View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20090_low_5 (Length: 468)

Name: NF20090_low_5
Description: NF20090
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20090_low_5
NF20090_low_5
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (8-458)||(5165041-5165491)
chr6 (8-457)||(25942203-25942652)
chr6 (8-457)||(13879273-13879722)
chr6 (8-457)||(17694049-17694498)
chr6 (8-311)||(22350169-22350470)
chr6 (319-457)||(22351363-22351501)
chr6 (15-152)||(33331247-33331384)
chr6 (15-152)||(14738373-14738510)
chr6 (15-150)||(9035448-9035583)
chr6 (55-139)||(16553567-16553651)
chr6 (55-139)||(16630123-16630207)
chr6 (55-139)||(34165775-34165859)
chr6 (55-142)||(5408262-5408349)
chr6 (55-142)||(5412587-5412674)
chr6 (55-142)||(26067631-26067718)
chr6 (216-309)||(9035648-9035740)
chr6 (55-143)||(12158206-12158294)
chr6 (55-139)||(16651828-16651912)
chr6 (55-142)||(33309845-33309932)
chr6 (55-141)||(30444250-30444336)
chr6 (55-139)||(16567877-16567961)
chr6 (51-143)||(25462698-25462790)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (8-457)||(25351886-25352335)
chr7 (8-457)||(44015863-44016312)
chr7 (8-457)||(7070329-7070778)
chr7 (15-457)||(25405948-25406390)
chr7 (15-457)||(3323992-3324434)
chr7 (15-151)||(18412807-18412943)
chr7 (15-151)||(21988069-21988205)
chr7 (15-151)||(5817987-5818124)
chr7 (15-152)||(16884076-16884213)
chr7 (15-152)||(24262124-24262261)
chr7 (15-152)||(12405486-12405623)
chr7 (15-151)||(21645174-21645310)
chr7 (15-151)||(49090826-49090962)
chr7 (55-142)||(48490293-48490380)
chr7 (33-151)||(9185959-9186077)
chr7 (55-139)||(6593726-6593810)
chr7 (55-139)||(18391364-18391448)
chr7 (55-143)||(13289735-13289823)
chr7 (55-142)||(1048525-1048612)
chr7 (55-142)||(6047449-6047536)
chr7 (55-142)||(7093697-7093784)
chr7 (55-142)||(7350887-7350974)
chr7 (55-142)||(22135768-22135855)
chr7 (36-79)||(23083723-23083766)
chr7 (55-130)||(31157521-31157596)
chr7 (55-142)||(38394949-38395036)
chr7 (55-142)||(40550795-40550882)
chr7 (55-142)||(47675330-47675417)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (8-457)||(20053958-20054407)
chr2 (8-457)||(22716431-22716880)
chr2 (8-457)||(2736739-2737188)
chr2 (15-457)||(39680580-39681022)
chr2 (9-458)||(28456701-28457151)
chr2 (8-130)||(17932982-17933104)
chr2 (249-415)||(10941949-10942115)
chr2 (249-415)||(10947818-10947984)
chr2 (15-152)||(19348426-19348563)
chr2 (15-151)||(25402799-25402935)
chr2 (15-144)||(10446246-10446375)
chr2 (55-142)||(35217206-35217293)
chr2 (55-142)||(36560377-36560464)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (8-457)||(22625177-22625626)
chr3 (8-456)||(47882086-47882534)
chr3 (8-457)||(10611975-10612424)
chr3 (8-457)||(10897539-10897988)
chr3 (8-457)||(29913153-29913602)
chr3 (8-453)||(54189048-54189493)
chr3 (8-457)||(10204889-10205338)
chr3 (8-457)||(16458000-16458448)
chr3 (15-457)||(6303845-6304287)
chr3 (56-457)||(10098041-10098442)
chr3 (15-151)||(16263512-16263648)
chr3 (15-152)||(8516243-8516380)
chr3 (15-152)||(32479489-32479626)
chr3 (15-151)||(28489976-28490112)
chr3 (55-142)||(29811757-29811844)
chr3 (43-139)||(10210092-10210188)
chr3 (55-142)||(7763159-7763246)
chr3 (33-144)||(9602655-9602766)
chr3 (55-142)||(27421573-27421660)
chr3 (15-151)||(3324350-3324486)
chr3 (55-139)||(4599912-4599996)
chr3 (55-139)||(9635316-9635400)
chr3 (55-139)||(10057136-10057220)
chr3 (55-139)||(10059358-10059442)
chr3 (55-139)||(10061580-10061664)
chr3 (55-139)||(10063802-10063886)
chr3 (55-139)||(10066024-10066108)
chr3 (55-142)||(4309746-4309833)
chr3 (55-142)||(18098407-18098494)
chr3 (55-142)||(43227012-43227099)
chr3 (55-144)||(5192814-5192903)
chr3 (16-85)||(20630996-20631065)
chr3 (55-136)||(23199331-23199412)
chr3 (55-139)||(5259515-5259599)
chr3 (55-142)||(5192585-5192672)
chr3 (55-142)||(5898344-5898431)
chr3 (55-142)||(6065029-6065116)
chr3 (55-142)||(32891978-32892065)
chr3 (55-142)||(37407577-37407664)
chr3 (55-137)||(6717406-6717488)
chr3 (66-139)||(22834212-22834285)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (8-457)||(33033175-33033623)
chr8 (15-457)||(16756465-16756907)
chr8 (15-457)||(28328442-28328884)
chr8 (8-457)||(28891298-28891747)
chr8 (15-454)||(15945189-15945634)
chr8 (127-457)||(21034402-21034732)
chr8 (45-340)||(4819474-4819769)
chr8 (8-91)||(26269504-26269587)
chr8 (15-151)||(18853965-18854101)
chr8 (15-152)||(10685065-10685202)
chr8 (15-152)||(35744539-35744676)
chr8 (15-151)||(26300487-26300623)
chr8 (55-143)||(31577530-31577618)
chr8 (15-151)||(23800319-23800455)
chr8 (43-139)||(41366174-41366270)
chr8 (55-142)||(15069578-15069665)
chr8 (55-143)||(17848536-17848624)
chr8 (55-142)||(4732546-4732633)
chr8 (55-142)||(27827996-27828083)
chr8 (55-142)||(34255698-34255785)
chr8 (55-142)||(43080613-43080700)
chr8 (16-142)||(28314855-28314981)
chr8 (66-139)||(5591776-5591849)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (8-457)||(9522259-9522708)
chr1 (8-457)||(2400422-2400871)
chr1 (8-458)||(14997570-14998018)
chr1 (15-152)||(41397388-41397525)
chr1 (15-151)||(19359640-19359776)
chr1 (55-135)||(3805367-3805447)
chr1 (43-142)||(27338357-27338456)
chr1 (43-142)||(28222602-28222701)
chr1 (15-103)||(9024649-9024737)
chr1 (15-151)||(47099620-47099756)
chr1 (55-130)||(8348307-8348382)
chr1 (57-136)||(13126975-13127054)
chr1 (55-142)||(16227124-16227211)
chr1 (55-142)||(28202936-28203022)
chr1 (55-142)||(28841378-28841465)
chr1 (55-142)||(31658092-31658179)
chr1 (55-142)||(47178318-47178405)
chr1 (55-142)||(51750993-51751080)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (8-457)||(16859-17308)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (8-457)||(15312852-15313301)
chr4 (8-458)||(16633023-16633473)
chr4 (231-457)||(4558842-4559068)
chr4 (8-130)||(4559067-4559189)
chr4 (15-151)||(5147050-5147186)
chr4 (15-103)||(21549539-21549627)
chr4 (33-152)||(9225205-9225324)
chr4 (55-139)||(5136983-5137067)
chr4 (55-139)||(7123599-7123683)
chr4 (55-139)||(8394309-8394393)
chr4 (43-142)||(4588840-4588939)
chr4 (55-138)||(5206856-5206939)
chr4 (63-142)||(5872703-5872782)
chr4 (55-142)||(22781973-22782060)
chr4 (15-130)||(38983911-38984026)
chr4 (55-142)||(52094555-52094642)
chr4 (55-136)||(12740925-12741006)
chr4 (55-136)||(12749131-12749212)
chr4 (35-151)||(18241541-18241656)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (8-458)||(10627892-10628342)
chr5 (8-457)||(25446021-25446470)
chr5 (8-458)||(31781658-31782109)
chr5 (8-312)||(28788401-28788705)
chr5 (313-454)||(28786936-28787077)
chr5 (15-152)||(27448971-27449108)
chr5 (15-152)||(31397793-31397930)
chr5 (15-152)||(33790464-33790601)
chr5 (15-152)||(37557425-37557562)
chr5 (15-151)||(24556387-24556523)
chr5 (15-151)||(24597419-24597555)
chr5 (43-142)||(13694322-13694421)
chr5 (15-152)||(43596270-43596407)
chr5 (15-152)||(43629064-43629201)
chr5 (55-139)||(16408226-16408310)
chr5 (55-139)||(16545331-16545415)
chr5 (55-139)||(29721266-29721350)
chr5 (55-139)||(40381007-40381091)
chr5 (55-142)||(6746024-6746111)
chr5 (55-142)||(31543689-31543776)
chr5 (15-80)||(34841764-34841830)
chr5 (55-171)||(32584715-32584831)
chr5 (55-142)||(10750654-10750741)
chr5 (55-142)||(15356085-15356172)
chr5 (55-142)||(20505442-20505529)
chr5 (55-142)||(23666002-23666089)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (8-82)||(50404-50478)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (376-457)||(16601-16682)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (15-151)||(1656-1792)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (15-152)||(678-815)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (15-152)||(15110-15247)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (15-152)||(149756-149893)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (15-151)||(3996-4132)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (15-151)||(18741-18877)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (55-142)||(115491-115578)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (55-142)||(580-667)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (55-142)||(72753-72840)
[»] scaffold1908 (1 HSPs)
scaffold1908 (58-142)||(254-338)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (55-142)||(23082-23169)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 458
Target Start/End: Original strand, 5165041 - 5165491
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  5165041 tgagactttcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagatgcttgaactttctccaaagtgata 5165140  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5165141 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaaggatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttgcagattaa 5165240  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5165241 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgatccattataggttttgattccaccattcggtaaaagtagagttgttgttt 5165340  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5165341 cggacattgtctatgtgccaaggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgaaacc 5165440  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctca 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5165441 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctca 5165491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 25942652 - 25942203
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25942652 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 25942553  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  25942552 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 25942453  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25942452 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgttt 25942353  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  25942352 cagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacacc 25942253  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25942252 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgctttatcattcatctc 25942203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 13879722 - 13879273
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13879722 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 13879623  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  13879622 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 13879523  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  13879522 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgttt 13879423  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| |||||    
T  13879422 cagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacacc 13879323  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13879322 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgccttatcattcatctc 13879273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Original strand, 17694049 - 17694498
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17694049 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 17694148  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||    
T  17694149 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaagtctttatccttgtcttctagattaa 17694248  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17694249 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcgataaaagtagagttgttgttt 17694348  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||| | |||||||||  |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  17694349 cagacattttctatgtgccaaagacttggttatgtataattaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacacc 17694448  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17694449 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgctttatcattcatctc 17694498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 311
Target Start/End: Original strand, 22350169 - 22350470
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22350169 tgagacattaaagccttctccactatcatcaactttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 22350268  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
     || | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  22350269 atgccatctttgccataaatcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcatacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 22350368  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  22350369 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattatagg--ttgactccaccattcggtaaaagtagatttgttgtct 22350466  T
Q  308 caga 311  Q
    ||||    
T  22350467 caga 22350470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 319 - 457
Target Start/End: Original strand, 22351363 - 22351501
Alignment:
Q  319 tatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatccccaag 418  Q
    |||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  22351363 tatgtgccaaagatttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaag 22351462  T
Q  419 acaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22351463 acatagaatgatagcactgatcgctttatcattcatctc 22351501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33331384 - 33331247
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  33331384 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 33331285  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  33331284 ccttaccataaagaatggtatccttgaaatgctcaaag 33331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14738510 - 14738373
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| |||    
T  14738510 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagcagtgccct 14738411  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  14738410 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 14738373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Original strand, 9035448 - 9035583
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||  || |||||||||||||| || || ||| |||||||  ||||||  || ||||||||  |||| ||||    
T  9035448 ttcaagccttcaccaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggttaattccttggttttcaaagccacttgaaactcctccaaagtagtagtttcct 9035547  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaa 150  Q
    | || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  9035548 cctttccataaaggatgatatccttaaaattctcaa 9035583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16553651 - 16553567
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16553651 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16553567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16630207 - 16630123
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16630207 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16630123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 34165859 - 34165775
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34165859 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 34165775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 5408262 - 5408349
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  5408262 acttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttcttccaaggtgatagtgccttcttttccatagagcatggtatccttgaa 5408349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 5412587 - 5412674
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  5412587 acttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttcttccaaggtgatagtgccttcttttccatagagcatggtatccttgaa 5412674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 26067631 - 26067718
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  26067631 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 26067718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 309
Target Start/End: Original strand, 9035648 - 9035740
Alignment:
Q  216 ttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttca 309  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||   | |||||||| || |||||||| | | |  ||||||||||||||||||    
T  9035648 ttcgccaaatca-caagaatcttgttgaatttcgtcaattgctttgtgataggtttagactccaccatcttgaatcagtagagttgttgtttca 9035740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12158294 - 12158206
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaa 143  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||| || || || |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12158294 acttggtcaactccttggttctcaaagccgtttgaacatcttctaaggtgacagtgccttctttgccataaatcattgtatcctcgaaa 12158206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16651912 - 16651828
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||  |||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16651912 acttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16651828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 33309932 - 33309845
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  33309932 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 33309845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30444336 - 30444250
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttga 141  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||| | |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  30444336 acttggtcaactccttggttctcaaagccacttgaacttcttcctaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcgttga 30444250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16567961 - 16567877
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| | || | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16567961 acttggtcaacttcttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16567877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 143
Target Start/End: Original strand, 25462698 - 25462790
Alignment:
Q  51 ttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaa 143  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||| |||||||||||  |||| ||||||    
T  25462698 ttgaactcggtcaactccttggttctcaaagtcgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttaccataaagcatgatatctttgaaa 25462790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 25352335 - 25351886
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25352335 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 25352236  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  25352235 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 25352136  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25352135 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgttt 25352036  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  25352035 cagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacacc 25351936  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25351935 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgctttatcattcatctc 25351886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Original strand, 44015863 - 44016312
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44015863 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttagttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 44015962  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  44015963 gtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagaacttaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 44016062  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44016063 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccactattcggtaaaagtagagttgttgttt 44016162  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  44016163 cagacattgtctatgtgccaaggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacaatagtttcccttgctacctctctcaacacc 44016262  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44016263 ttatcccaaagacatagaatgatagaactgaccgctttatcattcatctc 44016312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 7070778 - 7070329
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7070778 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgata 7070679  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  7070678 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 7070579  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  7070578 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgttt 7070479  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||  |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| |||||    
T  7070478 cagacattgcctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacacc 7070379  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7070378 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgccttatcattcatctc 7070329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 25406390 - 25405948
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  25406390 ttcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccct 25406291  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctac 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  25406290 ctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctat 25406191  T
Q  215 gttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |     
T  25406190 gttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacac 25406091  T
Q  315 tgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatccc 414  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  25406090 tgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccc 25405991  T
Q  415 caagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25405990 caagacacagaatgatagcgctgaccgccttatcattcatctc 25405948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Original strand, 3323992 - 3324434
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  3323992 ttcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccct 3324091  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctac 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  3324092 ctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctat 3324191  T
Q  215 gttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |     
T  3324192 gttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacac 3324291  T
Q  315 tgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatccc 414  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| || ||| ||||||| ||||    
T  3324292 tgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctccctttatacttctctcaacaccttgtccc 3324391  T
Q  415 caagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3324392 caagacacagaatgatagcgctgaccgccttatcattcatctc 3324434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 18412807 - 18412943
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  18412807 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 18412906  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  18412907 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 18412943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 21988069 - 21988205
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||  ||||| |||    
T  21988069 ttcaagccttcaccaccttcatccaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacttccttcaaagtagtagtgccct 21988168  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  21988169 ctttaccataaaggatggtatccgtgaaatgctcaaa 21988205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 5818124 - 5817987
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  | ||| |||    
T  5818124 ttcaagccttcaccaccctcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttgtacctcctccaaagtagtggtgccct 5818025  T
Q  115 -ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
     |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  5818024 ccttttccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 5817987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 16884076 - 16884213
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  16884076 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 16884175  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  16884176 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 16884213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24262261 - 24262124
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  24262261 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 24262162  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  24262161 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 24262124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 12405486 - 12405623
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  12405486 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattttttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 12405585  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||  || ||||||||||||| |||||||    
T  12405586 ccttaccataaatgatggtatccttgaaatgctcaaag 12405623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 21645174 - 21645310
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  21645174 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 21645273  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||  || |||||||| |||| ||||||    
T  21645274 ccttaccataaatgatggtatccttaaaatgctcaaa 21645310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 49090826 - 49090962
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||  |||||||||| ||||| || || ||||||||  | ||| |||    
T  49090826 ttcaagtcttcaccaccttcatcaaccttcaagtcattgaacttggtcaattccttgtttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtggtgccct 49090925  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  49090926 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 49090962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 48490380 - 48490293
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48490380 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 48490293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9186077 - 9185959
Alignment:
Q  33 tcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattg 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||||||  ||||| |||| || |||||||| ||      
T  9186077 tcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggaccttctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatga 9185978  T
Q  133 tatccttgaaattctcaaa 151  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  9185977 tatccttgaaatgctcaaa 9185959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Original strand, 6593726 - 6593810
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6593726 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 6593810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Original strand, 18391364 - 18391448
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18391364 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 18391448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Original strand, 13289735 - 13289823
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaa 143  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  13289735 acttggtcaactccttggttctcaaagttgtttgaacttcttccaatgtgacagtgccttctttgccatagaacatggtatccatgaaa 13289823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 1048525 - 1048612
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1048525 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 1048612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6047536 - 6047449
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | || | ||||||||||| || || |||||||||||    
T  6047536 acttggtaaactcgttgattctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatatagaatggtatccttgaa 6047449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 7093697 - 7093784
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7093697 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 7093784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 7350887 - 7350974
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7350887 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 7350974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22135855 - 22135768
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22135855 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 22135768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 79
Target Start/End: Original strand, 23083723 - 23083766
Alignment:
Q  36 tcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaa 79  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083723 tcaaccttcaagttgttgaacttggttaactctttcgttctcaa 23083766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 130
Target Start/End: Original strand, 31157521 - 31157596
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcat 130  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| |||||    
T  31157521 acttggtcaactccttagttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 31157596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 38395036 - 38394949
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  38395036 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 38394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40550882 - 40550795
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  40550882 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 40550795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 47675330 - 47675417
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  47675330 acttggtcaactccctggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccacagagcatggtatccttgaa 47675417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Original strand, 20053958 - 20054407
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20053958 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgata 20054057  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  20054058 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatgctcgtcttccagattaa 20054157  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20054158 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgttt 20054257  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  20054258 cagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgatacttctctcaacacc 20054357  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20054358 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgctttatcattcatctc 20054407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Original strand, 22716431 - 22716880
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22716431 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactttttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgata 22716530  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  22716531 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 22716630  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22716631 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgttt 22716730  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  22716731 cagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacacc 22716830  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22716831 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgctttatcattcatctc 22716880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 2737188 - 2736739
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2737188 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttaaacttcctccaaagtgata 2737089  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  2737088 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctgggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 2736989  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  2736988 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgttt 2736889  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||  |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||  || |||||    
T  2736888 cagaaattgcctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctttcaacacc 2736789  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2736788 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgccttatcattcatctc 2736739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 39681022 - 39680580
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  39681022 ttcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccct 39680923  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctac 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  39680922 ctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctat 39680823  T
Q  215 gttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatat 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |     
T  39680822 gttcgtcaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcaggcac 39680723  T
Q  315 tgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatccc 414  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  39680722 tgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccc 39680623  T
Q  415 caagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
     |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  39680622 taagacacagaatgatagcgctgactgccttatcattcatctc 39680580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 458
Target Start/End: Original strand, 28456701 - 28457151
Alignment:
Q  9 gagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatag 108  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |  |||| || || ||||||||| |||    
T  28456701 gagacattcaagccttcttcactatcatcaaccttcaactcctttaatttggttagctctttggttctcaaaaccacttggacatcctccaaagtgctag 28456800  T
Q  109 tgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtg-taagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||||| | ||||  ||||| ||| |||| || ||| |    
T  28456801 tgccctctttgccataaagcattgtatccttgaaattatcaaaggacctaggtaaaacacacagtagggggtaaggatttatcctcatcttccatattta 28456900  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28456901 catctatgttctccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttattccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagaattgttgttt 28457000  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||| |||||    
T  28457001 cagacattgtctatgtgacaaggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagaaacaacagtagtctctcatgttacctctctcaacacc 28457100  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctca 458  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28457101 ttatccccaagacacagaatgatggcactgatcgctttatcattcatctca 28457151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17933104 - 17932982
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17933104 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgata 17933005  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcat 130  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  17933004 gtgccctctttgccataaagcat 17932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 249 - 415
Target Start/End: Original strand, 10941949 - 10942115
Alignment:
Q  249 gtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatg 348  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  10941949 gtcagttgctccattatatattttgactccaccatccagtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctacgtgccaaagactttgtcatatacaatg 10942048  T
Q  349 aatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcccc 415  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  10942049 aatctagtttattccatatagacacatcagtagtctcccttgctacctttctcaacaccttatcccc 10942115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 249 - 415
Target Start/End: Original strand, 10947818 - 10947984
Alignment:
Q  249 gtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatg 348  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  10947818 gtcagttgctccattatatattttgactccaccatccagtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctacgtgccaaagactttgtcatatacaatg 10947917  T
Q  349 aatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatcccc 415  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  10947918 aatctagtttattccatatagacacatcagtagtctcccttgctacctttctcaacaccttatcccc 10947984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 19348426 - 19348563
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  19348426 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 19348525  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19348526 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 19348563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 25402799 - 25402935
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  25402799 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttcttaaagccgcttggacctcttccaaagtagtagtgccct 25402898  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  25402899 ccttaccataaaggatggtatccttaaaatgctcaaa 25402935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10446375 - 10446246
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| ||||  | |||||||||||| || ||||||||||| || || ||  |||||||||| ||||| || || | ||||||  | ||| |||    
T  10446375 ttcaagccttcaccacctttatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttgattctcaaagccgcttggacctccttcaaagtagtggtgccct 10446276  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaat 144  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||    
T  10446275 ccttaccataaaggatggtatccttgaaat 10446246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 35217206 - 35217293
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  35217206 acttggtcaaatccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 35217293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 36560377 - 36560464
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  36560377 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 36560464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Original strand, 22625177 - 22625626
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22625177 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 22625276  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  22625277 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 22625376  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22625377 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgttt 22625476  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  || |||||    
T  22625477 cagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctatcaacacc 22625576  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22625577 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgctttatcattcatctc 22625626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 8 - 456
Target Start/End: Original strand, 47882086 - 47882534
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  47882086 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgata 47882185  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  47882186 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctgggtaaagcccacagtaggtgtaaggctttatcatcgtcttccagattaa 47882285  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47882286 catctatgttctccaaatcatcaataatcttattgaactccgtctgttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgttt 47882385  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  47882386 cagacattgtctatgtgctaaggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttatttcacatagacacaacagtagtctcccttgctacctctctcaacacc 47882485  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatct 456  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47882486 ttatccccaagacacaaaatgatagcactgaccgctttatcattcatct 47882534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Original strand, 10611975 - 10612424
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10611975 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaaatctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 10612074  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  10612075 gtgccgtctttgccatagagcatagtatcctttaaattctcaaaggaccaaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 10612174  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10612175 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatttgataaaagtagagttgttgttt 10612274  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||| |||||    
T  10612275 cagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacaacaatagtctcccttgatacttttctcaacacc 10612374  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10612375 ttatccccaaaacacagaatgatagcgctgaccgctttatcattcatctc 10612424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 10897988 - 10897539
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10897988 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgata 10897889  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  10897888 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 10897789  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10897788 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcgattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgttt 10897689  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||  |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| |||||    
T  10897688 cagacattgcctatgggccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacacc 10897589  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10897588 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgctttatcattcatctc 10897539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Original strand, 29913153 - 29913602
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29913153 tgagacattcaagccttctccactatcttcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 29913252  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  29913253 gtgccctatttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacggtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 29913352  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29913353 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgttt 29913452  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| |||||    
T  29913453 cagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattcctcatagacacagcagtagactcccttgatacttctctcaacacc 29913552  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  29913553 ttatccccaagacacagaatgatagcgctaaccgccttatcattcatctc 29913602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 8 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 54189493 - 54189048
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54189493 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 54189394  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  54189393 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaacaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 54189294  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54189293 catctatgttcgccaaattatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgttt 54189194  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||| |||||    
T  54189193 cagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtttcccttgatacttctctcaacacc 54189094  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattca 453  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  54189093 ttatccccaagacacataatgatagcgctgaccgccttatcattca 54189048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Original strand, 10204889 - 10205338
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10204889 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 10204988  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  10204989 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctgggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 10205088  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10205089 catctatgttcgccaaatcattaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacggtaaaagtagagttgttgttt 10205188  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||| ||| || ||| |||||    
T  10205189 cagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcccctcttgatacttctctcaacacc 10205288  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10205289 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgccttatcattcatctc 10205338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16458448 - 16458000
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16458448 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaact-tttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgata 16458350  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||    
T  16458349 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggatttatcttcgtcttccagattaa 16458250  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16458249 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgctagttgctccattataggttttgactccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 16458150  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  16458149 cagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacacc 16458050  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16458049 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgccttatcattcatctc 16458000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6304287 - 6303845
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  6304287 ttcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccct 6304188  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctac 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  6304187 ctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctat 6304088  T
Q  215 gttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatat 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |     
T  6304087 gttcgccaaattatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacac 6303988  T
Q  315 tgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatccc 414  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  6303987 tgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccc 6303888  T
Q  415 caagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  6303887 caagacacagaatgatagcgttgaccgccttatcattcatctc 6303845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 56 - 457
Target Start/End: Original strand, 10098041 - 10098442
Alignment:
Q  56 cttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaat 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  10098041 cttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggac 10098140  T
Q  156 caaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaatt 255  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  10098141 ctgggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcattaataatcttattgaactccgtcaatt 10098240  T
Q  256 gctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaag 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  10098241 gctccattataggttttgactccaccatacggtaaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaag 10098340  T
Q  356 tttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatc 455  Q
     |||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10098341 cttattccacatagacacagcagtagccccccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacaaaatgatagcgctgaccgccttatcattcatc 10098440  T
Q  456 tc 457  Q
    ||    
T  10098441 tc 10098442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 16263512 - 16263648
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  |||||  ||    
T  16263512 ttcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgctct 16263611  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  16263612 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 16263648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 8516243 - 8516380
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  8516243 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 8516342  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  8516343 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 8516380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 32479489 - 32479626
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  32479489 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 32479588  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  32479589 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 32479626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28490112 - 28489976
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  28490112 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 28490013  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  28490012 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 28489976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29811844 - 29811757
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29811844 acttggtcaactctttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgtcttatttgccatagagcatggtatccttgaa 29811757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10210188 - 10210092
Alignment:
Q  43 tcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10210188 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10210092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7763246 - 7763159
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| | || | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7763246 acttggttaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 7763159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9602766 - 9602655
Alignment:
Q  33 tcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattg 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  | ||| |||| || |||||||| || |    
T  9602766 tcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtggtgccctccttaccataaaggatgg 9602667  T
Q  133 tatccttgaaat 144  Q
    ||||||||||||    
T  9602666 tatccttgaaat 9602655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27421660 - 27421573
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| | || | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27421660 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttctttcaaagtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 27421573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3324486 - 3324350
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| ||  |||| || || ||||||||  | ||| | |    
T  3324486 ttcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaacgcctcttggacctcctccaaagtagtggtgcctt 3324387  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  3324386 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 3324350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Original strand, 4599912 - 4599996
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4599912 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 4599996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Original strand, 9635316 - 9635400
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9635316 acttggtcaactcattggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 9635400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10057220 - 10057136
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10057220 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10057136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10059442 - 10059358
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10059442 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10059358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10061664 - 10061580
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10061664 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10061580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10063886 - 10063802
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10063886 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10063802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10066108 - 10066024
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10066108 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10066024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 4309746 - 4309833
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4309746 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatggtatctttgaa 4309833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 18098407 - 18098494
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  18098407 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaa 18098494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 43227099 - 43227012
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  43227099 acttggtcaactccttggttctcaaagcctcttgaacttcttccaaggtaacagtgtcttctttgccatagagcatggtatctttgaa 43227012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5192903 - 5192814
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaat 144  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  5192903 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaaat 5192814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20631065 - 20630996
Alignment:
Q  16 tcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgc 85  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||| | |||||||||| |||||||| |||||    
T  20631065 tcaagccttcaccactatcatcaaccttcaagtctctcaactcgattaactctttagttctcaatgctgc 20630996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Original strand, 23199331 - 23199412
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatc 136  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  23199331 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatc 23199412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Original strand, 5259515 - 5259599
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| | || | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5259515 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatcctt 5259599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5192672 - 5192585
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5192672 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 5192585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5898431 - 5898344
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  5898431 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagaatggtatctttgaa 5898344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 6065029 - 6065116
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  6065029 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 6065116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 32892065 - 32891978
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||  |||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  32892065 acttggtcaactccttggttctcaaagccggttgaacttcttccaaggtggcagtgccttctttcccatagagcatggtatccttgaa 32891978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37407664 - 37407577
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  37407664 acttggtcaactccttggttcttaaagccggttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaa 37407577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6717488 - 6717406
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcc 137  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||  |||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  6717488 acttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcc 6717406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Original strand, 22834212 - 22834285
Alignment:
Q  66 tctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22834212 tctttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtgacggtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 22834285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 33033623 - 33033175
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33033623 tgagacattcaagccttctccactatcattaaccttcaactctttgatcttggttaactctttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgata 33033524  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||| |    
T  33033523 gtgccttctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaataacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcatcttccagattta 33033424  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  33033423 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataagtttcgactccaccattcggtaaaagta-agttgttgctt 33033325  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33033324 cagacattgtctatgtgccaaggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacagtagtagtctcccttgctacctctctcaacacc 33033225  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33033224 ttatccccaagacacagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 33033175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Original strand, 16756465 - 16756907
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  16756465 ttcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccct 16756564  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctac 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  16756565 ctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctat 16756664  T
Q  215 gttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |     
T  16756665 gttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacac 16756764  T
Q  315 tgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatccc 414  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  16756765 tgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccc 16756864  T
Q  415 caagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16756865 caagacacagaatgatagcgctgaccgccttatcattcatctc 16756907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28328884 - 28328442
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  28328884 ttcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccct 28328785  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctac 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  28328784 ctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaagactttatcctcgtcttccagattaacatctat 28328685  T
Q  215 gttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |     
T  28328684 gttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcaggcac 28328585  T
Q  315 tgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatccc 414  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  28328584 tgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatacttctctcaacaccttatccc 28328485  T
Q  415 caagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28328484 caagacacagaatgatagcgctgaccgccttatcattcatctc 28328442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28891747 - 28891298
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28891747 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 28891648  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  28891647 gtgctctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatccttgtcttccagattaa 28891548  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28891547 catctatgttcgcgaaatcatcaataatcttattgaactccttcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgttt 28891448  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| || ||| |||||    
T  28891447 cagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcattagcctcccttgatacttctctcaacacc 28891348  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28891347 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgccttatcattcatctc 28891298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 15945634 - 15945189
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  15945634 ttcaagccttctccactatcattaaccttcaactccttgaatttggttagctttttggttctcaaagccgcttggacttcctccaaagtgatagtgccct 15945535  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctac 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  15945534 ctttgccataaagcattgtattcttgaaattctcaaaggacctaggtaattcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattcacatctat 15945435  T
Q  215 gttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgatt---ccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcaga 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15945434 gttctccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagtttctccattataggttttgagtacgccaccattcagtaaaagtagagttgttgtttcaga 15945335  T
Q  312 tattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacac---aacagtagtctcccttgctacctcactcgacacct 408  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| |||||| | | || |||    
T  15945334 cattgtctatgtgccaaggacttggtcatgtacgatgaatcatgtttattccacatagacacagtagtagtagtctcccttgatacctctcccaactcct 15945235  T
Q  409 tatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcat 454  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15945234 tatctccaagacacaaaatgatggcactgaccactttatcattcat 15945189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 127 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 21034732 - 21034402
Alignment:
Q  127 gcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatc 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21034732 gcatagtatccttgaaattctcaagggacctaggtaaagcacacagtaggtgaaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatc 21034633  T
Q  227 atcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgcc 326  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  21034632 atcaataatcttaatgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagtcattgtctatgtgcc 21034533  T
Q  327 atggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatccccaagacaaagaa 426  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||| || | ||    
T  21034532 aaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctcttaacaccttatccccaagccacaaaa 21034433  T
Q  427 tgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034432 tgatagcactgaccgctttatcattcatctc 21034402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 45 - 340
Target Start/End: Original strand, 4819474 - 4819769
Alignment:
Q  45 aactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4819474 aactctttgaacttggttaactctttggttcttaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaat 4819573  T
Q  145 tctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaacatctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaa 244  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4819574 tctcaaaggacctaggtaaagcacacattaggtgtaagtctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcattaataatcttattgaa 4819673  T
Q  245 tttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatggacttggtcat 340  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||    
T  4819674 ctccgtcatttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcat 4819769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 26269504 - 26269587
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaac 91  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26269504 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttgatcaactctttggttctcaaagcttcttgaac 26269587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18854101 - 18853965
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  18854101 ttcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 18854002  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  18854001 ccttaccataaaggatggtatccctgaaatgctcaaa 18853965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 10685202 - 10685065
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  10685202 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 10685103  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  10685102 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 10685065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 35744539 - 35744676
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  35744539 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 35744638  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  35744639 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 35744676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 26300487 - 26300623
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||| |||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  26300487 ttcaagccttcactaccttcatcaatcttcaagtccttgaacttggtcaattcattggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 26300586  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  26300587 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 26300623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Original strand, 31577530 - 31577618
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaa 143  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  31577530 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 31577618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23800455 - 23800319
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||||||||| || |  || ||||||||||| | ||| || || ||||||||  | ||| |||    
T  23800455 ttcaagccttcaccaccttcatcaactttcaagtccttgaacttggtcaatttcttggttctcaaagccgtttggacctcctccaaagtagtggtgccct 23800356  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  23800355 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 23800319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 139
Target Start/End: Original strand, 41366174 - 41366270
Alignment:
Q  43 tcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  41366174 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacggtgccttttttgccatagagcatggtatcctt 41366270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15069665 - 15069578
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15069665 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaa 15069578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17848624 - 17848536
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaa 143  Q
    ||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | | || ||||||||||||  |||||||||||    
T  17848624 acttggtttgctccttggttctcaaagcagcttgaacttcttccaaggtgacagtgcctttttagccataaagcatgatatccttgaaa 17848536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4732633 - 4732546
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  4732633 acttggtcaactccttggtttttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgctatagagcatggtatccttgaa 4732546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27828083 - 27827996
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27828083 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatatagcatggtatctttgaa 27827996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 34255698 - 34255785
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||  |||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  34255698 acttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaa 34255785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 43080700 - 43080613
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  43080700 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 43080613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 142
Target Start/End: Original strand, 28314855 - 28314981
Alignment:
Q  16 tcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctc 115  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||  | || |||||||||||  | || |||||||   ||||||| ||||| |||||||||| | | || ||    
T  28314855 tcaagccttcaccactatcatcaaccttcaagcccttcaacttggttaatgccttagttctcagctctgcttggacttcctccaaagtgacaatatcttc 28314954  T
Q  116 tttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||| ||||  ||||| |||| ||||||    
T  28314955 tttcccattgagcatggtattcttgaa 28314981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5591849 - 5591776
Alignment:
Q  66 tctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5591849 tctttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtgacggtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 5591776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 9522708 - 9522259
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9522708 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttcttaaagctgcttgcacttcctccaaagtgata 9522609  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  9522608 gtgccctttttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaagacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 9522509  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9522508 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaacttcgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcgataaaagtagagttgttgttt 9522409  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  9522408 cagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacacc 9522309  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9522308 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgctttatcattcatctc 9522259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Original strand, 2400422 - 2400871
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2400422 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttttcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 2400521  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  2400522 gtgccatctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcgtcgtcttccagattaa 2400621  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2400622 catctatgttcgccaaatcatcaataattttattgaactctgtcagttgctccattatagattttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgttt 2400721  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| |||||    
T  2400722 cagacattgtctatgtgccaaagacttagtcatgtattatgaattaagtttattccatatagacacaacagtagtttcccttgatacttctctcaacacc 2400821  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2400822 ttatccccaagacacagaatgatatcactgaccgctttatcattcatctc 2400871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 14998018 - 14997570
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  14998018 tgagacattcaagccttctccactatcatcaacctttaactccttgaatttggttagctctttggttctcaaagccgcttagacttcctccaaagtgata 14997919  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| ||||||  || |||| |||||| |    
T  14997918 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcttcatcttccagattta 14997819  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997818 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 14997719  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||    
T  14997718 cagacattgtctatgtgccaaggacttggtcatgtacaa--aatcaagtctattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctatctcaatacc 14997621  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctca 458  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  14997620 ttatccccaagacacataatgatggcactaaccacgttatcattcatctca 14997570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 41397388 - 41397525
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  41397388 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 41397487  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  41397488 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 41397525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19359776 - 19359640
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |  || ||||||||  ||||| |||    
T  19359776 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggaactcctccaaagtagtagtgccct 19359677  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  19359676 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 19359640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 135
Target Start/End: Original strand, 3805367 - 3805447
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtat 135  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3805367 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttctaaggtgacagtgtcttctttgccatagagcatggtat 3805447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 142
Target Start/End: Original strand, 27338357 - 27338456
Alignment:
Q  43 tcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  27338357 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttcccatagagcatggtatctttgaa 27338456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 142
Target Start/End: Original strand, 28222602 - 28222701
Alignment:
Q  43 tcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  28222602 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcctgaacttcttccaaggtgacagtgccttcttttccatatagcatggtatccttgaa 28222701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 9024737 - 9024649
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagt 103  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||  ||||  || |||||||||||    
T  9024737 ttcaagccttcaccaccctcatcaaccttcaagtccttaaacttggtcaattctttggttctcaaagtcgcttagacctcatccaaagt 9024649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 47099756 - 47099620
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||  ||||| || || |||| |||  | ||  |||    
T  47099756 ttcaagccttcaccaccttcttcaaccttcaagtccttgaacttggttaattccttggttctcaaagtcgcttggacctcctccagagtagtggttccct 47099657  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  47099656 ccttaccataaatgatggtatccttgaaatgctcaaa 47099620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 130
Target Start/End: Original strand, 8348307 - 8348382
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcat 130  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||| | | ||||||||| |||||    
T  8348307 acttggttaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaagataatagtgccttatttgccatagagcat 8348382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 136
Target Start/End: Original strand, 13126975 - 13127054
Alignment:
Q  57 ttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatc 136  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||  | ||||||||||| ||||| |||||    
T  13126975 ttggtcaactccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtaccttctttgccatagagcatggtatc 13127054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16227211 - 16227124
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16227211 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 16227124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 28202936 - 28203022
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| || | |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28202936 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaatttcatccaaggt-acagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaa 28203022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 28841465 - 28841378
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28841465 acttggtcaactccttggttctcaaagcctcttgaacttcttccaaggtaacagtgtcttccttgccatagagcatggtatctttgaa 28841378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31658179 - 31658092
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| | || | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31658179 acttggtcaattccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 31658092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 47178405 - 47178318
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  47178405 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaatgtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 47178318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 51751080 - 51750993
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  51751080 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 51750993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 17308 - 16859
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  17308 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaaatctttgaacttggtcaattctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtaata 17209  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  17208 gtgccctctttgccatagagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 17109  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17108 catctatgttcaccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgattccaccattcggtaaaagtagagttgttgttt 17009  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  17008 cagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacacc 16909  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16908 ttgtccccaagacacagaatgatagcactggccgctttatcattcatctc 16859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 15313301 - 15312852
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15313301 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaagtctttgaacttggtcaactctttggttatcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgata 15313202  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  15313201 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 15313102  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  15313101 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtaagttgctccattataggttttgactccatcattcgataaaagtagagttgttgttt 15313002  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||| |    
T  15313001 cagacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataataaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacatc 15312902  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15312901 ttatctccaagacacagaatgatagcgctgaccgctttatcattcatctc 15312852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16633473 - 16633023
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||    
T  16633473 tgagacattcaagccttatccactatcatcaaccttcaactccttgaatttggttaactctttggttctcaaagttgcttagacttcctccaaagtgata 16633374  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | || ||| |    
T  16633373 gtgccctctttgccataaagcattgtattcttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcgtcgtcgtccaaattca 16633274  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || ||||||| | |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16633273 aatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccatcagttactccattgtgggttttgactccaccattcggtataagtagagttgttgttt 16633174  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    || | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  16633173 caaacattgtgtatgtgccaaggacttggtcatgtacaatgaatcaattttatttcacatagacacatcagtagtctcccttgctgcctctctcaacacc 16633074  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctca 458  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16633073 ttatccccaatacacagaatgatggcactgaccgcttcatcattcatctca 16633023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 231 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 4559068 - 4558842
Alignment:
Q  231 ataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttcagatattgtttatgtgccatgg 330  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |     
T  4559068 ataatcttattgaacttcgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtaccaagt 4558969  T
Q  331 acttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatccccaagacaaagaatgat 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4558968 acttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacaatagtctcccttcctacctctctccacaccttatccccaagacacagaatgat 4558869  T
Q  431 agcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4558868 agcactaacctctttatcattcatctc 4558842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4559189 - 4559067
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4559189 tgagacattcaagccttctccactatcattaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgata 4559090  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcat 130  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  4559089 gtgccctcttttccataaagcat 4559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 5147050 - 5147186
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||| |||    
T  5147050 ttcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattgtttggttctcaaagccgcttggacttcctccaaagtagtagtgccct 5147149  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  5147150 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 5147186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21549627 - 21549539
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagt 103  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  21549627 ttcaagccttcgccactttcttcaaccttcaaatccttgaacttggttaactccttggttctcaaaggtgcttgaacctcctccaaagt 21549539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9225324 - 9225205
Alignment:
Q  33 tcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattg 132  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||| || |||||||| || |    
T  9225324 tcatcaaccttcatgtcattgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatgg 9225225  T
Q  133 tatccttgaaattctcaaag 152  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  9225224 tatccttgaaatgctcaaag 9225205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5137067 - 5136983
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5137067 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 5136983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7123683 - 7123599
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7123683 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 7123599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8394393 - 8394309
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8394393 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 8394309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4588939 - 4588840
Alignment:
Q  43 tcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||  |||| |||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  4588939 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcgttcatggtgacagtgtcttatttgcaatagagcatggtatccttgaa 4588840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 138
Target Start/End: Original strand, 5206856 - 5206939
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcct 138  Q
    ||||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  5206856 acttggtcaacttcttggttcttaaagctgcttggacttcctccaaggtgatagtgtcttcttttccatagaggatggtatcct 5206939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5872782 - 5872703
Alignment:
Q  63 aactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  5872782 aactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaa 5872703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 22781973 - 22782060
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22781973 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 22782060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Original strand, 38983911 - 38984026
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| |||||| || |||    
T  38983911 ttcaagcctttaccactatcatcaacattcaagtcattggacttgagtaactcattcgttctcaacaccgcttggacctcttccaaggtgataatgccct 38984010  T
Q  115 ctttgccataaagcat 130  Q
     ||| |||||||||||    
T  38984011 atttaccataaagcat 38984026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 52094555 - 52094642
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| | || | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  52094555 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatctttgaa 52094642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Original strand, 12740925 - 12741006
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatc 136  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  12740925 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttcaaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatc 12741006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Original strand, 12749131 - 12749212
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatc 136  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  12749131 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttcaaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatc 12749212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18241656 - 18241541
Alignment:
Q  35 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgta 134  Q
    |||||||||||| || |||||||| || || || ||| ||||||||||  |||| || || ||||||||  | ||| |||| || |||||||| || |||    
T  18241656 atcaaccttcaagtccttgaacttagtcaattccttcattctcaaagccacttggacctcctccaaagtagtggtgccctccttaccataaag-atggta 18241558  T
Q  135 tccttgaaattctcaaa 151  Q
    |||||||||| ||||||    
T  18241557 tccttgaaatgctcaaa 18241541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 10628342 - 10627892
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10628342 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgata 10628243  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  | |||||| |    
T  10628242 gtgtcctctttgccataaaggattgtatccttgaaattctcaaatgacataggtaaagcacacagtaggtctaaggctttatcctcgtaatccagattta 10628143  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10628142 catctataatcgccaaatcaacaataatcttattgaactccgtcagttgctccattatcggttttgactccaccattcggttaaagtagagttgttgttt 10628043  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||    
T  10628042 cagacattgtctatgtgccaaggacttggtcatgcacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacaatagtctcccttgctaactctctctatacc 10627943  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctca 458  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10627942 gtatccccaagacacagaatgatggcactgacagctttatcattcatctca 10627892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 25446470 - 25446021
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25446470 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaactttaactctttgaacttggttaactttttggttcttaaagctgtttgaacttcctccaaagtgata 25446371  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  25446370 gtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctgggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttctagattaa 25446271  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  25446270 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccacctttcgataaaagtagagttgttgttt 25446171  T
Q  308 cagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacacc 407  Q
    |||| | ||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| || ||| |||||    
T  25446170 cagacactgtctatgtgccaaagacttgatcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacatagcagtagcctcccttgatacttctctcaacacc 25446071  T
Q  408 ttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25446070 ttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgccttatcattcatctc 25446021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 458
Target Start/End: Original strand, 31781658 - 31782109
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  31781658 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactccttgaatttggttaactctttggttctcaaagttgcttgaccttcctccaaagtgata 31781757  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||| ||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||| |||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||| |    
T  31781758 gtgccctctttgccaaaactctttgtattcttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcatacaacaggtgtaaggctttatcctcgtcttccatattta 31781857  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattatagg-ttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgtt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31781858 catctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaattccgtcagttgcttcattattggtttttgactcgaccattcggtaaaagtagagttgttgtt 31781957  T
Q  307 tcagatattgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacac 406  Q
    ||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31781958 tcagacattgtctatgtgtccaggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacaatagtctcccttgctacctctctcaacac 31782057  T
Q  407 cttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctca 458  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31782058 cttatccccaagacacagaacgatggcactgatcgctttatcattcatctca 31782109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28788705 - 28788401
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgata 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28788705 tgagacattcaagccttctccactatcctcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgata 28788606  T
Q  108 gtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaagactttattctcgtcttgcagattaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  28788605 gtgtcttctttgccataaagcataatatccttgaaattttcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaa 28788506  T
Q  208 catctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgctccattataggttttgattccaccatttggtaaaagtagagttgttgttt 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||  ||||||||||    
T  28788505 catctatgttcgccaaatcatcaaaaatcttattaaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccgttcgataaaagtatggttgttgttt 28788406  T
Q  308 cagat 312  Q
    |||||    
T  28788405 cagat 28788401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 313 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 28787077 - 28786936
Alignment:
Q  313 attgtttatgtgccatggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatc 412  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  28787077 attgtctatgtgccaaagacttggccatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatacttctctcaacaccttatc 28786978  T
Q  413 cccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcat 454  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786977 cccaagacacagaatgatagcactgaccgctttatcattcat 28786936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 27448971 - 27449108
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  |||||||||    
T  27448971 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgtcct 27449070  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  27449071 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 27449108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31397930 - 31397793
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  31397930 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 31397831  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  31397830 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 31397793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 33790464 - 33790601
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  33790464 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 33790563  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  33790564 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 33790601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 37557562 - 37557425
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  37557562 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 37557463  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  37557462 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 37557425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24556523 - 24556387
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||| || || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||  | ||| |||    
T  24556523 ttcaagccttcaccaacatcatcaacctttaagtccttgaacttggtcaattatttggttctcaaagccgattggacttcctccaaagtagtggtgccct 24556424  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  24556423 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 24556387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24597555 - 24597419
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||| || || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||  | ||| |||    
T  24597555 ttcaagccttcaccaacatcatcaacctttaagtccttgaacttggtcaattatttggttctcaaagccgattggacttcctccaaagtagtggtgccct 24597456  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  24597455 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 24597419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 142
Target Start/End: Original strand, 13694322 - 13694421
Alignment:
Q  43 tcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  13694322 tcaactccttgaacttggttaactcattggtcctcaaagccgcttggacttccttcaaagtgacaatgtcttctttgccatagagcatggcatccttgaa 13694421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 43596270 - 43596407
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||| |||||  || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  43596270 ttcaagccttcactaccttcatcaatcttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 43596369  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  43596370 ccttaccataaaggatggtattcttgaaatgctcaaag 43596407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 43629064 - 43629201
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||| |||||  || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  43629064 ttcaagccttcactaccttcatcaatcttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 43629163  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  43629164 ccttaccataaaggatggtattcttgaaatgctcaaag 43629201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16408310 - 16408226
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16408310 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16408226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16545415 - 16545331
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16545415 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16545331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 29721350 - 29721266
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29721350 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 29721266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40381091 - 40381007
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatcctt 139  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40381091 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 40381007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6746111 - 6746024
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  6746111 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaa 6746024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31543776 - 31543689
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  31543776 acttggtcaactccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 31543689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Original strand, 34841764 - 34841830
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaacctt-caactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaa 80  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34841764 ttcaagccttcaccactttcatcaacctttcaaatctttgaacttggttaactccttggttctcaaa 34841830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 32584831 - 32584715
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaagaa 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||| || || ||||||||  | || |||||||||| ||| |||||| ||||   ||||||  |    
T  32584831 acttggttaactctttggttctcaattccgcttggacttcctcaaaggtgatagttccttccttgccataaatcatggtatccatgaaggactcaaaaga 32584732  T
Q  155 tcaaggtaaagcacaca 171  Q
    || ||||||||||||||    
T  32584731 tctaggtaaagcacaca 32584715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10750741 - 10750654
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  10750741 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 10750654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 15356085 - 15356172
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15356085 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 15356172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 20505442 - 20505529
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  20505442 acttggtcaactccttagttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttcccatagagcatagtatctttgaa 20505529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23666089 - 23666002
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23666089 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 23666002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 50404 - 50478
Alignment:
Q  8 tgagactttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagc 82  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50404 tgagacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagc 50478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 376 - 457
Target Start/End: Original strand, 16601 - 16682
Alignment:
Q  376 cagtagtctcccttgctacctcactcgacaccttatccccaagacaaagaatgatagcactgaccgctttatcattcatctc 457  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16601 cagtagtctcccttgatacttctctcaacaccttatccccaagacacagaatgatagcgctgaccgctttatcattcatctc 16682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 1656 - 1792
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||| |||| ||||| || || ||||||||  | ||| |||    
T  1656 ttcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattcattggttctctaagccgcttggacctcctccaaagtagtggtgccct 1755  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  1756 ctttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 1792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 815 - 678
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  815 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaactgggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 716  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  715 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15247 - 15110
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  15247 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 15148  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  15147 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 15110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 149893 - 149756
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  149893 ttcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttagttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 149794  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaag 152  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  149793 ccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaag 149756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 4132 - 3996
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  4132 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 4033  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  4032 ccttaccataaaagatggtatccttgaaatgctcaaa 3996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18877 - 18741
Alignment:
Q  15 ttcaagccttctccacaatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcct 114  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||| |||    
T  18877 ttcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattcgttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccct 18778  T
Q  115 ctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaa 151  Q
    | || |||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  18777 ccttaccataaaggatggtatccttaaaatgctcaaa 18741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 115578 - 115491
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  115578 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 115491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 667 - 580
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  667 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 72753 - 72840
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  72753 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaa 72840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 338 - 254
Alignment:
Q  58 tggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    |||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||| | ||   ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  338 tggtcaactctttggttctcaaagttgattgaacttcttccaaggtgacactgcgttctttgccatagagcatggtatccttgaa 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23169 - 23082
Alignment:
Q  55 acttggttaactctttcgttctcaaagctgcttgaacttcatccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 142  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23169 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 23082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University