View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20116_high_78 (Length: 232)

Name: NF20116_high_78
Description: NF20116
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20116_high_78
NF20116_high_78
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (1-196)||(52696788-52696983)
chr1 (1-197)||(25897370-25897566)
chr1 (1-197)||(26580283-26580479)
chr1 (1-197)||(1168499-1168695)
chr1 (1-197)||(1170457-1170653)
chr1 (1-197)||(39260359-39260555)
chr1 (1-197)||(52753160-52753356)
chr1 (1-192)||(8120870-8121061)
chr1 (1-196)||(42370808-42371003)
chr1 (1-198)||(16052091-16052288)
chr1 (1-198)||(20089466-20089663)
chr1 (1-194)||(26663257-26663450)
chr1 (1-190)||(29078519-29078708)
chr1 (1-197)||(29288145-29288339)
chr1 (1-194)||(5215384-5215577)
chr1 (1-197)||(1940760-1940956)
chr1 (1-197)||(33510480-33510676)
chr1 (2-190)||(38829072-38829260)
chr1 (4-196)||(40092488-40092680)
chr1 (1-193)||(46760966-46761158)
chr1 (1-196)||(970537-970734)
chr1 (1-193)||(8079722-8079914)
chr1 (1-196)||(12682817-12683012)
chr1 (1-197)||(17591687-17591880)
chr1 (5-198)||(32671574-32671767)
chr1 (4-197)||(41928511-41928704)
chr1 (1-198)||(43905649-43905846)
chr1 (1-177)||(17587518-17587694)
chr1 (1-193)||(19715174-19715366)
chr1 (1-198)||(46409430-46409629)
chr1 (1-198)||(7145202-7145399)
chr1 (1-197)||(2347652-2347849)
chr1 (4-196)||(15203109-15203301)
chr1 (3-198)||(13996738-13996933)
chr1 (1-196)||(51359230-51359424)
chr1 (1-191)||(15717787-15717976)
chr1 (1-193)||(2473722-2473914)
chr1 (3-196)||(23498457-23498650)
chr1 (6-198)||(49146167-49146359)
chr1 (1-197)||(15554165-15554353)
chr1 (1-194)||(6765458-6765651)
chr1 (1-159)||(40149497-40149655)
chr1 (27-195)||(29695673-29695842)
chr1 (1-198)||(38171827-38172011)
chr1 (64-197)||(52086263-52086396)
chr1 (45-179)||(23322897-23323031)
chr1 (122-198)||(5675100-5675176)
chr1 (44-197)||(5217840-5217992)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (1-197)||(2481409-2481605)
chr4 (1-198)||(45424535-45424732)
chr4 (1-201)||(54189537-54189737)
chr4 (1-196)||(19913631-19913826)
chr4 (2-196)||(38055154-38055348)
chr4 (4-196)||(23776463-23776655)
chr4 (1-197)||(28032713-28032909)
chr4 (1-197)||(50055102-50055298)
chr4 (1-197)||(15241029-15241225)
chr4 (1-197)||(37464717-37464913)
chr4 (1-197)||(53717465-53717661)
chr4 (3-194)||(1756767-1756958)
chr4 (1-198)||(20877042-20877239)
chr4 (1-198)||(50353796-50353993)
chr4 (3-195)||(11639581-11639773)
chr4 (1-197)||(15669179-15669375)
chr4 (1-197)||(27488649-27488845)
chr4 (1-192)||(16700782-16700973)
chr4 (1-198)||(14987787-14987984)
chr4 (1-198)||(44784918-44785115)
chr4 (1-197)||(6611361-6611557)
chr4 (1-196)||(6688628-6688817)
chr4 (3-198)||(23704212-23704407)
chr4 (1-184)||(33703850-33704033)
chr4 (1-195)||(40428721-40428915)
chr4 (1-202)||(43289961-43290162)
chr4 (1-194)||(54412627-54412820)
chr4 (1-193)||(1617084-1617276)
chr4 (1-193)||(31969681-31969873)
chr4 (5-193)||(35490778-35490966)
chr4 (1-197)||(48909842-48910038)
chr4 (1-195)||(47632032-47632227)
chr4 (1-198)||(8932179-8932376)
chr4 (1-198)||(30423566-30423762)
chr4 (1-201)||(37968758-37968958)
chr4 (1-193)||(52139203-52139395)
chr4 (1-192)||(53875658-53875849)
chr4 (1-193)||(8591093-8591285)
chr4 (1-192)||(19164974-19165164)
chr4 (1-197)||(44379188-44379384)
chr4 (1-197)||(55344826-55345022)
chr4 (1-197)||(27536105-27536297)
chr4 (1-198)||(53353050-53353255)
chr4 (1-189)||(27583633-27583821)
chr4 (1-192)||(30171581-30171772)
chr4 (4-184)||(38071327-38071504)
chr4 (22-190)||(28360433-28360602)
chr4 (3-189)||(40680041-40680227)
chr4 (1-194)||(44375844-44376037)
chr4 (44-197)||(50053439-50053592)
chr4 (5-197)||(16703821-16704009)
chr4 (1-116)||(23269047-23269162)
chr4 (108-198)||(23265865-23265955)
chr4 (44-198)||(44548185-44548340)
chr4 (1-75)||(53408137-53408212)
chr4 (45-127)||(51780763-51780845)
chr4 (1-51)||(23261887-23261937)
chr4 (1-91)||(9595903-9595982)
chr4 (140-197)||(9595975-9596031)
chr4 (1-37)||(50055301-50055337)
chr4 (44-186)||(17493340-17493482)
chr4 (1-54)||(48748197-48748250)
chr4 (49-105)||(55344724-55344780)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (1-197)||(22174989-22175185)
chr3 (1-197)||(15520629-15520825)
chr3 (1-197)||(50528922-50529118)
chr3 (1-195)||(20699144-20699338)
chr3 (3-190)||(44609334-44609521)
chr3 (1-198)||(20842347-20842544)
chr3 (1-197)||(37698142-37698338)
chr3 (3-198)||(42307906-42308101)
chr3 (4-196)||(25999382-25999574)
chr3 (3-198)||(15520143-15520338)
chr3 (3-194)||(38856089-38856280)
chr3 (1-190)||(21581042-21581231)
chr3 (1-196)||(25494284-25494479)
chr3 (1-198)||(8042599-8042796)
chr3 (1-197)||(29445481-29445677)
chr3 (1-198)||(32244112-32244309)
chr3 (1-197)||(35226440-35226636)
chr3 (1-197)||(38933939-38934134)
chr3 (1-197)||(46452161-46452357)
chr3 (1-197)||(54870173-54870369)
chr3 (3-198)||(12117659-12117854)
chr3 (1-197)||(24835698-24835894)
chr3 (1-197)||(54534327-54534521)
chr3 (1-196)||(2895179-2895378)
chr3 (1-186)||(42104970-42105155)
chr3 (1-198)||(32359251-32359448)
chr3 (6-196)||(26122808-26122998)
chr3 (1-197)||(34700334-34700530)
chr3 (1-197)||(53028218-53028406)
chr3 (42-195)||(35643212-35643365)
chr3 (1-169)||(44688782-44688949)
chr3 (1-157)||(16354379-16354535)
chr3 (56-190)||(50529827-50529961)
chr3 (1-190)||(48925002-48925189)
chr3 (62-198)||(49128041-49128177)
chr3 (5-167)||(12915930-12916091)
chr3 (1-76)||(24366143-24366218)
chr3 (1-69)||(13696914-13696982)
chr3 (140-198)||(24366084-24366142)
chr3 (3-36)||(50528883-50528916)
chr3 (163-193)||(40240485-40240515)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (1-198)||(15655908-15656105)
chr7 (1-198)||(43067976-43068173)
chr7 (1-196)||(33359093-33359288)
chr7 (5-199)||(30181031-30181225)
chr7 (1-201)||(12101181-12101381)
chr7 (1-197)||(24792335-24792531)
chr7 (1-195)||(20346487-20346681)
chr7 (1-192)||(42673467-42673654)
chr7 (1-198)||(3511319-3511516)
chr7 (1-198)||(42964999-42965196)
chr7 (3-194)||(7164184-7164375)
chr7 (1-198)||(42204150-42204348)
chr7 (5-198)||(4347269-4347462)
chr7 (3-196)||(22649699-22649892)
chr7 (1-191)||(1803029-1803219)
chr7 (1-198)||(5280856-5281053)
chr7 (1-198)||(933281-933478)
chr7 (1-198)||(36890833-36891029)
chr7 (1-197)||(33846532-33846723)
chr7 (1-192)||(4477324-4477515)
chr7 (1-196)||(25748485-25748680)
chr7 (1-198)||(6394747-6394944)
chr7 (1-193)||(9452591-9452783)
chr7 (1-196)||(12097593-12097788)
chr7 (4-197)||(32041539-32041732)
chr7 (1-189)||(43156718-43156906)
chr7 (1-191)||(38866547-38866737)
chr7 (7-195)||(8630665-8630853)
chr7 (1-194)||(17753600-17753793)
chr7 (3-194)||(46134309-46134500)
chr7 (1-193)||(46891342-46891535)
chr7 (1-159)||(48865665-48865826)
chr7 (1-198)||(16894510-16894697)
chr7 (49-198)||(19828266-19828415)
chr7 (1-198)||(43021583-43021776)
chr7 (100-198)||(37704976-37705074)
chr7 (44-198)||(43405016-43405170)
chr7 (44-198)||(37005857-37006011)
chr7 (51-196)||(36849590-36849735)
chr7 (44-198)||(15655458-15655612)
chr7 (60-189)||(20163824-20163953)
chr7 (44-196)||(30075277-30075426)
chr7 (107-178)||(27691435-27691506)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (3-197)||(16307023-16307217)
chr6 (1-198)||(3347536-3347733)
chr6 (1-196)||(26946889-26947084)
chr6 (1-198)||(18613535-18613732)
chr6 (1-197)||(2837543-2837739)
chr6 (1-197)||(6086612-6086808)
chr6 (1-196)||(30691850-30692045)
chr6 (1-197)||(21893453-21893649)
chr6 (1-196)||(26704352-26704547)
chr6 (4-194)||(3955782-3955972)
chr6 (1-193)||(17261086-17261278)
chr6 (1-196)||(9459562-9459757)
chr6 (1-192)||(34887305-34887496)
chr6 (1-196)||(20726790-20726981)
chr6 (1-197)||(11167238-11167434)
chr6 (1-193)||(28199521-28199714)
chr6 (1-185)||(1153603-1153787)
chr6 (9-197)||(35198282-35198469)
chr6 (32-197)||(52834-52999)
chr6 (1-191)||(30698942-30699132)
chr6 (1-125)||(33464399-33464523)
chr6 (1-98)||(53005-53102)
chr6 (117-199)||(33463697-33463779)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (4-198)||(9008073-9008267)
chr5 (1-198)||(16069351-16069548)
chr5 (1-197)||(1579035-1579231)
chr5 (1-197)||(1605584-1605780)
chr5 (1-197)||(27679182-27679378)
chr5 (1-198)||(33491209-33491406)
chr5 (3-198)||(27420856-27421051)
chr5 (1-190)||(3386499-3386688)
chr5 (1-198)||(24105684-24105881)
chr5 (1-191)||(16737460-16737650)
chr5 (1-198)||(31883142-31883339)
chr5 (3-198)||(35782659-35782854)
chr5 (3-197)||(33991139-33991333)
chr5 (1-198)||(4120935-4121132)
chr5 (1-189)||(1165614-1165802)
chr5 (1-197)||(8374352-8374547)
chr5 (1-198)||(3921579-3921776)
chr5 (1-198)||(19358524-19358721)
chr5 (4-196)||(5202972-5203164)
chr5 (5-198)||(20992163-20992356)
chr5 (4-197)||(38598466-38598659)
chr5 (1-196)||(31410476-31410671)
chr5 (3-159)||(26602957-26603113)
chr5 (1-151)||(27025001-27025151)
chr5 (61-198)||(20992354-20992495)
chr5 (55-188)||(33284642-33284775)
chr5 (1-46)||(35420437-35420482)
chr5 (60-184)||(31638157-31638281)
chr5 (164-196)||(26603108-26603140)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (1-197)||(24113179-24113375)
chr8 (1-196)||(14422702-14422897)
chr8 (1-191)||(2042537-2042727)
chr8 (1-198)||(18594534-18594731)
chr8 (1-197)||(39206584-39206780)
chr8 (1-196)||(29938060-29938255)
chr8 (1-193)||(13110406-13110598)
chr8 (1-192)||(144397-144588)
chr8 (3-197)||(10836770-10836964)
chr8 (1-198)||(6144286-6144483)
chr8 (3-196)||(35118046-35118239)
chr8 (1-197)||(22260643-22260839)
chr8 (1-197)||(39218775-39218971)
chr8 (3-199)||(36491153-36491349)
chr8 (1-196)||(33278399-33278594)
chr8 (1-195)||(34842378-34842572)
chr8 (1-198)||(4035844-4036041)
chr8 (1-190)||(34679470-34679659)
chr8 (3-192)||(41575516-41575705)
chr8 (1-197)||(7774762-7774958)
chr8 (1-196)||(38167168-38167363)
chr8 (1-194)||(7791412-7791605)
chr8 (1-198)||(34998909-34999106)
chr8 (1-189)||(44804957-44805145)
chr8 (3-197)||(7811993-7812187)
chr8 (42-198)||(40117906-40118062)
chr8 (1-196)||(5320563-5320758)
chr8 (42-197)||(33287079-33287234)
chr8 (4-193)||(8021721-8021902)
chr8 (56-198)||(26783801-26783943)
chr8 (3-191)||(42571598-42571783)
chr8 (1-193)||(28639280-28639474)
chr8 (1-192)||(66192-66384)
chr8 (1-116)||(9807339-9807454)
chr8 (44-198)||(2322068-2322222)
chr8 (108-193)||(9806875-9806960)
chr8 (67-190)||(5005171-5005294)
chr8 (44-193)||(39220258-39220407)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (1-196)||(22964-23159)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (1-198)||(33906060-33906257)
chr2 (1-196)||(31517228-31517423)
chr2 (3-196)||(3873259-3873452)
chr2 (1-197)||(18806897-18807093)
chr2 (1-197)||(2178782-2178978)
chr2 (3-198)||(26323201-26323396)
chr2 (8-198)||(1108275-1108464)
chr2 (1-193)||(28329852-28330042)
chr2 (1-197)||(5733395-5733591)
chr2 (1-197)||(39635448-39635644)
chr2 (3-197)||(4232157-4232351)
chr2 (1-193)||(4016039-4016231)
chr2 (1-197)||(42937715-42937912)
chr2 (1-197)||(6174841-6175037)
chr2 (1-193)||(850997-851189)
chr2 (3-198)||(19901153-19901347)
chr2 (1-198)||(30270692-30270889)
chr2 (1-189)||(16066307-16066495)
chr2 (1-192)||(1482916-1483106)
chr2 (2-197)||(16588790-16588985)
chr2 (1-180)||(19383948-19384127)
chr2 (44-194)||(30420223-30420373)
chr2 (3-192)||(429817-430006)
chr2 (1-195)||(44947562-44947749)
chr2 (44-197)||(42446625-42446778)
chr2 (51-157)||(22101210-22101316)
chr2 (44-192)||(3585291-3585439)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-197)||(36701-36897)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (1-198)||(10233-10430)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (3-195)||(3708-3900)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-193)||(145258-145450)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (1-197)||(19-215)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-193)||(19-212)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (1-194)||(308-501)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 52696983 - 52696788
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52696983 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 52696884  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52696883 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25897566 - 25897370
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25897566 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 25897467  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897466 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 25897370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 26580283 - 26580479
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26580283 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 26580382  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26580383 aagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 26580479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1168695 - 1168499
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1168695 aggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 1168596  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1168595 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1168499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 1170457 - 1170653
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1170457 aggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 1170556  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1170557 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1170653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 39260359 - 39260555
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  39260359 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 39260458  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39260459 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39260555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 52753160 - 52753356
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  52753160 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgat 52753259  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52753260 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52753356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8121061 - 8120870
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  8121061 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 8120962  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8120961 aaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 42370808 - 42371003
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  42370808 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgat 42370907  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42370908 aagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 42371003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16052288 - 16052091
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16052288 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16052189  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16052188 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcctt 16052091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20089663 - 20089466
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20089663 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 20089564  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20089563 aagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 20089466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26663450 - 26663257
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  26663450 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgat 26663351  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26663350 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 26663257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29078708 - 29078519
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29078708 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 29078609  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 190  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29078608 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 29078519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29288339 - 29288145
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29288339 aggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 29288242  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288241 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 29288145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5215577 - 5215384
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  5215577 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 5215478  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5215477 aagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 5215384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 1940760 - 1940956
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  1940760 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatgat 1940859  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1940860 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1940956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33510676 - 33510480
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33510676 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33510577  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33510576 aaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33510480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38829260 - 38829072
Alignment:
Q  2 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  38829260 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgata 38829161  T
Q  102 agctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 190  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38829160 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatccaaac 38829072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40092680 - 40092488
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40092680 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 40092581  T
Q  104 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40092580 atatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcc 40092488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 46761158 - 46760966
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  46761158 aggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgat 46761059  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46761058 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaaacggg 46760966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 970537 - 970734
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac--tatg 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  970537 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatatg 970636  T
Q  99 gtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
     ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  970637 ataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 970734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 8079722 - 8079914
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8079722 aggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgat 8079821  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8079822 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 8079914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12683012 - 12682817
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12683012 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 12682913  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12682912 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcc 12682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17591880 - 17591687
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  17591880 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 17591781  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  17591780 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctc--aataagccaatccaaacggggcct 17591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32671767 - 32671574
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32671767 ggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagc 32671668  T
Q  105 tgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32671667 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 32671574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Original strand, 41928511 - 41928704
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41928511 aggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 41928610  T
Q  104 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41928611 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatccaaacggggcct 41928704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 43905846 - 43905649
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43905846 aggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 43905747  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43905746 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggagcctt 43905649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 17587518 - 17587694
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  17587518 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaatatgat 17587617  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaata 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17587618 aagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 19715174 - 19715366
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  19715174 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaatgat 19715273  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19715274 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatccaaacggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 46409629 - 46409430
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaa--gccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409629 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 46409530  T
Q  99 gtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46409529 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagcctt 46409430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7145399 - 7145202
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7145399 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 7145300  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctc-aaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7145299 aaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatccaaacgggacctt 7145202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2347849 - 2347652
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatgg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  2347849 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 2347750  T
Q  100 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  2347749 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatccaaacggggcct 2347652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15203301 - 15203109
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15203301 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataag 15203202  T
Q  104 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15203201 ctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattcaaacggggcc 15203109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 13996738 - 13996933
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  13996738 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataa 13996837  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13996838 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatccaaacagggcctt 13996933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 51359230 - 51359424
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  51359230 aggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatgaaactatgat 51359329  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51359330 aagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 51359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15717976 - 15717787
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  15717976 aggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactat-ga 15717878  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 191  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15717877 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacg 15717787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2473914 - 2473722
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  2473914 aggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactataat 2473815  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  2473814 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaaacggg 2473722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23498650 - 23498457
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |    
T  23498650 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatga 23498551  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||    
T  23498550 actatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaattcaaacagggcc 23498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 49146359 - 49146167
Alignment:
Q  6 gttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagct 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49146359 gttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 49146260  T
Q  106 gtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  49146259 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggagcctt 49146167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 15554165 - 15554353
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||            
T  15554165 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaa-------- 15554256  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  15554257 atgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 15554353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6765651 - 6765458
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |    
T  6765651 aggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatatgat 6765552  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6765551 aaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 6765458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40149655 - 40149497
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  40149655 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgat 40149556  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagc 159  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40149555 aaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695673
Alignment:
Q  27 cttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaa 126  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  127 caccttcaaaaaggc-ttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 195  Q
    |||||| |||||    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacagggc 29695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38172011 - 38171827
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||| |    
T  38172011 aggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggca-------------cataagcagcttatgaaactatgat 38171925  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38171924 aaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataagtcaatgcaaacggagcctt 38171827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086263
Alignment:
Q  64 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccac 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  164 ataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaaacagggcct 52086263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 179
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323031
Alignment:
Q  45 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctta 144  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| || |||||  ||||| |||| ||||| | |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  145 tgcgagtagataagcccacataagctcaaaataag 179  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataag 23323031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675100
Alignment:
Q  122 ccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||||| |||  |||| |||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacggggcctt 5675100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217992
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    |||||| ||||| || |||||||||||    ||  |||  ||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctatttttatt-atttacccaaatgtatttgaaagagctt 5217938  T
Q  144 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    |||  ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  5217939 atgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaaacgaggcct 5217992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 2481409 - 2481605
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2481409 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 2481508  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2481509 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2481605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 45424535 - 45424732
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45424535 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 45424634  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424635 aaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 45424732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 54189737 - 54189537
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54189737 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 54189638  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctttg 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54189637 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctttg 54189538  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  54189537 t 54189537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 19913631 - 19913826
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  19913631 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 19913730  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19913731 aagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 19913826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38055348 - 38055154
Alignment:
Q  2 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38055348 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 38055249  T
Q  102 agctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055248 aaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 38055154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 23776463 - 23776655
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23776463 aggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 23776562  T
Q  104 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23776563 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 28032713 - 28032909
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  28032713 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatactatgat 28032812  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28032813 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatctaaacagggcct 28032909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 50055102 - 50055298
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  50055102 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgat 50055201  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50055202 aagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50055298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 15241029 - 15241225
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15241029 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 15241128  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15241129 aaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 15241225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37464913 - 37464717
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37464913 aggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 37464814  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37464813 aaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 37464717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 53717465 - 53717661
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  53717465 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactatgat 53717564  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53717565 aagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 53717661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Original strand, 1756767 - 1756958
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1756767 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 1756866  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1756867 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 1756958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20877239 - 20877042
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20877239 aggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 20877140  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20877139 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 20877042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50353993 - 50353796
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  50353993 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatcat 50353894  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50353893 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 50353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Original strand, 11639581 - 11639773
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11639581 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 11639680  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 195  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  11639681 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 11639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15669375 - 15669179
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15669375 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaactatgat 15669276  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15669275 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15669179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 27488649 - 27488845
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27488649 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 27488748  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  27488749 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 27488845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16700973 - 16700782
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16700973 aggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 16700874  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16700873 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14987984 - 14987787
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14987984 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 14987885  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14987884 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 14987787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 44784918 - 44785115
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  44784918 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 44785017  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44785018 aagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 44785115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 6611361 - 6611557
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  6611361 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgat 6611460  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6611461 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcct 6611557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 6688628 - 6688817
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |    
T  6688628 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcag------aaactatgat 6688721  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688722 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 6688817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 23704212 - 23704407
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23704212 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataa 23704311  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23704312 actatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacagggcctt 23704407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33704033 - 33703850
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33704033 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 33703934  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 184  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33703933 aagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaat 33703850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 40428721 - 40428915
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  40428721 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgat 40428820  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 195  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40428821 aagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggc 40428915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 43289961 - 43290162
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43289961 aggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 43290060  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctttg 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  43290061 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaaacggagcctatg 43290160  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  43290161 tg 43290162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 54412820 - 54412627
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  54412820 aggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 54412721  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54412720 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 54412627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1617276 - 1617084
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  1617276 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgat 1617177  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1617176 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31969873 - 31969681
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  31969873 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgat 31969774  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    || || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31969773 aaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataaatcaattcaaacggg 31969681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Original strand, 35490778 - 35490966
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35490778 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagc 35490877  T
Q  105 tgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35490878 tatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 35490966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 48910038 - 48909842
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48910038 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 48909939  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  48909938 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcct 48909842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47632227 - 47632032
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  47632227 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgag 47632128  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacacc-ttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 195  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  47632127 aagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggc 47632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 8932179 - 8932376
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  8932179 aggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgtt 8932278  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8932279 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 8932376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 30423566 - 30423762
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30423566 aggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 30423664  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30423665 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacgggacctt 30423762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 37968758 - 37968958
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37968758 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 37968857  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctttg 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||    
T  37968858 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggcatttg 37968957  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  37968958 t 37968958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 52139395 - 52139203
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52139395 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 52139296  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  52139295 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaacggg 52139203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 53875849 - 53875658
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  53875849 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactatgat 53875750  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  53875749 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 8591093 - 8591285
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8591093 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactatgat 8591192  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  8591193 aagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaagtcaaacggg 8591285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 19164974 - 19165164
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19164974 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatgat 19165071  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacacc-ttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19165072 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 44379188 - 44379384
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  44379188 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgat 44379287  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44379288 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcct 44379384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 55344826 - 55345022
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||| || |||| |    
T  55344826 aggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatgcaaatatgat 55344925  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55344926 aagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaacggggcct 55345022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 27536105 - 27536297
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  27536105 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgat 27536204  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27536205 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27536297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53353255 - 53353050
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcagcttatgaaacta 96  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353255 aggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 53353156  T
Q  97 tggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccaca----taagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53353155 tgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagccaatccaaacgg 53353056  T
Q  193 ggcctt 198  Q
    ||||||    
T  53353055 ggcctt 53353050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27583633 - 27583821
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27583633 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatgat 27583732  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 189  Q
    ||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27583733 aagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 27583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30171772 - 30171581
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  30171772 aggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactatgat 30171673  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30171672 aagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 38071327 - 38071504
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38071327 aggttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 38071423  T
Q  104 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 184  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071424 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360433
Alignment:
Q  22 agctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttattta 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  121 cccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 28360433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 40680041 - 40680227
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40680041 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 40680140  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 189  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40680141 gctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataagtcaatccaaa 40680227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44376037 - 44375844
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  44376037 aggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgat 44375938  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |  |||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44375937 aaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 44375844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053439
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 143  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  144 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50053439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16704009 - 16703821
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 104  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16704009 ggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaac 16703910  T
Q  105 tgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    | ||||| ||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||    |||||||||||||||| |||||    
T  16703909 tatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc----taagtcaatccaaacgaggcct 16703821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 23269047 - 23269162
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  23269047 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgat 23269146  T
Q  101 aagctgtttttgttta 116  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  23269147 aagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 198
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265955
Alignment:
Q  108 ttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 23265955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548340
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | || |||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  144 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataa-gtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataaggccaattcaaacggggcctt 44548340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 53408212 - 53408137
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaa-ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408212 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 127
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  45 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaac 127  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 23261887 - 23261937
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctga 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23261887 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 9595903 - 9595982
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9595903 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-----------gagagtttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 197
Target Start/End: Original strand, 9595975 - 9596031
Alignment:
Q  140 gcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9595975 gcttatgagagtagataagcccacataaactc-aaataagccaatccaaacggggcct 9596031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 50055337 - 50055301
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055337 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493340
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||   |||| | ||||| || |||||| ||||| || | ||||| ||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  144 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 186  Q
    ||  ||||||||| |  || ||||  |||||||||||||||||    
T  17493382 ataggagtagatatgttcatataaattcaaaataagtcaatcc 17493340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 48748250 - 48748197
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaa 54  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  48748250 aggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 105
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344780
Alignment:
Q  49 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagct 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataagct 55344780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 22174989 - 22175185
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22174989 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 22175088  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22175089 aagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22175185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15520825 - 15520629
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15520825 aggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 15520726  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15520725 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15520629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50529118 - 50528922
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50529118 aggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 50529019  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50529018 aagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50528922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20699338 - 20699144
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20699338 aggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 20699239  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20699238 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20699144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 44609334 - 44609521
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44609334 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 44609433  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44609434 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 44609521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20842347 - 20842544
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  20842347 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactatgat 20842446  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20842447 aagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 20842544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 37698142 - 37698338
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  37698142 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 37698241  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37698242 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 37698338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 42307906 - 42308101
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42307906 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 42308005  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42308006 gctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 42308101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25999574 - 25999382
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25999574 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 25999475  T
Q  104 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25999474 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 25999382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 15520143 - 15520338
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  15520143 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataa 15520242  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15520243 gttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 15520338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38856280 - 38856089
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38856280 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 38856181  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38856180 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 38856089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21581231 - 21581042
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21581231 aggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 21581132  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 190  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581131 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 21581042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 25494284 - 25494479
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25494284 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 25494383  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494384 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 25494479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8042796 - 8042599
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8042796 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 8042697  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8042696 aaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatccaaacggggcctt 8042599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29445677 - 29445481
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29445677 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatgat 29445578  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29445577 aagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 29445481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32244309 - 32244112
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32244309 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 32244210  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32244209 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 32244112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35226636 - 35226440
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35226636 aggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 35226537  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  35226536 aagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatccaaacagggcct 35226440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38934134 - 38933939
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  38934134 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 38934035  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38934034 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 38933939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 46452161 - 46452357
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  46452161 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 46452260  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  46452261 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 46452357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 54870173 - 54870369
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  54870173 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgatgat 54870272  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54870273 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcct 54870369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 12117659 - 12117854
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  12117659 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataa 12117758  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12117759 actatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcctt 12117854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 24835698 - 24835894
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  24835698 aggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 24835797  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24835798 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaaacggggcct 24835894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 54534327 - 54534521
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  54534327 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagcttat-aaaccatgat 54534424  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54534425 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 54534521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2895378 - 2895179
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcata----agctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 96  Q
    ||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895378 aggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 2895279  T
Q  97 tggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    || |||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2895278 tgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaatggggcc 2895179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 42104970 - 42105155
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  42104970 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 42105069  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 186  Q
    || || ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42105070 aaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 42105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32359448 - 32359251
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32359448 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 32359349  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || || ||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||  | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32359348 aaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 32359251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26122998 - 26122808
Alignment:
Q  6 gttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagct 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26122998 gttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagct 26122899  T
Q  106 gtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26122898 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaactgggcc 26122808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34700530 - 34700334
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  34700530 aggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 34700431  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  34700430 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatctaaacggggcct 34700334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 53028406 - 53028218
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |    
T  53028406 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatatgat 53028307  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||        ||||  |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53028306 aagctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcct 53028218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35643365 - 35643212
Alignment:
Q  42 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggc 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35643365 ggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaaggc 35643266  T
Q  142 ttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 195  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643265 ttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 35643212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44688949 - 44688782
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  44688949 aggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatgaaactatgat 44688851  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagc 169  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  44688850 aagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16354535 - 16354379
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16354535 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgat 16354436  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataa 157  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||    
T  16354435 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataa 16354379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 190
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529961
Alignment:
Q  56 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagat 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  156 aagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 190  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaac 50529961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 48925002 - 48925189
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  48925002 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgat 48925101  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 190  Q
    || || ||||| |||||||||||||  || || ||||| |||||||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  48925102 aaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagccaatccaaac 48925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128041
Alignment:
Q  62 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccc 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  162 acataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggcctt 49128041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12916091 - 12915930
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  12916091 ggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatgaaattatgataaac 12915992  T
Q  105 tgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataa 167  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12915991 tatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttatg-gagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24366218 - 24366143
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366218 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 13696982 - 13696914
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696982 aggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24366142 - 24366084
Alignment:
Q  140 gcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24366142 gcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaaaggggcctt 24366084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 36
Target Start/End: Original strand, 50528883 - 50528916
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528883 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 50528916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40240515 - 40240485
Alignment:
Q  163 cataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40240515 cataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 40240485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15656105 - 15655908
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15656105 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 15656006  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15656005 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 15655908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 43067976 - 43068173
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  43067976 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactatgat 43068075  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068076 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 43068173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 33359093 - 33359288
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33359093 aggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33359192  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33359193 aagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33359288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 199
Target Start/End: Original strand, 30181031 - 30181225
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30181031 ggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 30181130  T
Q  105 tgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttt 199  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30181131 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttt 30181225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 12101181 - 12101381
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12101181 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 12101280  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctttg 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12101281 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaatggggcctttg 12101380  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  12101381 t 12101381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 24792335 - 24792531
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24792335 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 24792434  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  24792435 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 24792531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20346681 - 20346487
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20346681 aggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 20346582  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 195  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20346581 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20346487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42673654 - 42673467
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42673654 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 42673555  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42673554 aagctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatccaaacgg 42673467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3511516 - 3511319
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3511516 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 3511417  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3511416 aagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaacgggacctt 3511319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42964999 - 42965196
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42964999 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 42965098  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42965099 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaaaggggcctt 42965196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7164375 - 7164184
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7164375 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 7164276  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7164275 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 7164184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42204348 - 42204150
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42204348 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 42204249  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacacc-ttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42204248 aagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 42204150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4347462 - 4347269
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347462 ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 4347363  T
Q  105 tgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4347362 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcctt 4347269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 22649699 - 22649892
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22649699 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataa 22649798  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22649799 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcc 22649892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1803219 - 1803029
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  1803219 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactatgat 1803120  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 191  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803119 aagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 1803029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5281053 - 5280856
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5281053 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 5280954  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5280953 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 5280856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 933478 - 933281
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  933478 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 933379  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  933378 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaattcaaacagggcctt 933281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 36890833 - 36891029
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  36890833 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 36890932  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36890933 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaaacggggcctt 36891029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 33846532 - 33846723
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  33846532 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgat 33846626  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33846627 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33846723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 4477324 - 4477515
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4477324 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgat 4477423  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4477424 aagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25748680 - 25748485
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25748680 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 25748581  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |  | ||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25748580 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 25748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6394944 - 6394747
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6394944 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgat 6394845  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6394844 aaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatctaaacggggcctt 6394747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9452783 - 9452591
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  9452783 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactatgat 9452684  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    || || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452683 aaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 9452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 12097593 - 12097788
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  12097593 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactatgat 12097692  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  12097693 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatccaaatggggcc 12097788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32041732 - 32041539
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32041732 aggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataag 32041633  T
Q  104 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  32041632 ctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcct 32041539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43156906 - 43156718
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  43156906 aggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactatgat 43156807  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 189  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43156806 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 43156718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38866737 - 38866547
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  38866737 aggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgat 38866638  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 191  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38866637 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcgatccaaacg 38866547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8630853 - 8630665
Alignment:
Q  7 ttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctg 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  8630853 ttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaacta 8630754  T
Q  107 tttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 195  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  8630753 tttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatccaaacggggc 8630665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17753793 - 17753600
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17753793 aggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgtt 17753694  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17753693 aagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatccaaacgggg 17753600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Original strand, 46134309 - 46134500
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||    
T  46134309 gaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataa 46134408  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
     || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46134409 actatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 46134500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 46891342 - 46891535
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  46891342 aggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgac 46891441  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacacc-ttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46891442 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 46891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 48865826 - 48865665
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48865826 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 48865727  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacacctt---caaaaaggcttatgcgagtagataagc 159  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||    
T  48865726 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagc 48865665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16894510 - 16894697
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16894510 aggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16894609  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || || ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16894610 aaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataa----------gctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 16894697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828266
Alignment:
Q  49 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcg 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  149 agtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcctt 19828266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 43021583 - 43021776
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |  |    |||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  43021583 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagcttatgaaactataat 43021678  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||   |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43021679 aagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatccaaatggggcctt 43021776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37705074 - 37704976
Alignment:
Q  100 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37705074 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacggggcctt 37704976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405016
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| | | || || ||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  144 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaattcaaacggggcctt 43405016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006011
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||  | |||||||||||| |||| |||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  144 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||   ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacggagcctt 37006011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 196
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849735
Alignment:
Q  51 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgag 150  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | || ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||  | ||||  ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  151 tagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    |||| || ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagcttcgaataagtcaatccaaacggggcc 36849735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655612
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |  || |||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  144 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    |||  |||||| |||| |||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcctt 15655612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163824
Alignment:
Q  60 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagc 159  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||| ||||  || ||| |||||||| | |||| ||||| |||||   ||| ||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaacgcattcacaaaggattatgttggtaaataagc 20163854  T
Q  160 ccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 189  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||    
T  20163853 tcatataagcccaaaataagtcaatccaaa 20163824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075426
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||  |||||| ||||| || ||||||||||||   |   ||| |||||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tata-taagctatttttatt-atttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  144 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    |||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcc 30075426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Original strand, 27691435 - 27691506
Alignment:
Q  107 tttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataa 178  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  27691435 tttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataa 27691506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 16307023 - 16307217
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16307023 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 16307122  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307123 gctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 16307217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3347536 - 3347733
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  3347536 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 3347635  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3347636 aagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 3347733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 26946889 - 26947084
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  26946889 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 26946988  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26946989 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26947084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18613732 - 18613535
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  18613732 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactatgat 18613633  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613632 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 18613535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2837739 - 2837543
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  2837739 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactatgat 2837640  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2837639 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2837543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 6086612 - 6086808
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  6086612 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 6086711  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6086712 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6086808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30692045 - 30691850
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30692045 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 30691946  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30691945 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 30691850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21893649 - 21893453
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21893649 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 21893550  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21893549 aagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaatcgatccaaacggggcct 21893453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 26704352 - 26704547
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26704352 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 26704451  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26704452 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 26704547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Original strand, 3955782 - 3955972
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3955782 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataag 3955881  T
Q  104 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3955882 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 3955972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 17261086 - 17261278
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |    
T  17261086 aggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaaatattat 17261185  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17261186 aagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 17261278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9459757 - 9459562
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9459757 aggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 9459658  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9459657 aagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 9459562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 34887305 - 34887496
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  34887305 aggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgat 34887404  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887405 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 34887496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20726981 - 20726790
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20726981 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 20726882  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    |||    || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20726881 aag----ttatttttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 20726790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11167434 - 11167238
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  11167434 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 11167335  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11167334 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 11167238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 28199521 - 28199714
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  28199521 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgat 28199619  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagta---gataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199620 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg-gagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 28199714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1153787 - 1153603
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1153787 aggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 1153688  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 185  Q
    || || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  1153687 aatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35198469 - 35198282
Alignment:
Q  9 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtt 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35198469 acataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35198370  T
Q  109 tttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35198369 tttatttatttacccaaacacctttaaaaa-gcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaaacggggcct 35198282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52834
Alignment:
Q  32 taagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacacct 131  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  132 tcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 30698942 - 30699132
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  30698942 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactatgat 30699041  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 191  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||   | || |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30699042 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataagtcaatccaaacg 30699132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 33464523 - 33464399
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33464523 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33464424  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaa 125  Q
    || || |||||  ||||||||||||    
T  33464423 aaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 53102 - 53005
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53102 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatg 53005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463697
Alignment:
Q  117 tttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttt 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggaccttt 33463697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 9008073 - 9008267
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9008073 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 9008172  T
Q  104 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9008173 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 9008267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16069548 - 16069351
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16069548 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16069449  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16069448 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggacctt 16069351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1579231 - 1579035
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1579231 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 1579132  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1579131 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1579035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 1605584 - 1605780
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1605584 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 1605683  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1605684 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1605780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 27679182 - 27679378
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27679182 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 27679281  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27679282 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27679378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 33491209 - 33491406
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  33491209 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatgat 33491308  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33491309 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 33491406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27421051 - 27420856
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27421051 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 27420952  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
     || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27420951 actatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 27420856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 3386499 - 3386688
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3386499 aggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 3386598  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 190  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3386599 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 3386688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24105684 - 24105881
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  24105684 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 24105783  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24105784 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggagcctt 24105881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16737460 - 16737650
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16737460 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16737559  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 191  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16737560 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaattcaaacg 16737650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31883339 - 31883142
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  31883339 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 31883240  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31883239 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagcctt 31883142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 35782659 - 35782854
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc-cggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35782659 gaggttacataaattcataagctccttg-taagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 35782757  T
Q  102 agctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35782758 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcctt 35782854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33991333 - 33991139
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  33991333 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataa 33991234  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33991233 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaattcaaacggggcct 33991139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4121132 - 4120935
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4121132 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 4121033  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||  | |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4121032 aaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattccaaacggggcctt 4120935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 1165614 - 1165802
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  1165614 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgat 1165713  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 189  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165714 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaa 1165802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 8374352 - 8374547
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8374352 aggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 8374450  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8374451 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatccaaacggggcct 8374547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3921776 - 3921579
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3921776 aggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 3921677  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3921676 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgggacctt 3921579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19358721 - 19358524
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19358721 aggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 19358622  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19358621 aagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcctt 19358524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5203164 - 5202972
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5203164 aggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 5203065  T
Q  104 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5203064 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 5202972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Original strand, 20992163 - 20992356
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  20992163 ggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatgaaactatgatatgc 20992262  T
Q  105 tgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20992263 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcctt 20992356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Original strand, 38598466 - 38598659
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38598466 aggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 38598565  T
Q  104 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || |||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  38598566 ctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatccaaaccgggcct 38598659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 31410671 - 31410476
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31410671 aggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactatgat 31410572  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31410571 aagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgcggcc 31410476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 26602957 - 26603113
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26602957 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 26603056  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagc 159  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26603057 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 26603113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27025151 - 27025001
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27025151 aggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactatgat 27025052  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagt 151  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||    
T  27025051 aagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992495
Alignment:
Q  61 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcc 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  161 c----acataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    |    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcctt 20992495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 188
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284775
Alignment:
Q  55 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtaga 154  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  155 taagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 35420437 - 35420482
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaa 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35420437 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638157
Alignment:
Q  60 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagc 159  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | || |||| | ||||| |  ||||| |||||||| || | |||||||||||  ||||| |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  160 ccacataagctcaaaataagtcaat 184  Q
     ||||||| |  |||||||||||||    
T  31638181 tcacataaacataaaataagtcaat 31638157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 196
Target Start/End: Original strand, 26603108 - 26603140
Alignment:
Q  164 ataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26603108 ataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26603140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 24113179 - 24113375
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  24113179 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 24113278  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113279 aatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 24113375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14422897 - 14422702
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14422897 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 14422798  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14422797 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 14422702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 2042537 - 2042727
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  2042537 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 2042636  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2042637 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18594731 - 18594534
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18594731 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 18594632  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18594631 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 18594534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39206780 - 39206584
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39206780 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 39206681  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39206680 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29938255 - 29938060
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29938255 aggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 29938156  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29938155 aagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 29938060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13110598 - 13110406
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13110598 aggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactatgat 13110499  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13110498 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 144588 - 144397
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  144588 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 144489  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    || || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  144488 aaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatccaaacgg 144397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 10836770 - 10836964
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  10836770 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 10836869  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10836870 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 10836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6144286 - 6144483
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6144286 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 6144385  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144386 aagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 6144483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 35118046 - 35118239
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35118046 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 35118145  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35118146 gctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 35118239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 22260643 - 22260839
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22260643 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaggat 22260742  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22260743 aagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22260839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39218971 - 39218775
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  39218971 aggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctatgat 39218872  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39218871 aaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39218775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36491349 - 36491153
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  36491349 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataa 36491250  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  36491249 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatccaaatggggccttt 36491153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33278594 - 33278399
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33278594 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33278495  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33278494 aaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 33278399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 34842378 - 34842572
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34842378 aggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 34842477  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 195  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34842478 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 34842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4036041 - 4035844
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4036041 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 4035942  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  4035941 aagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaaacggggcctt 4035844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 34679470 - 34679659
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  34679470 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgat 34679569  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 190  Q
    || || ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34679570 aaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 34679659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41575705 - 41575516
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41575705 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 41575606  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    ||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41575605 gcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 41575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7774958 - 7774762
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  7774958 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 7774859  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7774858 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagccaatctaaacgaggcct 7774762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 38167168 - 38167363
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38167168 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 38167267  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||    
T  38167268 aaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaaacagggcc 38167363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7791605 - 7791412
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  7791605 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 7791506  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7791505 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 7791412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 34998909 - 34999106
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  34998909 aggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaagat 34999008  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  34999009 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatccatacgggacctt 34999106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 44804957 - 44805145
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  44804957 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 44805056  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 189  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44805057 aagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagccaattcaaa 44805145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7812187 - 7811993
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7812187 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 7812088  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7812087 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcaaaacggggcct 7811993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Original strand, 40117906 - 40118062
Alignment:
Q  42 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggc 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40117906 ggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggc 40118005  T
Q  142 ttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40118006 ttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 40118062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5320758 - 5320563
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  5320758 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactatgat 5320659  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||  | ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5320658 aaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 5320563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 197
Target Start/End: Original strand, 33287079 - 33287234
Alignment:
Q  42 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  33287079 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagc 33287178  T
Q  142 ttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287179 atatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 33287234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8021902 - 8021721
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 103  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  8021902 aggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 8021811  T
Q  104 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8021810 ctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 8021721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 198
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783943
Alignment:
Q  56 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  156 aagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcctt 26783943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42571783 - 42571598
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42571783 gaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 42571686  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 191  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42571685 gctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28639474 - 28639280
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28639474 aggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 28639377  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggct----tatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    || || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||    |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  28639376 aaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaattcaaacggg 28639280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 66192 - 66384
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagg-taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 99  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  66192 aggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatta 66291  T
Q  100 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||| || |||||| | |||| || |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  66292 taagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatctaaacgg 66384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 9807454 - 9807339
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  9807454 aggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctatgat 9807355  T
Q  101 aagctgtttttgttta 116  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  9807354 aagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322222
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  144 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    |||  |||||||||  ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcctt 2322222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806875
Alignment:
Q  108 ttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 9806875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005171
Alignment:
Q  67 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacata 166  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||   |||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  167 agctcaaaataagtcaatccaaac 190  Q
    |||| || ||||| ||||||||||    
T  5005194 agcttaagataagccaatccaaac 5005171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220258
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |    |||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  144 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    |||   |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaattcaaacggg 39220258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 22964 - 23159
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22964 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 23063  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23064 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 33906060 - 33906257
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33906060 aggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33906159  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33906160 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatccaaacagggcctt 33906257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 31517228 - 31517423
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31517228 aggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgat 31517327  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31517328 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 31517423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 3873259 - 3873452
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3873259 gaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3873358  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 196  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3873359 gctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 3873452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 18806897 - 18807093
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  18806897 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgat 18806996  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18806997 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 18807093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 2178782 - 2178978
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2178782 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 2178881  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2178882 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatccaaacggggcct 2178978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 26323201 - 26323396
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26323201 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 26323300  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26323301 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcctt 26323396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108275
Alignment:
Q  8 tacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  108 ttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctt 1108275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 28329852 - 28330042
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  28329852 aggaggttacataaattcatatgctccttgttaagctag--ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgat 28329949  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329950 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 28330042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5733591 - 5733395
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  5733591 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 5733492  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  5733491 aagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggcct 5733395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39635644 - 39635448
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  39635644 aggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 39635545  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39635544 aagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaaacggggcct 39635448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 4232157 - 4232351
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4232157 gaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 4232256  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4232257 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcct 4232351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4016231 - 4016039
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4016231 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 4016132  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    | | | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4016131 acgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42937912 - 42937715
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42937912 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42937813  T
Q  100 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42937812 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 42937715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 6174841 - 6175037
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  6174841 aggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 6174940  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6174941 aaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6175037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 851189 - 850997
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  851189 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattatgat 851090  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  851089 aagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatccaaacggg 850997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 19901153 - 19901347
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19901153 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 19901252  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19901253 gctattttt-attatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 19901347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 30270692 - 30270889
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  30270692 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 30270791  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || || ||||  |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  30270792 aaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatccaaacggggcctt 30270889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 16066307 - 16066495
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16066307 aggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16066406  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 189  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16066407 aagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaa 16066495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 1482916 - 1483106
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  1482916 aggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacaataat 1483015  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1483016 aagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttatg-gagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcaaaacgg 1483106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Original strand, 16588790 - 16588985
Alignment:
Q  2 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggta 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16588790 ggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataata 16588889  T
Q  102 agctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16588890 agctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaaacggagcct 16588985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 19383948 - 19384127
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  19383948 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactatgat 19384047  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagt 180  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  19384048 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataagt 19384127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 194
Target Start/End: Original strand, 30420223 - 30420373
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30420223 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 30420322  T
Q  144 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30420323 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 30420373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 430006 - 429817
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  430006 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataa 429907  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||  ||| |||||||    
T  429906 gctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataagggaattcaaacgg 429817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 44947562 - 44947749
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44947562 aggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 44947654  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 195  Q
    || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  44947655 aaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaatacaaatggggc 44947749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446778
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  144 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    |||  ||||||||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  42446725 atgttagtagataagttcgcataaactccgaataagccaatccaaacggggcct 42446778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101316
Alignment:
Q  51 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgag 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| ||||||| || |||||  |||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttag 22101309  T
Q  151 tagataa 157  Q
    |||||||    
T  22101310 tagataa 22101316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585291
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 143  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||||| || ||||||| |||||| || || |||| ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  144 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 192  Q
    |||  ||| |||||  |||||||||||   |||||| | ||||||||||    
T  3585339 atgttagtggataaatccacataagctttgaataagccgatccaaacgg 3585291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36897 - 36701
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  36897 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 36798  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36797 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 36701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10430 - 10233
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10430 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgat 10331  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 198  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10330 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 10233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3900 - 3708
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3900 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3801  T
Q  103 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 195  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  3800 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 145258 - 145450
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  145258 aggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 145357  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  145358 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 19 - 215
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 118  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  119 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaatacaaacggggcct 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 19 - 212
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgat 117  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagta---gataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 193  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  118 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg-gagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 308 - 501
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  308 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 407  T
Q  101 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 194  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  408 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University