View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2009_low_2_N (Length: 458)

Name: NF2009_low_2_N
Description: NF2009
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2009_low_2_N
NF2009_low_2_N
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (12-458)||(16657309-16657755)
chr2 (15-427)||(16661787-16662199)
chr2 (12-458)||(43625342-43625788)
chr2 (12-412)||(12234665-12235065)
chr2 (14-412)||(7542202-7542600)
chr2 (12-427)||(14703369-14703784)
chr2 (114-412)||(12258475-12258773)
chr2 (12-412)||(12245198-12245598)
chr2 (12-304)||(11999478-11999770)
chr2 (12-153)||(17716485-17716626)
chr2 (374-412)||(11999383-11999421)
chr2 (190-220)||(17704013-17704043)
chr2 (183-220)||(273279-273316)
chr2 (190-226)||(17648005-17648041)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (11-458)||(8659293-8659740)
chr7 (12-451)||(10494166-10494605)
chr7 (12-455)||(13333248-13333691)
chr7 (12-455)||(8667352-8667795)
chr7 (15-458)||(1301390-1301837)
chr7 (21-455)||(8654383-8654817)
chr7 (15-427)||(8585501-8585913)
chr7 (12-432)||(8646833-8647253)
chr7 (15-454)||(17260175-17260614)
chr7 (15-309)||(8628611-8628905)
chr7 (14-454)||(17267873-17268313)
chr7 (30-428)||(27830685-27831083)
chr7 (12-412)||(3147240-3147648)
chr7 (12-196)||(8671422-8671606)
chr7 (15-454)||(6789446-6789885)
chr7 (12-331)||(8636135-8636454)
chr7 (180-421)||(8545600-8545841)
chr7 (12-421)||(29581633-29582042)
chr7 (28-421)||(8576293-8576686)
chr7 (12-325)||(8602037-8602350)
chr7 (12-421)||(8570278-8570687)
chr7 (12-421)||(7877525-7877934)
chr7 (30-421)||(29577479-29577873)
chr7 (27-421)||(8609884-8610278)
chr7 (21-421)||(8382677-8383077)
chr7 (12-421)||(8581667-8582076)
chr7 (12-421)||(8590605-8591014)
chr7 (36-304)||(8538120-8538388)
chr7 (12-426)||(39985608-39986022)
chr7 (12-98)||(8640339-8640425)
chr7 (11-139)||(8017204-8017332)
chr7 (13-335)||(8559386-8559708)
chr7 (12-154)||(8102901-8103043)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (11-458)||(4678349-4678795)
chr1 (12-423)||(34466585-34466996)
chr1 (15-428)||(15594994-15595414)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (12-455)||(9335683-9336126)
chr4 (27-424)||(30775216-30775613)
chr4 (12-382)||(35132454-35132824)
chr4 (12-156)||(23587525-23587669)
chr4 (11-146)||(54396665-54396800)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (270-458)||(43744746-43744934)
chr8 (12-395)||(12528497-12528880)
chr8 (12-240)||(43744997-43745223)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (261-458)||(28219848-28220045)
chr5 (12-240)||(28220099-28220327)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (12-320)||(28910650-28910958)
chr6 (71-153)||(11200123-11200205)
chr6 (71-145)||(11170813-11170887)
chr6 (71-145)||(11209635-11209709)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 458
Target Start/End: Original strand, 16657309 - 16657755
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16657309 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccatcgctggccttaatgtcattcgaatta 16657408  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16657409 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtcttgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 16657508  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16657509 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 16657608  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16657609 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaactcaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaa 16657708  T
Q  412 agaggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtagattct 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16657709 agaggacactctcttttgcttttgtcaccactgttgaggtagattct 16657755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 427
Target Start/End: Original strand, 16661787 - 16662199
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatca 114  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |  | || ||||    
T  16661787 aatgcagttgtcactgttcctgcttattttaacgattctcagcgaaaagccaccatggatgctggtgccattgctggccttaacgttgtgaggataatca 16661886  T
Q  115 atgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttt 214  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16661887 atgaacccactgcagcagctattgcatatggccttgacaaaagaagtaattgtgatggtgaaagaaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttt 16661986  T
Q  215 tgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtg 314  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16661987 tgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagccacttctggaaacactcacctcgggggagaggactttgataacagaatgttg 16662086  T
Q  315 aactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaaga 414  Q
    |||||||||||  | || ||| | | |||||| || ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| || |    
T  16662087 aactactttgtgaaagaatttaataggaagaacaaagtggatatcactaggaatccaagagccttgaggaggttgagaacttcttgtgaaaaggcgaaaa 16662186  T
Q  415 ggacactctcttt 427  Q
    |||||||||||||    
T  16662187 ggacactctcttt 16662199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 43625788 - 43625342
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |    
T  43625788 aagaatgcagttgttaccgtgcctgcttacttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgttggtgtcattgtcggccttaatgttttacgagtaa 43625689  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    |||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||  || ||||||||| | |||||| |||  |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  43625688 tcaatgaaccaacagctgctgctctagcatacggccttaacaagagaattaattgtgttggagaacgaaatattttcatctttgaccttggtggtggtac 43625589  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   | || ||    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |    
T  43625588 ttttgatgtgtctatacttacaattaaggacaaggtcttccgtgttaaagccactgctggaaacactcaccttggaggagaggactttgatgatagaatg 43625489  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaa 411  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| || | ||| ||  |||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||| | ||    
T  43625488 gtgaactactttgcagaagaatttgagaagaagaacaatgtggatattattggaaactcaagagccataagaaggttgagaacggcatgcgagagaggaa 43625389  T
Q  412 agaggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtagattct 458  Q
    | |||||||| ||||||||||   ||| |||| | ||||||||||||    
T  43625388 aaaggacactgtcttttgcttcgttcagcactattgaggtagattct 43625342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12235065 - 12234665
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||  |  |  | |    
T  12235065 aagaatgcagttgttaccgtgcctgcttatttcaatgattctcaacgaaaagcaactatagatgctggtgtcattgctggcctcaatgttatgagggtaa 12234966  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    | || ||||| |  || || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  12234965 tgaacgaacccatggcagccgctgttgcatatggtcttgacaagagaactgattgtgttggagaacgaaatatttttgtttttgatctcggcggtggcac 12234866  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || ||| |||| ||  | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  12234865 ttttgatgtgtctctcctaacaatcaaaggtaatgtcttccaagttaaagccacagccggaaacactcacctcgggggagaggactttgataacagaatg 12234766  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaag-aagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggca 410  Q
    || |||||| |||   | ||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12234765 gtaaactaccttgctcaagag-ttcaatagaaagaaaaaagtggacatgagtggaaatccaaaagccttgaggaggttaagaactgcttgtgagagggca 12234667  T
Q  411 aa 412  Q
    ||    
T  12234666 aa 12234665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 7542600 - 7542202
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |  |    ||     
T  7542600 gaatgcagttgttactgtacctgcttattttaatgattctcaacgaaaagccactatagatgcgggtgccattgctggcctcaatgttatgagggcaatg 7542501  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||  | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7542500 aatgaacctactgccgcagctgttgcatatggccttgacaagagaactgattatgatggagagcgaaatatttttgtttttgatcttggcggtggcactt 7542401  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||||||| | || || ||||||||  |    ||  | || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||     
T  7542400 ttgatgtgtctttactaacgattaagggcaacaacttccaagttaaggccactgctggcaacactcaccttggtggagaagactttgataatagaatggc 7542301  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaagaa-gaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaa 412  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7542300 gaactactttgtacaagagtt-caagagaaagaacaaagtggacattagtgggaatccaaaagccttgaggaggttgagaactgcttgtgagagggcaaa 7542202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 14703784 - 14703369
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| || | |||||| ||  |||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| |||||  |  |  | |    
T  14703784 aagaatgcagttgttacggtgcctgcttattttagtgattctcaaagaaaagccactatggatgctggtgttattgccggcctcaatgttatgagggtaa 14703685  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| || |||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14703684 tgaatgaacctacagctgcagctattgcatatggccttgacaagagaactgattatggtggagaacgtaatatatttgtctttgatcttggtggtggtac 14703585  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||    || ||  |  | || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  14703584 ttttgacgtgtctctcctaacaattaagggcaccgtcttccaaattaaggctactgctggaaacactcacctcgggggagaggacttcgataacagaatg 14703485  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataag-gtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggca 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||| |||| ||  ||  ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||||||    
T  14703484 gtgaactactttgttcaagag-ttcaagagaaaaaacagattggacattagtggaaatccaaaagccttaaggagcttgagaaccgcttgcgagagggca 14703386  T
Q  411 aagaggacactctcttt 427  Q
    || || ||||| |||||    
T  14703385 aaaagaacactttcttt 14703369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 412
Target Start/End: Original strand, 12258475 - 12258773
Alignment:
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| | ||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12258475 aatgaacctactgctgcagcttttgcatatggccttgacaaaagaattaattgtgtcgaaaaacggaatatttttgtctttgatcttggtggtggcactt 12258574  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||||||| | || || ||||||| | |||| ||| | || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  12258575 ttgatgtgtctctactaaccattaaggataatgtctttcaagttaaggctacagctggaaacacgcaccttggaggagaggactttgataatagaatggt 12258674  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaag-aagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaa 412  Q
    ||  ||||||||||| ||| ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||| |||||    
T  12258675 gagttactttgtagaagag-ttcaagagaaagaacaaagtagatataagtggaaatccaagagctttgaggagattgaaaacagcttgtgagagtgcaaa 12258773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 412
Target Start/End: Original strand, 12245198 - 12245598
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| || |||||  |  |  | |    
T  12245198 aagaatgctgttgttactgtacctgcttattttagtgattctcagcgaaaagcaacgatagatgctggctcaattgctggtctcaatgttatgagggtaa 12245297  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||  |||||||| |||  || | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  12245298 tgaatgaacccactgctgcagctgttgcatatggccttgaaaagagagctgattgtgttggagaaagaaacatttttgtgtttgatcttggtggtggcac 12245397  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||| | |  | ||  | || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |    
T  12245398 ttttgacgtttctatcctaactattaaggataacatcttccaagttaaggccactgctggaaacactcaccttggaggagaggattttgataatagaatg 12245497  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaag-aagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggca 410  Q
    || |||||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||  |||| || ||||  | | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12245498 gtaaactactttgcacaggag-ttcaagagaaagaacaaattggatattagtgcaagttcaaaagccttgaggagattgagaactgcttgtgagagggca 12245596  T
Q  411 aa 412  Q
    ||    
T  12245597 aa 12245598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11999770 - 11999478
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| || | |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||  |  |  | |    
T  11999770 aagaatgttgttgttactgtaccagcttattttagtgattctcaacgaaaagccactatagatgccggtgcaattgctggcatcaatgttataagggtaa 11999671  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    | |||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||  || | || ||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  11999670 tgaatgaacccactgctgcaactgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttggagaaagaaacattttagtctttgatcttggcggtggcac 11999571  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataa 304  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||   |||| ||  | || || ||||| || |||||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  11999570 ttttgatttgtctatactaacaattaaggacaatgtcttccaagttaaggccacagctggaaacactcacttcggaggagaggattttgataa 11999478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 153
Target Start/End: Original strand, 17716485 - 17716626
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||  ||| ||| || |||| || |   |||||||||| |||||||| |||||| || |  ||||||    
T  17716485 aagaatgccgttgttactgtccctgcttactttaatttttctcagagacaagctactaagcatgctggtgctattgctggtcttaatttcatgagaatta 17716584  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgaca 153  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  17716585 ttaatgagcccactgctgcagccattgcttatggttttgaca 17716626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11999421 - 11999383
Alignment:
Q  374 agccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaa 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11999421 agccttgaggaggttgagaactgcttgtgagagggcaaa 11999383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 220
Target Start/End: Original strand, 17704013 - 17704043
Alignment:
Q  190 tctttgaccttggcggtggtacttttgatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17704013 tctttgaccttggcggtggtacttttgatgt 17704043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 220
Target Start/End: Original strand, 273279 - 273316
Alignment:
Q  183 atttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgt 220  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  273279 attttggtctttgaccttggaggtggtacttttgatgt 273316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 226
Target Start/End: Original strand, 17648005 - 17648041
Alignment:
Q  190 tctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17648005 tctttgaccttggcggtggtacttttgacgtctctat 17648041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 8659740 - 8659293
Alignment:
Q  11 gaagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatt 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  8659740 gaagaatgctgttgttacagtgcctgcatagttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagattccggtgccattgctggccttaatgtcattcagata 8659641  T
Q  111 atcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggta 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  8659640 attaatgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaggtgactgtgatggtaaacaaaatattttggtctttgatcttggtggtggta 8659541  T
Q  211 cttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  8659540 cttttgatgtgtctatccttacaatgaagggtgatgtctttgaagtaaaagccacttctggaaacactcaccttggaggagaggactttgatagcagaat 8659441  T
Q  311 ggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8659440 ggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataaagtggacattagtggtaacccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggca 8659341  T
Q  411 aagaggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtagattct 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8659340 aagaggacactctcttttgcttttgtcaccactgttgaggtcgattct 8659293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 451
Target Start/End: Original strand, 10494166 - 10494605
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  10494166 aagaatgctgttgttactgtgccggcttacttcaacgattctcaacgaaaggctactattgatgctggtgctattgctggccttaatgtcattcggataa 10494265  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  10494266 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagagaagtgattgtgagggtaaccgaaatatttttgtctttgatctgggtggtggtac 10494365  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  10494366 ttttgatgtgtctatcctcacaattaagggtgatgtctttgaagtaaaagccactgcaggtaacactcaccttgggggagaggacttcgataacagaatg 10494465  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaa 411  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10494466 gtgaattattttgttgaggagttcaaaaagaagaataacgtggacatcagtgggaatccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaa 10494565  T
Q  412 agaggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggt 451  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  10494566 aaaggatactctctttttcttttgtcaccaccgttgaggt 10494605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 455
Target Start/End: Original strand, 13333248 - 13333691
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |    
T  13333248 aagaatgccgttgttactgtgccggcttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtgctattgctggccttaatatcattcgaataa 13333347  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  13333348 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagagacgtgattgtgatggtaagcgaaatatttttgtctttgatctgggtggtggtac 13333447  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  13333448 ttttgatgtgtctatccttacaattatgggtgatgtctttgaagtaaaagccaccgcaggaaacactcaccttgggggagaagacttcgataacagaatg 13333547  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaa 411  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| || || || |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13333548 gtgaactattttgttgaggagttcaaaaagaagaataacgtcgatatcagtgggaacccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggaaa 13333647  T
Q  412 agaggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtagat 455  Q
    | |||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  13333648 aaaggatactctccttttcttttgtcaccactgttgaagtagat 13333691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 8667795 - 8667352
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||| || |    
T  8667795 aagaatgccgttgttactgtgccagcttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtactattgctggacttaatgtcattcggataa 8667696  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || || || || ||    
T  8667695 tcaatgaacctactgcggcagctattgcatatggccttgacaagagaaatgactgtgatggtagccgaaatatttttgtctttgatctgggtggcgggac 8667596  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  8667595 ttttgatgtgtctatcctcacaattaagggtgatgtctttgaagtgaaagccactgcaggaaacactcaccttgggggcgaggacttcgataacagaatg 8667496  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaa 411  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8667495 gtgaactattttgttgaggagttaaaaaagaagaataaagtggacatcagtcagaacccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaa 8667396  T
Q  412 agaggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtagat 455  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8667395 aaaggatactctcttttgcttttgttaccactgttgaggtagat 8667352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 1301837 - 1301390
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatca 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  || || |    
T  1301837 aatgctgttgttactgtgcctgcacatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgccggtgcaattgctggccttaatgtcattcagataatta 1301738  T
Q  115 atgaaccta----ctgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggta 210  Q
    |||||||||    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1301737 atgaacctagctactgctgcagctattgcgtatggttttgacaagagaagtgactgtgatggtaaacggaatattttggtctttgaccttggcggtggta 1301638  T
Q  211 cttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaac 310  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  1301637 cttttgatgtgtctatccttaccatcaagggcgatgtctttgaagtaaaagccactggtggaaatactcaccttggaggagaggactttgataatagaat 1301538  T
Q  311 ggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggca 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||| || |  | | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1301537 ggtgagctactttgtagaggagttcagaaagaagaataaagtggacattagtggtaaccagaaatccttaaggaggttgagaattgcgtgtgagagggca 1301438  T
Q  411 aagaggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtagattct 458  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  1301437 aaaaggacactctcttttgctttagtcaccaccgttgaggtcgattct 1301390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 8654817 - 8654383
Alignment:
Q  21 gttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaac 120  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||  |||||||||    
T  8654817 gttgttactgtgccggcatacttcaatgactctcagcgaaaagcaaccatagatgctggtgccattgctggacttaacgtcattcggatactcaatgaac 8654718  T
Q  121 ctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgt 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8654717 ctactgccgcagctattgcatatggccttgacaagcgaagtaactatgatggtaaacggaatattttggtatttgatcttggtggtggtacttttgatgt 8654618  T
Q  221 gtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactac 320  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  8654617 gtctatactcacaattaagggtgatgtctttgacgtaaaagccactgctggaaacacgcacctagggggagaagactttgataacagaatggtgtactac 8654518  T
Q  321 tttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaagaggacac 420  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || || || || |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  8654517 tttgtagaggagttcaaaaagaagaataaagtggaaattagcggtaacccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaaaaaggatac 8654418  T
Q  421 tctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtagat 455  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  8654417 tctcttttacttttgtcaccactgttgaggtagat 8654383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 427
Target Start/End: Original strand, 8585501 - 8585913
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatca 114  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||    
T  8585501 aatgcagttgtgactgtgcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatggatgctggtgccattgctggccttaatgttatgaggataatca 8585600  T
Q  115 atgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttt 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | | || | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  8585601 atgaacccactgctgcagctattgcatatggccttgacaacaaaggtaactgtgatggtgaacgaaatatttttgtgtttgatcttggtggtgggacttt 8585700  T
Q  215 tgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtg 314  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  8585701 tgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagcaaccgctggaaatactcaccttgggggaggggactttgataacagaatgttg 8585800  T
Q  315 aactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaaga 414  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |  ||||| || ||||| || | |  ||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| | |||||| |    
T  8585801 aactactttgttgaggaatttaagagaaagaacaatgtggatattactaagaacccaagagctttgaggcggttaagaacggcatgtgaaaaggcaaaaa 8585900  T
Q  415 ggacactctcttt 427  Q
    ||||||| |||||    
T  8585901 ggacactttcttt 8585913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8647253 - 8646833
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || | || || |    
T  8647253 aagaatgcagttgttactgtgcctgcatacttcaatgattatcagcgaaaagccactatagatgccggggccattgctggccttaatatcatccggataa 8647154  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    |||||||||| || ||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||   |||||| ||   |||| ||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||    
T  8647153 tcaatgaaccaacagctgctgctctcgcatatggccttgacaagagaacaaattgtgctgaagaacgaaatatattcatcttcgaccttggtggtggaac 8647054  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||| | || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| |    
T  8647053 ttttgatgtgtctctccttacaattaaggataaggtctttcatgttaaagccaccgctggaaacactcacctcggaggagaggactttgatagtagaatg 8646954  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaa 411  Q
    ||| || |||||| | | || ||| | |||||||| ||||||||||| | ||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  8646953 gtggaccactttgcacaagaatttaacaagaagaacaaggtggacattactggaaactcaagagccttaaggaggttgagaacggcatgcgagagagcaa 8646854  T
Q  412 agaggacactctcttttgctt 432  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  8646853 aaaggacactatcttttgctt 8646833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17260614 - 17260175
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta-tc 113  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||  | ||| |     
T  17260614 aatgttgttattactgttcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgctggtgttattgctggcctttatgt-tttgaagttaatt 17260516  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||| |     ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  17260515 aatgaacctattgctgcagctattgcatatggccttgtcaagagaactaattgtgtttaagtacggaatatttttgtctttgaccttggtggggggactt 17260416  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | | || || || || || ||||| |  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  17260415 ttgatgtgtctctcgttacaattaaggataaggtcttcgaagttaaggccaccggtggagacactcatcttgggggtgaggactttgataatagaatggt 17260316  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaagaa-gaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaa 412  Q
    | |||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||  ||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  17260315 gtactattttgtagaggag-atcaaaagaacgaaaaaattggacattattgggaacccaaaagccttaaggaggttgagaactgcatgtgaaaaagcaaa 17260217  T
Q  413 gaggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtaga 454  Q
     |||||||| |||||||| | ||| |||| ||| ||||||||    
T  17260216 aaggacactttcttttgcctctgtgaccaatgttgaggtaga 17260175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8628905 - 8628611
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatca 114  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||    
T  8628905 aatgcagttgtcaccgtgcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatgaatgctggtgccattgctggccttaatgttatgaggataatca 8628806  T
Q  115 atgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttt 214  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  8628805 atgaccccactgctgcagctattgcatatggccttgacaacaaaggtaggtgtgatggtgaacgaaatatttttgtgtttgatcttggtggtgggacttt 8628706  T
Q  215 tgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaa 309  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8628705 tgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagccactgctggaaatactcaccttggtggagaggactttgataacagaa 8628611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17268313 - 17267873
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     | |||    
T  17268313 gaatgctgtcattactgtcccggcttacttcaacgattctcagcgaaaagccaccatagatgctggtgtcattgctggccttaatgtattgaaggtaatc 17268214  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | | |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17268213 aatgaaccaactgctgcagctattgcatatggccttggcaagagaactaactgtgttgaagaacggaatatttttgtctttgaccttggtggtgggactt 17268114  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | | || || || || || ||||| |  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  17268113 ttgatgtgtctctcgttacaattaaggataaggtcttcgaagttaaggccaccggtggagacactcatcttgggggtgaggactttgataatagaatggt 17268014  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaag 413  Q
      |||| ||||| |||||  |  ||| ||| || ||  || | ||   |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||     
T  17268013 atactattttgttgaggaaatcaaaaggaaaaaaaaattgaaaattgttgggaacccaaaagccatgaggaggttgagaactgcatgtgaaaaagcaaaa 17267914  T
Q  414 aggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtaga 454  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||||||||    
T  17267913 aggacactttctttcgcctctgtgaccaatgttgaggtaga 17267873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 428
Target Start/End: Original strand, 27830685 - 27831083
Alignment:
Q  30 gtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctg 129  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||  | || || || |  || ||||||||||    
T  27830685 gtgccagcttatttcaatgactctcaacgaaaagccactgtagattccggtgccattgctggccttaatgttatgcggataataagcgagcctactgctg 27830784  T
Q  130 cagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatcct 229  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | |||   | | |  |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |    
T  27830785 cagctattgcatatggccttgacacgggaacaaaatatactggagaacggaatatttttgtgtttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtctcttgt 27830884  T
Q  230 tacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgtagag 329  Q
    ||||||||||| | | || ||  | || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| |||    
T  27830885 tacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactattttgtggag 27830984  T
Q  330 gagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaagaggacactctctttt 428  Q
    | |||  | |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27830985 gtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacctaatgtgagaaggcaaaaaggacactctctttt 27831083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3147648 - 3147240
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| |  | || || |    
T  3147648 aagaatgcagttgttaccgtacctgcttatttcaatgatgctcagcggaaagcgacaatagatgctggtgttattgctggccttaatattatgcggataa 3147549  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtg--atggtaaa------cggaatatttttgtctttgaccttggc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| | ||||||  || ||  |      || ||||||||| |||||||| | ||     
T  3147548 tcaatgaacctactgctgcagctattgcgtatggactggacaagagaactaattgtgtaattgtgtagaggagcgtaatatttttatctttgacttgggt 3147449  T
Q  204 ggtggtacttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgata 303  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | | || ||| | || || ||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3147448 ggtgggacttttgatgtgtctcttcttacaattaaggataaggtctttcaagttaaggccatcgcaggaaacacccaccttgggggagaggactttgata 3147349  T
Q  304 acagaacggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtga 403  Q
    | || | |||||||||||||| |  ||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||| |||  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  3147348 ataggatggtgaactactttgcacgggagtttaagaagaagaacaaggtagacattagtgagaactcaagagccttaaggaggttgaaaacggcgtgtga 3147249  T
Q  404 gagggcaaa 412  Q
     || |||||    
T  3147248 aagagcaaa 3147240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 196
Target Start/End: Original strand, 8671422 - 8671606
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||| || |    
T  8671422 aagaatgccgttgttaccgtgccagcttacttcaatgattctcagcgaacggccaccattgatgctggtactattgctggacttaatgtcattcggataa 8671521  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttga 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  8671522 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagagaaatgaccgtgaaggtaaccgaaatatttttgtctttga 8671606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 6789885 - 6789446
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatca 114  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||    
T  6789885 aatgcagttattactgtgcctgcttatttcaatgattctcaacggaaagccactttagatgctggtgccattgctggtcttaatgttatacgaataatca 6789786  T
Q  115 atgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttt 214  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||| | |||  | |||  ||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  6789785 atgaaccaacagctgctgctcttgcatatggccttgataagagaactaattacggtggagaaaaaaatattttcgtcttcgaccttggtggtggcacttt 6789686  T
Q  215 tgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtg 314  Q
     |||||||||||| | ||||| || | | | || ||  | || || ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  |||     
T  6789685 cgatgtgtctatcttaacaatcaaagataaggtcttccaagttaaggccaccggtggaaacactcacctcggaggagaggactttgataaccgattggta 6789586  T
Q  315 aactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaaga 414  Q
    |||||||||| |||||||||| | | |||||| || ||||| || | ||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  6789585 aactactttgcagaggagtttaagaggaagaacaaagtggatattactggaaactcaagggccttaagaaggttgagaactgcgtgtgaaagggccaaaa 6789486  T
Q  415 ggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtaga 454  Q
    ||  ||||||||||| | | ||||| ||| | ||||||||    
T  6789485 gggtactctcttttgttgtcgtcactactattgaggtaga 6789446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 8636135 - 8636454
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || |    
T  8636135 aagaatgcagtcattactgtgcccgcttatttcaatgattctcagcgtaaatccaccaaagatgctggtgccattgccggccttaatgtaattcggataa 8636234  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||  || | |||||| || | |||| |    |  | || ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  8636235 tcaatgaaccaactgctgcagcttttgcgtatggacttcaaaagagaggtaactgtgttaaagagagaaacattttcgtatttgatcttggtggtggtac 8636334  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
     || || |||||||| || | |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  8636335 attcgacgtgtctatactcaaaattaaaggtgaagtctttgaagttaaagccactgccggagacacacaccttggaggagaggactttgataacagaatg 8636434  T
Q  312 gtgaactactttgtagagga 331  Q
    ||| | || |||||||||||    
T  8636435 gtggaatattttgtagagga 8636454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8545841 - 8545600
Alignment:
Q  180 aatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactc 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   | | || ||||| || || |||||||| ||| |||||     
T  8545841 aatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattcttacaattaaaaataaggtctttgatgtcaaggccactgctggagacactt 8545742  T
Q  280 accttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagcctt 379  Q
    |||| || || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||  | | |||||| || | ||| || ||| |||| |||  ||||||    
T  8545741 acctaggcggtgaagactttgataacagaatggtgaattactttgtgaaggagttcaagaggaagaacaatgaggatattagtcggaacccagaagcctt 8545642  T
Q  380 gaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaagaggacact 421  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  8545641 gaggaggttgagaactgcctgtgagaaggcaaaaaggacact 8545600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Original strand, 29581633 - 29582042
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    || |||||||| |||||  |  | || |    
T  29581633 aagaatgcagtgattaccgtgcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccaaagatgctggcattatagctggcctcaatgtaatgaggataa 29581732  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    |||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||| | ||| || || ||| || ||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  29581733 tcaacgaaccaactgctgctgcacttgcatatggtattcaaaagggaggtaattttgttggaaaacgaaatatattcatctttgatcttggtggtggcac 29581832  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    ||||||||||||| | || ||| | |||| ||||   ||||| || || |||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||||||| ||| |    
T  29581833 ttttgatgtgtctcttctcacactcaaggatgataagtttgaagtgaaggccactgctggcgatactcacctaggaggagaggactttgataaccgaatg 29581932  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaa 411  Q
    ||||| |||||||   | |||||  | | |||||| ||  ||||||| |||||||| |||| ||| || |||| | ||||||| || |||||||||||||    
T  29581933 gtgaattactttgcgaatgagttgaagaggaagaacaatttggacattagtgggaacccaaaagctttaaggaagctgagaacagcttgtgagagggcaa 29582032  T
Q  412 agaggacact 421  Q
    ||||||||||    
T  29582033 agaggacact 29582042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8576686 - 8576293
Alignment:
Q  28 ctgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgc 127  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || |||| |||||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||| | |  || ||||||||||| |||||    
T  8576686 ctgtgcctgcttattttaatgattcccaacgaagagccactaaagatgcaggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgc 8576587  T
Q  128 tgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatc 227  Q
     |||||| |||| |||||  || | ||||||  | |||||| || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  8576586 ggcagctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaaagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctatt 8576487  T
Q  228 cttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgtag 327  Q
    || ||| |||||    |||| || || || || |||||||||||| |||||||||| || ||  | ||||||||||||| || |||| |  |||||||      
T  8576486 ctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacctaggaggccaagactttgataacataatggtggatcactttgtta 8576387  T
Q  328 aggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaagaggacact 421  Q
    |||||||    || ||| | || | ||| || |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  8576386 aggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagccttaaggaggttgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacact 8576293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8602350 - 8602037
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||  | || || |    
T  8602350 aagaatgcagttgttactgtgccggcttattttaatgattctcagcgaaaagccacaaaagatgctggtgccattgctggtctcaatgtaatgcggataa 8602251  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    ||||||| || ||||| || ||| ||||||||||  || | ||||||  | |||||| ||   |  | ||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||    
T  8602250 tcaatgagccaactgcagctgctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattgtgttgaagagagaaatattttcatatttgatcttggtggtggaac 8602151  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||  | || | ||||| || || |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  8602150 ttttgatgtttctcttctcacaattaagaataatctctttgaagtcaaggccacttccggagacacacaccttggaggagaggactttgataaccgaatg 8602051  T
Q  312 gtgaactactttgt 325  Q
    |||||| |||||||    
T  8602050 gtgaaccactttgt 8602037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8570687 - 8570278
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| ||  ||||||| || ||||| || |||||||| || |||| |||||| | |||||| ||||  |||||||| || |||||  | || || |    
T  8570687 aagaatgcagtgattactgtacctgcttattttaatgattcacaacgaagagccactaaagatgcaggtgaaattgctggtctcaatgtaatgcggataa 8570588  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  || | ||||||  | ||| || || |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8570587 tcaatgaaccgactgcggcagctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattttgttgataagagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaac 8570488  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||| | |    | ||| || || |||||||| ||| |||||||||| || || || || ||||||||||||| |    
T  8570487 ttttgatgtgtctattctcacagttaaggataacaactatgaagtcaaggccactgctggagacactcacctgggaggtgaagattttgataacagaatg 8570388  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaa 411  Q
     |||   |||||||  || ||||  | |||||||| || | ||| || ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  8570387 ttgactcactttgtgaagaagttcaagaagaagaacaacgaggatattagtaggaacccaaaagccttgaggaggttaagaacagcttgtgagagggcaa 8570288  T
Q  412 agaggacact 421  Q
    | ||||||||    
T  8570287 aaaggacact 8570278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Original strand, 7877525 - 7877934
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||| |||||  | || || |    
T  7877525 aagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattctcaacgaaaagccacaaaagatgctggtgcagttgccggcctcaatgttatgcggataa 7877624  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgat-ggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggta 210  Q
    | |||||||| |||||||| ||  ||||||||||  || | ||||||| | | |   || || ||||| ||| | ||  || |||| ||||| ||||| |    
T  7877625 ttaatgaaccaactgctgctgcccttgcatatggccttcaaaagagaa-taaataacatcggaaaacgaaatgtgttcatcattgatcttggtggtggca 7877723  T
Q  211 cttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaac 310  Q
    |||| ||||||||| | || ||| | || | ||||   ||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  7877724 ctttcgatgtgtctcttctcacactaaaagatgatagctttgatgtaatagctactgccggagatactcacctaggtggagaggactttgataacagaat 7877823  T
Q  311 ggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggca 410  Q
    | ||||| | || ||   ||||||| | | ||||||||| ||||||||  |||| || || || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7877824 gttgaaccatttagtgatggagtttaagaggaagaataaagtggacattggtggaaacccgagggcccttaggaggttgagaactgcatgtgagagggct 7877923  T
Q  411 aagaggacact 421  Q
    || ||||||||    
T  7877924 aaaaggacact 7877934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 421
Target Start/End: Original strand, 29577479 - 29577873
Alignment:
Q  30 gtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctg 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    ||||||||||| |||||  | || || ||||||||||| |||||||    
T  29577479 gtgccagcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccaaagatgccggcattattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccaactgctg 29577578  T
Q  130 cagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggt---aaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctat 226  Q
    | ||  |||||||||| ||| | |||||| || ||| || || |   || || ||| | ||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |    
T  29577579 ctgcacttgcatatggaattcaaaagagaggtaattttgttgttggaaagcgaaatgtattcatctttgatcttggtggtggcacctttgatgtgtctct 29577678  T
Q  227 ccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgta 326  Q
     || ||| |||||| ||||  |||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| || ||||||||||| ||||| | || ||||| | |||||||     
T  29577679 tctcacacttaaggatgatagttttgaagtaaaggccactgctggtgatactcacctaggaggagaggacttcgataataaaatggtgagccactttgtg 29577778  T
Q  327 gaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaagaggacact 421  Q
     | |||||  | | |||||| || |||||||| |||  ||| |||| ||| || |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29577779 aatgagttgaagaggaagaacaatgtggacattagtttgaacccaaaagctttaaggaagctgagaactgcttgtgagagggcaaagagggcact 29577873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8610278 - 8609884
Alignment:
Q  27 actgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactg 126  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||  | || |||||||||||||| || |    
T  8610278 actgtgcctgcttattttaatgattctcagcggaaagccacaaaagatgctggtgtcatttctggccttaatgtaatccggattatcaatgaaccaacgg 8610179  T
Q  127 ctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaa-cggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtcta 225  Q
    |||| ||| ||||||||||| || | ||||||  | |||||| ||| |||  | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  8610178 ctgcggctcttgcatatggtcttcagaagagagctaattgtg-tggaaaatagaaatatttttatctttgatcttggtggtgggactttcgatgtgtctg 8610080  T
Q  226 tccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgt 325  Q
    | || ||||||||     ||| ||| || || || || ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||    
T  8610079 ttctcacaattaaaaacaatgctttcgatgtcaaggctactgctggagatactcaccttggaggagaggactttgatcacagaatggttaatcactttgt 8609980  T
Q  326 agaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaagaggacact 421  Q
      |||||||  ||| |||| ||      || || ||||||||  | || ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8609979 gaaggagttcaaaaggaagcattcaaaagatatcagtgggaactcgagggctcttaggaggttgaggactgcttgtgagagggcaaagaggacact 8609884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 421
Target Start/End: Original strand, 8382677 - 8383077
Alignment:
Q  21 gttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaac 120  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||  | || || |||||||| |    
T  8382677 gttgttaccgtgcctgcatatttcaatgattctcaacggaaagccacaaaagatgctggtgcgattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgagc 8382776  T
Q  121 ctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgt 220  Q
    | ||||| || ||| ||||||||||  || | ||||||  | |||||  ||   |  | ||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  8382777 caactgccgctgctcttgcatatggccttcagaagagagctaattgtcttgaagagagaaatattttcatctttgatcttggtggtggaacttttgatgt 8382876  T
Q  221 gtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactac 320  Q
    |||| |||| |||||||||  | |||| ||||  || || |||||||||||| ||||||| || || || || ||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  8382877 gtctctcctcacaattaagaataatgtctttgttgtgaaggccactgccggagacactcatctaggaggtgaagacttagataacagaatcgtgaagtac 8382976  T
Q  321 tttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaagaggacac 420  Q
    ||||| || |||||  | | |||| ||||   |||||| |||||||| ||||  ||  | || ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  8382977 tttgttgacgagttcaagaggaagcataataaggacattagtgggaacccaaaggctcttagaaggttaagaacggcttgcgagagggcaaaaaggacac 8383076  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  8383077 t 8383077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8582076 - 8581667
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| ||  ||||||| || ||||| || |||||||| || |||| |||||| | |||||| ||||  ||||| || || |||||  | || || |    
T  8582076 aagaatgcagtgattactgtacctgcttattttaatgattcacaacgaagagccactaaagatgcaggtgaaattgcaggtctcaatgtaatgcggataa 8581977  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  || | ||||||  | |||||| || |||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  8581976 tcaatgaaccgactgcggcagctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaatatttttatctttgaccttggaggtggaac 8581877  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||  | | |  | ||| || || |||||||| ||| |||||||||| || || || || ||||||||||||| |    
T  8581876 ttttgatgtgtctattctcacagttaagaataacgactatgaagtcaaggccactgctggagacactcacctgggaggggaagattttgataacagaatg 8581777  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaaga-ataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggca 410  Q
    |||||  |||||||   |||| ||||| |||| | |||| | ||| || | ||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||| |||||||| ||     
T  8581776 gtgaatcactttgtgtcggag-ttcaagagaaaacataaagaggagattattggaaatccaaaagccattagaaggttgaggactgcttgtgagagagcg 8581678  T
Q  411 aagaggacact 421  Q
    || ||||||||    
T  8581677 aaaaggacact 8581667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8591014 - 8590605
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | |||||  | || || |    
T  8591014 aagaatgcagttgttactgtgccagcttattttaatgattctcagaggaaagctaccaaagatgctggtgtcattgctggcttgaatgtaatgcggataa 8590915  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgat-ggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggta 210  Q
    | |||||||| ||||| || |   ||||||||||  || | ||||| ||  | |   || || ||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||| |    
T  8590914 ttaatgaaccaactgccgctggccttgcatatggccttcaaaagag-agaaagtaacatcggaaaacgaaatgtgttcatctttgatcttggtggtggca 8590816  T
Q  211 cttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaac 310  Q
    |||||||||||||| | || ||| | || ||||||   ||||| |||||||||||| ||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  8590815 cttttgatgtgtctcttctcacactcaaaggtgatagctttgatgtaaaagccacttccggagatacccacctaggaggagaggactttgataacagaat 8590716  T
Q  311 ggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggca 410  Q
    |||  || | || ||  ||||||||   | ||||||||| |||||  ||||||||||  |||| ||  | |||||||||| ||| || |||||||||||     
T  8590715 ggttcaccatttggtgaaggagtttaggaggaagaataaagtggatttaagtgggaacgcaagggctcttaggaggttgaaaacagcttgtgagagggct 8590616  T
Q  411 aagaggacact 421  Q
    || ||||||||    
T  8590615 aaaaggacact 8590605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8538388 - 8538120
Alignment:
Q  36 gcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctgcagcta 135  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  | || || |||||||||||||| ||||| |||     
T  8538388 gcttatttcaatgattcacagcgaagagccaccaaagatgctggtgtcattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgaacctacagctgctgctc 8538289  T
Q  136 ttgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatccttacaat 235  Q
    ||||||| ||  || | ||||||  | |||||| ||   |  | ||  ||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  8538288 ttgcatacggccttcaaaagagagctaattgtgttgaagagagaaaagttttcatctttgatcttggtggtggaacttttgatgtatctctccttacatt 8538189  T
Q  236 taagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataa 304  Q
     |||  | |||  |||   || || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8538188 gaagaataatgcctttacagtcaaggccactgccggagatactcaccttggaggagaggactttgataa 8538120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 39986022 - 39985608
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||  |||| ||||  |||||||| |  ||||| || ||||||||| | |||||||    
T  39986022 aagaatgctgttgttactgtccctgcttactttaatgactcccagcgtcaagctaccaaggatgctggagttattgccggtcttaatgtcatgcgaatta 39985923  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtga-ttgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggta 210  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||  |   ||| |||  |   |||| | ||  ||||||||||||| |||||||    
T  39985922 tcaatgagcccactgctgctgccattgcttatggtcttgacaaga-aagcaaccagtgttggagagaagaatgtcttgatctttgaccttggtggtggta 39985824  T
Q  211 cttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaac 310  Q
    |||||||||| ||| | || || ||| | |  | | | |||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||     
T  39985823 cttttgatgtctctttgctaactattgaagagggtatctttgaggtgaaagccacagccggagacacccatcttggaggtgaggattttgacaacagaat 39985724  T
Q  311 ggtgaactactttgtagaggagtttcaaaag-aagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggc 409  Q
    ||||||| |||||||  | ||| ||||| || ||||| |||  |||||| ||||| || || |||||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  39985723 ggtgaaccactttgttcaagag-ttcaagagaaagaacaagaaggacatcagtggcaaccccagagctcttaggaggttgaggactgcttgtgaaagagc 39985625  T
Q  410 aaagaggacactctctt 426  Q
     ||||| || |||||||    
T  39985624 gaagagaactctctctt 39985608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 98
Target Start/End: Original strand, 8640339 - 8640425
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaat 98  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8640339 aagaatgcagttgttactatgcctgcttacttcaatgattatcagcaaaaagccaccatagatgccggggccattgctggccttaat 8640425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Original strand, 8017204 - 8017332
Alignment:
Q  11 gaagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatt 110  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||| |||| |||||| || || ||||| ||  |||||    
T  8017204 gaagaatgccgttgttacagttccagcttacttcaatgattcgcagcgtcaagccacaaaggatgccggtgtcattgcaggactcaatgttttgagaatt 8017303  T
Q  111 atcaatgaacctactgctgcagctattgc 139  Q
    ||||| || || || ||||||||||||||    
T  8017304 atcaacgagccaacagctgcagctattgc 8017332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8559708 - 8559386
Alignment:
Q  13 agaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattat 112  Q
    ||||||||||  |||| || || ||||| || |||||||| ||  ||| |||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||  | |  || ||    
T  8559708 agaatgctgtgattaccgtacctgcttattttaatgattctcaaagaagagccaccaaagatgcaggtgaaattgctggtcttaatgtaatgcagataat 8559609  T
Q  113 caatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtact 212  Q
    ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||  || | ||||||  | |||||| |    |  | ||||||||  ||||||| || || ||||| |||    
T  8559608 caatgaaccaactgcagctgctcttgcatatggacttcaaaagagatctaattgtgttaaagagagaaatattttcatctttgatctcggtggtggaact 8559509  T
Q  213 tttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacgg 312  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||  | || | ||||| || || |||||| ||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  8559508 tttgatgtttctcttctcacaattaagaataatctctttgaagtcaaggccacttccggagacacacacctcggaggagaggactttgataacagaatgg 8559409  T
Q  313 tgaactactttgtagaggagttt 335  Q
    ||||  |||||||| | ||||||    
T  8559408 tgaaacactttgtaaaagagttt 8559386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8103043 - 8102901
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||| || | |||||||||||  || |||||  | ||||| ||  ||||||    
T  8103043 aagaatgccgtcgtcactgtccctgcttacttcaatgattctcagcgtcaagcaactaaagatgctggtgttatcgctggtttaaatgttttgagaatta 8102944  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaa 154  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  8102943 ttaatgagccaactgctgctgctattgcctacggtcttgacaa 8102901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 458
Target Start/End: Original strand, 4678349 - 4678795
Alignment:
Q  11 gaagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatt 110  Q
    ||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||     
T  4678349 gaagaatgtcgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcaacgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaata 4678448  T
Q  111 atcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggta 210  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4678449 atcaacgaacctactgttgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgattgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggta 4678548  T
Q  211 cttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaac 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  4678549 cttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacactcacctaggtggagaggactttgataacagaat 4678648  T
Q  311 ggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||  |||  ||| | |||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4678649 ggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttaaggaggttgagaactgcctgcgagagggca 4678748  T
Q  411 aagaggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtagattct 458  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  4678749 aagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttga-gtagattct 4678795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 423
Target Start/End: Original strand, 34466585 - 34466996
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| ||| | || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||| | ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  34466585 aagaatgcagttatcaccgtgcctgcttattttaatgattctcagcgaaaagctactgtggatgctggtactattgctggccttaatgttttgcaaataa 34466684  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaa-tatttttgtctttgaccttggcggtggta 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | || ||| | | |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  34466685 tcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggacttgacaagagagctgactttg-tggaagaaggaaatattttcgtctttgaccttggtggtggga 34466783  T
Q  211 cttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaac 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| || || |||||| | || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||     
T  34466784 cttttgatgtgtctctccttacaattaaggataatgtctttgaagttaaggccacttctggtaacactcacctcggacgagaggactttgataatagaat 34466883  T
Q  311 ggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggca 410  Q
    || |||| |||||| | |||||||  | | |||| ||||   ||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||    
T  34466884 ggcgaaccactttgcaaaggagttcaagaggaagcataataaggatattagtggaaaccctagagctttgaggaggttgagaactgcgtgcgagaatgca 34466983  T
Q  411 aagaggacactct 423  Q
    |||||||||||||    
T  34466984 aagaggacactct 34466996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15595414 - 15594994
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatca 114  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||    
T  15595414 aatgcagttgttaccgtgcctgcttatctcaatgattctcaacgaaaagccactatagatgcaggtgccattgctggccttaatgttatacgggtaatca 15595315  T
Q  115 atgaacctactgctg-------cagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtg 207  Q
    ||||||| || ||||       ||||||||||||||||  |||||||||| | | | |||| |||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15595314 atgaaccgacagctgacagctgcagctattgcatatggccttgacaagaggattaactgtgttggagaaagaaatatttttgtctttgatcttggtggtg 15595215  T
Q  208 gtacttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacag 307  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||   | || ||  | || || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15595214 gcacttttgatgtgtctatcctaacaattaaggacaaggtcttccaagttaaggccacaggcggaaacactcaccttggaggagaggactttgataacag 15595115  T
Q  308 aacggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagg 407  Q
    || ||| ||||||||||   |||| ||  | | |||||| || ||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  15595114 aatggtcaactactttgcgcaggaattcaagacgaagaacaaagtggatattactgggaacccaagggccttgaggagattgagaactgcgtgcgaaagg 15595015  T
Q  408 gcaaagaggacactctctttt 428  Q
    ||||| |||  ||||||||||    
T  15595014 gcaaaaagggtactctctttt 15594994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 455
Target Start/End: Original strand, 9335683 - 9336126
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |    
T  9335683 aagaatgccgttgttaccgtgccagcttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtactattgctggccttaatgtcattcggataa 9335782  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||    
T  9335783 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgataagagaaatgactgtgatggtaaccgaaatatttttgtctttgatctgggtggcggtac 9335882  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  9335883 ttttgatgtgtctatcctcacaattaagggtgatctatttgaagtaaaagccaccgcaggaaacacgcaccttggaggcgaggactttgataacagaatg 9335982  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaa 411  Q
    || ||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| |    ||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9335983 gttaactattttgtggaagagttaaaaaagaagaataaagtggacatcaagcagaacccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaa 9336082  T
Q  412 agaggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtagat 455  Q
    | |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9336083 aaaggatactgtcttttgcttttgttaccactgttgaggtagat 9336126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 30775613 - 30775216
Alignment:
Q  27 actgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactg 126  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||| || ||||| || ||||    
T  30775613 actgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactg 30775514  T
Q  127 ctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctat 226  Q
    | |||||||||||||||||  |||| |||||| ||   ||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  30775513 cagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 30775414  T
Q  227 ccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgta 326  Q
     || || ||||  | |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  30775413 tctcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaactgctggaaacactcacatcgggggagaggactttgataacagaatgttgaattactttgta 30775314  T
Q  327 gaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaagaggacactctc 424  Q
    ||||| ||| | | |||||| || |||||||| |  |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  30775313 gaggaatttaagacgaagaacaacgtggacattaccgggaatccaagagctttgagacagttgagaactgcatgtgaaaaggcaaaaaggacactctc 30775216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 35132824 - 35132454
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||  |  || | |    
T  35132824 aagaatgcagttgttactgtgcctgcttattttagtgattctcaacgaaaagccactatagatgctggtgctattgctggtcccaatgttatgagagtaa 35132725  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    | |||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  35132724 tgaatgaacctactgccgcagcggttgcatatggccttgacaagagatctgattgtgctggagaacaaaatatttttgtcttcgatcttggtggtggcac 35132625  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||||| | |||| ||  | || || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |    
T  35132624 ttttgatgtttcaatacttactattaaggataatgtcttccaagttaaggccactgccggaaacactcatctcggtggagaggactttgataacagaatg 35132525  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaag-aagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgag 382  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  35132524 gtgaactactttgtacaagag-ttcaagagaaagaacaaagtagacattagtgggaattcaaaagccttgag 35132454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Original strand, 23587525 - 23587669
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||| || | |||||| |||| |||| |||| || ||||| ||  ||||||    
T  23587525 aagaatgccgttgtaactgtgcctgcttacttcaacgattcacaacgtcaagctacaaaagatgccggtgtcatttctggactcaatgtgttgagaatta 23587624  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaaga 156  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||    
T  23587625 ttaatgaacctaccgctgctgctattgcttatggtcttgataaga 23587669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54396800 - 54396665
Alignment:
Q  11 gaagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||  |||| || | |||||||||||| ||| | ||  | ||||| ||  | |||    
T  54396800 gaagaatgctgttgttactgttcctgcttatttcaatgattctcaacgtcaagctacgaaagatgctggtgctatttcgggtttgaatgtgttgaggatt 54396701  T
Q  111 atcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggt 146  Q
    || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  54396700 attaatgagcctactgctgctgcaattgcttatggt 54396665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 270 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 43744934 - 43744746
Alignment:
Q  270 ggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatc 369  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||||| | ||| || |    
T  43744934 ggaaacactcacctcggaggagaggattttgataataggatggtgaactacttcgcagaggagtttaagaagaagaacaaggtggacattactggaaacc 43744835  T
Q  370 caagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaagaggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtagattct 458  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  43744834 caagagcattaaggaggttgagaacagcatgcgaaagagcaaaaaggacattatcttttgctgttgtcaccactattgaggtagattct 43744746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12528880 - 12528497
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||  | || || |    
T  12528880 aagaatgcagtgattacggtgccagcgtatttcaatgattcgcagcgacgagccaccaaggatgctggtgtcattgctggcctcaatgtaatacggataa 12528781  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    |||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| ||| | ||||||  | |||||  ||   |  | |  |||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  12528780 tcaacgaaccaactgcagctgctcttgcatatggcattcaaaagagagctaattgtcttgaagagagaaggatttttatttttgaccttggcggtggaac 12528681  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    ||||||||||||| | |||||| | |||  | |||| || || || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |    
T  12528680 ttttgatgtgtctcttcttacagtaaagaataatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcaccttggaggagaggactttgataatcgaatg 12528581  T
Q  312 gtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaact 395  Q
    |||||  |||||||  | |||||| | | |||||| || || ||||| | ||||||  ||| |||| | ||||| |||||||||    
T  12528580 gtgaatcactttgtgaaagagtttaagaggaagaacaaagttgacattattgggaactcaaaagccctaaggagattgagaact 12528497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43745223 - 43744997
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |    || |    
T  43745223 aagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccac--tagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataa 43745126  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | | | ||   |   | | ||||||||  |||||||||| || ||||| ||    
T  43745125 tcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggaagaaatattttcatctttgacctgggtggtgggac 43745026  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagg 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43745025 ttttgatgtgtctctccttacaattaagg 43744997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 261 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 28220045 - 28219848
Alignment:
Q  261 gccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataa 360  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  28220045 gccaccgctggaaacactcacctcgggggagaggactttgatagtaggatggtgaactacttcgcagaggagtttaagaagaagaacaaggtggacatta 28219946  T
Q  361 gtgggaatccaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaagaggacactctcttttgcttttgtcaccactgtagaggtagattct 458  Q
     ||| ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||||    
T  28219945 ctggaaactcaagagccttaaggaggttgagaacagcgtgcaagagagcaaaaaggacactatcttttgctgttgtcgccaccattgaggtagattct 28219848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28220327 - 28220099
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||  |  | ||      
T  28220327 aagaatgcagttattactgtgcctgcttatttcaatgattatcagcggaaagccaccatagatgcaggtaccattgctggtctaaatgttctaaggatag 28220228  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggta-aacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggta 210  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||| | | ||  |||| | |||| ||||||||  |||||||||| || ||||| |    
T  28220227 tcaatgaacccactgctgctgctattgcatatggattggacaaaagaactaactg-catgggagaacgaaatattttcatctttgacctgggtggtggga 28220129  T
Q  211 cttttgatgtgtctatccttacaattaagg 240  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  28220128 cttttgatgtgtctctccttagaataaagg 28220099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28910958 - 28910650
Alignment:
Q  12 aagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    ||||||||  |||||||| || | | ||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||  | || || |    
T  28910958 aagaatgcaattgttactttgactggttatttcaatgattcttagaggaaagccaccatagatgctggtgccattgtcaggcttaatgttatgcggataa 28910859  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    ||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||  ||| |||| |||  |||| |||| |||  |||| ||||| ||  |||| ||    
T  28910858 tcaatgagctcactgctgtagctatttcatatggcctcgacaagagagctgagtgtgctggagaacgaaatactttcatcttcgacctgggtagtgggac 28910759  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||| | | || ||  | || || ||||| || |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| || | |    
T  28910758 ttttgatgtttctctccttacaattcaggataaggtcttccaagttaaggccaccgctggaaacactcacctcggggtcgaggacattgataataggatg 28910659  T
Q  312 gtgaactac 320  Q
    |||||||||    
T  28910658 gtgaactac 28910650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11200205 - 11200123
Alignment:
Q  71 agatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgaca 153  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| || || |||||||||||| ||||||    
T  11200205 agatgcgggtgctattgctggcctcaatgttttgcgaataatcaatgagccttctgcagctgcaattgcatatggtcttgaca 11200123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11170887 - 11170813
Alignment:
Q  71 agatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatgg 145  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  11170887 agatgcgggtgctattgctggcctcaatgttttgcgaatactcaatgagcctactgcagctgcaattgcatatgg 11170813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11209709 - 11209635
Alignment:
Q  71 agatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatgg 145  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  11209709 agatgcgggtgctattgctggcctcaatgttttgcgaatactcaatgagcctactgcagctgcaattgcatatgg 11209635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University