View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2009_low_1 (Length: 301)

Name: NF2009_low_1
Description: NF2009
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2009_low_1
NF2009_low_1
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (3-282)||(16743990-16744270)
chr3 (127-290)||(2449238-2449401)
chr3 (54-259)||(13839025-13839232)
chr3 (54-259)||(2049941-2050147)
chr3 (54-259)||(12030073-12030279)
chr3 (54-259)||(14842487-14842693)
chr3 (127-284)||(17912483-17912639)
chr3 (6-189)||(19231982-19232169)
chr3 (117-259)||(51158008-51158150)
chr3 (101-259)||(15858996-15859156)
chr3 (134-259)||(15936634-15936759)
chr3 (127-259)||(13975722-13975853)
chr3 (127-259)||(45860937-45861068)
chr3 (127-274)||(13954890-13955036)
chr3 (54-173)||(19260749-19260869)
chr3 (134-259)||(15938476-15938601)
chr3 (161-274)||(16821256-16821369)
chr3 (139-251)||(15614973-15615085)
chr3 (139-259)||(55316351-55316471)
chr3 (11-88)||(15857120-15857198)
chr3 (6-85)||(3992873-3992953)
chr3 (139-259)||(41270207-41270327)
chr3 (6-85)||(55513193-55513273)
chr3 (6-85)||(2844514-2844594)
chr3 (6-85)||(54037976-54038056)
chr3 (6-85)||(17955832-17955916)
chr3 (6-85)||(7854305-7854385)
chr3 (25-85)||(45581954-45582016)
chr3 (143-197)||(14080701-14080756)
chr3 (134-224)||(11986173-11986263)
chr3 (13-65)||(12031852-12031904)
chr3 (13-65)||(17205024-17205076)
chr3 (134-223)||(54651625-54651714)
chr3 (13-65)||(17191884-17191936)
chr3 (13-65)||(38810868-38810920)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (3-259)||(41394353-41394610)
chr1 (127-290)||(51452592-51452755)
chr1 (54-274)||(20931461-20931682)
chr1 (54-259)||(20913161-20913367)
chr1 (54-223)||(37844374-37844546)
chr1 (54-223)||(20445846-20446019)
chr1 (54-259)||(20893551-20893758)
chr1 (66-223)||(20531611-20531770)
chr1 (161-259)||(2116386-2116484)
chr1 (161-259)||(45051554-45051652)
chr1 (177-258)||(22227941-22228022)
chr1 (177-258)||(22232638-22232719)
chr1 (161-259)||(18601140-18601238)
chr1 (139-259)||(5072388-5072508)
chr1 (6-85)||(21860334-21860414)
chr1 (12-85)||(44034829-44034903)
chr1 (6-65)||(41218749-41218808)
chr1 (13-65)||(27675139-27675191)
chr1 (13-69)||(20177513-20177570)
chr1 (13-65)||(13376711-13376763)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (6-259)||(20627190-20627445)
chr2 (6-259)||(43642833-43643089)
chr2 (127-290)||(19689401-19689564)
chr2 (127-290)||(23820171-23820334)
chr2 (127-290)||(14906440-14906603)
chr2 (54-258)||(462870-463075)
chr2 (127-290)||(20015111-20015274)
chr2 (6-259)||(19794581-19794836)
chr2 (60-259)||(8891373-8891574)
chr2 (54-259)||(36982364-36982573)
chr2 (127-259)||(17396653-17396784)
chr2 (54-259)||(24341309-24341521)
chr2 (127-259)||(25265390-25265522)
chr2 (177-258)||(7507894-7507975)
chr2 (54-147)||(22863171-22863267)
chr2 (6-85)||(22275045-22275125)
chr2 (6-85)||(22284278-22284358)
chr2 (6-84)||(15633538-15633617)
chr2 (139-259)||(19886661-19886781)
chr2 (13-69)||(19660217-19660273)
chr2 (143-236)||(24884838-24884933)
chr2 (13-65)||(43646237-43646289)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (127-290)||(5238187-5238350)
chr8 (127-290)||(24661248-24661411)
chr8 (127-290)||(43685646-43685809)
chr8 (54-259)||(16193643-16193848)
chr8 (127-284)||(22907214-22907371)
chr8 (6-259)||(16404852-16405107)
chr8 (54-259)||(24928716-24928923)
chr8 (54-259)||(43373392-43373600)
chr8 (139-259)||(6774258-6774378)
chr8 (127-259)||(17345700-17345832)
chr8 (161-259)||(21844594-21844692)
chr8 (139-259)||(24549113-24549233)
chr8 (161-259)||(21851987-21852085)
chr8 (6-85)||(274766-274846)
chr8 (6-85)||(641003-641083)
chr8 (6-85)||(826809-826889)
chr8 (6-85)||(24716714-24716794)
chr8 (139-259)||(30120854-30120974)
chr8 (139-259)||(16674392-16674512)
chr8 (6-85)||(39115598-39115678)
chr8 (143-197)||(23226076-23226131)
chr8 (202-274)||(222754-222826)
chr8 (202-274)||(736377-736449)
chr8 (202-274)||(860272-860344)
chr8 (143-236)||(15933450-15933545)
chr8 (143-236)||(26011646-26011741)
chr8 (202-259)||(691909-691966)
chr8 (13-65)||(17285548-17285600)
chr8 (13-65)||(21198005-21198057)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (127-290)||(11516327-11516490)
chr7 (127-290)||(15441564-15441727)
chr7 (127-290)||(30262129-30262292)
chr7 (127-290)||(7293116-7293279)
chr7 (13-255)||(3060101-3060344)
chr7 (54-259)||(16211897-16212103)
chr7 (54-259)||(36052795-36053003)
chr7 (54-259)||(13036938-13037146)
chr7 (54-259)||(11580661-11580871)
chr7 (127-259)||(25292338-25292470)
chr7 (127-258)||(47481031-47481162)
chr7 (134-259)||(18253842-18253967)
chr7 (162-259)||(16478985-16479082)
chr7 (128-224)||(13321182-13321278)
chr7 (161-259)||(13572808-13572906)
chr7 (139-259)||(10989541-10989661)
chr7 (161-251)||(13911046-13911136)
chr7 (161-258)||(2437590-2437687)
chr7 (6-85)||(32493898-32493978)
chr7 (62-255)||(295900-296094)
chr7 (6-85)||(126738-126818)
chr7 (6-85)||(1936869-1936949)
chr7 (6-85)||(111121-111201)
chr7 (127-169)||(14113989-14114031)
chr7 (127-169)||(14423639-14423681)
chr7 (13-65)||(13377872-13377924)
chr7 (13-65)||(13389698-13389750)
chr7 (6-65)||(7283908-7283967)
chr7 (143-236)||(16914928-16915023)
chr7 (143-236)||(48356796-48356891)
chr7 (134-223)||(48622665-48622754)
chr7 (13-65)||(16919874-16919926)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (127-290)||(20623069-20623232)
chr5 (127-290)||(21233528-21233691)
chr5 (127-290)||(16536297-16536460)
chr5 (127-290)||(37052844-37053007)
chr5 (129-290)||(25900408-25900568)
chr5 (54-259)||(23507096-23507302)
chr5 (54-259)||(27182471-27182679)
chr5 (54-258)||(18530988-18531198)
chr5 (54-259)||(22053753-22053965)
chr5 (127-259)||(34939408-34939540)
chr5 (139-259)||(29188284-29188404)
chr5 (161-257)||(27009975-27010071)
chr5 (139-274)||(22366481-22366616)
chr5 (161-259)||(43443417-43443515)
chr5 (161-274)||(4200007-4200120)
chr5 (161-274)||(18778014-18778127)
chr5 (139-259)||(19500031-19500151)
chr5 (139-259)||(25426760-25426880)
chr5 (139-259)||(12506-12626)
chr5 (139-259)||(21073595-21073715)
chr5 (11-65)||(11584394-11584448)
chr5 (134-224)||(32950861-32950951)
chr5 (143-240)||(21310709-21310808)
chr5 (143-223)||(29918131-29918212)
chr5 (13-65)||(21222462-21222514)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (54-259)||(122020-122226)
chr4 (127-290)||(10488662-10488825)
chr4 (127-290)||(16327926-16328089)
chr4 (6-259)||(54118120-54118376)
chr4 (127-284)||(26680306-26680463)
chr4 (54-259)||(13246561-13246769)
chr4 (54-259)||(15675009-15675221)
chr4 (54-259)||(10104170-10104382)
chr4 (127-274)||(13048221-13048368)
chr4 (161-274)||(10644336-10644449)
chr4 (154-255)||(31115764-31115865)
chr4 (54-200)||(33240890-33241043)
chr4 (6-85)||(25119059-25119139)
chr4 (139-274)||(47357771-47357906)
chr4 (143-252)||(40885570-40885680)
chr4 (6-85)||(5682380-5682460)
chr4 (162-259)||(7850131-7850228)
chr4 (13-65)||(41165808-41165860)
chr4 (13-65)||(47534933-47534985)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (54-259)||(1255-1462)
scaffold0266 (54-259)||(3508-3714)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (127-290)||(26895-27058)
scaffold0141 (134-290)||(22640-22796)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (127-290)||(1582-1745)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (127-284)||(37066-37223)
scaffold0078 (6-85)||(41632-41712)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (54-259)||(48729-48935)
scaffold0023 (161-274)||(36210-36323)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (66-259)||(51121-51314)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (54-274)||(882-1103)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (53-274)||(36836-37060)
scaffold0077 (6-65)||(15319-15378)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (54-259)||(41860-42066)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (54-274)||(172021-172242)
scaffold0001 (54-274)||(177724-177945)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (54-259)||(5990-6196)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (54-274)||(12229-12450)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (62-259)||(19337-19537)
scaffold0195 (127-259)||(21421-21553)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (54-257)||(26340-26545)
scaffold0162 (127-259)||(8180-8312)
scaffold0162 (13-65)||(6877-6929)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (54-259)||(23153578-23153786)
chr6 (98-258)||(14626089-14626249)
chr6 (127-259)||(1657748-1657880)
chr6 (127-259)||(35009439-35009571)
chr6 (127-259)||(15862602-15862734)
chr6 (139-259)||(1650105-1650225)
chr6 (6-85)||(19983144-19983224)
chr6 (6-85)||(35015009-35015089)
chr6 (167-274)||(25175680-25175787)
chr6 (139-274)||(27653983-27654118)
chr6 (54-122)||(23148266-23148335)
chr6 (139-264)||(16825752-16825879)
chr6 (127-210)||(27751605-27751688)
chr6 (127-224)||(29666040-29666137)
chr6 (6-85)||(18583640-18583720)
chr6 (13-65)||(21623511-21623563)
chr6 (143-242)||(29605596-29605696)
chr6 (143-236)||(18629608-18629703)
chr6 (161-240)||(17083216-17083296)
chr6 (13-65)||(22361619-22361671)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (54-259)||(128095-128301)
scaffold0008 (161-251)||(31697-31787)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (63-259)||(4996-5193)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (54-259)||(247366-247574)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (54-259)||(123087-123296)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (54-259)||(89378-89586)
scaffold0028 (54-178)||(107708-107835)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (54-274)||(272141-272362)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (54-259)||(9009-9215)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (95-259)||(148852-149018)
scaffold0025 (65-259)||(8980-9180)
scaffold0025 (54-147)||(146844-146938)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (134-259)||(5660-5785)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (127-274)||(13622-13769)
scaffold0132 (6-85)||(42677-42754)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (134-259)||(48318-48443)
scaffold0049 (6-65)||(20513-20572)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (127-229)||(534-636)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (127-258)||(41780-41911)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (134-259)||(107878-108003)
scaffold0026 (184-259)||(64573-64648)
scaffold0026 (142-184)||(89863-89905)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (161-259)||(13347-13445)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (161-259)||(9371-9469)
scaffold0215 (161-259)||(16269-16367)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (161-259)||(167-265)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (127-257)||(34460-34590)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (162-274)||(43114-43226)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (138-259)||(3094-3215)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (177-258)||(5254-5335)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (161-259)||(14083-14181)
scaffold0139 (161-256)||(21138-21233)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (139-259)||(1304-1424)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (6-85)||(80187-80267)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (177-258)||(3854-3936)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (6-86)||(166116-166197)
scaffold0016 (12-86)||(162036-162111)
scaffold0016 (13-65)||(116410-116462)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (6-85)||(31132-31212)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (12-85)||(5735-5809)
scaffold0686 (12-85)||(5941-6015)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (127-220)||(3360-3453)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (6-86)||(304-385)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (134-224)||(56106-56196)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (6-65)||(1721-1780)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (6-65)||(19802-19861)
scaffold0122 (6-65)||(24106-24165)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (177-224)||(45197-45244)
scaffold0066 (177-224)||(54583-54630)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (143-223)||(8176-8257)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (13-65)||(35821-35873)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (143-240)||(1348-1447)
scaffold0409 (143-240)||(9603-9702)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (15-65)||(114-164)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (134-224)||(10338-10428)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (11-65)||(6261-6315)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (143-196)||(70307-70361)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (143-184)||(1546-1587)
scaffold0456 (143-184)||(8691-8732)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (13-65)||(447-499)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (13-65)||(1363-1415)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (13-65)||(76699-76751)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 16743990 - 16744270
Alignment:
Q  3 tggagaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaatt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16743990 tggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaatt 16744089  T
Q  102 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16744090 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatg 16744189  T
Q  202 attgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgtt 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744190 attgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgtt 16744270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449401
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 2449401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13839025
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaa 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  252 aattgtgc 259  Q
    ||||||||    
T  13839032 aattgtgc 13839025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049941
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||| || || |||||    
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  2049947 attgtgc 2049941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030279
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  253 attgtgc 259  Q
     ||||||    
T  12030273 gttgtgc 12030279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842693
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  14842687 attgtgc 14842693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 284
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912639
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactt-gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgt 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgatatgttgt 17912639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19232169 - 19231982
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtg-aatttt 103  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19232169 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaatttt 19232070  T
Q  104 caaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 189  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19232069 caaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgat 19231982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 117 - 259
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158150
Alignment:
Q  117 aattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaatt 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  217 acatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51158150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 101 - 259
Target Start/End: Original strand, 15858996 - 15859156
Alignment:
Q  101 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgt 198  Q
    |||||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15858996 tttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 15859095  T
Q  199 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||| ||||| ||||||||||||    
T  15859096 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgc 15859156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936759
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtg 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||     
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgc 15936759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975853
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| || ||||||| |||||||||| |||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860937
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| || ||||||| |||||||||| |||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 45860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955036
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    ||| || |||||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaattt 13955036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 173
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  153 tccaactttgatgatatgttt 173  Q
    || || | |||||||||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938601
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtg 233  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||     
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgc 15938601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821256
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||  |||||||     
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgct 16821270  T
Q  261 aaatggatgaattt 274  Q
    |||| | |||||||    
T  16821269 aaattggtgaattt 16821256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15615085 - 15614973
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  15615085 tgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 15614986  T
Q  239 gaaaagttatgaa 251  Q
    || ||||| ||||    
T  15614985 gataagttgtgaa 15614973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316351
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgc 55316351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857198
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcat 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3992953 - 3992873
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  3992953 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270207
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||  |||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgc 41270207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 55513273 - 55513193
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  55513273 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2844594 - 2844514
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  2844594 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 54037976 - 54038056
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  54037976 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 17955832 - 17955916
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctag----agctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17955832 agaatcataggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7854385 - 7854305
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  7854385 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  25 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa--ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080701
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattg 197  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 14080701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 224
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986263
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt 224  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttt 11986263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 12031904 - 12031852
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  12031904 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 12031852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17205076 - 17205024
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17205076 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 17205024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 54651714 - 54651625
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 223  Q
    |||||||||||||| ||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||||    
T  54651714 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191884
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 17191884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 38810868 - 38810920
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||| ||||||||||||    
T  38810868 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataactaaggtaagggg 38810920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41394610 - 41394353
Alignment:
Q  3 tggagaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaatt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41394610 tggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaatt 41394511  T
Q  102 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41394510 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatg 41394411  T
Q  202 attgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41394410 attgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 41394353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452592
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 51452592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931461
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    ||||||| |||| | |||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattt 20931461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913161
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  20913167 attgtgc 20913161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844546
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 37844546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445846
Alignment:
Q  54 taaggtaaggg-gttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 223  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 20445846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893758
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgt-aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  20893750 aaattgtgc 20893758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20531770 - 20531611
Alignment:
Q  66 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttga 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  20531770 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtga 20531671  T
Q  164 tgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20531670 taatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 20531611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2116484 - 2116386
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  2116484 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 2116386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45051652 - 45051554
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45051652 tgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227941
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 22227941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232638
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 22232638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 18601140 - 18601238
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  18601140 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 18601238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072508
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgc 5072508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21860414 - 21860334
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  21860414 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44034903
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41218808 - 41218749
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41218808 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggg 41218749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675139
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggg 27675139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20177570 - 20177513
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttag 69  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20177570 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaatggggttag 20177513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376763
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13376763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 20627190 - 20627445
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-tttt 103  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  20627190 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaatttt 20627289  T
Q  104 caaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgat 203  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20627290 caaatattgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgat 20627389  T
Q  204 tgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| || || ||||||||||||    
T  20627390 tgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgc 20627445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 43642833 - 43643089
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43642833 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttc 43642932  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43642933 aaatgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 43643032  T
Q  203 ttgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |   |||||  ||||| ||||||||||||    
T  43643033 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgc 43643089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689564
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 19689564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820171
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 23820171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906603
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 14906603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462870
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  253 attgtg 258  Q
    ||||||    
T  462875 attgtg 462870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015111
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 20015111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 19794581 - 19794836
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  19794581 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-c 19794679  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794680 aaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatga 19794779  T
Q  203 ttgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| ||||||||||||    
T  19794780 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgc 19794836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8891574 - 8891373
Alignment:
Q  60 aaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaa 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8891574 aaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaa 8891475  T
Q  158 ctttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgt 257  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| ||||||||||    
T  8891474 ctgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 8891375  T
Q  258 gc 259  Q
    ||    
T  8891374 gc 8891373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982573
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatg 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  250 aaaattgtgc 259  Q
    ||||||||||    
T  36982564 aaaattgtgc 36982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396784
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| || ||||||| |||||||||| |||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 17396784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341521
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagtt 246  Q
    |  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||  |||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  247 atgaaaattgtgc 259  Q
     ||||||||||||    
T  24341509 gtgaaaattgtgc 24341521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265522
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgc 25265522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7507975
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtg 7507975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863171
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 22863171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22275125 - 22275045
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  22275125 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22284358 - 22284278
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22284358 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15633617 - 15633538
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatca 84  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15633617 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886781
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgc 19886781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660217
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggggttag 69  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaaggggttag 19660217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24884933 - 24884838
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat-gaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa-tatgtgaaa 236  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  24884933 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaa 24884838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 43646289 - 43646237
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  43646289 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 43646237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238187
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 5238187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661411
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 24661411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685646
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 43685646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16193848
Alignment:
Q  54 taaggtaaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgct 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16193643 taaggtaaggggttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgct 16193742  T
Q  154 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaa 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  16193743 ccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16193842  T
Q  254 ttgtgc 259  Q
    ||||||    
T  16193843 ttgtgc 16193848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 127 - 284
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907371
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgt 22907371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 16404852 - 16405107
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||    
T  16404852 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttc 16404950  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16404951 aaatgttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 16405050  T
Q  203 ttgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |   |||||  ||||| ||||||||||||    
T  16405051 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgc 16405107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24928923
Alignment:
Q  54 taaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaa 251  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  252 aattgtgc 259  Q
    ||||||||    
T  24928916 aattgtgc 24928923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373600
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||| ||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  43373592 aaattgtgc 43373600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774378
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgc 6774378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345700
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgc 17345700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 21844594 - 21844692
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  21844594 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21844692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24549113
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgc 24549113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 21851987 - 21852085
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  21851987 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 274846 - 274766
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  274846 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 641003 - 641083
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  641003 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 826809 - 826889
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  826809 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 24716714 - 24716794
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24716714 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120854
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgc 30120854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674512
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgc 16674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 39115678 - 39115598
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  39115678 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226131
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattg 197  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 23226131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222826
Alignment:
Q  202 attgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 222826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736449
Alignment:
Q  202 attgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 736449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860344
Alignment:
Q  202 attgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 860344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15933545 - 15933450
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa-tatgtgaaa 236  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  15933545 aaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaa 15933450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011646
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa-tatgtgaaa 236  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtgaaa 26011646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 259
Target Start/End: Original strand, 691909 - 691966
Alignment:
Q  202 attgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  691909 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 691966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17285600 - 17285548
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17285600 taggagctaaagtgaagcttgggttaggaattggtgataattaaggtaagggg 17285548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 21198005 - 21198057
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| |||||||    
T  21198005 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggg 21198057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516327
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 11516327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441727
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 15441727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262292
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 30262292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293116
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 7293116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3060101
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggggtta-gtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgtt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 3060245  T
Q  112 gtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtt 211  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||     
T  3060244 atatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtg 3060145  T
Q  212 aaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 255  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  3060144 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaatt 3060101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211897
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  16211903 attgtgc 16211897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052795
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatga 250  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  36052803 aaattgtgc 36052795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037146
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |   |||||| ||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  13037138 aaattgtgc 13037146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11580871
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattt 148  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| ||||||||||     
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  149 gtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttat 248  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  249 gaaaattgtgc 259  Q
    |||||||||||    
T  11580861 gaaaattgtgc 11580871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292470
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||||| |||| || ||| |||||| |||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgc 25292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481162
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 258  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 47481162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18253967
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtg 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||     
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgc 18253967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 259
Target Start/End: Original strand, 16478985 - 16479082
Alignment:
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16478985 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 16479082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321182
Alignment:
Q  128 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt 224  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttt 13321182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13572906 - 13572808
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  13572906 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13572808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989541
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgc 10989541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 13911046 - 13911136
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| ||||||||||    
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 13911136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2437687 - 2437590
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  2437687 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 2437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 32493898 - 32493978
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  32493898 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Original strand, 295900 - 296094
Alignment:
Q  62 ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaact 159  Q
    |||||| ||||| | ||||||  |||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||| ||| || || |    
T  295900 ggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgttctaatt 295998  T
Q  160 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaatt 255  Q
      | || ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  295999 gaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaatt 296094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 126818 - 126738
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  126818 agaatcataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 1936869 - 1936949
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1936869 agaatcatagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 111121 - 111201
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  111121 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 169  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 169  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 13377924 - 13377872
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13377924 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13377872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 13389750 - 13389698
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13389750 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13389698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 7283908 - 7283967
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  7283908 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggg 7283967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 236
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915023
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa-tatgtgaaa 236  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaa 16915023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48356891 - 48356796
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa-tatgtgaaa 236  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  48356891 aaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaa 48356796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 223
Target Start/End: Original strand, 48622665 - 48622754
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 223  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  48622665 attgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 48622754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 16919926 - 16919874
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| |||||||    
T  16919926 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggg 16919874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623069
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 20623069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233691
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 21233691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536297
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 16536297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052844
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 129 - 290
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900568
Alignment:
Q  129 ggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaat 228  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  229 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttgacatgttgttgttga 25900568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23507096
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  23507102 attgtgc 23507096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182679
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  27182671 aaattgtgc 27182679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 258
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531198
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatc---atcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  148 tgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagtta 247  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||  |||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  248 tgaaaattgtg 258  Q
    |||||||||||    
T  18531188 tgaaaattgtg 18531198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22053965
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat--tttgtgaa--ttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagtt 246  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||  |||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  247 atgaaaattgtgc 259  Q
     ||||||||||||    
T  22053953 gtgaaaattgtgc 22053965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939408
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgc 34939408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188404
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27010071 - 27009975
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgt 257  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  27010071 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 27009975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 274
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366616
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 22366616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 43443417 - 43443515
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  43443417 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 43443515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 274
Target Start/End: Original strand, 4200007 - 4200120
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| ||| |||     
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 4200106  T
Q  261 aaatggatgaattt 274  Q
    |||| | |||||||    
T  4200107 aaattggtgaattt 4200120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 274
Target Start/End: Original strand, 18778014 - 18778127
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||     
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 18778113  T
Q  261 aaatggatgaattt 274  Q
    |||| | |||||||    
T  18778114 aaattggtgaattt 18778127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19500031
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgc 19500031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426760
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgc 25426760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12506
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgc 12506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073715
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgc 21073715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584394
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 11584394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950861
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt 224  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||| || || || |||| ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttt 32950861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 240
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310808
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa-tatgtgaaaatga 240  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| |||||| ||| | |||||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtgaaaatga 21310808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918131
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 223  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 29918131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 21222462 - 21222514
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  21222462 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtatgggg 21222514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 122020
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  122026 attgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488662
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 10488662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328089
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 16328089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 54118120 - 54118376
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  54118120 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttc 54118219  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54118220 aaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 54118319  T
Q  203 ttgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |   || ||| ||||| ||||||||||||    
T  54118320 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgc 54118376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 127 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680306
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgt 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacatgttgt 26680306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246561
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||| ||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  13246569 aaattgtgc 13246561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675221
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagtt 246  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||  |||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  247 atgaaaattgtgc 259  Q
     ||||||||||||    
T  15675209 gtgaaaattgtgc 15675221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104382
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    |||   | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagtt 246  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||  |||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  247 atgaaaattgtgc 259  Q
     ||||||||||||    
T  10104370 gtgaaaattgtgc 10104382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048368
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    |||||| |||| || |||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaattt 13048368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10644449 - 10644336
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  |||||||     
T  10644449 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 10644350  T
Q  261 aaatggatgaattt 274  Q
    |||| | |||||||    
T  10644349 aaattggtgaattt 10644336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115764
Alignment:
Q  154 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaa 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  254 tt 255  Q
    ||    
T  31115765 tt 31115764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240890
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtat 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtat 33240890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 25119059 - 25119139
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  25119059 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357771
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 47357771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 252
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885680
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa-tatgtgaaaatgaa 241  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  242 aagttatgaaa 252  Q
    |||||||||||    
T  40885670 aagttatgaaa 40885680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 5682380 - 5682460
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag-gggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5682380 agaatcataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7850228 - 7850131
Alignment:
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||| |||||||| ||| ||| |||||| | || ||| |||||||||||  ||||  ||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7850228 gatgttatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtggaattgtatgtccaattatgtgaaaatgtgaagttatgaaaattgtgc 7850131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 41165808 - 41165860
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  41165808 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaacgtaagggg 41165860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 47534933 - 47534985
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | || || | |||| ||||||||||||||||||    
T  47534933 taggagctaaagtgaagcttgggcgaggaattggtgataattaaggtaagggg 47534985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1255
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  252 aattgtgc 259  Q
    ||||||||    
T  1262 aattgtgc 1255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3714
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  3708 attgtgc 3714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26895
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 26895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 134 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22640
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtg 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 22640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1745
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 1745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 127 - 284
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37223
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgt 37223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41712 - 41632
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  41712 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48729
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||| |||||    
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  48735 attgtgc 48729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36210
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||     
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T
Q  261 aaatggatgaattt 274  Q
    |||| | |||||||    
T  36223 aaattggtgaattt 36210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 259
Target Start/End: Original strand, 51121 - 51314
Alignment:
Q  66 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51121 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatg 51220  T
Q  166 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51221 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 274
Target Start/End: Original strand, 882 - 1103
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||    
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    |||||||  ||| |||||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattt 1103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 53 - 274
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37060
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||| |    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatg 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  250 aaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattt 37060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 15319 - 15378
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15319 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggg 15378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41860
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| || || |||||    
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  41866 attgtgc 41860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 172021
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| |||||    
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    ||||||| |||| | |||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattt 172021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177724
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| |||||    
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    ||||||| |||| | |||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattt 177724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6196
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| | |||    
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  6190 attgtgc 6196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12229
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgt-aactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaa 251  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  252 aattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    |||||||| |||| | |||||||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattt 12229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19537 - 19337
Alignment:
Q  62 ggggttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaac 158  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19537 ggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaac 19438  T
Q  159 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  19437 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 19338  T
Q  259 c 259  Q
    |    
T  19337 c 19337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21421
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 21421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 257
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26545
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||| |||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  252 aattgt 257  Q
    ||||||    
T  26540 aattgt 26545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8312
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgc 8312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 6877 - 6929
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  6877 taggagttaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 6929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153578
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||| ||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  23153586 aaattgtgc 23153578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 258
Target Start/End: Original strand, 14626089 - 14626249
Alignment:
Q  98 aattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattg 197  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14626089 aattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 14626188  T
Q  198 tatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14626189 tatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 14626249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657880
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgc 1657880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009571
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgc 35009571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862602
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgc 15862602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650225
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgc 1650225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 19983144 - 19983224
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  19983144 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 35015009 - 35015089
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  35015009 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25175787 - 25175680
Alignment:
Q  167 tatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatgg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |    
T  25175787 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 25175688  T
Q  267 atgaattt 274  Q
     |||||||    
T  25175687 gtgaattt 25175680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 274
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654118
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 27654118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt 122  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16825879
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgta--tgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaa 236  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||  | ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  237 atgaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaat 16825879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751605
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggt 210  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggt 27751605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29666040
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt 224  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| | || ||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgttt 29666040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18583720 - 18583640
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  18583720 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 21623563 - 21623511
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  21623563 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 21623511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605596
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttta-aatatgtgaaaatgaa 241  Q
    ||||| |||||| || | || ||||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||  |||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgaa 29605597  T
Q  242 a 242  Q
    |    
T  29605596 a 29605596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 236
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629703
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa-tatgtgaaa 236  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaa 18629703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Original strand, 17083216 - 17083296
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttta-aatatgtgaaaatga 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||  |||||||| |||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  17083216 tgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatga 17083296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 22361619 - 22361671
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  22361619 taggagctaaagtgaagcttggcctaggaattggtgataattaaggtaagggg 22361671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128301
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||  ||  ||||| |||||    
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  128295 attgtgc 128301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31787
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaa 251  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||  ||||||| ||||||||||    
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 31787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 259
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5193
Alignment:
Q  63 gggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaacttt 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 5193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247574
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||| |   |||||| ||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  247566 aaattgtgc 247574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123296
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatg 249  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  250 aaaattgtgc 259  Q
    ||||||||||    
T  123287 aaaattgtgc 123296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89586
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |   |||| | ||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  89578 aaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 178
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||| ||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatg 178  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272141
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  || |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| |||||    
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    ||||||| |||| | |||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattt 272141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 9009
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||  ||||| |||||    
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  9015 attgtgc 9009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 149018 - 148852
Alignment:
Q  95 gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataat 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  149018 gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 148919  T
Q  193 aattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  148918 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 148852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9180 - 8980
Alignment:
Q  65 gttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatttgtgctccaac 158  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  9180 gttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccatc 9081  T
Q  159 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  9080 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtg 8981  T
Q  259 c 259  Q
    |    
T  8980 c 8980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146844
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaatt 146844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5660
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtg 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13622
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
     ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 13622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42754 - 42677
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  42754 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48318
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtg 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||     
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgc 48318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 20572 - 20513
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20572 agaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 20513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 229
Target Start/End: Original strand, 534 - 636
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  227 ata 229  Q
    |||    
T  634 ata 636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41780
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 258  Q
     ||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtg 41780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107878
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtg 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||      
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgc 107878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 259
Target Start/End: Original strand, 64573 - 64648
Alignment:
Q  184 attgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  64573 attgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 64648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 184
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  142 taaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 13347 - 13445
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  13347 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9469
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 9469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16367
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 16367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 265 - 167
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||    
T  265 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgc 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 257
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34590
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 226  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  227 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgt 257  Q
     | ||| |||||   ||||| ||||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgt 34590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 43114
Alignment:
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaa 261  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| |    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  262 aatggatgaattt 274  Q
    ||| | |||||||    
T  43126 aattggtgaattt 43114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 3094
Alignment:
Q  138 ttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaa 237  Q
    |||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  238 tgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||  ||||| ||||||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgc 3094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5335
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 5335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14181
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgc 14181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 256
Target Start/End: Original strand, 21138 - 21233
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattg 256  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  21138 tgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattg 21233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1424
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 80267 - 80187
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  80267 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3854
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgt-gaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtg 3854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 166116 - 166197
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  166116 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162111
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 116410 - 116462
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  116410 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 116462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 31132 - 31212
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  31132 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5809
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6015
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacat 220  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 304 - 385
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  304 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 224
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56196
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt 224  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttt 56196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 1780 - 1721
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1780 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 1721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 19802 - 19861
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19802 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 19861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 24106 - 24165
Alignment:
Q  6 agaagcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24106 agaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 24165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45197
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgttt 45197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54583
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgttt 54583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8176
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 223  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| || || ||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgtt 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 35873 - 35821
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  35873 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 35821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 240
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1447
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat-gaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa-tatgtgaaaatga 240  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||||    
T  1348 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatga 1447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 240
Target Start/End: Original strand, 9603 - 9702
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat-gaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa-tatgtgaaaatga 240  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||||    
T  9603 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatga 9702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 114
Alignment:
Q  15 ggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  164 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 224
Target Start/End: Original strand, 10338 - 10428
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt 224  Q
    |||||||||||||| ||||||   || ||||||||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  10338 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Original strand, 6261 - 6315
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||||||||||    
T  6261 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggg 6315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 196
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70361
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataatt 196  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatt 70361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 447
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | ||||||||||    
T  499 taggagctaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataactgaggtaagggg 447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 1363 - 1415
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||    
T  1363 taggaactaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggg 1415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 76699 - 76751
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  76699 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgctgataattaaggtaagggg 76751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University