View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20057_low_2 (Length: 685)

Name: NF20057_low_2
Description: NF20057
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20057_low_2
NF20057_low_2
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (16-668)||(29173359-29174011)
chr1 (100-613)||(51441649-51442160)
chr1 (113-613)||(49348279-49348784)
chr1 (208-613)||(43241266-43241669)
chr1 (178-608)||(8670882-8671313)
chr1 (113-613)||(35829278-35829772)
chr1 (119-603)||(32405359-32405836)
chr1 (265-613)||(45833611-45833957)
chr1 (265-608)||(34827975-34828318)
chr1 (470-601)||(40418936-40419067)
chr1 (483-613)||(37463747-37463877)
chr1 (232-339)||(11681837-11681944)
chr1 (475-613)||(3877199-3877337)
chr1 (384-428)||(31264670-31264714)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (100-613)||(23907187-23907698)
chr4 (100-613)||(48623412-48623923)
chr4 (251-613)||(435267-435629)
chr4 (232-613)||(1777900-1778283)
chr4 (232-608)||(39707480-39707854)
chr4 (193-601)||(27451070-27451476)
chr4 (265-613)||(53703658-53704007)
chr4 (402-613)||(55769268-55769478)
chr4 (402-613)||(55833524-55833734)
chr4 (103-323)||(16001117-16001335)
chr4 (281-445)||(2296236-2296403)
chr4 (116-256)||(56224665-56224803)
chr4 (355-555)||(16002147-16002346)
chr4 (298-481)||(21059840-21060023)
chr4 (326-541)||(41426964-41427176)
chr4 (344-458)||(6937107-6937221)
chr4 (402-440)||(33369028-33369066)
chr4 (424-540)||(44860319-44860433)
chr4 (570-613)||(1212192-1212235)
chr4 (384-456)||(29822295-29822367)
chr4 (167-201)||(32912059-32912093)
chr4 (402-440)||(41598176-41598214)
chr4 (422-459)||(42037113-42037150)
chr4 (500-608)||(52281349-52281458)
chr4 (371-444)||(54797344-54797419)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (100-613)||(36650880-36651391)
chr7 (149-613)||(33350691-33351153)
chr7 (100-613)||(32629498-32630005)
chr7 (236-613)||(39907264-39907641)
chr7 (100-603)||(24178090-24178591)
chr7 (360-613)||(46356736-46356989)
chr7 (116-417)||(11592591-11592890)
chr7 (232-481)||(38896633-38896882)
chr7 (281-481)||(22346577-22346777)
chr7 (333-613)||(38606156-38606435)
chr7 (403-613)||(36870209-36870419)
chr7 (417-613)||(11593154-11593350)
chr7 (499-613)||(49028564-49028678)
chr7 (402-613)||(48055702-48055912)
chr7 (413-613)||(20499308-20499506)
chr7 (368-481)||(33738343-33738456)
chr7 (552-613)||(38896947-38897008)
chr7 (435-539)||(43793985-43794089)
chr7 (550-608)||(22346783-22346841)
chr7 (402-454)||(32483659-32483711)
chr7 (393-442)||(17101539-17101588)
chr7 (266-342)||(46356993-46357069)
chr7 (401-455)||(31988024-31988078)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (100-613)||(24177410-24177921)
chr5 (113-613)||(20317890-20318388)
chr5 (149-613)||(2076359-2076821)
chr5 (100-434)||(1288592-1288924)
chr5 (100-517)||(26845-27260)
chr5 (499-613)||(1288474-1288588)
chr5 (510-613)||(1274559-1274662)
chr5 (502-613)||(3393997-3394108)
chr5 (502-603)||(3301135-3301236)
chr5 (529-613)||(12493247-12493331)
chr5 (416-606)||(31502939-31503129)
chr5 (281-491)||(37123637-37123846)
chr5 (410-613)||(30418593-30418793)
chr5 (402-600)||(14099514-14099710)
chr5 (407-541)||(3095324-3095457)
chr5 (238-372)||(756080-756214)
chr5 (407-481)||(17212459-17212533)
chr5 (547-608)||(27262-27323)
chr5 (402-458)||(35685044-35685100)
chr5 (501-540)||(7605744-7605783)
chr5 (346-443)||(3422965-3423060)
chr5 (550-608)||(43558689-43558747)
chr5 (232-301)||(22832091-22832160)
chr5 (609-653)||(20318447-20318491)
chr5 (240-339)||(25937120-25937220)
[»] chr3 (12 HSPs)
chr3 (149-613)||(51448594-51449056)
chr3 (232-613)||(52137844-52138225)
chr3 (101-613)||(38848989-38849491)
chr3 (100-441)||(3368649-3368989)
chr3 (319-526)||(50630293-50630498)
chr3 (384-604)||(9258055-9258274)
chr3 (217-613)||(27916581-27916968)
chr3 (296-614)||(48220860-48221179)
chr3 (297-431)||(30724850-30724980)
chr3 (402-533)||(11580749-11580880)
chr3 (294-446)||(6778993-6779143)
chr3 (515-563)||(19736514-19736562)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (100-607)||(8179679-8180186)
chr2 (232-613)||(452501-452882)
chr2 (149-613)||(24584491-24584956)
chr2 (232-613)||(45368510-45368892)
chr2 (100-606)||(37280994-37281495)
chr2 (384-613)||(2609696-2609925)
chr2 (164-608)||(13148272-13148714)
chr2 (443-613)||(16291940-16292110)
chr2 (499-613)||(38453503-38453617)
chr2 (238-526)||(33251337-33251624)
chr2 (294-613)||(14769383-14769695)
chr2 (470-613)||(876411-876551)
chr2 (103-204)||(11502805-11502906)
chr2 (392-454)||(6464937-6464999)
chr2 (406-491)||(39287838-39287923)
chr2 (240-339)||(7789634-7789733)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (100-613)||(36544038-36544549)
chr8 (100-613)||(15216157-15216665)
chr8 (242-613)||(42854898-42855271)
chr8 (384-613)||(36566126-36566355)
chr8 (355-613)||(25984689-25984945)
chr8 (100-309)||(13588593-13588800)
chr8 (370-443)||(6184814-6184887)
chr8 (294-346)||(41445394-41445446)
chr8 (530-609)||(45231811-45231890)
chr8 (239-481)||(30579239-30579481)
chr8 (384-526)||(35093989-35094131)
chr8 (509-613)||(3284785-3284890)
chr8 (537-613)||(13983954-13984030)
chr8 (402-461)||(41445320-41445380)
chr8 (406-454)||(11130981-11131029)
chr8 (569-613)||(12492727-12492771)
chr8 (161-225)||(41148437-41148500)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (112-613)||(6082287-6082797)
chr6 (102-613)||(20428522-20429031)
chr6 (232-613)||(30669911-30670285)
chr6 (100-562)||(5260184-5260644)
chr6 (100-613)||(9705684-9706172)
chr6 (99-613)||(26290669-26291179)
chr6 (265-481)||(2681453-2681669)
chr6 (296-454)||(3629346-3629504)
chr6 (354-613)||(2208287-2208546)
chr6 (499-600)||(2680945-2681046)
chr6 (164-613)||(17222503-17222947)
chr6 (333-539)||(9369353-9369558)
chr6 (511-605)||(27790451-27790545)
chr6 (552-608)||(3629566-3629622)
chr6 (115-176)||(3629192-3629253)
chr6 (384-493)||(10864625-10864734)
chr6 (609-653)||(20428419-20428463)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (100-613)||(13141-13653)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (268-613)||(30520-30865)
[»] scaffold0045 (3 HSPs)
scaffold0045 (294-459)||(90129-90294)
scaffold0045 (470-551)||(88869-88950)
scaffold0045 (568-613)||(88819-88864)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (354-613)||(386-645)
[»] scaffold0606 (2 HSPs)
scaffold0606 (281-461)||(8756-8936)
scaffold0606 (497-613)||(8949-9065)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (276-523)||(25184-25431)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (344-459)||(5575-5690)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (280-367)||(14917-15004)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 564; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 29174011 - 29173359
Alignment:
Q  16 aatatgtaggtaacaaatttagatatacaaaatgaggccaaaacataatttcatcaaatttgtattacnnnnnnnaacgtaatttagaggaatagtatgg 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||| || |||    
T  29174011 aatatgcaggtaacaaatttagatatacaaaatgaggccaaaacataatttgatcaaatttgtattactttttttaacgtaatttagaggaattgtgtgg 29173912  T
Q  116 ctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggatatac 215  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29173911 ttcaccaaactttttaacgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatctataagaacaagaaggatatac 29173812  T
Q  216 gaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagtt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173811 gaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagtt 29173712  T
Q  316 acggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagact 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173711 acggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatttacttacttcgacgtgtgatggagcgatatcagacggataaaaaagact 29173612  T
Q  416 tgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatat 515  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29173611 tgcacttagtttttattgatttggagaaggcgtatgatagagtgccgagagaggttttgtggaaaggcctagagaagagaggggttaggattgcctatat 29173512  T
Q  516 tagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaagag 615  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173511 tagagctatcaatgatatgcatggggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaagag 29173412  T
Q  616 ttagcacctagaagtatgcattttgcagatgatatagtttgggatgtacttac 668  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173411 ttagcacctagatgtatgcattttgcagatgatatagtttgggatgtacttac 29173359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 100 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 51442160 - 51441649
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| ||||||||| | |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  51442160 tagagggattgtgtggctcacaaacctttttaacgagattatgaggacgaagaaaatgtcggacgagtggagaagaagcactttaattccaatctataag 51442061  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||  |||||||| ||||  || ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||    
T  51442060 aacaagggggatatacaaaatcacgcgaattata--ggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaag 51441963  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||    
T  51441962 aaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatgcctgggaggtcgactatggaagcaatctacttacatcgacgcgtgatggagtgatatcag 51441863  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  || ||||  |||||||||||| ||| ||||| | | | |    
T  51441862 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaagcgtatgatagagtatcgtgagagattttgtggaaagccctggagaagaaatggg 51441763  T
Q  500 ttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaat 599  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51441762 ttagaattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgattagtgtgaggacgcaagatgggactaccgaagattttcccataacaat 51441663  T
Q  600 aggattgcatcaag 613  Q
    ||||||||| ||||    
T  51441662 aggattgcaccaag 51441649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 113 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 49348784 - 49348279
Alignment:
Q  113 tggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggata 212  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||| | |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||    
T  49348784 tggctcacaaacctttttaacgagattatgaggacgaagaaaatgtcggacgagtggagaagaagcactttaattccaatctataagaacaaggggg-ta 49348686  T
Q  213 tacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcga 312  Q
    ||| |||||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||| ||| || |||| ||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||  ||||||||    
T  49348685 tacaaaattgcgcgaattata--ggagaattaagctaatgagtcataccatgaagtcatgggaaagggtgatcgaaagaagactaagaaagaagactcga 49348588  T
Q  313 gttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaag 412  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49348587 gttatggataaccaatttggttttatgcctgggaggtcgactatggaagcaatctacttacttcgacgcgtgatggagcgatatcggacggataaaaaag 49348488  T
Q  413 acttgcacttagttttcattgatttggagaaggc--------atatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttagg 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | | | ||||||    
T  49348487 acttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtgtgatagtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctggagaagaaaagggttagg 49348388  T
Q  505 attgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggat 604  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49348387 attgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcatgatgggactaccgaagattttcccataacaataggat 49348288  T
Q  605 tgcatcaag 613  Q
    |||| ||||    
T  49348287 tgcaccaag 49348279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 208 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 43241669 - 43241266
Alignment:
Q  208 ggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagaga 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||    
T  43241669 ggatatacaaaattgcgtgaattataa--gggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaagaaaggaga 43241572  T
Q  308 ctcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataa 407  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  43241571 ctcaagttacggataaccaatttggttttatgcctgggaggtcgactatggaagcaatctacttacttcgacgcgtgatggagcgatatcggacggataa 43241472  T
Q  408 aaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggatt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||| | ||| |||||||||    
T  43241471 aaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaagacgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagctctggagaagaaaggggttaggatt 43241372  T
Q  508 gcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgc 607  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43241371 gcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcacgatgggactaccgaagattttcccataacaataggattgc 43241272  T
Q  608 atcaag 613  Q
    | ||||    
T  43241271 accaag 43241266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 178 - 608
Target Start/End: Original strand, 8670882 - 8671313
Alignment:
Q  178 cactttaatttcaatttataagaacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaa 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  8670882 cactttaattccaatttataagaacaagggggatatacaaaactgcgcgaattata--ggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaa 8670979  T
Q  278 ggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttg 377  Q
    || |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8670980 gggtgatggaaagaaaactaagaaaggagcctcgagttacggataaaaaatttggttttatgcctgggaggtcgactatggaagcaatctacttacttcg 8671079  T
Q  378 acgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtgg 477  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  8671080 acgcgtgatggagcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtgg 8671179  T
Q  478 aaaggcctagagaatagaggtgttag---gattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatgggg 574  Q
    ||||  || ||||| | ||| |||||    |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  8671180 aaagcactggagaagaaaggggttagaataattgtctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatggga 8671279  T
Q  575 ctaccgaagattttcccataacaataggattgca 608  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8671280 ctatcgaagattttcccataacaatagaattgca 8671313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 113 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 35829772 - 35829278
Alignment:
Q  113 tggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggata 212  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||| | | | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||    
T  35829772 tggctcaccaaattttttaacgaaattatgaggacatagaaaatgccaaatgagtggagaagaagcactttaattccgatctataagaacaagatggata 35829673  T
Q  213 tacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcga 312  Q
    ||  |||||| |  ||||||| ||| |  |||||||  |||||| ||| |  |||||||| |||||  |||||||||| | | |||||||| | ||||||    
T  35829672 taaaaaattgtgcaaattatagaggag--ttaaact--tgagtcataccaagaagttatgggaaagagtgattgaacggagagtaagaaaaaatactcga 35829577  T
Q  313 gttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaag 412  Q
    |||||  ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||| | ||||  |||  |||||||||    
T  35829576 gttacttataaccaatttagatttatgcctgggaggtcgactatggaagtgatctacttacttagacgtatgatggaacaatattggacaaataaaaaag 35829477  T
Q  413 acttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgccta 512  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || | | | |||| |||||| ||    
T  35829476 atatacacttagttttcattgatttggagaaggcttataat--agtgcctagagaggttttttggaaagccctagaaaagaaatgagttatgattgctta 35829379  T
Q  513 tattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaa 612  Q
    | || ||||||||||  ||||||||||||    ||| ||||||||||| || || |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35829378 tgttcgagctatcaaatatatgcatgaggggacttcaactagtgtgagtacacaagatggggtcgccgacgattttcccataacaataggattgcaccaa 35829279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 119 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 32405836 - 32405359
Alignment:
Q  119 accaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggatatacgaa 218  Q
    |||||||||||||| || |||| | | | ||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||   || ||| ||||||||   ||||||| ||    
T  32405836 accaaactttttaacgaaattacgaggacaaagaaaatgttggatgagtggagaagaaacactttaattctgatctattagaacaag-gcgatatacaaa 32405738  T
Q  219 attgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacg 318  Q
    |||| |  |||  ||||||| |||||| || ||||||| ||| || |||||||| |||| | ||||||| || | |||||||||| ||| |||||||||     
T  32405737 attgtgcaaat--tatagggaaattaaccttatgagtcataccatgaagttatgggaaaaggtgattgagcggagactaagaaaa-agattcgagttacc 32405641  T
Q  319 gataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgc 418  Q
     ||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||||||||| |||||||||||  |||    
T  32405640 aataatcaatttggatttatgccttgaaggtcgactatggaagcaatctacttacttcgacatgtgatgga--gatatcagactgataaaaaagatgtgc 32405543  T
Q  419 acttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattag 518  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||  |||||||||||| | ||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  32405542 acttagttttcattgatttgga-aaagcgtatgatagagtgtctagagagattttgtggaaagccatagagaagaaaggggttagaattgcttatattag 32405444  T
Q  519 agctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaatagga 603  Q
    |||||| || |||| | | | || || || ||||||| |||||| |||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32405443 agctataaaggatacgtacgcgggagctttgactagtttgaggatgcagaatggggttacagaagattttctcataacaatagga 32405359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 265 - 613
Target Start/End: Original strand, 45833611 - 45833957
Alignment:
Q  265 aagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaa 364  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||  ||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||||  |  ||  || |||||| ||||||    
T  45833611 aagttatgagaaatgatgattgagcgaagactaaagaaatagactcaagttt--gataactaatttggttttatgtatgagatatcaactatgaaagcaa 45833708  T
Q  365 tctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgag 464  Q
     |||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||  |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||    
T  45833709 cctacttacttcgacgtgtgatggagtgatattggacaaataaaaaagatttgtatatagttttcattgatttgaagaaggcgtacgatagagtgtctag 45833808  T
Q  465 agatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacg 564  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||| | || |||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||  |||||| || |||||||| ||||||||||    
T  45833809 agatattttgtggaaagcctaagagaaaaaagatgttaggattgtttatactagagttatcaaagatatatatgagggagcttcgactaatgtgaggacg 45833908  T
Q  565 catgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    || |||| |||||  || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  45833909 caggatgtggctattgacgatttttccataacaataagattgtatcaag 45833957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 265 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 34828318 - 34827975
Alignment:
Q  265 aagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaa 364  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||| || ||| ||||||||| ||||||   |||   |||||| |||||||    ||||||||| ||| ||||| |    
T  34828318 aagttatgggaaaggatgattgagagaagaccaaggaaagagacttgagttatcaatattcaatttgattttatgttagggaggtcgattatagaagcga 34828219  T
Q  365 tctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgag 464  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| |||| | |     
T  34828218 tctacctacttcgacgtacgatggagagatatcggacatataaaaatgactcgcacttagttttcattgatttgaagaatgtgtatgatatagtgtctaa 34828119  T
Q  465 agatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacg 564  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||| |||||| || ||||| | |||||| ||||||  |  || ||||||||||||||     
T  34828118 agagattttgtggaaagtcctagagaagaaagaggttaggattgcttatattcgatctatccaagatatgtatgagggggcctccactagtgtgaggact 34828019  T
Q  565 catgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgca 608  Q
    || |||| || |||| | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  34828018 caagatgaggttaccaatgattttccaataacaataggcttgca 34827975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 470 - 601
Target Start/End: Original strand, 40418936 - 40419067
Alignment:
Q  470 ttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatga 569  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||  || | ||||||||||||||| || |     
T  40418936 ttttgtggaaagccctagagaagaaaggtgttagggtggcctatattagagctattaaggatatgcatgagggggtctagactagtgtgaggacacaagg 40419035  T
Q  570 tggggctaccgaagattttcccataacaatag 601  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  40419036 tggagacaccgaagattttcccataacaatag 40419067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 483 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 37463877 - 37463747
Alignment:
Q  483 cctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaa 582  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||| || | | ||||||||||||| ||| || ||| |||||||     
T  37463877 cctagagaagaaaggggttaggattgcttatactagagctatcaaggatgtgtatgagggagctgcaactagtgtgaggatgcaggaggggcctaccgat 37463778  T
Q  583 gattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37463777 gattttcctataacaataggattgcaccaag 37463747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 232 - 339
Target Start/End: Original strand, 11681837 - 11681944
Alignment:
Q  232 tataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttg 331  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  11681837 tataggggaattaagctaaagagtcataccatcaaattatgggaaagggtgattgagcgaagactaagaaaagagacttgagttaccgataatcaaattg 11681936  T
Q  332 gttttatg 339  Q
    ||||||||    
T  11681937 gttttatg 11681944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 613
Target Start/End: Original strand, 3877199 - 3877337
Alignment:
Q  475 tggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatgggg 574  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| || |||||| | |||||| |||||||||| || ||  |  |||| | ||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  3877199 tggaaagccctagagaagaaaggagtaaggattacttatatttgagctatcaaggacatctactaggaggcttcaactagtgtgaggacgcacgatgagg 3877298  T
Q  575 ctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
      ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3877299 tcaccaacgattttcccgtaacaatatgattgcatcaag 3877337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 31264714 - 31264670
Alignment:
Q  384 gatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagtttt 428  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31264714 gatggagcgatatcaaatggataaaaatgacttgtacttagtttt 31264670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 100 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 23907698 - 23907187
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23907698 tagagggattgtgtggctcaccaacctttttaacgagattatgaggacgaagaaaatgctggacgagtggagaagaagcactttaattccaatttataag 23907599  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||  |||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||    
T  23907598 aacaagggggatatacaaaattccgcgaattata--ggggaattaagctaatgagtcataccataaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaag 23907501  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||      
T  23907500 aaaggagactcgagttacggataatcaatttggttttatgcctgggaggtcgactatggaagcaatctacttacttcgacgcgtgatggagcgatatcga 23907401  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |    
T  23907400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccaagagagattttgtggaaagccctggagaagaaagggg 23907301  T
Q  500 ttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaat 599  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23907300 ttaggattgtctatattagagctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgagactaccgaagattttcccataacaat 23907201  T
Q  600 aggattgcatcaag 613  Q
    ||||||||| ||||    
T  23907200 aggattgcaccaag 23907187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 100 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 48623923 - 48623412
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  48623923 tagagggattgtgtggctcacaaacctttttaattagattatgaggattaagaaaatgtcgtatgagtggagaataagcactttaattccaatctataag 48623824  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||    
T  48623823 aacaagggggatatacaaaattgcgcgaattata--ggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaag 48623726  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||  |    
T  48623725 aaagaagactcgagttacagataaccaatttggttttatgcctgggaggtcgactatggaagcaatctacttagttcgacgcgtgatggagcgatatagg 48623626  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |    
T  48623625 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggtgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctggagaagaaagggg 48623526  T
Q  500 ttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaat 599  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| | || ||||    
T  48623525 ttaggattgcctatattagggctatcaaagatatgtacgagggagcttcgactagtgtgaggatgcatgatttgactaccgaagattttctcttatcaat 48623426  T
Q  600 aggattgcatcaag 613  Q
    ||||||||| ||||    
T  48623425 aggattgcaccaag 48623412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 251 - 613
Target Start/End: Original strand, 435267 - 435629
Alignment:
Q  251 tgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtc 350  Q
    |||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  435267 tgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaagaaaggaggctcgagttacggataaccaatttggttttatgcctgggaggtt 435366  T
Q  351 gactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatat 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  435367 gactatggaagcaatctacttacttcgacgcgtgatagagcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaagacgtat 435466  T
Q  451 gatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcga 550  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || |||||    
T  435467 gatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctggagaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcga 435566  T
Q  551 ctagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  435567 ctagtgtgaggacgcaagatgggactaccgaagattttcccataacaataggagtgcaccaag 435629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 232 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1778283 - 1777900
Alignment:
Q  232 tataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttg 331  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||  | ||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1778283 tataggagaattaagctaatgagtcataccatggaattatgggaaagggtgatcgaaagaagactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttg 1778184  T
Q  332 gttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcat 431  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1778183 attttatgcctgggaggttgactatggaagcaatctacttacttcgacgtgtgatggagcgatatcggacggataaaaaaaacttgcacttagttttcat 1778084  T
Q  432 tgatttgg-agaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatga 530  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||||  | |||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1778083 tgatttggaaaaaggtgtatgatagagtatcaagagagattttgtggaaagcccttgagaagaaaggggttagaattgcctatattagggctatcaatga 1777984  T
Q  531 tatgcatgaggaag-tttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    |||| |||||| || |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1777983 tatgtatgagggagctttcaactagtgtgaggacgtaggatgggactaccgaagattttcccataacaataggattgcaccaag 1777900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 232 - 608
Target Start/End: Original strand, 39707480 - 39707854
Alignment:
Q  232 tataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaag-gatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaattt 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||  | |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||    
T  39707480 tatagaggaattaaactaatgagtcataccatgaagttataggaaaaaggtgattgaacgaagactaagaaaagaaagtcgatttacgaataaccaattt 39707579  T
Q  331 ggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttca 430  Q
     ||||||||||| |||| | ||||| | |||| || ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39707580 tgttttatgcct-ggagattgactacgaaagcgatttacttacttcgacgtgtgatggagcgataacagacggataaaaaagacttgcacttagttttca 39707678  T
Q  431 ttgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatga 530  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39707679 ttgatttggagaagacgtatgatagagtgcctagagaggttttgt-gaaagtcctggagaagaaaggggtttggattgcctatattagagctatcaagga 39707777  T
Q  531 tatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgca 608  Q
     ||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39707778 aatgtatgagggagttttgactagcgtgaggacgcatgat-gggctaccaaagattttcccataacaataggattgca 39707854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 193 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 27451476 - 27451070
Alignment:
Q  193 ttataagaacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaa 292  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  27451476 ttataagaacaaaggggatatacataattgcgcgaattata--ggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtaattgagcgaa 27451379  T
Q  293 aactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcg 392  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||    
T  27451378 gactaagaaaagagactcatgttacggataacttatttggttttattcctcggaggtcgactatggaagcgaactacttactttgacgcatgatggagcg 27451279  T
Q  393 atatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaat 492  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| |  |||||  |||||||||||  ||| |||||     
T  27451278 atatcggacggataaaaaagacttgcaattagttttcacttatttggagaaggcgtaggatagagtacttagagagattttgtggaaaaccctggagaag 27451179  T
Q  493 agaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttccca 592  Q
    | |||  | ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  27451178 aaagggatgaggattgcctatattagagctatctgggatatgtatgagggagcttccactagtgtgaagacgcatgatggggatagcgtagattttccca 27451079  T
Q  593 taacaatag 601  Q
    |||||||||    
T  27451078 taacaatag 27451070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 265 - 613
Target Start/End: Original strand, 53703658 - 53704007
Alignment:
Q  265 aagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaa 364  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| || ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  53703658 aagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaagaaaggagactcgggttacagataaccaaattgattttatgtctgagaggtcgactatggaagcaa 53703757  T
Q  365 tctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaag-acttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccga 463  Q
    ||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  53703758 tctacttacttcgacgcgtgacggagcgatatcggacggatgaaaaaggacttgcacttagttttcactgatttggaaaaggcgtatgattgagtaccga 53703857  T
Q  464 gagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggac 563  Q
    ||||  |||||||||||| |||  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  53703858 gagagattttgtggaaagccctgaagaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggac 53703957  T
Q  564 gcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
     || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53703958 acaggatgggactaccgaagattttcccgtaacaataggattgcaccaag 53704007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 402 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 55769478 - 55769268
Alignment:
Q  402 ggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgtt 501  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||  |||||||| | |||  ||    
T  55769478 ggataaaaaagacttgcagttgattatcattgattttgataaggcgtatggtagagtgcctagacagattttgtggaaagctctagagaagaaagggatt 55769379  T
Q  502 aggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaatag 601  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||| |||||||||| ||||| || || ||  ||||||||||||||||||    
T  55769378 aggattgcttatattagagctatcaatgatatgtat-agggagcttcgactagtttgaggacgcaagatggagccacagacaattttcccataacaatag 55769280  T
Q  602 gattgcatcaag 613  Q
    ||||||| ||||    
T  55769279 gattgcaccaag 55769268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 402 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 55833734 - 55833524
Alignment:
Q  402 ggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgtt 501  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||  |||||||| | |||  ||    
T  55833734 ggataaaaaagacttgcagttgattatcattgattttgataaggcgtatggtagagtgcctagacagattttgtggaaagctctagagaagaaagggatt 55833635  T
Q  502 aggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaatag 601  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||| |||||||||| ||||| || || ||  ||||||||||||||||||    
T  55833634 aggattgcttatattagagctatcaatgatatgtat-agggagcttcgactagtttgaggacgcaagatggagccacagacaattttcccataacaatag 55833536  T
Q  602 gattgcatcaag 613  Q
    ||||||| ||||    
T  55833535 gattgcaccaag 55833524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16001335 - 16001117
Alignment:
Q  103 aggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaac 202  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||    
T  16001335 aggaattgtgtgggtcaccaaactttttaacgagattatgaggacgaagaaaataccggacgagtggagaagctgcactttaattcccatctataagaac 16001236  T
Q  203 aagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaatt-aaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaa 301  Q
    ||    |||||||  ||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  16001235 aa-tgtgatatacataattgcgtgaat--tataggagaattaaaattaatgagtcatactatgaagttatgggaaagggtgatttaacgaagactaagaa 16001139  T
Q  302 aagagactcgagttacggataa 323  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  16001138 aagaaactcgagctacggataa 16001117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 281 - 445
Target Start/End: Original strand, 2296236 - 2296403
Alignment:
Q  281 tgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacg 380  Q
    ||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||| | |||||||| || ||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||||||| ||   |||    
T  2296236 tgattaaacgaaaactaataaa--agactcaagttactggtaactaatatgattttatgtctaggaggttgaccaaggaagcgatctactttctacaacg 2296333  T
Q  381 tgcgatggagcgatatcagacggat-----aaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaagg 445  Q
     | |||| |||||||||| | ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2296334 agtgatgtagcgatatcaaatggataaaaaaaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaagg 2296403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 256
Target Start/End: Original strand, 56224665 - 56224803
Alignment:
Q  116 ctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggatatac 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||| ||||| ||||||||  |||| |||  ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  56224665 ctcacctaactttttaatgagattatgaagacaaagaaaatgtcagatgagtgcagaagaagttctttgattctaatctataagaataaggaggatatac 56224764  T
Q  216 gaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtc 256  Q
     |||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  56224765 aaaattgtgtaaat--tatagaggaattaaactaatgagtc 56224803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 355 - 555
Target Start/End: Original strand, 16002147 - 16002346
Alignment:
Q  355 atggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgata 454  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| | | ||||   |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  16002147 atggaagcaatctacttacttcaacgtgtgatgtaacaatattgcacggataaaaaaaaatttcacttagttttcattgattt-gaaaaggcatatgaaa 16002245  T
Q  455 gagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactag 554  Q
     ||| || |||||  ||||||||||||  || | ||| | ||| |||||| ||||||||||| |   |||||| |||||| || || ||| |||||||||    
T  16002246 aagttcctagagagattttgtggaaagcacttgcgaagaaaggggttagggttgcctatattcgttatatcaaggatatgtatcagcaagcttcgactag 16002345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 481
Target Start/End: Original strand, 21059840 - 21060023
Alignment:
Q  298 agaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatc 397  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||  |||||||||||||| |||||  |||||| |||  || ||||||    
T  21059840 agaaaagagattcgaattattgataactaatttggtgttatgtctgagaggttgatgatggaagcaatctatttactacgacgtgtgatatagtgatatc 21059939  T
Q  398 agacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaag 481  Q
    ||| |||||||| | | ||||| ||||||||| || |||| |||||  | ||||||||| |||  || ||  ||||||||||||    
T  21059940 agatggataaaatatatttgcatttagttttccttaatttagagaaatcgtatgatagaatgcttagcgagattttgtggaaag 21060023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 541
Target Start/End: Original strand, 41426964 - 41427176
Alignment:
Q  326 aatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagt 425  Q
    |||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||  ||    ||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||    
T  41426964 aatttgattttatgcatgggtggtcgactttggaagcaatttacttcatt----gtgtgatggagcgatatcaaacgcataaacacgacttgcacttggt 41427059  T
Q  426 tttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaataga-ggtgttaggattgcctatattagagctat 524  Q
     ||| ||| ||| |||||||| | |||||||||| | || ||  || |||||||||  |||||||  | | || ||||  ||||| |||||| |||||||    
T  41427060 attccttggtttcgagaaggcgtgtgatagagtgactagggagattctgtggaaagctctagagatgaaagggggttacaattgcttatatttgagctat 41427159  T
Q  525 caatgatatgcatgagg 541  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  41427160 caaagatatgtatgagg 41427176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 458
Target Start/End: Original strand, 6937107 - 6937221
Alignment:
Q  344 ggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaa 443  Q
    |||||||||| |  ||||||||  |||||||  |||||| |||||||| |||||  | | || |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6937107 ggaggtcgacaagagaagcaatagacttactacgacgtgtgatggagcaatatccaatgtatcaaaaggagttgcacttaatttttattgatttggagaa 6937206  T
Q  444 ggcatatgatagagt 458  Q
    | |||||||||||||    
T  6937207 gacatatgatagagt 6937221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 440
Target Start/End: Original strand, 33369028 - 33369066
Alignment:
Q  402 ggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttgga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33369028 ggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttgga 33369066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 424 - 540
Target Start/End: Original strand, 44860319 - 44860433
Alignment:
Q  424 gttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagcta 523  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| |  |||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  44860319 gttttcattgatttggaggaggcgtatgatag--tgcctagacagattttgtggaaagccttagagaagaaaggggttaggaatgtctatattcgagcta 44860416  T
Q  524 tcaatgatatgcatgag 540  Q
    || | |||||| |||||    
T  44860417 tctaggatatgtatgag 44860433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 570 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1212235 - 1212192
Alignment:
Q  570 tggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1212235 tggggctaccgaatattttcccataacaataggattgcaccaag 1212192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29822367 - 29822295
Alignment:
Q  384 gatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgataga 456  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  29822367 gatggagcgatatcaaatggattaaaaagacttccacttaatttttattgatatggtgaagacatgtgataga 29822295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32912093 - 32912059
Alignment:
Q  167 tggagaagaagcactttaatttcaatttataagaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32912093 tggagaagaagcactttaattacaatttataagaa 32912059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 402 - 440
Target Start/End: Original strand, 41598176 - 41598214
Alignment:
Q  402 ggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttgga 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41598176 ggataaaagagacttgcacttagttttcaatgatttgga 41598214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 459
Target Start/End: Original strand, 42037113 - 42037150
Alignment:
Q  422 tagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42037113 tagttttcattgatttggagaagacatatgatatagtg 42037150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 52281458 - 52281349
Alignment:
Q  500 ttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatga-ggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaa 598  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |  ||| || |||| |||| | | |||||||||| |||| ||| |||||| || ||| ||||||| ||||| ||    
T  52281458 ttaggcttgcttatattagagctataatggatgtgtatgatggaactctagactagtgtggggacacataatggggttatcgacgattttcgcataataa 52281359  T
Q  599 taggattgca 608  Q
    ||||||||||    
T  52281358 taggattgca 52281349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 54797419 - 54797344
Alignment:
Q  371 tactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggata--aaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaag 444  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  54797419 tactttaacgtgtgatggagcgatatcgaacggataataaaaatatttgcatttagttttcattcctttggagaag 54797344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 100 - 613
Target Start/End: Original strand, 36650880 - 36651391
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||| | ||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  36650880 tagagggattgtgtggctcacaaacctttttgacgagattatgaggacgaagaaaatgccggacgagtggagaagaatcactttaattccaatctataag 36650979  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||    
T  36650980 aacaagggggatatacaaaattgcgtgaattata--ggagaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgattgaaagaagactaag 36651077  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |    
T  36651078 aaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatgtctgggaggtcgattatggaagcaatctacttacttcgacgcgtgatggagcgatatcgg 36651177  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||| |||||   ||| |    
T  36651178 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagatttcgtggaaagccctggagaagtaagggg 36651277  T
Q  500 ttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaat 599  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  36651278 ttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagtttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagtttttcccataacaat 36651377  T
Q  600 aggattgcatcaag 613  Q
    ||||||||| ||||    
T  36651378 aggattgcaccaag 36651391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 149 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 33351153 - 33350691
Alignment:
Q  149 aagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaact 248  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||    
T  33351153 aagaaaatgtcggacgagtggagaagaagcactttaattccaatcgataagaacaagggggatatacaaaattgcgcgaattata--ggggaattaagct 33351056  T
Q  249 aatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggagg 348  Q
    |||||||| ||| || ||||| || |||||| ||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  33351055 aatgagtcataccatgaagttgtgggaaagggtgatcaaaagaagactaagaaaggagactctagttacggataaccaatttggttttatgcttgggagg 33350956  T
Q  349 tcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcat 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |    
T  33350955 tcgactatggaagcaatctacttacttcaacgcgtgatggagcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttctttgatttggaaaaggggt 33350856  T
Q  449 atgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttc 548  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | | | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  || |||    
T  33350855 atgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctggagaagaaaagggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagagagcttc 33350756  T
Q  549 gactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33350755 gactagtgtgaagacgcaggatgggactaccgaagattttcccataacaataggattgcaccaag 33350691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 100 - 613
Target Start/End: Original strand, 32629498 - 32630005
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||  ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  32629498 tagaggaattgtgtggctcacaaaacttttcaacgagattatgaaaacgaagaaaatgcttgacgagtggagaagaagcaccttaattccaatctataag 32629597  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||  |||||||| | |||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||    
T  32629598 aacaagggggatatacaacattgcgcgaattaca--ggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtaattgaacgaagactaag 32629695  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||     |||| | ||||||| |||||| |    
T  32629696 aaaagagactcacgttacggataaccaatttggctttatgcctggaaggtcgactatggaagcgatctacttc----gacgcgtgatggagagatatcgg 32629791  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtg 499  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||||||||| |||  |||| | ||| |    
T  32629792 acggataaaaaagacttacacttagttttcattgatttggagaaggcgtatgatagagtacctagagagattttgtggaaagccctgaagaagaaagggg 32629891  T
Q  500 ttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaat 599  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||| || ||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32629892 tgaggattgcctatattaaagctatccaggatatgtatgagggagcttcgacctgtgtgaggacgcaggatggggataccgtagattttcccataacaat 32629991  T
Q  600 aggattgcatcaag 613  Q
    |||| |||| ||||    
T  32629992 aggactgcaccaag 32630005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 236 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 39907641 - 39907264
Alignment:
Q  236 ggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttt 335  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39907641 ggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaagaaaggagacccgagttacggataaccaatttggttt 39907542  T
Q  336 tatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgat 435  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39907541 tatgcctgggaggtcgactgtggaagcaatctacttacttcgacgcgtgatggagcgatatcggacagataaaaaagacttgcacttagttttcattgat 39907442  T
Q  436 ttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgc 535  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  39907441 ttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctggagaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgt 39907342  T
Q  536 atgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39907341 atgagggagcttcgactagtgtgaggatgcaggatgggactacggaagattttcccataacaataggattgcaccaag 39907264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 100 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 24178591 - 24178090
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| | |  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| || ||| |||| |||||     
T  24178591 tagaggaattgtgtggctcacaaaacttttcaatgagattatgaggacgaagaaaatgtcagaggagtggagaataagcaccttcattccaatctataat 24178492  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||    ||||||  ||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  24178491 aacaagggatatatacagaattgcgtgaattata--ggggaatttagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgattcaacgaagactaag 24178394  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||  || | | |||||||||||| | |    
T  24178393 aaaagagactcaagttacggataacaaatttggttttacgccctggaggtcgactatggaagcgatctacttgctgcgatgcgtgatggagcgataccgg 24178294  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtg 499  Q
    ||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| || |||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |    
T  24178293 acggatacaaaagggttacaattagttttcattgatttggagacggtgtatgacagagtacctagagagattttgtggaaagccctggagaagaaagggg 24178194  T
Q  500 ttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaat 599  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  24178193 ttaggattgcctaaattaaagctatcaaggatgtgtatgagggagcttcgactagggtgaggacgccggatggggataccgaagactttcccacaacaat 24178094  T
Q  600 agga 603  Q
    ||||    
T  24178093 agga 24178090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 360 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 46356989 - 46356736
Alignment:
Q  360 agcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtg 459  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  46356989 agcaatctacttacttcgacgcgtgatggagcgatatcggacgaataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagta 46356890  T
Q  460 ccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtga 559  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  46356889 ccgagagagattttgtggaaagccctggagaagaaaggggttagaattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtga 46356790  T
Q  560 ggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46356789 ggacgcaggatgggactaccaaagattttcccataacaataggattgcaccaag 46356736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 116 - 417
Target Start/End: Original strand, 11592591 - 11592890
Alignment:
Q  116 ctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggatatac 215  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  11592591 ctcacaaacctttttaacgagactatgaggacgaagaaaatgccggacgagtggagaagaagcactttaattccaatctataaaaacaagggggatatac 11592690  T
Q  216 gaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagtt 315  Q
     |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11592691 aaaattgcgcgaattata--ggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaagaaaggagactcgagtt 11592788  T
Q  316 acggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagact 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11592789 acggataaccaatttggttttatggcttggaggtcgactatggaagcaatctgcttacttcgacgcgtgatggagcgatatcggacgaataaaaaagact 11592888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 232 - 481
Target Start/End: Original strand, 38896633 - 38896882
Alignment:
Q  232 tataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttg 331  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  38896633 tataggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatggaaaagggtgatcgaaagaagactaagaaaggagactcgagttacggataaccaattcg 38896732  T
Q  332 gttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcat 431  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38896733 gttttatgcctgggaggtcaactatggaagcaatctacttacttcgacgcacaatggagcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcat 38896832  T
Q  432 tgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaag 481  Q
    | ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  38896833 taatttggaaaaggtgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaag 38896882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 281 - 481
Target Start/End: Original strand, 22346577 - 22346777
Alignment:
Q  281 tgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacg 380  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22346577 tgatcgaaagaagactaagaaaggagactcgagtttcggataaccaatttggttttatgcctgggaggtcgactatggaagcaatctacttacttcgaca 22346676  T
Q  381 tgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaa 480  Q
     | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  22346677 cgtgatggagcgatatcgaacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaa 22346776  T
Q  481 g 481  Q
    |    
T  22346777 g 22346777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 333 - 613
Target Start/End: Original strand, 38606156 - 38606435
Alignment:
Q  333 ttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcatt 432  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38606156 ttttatgtctgggaggtcgactatgaaagcgatctacttacttcgacgcgtgatggagcgatatcggacggataaaaaagacttacacttagttttcatt 38606255  T
Q  433 gatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgata 532  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||  ||||  |||||||||||| ||| ||||| | |||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  38606256 gattttgagaaggcgtatgat-gagtacctggagagattttgtggaaagccctggagaagaaagggatgaggattgcctatattagagctatccaagata 38606354  T
Q  533 tgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||    
T  38606355 tgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggaataccgtagatttttcgataacaataggactgcaccaag 38606435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 403 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 36870419 - 36870209
Alignment:
Q  403 gataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgtta 502  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| || |||| ||| ||||    
T  36870419 gataaaaaatacttgcacttaattttcattgatttggagaaggcgtatgatagagtgcctagagagattttgtggaaagccctggaaaataaaggggtta 36870320  T
Q  503 ggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaatagg 602  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  36870319 ggattgcctatattagagtcatcaaggatatgtatgagggagcttcaactagtgtgaggatgcaggatggggataccgcaaattttcccataacaatagg 36870220  T
Q  603 attgcatcaag 613  Q
    |||||| ||||    
T  36870219 attgcaccaag 36870209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 417 - 613
Target Start/End: Original strand, 11593154 - 11593350
Alignment:
Q  417 gcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatatt 516  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||  ||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  11593154 gcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtgacaagccctggagaagaaaggggttaggattgcctatatt 11593253  T
Q  517 agagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    || |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11593254 agggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgagactaccgaagattttcccataacaataggattgcaccaag 11593350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 613
Target Start/End: Original strand, 49028564 - 49028678
Alignment:
Q  499 gttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaa 598  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49028564 gttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgtaggatgggactaccgaagattttcccataacaa 49028663  T
Q  599 taggattgcatcaag 613  Q
    |||||||||| ||||    
T  49028664 taggattgcaccaag 49028678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 402 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 48055912 - 48055702
Alignment:
Q  402 ggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgtt 501  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | |||  |||  ||||||  ||||||||| | ||| |||    
T  48055912 ggattaaaacgacttgcacttagttttcattgattcggagaaggcgtgtgatagagtgcctaaagagatttcatggaaatccctagagaagaaaggggtt 48055813  T
Q  502 aggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaatag 601  Q
    |||| |||||||||| ||||||| || |||||  || ||| ||| || |||||||||||||| || ||||| |  | ||  |||||| ||||||||||||    
T  48055812 agga-tgcctatattcgagctatgaaggatatctataagggagtctcaactagtgtgaggacacaggatggagacatcggtgatttttccataacaatag 48055714  T
Q  602 gattgcatcaag 613  Q
    ||||||| ||||    
T  48055713 gattgcaccaag 48055702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 413 - 613
Target Start/End: Original strand, 20499308 - 20499506
Alignment:
Q  413 acttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgccta 512  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||| |||||  ||| |||||||  ||||||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  20499308 acttgcacttagttttcatttatc-ggagaaggcgtgtgatagagtgcctagagagatttcgtggaaatccctagagaaaaaaggggttagga-tgccta 20499405  T
Q  513 tattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaa 612  Q
    ||||  |||||| || |||||  || ||| ||| || |||||||||||||| |||||||| |  | ||  | |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20499406 tattcaagctatgaaggatatctataagggagtctcaactagtgtgaggacacatgatggagacatcggcgttttttccataacaataggattgcaccaa 20499505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 33738456 - 33738343
Alignment:
Q  368 acttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagaga 467  Q
    |||||||  |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| |||| | ||| |    
T  33738456 acttactaggacgtgtgatggagtgataccagatggataaaaaagacttgcacttaattttcattgatttggaaaatgcatacgataaagtggctagaaa 33738357  T
Q  468 tgttttgtggaaag 481  Q
      ||||||||||||    
T  33738356 gattttgtggaaag 33738343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 552 - 613
Target Start/End: Original strand, 38896947 - 38897008
Alignment:
Q  552 tagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38896947 tagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagattttcccataacaataggattgcaccaag 38897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 435 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 43794089 - 43793985
Alignment:
Q  435 tttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatg 534  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||  |||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  43794089 tttggaggaggcatatgatagagtgcctagagtgattttgtggaaagctctagagaagaaaggtgttagggtggcctatatttgagctatcaaggatatg 43793990  T
Q  535 catga 539  Q
     ||||    
T  43793989 tatga 43793985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 550 - 608
Target Start/End: Original strand, 22346783 - 22346841
Alignment:
Q  550 actagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgca 608  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22346783 actagtgtgaggacgctggatgagactaccgaagattttcccataacaataggattgca 22346841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 454
Target Start/End: Original strand, 32483659 - 32483711
Alignment:
Q  402 ggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgata 454  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  32483659 ggataaaaaagacttgcacttaattttcattgatttgtagaagacatacgata 32483711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17101588 - 17101539
Alignment:
Q  393 atatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaga 442  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17101588 atatcggatggataaaaaagacttgtacttagttttcatcgatttggaga 17101539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 46357069 - 46356993
Alignment:
Q  266 agttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcct 342  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  46357069 agttatgggaaagggtgatcgaaagaagaccaaaaaaggagactcgagttacggataatcaatttggttttaggcct 46356993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 401 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 31988078 - 31988024
Alignment:
Q  401 cggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatag 455  Q
    |||||||||||||||| ||| |    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31988078 cggataaaaaagacttacacatgtcattcattgatttggagaaggcatatgatag 31988024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 100 - 613
Target Start/End: Original strand, 24177410 - 24177921
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||  |||||||| | |  |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  24177410 tagagggattgtgtggctcacaaacctttttaacaagattatgaggacgaagaaaatgccgaatgagtggagaaaaagcactttaattccaatctataag 24177509  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||    
T  24177510 aacaagggggatatacaaaattgcgtgaattata--ggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaag 24177607  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |    
T  24177608 aaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatgcctggaaggtcgactacggaagcaatctacttacttcgacgcatgatggagcgatatcgg 24177707  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |    
T  24177708 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttgaaaaaggcatatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctggagaagaaagggg 24177807  T
Q  500 ttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaat 599  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24177808 ttagcattgcctatattagagctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagattttccgataacaat 24177907  T
Q  600 aggattgcatcaag 613  Q
    ||||||||| ||||    
T  24177908 aggattgcaccaag 24177921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 113 - 613
Target Start/End: Original strand, 20317890 - 20318388
Alignment:
Q  113 tggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggata 212  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||| | |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||    
T  20317890 tggctcacaaacctttttaacgagattatgaggacgaagaaaatgtcggacgagtggagaagaagcactttaattccaatctataagaacaagggggata 20317989  T
Q  213 tacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcga 312  Q
    ||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  20317990 tacaaaattgcgcaaattat-taggg-aattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaagaaaggagactcga 20318087  T
Q  313 gttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaag 412  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20318088 gttacagataaccaatttggttttatgcctgggaggtcgactatggaagcaatctacttacttcgacgcgtgatggagcgatatcggacggataaataag 20318187  T
Q  413 acttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgccta 512  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  20318188 acttgcacttagttttcattaatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgggagagattttgtggaaagccctggagaagaaaggggttaggattgccta 20318287  T
Q  513 tattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaa 612  Q
    |||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20318288 tattatggctatcaaggatatgtatgagggagtttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagattttcccataacaataggattgcaccaa 20318387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 149 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 2076821 - 2076359
Alignment:
Q  149 aagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaact 248  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||    
T  2076821 aagaaaatgtcggacgagtggagaagaagcactttaattccaatctataagaacaagggggacatacaaaattgcgcgaattata--ggggaattaagct 2076724  T
Q  249 aatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggagg 348  Q
    || ||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2076723 aacgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatgcctgggagg 2076624  T
Q  349 tcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcat 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  2076623 tcgactatggaagcaatctacttacttcgacgcgggatggagcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttaattttcattgatttggaaaaggcgt 2076524  T
Q  449 atgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttc 548  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||| || |||    
T  2076523 atgatagagtaccgagagagattttgtggcaagccctagagaaataaggggttaggattgcctatatcatggctatcaaggatatgtatgagggagcttc 2076424  T
Q  549 gactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2076423 gactagtgtgaggacgcatgatgagactaccgaagattttcccacaacaataggattgcaccaag 2076359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 100 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1288924 - 1288592
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||| | |  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1288924 tagagggattgtatggctcacaaacctttttaacgagattatgaggacgaagaaaatgtcgaacgagtggagaagaagcactttaattccaatctataag 1288825  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||| || ||| |||| |||||| |||| ||| ||| ||||||    
T  1288824 aacaagggggatatacaaaattgtgcgaattata--ggggaattaagttaatgagtcataccatgaagctatgggaaagggtgatcgaaagaagactaag 1288727  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| |    
T  1288726 aaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatggctgggaggtcgattgtggaagcaatctacttacttcgacgcgtgatggagcaatatcgg 1288627  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattga 434  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1288626 acggataaaaaagacatgcacttagttttcattga 1288592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 517
Target Start/End: Original strand, 26845 - 27260
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||||    | ||||||    
T  26845 tagaggaattgtgtggctcaccaaactttttaacgagattatgaggacaaagaaaatgtcggatgagtggaaaagaaacactttaattctgttctataag 26944  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    |||||| ||||||||| ||||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| || |||| |||  |  || |||||||||||||| ||||    
T  26945 aacaaggaggatatacaaaattgttcgaattata--ggggaattaaattaatgagtcataccatgaagtcatggaagcgggtgattgaacgaaaattaag 27042  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||      
T  27043 aaaaaagacttgagttactgataaccattttggttttatgctt-gaagatcgactatggaagcgatctacttacttcaacgtgtgatgaagcgatatcga 27141  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgcc--gagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagagg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||   |||||| |||||| ||||| ||||||||| |  ||    
T  27142 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcgaatgatagatttcctaaagagat-ttttgtcgaaagccctagagaagaaggg 27240  T
Q  498 tgttaggattgcctatatta 517  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  27241 ggttaggattgcttatatta 27260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1288588 - 1288474
Alignment:
Q  499 gttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaa 598  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1288588 gttatgattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagattttcccataacaa 1288489  T
Q  599 taggattgcatcaag 613  Q
    |||||||||| ||||    
T  1288488 taggattgcaccaag 1288474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 510 - 613
Target Start/End: Original strand, 1274559 - 1274662
Alignment:
Q  510 ctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcat 609  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  1274559 ctatattagggctatcaaagatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagattttcccataacaatagaattgcac 1274658  T
Q  610 caag 613  Q
    ||||    
T  1274659 caag 1274662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 502 - 613
Target Start/End: Original strand, 3393997 - 3394108
Alignment:
Q  502 aggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaatag 601  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  3393997 aggattgcctatattagagttatccaggatatgtatgaggaagcttcgactaatgtgaggacgcgggatggggatatcgtagattttcccataacaatag 3394096  T
Q  602 gattgcatcaag 613  Q
    ||||||| ||||    
T  3394097 gattgcaccaag 3394108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 502 - 603
Target Start/End: Original strand, 3301135 - 3301236
Alignment:
Q  502 aggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaatag 601  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||    
T  3301135 aggattgcctatattagagttatccatgatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatggggatactgtagattttcccttaacaaaag 3301234  T
Q  602 ga 603  Q
    ||    
T  3301235 ga 3301236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 529 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 12493331 - 12493247
Alignment:
Q  529 gatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12493331 gatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaatattttcccataacaataggattgcaccaag 12493247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 416 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 31503129 - 31502939
Alignment:
Q  416 tgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatat 515  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | || | ||| |  |||||  ||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  31503129 tgcacttagtttttattgatttggagaagacatatgataaattgtctagaaagattttgatgaaagacctagagaagaaaggtgttagggtggcctatat 31503030  T
Q  516 tagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattg 606  Q
    | ||| ||| || |||||| |||| |  || ||||||| ||||||||| |  || || |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31503029 tcgagttataaaggatatgtatgatggggtctcgactactgtgaggacaccagaaggagacaccgaagatttccccttaacaataggattg 31502939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 491
Target Start/End: Original strand, 37123637 - 37123846
Alignment:
Q  281 tgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacg 380  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  | |||  || |||||||||||| |  || |||||| || ||||  |||||||||||   |||    
T  37123637 tgattgaatgaagactaagaaaagagactcaagttattgttaatcaaattggttttatgcttgagatgtcgaccatagaagtgatctacttactacaacg 37123736  T
Q  381 tgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaa 480  Q
    |  || ||||||||| |  | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| || | |||  ||||||| |||    
T  37123737 tatga-ggagcgataacgaatggataaaaaagatgtgcacttagttttcattgatttggagaaactgtatgatagagttcctaaagagattttgtgtaaa 37123835  T
Q  481 ggcctagagaa 491  Q
    | |||||||||    
T  37123836 gtcctagagaa 37123846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 410 - 613
Target Start/End: Original strand, 30418593 - 30418793
Alignment:
Q  410 aagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgc 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||   || || || | ||| |||| || |||    
T  30418593 aagacttccacttagttttcattaatttggagaagacata-gatagagtgcctagagagattttgtggaaaactctcgacaagaaaggggttaagactgc 30418691  T
Q  510 ctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtt-tcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgca 608  Q
    |||  || |||||||||| ||||||  || ||| ||| ||||||||||||||||| ||   |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30418692 ctacttttgagctatcaaggatatgtgtg-ggaggttctcgactagtgtgaggacacagagtggggtcac--aagattttcccataacaataggactgca 30418788  T
Q  609 tcaag 613  Q
     ||||    
T  30418789 ccaag 30418793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 600
Target Start/End: Original strand, 14099514 - 14099710
Alignment:
Q  402 ggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgtt 501  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |  ||||  ||||||||||| || ||||||| | ||  |||    
T  14099514 ggattaaaaagacttgaacttagttttcattgattttgataaggcatataat--agtgtctggagagcttttgtggaaatgcatagagaagaaagaagtt 14099611  T
Q  502 aggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaata 600  Q
    || |||||||||||| ||||| || |   |||  |||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |  ||  | ||||||||||||||||||    
T  14099612 agtattgcctatattcgagctgtcgagattatatatgagggagtatagactagtgtgaggacacttgatggagacactaacgattttcccataacaata 14099710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 407 - 541
Target Start/End: Original strand, 3095324 - 3095457
Alignment:
Q  407 aaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggat 506  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| |||| |||||  |||||||||||||||  |||||  |||||||||||| ||| ||||| | || ||||||| |    
T  3095324 aaaaggacttgcatttagtttccattaatttcgagaatacatatgatagagtgcttagagagattttgtggaaagccctcgagaagaaagatgttagggt 3095423  T
Q  507 tgcctatattagagctatcaatgatatgcatgagg 541  Q
     ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  3095424 ggcctatatt-gagcaatcaaggatatgtatgagg 3095457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 756214 - 756080
Alignment:
Q  238 ggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggtttta 337  Q
    ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||| || | || |||||||||||||| || ||  |||||  |||||  |||||    
T  756214 ggaattaaacttaagagtcgtaccaacaagttatgggaaagagtgattgagcggagacaaagaaaagagactcaaggtaacgataatcaatttaatttta 756115  T
Q  338 tgcctaggaggtcgactatggaagcaatctactta 372  Q
    |||||  |||||  || |||||||| |||||||||    
T  756114 tgcctgagaggttaacaatggaagcgatctactta 756080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 481
Target Start/End: Original strand, 17212459 - 17212533
Alignment:
Q  407 aaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaag 481  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||  |||| |||||||    
T  17212459 aaaatgacttgcacttagatttcattgatttgaagaagacgtatgataaagtgcctagagagattttatggaaag 17212533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 547 - 608
Target Start/End: Original strand, 27262 - 27323
Alignment:
Q  547 tcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgca 608  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27262 tcgactagtgtgaggacgtatgaggggcctttcgacgattttcccgtaacaataggattgca 27323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 458
Target Start/End: Original strand, 35685044 - 35685100
Alignment:
Q  402 ggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagt 458  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  35685044 ggataaaaaagacttacgcttaattttcattgatttggagaagacttgtgatagagt 35685100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 540
Target Start/End: Original strand, 7605744 - 7605783
Alignment:
Q  501 taggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgag 540  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7605744 taggattgcctatattcgagctatcaatgatatgtatgag 7605783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Original strand, 3422965 - 3423060
Alignment:
Q  346 aggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaa 443  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||  ||  |||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||    
T  3422965 aggtcgactacggaaacgatctacttactttgacgtgtgatggagtggtatcaaac--atgtaaaaaacttacacttaatattcatcgatttggagaa 3423060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 550 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 43558747 - 43558689
Alignment:
Q  550 actagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgca 608  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  43558747 actagtgcgaggacgcaggatagggccaccgcaaattttccaataacaataggattgca 43558689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22832160 - 22832091
Alignment:
Q  232 tataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaa 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||   |||||||| ||| ||||||||    
T  22832160 tataggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaaaagtgattgaatgaagactaagaa 22832091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 653
Target Start/End: Original strand, 20318447 - 20318491
Alignment:
Q  609 tcaagagttagcacctagaagtatgcattttgcagatgatatagt 653  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  20318447 tcaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcagatgatgtagt 20318491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 339
Target Start/End: Original strand, 25937120 - 25937220
Alignment:
Q  240 aattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaa-ggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttat 338  Q
    ||||||||| |||| || ||| || |||||||| |||| || | ||||| |||| |||| |||| ||||||||| || | |||||| |||||||||||||    
T  25937120 aattaaacttatgattcataccatgaagttatgggaaaaggttaattgagcgaagactacgaaatgagactcgattttctgataaccaatttggttttat 25937219  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  25937220 g 25937220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 12)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 149 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 51449056 - 51448594
Alignment:
Q  149 aagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaact 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||    
T  51449056 aagaaaatgccggacgagtggagaagaaacactttaattccaatctataagaacaagagggatatacaaaattgcgcgaattata--ggggaattaagct 51448959  T
Q  249 aatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggagg 348  Q
    |||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  51448958 aatgagtcataccataaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatacctgggagg 51448859  T
Q  349 tcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcat 448  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  51448858 tcgactatggaagcaatctatttacttcgacgcgtgatggagcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgt 51448759  T
Q  449 atgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttc 548  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || |||    
T  51448758 atgatagagtaccgagagagattttgtggaaagcccgggagaagaaaggggttaggtttgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttc 51448659  T
Q  549 gactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51448658 gactggtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagattttcccataacaataggattgcaccaag 51448594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 232 - 613
Target Start/End: Original strand, 52137844 - 52138225
Alignment:
Q  232 tataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttg 331  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  52137844 tataggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactcagaaaggagattcgagttacggataaccaatttg 52137943  T
Q  332 gttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcat 431  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52137944 gttttatgcctgggaggtcgaatatgaaagcaatctacttacttcgacgcgtgatggagcgatatcggacagataaaaaagacttgcacttagttttcat 52138043  T
Q  432 tgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgat 531  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  52138044 tgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctggagaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggat 52138143  T
Q  532 atgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  52138144 atgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagattttcccataacaatagaattgcaccaag 52138225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 101 - 613
Target Start/End: Original strand, 38848989 - 38849491
Alignment:
Q  101 agaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataaga 200  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |  ||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  38848989 agaggaattgtgtggctcacaaaactttttaacgagattataaggacgaagaaaatatcggacgagtggagaagaaacactttaattccaatctataaga 38849088  T
Q  201 acaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaaga 300  Q
    |||||  |||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||||||||  ||||||    
T  38849089 acaagggggatatacaaaattgcgcgaattataa--gggaattaaactaatgagtcataccatgaagttatgggaaagagtgattgaacgaaggctaaga 38849186  T
Q  301 aaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcaga 400  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   || |||| ||| || ||    
T  38849187 aaagagactcgggttacagataactaattttcttttatgcctgggaggtcgactatggaagcggtctacttactttgacgcttgacggagtgatgtcgga 38849286  T
Q  401 cggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagag--tgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggt 498  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||  |||||||          ||| |||| |||| | |||     
T  38849287 cggataaaaaacacttacacttagttttcattgatttggagaaggcgtaagatagagtttgtagagagat----------aagccctatagaagaaaggg 38849376  T
Q  499 gttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaa 598  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  38849377 gttatgattgcctatattagagctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaaaatggggctaccaaagatttttccataacag 38849476  T
Q  599 taggattgcatcaag 613  Q
    |||||||||| ||||    
T  38849477 taggattgcaccaag 38849491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 441
Target Start/End: Original strand, 3368649 - 3368989
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||  | | |||||||||    || || ||||||||||||| |||| || | |||||||||    
T  3368649 tagaggaattgtgtggctcaccgaacttttaaacgagattataaggacaaagaaaatattggatgaatggagaagaagcattttagttccgatttataag 3368748  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |  ||||||||| || | || ||| || |||||||| ||||   |||||||||||| ||||||    
T  3368749 aacaagatggatatacaaaattgtgtgaattatagaag--aattaaacttataattcataccatgaagttatgggaaaatgtgattgaacgaagactaag 3368846  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| | ||| |  ||| ||||||||| |||  |||||| ||||| ||||   |||||||| |||||||    
T  3368847 aaaagagactcgagttacttataattaatttagttatttgcttgtgagatcgactatgaaagttatctacctacttcgacgcatgatggagcaatatcag 3368946  T
Q  400 acggat-aaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggag 441  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3368947 acggataaaaaaagacttgcacttagttttctttgatttggag 3368989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 319 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 50630498 - 50630293
Alignment:
Q  319 gataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgc 418  Q
    |||||| |||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||    || || ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  50630498 gataaccaatttgattttatgcttgcgaggtcgaccatggaagcaatctacttaccacaacatgtgatggagcagtataagatggataaaaaagacttgc 50630399  T
Q  419 acttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattag 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||||      
T  50630398 acttagttttcattgatttggagaaggcatatg--agagtgcctcgagatattttgtggaaagccctagagaagaaaagtgttacgattgcctatattta 50630301  T
Q  519 agctatca 526  Q
    ||||||||    
T  50630300 agctatca 50630293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 604
Target Start/End: Original strand, 9258055 - 9258274
Alignment:
Q  384 gatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggc 483  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | || |||||  |||| |||||||      
T  9258055 gatggagcgatatcaaacgcataaaaataactcgcactaagttttcattgatttggagaacgcatatgataaaattcctagagagattttatggaaagct 9258154  T
Q  484 ctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaag 583  Q
    || || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||  || |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  9258155 ctggataataaagg-gttaggattgtctatattagagctataaacgatatgtatgagagagcttcgactattgtgaggacacatgatggggttaccgaat 9258253  T
Q  584 attttcccataacaataggat 604  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  9258254 attttcccacaacaataggat 9258274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 613
Target Start/End: Original strand, 27916581 - 27916968
Alignment:
Q  217 aaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagtta 316  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||| | ||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| | |||||    
T  27916581 aaattgcgtgaattata--ggggatataaattgatgagtcataccatgaagttatgagaaagggtgattgaacgaagaataagaaaagagacccaagtta 27916678  T
Q  317 cggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagactt 416  Q
      |||||| |||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |  || |||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||   ||||||| | ||    
T  27916679 gtgataaccaatttggttttatgtcta--aggtcgaccatggatgtgatttacttacttccacgtgtgatggagcgacgtcagacatgtaaaaaaaaatt 27916776  T
Q  417 gcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatatt 516  Q
        ||  ||||||||||||||||| ||   ||||||  |||||| | |||  || | ||||||| |||| |||| | | | ||||||||| | ||||||    
T  27916777 --ctttttttttcattgatttggaggag---tatgatcaagtgcctatagagattctatggaaagccctaaagaagaaatgagttaggattacttatatt 27916871  T
Q  517 agagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||||||||| | ||||   |||||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||  |  |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27916872 agagctatccaggatacctatgaggaaattttgactagtgttaggacacacgatgggactacaaacaatttccccataacaataggattgcaccaag 27916968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 614
Target Start/End: Original strand, 48220860 - 48221179
Alignment:
Q  296 taagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgata 395  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||    | | || ||  |||| ||||  |||||||||| | |||||  |||||| |||||    
T  48220860 taagaaaagagactcgagttagagataactaatttgaatttagaattggaagatcatctatagaagagatctacttacctcgacgtatgatggaacgata 48220959  T
Q  396 tcagacggataaaa-aagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatag 494  Q
     |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||  | |  |     
T  48220960 acagacaaataaaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaaacgtatgatagattgcctagagatattttatggaaagccctgaaaaggaa 48221059  T
Q  495 aggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccata 594  Q
    |   ||||  ||| | |||| | |||||||||| |||||| ||||||  | |||  |||||||||||| ||| |||| | | ||||| || ||| |||||    
T  48221060 ataagttataattacttatactcgagctatcaaagatatgtatgaggtggattcagctagtgtgaggatgcaggatgcgaccaccgacgaattttccata 48221159  T
Q  595 acaataggattgcatcaaga 614  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  48221160 acaataggattgcaccaaga 48221179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30724980 - 30724850
Alignment:
Q  297 aagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatat 396  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||||| | |||||  || ||| |||||| | |||     
T  30724980 aagaaaggagacacgagttactgatcaccaatttggttttatgtatgggaggtcgaccatgaaagcaatccatttactacgatgtgtgatggatcaatac 30724881  T
Q  397 cagacggataaaaaagacttgcacttagttttcat 431  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30724880 t----ggataaaaaagacttgcacttagttttcat 30724850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 402 - 533
Target Start/End: Original strand, 11580749 - 11580880
Alignment:
Q  402 ggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgtt 501  Q
    |||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||| |||| | |||| || ||||    
T  11580749 ggatcaaaaggacttgcatttagattttattgattttgagaaggcatatgttagagtgtttagagaaattttgtggaaagtcctataaaataaagatgtt 11580848  T
Q  502 aggattgcctatattagagctatcaatgatat 533  Q
    || | || |||||||  || |||||| |||||    
T  11580849 agaaatgtctatatttaagttatcaaggatat 11580880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 446
Target Start/End: Original strand, 6778993 - 6779143
Alignment:
Q  294 actaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcga 393  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||  |||| ||||||  |||||| | | ||| ||    
T  6778993 actaagaaaagagactcgaccgactgataaccaatttggttttgtgcatgggatgtcgaccatggaagttatcttcttactacgacgtgtggttgagtga 6779092  T
Q  394 tatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggc 446  Q
    ||||| |  |||  |||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||    
T  6779093 tatcatatagat--aaaatacttgtacttagttttcatggaattgtagaaggc 6779143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 563
Target Start/End: Original strand, 19736514 - 19736562
Alignment:
Q  515 ttagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggac 563  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||| |||||||    
T  19736514 ttagagctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtatgaggac 19736562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 100 - 607
Target Start/End: Original strand, 8179679 - 8180186
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| ||||||||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8179679 tagagggattgtgtggctcacaaacctttttaacgagattatgaggacgaagaaaatgtcagacgagtggagaagaagcactttaattccaatctataag 8179778  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||    
T  8179779 aacaaggaggatatacaaaattgcgcgaattata--ggggaattaagctaataagtcataccatgaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaag 8179876  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  8179877 aaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatgcctgggaggtcgactatgaaagcaatctacttactttgacgcgtgatggagcgatatcgg 8179976  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgcc--gagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagagg 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||| ||| ||||| | |||    
T  8179977 acggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggaaaagacgtatgatagagtaccgagagagagattttgtggaaagccctggagaagaaagg 8180076  T
Q  498 tgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataaca 597  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | |||| || |||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8180077 ggttaggattgccaatattagggctatcaaggatatgtacgagggagcttcgactagtgtgaggtcgcaggatggaactaccgaagattttcccataaca 8180176  T
Q  598 ataggattgc 607  Q
    ||||||||||    
T  8180177 ataggattgc 8180186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 232 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 452882 - 452501
Alignment:
Q  232 tataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttg 331  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| | |||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  452882 tataggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttacgagaaagggtgatcgaaagaagactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttg 452783  T
Q  332 gttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcat 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  452782 gttttatgcctgggaggtcgactatggaagcaatctacttacttcgacgcgtgatggagcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcat 452683  T
Q  432 tgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgat 531  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  452682 tgatttggaaaaggcgtacgatagagtaccgagagagattttgtggaaagcccgggagaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaagaat 452583  T
Q  532 atgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  452582 atgtatgagggaggttcgactagtgtgaggacgcaggatgagactaccgaagattttcccataacaataggattgcaccaag 452501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 149 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 24584956 - 24584491
Alignment:
Q  149 aagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaact 248  Q
    ||||||||  ||||| |||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||    
T  24584956 aagaaaatttcagaccagtgaaaaagaaacactttaattccaatctataagaacaaaggggatatacaaaattgcacgaattata--ggggaattaagct 24584859  T
Q  249 aatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgatt---gaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctagg 345  Q
    |||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||   |||| || ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || ||    
T  24584858 aatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgattattgaacaaagactaagaaaggagactcgagttatagataactgatttggttttatgtctggg 24584759  T
Q  346 aggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaagg 445  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  24584758 aggtcgagtatggaagcgatctacttacttcgacgcgtgatggagcgatatcggacggataaaaaagacttacacctaattttcattgatttggagaagg 24584659  T
Q  446 catatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagt 545  Q
    | |||||||||||  | |||||  |||||||||||  ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||     
T  24584658 cgtatgatagagtttccagagagattttgtggaaaaccctggagaagaaaggggttaggattgcctatatcagagctatcaaggatatgtatgagggagc 24584559  T
Q  546 ttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24584558 ttcgactactgtgaagacgcaggatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcaccaag 24584491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 232 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 45368892 - 45368510
Alignment:
Q  232 tataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttg 331  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  45368892 tataggggaattaagctaatgagtcataccatgaaattatgggaaagggtaattgaacgaagactaagaaaagagactcatgttacggataaccaatttg 45368793  T
Q  332 gttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcat 431  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  45368792 gctttatgcctgggaggttgactatggaagcgatatacttacttcgacgcgtgatggagcgatatcggacggataaaaagaacttacacttagttttcat 45368693  T
Q  432 tgatttggagaaggcatatgatagagtgcc--gagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatg 529  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||| |  || || |||||||||||||||||||||||| | |    
T  45368692 tgattttgagaaggcgtatgatagagtacctagagagat-ttttgtggaaagccctggagaagaatggggtgaggattgcctatattagagctatccagg 45368594  T
Q  530 atatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  45368593 atatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggatgcaggatggggataccgtagattttcccataacaataggactgcaccaag 45368510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 100 - 606
Target Start/End: Original strand, 37280994 - 37281495
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||| | | ||  |||||| | || || |||||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  37280994 tagaggaattgtgtggctcaccaaacattttaacgagactatgaggacaac-aaaatgtcggatgaatggagaagaaacgctttaatttcgatctataag 37281092  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| || ||| || ||||||||  |||   |||||||||||| ||||||    
T  37281093 aacaagg-ggatatacaaaattgcgcgaattata--ggagaattaaactaatgaatcataccatgaagttatgataaaaagtgattgaacgaagactaag 37281189  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
     ||| | |||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||     
T  37281190 taaacaaacttaagttactgataaccaatttggttttatacctgagaagtcgactatagaagtgatctacttactttgacgtgtgatgaagcgatgtcat 37281289  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtg 499  Q
     || |||||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||  |||| |||||||||  ||||  |  ||||||||  ||||||||| | || ||    
T  37281290 gcgaataaaaaagatttgcaattag-ttccattgacttggagaaggtgtatgctagagtgccttgagagatcgtgtggaaatccctagagaagaaagttg 37281388  T
Q  500 ttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaat 599  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| || ||| || ||| |||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37281389 ttaggattgattatattagaactatcaaggatatgtataagggagcttcaactagtgtgaggaaacatgagagggctaccgacgattttcccataacaat 37281488  T
Q  600 aggattg 606  Q
     ||||||    
T  37281489 tggattg 37281495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 384 - 613
Target Start/End: Original strand, 2609696 - 2609925
Alignment:
Q  384 gatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggc 483  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |    
T  2609696 gatggatcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtgctgagagagattttgtggaaagcc 2609795  T
Q  484 ctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaag 583  Q
    |  ||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  2609796 ccggagaagaaaggggtaaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagagagcttcgattagtgtgaggacgcaggatgggactaccaaag 2609895  T
Q  584 attttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2609896 attttcccataacaataggattgcaccaag 2609925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 164 - 608
Target Start/End: Original strand, 13148272 - 13148714
Alignment:
Q  164 gagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaat 263  Q
    ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  13148272 gagtggataagaagtactttatttccaatttataagaacaaaggggatatacaaaattgcttggattata--ggggaattaaactaatgagtcttaccat 13148369  T
Q  264 caagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagca 363  Q
     |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||     
T  13148370 gaagttatgggaaagggtgattgaatgaagactaagaaaagagactcgagttatcgataaccaatttgattttatgcctagg-tgtcaactatggaagcg 13148468  T
Q  364 atctacttactttgacgtgcgatggagcg--atatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgcc 461  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||| |  | ||| || ||| ||||||  |   |||||| | ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  13148469 atctacttacttcggcgtatgatggagagaaacatcggatgga-aaaaaatgcccacacttaatcttcattgatttggggaaggtgtgtgatagagtgcc 13148567  T
Q  462 gagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgagg 561  Q
     |||||  ||||||| |||| |||||| || | ||| ||||  ||||  |||||||||| |||| |||||||| |||| | |||||  ||||| || | |    
T  13148568 tagagagattttgtgaaaagccctagaaaagaaaggggttataattggttatattagagttatccatgatatgtatgatggagttttaactagagtaaag 13148667  T
Q  562 acgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgca 608  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  13148668 acgtaagatggggctactgaagatttttcgataacaatagaattgca 13148714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 613
Target Start/End: Original strand, 16291940 - 16292110
Alignment:
Q  443 aggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgagga 542  Q
    |||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||  ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||      
T  16291940 aggcgtatgatagagtatcgagagagattttgtggaaaatcctggagaagaaaggggttaggattgcctatattaggactatcaaggatatgtatgagag 16292039  T
Q  543 agtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    || |||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16292040 agcttcgactagtgtgaggacacaggatgggactaccgaaaattttcccataacattaggattgcatcaag 16292110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 38453617 - 38453503
Alignment:
Q  499 gttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaa 598  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38453617 gttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagagagtttcgactagtgtgaggacgcaggatgggattaccgaagattttcccataacaa 38453518  T
Q  599 taggattgcatcaag 613  Q
    |||||||||| ||||    
T  38453517 taggattgcaccaag 38453503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 526
Target Start/End: Original strand, 33251337 - 33251624
Alignment:
Q  238 ggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggtttta 337  Q
    ||||||||||| ||||||| | | || ||| ||||  ||| | |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  33251337 ggaattaaacttatgagtcatcccatgaagctatggaaaatggtgattgaacgaagactaaaaaaagtgattcgagttacttataaccaatctggtttta 33251436  T
Q  338 tgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgattt 437  Q
    ||||    |||||  |||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||  | | |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  33251437 tgcccgaaaggtcttctatggaagttatctaattacttcgacgtgtgatggagcgatatcgtatgtataaaaaagattgtcacctagttttcattgattt 33251536  T
Q  438 ggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaataga-ggtgttaggattgcctatattagagctatca 526  Q
     |||||||| | ||||| ||||   |||||  |||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||| | |||||||||| |||||    
T  33251537 cgagaaggcgtgtgatatagtgtaaagaga--ttttgtggaaagccttagagaataaagggggttaggatttcttatattagagttatca 33251624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 613
Target Start/End: Original strand, 14769383 - 14769695
Alignment:
Q  294 actaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctagg-aggtcgactatggaagca--atctacttactttgacgtgcgatggag 390  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||   |||||||||  |        ||||||     
T  14769383 actaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctacttatct--------gatggaa 14769474  T
Q  391 cgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagaga 490  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  | |||||  ||||||||||||   || |||    
T  14769475 cgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-aga 14769573  T
Q  491 atagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcc 590  Q
    | | |   |||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||  || |||||||||||||| |  |||||||| |||| | | |||||    
T  14769574 agaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcatcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaatttcc 14769672  T
Q  591 cataacaataggattgcatcaag 613  Q
    || ||||||| ||||||| ||||    
T  14769673 caaaacaatatgattgcaccaag 14769695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 470 - 613
Target Start/End: Original strand, 876411 - 876551
Alignment:
Q  470 ttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatga 569  Q
    |||| ||||||  |||| |||||| |||||||||| |  |||||||| |||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||| ||  |    
T  876411 ttttttggaaaaccctatagaataaaggtgttagggtgccctatattcgagctatcaaggatatgtatgaggg-gtctcgactagtgtgaggacaca--a 876507  T
Q  570 tggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  876508 tggagacactgaagattttcccataacaacaggattgcaccaag 876551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11502906 - 11502805
Alignment:
Q  103 aggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaac 202  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| | | ||| ||||||   || ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  11502906 aggaatagtgtggctcaccaatctttctaactagattatgaggacaaataaaatgttcgatgagtggagaagaaacactttaatttcgatctataagaac 11502807  T
Q  203 aa 204  Q
    ||    
T  11502806 aa 11502805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 454
Target Start/End: Original strand, 6464937 - 6464999
Alignment:
Q  392 gatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgata 454  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6464937 gatatcagattgataaaaaaaaattgcacttaattttcattgatttggataagacatatgata 6464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 39287923 - 39287838
Alignment:
Q  406 aaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaa 491  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||  ||| ||||||| ||||| ||||    
T  39287923 aaaaaggatttgcactcagttttcattgatttggagaagacatgtgataaagtggctagagagatttagtggaaaagcctaaagaa 39287838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7789733 - 7789634
Alignment:
Q  240 aattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatg 339  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || || |||||  ||||  ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  7789733 aattaaacttatgagtcataccattaaattatggaaaagagtgattgaacaaagattaacaaaagagactcgagttactcataatcaatttggttttatg 7789634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 100 - 613
Target Start/End: Original strand, 36544038 - 36544549
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| ||||||||| | |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36544038 tagagggattgtgtggctcacaaacctttttaaagagattatgaggacgaagaaaatgtcggacgagtggagaagaagcactttaattccaatctataag 36544137  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||  |||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||    
T  36544138 aacaagggggatatacaaaattgcgcgaatcata--ggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaag 36544235  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| |    
T  36544236 aaaggagactcaagttacggataaccaatttggttttatgcctgggaggtcgactatggaagcaatctacttacttcgacgcgtgattgagcgatatctg 36544335  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtg 499  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |    
T  36544336 acggataaaaaagatttgcacttagttttcattgatttgga-aaggcgtatgatagagtaccgagatagattttgtggaaagccctggagaagaaagggg 36544434  T
Q  500 ttagga-ttgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaa 598  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36544435 ttagaatttgcctatattagggctatcaaggatatatatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagattttcccataacaa 36544534  T
Q  599 taggattgcatcaag 613  Q
    |||||||||| ||||    
T  36544535 taggattgcaccaag 36544549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 100 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 15216665 - 15216157
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    |||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  15216665 tagaggaattatgtggctcacaaaacttttcaacgagattatgaggacgaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcaccttaattccaatctataag 15216566  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||  |||||||| | |||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||    
T  15216565 aacaaggtggatatacaacattgcacgaattata--ggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgcgaaagggtaattgagcgaagactaag 15216468  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||   ||||  ||||||||      
T  15216467 aaaagagactcaagttatggataatcaatttggttttatgcctgggaggtcgactatgaaagcgatctacttacttcgacgcttgatg--gcgatatcga 15216370  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtg 499  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| |  |||||||||||  ||  ||||| | ||| |    
T  15216369 atggataaaaaagacttacatttagttttcattgatttgaataaggcgtatgatagagtacctagatagattttgtggaaa-tccatgagaagaaagggg 15216271  T
Q  500 ttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaat 599  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  15216270 cgaggattgcctatattagagctatctatgatatatatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgaggataccgtagattttcccataacaat 15216171  T
Q  600 aggattgcatcaag 613  Q
    |||| |||| ||||    
T  15216170 aggactgcaccaag 15216157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 42855271 - 42854898
Alignment:
Q  242 ttaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcc 341  Q
    |||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42855271 ttaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaaggaaaattgagcgaagactaagaaaagagactcgcgttacggataaccaatttggttttatgcc 42855172  T
Q  342 taggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataa--aaaagacttgcacttagttttcattgatttgg 439  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42855171 tgggaggtcgactattgaagcgatctacttacttcgacgcgtgatggagcgatattggacggataaaaaaaagacttacacttagttttcattgatttgg 42855072  T
Q  440 agaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctag-agaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatg 538  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | |||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||    
T  42855071 agaaggcatatgatagagtgcctagagatattttgtggaaa-gcctcgtagaagaaaggggtgaggattgcctaaattagagctatccgggatatgtatg 42854973  T
Q  539 aggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  42854972 agggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgaagataccgtagattttcctataacaataggactgcaccaag 42854898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 384 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 36566355 - 36566126
Alignment:
Q  384 gatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggc 483  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||| |    
T  36566355 gatggagcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtatcgagagagattttgtggaaagcc 36566256  T
Q  484 ctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaag 583  Q
    || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  36566255 ctggagaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgagactactgaag 36566156  T
Q  584 attttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36566155 attttcccataacaataggattgcaccaag 36566126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 355 - 613
Target Start/End: Original strand, 25984689 - 25984945
Alignment:
Q  355 atggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgata 454  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||  ||||||||  ||||| | |||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25984689 atggaagcaacatacttactacgacgtaggatggagcagtatcaaatggatcaaaaggacttgcacttggtttccattgatttggagaaggcatatgata 25984788  T
Q  455 gagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactag 554  Q
    ||||| | | | |  |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| |||| | |||   ||| ||    
T  25984789 gagtgtctaaaaa--ttttgtggaaagccctagagaagagaagtgttagggttgccaatattcaagctatcaaggatatgtatgacggagtcaagacaag 25984886  T
Q  555 tgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||||||| | ||   ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25984887 tgtgagggcacaaagtggagacaccgaagattttcccataacaataggattgcaccaag 25984945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 309
Target Start/End: Original strand, 13588593 - 13588800
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    |||||||||  | |||||||| |||||||||||  |||||||  | | |||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||    
T  13588593 tagaggaattatgtggctcactaaactttttaacaagattataaggacaaagaagatgtcagatgagtggaaaagaaacactttaattctgatttataag 13588692  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    |||||||||||| ||| ||| || || |||||||   | |||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  13588693 aacaagaaggatgtacaaaactgtgtaaattataa--gtgaattaaactaatgagtcataccataaagttaagggaaatgatgattgagcgaaaactaag 13588790  T
Q  300 aaaagagact 309  Q
    ||||||||||    
T  13588791 aaaagagact 13588800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 370 - 443
Target Start/End: Original strand, 6184814 - 6184887
Alignment:
Q  370 ttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaa 443  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6184814 ttacttcgacgtgtgatggagcgatatcggacagataaaaaagacttacacttagttttcattgatttggagaa 6184887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41445446 - 41445394
Alignment:
Q  294 actaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctagga 346  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41445446 actaagaaaagacactcgagttacggctaaccaatttggttttatgcctagga 41445394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 530 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 45231890 - 45231811
Alignment:
Q  530 atatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcat 609  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||   ||||||||||||||||||    
T  45231890 atatgtatgagggaatttcgactagtgtgaggacgcatgatggggcttttgacgatttttatataacaataggattgcat 45231811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 30579481 - 30579239
Alignment:
Q  239 gaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttat 338  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| |  ||||||| |||| |  |||||||| | | ||||||||| | |||| |||||||  || || ||||| |||||||    
T  30579481 gaatgaaacttatgagtcataccacgaagttatccgaacgagtgattgaatggatactaagaaacgggacttgagttacttattaccaatttagttttat 30579382  T
Q  339 gcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttg 438  Q
    || |  || || ||| ||| || | ||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||  ||  |||  || |||||||||||||| ||| |||||    
T  30579381 gcttgagacgttgaccatgaaatcgatctactcactatgacatgtgatggagtgatatcagatagaacaaactgatttgcacttagttttaattcatttg 30579282  T
Q  439 gagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaag 481  Q
    ||||||||  || |||||||||| |||||  |||||| |||||    
T  30579281 gagaaggcgaatcatagagtgcctagagagattttgtcgaaag 30579239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 35094131 - 35093989
Alignment:
Q  384 gatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggc 483  Q
    |||||||||||| || | | || | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| | |||   ||||||||||| |    
T  35094131 gatggagcgatagcatatgcatcacaaagagttgcatttagttttcattgatttggagaaggtgtgtgatagaatgcctaaagagactttgtggaaagcc 35094032  T
Q  484 ctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatca 526  Q
    |||||||| | ||| || | ||  ||||||||| |||||||||    
T  35094031 ctagagaagaaaggggtaaagaccgcctatattcgagctatca 35093989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 509 - 613
Target Start/End: Original strand, 3284785 - 3284890
Alignment:
Q  509 cctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaag-attttcccataacaataggattgc 607  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| |  ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  3284785 cctattttagagctatcaaggatatgtatgagggagtctcgactagtgtgaggacacaagatggagacactaaagaattttctcataacaatagtattgc 3284884  T
Q  608 atcaag 613  Q
    | ||||    
T  3284885 accaag 3284890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 613
Target Start/End: Original strand, 13983954 - 13984030
Alignment:
Q  537 tgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||    
T  13983954 tgagggagcttcgactagtgtgaggacgtaagatggggctactgacgattttctcataactatatgattgcaccaag 13984030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 41445380 - 41445320
Alignment:
Q  402 ggataaaaaagacttgcactt-agttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgcc 461  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  41445380 ggataaaaaagacttgcacttaagtatttattgaattggagaaggcacgtgatagagtgcc 41445320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 11131029 - 11130981
Alignment:
Q  406 aaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgata 454  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11131029 aaaaaatacttgcatctagttttcattgatttggataaggcgtatgata 11130981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 569 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 12492771 - 12492727
Alignment:
Q  569 atggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12492771 atgggactatcgaagatttttccataacaataggattgcaccaag 12492727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Original strand, 41148437 - 41148500
Alignment:
Q  161 gacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggatatacgaaattgcgt 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| |||  |||||||| |||||||||    
T  41148437 gacgagtggagaagaaacactttaactacgatttataagaaaaag-gggatatacaaaattgcgt 41148500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 112 - 613
Target Start/End: Original strand, 6082287 - 6082797
Alignment:
Q  112 atggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggat 211  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||||||| | |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||    
T  6082287 atggctcacatacctttttaacgagattatgaggacgaagaaaatgtcggacgagtggagaagaagcactttaattccaatctataagaacaaggggcat 6082386  T
Q  212 atacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcg 311  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  6082387 atacaaaattgcgcgaattata--ggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtgatcgaaagaagactaagaaaggagactcg 6082484  T
Q  312 agttacggataactaatttggtttt-----------atgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcaga 400  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||           |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||    
T  6082485 agttacggataaccaattttttttttttttttttttatgcctgggaggtcgactatggaagcaatctacttacttcgacatgtgatgcagcgatatcgga 6082584  T
Q  401 cggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgt 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| ||    
T  6082585 cggataaaaaggacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggtgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctggagaagaaaggggt 6082684  T
Q  501 taggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaata 600  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  6082685 taggattgcctatattagaactatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaagatgagactaccgaagattttctcgtaacaata 6082784  T
Q  601 ggattgcatcaag 613  Q
    |||||||| ||||    
T  6082785 ggattgcaccaag 6082797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 102 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 20429031 - 20428522
Alignment:
Q  102 gaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaa 201  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||| | |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  20429031 gaggaattgtgtggctcacaaaactgttcaacgagattatgaggacgaagaaaatgccagacgaatgaagaagaagcaccttaattccaatatataagaa 20428932  T
Q  202 caagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaa 301  Q
    ||||  |||||||| | |||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  20428931 caagggggatatacaacattgcgcgaattataa--gggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtaattgaacgaagactaagaa 20428834  T
Q  302 aagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagac 401  Q
     ||||||||  |||||  ||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  20428833 cagagactcacgttacaaataaccaatatggttttatgcttgggaggttgactatggaagcgatctacttactttgacgtgtgatggagcgatatcggac 20428734  T
Q  402 ggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgtt 501  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| ||     
T  20428733 ggataaaaaagacttacacctagttttcattgatttgtagaaggcgtatgatagagtacctagagagattttgtggaaagccctggagaagaaaggggtg 20428634  T
Q  502 aggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaatag 601  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  20428633 aggattgcctatattagagctatccaggatatgtatgtgggagcttcgactagtgtgaggaagtaggatggggataccgtatattttcccataacaatag 20428534  T
Q  602 gattgcatcaag 613  Q
    || |||| ||||    
T  20428533 gactgcaccaag 20428522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 232 - 613
Target Start/End: Original strand, 30669911 - 30670285
Alignment:
Q  232 tataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttg 331  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30669911 tataggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatggcaaaggatgattgaacgaagactaagaaatgagactcaagttacggataaccaatttg 30670010  T
Q  332 gttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcat 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30670011 gttttatgcc-aggaggtcgactatggaagcaatctacttacttcgacgtgtgatggagcgatatcggacagagaaaaaagacttacacttagttttcat 30670109  T
Q  432 tgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgat 531  Q
    ||||||||||||||| | |||||      | |||||  |||||||||||| |||  |||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  30670110 tgatttggagaaggcgtttgata------ctagagagattttgtggaaagtcctgaagaagaaagaggttaagattgcctatattagagctatccaggat 30670203  T
Q  532 atgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    ||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30670204 atgtataagggagttttgactagtgtgaggatgcatgatgaggttacctaagattttcccataacaataagattgcaccaag 30670285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 100 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 5260644 - 5260184
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||    
T  5260644 tagaggaattgtgtggctcacaaaacttttcaacgagattatgaggacaaagaaaatgccggacgagtggagaagaatcaccttaattccaatctataag 5260545  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||  |||||||| | | |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| | ||||| |||| ||| ||    
T  5260544 aacaagggggatatacaacaatgcgcgaattata--ggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaagggtaattgagcgaagacttag 5260447  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||||  ||| || ||||   |||||||||||||| |    
T  5260446 aaaagagactcacgttacggataaccaatttggttttatgtatgggaggtcgattatggaagcgatctctttatttcgacgcctgatggagcgatatcgg 5260347  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtg 499  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||| |||||||| |||||| || | ||| |    
T  5260346 acggataaaaaagacttacacttagttttcatcgatttggagaaggcgtatgatagagtacctagagagatttagtggaaagccctagaaaagaaagggg 5260247  T
Q  500 ttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgagga 562  Q
    | | |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||| || ||| |||||||||||||    
T  5260246 tgatgattgcttatattagagctatataggatatgtatgagggagcttcaactagtgtgagga 5260184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 100 - 613
Target Start/End: Original strand, 9705684 - 9706172
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  9705684 tagaggaattgtgtggctcacaaaacttttcaacgagattatgagaacgaagaaaatgtccgacgagtggagaagaagcaccttaattccaatctataag 9705783  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||  |||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||        ||| ||| || |||||||| |||||               ||||||    
T  9705784 aacaagggggatatacaacattgcgcgaattata--ggggaattaa--------gtcataccatgaagttatgggaaag---------------actaag 9705858  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || |||  ||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  9705859 aaaagagactcacgttacggataaccaacttgactttatgcctgggaagtcgactatggaaacgatctacttacttcgacgcgcgatggagcgatatcgg 9705958  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtg 499  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||||||||| |||  |||| | ||| |    
T  9705959 acggataaaaaagacttacacttagttttcattgatttggagaaggcgtatgatagagtacctagagagattttgtggaaagccctgtagaagaaagggg 9706058  T
Q  500 ttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaat 599  Q
    | ||||||||||| ||||||||| || | |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  9706059 tgaggattgcctaaattagagctttccaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgaggataccgtagattttcccataacaat 9706158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 613
Target Start/End: Original strand, 26290669 - 26291179
Alignment:
Q  99 ttagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataa 198  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | | || ||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||| | ||  ||||    
T  26290669 ttagaggtattgtgtggctaaccaaactttttaacgagattatgaggacaatgaaaatgcaggatgagtggagatgaaacactttaattacgatccataa 26290768  T
Q  199 gaacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaa 298  Q
    |||||||  |||||||| |||||| | |||| |||  |||||||||| || ||||||| ||| || ||||||    ||||  |||||||||||| |||||    
T  26290769 gaacaagggggatatacaaaattgtgcgaatgata--ggggaattaaccttatgagtcataccataaagttaataaaaagagtgattgaacgaagactaa 26290866  T
Q  299 gaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatca 398  Q
     ||||||| ||| |||||  || ||  ||||| ||||||||  | | ||||||| ||||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||    
T  26290867 aaaaagagtctcaagttattgacaatcaatttagttttatgtttggaaggtcga-tatggaagcgatctacttgcttcgatgtgtgatggagcgatatca 26290965  T
Q  399 gacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggt 498  Q
    |||  | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||    ||||||||||| ||   |||  || ||||||||| || |||||  | |||     
T  26290966 gacaaaaaaaaaggacttgcacttagtttttgttgatttgaataa-ttgtatgatagagttcctgaagagattatgtggaaagcccaagagatgaaaggg 26291064  T
Q  499 gttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaa 598  Q
     |||||||||| ||||| | | ||||||| |||||| |||||| || ||| | |||| |||||||  | ||||| ||||  ||  |||||  ||||||||    
T  26291065 tttaggattgcttatatgataactatcaacgatatgtatgagggagcttcaagtagtttgaggacttaagatggcgctattgacaattttttcataacaa 26291164  T
Q  599 taggattgcatcaag 613  Q
    |||||||||| ||||    
T  26291165 taggattgcaccaag 26291179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 2681669 - 2681453
Alignment:
Q  265 aagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaa 364  Q
    |||||| | |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| ||   | || |||||||||||| |    
T  2681669 aagttacgggaaagggtgattgaaggaagattaagaaaagagactcgaggaatggataaccaatttggttttatgtctgtaaagttgactatggaagcga 2681570  T
Q  365 tctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgag 464  Q
      |||||| || |||||  | |  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  2681569 cttacttagttcgacgtatggtacaacgatatcagacgggtaaaaaatacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcgtatgatagtgtgtcgag 2681470  T
Q  465 agatgttttgtggaaag 481  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  2681469 agaggttttgtagaaag 2681453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 296 - 454
Target Start/End: Original strand, 3629346 - 3629504
Alignment:
Q  296 taagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgata 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||   |||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  3629346 taagaaaagagactcgagttacggataatcaatttgattttatgctttggaggtcgacaatggaaatgatctacttacttcggcgtatgatggagcgata 3629445  T
Q  396 tcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgata 454  Q
    || |||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3629446 tcggacaaacaaaaaagacttacacttagttttcattgatttgaagaaggcgtatgata 3629504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 354 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 2208546 - 2208287
Alignment:
Q  354 tatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgat 453  Q
    |||||||||||||||| || || |||||| || |||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  2208546 tatggaagcaatctacctatttcgacgtgtgacggagagatatcagacaaataaaaacgacttgtacttagttttcattgatttggagaaggtgtatgat 2208447  T
Q  454 agagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgacta 553  Q
    ||| || | |||||   ||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||||| || |||| | || ||| || |||    || || ||    
T  2208446 agaatgtctagagagactttttggaaaggcctagagaagaaagatgttagaattgcttatattaaagttatccaagagatgtataaggggactttgatta 2208347  T
Q  554 gtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    || |||||| ||| |||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  2208346 gtatgaggatgcaagatgggactaccaacgatttttccatatcaatatgattgcaccaag 2208287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 499 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 2681046 - 2680945
Alignment:
Q  499 gttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaa 598  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2681046 gttagcattgcctattttagagctatcaaggatatgcatgaaggagcttcgactagtgtgagaacacaggatggggctaccgaaaatttttccataacaa 2680947  T
Q  599 ta 600  Q
    ||    
T  2680946 ta 2680945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 17222947 - 17222503
Alignment:
Q  164 gagtggagaagaagcactttaatttcaatttataagaacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaat 263  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || |||| |||||||| | |  |||||| |||||  |||| ||| ||  |||| ||||||| ||||||| ||| ||    
T  17222947 gagtggagaagaaacactttagtgtcgatttttaagaacacggaaaatatacaaaattatgtgatttaaatgaggga-ttaaacttatgagtcttaccat 17222849  T
Q  264 caagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagca 363  Q
     |||||||| ||| | |||||||||     | |||||||||||||||  ||||| || ||| |||||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||    
T  17222848 aaagttatgagaa-gaatgattgaatagggattaagaaaagagactcaggttactgagaaccaatttgattttttgcctaggaggttgacaatgaaagca 17222750  T
Q  364 atctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccga 463  Q
    || || |||||   ||||| |||||||| |||||  | | || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||| ||| ||      
T  17222749 atgtatttact---acgtgtgatggagcaatatcgaatgtatcaaaaggacttacacttagtttttattgatttggaaagtgcatgtgataaagttcctt 17222653  T
Q  464 gagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggac 563  Q
    |  |  |||| || |||  | |  |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||||| |||||  ||| |||| ||||||| ||||    
T  17222652 gcaagattttatgaaaacccatgaagaataaaggtgttagggttgtctatatttgagttatcaaagatatgtatgagagagtctcgaatagtgtgcggac 17222553  T
Q  564 gcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
     || ||||| |    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  17222552 acaagatggagacgtcgaagattttctcataacaatatgattgcaacaag 17222503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 9369558 - 9369353
Alignment:
Q  333 ttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcatt 432  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| ||| || ||||| | ||  ||   ||| |||||||| ||||||||||||    
T  9369558 ttttatgcctaggaagtcgacaatggaagcaatatacttactataacgtgtgatcgaacgatacc-gaatgaaccaaaggacttgcatttagttttcatt 9369460  T
Q  433 gatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgata 532  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| ||| |  ||  |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| |  |||||||| ||| |||||| ||||    
T  9369459 gatttgaagaagtcatatggtagagagcctaacgagattttgtagaaagccctagagaagaaaggtgttagggtgacctatattcgagatatcaaggata 9369360  T
Q  533 tgcatga 539  Q
    || ||||    
T  9369359 tgtatga 9369353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 511 - 605
Target Start/End: Original strand, 27790451 - 27790545
Alignment:
Q  511 tatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggatt 605  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  27790451 tatattagagttatccatgatatgtatgatggagtttcgactagtgtgaggatacatgatgagtatacctacgattttcccataacaaaaggatt 27790545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 608
Target Start/End: Original strand, 3629566 - 3629622
Alignment:
Q  552 tagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgca 608  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3629566 tagtgtgagaacgcaagatagggttaccgacgattttcccataacaataggattgca 3629622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 176
Target Start/End: Original strand, 3629192 - 3629253
Alignment:
Q  115 gctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaa 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||   |||||||| ||||||||    
T  3629192 gctcaccaaactttttaatgaaattatgaggacaaagaaaattttagacgagtagagaagaa 3629253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 10864734 - 10864625
Alignment:
Q  384 gatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggc 483  Q
    |||||| ||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||| |||| | ||||||  ||||| ||| | |    
T  10864734 gatggaacgatatccgatggatcaaaaaaacttgaacttagttttcattgttttgaagaatacatataatatagtgtctagagatagtttgtagaatgtc 10864635  T
Q  484 ctagagaata 493  Q
     |||||||||    
T  10864634 atagagaata 10864625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 20428463 - 20428419
Alignment:
Q  609 tcaagagttagcacctagaagtatgcattttgcagatgatatagt 653  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  20428463 tcaagagttagcaccgagatgtatgctttttgcagatgatgtagt 20428419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 100 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 13653 - 13141
Alignment:
Q  100 tagaggaatagtatggctcaccaaactttttaatgagattatgtgaataaagaaaatgccagacgagtggagaagaagcactttaatttcaatttataag 199  Q
    ||||| ||| || |||||||| | | ||||||| ||||||||| | |  ||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||    
T  13653 tagagaaattgtgtggctcacaatattttttaacgagattatgaggacgaagaaaatgtcggacgagtggagaacaaacactttaattccaatctataag 13554  T
Q  200 aacaagaaggatatacgaaattgcgtgaattatataggggaattaaactaatgagtcgtacaatcaagttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaag 299  Q
    ||||||  | |||||| ||| | || ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||| | |||||||||||| ||||||    
T  13553 aacaag-ggaatatacaaaactacgcgaat--tataggggaattaagctaatgagtcataccatgaagttatgggaaatggtgattgaacgaagactaag 13457  T
Q  300 aaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcag 399  Q
    | |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| | | |||||||||||  |    
T  13456 agagaagactccagttacggataaccaatttggttttatgcttgggaggtcgactatggaaacgatctacttacttcgacgcgtggtggagcgatatatg 13357  T
Q  400 acggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtg 499  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |  |  |    
T  13356 acggataataaagacttacacttagttttcattgatttggagaaggcgtatgatagagttcctagagagattttgtggaaagtcctggagaagaacgagg 13257  T
Q  500 ttaggattgcctatattagagctatcaatgatatg--catgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataaca 597  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13256 ttaagattgcctatattagagctatcaaggatatgtatatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaagatgggactaccgaagattttcccataaca 13157  T
Q  598 ataggattgcatcaag 613  Q
    ||||||||||| ||||    
T  13156 ataggattgcaccaag 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 268 - 613
Target Start/End: Original strand, 30520 - 30865
Alignment:
Q  268 ttatgcgaaaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatct 367  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30520 ttatgggaaagggtgattgaaagaagactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatgcctgggaggtcgactatggaagcaatct 30619  T
Q  368 acttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagaga 467  Q
    ||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30620 acttacttcaacgcgtgatgaagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgaattggaaaaggcgtatgatagagtaccgagaga 30719  T
Q  468 tgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcat 567  Q
      |||||||||||| ||   |||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||     
T  30720 gattttgtggaaagccccgaagaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcag 30819  T
Q  568 gatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  30820 gatgggactaccgaagattttcccaaaacaataggactgcaccaag 30865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 90294 - 90129
Alignment:
Q  294 actaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcga 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||| || ||| || | | |||||     
T  90294 actaagaaaagagactcgagttacggataaccaatttgattttatgccagggaggtcaactatggaagtgatctacttaattcgacatgtggtcgagcgt 90195  T
Q  394 tatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtg 459  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  90194 tatcggacggataaaaaagacttacacttagttttcattgatttggagaaggcgtatgatagagtg 90129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 470 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 88950 - 88869
Alignment:
Q  470 ttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgac 551  Q
    ||||||| |||| | | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||    
T  88950 ttttgtgaaaagccttggagaagaaaggagttaggattgcctatattagagctatcaaggatatgtatgagggaggttcgac 88869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 88864 - 88819
Alignment:
Q  568 gatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  88864 gatggggctaccaaagattttcccgtaaccataggattgcaccaag 88819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 354 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 645 - 386
Alignment:
Q  354 tatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgat 453  Q
    |||||||||||||||| || || |||||| || |||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  645 tatggaagcaatctacctatttcgacgtgtgacggagagatatcagacaaataaaaacgacttgtacttagttttcattgatttggagaaggtgtatgat 546  T
Q  454 agagtgccgagagatgttttgtggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgacta 553  Q
    ||| || | |||||   ||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||||| || |||| | || ||| || |||    || || ||    
T  545 agaatgtctagagagactttttggaaaggcctagagaagaaagatgttagaattgcttatattaaagttatccaagagatgtataaggggactttgatta 446  T
Q  554 gtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataacaataggattgcatcaag 613  Q
    || |||||| ||| |||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  445 gtatgaggatgcaagatgggactaccaacgatttttccatatcaatatgattgcaccaag 386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 461
Target Start/End: Original strand, 8756 - 8936
Alignment:
Q  281 tgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacg 380  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||| || ||  ||||  |||||||| ||||||||||||| ||  || |||| ||||||||   | |    
T  8756 tgattgaacaaagactaagataagagacttaagttactgaaaagcaattcagttttatgtctaggaggtcgaccataaaaacaatatacttactacaatg 8855  T
Q  381 tgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgcc 461  Q
    || || |||||| |||   | |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8856 tgtgaaggagcggtatagaatggatcaaaaggacttgcgcttagttttcattgatttgtagaagtcatatgatagagtgcc 8936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 497 - 613
Target Start/End: Original strand, 8949 - 9065
Alignment:
Q  497 gtgttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatgaggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccgaagattttcccataac 596  Q
    ||||| ||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||     | ||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  8949 gtgtttggattgccagtattcaagctatccatgatatgcatgaatggatctcgactagtgtgaggacacatggtggagacaccgacgattttcccataac 9048  T
Q  597 aataggattgcatcaag 613  Q
    |||||||||||| ||||    
T  9049 aataggattgcaccaag 9065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 276 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 25431 - 25184
Alignment:
Q  276 aaggatgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatctacttactt 375  Q
    |||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||| | | ||  ||||||  |||||||| |  ||||| ||| | | |||| || |||||||||    
T  25431 aaggatgattaaatggatactaataaaagagactcgagttgctggtagttaatttctttttatgcttcagaggttgacaaagaaagcgatttacttactt 25332  T
Q  376 tgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgccgagagatgttttgt 475  Q
     |||||  ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||| | | |||||||||| | | |||  | ||||    
T  25331 cgacgtttgatagagtgatatcaaacagataaaaaagacttgcacctagttttcattgattcatataagccgtgtgatagagtgtctatagagatcttgt 25232  T
Q  476 ggaaaggcctagagaatagaggtgttaggattgcctatattagagcta 523  Q
    |||||| |||| | || | | | ||||||||||| |||||||||||||    
T  25231 ggaaagccctatataagaaatgagttaggattgcttatattagagcta 25184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 459
Target Start/End: Original strand, 5575 - 5690
Alignment:
Q  344 ggaggtcgactatggaagcaatctacttactttgacgtgcgatggagcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaa 443  Q
    ||||||||| ||| ||||| || | |||||||  ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5575 ggaggtcgaatatcgaagcgatttccttacttaaacgtgtgatggagcgatatttgactgataaaaaacaatcgcacttagttttcatttatttggagaa 5674  T
Q  444 ggcatatgatagagtg 459  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  5675 ggcgtatgatatagtg 5690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15004 - 14917
Alignment:
Q  280 atgattgaacgaaaactaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatgcctaggaggtcgactatggaagcaatct 367  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||   |||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  15004 atgattgagcgaagactaataaaagagactcatattatcaataattaatttggttttatgtctaggaggtcgacaattgaagcaatct 14917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University