View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19979_low_4 (Length: 462)

Name: NF19979_low_4
Description: NF19979
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19979_low_4
NF19979_low_4
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (66-433)||(11357166-11357534)
chr3 (75-446)||(22450962-22451350)
chr3 (53-446)||(46297534-46297944)
chr3 (65-433)||(33378569-33378951)
chr3 (66-433)||(52040707-52041092)
chr3 (53-446)||(26941032-26941442)
chr3 (69-446)||(48354935-48355329)
chr3 (65-446)||(37203061-37203460)
chr3 (69-438)||(40935993-40936361)
chr3 (65-446)||(4015454-4015851)
chr3 (69-401)||(42505863-42506212)
chr3 (66-433)||(53228937-53229322)
chr3 (80-426)||(44186316-44186663)
chr3 (65-446)||(40552043-40552441)
chr3 (65-446)||(21193600-21193999)
chr3 (53-433)||(43975664-43976054)
chr3 (65-446)||(39282647-39283044)
chr3 (65-433)||(29099362-29099739)
chr3 (65-446)||(37157702-37158100)
chr3 (65-433)||(44891514-44891889)
chr3 (65-402)||(21009585-21009940)
chr3 (104-433)||(34132942-34133288)
chr3 (65-401)||(2007972-2008331)
chr3 (52-417)||(3362276-3362660)
chr3 (65-433)||(32373479-32373861)
chr3 (73-446)||(7327274-7327665)
chr3 (73-433)||(47481529-47481907)
chr3 (71-417)||(4761438-4761802)
chr3 (65-433)||(22445849-22446234)
chr3 (65-326)||(22622502-22622780)
chr3 (58-391)||(24707892-24708242)
chr3 (53-265)||(1089886-1090097)
chr3 (64-433)||(3654982-3655371)
chr3 (65-446)||(11466818-11467202)
chr3 (65-346)||(29163912-29164194)
chr3 (65-328)||(33698265-33698545)
chr3 (65-390)||(14586464-14586796)
chr3 (73-425)||(54505823-54506192)
chr3 (69-433)||(25579746-25580127)
chr3 (110-349)||(46994490-46994746)
chr3 (80-433)||(24488761-24489131)
chr3 (52-253)||(51212548-51212743)
chr3 (65-262)||(36012333-36012532)
chr3 (142-427)||(45174516-45174821)
chr3 (104-352)||(38591786-38592051)
chr3 (255-433)||(27480370-27480548)
chr3 (151-371)||(43348327-43348563)
chr3 (126-349)||(54828546-54828786)
chr3 (53-265)||(11356930-11357134)
chr3 (52-265)||(20373034-20373228)
chr3 (255-446)||(51212972-51213163)
chr3 (255-446)||(35844320-35844512)
chr3 (73-265)||(27480150-27480350)
chr3 (80-247)||(50475021-50475195)
chr3 (268-433)||(20373300-20373465)
chr3 (254-367)||(53176127-53176240)
chr3 (142-265)||(11835494-11835611)
chr3 (144-252)||(53811597-53811701)
chr3 (256-338)||(11835619-11835702)
chr3 (298-363)||(53811696-53811767)
chr3 (256-322)||(1089811-1089877)
chr3 (69-127)||(35844577-35844635)
chr3 (266-333)||(36012244-36012312)
chr3 (54-96)||(13498678-13498720)
chr3 (404-446)||(40640637-40640679)
chr3 (227-265)||(53176246-53176284)
[»] chr8 (51 HSPs)
chr8 (7-433)||(1204942-1205389)
chr8 (73-446)||(27082636-27083026)
chr8 (52-433)||(37970296-37970694)
chr8 (65-446)||(16446665-16447063)
chr8 (52-446)||(5299723-5300134)
chr8 (58-428)||(33906244-33906617)
chr8 (69-446)||(34894969-34895358)
chr8 (52-446)||(43643372-43643783)
chr8 (58-430)||(16222881-16223273)
chr8 (65-430)||(38643996-38644378)
chr8 (69-368)||(1149426-1149742)
chr8 (65-446)||(34951847-34952219)
chr8 (65-433)||(465857-466232)
chr8 (52-433)||(23854209-23854606)
chr8 (73-433)||(11727039-11727416)
chr8 (82-446)||(6098320-6098706)
chr8 (59-433)||(10554988-10555377)
chr8 (65-446)||(36694756-36695154)
chr8 (65-446)||(12876111-12876510)
chr8 (65-367)||(7890747-7891066)
chr8 (104-433)||(9864163-9864509)
chr8 (64-366)||(35459500-35459819)
chr8 (65-371)||(1953778-1954103)
chr8 (65-369)||(44869576-44869897)
chr8 (65-433)||(30654373-30654758)
chr8 (65-433)||(31933676-31934061)
chr8 (69-446)||(40862421-40862816)
chr8 (52-323)||(4132463-4132750)
chr8 (65-371)||(39098909-39099232)
chr8 (69-422)||(8803610-8803974)
chr8 (66-235)||(12587812-12587981)
chr8 (151-446)||(13307625-13307936)
chr8 (65-239)||(35859160-35859334)
chr8 (111-265)||(1149756-1149906)
chr8 (75-217)||(24823194-24823336)
chr8 (69-204)||(33198063-33198198)
chr8 (255-446)||(1150102-1150293)
chr8 (52-223)||(18259321-18259492)
chr8 (188-341)||(7998401-7998555)
chr8 (256-446)||(41362520-41362707)
chr8 (52-164)||(41362723-41362835)
chr8 (255-422)||(41910985-41911153)
chr8 (144-235)||(34463704-34463792)
chr8 (73-165)||(43025974-43026066)
chr8 (195-397)||(43025753-43025972)
chr8 (181-265)||(41910895-41910978)
chr8 (325-436)||(4133077-4133186)
chr8 (300-350)||(33197947-33197997)
chr8 (381-433)||(24823395-24823447)
chr8 (69-112)||(41910852-41910895)
chr8 (69-113)||(13307931-13307975)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (65-433)||(14758053-14758429)
chr1 (65-433)||(11742147-11742514)
chr1 (58-433)||(16415657-16416050)
chr1 (65-446)||(15168088-15168493)
chr1 (65-446)||(2959747-2960145)
chr1 (53-433)||(47279201-47279599)
chr1 (53-433)||(4330291-4330690)
chr1 (53-412)||(32216088-32216464)
chr1 (52-430)||(10922742-10923137)
chr1 (53-446)||(15752028-15752438)
chr1 (65-446)||(38823213-38823611)
chr1 (65-433)||(31621327-31621717)
chr1 (81-371)||(27227280-27227587)
chr1 (65-446)||(34012161-34012554)
chr1 (81-433)||(27266995-27267361)
chr1 (69-430)||(9902837-9903215)
chr1 (65-366)||(30254502-30254820)
chr1 (65-433)||(27532761-27533144)
chr1 (69-433)||(32267046-32267427)
chr1 (69-433)||(28564566-28564945)
chr1 (52-433)||(23999359-23999758)
chr1 (65-410)||(46931446-46931807)
chr1 (69-433)||(37451298-37451678)
chr1 (58-352)||(8222221-8222532)
chr1 (52-446)||(10181773-10182185)
chr1 (73-423)||(15382955-15383323)
chr1 (52-433)||(47682260-47682657)
chr1 (65-446)||(19899547-19899946)
chr1 (64-417)||(40884841-40885212)
chr1 (53-446)||(3534931-3535332)
chr1 (65-433)||(7078842-7079238)
chr1 (79-367)||(25160710-25161016)
chr1 (73-446)||(28769652-28770042)
chr1 (73-446)||(42721038-42721425)
chr1 (55-420)||(51128884-51129264)
chr1 (80-446)||(3309147-3309536)
chr1 (73-446)||(238300-238689)
chr1 (65-446)||(33725390-33725777)
chr1 (69-433)||(39393395-39393777)
chr1 (52-381)||(27563671-27564017)
chr1 (86-446)||(30326751-30327129)
chr1 (64-446)||(41926162-41926554)
chr1 (102-446)||(18422650-18423004)
chr1 (69-349)||(27763093-27763391)
chr1 (65-446)||(1547286-1547668)
chr1 (65-265)||(48353740-48353939)
chr1 (64-349)||(22170807-22171109)
chr1 (53-265)||(1359703-1359914)
chr1 (114-446)||(37618729-37619073)
chr1 (52-248)||(21289817-21290010)
chr1 (255-423)||(48620659-48620827)
chr1 (65-225)||(31962853-31963014)
chr1 (301-439)||(21289671-21289816)
chr1 (149-265)||(38759730-38759846)
chr1 (65-135)||(48620916-48620986)
chr1 (52-106)||(38759846-38759900)
chr1 (184-245)||(48620845-48620906)
[»] chr7 (65 HSPs)
chr7 (58-424)||(29173540-29173905)
chr7 (69-446)||(41764867-41765261)
chr7 (65-433)||(31520526-31520893)
chr7 (58-446)||(18797307-18797710)
chr7 (65-422)||(26980325-26980682)
chr7 (64-433)||(48928081-48928466)
chr7 (69-446)||(30055504-30055899)
chr7 (52-446)||(31578836-31579252)
chr7 (69-401)||(32592996-32593326)
chr7 (65-446)||(24211719-24212118)
chr7 (73-446)||(32820846-32821236)
chr7 (65-433)||(9355611-9355996)
chr7 (65-433)||(21991627-21992003)
chr7 (69-446)||(12390438-12390813)
chr7 (53-446)||(37109850-37110262)
chr7 (65-446)||(5657265-5657664)
chr7 (65-446)||(8861263-8861661)
chr7 (53-446)||(17842357-17842769)
chr7 (65-446)||(15612544-15612941)
chr7 (58-433)||(23111181-23111575)
chr7 (65-433)||(37347013-37347397)
chr7 (36-412)||(35353120-35353517)
chr7 (110-423)||(12165753-12166074)
chr7 (65-446)||(6546497-6546895)
chr7 (69-423)||(27283745-27284118)
chr7 (64-446)||(4582897-4583296)
chr7 (65-446)||(10358999-10359397)
chr7 (52-433)||(7334785-7335182)
chr7 (86-367)||(11071263-11071558)
chr7 (73-433)||(25691337-25691715)
chr7 (65-446)||(32432435-32432828)
chr7 (52-369)||(10481660-10481994)
chr7 (52-265)||(37703270-37703483)
chr7 (73-433)||(22687230-22687599)
chr7 (65-265)||(46480914-46481114)
chr7 (65-331)||(15672544-15672830)
chr7 (170-433)||(38258536-38258816)
chr7 (189-433)||(48928473-48928733)
chr7 (52-249)||(44411312-44411509)
chr7 (135-433)||(33688117-33688431)
chr7 (151-446)||(43686019-43686330)
chr7 (80-349)||(43925177-43925456)
chr7 (65-265)||(26587877-26588069)
chr7 (151-370)||(38053540-38053751)
chr7 (65-353)||(44598737-44599042)
chr7 (52-236)||(37704387-37704571)
chr7 (71-225)||(34361967-34362123)
chr7 (256-446)||(27421373-27421562)
chr7 (53-153)||(38258867-38258967)
chr7 (255-446)||(44413371-44413563)
chr7 (300-446)||(26524364-26524510)
chr7 (255-340)||(37704241-37704326)
chr7 (319-428)||(34362205-34362313)
chr7 (211-265)||(37704333-37704387)
chr7 (65-115)||(12166215-12166265)
chr7 (255-305)||(26588076-26588126)
chr7 (134-198)||(27421219-27421283)
chr7 (310-352)||(34362149-34362191)
chr7 (385-446)||(8299193-8299254)
chr7 (52-88)||(23402047-23402083)
chr7 (256-316)||(46481122-46481182)
chr7 (404-433)||(3953747-3953776)
chr7 (404-433)||(23402374-23402403)
chr7 (65-106)||(33688077-33688118)
chr7 (280-316)||(37703515-37703551)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (52-430)||(24886121-24886501)
chr5 (65-446)||(14409115-14409498)
chr5 (64-433)||(33908249-33908634)
chr5 (65-427)||(31786420-31786799)
chr5 (52-433)||(22980809-22981207)
chr5 (65-433)||(699166-699551)
chr5 (115-433)||(1428983-1429304)
chr5 (65-446)||(38528011-38528408)
chr5 (65-446)||(19119862-19120260)
chr5 (65-433)||(35511256-35511636)
chr5 (52-433)||(27318249-27318646)
chr5 (52-430)||(5837574-5837969)
chr5 (65-446)||(7693233-7693622)
chr5 (51-446)||(8741645-8742059)
chr5 (65-433)||(22255197-22255583)
chr5 (52-446)||(22973843-22974254)
chr5 (65-431)||(8466763-8467127)
chr5 (65-433)||(30969097-30969483)
chr5 (53-446)||(31705374-31705783)
chr5 (53-446)||(36866765-36867175)
chr5 (53-446)||(40133388-40133798)
chr5 (53-446)||(36860426-36860837)
chr5 (65-425)||(22019656-22020024)
chr5 (69-446)||(27330309-27330701)
chr5 (65-433)||(9200249-9200625)
chr5 (69-431)||(23116008-23116379)
chr5 (52-446)||(12910353-12910769)
chr5 (64-446)||(35826259-35826655)
chr5 (65-371)||(7208638-7208960)
chr5 (65-370)||(15992314-15992636)
chr5 (65-446)||(25500700-25501098)
chr5 (65-433)||(8436982-8437366)
chr5 (65-446)||(39572822-39573212)
chr5 (65-446)||(32563152-32563541)
chr5 (65-433)||(35933918-35934297)
chr5 (58-371)||(35504443-35504773)
chr5 (53-265)||(2888207-2888419)
chr5 (65-368)||(43308434-43308746)
chr5 (81-265)||(5830093-5830278)
chr5 (58-265)||(17157798-17158005)
chr5 (73-446)||(15724493-15724881)
chr5 (65-329)||(42342851-42343122)
chr5 (65-296)||(25669739-25669977)
chr5 (64-395)||(21088541-21088887)
chr5 (65-252)||(25889584-25889771)
chr5 (53-261)||(13956126-13956332)
chr5 (52-381)||(23954563-23954897)
chr5 (65-391)||(14919313-14919645)
chr5 (255-433)||(26268090-26268268)
chr5 (68-204)||(28416328-28416464)
chr5 (258-433)||(5112297-5112472)
chr5 (139-391)||(6824329-6824598)
chr5 (65-201)||(26269074-26269210)
chr5 (52-167)||(43254154-43254269)
chr5 (255-410)||(28416508-28416663)
chr5 (300-391)||(25668707-25668798)
chr5 (312-433)||(11898018-11898139)
chr5 (208-265)||(26268275-26268332)
chr5 (280-327)||(13956368-13956415)
chr5 (271-410)||(17158028-17158166)
chr5 (268-388)||(5829962-5830073)
chr5 (374-446)||(16004476-16004549)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (65-446)||(28002796-28003194)
chr4 (69-446)||(19089267-19089661)
chr4 (52-433)||(879345-879743)
chr4 (53-446)||(35020829-35021243)
chr4 (69-446)||(37663555-37663947)
chr4 (65-433)||(49375982-49376368)
chr4 (52-446)||(25184116-25184527)
chr4 (65-433)||(19440458-19440843)
chr4 (65-433)||(7703533-7703910)
chr4 (67-446)||(33341398-33341797)
chr4 (64-427)||(32579466-32579848)
chr4 (53-432)||(23761089-23761484)
chr4 (69-433)||(25700870-25701252)
chr4 (65-446)||(55240915-55241312)
chr4 (53-431)||(6864053-6864448)
chr4 (83-433)||(34947923-34948292)
chr4 (69-433)||(37775685-37776055)
chr4 (79-446)||(55477715-55478103)
chr4 (52-446)||(36493486-36493896)
chr4 (53-439)||(32592103-32592497)
chr4 (65-433)||(46887968-46888352)
chr4 (71-433)||(50764748-50765115)
chr4 (39-433)||(5047746-5048160)
chr4 (69-446)||(29584014-29584406)
chr4 (74-341)||(1815409-1815693)
chr4 (65-446)||(27396619-27397015)
chr4 (65-446)||(32912389-32912788)
chr4 (65-446)||(47253752-47254141)
chr4 (65-446)||(34361301-34361699)
chr4 (53-423)||(17173316-17173703)
chr4 (69-433)||(30002455-30002819)
chr4 (53-265)||(3042820-3043032)
chr4 (65-423)||(17167739-17168114)
chr4 (65-371)||(50697320-50697643)
chr4 (65-433)||(4598009-4598383)
chr4 (65-265)||(33816326-33816526)
chr4 (64-265)||(7152013-7152214)
chr4 (65-446)||(9139250-9139628)
chr4 (151-430)||(38011873-38012169)
chr4 (69-446)||(37287736-37288126)
chr4 (55-395)||(4934012-4934360)
chr4 (69-349)||(17272068-17272361)
chr4 (69-430)||(42199748-42200127)
chr4 (69-265)||(26896288-26896485)
chr4 (255-433)||(33816550-33816728)
chr4 (65-238)||(39400236-39400409)
chr4 (53-234)||(4205216-4205397)
chr4 (53-262)||(46883911-46884116)
chr4 (67-204)||(35025379-35025515)
chr4 (189-433)||(35025530-35025783)
chr4 (65-195)||(23431826-23431956)
chr4 (255-424)||(54499254-54499425)
chr4 (73-160)||(38012568-38012655)
chr4 (255-446)||(39397921-39398103)
chr4 (162-227)||(56050169-56050234)
chr4 (271-327)||(3042741-3042797)
chr4 (355-446)||(4205119-4205210)
chr4 (404-446)||(20097494-20097536)
chr4 (404-446)||(38812263-38812305)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (53-446)||(7234803-7235215)
chr6 (65-446)||(3879722-3880120)
chr6 (73-446)||(20768089-20768475)
chr6 (53-388)||(6090953-6091306)
chr6 (69-433)||(33618850-33619230)
chr6 (65-446)||(8513236-8513622)
chr6 (65-433)||(5627407-5627793)
chr6 (65-433)||(1945849-1946237)
chr6 (86-446)||(4318626-4319004)
chr6 (80-446)||(6088911-6089282)
chr6 (65-446)||(33892795-33893183)
chr6 (77-433)||(21016913-21017280)
chr6 (65-433)||(29182179-29182562)
chr6 (255-433)||(15491631-15491809)
chr6 (53-213)||(7054543-7054704)
chr6 (180-446)||(30353256-30353539)
chr6 (255-433)||(7055205-7055383)
chr6 (318-433)||(18498449-18498565)
chr6 (85-140)||(33724062-33724117)
chr6 (208-265)||(7055141-7055198)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (69-368)||(7006744-7007043)
chr2 (65-446)||(33660179-33660568)
chr2 (53-446)||(4166925-4167335)
chr2 (69-412)||(43648051-43648411)
chr2 (65-433)||(4763644-4764033)
chr2 (53-446)||(2325168-2325570)
chr2 (64-433)||(26357593-26357979)
chr2 (59-433)||(33550778-33551173)
chr2 (53-433)||(18494071-18494455)
chr2 (64-446)||(41465512-41465903)
chr2 (65-349)||(41960940-41961241)
chr2 (53-430)||(11366170-11366565)
chr2 (65-446)||(43770650-43771038)
chr2 (65-433)||(19424444-19424815)
chr2 (65-423)||(19289125-19289500)
chr2 (67-417)||(33709036-33709403)
chr2 (64-433)||(39167170-39167550)
chr2 (65-423)||(3176965-3177340)
chr2 (65-439)||(5881544-5881930)
chr2 (104-417)||(27349789-27350109)
chr2 (114-412)||(4478406-4478717)
chr2 (65-446)||(31570536-31570934)
chr2 (52-446)||(29241934-29242338)
chr2 (60-265)||(35959097-35959298)
chr2 (127-446)||(19313855-19314186)
chr2 (64-417)||(37905740-37906113)
chr2 (72-446)||(13711467-13711853)
chr2 (73-446)||(44913665-44914060)
chr2 (113-446)||(4263926-4264277)
chr2 (65-348)||(31861953-31862253)
chr2 (52-262)||(19500706-19500914)
chr2 (132-433)||(44285965-44286283)
chr2 (161-446)||(36641989-36642293)
chr2 (161-368)||(45327801-45328025)
chr2 (172-446)||(17071646-17071937)
chr2 (172-446)||(17054005-17054296)
chr2 (192-446)||(41463779-41464050)
chr2 (75-201)||(41051112-41051238)
chr2 (263-425)||(33902092-33902252)
chr2 (73-193)||(41463400-41463520)
chr2 (73-163)||(33902317-33902407)
chr2 (65-178)||(18257340-18257453)
chr2 (65-128)||(45328028-45328091)
chr2 (174-265)||(18258198-18258289)
chr2 (304-422)||(41051263-41051382)
chr2 (266-346)||(19501760-19501839)
chr2 (268-433)||(35958925-35959077)
chr2 (63-137)||(17071571-17071646)
chr2 (63-137)||(17053931-17054005)
chr2 (213-265)||(33902267-33902319)
chr2 (53-92)||(19093787-19093826)
chr2 (65-110)||(4263711-4263756)
chr2 (404-433)||(6177791-6177820)
chr2 (255-308)||(18258296-18258349)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (69-446)||(7890-8284)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (58-446)||(43960-44364)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (58-446)||(154423-154827)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (65-446)||(11909-12309)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (80-446)||(137-514)
scaffold0002 (75-348)||(408223-408512)
scaffold0002 (65-237)||(93885-94056)
scaffold0002 (255-428)||(94374-94547)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (69-433)||(145803-146185)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (52-401)||(267331-267690)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (121-305)||(100894-101058)
scaffold0009 (358-433)||(42364-42439)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 66 - 433
Target Start/End: Original strand, 11357166 - 11357534
Alignment:
Q  66 aactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 165  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357166 aactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 11357265  T
Q  166 cttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 265  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357266 cttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 11357365  T
Q  266 aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt 365  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11357366 aaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagt 11357465  T
Q  366 -ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
     ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357466 gggggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 11357534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 75 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22451350 - 22450962
Alignment:
Q  75 ttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22451350 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaaca 22451251  T
Q  175 tcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtg 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||                 |||    
T  22451250 tcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtg 22451151  T
Q  258 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22451150 ttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccata 22451051  T
Q  358 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||    
T  22451050 caaacagtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 22450962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Original strand, 46297534 - 46297944
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46297534 ggtgcagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaat 46297633  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46297634 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt 46297733  T
Q  253 aa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    ||                 |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  46297734 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgggga 46297833  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttga 435  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  46297834 ctgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttca 46297933  T
Q  436 caatggaattt 446  Q
    | || ||||||    
T  46297934 ccatagaattt 46297944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 33378569 - 33378951
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33378569 aaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 33378668  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||              
T  33378669 gtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaagtattacact 33378768  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33378769 tcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttga 33378868  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    || ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  33378869 tgtcaccgtacaaatattggggtactactcactacacttttgatactatagtgttgacttcac---aaaagtcattctcataactt 33378951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 66 - 433
Target Start/End: Original strand, 52040707 - 52041092
Alignment:
Q  66 aactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 165  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  52040707 aactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatg 52040806  T
Q  166 cttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-------- 257  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||            
T  52040807 tttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacta 52040906  T
Q  258 ---------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 348  Q
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52040907 tgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgat 52041006  T
Q  349 gccaccgtacaaaca-gtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||  ||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52041007 gccactatacaaacatttggggagttactcactacacttttgatgttatagtattaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 52041092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Original strand, 26941032 - 26941442
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26941032 ggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 26941131  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  26941132 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtttt 26941231  T
Q  253 aagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    ||||||||||                 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26941232 aagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgagga 26941331  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttga 435  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||| || | |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  26941332 ctgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttca 26941431  T
Q  436 caatggaattt 446  Q
    | || ||||||    
T  26941432 ccatagaattt 26941442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 48355329 - 48354935
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  48355329 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatctagtaatactt 48355230  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac----- 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  48355229 gcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 48355130  T
Q  264 ------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
                ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48355129 ggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgcc 48355030  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |  ||||||||| |||||||  ||||| |||| |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||    
T  48355029 attgtacaaacaatggggtgttactcattacatttttaatattatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 48354935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 37203460 - 37203061
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37203460 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaat 37203361  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaa-agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 263  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37203360 gcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 37203261  T
Q  264 tt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
    ||                 |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37203260 tttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 37203161  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||| ||||| | ||||||| || || ||||||    
T  37203160 atgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattt 37203061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 40936361 - 40935993
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40936361 tgacttttttgaaaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgctt 40936262  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 268  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40936261 gcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 40936162  T
Q  269 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 368  Q
    | || || || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || |    
T  40936161 a-aaagttggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgag 40936063  T
Q  369 gtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaa 438  Q
    |||  |||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40936062 gtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcacaa 40935993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 4015851 - 4015454
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4015851 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 4015752  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||              
T  4015751 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaac-aagttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacact 4015653  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4015652 ttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 4015553  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || |||  |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  4015552 tgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 4015454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 401
Target Start/End: Original strand, 42505863 - 42506212
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505863 tgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 42505962  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  42505963 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 42506062  T
Q  263 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
               |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42506063 ggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 42506162  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 401  Q
    |  ||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  42506163 attgtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatgttatagtgt 42506212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 66 - 433
Target Start/End: Original strand, 53228937 - 53229322
Alignment:
Q  66 aactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 165  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53228937 aactgatttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatg 53229036  T
Q  166 cttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagt--------- 256  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             
T  53229037 cttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactt 53229136  T
Q  257 --------gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 348  Q
            ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  53229137 tgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgat 53229236  T
Q  349 gccaccgtacaaacagtg-gggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    || || ||||||||| || |||||   ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | ||| |||||||||    
T  53229237 gcaactgtacaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgctatagtgttaatttcaccagaaaaataattttcatgactt 53229322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 80 - 426
Target Start/End: Original strand, 44186316 - 44186663
Alignment:
Q  80 aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 179  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  44186316 aaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctta 44186415  T
Q  180 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-tcttaagtgttacacttaaaacaaggtagg 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | |   |||||||| |||||||||||||||    
T  44186416 gacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagttgtggggtgttacatttaaaacaaggtagg 44186515  T
Q  279 gtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactca 378  Q
     ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||  |||||    
T  44186516 ataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtataaacagcggggtgttactca 44186615  T
Q  379 ctacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctc 426  Q
    | ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  44186616 caacacttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 44186663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 40552043 - 40552441
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40552043 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaat 40552142  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 262  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||      
T  40552143 gcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacg 40552242  T
Q  263 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                   |||| |||||| || | |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40552243 ttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttga 40552342  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||  |||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  40552343 tgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttctccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 40552441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 21193999 - 21193600
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21193999 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatttagtaat 21193900  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt------------ 252  Q
    | ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||                
T  21193899 ggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcc 21193800  T
Q  253 ------aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21193799 tttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttg 21193700  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  21193699 atgtcactctacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgattcaacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattt 21193600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 53 - 433
Target Start/End: Original strand, 43975664 - 43976054
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  43975664 ggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaaattaatcttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaat 43975763  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaa---agttgatgatattatgtgatagt 249  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  43975764 tcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgatagt 43975863  T
Q  250 ctta----------agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga 339  Q
     |||           ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  43975864 gttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaa 43975963  T
Q  340 acttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||    
T  43975964 acttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgactt---caaaaaagtcattctcatgactt 43976054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 39283044 - 39282647
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39283044 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaat 39282945  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  39282944 gcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 39282845  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39282844 ttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttga 39282745  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||| ||| ||||||||||||   |||||| ||| |||||||  ||||||||  | || | ||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||    
T  39282744 tgccactgtataaacagtggggtattactcac-acagttttgatgttatagtgttaattttatcagaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattt 39282647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 29099739 - 29099362
Alignment:
Q  65 aaactgactttttta-aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29099739 aaactgactttttttgaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaa 29099640  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt----ctt----aag 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||    |||      |    
T  29099639 tgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaagttacactttgtgggg 29099540  T
Q  256 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |    
T  29099539 tgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactg 29099440  T
Q  356 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29099439 tacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgactt 29099362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 37158100 - 37157702
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37158100 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaat 37158001  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaa-agttgatgatattatgtgatagtcttaa--------- 254  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||             
T  37158000 gcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 37157901  T
Q  255 --------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
            ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37157900 tttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttg 37157801  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| || ||||| |||| ||||||||| || || ||||||    
T  37157800 atgccactgtac-aacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagccattttcatgacttcaccatagaattt 37157702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 44891889 - 44891514
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44891889 aaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaat 44891790  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       
T  44891789 gcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 44891690  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  44891689 ttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttga 44891590  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||         |||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44891589 tgcc---------acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaagtcattttcatgactt 44891514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 65 - 402
Target Start/End: Original strand, 21009585 - 21009940
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21009585 aaactgacttttttaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 21009684  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca- 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21009685 tgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 21009784  T
Q  263 ----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                    |||| |||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21009785 tttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttg 21009884  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtc 402  Q
    ||| ||   |||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  21009885 atgtcattctacaaatagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtc 21009940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 104 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 34133288 - 34132942
Alignment:
Q  104 tttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133288 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 34133189  T
Q  204 taaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaatt 286  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||| |||||||    
T  34133188 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 34133089  T
Q  287 agattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacactt 386  Q
    | |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| ||    
T  34133088 atattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattt 34132989  T
Q  387 ttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  34132988 ttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgactt 34132942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2008331 - 2007972
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgatta-------atgatcaatagtaattcatc 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||| || ||||||    
T  2008331 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatc 2008232  T
Q  158 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2008231 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtg 2008132  T
Q  258 ttac----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 341  Q
    ||||                ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  2008131 ttacactttgtggagtgtacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaac 2008032  T
Q  342 ttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |  |||||||||    
T  2008031 ttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgt 2007972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 52 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 3362660 - 3362276
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3362660 tggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 3362561  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3362560 ttcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtct 3362461  T
Q  252 taagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagatta--agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 332  Q
    ||||||||||                 |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  3362460 taagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatga 3362361  T
Q  333 ggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 417  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||| | || |||| |||||||||  ||||||||| ||||    
T  3362360 ggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaa 3362276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32373861 - 32373479
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32373861 aaactgaattttttgaaaaagttaattttaatcttattgatgaattcatttt-aaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaat 32373763  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag--------- 255  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||             
T  32373762 gcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacact 32373663  T
Q  256 --------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||   ||||||||||    
T  32373662 ttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttga 32373563  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |   |||||||||||||||||||||    
T  32373562 tgccactgtacaaacagtggagt--tactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttattggaaaagtcattctcatgactt 32373479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 73 - 446
Target Start/End: Original strand, 7327274 - 7327665
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7327274 ttttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 7327373  T
Q  173 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt------- 265  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||           
T  7327374 catcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 7327473  T
Q  266 ----------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
               ||| |||||||| ||||| || |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  7327474 tgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactg 7327573  T
Q  356 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtg-tcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||| | ||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  7327574 tacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttcactaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattt 7327665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 73 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 47481907 - 47481529
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgca 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47481907 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgca 47481808  T
Q  172 acatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca--------- 262  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||             
T  47481807 acatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagg 47481708  T
Q  263 --------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
            |||| || ||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||      
T  47481707 gtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcatt 47481608  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
     ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||  ||||||  |||||||    
T  47481607 ctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaacatcattcctatgactt 47481529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 71 - 417
Target Start/End: Original strand, 4761438 - 4761802
Alignment:
Q  71 acttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 170  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4761438 actttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgc 4761537  T
Q  171 aacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------------- 254  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                    
T  4761538 aacattttggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgg 4761637  T
Q  255 --gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 352  Q
      |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4761638 gggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 4761737  T
Q  353 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 417  Q
      ||||||||||||  |||  ||||| |||| |||||||| |||||| |  ||||||||| ||||    
T  4761738 ttgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgatattatagtattaacttcaccaaaaaa 4761802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 22445849 - 22446234
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22445849 aaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaat 22445948  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct------------- 251  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||                 
T  22445949 acttgcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttataca 22446048  T
Q  252 ---taagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-ggactgaacttttga 347  Q
       | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22446049 ttgtgagtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttga 22446148  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc-agaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||  |||| |||  |||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  22446149 tgccactgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaacttcaccaaaaaaagtcattttcatgactt 22446234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 65 - 326
Target Start/End: Original strand, 22622502 - 22622780
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22622502 aaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 22622601  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||              
T  22622602 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgct 22622701  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgata 326  Q
           ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22622702 ttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 58 - 391
Target Start/End: Original strand, 24707892 - 24708242
Alignment:
Q  58 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 157  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  24707892 agtcagaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatc 24707991  T
Q  158 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa--- 254  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||       
T  24707992 taataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtg 24708091  T
Q  255 --------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagat--taagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 338  Q
                  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24708092 ttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactg 24708191  T
Q  339 aacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 391  Q
    ||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||  ||||||| || |||||||    
T  24708192 aacttttgatgtcactgtac--acagtgaggtgttactcactgcagttttgat 24708242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1090097 - 1089886
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1090097 ggtgtagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaat 1089998  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||    
T  1089997 tcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtctt 1089899  T
Q  253 aagtgttacactt 265  Q
    |||||||||||||    
T  1089898 aagtgttacactt 1089886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 433
Target Start/End: Original strand, 3654982 - 3655371
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattc-atttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcat--ctag 160  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  3654982 aaaactgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatctag 3655081  T
Q  161 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3655082 taatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgtta 3655181  T
Q  261 ca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 343  Q
    ||                 |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3655182 cattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 3655281  T
Q  344 ttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  |||| | || |||||||||| | |||||||    
T  3655282 ttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactttatcaaaaaagtcatttttatgactt 3655371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 11467202 - 11466818
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||         
T  11467202 aaactgacttttttgaaaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatcta----- 11467115  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 264  Q
      |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11467114 --ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 11467017  T
Q  265 t-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
    |                 ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11467016 ttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttga 11466917  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||  |||||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  11466916 tgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcagaaaagtcattctcaagacttcaccatagaattt 11466818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29164194 - 29163912
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  29164194 aaactgacttttctaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaat 29164102  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagt 256  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||    
T  29164101 gcttgtaacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggt 29164002  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29164001 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 65 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33698545 - 33698265
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33698545 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 33698446  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||       
T  33698445 gcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacact 33698346  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 328  Q
                  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698345 ttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 65 - 390
Target Start/End: Original strand, 14586464 - 14586796
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14586464 aaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaat 14586563  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat----gtgatagtctt----aagt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    ||| ||  |||      ||    
T  14586564 gcttgcaacatcttggacttac-cgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatacgagtgttacactttgtggggt 14586662  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 356  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||  ||| ||    
T  14586663 gttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgatatcactgt 14586762  T
Q  357 acaaacagtggggtgccactcactacacttttga 390  Q
    | ||| |||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  14586763 ataaatagtgaggtgttactcacaacacttttga 14586796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 73 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 54506192 - 54505823
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgca 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54506192 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgca 54506093  T
Q  172 acatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca--------- 262  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  54506092 acattttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtaga 54505993  T
Q  263 --------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
            |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||      
T  54505992 gtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgagg-ctgaatttttgatgtcatt 54505894  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattct 425  Q
     || ||| | |||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  54505893 ctataaataatggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattct 54505823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 25580127 - 25579746
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580127 tgacttttttaaaaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 25580028  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt--- 265  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||       
T  25580027 gcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgt 25579928  T
Q  266 --------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
                  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  25579927 ggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtc 25579828  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    || ||| ||| ||| |  ||  | |||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25579827 actgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgatgctatagtattaacttcaccagaaaaatcattctcataactt 25579746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 349
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994746
Alignment:
Q  110 tcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaat 209  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  210 ctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagt-----------------gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagatta 292  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagatta 46994689  T
Q  293 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 349  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46994690 agtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatg 46994746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 433
Target Start/End: Original strand, 24488761 - 24489131
Alignment:
Q  80 aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 179  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24488761 aaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttg 24488860  T
Q  180 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttaca 262  Q
     |||||| |  |||||||||| |||   |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||                 ||||||||    
T  24488861 aacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttaca 24488960  T
Q  263 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 362  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  || |||||    
T  24488961 cttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaac 24489060  T
Q  363 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||  ||  |||||| ||| |||| |||||||||| |  ||||||| | |||| ||||| || ||||||    
T  24489061 agtggaatgttactcacaacatttttaatactatagtcttaacttcacaaaaaaaatcattttcgtgactt 24489131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Original strand, 51212548 - 51212743
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  51212548 tggtgcagtcagaaaactgacatttttgaaaaagttaattttgatcttaat------ttcatttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagtaa 51212641  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  51212642 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagcct 51212741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 36012532 - 36012333
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaa-ttttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36012532 aaactgacttttttgaaaaagttaaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 36012433  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaa-agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 262  Q
    |||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36012432 tgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttaca 36012333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174516
Alignment:
Q  142 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  242 gtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 323  Q
     | |||||||||||||||||||||                 ||||||||||||| ||||| ||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatg 45174622  T
Q  324 atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccact--cactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtca 421  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||  |||  ||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||| |    
T  45174621 atactatggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtta 45174522  T
Q  422 ttctca 427  Q
    ||||||    
T  45174521 ttctca 45174516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38592051 - 38591786
Alignment:
Q  104 tttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||    
T  38592051 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgt 38591952  T
Q  204 taaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-----------------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaatt 286  Q
    |   |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  38591951 tgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaatt 38591852  T
Q  287 agattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 352  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  38591851 agattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgcca 38591786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 255 - 433
Target Start/End: Original strand, 27480370 - 27480548
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27480370 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcacc 27480469  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||  |||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||    
T  27480470 gtacaaacaattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctcatgactt 27480548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348327
Alignment:
Q  151 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  251 ttaagtgt-----------------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 333  Q
    ||||||||                 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  43348463 ttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-aaa 43348365  T
Q  334 gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg 371  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  43348364 gactgaacttttgatgccactaaacaaacagtggggtg 43348327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 349
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828786
Alignment:
Q  126 gattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaaca 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||    
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaaca 54828645  T
Q  226 aagttgatgatattatgtgatagtcttaag-----------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaa 308  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||                 ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  54828646 tagttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttca 54828745  T
Q  309 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 349  Q
    | ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  54828746 tatgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatg 54828786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Original strand, 11356930 - 11357134
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  11356930 ggtgcagtcagacaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattactaattaatgatgaatagtaat 11357029  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
            |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   || |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11357030 --------taatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtctt 11357121  T
Q  253 aagtgttacactt 265  Q
     ||||||||||||    
T  11357122 gagtgttacactt 11357134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 265
Target Start/End: Original strand, 20373034 - 20373228
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20373034 tggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 20373133  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    ||                   ||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20373134 tt-------------------catcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttt 20373214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 255 - 446
Target Start/End: Original strand, 51212972 - 51213163
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  51212972 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggactcaacttttgatgccatt 51213071  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||  || |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  51213072 gtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 51213163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 255 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 35844512 - 35844320
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  35844512 gtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcac 35844413  T
Q  354 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
     |||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  35844412 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatttttgttgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattt 35844320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
Target Start/End: Original strand, 27480150 - 27480350
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg--- 169  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||       
T  27480150 tttttttaaaaatataattttgttcttaatgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaa 27480249  T
Q  170 -caacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaac----aaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 264  Q
      ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27480250 ttaacattttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacact 27480349  T
Q  265 t 265  Q
    |    
T  27480350 t 27480350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 50475195 - 50475021
Alignment:
Q  80 aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgat-------caatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 172  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50475195 aaaaatttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaa 50475096  T
Q  173 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgata 247  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| || | |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  50475095 catcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 268 - 433
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373465
Alignment:
Q  268 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 367  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  368 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||  ||||  |||| |||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  20373400 ggtgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgactt 20373465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 53176240 - 53176127
Alignment:
Q  254 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 353  Q
    ||||||| | ||||||  |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  53176240 agtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttat 53176141  T
Q  354 cgtacaaacagtgg 367  Q
     |||||||||||||    
T  53176140 tgtacaaacagtgg 53176127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 265
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835611
Alignment:
Q  142 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||      |||||||| | |||||||||||| ||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacat------catgcaaatagagttgatgatatcat 11835587  T
Q  242 gtgatagtcttaagtgttacactt 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  11835588 gtgatagtcttaattgttacactt 11835611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 252
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811701
Alignment:
Q  144 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatg----caaagttgatgatattatgt 53811692  T
Q  244 gatagtctt 252  Q
    |||||||||    
T  53811693 gatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 338
Target Start/End: Original strand, 11835619 - 11835702
Alignment:
Q  256 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaa-attagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11835619 tgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgatactatggggactg 11835702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 363
Target Start/End: Original strand, 53811696 - 53811767
Alignment:
Q  298 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg------actgaacttttgatgccaccgtacaaaca 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53811696 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggttatatactgaacttttgatgccactgtacaaaca 53811767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1089877 - 1089811
Alignment:
Q  256 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||| ||||||| |||||||    
T  1089877 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgataaattgat 1089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 35844635 - 35844577
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttga 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35844635 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttga 35844577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36012312 - 36012244
Alignment:
Q  266 aaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 333  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36012312 aaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatgag 36012244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13498720 - 13498678
Alignment:
Q  54 gtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgat 96  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13498720 gtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgat 13498678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 404 - 446
Target Start/End: Original strand, 40640637 - 40640679
Alignment:
Q  404 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  40640637 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 40640679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 53176284 - 53176246
Alignment:
Q  227 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 265  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53176284 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 53176246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 51)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1205389 - 1204942
Alignment:
Q  7 gtcgaagaatattggagggaattttgtgtttttattttgggagctt----ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttatt 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1205389 gtcgaaaaatattggagggaattttgtgtttttattttgggagcttctacggtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgatcttgtt 1205290  T
Q  103 gtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1205289 gtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 1205190  T
Q  203 ttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||                 |||||||||||||| | ||||||    
T  1205189 ttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaat 1205090  T
Q  286 tagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacact 385  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||  |||||||||| |    
T  1205089 tagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacatt 1204990  T
Q  386 tttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1204989 ttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 1204942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 73 - 446
Target Start/End: Original strand, 27082636 - 27083026
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27082636 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaa 27082735  T
Q  173 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac----------- 261  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||               
T  27082736 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcgggg 27082835  T
Q  262 ------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
          |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27082836 tgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactg 27082935  T
Q  356 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||    
T  27082936 cacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcagtctgatgacttcaccatagaattt 27083026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 52 - 433
Target Start/End: Original strand, 37970296 - 37970694
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  37970296 tggtgcagtcaggaaagtgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaa 37970395  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37970396 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtct 37970495  T
Q  252 taa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||                 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37970496 taagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagg 37970595  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
     |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37970596 gctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgactt 37970694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 16446665 - 16447063
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446665 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 16446764  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||              
T  16446765 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgct 16446864  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  16446865 ttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttga 16446964  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||   ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  16446965 tgccattatacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactttatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 16447063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 52 - 446
Target Start/End: Original strand, 5299723 - 5300134
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5299723 tggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaa 5299822  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||    
T  5299823 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatct 5299922  T
Q  252 taa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||                 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5299923 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataagg 5300022  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttg 434  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||     
T  5300023 actgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattaaaaaagtcattctcatgacttc 5300122  T
Q  435 acaatggaattt 446  Q
    || || ||||||    
T  5300123 accatagaattt 5300134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 58 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33906617 - 33906244
Alignment:
Q  58 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 157  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33906617 agtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaatt--tgattgctgattaatgatcaatagtaattcatc 33906520  T
Q  158 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33906519 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtg 33906420  T
Q  258 ttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 340  Q
    |||||                 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33906419 ttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaa 33906320  T
Q  341 cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcat 428  Q
    |||            || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33906319 ctt------------tataaacagtggggtgctactcactacacttttaatactatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcat 33906244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 34895358 - 34894969
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34895358 tgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgctt 34895259  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgata--gtctta----------agt 256  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || |||           ||    
T  34895258 gcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtgtgttacattttgtggggt 34895159  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 356  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  34895158 gttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccacttt 34895059  T
Q  357 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  34895058 acaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 34894969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 52 - 446
Target Start/End: Original strand, 43643372 - 43643783
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43643372 tggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaa 43643471  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  43643472 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtct 43643571  T
Q  252 taagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||||||||||                 |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  43643572 taagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaag 43643671  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttg 434  Q
    | |||||||| |||| ||  ||||||||||| | |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||     
T  43643672 attgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttc 43643771  T
Q  435 acaatggaattt 446  Q
    || || ||||||    
T  43643772 accatagaattt 43643783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 58 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16223273 - 16222881
Alignment:
Q  58 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaag---ttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattc 154  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16223273 agtcagaaaactgactttttgaaaaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 16223174  T
Q  155 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16223173 atctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaa 16223074  T
Q  255 gtgttacac-----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 337  Q
    |||||||||                 ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16223073 gtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggact 16222974  T
Q  338 gaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 430  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| ||||||  | |||||||| | |||| ||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  16222973 gaacttttgatgtcattgtacaaactgtggggaactactcactatattttttatgttatagtgttaaattcaccagaaaagtcattctcatga 16222881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 65 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 38644378 - 38643996
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38644378 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 38644279  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||       
T  38644278 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacact 38644179  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38644178 ttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttga 38644079  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 430  Q
    ||||||   |||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||    
T  38644078 tgccactagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttgaccaaaaaagtcattctcatga 38643996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 69 - 368
Target Start/End: Original strand, 1149426 - 1149742
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149426 tgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 1149525  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          
T  1149526 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 1149625  T
Q  263 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
               |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1149626 ggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtc 1149725  T
Q  352 accgtacaaacagtggg 368  Q
    |  ||||||||||||||    
T  1149726 attgtacaaacagtggg 1149742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 34951847 - 34952219
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34951847 aaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaag 34951946  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 264  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |         |||||||||||    
T  34951947 acttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcg---------agtgttacact 34952037  T
Q  265 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacag 364  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34952038 taaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcactgtacaaacag 34952137  T
Q  365 tggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||    
T  34952138 tgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccagaaaagtcattttaatgactttactatagaattt 34952219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 466232 - 465857
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466232 aaactgatttttttgaataagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 466133  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagt 256  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    ||  |||      ||    
T  466132 gcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgata-tatgtgagtgttacactttgtggggt 466034  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 356  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  466033 gttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgt 465934  T
Q  357 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  465933 acaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaacttcaccacaaaagtcattttaatgactt 465857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 52 - 433
Target Start/End: Original strand, 23854209 - 23854606
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23854209 tggtgtagtcaggaaattga-ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaa 23854307  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  23854308 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtct 23854407  T
Q  252 taa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||                 |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23854408 taagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgagg 23854507  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23854508 actgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgactt 23854606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 73 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11727416 - 11727039
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11727416 ttttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 11727317  T
Q  173 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-------------- 258  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||                  
T  11727316 catcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgggg 11727217  T
Q  259 ---tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
       ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  11727216 tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccacta 11727117  T
Q  356 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||| |||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  11727116 tacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataactt 11727039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 446
Target Start/End: Original strand, 6098320 - 6098706
Alignment:
Q  82 aaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 181  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6098320 aaagttaatcatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 6098419  T
Q  182 cttacaggtactattttat-----cgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-----------------t 259  Q
    |||||| |||||||| |||     ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 |    
T  6098420 cttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtt 6098519  T
Q  260 acacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtaca 359  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6098520 acacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtaca 6098619  T
Q  360 aacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| || || ||||||    
T  6098620 aacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattt 6098706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 59 - 433
Target Start/End: Original strand, 10554988 - 10555377
Alignment:
Q  59 gtcaaaaaactgactttttt-aaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagt--aattca 155  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||  ||||||    
T  10554988 gtcagaaaattgacttttttgaaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattact---taatgatcaatagtgtaattca 10555084  T
Q  156 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc----- 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  10555085 tctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcaagtg 10555184  T
Q  251 ----------ttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 340  Q
              | | ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10555185 ttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaa 10555284  T
Q  341 cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||| |||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10555285 cttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgactt 10555377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 36694756 - 36695154
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  36694756 aaactgatttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgat 36694855  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||              
T  36694856 gcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 36694955  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36694956 ttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttga 36695055  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || ||||||    
T  36695056 tgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattt 36695154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 12876510 - 12876111
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12876510 aaactgacttttttaaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaat 12876411  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttaca- 262  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12876410 gcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacac 12876311  T
Q  263 ----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12876310 tttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 12876211  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||| ||  ||||||||||| |||||  |||||| ||| |||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || ||||||    
T  12876210 atgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttaaccatagaattt 12876111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 367
Target Start/End: Original strand, 7890747 - 7891066
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7890747 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 7890846  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 262  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  7890847 gcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacg 7890946  T
Q  263 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                   |||| ||||| ||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7890947 ttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttga 7891046  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtgg 367  Q
    |||||  |||||||| ||||    
T  7891047 tgccattgtacaaacggtgg 7891066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 104 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 9864509 - 9864163
Alignment:
Q  104 tttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9864509 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgt 9864410  T
Q  204 taaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaatt 286  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||| |||||||    
T  9864409 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 9864310  T
Q  287 agattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacactt 386  Q
    | |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| ||    
T  9864309 atattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattt 9864210  T
Q  387 ttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  9864209 ttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgactt 9864163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 366
Target Start/End: Original strand, 35459500 - 35459819
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35459500 aaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 35459599  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag-------- 255  Q
    || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||            
T  35459600 tgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtgttataa 35459699  T
Q  256 ---------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
             ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  35459700 tctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaactttta 35459799  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtg 366  Q
    ||| ||  |||||| |||||    
T  35459800 atgtcattgtacaatcagtg 35459819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 65 - 371
Target Start/End: Original strand, 1953778 - 1954103
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1953778 aaactgatttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataat 1953877  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag--------- 255  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||             
T  1953878 gcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacact 1953977  T
Q  256 ---------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat-gatactatgaggactgaactttt 345  Q
             ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1953978 ttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaactttt 1954077  T
Q  346 gatgccaccgtacaaacagtggggtg 371  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||    
T  1954078 gatgccactgtccaaatagtagggtg 1954103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 65 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44869897 - 44869576
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44869897 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 44869798  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||       
T  44869797 gcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacact 44869698  T
Q  262 -------------acttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  44869697 ttgtggggacaacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttga 44869598  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtgggg 369  Q
    || ||  || ||||||||||||    
T  44869597 tgtcattgtgcaaacagtgggg 44869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 30654373 - 30654758
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 163  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  30654373 aaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatgatcaataatatattcatttagtaa 30654471  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca- 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30654472 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 30654571  T
Q  263 ----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  30654572 tttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttg 30654671  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| ||    |||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||| ||| |||||||    
T  30654672 atgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcactcttatgactt 30654758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 31933676 - 31934061
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31933676 aaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaat 31933775  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 262  Q
    |  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||      
T  31933776 gtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacact 31933875  T
Q  263 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                   |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31933876 ttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttga 31933975  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    || ||  ||| ||| |||||||||  ||||| || | ||||||||  |||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  31933976 tgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatatttttgatatcatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataactt 31934061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 40862816 - 40862421
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcattttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 167  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40862816 tgacttttttgaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaatgct 40862717  T
Q  168 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------ 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||          
T  40862716 tgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 40862617  T
Q  262 -----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 350  Q
               ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||| | |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  40862616 tggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatga-gactgaacttttgatgc 40862518  T
Q  351 caccgtacaaacagtggggtgccactcactaca-cttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||  |||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||| || || ||||||    
T  40862517 cattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagttattttcgtgacttcactatagaattt 40862421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 323
Target Start/End: Original strand, 4132463 - 4132750
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4132463 tggtgcagtcagcaaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaa 4132562  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4132563 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtct 4132662  T
Q  252 taagtgttacact----------------taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 323  Q
    || ||||||||||                | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4132663 tatgtgttacactttgtggggtgttacacttaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 65 - 371
Target Start/End: Original strand, 39098909 - 39099232
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39098909 aaactgatttttttaaaaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 39099008  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag--------- 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||             
T  39099009 gcttgcaacattttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatact 39099108  T
Q  256 --------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
            |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39099109 ttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttga 39099208  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtg 371  Q
    ||| |  ||||||| |||||||||    
T  39099209 tgctagtgtacaaagagtggggtg 39099232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 69 - 422
Target Start/End: Original strand, 8803610 - 8803974
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgct 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8803610 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaatgct 8803709  T
Q  168 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-- 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  8803710 tgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacactttt 8803809  T
Q  266 ---------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 350  Q
                   | ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||       | ||||||||||||||     
T  8803810 tagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata-------ggctgaacttttgatgt 8803902  T
Q  351 caccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 422  Q
    ||   |||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  8803903 cattctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcat 8803974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12587981 - 12587812
Alignment:
Q  66 aactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 165  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12587981 aactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 12587882  T
Q  166 cttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatga 235  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||    
T  12587881 cttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 151 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307625
Alignment:
Q  151 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 250  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  251 ttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 333  Q
    |||||||||||||||                 |||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13307837 ttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggg 13307738  T
Q  334 gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13307737 gactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 13307638  T
Q  434 gacaatggaattt 446  Q
     || || ||||||    
T  13307637 caccatagaattt 13307625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 65 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35859334 - 35859160
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35859334 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 35859235  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatatt 239  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35859234 gcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 111 - 265
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149906
Alignment:
Q  111 catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatc 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  211 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  1149856 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt----gtcttaagtgttacactt 1149906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 217
Target Start/End: Original strand, 24823194 - 24823336
Alignment:
Q  75 ttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24823194 ttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 24823293  T
Q  175 tcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaaca 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  24823294 tcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33198198 - 33198063
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33198198 tgacttttttgaaaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtgatgctt 33198099  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 204  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  33198098 gcaacattttagacttacatgtactattttatcgtt 33198063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 446
Target Start/End: Original strand, 1150102 - 1150293
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |       
T  1150102 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcgtt 1150201  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||  ||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  1150202 gtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 1150293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18259492 - 18259321
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | |||    
T  18259492 tggtgcagtcatgaaattgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataa 18259393  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  18259392 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaa 18259321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 188 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7998555 - 7998401
Alignment:
Q  188 ggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggt-aaaatt 286  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7998555 ggtactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaatt 7998456  T
Q  287 agattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 341  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  7998455 agattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatggggaccgaac 7998401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 256 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362520
Alignment:
Q  256 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||      
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcacta 41362608  T
Q  356 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||| || || ||||||    
T  41362607 tacaaatagtggggtgttactcactaca-tttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcataacttcaccatagaattt 41362520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 41362835 - 41362723
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41362835 tggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaa 41362736  T
Q  152 ttcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||    
T  41362735 ttcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 255 - 422
Target Start/End: Original strand, 41910985 - 41911153
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||     
T  41910985 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgctact 41911084  T
Q  355 gtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 422  Q
    ||   || ||| ||||||  |||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||    
T  41911085 gttataatagtgggggtgttactcacgacacttttgatgatatagtattaacttcaccaaaaaaatcat 41911153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463704
Alignment:
Q  144 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatga 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43026066 - 43025974
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 165  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43026066 tttttgaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcatgatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025753
Alignment:
Q  195 ttttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtag 277  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||                 |||| |||||||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtag 43025873  T
Q  278 ggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactc 377  Q
    | |||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||   | ||    
T  43025872 gataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggtattaatc 43025773  T
Q  378 actacacttttgatactata 397  Q
    || |||||||||||||||||    
T  43025772 acaacacttttgatactata 43025753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 41910895 - 41910978
Alignment:
Q  181 acttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  41910895 acttacaggtaatattttatcgttgca-tctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactt 41910978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 436
Target Start/End: Original strand, 4133077 - 4133186
Alignment:
Q  325 tactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||   ||||||||   |||| || |  ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  4133077 tactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtcaggtattactcactatcttttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattc 4133174  T
Q  425 tcatgacttgac 436  Q
    | ||||||||||    
T  4133175 tgatgacttgac 4133186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33197997 - 33197947
Alignment:
Q  300 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  33197997 tcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatgc 33197947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 433
Target Start/End: Original strand, 24823395 - 24823447
Alignment:
Q  381 acacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24823395 acacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataactt 24823447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 112
Target Start/End: Original strand, 41910852 - 41910895
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  41910852 tgacttttttaaaaaagttaattttaatctgaatgtttgattca 41910895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 13307975 - 13307931
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcat 113  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13307975 tgactattttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcat 13307931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 14758429 - 14758053
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758429 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 14758330  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------gt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||        ||    
T  14758329 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaatttctggggt 14758230  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 356  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14758229 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgt 14758130  T
Q  357 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758129 acaaacagttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 14758053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 11742147 - 11742514
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11742147 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 11742246  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11742247 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaattgttacact 11742346  T
Q  265 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacag 364  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11742347 taaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacag 11742445  T
Q  365 tggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||  ||| || |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11742446 tggggtgttacttacaacacttttgataatatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactt 11742514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 58 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16416050 - 16415657
Alignment:
Q  58 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 157  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16416050 agtcaaataactaacttttttagaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatc 16415951  T
Q  158 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa--- 254  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       
T  16415950 taataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagta 16415851  T
Q  255 --------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 340  Q
                  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  16415850 ttacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaa 16415751  T
Q  341 cttttgatgccaccgtacaaaca-gtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16415750 cttttgatgccactgtacaaacatttagggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 16415657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15168493 - 15168088
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15168493 aaactgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctaataat 15168394  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||       
T  15168393 gcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgttacact 15168294  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15168293 ttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttga 15168194  T
Q  348 tgccac-------cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatg 440  Q
    ||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||     
T  15168193 tgccaccgtacaacgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaagcattctcatcacttcacgata 15168094  T
Q  441 gaattt 446  Q
    ||||||    
T  15168093 gaattt 15168088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 2960145 - 2959747
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960145 aaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 2960046  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt------ 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||          
T  2960045 gcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaat 2959946  T
Q  259 -----------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
               ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2959945 ttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttga 2959846  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||| |||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  2959845 tgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 2959747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 53 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 47279599 - 47279201
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgactttttta-aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  47279599 ggtgcagtcataaaactgattttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaa 47279500  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  47279499 ttcatctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtct 47279400  T
Q  252 taagtgttacac-----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    ||||||||||||                 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47279399 taagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 47279300  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47279299 actgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatagtataatgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgactt 47279201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 53 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4330690 - 4330291
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| | |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4330690 ggtgcagtcagacaactgatttttttggaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaat 4330591  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4330590 tcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtctt 4330491  T
Q  253 aagtgt-----------------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    ||||||                 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4330490 aagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatga 4330391  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcga-cttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4330390 ctgaacttttgatcccactgtacaaacattgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgtttatcttcatcagaaaagtcattctcataactt 4330291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 53 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 32216464 - 32216088
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32216464 ggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 32216365  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  32216364 tcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtctt 32216265  T
Q  253 aagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    |||||||||                 ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32216264 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagga 32216165  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 412  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||    
T  32216164 ctgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 32216088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 52 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 10923137 - 10922742
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10923137 tggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 10923038  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10923037 ttcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtct 10922938  T
Q  252 taagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||||||||||                 |||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10922937 taagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagg 10922838  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 430  Q
    | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||   ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10922837 attgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatga 10922742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15752438 - 15752028
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15752438 ggtgcagtcagaaaattgattttttaaaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 15752339  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15752338 tcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactctt 15752239  T
Q  253 aagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    ||||||||||                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752238 aagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 15752139  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttga 435  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||| | |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15752138 ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttca 15752039  T
Q  436 caatggaattt 446  Q
    | || ||||||    
T  15752038 ccatagaattt 15752028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 38823611 - 38823213
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38823611 aaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 38823512  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       
T  38823511 gcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 38823412  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38823411 ttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttga 38823312  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  38823311 tgacactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttaaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 38823213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 31621327 - 31621717
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcattttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31621327 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaa 31621426  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaac-----atgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||     ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31621427 tgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgt 31621526  T
Q  259 tacact----------------taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 342  Q
     |||||                |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31621527 cacacttctggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatt 31621626  T
Q  343 tttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31621627 tttgatgccaccgtacaaatagcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgttgacttcactagaaaagtcattctcatgactt 31621717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 81 - 371
Target Start/End: Original strand, 27227280 - 27227587
Alignment:
Q  81 aaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 180  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27227280 aaaagttaattttgatattaatgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 27227379  T
Q  181 acttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacac 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||                 |||||||||    
T  27227380 acttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacac 27227479  T
Q  264 ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaaca 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27227480 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaaca 27227579  T
Q  364 gtggggtg 371  Q
    ||| ||||    
T  27227580 gtgaggtg 27227587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 34012161 - 34012554
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34012161 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaat 34012260  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgata--gtctta--------- 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || |||             
T  34012261 gcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtgtgttacattttgtg 34012360  T
Q  254 -agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 352  Q
      ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34012361 gggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgcca 34012460  T
Q  353 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |  |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  ||||||||  |||||| || ||| |||||| ||||||||| || || ||||||    
T  34012461 ctttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcataaacgtcattttcatgacttcaccatagaattt 34012554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 433
Target Start/End: Original strand, 27266995 - 27267361
Alignment:
Q  81 aaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 180  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27266995 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttag 27267094  T
Q  181 acttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacac 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||    
T  27267095 acttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacac 27267194  T
Q  264 ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaaca 363  Q
    | ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27267195 tcaaaacaaggta-gattaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaaca 27267293  T
Q  364 gtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27267294 gtggggtgtcactcactacattttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgactt 27267361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 69 - 430
Target Start/End: Original strand, 9902837 - 9903215
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9902837 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgctt 9902936  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 254  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||                  
T  9902937 gcagcatcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgt 9903036  T
Q  255 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
       ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |    
T  9903037 ggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtc 9903136  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 430  Q
    || |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||    
T  9903137 actgtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 9903215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 65 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30254820 - 30254502
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30254820 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaat 30254721  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||      
T  30254720 gcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacact 30254621  T
Q  263 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30254620 ttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttga 30254521  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtg 366  Q
    || ||  ||||||||||||    
T  30254520 tgtcattgtacaaacagtg 30254502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 27532761 - 27533144
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27532761 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 27532859  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt------------ 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||||||||                
T  27532860 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgagtgttacact 27532959  T
Q  253 -----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
         | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27532960 ttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttga 27533058  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||  || ||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27533059 tgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactt 27533144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32267427 - 32267046
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32267427 tgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgctt 32267328  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          
T  32267327 gcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgt 32267228  T
Q  263 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
               |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  32267227 ggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtc 32267128  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  |||| |||  ||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  32267127 attgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaacttcacaaaaaaagtcattcttatgactt 32267046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Original strand, 28564566 - 28564945
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28564566 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 28564665  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||          
T  28564666 gcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag--ttaagtgttacactttac 28564763  T
Q  263 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
               |||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28564764 ggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 28564863  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |  |||||||||||  ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||| ||||| |||| ||||    
T  28564864 attgtacaaacagtaaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattttcataactt 28564945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 52 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23999758 - 23999359
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta- 150  Q
    ||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  23999758 tggtgcagtcaggaaattgacctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtat 23999659  T
Q  151 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23999658 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 23999559  T
Q  251 ttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 333  Q
    ||||||||||||                 |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23999558 ttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgag 23999459  T
Q  334 gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    | |||||||||||||| ||   |||||| |||||||||  ||||  || | |||| ||  | ||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  23999458 ggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgactt 23999359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 65 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 46931807 - 46931446
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  46931807 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataatatattcatctagtaa 46931708  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931707 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 46931608  T
Q  264 tt---------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 348  Q
    ||                 ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  46931607 tttgtagggtgttacgctgaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgat 46931508  T
Q  349 gccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 410  Q
    |||    |||||||||||||||   ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||    
T  46931507 gccgttctacaaacagtggggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 46931446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 37451678 - 37451298
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37451678 tgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 37451579  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  37451578 gcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttttt 37451479  T
Q  262 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
              ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37451478 gaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtc 37451380  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |  |||||||| || |||||  ||| | |||| |||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  37451379 attgtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaagtcatttttatgactt 37451298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8222532 - 8222221
Alignment:
Q  58 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgatt-catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcat 156  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8222532 agtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaata-taattcat 8222434  T
Q  157 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8222433 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagt 8222334  T
Q  257 gttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga 339  Q
    ||||||                 |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8222333 gttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactga 8222234  T
Q  340 acttttgatgcca 352  Q
    |||||||||||||    
T  8222233 acttttgatgcca 8222221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 52 - 446
Target Start/End: Original strand, 10181773 - 10182185
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  10181773 tggtgcagtcaggaaactaacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaa 10181872  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttac-aggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||   ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10181873 ttcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtc 10181972  T
Q  251 ttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 333  Q
    ||||                 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10181973 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgag 10182072  T
Q  334 gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||| | |||| ||  || ||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10182073 gactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatgttacagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgactt 10182172  T
Q  434 gacaatggaattt 446  Q
     || || ||||||    
T  10182173 caccatagaattt 10182185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 73 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15383323 - 15382955
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgatt-catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgca 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383323 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgca 15383224  T
Q  172 acatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca--------- 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||             
T  15383223 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggg 15383124  T
Q  263 --------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
            |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||      
T  15383123 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacatt 15383024  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 423  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  15383023 gtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatt 15382955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 52 - 433
Target Start/End: Original strand, 47682260 - 47682657
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47682260 tggtgcagtcagtaaactgacttttttgaacaagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaa 47682359  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  47682360 ttcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtct 47682459  T
Q  252 taa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||                 |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47682460 taagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 47682559  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg-gtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    | |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||  |||||| ||| |||| || |  ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47682560 aatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcactctcatgactt 47682657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 19899547 - 19899946
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 163  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19899547 aaactgacttttttggaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 19899646  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca- 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19899647 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 19899746  T
Q  263 ----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                    |||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19899747 tttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttg 19899846  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || ||||||    
T  19899847 atgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattattatgacttcaccatagaattt 19899946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 64 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40885212 - 40884841
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaa-ttttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagta 162  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| | |||| | || ||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40885212 aaaattgacttttttaaaaatgttaacttttaaccttaatattcgattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagtaattcatctagta 40885113  T
Q  163 atgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40885112 atgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 40885013  T
Q  263 ctt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttt 345  Q
    |||                 |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  40885012 cttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaactttt 40884913  T
Q  346 gatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||    
T  40884912 gatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgttgacttcaccagaaaa 40884841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 3535332 - 3534931
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3535332 ggtgtagtcatgaaactgattttttttaaaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaat 3535233  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatat----tatgtgatag 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||    || ||| ||     
T  3535232 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaagtgttac 3535133  T
Q  249 tctt----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 344  Q
     |||      |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  3535132 actttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttt 3535033  T
Q  345 tgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaat 444  Q
    ||||| ||| | |||||||||  ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| ||||||| | ||| ||||    
T  3535032 tgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaattaattctaatgacttcataatagaat 3534933  T
Q  445 tt 446  Q
    ||    
T  3534932 tt 3534931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 7078842 - 7079238
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7078842 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 7078941  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    | |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||              
T  7078942 gtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatact 7079041  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7079042 ttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttga 7079141  T
Q  348 tgccaccgtacaaac-----------agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    || ||  ||||||||           |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7079142 tgtcattgtacaaacagtgaggtgttagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgactt 7079238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 79 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25161016 - 25160710
Alignment:
Q  79 aaaaaagttaattttgatcttattgtttgatt-catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 177  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25161016 aaaaaggttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatct 25160917  T
Q  178 tggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgtta 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||                 ||||||    
T  25160916 tggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgtta 25160817  T
Q  261 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 360  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25160816 cacttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaa 25160717  T
Q  361 acagtgg 367  Q
    || ||||    
T  25160716 acggtgg 25160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 73 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 28770042 - 28769652
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 172  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28770042 ttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaa 28769943  T
Q  173 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac--------- 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||             
T  28769942 catcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggg 28769843  T
Q  264 ---------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
             ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||      
T  28769842 gtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccatt 28769743  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||| || |||||  ||||| |||| |||||||   |||||||  ||||||| | |||||| ||| | ||||||| || || ||||||    
T  28769742 gtacaaacggt-gggtgttactcattacatttttgatgtcatagtgttaacttcacaaaaaaagttatttttatgacttcaccatagaattt 28769652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 73 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 42721425 - 42721038
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  42721425 ttttttaaaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaa 42721326  T
Q  173 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg--------------- 257  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||                   
T  42721325 catcttggacttacatgtaatattttatcgtt---gtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtgggg 42721229  T
Q  258 --ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  || |    
T  42721228 tattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactg 42721129  T
Q  356 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| | |||| ||  ||||| |   ||||||||| |||| ||||| ||||||||| || || ||||||    
T  42721128 tacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgatatagggctaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattt 42721038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 55 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 51129264 - 51128884
Alignment:
Q  55 tgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattc 154  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||  || ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51129264 tgtagttaagaaattgacttttttgaaaaagttaattt--attttaatacttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 51129167  T
Q  155 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51129166 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaa 51129067  T
Q  255 -----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 337  Q
                     |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  51129066 ttgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgact 51128967  T
Q  338 gaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtc 420  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||| |||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||| | |||||||    
T  51128966 gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtc 51128884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 80 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 3309536 - 3309147
Alignment:
Q  80 aaaaagttaattttga-tcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 178  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3309536 aaaaagttaattttaaatctaaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 3309437  T
Q  179 ggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac--------------- 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||                   
T  3309436 ggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggt 3309337  T
Q  264 -------ttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
           ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |    
T  3309336 gttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactg 3309237  T
Q  356 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  3309236 tacaaacagt-gggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattt 3309147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 73 - 446
Target Start/End: Original strand, 238300 - 238689
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 172  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  238300 ttttttgaaaaagttgattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 238399  T
Q  173 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 255  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||                 |    
T  238400 catcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 238499  T
Q  256 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |    
T  238500 tgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattg 238599  T
Q  356 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| || |||||| || || ||||||    
T  238600 tacaaacagt-ggatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaacttcaccaaaaaagttattttcgtgacttcactatagaattt 238689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 33725390 - 33725777
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcattttta-aattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||               
T  33725390 aaactgatttttttgaaaaagtttattttgatcttaatgttcgattcatttttttaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaat----------- 33725478  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------- 254  Q
     | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||             
T  33725479 -gtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatgttacac 33725577  T
Q  255 --------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33725578 tttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 33725677  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||||  | ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| || || ||||||    
T  33725678 atgccaccaaagaaatagtgggctgctactcaatacacttttgatgatatagcgttgacttcactagaaaagtcattctcttgactttaccatagaattt 33725777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 39393777 - 39393395
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39393777 tgacttttttaaaaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 39393678  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 261  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||| | |||| || |||||||||||||||||||           
T  39393677 gcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacactttgt 39393578  T
Q  262 ----------acttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 350  Q
              ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  39393577 aggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgc 39393478  T
Q  351 caccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| ||||||||| ||  ||   |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  39393477 cactgtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattagaaaagtcattctcataactt 39393395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 52 - 381
Target Start/End: Original strand, 27563671 - 27564017
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  27563671 tggtgcagtcaggaaactgatttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaa 27563770  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  27563771 ttcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtct 27563870  T
Q  252 taagtg-----------------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    ||||||                 ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |     
T  27563871 taagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcgga 27563970  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcacta 381  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||  ||||||||    
T  27563971 actgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactcacta 27564017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 446
Target Start/End: Original strand, 30326751 - 30327129
Alignment:
Q  86 ttaattttgatcttattgtttgatt-catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 184  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326751 ttaattttgattttaatatttgatttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 30326850  T
Q  185 acaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaa 267  Q
    | | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||                 ||||     
T  30326851 aaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttat 30326950  T
Q  268 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 367  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || |    
T  30326951 aacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttg 30327050  T
Q  368 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||   ||||| |||| |||||||  ||||||||  | ||||| | |||||||||| | ||||||| || || ||||||    
T  30327051 ggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaaattcacaaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattt 30327129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 41926554 - 41926162
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    |||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41926554 aaaactgatttttttttaaaaattaattatgattttaatgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 41926455  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgat-agtctta--------- 253  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||             
T  41926454 tgcttg-aatatcttggacttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaataagtgttacactttgtg 41926356  T
Q  254 -agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 352  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  41926355 gagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgcca 41926256  T
Q  353 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    | |||||||||||||| |   |||||||| | |||||||  |||||| |  |||||| || |||| ||||| |||| |||| || || ||||||    
T  41926255 ctgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatgttatagtattaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttcaccatagaattt 41926162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 102 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 18423004 - 18422650
Alignment:
Q  102 tgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  18423004 tgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatc 18422912  T
Q  202 gttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact-----------------taaaacaaggtagggtaaaa 284  Q
    |||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||                 || ||||||||||| |||||    
T  18422911 gttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaa 18422812  T
Q  285 ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacac 384  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||  || |     
T  18422811 ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatat 18422712  T
Q  385 ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| || || ||||||    
T  18422711 ttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattt 18422650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 349
Target Start/End: Original strand, 27763093 - 27763391
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgct 167  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27763093 tgacatttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaatgct 27763192  T
Q  168 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa------------- 254  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||                 
T  27763193 tgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattacactttg 27763292  T
Q  255 ----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 349  Q
        ||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27763293 tagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatg 27763391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 1547668 - 1547286
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1547668 aaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaat 1547569  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag--------- 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||        |||| ||||| |||||| |||||||||| || ||             
T  1547568 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacact 1547477  T
Q  256 --------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
            ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1547476 ttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatc--------tgatgatactatgagaactgaacttttga 1547385  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||| | ||||||||||| |||  |||||| ||| |||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  1547384 tgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 1547286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 48353939 - 48353740
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48353939 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaat 48353840  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  48353839 gcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacact 48353741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 64 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22171109 - 22170807
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22171109 aaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaatttatctaataa 22171010  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 263  Q
    || |||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171009 tgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 22170910  T
Q  264 -----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                     || |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  22170909 tttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttg 22170810  T
Q  347 atg 349  Q
    |||    
T  22170809 atg 22170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Original strand, 1359703 - 1359914
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1359703 ggtgcagtcagaaaactgacttgttaaaaaaaaaaaattt-gatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaat 1359801  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1359802 tcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatctt 1359901  T
Q  253 aagtgttacactt 265  Q
    |||||||||||||    
T  1359902 aagtgttacactt 1359914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 446
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37619073
Alignment:
Q  114 ttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatcttt 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  214 aacatgcaaacaaagttgatgatattat----gtgatagtcttaa----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgt 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    ||| ||  ||| |     |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgatattatatgagtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgt 37618928  T
Q  306 taatctgatgaattgatg--atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg--ccactcactacacttttgatactatagtgt 401  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    ||||| || | |||||||  ||||||||    
T  37618929 taatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgt 37619028  T
Q  402 cgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
      ||||||||| |||||||||||| || |||| || || ||||||    
T  37619029 taacttcaccaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattt 37619073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21290010 - 21289817
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  21290010 tggtgcagttaaaaaactgacttttttagaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataa 21289911  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  21289910 ttcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagt---tgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 255 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 48620827 - 48620659
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||     
T  48620827 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcact 48620728  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 423  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  48620727 gtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatattgttaacttcacaagaaaagtcatt 48620659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31963014 - 31962853
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaa-ttgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31963014 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtagttcatctaataa 31962915  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaaca 225  Q
    |||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  31962914 tgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaaca 31962853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289671
Alignment:
Q  301 cttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacactt-------ttgatac 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||       || ||      
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatga 21289717  T
Q  394 tatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaat 439  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21289716 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacaat 21289671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759730
Alignment:
Q  149 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  249 tcttaagtgttacactt 265  Q
    ||| |||||||||||||    
T  38759746 tctcaagtgttacactt 38759730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 48620986 - 48620916
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgat 135  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48620986 aaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattaatgat 48620916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 38759900 - 38759846
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgttt 106  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38759900 tggtgcagtcaattaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttt 38759846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48620906 - 48620845
Alignment:
Q  184 tacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 245  Q
    ||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  48620906 tacaggtactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 48620845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 58 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 29173905 - 29173540
Alignment:
Q  58 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 157  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29173905 agtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatc 29173806  T
Q  158 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173805 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 29173707  T
Q  258 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 357  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  29173706 taacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgta 29173607  T
Q  358 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattc 424  Q
    |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  29173606 caaacagtggagtgttactcacaacacttttgatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 29173540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Original strand, 41764867 - 41765261
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41764867 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgctt 41764966  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt---------- 258  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  41764967 gcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttct 41765066  T
Q  259 -------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
           ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41765067 ggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgcc 41765166  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41765167 accgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtattgactttatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatggaattt 41765261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 31520526 - 31520893
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31520526 aaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaat 31520625  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31520626 gcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 31520725  T
Q  265 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacag 364  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  31520726 taaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaa 31520824  T
Q  365 tggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| |||  |||||||| | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31520825 tggagtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgactt 31520893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 58 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 18797710 - 18797307
Alignment:
Q  58 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18797710 agtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatc 18797611  T
Q  158 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797610 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 18797511  T
Q  258 ttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 340  Q
    ||||                 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18797510 ttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaa 18797411  T
Q  341 cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatg 440  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||  ||   ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  18797410 cttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt--tatgttagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccata 18797313  T
Q  441 gaattt 446  Q
    ||||||    
T  18797312 gaattt 18797307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 65 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26980682 - 26980325
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26980682 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaat 26980583  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 264  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26980582 acttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 26980483  T
Q  265 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacag 364  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26980482 taaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccg 26980383  T
Q  365 tggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 422  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  26980382 tggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccataaaagtcat 26980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 64 - 433
Target Start/End: Original strand, 48928081 - 48928466
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48928081 aaaattgacttttttaaaaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 48928180  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag-------- 255  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||            
T  48928181 tgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacac 48928280  T
Q  256 ---------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
             ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  48928281 tttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttg 48928379  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48928380 atggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 48928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 30055899 - 30055504
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30055899 tgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 30055800  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  30055799 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 30055700  T
Q  263 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
               |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30055699 agggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 30055600  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca-ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| | | |||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  30055599 attgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 30055504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 52 - 446
Target Start/End: Original strand, 31578836 - 31579252
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31578836 tggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaa 31578935  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31578936 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtct 31579035  T
Q  252 taagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    ||||||||||                 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31579036 taagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaag 31579135  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgta-----caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatg 429  Q
    ||||||||||||||| ||  |||      |||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| | ||||| |||    
T  31579136 actgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaattattcttatg 31579235  T
Q  430 acttgacaatggaattt 446  Q
    |||| || || ||||||    
T  31579236 acttcaccatagaattt 31579252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 69 - 401
Target Start/End: Original strand, 32592996 - 32593326
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||    
T  32592996 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatattt 32593094  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 268  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32593095 gtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttaaa 32593194  T
Q  269 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 368  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  32593195 acaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtga-gactgaacttttgataccaccatataaacagtggg 32593293  T
Q  369 gtgccactcactacacttttgatactatagtgt 401  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  32593294 gtgctactcactacacttttaatgctatagtgt 32593326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 24212118 - 24211719
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24212118 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 24212019  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-- 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  24212018 tgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacac 24211919  T
Q  262 ---------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                   ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24211918 tttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttg 24211819  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||   || ||||||| |||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  24211818 atgccattctataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 24211719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 73 - 446
Target Start/End: Original strand, 32820846 - 32821236
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32820846 tttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 32820945  T
Q  173 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca---------- 262  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||              
T  32820946 catcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatgggg 32821045  T
Q  263 -------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
           |||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  32821046 tgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattg 32821145  T
Q  356 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  |||| |||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||| || || ||||||    
T  32821146 tacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattt 32821236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 9355611 - 9355996
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9355611 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaat 9355710  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||              
T  9355711 gcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacact 9355810  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| |||||||||    
T  9355811 ttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttga 9355910  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    || ||| ||||||||||||||||    ||||||||| |||| || |||||||||  | ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9355911 tgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgttaaattcaccaaaatggtcattctcatgactt 9355996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21992003 - 21991627
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||     |    
T  21992003 aaactgacttttttgaaaaggttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgat----gatcaatagtaattcatct-----t 21991913  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       
T  21991912 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 21991813  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21991812 ttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttga 21991713  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    || ||| |||||||||||||||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21991712 tgacactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgactt 21991627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Original strand, 12390438 - 12390813
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  12390438 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatggtt 12390537  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12390538 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtg--agtcttaagtgttacacttaaa 12390635  T
Q  269 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 368  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  12390636 agaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagtggg 12390735  T
Q  369 gtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
     ||  ||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||  ||| ||||||| || || ||||||    
T  12390736 atgttactcattacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcgatctgatgacttcaccatagaattt 12390813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 37110262 - 37109850
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| |||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37110262 ggtgcagtcaagaaattgatttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 37110163  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  37110162 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtctt 37110063  T
Q  253 aagtgttaca-----------------cttaaaacaagg--tagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 333  Q
    ||||||||||                 |||| |||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  37110062 aagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataat 37109963  T
Q  334 gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  37109962 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgactt 37109863  T
Q  434 gacaatggaattt 446  Q
     || || ||||||    
T  37109862 caccatagaattt 37109850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 5657265 - 5657664
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatctt-attgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | || || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5657265 aaactgacatttttgaaaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactcattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 5657364  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag-------- 255  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||            
T  5657365 tgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattacac 5657464  T
Q  256 ---------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
             ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5657465 tttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttg 5657564  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  5657565 atgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 5657664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 8861661 - 8861263
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8861661 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaat 8861562  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||       
T  8861561 gcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacact 8861462  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  |||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8861461 ttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttga 8861362  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||| |||||||||||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  8861361 tgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgttaacttcgcgagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 8861263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Original strand, 17842357 - 17842769
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17842357 ggtgcagtcaagaaattgacttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 17842456  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17842457 tcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtctt 17842556  T
Q  253 aagtgttaca-----------------cttaaaacaagg--tagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 333  Q
    ||||||||||                 |||| |||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  17842557 aagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataat 17842656  T
Q  334 gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||| ||||||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17842657 gactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgactt 17842756  T
Q  434 gacaatggaattt 446  Q
     || || ||||||    
T  17842757 caccatagaattt 17842769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 15612544 - 15612941
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15612544 aaactgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaataattcatctagtaat 15612643  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||              
T  15612644 gcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 15612743  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  15612744 ttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttga 15612843  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||  |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||||  ||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| || || ||||||    
T  15612844 tgccactctacaaacactggggtgttactcataacac-tttgatgttatagtgttaacttcacaagaaacgttattctcatgacttcaccatagaattt 15612941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 58 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23111575 - 23111181
Alignment:
Q  58 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23111575 agtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagtaattcttc 23111476  T
Q  158 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 257  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23111475 tagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 23111376  T
Q  258 ttaca-----------------cttaaaacaaggtagg--gtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 338  Q
    |||||                 |||||||||| ||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  ||    
T  23111375 ttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttg 23111276  T
Q  339 aacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||  |||||| | | |||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23111275 aacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcatgactt 23111181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 37347397 - 37347013
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37347397 aaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaat 37347298  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  37347297 gcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacact 37347198  T
Q  262 -------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 348  Q
                 ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37347197 ttgtggagtttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 37347098  T
Q  349 gccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    | ||| ||||||||| |||||||  ||||| || | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  37347097 gtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaaatcattttcatgactt 37347013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 35353517 - 35353120
Alignment:
Q  36 ttttattttgggagctt----ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattag 131  Q
    |||||||||||||||||    |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||      
T  35353517 ttttattttgggagcttctaaggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgc 35353418  T
Q  132 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttg 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||    
T  35353417 tgattaatgatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttg 35353318  T
Q  232 atgatattatgtgatagtcttaagtgtta-----------------cacttaaaacaaggtagg-gtaaaat-tagattaagtgcagtcttgttaatctg 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||                 |||||||||||||||| | || | || |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  35353317 atgatattatgagatagtcttaagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggtaagtgttacatctag--taa-tgcagtcttgttaatctg 35353221  T
Q  313 atgaattgatgatactatgaggactgaa-cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 411  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35353220 atgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcacc 35353121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165753
Alignment:
Q  110 tcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaat 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  210 ctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtc 301  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||  |||      |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattc 12165875  T
Q  302 ttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  12165874 ttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatgctatagtgt 12165775  T
Q  402 cgacttcaccagaaaagtcatt 423  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  12165774 taacttcaccagaaaagtcatt 12165753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 6546895 - 6546497
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6546895 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 6546796  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||              
T  6546795 gcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatact 6546696  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||    
T  6546695 ttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttga 6546596  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||  || ||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || || ||||||    
T  6546595 tgttactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcactagaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattt 6546497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 69 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 27284118 - 27283745
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaag-ttaattttgatcttattgtttgattc-atttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 166  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284118 tgactttttttgaaaagattaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 27284019  T
Q  167 ttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac----- 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||         
T  27284018 ttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttacacttt 27283919  T
Q  262 ------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 349  Q
                ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27283918 gtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatt 27283819  T
Q  350 ccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 423  Q
     ||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| |||||    
T  27283818 tcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatt 27283745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 4583296 - 4582897
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  4583296 aaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagtaattcatccagtaa 4583197  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-- 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||  || ||||| |||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  4583196 tgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacac 4583097  T
Q  262 ---------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                   ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4583096 tttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttg 4582997  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||| ||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||    
T  4582996 atgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtattaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 4582897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 10358999 - 10359397
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10358999 aaactaacttttttgaaaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaat 10359098  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||              
T  10359099 gcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacact 10359198  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattaga-ttaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
           |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10359199 ttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatca-gactgaacttttg 10359297  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||| ||| ||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||| |||||   |  | || ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  10359298 atgtcactgtataaatagtaggatgttactcactacacttttgatgctataagattaattttaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattt 10359397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7335182 - 7334785
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  7335182 tggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaa 7335083  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||| |||    
T  7335082 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaac-tagttgatgatattatctgataatct 7334984  T
Q  252 taa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||                 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  7334983 taagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgaga 7334884  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| ||||  ||| ||  ||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  7334883 actgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattctcacgactt 7334785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 86 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11071558 - 11071263
Alignment:
Q  86 ttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 185  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11071558 ttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggactta 11071459  T
Q  186 caggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-----------------ttacacttaaa 268  Q
    |||||| ||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||                 |||||||||||    
T  11071458 caggtattattttatcgtt---gtctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaa 11071362  T
Q  269 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11071361 acaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgg 11071263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 73 - 433
Target Start/End: Original strand, 25691337 - 25691715
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25691337 ttttttaaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaa 25691436  T
Q  173 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 255  Q
    ||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                 |    
T  25691437 cattttgaacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtgggg 25691536  T
Q  256 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||| |    
T  25691537 tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactg 25691636  T
Q  356 tacaaacagtggggt-gccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||| |||    |||||| | |||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25691637 tacaaacagtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattctcatgactt 25691715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 32432828 - 32432435
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32432828 aaactgacttttttaaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatgattaataataattcatctagtaat 32432729  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt------ 258  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||          
T  32432728 gcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacatt 32432629  T
Q  259 -----------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
               ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32432628 ttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttga 32432529  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||  ||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||     |||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| || || ||||||    
T  32432528 tgtcattgtacaaacaatggggtgttactcacaacatttttg-----atagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattt 32432435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10481994 - 10481660
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  10481994 tggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaa 10481895  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10481894 ttcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtct 10481795  T
Q  252 taagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    ||||||||||                 ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10481794 taagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaag 10481695  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgggg 369  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||    
T  10481694 actgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggg 10481660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 265
Target Start/End: Original strand, 37703270 - 37703483
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37703270 tggtgcagtcagtaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaa 37703369  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37703370 ttcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtct 37703469  T
Q  252 taagtgttacactt 265  Q
    |||||| |||||||    
T  37703470 taagtggtacactt 37703483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 73 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22687599 - 22687230
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 172  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22687599 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaa 22687500  T
Q  173 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-------------- 258  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||        |||| ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||                  
T  22687499 catcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcctt--------aacagagttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtgggg 22687408  T
Q  259 ---tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  22687407 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactg 22687308  T
Q  356 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
     ||||||||||| |||  |||||| ||| |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22687307 cacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgactt 22687230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 46480914 - 46481114
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46480914 aaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 46481013  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 264  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46481014 gtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 46481113  T
Q  265 t 265  Q
    |    
T  46481114 t 46481114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 331
Target Start/End: Original strand, 15672544 - 15672830
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15672544 aaactgacttttttgaaaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaat 15672643  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtac---tattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctta-------- 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||   ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||            
T  15672644 gcttgcaacattttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 15672743  T
Q  254 ---------agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 331  Q
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15672744 actttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 170 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258536
Alignment:
Q  170 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt---- 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T
Q  266 -------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 352  Q
                 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  38258716 gggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtca 38258617  T
Q  353 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
      |||||||| ||| ||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | |||||||    
T  38258616 ttgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgactt 38258536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 189 - 433
Target Start/End: Original strand, 48928473 - 48928733
Alignment:
Q  189 gtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag-----------------tgttacacttaaaaca 271  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||                 |||||||||||||| |    
T  48928473 gtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaata 48928572  T
Q  272 aggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg 371  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  48928573 atgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtg 48928671  T
Q  372 ccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48928672 ctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 48928733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 249
Target Start/End: Original strand, 44411312 - 44411509
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  44411312 tggtgcagtcaggaaactaacttttttggaaaggttaattatgatcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaa 44411411  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44411412 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 135 - 433
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688431
Alignment:
Q  135 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  235 atattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaa 317  Q
    |||| || |||||||||| |                 |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaa 33688316  T
Q  318 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 417  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||  |||||  |||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||    
T  33688317 ttgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt-accagaaaa 33688415  T
Q  418 gtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||| ||||    
T  33688416 gtcattctcataactt 33688431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 151 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686019
Alignment:
Q  151 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  251 ttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 333  Q
    |||||||||||||||                 ||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||  |    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagg 43686131  T
Q  334 gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  43686130 gactgaacttttgatgccattgtacaaacagt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacccaaaaagtcattttcgtgactt 43686032  T
Q  434 gacaatggaattt 446  Q
     || || ||||||    
T  43686031 caccatagaattt 43686019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 80 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 43925456 - 43925177
Alignment:
Q  80 aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 179  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43925456 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 43925357  T
Q  180 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttaca 262  Q
    |||      ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||                 ||||| ||    
T  43925356 gac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgca 43925263  T
Q  263 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 349  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43925262 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatg 43925177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 26587877 - 26588069
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26587877 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 26587976  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 264  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26587977 gcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacact 26588068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 151 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053540
Alignment:
Q  151 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 250  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  251 ttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 350  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  38053651 ttaagtgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgacactatgagaactgaacttttgatgt 38053560  T
Q  351 caccgtacaaacagtggggt 370  Q
    ||  ||||||||||| ||||    
T  38053559 cattgtacaaacagtagggt 38053540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 44599042 - 44598737
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagt---gattaatgatcaatagtaattcatctagt 161  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44599042 aaactgatttttttgaaaaaattaattttaatcttaacgattgattcatttt-aaattgttgattattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagt 44598946  T
Q  162 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 261  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44598945 aatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttac 44598846  T
Q  262 -----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 344  Q
                     ||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||    
T  44598845 actttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattgaatttt 44598746  T
Q  345 tgatgccac 353  Q
    |||||||||    
T  44598745 tgatgccac 44598737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37704571 - 37704387
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||  ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37704571 tggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaaactaatcttgattttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaa 37704472  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37704471 ttcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 225
Target Start/End: Original strand, 34361967 - 34362123
Alignment:
Q  71 acttttttaaaaaagttaattttga-tctt-attgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  34361967 acttttttgaaaaagttaattttaaatctttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgttt 34362066  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaaca 225  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  34362067 gcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaaca 34362123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 256 - 446
Target Start/End: Original strand, 27421373 - 27421562
Alignment:
Q  256 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||  |    
T  27421373 tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattg 27421471  T
Q  356 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||| ||||| || || ||||||    
T  27421472 tacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattatcacgacttcaccatagaattt 27421562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38258967 - 38258867
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38258967 ggtgcagtcagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 38258868  T
Q  153 t 153  Q
    |    
T  38258867 t 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 255 - 446
Target Start/End: Original strand, 44413371 - 44413563
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||  ||      
T  44413371 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggagaccgaacttttgatttcagt 44413470  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca-ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||  ||||||||  ||||||   | |||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  44413471 gtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattttcatgactttaccatagaattt 44413563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 300 - 446
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524510
Alignment:
Q  300 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagt 399  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||  | |||| ||| |||||||  ||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  400 gtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  26524464 gttaacatcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 26524510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37704326 - 37704241
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  37704326 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggactgaa 37704241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 319 - 428
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362313
Alignment:
Q  319 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  | |||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttcctagaaaag 34362303  T
Q  419 tcattctcat 428  Q
    ||||||||||    
T  34362304 tcattctcat 34362313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704333
Alignment:
Q  211 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactt 37704333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 12166265 - 12166215
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcattt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12166265 aaactgacttttctaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 12166215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 305
Target Start/End: Original strand, 26588076 - 26588126
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgt 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  26588076 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 198
Target Start/End: Original strand, 27421219 - 27421283
Alignment:
Q  134 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactatttt 198  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27421219 attaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 27421283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 352
Target Start/End: Original strand, 34362149 - 34362191
Alignment:
Q  310 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 352  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34362149 ctgatgaattgatgatactataagaactgaacttttgatgcca 34362191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 8299254 - 8299193
Alignment:
Q  385 ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||    
T  8299254 ttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 8299193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 88
Target Start/End: Original strand, 23402047 - 23402083
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagtta 88  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402047 tggtgcagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagtta 23402083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 316
Target Start/End: Original strand, 46481122 - 46481182
Alignment:
Q  256 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  46481122 tgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 3953776 - 3953747
Alignment:
Q  404 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3953776 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 3953747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 433
Target Start/End: Original strand, 23402374 - 23402403
Alignment:
Q  404 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402374 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 23402403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 106
Target Start/End: Original strand, 33688077 - 33688118
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  33688077 aaactgacttttttaaaaaagttaattttaattttaatgttt 33688118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 316
Target Start/End: Original strand, 37703515 - 37703551
Alignment:
Q  280 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37703515 taaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 52 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24886501 - 24886121
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24886501 tggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaa 24886402  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24886401 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtct 24886302  T
Q  252 taagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24886301 taagtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 24886202  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc--agaaaagtcattctcatga 430  Q
    |  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  24886201 attgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcattctcatga 24886121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 14409115 - 14409498
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14409115 aaactgatttttttgaaaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagtaattcatttagtaat 14409214  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag---tgttac 261  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    |||||    
T  14409215 gtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagagtagttac 14409314  T
Q  262 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaa 361  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14409315 acttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgccaccgtattaa 14409413  T
Q  362 cagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||    
T  14409414 gagtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 14409498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 64 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 33908634 - 33908249
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33908634 aaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaatt-atctagtaa 33908536  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33908535 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacac 33908436  T
Q  264 -----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                     ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33908435 tttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttg 33908336  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33908335 atgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgatatagtgttgacttcaccagaaagttcattctcatgactt 33908249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Original strand, 31786420 - 31786799
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31786420 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaat 31786519  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||              
T  31786520 gcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacact 31786619  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31786620 ttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttga 31786719  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctca 427  Q
    |||||| |||||||||||||||     ||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  31786720 tgccactgtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctca 31786799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 52 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22981207 - 22980809
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22981207 tggtgcagtcaggaaactgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataa 22981108  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22981107 ttcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtct 22981008  T
Q  252 taagtgt-----------------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||||||                 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22981007 taagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggg 22980908  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22980907 actgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactt 22980809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 699551 - 699166
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  699551 aaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaat 699452  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctta----------- 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||               
T  699451 gcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacact 699352  T
Q  254 ------agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
          |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  699351 ttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttga 699252  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    || ||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  699251 tgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcataactt 699166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 115 - 433
Target Start/End: Original strand, 1428983 - 1429304
Alignment:
Q  115 tttaaattgttga---ttagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatct 211  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  1428983 tttaaattgttgaatattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 1429082  T
Q  212 ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatct 311  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  1429083 ttaacatgcaaataaagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaattt 1429182  T
Q  312 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  1429183 gatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttcacc 1429282  T
Q  412 agaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    | || ||||||| |||||||||    
T  1429283 aaaagagtcattttcatgactt 1429304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 38528011 - 38528408
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528011 aaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 38528110  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||              
T  38528111 gcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 38528210  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38528211 ttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttga 38528309  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||| ||| ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| |||||||  |||| ||||||||| || || ||||||    
T  38528310 tgtcactgtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattt 38528408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19120260 - 19119862
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19120260 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 19120161  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       
T  19120160 gcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 19120061  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19120060 ttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttga 19119961  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  19119960 tgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccacaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 19119862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 35511256 - 35511636
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35511256 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaat 35511355  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgata--gtctta--------- 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || |||             
T  35511356 gcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtgtgttacattttgtg 35511455  T
Q  254 -agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 352  Q
      ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  35511456 gggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtca 35511555  T
Q  353 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |  |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  |||| |||  |||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  35511556 ctttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttataatgttaacttcatcagaaacgtcattttcatgactt 35511636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 52 - 433
Target Start/End: Original strand, 27318249 - 27318646
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaa-ttgttgattagtgattaatgatcaatagta 150  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27318249 tggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagta 27318348  T
Q  151 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 250  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27318349 attcatatagtaatgtttgcaacatcttaaacttat--gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc 27318446  T
Q  251 ttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 333  Q
    ||||||||||||                 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27318447 ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgag 27318546  T
Q  334 gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
     ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||  | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27318547 aactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttactcactacattttttatgttttagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 27318646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 52 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 5837969 - 5837574
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5837969 tggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaa 5837870  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||    
T  5837869 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtct 5837770  T
Q  252 taagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    ||||||||||                 ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  5837769 taagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggag 5837670  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 430  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  5837669 actgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaccttcaccagaaaagtcattctcatga 5837574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 7693622 - 7693233
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7693622 aaactgacttttctaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaat 7693523  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagt 256  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||    ||  |||      ||    
T  7693522 gcttgcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtgagtgttacactttgtggggt 7693423  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 356  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  7693422 gttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgt 7693323  T
Q  357 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||    
T  7693322 acaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattt 7693233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 51 - 446
Target Start/End: Original strand, 8741645 - 8742059
Alignment:
Q  51 ttggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta 150  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8741645 ttggtgcagtcatgaaacagacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta 8741744  T
Q  151 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat-attatgtgatagt 249  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | || || ||||||||||    
T  8741745 tttcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagt 8741844  T
Q  250 cttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 332  Q
    |||||                 |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  8741845 cttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgg 8741944  T
Q  333 ggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgac 431  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8741945 agactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgac 8742044  T
Q  432 ttgacaatggaattt 446  Q
    || || || ||||||    
T  8742045 ttcaccatagaattt 8742059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22255583 - 22255197
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22255583 aaactgactttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaag 22255484  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||      
T  22255483 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacact 22255384  T
Q  263 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                   |||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22255383 ttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttga 22255284  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactaca-cttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||  |||||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||||  |||| |||  ||||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  22255283 tgccattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttgatgttataatgttaacttcaccaaaaaagttatttttatgactt 22255197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 52 - 446
Target Start/End: Original strand, 22973843 - 22974254
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22973843 tggtgcagtcagaaaactgattttttttaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 22973942  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  22973943 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtct 22974042  T
Q  252 taagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||||||||||                 |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||     
T  22974043 taagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgaga 22974142  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttg 434  Q
    | |||||||||||||  |  |||||||||||||| ||  ||||| |||  |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  22974143 attgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttc 22974242  T
Q  435 acaatggaattt 446  Q
    || || ||||||    
T  22974243 accatagaattt 22974254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 65 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8467127 - 8466763
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8467127 aaactgattttttttaaaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 8467028  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| | | |||||| ||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  8467027 gcttgcaacattttggacttacaaataatattttatcgtt-acacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgttacatt 8466929  T
Q  265 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacag 364  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  8466928 taaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccactgtacaaagag 8466829  T
Q  365 tggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgac 431  Q
     ||||||  | |||| |||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8466828 -ggggtgttattcacaacacttttgatgttacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgac 8466763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 30969097 - 30969483
Alignment:
Q  65 aaactgactttt-ttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30969097 aaactgactttttttaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaa 30969196  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------- 254  Q
    | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||             
T  30969197 tacttgcagcatcttgaacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacac 30969296  T
Q  255 --------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
            |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30969297 tttgtgaggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 30969396  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| ||  ||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30969397 atgtcattgtataaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagataaatcattctcatgactt 30969483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Original strand, 31705374 - 31705783
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31705374 ggtgcagtcaagaaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 31705473  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31705474 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtctt 31705573  T
Q  253 aagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    ||||||||||                 |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31705574 aagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagga 31705672  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttga 435  Q
    ||| |||||||||| ||  |||||||| || |||||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| |    
T  31705673 ctggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttca 31705772  T
Q  436 caatggaattt 446  Q
    | || ||||||    
T  31705773 ccatagaattt 31705783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 36867175 - 36866765
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  36867175 ggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaat 36867076  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  36867075 tcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtttt 36866976  T
Q  253 aagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    |||||||||                 ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||    
T  36866975 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcggga 36866876  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttga 435  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| | | |||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| |    
T  36866875 ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttca 36866776  T
Q  436 caatggaattt 446  Q
    | || ||||||    
T  36866775 ccatagaattt 36866765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 40133798 - 40133388
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  40133798 ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaat 40133699  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  40133698 tcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtttt 40133599  T
Q  253 aagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    |||||||||                 ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||    
T  40133598 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatgggga 40133499  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttga 435  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| || |||||| |    
T  40133498 ctgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactataatgttaacttcaccacaaaagtcattttcgtgacttca 40133399  T
Q  436 caatggaattt 446  Q
    | || ||||||    
T  40133398 ccatagaattt 40133388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 36860837 - 36860426
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  36860837 ggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaat 36860738  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  36860737 tcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtttt 36860638  T
Q  253 aagtgttacactt------------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||||||||||||                  |||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||    
T  36860637 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatgggg 36860538  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttg 434  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||     
T  36860537 actgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttc 36860438  T
Q  435 acaatggaattt 446  Q
    || || ||||||    
T  36860437 accatagaattt 36860426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 65 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22020024 - 22019656
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22020024 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 22019925  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctta--------agt 256  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||  ||  ||         ||    
T  22019924 gcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgagtgttatactttgtggggt 22019825  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 356  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||  |    
T  22019824 gttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactat 22019725  T
Q  357 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattct 425  Q
    ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  22019724 acaaacaatggggtgttactcacaacacttttgattctatagttttaacttcaccagaaaagtcattct 22019656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 27330701 - 27330309
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27330701 tgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 27330602  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||                  
T  27330601 gcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcat 27330502  T
Q  255 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
       |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27330501 ggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgcc 27330402  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |  |||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||    
T  27330401 attgtacaaacagtaaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattt 27330309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 9200625 - 9200249
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9200625 aaactgatttttttgaaaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 9200526  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagt 256  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||     | |    
T  9200525 gcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggaat 9200426  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 356  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  9200425 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgt 9200326  T
Q  357 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||| ||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  9200325 acaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagttattttaatgactt 9200249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 69 - 431
Target Start/End: Original strand, 23116008 - 23116379
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |        |||||||||    
T  23116008 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtca--------gtaatgctt 23116099  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt---------- 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||              
T  23116100 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 23116199  T
Q  259 -------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
           ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  23116200 ggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattcc 23116299  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgac 431  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||  ||||||  | |||||||||| |||||||    
T  23116300 actgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaacttcataaaaaaagtcattttcatgac 23116379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 12910769 - 12910353
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  12910769 tggtgcagtcaggaaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaa 12910670  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||   ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12910669 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtct 12910570  T
Q  252 taagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    || |||||||                 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12910569 taggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgagg 12910470  T
Q  335 actgaacttttgatgcc-----accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatg 429  Q
    ||||||||||||||| |     || |||||||||||||||||  || ||||| | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  12910469 actgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatg 12910370  T
Q  430 acttgacaatggaattt 446  Q
    |||| || || ||||||    
T  12910369 acttcaccatagaattt 12910353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Original strand, 35826259 - 35826655
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35826259 aaaactggttttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 35826358  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctta---------- 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||              
T  35826359 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatcttaagggttacac 35826456  T
Q  254 -------agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
           |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35826457 tttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttg 35826555  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||| ||| ||||||||| ||  |||  ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||||| | |||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  35826556 atgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtattaacttcacaaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattt 35826655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 65 - 371
Target Start/End: Original strand, 7208638 - 7208960
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7208638 aaactgactttttttaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaat 7208737  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac- 263  Q
     |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7208738 acttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacact 7208837  T
Q  264 ----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7208838 ttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttga 7208936  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtg 371  Q
    || ||  |||||||| || |||||    
T  7208937 tgtcaatgtacaaacggtagggtg 7208960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 370
Target Start/End: Original strand, 15992314 - 15992636
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992314 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 15992413  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 264  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  15992414 gcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacact 15992513  T
Q  265 t-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
    |                 ||| ||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15992514 ttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttga 15992613  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggt 370  Q
    || ||| ||||||||||||||||    
T  15992614 tgtcactgtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 25500700 - 25501098
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25500700 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtatttcatctagtaat 25500799  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||              
T  25500800 gcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacact 25500899  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  25500900 ttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttga 25500999  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||  |||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  25501000 tggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 25501098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8437366 - 8436982
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8437366 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 8437267  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||       
T  8437266 gttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacaca 8437167  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||| |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8437166 ttgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatg-gttgatgatataatgaggactgaacttttga 8437068  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    || ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||  |||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8437067 tgtcactgtacaaacaatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgttaatttcaccaaaaaaatcattctcatgactt 8436982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 39573212 - 39572822
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39573212 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 39573113  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag--------- 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||             
T  39573112 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacact 39573021  T
Q  256 --------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39573020 ttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttga 39572921  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||| | ||||||||||| |||  |||||| ||| |||| ||| |||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  39572920 tgtcactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatattatagtattaacttaactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 39572822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 32563541 - 32563152
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32563541 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaat 32563442  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagt 256  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||       |    
T  32563441 tcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtgggct 32563342  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||    
T  32563341 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgt 32563242  T
Q  357 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||||| || || ||||||    
T  32563241 acagacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaatcattttaatgacttcaccatagaattt 32563152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 35934297 - 35933918
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35934297 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaat 35934198  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       
T  35934197 gcttgcaacatcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 35934098  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  35934097 ttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttg 35933998  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||  ||     |||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  35933997 atgccac--ta-----agtgaggtgttactcacaacacttttgattctatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattctcatgactt 35933918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 58 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35504773 - 35504443
Alignment:
Q  58 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 157  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35504773 agtcaagaaattgacttttttgaaaaagtcaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatc 35504674  T
Q  158 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35504673 tagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtg 35504574  T
Q  258 ttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 340  Q
    |||||                 |||| || | |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||    
T  35504573 ttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaa 35504474  T
Q  341 cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg 371  Q
    ||||||||| || | ||||||| ||| ||||    
T  35504473 cttttgatgtcatcatacaaacggtgaggtg 35504443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Original strand, 2888207 - 2888419
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2888207 ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 2888306  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  2888307 tcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtctt 2888406  T
Q  253 aagtgttacactt 265  Q
    |||||||||||||    
T  2888407 aagtgttacactt 2888419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 65 - 368
Target Start/End: Original strand, 43308434 - 43308746
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43308434 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 43308533  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgata-----ttatgtgatagtctt----aag 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  | |||||||||||     ||| ||| ||  |||      |    
T  43308534 gcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatatagtcttaagtgttacacttttcaggg 43308633  T
Q  256 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  43308634 tgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattg 43308733  T
Q  356 tacaaacagtggg 368  Q
    ||| |||||||||    
T  43308734 tacgaacagtggg 43308746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 81 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5830278 - 5830093
Alignment:
Q  81 aaaagttaattttgatcttattgtttgatt-catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 179  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5830278 aaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 5830179  T
Q  180 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5830178 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 5830093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 265
Target Start/End: Original strand, 17157798 - 17158005
Alignment:
Q  58 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 157  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17157798 agtcaagaaattgacttttttgaaaaagtcaagtttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatc 17157897  T
Q  158 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17157898 tagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtg 17157997  T
Q  258 ttacactt 265  Q
    ||||||||    
T  17157998 ttacactt 17158005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 73 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15724881 - 15724493
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 172  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15724881 ttttttgaaaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaa 15724782  T
Q  173 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 255  Q
     || ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||                 |    
T  15724781 tattttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcg 15724682  T
Q  256 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
    ||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||  |    
T  15724681 tgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattg 15724584  T
Q  356 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || |||||||||||||  |||||| | |||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  15724583 tataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattt 15724493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 65 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42343122 - 42342851
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42343122 aaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaat 42343023  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagt 256  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    ||  |||      ||    
T  42343022 gcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtgagtgttacactttgtggtgt 42342923  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 329  Q
     ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342922 attacacttaaaacaa-gtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 42342851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25669977 - 25669739
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25669977 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 25669878  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt---aagtg 257  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    ||  |||    ||||    
T  25669877 gcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtgagtgttacacttgtggagtg 25669778  T
Q  258 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 296  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25669777 ttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtg 25669739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 395
Target Start/End: Original strand, 21088541 - 21088887
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaag-ttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagta 162  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21088541 aaaactgactttttaaaaaaaaattaactttaatcttaatgtttgattcatttttaaattg---attatttattcatgattaatagtaattcatctagta 21088637  T
Q  163 atgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag------- 255  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||           
T  21088638 atgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttaca 21088737  T
Q  256 ----------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttt 345  Q
              ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21088738 ctttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaactttt 21088837  T
Q  346 gatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatacta 395  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  21088838 gatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactcacaacattttttatacta 21088887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25889771 - 25889584
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25889771 aaactgacttttctggaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 25889672  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25889671 gctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataatctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 261
Target Start/End: Original strand, 13956126 - 13956332
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||   | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13956126 ggtgcagtcagaaagctgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgaaaaagtt--aaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 13956223  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13956224 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatatgatagtctt 13956323  T
Q  253 aagtgttac 261  Q
    |||||||||    
T  13956324 aagtgttac 13956332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 381
Target Start/End: Original strand, 23954563 - 23954897
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||    
T  23954563 tggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaa 23954655  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||| ||||||| |     ||||||| |||||||  || ||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23954656 ttcatcaagtaatgtt-----catcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtct 23954749  T
Q  252 taagtgt-----------------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||||||                 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  23954750 taagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggaa 23954849  T
Q  335 actgaacttttgatgccac-cgtacaaacagtggggtgccactcacta 381  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  23954850 actgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtgttactcacta 23954897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 391
Target Start/End: Original strand, 14919313 - 14919645
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||          
T  14919313 aaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaat-gtaattcatct------ 14919405  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagt-------- 256  Q
    | |||||| ||||||||||||    ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||            
T  14919406 gattgcaatatcttggactta----tacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaat 14919501  T
Q  257 ---------gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
             |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14919502 ttgtgaggtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttga 14919601  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 391  Q
    || ||   || |||||||| ||||  ||||| |||| |||||||    
T  14919602 tgtcattatataaacagtgaggtgttactcattacatttttgat 14919645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 255 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26268268 - 26268090
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  26268268 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcacc 26268169  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26268168 gtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 26268090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 204
Target Start/End: Original strand, 28416328 - 28416464
Alignment:
Q  68 ctgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28416328 ctgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgct 28416427  T
Q  168 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 204  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28416428 tgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgtt 28416464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 258 - 433
Target Start/End: Original strand, 5112297 - 5112472
Alignment:
Q  258 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 357  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  5112297 ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgta 5112396  T
Q  358 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | |||| ||  |||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5112397 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgactt 5112472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 391
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824598
Alignment:
Q  139 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 238  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  239 tatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 321  Q
      |||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattga 6824526  T
Q  322 tgatactatgaggactga--acttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 391  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  6824527 tgatactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgat 6824598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26269210 - 26269074
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  26269210 aaactgacttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtatt 26269111  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 201  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26269110 gcttacaacatcttaaacttacaggtactattttatc 26269074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43254269 - 43254154
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43254269 tggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 43254170  T
Q  152 ttcatctagtaatgct 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  43254169 ttcatctagtaatgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 255 - 410
Target Start/End: Original strand, 28416508 - 28416663
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||| ||||     
T  28416508 gtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattgaacttttgattccact 28416607  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 410  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||| ||||||||  |||||||    
T  28416608 gtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaacttcac 28416663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 300 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25668798 - 25668707
Alignment:
Q  300 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 391  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  25668798 tcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgat 25668707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898018
Alignment:
Q  312 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||| |||||  ||||| | |||||||||| ||||| | |  |||| |||    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttacc 11898040  T
Q  412 agaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  11898039 agaaaagttattatcatgactt 11898018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26268332 - 26268275
Alignment:
Q  208 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 265  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26268332 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 26268275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 327
Target Start/End: Original strand, 13956368 - 13956415
Alignment:
Q  280 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 327  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13956368 taaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 410
Target Start/End: Original strand, 17158028 - 17158166
Alignment:
Q  271 aaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggt 370  Q
    |||||| | || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| ||  |||||||| |||| ||    
T  17158028 aaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagt 17158126  T
Q  371 gccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 410  Q
    |  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  |||||||    
T  17158127 gttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 17158166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 5830073 - 5829962
Alignment:
Q  268 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 367  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| || |    
T  5830073 aacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaat---------tgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtag 5829983  T
Q  368 ggtgccactcactacactttt 388  Q
    ||||  ||||| |||| ||||    
T  5829982 ggtgttactcattacattttt 5829962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 446
Target Start/End: Original strand, 16004476 - 16004549
Alignment:
Q  374 actcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtc-attctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||| ||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||    
T  16004476 actcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcaattctcatgactttaccatagaattt 16004549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 28002796 - 28003194
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28002796 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 28002895  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||              
T  28002896 gttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacact 28002995  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28002996 ttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttga 28003095  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  28003096 tgtcactgtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 28003194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Original strand, 19089267 - 19089661
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089267 tgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 19089366  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact---- 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  19089367 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 19089466  T
Q  265 -------------taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
                 || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19089467 agggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 19089566  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |   ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| || |||||| ||||| ||||||| || || ||||||    
T  19089567 attatacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaagttattcttatgacttcaccatagaattt 19089661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 52 - 433
Target Start/End: Original strand, 879345 - 879743
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  879345 tggtgtagtcagaaaactgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataa 879444  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879445 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 879544  T
Q  252 taa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||                 ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  879545 taaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaag 879644  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    | | ||||||||||| ||  ||||||||| || ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  879645 attaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtttacttcaccaaaaaaattattctcatgactt 879743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Original strand, 35020829 - 35021243
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaata----g 148  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    |    
T  35020829 ggtgtagtcagaaaactgactcttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatatatag 35020928  T
Q  149 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35020929 taattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 35021028  T
Q  249 tcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 331  Q
    ||||||||||||||                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  35021029 tcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacg 35021128  T
Q  332 aggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgac 431  Q
    |||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35021129 aggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgac 35021228  T
Q  432 ttgacaatggaattt 446  Q
    || || || ||||||    
T  35021229 ttcaccatagaattt 35021243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Original strand, 37663555 - 37663947
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663555 tgacttttttaataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 37663654  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  37663655 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 37663754  T
Q  263 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
               |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37663755 ggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 37663854  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||    ||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  37663855 attgtacaaacagtggggtgttactcattacagttttaat--gttagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 37663947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 49376368 - 49375982
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49376368 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaat 49376269  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  49376268 gctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacaca 49376169  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  ||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49376168 ttgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttga 49376069  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccag-aaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49376068 tgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaaagtcattctcatgactt 49375982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 52 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 25184527 - 25184116
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25184527 tggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaa 25184428  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25184427 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtct 25184328  T
Q  252 taagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||||||||||                 |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25184327 taagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaag 25184228  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttg 434  Q
    | |||||||| |||| ||  ||||||||||| | |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||     
T  25184227 attgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttc 25184128  T
Q  435 acaatggaattt 446  Q
    || || ||||||    
T  25184127 accatagaattt 25184116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 19440458 - 19440843
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19440458 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 19440557  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||              
T  19440558 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataaacttaagggttacacg 19440657  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           ||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19440658 ttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttga 19440757  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||  |||||||| |||| |||  | ||| |||| |||||||  ||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19440758 tgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtgttaacatcaccaaaaaagtcattctcatgactt 19440843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7703910 - 7703533
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7703910 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaat 7703811  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||              
T  7703810 gcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacact 7703711  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||        ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7703710 ttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactatggggactgaacttttga 7703619  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703618 tgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 7703533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 67 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 33341797 - 33341398
Alignment:
Q  67 actgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341797 actgacttttttaaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 33341698  T
Q  167 ttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac----- 261  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||         
T  33341697 ttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttt 33341598  T
Q  262 ------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 349  Q
                ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33341597 gtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatg 33341499  T
Q  350 ccaccgtacaaacagtggggtgccactcacta----cacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatt 445  Q
    |||| |||||||||||||||||   ||| | |    || |||||||  ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||    
T  33341498 ccactgtacaaacagtggggtgttcctcgcaacaatcaattttgatgatatagtgttaatttcaccagaaaaatcattctcatgacttcactatagaatt 33341399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 64 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 32579848 - 32579466
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32579848 aaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 32579749  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------- 254  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||             
T  32579748 tgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagagttacac 32579649  T
Q  255 --------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
            || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  32579648 tttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatga-gactaaacttttg 32579550  T
Q  347 atgccaccgt---acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctca 427  Q
    ||| ||||||   ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32579549 atggcaccgtacaacaaacactggggtgctactcactgcacttttgatgttataatgttgacttcaccagaaaagtcattctca 32579466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 53 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23761484 - 23761089
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23761484 ggtgtagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataat 23761385  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  23761384 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtctt 23761285  T
Q  253 aa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    ||                 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23761284 aaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggga 23761186  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgact 432  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  23761185 ctgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttacaagaatagtcattctcatgact 23761089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Original strand, 25700870 - 25701252
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25700870 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgctt 25700969  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag------------- 255  Q
    |||| ||||| || |||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||                 
T  25700970 gcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgt 25701069  T
Q  256 -----tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 350  Q
         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25701070 ggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgt 25701169  T
Q  351 caccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  |||| |||  |||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  25701170 cactgtacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatgttataatgttaactttaccaaaaaagtcattatcatgactt 25701252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 55240915 - 55241312
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  55240915 aaactgacttttttgaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaat 55241014  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||              
T  55241015 gtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacact 55241114  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55241115 ttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctt-atctgataaattgatgatactatggggactgaacttttga 55241213  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  55241214 tgccactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgataatatagtattaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 55241312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 53 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6864448 - 6864053
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6864448 ggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaat 6864349  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6864348 tcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 6864249  T
Q  253 aa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    ||                 ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6864248 aagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgagga 6864149  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgac 431  Q
    ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| || ||  | ||| || | |||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6864148 ctggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtgataacttcaccaaaaaagtcattctcatgac 6864053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 83 - 433
Target Start/End: Original strand, 34947923 - 34948292
Alignment:
Q  83 aagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 182  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34947923 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 34948022  T
Q  183 ttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------------gtgttacac 263  Q
    ||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                   ||||| |||    
T  34948023 ttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcac 34948122  T
Q  264 ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaaca 363  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34948123 tttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaaca 34948222  T
Q  364 gtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34948223 gtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcgccagaaaagtcattctcatgactt 34948292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 37776055 - 37775685
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37776055 tgacttttttaaaaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 37775956  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 260  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||||||    
T  37775955 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgtta 37775856  T
Q  261 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 360  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||| ||||||    
T  37775855 cacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggggggaacttttgatgccactgtacaa 37775758  T
Q  361 acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||||  |||||| ||| |||| ||| |||||||   ||||||||| |||| ||||| | |||||||    
T  37775757 acagtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtgctaacttcaccaaaaaaatcattttaatgactt 37775685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 79 - 446
Target Start/End: Original strand, 55477715 - 55478103
Alignment:
Q  79 aaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 178  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55477715 aaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 55477814  T
Q  179 ggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttac 261  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |                 |||||||    
T  55477815 ggacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttac 55477914  T
Q  262 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt----a 357  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    |    
T  55477915 acttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaa 55478014  T
Q  358 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||| |||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||    
T  55478015 caaacagtggagtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 55478103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 52 - 446
Target Start/End: Original strand, 36493486 - 36493896
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  36493486 tggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaa 36493585  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36493586 ttcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtct 36493685  T
Q  252 taagtg----------------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    ||||||                ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  36493686 taagtgttacactttgtggagtttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatgggga 36493785  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttga 435  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| |    
T  36493786 ctgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttca 36493885  T
Q  436 caatggaattt 446  Q
    | || ||||||    
T  36493886 ccatagaattt 36493896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 53 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 32592497 - 32592103
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32592497 ggtgcagtcataaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaat 32592398  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat----gtgatag 248  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    ||| ||     
T  32592397 tcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatgagtgttac 32592298  T
Q  249 tctt----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 344  Q
     |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32592297 actttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttt 32592198  T
Q  345 tgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaat 439  Q
    ||||| |||  |||||||||||| |||  |||| | |||||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||| | ||||||| |||||    
T  32592197 tgatgtcactatacaaacagtggagtgttactctcaacacttttgatactgtagtgttaacttcatcaaaaaagtcattataatgacttcacaat 32592103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 46887968 - 46888352
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46887968 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 46888067  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctta----------- 253  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |               
T  46888068 gcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtctaagtgttacgttt 46888167  T
Q  254 -----agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 348  Q
          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  46888168 tgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgat 46888267  T
Q  349 gccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| | ||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||  |||||| |  |||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  46888268 gccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagtattaacttcatcagaaaagttattttcttgactt 46888352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 50765115 - 50764748
Alignment:
Q  71 acttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50765115 acttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 50765016  T
Q  171 aacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact------ 264  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | || |||||| ||||          
T  50765015 aacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgtgg 50764916  T
Q  265 --taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 362  Q
      |   || | ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  50764915 ggtgttac-acgtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaac 50764817  T
Q  363 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||    ||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  50764816 agtggggtgttactcacaacacttttgat--gttagtgttaacttcatcaaaaaagttattctcatgactt 50764748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 39 - 433
Target Start/End: Original strand, 5047746 - 5048160
Alignment:
Q  39 tattttgggagctt----ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtga 134  Q
    ||||||||||||||    |||| |||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||    
T  5047746 tattttgggagcttttacggtgcagtcaggaaacagacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgtttattgttga 5047845  T
Q  135 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatg 234  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||| |||    
T  5047846 ttactgatcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatg 5047945  T
Q  235 atattatgtgatagtcttaagtg----------------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaat 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5047946 atatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgcgggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaat 5048045  T
Q  319 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 418  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||     
T  5048046 tgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaacagtgtggtcctactcactacacttttgatgttatagagttgacttcaccagaaaaa 5048145  T
Q  419 tcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||| ||||    
T  5048146 tcattctcataactt 5048160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Original strand, 29584014 - 29584406
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29584014 tgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 29584113  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||                  
T  29584114 gcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcat 29584213  T
Q  255 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
       |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29584214 ggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgcc 29584313  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |  |||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||    
T  29584314 attgtacaaacagtgaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattt 29584406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 74 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1815693 - 1815409
Alignment:
Q  74 tttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1815693 tttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaac 1815594  T
Q  174 atcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca----------- 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  1815593 atcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 1815494  T
Q  263 ------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 341  Q
          |||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815493 gttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 27397015 - 27396619
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397015 aaactgattttttaaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaat 27396918  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag--------- 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||| ||||||||             
T  27396917 gcttgcaacattttggacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacact 27396818  T
Q  256 --------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
            ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27396817 ttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttga 27396718  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||  ||||||||||| |||||  |||||  |||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  27396717 tgtcattgtacaaacagtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 27396619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 32912389 - 32912788
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 163  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32912389 aaactgacttttttgaaaaaattcattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 32912488  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca- 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32912489 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 32912588  T
Q  263 ----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  32912589 tttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttg 32912688  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||  ||   |||||| | | |||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  32912689 atatcattctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 32912788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 47254141 - 47253752
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47254141 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 47254042  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       
T  47254041 gcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 47253942  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47253941 ttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactatgaggactgaacttttga 47253850  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||| ||| ||||| | |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  47253849 tgtcactgtataaacaat-gggtgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 47253752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 34361301 - 34361699
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34361301 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 34361400  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca- 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  34361401 tgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacac 34361500  T
Q  263 ----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| | | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  34361501 tttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgagg-ctgaactttta 34361599  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  34361600 atgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 34361699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 53 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17173703 - 17173316
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  17173703 ggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaat 17173604  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17173603 tcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt 17173504  T
Q  253 aagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    |||||||||                 ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||    
T  17173503 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggaga 17173404  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 423  Q
     ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  17173403 ttgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcatt 17173316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Original strand, 30002455 - 30002819
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30002455 tgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 30002554  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 260  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||||||    
T  30002555 gcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgtta 30002654  T
Q  261 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 360  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||        ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30002655 cacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactaagaagactgaacttttgatgtcactgtacaa 30002746  T
Q  361 acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||| ||||  |||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  30002747 acagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgactt 30002819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3043032 - 3042820
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  3043032 ggtgcagtcaagaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaat 3042933  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3042932 tcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 3042833  T
Q  253 aagtgttacactt 265  Q
    |||||||||||||    
T  3042832 aagtgttacactt 3042820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 65 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17168114 - 17167739
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  17168114 aaactgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgat 17168015  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  17168014 gcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 17167915  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||    
T  17167914 ttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttga 17167815  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 423  Q
    || ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  17167814 tgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcatt 17167739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 65 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 50697643 - 50697320
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50697643 aaactgacttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 50697544  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaaca-tgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------- 254  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||             
T  50697543 gcttacaacatcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcac 50697444  T
Q  255 --------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
            ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  50697443 tttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttg 50697345  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtg 371  Q
    ||| ||  |||||||| || |||||    
T  50697344 atgtcattgtacaaacggtagggtg 50697320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4598383 - 4598009
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4598383 aaactgactttttgtaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataat 4598284  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagt 256  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||    
T  4598283 gcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggt 4598184  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 356  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  4598183 gttacacttaaaacaa-gcaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgt 4598085  T
Q  357 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4598084 acaaacagtggggtgttactcacaacac-tttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgactt 4598009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 33816326 - 33816526
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33816326 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 33816425  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 264  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33816426 gtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacact 33816525  T
Q  265 t 265  Q
    |    
T  33816526 t 33816526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Original strand, 7152013 - 7152214
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7152013 aaaactgacttttttgaaaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataa 7152112  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 263  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  7152113 tgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttatac 7152212  T
Q  264 tt 265  Q
    ||    
T  7152213 tt 7152214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 9139628 - 9139250
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9139628 aaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaatta--gattattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaat 9139531  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt----aagtgtta 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||||||||||||||| |||   | || ||| ||| ||  |||      ||||||    
T  9139530 gcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagt---ttatcttaagtgttacactttgtagggtgtta 9139434  T
Q  261 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 360  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  9139433 cagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaa 9139334  T
Q  361 acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||||||||  |||||||  | |||| || |||||  ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||| || || ||||||    
T  9139333 acggtggggtgttactcact--attttttatgctataacgttaacttcaccaaaaaagtcaatttcatgacttcaccatagaattt 9139250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011873
Alignment:
Q  151 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 250  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  251 ttaag-----------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 333  Q
    |||||                 |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  38012069 ttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggg 38011970  T
Q  334 gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 430  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38011969 gactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatga 38011873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 37288126 - 37287736
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttga-tcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  37288126 tgacttttttgaaaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgct 37288027  T
Q  168 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt--------- 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||             
T  37288026 tgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttg 37287927  T
Q  259 ---------tacacttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 348  Q
             |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||        | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37287926 tgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------ttatgatattatgaggattgaacttttgat 37287835  T
Q  349 gccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc-agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  37287834 gccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagtcattctcattacttcaccatagaattt 37287736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 55 - 395
Target Start/End: Original strand, 4934012 - 4934360
Alignment:
Q  55 tgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaa-ttgttgattagtgattaatgatcaatagtaatt 153  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  4934012 tgtagtcaataaactgacttttttgaacaagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaaatt 4934111  T
Q  154 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctta 253  Q
    |||||| |||||| ||||||||           ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4934112 catctattaatgcgtgcaacat-----------aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtctta 4934200  T
Q  254 agtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 336  Q
    ||||||||||||                 ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  4934201 agtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggat 4934300  T
Q  337 tgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatacta 395  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  4934301 tgaacttttgatgccagtgtacaaacaatgggggtgttactcactacattttttatacta 4934360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17272361 - 17272068
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17272361 tgacttatttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 17272262  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||                  
T  17272261 gcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcat 17272162  T
Q  255 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 349  Q
       |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  17272161 ggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta----gactgaacttttgatg 17272068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 42200127 - 42199748
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgct 167  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  42200127 tgacctttttgaaaaagttaattt-gattttgatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaatgct 42200029  T
Q  168 tgcaacatcttggacttaca-ggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca---- 262  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||        
T  42200028 tgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 42199929  T
Q  263 -------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 349  Q
                 |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  42199928 gtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatg 42199829  T
Q  350 ccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 430  Q
     ||   |||||| | ||||||   ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  42199828 tcattctacaaataatggggtattactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatga 42199748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26896485 - 26896288
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgct 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  26896485 tgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtt 26896386  T
Q  168 tgcaacatctt-ggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 265  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26896385 tgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 26896288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 255 - 433
Target Start/End: Original strand, 33816550 - 33816728
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33816550 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccacc 33816649  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33816650 gtataaatagtgaggtgctactcactacacttttgatgctacaatgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 33816728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39400409 - 39400236
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39400409 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaat 39400310  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 238  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39400309 gcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4205397 - 4205216
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  4205397 ggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaat 4205298  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatg 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4205297 tcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 262
Target Start/End: Original strand, 46883911 - 46884116
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgactttttta-aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46883911 ggtgcagtcaaaaaattgattttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 46884010  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  46884011 ttcatctagtaatgcttgcaacatc--ggacttaca--tactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatagt-t 46884105  T
Q  252 taagtgttaca 262  Q
    |||||||||||    
T  46884106 taagtgttaca 46884116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 204
Target Start/End: Original strand, 35025379 - 35025515
Alignment:
Q  67 actgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 166  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35025379 actgacttttatgaaaaagttaattttgat-ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 35025477  T
Q  167 ttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35025478 ttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 189 - 433
Target Start/End: Original strand, 35025530 - 35025783
Alignment:
Q  189 gtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaaca 271  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||                 ||||||    
T  35025530 gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaaca 35025629  T
Q  272 aggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg 371  Q
    || |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  35025630 agataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatctgat--------gatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtg 35025721  T
Q  372 ccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  35025722 ctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattttcatgactt 35025783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23431956 - 23431826
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23431956 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaat 23431857  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23431856 gcttgcaacatcttggacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 255 - 424
Target Start/End: Original strand, 54499254 - 54499425
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 353  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||     
T  54499254 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcat 54499353  T
Q  354 c-gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattc 424  Q
      |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  54499354 tagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 54499425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38012655 - 38012568
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctag 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012655 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 255 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 39398103 - 39397921
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||         ||||||||||  || |||||||||||||||| |||     
T  39398103 gtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat---------tgatgatactgagaagactgaacttttgatgtcact 39398013  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  39398012 gtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctaatgacttcaccatagaattt 39397921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050169
Alignment:
Q  162 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaacaaa 56050169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3042797 - 3042741
Alignment:
Q  271 aaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 327  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3042797 aaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatac 3042741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 4205210 - 4205119
Alignment:
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||||||||||  | |||  ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || ||||||    
T  4205210 gtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattt 4205119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 404 - 446
Target Start/End: Original strand, 20097494 - 20097536
Alignment:
Q  404 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  20097494 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 20097536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 404 - 446
Target Start/End: Original strand, 38812263 - 38812305
Alignment:
Q  404 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  38812263 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 38812305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Original strand, 7234803 - 7235215
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtg---attaatgatcaatagt 149  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||    
T  7234803 ggtgtagtcaggaaaatgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgttgattaatgatcaatagt 7234902  T
Q  150 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7234903 aattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagt 7235002  T
Q  250 cttaag-----------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 332  Q
    ||||||                 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7235003 cttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatga 7235102  T
Q  333 ggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgact 432  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  7235103 g-actgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccggaaaagtcattctcataact 7235201  T
Q  433 tgacaatggaattt 446  Q
    | || || ||||||    
T  7235202 tcaccatagaattt 7235215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 3879722 - 3880120
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3879722 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaat 3879821  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac- 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3879822 gcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 3879921  T
Q  264 ----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                    ||||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3879922 ttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttga 3880021  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||  ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||    
T  3880022 tgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcgtgacttcaccatagaattt 3880120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 73 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 20768475 - 20768089
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20768475 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 20768376  T
Q  173 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac----------- 261  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||||               
T  20768375 caccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatggga 20768276  T
Q  262 ------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 355  Q
          ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  20768275 tgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagt--aatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-ct 20768179  T
Q  356 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
     ||||||| | || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  20768178 aacaaacaat-ggatgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 20768089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 388
Target Start/End: Original strand, 6090953 - 6091306
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6090953 ggtgcagtcagaaaacttacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 6091052  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc-t 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  6091053 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt 6091152  T
Q  252 taagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    |||||||||||                 |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  6091153 taagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagt 6091252  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacactttt 388  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  6091253 actgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactacattttt 6091306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 33619230 - 33618850
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgat---taatgatcaatagtaattcatctagtaatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33619230 tgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 33619131  T
Q  166 cttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaac-----atgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 260  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||     ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  33619130 cttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactcttaagtgtca 33619031  T
Q  261 cacttaaa-------acaa-ggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 352  Q
    |||||  |       |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33619030 cacttctagggtgttacactggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgcca 33618931  T
Q  353 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  33618930 ccgtacaaataatgggttgctactcactacacttttgatgcgatagtgttgacttcaccagaaaagtatttcccatgactt 33618850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 8513622 - 8513236
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  8513622 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaat 8513530  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 264  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8513529 gcttgcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 8513430  T
Q  265 t-----------aaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 352  Q
    |           ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  8513429 ttgtagggtgttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtca 8513330  T
Q  353 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    | |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  8513329 ctgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 8513236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5627793 - 5627407
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 163  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5627793 aaactgatttttttaaaaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcacctagtaa 5627694  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca- 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  5627693 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacac 5627594  T
Q  263 ----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5627593 tttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttg 5627494  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| ||   |||||| |||||||||  ||||| || | |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5627493 atgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgactt 5627407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1946237 - 1945849
Alignment:
Q  65 aaactgactttttt-aaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagta 162  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1946237 aaactgacttttttgaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaata 1946138  T
Q  163 atgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1946137 atgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 1946038  T
Q  263 -----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttt 345  Q
                     |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1946037 ctttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaactttt 1945938  T
Q  346 gatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc-agaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||| ||   ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  1945937 gatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaagtcattcttatgactt 1945849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 86 - 446
Target Start/End: Original strand, 4318626 - 4319004
Alignment:
Q  86 ttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 185  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4318626 ttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttt 4318725  T
Q  186 caggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaa 268  Q
    |  ||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                 ||||||||||||||    
T  4318726 cccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaa 4318825  T
Q  269 acaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 367  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4318826 acaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgg 4318925  T
Q  368 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  4318926 ggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 4319004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 80 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 6089282 - 6088911
Alignment:
Q  80 aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 179  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6089282 aaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacattttg 6089190  T
Q  180 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac-----------ttaaa 268  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||           |||||    
T  6089189 gacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtgttaaa 6089090  T
Q  269 acaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 367  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6089089 acaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagtgg 6088990  T
Q  368 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || |  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||    
T  6088989 ggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 6088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 33892795 - 33893183
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33892795 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaat 33892894  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagt 256  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||    
T  33892895 gtttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggt 33892994  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 356  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||  ||    
T  33892995 gttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttaatatcattgt 33893093  T
Q  357 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| | |||| | ||||| ||||||| || || ||||||    
T  33893094 acaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaaattattctaatgactttaccatagaattt 33893183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 433
Target Start/End: Original strand, 21016913 - 21017280
Alignment:
Q  77 ttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21016913 ttaaaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 21017012  T
Q  177 ttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-----------------t 259  Q
    || |||      |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 |    
T  21017013 ttagac------gtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtt 21017106  T
Q  260 acacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtaca 359  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  21017107 acacttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtaca 21017206  T
Q  360 aacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    || | |||||||  |||||| ||| |||| |||||| | |||  ||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  21017207 aataatggggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttcaccaaaaaagtcattttcgtgactt 21017280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 29182562 - 29182179
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  29182562 aaactaacttttttgaaaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatca---gtaattcatctagtaat 29182466  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       
T  29182465 acttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 29182366  T
Q  262 ---------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                   |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  29182365 ttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttg 29182266  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  29182265 atgacactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcaataaaatcattctcatgactt 29182179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 255 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 15491809 - 15491631
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  15491809 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccact 15491710  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  || | |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15491709 gtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttacaatgttaacttcacgagaaaagtcattctcataactt 15491631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 213
Target Start/End: Original strand, 7054543 - 7054704
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-a 151  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7054543 ggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtata 7054642  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatcttt 213  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  7054643 ttcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttatcgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 180 - 446
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353539
Alignment:
Q  180 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt-----------------aca 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||                 |||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 30353355  T
Q  263 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 362  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  30353356 cttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaac 30353455  T
Q  363 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||| | |   |||| | |||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  30353456 agtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 30353539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 255 - 433
Target Start/End: Original strand, 7055205 - 7055383
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  7055205 gtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcatt 7055304  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
     |||||| |||| ||||  ||| | || | |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  7055305 ctacaaatagtgaggtgttactaattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgactt 7055383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 318 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498449
Alignment:
Q  318 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaa 18498466  T
Q  417 agtcattctcatgactt 433  Q
    |||||||||||||||||    
T  18498465 agtcattctcatgactt 18498449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 140
Target Start/End: Original strand, 33724062 - 33724117
Alignment:
Q  85 gttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatg 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33724062 gttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttaatgattaatg 33724117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 265
Target Start/End: Original strand, 7055141 - 7055198
Alignment:
Q  208 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 265  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7055141 atctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 7055198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 69 - 368
Target Start/End: Original strand, 7006744 - 7007043
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7006744 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgctt 7006843  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7006844 gcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaagtgttacacttaaa 7006943  T
Q  269 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 368  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7006944 acaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaacagtggg 7007043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 33660179 - 33660568
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33660179 aaactgacttttctgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 33660278  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat----gtgatagtctt----aagt 256  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    ||| ||  |||      ||    
T  33660279 gcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgggtgttacactttgtggggt 33660378  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  33660379 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgt 33660478  T
Q  357 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||||| |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| || |||||||||||| | ||||||| || || ||||||    
T  33660479 acaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttaactagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattt 33660568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 4167335 - 4166925
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  4167335 ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaat 4167236  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4167235 tcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtttt 4167136  T
Q  253 aagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    |||||||||                 ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  4167135 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatgggga 4167036  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttga 435  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  4167035 ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttca 4166936  T
Q  436 caatggaattt 446  Q
    | || ||||||    
T  4166935 ccatagaattt 4166925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 69 - 412
Target Start/End: Original strand, 43648051 - 43648411
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43648051 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 43648150  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 254  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  43648151 gcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgt 43648250  T
Q  255 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
       |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43648251 gtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtc 43648350  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 412  Q
    |   ||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||||    
T  43648351 attatacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 43648411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4764033 - 4763644
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaa-gttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4764033 aaactgactttttaaaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaa 4763934  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-- 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4763933 tgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 4763834  T
Q  262 ---------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                   |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  4763833 tttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttg 4763734  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcg---acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  |||||||| |   |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4763733 atgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactacagttttgttgatatagtgttgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgactt 4763644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 53 - 446
Target Start/End: Original strand, 2325168 - 2325570
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    |||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2325168 ggtgcagtcagaaaattgattttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaat 2325267  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2325268 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtctt 2325367  T
Q  253 aagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 335  Q
    ||||||||||                 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||    
T  2325368 aagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgatactatgagga 2325459  T
Q  336 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttga 435  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| |||| || ||||  |||| |||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||| |    
T  2325460 ctgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttcacgagaaaagtcattcacataacttca 2325559  T
Q  436 caatggaattt 446  Q
    | || ||||||    
T  2325560 ccatagaattt 2325570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 64 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26357979 - 26357593
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26357979 aaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 26357880  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt----- 258  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||         
T  26357879 tgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaagtgttacaa 26357780  T
Q  259 ------------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |  |||| || ||||||||||||    
T  26357779 tttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttg 26357680  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26357679 atgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgactt 26357593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 59 - 433
Target Start/End: Original strand, 33550778 - 33551173
Alignment:
Q  59 gtcaaaaaactgacttttttaaaaaa-gttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatga----tcaatagtaatt 153  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    |||||||| |||    
T  33550778 gtcagaaaactgaatttttaaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttatt 33550877  T
Q  154 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctta 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||    
T  33550878 catctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtctta 33550976  T
Q  254 agtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 336  Q
    |||||||||                 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33550977 agtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagac 33551076  T
Q  337 tgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
     |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33551077 cgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcattctcatgactt 33551173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 53 - 433
Target Start/End: Original strand, 18494071 - 18494455
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 152  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18494071 ggtgtagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaat 18494170  T
Q  153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||    
T  18494171 tcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtctt 18494270  T
Q  253 aagtg----------------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 336  Q
    |||||                |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494271 aagtgtgactctttgtgaggtttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggac 18494370  T
Q  337 tgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||| |            ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18494371 tgaacttttgatgtc------------gtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgactt 18494455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 41465903 - 41465512
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41465903 aaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaa 41465804  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-- 261  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  41465803 tgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacac 41465704  T
Q  262 ---------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
                   ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  41465703 tttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttg 41465604  T
Q  347 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || ||| |||        | |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  41465603 ataccagcgt--------tagggtgctactcactacacctttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 41465512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 65 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 41961241 - 41960940
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41961241 aaactgaattttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41961142  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  41961141 gcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacact 41961042  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41961041 ttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttga 41960942  T
Q  348 tg 349  Q
    ||    
T  41960941 tg 41960940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 53 - 430
Target Start/End: Original strand, 11366170 - 11366565
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-a 151  Q
    |||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11366170 ggtgcagtcagaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtata 11366269  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11366270 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtct 11366369  T
Q  252 taagtgttacac-----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    ||||||||||||                 ||| |||||| || | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11366370 taagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagg 11366469  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 430  Q
     |||||||||||||| ||   |||||| |||| | ||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  11366470 gctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattcttatga 11366565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 43770650 - 43771038
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43770650 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaat 43770749  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagt 256  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||    | ||    
T  43770750 gcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtgaggt 43770849  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 356  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||    
T  43770850 gttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgt 43770949  T
Q  357 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    | |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || || ||||||    
T  43770950 ataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaatcattctaatgacttcaccatagaattt 43771038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 433
Target Start/End: Original strand, 19424444 - 19424815
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19424444 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 19424543  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||              |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||              
T  19424544 gcttgcaacatcttagacttgcaggtactat--------------ctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacact 19424629  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19424630 ttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttga 19424729  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||  || ||||| |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19424730 tgccactatataaacaatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagccattctcatgactt 19424815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 423
Target Start/End: Original strand, 19289125 - 19289500
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19289125 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 19289224  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac- 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19289225 gcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 19289324  T
Q  264 ----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  19289325 ttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttga 19289424  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 423  Q
    || ||  ||||||||| |||||||  ||||| || | |||||||  ||||||||  |||||| || ||||||||||    
T  19289425 tgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatt 19289500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 67 - 417
Target Start/End: Original strand, 33709036 - 33709403
Alignment:
Q  67 actgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 166  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709036 actgaattttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 33709135  T
Q  167 ttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa------------ 254  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||                
T  33709136 ttgcaacatcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttt 33709235  T
Q  255 -----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 349  Q
         |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33709236 gtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatg 33709335  T
Q  350 ccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 417  Q
     ||| |||| |||||||| |||  |||| | |||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||    
T  33709336 tcactgtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccataaaa 33709403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 64 - 433
Target Start/End: Original strand, 39167170 - 39167550
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  39167170 aaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagtaa 39167269  T
Q  164 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------- 254  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | |             
T  39167270 tgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagttgttacactttgtg 39167369  T
Q  255 --gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 352  Q
       |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39167370 ggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 39167469  T
Q  353 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
      |||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||  |||  |||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  39167470 ttgtacaaacagtgaggtgttactcacaatacttttgatactattctgttaacttcatcaaaaaaatcattctcgtgactt 39167550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 65 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3177340 - 3176965
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3177340 aaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaat 3177241  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 261  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  3177240 gcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 3177141  T
Q  262 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3177140 ttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 3177041  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 423  Q
    || ||  ||||||||||| | |||  |||||  ||| |||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  3177040 tgtcattgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttcatcagaaaagtcatt 3176965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 65 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 5881930 - 5881544
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5881930 aaactgatttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaat 5881831  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagt 256  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    ||  |||    | ||    
T  5881830 gcttgcaacatcttagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtgagtgttacactttgtgaggt 5881731  T
Q  257 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 356  Q
     ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  5881730 attacacttaaaacaaggtatgat-aaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgt 5881632  T
Q  357 acaaacagtggggtgccactcactacac-----ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaat 439  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||     |||||||  |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  5881631 acaaacagtggggtgttactcacaacacttttgttttgatgttataatatcaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcacaat 5881544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 104 - 417
Target Start/End: Original strand, 27349789 - 27350109
Alignment:
Q  104 tttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27349789 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgt 27349888  T
Q  204 taaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagt 295  Q
    |  |||||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||    ||  |||      ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27349889 tggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagt 27349988  T
Q  296 gcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatacta 395  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||| |||    
T  27349989 gtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatgcta 27350087  T
Q  396 tagtgtcgacttcaccagaaaa 417  Q
    ||||||  ||||||||| ||||    
T  27350088 tagtgttaacttcaccaaaaaa 27350109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 114 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478406
Alignment:
Q  114 ttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatcttt 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||   ||||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  214 aacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------------acttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagt 300  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||            ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacactttgtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtatt 4478518  T
Q  301 cttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||  |||||||    
T  4478517 cttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtg 4478418  T
Q  401 tcgacttcacca 412  Q
    |  |||||||||    
T  4478417 ttaacttcacca 4478406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Original strand, 31570536 - 31570934
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31570536 aaactgactttttttaaaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagcaat 31570635  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||              
T  31570636 gcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacatt 31570735  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31570736 ttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttga 31570835  T
Q  348 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    || |||  || ||| |||||||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| || || ||||||    
T  31570836 tgtcactataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgttaatttcaccagaaaagttattctcataacttcaccatagaattt 31570934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 446
Target Start/End: Original strand, 29241934 - 29242338
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||  |||||||  |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  29241934 tggtgcagtcaggaaactgaactttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaa 29242033  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    ||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29242034 ttcatctagtaattc-------atcttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtct 29242126  T
Q  252 taagtgt-----------------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 334  Q
    || ||||                 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29242127 taggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaag 29242226  T
Q  335 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttg 434  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| | |||| ||  |||||| |  ||||||||| ||||  |||| |||||||||     
T  29242227 actgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgttacgcactatattttttatgttatagttttaacttcaccaaaaaaaccattttcatgacttc 29242326  T
Q  435 acaatggaattt 446  Q
    || || ||||||    
T  29242327 accatagaattt 29242338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 60 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35959298 - 35959097
Alignment:
Q  60 tcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatcta 159  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35959298 tcaaaaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatcta 35959199  T
Q  160 gtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 259  Q
    |||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35959198 gtaatgcttgcaacatcttgg----acatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgtt 35959103  T
Q  260 acactt 265  Q
    ||||||    
T  35959102 acactt 35959097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19314186 - 19313855
Alignment:
Q  127 attagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta---caggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaa 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  19314186 attactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaa 19314087  T
Q  224 caaagttgatgatattatgtgatagtcttaa----------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 313  Q
    || ||||| |||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  19314086 catagttgctgatatcatgtgatagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctga 19313987  T
Q  314 tgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccag 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||  ||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  19313986 tgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccag 19313888  T
Q  414 aaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  19313887 aaaagtcattctaatgacttcaccatagaattt 19313855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 64 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 37906113 - 37905740
Alignment:
Q  64 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgatt-catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagta 162  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37906113 aaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccagta 37906014  T
Q  163 atgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 262  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37906013 attcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttaca 37905914  T
Q  263 -------------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 343  Q
                       |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37905913 ctttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 37905814  T
Q  344 ttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 417  Q
    |||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||  |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||    
T  37905813 ttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaa 37905740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13711853 - 13711467
Alignment:
Q  72 cttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgca 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || | | || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13711853 cttttttgaaaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgca 13711754  T
Q  172 acatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa----------------- 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||                     
T  13711753 acatcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaactattatactttatggg 13711654  T
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    ||||||||||||||||     | | |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||     
T  13711653 gtgttacacttaaaac-----atgataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcact 13711559  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  13711558 gtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctgatgacttcaccatagaattt 13711467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 73 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 44914060 - 44913665
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcat---ctagtaatgcttg 169  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||| |||||||||    
T  44914060 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttg 44913961  T
Q  170 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-------- 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  44913960 caacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 44913861  T
Q  262 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gaggactgaacttttgatgc 350  Q
              ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||     
T  44913860 ggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgt 44913761  T
Q  351 caccgtacaaac-agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||   ||||||| |||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||| || |||||| || || ||||||    
T  44913760 cattttacaaacaagtgaggtgttactcacaacatttttgatactacagtgttaacttca-cataaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 44913665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 113 - 446
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264277
Alignment:
Q  113 tttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctt 212  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||   |||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  213 taacatgcaaacaaagttgatgatattatgt-gatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaag 294  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 4264125  T
Q  295 tgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatact 394  Q
    || | |||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||    
T  4264126 tgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgct 4264225  T
Q  395 atagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||    
T  4264226 atagtgttaactttaccagaaaagtcattatgatgacttcaccatagaattt 4264277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31862253 - 31861953
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31862253 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 31862154  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 262  Q
    |  | ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||   |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||      
T  31862153 gtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacact 31862054  T
Q  263 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
                   |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  31862053 ttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataatgactgaaattttga 31861954  T
Q  348 t 348  Q
    |    
T  31861953 t 31861953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Original strand, 19500706 - 19500914
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19500706 tggtgcagtcaaaaaatt-acttttttgaaaaaat-aattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 19500803  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  19500804 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtct 19500903  T
Q  252 taagtgttaca 262  Q
    |||||||||||    
T  19500904 taagtgttaca 19500914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 132 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 44286283 - 44285965
Alignment:
Q  132 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  44286283 tgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttg 44286184  T
Q  232 atgatattatgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgat 314  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  44286183 ttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgat 44286084  T
Q  315 gaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccaga 414  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |    ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  44286083 gaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcaga 44285984  T
Q  415 aaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  44285983 aaaatcattcgcatgactt 44285965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 161 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36641989
Alignment:
Q  161 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 260  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  261 cactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaa--ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 341  Q
    |||||                 ||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36642193 cactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaac 36642094  T
Q  342 ttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatgg 441  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  36642093 ttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatag 36641994  T
Q  442 aattt 446  Q
    |||||    
T  36641993 aattt 36641989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 161 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327801
Alignment:
Q  161 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  261 cactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 343  Q
    |||||                 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaactt 45327826  T
Q  344 ttgatgccaccgtacaaacagtggg 368  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  45327825 ttgatgtcaccgtataaacaatggg 45327801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 172 - 446
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071937
Alignment:
Q  172 acatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt------ 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17071745  T
Q  266 -----------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
               |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||      
T  17071746 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcatt 17071845  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||| | || | ||  ||| |||||| ||||| |  ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  17071846 gtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattt 17071937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 172 - 446
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054296
Alignment:
Q  172 acatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca--------- 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||             
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggg 17054104  T
Q  263 --------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
            ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||| ||      
T  17054105 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcatt 17054204  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||||||| || | ||  ||| |||||| |||||||  |||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  17054205 gtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattt 17054296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 446
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41464050
Alignment:
Q  192 ctattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaagg 274  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                 |||||||| ||||||||| |    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaag 41463878  T
Q  275 tagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgcca 374  Q
    || | |||||||| |||||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |    
T  41463879 tatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgtta 41463978  T
Q  375 ctcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||||| ||| |||||||||| ||||| || || ||||||    
T  41463979 ctcacaacacttttgattttatagtattaacttcaccaaaaatgtcattctcacgacttcaccatagaattt 41464050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 201
Target Start/End: Original strand, 41051112 - 41051238
Alignment:
Q  75 ttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 174  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  41051112 ttttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaaca 41051211  T
Q  175 tcttggacttacaggtactattttatc 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41051212 tcttgaacttacaggtactattttatc 41051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 263 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 33902252 - 33902092
Alignment:
Q  263 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||    
T  33902252 cttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaac 33902153  T
Q  363 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattct 425  Q
    ||||||||   |||||||||| ||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33902152 agtggggtattactcactacattttt--tatgttagtgttaacttcaccagaaaagtcattct 33902092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 193
Target Start/End: Original strand, 41463400 - 41463520
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 172  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  41463400 tttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaa 41463499  T
Q  173 catcttggacttacaggtact 193  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  41463500 catcttagacttagaggtact 41463520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33902407 - 33902317
Alignment:
Q  73 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33902407 ttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacagattaataatcaataataattcatctagtaa 33902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 178
Target Start/End: Original strand, 18257340 - 18257453
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || ||| |  || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18257340 aaactgacttttgtgaaaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaat 18257439  T
Q  165 gcttgcaacatctt 178  Q
    ||||||||||||||    
T  18257440 gcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45328091 - 45328028
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgat 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45328091 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 45328028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 265
Target Start/End: Original strand, 18258198 - 18258289
Alignment:
Q  174 atcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 265  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18258198 atcttagacttgcagttactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 18258289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 422
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051382
Alignment:
Q  304 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac-cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtc 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||  |  ||| ||||||||||| ||||||| |     
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtgttatacacaacacttttgatgctatagtatt 41051362  T
Q  403 gacttcaccagaaaagtcat 422  Q
      ||||| ||||||||||||    
T  41051363 agcttcatcagaaaagtcat 41051382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 346
Target Start/End: Original strand, 19501760 - 19501839
Alignment:
Q  266 aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 346  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19501760 aaaacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 35959077 - 35958925
Alignment:
Q  268 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 367  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  35959077 aacaaggtaggataaa-ttatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg------------ctgaacttttaatgtcattgtacaaacagtgg 35958991  T
Q  368 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||   |||| |||| |||| ||  ||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  35958990 ggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttcaccaaaaaagtcatttttatgactt 35958925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 17071571 - 17071646
Alignment:
Q  63 aaaaactgacttttttaaaa-aagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgatta 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17071571 aaaaactgacttttttaaaataaaaaaaaattgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 17053931 - 17054005
Alignment:
Q  63 aaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgatta 137  Q
    ||||||||||||||| ||| ||   ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17053931 aaaaactgactttttaaaataaaaaaaaattgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902267
Alignment:
Q  213 taacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 265  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactt 33902267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 19093826 - 19093787
Alignment:
Q  53 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattt 92  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19093826 ggtgcagtcaaaaaattgacttttttaaaaaagttaattt 19093787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 110
Target Start/End: Original strand, 4263711 - 4263756
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgatt 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4263711 aaactgattttttttaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt 4263756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 6177820 - 6177791
Alignment:
Q  404 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177820 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 6177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Original strand, 18258296 - 18258349
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaa 308  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  18258296 gtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 8284 - 7890
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 168  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8284 tgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 8185  T
Q  169 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  8184 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 8085  T
Q  263 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 351  Q
               |||| | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8084 ggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 7985  T
Q  352 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    |  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||||||||||| || |||| || || ||||||    
T  7984 attgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattt 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 44364 - 43960
Alignment:
Q  58 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 157  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  44364 agtcaacaaactgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatt 44265  T
Q  158 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 257  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44264 cagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtg 44166  T
Q  258 ttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 340  Q
    |||||                 |||| |||||| || | |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44165 ttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 44066  T
Q  341 cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatg 440  Q
    ||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||| |||| | ||||| || ||     
T  44065 ctttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccata 43966  T
Q  441 gaattt 446  Q
    ||||||    
T  43965 gaattt 43960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 446
Target Start/End: Original strand, 154423 - 154827
Alignment:
Q  58 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 157  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  154423 agtcaacaaactgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatt 154522  T
Q  158 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 257  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  154523 cagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtg 154621  T
Q  258 ttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 340  Q
    |||||                 |||| |||||| || | |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154622 ttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 154721  T
Q  341 cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatg 440  Q
    ||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||| |||| | ||||| || ||     
T  154722 ctttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccata 154821  T
Q  441 gaattt 446  Q
    ||||||    
T  154822 gaattt 154827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 12309 - 11909
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12309 aaacttacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 12211  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 254  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||              
T  12210 gcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacact 12111  T
Q  255 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 347  Q
           ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12110 ttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttga 12011  T
Q  348 tgccaccg-tacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtca-ttctcatgacttgacaatggaat 444  Q
    | |||| | |||||||| | ||||||  |||||| |||||||| ||  ||| ||||  | |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||    
T  12010 taccactgatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgttaatttcaccagaaaagtcatttctcatgacttcaccatagaat 11911  T
Q  445 tt 446  Q
    ||    
T  11910 tt 11909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 80 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 514 - 137
Alignment:
Q  80 aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 179  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  514 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 415  T
Q  180 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-------------- 265  Q
    |||      ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  414 gac------gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttaca 321  T
Q  266 ---aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 362  Q
       |||| ||| |||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  320 cttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaac 221  T
Q  363 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 446  Q
    ||||| |||  |||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||    
T  220 agtggagtgttactcacaacattttttatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 75 - 348
Target Start/End: Original strand, 408223 - 408512
Alignment:
Q  75 ttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 174  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408223 ttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 408322  T
Q  175 tcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtg 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||                 |||    
T  408323 tcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtg 408422  T
Q  258 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 348  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  408423 ttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgat 408512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 93885 - 94056
Alignment:
Q  65 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 164  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  93885 aaacggacctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaat 93983  T
Q  165 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  93984 gcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 255 - 428
Target Start/End: Original strand, 94374 - 94547
Alignment:
Q  255 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 354  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||     
T  94374 gtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccact 94473  T
Q  355 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcat 428  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||    
T  94474 gtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcat 94547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Original strand, 145803 - 146185
Alignment:
Q  69 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgct 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  145803 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtatattcatttagtaatgct 145902  T
Q  168 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca----- 262  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  145903 tgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 146002  T
Q  263 ------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 350  Q
                |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  146003 tagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgt 146102  T
Q  351 caccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    ||   |||||| | |||||||  ||||| |||| |||| ||  |||| |||  |||| |||| |||| ||||||| |||||||    
T  146103 cattctacaaataatggggtgttactcattacattttttatgttataatgttaacttaaccaaaaaaatcattcttatgactt 146185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 267690 - 267331
Alignment:
Q  52 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 151  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |         |||    
T  267690 tggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattggt---------taa 267600  T
Q  152 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc- 250  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  267599 ttcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 267500  T
Q  251 ttaagtgttacac-----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 333  Q
    |||||||||||||                 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||       
T  267499 ttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattataga 267400  T
Q  334 gactgaacttttgatgccaccgtac-aaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 401  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||  |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  267399 gactgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgt 267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 101058 - 100894
Alignment:
Q  121 ttgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgc 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||            ||||||  ||||||||||||||    
T  101058 ttgttgattactgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttac------------atcgttggaatctttaacatgc 100973  T
Q  221 aaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac--ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgt 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  100972 aaacagagttgatgatattatgtg--------aagtgttacacagttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 42439 - 42364
Alignment:
Q  358 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 433  Q
    |||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  42439 caaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctcatgactt 42364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University