View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF20107_low_49 (Length: 234)
Name: NF20107_low_49
Description: NF20107
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF20107_low_49 |
 | |
|
| [»] scaffold0055 (7 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0052 (9 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0021 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: scaffold0055 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 7)
Name: scaffold0055
Description:
Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 42284 - 42487
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42284 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
42383 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42384 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
42483 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
42484 |
ctac |
42487 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 51532 - 51735
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51532 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
51631 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51632 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
51731 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
51732 |
ctac |
51735 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 67067 - 67270
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67067 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
67166 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67167 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
67266 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
67267 |
ctac |
67270 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 69987 - 70190
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
69987 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
70086 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70087 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
70186 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
70187 |
ctac |
70190 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4237 - 4034
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4237 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
4138 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4137 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcattaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
4038 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
4037 |
ctac |
4034 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 32976 - 33179
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
32976 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggcagct |
33075 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33076 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccgatattgttatttattgtca |
33175 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
33176 |
ctac |
33179 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Original strand, 80533 - 80592
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaac |
73 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80533 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaac |
80592 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 9)
Name: scaffold0052
Description:
Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 26057 - 26260
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26057 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
26156 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26157 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
26256 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
26257 |
ctac |
26260 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 27831 - 28034
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27831 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
27930 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27931 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
28030 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
28031 |
ctac |
28034 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 48439 - 48642
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48439 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
48538 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48539 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
48638 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
48639 |
ctac |
48642 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 51031 - 51234
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51031 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
51130 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51131 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
51230 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
51231 |
ctac |
51234 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 80298 - 80501
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80298 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
80397 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80398 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcattaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
80497 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
80498 |
ctac |
80501 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 63089 - 62886
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
63089 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggcagct |
62990 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
62989 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccgatattgttatttattgtca |
62890 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
62889 |
ctac |
62886 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 18559 - 18762
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18559 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaatgtccaactactagctttttaactgcaacaacttacatatacgctattggagctggaatgaccgcggctgct |
18658 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18659 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
18758 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
18759 |
ctac |
18762 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 6887 - 7033
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6887 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
6986 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagatt |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6987 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagatt |
7033 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 103 - 217
Target Start/End: Original strand, 4168 - 4282
Alignment:
| Q |
103 |
ccgcggctgctggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgtt |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4168 |
ccgcggctgctggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgtt |
4267 |
T |
|
| Q |
203 |
atttattgtcactac |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
4268 |
atttattgtcactac |
4282 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 46701 - 46904
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46701 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
46800 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46801 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctcgttaagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtca |
46900 |
T |
|
| Q |
214 |
ctac |
217 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
46901 |
ctac |
46904 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13700938 - 13700809
Alignment:
| Q |
14 |
cataggcggaccgatcgacccaacccaaggtccaactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13700938 |
cataggcggaccgatcgacctaacccgaggtccaactacaagctttttaactacaacaacttaaatatacgctattggagctgtaattatcgcggctgct |
13700839 |
T |
|
| Q |
114 |
ggcaccagacttgccctccaatggatcctc |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13700838 |
agcaccagacttgtcctccaatggagcctc |
13700809 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8125686 - 8125518
Alignment:
| Q |
46 |
caactacgagctttttaactgcaacaacttaaatatacgctattggagctggaattaccgcggctgctggcaccagacttgccctccaatggatcctcgt |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| | || ||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
8125686 |
caactacgagctttttaattgcaacaatttaaatatacgctattgaagctaaaattaccgcagctgctgacaccaaatttatccttcaataaatcctcgt |
8125587 |
T |
|
| Q |
146 |
taagggatttagattgtactcattccaattaccagactcaatgagcccggtattgttatttattgtcac |
214 |
Q |
| |
|
||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8125586 |
taaagaatttatattgtactcatttcaattaccagactcaatgagtctactattgttatttattatcac |
8125518 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University