View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20070_low_29 (Length: 267)

Name: NF20070_low_29
Description: NF20070
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20070_low_29
NF20070_low_29
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-256)||(15587-15855)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (1-256)||(44469643-44469911)
chr1 (1-257)||(29352405-29352674)
chr1 (1-256)||(37019028-37019296)
chr1 (1-256)||(30909661-30909929)
chr1 (1-256)||(9710750-9711018)
chr1 (1-256)||(5081996-5082266)
chr1 (1-256)||(13633504-13633773)
chr1 (1-256)||(12643381-12643646)
chr1 (1-256)||(20353567-20353835)
chr1 (1-256)||(6558060-6558342)
chr1 (1-232)||(3944172-3944416)
chr1 (1-232)||(3993474-3993718)
chr1 (1-232)||(38771828-38772072)
chr1 (1-256)||(51666298-51666566)
chr1 (1-256)||(8459130-8459398)
chr1 (1-256)||(7966155-7966430)
chr1 (1-238)||(25039713-25039963)
chr1 (1-256)||(36072535-36072813)
chr1 (1-256)||(19495212-19495493)
chr1 (1-205)||(13177758-13177981)
chr1 (1-256)||(1655712-1655990)
chr1 (74-256)||(15051053-15051248)
chr1 (120-256)||(46886148-46886288)
chr1 (1-205)||(38690137-38690349)
chr1 (1-121)||(50113642-50113762)
chr1 (120-256)||(50113480-50113620)
chr1 (3-256)||(5141504-5141769)
chr1 (1-203)||(33168133-33168354)
chr1 (130-255)||(94571-94700)
chr1 (130-252)||(31780144-31780270)
chr1 (130-256)||(52805330-52805460)
chr1 (130-255)||(16281870-16281999)
chr1 (130-255)||(22527465-22527594)
chr1 (120-256)||(4518176-4518316)
chr1 (120-256)||(46979018-46979158)
chr1 (129-255)||(19521770-19521900)
chr1 (130-255)||(470840-470969)
chr1 (1-112)||(4518026-4518135)
chr1 (1-112)||(46978866-46978977)
chr1 (134-255)||(21144405-21144530)
chr1 (133-255)||(50617376-50617503)
chr1 (129-256)||(22345818-22345944)
chr1 (122-168)||(1179878-1179924)
chr1 (224-256)||(23359217-23359249)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (1-256)||(39630-39898)
chr8 (1-256)||(23924138-23924406)
chr8 (1-255)||(35962481-35962748)
chr8 (1-232)||(30301332-30301576)
chr8 (1-232)||(7344188-7344432)
chr8 (1-256)||(43679569-43679837)
chr8 (1-232)||(8419602-8419846)
chr8 (1-232)||(32375849-32376093)
chr8 (48-256)||(20548938-20549159)
chr8 (1-205)||(22588074-22588287)
chr8 (29-256)||(39751233-39751473)
chr8 (1-121)||(43376911-43377031)
chr8 (1-256)||(4867425-4867703)
chr8 (1-121)||(2124515-2124635)
chr8 (1-205)||(7171949-7172172)
chr8 (1-121)||(31959679-31959799)
chr8 (3-203)||(22661208-22661417)
chr8 (120-256)||(31959821-31959961)
chr8 (1-105)||(41744160-41744264)
chr8 (130-255)||(34367085-34367214)
chr8 (120-256)||(43377053-43377193)
chr8 (135-256)||(41744037-41744162)
chr8 (131-251)||(41239026-41239150)
chr8 (120-256)||(2124353-2124493)
chr8 (14-203)||(30972519-30972717)
chr8 (162-256)||(23578607-23578705)
chr8 (1-75)||(31281179-31281253)
chr8 (1-37)||(39751659-39751695)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (1-256)||(25890167-25890435)
chr5 (1-256)||(34079763-34080031)
chr5 (1-256)||(13563814-13564082)
chr5 (1-256)||(27863576-27863844)
chr5 (1-256)||(37814755-37815023)
chr5 (12-256)||(7017684-7017941)
chr5 (1-256)||(7796750-7797018)
chr5 (1-256)||(11029181-11029448)
chr5 (1-240)||(28882177-28882429)
chr5 (1-256)||(38855887-38856156)
chr5 (1-256)||(33994781-33995049)
chr5 (1-256)||(24053326-24053604)
chr5 (1-256)||(24050199-24050479)
chr5 (120-256)||(1039565-1039705)
chr5 (127-256)||(34122697-34122830)
chr5 (1-121)||(14280610-14280730)
chr5 (1-121)||(34122859-34122979)
chr5 (1-93)||(28387887-28387979)
chr5 (1-113)||(1039424-1039535)
chr5 (130-255)||(7762013-7762142)
chr5 (130-255)||(38407320-38407449)
chr5 (130-255)||(41799539-41799667)
chr5 (1-121)||(4196837-4196955)
chr5 (1-121)||(25877953-25878071)
chr5 (8-203)||(6267704-6267908)
chr5 (1-112)||(30352760-30352871)
chr5 (120-256)||(25877793-25877931)
chr5 (152-256)||(28388311-28388419)
chr5 (1-63)||(43179497-43179559)
chr5 (120-191)||(30352662-30352733)
chr5 (202-256)||(4196727-4196781)
chr5 (126-203)||(43179666-43179743)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (1-256)||(9426778-9427046)
chr3 (1-256)||(13743440-13743707)
chr3 (1-256)||(48246584-48246852)
chr3 (1-256)||(6744958-6745226)
chr3 (1-256)||(2857614-2857882)
chr3 (1-232)||(30943388-30943632)
chr3 (1-232)||(3952846-3953090)
chr3 (1-232)||(8156706-8156950)
chr3 (1-256)||(21951972-21952240)
chr3 (5-256)||(50957315-50957593)
chr3 (63-256)||(7841268-7841474)
chr3 (1-196)||(2743678-2743896)
chr3 (120-256)||(4002265-4002405)
chr3 (1-256)||(67046-67324)
chr3 (1-121)||(36813172-36813292)
chr3 (1-121)||(6489664-6489784)
chr3 (1-121)||(14402637-14402757)
chr3 (1-121)||(46989847-46989967)
chr3 (1-121)||(4002123-4002243)
chr3 (115-256)||(36813010-36813155)
chr3 (130-255)||(600314-600443)
chr3 (130-255)||(36134053-36134182)
chr3 (130-255)||(50213631-50213760)
chr3 (120-256)||(46989685-46989825)
chr3 (130-255)||(42166182-42166311)
chr3 (130-255)||(2271528-2271658)
chr3 (130-255)||(47070642-47070771)
chr3 (130-255)||(16646944-16647072)
chr3 (132-256)||(6489501-6489629)
chr3 (132-255)||(9473721-9473848)
chr3 (135-255)||(52387973-52388097)
chr3 (171-256)||(14402808-14402897)
chr3 (215-256)||(2743570-2743611)
chr3 (215-255)||(4005018-4005058)
chr3 (124-202)||(7314607-7314685)
chr3 (120-157)||(14402779-14402816)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (1-256)||(24753656-24753924)
chr2 (1-256)||(7267076-7267344)
chr2 (7-256)||(28342695-28342957)
chr2 (1-248)||(39798072-39798331)
chr2 (1-256)||(41181583-41181851)
chr2 (1-232)||(41564122-41564366)
chr2 (1-256)||(3795509-3795791)
chr2 (1-232)||(5351363-5351607)
chr2 (1-232)||(10620171-10620415)
chr2 (1-256)||(45479453-45479721)
chr2 (1-232)||(209182-209426)
chr2 (35-256)||(38950232-38950466)
chr2 (1-256)||(43943862-43944142)
chr2 (1-256)||(12905692-12905970)
chr2 (1-121)||(1096904-1097024)
chr2 (1-256)||(41004699-41004977)
chr2 (1-121)||(24601974-24602092)
chr2 (1-121)||(24612022-24612140)
chr2 (68-232)||(18000430-18000607)
chr2 (120-256)||(1096742-1096882)
chr2 (1-121)||(9659672-9659794)
chr2 (130-255)||(29398083-29398208)
chr2 (1-121)||(439442-439562)
chr2 (1-121)||(1150663-1150783)
chr2 (130-255)||(39950941-39951070)
chr2 (128-256)||(439592-439722)
chr2 (120-256)||(41052794-41052934)
chr2 (1-121)||(81882-82002)
chr2 (130-255)||(10825392-10825521)
chr2 (130-255)||(32952904-32953033)
chr2 (120-256)||(9659816-9659956)
chr2 (120-256)||(24601812-24601952)
chr2 (120-256)||(24612162-24612302)
chr2 (135-256)||(25184606-25184731)
chr2 (1-121)||(41052956-41053074)
chr2 (120-255)||(82024-82162)
chr2 (126-212)||(3206968-3207054)
chr2 (1-38)||(38949818-38949855)
chr2 (23-116)||(25613528-25613621)
chr2 (122-202)||(25613433-25613513)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (1-256)||(18109425-18109694)
chr7 (1-256)||(47742621-47742889)
chr7 (1-256)||(15069982-15070251)
chr7 (1-256)||(603952-604220)
chr7 (1-256)||(42503470-42503739)
chr7 (1-232)||(30790638-30790882)
chr7 (1-256)||(34622671-34622939)
chr7 (1-232)||(45767492-45767736)
chr7 (1-232)||(43619877-43620121)
chr7 (1-255)||(10705421-10705698)
chr7 (1-246)||(12111398-12111664)
chr7 (1-121)||(19044627-19044747)
chr7 (1-121)||(20709889-20710009)
chr7 (122-256)||(40928715-40928853)
chr7 (1-105)||(29592839-29592943)
chr7 (1-121)||(47064926-47065046)
chr7 (130-255)||(5538018-5538147)
chr7 (130-255)||(17838405-17838534)
chr7 (135-256)||(29592716-29592841)
chr7 (120-256)||(19044465-19044605)
chr7 (120-256)||(20710031-20710171)
chr7 (132-255)||(34742168-34742294)
chr7 (130-255)||(13323485-13323614)
chr7 (130-205)||(10522285-10522360)
chr7 (127-200)||(47065075-47065148)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (1-256)||(3407871-3408140)
chr4 (1-256)||(10423040-10423307)
chr4 (1-232)||(49564039-49564283)
chr4 (1-256)||(19069359-19069641)
chr4 (1-205)||(10374267-10374480)
chr4 (1-256)||(38460598-38460866)
chr4 (25-251)||(50904819-50905058)
chr4 (1-121)||(37394835-37394955)
chr4 (1-121)||(44050711-44050831)
chr4 (1-256)||(4774236-4774514)
chr4 (1-256)||(18578795-18579073)
chr4 (1-199)||(24415392-24415609)
chr4 (120-256)||(37394977-37395117)
chr4 (128-256)||(15995894-15996026)
chr4 (130-255)||(51492245-51492374)
chr4 (120-256)||(44050853-44050993)
chr4 (130-255)||(44674311-44674440)
chr4 (35-256)||(51642179-51642423)
chr4 (1-106)||(11506726-11506831)
chr4 (1-105)||(6186995-6187099)
chr4 (130-255)||(50278593-50278722)
chr4 (130-255)||(37016072-37016201)
chr4 (1-112)||(30043055-30043166)
chr4 (122-203)||(6186878-6186959)
chr4 (122-203)||(30043194-30043275)
chr4 (1-116)||(31598816-31598931)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (1-256)||(4958-5227)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (1-256)||(29286375-29286643)
chr6 (1-256)||(31150697-31150965)
chr6 (1-256)||(25140737-25141006)
chr6 (1-232)||(1608491-1608735)
chr6 (1-256)||(13382800-13383082)
chr6 (1-256)||(18609865-18610133)
chr6 (1-256)||(23959063-23959331)
chr6 (1-256)||(29667455-29667733)
chr6 (74-256)||(18351348-18351543)
chr6 (1-121)||(2051362-2051482)
chr6 (1-121)||(7537521-7537641)
chr6 (1-203)||(34230709-34230921)
chr6 (120-256)||(7537359-7537499)
chr6 (1-116)||(28362349-28362464)
chr6 (130-255)||(31771510-31771639)
chr6 (130-255)||(3502434-3502563)
chr6 (132-256)||(11840022-11840150)
chr6 (1-180)||(2259338-2259525)
chr6 (120-256)||(26702472-26702611)
chr6 (126-256)||(2051200-2051334)
chr6 (120-256)||(28362491-28362631)
chr6 (1-203)||(20448420-20448630)
chr6 (116-203)||(19129204-19129291)
chr6 (122-203)||(20439767-20439848)
chr6 (178-256)||(2258458-2258540)
chr6 (159-203)||(8304667-8304711)
chr6 (122-203)||(20436059-20436140)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (39-256)||(8372-8602)
[»] scaffold0201 (2 HSPs)
scaffold0201 (120-256)||(22574-22713)
scaffold0201 (1-121)||(22735-22855)
[»] scaffold0219 (2 HSPs)
scaffold0219 (15-121)||(19743-19849)
scaffold0219 (120-256)||(19871-20011)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (36-205)||(21865-22053)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (130-251)||(12581-12706)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (130-255)||(236006-236135)
[»] scaffold0794 (1 HSPs)
scaffold0794 (1-106)||(1383-1488)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (1-83)||(10896-10978)
scaffold0169 (209-256)||(1537-1584)


Alignment Details
Target: scaffold0116 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 15587 - 15855
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587 tttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 15686  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15687 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaactaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 15786  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15787 ttgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 15855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 44469643 - 44469911
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44469643 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 44469742  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44469743 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 44469842  T
Q  192 ttgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44469843 ttgtaaaagatattgtacttatcttgattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 44469911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29352674 - 29352405
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29352674 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 29352575  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  29352574 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaa 29352475  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttgc 257  Q
    |||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29352474 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttgc 29352405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 37019028 - 37019296
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37019028 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgt 37019127  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37019128 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaacattttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttaatttaattatggacaa 37019227  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37019228 ttgtaaaagatattgtatttatcttgtttatatccgagtttcaatgttgtatgaattattttacctttg 37019296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 30909661 - 30909929
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30909661 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgtttcatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 30909760  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||  ||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  30909761 gtaatgagtactttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaacgtcggtttaatttaattatgaacaa 30909860  T
Q  192 ttgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    |||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30909861 ttgtaaaagatattgtacttatgttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 30909929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9711018 - 9710750
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9711018 tttatgtttcggaatatggtgaaagataatatattatatatgtatgttctttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 9710919  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9710918 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaacattttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcagtttgatttaattatggacaa 9710819  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9710818 ttgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtcctagtttcaatgttgtatgaattattttacctttg 9710750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 5081996 - 5082266
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5081996 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaaatatggatttaatttaatgatgt 5082095  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||| ||||  ||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5082096 gtaaggagtactttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 5082195  T
Q  192 ttgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtc--cgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    |||||||  |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5082196 ttgtaaaagatattgtacttatctttattatgtctgagagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 5082266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 13633504 - 13633773
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13633504 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgtttgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttattgatgt 13633603  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatggaca 190  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13633604 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggttaaatttaattatgaaca 13633703  T
Q  191 attgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13633704 attgtaaaagatattgtatttatcttgattatgaccgagtttcaatattgtatgaattatttagcctttg 13633773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12643646 - 12643381
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643646 tttatgtttcagaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 12643547  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg------taatgttttga---tgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||| ||||      |||| | | ||   | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643546 gtaatgagttgtttaattatggacacttaat-tatagacacttaatt--aaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 12643450  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12643449 ttgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtctgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 12643381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 20353567 - 20353835
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353567 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 20353666  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
     |||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20353667 ataatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 20353766  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  20353767 ttgtaaaagatattgtatttgtcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattatattacctttg 20353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6558342 - 6558060
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6558342 tttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 6558243  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgt--------------tttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaat 177  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6558242 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgagtggtttaatttgatgaatttcaaacatttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaat 6558143  T
Q  178 ttaattatggacaattgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6558142 ttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 6558060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3944416 - 3944172
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944416 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 3944317  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3944316 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaa 3944217  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3944216 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 3944172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 3993474 - 3993718
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3993474 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 3993573  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3993574 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaa 3993673  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3993674 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 3993718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38772072 - 38771828
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38772072 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 38771973  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38771972 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 38771873  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    ||||||| |||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38771872 ttgtaaaggatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 38771828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 51666298 - 51666566
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51666298 tttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgt 51666397  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| |||||  |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51666398 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaactttttgatgaatttcaaacttttatgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 51666497  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||| ||||    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51666498 ttgtaaaatatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 51666566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8459398 - 8459130
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8459398 tttatgtttcaaaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgt 8459299  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg---------taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||| ||||         ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8459298 gtaatgagttgtttaattatggacactttttaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 8459199  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8459198 ttgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccaagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 8459130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7966430 - 7966155
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7966430 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattacatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 7966331  T
Q  101 ------gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattat 185  Q
          |||||| ||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7966330 gtaaatgtaatgtgttgtttaattatggacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattat 7966231  T
Q  186 ggacaattgt-aaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||| |||||||||| |||    |||||||||| | |||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  7966230 ggacaattgtaaaaagatattgtattttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcctttg 7966155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 25039713 - 25039963
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25039713 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatgtgtatgttcgttccatatacaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 25039812  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||| ||||||||         ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  25039813 gtaatgtgttgtttatgcatggacactatgtaacgatttgatgaattttaaacttttgtgtattttgaaccaaatatcagtttgatttaattatggacaa 25039912  T
Q  192 ttgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgta 238  Q
    |||||||||||||| |||    |||||||||| | |||||| |||||||||    
T  25039913 ttgtaaaagatattgtattttacttgtttatgactgagtttaaatgttgta 25039963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36072813 - 36072535
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36072813 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgt 36072714  T
Q  101 gtaatgag----------ttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    ||||||||          |||||||         ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36072713 gtaatgagttgtaatatgttgtttaatcatggacactatctaatgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaa 36072614  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||    |||||||||| | |||||| | |||||||| | |||| |||||||||    
T  36072613 ttatgaacaattgtaaaagatattgtattttacttgtttatgactgagtttaactgttgtataagttatattgcctttg 36072535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19495493 - 19495212
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19495493 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 19495394  T
Q  101 gtaatga----------gttgtttaactatgta----atgt--------tttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatt 178  Q
    |||||||          ||||||||| |||| |    ||||        ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| |||    
T  19495393 gtaatgacttgtaatgtgttgtttaattatggacactatgtaacacgcgtttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatt 19495294  T
Q  179 taattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  19495293 taattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttatttatgactgagtttaaatgttgtatgaattatattacctttg 19495212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 13177758 - 13177981
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13177758 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcattccatatgcaattgcattgaaagtaagtagggatttaatttaataatgt 13177857  T
Q  101 gtaatga----------gttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    |||||||          ||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13177858 gtaatgagttgtaatgtgttgtttaactatggacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaa 13177957  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13177958 ttatggacaattgtaaaagatatt 13177981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 1655712 - 1655990
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1655712 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaatgatttaatttaatgatgt 1655811  T
Q  101 gtaatga----------gttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    |||||||          ||||||||         ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  1655812 gtaatgagttgtaatgtgttgtttatgcatggatactatgtaacgatttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtccgtttgatttaa 1655911  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| |  | ||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  1655912 ttatggacaattgtaaaagatattgtattttacttgtttatgactaaatttaaatgttgtataagttatattgcctttg 1655990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Original strand, 15051053 - 15051248
Alignment:
Q  74 gtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaactatg---------taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaa 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15051053 gtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaa 15051152  T
Q  165 atgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15051153 atgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 15051248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 46886148 - 46886288
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  46886148 tgtaatgtttcgatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtt 46886247  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46886248 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 46886288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38690349 - 38690137
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  38690349 tttatgtttcaaaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgtttgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagta-ggatttaatataatgatgt 38690251  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||| ||||||||         ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38690250 gtaatgtgttgtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaactatggacaa 38690151  T
Q  192 ttgtaaaagatatt 205  Q
    ||||||||||||||    
T  38690150 ttgtaaaagatatt 38690137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 50113762 - 50113642
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50113762 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaataatgt 50113663  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  50113662 gtaatgagttgtttaattatg 50113642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 50113620 - 50113480
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  50113620 tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtt 50113521  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50113520 tatgtctgagtttcaacgttgtatgaattattttgcctttg 50113480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Original strand, 5141504 - 5141769
Alignment:
Q  3 tatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgt 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| | |    
T  5141504 tatgtttcggaatatgatggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgtagaatgtcagtagagatttaatttaacgatatat 5141603  T
Q  103 aatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaatt 193  Q
    |||| ||||||||         ||||| ||| ||||| ||||||||||||| || |  |||||  ||||   ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5141604 aatgtgttgtttaattattgacactatttaacgttttaatgaatttcaaacattcgagtaattcgaaccccttgtcggtttgatttaattatggacaact 5141703  T
Q  194 gtaaaagatat---tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||    || ||||||||||| | |||| | |||||||||||| |||| |||||||||    
T  5141704 gtaaaagatatgtaattttcttgtttatgcctgagtataaatgttgtatgagttatattgcctttg 5141769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33168354 - 33168133
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  33168354 tttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgagtgtaagtagggatttaatttaatgatat 33168255  T
Q  101 gtaatgag----------ttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    ||||||||          |||||||         ||||||||| |||||||||| |||||||| || || || ||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  33168254 gtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatggacactatgtaacgttttgatgattttcaaactttcgtgtactttgaactaaatgtcggtttgatttaa 33168155  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagata 203  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  33168154 ttatggacaactgtaaaagata 33168133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 94700 - 94571
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  94700 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 94601  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  94600 tttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 94571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31780270 - 31780144
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  31780270 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacctaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 31780171  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgcc 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31780170 tttcaatgttgtatgaattgttttgcc 31780144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 256
Target Start/End: Original strand, 52805330 - 52805460
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||| |||||||| |||    
T  52805330 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttatttatgtcagag 52805429  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52805430 tttcaatgttatatgaattattttgcctttg 52805460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16281999 - 16281870
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||    
T  16281999 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccagatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttttcttgtttatgtccgag 16281900  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16281899 ttttaatgttgtatgaattattttgccttt 16281870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 22527465 - 22527594
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||    
T  22527465 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaacatattgtatttatcttgtttatgtccgag 22527564  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22527565 tttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 22527594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 4518176 - 4518316
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  4518176 tgtaacgttctgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtt 4518275  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4518276 tatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 4518316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 46979018 - 46979158
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  46979018 tgtaatgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaatcaaatgtctgtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattctatttttcttgtt 46979117  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  46979118 tatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 46979158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19521900 - 19521770
Alignment:
Q  129 ttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccga 224  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||    
T  19521900 ttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatagacaattgtaaaagatatagtatttttcttgtttatgtccga 19521801  T
Q  225 gtttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19521800 gtttcaatgctgtatgaattattttgccttt 19521770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 470840 - 470969
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  470840 tgatgaatttcaaacgtttgtataatttgaaccaaatgtcggtttgattaaattatgaacaatggtaaaagatattgtacttatcttgtttatgtccgag 470939  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  470940 tttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 470969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 4518026 - 4518135
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  4518026 tttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatt--atataatgatgt 4518123  T
Q  101 gtaatgagttgt 112  Q
    ||||||||||||    
T  4518124 gtaatgagttgt 4518135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 46978866 - 46978977
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46978866 tttatgtttcgaaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttcctaatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgt 46978965  T
Q  101 gtaatgagttgt 112  Q
    ||||||| ||||    
T  46978966 gtaatgaattgt 46978977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
Target Start/End: Original strand, 21144405 - 21144530
Alignment:
Q  134 gaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||||||    
T  21144405 gaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatagacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgttcgagtttc 21144504  T
Q  230 aatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21144505 aatgttgtatgaattattttgccttt 21144530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 50617503 - 50617376
Alignment:
Q  133 tgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata-----ttttatcttgtttatgtccgagtt 227  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     |||| | ||||||||||| |||||    
T  50617503 tgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaaatatggacaattgtaaaaaatattgtgtttttttttgtttatgtcagagtt 50617404  T
Q  228 tcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50617403 tcaatgttgtatgaattattttgccttt 50617376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 256
Target Start/End: Original strand, 22345818 - 22345944
Alignment:
Q  129 ttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattttatcttgtttatgtccgagttt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | |  ||||||||||    
T  22345818 ttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttacttatggacaattgtaaaagatattgtat-ttttcttggtccgagttt 22345916  T
Q  229 caatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22345917 caatgttgtatgatttatattgcctttg 22345944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1179924 - 1179878
Alignment:
Q  122 taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  1179924 taatgttttgatgaatttcaaacattcgtgtaattttaacgaaatgt 1179878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 256
Target Start/End: Original strand, 23359217 - 23359249
Alignment:
Q  224 agtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23359217 agtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 23359249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39898 - 39630
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39898 tttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 39799  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaatgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 39699  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39698 ttgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtctgaggttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 39630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23924406 - 23924138
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23924406 tttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcagttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 23924307  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23924306 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 23924207  T
Q  192 ttgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23924206 ttgtaaaagatattgtacttatcttttttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 23924138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35962748 - 35962481
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35962748 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatacgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgt 35962649  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    | |||||||||||||         ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35962648 gcaatgagttgtttaattatgcacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatttcggtttaatttaattatggacaa 35962549  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35962548 ttgtaaaagatattgtatttatcttgtttatatccgagttttaatgttgtatgaattattttgccttt 35962481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30301576 - 30301332
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30301576 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 30301477  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30301476 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 30301377  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30301376 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 30301332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 7344188 - 7344432
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344188 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 7344287  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7344288 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctatttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 7344387  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7344388 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 7344432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43679837 - 43679569
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43679837 tttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagcagggatttaatataatgatgt 43679738  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43679737 gtaatgagttgtttaattatgaacactttgtaacgttttgatgaattttaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 43679638  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  43679637 ttgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaattttgtatgatttatattgcctttg 43679569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8419846 - 8419602
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419846 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtacgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 8419747  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  8419746 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaa 8419647  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8419646 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 8419602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32376093 - 32375849
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32376093 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 32375994  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  32375993 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcgatttaatttaattattaacaa 32375894  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  32375893 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgttcgagtttcaat 32375849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 256
Target Start/End: Original strand, 20548938 - 20549159
Alignment:
Q  48 tcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaactatg---------taatgttttgatgaatt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||    
T  20548938 tcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaaggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatt 20549037  T
Q  139 tcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgt 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  20549038 tcaaacgtttgtttaattttaaccaaatttcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatatccgagtttcaatct 20549137  T
Q  235 tgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  20549138 tgtatgaattattttgtctttg 20549159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 22588074 - 22588287
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22588074 tttatgttttgaaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 22588173  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  22588174 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaacgttttgatcaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacctaatgtcggtttgatttaattatggataa 22588273  T
Q  192 ttgtaaaagatatt 205  Q
    ||||||||||||||    
T  22588274 ttgtaaaagatatt 22588287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39751473 - 39751233
Alignment:
Q  29 atatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta---------acta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||     
T  39751473 atatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattacgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt 39751374  T
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    ||| ||||| |    
T  39751373 tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcagtttgatttaattacggacaactgtaaaagatattgtatttttcttggt 39751274  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  39751273 tatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgtctttg 39751233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 43376911 - 43377031
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43376911 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgt 43377010  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  43377011 gtaatgagttgtttaattatg 43377031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 4867425 - 4867703
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4867425 tttatgtttcggattatggtggaaaataatatattatatacgtatgttcgttccatatccaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgataa 4867524  T
Q  101 gtaatga----------gttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    |||||||          ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||| ||||| ||||||    
T  4867525 gtaatgagttgtaatctgttgtttaattatggagactatgtaatgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttaaatcaaatgttggtttgatttaa 4867624  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||| || ||||||||    ||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  4867625 ttatggacaatggtgaaagatattgtatttttcttgtttatgactgagtttaaatgttgtatgagttatattgcctttg 4867703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2124635 - 2124515
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2124635 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtattttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggacttaatttaatgatgt 2124536  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  2124535 gtaatgagttgtttaattatg 2124515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 7171949 - 7172172
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  7171949 tttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgt 7172048  T
Q  100 ---------tgtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
             ||||||| ||||||||         ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||| |||||| ||||| ||||||    
T  7172049 gtactgagttgtaatgtgttgtttaattatggacactatgtaacgttttcatgaatttcaaacttttgtgtattttgaacaaaatgtgggtttgatttaa 7172148  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7172149 ttatggacaattgtaaaagatatt 7172172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 31959679 - 31959799
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31959679 tttatgttttggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtatggatttaatttaatgatgt 31959778  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  31959779 gtaatgagttgtttaattatg 31959799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Original strand, 22661208 - 22661417
Alignment:
Q  3 tatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  22661208 tatgtttcggaatatggtggaagatgatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaactgcgcagaatgtcagtagagatttaatttaacgatatgt 22661307  T
Q  103 aatgagttgtttaactatg---------taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaatt 193  Q
    |||| ||||||||| ||||         |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  22661308 aatgtgttgtttaattatggacactctttaatgttttgatgaatctcaaacattcgtgtaattttaacgaaatatcggtttgatttaattatggacaacc 22661407  T
Q  194 gtaaaagata 203  Q
    ||||||||||    
T  22661408 gtaaaagata 22661417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 31959821 - 31959961
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||    
T  31959821 tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtgggtttaatttaatcatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtt 31959920  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31959921 tatgtccgagtttcaatcttatatgaattattttgcctttg 31959961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 41744264 - 41744160
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41744264 tttatatttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatattcgctccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggacttaatttaatgatgt 41744165  T
Q  101 gtaat 105  Q
    |||||    
T  41744164 gtaat 41744160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34367214 - 34367085
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  34367214 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 34367115  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34367114 tttcaatgctgtatgaattgttttgccttt 34367085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 43377053 - 43377193
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  43377053 tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaacttgaaccaaatttcggtttcatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtt 43377152  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  43377153 tatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 43377193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41744162 - 41744037
Alignment:
Q  135 aatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttca 230  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||| |||||||||    
T  41744162 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaatcatggacaattgtaaaaaatattgtatttatcttgtttatgttcgagtttca 41744063  T
Q  231 atgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    || |||||| ||||||||||||||||    
T  41744062 atcttgtataaattattttgcctttg 41744037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41239150 - 41239026
Alignment:
Q  131 gatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagt 226  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||     
T  41239150 gatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttgtcttgtttatgtccgaga 41239051  T
Q  227 ttcaatgttgtatgaattattttgc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41239050 ttcaatgttgtatgaattattttgc 41239026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2124493 - 2124353
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    ||| ||||| |    
T  2124493 tgtaacgttttgatgaatttcaaatgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaactatggacaactgtaaaagatattatatttttcttggt 2124394  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2124393 tatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 2124353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Original strand, 30972519 - 30972717
Alignment:
Q  14 atatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtt 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||| ||||||   |||  |||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  30972519 atatggttgaagataatatattatatatgtgtgtttgttccatttgcacatgcgtagaatgtcgatagatattttatgtaatgatgtgtaatgtgttgtt 30972618  T
Q  114 ta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata 203  Q
    ||         ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||| |  || |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30972619 taattatgtatactctgtaatgttttgatgaatttcaaacattcgtgtaattttaacgaaatgttgaattgatttaattatcgacaaccgtaaaagata 30972717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23578705 - 23578607
Alignment:
Q  162 caaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  23578705 caaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgacagagtttcaatgttgtataatttatattgcctttg 23578607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 31281253 - 31281179
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgt 75  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  31281253 tttatgtttcagaatatggttgaagataatatattatatctttatgttcgttccatctgcacgtgcgtagaatgt 31281179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 39751695 - 39751659
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattat 37  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39751695 tttatgtttcggaatatggtagaagataatatattat 39751659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25890435 - 25890167
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25890435 tttatgtttcagaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 25890336  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25890335 gtaatgagttgtttaattatgaacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 25890236  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25890235 ttgtataagatattgtatttatcttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 25890167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 34079763 - 34080031
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34079763 tttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaaggatttaatttaatgatgt 34079862  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34079863 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 34079962  T
Q  192 ttgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34079963 ttgtaaaagatattgtacttatcttgattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 34080031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13564082 - 13563814
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13564082 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgatccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 13563983  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13563982 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaatgttttaatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 13563883  T
Q  192 ttgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13563882 ttgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 13563814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27863844 - 27863576
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27863844 tttatgttttggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatttgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 27863745  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27863744 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 27863645  T
Q  192 ttgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27863644 ttgtaaaagatattgtacttatcttgattatgtccgagtttcaatcttgtgtgaattattttgcctttg 27863576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37815023 - 37814755
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37815023 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaaagtaagtagggatttaatttaatgatgt 37814924  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37814923 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 37814824  T
Q  192 ttgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37814823 ttgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 37814755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7017941 - 7017684
Alignment:
Q  12 gaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7017941 gaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtag 7017842  T
Q  112 tttaactatg---------taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagat 202  Q
    ||||| ||||         ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7017841 tttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagat 7017742  T
Q  203 att----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7017741 attgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 7017684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7797018 - 7796750
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7797018 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 7796919  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7796918 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 7796819  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    || ||||||||||    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7796818 ttataaaagatattgtatttttcttgtttataaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 7796750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11029448 - 11029181
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11029448 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgtttcatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 11029349  T
Q  101 gtaatgagttgttta-------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatggacaat 192  Q
    || |||||| |||||       ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11029348 gtgatgagtagtttaattatggactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaat 11029249  T
Q  193 tgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11029248 tgtaaaagatattgcatttatcttgattatgaccgagtttcaatattgtatgaattatttagcctttg 11029181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28882429 - 28882177
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28882429 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtggggatttaatttaatgatgt 28882330  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28882329 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaacgaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 28882230  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatg 240  Q
    |||||||||||||    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  28882229 ttgtaaaagatattgtatttatcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatg 28882177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38856156 - 38855887
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38856156 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggattgaatttaatgatgt 38856057  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatggaca 190  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  38856056 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggtttaatttaattacgaaca 38855957  T
Q  191 attgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  38855956 attgtaaaagatattgtatttatcttgattatgaccgagtttcaatattgtatgaattatttagcctttg 38855887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 33994781 - 33995049
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33994781 tttatgtttcttaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 33994880  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||| ||||||||         ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33994881 gtaatgtgttgtttatgcatggacactatgtaacgatttgaagaatttcaaacttttttgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 33994980  T
Q  192 ttgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||| |||    |||||||||| | |||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  33994981 ttgtaaaagatattgtattttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcctttg 33995049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24053604 - 24053326
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24053604 tttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttctttctatatgcaattgcgttgaatgtaattagggatataatttaatgatgt 24053505  T
Q  101 gtaatgag----------ttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    ||||||||          |||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| || |||    
T  24053504 gtaatgagttgtaatatgttgtttaattatggacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatgtaa 24053405  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| | |||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  24053404 ttatggacaattgtaaaagatattgtattttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcctttg 24053326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24050479 - 24050199
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatat--tatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24050479 tttatgtttcagaatatggtggaagataatatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatataatttaatgat 24050380  T
Q  99 gtgtaatgag----------ttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaattt 179  Q
    ||||||||||          |||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||    
T  24050379 gtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatggatactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgattt 24050280  T
Q  180 aattatggacaattgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| | || ||| |||||||||| | |||| || ||||||    
T  24050279 aattatggacaattgtaaaagatattgtattttacttgtttatgactgaatttaaatgttgtataagttatatttcctttg 24050199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 1039565 - 1039705
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||    
T  1039565 tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcgtgtt 1039664  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1039665 tatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 1039705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 127 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34122830 - 34122697
Alignment:
Q  127 ttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtcc 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  34122830 ttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtcc 34122731  T
Q  223 gagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34122730 gagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 34122697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 14280610 - 14280730
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280610 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 14280709  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  14280710 gtaatgagtagtttaattatg 14280730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 34122979 - 34122859
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34122979 tttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatatatatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaagtatgaatttaatttaatgatgt 34122880  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  34122879 gtaatgagttgtttaattatg 34122859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 28387887 - 28387979
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaattta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28387887 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgattgtaagtagggatttaattta 28387979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 1039424 - 1039535
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1039424 tttatgttt-ggaatatggtggaaaataatatgttatatatgtatgttcgtaccatatgcagttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatat 1039522  T
Q  101 gtaatgagttgtt 113  Q
    |||||||||||||    
T  1039523 gtaatgagttgtt 1039535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 7762013 - 7762142
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||| ||||    
T  7762013 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatctatcttgtttatgttcgag 7762112  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7762113 tttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 7762142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38407449 - 38407320
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||| |||    
T  38407449 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgccggtttgatttaattatggacaattctaaaagatattgtatttttcttgtttatgtctgag 38407350  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38407349 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 38407320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 41799539 - 41799667
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaga----tattttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||| |||||||||||||| ||    
T  41799539 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaaattgtatttt-tcttgtttatgtccaag 41799637  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41799638 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 41799667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 4196955 - 4196837
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  4196955 tttatgtttcggaatatggtcgaaaataatatattatatatgtat--tcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatat 4196858  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  4196857 gtaatgagttgtttaattatg 4196837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 25878071 - 25877953
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| |||| | ||    
T  25878071 tttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgtttgttccatatgcaattgtgatg--tgtaagtagggatttaatataatcacgt 25877974  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  25877973 gtaatgagttgtttaattatg 25877953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6267908 - 6267704
Alignment:
Q  8 ttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  6267908 ttcggaatatgatggaagataatatattatatatgtatttttgttccatctgcaactgcgtagaatgtcagtagagatttaatttaatgatatgtaatgt 6267809  T
Q  108 gttgtttaactatg---------taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaa 198  Q
    ||||||||| ||||         ||||||| ||||||||||||||| ||  |  ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||    
T  6267808 gttgtttaattatggacactctttaatgttatgatgaatttcaaacattcttgcaattttaatgaaatgtcggattgatttaattatggataacggtaaa 6267709  T
Q  199 agata 203  Q
    |||||    
T  6267708 agata 6267704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 30352871 - 30352760
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| |    
T  30352871 tttatgtttcggaatattgtggaaaataatatattatatatgtatgttttttccatatgcaattgcattgaatgtaagtaaagatttaatttattgatat 30352772  T
Q  101 gtaatgagttgt 112  Q
    ||||||||||||    
T  30352771 gtaatgagttgt 30352760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25877931 - 25877793
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  25877931 tgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtt--atttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtt 25877834  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  25877833 tatgaccaagtttcaatgttgtatgatttatattgcttttg 25877793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 256
Target Start/End: Original strand, 28388311 - 28388419
Alignment:
Q  152 taattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattatt 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28388311 taatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttattttgtttatgtccgaatttcaatcttgtatgaattatt 28388410  T
Q  248 ttgcctttg 256  Q
    |||||||||    
T  28388411 ttgcctttg 28388419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 43179497 - 43179559
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43179497 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatctgcaat 43179559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30352733 - 30352662
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  30352733 tgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgctggtttgatttaattatggacaa 30352662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4196781 - 4196727
Alignment:
Q  202 tattttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4196781 tattttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 4196727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 203
Target Start/End: Original strand, 43179666 - 43179743
Alignment:
Q  126 gttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata 203  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||| || ||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  43179666 gttttgatgaatttcaaacattcgtgtaattttaacgaaatgttggattgtattaattatggacaagtgtaaaagata 43179743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9427046 - 9426778
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9427046 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 9426947  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9426946 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 9426847  T
Q  192 ttgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9426846 ttgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 9426778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13743707 - 13743440
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743707 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 13743608  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13743607 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaa-tttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 13743509  T
Q  192 ttgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13743508 ttgtaaaagatattgtacttatcttgattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 13743440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48246852 - 48246584
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48246852 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgtttgttccatatgcaactgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 48246753  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48246752 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaattttttgatgaatttcaaaagtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 48246653  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48246652 ttgtaaaagatattgtatttatattgcttatgtctgagtttcaatgttttatgaattattttgcctttg 48246584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 6744958 - 6745226
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6744958 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 6745057  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6745058 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 6745157  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  6745158 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattatattacctttg 6745226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 2857614 - 2857882
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2857614 tttatgtttcggaaaatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcattccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 2857713  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2857714 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttaagatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 2857813  T
Q  192 ttgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    |||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2857814 ttgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccaagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 2857882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30943632 - 30943388
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943632 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 30943533  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30943532 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 30943433  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30943432 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 30943388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 3952846 - 3953090
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3952846 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 3952945  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3952946 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctatttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 3953045  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3953046 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 3953090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8156950 - 8156706
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8156950 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 8156851  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  8156850 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaa 8156751  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8156750 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 8156706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21952240 - 21951972
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21952240 tttaggtttcggaatatggtggaagatgatatattatatttgtatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaactagggatttaatttaatgacgt 21952141  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21952140 gtaatgagttgtttaatcatggacacattgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaatcaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 21952041  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  21952040 ttgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgttcgagtttcaatgttgtatgatttatattgcatttg 21951972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 256
Target Start/End: Original strand, 50957315 - 50957593
Alignment:
Q  5 tgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50957315 tgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaa 50957414  T
Q  105 tgagttgttta---------actatgtaatgttttg--------------atgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    ||||| |||||         ||| || |||||||||              ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50957415 tgagtagtttaattatggacactttggaatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtctgtttaatttaa 50957514  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50957515 ttatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 50957593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7841474 - 7841268
Alignment:
Q  63 ttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaactatg---------taatgttttgatgaatttcaaacctttgttta 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||         ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  7841474 ttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagttgtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaattttaaacgtttgtgta 7841375  T
Q  154 attttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata----ttttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattatttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7841374 attttaaccaaatgtcggtttaatttacttatggacaattgtaaaagatactgtatttatcttgtttatgtctgagtttcaatgttgtatgaattatttt 7841275  T
Q  250 gcctttg 256  Q
    |||||||    
T  7841274 gcctttg 7841268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2743896 - 2743678
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2743896 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatacgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 2743797  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgt--------------tttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaat 177  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2743796 gtaatgagtagtttaattatgaacactttgtaatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaat 2743697  T
Q  178 ttaattatggacaattgta 196  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  2743696 ttaattatgaacaattgta 2743678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 4002265 - 4002405
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  4002265 tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtt 4002364  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4002365 tatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 4002405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 67324 - 67046
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  67324 tttatgtttcggaatatggtggaaaataatacattatatatgtatgttcgttccatatgtgattgcgttgaatgtaagtagggatttcatttaatgatgt 67225  T
Q  101 gtaatgag----------ttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    ||||||||          |||||||         ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  67224 gtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatggacactatgtaccgttttgatgaatttcaaacttttgtgtagtttgaaccaaatgtcggtttgatttaa 67125  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  67124 ttatggacaattgtaaaagatattgtattttacttgtttataagtgagtttaaatgttgtatgaattatattgcatttg 67046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 36813292 - 36813172
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36813292 tttatgtttcggaatatggtggaatataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatataatttaatgatgt 36813193  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  36813192 gtaatgagttgtttaattatg 36813172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 6489784 - 6489664
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6489784 tttatatttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgt 6489685  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  6489684 gtaatgagttgtttaattatg 6489664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 14402637 - 14402757
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14402637 tttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgacgt 14402736  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  14402737 gtaatgagttgtttaattatg 14402757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 46989967 - 46989847
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46989967 tttatgttttggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccacatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 46989868  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  46989867 gtaatgagttgtttaattatg 46989847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 4002123 - 4002243
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4002123 tttatgtttcggaaaatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 4002222  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  4002223 gtaatgagttatttaattatg 4002243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 115 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36813155 - 36813010
Alignment:
Q  115 aactatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatc 210  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    ||||||    
T  36813155 aactttgtaatgttttaatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtataagatattgtatttatc 36813056  T
Q  211 ttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36813055 ttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatggattattttgcctttg 36813010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 600314 - 600443
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||    
T  600314 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgtccgag 600413  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  600414 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 600443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 36134053 - 36134182
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  36134053 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 36134152  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36134153 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 36134182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 50213760 - 50213631
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||    
T  50213760 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgcatttttcttgtttatgtccgag 50213661  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50213660 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 50213631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 46989825 - 46989685
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  46989825 tgtaacgttttgatgaatttcaaatgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtt 46989726  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  46989725 tatgtccgagtttcacatttgtatgaattattttgcctttg 46989685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 42166182 - 42166311
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    |||| |||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  42166182 tgataaatttcaaacattagtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 42166281  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42166282 tttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 42166311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2271658 - 2271528
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaga-----tattttatcttgtttatgtccga 224  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| |    
T  2271658 tgatgaattttaaacgtttgtctaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttatcttgtttatgtccaa 2271559  T
Q  225 gtttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2271558 gtttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 2271528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 47070771 - 47070642
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||| ||||    
T  47070771 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaacgtcggtttgatttaattatggacaattggaaaagatattgtatttatcttgtttatgttcgag 47070672  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47070671 tttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 47070642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 16646944 - 16647072
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| |||||||| |||    
T  16646944 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttaaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaatcgtaaaagatattatatttatctt-tttatgtctgag 16647042  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16647043 tttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 16647072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6489629 - 6489501
Alignment:
Q  132 atgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata----ttttatcttgtttatgtccgagtt 227  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||| ||||||||||| |||||||    
T  6489629 atgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagataatgtatttttcttgtttatgaccgagtt 6489530  T
Q  228 tcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6489529 tcaatgttgtatgatttatattgcctttg 6489501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 255
Target Start/End: Original strand, 9473721 - 9473848
Alignment:
Q  132 atgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtt 227  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    ||||| |||||||||||||||||    
T  9473721 atgaatttcaaacgtttgtgtaacttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggataattgtaatagatattgtatttatattgtttatgtccgagtt 9473820  T
Q  228 tcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9473821 tcaatgttgtatgaattgttttgccttt 9473848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 52388097 - 52387973
Alignment:
Q  135 aatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttca 230  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  52388097 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggtcaattgtaaaagatattgtatttatattgtttatgtccgagtttca 52387998  T
Q  231 atgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    
T  52387997 atgttgtatgaattggtttgccttt 52387973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Original strand, 14402808 - 14402897
Alignment:
Q  171 gtttaatttaattatggacaattgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14402808 gtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 14402897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2743611 - 2743570
Alignment:
Q  215 ttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2743611 ttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 2743570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4005058 - 4005018
Alignment:
Q  215 ttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4005058 ttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 4005018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7314685 - 7314607
Alignment:
Q  124 atgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagat 202  Q
    |||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||  || |||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  7314685 atgttttgttgaatttcaaacattcgtataattttaacaaaatgtcgaattgatttaattttggtcaattgtgaaagat 7314607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 157
Target Start/End: Original strand, 14402779 - 14402816
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattt 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14402779 tgtaatgttttcatgaatttcaaacgtttgtttaattt 14402816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 24753656 - 24753924
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24753656 tttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgtttgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 24753755  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  24753756 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaaaaa 24753855  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24753856 ttgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtcccagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 24753924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 7267076 - 7267344
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7267076 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgt 7267175  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7267176 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtaggtttaatttaattatgaacaa 7267275  T
Q  192 ttgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7267276 ttgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtataaattattttgcctttg 7267344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28342957 - 28342695
Alignment:
Q  7 tttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342957 tttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatg 28342858  T
Q  107 agttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaa 197  Q
    | |||||||         ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28342857 aattgtttaattatgaacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaa 28342758  T
Q  198 aagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28342757 aagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 28342695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 39798072 - 39798331
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39798072 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgt 39798171  T
Q  101 gtaatgagttgttta-------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatggacaat 192  Q
    ||||||||| |||||       ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39798172 gtaatgagtagtttaattatggactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaat 39798271  T
Q  193 tgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattt 248  Q
    ||||||||||||    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39798272 tgtaaaagatattgcatttatcttgattatgaccgagtttcaatattgtatgaattattt 39798331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41181851 - 41181583
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41181851 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 41181752  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41181751 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 41181652  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
     ||||||||||||    ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41181651 ctgtaaaagatattgtatttttcttagttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 41181583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 41564122 - 41564366
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564122 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 41564221  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41564222 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 41564321  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41564322 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 41564366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3795791 - 3795509
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795791 tttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 3795692  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgt--------------tttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaat 177  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795691 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaat 3795592  T
Q  178 ttaattatggacaattgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3795591 ttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 3795509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 5351363 - 5351607
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351363 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 5351462  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5351463 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaa 5351562  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5351563 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 5351607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10620415 - 10620171
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10620415 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 10620316  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10620315 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaa 10620216  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10620215 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 10620171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 45479453 - 45479721
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45479453 tttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 45479552  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||| ||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45479553 gtaatgtgttgtttaattatggacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttttgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaacaa 45479652  T
Q  192 ttgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||| |||    |||||||||| | |||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  45479653 ttgtaaaagatattgtattttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtattagttatattgcctttg 45479721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 209426 - 209182
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  209426 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtatggatttaatttaatgatgt 209327  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  209326 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaa 209227  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  209226 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 209182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 256
Target Start/End: Original strand, 38950232 - 38950466
Alignment:
Q  35 tatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaactatg---------taat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||         ||||    
T  38950232 tatatatgtatgttcgttccatatgtaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaat 38950331  T
Q  126 gttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtc 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||  |||||||    
T  38950332 gttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtc 38950431  T
Q  222 cgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  38950432 cgagtttcaatcttgtatgaattatattacctttg 38950466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43944142 - 43943862
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43944142 tttatgtttcggaatatggtggaagataatataatatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 43944043  T
Q  101 gtaatga----------gttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    |||||||          ||||||||         ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43944042 gtaatgaattgtaatgtgttgtttatgcatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttttgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaa 43943943  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaat--tattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  43943942 ttatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagttttaatgttgtatgatttatattttgcctttg 43943862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12905970 - 12905692
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12905970 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgtttgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtacggatttaatttaatgatgt 12905871  T
Q  101 gtaatgag----------ttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    ||||||||          |||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12905870 gtaatgagttgtaatgtgttgtttaattattgacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaa 12905771  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||    |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  12905770 ttatggacaattgtaaaatatattgtattttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtatgagttatattgcctttg 12905692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1097024 - 1096904
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1097024 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatat 1096925  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  1096924 gtaatgagttgtttaattatg 1096904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41004977 - 41004699
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  41004977 tttatgtttcagaatatgttgaaaaattatatattatatatgtatgttcattccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagtgatttaatataatgatgt 41004878  T
Q  101 gtaatgagttgt--------------tta-----actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    ||||||||||||              |||     ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  41004877 gtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttaaaccaaatgttggtttgatttaa 41004778  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  41004777 ttatagacaattgtaaaagatattatatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgtctttg 41004699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24602092 - 24601974
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24602092 tttatttttcggaatatggtggaagataatatattatatat--atgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 24601995  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  24601994 gtaatgagttgtttaattatg 24601974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 24612022 - 24612140
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24612022 tttatttttcggaatatggtggaagataatatattatatat--atgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 24612119  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  24612120 gtaatgagttgtttaattatg 24612140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18000607 - 18000430
Alignment:
Q  68 ttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaactatg---------taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaatttt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||         ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18000607 ttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaatttt 18000508  T
Q  159 aaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18000507 aaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 18000430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1096882 - 1096742
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata----ttttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||    
T  1096882 tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtagtttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatactgtatttatcttgtt 1096783  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1096782 tatgtccgagttttaatgttgtatgaattattttgcctttg 1096742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 9659672 - 9659794
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatat--gtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9659672 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattttatatttgtatgttcgttcaatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggtatttaatttaatgat 9659771  T
Q  99 gtgtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  9659772 gtgtaatgagttgtttaattatg 9659794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29398208 - 29398083
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattttatcttgtttatgtccgagtttc 229  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  29398208 tgatgaatttcaaacatttgtgtaatttgaactaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttttcttatgtccgagtttc 29398109  T
Q  230 aatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29398108 aatgttgtatgaattattttgccttt 29398083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 439442 - 439562
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  439442 tttatgtttcggaatatggtggaaagtaatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaaggagggatttaatataatcatgt 439541  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  439542 gtaatgagttgtttaattatg 439562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 1150663 - 1150783
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1150663 tttatgttttggaatatgatggaagatactatattatatatgtatgttcgttccatatgcaatttcattgaatgtaagtagtgatttaatttaatgatgt 1150762  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  1150763 gtaatgaattgtttaattatg 1150783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 39950941 - 39951070
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  39950941 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 39951040  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39951041 tttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 39951070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 256
Target Start/End: Original strand, 439592 - 439722
Alignment:
Q  128 tttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatatttta--tcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  439592 tttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttcttgtttatgaccgag 439691  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  439692 tttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 439722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41052934 - 41052794
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  41052934 tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtt 41052835  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41052834 tatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 41052794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 81882 - 82002
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  81882 tttatgtttcggaatatggttgaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatgcatttaatataatcatgt 81981  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  81982 gtaatgagttgtttaattatg 82002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10825521 - 10825392
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||    
T  10825521 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtctgtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtctgag 10825422  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10825421 tttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 10825392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32953033 - 32952904
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||| ||||||| ||||| |||    
T  32953033 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttttcttgttgatgtctgag 32952934  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32952933 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 32952904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 9659816 - 9659956
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  9659816 tgtaacgttttgatgaatttcaagcgtttgtgtaattttaaccaaatgtcgttttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtt 9659915  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9659916 tatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 9659956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24601952 - 24601812
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  24601952 tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtctgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtt 24601853  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24601852 tatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 24601812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 24612162 - 24612302
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  24612162 tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtctgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtt 24612261  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24612262 tatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 24612302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 256
Target Start/End: Original strand, 25184606 - 25184731
Alignment:
Q  135 aatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttca 230  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25184606 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatatcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttca 25184705  T
Q  231 atgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||    
T  25184706 atgttgtatgatttatattgcctttg 25184731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 41053074 - 41052956
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatata-ttatatatgtatgttcgttcc--atatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatga 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||    
T  41053074 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatatttatatatgtgtgttcgttccatatatgcaattgcattgaatgtaagtagg-----aatttaatga 41052980  T
Q  98 tgtgtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||| |||||||| ||||    
T  41052979 tgtgtaatgaattgtttaattatg 41052956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 255
Target Start/End: Original strand, 82024 - 82162
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  82024 tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaa-tatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtt 82122  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    |||| || |||||  |||||| |||| ||||  |||||||    
T  82123 tatgaccaagttttgatgttggatgatttatactgccttt 82162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3207054 - 3206968
Alignment:
Q  126 gttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattttatctt 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  3207054 gttttgatgaatttcaaacttttgtatactttgaactaaatgtcggtttgatttaattatagacaattgtaaaagataatgtatctt 3206968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 38949818 - 38949855
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattata 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38949818 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattata 38949855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 25613621 - 25613528
Alignment:
Q  23 aagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||| | |||||| | ||| ||||| || ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  25613621 aagataatatattatatctttgtgttcgttccatctgcatgtgcatagaatgtcaatagagattttatgtaatgatatgtaatgtgttgattaa 25613528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25613513 - 25613433
Alignment:
Q  122 taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagat 202  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  | |||||| ||| ||||| | | || |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25613513 taatattttgatgaatttcaaacattcttgtaatttaaacaaaatgcctgattgatttaattttggtcaattgtaaaagat 25613433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 18109425 - 18109694
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18109425 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 18109524  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatggaca 190  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  18109525 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaaca 18109624  T
Q  191 attgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18109625 attgtaaaagatattgtatttatcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 18109694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 47742621 - 47742889
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47742621 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 47742720  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47742721 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttaatttaattatggacaa 47742820  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47742821 ttgtaaaagatattgcatttatcttgtttttgtccatgtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 47742889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 15069982 - 15070251
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15069982 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 15070081  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatggaca 190  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  15070082 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaaca 15070181  T
Q  191 attgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15070182 attgtaaaagatattgtatttatcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatgaattatttagcctttg 15070251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 604220 - 603952
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  604220 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgtttgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 604121  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  604120 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcgatttaatttaattatgaacaa 604021  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  604020 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgttcgagtttcaatcttgtatgaattattttacctttg 603952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 42503470 - 42503739
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42503470 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 42503569  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatggaca 190  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  42503570 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgttggtttaatttaatcatgaaca 42503669  T
Q  191 attgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||| ||||||||||    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  42503670 attataaaagatattgtatttatcttgattatgaccgagtttcaatcttgcatgaattatttagcctttg 42503739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 30790638 - 30790882
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790638 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 30790737  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30790738 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 30790837  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30790838 ttgtaaaagatattctatttatcttcattatgtccgagtttcaat 30790882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34622939 - 34622671
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  34622939 tttatgtttcggaatatgatggaagataatatattatatatgtatgttcgtttcatatgcaattgcgttgaatgtaagtagaagtttaatttaatgatgt 34622840  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34622839 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 34622740  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||| ||||    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34622739 ttgtaaaatatattgtatttttcttatttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 34622671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 45767492 - 45767736
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45767492 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 45767591  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  45767592 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaa 45767691  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  45767692 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 45767736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43620121 - 43619877
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43620121 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 43620022  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  43620021 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaa 43619922  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  43619921 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtctgagtttcaat 43619877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10705698 - 10705421
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10705698 tttatgtttcagaatatggtggaagatgatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttattgatgt 10705599  T
Q  101 gtaatgag----------ttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    ||||||||          |||||||         |||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10705598 gtaatgagttgtaatgtattgtttaattatggacactatgtaacattttgatgaattttaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaa 10705499  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| | |||||| |||||||||| | |||| ||||||||    
T  10705498 ttatggacaattgtaaaagatattgtattttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgccttt 10705421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12111664 - 12111398
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12111664 tttatatttcggaatatggtggaaaataatat--tatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatttaatgatat 12111567  T
Q  101 gtaatgag----------ttgtttaactatg---------taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    ||||||||          |||||||| ||||         ||| |||||||||||||| |||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12111566 gtaatgagttgtaatgtattgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaattttaaactttggtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaa 12111467  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattat 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12111466 ttatggacaattataaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttat 12111398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 19044747 - 19044627
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19044747 tttatgtttcgaaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgt 19044648  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  19044647 gtaatgatttgtttaattatg 19044627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 20709889 - 20710009
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20709889 tttatgtttcgaaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgt 20709988  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  20709989 gtaatgatttgtttaattatg 20710009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 122 - 256
Target Start/End: Original strand, 40928715 - 40928853
Alignment:
Q  122 taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgttta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||| |||    
T  40928715 taatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgatta 40928814  T
Q  218 tgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40928815 tgaccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 40928853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 29592943 - 29592839
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592943 tttatgtttcggaatatggtggaagataatacattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 29592844  T
Q  101 gtaat 105  Q
    |||||    
T  29592843 gtaat 29592839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 47064926 - 47065046
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  47064926 tttatgtttcgaaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgt 47065025  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  47065026 gtaatgagttgtttaattatg 47065046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5538147 - 5538018
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatatttta----tcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||    
T  5538147 tgatgaatttcaaacgtttgtataatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtataagatattttatttttcttgtttatgtccgag 5538048  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5538047 tttcaatgttgtatgaattattttcccttt 5538018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 17838405 - 17838534
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  17838405 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 17838504  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17838505 tttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 17838534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29592841 - 29592716
Alignment:
Q  135 aatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttca 230  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29592841 aatttcaaaagtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttatcttgtttatgtccgagtttca 29592742  T
Q  231 atgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    || |||||||||||||||| ||||||    
T  29592741 atcttgtatgaattatttttcctttg 29592716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19044605 - 19044465
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    ||| ||||| |    
T  19044605 tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgtatttttcttggt 19044506  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19044505 tatgacccaatttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 19044465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 20710031 - 20710171
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    ||| ||||| |    
T  20710031 tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgtatttttcttggt 20710130  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20710131 tatgacccaatttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 20710171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 255
Target Start/End: Original strand, 34742168 - 34742294
Alignment:
Q  132 atgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtt 227  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||    
T  34742168 atgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcgatttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgtccgagtt 34742267  T
Q  228 tcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34742268 tcaatgttgtatgaatt-ttttgccttt 34742294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 13323485 - 13323614
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    ||| ||||||| |||||  ||    
T  13323485 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacgaaatgccggtttaatttaattatggaaaattgtaaaaaatattgtatttttcttgttaatgtctcag 13323584  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13323585 tttcaacgttgtatgaattattttaccttt 13323614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Original strand, 10522285 - 10522360
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatatt 205  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10522285 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatatt 10522360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 200
Target Start/End: Original strand, 47065075 - 47065148
Alignment:
Q  127 ttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47065075 ttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttaaatcaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaag 47065148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 3407871 - 3408140
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407871 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 3407970  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatggaca 190  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  3407971 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaaca 3408070  T
Q  191 attgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3408071 attgtaaaagatattgtatttatcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 3408140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 10423040 - 10423307
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  10423040 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatctaatgatat 10423139  T
Q  101 gtaatgagttgtttaacta---------tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||| ||         ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10423140 gtaatgagttgtttaattatggacacattgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacctaatgtcggtttaatttaattatggacaa 10423239  T
Q  192 ttgtaaaagatat---tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10423240 ttgtaaaagatatgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 10423307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49564283 - 49564039
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49564283 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 49564184  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49564183 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 49564084  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||| ||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  49564083 ttgtaaaatatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 49564039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19069641 - 19069359
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19069641 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatacatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 19069542  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgt--------------tttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaat 177  Q
    | ||||||| |||||         ||| ||||||||              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19069541 gcaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaat 19069442  T
Q  178 ttaattatggacaattgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19069441 ttaattatgaacaattgtaaaagatattttacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 19069359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10374480 - 10374267
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10374480 tttatgtttcgaaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 10374381  T
Q  101 gtaatgagttgtttaacta---------tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||| ||         ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10374380 gtaatgagttgtttaattatggacaccttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttcatttaattatggacaa 10374281  T
Q  192 ttgtaaaagatatt 205  Q
     |||||||| ||||    
T  10374280 ctgtaaaaggtatt 10374267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38460866 - 38460598
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38460866 tttatgtttcagaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgtttgttgcatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgt 38460767  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg---------taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||| ||||         |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38460766 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaacattttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 38460667  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38460666 ttgtaaaagatattatatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 38460598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 251
Target Start/End: Original strand, 50904819 - 50905058
Alignment:
Q  25 gataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttta--------- 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||             
T  50904819 gataatatattatatttgtatgtttgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgaaatgaattgtttaattatgaac 50904918  T
Q  116 actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatct 211  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||    
T  50904919 actttgtatcgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatttcatatttttct 50905018  T
Q  212 tgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgc 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  50905019 tgtttatgttcgagtttcaatgttgtatgatttatattgc 50905058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 37394835 - 37394955
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37394835 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 37394934  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  37394935 gtaatgagttgtttaattatg 37394955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 44050711 - 44050831
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44050711 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgcaagtagggatttaatttaatgatgt 44050810  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  44050811 gtaatgagttgtttaattatg 44050831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 4774236 - 4774514
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4774236 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatgttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgcatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 4774335  T
Q  101 gtaatga----------gttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    |||||||          ||||||||         ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  4774336 gtaatgagttgtaatgtgttgtttatgcatggacactatgtaacgatttaatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcgatttgatttaa 4774435  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||    |||| ||||| | |||||| |||||||||| | |||| ||| |||||    
T  4774436 ttatggacaattgtaaatgatattgtattttacttgcttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattggctttg 4774514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18579073 - 18578795
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18579073 tttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatatatgtatgttagttctatatgcaattgcgttgaatgtaagaagtgatttaatttaatgatgt 18578974  T
Q  101 gtaatgag----------ttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    ||||||||          |||||||         |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  18578973 gtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatggacactatgtaacattttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaatcaaatgtcggtttgatttaa 18578874  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||   |||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  18578873 ttatggacaattgtaaaagatattgtattttacttgtttatgagtgagtttaaatgttgtataagttatattgcctttg 18578795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24415609 - 24415392
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24415609 tttatgtttcggaatatgatggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatat 24415510  T
Q  101 gtaatgag----------ttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    ||||||||          |||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24415509 gtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatggacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaa 24415410  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24415409 ttatggacaattgtaaaa 24415392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 37394977 - 37395117
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  37394977 tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtt 37395076  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37395077 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattatttttcctttg 37395117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 128 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15996026 - 15995894
Alignment:
Q  128 tttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccg 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||  |||||||||    
T  15996026 tttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccg 15995927  T
Q  224 agtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15995926 actttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 15995894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 51492374 - 51492245
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||    
T  51492374 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtacttatcttgtttatgttcgag 51492275  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51492274 ttttaatgttgtatgaattattttgccttt 51492245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 44050853 - 44050993
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  44050853 tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtt 44050952  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44050953 tatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 44050993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44674440 - 44674311
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    |||||||||| |||  ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  44674440 tgatgaattttaaatgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtacttatcttgtttatgtccgag 44674341  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44674340 tttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 44674311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 51642423 - 51642179
Alignment:
Q  35 tatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaactatg--- 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||          |||| ||||       
T  51642423 tatatatgtatgttcgttctatatgtaattgtgatgaatgtaagttgggatttaacttaatgatatgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatggac 51642324  T
Q  122 ------taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatct 211  Q
          ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||    
T  51642323 aatttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttct 51642224  T
Q  212 tgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  51642223 tgtttatgatcgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttg 51642179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 11506726 - 11506831
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11506726 tttatgttttgaaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatggatttaatataatgatgt 11506825  T
Q  101 gtaatg 106  Q
    ||||||    
T  11506826 gtaatg 11506831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6187099 - 6186995
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  6187099 tttatgtttagcaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaaatgcgtagaatgtcagtagagatttaatttaatgatat 6187000  T
Q  101 gtaat 105  Q
    |||||    
T  6186999 gtaat 6186995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 50278593 - 50278722
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||    
T  50278593 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttcaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaataattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgtccgag 50278692  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  50278693 tttcaatgttgtatagattattttgccttt 50278722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37016201 - 37016072
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  37016201 tgatgaatttcaaacgtttctgtaatttgaatcaaacgtcagtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 37016102  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37016101 tttcaatgatgtatgaattgttttgccttt 37016072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 30043055 - 30043166
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| | | | |||||| |  || ||||| |||||| ||| |    
T  30043055 tttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatttgtattttcgttccatttgcaacttcatagaatgtcaccagagatttcatttaacgatat 30043154  T
Q  101 gtaatgagttgt 112  Q
    |||||| |||||    
T  30043155 gtaatgtgttgt 30043166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6186959 - 6186878
Alignment:
Q  122 taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| | | |||||||||    
T  6186959 taatgttttgatgaatttcaaacatacgtgtaattttaacgaaatgtcggattgatttaattattgactactataaaagata 6186878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Original strand, 30043194 - 30043275
Alignment:
Q  122 taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata 203  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||   | ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30043194 taatgttttgataaatttcaaacatccgtgtaattttaactctacgtcggattgatttaattatggataattgtaaaagata 30043275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 31598931 - 31598816
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| | || |||||| |  ||||  ||||| |||||| ||||| ||||| || ||||| | |    
T  31598931 tttatgtttagacatatggttgaaaataatatattatatatttgtggtcgttctaactgcatgtgcgtagaatgtcagtagagatttcatataatgttat 31598832  T
Q  101 gtaatgagttgtttaa 116  Q
    ||||||||||| ||||    
T  31598831 gtaatgagttgcttaa 31598816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 4958 - 5227
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4958 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 5057  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatggaca 190  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  5058 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttcatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaaca 5157  T
Q  191 attgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5158 attgtaaaagatattgtatttatcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatgaattatttagcctttg 5227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29286643 - 29286375
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29286643 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagaggtttaatttaatgatgt 29286544  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29286543 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 29286444  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  29286443 ttgtaaaagatattgtatttttcttgtttaagaccgagtttcaacgttgtatgatttatattgcctttg 29286375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 31150697 - 31150965
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31150697 tttatgttttagaatatggtggaagataatatattatatatgtatgtttgatcgatatgcaattgcgttgaatgtatgtagggatttaatttaatgatgt 31150796  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg---------taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||| ||||         ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31150797 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattggaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 31150896  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31150897 ttgtaaaagatattgtatttaccttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 31150965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 25140737 - 25141006
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatata-tgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25140737 tttatgtttcggaatatggtgaaagataatatattatataatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatg 25140836  T
Q  100 tgtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggaca 190  Q
    ||||||||||||||||         ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25140837 tgtaatgagttgtttaattatggacactttgtaacgtgttgatgaatttcaaacgtttgtttaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggaca 25140936  T
Q  191 attgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||| |||||    ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25140937 attgtaaatgatattgtatttttcttgtttatggccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttg 25141006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1608735 - 1608491
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608735 tttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 1608636  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    ||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1608635 gtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 1608536  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaat 232  Q
    |||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1608535 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 1608491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13383082 - 13382800
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13383082 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 13382983  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgt--------------tttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaat 177  Q
    | ||||||| |||||         ||| ||||||||              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13382982 gcaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaat 13382883  T
Q  178 ttaattatggacaattgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13382882 ttaattatgaacaattgtaaaagatattgtagttatctttattatgtccgagtttcaaacttgtatgaattattttgcctttg 13382800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 18609865 - 18610133
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18609865 tttatgtttcggaatatggtggaaaattatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgt 18609964  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||||||||||||         ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18609965 gtaatgagttgtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattcgaaccagatgtcggtttgatttaattatggacaa 18610064  T
Q  192 ttgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18610065 ttgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 18610133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23959331 - 23959063
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23959331 tttatgtttcggaatatggtgtaagataatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 23959232  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    |||||| ||||||||         |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23959231 gtaatgtgttgtttaattatggacactatgtaacattttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaacaa 23959132  T
Q  192 ttgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||| ||||| |||    |||||||||| | |||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  23959131 ttgtaaaaaatattgtattttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcctttg 23959063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 29667455 - 29667733
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29667455 tttatgtttcggaatatggtggaagttaatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 29667554  T
Q  101 gtaatga----------gttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 181  Q
    |||||||          ||||||||         ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29667555 gtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatggacactgtgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaa 29667654  T
Q  182 ttatggacaattgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| | |||||| || ||||||| | |||| |||||||||    
T  29667655 ttatggacaattgtaaaagatattgtattttacttgtttatgactgagtttaaaagttgtataagttatattgcctttg 29667733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Original strand, 18351348 - 18351543
Alignment:
Q  74 gtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaactatg---------taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaa 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18351348 gtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaataagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaa 18351447  T
Q  165 atgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18351448 atgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 18351543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2051482 - 2051362
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2051482 tttatgtttcgaaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 2051383  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  2051382 gtaatgagttgtttaattatg 2051362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 7537641 - 7537521
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7537641 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcatttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 7537542  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    | ||||| |||||||| ||||    
T  7537541 gcaatgatttgtttaattatg 7537521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34230921 - 34230709
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  34230921 tttatgttttagaatatggtagaagataatatattatatatgtatgttcgttccatctgcaactgtgtagaatgttagtagagatttaatttaacgatgt 34230822  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg---------taatgttttgatgaatttcaaa-cctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggaca 190  Q
    |||||| ||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34230821 gtaatgtgttgtttaattatggacactctttaatgttttgatgaatttcaaagcattcatgtaattttaacgaaatgtcggtttgatttaattatagaca 34230722  T
Q  191 attgtaaaagata 203  Q
    |||||||||||||    
T  34230721 attgtaaaagata 34230709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7537499 - 7537359
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  7537499 tgtaatgtttagatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtt 7537400  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7537399 tatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 7537359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 28362349 - 28362464
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28362349 tttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgatcgatatgcaattgtgtagaatgtatgtagggatttaatttaatgatgt 28362448  T
Q  101 gtaatgagttgtttaa 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  28362449 gtaatgagttgtttaa 28362464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 31771510 - 31771639
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||    
T  31771510 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaaaatattgtatttttcttgtttatgtccgag 31771609  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31771610 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 31771639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 3502434 - 3502563
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| || ||    
T  3502434 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatggccaag 3502533  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3502534 tttcaatgttgtatgaattgttttgccttt 3502563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Original strand, 11840022 - 11840150
Alignment:
Q  132 atgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgagtt 227  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||    
T  11840022 atgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgttcgagtt 11840121  T
Q  228 tcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840122 tcaatgttgtatgaattattttgcctttg 11840150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2259525 - 2259338
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |    
T  2259525 tttatgtttcgaaatatggtggaaaataatatattatatatgcatgtttgttccatatgcaa-tacgttgaatgtaagtaaggatttaatttaataagtt 2259427  T
Q  101 gtaatgagttgttta---------actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaattta 180  Q
    |||||| ||||||||         ||||||||| |||||||||||||||||   |||||  | ||| |||||||||||||||| |||||    
T  2259426 gtaatgtgttgtttaattatggacactatgtaacgttttgatgaatttcaacattttgtgcattttgaaccaaatgtcggtttcattta 2259338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 26702472 - 26702611
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  26702472 tgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggttt-atttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtt 26702570  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  26702571 tatgaccgaatttctatgttgtatgatttatactgcctttg 26702611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2051334 - 2051200
Alignment:
Q  126 gttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtc 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    ||| ||||| |||||      
T  2051334 gttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgtatttttcttggttatgat 2051235  T
Q  222 cgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2051234 cgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 2051200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 28362491 - 28362631
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    ||| |||||||    
T  28362491 tgtaacgttttgttgaatttcaatcggttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattttagacaactgtaaaagatattgtatttttcttgtt 28362590  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||    
T  28362591 tatgaccgagtttcaatgttatatgatttatattacctttg 28362631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 20448420 - 20448630
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| || || ||||||   |||  |||| || ||||||| |    
T  20448420 tttatgtttaggtatatgttg-aagataatatattatatatgtgtgtttgttacatttgcaaatgtgtagaatgtcgatagatattttatgtaatgatat 20448518  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg---------taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaa 191  Q
    | |||| ||||||||| ||||         ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20448519 gaaatgtgttgtttaattatggacactctttaatgtttttatgaatttcaaacattcctctaattttaacgaaatgtcggattgatttaattatggacaa 20448618  T
Q  192 ttgtaaaagata 203  Q
     |||||||||||    
T  20448619 ctgtaaaagata 20448630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19129291 - 19129204
Alignment:
Q  116 actatgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||| ||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19129291 actatttaatgttttgatgaatttcaaacattcgtgtaatttcaacgaaatgtcagattgatttaattatggacaactgtaaaagata 19129204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Original strand, 20439767 - 20439848
Alignment:
Q  122 taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20439767 taatgttttcatgaatttcaaacattcctgtaattttaacaaaatgtcggattgatttaattatggacaactgtaaaagata 20439848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2258540 - 2258458
Alignment:
Q  178 ttaattatggacaattgtaaaagatattttat----cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  2258540 ttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgactgagtttaaatgttgtatgagttatattgcctttg 2258458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8304711 - 8304667
Alignment:
Q  159 aaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8304711 aaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagata 8304667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Original strand, 20436059 - 20436140
Alignment:
Q  122 taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||  ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20436059 taatgttttcatgaatttcaaacattcatgtaattttaataaaatgtcggattgatttaatcatggacaactgtaaaagata 20436140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8602 - 8372
Alignment:
Q  39 tatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaactatg---------taatgttt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||    
T  8602 tatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgtaatgttt 8503  T
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatatt----ttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||    
T  8502 tgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgttggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttgattatgcccgag 8403  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8402 tttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 8372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22713 - 22574
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |    
T  22713 tgtaatgttttgatgaatttcaa-cgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgat 22615  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22614 tatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttg 22574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22855 - 22735
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22855 tttatgtttcagaatatggtggaaaatattatattatatatgtatgttcgttccatttgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 22756  T
Q  101 gtaatgagttgtttaactatg 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  22755 gtaatgagttgtttaattatg 22735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 19743 - 19849
Alignment:
Q  15 tatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgttt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19743 tatggtggaagataatatattatatatgtatgctcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagttgttt 19842  T
Q  115 aactatg 121  Q
    || ||||    
T  19843 aattatg 19849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 19871 - 20011
Alignment:
Q  120 tgtaatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtt 215  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  19871 tgtaacgttttgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtt 19970  T
Q  216 tatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19971 tatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 20011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22053 - 21865
Alignment:
Q  36 atatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgag----------ttgtttaactatg---- 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          |||||||| ||||        
T  22053 atatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatggaca 21954  T
Q  122 -----taatgttttgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatatt 205  Q
         ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21953 ctttttaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatatt 21865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12706 - 12581
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  12706 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttaaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 12607  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgc 251  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12606 tttcaatgttgtatgaattgttttgc 12581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 236006 - 236135
Alignment:
Q  130 tgatgaatttcaaacctttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat----tttatcttgtttatgtccgag 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||    
T  236006 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtctgag 236105  T
Q  226 tttcaatgttgtatgaattattttgccttt 255  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  236106 tttcaatattgtatgaattgttttgccttt 236135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0794 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0794
Description:

Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 1383 - 1488
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgt 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1383 tttatgttttgaaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatggatttaatataatgatgt 1482  T
Q  101 gtaatg 106  Q
    ||||||    
T  1483 gtaatg 1488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 10896 - 10978
Alignment:
Q  1 tttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggg 83  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10896 tttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatttgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggg 10978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 256
Target Start/End: Original strand, 1537 - 1584
Alignment:
Q  209 tcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttg 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1537 tcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttg 1584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University