View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20116_low_71 (Length: 252)

Name: NF20116_low_71
Description: NF20116
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20116_low_71
NF20116_low_71
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (1-252)||(35198153-35198403)
chr6 (133-252)||(3955853-3955972)
chr6 (132-252)||(21893455-21893575)
chr6 (132-252)||(26704426-26704546)
chr6 (136-252)||(30691855-30691971)
chr6 (132-251)||(3347611-3347730)
chr6 (132-251)||(6086687-6086806)
chr6 (132-251)||(26946964-26947083)
chr6 (132-252)||(2837545-2837665)
chr6 (126-251)||(52830-52955)
chr6 (135-252)||(34887379-34887496)
chr6 (134-252)||(17261160-17261278)
chr6 (132-252)||(16307095-16307215)
chr6 (132-252)||(9459563-9459683)
chr6 (132-251)||(18613538-18613657)
chr6 (132-251)||(11167240-11167359)
chr6 (132-252)||(20726791-20726907)
chr6 (143-252)||(1153604-1153713)
chr6 (180-252)||(28199594-28199666)
chr6 (182-252)||(30699016-30699086)
chr6 (134-210)||(33463703-33463779)
chr6 (202-252)||(33464399-33464449)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (132-252)||(14422703-14422823)
chr8 (132-252)||(29938061-29938181)
chr8 (132-252)||(39206586-39206706)
chr8 (132-251)||(18594537-18594656)
chr8 (132-251)||(40117940-40118059)
chr8 (132-252)||(34842452-34842572)
chr8 (132-251)||(35118119-35118238)
chr8 (127-252)||(33287112-33287237)
chr8 (138-251)||(44805032-44805145)
chr8 (134-252)||(13110406-13110524)
chr8 (136-252)||(26783820-26783936)
chr8 (135-251)||(41575516-41575632)
chr8 (136-251)||(2042612-2042727)
chr8 (125-252)||(10836842-10836969)
chr8 (133-251)||(7791412-7791530)
chr8 (134-251)||(8021721-8021838)
chr8 (137-250)||(34679546-34679659)
chr8 (143-251)||(7774775-7774883)
chr8 (132-252)||(39218777-39218897)
chr8 (132-251)||(24113254-24113373)
chr8 (136-251)||(42571598-42571712)
chr8 (134-252)||(34998983-34999101)
chr8 (132-252)||(4035847-4035967)
chr8 (132-252)||(6144360-6144480)
chr8 (132-252)||(22260717-22260837)
chr8 (132-251)||(5320564-5320683)
chr8 (135-252)||(144397-144514)
chr8 (132-252)||(33278400-33278520)
chr8 (132-251)||(7811995-7812114)
chr8 (132-252)||(38167242-38167362)
chr8 (134-252)||(28639280-28639402)
chr8 (132-241)||(36491157-36491266)
chr8 (178-252)||(66267-66341)
chr8 (132-250)||(2322101-2322219)
chr8 (137-252)||(5005171-5005286)
chr8 (211-251)||(9807339-9807379)
chr8 (134-219)||(9806875-9806960)
chr8 (134-247)||(39220258-39220371)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (132-250)||(40428797-40428915)
chr4 (126-252)||(48909838-48909964)
chr4 (133-251)||(54412627-54412745)
chr4 (132-252)||(11639653-11639773)
chr4 (132-252)||(23776534-23776654)
chr4 (132-251)||(14987790-14987909)
chr4 (125-251)||(6611436-6611562)
chr4 (127-252)||(50055176-50055301)
chr4 (132-252)||(53717539-53717659)
chr4 (134-251)||(20877047-20877164)
chr4 (132-252)||(54189543-54189663)
chr4 (132-251)||(19913706-19913825)
chr4 (134-252)||(30423639-30423757)
chr4 (134-252)||(31969681-31969799)
chr4 (134-252)||(52139203-52139321)
chr4 (143-252)||(37968832-37968941)
chr4 (135-251)||(16700782-16700898)
chr4 (132-252)||(27488723-27488843)
chr4 (132-252)||(37464719-37464839)
chr4 (132-252)||(38055155-38055275)
chr4 (124-252)||(50053433-50053561)
chr4 (132-252)||(50353799-50353919)
chr4 (135-251)||(53875658-53875774)
chr4 (133-252)||(1756839-1756958)
chr4 (136-251)||(15241104-15241219)
chr4 (149-252)||(28032787-28032890)
chr4 (134-252)||(8591167-8591285)
chr4 (132-252)||(2481483-2481603)
chr4 (132-252)||(44784992-44785112)
chr4 (135-252)||(19165046-19165164)
chr4 (134-252)||(35490848-35490966)
chr4 (132-252)||(8932253-8932373)
chr4 (127-251)||(15669176-15669300)
chr4 (132-252)||(45424609-45424729)
chr4 (149-252)||(28360445-28360548)
chr4 (149-252)||(38071395-38071498)
chr4 (149-252)||(40680113-40680216)
chr4 (132-237)||(6688711-6688816)
chr4 (135-252)||(43290035-43290152)
chr4 (132-252)||(23704284-23704404)
chr4 (132-232)||(55344920-55345020)
chr4 (149-252)||(27583707-27583810)
chr4 (135-250)||(30171581-30171696)
chr4 (136-251)||(33703843-33703958)
chr4 (132-252)||(53353053-53353177)
chr4 (134-248)||(1617084-1617198)
chr4 (132-252)||(47632032-47632153)
chr4 (175-252)||(27536179-27536256)
chr4 (175-252)||(16703862-16703939)
chr4 (175-251)||(44379263-44379339)
chr4 (133-251)||(44375844-44375962)
chr4 (134-219)||(23265865-23265950)
chr4 (132-252)||(44548216-44548337)
chr4 (200-252)||(51780793-51780845)
chr4 (211-252)||(23269121-23269162)
chr4 (149-250)||(17493348-17493449)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (126-252)||(25897366-25897492)
chr1 (135-252)||(49146173-49146290)
chr1 (133-252)||(26663257-26663376)
chr1 (132-252)||(1168501-1168621)
chr1 (124-252)||(41928582-41928710)
chr1 (137-252)||(29078519-29078634)
chr1 (126-252)||(26580357-26580483)
chr1 (126-252)||(29288141-29288267)
chr1 (126-252)||(39260433-39260559)
chr1 (134-251)||(19715249-19715366)
chr1 (132-252)||(13996810-13996930)
chr1 (132-252)||(32671577-32671697)
chr1 (132-252)||(52753234-52753354)
chr1 (132-251)||(20089469-20089588)
chr1 (125-251)||(2347647-2347773)
chr1 (134-252)||(8079796-8079914)
chr1 (135-252)||(43905655-43905772)
chr1 (132-252)||(15203110-15203230)
chr1 (132-252)||(16052094-16052214)
chr1 (132-252)||(33510482-33510602)
chr1 (132-251)||(1170532-1170651)
chr1 (132-251)||(1940835-1940954)
chr1 (124-251)||(2473712-2473839)
chr1 (132-252)||(12682818-12682938)
chr1 (132-252)||(52696789-52696909)
chr1 (132-252)||(970611-970733)
chr1 (137-248)||(38829072-38829183)
chr1 (135-252)||(46409436-46409553)
chr1 (135-251)||(8120870-8120986)
chr1 (132-248)||(42370886-42371002)
chr1 (133-252)||(5215384-5215503)
chr1 (134-252)||(46760966-46761084)
chr1 (132-251)||(17591689-17591805)
chr1 (132-252)||(40092489-40092609)
chr1 (135-251)||(38171833-38171949)
chr1 (132-252)||(51359304-51359423)
chr1 (150-252)||(17587592-17587694)
chr1 (132-250)||(23498458-23498576)
chr1 (132-251)||(29695673-29695793)
chr1 (132-252)||(52086265-52086385)
chr1 (152-252)||(7145226-7145325)
chr1 (175-251)||(40149504-40149580)
chr1 (181-252)||(15717832-15717902)
chr1 (133-251)||(6765458-6765576)
chr1 (132-224)||(15554259-15554351)
chr1 (149-251)||(23322928-23323030)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (122-251)||(37698217-37698346)
chr3 (132-252)||(25999383-25999503)
chr3 (132-252)||(42307978-42308098)
chr3 (132-251)||(12117732-12117851)
chr3 (132-251)||(26122809-26122928)
chr3 (132-251)||(34700336-34700455)
chr3 (132-252)||(25494358-25494478)
chr3 (132-252)||(29445483-29445603)
chr3 (133-252)||(38856089-38856208)
chr3 (132-251)||(54870248-54870367)
chr3 (126-252)||(15520625-15520751)
chr3 (134-252)||(32244117-32244235)
chr3 (125-251)||(38933934-38934059)
chr3 (132-252)||(15520215-15520335)
chr3 (132-252)||(22175063-22175183)
chr3 (132-252)||(50528924-50529044)
chr3 (149-252)||(21581054-21581157)
chr3 (159-252)||(44688783-44688876)
chr3 (132-252)||(2895180-2895300)
chr3 (132-252)||(20699144-20699264)
chr3 (132-252)||(24835772-24835892)
chr3 (132-252)||(54534400-54534519)
chr3 (149-252)||(50529846-50529949)
chr3 (132-250)||(20842423-20842541)
chr3 (132-252)||(8042602-8042722)
chr3 (132-252)||(46452235-46452355)
chr3 (132-251)||(35643212-35643331)
chr3 (126-252)||(35226436-35226562)
chr3 (149-251)||(42105045-42105147)
chr3 (137-252)||(44609406-44609521)
chr3 (134-252)||(32359256-32359374)
chr3 (132-252)||(49128044-49128164)
chr3 (181-252)||(16354390-16354461)
chr3 (188-251)||(12915957-12916020)
chr3 (137-251)||(48925077-48925189)
chr3 (132-251)||(53028220-53028331)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (132-252)||(3708-3828)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (132-252)||(12101255-12101375)
chr7 (132-252)||(22649771-22649891)
chr7 (132-252)||(30181101-30181221)
chr7 (132-251)||(33846602-33846721)
chr7 (132-252)||(20346487-20346607)
chr7 (132-252)||(33359167-33359287)
chr7 (132-252)||(42965073-42965193)
chr7 (132-252)||(6394750-6394870)
chr7 (132-252)||(8630665-8630785)
chr7 (132-252)||(19828269-19828389)
chr7 (132-252)||(24792409-24792529)
chr7 (133-252)||(7164184-7164303)
chr7 (132-251)||(43068051-43068170)
chr7 (136-250)||(1803029-1803143)
chr7 (134-252)||(3511324-3511442)
chr7 (135-252)||(4477398-4477515)
chr7 (138-251)||(43156718-43156831)
chr7 (132-252)||(933284-933404)
chr7 (132-251)||(32041541-32041660)
chr7 (132-252)||(42204153-42204274)
chr7 (132-252)||(4347272-4347392)
chr7 (132-252)||(15655911-15656031)
chr7 (132-252)||(25748486-25748606)
chr7 (134-252)||(5280861-5280979)
chr7 (132-252)||(36890907-36891026)
chr7 (149-252)||(38866560-38866663)
chr7 (175-251)||(12097668-12097744)
chr7 (175-252)||(16894584-16894661)
chr7 (175-252)||(17753642-17753719)
chr7 (132-228)||(37704979-37705075)
chr7 (135-252)||(42673467-42673580)
chr7 (133-245)||(46134388-46134500)
chr7 (134-245)||(9452591-9452702)
chr7 (189-252)||(48865689-48865752)
chr7 (134-251)||(46891417-46891535)
chr7 (132-251)||(43021654-43021773)
chr7 (132-242)||(43405019-43405129)
chr7 (135-252)||(37005888-37006005)
chr7 (138-222)||(27691433-27691517)
chr7 (189-251)||(36849615-36849677)
chr7 (136-250)||(15655491-15655605)
chr7 (200-250)||(20163886-20163936)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (132-252)||(9008144-9008264)
chr5 (135-251)||(24105759-24105875)
chr5 (132-252)||(27679256-27679376)
chr5 (132-248)||(33491287-33491403)
chr5 (127-252)||(1579032-1579157)
chr5 (127-252)||(1605658-1605783)
chr5 (136-252)||(16737534-16737650)
chr5 (132-252)||(35782731-35782851)
chr5 (134-252)||(3921584-3921702)
chr5 (132-252)||(27420859-27420979)
chr5 (137-252)||(3386573-3386688)
chr5 (134-252)||(16069356-16069474)
chr5 (127-252)||(33991136-33991261)
chr5 (132-252)||(4120938-4121058)
chr5 (132-252)||(5202973-5203093)
chr5 (132-252)||(8374425-8374545)
chr5 (132-252)||(19358527-19358647)
chr5 (132-252)||(20992233-20992353)
chr5 (124-252)||(38598537-38598665)
chr5 (132-252)||(20992368-20992492)
chr5 (149-251)||(1165689-1165791)
chr5 (175-252)||(26603029-26603106)
chr5 (135-251)||(31883148-31883264)
chr5 (136-252)||(31410481-31410597)
chr5 (149-250)||(33284664-33284765)
chr5 (176-252)||(27025001-27025077)
chr5 (181-251)||(31638195-31638265)
chr5 (197-250)||(41818552-41818605)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (126-251)||(36697-36822)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (132-252)||(26323273-26323393)
chr2 (132-252)||(33906134-33906254)
chr2 (133-252)||(30420254-30420373)
chr2 (132-252)||(31517302-31517422)
chr2 (132-251)||(6174916-6175035)
chr2 (126-251)||(39635444-39635569)
chr2 (136-252)||(3873331-3873447)
chr2 (132-252)||(18806971-18807091)
chr2 (134-252)||(4016039-4016157)
chr2 (134-252)||(28329924-28330042)
chr2 (135-252)||(42937720-42937837)
chr2 (132-252)||(1108278-1108397)
chr2 (132-252)||(4232229-4232349)
chr2 (143-251)||(5733408-5733516)
chr2 (132-252)||(44947629-44947749)
chr2 (132-251)||(30270767-30270886)
chr2 (135-252)||(429817-429934)
chr2 (132-252)||(19901225-19901344)
chr2 (138-252)||(16066381-16066495)
chr2 (132-252)||(2178856-2178976)
chr2 (143-252)||(1482990-1483098)
chr2 (135-252)||(16588863-16588980)
chr2 (134-252)||(850997-851115)
chr2 (181-252)||(19384022-19384093)
chr2 (132-251)||(22101235-22101353)
chr2 (181-252)||(42446656-42446727)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (132-252)||(23038-23158)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (125-252)||(93-220)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (133-251)||(383-501)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (132-250)||(10236-10354)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (134-251)||(145333-145450)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (180-252)||(92-164)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 35198153 - 35198403
Alignment:
Q  1 caattatcatatatgaaatgtattaaatagtaaccagatgttgtgtatgcaatggcataatgctttatgtcatgcatgaggtgcaaaggtagatcattta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35198153 caattatcatatatgaaatgtattaaatagtaaccagatgttgtgtatgtaatggcataatgctttatgtcatgcatgaggtgcaaaggtagatcattta 35198252  T
Q  101 ctttcaaatatttcttaatggttacacttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  35198253 ctttcaaatattttttaatggttacacttaggccccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataag-ctttttaaaggtg 35198351  T
Q  201 tttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35198352 tttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 35198403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 133 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3955972 - 3955853
Alignment:
Q  133 ccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3955972 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 3955873  T
Q  233 gtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  3955872 gtttcataaactgcttatgc 3955853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 21893455 - 21893575
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| || | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21893455 gccccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatcat 21893554  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21893555 agtttcataagctgcttatgc 21893575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26704546 - 26704426
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26704546 gccccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 26704447  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26704446 agtttcataagctgcttatgc 26704426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 252
Target Start/End: Original strand, 30691855 - 30691971
Alignment:
Q  136 cgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 235  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691855 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30691954  T
Q  236 tcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||    
T  30691955 tcataagctgcttatgc 30691971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3347730 - 3347611
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3347730 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcat 3347631  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3347630 agtttcataagctgcttatg 3347611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6086806 - 6086687
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6086806 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 6086707  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6086706 agtttcataagctgcttatg 6086687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26947083 - 26946964
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26947083 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 26946984  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26946983 agtttcataagctgcttatg 26946964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 2837545 - 2837665
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2837545 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 2837644  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  2837645 agtttcatgagctgctcatgc 2837665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 251
Target Start/End: Original strand, 52830 - 52955
Alignment:
Q  126 acttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52830 acttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 52929  T
Q  226 tatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  52930 tatcatagtttcataagctgcttatg 52955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34887496 - 34887379
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887496 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34887397  T
Q  235 ttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  34887396 ttcataagctgtttatgc 34887379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17261278 - 17261160
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  17261278 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatat 17261179  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17261178 tttcataagctgcttatgc 17261160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16307215 - 16307095
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16307215 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcat 16307116  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16307115 agtttcataagctgcttatgc 16307095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 9459563 - 9459683
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |  ||| || | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9459563 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 9459662  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9459663 agtttcataagctgcttatgc 9459683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 18613538 - 18613657
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18613538 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 18613637  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  18613638 agttccataagctgcttatg 18613657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 11167240 - 11167359
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||| || |  ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11167240 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 11167339  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11167340 agtttcataagctgcttatg 11167359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 20726791 - 20726907
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| ||||||||    
T  20726791 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgg----gtaaataaaaataacttatcat 20726886  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20726887 agtttcataagctgcttatgc 20726907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 143 - 252
Target Start/End: Original strand, 1153604 - 1153713
Alignment:
Q  143 attggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 242  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1153604 attggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataag 1153703  T
Q  243 ctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||    
T  1153704 ctgcttatgc 1153713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28199666 - 28199594
Alignment:
Q  180 ccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28199666 ccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcatatgctgcttatgc 28199594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30699086 - 30699016
Alignment:
Q  182 ataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30699086 ataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttttattagctgcttatgc 30699016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 33463703 - 33463779
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaa 210  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33463703 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 252
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464449
Alignment:
Q  202 ttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgc 33464449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 14422703 - 14422823
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14422703 gccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 14422802  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14422803 agtttcataagctgcttatgc 14422823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 29938061 - 29938181
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  29938061 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcat 29938160  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29938161 agtttcataagctgcttatgc 29938181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 39206586 - 39206706
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39206586 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 39206685  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39206686 agtttcataagctgcttatgc 39206706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 18594537 - 18594656
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18594537 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 18594636  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18594637 agtttcataagctgcttatg 18594656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40118059 - 40117940
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40118059 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 40117960  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40117959 agtttcataagctgcttatg 40117940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34842572 - 34842452
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34842572 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 34842473  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34842472 agtttcataagctgcttatgc 34842452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35118238 - 35118119
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35118238 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 35118139  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35118138 agtttcataagctgcttatg 35118119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33287237 - 33287112
Alignment:
Q  127 cttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctt 226  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33287237 cttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagttt 33287138  T
Q  227 atcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33287137 atcatagtttcataagctgcttatgc 33287112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 44805145 - 44805032
Alignment:
Q  138 tttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 237  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805145 tttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 44805046  T
Q  238 ataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||    
T  44805045 ataagctgcttatg 44805032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 13110406 - 13110524
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13110406 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 13110505  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  13110506 tttaataagctgcttatgc 13110524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26783936 - 26783820
Alignment:
Q  136 cgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 235  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26783936 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtt 26783837  T
Q  236 tcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||    
T  26783836 tcataagctgcttatgc 26783820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 251
Target Start/End: Original strand, 41575516 - 41575632
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41575516 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagt 41575615  T
Q  235 ttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||    
T  41575616 ttcataagctgcttatg 41575632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042612
Alignment:
Q  136 cgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 235  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 2042628  T
Q  236 tcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||    
T  2042627 tcataagctgcttatg 2042612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 125 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10836969 - 10836842
Alignment:
Q  125 cacttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 224  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  10836969 cacttaggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 10836870  T
Q  225 ttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10836869 ttatcatagtttcataaactgcttatgc 10836842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 251
Target Start/End: Original strand, 7791412 - 7791530
Alignment:
Q  133 ccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7791412 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 7791511  T
Q  233 gtttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7791512 gtttcataagctgcttatg 7791530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 251
Target Start/End: Original strand, 8021721 - 8021838
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8021721 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 8021820  T
Q  234 tttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8021821 tttcataagctgcttatg 8021838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34679659 - 34679546
Alignment:
Q  137 gtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 236  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34679659 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagttt 34679560  T
Q  237 cataagctgcttat 250  Q
    ||||||||||||||    
T  34679559 cataagctgcttat 34679546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Original strand, 7774775 - 7774883
Alignment:
Q  143 attggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 242  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7774775 attggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataag 7774874  T
Q  243 ctgcttatg 251  Q
    |||||||||    
T  7774875 ctgcttatg 7774883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 39218777 - 39218897
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  39218777 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatcat 39218876  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  39218877 agcttcataagctgcttatgc 39218897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24113373 - 24113254
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  24113373 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatcat 24113274  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24113273 agtttcataagctgcttatg 24113254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 251
Target Start/End: Original strand, 42571598 - 42571712
Alignment:
Q  136 cgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 235  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42571598 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtt 42571696  T
Q  236 tcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||    
T  42571697 tcataagctgcttatg 42571712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34999101 - 34998983
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| |||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34999101 cccgtatggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcttag 34999002  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34999001 tttcataagctgcttatgc 34998983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 4035847 - 4035967
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4035847 gccccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcat 4035946  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4035947 agtttcataagctgcttatgc 4035967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6144480 - 6144360
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6144480 gccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 6144381  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6144380 agtttcataagctgcttatgc 6144360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22260837 - 22260717
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  22260837 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcct 22260738  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22260737 agtttcataagctgcttatgc 22260717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 5320564 - 5320683
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||    
T  5320564 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatcat 5320663  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  5320664 agtttcataagttgcttatg 5320683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Original strand, 144397 - 144514
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  144397 ccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatagt 144496  T
Q  235 ttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||    
T  144497 ttcataagctgcttatgc 144514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 33278400 - 33278520
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  |||| |||   ||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33278400 gccccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcat 33278499  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33278500 agtttcataagctgcttatgc 33278520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 7811995 - 7812114
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||  ||||||| || ||| |||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7811995 gccccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcat 7812094  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7812095 agtttcataagctgcttatg 7812114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 38167362 - 38167242
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||| ||||| |||||  ||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  38167362 gccctgtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtttatcat 38167263  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38167262 agtttcataagctgcttatgc 38167242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 28639280 - 28639402
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccat----aagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatc 229  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||| |||||| ||    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  28639280 cccgtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatc 28639379  T
Q  230 atagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28639380 atagtttcataagctgcttatgc 28639402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 241
Target Start/End: Original strand, 36491157 - 36491266
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||  ||| || || |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36491157 gccccatttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 36491256  T
Q  232 agtttcataa 241  Q
    ||||||||||    
T  36491257 agtttcataa 36491266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 66341 - 66267
Alignment:
Q  178 tcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  66341 tcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatagtttcataagctgcttatgc 66267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2322219 - 2322101
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| |||||  || ||||| ||| | ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||     
T  2322219 gccccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatcac 2322120  T
Q  232 agtttcataagctgcttat 250  Q
    | |||||||||||||||||    
T  2322119 aatttcataagctgcttat 2322101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 252
Target Start/End: Original strand, 5005171 - 5005286
Alignment:
Q  137 gtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 236  Q
    ||||| ||||| |||| || | ||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || | |    
T  5005171 gtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatgctactct 5005270  T
Q  237 cataagctgcttatgc 252  Q
    ||||| ||||||||||    
T  5005271 cataaactgcttatgc 5005286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 251
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807379
Alignment:
Q  211 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatg 9807379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Original strand, 9806875 - 9806960
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaa 219  Q
    |||||||| ||||  |||||||||  |||| || |  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9806875 cccgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 247
Target Start/End: Original strand, 39220258 - 39220371
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    ||| |||  ||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||   |     
T  39220258 cccgtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaa 39220357  T
Q  234 tttcataagctgct 247  Q
    ||||||||||||||    
T  39220358 tttcataagctgct 39220371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40428915 - 40428797
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40428915 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 40428816  T
Q  232 agtttcataagctgcttat 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40428815 agtttcataagctgcttat 40428797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 252
Target Start/End: Original strand, 48909838 - 48909964
Alignment:
Q  126 acttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 225  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48909838 acttaggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 48909937  T
Q  226 tatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  48909938 tatcatagtttcataagctgcttatgc 48909964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 133 - 251
Target Start/End: Original strand, 54412627 - 54412745
Alignment:
Q  133 ccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54412627 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 54412726  T
Q  233 gtttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||||    
T  54412727 gtttcataagctgcttatg 54412745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11639773 - 11639653
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11639773 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 11639674  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11639673 agtttcataagctgcttatgc 11639653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23776654 - 23776534
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23776654 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 23776555  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23776554 agtttcataagctgcttatgc 23776534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 14987790 - 14987909
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14987790 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 14987889  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14987890 agtttcataagctgcttatg 14987909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6611562 - 6611436
Alignment:
Q  125 cacttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 224  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6611562 cacttaggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 6611463  T
Q  225 ttatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6611462 ttatcatagtttcataagctgtttatg 6611436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 50055301 - 50055176
Alignment:
Q  127 cttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctt 226  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50055301 cttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagctt 50055202  T
Q  227 atcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50055201 atcatggtttcataagctgcttatgc 50055176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 53717659 - 53717539
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53717659 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 53717560  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  53717559 agtttcataagctgcttatgc 53717539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 251
Target Start/End: Original strand, 20877047 - 20877164
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20877047 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 20877146  T
Q  234 tttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20877147 tttcataagctgcttatg 20877164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 54189543 - 54189663
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54189543 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 54189642  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  54189643 agtttcataagctgcttatgc 54189663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19913825 - 19913706
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  19913825 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatcat 19913726  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19913725 agtttcataagctgcttatg 19913706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30423757 - 30423639
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30423757 cccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 30423658  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30423657 tttcataagctgcttatgc 30423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 31969681 - 31969799
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31969681 cccgtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 31969780  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31969781 tttcataagctgcttatgc 31969799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 52139203 - 52139321
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52139203 cccgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 52139302  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  52139303 tttcataagctgcttatgc 52139321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37968941 - 37968832
Alignment:
Q  143 attggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968941 attggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 37968842  T
Q  243 ctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||    
T  37968841 ctgcttatgc 37968832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 251
Target Start/End: Original strand, 16700782 - 16700898
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16700782 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 16700881  T
Q  235 ttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||    
T  16700882 ttcataagctgcttatg 16700898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27488843 - 27488723
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27488843 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 27488744  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27488743 agtttcataagctgcttatgc 27488723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 37464719 - 37464839
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  37464719 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcat 37464818  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37464819 agtttcataagctgcttatgc 37464839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 38055155 - 38055275
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  38055155 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 38055254  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38055255 agtttcataagctgcttatgc 38055275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 124 - 252
Target Start/End: Original strand, 50053433 - 50053561
Alignment:
Q  124 acacttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatag 223  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  50053433 acacttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatag 50053532  T
Q  224 cttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50053533 cttatcatagtttcataagctgcttatgc 50053561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 50353799 - 50353919
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  50353799 gccccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatgat 50353898  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  50353899 agtttcataagctgcttatgc 50353919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 251
Target Start/End: Original strand, 53875658 - 53875774
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53875658 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 53875757  T
Q  235 ttcataagctgcttatg 251  Q
    || ||||||||||||||    
T  53875758 tttataagctgcttatg 53875774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1756958 - 1756839
Alignment:
Q  133 ccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1756958 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 1756859  T
Q  233 gtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1756858 gtttcataagctgcttatgc 1756839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15241219 - 15241104
Alignment:
Q  136 cgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 235  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  15241219 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtt 15241120  T
Q  236 tcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||    
T  15241119 tcataagctgcttatg 15241104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28032890 - 28032787
Alignment:
Q  149 ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 248  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28032890 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtatcataagctgctt 28032791  T
Q  249 atgc 252  Q
    ||||    
T  28032790 atgc 28032787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8591285 - 8591167
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8591285 cccgtttgacttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8591186  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8591185 tttcataagctgcttatgc 8591167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2481603 - 2481483
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  2481603 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 2481504  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2481503 agtttcataagctgcttatgc 2481483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44785112 - 44784992
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44785112 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcat 44785013  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  44785012 agtttcataagttgcttatgc 44784992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19165164 - 19165046
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagccttttt-aaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19165164 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 19165065  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19165064 tttcataagctgcttatgc 19165046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 35490966 - 35490848
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35490966 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 35490867  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  35490866 tttcataagttgcttatgc 35490848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8932373 - 8932253
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |    
T  8932373 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttaacgt 8932274  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8932273 agtttcataagctgcttatgc 8932253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 251
Target Start/End: Original strand, 15669176 - 15669300
Alignment:
Q  127 cttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctt 226  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15669176 cttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagctt 15669275  T
Q  227 atcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15669276 atcatagtttcataagctgcttatg 15669300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 45424729 - 45424609
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  45424729 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 45424630  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45424629 agtttcataagctgcttatgc 45424609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 252
Target Start/End: Original strand, 28360445 - 28360548
Alignment:
Q  149 ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 248  Q
    ||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28360445 ttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataagctgctt 28360544  T
Q  249 atgc 252  Q
    ||||    
T  28360545 atgc 28360548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 38071498 - 38071395
Alignment:
Q  149 ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 248  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38071498 ttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgctt 38071399  T
Q  249 atgc 252  Q
    ||||    
T  38071398 atgc 38071395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 40680216 - 40680113
Alignment:
Q  149 ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 248  Q
    |||||||||| ||||||| |  ||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680216 ttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 40680117  T
Q  249 atgc 252  Q
    ||||    
T  40680116 atgc 40680113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6688816 - 6688711
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6688816 gccccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 6688717  T
Q  232 agtttc 237  Q
    ||||||    
T  6688716 agtttc 6688711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43290152 - 43290035
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||| | || |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43290152 ccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagt 43290053  T
Q  235 ttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43290052 ttcataagctgcttatgc 43290035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23704404 - 23704284
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23704404 gccctgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 23704305  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23704304 agtttcataagctgcttatgc 23704284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 55345020 - 55344920
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55345020 gccccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 55344921  T
Q  232 a 232  Q
    |    
T  55344920 a 55344920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27583810 - 27583707
Alignment:
Q  149 ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 248  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27583810 ttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgcataagctgctt 27583711  T
Q  249 atgc 252  Q
    ||||    
T  27583710 atgc 27583707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Original strand, 30171581 - 30171696
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||| |  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30171581 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagt 30171680  T
Q  235 ttcataagctgcttat 250  Q
    ||||||||||||||||    
T  30171681 ttcataagctgcttat 30171696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 251
Target Start/End: Original strand, 33703843 - 33703958
Alignment:
Q  136 cgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 235  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33703843 cgttttaattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtt 33703942  T
Q  236 tcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||    
T  33703943 tcataagctgcttatg 33703958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 53353053 - 53353177
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaactta----tgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 227  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||    | ||||  ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53353053 gccccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 53353152  T
Q  228 tcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  53353153 tcatagtttcataagctgcttatgc 53353177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 248
Target Start/End: Original strand, 1617084 - 1617198
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1617084 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatag 1617183  T
Q  234 tttcataagctgctt 248  Q
    |||||||||||||||    
T  1617184 tttcataagctgctt 1617198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 47632032 - 47632153
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaa-ggtgtttggataaataaataaaaatagcttatca 230  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||   ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  47632032 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctca 47632131  T
Q  231 tagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47632132 tagtttcataagctgcttatgc 47632153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 175 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27536256 - 27536179
Alignment:
Q  175 tactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27536256 tactcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataaactgcttatgc 27536179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 252
Target Start/End: Original strand, 16703862 - 16703939
Alignment:
Q  175 tactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16703862 tacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgc 16703939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 44379339 - 44379263
Alignment:
Q  175 tactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44379339 tacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgcttatg 44379263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 251
Target Start/End: Original strand, 44375844 - 44375962
Alignment:
Q  133 ccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||  ||| || ||| |||  | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44375844 ccccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcata 44375943  T
Q  233 gtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  44375944 gtttcataaactgcttatg 44375962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23265950 - 23265865
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaa 219  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23265950 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44548337 - 44548216
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggt-ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatca 230  Q
    ||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  44548337 gccccgtttgaattggccttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatcttatca 44548238  T
Q  231 tagtttcataagctgcttatgc 252  Q
     | ||| ||||| || ||||||    
T  44548237 caattttataagttgtttatgc 44548216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 51780845 - 51780793
Alignment:
Q  200 gtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51780845 gtttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgc 51780793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269121
Alignment:
Q  211 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 23269121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 250
Target Start/End: Original strand, 17493348 - 17493449
Alignment:
Q  149 ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 248  Q
    |||||||||| |||| ||   |||| |||||| |||||| ||||||| || |||||  ||||| |||||||||| |||||  || ||| |||||||||||    
T  17493348 ttattttgaatttatatgaacatatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttataagctgctt 17493447  T
Q  249 at 250  Q
    ||    
T  17493448 at 17493449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 252
Target Start/End: Original strand, 25897366 - 25897492
Alignment:
Q  126 acttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25897366 acttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 25897465  T
Q  226 tatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25897466 tatcatagtttcataagctgcttatgc 25897492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Original strand, 49146173 - 49146290
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49146173 ccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 49146272  T
Q  235 ttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49146273 ttcataagctgcttatgc 49146290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 133 - 252
Target Start/End: Original strand, 26663257 - 26663376
Alignment:
Q  133 ccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663257 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 26663356  T
Q  233 gtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  26663357 gtttcataagctgtttatgc 26663376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 1168501 - 1168621
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1168501 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 1168600  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1168601 agtttcataagctgcttatgc 1168621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 124 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41928710 - 41928582
Alignment:
Q  124 acacttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatag 223  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41928710 acacttaggccccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 41928611  T
Q  224 cttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928610 tttatcatagtttcataagctgcttatgc 41928582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 137 - 252
Target Start/End: Original strand, 29078519 - 29078634
Alignment:
Q  137 gtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 236  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078519 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 29078618  T
Q  237 cataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||    
T  29078619 cataagctgcttatgc 29078634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 126 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26580483 - 26580357
Alignment:
Q  126 acttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26580483 acttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagct 26580384  T
Q  226 tatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26580383 tatcatagtttcataagctgcttatgc 26580357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 126 - 252
Target Start/End: Original strand, 29288141 - 29288267
Alignment:
Q  126 acttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29288141 acttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 29288240  T
Q  226 tatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  29288241 tatcatagtttcataagctgcttatgc 29288267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 126 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39260559 - 39260433
Alignment:
Q  126 acttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39260559 acttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 39260460  T
Q  226 tatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39260459 tatcatagtttcataagttgcttatgc 39260433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19715366 - 19715249
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19715366 cccgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattg 19715267  T
Q  234 tttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19715266 tttcataagctgcttatg 19715249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13996930 - 13996810
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13996930 gccctgtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttataat 13996831  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  13996830 ggtttcataagctgcttatgc 13996810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 32671577 - 32671697
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32671577 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 32671676  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  32671677 agtttcataagctacttatgc 32671697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 52753354 - 52753234
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52753354 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 52753255  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  52753254 agtttcataagctacttatgc 52753234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 20089469 - 20089588
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20089469 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcat 20089568  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20089569 agtttcataagctgcttatg 20089588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 125 - 251
Target Start/End: Original strand, 2347647 - 2347773
Alignment:
Q  125 cacttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 224  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2347647 cacttaggccccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 2347746  T
Q  225 ttatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2347747 ttatcatagtttcataagctgcttatg 2347773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8079914 - 8079796
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8079914 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8079815  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  8079814 tttcataagctacttatgc 8079796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Original strand, 43905655 - 43905772
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905655 ccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 43905754  T
Q  235 ttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43905755 ttcataagctgcttatgc 43905772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 15203110 - 15203230
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15203110 gccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagcttatcat 15203209  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  15203210 agtttcataagctgtttatgc 15203230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 16052094 - 16052214
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16052094 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 16052193  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16052194 agtttcataagctgcttatgc 16052214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 33510482 - 33510602
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33510482 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcat 33510581  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33510582 agtttcataagctgcttatgc 33510602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1170651 - 1170532
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1170651 gccccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 1170552  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1170551 agtttcataagctgcttatg 1170532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1940954 - 1940835
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1940954 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 1940855  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  1940854 agtttcataagttgtttatg 1940835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 251
Target Start/End: Original strand, 2473712 - 2473839
Alignment:
Q  124 acacttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatag 223  Q
    ||||||| | |||||||| || |||||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2473712 acacttaggtcccgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 2473811  T
Q  224 cttatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2473812 cttattatagtttcataagctgcttatg 2473839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 12682818 - 12682938
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12682818 gccctgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 12682917  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12682918 agtttcataagctgcttatgc 12682938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 52696789 - 52696909
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  52696789 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 52696888  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  52696889 agtttcataagctgcttatgc 52696909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 970733 - 970611
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatc-- 229  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  970733 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcat 970634  T
Q  230 atagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  970633 atagtttcataagctgcttatgc 970611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 248
Target Start/End: Original strand, 38829072 - 38829183
Alignment:
Q  137 gtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 236  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829072 gtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 38829171  T
Q  237 cataagctgctt 248  Q
    ||||||||||||    
T  38829172 cataagctgctt 38829183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Original strand, 46409436 - 46409553
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||   ||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409436 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 46409535  T
Q  235 ttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46409536 ttcataagctgcttatgc 46409553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 251
Target Start/End: Original strand, 8120870 - 8120986
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  8120870 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagt 8120969  T
Q  235 ttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||    
T  8120970 ttcataagctgcttatg 8120986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42371002 - 42370886
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  42371002 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatcat 42370903  T
Q  232 agtttcataagctgctt 248  Q
    |||||||||||||||||    
T  42370902 agtttcataagctgctt 42370886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 252
Target Start/End: Original strand, 5215384 - 5215503
Alignment:
Q  133 ccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5215384 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcata 5215483  T
Q  233 gtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  5215484 gtttcataagttgcttatgc 5215503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 46760966 - 46761084
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||| || |  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46760966 cccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 46761065  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  46761066 tttcataaactgcttatgc 46761084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 17591689 - 17591805
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| |||||  || ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17591689 gccccgtttggattggcttatt--gagcttatgtggct-tatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 17591785  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17591786 agtttcataagctgcttatg 17591805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 40092489 - 40092609
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||| ||||| || |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40092489 gccctgtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatcat 40092588  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40092589 agtttcataagctgcttatgc 40092609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 251
Target Start/End: Original strand, 38171833 - 38171949
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||||||    ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  38171833 ccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatcatagt 38171932  T
Q  235 ttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||    
T  38171933 ttcataagctgcttatg 38171949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 51359423 - 51359304
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||  ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  51359423 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatcat 51359325  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  51359324 agtttcataaggtgcttatgc 51359304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587592
Alignment:
Q  150 tattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctta 249  Q
    |||||||| |||||||| |  ||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  250 tgc 252  Q
    |||    
T  17587594 tgc 17587592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Original strand, 23498458 - 23498576
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  23498458 gccctgtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatcat 23498557  T
Q  232 agtttcataagctgcttat 250  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  23498558 agtttcataagttgcttat 23498576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 29695673 - 29695793
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataa-gcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatca 230  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  29695673 gccctgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatca 29695772  T
Q  231 tagtttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29695773 tagtttcataagctgcttatg 29695793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 52086265 - 52086385
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||    
T  52086265 gccctgtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatcat 52086364  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  52086365 aatttcataagctgcttatgc 52086385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 252
Target Start/End: Original strand, 7145226 - 7145325
Alignment:
Q  152 ttttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7145226 ttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgttggg-taaataaacaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatg 7145324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 251
Target Start/End: Original strand, 40149504 - 40149580
Alignment:
Q  175 tactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  40149504 tactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatg 40149580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 252
Target Start/End: Original strand, 15717832 - 15717902
Alignment:
Q  181 cataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15717832 cataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtttcataagctgcttatgc 15717902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 251
Target Start/End: Original strand, 6765458 - 6765576
Alignment:
Q  133 ccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||  | ||| ||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6765458 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 6765557  T
Q  233 gtttcataagctgcttatg 251  Q
     |||||| |||||||||||    
T  6765558 ttttcatgagctgcttatg 6765576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15554351 - 15554259
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 224  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15554351 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 15554259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23323030 - 23322928
Alignment:
Q  149 ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 248  Q
    ||||||||| ||||| | ||  ||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23323030 ttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgctt 23322931  T
Q  249 atg 251  Q
    |||    
T  23322930 atg 23322928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 122 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37698346 - 37698217
Alignment:
Q  122 ttacacttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaat 221  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37698346 ttacatttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat 37698247  T
Q  222 agcttatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698246 agcttatcatagtttcataagctgcttatg 37698217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 25999383 - 25999503
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25999383 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 25999482  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25999483 agtttcataagctgcttatgc 25999503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42308098 - 42307978
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42308098 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 42307999  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42307998 agtttcataagctgcttatgc 42307978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12117851 - 12117732
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12117851 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcat 12117752  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  12117751 agtttcataagttgcttatg 12117732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 26122809 - 26122928
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26122809 gcccagtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 26122908  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26122909 agtttcataagctgcttatg 26122928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 34700336 - 34700455
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34700336 gccccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcat 34700435  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34700436 agtttcataagctgcttatg 34700455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25494478 - 25494358
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25494478 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 25494379  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25494378 agtttcataagctgcttatgc 25494358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 29445483 - 29445603
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29445483 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 29445582  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  29445583 agtttcataagctgtttatgc 29445603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 252
Target Start/End: Original strand, 38856089 - 38856208
Alignment:
Q  133 ccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38856089 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 38856188  T
Q  233 gtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38856189 gtttcataagctgcttatgc 38856208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 54870367 - 54870248
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54870367 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 54870268  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
     |||||||||||||||||||    
T  54870267 cgtttcataagctgcttatg 54870248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 252
Target Start/End: Original strand, 15520625 - 15520751
Alignment:
Q  126 acttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15520625 acttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagct 15520724  T
Q  226 tatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15520725 tatcatagtttcataagctgcttatgc 15520751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 32244117 - 32244235
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32244117 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 32244216  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32244217 tttcataagctgcttatgc 32244235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 125 - 251
Target Start/End: Original strand, 38933934 - 38934059
Alignment:
Q  125 cacttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 224  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  38933934 cacttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtggct-tatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagc 38934032  T
Q  225 ttatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38934033 ttatcatagtttcataagctgcttatg 38934059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15520335 - 15520215
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15520335 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcat 15520236  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  15520235 cgtttcataaactgcttatgc 15520215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22175183 - 22175063
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22175183 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 22175084  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22175083 agtttcataagctgcttatgc 22175063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 50528924 - 50529044
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  50528924 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 50529023  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  50529024 agtttcataagctgcttatgc 50529044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 252
Target Start/End: Original strand, 21581054 - 21581157
Alignment:
Q  149 ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 248  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21581054 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctt 21581153  T
Q  249 atgc 252  Q
    ||||    
T  21581154 atgc 21581157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 252
Target Start/End: Original strand, 44688783 - 44688876
Alignment:
Q  159 cttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44688783 cttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 44688876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 2895180 - 2895300
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  2895180 gccccatttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatcat 2895279  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2895280 agtttcataagctgcttatgc 2895300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 20699144 - 20699264
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  20699144 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 20699243  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20699244 agtttcataagctgcttatgc 20699264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24835892 - 24835772
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24835892 gccccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttattat 24835793  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24835792 agtttcataagctgcttatgc 24835772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 54534519 - 54534400
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54534519 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 54534420  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
     |||| |||||||||||||||    
T  54534419 ggttt-ataagctgcttatgc 54534400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 149 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 50529949 - 50529846
Alignment:
Q  149 ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 248  Q
    |||||||||  ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529949 ttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 50529850  T
Q  249 atgc 252  Q
    ||||    
T  50529849 atgc 50529846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20842541 - 20842423
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  20842541 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcat 20842442  T
Q  232 agtttcataagctgcttat 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20842441 agtttcataagctgcttat 20842423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 8042602 - 8042722
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| || || ||||||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  8042602 gccccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcat 8042701  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8042702 agtttcataagctgcttatgc 8042722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 46452355 - 46452235
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  46452355 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 46452256  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  46452255 agtttcataagttgcttatgc 46452235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 35643212 - 35643331
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35643212 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 35643311  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35643312 agtttcataagctgcttatg 35643331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 252
Target Start/End: Original strand, 35226436 - 35226562
Alignment:
Q  126 acttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 225  Q
    ||||| |||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  35226436 acttaggccctgtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagct 35226535  T
Q  226 tatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  35226536 tatcatagtttcataagctgcttatgc 35226562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42105147 - 42105045
Alignment:
Q  149 ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 248  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42105147 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgctt 42105048  T
Q  249 atg 251  Q
    |||    
T  42105047 atg 42105045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44609521 - 44609406
Alignment:
Q  137 gtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 236  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||   ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44609521 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 44609422  T
Q  237 cataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||    
T  44609421 cataagctgcttatgc 44609406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 32359256 - 32359374
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || | |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32359256 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatag 32359355  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32359356 tttcataagctgcttatgc 32359374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 49128044 - 49128164
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  49128044 gccccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataacttatcgt 49128143  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  49128144 aatttcataagctgcttatgc 49128164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 252
Target Start/End: Original strand, 16354390 - 16354461
Alignment:
Q  181 cataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16354390 cataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgc 16354461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 251
Target Start/End: Original strand, 12915957 - 12916020
Alignment:
Q  188 ctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  12915957 ctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatg 12916020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48925189 - 48925077
Alignment:
Q  137 gtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 236  Q
    ||||| ||||| |||||| ||  |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48925189 gtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 48925092  T
Q  237 cataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||| |||||    
T  48925091 cataagctgtttatg 48925077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 53028220 - 53028331
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  53028220 gccctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt--------aaataaataaaaatagcttatcat 53028311  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  53028312 attttcataaactgcttatg 53028331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 3708 - 3828
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3708 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 3807  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3808 agtttcataagctgcttatgc 3828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12101375 - 12101255
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12101375 gccccatttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 12101276  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12101275 agtttcataagctgcttatgc 12101255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22649891 - 22649771
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22649891 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 22649792  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  22649791 aatttcataagctgcttatgc 22649771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30181221 - 30181101
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30181221 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 30181122  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30181121 agtttcataagctgcttatgc 30181101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33846721 - 33846602
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33846721 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 33846622  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  33846621 agtttcataaactgcttatg 33846602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 20346487 - 20346607
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20346487 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcat 20346586  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20346587 agtttcataagctgcttatgc 20346607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33359287 - 33359167
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33359287 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 33359188  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33359187 agtttcataagctgcttatgc 33359167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42965193 - 42965073
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42965193 gccccttttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 42965094  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42965093 agtttcataagctgcttatgc 42965073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 6394750 - 6394870
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6394750 gccccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcat 6394849  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  6394850 ggtttcataagctgcttatgc 6394870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 8630665 - 8630785
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  8630665 gccccgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcat 8630764  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8630765 agtttcataagctgcttatgc 8630785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 19828269 - 19828389
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19828269 gccccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatcat 19828368  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  19828369 agtttcataaattgcttatgc 19828389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24792529 - 24792409
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24792529 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 24792430  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24792429 agtttcataagctgcttatgc 24792409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 252
Target Start/End: Original strand, 7164184 - 7164303
Alignment:
Q  133 ccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7164184 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 7164283  T
Q  233 gtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7164284 gtttcataagctgcttatgc 7164303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 43068170 - 43068051
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43068170 gccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 43068071  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  43068070 agtttcataagcttcttatg 43068051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 250
Target Start/End: Original strand, 1803029 - 1803143
Alignment:
Q  136 cgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 235  Q
    |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803029 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 1803128  T
Q  236 tcataagctgcttat 250  Q
    |||||||||||||||    
T  1803129 tcataagctgcttat 1803143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 3511324 - 3511442
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3511324 cccgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttatcatag 3511423  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3511424 tttcataagctgcttatgc 3511442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4477515 - 4477398
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4477515 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggt 4477416  T
Q  235 ttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4477415 ttcataagctgcttatgc 4477398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 251
Target Start/End: Original strand, 43156718 - 43156831
Alignment:
Q  138 tttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 237  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156718 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 43156817  T
Q  238 ataagctgcttatg 251  Q
    |||||||| |||||    
T  43156818 ataagctgtttatg 43156831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 933284 - 933404
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  933284 gccctgtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 933383  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  933384 agtttcataagctgcttatgc 933404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 32041541 - 32041660
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32041541 gccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 32041640  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32041641 agtttcataagctgcttatg 32041660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 42204153 - 42204274
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttt-taaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatca 230  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42204153 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatca 42204252  T
Q  231 tagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42204253 tagtttcataagctgcttatgc 42204274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 4347272 - 4347392
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4347272 gccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaccat 4347371  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4347372 agtttcataagctgcttatgc 4347392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 15655911 - 15656031
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  15655911 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 15656010  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15656011 agtttcataagctgcttatgc 15656031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 25748486 - 25748606
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||| ||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25748486 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 25748585  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25748586 agtttcataagctgcttatgc 25748606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 5280861 - 5280979
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||| || || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5280861 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 5280960  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5280961 tttcataagctgcttatgc 5280979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 36891026 - 36890907
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  |||||| || ||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36891026 gccccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 36890928  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  36890927 agtttcataagttgcttatgc 36890907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 252
Target Start/End: Original strand, 38866560 - 38866663
Alignment:
Q  149 ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 248  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  38866560 ttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgttt 38866659  T
Q  249 atgc 252  Q
    ||||    
T  38866660 atgc 38866663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12097744 - 12097668
Alignment:
Q  175 tactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12097744 tactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctacttatg 12097668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16894661 - 16894584
Alignment:
Q  175 tactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894661 tactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgc 16894584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 252
Target Start/End: Original strand, 17753642 - 17753719
Alignment:
Q  175 tactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17753642 tactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacatagtttcataagctgcttatgc 17753719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Original strand, 37704979 - 37705075
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttat 228  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37704979 gccccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Original strand, 42673467 - 42673580
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||||||| |||||||||||||    
T  42673467 ccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgg----gtaaataaaaacagcttatcatagt 42673562  T
Q  235 ttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42673563 ttcataagctgcttatgc 42673580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46134500 - 46134388
Alignment:
Q  133 ccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  46134500 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattata 46134401  T
Q  233 gtttcataagctg 245  Q
    |||||||||||||    
T  46134400 gtttcataagctg 46134388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 245
Target Start/End: Original strand, 9452591 - 9452702
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||    ||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9452591 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatag 9452690  T
Q  234 tttcataagctg 245  Q
    ||||||||||||    
T  9452691 tttcataagctg 9452702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 252
Target Start/End: Original strand, 48865689 - 48865752
Alignment:
Q  189 tttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865689 tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgc 48865752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 46891535 - 46891417
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagccttttt-aaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||  ||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  46891535 cccgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcata 46891436  T
Q  233 gtttcataagctgcttatg 251  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  46891435 gttttataagctgcttatg 46891417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 43021773 - 43021654
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||| |  ||||||||   ||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  43021773 gccccatttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttattat 43021674  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43021673 agtttcataagctgcttatg 43021654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Original strand, 43405019 - 43405129
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  43405019 gccccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcgt 43405118  T
Q  232 agtttcataag 242  Q
    | |||||||||    
T  43405119 aatttcataag 43405129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37006005 - 37005888
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||| | |||||||| || ||| |||| | |||||  |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| || |    
T  37006005 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatcgtaat 37005906  T
Q  235 ttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37005905 ttcataagctgcttatgc 37005888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27691517 - 27691433
Alignment:
Q  138 tttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaata 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27691517 tttgaattggtttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaata 27691433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36849677 - 36849615
Alignment:
Q  189 tttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||| ||| |||||    
T  36849677 tttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatcacaatttcataaactgtttatg 36849615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15655605 - 15655491
Alignment:
Q  136 cgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 235  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||| |  | | ||||  |||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||    
T  15655605 cgtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagcttaccacaatt 15655506  T
Q  236 tcataagctgcttat 250  Q
    | |||| ||||||||    
T  15655505 ttataaactgcttat 15655491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 250
Target Start/End: Original strand, 20163886 - 20163936
Alignment:
Q  200 gtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 250  Q
    |||||| | ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20163886 gtttgggtgaattaattaaaatagcttatcacagtttcataagctgcttat 20163936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9008264 - 9008144
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9008264 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 9008165  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9008164 agtttcataagctgcttatgc 9008144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24105875 - 24105759
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105875 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 24105776  T
Q  235 ttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||    
T  24105775 ttcataagctgcttatg 24105759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27679376 - 27679256
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27679376 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 27679277  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27679276 agtttcataagctgcttatgc 27679256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33491403 - 33491287
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33491403 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 33491304  T
Q  232 agtttcataagctgctt 248  Q
    |||||||||||||||||    
T  33491303 agtttcataagctgctt 33491287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 252
Target Start/End: Original strand, 1579032 - 1579157
Alignment:
Q  127 cttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctt 226  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1579032 cttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 1579131  T
Q  227 atcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1579132 atcatagtttcataagctgcttatgc 1579157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1605783 - 1605658
Alignment:
Q  127 cttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctt 226  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1605783 cttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 1605684  T
Q  227 atcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1605683 atcatagtttcataagctgcttatgc 1605658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16737650 - 16737534
Alignment:
Q  136 cgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 235  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737650 cgtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 16737551  T
Q  236 tcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||    
T  16737550 tcataagctgcttatgc 16737534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 35782851 - 35782731
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35782851 gccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 35782752  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35782751 agtttcataagctgcttatgc 35782731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 3921584 - 3921702
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  |||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921584 cccgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 3921683  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3921684 tttcataagctgcttatgc 3921702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 27420859 - 27420979
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  27420859 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcat 27420958  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27420959 agtttcataagctgcttatgc 27420979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3386688 - 3386573
Alignment:
Q  137 gtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 236  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386688 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 3386589  T
Q  237 cataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||    
T  3386588 cataagctgcttatgc 3386573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 16069356 - 16069474
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16069356 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatag 16069455  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16069456 tttcataagctgcttatgc 16069474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 252
Target Start/End: Original strand, 33991136 - 33991261
Alignment:
Q  127 cttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctt 226  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33991136 cttaggccccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 33991235  T
Q  227 atcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  33991236 atcatagtttcataagttgcttatgc 33991261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 4120938 - 4121058
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  4120938 gccccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatcat 4121037  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4121038 agtttcataagctgcttatgc 4121058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 5202973 - 5203093
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5202973 gccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 5203072  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5203073 agtttcataagctgcttatgc 5203093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8374545 - 8374425
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8374545 gccccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 8374446  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8374445 agtttcataagctgcttatgc 8374425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 19358527 - 19358647
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19358527 gccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 19358626  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19358627 agtttcataagctgcttatgc 19358647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20992353 - 20992233
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20992353 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcat 20992254  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  20992253 agtttcataagctgattatgc 20992233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 38598665 - 38598537
Alignment:
Q  124 acacttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatag 223  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  38598665 acacttaggcccggtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatag 38598566  T
Q  224 cttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598565 cttatcatagtttcataagctgcttatgc 38598537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20992492 - 20992368
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgt----gggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 227  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  20992492 gccctgtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcata 20992393  T
Q  228 tcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20992392 tcatagtttcataagctgcttatgc 20992368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1165791 - 1165689
Alignment:
Q  149 ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 248  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1165791 ttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgctt 1165692  T
Q  249 atg 251  Q
    |||    
T  1165691 atg 1165689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 175 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26603106 - 26603029
Alignment:
Q  175 tactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26603106 tactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgc 26603029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 251
Target Start/End: Original strand, 31883148 - 31883264
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31883148 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 31883247  T
Q  235 ttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||    
T  31883248 ttcataagctgcttatg 31883264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 252
Target Start/End: Original strand, 31410481 - 31410597
Alignment:
Q  136 cgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31410481 cgtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatcatagtt 31410580  T
Q  236 tcataagctgcttatgc 252  Q
    | |||||||||||||||    
T  31410581 ttataagctgcttatgc 31410597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33284765 - 33284664
Alignment:
Q  149 ttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 248  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33284765 ttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagttttataaactgctt 33284666  T
Q  249 at 250  Q
    ||    
T  33284665 at 33284664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 252
Target Start/End: Original strand, 27025001 - 27025077
Alignment:
Q  176 actcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025001 actcccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 27025077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 251
Target Start/End: Original strand, 31638195 - 31638265
Alignment:
Q  181 cataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  31638195 cataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataagcttcttatg 31638265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818552
Alignment:
Q  197 ggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 250  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttat 41818552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 251
Target Start/End: Original strand, 36697 - 36822
Alignment:
Q  126 acttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36697 acttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 36796  T
Q  226 tatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  36797 tatcatagtttcataagctgcttatg 36822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26323393 - 26323273
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323393 gccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 26323294  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26323293 agtttcataagctgcttatgc 26323273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33906254 - 33906134
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33906254 gccctgtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 33906155  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33906154 agtttcataagctgcttatgc 33906134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 133 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30420373 - 30420254
Alignment:
Q  133 ccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30420373 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 30420274  T
Q  233 gtttcataagctgcttatgc 252  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  30420273 ggttcataagctgcttatgc 30420254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31517422 - 31517302
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31517422 gccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 31517323  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  31517322 agtttcataaactgcttatgc 31517302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6175035 - 6174916
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  6175035 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 6174936  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6174935 agtttcataagctgcttatg 6174916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 251
Target Start/End: Original strand, 39635444 - 39635569
Alignment:
Q  126 acttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 225  Q
    ||||| |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  39635444 acttaggccccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagct 39635543  T
Q  226 tatcatagtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  39635544 tatcatagtttcataagctgcttatg 39635569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3873447 - 3873331
Alignment:
Q  136 cgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 235  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3873447 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtt 3873348  T
Q  236 tcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||    
T  3873347 tcataagctgcttatgc 3873331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18807091 - 18806971
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18807091 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 18806992  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18806991 agtttcataagctgcttatgc 18806971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 4016039 - 4016157
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  4016039 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatag 4016138  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4016139 tttcataagctgcttatgc 4016157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28330042 - 28329924
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28330042 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 28329943  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  28329942 tttcataaactgcttatgc 28329924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Original strand, 42937720 - 42937837
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42937720 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 42937819  T
Q  235 ttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42937820 ttcataagctgcttatgc 42937837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Original strand, 1108278 - 1108397
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| || || ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1108278 gccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 1108376  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  1108377 agtttcataagttgcttatgc 1108397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4232349 - 4232229
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4232349 gccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 4232250  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4232249 agtttcataagctgcttatgc 4232229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Original strand, 5733408 - 5733516
Alignment:
Q  143 attggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5733408 attggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatcatagtttcataag 5733507  T
Q  243 ctgcttatg 251  Q
    |||||||||    
T  5733508 ctgcttatg 5733516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44947749 - 44947629
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||| || | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44947749 gccccatttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcat 44947650  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44947649 agtttcataagctgcttatgc 44947629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30270886 - 30270767
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| | ||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  30270886 gccccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatcat 30270787  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30270786 agtttcataagctgcttatg 30270767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Original strand, 429817 - 429934
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    |||||||||||   |||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  429817 ccgtttgaattcccttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataat 429916  T
Q  235 ttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||| |||||||||    
T  429917 ttcataagttgcttatgc 429934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19901344 - 19901225
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | | |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19901344 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcat 19901246  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  19901245 agtttcataaactgcttatgc 19901225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066381
Alignment:
Q  138 tttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 237  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| | ||  |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 16066396  T
Q  238 ataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||    
T  16066395 ataagctgcttatgc 16066381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2178976 - 2178856
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||   ||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2178976 gccccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 2178877  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2178876 agtttcataagctgcttatgc 2178856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1483098 - 1482990
Alignment:
Q  143 attggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 242  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1483098 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcc-ataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgtttcataag 1483000  T
Q  243 ctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||    
T  1482999 ctgcttatgc 1482990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16588980 - 16588863
Alignment:
Q  135 ccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||   |||||||||  ||| ||||  |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16588980 ccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 16588881  T
Q  235 ttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16588880 ttcataagctgcttatgc 16588863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 850997 - 851115
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||| | ||||||| | ||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||     
T  850997 cccgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataa 851096  T
Q  234 tttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  851097 ttttataagctgcttatgc 851115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19384093 - 19384022
Alignment:
Q  181 cataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  19384093 cataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgtttatgc 19384022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22101353 - 22101235
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||||     
T  22101353 gccccgtttgaattgggttattcagaatttatgtggtt-tatctactaacataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcac 22101255  T
Q  232 agtttcataagctgcttatg 251  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  22101254 aatttcataagctgcttatg 22101235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42446727 - 42446656
Alignment:
Q  181 cataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42446727 cataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgc 42446656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23158 - 23038
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23158 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 23059  T
Q  232 agtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23058 agtttcataagctgcttatgc 23038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 125 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 220 - 93
Alignment:
Q  125 cacttacgccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 224  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||  ||||  |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  220 cacttaggccccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 121  T
Q  225 ttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  120 ttatcatagtttcataagctgcttatgc 93  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 501 - 383
Alignment:
Q  133 ccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 232  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  501 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 402  T
Q  233 gtttcataagctgcttatg 251  Q
    |||||||||||||||||||    
T  401 gtttcataagctgcttatg 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Original strand, 10236 - 10354
Alignment:
Q  132 gccccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 231  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10236 gccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 10335  T
Q  232 agtttcataagctgcttat 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10336 agtttcataagctgcttat 10354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145333
Alignment:
Q  134 cccgtttgaattggtttattttgaacttatgtgggtatatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 233  Q
    |||||||| ||||  |||||||||  ||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  145450 cccgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 145351  T
Q  234 tttcataagctgcttatg 251  Q
    ||||||||||||||||||    
T  145350 tttcataagctgcttatg 145333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 92
Alignment:
Q  180 ccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  164 ccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcatatgctgcttatgc 92  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University