22760920  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  22760921 aagtgagctttcttggacatgttatttgtggtagtggtatt 22760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 24293948 - 24294276
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||  |||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  24293948 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 24294047  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  24294048 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 24294147  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24294148 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 24294247  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24294248 aagtgagttttctaggccatgttatttct 24294276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 341
Target Start/End: Original strand, 19487486 - 19487772
Alignment:
Q  45 acggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtattt 144  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||           
T  19487486 acggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaat------- 19487578  T
Q  145 ttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgtttt 244  Q
       |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||| |||| ||    
T  19487579 ---atgcttatttggatcggtttgtggttgtttttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgtt 19487675  T
Q  245 gcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagt 341  Q
    ||||||| |||| |  || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19487676 gcaagtgttgaaggtaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagt 19487772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 2872969 - 2873296
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  2872969 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 2873068  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  2873069 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttgatttactccaag 2873168  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  2873169 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaggagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaag 2873268  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  2873269 aagtgagtttccttggccatgttatttc 2873296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 22828521 - 22828852
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || ||| |||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  22828521 atcaccagattaaagtaaaagataaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 22828620  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  22828621 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgcgttcatcgatgatattttgatttactccaag 22828720  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  22828721 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 22828820  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22828821 aagtgagttttcttggccatgttatttctggt 22828852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 339
Target Start/End: Original strand, 16961761 - 16961980
Alignment:
Q  120 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 219  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  16961761 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 16961860  T
Q  220 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 319  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16961861 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagtcatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttct 16961960  T
Q  320 tggccatattatttctggta 339  Q
    ||||||| | ||||||||||    
T  16961961 tggccatgtcatttctggta 16961980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19455137 - 19454804
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | |||| |||||  || ||| ||||    
T  19455137 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgtagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaatg 19455038  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||   ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || || ||| |    
T  19455037 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaatttgtggttgtatttattgatgacatcttgatttattcaaagac 19454938  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    | |||||||  ||||  ||||| ||||| | || ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  19454937 taaagaagagcatgcagagcatctgaagatagtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaa 19454838  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19454837 gtgagttttcttggccacattatttttggtagtg 19454804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Original strand, 5837385 - 5837717
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || || ||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  5837385 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagaccgctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgccttttggtgttaccaa 5837484  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || || |||    
T  5837485 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtcttcattgacgacattctgatttattccaag 5837584  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     |||| |||||| |||   ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  5837585 actgaggaagaacatgttgagcatctgaagactgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgccaagttgtctaagtgtgagttctggttgaaag 5837684  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5837685 aggtaagttttcttggccacgttatttctggta 5837717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 14378084 - 14378416
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  14378084 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14378183  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||||| |    
T  14378184 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagac 14378283  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| | |||     
T  14378284 tgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaa 14378383  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagt 341  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14378384 gtaagttttcttggccacattatttctggtagt 14378416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 14379634 - 14379966
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  14379634 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14379733  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||||| |    
T  14379734 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagac 14379833  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| | |||     
T  14379834 tgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaa 14379933  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagt 341  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14379934 gtaagttttcttggccacattatttctggtagt 14379966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25114667 - 25114340
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || |  |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  25114667 atcatcagattaaagtaaaggttgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactgtgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 25114568  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    | |||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  25114567 tacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttgttcatcgatgatattttgatctactccaag 25114468  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||| ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  25114467 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgtcaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 25114368  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25114367 aggtgagttttcttggccatgttatttc 25114340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 28261461 - 28261690
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28261461 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 28261560  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28261561 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 28261660  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
     || |||||||| | ||||||| |||||||    
T  28261661 agaagtgagtttccctggccatgttatttc 28261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28284455 - 28284226
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28284455 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 28284356  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28284355 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 28284256  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
     || |||||||| | ||||||| |||||||    
T  28284255 agaagtgagtttccctggccatgttatttc 28284226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 28340210 - 28340439
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28340210 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 28340309  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28340310 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 28340409  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
     || |||||||| | ||||||| |||||||    
T  28340410 agaagtgagtttccctggccatgttatttc 28340439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Original strand, 16925804 - 16926136
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || || || |||||    |  ||||| |||  ||  || ||    
T  16925804 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataatgttatgccgttcggtgtgaccaa 16925903  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || ||| |||| || ||||| || || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  16925904 tgcacctggagtgtttttggagtatatgaagcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcatcgatgatattttgatttactccaag 16926003  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16926004 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagttatctaagtgtgaattctggttgaaag 16926103  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16926104 aggtaagttttcttggccatgtcatttctggta 16926136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18796803 - 18796465
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||| || ||| ||||    
T  18796803 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatg 18796704  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
      || ||||| || ||||| || |||||  | ||||| ||||| ||| | |||   ||||| ||||| ||||||||  | |||||||| || ||||   |    
T  18796703 tgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtattcattgataacattttgatctattctagaac 18796604  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  18796603 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaaatgaa 18796504  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18796503 gtgagttttcatggccacattatttctggtagtggtatt 18796465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Original strand, 18963254 - 18963396
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||    
T  18963254 atcaccagattaaagtgaaagatgacgatatgcagaagacgacttttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaa 18963353  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcat 149  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18963354 tgcaccaggtgtatttatggagtacatgaatcatatttttcat 18963396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 338
Target Start/End: Original strand, 27564112 - 27564330
Alignment:
Q  120 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 219  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  27564112 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtgttcatcgatgaaattttgatttactccaagactgaagaagaac 27564211  T
Q  220 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 319  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  27564212 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttct 27564311  T
Q  320 tggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  27564312 tggccatgttatttctggt 27564330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27189531 - 27189224
Alignment:
Q  27 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 126  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||    
T  27189531 gatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgg 27189432  T
Q  127 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 226  Q
    | || |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  27189431 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgcgga 27189332  T
Q  227 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 326  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27189331 acatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagtttccttggccat 27189232  T
Q  327 attatttc 334  Q
     |||||||    
T  27189231 gttatttc 27189224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Original strand, 27259709 - 27260016
Alignment:
Q  27 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 126  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||    
T  27259709 gatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgg 27259808  T
Q  127 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 226  Q
    | || |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  27259809 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgcgga 27259908  T
Q  227 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 326  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27259909 acatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagtttccttggccat 27260008  T
Q  327 attatttc 334  Q
     |||||||    
T  27260009 gttatttc 27260016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25769957 - 25769619
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||| || |||||||| || ||    | |||| |||||  || ||| ||||    
T  25769957 catcagattaaggtgaatgatgaggatatgcagaaaatggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctttcggtgttactaatg 25769858  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||   |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || |||||||     
T  25769857 cgcctggtgtatttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatccggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagta 25769758  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| | |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||     
T  25769757 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaataaatgaagttgtatgctaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 25769658  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25769657 gtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 25769619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 16380637 - 16380867
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  16380637 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 16380736  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  16380737 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 16380836  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  16380837 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 16380867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19881411 - 19881073
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||| ||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  19881411 catcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19881312  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||  | |||   ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |   |    
T  19881311 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaataggatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgttcattgatgacattttgatctattcgagaac 19881212  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||     
T  19881211 tgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaaactgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttctggttaagtgaa 19881112  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19881111 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 19881073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19437115 - 19436777
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  19437115 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19437016  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | ||  |||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || ||| |||| || ||||   |    
T  19437015 cgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattctagaac 19436916  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| | || ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||     
T  19436915 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaagagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctgcttaagtgaa 19436816  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19436815 gtgagttttctgggccacattatttctggtagtggtatt 19436777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21473713 - 21473376
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    | |||| ||||| ||| ||| ||||    
T  21473713 catcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctttcgatgttactaatg 21473614  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | | || ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||| | |||||  | || || ||||||      
T  21473613 cgctgg-tgtgtttatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttatttatgatatcctaatttattctaagaa 21473515  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| |  ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||     
T  21473514 tgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaggaagttgtatgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 21473415  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  21473414 gtaagttttcttggccacaatatttttggtagtggtatt 21473376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19866704 - 19866471
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| |    
T  19866704 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactcca 19866605  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||  | || ||| |||| |||||||||||    
T  19866604 agactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagcgtgagttctggttgaa 19866505  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19866504 agaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 19866471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22435874 - 22435653
Alignment:
Q  117 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaag 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || ||||| ||| || ||||||    
T  22435874 gtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttaatttactccaagactaaagaag 22435775  T
Q  217 aaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttt 316  Q
    || |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||| | || || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22435774 aacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttt 22435675  T
Q  317 tcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  22435674 tcttggccatgttatttctggt 22435653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22444272 - 22444051
Alignment:
Q  117 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaag 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || ||||| ||| || ||||||    
T  22444272 gtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttaatttactccaagactaaagaag 22444173  T
Q  217 aaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttt 316  Q
    || |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||| | || || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22444172 aacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttt 22444073  T
Q  317 tcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  22444072 tcttggccatgttatttctggt 22444051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24366527 - 24366187
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  24366527 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 24366428  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  24366427 tgtgccaggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 24366328  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||  |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  24366327 aatgaggaggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtg 24366228  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  24366227 aagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 24366187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 16648233 - 16648463
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  16648233 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 16648332  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  16648333 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 16648432  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  16648433 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 16648463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 338
Target Start/End: Original strand, 25763474 - 25763725
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || |||||||||||| ||  | |||||||| || |||||||| || || | ||| | ||| ||||| ||| | ||||| || ||||| |    
T  25763474 atgcctttcggtgttacaaatgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccttgcatttttggatcgctttatggttgtctttattgatg 25763573  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    | ||||| || ||||| ||| |||||| |||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||  | ||||| || || || ||    
T  25763574 acattttaatttactccaagactgaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagataaaaatgtatgctaaattatctaa 25763673  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  25763674 ttgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttctggt 25763725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15461449 - 15461119
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  15461449 catcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcaaaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 15461350  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| | | |||||   ||||| || ||||| || || |||||| |||| || |||||  |    
T  15461349 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctagataaatttgtggtggtgtttatagatgatattctgatttattctaaaac 15461250  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||| | ||| | || |||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||     
T  15461249 tgaagaggaacacgccgaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgatttctggttaagtgaa 15461150  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  15461149 gtgagttttctaggccacgttatttctggta 15461119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 10467017 - 10467355
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  10467017 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgataaagtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 10467116  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||| | || || || |||      
T  10467117 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttatggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattctaatctattccaagaa 10467216  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||     
T  10467217 tgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagcgaa 10467316  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||||| ||||    
T  10467317 gtgagttttctgggtcacattatttctgatagtggtatt 10467355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23998265 - 23998035
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || |  |    
T  23998265 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattgaa 23998166  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    |||| || |||||  ||||  | ||||||| | |||| ||| ||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| |    
T  23998165 agtccgaggaagagcatgctgaacatttgaggattgtgttgtaagtcttgaaagagaaccagttatgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgga 23998066  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  23998065 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 23998035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 347
Target Start/End: Original strand, 34643983 - 34644092
Alignment:
Q  238 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 337  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34643983 ttgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctgg 34644082  T
Q  338 tagtgatatt 347  Q
     |||| ||||    
T  34644083 aagtggtatt 34644092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Original strand, 28280981 - 28281125
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  28280981 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 28281080  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 153  Q
    | |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  28281081 cgccgggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgctt 28281125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 1647078 - 1647308
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||| | || || |    
T  1647078 aatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgacattttggtgtattcga 1647177  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||| ||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||| ||   ||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  1647178 agtttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 1647277  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  1647278 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 1647308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Original strand, 18183533 - 18183663
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  18183533 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgtcttttagcacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 18183632  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaat 137  Q
    ||| || ||||| |||||||  |||||||||    
T  18183633 tgcgcctggtgtgtttatggtgtacatgaat 18183663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 21568159 - 21568497
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||   || |||| |||||  || ||| || |    
T  21568159 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacactttatggtcattacgaatacaaagtgatgtctttcggtgttactaacg 21568258  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||| | | |||   ||| | ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||| |    
T  21568259 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctgatttattctaagac 21568358  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
     ||||| ||  |||   | ||| ||| | |||  ||  | ||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| | | |||     
T  21568359 cgaagaggagcatgtagaacatctgaggattgaattataggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggctaattgaa 21568458  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21568459 gtaagttttctcggccacattatttctggtagtggtatt 21568497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 24516576 - 24516646
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 79  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  24516576 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaata 24516646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 339
Target Start/End: Original strand, 5295573 - 5295704
Alignment:
Q  208 ctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatga 307  Q
    ||||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || |  |||||||| | |||    
T  5295573 ctgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgtgttctggttaagtga 5295672  T
Q  308 ggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5295673 agtaagttttcttggccacattatttctggta 5295704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 201494 - 201832
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||      
T  201494 catcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaaca 201593  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  201594 cgccgggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgatattttgatatactctaagac 201693  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||| ||||  | ||||||||| |||| ||||||||| |||| || || ||| | |||||||| | ||| || |||||||||||||| | |||     
T  201694 tgaagaagaacatgcagaacatttgaaggttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagctgtatgccaaatggtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 201793  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  201794 gtaaattttcttggccatattatttctggtagtggtatt 201832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 324984 - 324646
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  324984 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 324885  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   || || ||||| || ||||| || ||| |||| || || | | |    
T  324884 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacattctgatctattcaaggac 324785  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  |||   | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | |||     
T  324784 tgaagaagagcatgtagaacatctgaagattgtattgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagtcgtcgaagtgtgaattctggttaagtgaa 324685  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  324684 gtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 324646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1280 - 939
Alignment:
Q  6 catcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaa 105  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||  | ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||||||||||  || ||| |    
T  1280 catcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcataagacagcctttaggacacgttacagacattacaaatattcggtgatgcctttcggtgttacta 1181  T
Q  106 atgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 205  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||    
T  1180 acgcgccgggagtgtttatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcagtttgttgttgtgtttatagatgatattatgatatactctaa 1081  T
Q  206 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaat 305  Q
    | | ||||| ||| ||||  |||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  1080 gaccgaagaggaacatgcggagcatttgagaattgttttgcaagtactgaaggagaagaagttatatgccaaattatcgaagtgtgaattctggttgaac 981  T
Q  306 gaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  980 gaagtgacttttcttggccatatcatttctggtagtggtatt 939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 84558 - 84883
Alignment:
Q  22 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 121  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||  || ||| ||||| | | | |||||    
T  84558 tgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgagagtatt 84657  T
Q  122 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| |  | || ||  ||    
T  84658 tatggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattatgatatactctaagaccaaggaggagcat 84757  T
Q  222 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 321  Q
    ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  84758 gccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgcgaattctggttgaacaaagtgagtttccttg 84857  T
Q  322 gccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||    
T  84858 gtcatattatttcagttagtggtatt 84883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 268888 - 268558
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  268888 catcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatgtggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 268789  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||| | | |||   || || || ||||| || || ||||||||||| || |||||  |    
T  268788 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccagattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtgtttatagatgatattttgatttattctaaaac 268689  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||     
T  268688 tgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 268589  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  268588 gtgagtttcctaggccatgttatttctggta 268558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 91 - 431
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||    
T  91 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgtgttatggacattatgagtataacgtgatgccgttcggtgttacaaa 190  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  191 tgcacctggtgtgttgatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaag 290  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     |||| |||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  291 actgaggaagaacatgctgagcatttgaagactgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 390  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  391 aggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Original strand, 16002 - 16333
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || || |||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || || |||| |||||||||   || ||||||    
T  16002 atcaccagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagatggcttttagaaaacgttatggacattatgagtattcagtgatgcctttgggtgttacaaa 16101  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
     || || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16102 cgcgccaggtgtgtttatgtagtacatgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttatattcatcgatgatattttgatatactctaag 16201  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||| ||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202 actgaagaggaatatgctgagcatttgaagatt-ttttgcaagtgttcaaggagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 16300  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||| |||||||||| || | ||||||||||||    
T  16301 aggtaagttttcttgaccgtgttatttctggta 16333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8302 - 7962
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||| ||| |||| || ||    | |||||| |||  || ||||||    
T  8302 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggagattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaa 8203  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  8202 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccatg 8103  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  8102 tctgaagaagaacatgctaagcatttgaagctagttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 8003  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  8002 aagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 7962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 103515 - 103175
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||| ||||| || || ||   || ||||||||||  || | ||||    
T  103515 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatggattttagaacgcgttatggacactatgagtataaagtgatgcctttcggtgttgcaaa 103416  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  103415 tgcgccaggtgtgtttatggagtgcatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtagtattcatcgatgatattttgatttactccaag 103316  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |    
T  103315 tctgaggaagaacatgccgaacatttgaagactgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattatcaaagtgtgaattctgattgaaag 103216  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  103215 aggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 103175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3855 - 3533
Alignment:
Q  15 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 114  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||   || ||||||||||  || |||||||||||| |    
T  3855 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctg 3756  T
Q  115 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 214  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  3755 ctgtgtttatggagtacgtgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgagga 3656  T
Q  215 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 314  Q
    |||| ||||  |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3655 agaacatgctgagcatttgaagactgttttggaagtgttgaaagagaaaaagttttatgctaaattgtcaaagtgtgaattatggttgaaagaggtgagt 3556  T
Q  315 tttcttggccatattatttctgg 337  Q
    |||||| | ||| ||||||||||    
T  3555 tttcttagacatgttatttctgg 3533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 42131 - 42471
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||  |||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||||||||  || ||| ||    
T  42131 atcaccagatcaaagtgaaagatggggatattcagaagacggcctttaggacacattacgaacattacgaatattcggtgatgcctttcggtgttactaa 42230  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
     || |  || || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| |||    
T  42231 cgcgcaaggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttggatcgatttgtttttgtgtttatagatgatattctgatatactccaag 42330  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     | || || ||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||| |    
T  42331 accgaggaggaacatgccgagcatttgagatttgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccagtttatcgaagtgcgaattctggttgaacg 42430  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  42431 aagtgagttttcttggtcatattatttccggtagtggtatt 42471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5029 - 4691
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||  | || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  5029 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggtcacgttatggttactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 4930  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || || |||||||| ||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  4929 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtagttgtgtttattgatgacattctgatttattctaagac 4830  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| || |||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | |||     
T  4829 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaattgtgagttctggttaagtgaa 4730  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4729 gtcagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 4691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 87050 - 86711
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||  || ||| ||    
T  87050 atcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcgatgatgcctttcggtgttactaa 86951  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
     || || || || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| || || || ||| | ||||||||||||    
T  86950 cgcccctggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttgaatcgatttgttgttatgtttatagatgagattctaatatactctaag 86851  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     | || || ||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  86850 accgaggaggaacatgccgagcattt-aagaatgttttgcaagtgctgaaggagaataagttatatgcctagttatcgaagtgcgaattctggttgaacg 86752  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  86751 aagtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 86711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 2537 - 2869
Alignment:
Q  15 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 114  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||   || ||||||||    || |||||| || |  |    
T  2537 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgccttctggtgttacaaacgcgcttg 2636  T
Q  115 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 214  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  2637 gtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttgatttactccaagtctgagga 2736  T
Q  215 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 314  Q
    |||| ||||  |||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2737 agaacatgctgagcatttgaagactagtttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagagatgagt 2836  T
Q  315 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  2837 tttcttggccatgttatttctagtagtggtatt 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 151392 - 151052
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || || ||   ||  |||||||||  || ||  ||    
T  151392 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttatgaa 151293  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || ||  ||||||| || ||||| |||    
T  151292 tgcacttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgataatattttaatttactccaag 151193  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  151192 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggtgttgcaagtgttgaaagagaataagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttgaaag 151093  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| ||||| || ||| | ||||||||||||| ||||    
T  151092 aagtgagctttctaggacatgtaatttctggtagtggtatt 151052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 7111 - 7446
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||   || |||| | |||  || ||||||    
T  7111 atcaccagattaaagtgaaagatggagatatgcagaagacaacttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgtcgttcggtgttacaaa 7210  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||  | ||||| ||||| || || |||||| | ||||| |||    
T  7211 tgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgaatctttcatgcatttttggatcgtttcatggttgtattcatcgatgacattttggtttactccaag 7310  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7311 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 7410  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7411 aggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtg 7446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 173 - 342
Target Start/End: Original strand, 115171 - 115340
Alignment:
Q  173 tgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatat 272  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  115171 tgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagtagttatat 115270  T
Q  273 gccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  115271 gccaagttgtcaaagtgtgaattttggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtg 115340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Original strand, 115062 - 115163
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| || || |||||  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||  || ||||||    
T  115062 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatccagaagatggcctttaggacacgttatggacattacgaatattgagtgatgcctttcggtgttacaaa 115161  T
Q  107 tg 108  Q
    ||    
T  115162 tg 115163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6153 - 5825
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| ||||||| |  ||||| |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||||||    
T  6153 atcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaa 6054  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  6053 tgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaag 5954  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    || ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  5953 tccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaattctggttgaaag 5854  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  5853 aggtaagttttcttggccacgttatttct 5825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13283 - 12955
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| ||||||| |  ||||| |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||||||    
T  13283 atcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaa 13184  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  13183 tgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaag 13084  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    || ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  13083 tccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaattctggttgaaag 12984  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  12983 aggtaagttttcttggccacgttatttct 12955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3714 - 3373
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || |  || |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  3714 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttactaa 3615  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  3614 ttcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaac 3515  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| |    
T  3514 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaattgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 3415  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatta 348  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3414 aagtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatta 3373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Original strand, 839 - 1163
Alignment:
Q  13 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 112  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || || || || |||||   || ||||||||||  || ||||||||||||    
T  839 agattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacc 938  T
Q  113 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 212  Q
     || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||  ||||| ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  939 tggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgttttcatagatggtattttgatttactccaagtctgaa 1038  T
Q  213 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga 312  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1039 gaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtga 1138  T
Q  313 gttttcttggccatattatttctgg 337  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||    
T  1139 gttttcttggacatgttatttctgg 1163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 56037 - 55697
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| || || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  56037 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 55938  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || || || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  55937 tgcccctggagtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaag 55838  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     |||| |||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  55837 actgaggaagaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaag 55738  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  55737 aggtgagttttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 55697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40914 - 40574
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |  || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  40914 atcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 40815  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||    
T  40814 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacattttaatttactccaag 40715  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     | || |||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| |    
T  40714 accgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 40615  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  40614 aggtgagttttcttggccatgttatttatggtagtggtatt 40574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 74634 - 74294
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |  || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  74634 atcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 74535  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||    
T  74534 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacattttaatttactccaag 74435  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     | || |||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| |    
T  74434 accgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 74335  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  74334 aggtgagttttcttggccatgttatttatggtagtggtatt 74294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 8948 - 9178
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | || |||||| ||||| | |||||||||||  | |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  8948 aatgcaccaggtgtctttatgggatacatgaatagaatatttcatccttatctggatcgttttgtgatggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 9047  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||  ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  9048 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaactagttatgtgttaagttatctaagtgtgagttttggttgaa 9147  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  9148 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 9178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 50618491 - 50618831
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| || || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  50618491 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 50618590  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || || || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  50618591 tgcccctggagtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaag 50618690  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     |||| |||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  50618691 actgaggaagaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaag 50618790  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  50618791 aggtgagttttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 50618831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21751207 - 21750876
Alignment:
Q  6 catcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaa 105  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||| || ||   ||  ||||||||   || ||| |    
T  21751207 catcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacaacttttaggacgcggtatggacattatgagtataaagttatgccttttggtgttacta 21751108  T
Q  106 atgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 205  Q
    |||| |  || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  21751107 atgctcttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttaatttactccaa 21751008  T
Q  206 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaat 305  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||     
T  21751007 gtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaaaagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttaaaa 21750908  T
Q  306 gaggtgagttttcttggccatattatttctgg 337  Q
    || || | ||||||||| ||| ||||||||||    
T  21750907 gaagtaatttttcttggacatgttatttctgg 21750876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 51331586 - 51331914
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  51331586 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 51331685  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  51331686 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 51331785  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  51331786 actgaagaagaacatgcggagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 51331885  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  51331886 aagtgagttttctaggccatgttatttct 51331914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 33389122 - 33389449
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  33389122 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 33389221  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  33389222 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 33389321  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  33389322 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 33389421  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  33389422 aagtgagttttctaggccatgttatttc 33389449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20140254 - 20140009
Alignment:
Q  102 acaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatact 201  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  20140254 acaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttttggttgttttcattgatgatattttgatttact 20140155  T
Q  202 ctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggtt 301  Q
    | ||| ||||||||||| ||||  | || |||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  20140154 ccaagactgaagaagaacatgctgatcacttgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctctatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtt 20140055  T
Q  302 gaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||  | ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  20140054 gaaaaaagtgagctttcttggccatgttatttctcgtagtggtatt 20140009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 347
Target Start/End: Original strand, 430289 - 430549
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  430289 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatg 430388  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || || || ||    
T  430389 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaa 430488  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  430489 gtgtgaattctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttctggtagtggtatt 430549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 22360337 - 22360677
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  22360337 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaa 22360436  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||  ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  22360437 tgcaccttgagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattttaggatcggttcgtcgttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 22360536  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||| | | | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22360537 tctgaagaagaacctgctgagcatttgaaactggttttgcaggtgttgaaagagaagatgatttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 22360636  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22360637 aagtgagctatcttggacatgttatttctggtagtggtatt 22360677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21832568 - 21832237
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |  || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  21832568 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 21832469  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||  || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  21832468 tgcacatggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 21832369  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21832368 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 21832269  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21832268 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 21832237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21839216 - 21838885
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  21839216 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 21839117  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  21839116 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 21839017  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21839016 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 21838917  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21838916 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 21838885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 21862466 - 21862792
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || | |||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  21862466 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatgcacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaa 21862565  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||  |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||    
T  21862566 tgcacctagtgtgtttatggagcacatgaatcgcatttttcatgcatttttggaccgtttcgtggttgtttttattgatgacattttaatttactccaag 21862665  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     |||| |||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||| | ||||| || || || |||||||||||||||||||| |    
T  21862666 actgaggaagaacatgctgagcatttgaagatggttttgcaagtgttcaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 21862765  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattattt 333  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21862766 aggtgagttttcttggacatgttattt 21862792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 17043108 - 17043439
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  17043108 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 17043207  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  17043208 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 17043307  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     || |||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17043308 actaaagaagaacatgctgagcatatgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaag 17043407  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17043408 aagtaagttttcttggccatgttatttctggt 17043439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 20833995 - 20834333
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | |||||||||   || ||| ||||    
T  20833995 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttaggtgttactaatg 20834094  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | |  ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  20834095 cgcgtggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattcaaagac 20834194  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||| ||||  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||     
T  20834195 tgaagaagaacatgcagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaggttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttatgtgaa 20834294  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20834295 gcgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 20834333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 21743647 - 21743985
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  21743647 catcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 21743746  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| |||||  | || || || || |||||| |    
T  21743747 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttaatttattctaagac 21743846  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||     
T  21743847 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaa 21743946  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21743947 gtaagtcttcttggccacattatttctggtagtggtatt 21743985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 16348688 - 16349016
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaat-gctacaa 105  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||     | ||| |    
T  16348688 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgggagttacca 16348787  T
Q  106 atgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 205  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  16348788 atgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaa 16348887  T
Q  206 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaat 305  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  16348888 gactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaa 16348987  T
Q  306 gaggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    || ||||||||||| || ||| |||||||    
T  16348988 gaagtgagttttctaggtcatgttatttc 16349016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19108536 - 19108303
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || || || | ||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  19108536 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccacgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgatattttgatttactcta 19108437  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19108436 agactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 19108337  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19108336 agaagtgagttttcttggccatgttatttctggt 19108303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 20854855 - 20855184
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  20854855 catcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 20854954  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||||||||| || |||||  |    
T  20854955 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaaaac 20855054  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  | || |||||| |||| |||||  |  |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||     
T  20855055 tgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 20855154  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20855155 gtgagttttctaggccatgttatttctggt 20855184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 31538090 - 31538430
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  31538090 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 31538189  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  31538190 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 31538289  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  31538290 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 31538389  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  31538390 aagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 31538430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 21233824 - 21234155
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  |  ||    
T  21233824 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgatcaa 21233923  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||  | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||    
T  21233924 tgcacctcgagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaag 21234023  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21234024 actgaagaagaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 21234123  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21234124 aagtaagttttcttggccatgttatttctggt 21234155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 41351755 - 41352082
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  41351755 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaa 41351854  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||  || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  41351855 tgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 41351954  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  41351955 actgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 41352054  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||    
T  41352055 aagtgagttttcttggtcatgttatttc 41352082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 19661231 - 19661569
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  19661231 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctctaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19661330  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  |||||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || || | | |    
T  19661331 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaggac 19661430  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  19661431 tgaagaagagcatgcatagcatctgaagattgtattgtaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 19661530  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19661531 gtgagttttcctggccacattatttctggtagtggtatt 19661569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16378355 - 16378150
Alignment:
Q  13 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 112  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||    
T  16378355 agattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcc 16378256  T
Q  113 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 212  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| |||    
T  16378255 tggtgtgttcatggagtacatgaatcgaatttttcatgtgtttttggatcgtttcgtggttgtgtttattgatgacattttgatatacttcaagtccgaa 16378156  T
Q  213 gaagaa 218  Q
    ||||||    
T  16378155 gaagaa 16378150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48425170 - 48424830
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  48425170 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 48425071  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  48425070 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 48424971  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  48424970 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 48424871  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  48424870 aagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 48424830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52988038 - 52987698
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  52988038 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 52987939  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  52987938 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 52987839  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  52987838 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 52987739  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  52987738 aagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 52987698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 24792709 - 24793040
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   ||  || ||    
T  24792709 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaaggtatgccttttggtgtgaccaa 24792808  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  24792809 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 24792908  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| |    
T  24792909 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaag 24793008  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24793009 aagtaagttttcttggccatgttatttctggt 24793040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 20829583 - 20829813
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  20829583 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 20829682  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  20829683 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 20829782  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  20829783 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 20829813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41308775 - 41308599
Alignment:
Q  171 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 270  Q
    |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |    
T  41308775 gttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgt 41308676  T
Q  271 atgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41308675 atgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 41308599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 38910919 - 38911259
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||    
T  38910919 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaa 38911018  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||||||   | |||   |||||||| || || ||||| |||||||| || || || |||    
T  38911019 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccaaattttccatgctttcctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattttaatctattccaag 38911118  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| | ||    
T  38911119 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtcgaaatgtgagttctggttaagtg 38911218  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  38911219 aagtgagctttctgggtcatattatttctggtagtggtatt 38911259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 20938158 - 20938496
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  20938158 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 20938257  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || |||   || || |||||||| ||||| || | | |||| || || ||| |    
T  20938258 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacagtctgatttattcgaagac 20938357  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  |||   ||||| |||   | || || |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  20938358 tgaagaagagcatgtagagcatctgagaatagtattacaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaattgaa 20938457  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20938458 gtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 20938496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 24097698 - 24098036
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  24097698 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatgaacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 24097797  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||| | | |||   || || || || || ||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  24097798 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatctattctaagac 24097897  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  |  || ||||| |||| ||| ||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  24097898 tgaagaggagcatgcagaaaatctgaagattgtattgtaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaa 24097997  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  24097998 gtgagttttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 24098036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19856569 - 19856231
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  | || |||||    | ||||||||||  || |||  |||    
T  19856569 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggttactatgaatataaggtgatgcctttcgttgttactcatg 19856470  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || || |||||||| ||||  || |||||||| || |||||| |    
T  19856469 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgtgtttattggtgacattttgatttattctaagac 19856370  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  |||   | ||| ||||| | || |||||| |  | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | |||     
T  19856369 tgaagaagagcatgaagaacatctgaagatagtattgcaaatattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttctagttaagtgaa 19856270  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19856269 gtgagtttccttggccacattatttctggtagtggtatt 19856231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20296676 - 20296338
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  20296676 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 20296577  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||      
T  20296576 cgcctggtgtgttcatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattctaagaa 20296477  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| | |   |||| ||||||||| |||| || || |  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||     
T  20296476 tgaagaggagcatgcagagcatctaagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 20296377  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  20296376 gtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 20296338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37679346 - 37679006
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  37679346 atcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 37679247  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  37679246 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 37679147  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| ||  |  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||   ||    
T  37679146 aatgaggagaagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaattctggttaggtg 37679047  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || |||||| | || || |||||||||||||||| ||||    
T  37679046 aagtaagttttttgggtcacattatttctggtagtggtatt 37679006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21026275 - 21026108
Alignment:
Q  171 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 270  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |    
T  21026275 gttgttttcatcgatgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttt 21026176  T
Q  271 atgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||| ||  | || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21026175 atgctaaaatatctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagtttttttggccatgttatttctggt 21026108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Original strand, 22503382 - 22503701
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  ||| |||||  || ||| ||    
T  22503382 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgtctttcggtgttaccaa 22503481  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  22503482 tgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcggggttgttttcatcgatgatattttgatttactccaag 22503581  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||||||||||| |    
T  22503582 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaaatatctaagtgtgagttctggttgaaag 22503681  T
Q  307 aggtgagttttcttggccat 326  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  22503682 aggtaagttttcttggccat 22503701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16378156 - 16378076
Alignment:
Q  259 agaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16378156 agaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggttagttttcttggccatgttatttctggta 16378076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21953173 - 21952844
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  21953173 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 21953074  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||      
T  21953073 cgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaa 21952974  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
     ||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||     
T  21952973 cgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagcgaa 21952874  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    ||||| ||||| || || ||||||| ||||    
T  21952873 gtgagctttctgggtcacattatttatggt 21952844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20927222 - 20927005
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | ||  ||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  20927222 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacagttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 20927123  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  |||   ||||||||| | |||| ||||||||  |||| |||||  |||||| ||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  20927122 agtctgaggaagagcatgatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaatcagttatgtgctaagttatctaagtgtgagttttggttgaa 20927023  T
Q  305 tgaggtgagttttcttgg 322  Q
     || |||| ||| |||||    
T  20927022 ggaagtgattttccttgg 20927005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 347
Target Start/End: Original strand, 23196573 - 23196682
Alignment:
Q  238 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 337  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || || |||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||| |||    
T  23196573 ttgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttatgg 23196672  T
Q  338 tagtgatatt 347  Q
    ||||| ||||    
T  23196673 tagtggtatt 23196682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 41310821 - 41310766
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtta 64  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41310821 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtta 41310766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22116880 - 22116839
Alignment:
Q  306 gaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22116880 gaggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 22116839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11108 - 10770
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  11108 catcagattaaagtgaaagaaaaagatatgcagaaaacggcctttaagacacgatacgggcattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttaccaatg 11009  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  11008 cgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcaatttgtagttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 10909  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  || |  ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||     
T  10908 tgaagaagagcatacagagcatttaaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 10809  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10808 gtaagttttcttggccatatcatttctggtagtggtatt 10770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 347
Target Start/End: Original strand, 38070 - 38312
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  38070 aatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactaca 38169  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38170 agtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 38269  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
     || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  38270 agaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 38312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Original strand, 176374 - 176708
Alignment:
Q  13 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 112  Q
    |||||||| | || |||||||||||| | || ||| | ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||  || ||| ||||| ||    
T  176374 agattaaagtaaaagatgaagatatgcataaaacgacctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatatctttcggtgttactaatgcgcc 176473  T
Q  113 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 212  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  176474 tggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgttgttgtatttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaa 176573  T
Q  213 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga 312  Q
    |||||  ||||  ||||||| ||| |||| ||| ||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || |    
T  176574 gaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgtaagtgttgaatgaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaa 176673  T
Q  313 gttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  176674 attttcttggccatattatttatggtagtggtatt 176708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 348
Target Start/End: Original strand, 803 - 1141
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||    
T  803 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaa 902  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  903 tgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaag 1002  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    ||||||||| |   |||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||  |    
T  1003 tctgaagaaca---tgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgagag 1099  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatta 348  Q
    | ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||    
T  1100 aagtgagctttcttggacatgttatttttggtagtggtatta 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 85254 - 85594
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  85254 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacgaa 85353  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || | ||| |||    
T  85354 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatttcctccaag 85453  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  85454 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagcttgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttgaaag 85553  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  85554 aagtgagctttcttggacatgttatttcaggtagtggtatt 85594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 85820 - 86144
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  85820 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 85919  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || ||||| || || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||    
T  85920 tgcacctggagtgtttatagagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgttttcatcgatgacattttgatttactccaag 86019  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| |    
T  86020 actgaagaagaacatattgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 86119  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattat 331  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||    
T  86120 aggtaagttttcttggccatgttat 86144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 261 - 1
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  261 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatg 162  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || || || ||    
T  161 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaa 62  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  61 gtgtgaattctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttctggtagtggtatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12073 - 11735
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  12073 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 11974  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||||||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||      
T  11973 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaa 11874  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  11873 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttgagtgaa 11774  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11773 ttaagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 11735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16923 - 16583
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  16923 atcaccagattaaagtgaaaggtgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaa 16824  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||   ||| ||||| || || || || || || || ||||||||||| ||||| |||    
T  16823 tgcaccaggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcggttcgtggtggtttttatcgatgatattttgatttactccaag 16724  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |    
T  16723 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaattgcgaattctggttgaaag 16624  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  16623 aagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 16583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17931 - 17596
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| || || || |||||||| || ||    | ||||||||||  || ||||||    
T  17931 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaa 17832  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||     ||| ||||  ||     
T  17831 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcaatgatgat-----gatttacttcaat 17737  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| |    
T  17736 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaatctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 17637  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17636 aagtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 17596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20520 - 20180
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || || || |||||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||    
T  20520 atcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaa 20421  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||  | || |||||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  20420 tgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcatatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 20321  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20320 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 20221  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |  |||| |||||||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  20220 aattgagctttcttggacatgctatttctggtagtggtatt 20180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31227 - 30887
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  31227 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacaaa 31128  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||  | ||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  31127 tgcacctagagtatttatggagtgcatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcatggttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 31028  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    ||| || ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  31027 tcttaataagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 30928  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  30927 aagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 30887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 51090 - 50759
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  51090 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 50991  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||| ||| | |||   ||| | |||||||| ||||| || || || || || |||| | |    
T  50990 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaatagaatttttcatgcctatctggataaatttttggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctatgac 50891  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||     
T  50890 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattcttgttaagtgaa 50791  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtag 340  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50790 gtaagttttcttggccatattatttctggtag 50759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9220 - 8889
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  9220 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 9121  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  9120 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 9021  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  9020 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 8921  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8920 aagtgagttttctaggccatgttatttctggt 8889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 101 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7409 - 7163
Alignment:
Q  101 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 200  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  7409 tacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttac 7310  T
Q  201 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 300  Q
    || ||| | || |||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  7309 tccaagaccgaggaagaacatgttgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggt 7210  T
Q  301 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  7209 taaaagaagtgagttttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 7163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 347
Target Start/End: Original strand, 1486 - 1746
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||| | ||  | ||||| |||||||| |    
T  1486 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatg 1585  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  1586 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 1685  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  1686 gtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttgtacatgttatttctggtagtggtatt 1746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1048 - 708
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||    
T  1048 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaa 949  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||| ||||  |||    
T  948 tgcgcctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttacttcaag 849  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  848 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaacctttatgcgaaattgtctaagggtgaattctggttgaaag 749  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  748 aagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 24969 - 25309
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  24969 atcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacaatatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 25068  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  25069 tgcacctgaagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttctttttattgacgatattttgatttactccaag 25168  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      ||| |||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| |    
T  25169 attgaggaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagataagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 25268  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |  |||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||    
T  25269 aattgagttttcttggatatgttatttctgttagtggtatt 25309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7030 - 6691
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  7030 catcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 6931  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || | ||| ||||| || || ||||| || ||||||||||||| | |   |   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  6930 cgcctgatgtgtttatagagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctgattaaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 6831  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||| |||||  |||   | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||     
T  6830 tgaggaagagcatgtagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 6731  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatta 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6730 gtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatta 6691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45433 - 45106
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||  | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  45433 atcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 45334  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||  | ||||||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  45333 tgcacctagagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 45234  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  45233 actgaagaagaacatgctgatcatctgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaaaaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 45134  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45133 aggtgagttttcttggccatgttatttc 45106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10756 - 10428
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||| |||||||| |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  10756 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacgactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 10657  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  10656 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaag 10557  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||| ||||| ||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |    
T  10556 actgaaaaagaacatgctgagcatctaaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgagag 10457  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10456 aagtgagtttccttggccatgttatttct 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17218 - 16890
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  17218 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 17119  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||| | || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  17118 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaag 17019  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |    
T  17018 actgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgagag 16919  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16918 aagtgagtttccttggccatgttatttct 16890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 48540 - 48878
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  48540 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttagcacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 48639  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |    
T  48640 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaac 48739  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||     
T  48740 tgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaa 48839  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48840 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 48878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4118
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata--atcagc-gatgcctttcaatgctacaa 105  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  || ||  ||||||||||  || ||| |    
T  4459 catcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataataaggtgatgcctttcggtgttacta 4360  T
Q  106 atgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 205  Q
    |||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| |||||  | || ||||| || | |||    
T  4359 atgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttgatttattataa 4260  T
Q  206 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaat 305  Q
    | ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |    
T  4259 gactgaagaagagcatgcataacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagt 4160  T
Q  306 gaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || || |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  4159 gaagtaagttttctgggccatatcatttatggtagtggtatt 4118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2149 - 1811
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  |||||| ||||    
T  2149 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgctactaatg 2050  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | ||  |||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||    |||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |    
T  2049 cgcctagtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaaattgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagac 1950  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||     
T  1949 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaa 1850  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1849 gtaagttttcttgaccatattatttctggtagtggtatt 1811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33614 - 33276
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  33614 catcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 33515  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||| |||   || || |||||||||||||| || || ||||| || |||||| |    
T  33514 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatttggataaattcgtggttgtgttcattgatgacatcttgatttattctaagac 33415  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| | ||| |||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| | |||     
T  33414 tgaagaagagcatgcagaacatctaaagattgtattacaggtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgttaaaatgtgagttctagttaagtgaa 33315  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33314 gtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 33276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2996 - 2658
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  2996 catcagattaagtcgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacatgatatggacattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatg 2897  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| |    
T  2896 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagac 2797  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||     
T  2796 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgagttctggttaagtgaa 2697  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2696 gtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 2658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35778 - 35446
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  35778 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 35679  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||  |||| || |||||||| || ||||| |||    
T  35678 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttctcatcgatgatattttaatttactccaag 35579  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     | ||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| |    
T  35578 accgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaag 35479  T
Q  307 aggtga-gttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  35478 aggtaaggttttgttggccatgttatttctggt 35446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Original strand, 50206 - 50536
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||      
T  50206 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaca 50305  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| |    
T  50306 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagac 50405  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
     ||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||| | |||     
T  50406 ggaagaagagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctagttaagtgaa 50505  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  50506 gttagctttcttggccatattatttttggta 50536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Original strand, 59240 - 59570
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||      
T  59240 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaca 59339  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| |    
T  59340 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagac 59439  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
     ||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||| | |||     
T  59440 ggaagaagagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctagttaagtgaa 59539  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  59540 gttagctttcttggccatattatttttggta 59570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Original strand, 65628 - 65958
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||      
T  65628 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaca 65727  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| |    
T  65728 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagac 65827  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
     ||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||| | |||     
T  65828 ggaagaagagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctagttaagtgaa 65927  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  65928 gttagctttcttggccatattatttttggta 65958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28902 - 28564
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  28902 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 28803  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || |||||  ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  28802 cgcctggtgtgcttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 28703  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| | || ||| ||||| ||||||| || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||     
T  28702 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgaaagtgttgaaagaaaagaagttgtctgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttagatgaa 28603  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  28602 gtaagttttgttggccacattatttatggtagtggtatt 28564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 2979 - 3317
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  2979 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 3078  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   || || |||||||| ||||| || ||  | || || || ||| |    
T  3079 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcctaatttattcaaagac 3178  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  3179 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtttagtgaa 3278  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3279 gtttgttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 69650 - 69312
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  69650 catcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 69551  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   || || || || || ||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  69550 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatttattctaagac 69451  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  | |  |||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||| | |||     
T  69450 tgaagaggagcatgcagaacgcttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttcttgttaagtgaa 69351  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  69350 gtgagttttctaggccacgttatttctggtagtggtatt 69312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 99588 - 99926
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  99588 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 99687  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || ||| |||| || ||||   |    
T  99688 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattctagaac 99787  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  99788 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaaaagttatatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 99887  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  99888 gtgagttttctgggccacattatttctggtagtggtatt 99926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 55886 - 56211
Alignment:
Q  22 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||   |  ||||||||||  || ||| ||||| || ||||||||    
T  55886 tgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaattgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatt 55985  T
Q  122 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 221  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||||| | | |||   ||| | ||||| |||||||| || ||  | || || || ||| ||||||| ||  ||    
T  55986 catggagtatatgaaccgtatttttcatgcttttctggataagtttatggttgtattcattgatgacatcctaatttattccaagactgaagaggagcat 56085  T
Q  222 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 321  Q
    ||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||     
T  56086 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttctta 56185  T
Q  322 gccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  56186 gccacattatttctggtagtggtatt 56211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 47060 - 47398
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  47060 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 47159  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||| | || ||||| |  ||||| ||||| ||| |||||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || | ||||      
T  47160 cgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccaaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattttaagaa 47259  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| || || |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| | |||     
T  47260 tgaagatgagcatgcagagcatctgcagattgtattgcaagtgttgaaagaaaaaaagttgtatgcgacgttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaa 47359  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47360 gtaggttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 47398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 347
Target Start/End: Original strand, 6436 - 6695
Alignment:
Q  88 tgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacga 187  Q
    ||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || ||    
T  6436 tgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcgtttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatga 6535  T
Q  188 tattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaag 287  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||    
T  6536 tattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaag 6635  T
Q  288 tgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| || ||| | |||||||| ||| ||||| || |||||| ||||    
T  6636 tgcgaattctggttgaaagaagtgtgctttcttggacatgttattgctagtagtggtatt 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 11263 - 11594
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  11263 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 11362  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  11363 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 11462  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  11463 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 11562  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11563 aagtaagttttcttggccatgttatttctggt 11594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 50259 - 50032
Alignment:
Q  120 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 219  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  50259 tttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaac 50160  T
Q  220 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 319  Q
    |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||    
T  50159 atgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattttggttgaaagaagtgggctttct 50060  T
Q  320 tggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  50059 tggacatgttatttctcgtagtggtatt 50032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 53837 - 53635
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||| ||| |    
T  53837 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatg 53738  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  53737 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 53638  T
Q  287 gtg 289  Q
    |||    
T  53637 gtg 53635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31084 - 30833
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || ||||| ||||| || |    
T  31084 atgcctttcgatgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcatcgaag 30985  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||| ||| | ||||| || ||  | ||||| || || || ||    
T  30984 atattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaa 30885  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30884 gtgtgagttctggttgaaagaggtcagttttcttggccatgttatttctggt 30833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36550 - 36298
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| |||| |||||| ||||| || ||||| |    
T  36550 atgcctttcgatgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatctttttgtggttgtttttattgatg 36451  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||| ||| | ||||| || ||  | ||||| || || || ||    
T  36450 atatttttatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaa 36351  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtga-gttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  36350 gtgtgagttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttctggt 36298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 10083 - 10421
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  10083 catcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttgggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 10182  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | ||  |||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||  |||||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| |    
T  10183 cgcctagtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagac 10282  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  10283 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaa 10382  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10383 gtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 10421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Original strand, 49905 - 50239
Alignment:
Q  13 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || || ||||| |||||    | |||||||||| ||| ||| ||||| ||    
T  49905 agattaaggtgaatgatgaggatatgcagaatacgccctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcgatgttactaatgcgcc 50004  T
Q  113 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 212  Q
     ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |||||    
T  50005 tggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaa 50104  T
Q  213 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga 312  Q
    |||||  ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| || |    
T  50105 gaagagcatgcagagcatctgaagattgtgtttcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattcttgttaagtgaagtaa 50204  T
Q  313 gttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50205 gttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 50239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 262504 - 262166
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  262504 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 262405  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||| ||||  | | | |||   ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || |||||| |    
T  262404 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcctaatttattctaagac 262305  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    | |||| ||  ||||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||     
T  262304 taaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaa 262205  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  262204 gtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 262166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16440 - 16113
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||  || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  16440 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttgtggtcactatgaatataaagttatgcctttccgtgtgaccaa 16341  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16340 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgatattttgatttactccaag 16241  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16240 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaaatttatgctaacttgtctaagtgtgaattctggttgaaag 16141  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    |  | ||||||||||||||| |||||||    
T  16140 aattaagttttcttggccatgttatttc 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2605 - 2375
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  2605 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 2506  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagtt-gtcaaagtgtgaattctggttga 303  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  2505 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaataacctttatgctaacttggtctaagtgtgaattctggttga 2406  T
Q  304 atgaggtgagttttcttggccatattatttc 334  Q
    | ||  | ||||||||||||||| |||||||    
T  2405 aagaattaagttttcttggccatgttatttc 2375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 2298 - 2636
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||    
T  2298 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatg 2397  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||||||      
T  2398 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagaa 2497  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| || | ||||||||| | ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||     
T  2498 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttaagtgaa 2597  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  2598 gtaagttttcttggccacattatttatggtagtggtatt 2636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16392 - 16054
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  16392 catcagattaaggtgaaggatgaggatttgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 16293  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||| | |    
T  16292 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacggaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctacgac 16193  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||     
T  16192 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaa 16093  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16092 gtaagttttcttggccatattatttatggtagtggtatt 16054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Original strand, 7983 - 8213
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||| | || ||||| || || ||||||||  | || || |    
T  7983 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttttggtggtgtttatagatgatattttagtgtattcga 8082  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    |||| || |||||  |||   ||||| ||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||  || ||||||||    
T  8083 agtcggaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgtgttttggttgaa 8182  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  8183 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 8213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 21541 - 21879
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    | ||||||||||  |  ||| ||||    
T  21541 catcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatg 21640  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| |    
T  21641 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcgaagac 21740  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
     ||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||     
T  21741 agaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 21840  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21841 gtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 21879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 13362 - 13700
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    | ||||||||||  |  ||| ||||    
T  13362 catcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatg 13461  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| |    
T  13462 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcgaagac 13561  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
     ||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| | |||     
T  13562 agaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcaaaattgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 13661  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13662 gtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 13700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19632 - 19302
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  19632 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19533  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || || ||    ||||| ||||||||| |||||   ||||| ||| |||| ||||| || || || || || |||||| |    
T  19532 cgcctggtgtgtttatggagtatataaacaaaattttccatgcttatctagataaatttgtggttatgtttattgatgacatcttaatttattctaagac 19433  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
     ||||| ||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||     
T  19432 cgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaa 19333  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19332 gtaagttttcttggccacattatttctggta 19302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 335
Target Start/End: Original strand, 25032 - 25129
Alignment:
Q  238 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||  |||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  25032 ttgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgcaaagttatctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 25129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 29311 - 29649
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||    
T  29311 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatg 29410  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||||||      
T  29411 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagaa 29510  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| || | ||||||||| | ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||     
T  29511 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttaagtgaa 29610  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  29611 gtaagttttcttggccacattatttatggtagtggtatt 29649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 49384 - 49046
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||   | ||| ||||    
T  49384 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatg 49285  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||    ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  49284 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 49185  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | | |     
T  49184 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtcaa 49085  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  49084 gtaagttttcttggccatatcatttatggtagtggtatt 49046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 53325 - 52987
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    | ||| |||||| ||| ||| ||||    
T  53325 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaaggtgatacctttcgatgttactaatg 53226  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
      || ||| | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||| |    
T  53225 tgcctggtttgttcatggagtatatgaaccggattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgatattctgatttattctaagac 53126  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  53125 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgttaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 53026  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53025 gtgagttttctgggccacattatttctggtagtggtatt 52987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 109910 - 109572
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  109910 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 109811  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
      ||  |||| |||||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||| |||||   ||||| |||||||| ||||| || ||  |||| || |||||| |    
T  109810 tgcctagtgtgtttatggagtctatgaaccgaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcgtgatttattctaagac 109711  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| | |||     
T  109710 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgcgagttctggttaagtgaa 109611  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  109610 gtaagttttcttggccatattatttcttgtagtggtatt 109572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 338
Target Start/End: Original strand, 55020 - 55346
Alignment:
Q  12 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 111  Q
    ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| |||||||    
T  55020 cagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgatatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcac 55119  T
Q  112 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 211  Q
    | || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| | ||| ||||  ||||| ||||| ||  | || |||||||| || ||||| ||  ||||    
T  55120 ctggagtgtttatggagtaattgaatcgcatcttccatgcatttttggatccctttgtggttgtttttctggatgatatttttatttactccaatactga 55219  T
Q  212 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtg 311  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| |||||||||||  ||||     
T  55220 agaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtttaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaaaaggta 55319  T
Q  312 agttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  55320 agttttcttggccatgttatttctggt 55346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Original strand, 107835 - 108165
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||  ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  107835 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgtagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 107934  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||| ||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  107935 tgcacctggagtgtttatggagtatatgagtcgcatcttccatgcgtttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 108034  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
      |||||| ||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  108035 attgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 108134  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctgg 337  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  108135 aggtaagttttcttggccatgttatttctgg 108165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 114839 - 114501
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  114839 catcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 114740  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |    
T  114739 cgcctggtgtgttcatggaatatatgaatagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcaagaac 114640  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  114639 tgaggaagagcatgcagaacatctgatgattgtattgcaagtattgaaagagaagaaattgtatgccaaattgtcgaagtgcgagttctggttaaatgaa 114540  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  114539 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 114501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 94920 - 94990
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 79  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  94920 catcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcactacgaata 94990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 5115 - 5447
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagc-gatgcctttcaatgctacaaat 107  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || || | ||  |||| |||||  || ||| |||    
T  5115 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagta-taagatgatgtctttcggtgttactaat 5213  T
Q  108 gcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagt 207  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||     
T  5214 gcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaaga 5313  T
Q  208 ctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatga 307  Q
     |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||     
T  5314 atgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgg 5413  T
Q  308 ggtgagttttcttggccatattatttctggtagt 341  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5414 agtaagttttcttggccatattatttatggtagt 5447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9648 - 9319
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  9648 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 9549  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||    
T  9548 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatatttttatttactccaag 9449  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  9448 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 9349  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctg 336  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9348 aagtgagttttcttggccatgttatttctg 9319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40429 - 40104
Alignment:
Q  13 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 112  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |  || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||    
T  40429 agattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacc 40330  T
Q  113 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 212  Q
     || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| ||||| ||| |||||    
T  40329 tggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgacattttgatttactccaagactgaa 40230  T
Q  213 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga 312  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || |    
T  40229 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaa 40130  T
Q  313 gttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  40129 gttttcttggccatgttatttctggt 40104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 338
Target Start/End: Original strand, 14261 - 14480
Alignment:
Q  120 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttg-atatactctaagtctgaagaagaa 218  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||  || ||||| | | |||||||||||    
T  14261 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgatattttttatttactccatgactgaagaagaa 14360  T
Q  219 aatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttc 318  Q
     ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  14361 tatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttctaagtgtgaattctgtttgaaggaagtaagttttc 14460  T
Q  319 ttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  14461 ttggccatgttatttctggt 14480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8251 - 7991
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||  || |||||||| | ||| ||||| || ||  |||| |||||||| |    
T  8251 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtgcttgttttcattgatg 8152  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  8151 atattttgatttactccaagtttgaggaagaatatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 8052  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  8051 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttctggtagtggtatt 7991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17447 - 17187
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||  || |||||||| | ||| ||||| ||  |  |||| |||||||| |    
T  17447 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcttgcttgttttcattgatg 17348  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  17347 atattttgatttactccaagtttgatgaagaatattttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 17248  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  17247 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttctggtagtggtatt 17187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 652 - 393
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||| |  ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||  || || ||||| || ||| | |    
T  652 atgcctttcagttttactaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtagttgtttttatttatg 553  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||||| || ||    
T  552 atattttgatttactctaagtctgaagaagaacatatga-gcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaagttatctaa 454  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
     |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  453 ctgtgaattttggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttcttgtagtggtatt 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24491 - 24156
Alignment:
Q  12 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 111  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| |    
T  24491 cagattaaggtgaaggatgacgatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgc 24392  T
Q  112 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 211  Q
    | || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||| ||||    
T  24391 ctggggtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagactga 24292  T
Q  212 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtg 311  Q
    ||| ||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||     
T  24291 agaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagta 24192  T
Q  312 agttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  24191 agttttcttggccacattatttctggttgtggtatt 24156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 44443 - 44781
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  44443 catcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 44542  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||    ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |    
T  44543 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaaaaaattttccatgcatatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagac 44642  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    | |||||||  || | || ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||     
T  44643 taaagaagagcatacaaaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaa 44742  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  44743 gtaagttttcttggccccattatttctggtagtggtatt 44781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20804 - 20553
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  20804 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatg 20705  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | | |||||| ||  | ||||| || || || ||    
T  20704 atattttaatttactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaagagagaagaaactttatgctaaattatctaa 20605  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20604 gtgtgagttctggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 20553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36228 - 35977
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  36228 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatg 36129  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | | |||||| ||  | ||||| || || || ||    
T  36128 atattttaatttactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaatagagaagaaactttatgctaaattatctaa 36029  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36028 gtgtgagttctggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 35977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 338
Target Start/End: Original strand, 195531 - 195842
Alignment:
Q  27 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| |||||||| |  ||||||||||    
T  195531 gatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcaccagaagtatttatgg 195630  T
Q  127 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 226  Q
    | || |||||||| || || ||||| | | | ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  195631 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcgttttgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctga 195730  T
Q  227 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 326  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  195731 gcatctgaaggttgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccat 195830  T
Q  327 attatttctggt 338  Q
     | |||||||||    
T  195831 gtcatttctggt 195842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 58297 - 57966
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  58297 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 58198  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||    
T  58197 tgcacctggagtgtttatggattatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtagttgtgtttatcgatgacattttgatttactccaag 58098  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 306  Q
     ||||||||||| ||||   |||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  58097 actgaagaagaacatgctgtgcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 57998  T
Q  307 aggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  57997 aggtaagttttcttggccatgttatttctggt 57966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 338
Target Start/End: Original strand, 18321 - 18422
Alignment:
Q  238 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga-gttttcttggccatattatttctg 336  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||    
T  18321 ttgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttctg 18420  T
Q  337 gt 338  Q
    ||    
T  18421 gt 18422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 506 - 169
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  506 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaagaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatg 407  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||  | ||||| || ||||| || |||||||| || | || | |    
T  406 cgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcatggttgtatttattgatgacattttgat-tattttaggac 308  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  307 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgatttctggttaagtgat 208  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  207 gttagttttcttggccacattatttcttgtagtggtatt 169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 1511 - 1849
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| || | ||| || |||||    | |||  |||||  || ||| ||||    
T  1511 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggtctttaggacacgatatgaacactatgaatataaggtgatatctttcggtgttactaatg 1610  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  1611 cgcctggtgtgtttatggagtatataaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 1710  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  |  || ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  1711 tgaagaagagcatgcagaagatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaaatgaa 1810  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  1811 gttagttttcttggccacattatttatggtagtggtatt 1849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 880 - 1213
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  880 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 979  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || || |||| ||| ||||| || || ||||| || ||||||      
T  980 cgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgagtttattgatgacatcttgatttattctaagaa 1079  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||||||||| |||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||     
T  1080 tgaagaagagaatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattaaaggagaagaagttgtatgccaagttgtcgaagtgtgaattttggttaagtgaa 1179  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1180 gtgagttttcttggccacattatttctggaagtg 1213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8574 - 8314
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| || || || |    
T  8574 atgcctttcggtgttacgaatgcacctgtagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgatg 8475  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | |||||| || |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || |||   ||||| || ||||| ||    
T  8474 atattttgatttactccaagtctaaggaagaacattctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagaaaagaagcattatgcgaaattgtctaa 8375  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  8374 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctagtagtggtatt 8314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 5377 - 5714
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || || || |||||    | ||||| ||||  || ||| ||||    
T  5377 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatttcggtgttactaatg 5476  T
Q  109 c-accgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagt 207  Q
    | || | ||||  ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || |||     
T  5477 cgactgcgtgt--ttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaaga 5574  T
Q  208 ctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatga 307  Q
    ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||    
T  5575 ctgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtga 5674  T
Q  308 ggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
     || |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  5675 agtaagttttcttggccacattagttctggtagtggtatt 5714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 9808 - 10145
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || || || |||||    | ||||| ||||  || ||| ||||    
T  9808 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatttcggtgttactaatg 9907  T
Q  109 c-accgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagt 207  Q
    | || | ||||  ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || |||     
T  9908 cgactgcgtgt--ttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaaga 10005  T
Q  208 ctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatga 307  Q
    ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||    
T  10006 ctgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtga 10105  T
Q  308 ggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
     || |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  10106 agtaagttttcttggccacattagttctggtagtggtatt 10145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Original strand, 44846 - 44998
Alignment:
Q  186 gatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaa 285  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |    
T  44846 gatattttgatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaaatgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtcta 44945  T
Q  286 agtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44946 agtgtgacttctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctggt 44998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 347
Target Start/End: Original strand, 8876 - 9172
Alignment:
Q  51 tttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatg 150  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||    ||||| ||||    
T  8876 tttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtacatgaacttaattttccatg 8975  T
Q  151 cttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagt 250  Q
    ||||| | |||   ||||| || ||||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||  || | ||||||||    
T  8976 cttatctggataaatttgtggtcgtgtttattgatgatatctttatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagt 9075  T
Q  251 gctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9076 gttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttatgtgaagtgtgttttcttcgccatattatttctggtagtggtatt 9172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Original strand, 13240 - 13567
Alignment:
Q  12 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 111  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || ||||| || || || || || ||   ||  ||||||||   || ||| |||||||    
T  13240 cagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttttggtgttacgaatgcac 13339  T
Q  112 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 211  Q
      || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||  || |  || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13340 gtggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgatttaaaagatgatattttgatttactccaagtctga 13439  T
Q  212 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtg 311  Q
    ||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||    
T  13440 agaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttaaaagaagtg 13539  T
Q  312 agttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  13540 agctttcttggacatgttatttctggta 13567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 337
Target Start/End: Original strand, 23178 - 23428
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||    
T  23178 atgcctttcggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatcgacg 23277  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    | |||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||||||  |||| ||    
T  23278 acattttgatttactccaaaactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaactgtctaa 23377  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 337  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23378 gtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctgg 23428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Original strand, 31345 - 31675
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||      ||||||||||| || ||| ||||    
T  31345 catcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggagacgatatggacattacgaatacaagttgatgcctttcagtgttactaatg 31444  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| | | | |   ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || |||||| |    
T  31445 cgcctggggtatttatggaatatatgaaccgaattttccatgcttttctggttaaatttgtggtggtgtttattgatgatattctgatttattctaagac 31544  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| ||||| || | ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | |||     
T  31545 tgaagaggagcatgcagagcatctgaagattatattgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagctgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaa 31644  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  31645 gtgagttttctgggtcacattatttctggta 31675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 9487 - 9821
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  9487 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 9586  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  || ||    |||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||  ||| | |    
T  9587 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctaaat----ttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttaagctaggac 9682  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  || |  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  9683 tgaagaggagcatacagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 9782  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9783 gtaagatttcttggccacattatttctggtagtggtatt 9821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 19701 - 20035
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  19701 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 19800  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  || ||    |||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||  ||| | |    
T  19801 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctaaat----ttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttaagctaggac 19896  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  || |  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  19897 tgaagaggagcatacagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 19996  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19997 gtaagctttcttggccacattatttctggtagtggtatt 20035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 860 - 1198
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  860 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 959  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |  ||||| |||| || | | |||   ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||      
T  960 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgattttctggataaatttgttgttgtattcattgacgatattttaatctattccaagaa 1059  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||     
T  1060 tgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 1159  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  1160 gtgagttttctgggtcatattatttctggtagtggtatt 1198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25578 - 25348
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  25578 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 25479  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  25478 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 25379  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  25378 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 25348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28805 - 28467
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||| || ||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  28805 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 28706  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || |||||||||||||| || |||||  | ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || |||| |      
T  28705 cgcctggtgtatttatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaggaa 28606  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||||||| |  ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||     
T  28605 tgaagaaaagcatgcagagcatctgatgattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaaattgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 28506  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28505 gtaagttttcttggccatattatttatggtagtggtatt 28467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15092 - 14862
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  15092 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 14993  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  14992 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 14893  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  14892 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 14862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Original strand, 11296 - 11513
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  11296 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 11395  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||    ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||| |  |||||||| || ||||||||    
T  11396 agtctgaggaagagcataatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttatataagtgtgagttttggttgaa 11495  T
Q  305 tgaggtgagttttcttgg 322  Q
     || |||||||| |||||    
T  11496 ggaagtgagtttccttgg 11513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 250900 - 250562
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  250900 catcagattaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 250801  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  250800 cgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 250701  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | |||     
T  250700 tgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaa 250601  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  250600 gtgagttttctgggtcacattatttctggcagtggtatt 250562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 335
Target Start/End: Original strand, 64639 - 64860
Alignment:
Q  114 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 213  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||| ||||||    
T  64639 ggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcaaagactgaag 64738  T
Q  214 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 313  Q
    ||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || ||    
T  64739 aagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaaaagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaag 64838  T
Q  314 ttttcttggccatattatttct 335  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  64839 ttttcttggccacattatttct 64860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 64545 - 64615
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 79  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||    
T  64545 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgtcctttaggacacgatatggtcattacgaata 64615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2881 - 2637
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||  ||||||| || || || ||||| || ||||||  || |||||| |||| || ||||||    
T  2881 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatccagaagacaccttttagaacgcgatatggacactatgaataaaaagtgatgccgttcagtgttacaaa 2782  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 206  Q
    ||||||  | || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||  ||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  2781 tgcacctcgagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttgaatcatttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactgcaag 2682  T
Q  207 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtg 251  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  2681 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtg 2637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 347
Target Start/End: Original strand, 18445 - 18705
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||  || || ||||| || || || |    
T  18445 atgcctttcggtgttacgaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtggttgtttttatcgatg 18544  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    |||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  ||| | ||||| || ||||| ||    
T  18545 atattttgatttaccccaagtttgaagaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttaaaagagatgaagctttatgcgaaattgtctaa 18644  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  18645 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttatggtagtggtatt 18705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22154 - 22102
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacg 61  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22154 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacg 22102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 338
Target Start/End: Original strand, 444 - 695
Alignment:
Q  87 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 186  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||  | ||||||||||| || |    
T  444 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcttagttgtgttcatcgatg 543  T
Q  187 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 286  Q
    ||| ||||||  |||| ||| || |||||||| ||||  ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || |||||    
T  544 ataatttgattgactccaagactaaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcctgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaa 643  T
Q  287 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    |||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  644 gtgtgagttctggctgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41976 - 41639
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||   | ||| ||||    
T  41976 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaatacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggagttactaatg 41877  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||      
T  41876 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttgcatgcttatatggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagaa 41777  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || || ||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||    ||     
T  41776 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaa-gaaaagaagttgtatgacaagctgtccaagtgtgaattctggttacgcgaa 41678  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41677 gtaagttttcttggccatattatatctggtagtggtatt 41639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Original strand, 51389 - 51624
Alignment:
Q  27 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 126  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||  | ||||||||||    
T  51389 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagtcatgccttttggtgttaccaatgcacctcgagtatttatgg 51488  T
Q  127 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 226  Q
    | || |||||||| || ||||||||   ||| ||||  ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  51489 agtatatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcactttgtggttgttttcatcgatgacattttgatttactccaagactgaagaagaagatgctga 51588  T
Q  227 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 262  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  51589 gcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 51624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 31703 - 32041
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  31703 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 31802  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |    
T  31803 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaac 31902  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||     
T  31903 tgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaa 32002  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32003 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 32041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42433 - 42212
Alignment:
Q  114 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |||||||| |    
T  42433 ggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgagg 42334  T
Q  214 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 313  Q
    ||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||    
T  42333 aagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgag 42234  T
Q  314 ttttcttggccatattatttct 335  Q
    ||| ||||| ||| | ||||||    
T  42233 tttccttggtcatgtgatttct 42212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 54437 - 54507
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 79  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54437 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaata 54507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 347
Target Start/End: Original strand, 55149 - 55264
Alignment:
Q  232 tgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattat 331  Q
    ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |  || || ||||| | ||| || |||||||||||||| |||||    
T  55149 tgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaaataagagttttggttaagtgaagtaagttttcttggccacattat 55248  T
Q  332 ttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| ||||    
T  55249 ttctggtagtggtatt 55264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 936
Alignment:
Q  114 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 213  Q
    ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| ||||||    
T  1169 ggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaag 1070  T
Q  214 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 313  Q
    ||||  ||||  | ||| ||||  |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||    
T  1069 aagagcatgcagaacatctgaatattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctagttaaatgaagtaag 970  T
Q  314 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  969 ttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 195291 - 195182
Alignment:
Q  238 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 337  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  195291 ttgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctgg 195192  T
Q  338 tagtgatatt 347  Q
    ||||| ||||    
T  195191 tagtggtatt 195182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4363 - 4145
Alignment:
Q  120 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 219  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||| ||| | ||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||  |||  ||||||||||     
T  4363 tttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatggctttgtggttgtttttattgatgatattctgatttacttcaagaatgaagaagaac 4264  T
Q  220 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 319  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4263 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttct 4164  T
Q  320 tggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  4163 tggccatgttatttttggt 4145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7337 - 7107
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  7337 aatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcga 7238  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  7237 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 7138  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  7137 ggaagtgagtttccttggtcatttgatttct 7107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 395 - 165
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  395 aatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcga 296  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  295 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttttctaagtgtgagttttggttgaa 196  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  195 ggaagtgagtttccttggtcatttgatttct 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 347
Target Start/End: Original strand, 33911 - 34117
Alignment:
Q  141 atttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttg 240  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || ||||| || ||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||  ||||  ||||||| ||| ||     
T  33911 attttccatgcttatttggattggttcgtggttgtatttattgatgacattttgatttattctaggtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagatta 34010  T
Q  241 ttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtag 340  Q
    | ||||||||| | || || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34011 tgttgcaagtgttaaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctgatag 34110  T
Q  341 tgatatt 347  Q
    || ||||    
T  34111 tggtatt 34117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 347
Target Start/End: Original strand, 510 - 604
Alignment:
Q  253 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  510 tgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttatggtagtggtatt 604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 347
Target Start/End: Original strand, 4830 - 4924
Alignment:
Q  253 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4830 tgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttatggtagtggtatt 4924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 338
Target Start/End: Original strand, 7839 - 8048
Alignment:
Q  129 tacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagc 228  Q
    |||| |||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||    
T  7839 tacacgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttgtcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagc 7938  T
Q  229 atttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatat 328  Q
    || ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |    
T  7939 atctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttgcccatgt 8038  T
Q  329 tatttctggt 338  Q
    ||||||||||    
T  8039 tatttctggt 8048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 619 - 951
Alignment:
Q  15 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 114  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| |||||||| |    
T  619 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctg 718  T
Q  115 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 214  Q
    |||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||  |||||   ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || |   | || ||    
T  719 gtgtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttacctagataaatttgtggttgtattcattgatgacatttttatctattcaagaaccgagga 818  T
Q  215 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 314  Q
    |||  | ||  | ||   |||| |||| |||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||||| |  || |||| |    
T  819 agagcacgcagaacaccagaagattgtgttgcagattttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttttcgaagtgcgggttctggttaagggaagtgaat 918  T
Q  315 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  919 tttcttggccatattatttctggtagtggtatt 951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Original strand, 3556 - 3708
Alignment:
Q  186 gatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaa 285  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |    
T  3556 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattatcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcta 3655  T
Q  286 agtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3656 agtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 232 - 347
Target Start/End: Original strand, 1794 - 1909
Alignment:
Q  232 tgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattat 331  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1794 tgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattat 1893  T
Q  332 ttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| ||||    
T  1894 ttctggtagtggtatt 1909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10448 - 10307
Alignment:
Q  7 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||  | || ||||| || ||    | ||||||||||  || ||||||    
T  10448 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgggatggtcattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaa 10349  T
Q  107 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttca 148  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  10348 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttca 10307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 925 - 588
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  925 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 826  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | |||||||| || ||| | || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| ||||| || ||| | || || |||||| |    
T  825 cgccgggtgtgttcatgtagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgacattctaatttattctaagac 726  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||| | | |||     
T  725 tgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcgaaatgtgagttttgg-taagtgaa 627  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  626 gtaagttttctgggccacattatttctggtagtggtatt 588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 7894 - 7824
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 79  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  7894 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Original strand, 10812 - 11142
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  10812 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 10911  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||   | |||   || || || || || ||||| |||||||| || || |||||| |    
T  10912 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgctttcctggataaattcgtagtggtatttattgatgatattttaatttattctaagac 11011  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | | |||     
T  11012 tgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtatttaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaa 11111  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11112 gtaagtttccttggtcatattatttctggta 11142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37928 - 37590
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    | |||||||| |  || ||| ||||    
T  37928 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgccttacggtgttactaatg 37829  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| ||||  || ||||| || ||| |||| || || ||| |    
T  37828 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgaatttattgatgacattctgatttattcaaagac 37729  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||  ||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | | |     
T  37728 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattagaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttttggttaagtaaa 37629  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  37628 gtgagttttcttggccacattatttatggtagtggtatt 37590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Original strand, 79857 - 80187
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  79857 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatg 79956  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | |  ||||| || ||||| || |||||  | |||||||||||||   | |||   ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||||| |    
T  79957 cgcttggtgtgttcatggagtatatgaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggtagtattcattgatgatattttaatttattctaagac 80056  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  |||| |||||| ||| | |||| || || ||  ||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| | |||     
T  80057 tgaagaggagcatgcaaagcatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgagttttggttaagtgaa 80156  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    || ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  80157 gtaagtttccttggccatattatttttggta 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 40 - 365
Alignment:
Q  22 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 121  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  40 tgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 139  T
Q  122 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 221  Q
     ||||| || |||||| | ||||||||||||||| | |||   ||||| || |||| |||||| || |||||||| || || |   | || |||||  ||    
T  140 catggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggtagtgtacattgatgacattttgatctattcgacaacggaggaagagcat 239  T
Q  222 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 321  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||    
T  240 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagtttccttg 339  T
Q  322 gccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  340 gccatattatttctggaagtggtatt 365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 182 - 338
Target Start/End: Original strand, 28770 - 28926
Alignment:
Q  182 tgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttg 281  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||     
T  28770 tgangatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaatta 28869  T
Q  282 tcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    || |||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28870 tctaagtgtaagttatggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 28926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 262
Target Start/End: Original strand, 28586 - 28742
Alignment:
Q  106 atgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 205  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||    
T  28586 atgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaa 28685  T
Q  206 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 262  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  28686 gactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 28742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25393 - 25060
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||  || |    
T  25393 catcaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttattaacg 25294  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||| | | | |||   || || || || || || || ||||||||||| || |||||| |    
T  25293 cgcctggcgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctggataaattcgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaagac 25194  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  |||| |||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||     
T  25193 tgaagaggagcatgcagagcacttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgggagttctggttaactgaa 25094  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  25093 gtgagttttctaggccacgttatttctggtagtg 25060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36164 - 36055
Alignment:
Q  238 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 337  Q
    |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  36164 ttgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttatgg 36065  T
Q  338 tagtgatatt 347  Q
    ||||| ||||    
T  36064 tagtggtatt 36055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14286 - 14142
Alignment:
Q  203 taagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttg 302  Q
    |||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||     
T  14286 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 14187  T
Q  303 aatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14186 attgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 14142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 335
Target Start/End: Original strand, 5969 - 6160
Alignment:
Q  144 tttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttt 243  Q
    |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| |    
T  5969 tttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgt 6068  T
Q  244 tgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
    |||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  6069 tgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 14486 - 14431
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtta 64  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14486 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtta 14431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1161 - 1003
Alignment:
Q  180 attgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagt 279  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||  | ||||| ||      
T  1161 attgatgatattctgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaac 1062  T
Q  280 tgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 338  Q
    | || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1061 tatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 1003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9341 - 9003
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | |||| |||||  || ||| || |    
T  9341 catcaaattaaggtgaaggacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaacg 9242  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||| | |||   ||||| ||||| || ||||| || || || || || || ||| |    
T  9241 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtatttattgatgacatcttaatttattcaaagac 9142  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| || |||||  |||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||| ||| | |||     
T  9141 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaaagttgtgtgctaagttgtcgaagtgtgagttctagttaagtgaa 9042  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9041 gtgagttttctgggccacattatttctggtagtggtatt 9003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 1515 - 1585
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 79  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  1515 catcagattaaggtaaaggatgaggatatgaagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 1585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 43196 - 42859
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  |||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  43196 catcaaattaaggtgaaggatgagggtatgcagaagagggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 43097  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || || || || ||||| || |||| | |||||||  | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  43096 cgcctggtgtgttcatcgagtatatgaaccgaatttct-atgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatctattcaaagac 42998  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||  |||| |||||| |  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  42997 tgaagaagagcatgcagaacatctgaaaattgtgttgcaaatattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 42898  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  42897 gtaagctttcttggccacatcatttctggtagtggtatt 42859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20881 - 20791
Alignment:
Q  257 agagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20881 agagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 20791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25043 - 24953
Alignment:
Q  257 agagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25043 agagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 24953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 347
Target Start/End: Original strand, 546 - 640
Alignment:
Q  253 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  546 tgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttatggtagtggtatt 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 347
Target Start/End: Original strand, 14786 - 15077
Alignment:
Q  56 gacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttat 155  Q
    ||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||  || || ||||||| |    
T  14786 gacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatctaatcttccatgctttt 14885  T
Q  156 ttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctga 255  Q
     | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||    
T  14886 ctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttga 14985  T
Q  256 aagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||| ||| | ||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  14986 aggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctagttaagtgaagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 15077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Original strand, 19660 - 19934
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||| || ||| ||||    
T  19660 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatg 19759  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    |  | |  || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||      
T  19760 cgtctgacgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagaa 19859  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtc 283  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19860 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattcaaagagaataagttgtatgccaagttgtc 19934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 3
Alignment:
Q  13 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||| || ||   ||   ||||| ||| || ||||||||||||    
T  156 agattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcggtatggacattatgagtataaagttttgcctctcagtgttacaaatgcacc 57  T
Q  113 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttt 166  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  56 tggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 347
Target Start/End: Original strand, 23339 - 23443
Alignment:
Q  243 ttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    ||||||||| |||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23339 ttgcaagtgttgaaggaaaagaaggtgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtg 23438  T
Q  343 atatt 347  Q
     ||||    
T  23439 gtatt 23443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1919 - 1825
Alignment:
Q  253 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1919 tgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacattatttctggtagtggtatt 1825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 339
Target Start/End: Original strand, 12349 - 12655
Alignment:
Q  33 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| || ||||| || |    
T  12349 gatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 12448  T
Q  133 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 232  Q
     ||| || ||||| |||||||| || ||    ||||| ||||| || |||||  ||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||||  | ||| |    
T  12449 cgaaccgaattttccatgcttacttggaaaaatttgtggttgtatttattgataatattctgatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatct 12548  T
Q  233 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 332  Q
    |||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||  | ||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  12549 gaagattgtgttgcaattattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtaagttctggtaaagtgaagtgagttttctgggccacatcatt 12648  T
Q  333 tctggta 339  Q
    | |||||    
T  12649 tttggta 12655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34269 - 34039
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  34269 aatgcgccaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 34170  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  34169 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggttgga 34070  T
Q  305 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
     || || ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  34069 ggaagtaagtttccttggtcatgtgatttct 34039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 264 - 342
Target Start/End: Original strand, 5974 - 6052
Alignment:
Q  264 aagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 342  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5974 aagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 6052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Original strand, 9900 - 10044
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  9900 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatg 9999  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 153  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  10000 cgccaggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgctt 10044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 339
Target Start/End: Original strand, 10159 - 10245
Alignment:
Q  253 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10159 tgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctggta 10245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 18509 - 18579
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 79  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  18509 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaata 18579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8288 - 7965
Alignment:
Q  15 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |  | ||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| |    
T  8288 attaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgctttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctg 8189  T
Q  115 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 214  Q
    | || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||  |||| ||    
T  8188 gagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcctttttggatcggttcattgttgtgtttatcgacgatattttgatttacttcaaaactgagga 8089  T
Q  215 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 314  Q
     ||| ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  8088 ggaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaaatgtgagttctggttgaaagaggtaagt 7989  T
Q  315 tttcttggccatattatttctggt 338  Q
    ||| | |||||| |||||||||||    
T  7988 tttatgggccatgttatttctggt 7965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 339
Target Start/End: Original strand, 243 - 329
Alignment:
Q  253 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  243 tgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctggta 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29212 - 28875
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  29212 catcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 29113  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||| | || ||||| |  ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||      
T  29112 cgcctggtgtgtttatgtagtatatgaacctaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatctattctaagaa 29013  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  ||||  |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||     
T  29012 tgaaga-gagcatgcagagcacctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 28914  T
Q  309 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  28913 gtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 28875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Original strand, 2074 - 2291
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| | || | |||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  2074 aatgcaccaggtgtctttatggaataaatgaatagaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttaatagatgatattttggtgtattcaa 2173  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 304  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | || | ||||| ||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||| |    
T  2174 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattatgttgcaggtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgga 2273  T
Q  305 tgaggtgagttttcttgg 322  Q
     || |||||||| |||||    
T  2274 ggaagtgagtttccttgg 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 347
Target Start/End: Original strand, 16430 - 16513
Alignment:
Q  264 aagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 347  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16430 aagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 16513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21429 - 21298
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  21429 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 21330  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaag 236  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  21329 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaag 21298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3989 - 3868
Alignment:
Q  226 agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggcca 325  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| | ||||||||||||||| || || || ||||||||| | ||    
T  3989 agcatttgaaggtgattttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctatgtgtgaattctggttaaaagaagtaagttttcttagaca 3890  T
Q  326 tattatttctggtagtgatatt 347  Q
    | |||||| |||||||| ||||    
T  3889 tgttatttttggtagtggtatt 3868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 780 - 572
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||    | |||||| |||  || ||| ||||    
T  780 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgccattcggtgttactaatg 681  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| |||||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |    
T  680 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagac 581  T
Q  209 tgaagaaga 217  Q
    |||||||||    
T  580 tgaagaaga 572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 322
Target Start/End: Original strand, 943 - 1141
Alignment:
Q  123 atggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatg 222  Q
    |||||||| |||||| | || |||||| ||||||| || | |||||| || ||||| || || ||||||| | | || || |||||||| || ||  |||    
T  943 atggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccattttgtggtggtgtttatagatgatatttgg-tgtattcgaagtctgaggaggagcatg 1041  T
Q  223 ccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttgg 322  Q
    |  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||    
T  1042 ctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtcgaagtgtgaattttggttgcaggaagtgagtttccttgg 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 250
Target Start/End: Original strand, 1743 - 1888
Alignment:
Q  105 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  1743 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcga 1842  T
Q  205 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagt 250  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||    
T  1843 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1232 - 922
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||   ||  |||||||||  || ||| || |    
T  1232 catcagattaaggtgaaggatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtaatgcctttcggtgttactaacg 1133  T
Q  109 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 208  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | ||    ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||      
T  1132 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggacaaatttgttgttgtatttattgatgatattttaatttattctaagaa 1033  T
Q  209 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 308  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || |  || ||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||| | |||     
T  1032 tgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagagattgtatgcaaagctgtcaaaatgtgagttctagttaagtgaa 933  T
Q  309 gtgagttttct 319  Q
    |||||||||||    
T  932 gtgagttttct 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2288 - 2218
Alignment:
Q  265 agttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttct 335  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2288 agttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttttcttggtcatgttatttct 2218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 339
Target Start/End: Original strand, 4606 - 4692
Alignment:
Q  253 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4606 tgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtttccttggtcatattatttctggta 4692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 44829 - 44733
Alignment:
Q  243 ttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  44829 ttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggtcacattatttctggta 44733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1360 - 1274
Alignment:
Q  253 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 339  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1360 tgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgagttttggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctggta 1274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 11238 - 11188
Alignment:
Q  9 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggaca 59  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  11238 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggaca 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9288 - 9215
Alignment:
Q  226 agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctgg 299  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  9288 agcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctgg 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Original strand, 6185 - 6241
Alignment:
Q  23 gaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 79  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||    
T  6185 gaaggatgaagacatgcagaagacggcctttaggacacgaaatggtcattacgaata 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 341
Target Start/End: Original strand, 6415 - 6503
Alignment:
Q  253 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagt 341  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  6415 tgaaagaaaagaagttgtatgcaaagttgttaaaatgtgagttatggttaagtgaagtgagttttctgggttacattatttctggtagt 6503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University