View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20058_high_5 (Length: 694)

Name: NF20058_high_5
Description: NF20058
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20058_high_5
NF20058_high_5
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (1-686)||(10415225-10415911)
chr1 (231-686)||(10420343-10420798)
chr1 (231-686)||(10409759-10410220)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (114-676)||(35410649-35411211)
chr5 (1-686)||(35385978-35386654)
chr5 (231-674)||(35754792-35755235)
chr5 (231-686)||(35366826-35367281)
chr5 (231-686)||(35376372-35376833)
chr5 (231-686)||(35423631-35424092)
chr5 (537-686)||(35370210-35370362)
chr5 (535-616)||(35437049-35437130)
chr5 (1-96)||(35411207-35411300)
chr5 (1-57)||(35371086-35371142)
chr5 (1-45)||(35367462-35367506)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (238-686)||(29622904-29623352)
chr7 (3-49)||(29622781-29622827)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (238-676)||(30662998-30663436)
chr2 (238-676)||(30671678-30672116)
chr2 (238-676)||(30626047-30626485)
[»] chr3 (3 HSPs)
chr3 (342-611)||(1153787-1154056)
chr3 (1-57)||(1154260-1154316)
chr3 (145-272)||(1154064-1154186)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (375-685)||(13564597-13564895)
chr8 (231-355)||(15294046-15294170)
chr8 (231-355)||(15474415-15474539)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 623; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 623; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 686
Target Start/End: Original strand, 10415225 - 10415911
Alignment:
Q  1 tcccaaagctatagatatctccctgtggtgatactggaacacctgttccgtactcttctcgaacaacaaaaacaacaacaatttaggaaaaatataacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10415225 tcccaaagctatagatatctccctgtggtgatactggaacacctgttccgtactcttctcgaacaacaacaataacaacaatttaggaaaaatataacat 10415324  T
Q  101 aggagtatacaata-tatatcaaattttaacacattgatcagaaaacattgagggtcatatctgatataaataacaataaattagcattgctaaatttct 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10415325 aggagtatacaataatatatcaaattttaacacattgatcagaaaacattgagggtcatatctgatataaataacaataaattagcattgctaaatttct 10415424  T
Q  200 taaaggtactaaccaaaaatggatataagttaagagctttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttact 299  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10415425 taagggtactaaccaaaaatggatataagttaagagctttaccagtaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttact 10415524  T
Q  300 tgaatgctctgcggctccaagaatgagcctagataagccaaagtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatca 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10415525 tgaatgctctgtggctccaagaatgagcctagctaagccaaagtctcccaagtgggctacaacgtcatcgtcaagaagaacgttgcttgacttaacatca 10415624  T
Q  400 cagtgaactacggcttgctctgtatcattgtgaagataatcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaa 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10415625 cagtgaactacggcttgctctgtatcattgtgaagataatcaagtgcatgagctagatcaagagcgatgtctaacctttgtgccaggctgagattatgaa 10415724  T
Q  500 ttccagacccttcgttatcgtgcagaatcttttccagactccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacact 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10415725 ttccagacccttcgttatcgtgcagaatcttttccagactccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacact 10415824  T
Q  600 tgaacaacaagttaggattttgacaagattacggtgcttcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaactctctgctgctcc 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10415825 tgaacaacaagttaggattttgacaagattacggtgcttcatctttcctaaagcattgcattcctccatgaaactctttgctgctcc 10415911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 231 - 686
Target Start/End: Original strand, 10420343 - 10420798
Alignment:
Q  231 aagagctttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttacttgaatgctctgcggctccaagaatgagccta 330  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || || || || ||| | |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  10420343 aagaactttaccaggaggaacatatcctatacttcccttgattgtggaagaattaacttgatctttacttgaatggtctctggttccaagaatgagccta 10420442  T
Q  331 gataagccaaagtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatcacagtgaactacggcttgctctgtatcattgt 430  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10420443 gctaagccaaagtctcccaagtgagctacaatgtcatcgtccagaagaacgttgctcggcttaatatcacagtgaactatggcttgctctgtaccattgt 10420542  T
Q  431 gaagataatcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaattccagacccttcgttatcgtgcagaatctt 530  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  10420543 gaagataattaagtgcatgagctacatcaagagcaatgtcaaccctttgtctgaggctgagattatgaattccagacccttctttatcgtgcagaagctt 10420642  T
Q  531 ttccagactccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgacaagatta 630  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  10420643 ttctagactccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaactcttcacccttataatcaacgcttgaacaacaagttaggatcttgacaaggttt 10420742  T
Q  631 cggtgcttcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaactctctgctgctcc 686  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || ||| ||  ||||||||| |||| ||||    
T  10420743 cggtgtttcatctttcctagagcttcgcgttctgctttgaaactctttgctcctcc 10420798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 231 - 686
Target Start/End: Original strand, 10409759 - 10410220
Alignment:
Q  231 aagagctttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttacttgaatgctctgcggctccaagaatgagccta 330  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||    
T  10409759 aagaactttaccgggaggaacatatcctatagttcccttaattgtagaggaaataacttgatctttacttgaatgttctgtagctccacgaattagccta 10409858  T
Q  331 gataagccaaagtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatcacagtgaactacggcttgctctgtatcattgt 430  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||| || |||||||  ||||| |  |||||  |||  ||||| ||  ||||||||| |||| |||    
T  10409859 gctaagccaaagtctcctaagtgagctacattgtcatcatcgagaagaacattgcttggtttaacgccactatgaaccaccacttgctctgcatcaatgt 10409958  T
Q  431 gaagataatcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaattccagaccc---ttcgttat---cgtgcag 524  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||   |||||||  || ||| |||| |   ||| ||||   | ||||     
T  10409959 gaagataatccaatgcatgagctacgttgagaacaatgtctaacctttgtgtgaaattgagattcagatttctagactcgtgttctttattaccatgcaa 10410058  T
Q  525 aatcttttccagactccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgaca 624  Q
    ||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  10410059 aaggttttccaaactcccattaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttaaca 10410158  T
Q  625 agattacggtgcttcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaactctctgctgctcc 686  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||| | |||||||    
T  10410159 agattccggtgcttcatgtttcccagagctttgcattccaccacgaaactctttactgctcc 10410220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 114 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 35411211 - 35410649
Alignment:
Q  114 atatatcaaattttaacacattgatcagaaaacattgagggtcatatctgatataaataacaataaattagcattgctaaatttcttaaaggtactaacc 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | || |||||||| ||| |||||     
T  35411211 atatatcaaattttaacacatagatcataaaacattgagggtcatatctgatataaataataataaatcagcactaccaattttcttaagggtgctaact 35411112  T
Q  214 aaaaatggatataagttaagagctttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttacttgaatgctctgcgg 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35411111 aaaaatggatataagataagagctttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaattgtagaaaaaataacttgatctttacttgaatgctctgtgg 35411012  T
Q  314 ctccaagaatgagcctagataagccaaagtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatcacagtgaactacggc 413  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  35411011 ttccaagaatgagcctagccaagccaaagtctcccaagtgggctacaaagtcatcgtcaagaagaacgttgctcggcttaagatcacagtgaactacagc 35410912  T
Q  414 ttgctctgtatcattgtgaagataatcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaattccagacccttcg 513  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  35410911 ttgctctgtctcattgtgaagataatcaagtgcatgagctacatcaagagcaatgtctaacctttgtgtgaggttgagattatgattttcagacccttcg 35410812  T
Q  514 ttatcgtgcagaatcttttccagactccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagtta 613  Q
    ||||| |||| || |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35410811 ttatcatgcaaaaacttttctagattcccattaggcattaactcaaaaacaatagccttgaactcttcaccattataatcaacacttgaacaacacgtta 35410712  T
Q  614 ggattttgacaagattacggtgcttcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaactct 676  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35410711 ggattttgacaagattacggtgcctcatctttcttaaagcattgcattccgccatgaaactct 35410649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 35386654 - 35385978
Alignment:
Q  1 tcccaaagctatagatatctccctgtggtgatactggaacacctgttccgtactcttctcgaacaacaaaaacaacaacaatttaggaaaaatataacat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||      |||| ||||||||||||||||        
T  35386654 tcccaaagctgtagatatctccctttggtgatactggaacaccttctccgtactcttttcaaacaacaa------caactatttaggaaaaatatagt-- 35386563  T
Q  101 aggagtatacaatatatatcaaattttaacacattgatcagaaaacattgagggtcatatctgata-taaataacaataaattagcattgctaaatttct 199  Q
     | |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||| | |  |||| | |  | ||||||||||||    
T  35386562 -gaagtatacattatatattaaattttaacacatcgatcataaaacatggaggctaatatttgataataagttatgataa-tgattactgctaaatttct 35386465  T
Q  200 taaaggtactaaccaaaaatggatataagttaagagctttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttact 299  Q
    |||||||| |||| |  |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35386464 taaaggtaataacaagtatgggatataaattaagaactttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaataacttgatctttact 35386365  T
Q  300 tgaatgctctgcggctccaagaatgagcctagataagccaaagtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatca 399  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  35386364 tgaatgctctgtggttccaagaatgatcctagccaagccaaagtctcccaagtgggctacaaagtcatcgtcaagaagaacgttgcttggcttaagatca 35386265  T
Q  400 cagtgaactacggcttgctctgtatcattgtgaagataatcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaa 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  35386264 cagtgaactacggcttgctctgtatcattgtgaagataatcaagtgcatgagctacatcaagagcaatgtctaacctttatgtgaggttgagattatgat 35386165  T
Q  500 ttccagacccttcgttatcgtgcagaatcttttccagactccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacact 599  Q
    || |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35386164 tttcagacccttcattattgtgcaaaaacttttcaagactctcatttgacatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacccttataatcaacact 35386065  T
Q  600 tgaacaacaagttaggattttgacaagattacggtgcttcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaactctctgctgctcc 686  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35386064 tgaacaacaggttaggaccttgacaagattctggtgcttcatctttcccagagcattgcattctgccatgaaactctttgctgctcc 35385978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 231 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 35755235 - 35754792
Alignment:
Q  231 aagagctttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttacttgaatgctctgcggctccaagaatgagccta 330  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||    
T  35755235 aagaactttaccaggaggaacatatcctatagttcccttaattgtagaggaattaacttgatctttacttgaatgttctgtagctccatgaatgagccta 35755136  T
Q  331 gataagccaaagtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatcacagtgaactacggcttgctctgtatcattgt 430  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35755135 gctaggccaaagtctcccaagtgggctacaatttcatcatcaagaagaacattgcttggcttaatatcacagtgaactacgacttgttctgtatcattgt 35755036  T
Q  431 gaagataatcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaattccagacccttcgttatcgtgcagaatctt 530  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||  | |||    
T  35755035 gaagataatccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtctaacctttgtgtgaggttgagattaaaatttcctgacccttcattatcgtgcaacaactt 35754936  T
Q  531 ttccagactccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgacaagatta 630  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  35754935 ttcaagactcccatttgacatgaactcaaaaacaatagctttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaaaatcttgacaagattc 35754836  T
Q  631 cggtgcttcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaact 674  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  35754835 cggtgcttcatctttcccaatgcattgcattccgctatgaaact 35754792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 231 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 35367281 - 35366826
Alignment:
Q  231 aagagctttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttacttgaatgctctgcggctccaagaatgagccta 330  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||| | |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  35367281 aagaactttaccaggaggaacatatcctatagttcccttaattgtggaagaattaacttgatctttacttgaatggtctctggttccaagaatgagccta 35367182  T
Q  331 gataagccaaagtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatcacagtgaactacggcttgctctgtatcattgt 430  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  35367181 gctaagccaaagtctcccaagtgggctacagtgtcatcgtccagaagaacgttgctcggcttaatatcacagtgaactatggatttctctgtaccattgt 35367082  T
Q  431 gaagataatcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaattccagacccttcgttatcgtgcagaatctt 530  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  35367081 gaagataatcgagtgcatgagctacatcaagagcaatgtcaactctgtgtctgaggctgagattatgatttccagacccttcgttatcatgcagaagctt 35366982  T
Q  531 ttccagactccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgacaagatta 630  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  35366981 ttctagacttcccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaactcttcacccttataatcaatgcttgaacaacaagttaggatcttgacaagattt 35366882  T
Q  631 cggtgcttcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaactctctgctgctcc 686  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  35366881 cggtgcttcatctttcctagagcttcacattctgctttgaaactctttgctgctcc 35366826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 231 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 35376833 - 35376372
Alignment:
Q  231 aagagctttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttacttgaatgctctgcggctccaagaatgagccta 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||  |||||| | | || ||||    
T  35376833 aagaactttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaattgtggaggaaataacttgatttttacttgaatattctgtagctccatggaggaaccta 35376734  T
Q  331 gataagccaaagtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatcacagtgaactacggcttgctctgtatcattgt 430  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35376733 gctaagccaaagtctcctaagtgggccacaccgtcatcatcaagaagaacattgcttggcttaacatcacaatgaactacaacttgctctgtatcattgt 35376634  T
Q  431 gaagataatcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaattccagaccc------ttcgttatcgtgcag 524  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||   |||||||  || ||| |||| |      ||||||| | ||||     
T  35376633 gaagataatccaatgcatgagctacgtcgagagcaatgtctaacctttgtgtgaaattgagattcagatttctagactcatgatcttcgttaccatgcaa 35376534  T
Q  525 aatcttttccagactccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgaca 624  Q
     |  ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35376533 caggttttccagattcccactaggcatgaactcaaaaacaatggccttaaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgaca 35376434  T
Q  625 agattacggtgcttcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaactctctgctgctcc 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  35376433 agattacggtgcttcatctttcctaaagcattgcattccgcaatgaaactctttgctgctcc 35376372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 231 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 35424092 - 35423631
Alignment:
Q  231 aagagctttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttacttgaatgctctgcggctccaagaatgagccta 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||  |||||| | | || ||||    
T  35424092 aagaactttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaattgtggaggaaataacttgatttttacttgaatattctgtagctccatggaggaaccta 35423993  T
Q  331 gataagccaaagtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatcacagtgaactacggcttgctctgtatcattgt 430  Q
    | || |||||||||||| |||||||  ||| | ||||| ||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35423992 gctacgccaaagtctcctaagtgggtcacaccgtcatcatcaagaagaacattgcttggtttaacatcacaatgaactacaacttgctctgtatcattgt 35423893  T
Q  431 gaagataatcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaattccagaccc------ttcgttatcgtgcag 524  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||   |||||||  || ||| |||| |      ||||||| | ||||     
T  35423892 gaagataatccaatgcatgagctacgtcgagagcaatgtctaacctttgtgtgaaattgagattcagatttctagactcatgatcttcgttaccatgcaa 35423793  T
Q  525 aatcttttccagactccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgaca 624  Q
     |  ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  35423792 caggttttctagattcccactaggcatgaactcaaaaacaatggccttaaaatcttcaccattataatcaacacttgaacagcaagttaggattttcaca 35423693  T
Q  625 agattacggtgcttcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaactctctgctgctcc 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35423692 agattacggtgcttcatctttcctaaagcattgcattccaccatgaaactctttgctgctcc 35423631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 537 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 35370362 - 35370210
Alignment:
Q  537 actccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaa-tcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgacaagattacggtg 635  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35370362 actcccattgggcatgaactcaaaaacaatagccttggaactcttcaccattataatcaacacttgagcaacacgttaggattttgacaagattacggtg 35370263  T
Q  636 cttcatctttcctaaagcattgc--attccgccatgaaactctctgctgctcc 686  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  35370262 cctcatctttcctaaagcattgcatattccgcaatgaaactctttgctgctcc 35370210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 535 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 35437130 - 35437049
Alignment:
Q  535 agactccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttagga 616  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  35437130 agactccccataggcatgaattcaaaaactatagccttgaaaacttcaccattataatcaatacttgaacagaaagttagga 35437049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 35411300 - 35411207
Alignment:
Q  1 tcccaaagctatagatatctccctgtggtgatactggaacacctgttccgtactcttctcgaacaacaaaaacaacaacaatttaggaaaaatata 96  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  35411300 tcccaaagctgtagatatctccccgtggtgatactggaacaccttctccgtactcttttcaaacaacaaca--aacaactatttaggaaaaatata 35411207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 35371142 - 35371086
Alignment:
Q  1 tcccaaagctatagatatctccctgtggtgatactggaacacctgttccgtactctt 57  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35371142 tcccaaagctatagatatctccatgtggtgatactggaacacctgtcccgtactctt 35371086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 35367506 - 35367462
Alignment:
Q  1 tcccaaagctatagatatctccctgtggtgatactggaacacctg 45  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35367506 tcccaaagctgtaaacatctccctgtggagatactggaacacctg 35367462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 238 - 686
Target Start/End: Original strand, 29622904 - 29623352
Alignment:
Q  238 ttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttacttgaatgctctgcggctccaagaatgagcctagataagc 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||| | | |||||| ||||||||||| | || || ||||  ||||||||||| ||| |    
T  29622904 ttaccaggaggaacatatcctatagttcccttaattgtggaagaagtaatttgatcattacttgaatggtttgaggatccattaatgagcctagctaatc 29623003  T
Q  338 caaagtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatcacagtgaactacggcttgctctgtatcattgtgaagata 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29623004 caaagtctcccaagtgggctacaatgtcatcatcaagaagaacattgcttggcttaacatcacagtgaactacagcttgttctatatcattgtgaagata 29623103  T
Q  438 atcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaattccagacccttcgttatcgtgcagaatcttttccaga 537  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||    
T  29623104 atccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtctatcctttgtgtgaggttgagattatggcttccagatccttcattatcgtgcaacatcttttctaga 29623203  T
Q  538 ctccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgacaagattacggtgct 637  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  29623204 ctcatattaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttataatcaacacttgaacaacaagttaggatcttgacaagattccggtgtt 29623303  T
Q  638 tcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaactctctgctgctcc 686  Q
    |||||||||||| ||  || ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  29623304 tcatctttcctagagatttacattctgcaatgaaactctttgctgctcc 29623352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 49
Target Start/End: Original strand, 29622781 - 29622827
Alignment:
Q  3 ccaaagctatagatatctccctgtggtgatactggaacacctgttcc 49  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29622781 ccaaagctgtagatatctccctgtggtgatactggaacacctgttcc 29622827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 238 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 30663436 - 30662998
Alignment:
Q  238 ttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttacttgaatgctctgcggctccaagaatgagcctagataagc 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||| | |||||||||  ||||||||   ||| ||||||| |||| | ||| |  || |    
T  30663436 ttaccaggaggaacatatcctatagttcccttaattgtggacgaattaacttgatctacacttgaatatgctgtggctccatgaattaaccttgccaatc 30663337  T
Q  338 caaagtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatcacagtgaactacggcttgctctgtatcattgtgaagata 437  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||  ||| | |  || |||||||||||||||||  | | ||| ||| |||||||||||||    
T  30663336 caaagtctcccaagtgggctaccatgtcatcatcaagaagaacattgtttggtttcacatcacagtgaactacaacattctcagtaccattgtgaagata 30663237  T
Q  438 atcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaattccagacccttcgttatcgtgcagaatcttttccaga 537  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  30663236 atccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtcaaccctttgtgtgaggctgagattatgaattccagactcttcgttatcgtgcagaagcttttctaga 30663137  T
Q  538 ctccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgacaagattacggtgct 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||    
T  30663136 ctccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaactcgtcacccttataatctacgcttgaacaacatgtaagaatcttgacaagatttcggtgct 30663037  T
Q  638 tcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaactct 676  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  30663036 tcatctttcccaaagctttgcattcagctgtgaaactct 30662998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 238 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 30672116 - 30671678
Alignment:
Q  238 ttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttacttgaatgctctgcggctccaagaatgagcctagataagc 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||| | |||||||||  ||||||||   ||| ||||||| |||| | ||| |  || |    
T  30672116 ttaccaggaggaacatatcctatagttcccttaattgtggacgaattaacttgatctacacttgaatatgctgtggctccatgaattaaccttgccaatc 30672017  T
Q  338 caaagtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatcacagtgaactacggcttgctctgtatcattgtgaagata 437  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||  ||| | |  || |||||||||||||||||  | | ||| ||| |||||||||||||    
T  30672016 caaagtctcccaagtgggctaccatgtcatcatcaagaagaacattgtttggtttcacatcacagtgaactacaacattctcagtaccattgtgaagata 30671917  T
Q  438 atcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaattccagacccttcgttatcgtgcagaatcttttccaga 537  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  30671916 atccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtcaaccctttgtgtgaggctgagattatgaattccagactcttcgttatcgtgcagaagcttttctaga 30671817  T
Q  538 ctccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgacaagattacggtgct 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||    
T  30671816 ctccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaactcgtcacccttataatctacgcttgaacaacatgtaagaatcttgacaagatttcggtgct 30671717  T
Q  638 tcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaactct 676  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  30671716 tcatctttcccaaagctttgcattcagctgtgaaactct 30671678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 238 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 30626485 - 30626047
Alignment:
Q  238 ttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttacttgaatgctctgcggctccaagaatgagcctagataagc 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||| | |||||||||  ||||||||   ||| ||||||| |||| | ||| |  || |    
T  30626485 ttaccaggaggaacatatcctatagttcccttaattgtggacgaattaacttgatctacacttgaatatgctgtggctccatgaattaaccttgccaatc 30626386  T
Q  338 caaagtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatcacagtgaactacggcttgctctgtatcattgtgaagata 437  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||  ||| | |  || |||||||| ||||||||  | | ||| ||| |||||||||||||    
T  30626385 caaagtctcccaagtgggctaccatgtcatcatcaagaagaacattgtttggtttcacatcacattgaactacaacattctcagtaccattgtgaagata 30626286  T
Q  438 atcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaattccagacccttcgttatcgtgcagaatcttttccaga 537  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  30626285 atccaatgcatgagctacatcaagagcaatgtcaaccctttgtgtgaggctgagattatgaattccagactcttcgttatcgtgcagaagcttttctaga 30626186  T
Q  538 ctccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgacaagattacggtgct 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||    
T  30626185 ctccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaactcgtcacccttataatctattcttgaacaacatgtaagaatcttgacaagatttcggtgct 30626086  T
Q  638 tcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaactct 676  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  30626085 tcatctttcccaaagctttgcattcagctgtgaaactct 30626047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 342 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 1154056 - 1153787
Alignment:
Q  342 gtctcccaagtgggctacaacatcatcgtcaagaagaatgttgctcgacttaacatcacagtgaactacggcttgctctgtatcattgtgaagataatca 441  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1154056 gtctcccaagtgggctacattgtcatcatcaagaagaacattgcttggcttaatatcacagtgaactgtaacttgctttgtatcattgtgaagaaaatca 1153957  T
Q  442 agtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaacctttgtgtgaggctgagattatgaattccagacccttcgttatcgtgcagaatcttttccagactcc 541  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||| ||||||  ||||||| ||| || ||||||||||  |||| ||||  |||||||| |||||||    
T  1153956 agtgcatgagctatatcaagagcaaaatctaccctttttgtgagcttgagattgtgattttcagacccttcaatatcatgcaacatcttttctagactcc 1153857  T
Q  542 ccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagt 611  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||||    
T  1153856 cgttaggcatgaactcaaaaacaatagccttgaaatcttcacctttgcaatcaatacttgagcaacaagt 1153787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1154316 - 1154260
Alignment:
Q  1 tcccaaagctatagatatctccctgtggtgatactggaacacctgttccgtactctt 57  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154316 tcccaaagctgtagatatctccctgtggtgatactggaacacctgttccgtactctt 1154260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1154186 - 1154064
Alignment:
Q  145 acattgagggtcatatctgatataaataacaataaattagcattgctaaatttcttaaaggtactaaccaaaaatggatataagttaagagctttaccag 244  Q
    ||||||| ||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| || |||| |  |||||||     |||||| |||||||||    
T  1154186 acattgatggtcataactaatttaaataataataaattagcaatgccaaatttctgaaagatagtaactattaatggat-----ttaagaactttaccag 1154092  T
Q  245 gaggaatatatcctatagttcctttaat 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1154091 gaggaatatatcctattgttcctttaat 1154064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 375 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 13564895 - 13564597
Alignment:
Q  375 aagaatgttgctcgacttaacatcacagtgaactacggcttgctctgtatcattgtgaagataatcaagtgcatgagctacatcaagagcgatgtctaac 474  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||            |||| | |    
T  13564895 aagaacgttgctcggcttaacatcacaatgacctaaggcttgctctacatcattgtgaagataatccaatgcataagcta------------tgtccacc 13564808  T
Q  475 ctttgtgtgaggctgagattatgaattccagacccttcgttatcgtgcagaatcttttccagactccccttaggcatgaactcaaaaacaatagccttga 574  Q
    ||||| |  | |||||||| |||| || |||  |||||||||| |||||  |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13564807 ctttgagaaaagctgagataatgattttcagttccttcgttattgtgcaacatcttttctagactaccattagacatgaactcaaaaacaatagccttga 13564708  T
Q  575 aatcttcaccattataatcaacacttgaacaacaagttaggattttgacaagattacggtgcttcatctttcctaaagcattgcattccgccatgaaact 674  Q
    |||| ||||| |||| ||||| |||||||||  |||  || || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||    
T  13564707 aatcgtcacccttattatcaatacttgaacattaaggaagaatcttaacacgatttcggtgcttcatctttcctaaagctttgcattcagccgtaaaact 13564608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 231 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15294170 - 15294046
Alignment:
Q  231 aagagctttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttacttgaatgctctgcggctccaagaatgagccta 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  15294170 aagaactttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatcttagaggcaataactttatctttacttgaatgctctatggttccatgaatgagccta 15294071  T
Q  331 gataagccaaagtctcccaagtggg 355  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  15294070 gccaagccaaagtctcccaagtggg 15294046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 231 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15474539 - 15474415
Alignment:
Q  231 aagagctttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatagtagaggaaatgacttgatctttacttgaatgctctgcggctccaagaatgagccta 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  15474539 aagaactttaccaggaggaatatatcctatagttcctttaatcttagaggcaataactttatctttacttgaatgctctatggttccatgaatgagccta 15474440  T
Q  331 gataagccaaagtctcccaagtggg 355  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  15474439 gccaagccaaagtctcccaagtggg 15474415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University