View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20071_low_11 (Length: 501)

Name: NF20071_low_11
Description: NF20071
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20071_low_11
NF20071_low_11
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (1-485)||(8768134-8768618)
chr5 (277-485)||(3010544-3010752)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (1-485)||(7561934-7562418)
chr2 (9-485)||(6352687-6353157)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (9-485)||(14242137-14242607)
chr4 (1-236)||(29606869-29607099)
chr4 (1-197)||(29607107-29607298)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (103-479)||(24225989-24226362)
chr8 (4-65)||(24225896-24225957)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (88-480)||(17216621-17217009)
chr1 (81-480)||(17216110-17216498)
chr1 (25-65)||(17216562-17216602)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (400-480)||(424850-424929)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8768618 - 8768134
Alignment:
Q  1 ttgttttgtgttgattctgtttgtatgattattgccgtatcaaaattaaagcatcaactgaattannnnnnnnnnnnnctttctttcagattttcgttcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||    
T  8768618 ttgttttgtgttgattctgtttgtatgattattgccgtatcaaaattaaagcatcaactgaattatttttatttttgtctttctttcagattttcgttcc 8768519  T
Q  101 tattaacgatcagggggtgcactggtatctcatggtcgtcgacttttcagaaagaaagttgatggtgttagactctttgccttgtcttgaaagaaattac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8768518 tattaacgatcagggggtgcactggtatctcatggtcgtcgacttttcagaaagaaagttggtggtgttagactctttgccttgtcttgaaagaaattac 8768419  T
Q  201 ataagacaacgggaggttttgaagctggtatgtatccgacatgtttgttactttataacttattattatgcttatgttactaaggtttgtaacttattgc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8768418 ataagacaacgggaggttttgaagctggtatgtatcctacatgtttgttactttataacttattattatgcttatgttactaaggtttgtaacttattgc 8768319  T
Q  301 agggtatatttattgaggagatgctgagtattgattctgttgttgataatgtggattcaaccaactcaatatcaaacttttgtttaatttcacctagagc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8768318 agggtatatttattgaggagatattgagtattgattctgttgttgataatgtggattcaaccaactcattatcaaacttttgtttaatttcacctagagc 8768219  T
Q  401 ctttccaacacagcgcaccggatcgtatatctcattcgttatactttgtttatttctatttttaatctatggttgttgtcagagt 485  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8768218 ccttccaacacagcgcaccggatcgtatatctcattcattatactttgtttatttctatttttaatctatggttgttgtcagagt 8768134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 277 - 485
Target Start/End: Original strand, 3010544 - 3010752
Alignment:
Q  277 ttactaaggtttgtaacttattgcagggtatatttattgaggagatgctgagtattgattctgttgttgataatgtggattcaaccaactcaatatcaaa 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3010544 ttactaaggtttgtaacttattgcagggtatttttattgaggaaatattgagtattgattctgttgttgatgatgtggattcatccaattcaatatcaaa 3010643  T
Q  377 cttttgtttaatttcacctagagcctttccaacacagcgcaccggatcgtatatctcattcgttatactttgtttatttctatttttaatctatggttgt 476  Q
    ||||||| |||||  ||||||| || |||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3010644 cttttgtataattcaacctagatcccttccaacagagtgcactggatcgtatttctcattcattatactttgtttatttctatttttaatctatggttgt 3010743  T
Q  477 tgtcagagt 485  Q
    |||||||||    
T  3010744 tgtcagagt 3010752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Original strand, 7561934 - 7562418
Alignment:
Q  1 ttgttttgtgttgattctgtttgtatgattattgccgtatcaaaattaaagcatcaactgaattannnnnnnnnnnnnctttctttcagattttcgttcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||    
T  7561934 ttgttttgtgttgattctgtttgtatgattattgccgtatcaaaattaaagcatcaactgaattatttttatttttatctttctttcagattttcgttcc 7562033  T
Q  101 tattaacgatcagggggtgcactggtatctcatggtcgtcgacttttcagaaagaaagttgatggtgttagactctttgccttgtcttgaaagaaattac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7562034 tattaacgatcagggggtgcactggtatctcatggtcgtcgacttttcagaaagaaagttggtggtgttagactctttgccttgtcttgaaagaaattac 7562133  T
Q  201 ataagacaacgggaggttttgaagctggtatgtatccgacatgtttgttactttataacttattattatgcttatgttactaaggtttgtaacttattgc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7562134 ataagacaacgggaggttttgaagctggtatgtatcctacatgtttgttactttataacttattattatgcttatgttactaaggtttgtaacttattgc 7562233  T
Q  301 agggtatatttattgaggagatgctgagtattgattctgttgttgataatgtggattcaaccaactcaatatcaaacttttgtttaatttcacctagagc 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7562234 aggatatatttattgaggagatattgagtattgattctgttgttgataatgtggattcaaccaactcattatcaaacttttgtttaatttcacctagagc 7562333  T
Q  401 ctttccaacacagcgcaccggatcgtatatctcattcgttatactttgtttatttctatttttaatctatggttgttgtcagagt 485  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7562334 cattccaacacagcgcaccggatcgtatatctcattcattatactttgtttatttctatttttaatctatggttgttgtcagagt 7562418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Original strand, 6352687 - 6353157
Alignment:
Q  9 tgttgattctgtttgtatgattattgccgtatcaaaattaaagcatcaactgaattannnnnnnnnnnnnctttctttcagattttcgttcctattaacg 108  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||              |||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  6352687 tgtttattctgtttctatgattattgccatatcaaaattaaagcatcaactgaattattttttta------tttcattcaaattttcattcctgttaacg 6352780  T
Q  109 atcagggggtgcactggtatctcatggtcgtcgacttttcagaaagaaagttgatggtgttagactctttgccttgtcttgaaagaaattacataagaca 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  6352781 atcaaggggtgcactggtatctcatggtcgtcgatgttatggaaagaaagatggtgttgttagactctttgccttgtcctgaaagaaattacttaagacg 6352880  T
Q  209 acgggaggttttgaagctggtatgtatccgacatgtttgttactttataacttattattatgcttatgttactaaggtttgtaacttattgcagggtata 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||     
T  6352881 tcgggaggttttgaagctggtatgtatcctacatgtttgttactttataacttattattatgcttatgttactaagaattgtaatttattgcagggtatt 6352980  T
Q  309 tttattgaggagatgctgagtattgattctgttgttgataatgtggattcaaccaactcaatatcaaacttttgtttaatttcacctagagcctttccaa 408  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| |||  |||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || ||||||    
T  6352981 tttattgaggaaatgttgagtaatgattatgttgttcatggtgtggattcatccatttcaatatcaaacttctgtataattcaacctagatcccttccaa 6353080  T
Q  409 cacagcgcaccggatcgtatatctcattcgttatactttgtttatttctatttttaatctatggttgttgtcagagt 485  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6353081 cacagcgcattggatcgtaattctcattcattatactttgtttatttctatttttaatctatggttgttgtcagagt 6353157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Original strand, 14242137 - 14242607
Alignment:
Q  9 tgttgattctgtttgtatgattattgccgtatcaaaattaaagcatcaactgaattannnnnnnnnnnnnctttctttcagattttcgttcctattaacg 108  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  14242137 tgtttattctgtttctatgattattgccatatcaaaattaaagcatcaactgaattattttttta------tttcattcagattttcattcctgttaacg 14242230  T
Q  109 atcagggggtgcactggtatctcatggtcgtcgacttttcagaaagaaagttgatggtgttagactctttgccttgtcttgaaagaaattacataagaca 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  14242231 atcaaggggtgcactggtatctcatggtcgtcgatgttatggaaagaaagatggtgttgttagactctttgccttgtcctgaaagaaattacttaagacg 14242330  T
Q  209 acgggaggttttgaagctggtatgtatccgacatgtttgttactttataacttattattatgcttatgttactaaggtttgtaacttattgcagggtata 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||     
T  14242331 tcgggaggttttgaagctggtatgtatcctacatgtttgttactttataacttattattatgcttatgttactaagaattgtaatttattgcagggtatt 14242430  T
Q  309 tttattgaggagatgctgagtattgattctgttgttgataatgtggattcaaccaactcaatatcaaacttttgtttaatttcacctagagcctttccaa 408  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| |||  |||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || ||||||    
T  14242431 tttattgaggaaatgttgagtaatgattatgttgttcatggtgtggattcatccatttcaatatcaaacttctgtataattcaacctagatcccttccaa 14242530  T
Q  409 cacagcgcaccggatcgtatatctcattcgttatactttgtttatttctatttttaatctatggttgttgtcagagt 485  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14242531 cacagcgcattggatcgtaattctcattcattatactttgtttatttctatttttaatctatggttgttgtcagagt 14242607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 29606869 - 29607099
Alignment:
Q  1 ttgttttgtgttgattctgtttgtatgattattgccgtatcaaaattaaagcatcaactgaattannnnnnnnnnnnnctttctttcagattttcgttcc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||             | ||||| ||||||||| ||||    
T  29606869 ttgttttatgttgattatgtttgaatgattattgtcacatcaaaattaaagcatcaactgaattatgcttttc-----cattcttacagattttcattcc 29606963  T
Q  101 tattaacgatcagggggtgcactggtatctcatggtcgtcgacttttcagaaagaaagttgatggtgttagactctttgccttgtcttgaaagaaattac 200  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29606964 tgttaacgatcaaggggtgcattggtatctcatggtcgtcgatattatagaaagaaagttggtgttgttagactctttgccttgtgttgaaagaaattac 29607063  T
Q  201 ataagacaacgggaggttttgaagctggtatgtatc 236  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  29607064 ctaagacgtcgggaggttttgaagctggtgtgtatc 29607099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29607298 - 29607107
Alignment:
Q  1 ttgttttgtgttgattctgtttgtatgattattgccgtatcaaaattaaagcatcaactgaattannnnnnnnnnnnnctttctttcagattttcgttcc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||             | ||||| ||||||||| ||||    
T  29607298 ttgttttatgttgattatgtttgaatgattattgtaacatcaaaattaaagcatcaactgaattatgcttttc-----cattcttacagattttcattcc 29607204  T
Q  101 tattaacgatcagggggtgcactggtatctcatggtcgtcgacttttcagaaagaaagttgatggtgttagactctttgccttgtcttgaaagaaat 197  Q
    | |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29607203 tgttaacgatcaaggggtgcattggtatctcatggttgtcgatattatagaaagaaagttggtgttgttagactctttgccttgtcatgaaagaaat 29607107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 103 - 479
Target Start/End: Original strand, 24225989 - 24226362
Alignment:
Q  103 ttaacgatcagggggtgcactggtatctcatggtcgtcgacttttcagaaagaaagttgatggtgttagactctttgccttgtcttgaaagaaattacat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  24225989 ttaacgatcaaggggtgcactggtatctcatggccatcgatgttttagaaagaaagttggtgttgttagactctttgccttgtcctaaaagaaattacct 24226088  T
Q  203 aagacaacgggaggttttgaagctggtatgtatccgacatgtttgttactttataacttattattatgcttatgttactaaggtttgtaacttattgcag 302  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24226089 aacacgtcgggaggttttgaagctggtatgtatcctacatgtttgttactttataacttattattatgcttatgttactaaggtttgtaatttattgtag 24226188  T
Q  303 ggtatatttattgaggagatgctgagtattgattctgttgttgataatgtggattcaaccaactcaatatcaaacttttgtttaatttcacctagagcct 402  Q
    | ||| | ||||||| | ||  | |||||||| ||| ||| ||   ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| || ||  | | ||| ||     
T  24226189 gctatttctattgagaaaatattaagtattgaatctattggtg---atgtgaattcatccaattcaatatcaaacttctgtatagttcaatcaagatccc 24226285  T
Q  403 ttccaacacagcgcaccggatcgtatatctcattcgttatactttgtttatttctatttttaatctatggttgttgt 479  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24226286 ttccaacacaatgcactggatcgtaattttcattcattatactttgtttatttatatttttaatctatggttgttgt 24226362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Original strand, 24225896 - 24225957
Alignment:
Q  4 ttttgtgttgattctgtttgtatgattattgccgtatcaaaattaaagcatcaactgaatta 65  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  24225896 ttttatgttgattttgtttgaatgattattgccacatcaaagttaaagcatcaactaaatta 24225957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 88 - 480
Target Start/End: Original strand, 17216621 - 17217009
Alignment:
Q  88 agattttcgttcctattaacgatcagggggtgcactggtatctcatggtcgtcgacttttcagaaagaaagttgatggtgttagactctttgccttgtct 187  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  17216621 agattttcattccagttaacgatcaaggggtgcactggtatctcatggtcgtcgatattttagaaagaaagttgatgtggttagactccttgtcttgtcc 17216720  T
Q  188 tgaaagaaattacataagacaacgggaggttttgaagctggtatgtatccgacatgtttgttactttataacttattattatgcttatgttactaaggtt 287  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||   |||||||||| | || ||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17216721 tgaaagaaattacctaagacgtcgtatggttttgaag-ttgtgtgtatcctacattctatttactttataacttattattatgcttatattactaaggtt 17216819  T
Q  288 tgtaacttattgcagggtatatttattgaggagatgctgagtattgattctgttgttgataatgtggattcaaccaactcaatatcaaacttttgtttaa 387  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||| || ||| ||| ||| ||   ||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||  ||    
T  17216820 tgtaatttattgcaggctatttttattgaggaaatattgaataatgaatctattggtg---atgtgaactcatccaattcaatatcaaacttttgtacaa 17216916  T
Q  388 tttcacctagagcctttccaacacagcgcaccggatcgtatatctcattcgttatactttgtttatttctatttttaatctatggttgttgtc 480  Q
    ||  ||| ||  || |||||||| ||||||  |||| | |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17216917 ttcaaccaagttcccttccaacaaagcgcaatggattgaaattctcattcattatactttgtttattactatttttaatttatggttgttgtc 17217009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 17216498 - 17216110
Alignment:
Q  81 ttctttcagattttcgttcctattaacgatcagggggtgcactggtatctcatggtcgtcgacttttcagaaagaaagttgatggtgttagactctttgc 180  Q
    ||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  17216498 ttcttacatattttcattcctgttaacgatcaaggggtgcactggtatctcatggtcgtcgatattttagaaagaaagttggtgctgttagactccttgc 17216399  T
Q  181 cttgtcttgaaagaaattacataagacaacgggaggttttgaagctggtatgtatccgacatgtttgttactttataacttattattatgcttatgttac 280  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||  |    | |||||||||       ||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17216398 cttgtcgtgaaagaaattacctaaaacgtcatatgattttgaagc-------tatccgacattctatttacattataacttattattatgcttatattac 17216306  T
Q  281 taaggtttgtaacttattgcagggtatatttattgaggagatgctgagtattgattctgttgttgataatgtggattcaaccaactcaatatcaaacttt 380  Q
     ||||||||||| | |||||| | ||| | ||||||||| ||  ||| || ||| ||| ||| ||   ||||| | ||| |||| ||||||||||||||     
T  17216305 aaaggtttgtaattgattgcaagctatttctattgaggaaatattgaataatgaatctattggtg---atgtgaactcatccaattcaatatcaaacttc 17216209  T
Q  381 tgtttaatttcacctagagcctttccaacacagcgcaccggatcgtatatctcattcgttatactttgtttatttctatttttaatctatggttgttgtc 480  Q
    ||| |||||  ||| ||  || || ||||||| ||||  |||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17216208 tgtataattcaaccaagttcccttacaacacaacgcaatggatcgaat-tctcattcattaaactttgtttatttctatttttaatttatgattgttgtc 17216110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 65
Target Start/End: Original strand, 17216562 - 17216602
Alignment:
Q  25 atgattattgccgtatcaaaattaaagcatcaactgaatta 65  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17216562 atgataattgccacatcaaaattaaagcatcaactgaatta 17216602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 424929 - 424850
Alignment:
Q  400 cctttccaacacagcgcaccggatcgtatatctcattcgttatactttgtttatttctatttttaatctatggttgttgtc 480  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  424929 cctttccaacacggcgcattggatcgtaattctcattcattatactttgtttatttct-gttttcatttatggttgttgtc 424850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University