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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF19965_low_3 (Length: 591)
Name: NF19965_low_3
Description: NF19965
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF19965_low_3 |
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Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 491; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 575
Target Start/End: Original strand, 44250457 - 44251018
Alignment:
| Q |
13 |
aaaatccatagtaggcgtgcaaatattggtgnnnnnnncatcaagaaccttcctccattatccaagccaaaaccaaatgcaaccaagaaagatgatggca |
112 |
Q |
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| T |
44250457 |
aaaatccatagtaggcgtgcaaatattggtgaaaaaaacatcaagaaccttcctccattatccaagccaaaaccaaatgcaaccaagaaagatgatggca |
44250556 |
T |
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| Q |
113 |
gatacagaacagaccagattttcaggtccacttccaccagagaatttagaaaattaaaaacagaagaacatttactctttgattaggcaatccaagatta |
212 |
Q |
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| T |
44250557 |
gatacagaacagaccagattttcaggtccacttccaccagagaatttagaaaattaaaaacagaagaacatttactctttgattaggcaatccaagatta |
44250656 |
T |
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| Q |
213 |
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312 |
Q |
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| T |
44250657 |
tgtatacctaaaaaattgattatttcattatatcatttgattttatgtattttgaaagttactctacatattcaacgttttttgtcattggaaataaaag |
44250756 |
T |
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| Q |
313 |
ggtcattttcaatgaatgaattnnnnnnnnnntacagtttactatgtgttataaaagtgttatgcaattagttaccatgttagcattttagcaactattt |
412 |
Q |
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| T |
44250757 |
ggtcattttcaatgattgaatt-aaagaaaaatacagtttactatgtgttatagaagtgttatgcaattatttaccatgttagcattttagcaactattt |
44250855 |
T |
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| Q |
413 |
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512 |
Q |
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| T |
44250856 |
aagctttaatatattgcaacttggaagaatgaagaaaagaataactacggtaacattgagctaacacttggcacaaatgaaatttgaaacatgcaattga |
44250955 |
T |
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| Q |
513 |
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575 |
Q |
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| T |
44250956 |
ttattttatgcttatgtaccaattatcaaagtatttatttacttatacatatatcattgttaa |
44251018 |
T |
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