View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20135_low_21 (Length: 293)

Name: NF20135_low_21
Description: NF20135
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20135_low_21
NF20135_low_21
[»] chr1 (115 HSPs)
chr1 (64-247)||(31040704-31040888)
chr1 (70-247)||(31308002-31308180)
chr1 (70-247)||(45538154-45538332)
chr1 (63-245)||(17994956-17995139)
chr1 (70-247)||(3611137-3611315)
chr1 (70-247)||(44661971-44662149)
chr1 (71-244)||(4068689-4068863)
chr1 (70-247)||(5981171-5981349)
chr1 (70-247)||(21139415-21139593)
chr1 (71-247)||(43251713-43251890)
chr1 (64-247)||(25678262-25678446)
chr1 (70-247)||(25058689-25058867)
chr1 (70-247)||(26277178-26277356)
chr1 (70-247)||(38790200-38790378)
chr1 (70-244)||(24245031-24245206)
chr1 (70-247)||(6327551-6327728)
chr1 (70-247)||(23932512-23932690)
chr1 (70-247)||(23984756-23984934)
chr1 (70-247)||(26085401-26085578)
chr1 (70-247)||(33884089-33884267)
chr1 (70-247)||(33959985-33960163)
chr1 (70-246)||(23220939-23221110)
chr1 (65-247)||(37620195-37620378)
chr1 (70-247)||(5980069-5980247)
chr1 (70-247)||(33112821-33112998)
chr1 (70-247)||(36566331-36566509)
chr1 (70-247)||(39646569-39646747)
chr1 (62-247)||(46967044-46967230)
chr1 (70-247)||(47671587-47671765)
chr1 (57-247)||(38331862-38332053)
chr1 (70-244)||(41999816-41999991)
chr1 (70-247)||(24885502-24885680)
chr1 (70-251)||(26794305-26794487)
chr1 (62-247)||(35273589-35273775)
chr1 (70-247)||(47383735-47383913)
chr1 (64-241)||(49253984-49254162)
chr1 (70-247)||(50774218-50774396)
chr1 (70-247)||(35692666-35692845)
chr1 (70-247)||(3285403-3285580)
chr1 (70-247)||(26524892-26525070)
chr1 (70-247)||(51057072-51057250)
chr1 (70-247)||(28888582-28888760)
chr1 (70-247)||(46616550-46616728)
chr1 (70-247)||(46784424-46784602)
chr1 (70-247)||(47317316-47317494)
chr1 (70-222)||(31844377-31844530)
chr1 (71-237)||(42863867-42864034)
chr1 (70-247)||(47187106-47187284)
chr1 (70-207)||(25518815-25518952)
chr1 (70-247)||(36003131-36003312)
chr1 (70-247)||(49398991-49399169)
chr1 (70-247)||(48373505-48373674)
chr1 (70-247)||(42313364-42313546)
chr1 (70-247)||(27983606-27983768)
chr1 (71-224)||(45475869-45476014)
chr1 (70-185)||(51403074-51403188)
chr1 (71-188)||(31979998-31980115)
chr1 (104-247)||(2450529-2450673)
chr1 (70-247)||(33073212-33073379)
chr1 (70-247)||(41467635-41467802)
chr1 (70-188)||(2556909-2557027)
chr1 (110-247)||(51045599-51045737)
chr1 (70-247)||(2657304-2657471)
chr1 (70-247)||(10928068-10928235)
chr1 (70-247)||(26685857-26686024)
chr1 (70-247)||(42234841-42235007)
chr1 (70-245)||(29770671-29770836)
chr1 (123-247)||(4808699-4808824)
chr1 (70-247)||(2954856-2955023)
chr1 (70-247)||(6626027-6626194)
chr1 (70-244)||(26472185-26472349)
chr1 (72-247)||(1388476-1388641)
chr1 (64-247)||(38716250-38716423)
chr1 (72-247)||(30289913-30290078)
chr1 (120-247)||(4156438-4156573)
chr1 (70-244)||(34752320-34752484)
chr1 (70-247)||(5961270-5961437)
chr1 (70-247)||(4243493-4243660)
chr1 (70-247)||(4953053-4953220)
chr1 (70-247)||(10920201-10920368)
chr1 (71-247)||(41895167-41895333)
chr1 (70-165)||(13313249-13313346)
chr1 (70-176)||(27924722-27924828)
chr1 (71-161)||(32448650-32448740)
chr1 (70-224)||(13281588-13281732)
chr1 (81-247)||(48683333-48683489)
chr1 (70-247)||(39475786-39475952)
chr1 (70-177)||(33187341-33187448)
chr1 (70-161)||(44544125-44544216)
chr1 (158-247)||(13312534-13312624)
chr1 (70-160)||(24649802-24649892)
chr1 (70-168)||(39637901-39637996)
chr1 (70-233)||(51155606-51155759)
chr1 (119-247)||(47772175-47772304)
chr1 (70-161)||(46428332-46428423)
chr1 (70-247)||(52323939-52324107)
chr1 (70-176)||(52367884-52367990)
chr1 (68-247)||(7561531-7561714)
chr1 (70-128)||(4156188-4156246)
chr1 (71-161)||(35991678-35991768)
chr1 (80-161)||(44293534-44293615)
chr1 (132-247)||(31286507-31286612)
chr1 (196-247)||(33187450-33187502)
chr1 (161-228)||(9779915-9779982)
chr1 (70-121)||(10919313-10919364)
chr1 (71-110)||(12891401-12891440)
chr1 (70-157)||(15611671-15611758)
chr1 (173-232)||(29730728-29730787)
chr1 (70-100)||(23994849-23994879)
chr1 (115-161)||(24215809-24215855)
chr1 (213-247)||(31844818-31844852)
chr1 (176-247)||(38718170-38718242)
chr1 (209-247)||(52368013-52368051)
chr1 (195-247)||(32448754-32448807)
chr1 (70-98)||(47772306-47772334)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (70-247)||(32984080-32984258)
chr8 (70-247)||(24079904-24080082)
chr8 (70-247)||(43328708-43328886)
chr8 (70-246)||(31830959-31831136)
chr8 (70-247)||(10646124-10646302)
chr8 (70-247)||(37956422-37956600)
chr8 (70-247)||(40435156-40435334)
chr8 (70-247)||(41862221-41862399)
chr8 (70-247)||(9013685-9013862)
chr8 (70-247)||(9734256-9734432)
chr8 (68-247)||(17718725-17718905)
chr8 (70-247)||(5946048-5946226)
chr8 (70-247)||(6365987-6366165)
chr8 (70-247)||(9303577-9303755)
chr8 (70-247)||(33730644-33730822)
chr8 (70-247)||(45236568-45236746)
chr8 (74-247)||(32114254-32114428)
chr8 (70-247)||(33981666-33981844)
chr8 (70-247)||(37301328-37301506)
chr8 (70-247)||(37419941-37420119)
chr8 (70-247)||(41653896-41654074)
chr8 (70-233)||(2714550-2714714)
chr8 (72-241)||(25185902-25186072)
chr8 (70-224)||(29048429-29048584)
chr8 (65-247)||(35628773-35628956)
chr8 (70-247)||(2275914-2276091)
chr8 (70-247)||(13356123-13356301)
chr8 (70-247)||(41231947-41232125)
chr8 (70-247)||(13760649-13760829)
chr8 (70-247)||(22878392-22878570)
chr8 (70-247)||(44088446-44088624)
chr8 (70-241)||(45066601-45066773)
chr8 (70-247)||(25248040-25248212)
chr8 (70-247)||(41639915-41640093)
chr8 (70-233)||(45258511-45258675)
chr8 (125-247)||(12032986-12033109)
chr8 (118-244)||(3904126-3904252)
chr8 (70-238)||(42701301-42701471)
chr8 (70-245)||(31940316-31940480)
chr8 (135-247)||(41981534-41981647)
chr8 (70-247)||(4447298-4447465)
chr8 (70-247)||(10378310-10378477)
chr8 (68-247)||(117332-117501)
chr8 (70-247)||(3211207-3211373)
chr8 (70-176)||(39915887-39915993)
chr8 (138-247)||(31336163-31336273)
chr8 (70-236)||(41843254-41843410)
chr8 (70-245)||(9713690-9713852)
chr8 (70-247)||(33896846-33897012)
chr8 (70-245)||(40458777-40458942)
chr8 (71-245)||(4975412-4975576)
chr8 (90-171)||(41981454-41981535)
chr8 (70-247)||(2379141-2379308)
chr8 (70-247)||(3490402-3490569)
chr8 (70-178)||(31148953-31149060)
chr8 (70-161)||(27243218-27243309)
chr8 (70-161)||(27254793-27254884)
chr8 (74-244)||(32373733-32373892)
chr8 (70-247)||(26196320-26196486)
chr8 (65-244)||(9509406-9509575)
chr8 (70-247)||(33622470-33622635)
chr8 (70-161)||(38631653-38631744)
chr8 (81-244)||(40649837-40649990)
chr8 (75-160)||(164728-164812)
chr8 (176-245)||(41425434-41425503)
chr8 (69-116)||(39901573-39901620)
chr8 (70-105)||(12032953-12032988)
chr8 (186-247)||(39901674-39901736)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (70-247)||(5882507-5882685)
chr6 (70-246)||(14891383-14891560)
chr6 (70-247)||(2892189-2892367)
chr6 (70-247)||(8615241-8615419)
chr6 (70-247)||(22551064-22551242)
chr6 (70-247)||(24168092-24168270)
chr6 (70-247)||(26377207-26377385)
chr6 (82-247)||(11988977-11989143)
chr6 (63-247)||(34527865-34528050)
chr6 (72-247)||(18101498-18101674)
chr6 (70-247)||(19415536-19415714)
chr6 (70-247)||(28947088-28947266)
chr6 (70-247)||(959907-960085)
chr6 (70-247)||(2593855-2594033)
chr6 (70-247)||(7345115-7345293)
chr6 (70-247)||(7393589-7393767)
chr6 (70-247)||(599893-600071)
chr6 (70-241)||(16703367-16703539)
chr6 (70-247)||(1970712-1970890)
chr6 (70-247)||(10507911-10508089)
chr6 (82-247)||(22341791-22341959)
chr6 (65-247)||(19281058-19281241)
chr6 (67-241)||(30743457-30743632)
chr6 (70-247)||(33452575-33452753)
chr6 (63-247)||(5294804-5294989)
chr6 (63-247)||(5299356-5299541)
chr6 (70-247)||(24224073-24224252)
chr6 (70-198)||(30467656-30467784)
chr6 (70-247)||(7167583-7167750)
chr6 (101-247)||(23261932-23262079)
chr6 (70-247)||(28948848-28949015)
chr6 (70-243)||(13329382-13329545)
chr6 (61-247)||(15965425-15965601)
chr6 (70-245)||(4487528-4487693)
chr6 (70-151)||(929660-929741)
chr6 (70-247)||(3291009-3291176)
chr6 (70-247)||(1398554-1398721)
chr6 (70-245)||(3786750-3786915)
chr6 (75-165)||(1939579-1939669)
chr6 (70-167)||(375797-375894)
chr6 (80-176)||(13844847-13844943)
chr6 (176-247)||(18661830-18661902)
chr6 (192-247)||(34262342-34262398)
chr6 (70-125)||(11743070-11743125)
chr6 (192-247)||(375730-375786)
chr6 (176-247)||(24913099-24913171)
[»] chr5 (72 HSPs)
chr5 (70-247)||(24253383-24253561)
chr5 (70-245)||(43326384-43326560)
chr5 (62-244)||(40886034-40886216)
chr5 (70-247)||(3466684-3466862)
chr5 (70-247)||(6901800-6901978)
chr5 (70-247)||(15398485-15398663)
chr5 (65-247)||(39932575-39932758)
chr5 (70-247)||(7722050-7722228)
chr5 (70-247)||(35626039-35626217)
chr5 (70-247)||(739707-739885)
chr5 (70-247)||(5184973-5185151)
chr5 (70-243)||(18479675-18479849)
chr5 (70-247)||(27938898-27939077)
chr5 (70-247)||(12648798-12648976)
chr5 (70-247)||(43262186-43262364)
chr5 (70-247)||(2484295-2484473)
chr5 (70-247)||(15683792-15683970)
chr5 (70-247)||(27501058-27501236)
chr5 (70-247)||(25831522-25831699)
chr5 (70-247)||(27278476-27278658)
chr5 (80-247)||(31938908-31939076)
chr5 (70-247)||(5137716-5137894)
chr5 (71-247)||(13504745-13504922)
chr5 (80-247)||(40278861-40279029)
chr5 (70-247)||(28424798-28424974)
chr5 (70-247)||(890907-891084)
chr5 (106-247)||(29789298-29789440)
chr5 (77-247)||(38756490-38756662)
chr5 (70-247)||(40110235-40110412)
chr5 (115-247)||(34451296-34451429)
chr5 (70-247)||(763724-763902)
chr5 (70-247)||(33617586-33617753)
chr5 (70-231)||(4149695-4149847)
chr5 (64-247)||(9424595-9424768)
chr5 (70-247)||(31293992-31294170)
chr5 (70-245)||(38015519-38015684)
chr5 (70-208)||(40632500-40632629)
chr5 (70-247)||(19295731-19295898)
chr5 (70-247)||(23195251-23195418)
chr5 (70-247)||(27503380-27503547)
chr5 (70-247)||(5497274-5497441)
chr5 (70-247)||(13957671-13957838)
chr5 (70-245)||(6973064-6973229)
chr5 (70-180)||(12558090-12558199)
chr5 (70-241)||(42658671-42658832)
chr5 (70-247)||(2585463-2585630)
chr5 (65-233)||(36365462-36365620)
chr5 (70-245)||(9374507-9374672)
chr5 (70-247)||(24167787-24167954)
chr5 (70-247)||(38637913-38638080)
chr5 (70-176)||(36472348-36472454)
chr5 (70-244)||(1402511-1402675)
chr5 (70-244)||(18327179-18327343)
chr5 (70-247)||(14971979-14972146)
chr5 (70-157)||(42247865-42247952)
chr5 (95-247)||(36948493-36948633)
chr5 (80-177)||(5120036-5120132)
chr5 (77-247)||(27390605-27390765)
chr5 (96-245)||(3656573-3656712)
chr5 (74-247)||(33623942-33624105)
chr5 (70-247)||(40686900-40687066)
chr5 (70-224)||(6206885-6207029)
chr5 (72-154)||(9171111-9171193)
chr5 (68-136)||(9527124-9527192)
chr5 (103-233)||(38492647-38492767)
chr5 (95-247)||(612760-612900)
chr5 (93-160)||(3940411-3940478)
chr5 (80-151)||(15300962-15301033)
chr5 (73-129)||(28756082-28756138)
chr5 (177-216)||(9171069-9171108)
chr5 (102-168)||(20207088-20207154)
chr5 (70-129)||(27584386-27584447)
[»] chr4 (128 HSPs)
chr4 (62-247)||(9798458-9798644)
chr4 (70-247)||(34276548-34276726)
chr4 (71-247)||(21366612-21366789)
chr4 (66-247)||(22618517-22618697)
chr4 (64-247)||(53854433-53854616)
chr4 (70-247)||(6019929-6020107)
chr4 (70-247)||(23437593-23437771)
chr4 (70-247)||(32366663-32366841)
chr4 (71-247)||(44984763-44984940)
chr4 (70-244)||(237478-237653)
chr4 (70-247)||(397403-397581)
chr4 (70-247)||(18462016-18462194)
chr4 (70-247)||(29478361-29478539)
chr4 (70-247)||(31532138-31532316)
chr4 (70-247)||(42085208-42085386)
chr4 (70-247)||(51363008-51363185)
chr4 (70-247)||(146432-146610)
chr4 (70-247)||(2826685-2826862)
chr4 (70-247)||(26091261-26091439)
chr4 (70-247)||(39077546-39077724)
chr4 (70-247)||(41702462-41702640)
chr4 (70-247)||(53461819-53461997)
chr4 (70-247)||(54574943-54575121)
chr4 (65-247)||(42765845-42766027)
chr4 (70-247)||(6285308-6285486)
chr4 (70-247)||(43471698-43471876)
chr4 (70-247)||(47344657-47344835)
chr4 (70-247)||(49881062-49881244)
chr4 (70-247)||(55056262-55056440)
chr4 (70-247)||(407755-407931)
chr4 (70-247)||(41949383-41949563)
chr4 (70-233)||(27373077-27373241)
chr4 (69-247)||(42222291-42222470)
chr4 (65-247)||(50457813-50457996)
chr4 (70-247)||(19387691-19387869)
chr4 (70-247)||(45797480-45797658)
chr4 (70-247)||(56023001-56023179)
chr4 (63-247)||(23609081-23609266)
chr4 (72-247)||(31972339-31972515)
chr4 (70-247)||(14017379-14017555)
chr4 (68-246)||(50534630-50534809)
chr4 (65-243)||(54607958-54608137)
chr4 (70-247)||(2243459-2243637)
chr4 (70-247)||(3170627-3170805)
chr4 (70-247)||(3692213-3692391)
chr4 (70-247)||(29777260-29777438)
chr4 (70-247)||(31070077-31070254)
chr4 (70-247)||(31914199-31914376)
chr4 (70-247)||(41560329-41560507)
chr4 (70-247)||(48313558-48313734)
chr4 (70-247)||(55519828-55520006)
chr4 (70-247)||(55776046-55776223)
chr4 (70-247)||(55840224-55840401)
chr4 (70-247)||(38591669-38591843)
chr4 (70-232)||(22468788-22468951)
chr4 (70-247)||(42033176-42033354)
chr4 (70-247)||(50234001-50234179)
chr4 (70-246)||(35446507-35446683)
chr4 (68-247)||(53834057-53834237)
chr4 (70-244)||(1932764-1932939)
chr4 (70-247)||(47662105-47662283)
chr4 (70-247)||(54086411-54086587)
chr4 (71-247)||(48657826-48657997)
chr4 (70-246)||(50536628-50536805)
chr4 (70-233)||(39587796-39587960)
chr4 (71-241)||(33897504-33897675)
chr4 (70-247)||(41632010-41632187)
chr4 (70-247)||(54424983-54425160)
chr4 (70-247)||(54805617-54805799)
chr4 (70-233)||(48259528-48259691)
chr4 (68-247)||(51951681-51951860)
chr4 (70-247)||(36532833-36533001)
chr4 (70-247)||(48654815-48654999)
chr4 (109-247)||(52728310-52728448)
chr4 (70-247)||(9997934-9998101)
chr4 (70-244)||(54715036-54715200)
chr4 (70-247)||(45633782-45633949)
chr4 (63-247)||(15060292-15060466)
chr4 (70-247)||(34835178-34835345)
chr4 (70-247)||(38547604-38547771)
chr4 (70-247)||(43890929-43891096)
chr4 (70-246)||(46720026-46720195)
chr4 (70-245)||(37239095-37239260)
chr4 (70-224)||(5117464-5117608)
chr4 (70-247)||(20351845-20352012)
chr4 (70-247)||(34552320-34552487)
chr4 (70-246)||(27398607-27398773)
chr4 (65-245)||(31881319-31881489)
chr4 (70-244)||(54216742-54216906)
chr4 (70-176)||(14335165-14335271)
chr4 (70-245)||(22620594-22620759)
chr4 (70-176)||(27580120-27580226)
chr4 (154-247)||(35595772-35595866)
chr4 (124-244)||(42509351-42509472)
chr4 (70-247)||(47811907-47812074)
chr4 (70-247)||(54216314-54216481)
chr4 (117-207)||(52396774-52396865)
chr4 (70-176)||(1662323-1662429)
chr4 (149-247)||(35344868-35344966)
chr4 (70-245)||(52688350-52688515)
chr4 (70-224)||(4486607-4486751)
chr4 (73-247)||(46708744-46708908)
chr4 (61-247)||(49014090-49014266)
chr4 (70-247)||(6371252-6371419)
chr4 (70-153)||(42557583-42557666)
chr4 (70-241)||(33289704-33289865)
chr4 (73-247)||(573807-573971)
chr4 (70-224)||(27873574-27873718)
chr4 (70-245)||(52461367-52461529)
chr4 (70-161)||(3293102-3293193)
chr4 (70-161)||(11972208-11972299)
chr4 (70-168)||(43231504-43231601)
chr4 (178-247)||(33048990-33049060)
chr4 (97-247)||(27872607-27872747)
chr4 (68-161)||(33558021-33558114)
chr4 (70-175)||(49057933-49058038)
chr4 (70-120)||(17555617-17555667)
chr4 (174-247)||(48259707-48259780)
chr4 (80-175)||(18206583-18206682)
chr4 (146-247)||(42558270-42558364)
chr4 (167-236)||(49304602-49304671)
chr4 (106-216)||(51981513-51981613)
chr4 (80-227)||(16738569-16738715)
chr4 (209-247)||(18206515-18206553)
chr4 (183-247)||(3291808-3291873)
chr4 (183-228)||(29066865-29066910)
chr4 (207-247)||(14335104-14335144)
chr4 (119-159)||(47105108-47105148)
[»] chr2 (81 HSPs)
chr2 (70-247)||(6594461-6594639)
chr2 (70-247)||(746466-746644)
chr2 (71-247)||(23901780-23901957)
chr2 (64-247)||(4034586-4034770)
chr2 (70-247)||(2324892-2325070)
chr2 (70-247)||(10424595-10424773)
chr2 (70-247)||(14660446-14660624)
chr2 (70-247)||(17600836-17601014)
chr2 (70-247)||(27651037-27651215)
chr2 (70-247)||(38997101-38997279)
chr2 (70-247)||(45370990-45371168)
chr2 (70-244)||(6430473-6430648)
chr2 (61-247)||(34518359-34518545)
chr2 (70-247)||(11184972-11185150)
chr2 (70-247)||(13815221-13815399)
chr2 (70-247)||(26710345-26710523)
chr2 (70-247)||(40635218-40635396)
chr2 (65-247)||(10244585-10244768)
chr2 (70-247)||(1091954-1092132)
chr2 (70-247)||(27400403-27400581)
chr2 (70-247)||(5726129-5726307)
chr2 (70-247)||(32327361-32327539)
chr2 (65-247)||(2914141-2914324)
chr2 (70-247)||(7892691-7892869)
chr2 (70-247)||(27024415-27024593)
chr2 (70-247)||(40037143-40037320)
chr2 (70-244)||(33427653-33427828)
chr2 (70-247)||(4609626-4609804)
chr2 (70-247)||(32948446-32948623)
chr2 (70-247)||(37620870-37621051)
chr2 (70-247)||(14697540-14697718)
chr2 (70-247)||(40735464-40735642)
chr2 (70-224)||(32608380-32608535)
chr2 (70-247)||(37255340-37255513)
chr2 (84-247)||(32856439-32856603)
chr2 (70-247)||(9444683-9444871)
chr2 (73-247)||(11159625-11159799)
chr2 (70-244)||(15925080-15925255)
chr2 (70-225)||(8432941-8433097)
chr2 (68-223)||(12842101-12842257)
chr2 (59-194)||(42899904-42900039)
chr2 (121-247)||(25294886-25295013)
chr2 (70-247)||(39103047-39103214)
chr2 (68-247)||(35158053-35158222)
chr2 (71-216)||(41172459-41172605)
chr2 (70-247)||(145282-145449)
chr2 (70-247)||(21734903-21735070)
chr2 (70-247)||(12333500-12333665)
chr2 (70-247)||(1229635-1229806)
chr2 (65-245)||(43898976-43899145)
chr2 (65-247)||(29687036-29687208)
chr2 (70-247)||(44481828-44481995)
chr2 (64-247)||(28641295-28641468)
chr2 (144-247)||(447636-447740)
chr2 (70-245)||(35126780-35126945)
chr2 (70-247)||(4258490-4258656)
chr2 (66-247)||(27331294-27331469)
chr2 (70-247)||(39301200-39301367)
chr2 (70-245)||(19428431-19428597)
chr2 (80-247)||(13543627-13543784)
chr2 (70-245)||(27764868-27765032)
chr2 (70-149)||(12814614-12814693)
chr2 (70-245)||(12730061-12730226)
chr2 (70-245)||(28566703-28566868)
chr2 (68-161)||(3266294-3266387)
chr2 (144-247)||(12827137-12827240)
chr2 (70-247)||(34249265-34249432)
chr2 (141-208)||(28014861-28014928)
chr2 (70-161)||(40544155-40544246)
chr2 (70-247)||(43356099-43356263)
chr2 (70-247)||(2688732-2688899)
chr2 (70-160)||(2000417-2000507)
chr2 (101-245)||(3711664-3711798)
chr2 (70-161)||(8056626-8056717)
chr2 (70-166)||(30545821-30545917)
chr2 (70-113)||(28019959-28020002)
chr2 (77-176)||(38985342-38985439)
chr2 (70-136)||(10176559-10176625)
chr2 (193-247)||(3266399-3266454)
chr2 (70-108)||(1897130-1897168)
chr2 (152-201)||(17799296-17799345)
[»] chr3 (114 HSPs)
chr3 (63-247)||(47257787-47257972)
chr3 (68-247)||(38416727-38416907)
chr3 (70-247)||(47809599-47809778)
chr3 (70-247)||(7855117-7855295)
chr3 (70-247)||(24100284-24100461)
chr3 (70-247)||(28048395-28048573)
chr3 (70-247)||(40130962-40131140)
chr3 (70-247)||(41464353-41464531)
chr3 (70-247)||(49330038-49330216)
chr3 (70-247)||(51170036-51170214)
chr3 (68-247)||(40804513-40804693)
chr3 (70-247)||(22399098-22399275)
chr3 (70-247)||(32234401-32234578)
chr3 (70-241)||(29625836-29626008)
chr3 (70-247)||(2666001-2666179)
chr3 (70-247)||(27066981-27067159)
chr3 (70-247)||(40419836-40420014)
chr3 (70-247)||(42291843-42292021)
chr3 (70-247)||(43612050-43612228)
chr3 (70-247)||(55453247-55453425)
chr3 (62-247)||(39053387-39053573)
chr3 (70-247)||(39634575-39634752)
chr3 (70-247)||(40643801-40643979)
chr3 (78-247)||(48609732-48609902)
chr3 (70-247)||(48739236-48739414)
chr3 (74-247)||(52628959-52629132)
chr3 (65-247)||(20754396-20754579)
chr3 (70-224)||(43125832-43125987)
chr3 (65-247)||(44806680-44806863)
chr3 (70-247)||(35748314-35748492)
chr3 (70-247)||(37313400-37313578)
chr3 (70-247)||(37324542-37324720)
chr3 (70-247)||(46134357-46134535)
chr3 (70-247)||(51102381-51102559)
chr3 (70-247)||(51452754-51452931)
chr3 (70-247)||(52638843-52639021)
chr3 (59-247)||(53943591-53943779)
chr3 (70-247)||(7755310-7755487)
chr3 (74-247)||(43183917-43184091)
chr3 (70-247)||(44222830-44223008)
chr3 (59-247)||(18946893-18947082)
chr3 (70-246)||(35594122-35594299)
chr3 (71-247)||(41293322-41293498)
chr3 (70-247)||(43021715-43021894)
chr3 (70-235)||(52215077-52215243)
chr3 (65-244)||(36368935-36369114)
chr3 (70-224)||(24376574-24376729)
chr3 (63-245)||(51146220-51146403)
chr3 (70-247)||(41732529-41732707)
chr3 (70-247)||(53832487-53832665)
chr3 (92-247)||(46126010-46126165)
chr3 (70-247)||(47894823-47895001)
chr3 (70-217)||(53637842-53637990)
chr3 (70-247)||(5560028-5560213)
chr3 (70-247)||(41216456-41216634)
chr3 (73-233)||(46949379-46949538)
chr3 (70-247)||(54159001-54159169)
chr3 (70-247)||(55379986-55380153)
chr3 (70-245)||(25641647-25641812)
chr3 (70-245)||(42589831-42589996)
chr3 (70-247)||(48546843-48547010)
chr3 (129-247)||(52864550-52864668)
chr3 (70-248)||(49130579-49130747)
chr3 (70-247)||(53115448-53115615)
chr3 (70-247)||(55000181-55000348)
chr3 (70-245)||(34279726-34279891)
chr3 (70-208)||(37758930-37759068)
chr3 (70-245)||(54707225-54707390)
chr3 (66-247)||(31286796-31286967)
chr3 (70-247)||(38156635-38156802)
chr3 (70-247)||(51415970-51416137)
chr3 (68-247)||(51143816-51143985)
chr3 (70-241)||(54401188-54401349)
chr3 (70-247)||(25353555-25353722)
chr3 (136-247)||(33550470-33550582)
chr3 (70-247)||(41635803-41635970)
chr3 (70-247)||(47510943-47511110)
chr3 (70-233)||(39141141-39141296)
chr3 (65-245)||(40022070-40022240)
chr3 (70-247)||(30251504-30251671)
chr3 (70-247)||(42998792-42998958)
chr3 (62-247)||(45058876-45059051)
chr3 (70-245)||(37028724-37028889)
chr3 (70-168)||(41882063-41882161)
chr3 (118-200)||(47182049-47182131)
chr3 (70-224)||(17665550-17665694)
chr3 (70-247)||(21597151-21597318)
chr3 (70-247)||(24688115-24688282)
chr3 (70-247)||(43176741-43176908)
chr3 (70-180)||(2227995-2228105)
chr3 (70-168)||(28576184-28576282)
chr3 (70-245)||(51224043-51224207)
chr3 (71-168)||(50731986-50732083)
chr3 (71-168)||(50780773-50780870)
chr3 (70-168)||(48726070-48726168)
chr3 (78-180)||(47402810-47402911)
chr3 (70-155)||(44946014-44946099)
chr3 (97-247)||(52756070-52756214)
chr3 (70-247)||(40165653-40165819)
chr3 (64-145)||(52434134-52434216)
chr3 (69-247)||(177161-177329)
chr3 (70-145)||(48752086-48752161)
chr3 (71-180)||(8847718-8847827)
chr3 (125-245)||(48534012-48534122)
chr3 (164-247)||(30429230-30429314)
chr3 (100-180)||(41609098-41609178)
chr3 (70-121)||(37741436-37741487)
chr3 (70-113)||(51942543-51942586)
chr3 (176-247)||(44945938-44946010)
chr3 (141-244)||(52434251-52434344)
chr3 (207-247)||(43260842-43260882)
chr3 (200-247)||(50731917-50731965)
chr3 (200-247)||(50780891-50780939)
chr3 (192-247)||(48752226-48752282)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (70-247)||(13765-13943)
[»] chr7 (94 HSPs)
chr7 (70-247)||(25893920-25894098)
chr7 (70-247)||(33423278-33423456)
chr7 (70-247)||(33839718-33839896)
chr7 (70-247)||(49171365-49171543)
chr7 (66-241)||(15877548-15877724)
chr7 (64-247)||(20165817-20166001)
chr7 (68-247)||(23393054-23393234)
chr7 (70-247)||(17855430-17855608)
chr7 (70-247)||(22979650-22979828)
chr7 (70-247)||(27018118-27018296)
chr7 (70-247)||(33695824-33696002)
chr7 (70-247)||(35355890-35356068)
chr7 (70-247)||(47066980-47067158)
chr7 (71-247)||(45690100-45690277)
chr7 (70-247)||(46913111-46913291)
chr7 (70-244)||(31586850-31587025)
chr7 (70-247)||(33411262-33411440)
chr7 (70-247)||(35328072-35328250)
chr7 (62-247)||(37846019-37846205)
chr7 (70-247)||(47740334-47740512)
chr7 (70-247)||(2341664-2341843)
chr7 (70-247)||(40670565-40670743)
chr7 (70-247)||(45482660-45482838)
chr7 (70-247)||(10028490-10028670)
chr7 (89-247)||(36389377-36389536)
chr7 (70-247)||(33332791-33332968)
chr7 (70-247)||(48609680-48609858)
chr7 (70-247)||(5712170-5712348)
chr7 (70-247)||(26579720-26579898)
chr7 (66-247)||(31625702-31625883)
chr7 (85-244)||(5183831-5183991)
chr7 (70-247)||(35757023-35757201)
chr7 (68-238)||(41990870-41991041)
chr7 (70-247)||(19563449-19563627)
chr7 (70-247)||(45063360-45063536)
chr7 (70-244)||(43499487-43499662)
chr7 (93-247)||(29446863-29447017)
chr7 (70-247)||(33870247-33870422)
chr7 (65-247)||(31429478-31429661)
chr7 (70-247)||(35767483-35767654)
chr7 (70-216)||(33720070-33720217)
chr7 (65-244)||(10618295-10618468)
chr7 (120-247)||(30076530-30076658)
chr7 (119-247)||(28233939-28234068)
chr7 (70-247)||(35752037-35752204)
chr7 (70-245)||(46817426-46817591)
chr7 (70-247)||(24923027-24923194)
chr7 (70-247)||(43489220-43489387)
chr7 (70-245)||(36816850-36817015)
chr7 (70-247)||(37127939-37128106)
chr7 (70-247)||(44003373-44003540)
chr7 (70-247)||(46898019-46898186)
chr7 (86-224)||(44564356-44564495)
chr7 (70-241)||(26941541-26941702)
chr7 (70-241)||(48085860-48086021)
chr7 (70-247)||(2332021-2332188)
chr7 (70-247)||(21718119-21718285)
chr7 (70-247)||(24228543-24228710)
chr7 (70-247)||(33393330-33393497)
chr7 (132-247)||(44405412-44405528)
chr7 (73-247)||(7876331-7876495)
chr7 (135-247)||(41904272-41904385)
chr7 (70-247)||(7257383-7257550)
chr7 (64-245)||(29610631-29610802)
chr7 (65-245)||(47906763-47906934)
chr7 (70-246)||(29098753-29098915)
chr7 (70-176)||(16482847-16482953)
chr7 (68-247)||(47460775-47460944)
chr7 (63-245)||(498193-498365)
chr7 (70-247)||(15643949-15644116)
chr7 (70-247)||(45502819-45502986)
chr7 (70-216)||(32556640-32556776)
chr7 (64-157)||(39453558-39453651)
chr7 (68-161)||(39866665-39866758)
chr7 (68-245)||(26371049-26371216)
chr7 (70-242)||(25037516-25037678)
chr7 (70-247)||(39323618-39323776)
chr7 (70-246)||(41855061-41855228)
chr7 (70-169)||(29863017-29863116)
chr7 (70-245)||(44659846-44660010)
chr7 (70-247)||(45237536-45237703)
chr7 (74-247)||(46103127-46103289)
chr7 (70-169)||(7720574-7720673)
chr7 (70-161)||(33455098-33455189)
chr7 (70-247)||(35484638-35484806)
chr7 (80-180)||(38448508-38448608)
chr7 (70-133)||(30077043-30077106)
chr7 (70-136)||(35557732-35557798)
chr7 (108-247)||(37443605-37443734)
chr7 (70-131)||(35823292-35823353)
chr7 (70-176)||(21649442-21649549)
chr7 (116-177)||(26456157-26456218)
chr7 (176-247)||(39453485-39453557)
chr7 (70-105)||(42272153-42272188)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (70-247)||(39559-39737)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (71-247)||(1871-2048)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (71-247)||(11136-11312)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (65-244)||(2438-2618)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (70-247)||(75247-75425)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (70-247)||(278007-278187)
scaffold0007 (81-247)||(176666-176833)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (70-247)||(18857-19035)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (70-222)||(32562-32715)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (68-247)||(4599-4773)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (70-247)||(3089-3258)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (70-247)||(20480-20647)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (63-247)||(7084-7259)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (70-247)||(14745-14912)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (70-247)||(103-269)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (70-176)||(4618-4725)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (70-176)||(3393-3500)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (70-216)||(17907-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (80-175)||(19228-19327)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 115)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 247
Target Start/End: Original strand, 31040704 - 31040888
Alignment:
Q  64 ttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31040704 ttatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 31040803  T
Q  164 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31040804 taccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtc 31040888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 31308002 - 31308180
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308002 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31308101  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31308102 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 31308180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 45538154 - 45538332
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538154 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 45538253  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45538254 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 45538332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 63 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17995139 - 17994956
Alignment:
Q  63 tttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 162  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17995139 tttatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatgg 17995040  T
Q  163 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17995039 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttg 17994956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 3611137 - 3611315
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3611137 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 3611236  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3611237 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 3611315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 44661971 - 44662149
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44661971 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 44662070  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44662071 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 44662149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 71 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4068863 - 4068689
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4068863 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 4068764  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4068763 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 4068689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 5981171 - 5981349
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981171 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 5981270  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5981271 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 5981349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21139593 - 21139415
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139593 ttttttctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 21139494  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21139493 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtc 21139415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Original strand, 43251713 - 43251890
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43251713 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccact 43251812  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43251813 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 43251890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25678446 - 25678262
Alignment:
Q  64 ttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 163  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25678446 ttatggttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 25678347  T
Q  164 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25678346 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtc 25678262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 25058689 - 25058867
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25058689 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccac 25058788  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25058789 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 25058867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 26277178 - 26277356
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26277178 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26277277  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26277278 ttaaaaatttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 26277356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38790378 - 38790200
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38790378 ttttttctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 38790279  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38790278 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 38790200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24245206 - 24245031
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245206 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24245107  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24245106 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagtt 24245031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6327728 - 6327551
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327728 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 6327629  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6327628 ttaaaaatgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtc 6327551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23932690 - 23932512
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23932690 ttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccac 23932591  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggt-tgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23932590 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 23932512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 23984756 - 23984934
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23984756 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23984855  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23984856 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 23984934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26085578 - 26085401
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26085578 tttttactagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 26085480  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26085479 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 26085401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 33884089 - 33884267
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  33884089 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccat 33884188  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33884189 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtc 33884267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33960163 - 33959985
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  33960163 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccat 33960064  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33960063 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtc 33959985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23221110 - 23220939
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221110 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23221011  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23221010 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-----tatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 23220939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37620378 - 37620195
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37620378 tatggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 37620279  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37620278 accacttaaaaatgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtc 37620195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 5980069 - 5980247
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5980069 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccac 5980168  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5980169 ttaaaaattagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctagctgtc 5980247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33112998 - 33112821
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33112998 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33112899  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  33112898 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat-ggtaccctagttgtc 33112821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 36566331 - 36566509
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566331 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 36566430  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36566431 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 36566509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 39646569 - 39646747
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39646569 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccac 39646668  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39646669 ttaaaaatgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 39646747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 62 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 46967230 - 46967044
Alignment:
Q  62 ttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46967230 ttttatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 46967131  T
Q  162 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  46967130 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtc 46967044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 47671587 - 47671765
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47671587 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccac 47671686  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  47671687 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 47671765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38332053 - 38331862
Alignment:
Q  57 acttcttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagt 156  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38332053 acttgttttaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagt 38331954  T
Q  157 tcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  38331953 tcatgaatatcacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtc 38331862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Original strand, 41999816 - 41999991
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41999816 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccac 41999915  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41999916 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 41999991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 24885502 - 24885680
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24885502 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24885601  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  24885602 ttaaaaatatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtc 24885680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 251
Target Start/End: Original strand, 26794305 - 26794487
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26794305 ttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 26794404  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcttta 251  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26794405 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgttttta 26794487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 62 - 247
Target Start/End: Original strand, 35273589 - 35273775
Alignment:
Q  62 ttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273589 ttttatggttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 35273688  T
Q  162 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35273689 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtc 35273775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47383913 - 47383735
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47383913 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47383814  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  47383813 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtc 47383735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 64 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49254162 - 49253984
Alignment:
Q  64 ttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49254162 ttatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatgga 49254063  T
Q  164 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtacccta 241  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  49254062 taccacttaaaaatgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatacccta 49253984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 50774218 - 50774396
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50774218 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 50774317  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  50774318 ttaaaaatatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtc 50774396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35692845 - 35692666
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattta-cccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35692845 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccg 35692746  T
Q  169 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  35692745 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtc 35692666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 3285403 - 3285580
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285403 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 3285502  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3285503 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 3285580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26525070 - 26524892
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26525070 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccac 26524971  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  26524970 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtc 26524892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 51057072 - 51057250
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  51057072 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccac 51057171  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51057172 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 51057250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 28888582 - 28888760
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28888582 ttttttctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 28888681  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28888682 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 46616550 - 46616728
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  46616550 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 46616649  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  46616650 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtactctaggtgtc 46616728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 46784424 - 46784602
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  46784424 ttttttctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccac 46784523  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  46784524 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtc 46784602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 47317316 - 47317494
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47317316 ttttttttatattacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 47317415  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47317416 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtc 47317494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 222
Target Start/End: Original strand, 31844377 - 31844530
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31844377 ttttttctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccac 31844476  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccacca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31844477 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 31844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 71 - 237
Target Start/End: Original strand, 42863867 - 42864034
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42863867 tttttctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactact 42863966  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtac 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  42863967 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtac 42864034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 47187106 - 47187284
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47187106 ttttttctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 47187205  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  47187206 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtc 47187284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 207
Target Start/End: Original strand, 25518815 - 25518952
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518815 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25518914  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518915 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 36003131 - 36003312
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36003131 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccac 36003230  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttc---catgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||    
T  36003231 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtc 36003312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 49399169 - 49398991
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  49399169 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccac 49399070  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  49399069 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtc 49398991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 48373505 - 48373674
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48373505 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 48373604  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  48373605 ttaaaaatgtgctt---------atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtc 48373674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42313546 - 42313364
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgg----gtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||    
T  42313546 ttttttctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaata 42313447  T
Q  166 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42313446 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 42313364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27983768 - 27983606
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||     
T  27983768 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg----------------ggataccat 27983685  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27983684 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 27983606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 71 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45476014 - 45475869
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45476014 tttttctagattacctttgaagaatggt--------tacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccact 45475923  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatt 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45475922 tacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatt 45475869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 51403188 - 51403074
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51403188 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 51403089  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttat 185  Q
    || |||||||||||||    
T  51403088 tt-aaaatgtgcttat 51403074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31980115 - 31979998
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31980115 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccact 31980016  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtg 188  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  31980015 taaaaatgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450673
Alignment:
Q  104 atttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  204 tt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtc 2450673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 33073212 - 33073379
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||            
T  33073212 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-------- 33073303  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33073304 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 33073379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41467802 - 41467635
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  41467802 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 41467711  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  41467710 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 41467635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2557027 - 2556909
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2557027 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 2556928  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtg 188  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  2556927 ttaaaaatgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045599
Alignment:
Q  110 ccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-ggg 208  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattaggg 51045638  T
Q  209 taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||    
T  51045637 taaattacccaccattcttctacgggtatcctagttgtc 51045599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 2657304 - 2657471
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  2657304 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 2657395  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  2657396 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 2657471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 10928068 - 10928235
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  10928068 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-------- 10928159  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  10928160 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtc 10928235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 26685857 - 26686024
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26685857 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccac 26685956  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26685957 ctaaaaaagtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 26686024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 42234841 - 42235007
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  42234841 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 42234932  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  42234933 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 42235007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 29770671 - 29770836
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  29770671 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 29770762  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  29770763 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagcctagttg 29770836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 247
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808824
Alignment:
Q  123 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccacc 221  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  222 atttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtc 4808824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 2954856 - 2955023
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2954856 ttttttctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccac 2954955  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||| |||           | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2954956 ttaaaaaggtg-----------attgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 2955023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6626194 - 6626027
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  6626194 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 6626103  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  6626102 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 6626027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26472349 - 26472185
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  26472349 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 26472258  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
       || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||    
T  26472257 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagtt 26472185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 247
Target Start/End: Original strand, 1388476 - 1388641
Alignment:
Q  72 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 171  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1388476 ttttctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacct 1388575  T
Q  172 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||| |||           ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1388576 aaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 1388641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38716423 - 38716250
Alignment:
Q  64 ttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 163  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  38716423 ttatggttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatgga 38716324  T
Q  164 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||| |||||| |||           ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38716323 taccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccttgttgtc 38716250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30290078 - 30289913
Alignment:
Q  72 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 171  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||              
T  30290078 ttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatg---------- 30289989  T
Q  172 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  30289988 -aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtc 30289913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 247
Target Start/End: Original strand, 4156438 - 4156573
Alignment:
Q  120 atgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-------tagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaa 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4156438 atgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 4156537  T
Q  212 attacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4156538 attacccatcatttttccatgggtactctagttgtc 4156573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34752484 - 34752320
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||            
T  34752484 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatg-------- 34752393  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||    
T  34752392 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagtt 34752320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5961437 - 5961270
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5961437 ttttttctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 5961338  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5961337 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtc 5961270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4243660 - 4243493
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||            
T  4243660 ttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-------- 4243569  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg-ttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| || ||||||||  |||||||||    
T  4243568 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtc 4243493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 4953053 - 4953220
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  4953053 ttttctctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 4953144  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| || |||| |||||    
T  4953145 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtc 4953220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 10920201 - 10920368
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10920201 ttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 10920300  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10920301 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtc 10920368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41895333 - 41895167
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||             
T  41895333 tttttctaaattacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatg--------- 41895243  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  41895242 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 41895167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13313346 - 13313249
Alignment:
Q  70 ttttttctagatta--cctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 165  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13313346 ttttttctagattatacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27924828 - 27924722
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27924828 ttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 27924729  T
Q  170 ttaaaaa 176  Q
     ||||||    
T  27924728 ctaaaaa 27924722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 161
Target Start/End: Original strand, 32448650 - 32448740
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  32448650 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13281732 - 13281588
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||            
T  13281732 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-------- 13281641  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatt 224  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  13281640 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcatt 13281588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48683489 - 48683333
Alignment:
Q  81 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 180  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||    
T  48683489 ttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg 48683390  T
Q  181 cttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
               ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48683389 -----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 48683333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39475952 - 39475786
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39475952 ttttttctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggt-gggtcaagatagtttatggataccac 39475854  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     ||||||||||           || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39475853 ctaaaaatgtg-----------aacgtttattggttgggataaataacccatcattttttcatgggtaccctagttgtc 39475786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 177
Target Start/End: Original strand, 33187341 - 33187448
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  33187341 ttttttctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccac 33187440  T
Q  170 ttaaaaat 177  Q
    ||||||||    
T  33187441 ttaaaaat 33187448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44544216 - 44544125
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44544216 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312534
Alignment:
Q  158 catggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 13312534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24649892 - 24649802
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24649892 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Original strand, 39637901 - 39637996
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttc-atggatacca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39637901 ttttttctagattacctatgaagaatggtgggtaatttaccc----accaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacca 39637996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 51155759 - 51155606
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||            
T  51155759 ttttttctaaattacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg-------- 51155668  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgg 233  Q
       || ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51155667 ---aatatgtgtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 51155606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772175
Alignment:
Q  119 aatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacc 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  218 caccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  47772204 caccattcttccatgggtaccttaattgtc 47772175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 46428423 - 46428332
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  46428423 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 52323939 - 52324107
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  52323939 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaataccac 52324038  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           |||||  |||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  52324039 ctaaaaaggtg----------aaatgttcattgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtc 52324107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Original strand, 52367884 - 52367990
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  52367884 ttttttctggattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccac 52367983  T
Q  170 ttaaaaa 176  Q
     ||||||    
T  52367984 ctaaaaa 52367990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7561714 - 7561531
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa-gatagttcatggatac 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |    | ||  |||     
T  7561714 gattttttctaaattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatag 7561615  T
Q  167 cacttaaaaatgtgctta--tgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
      | | || |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  7561614 ttcatgaatatgtgcttacgtggggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtc 7561531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4156246 - 4156188
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4156246 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 35991768 - 35991678
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  35991768 tttttttaaattacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 35991678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44293615 - 44293534
Alignment:
Q  80 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44293615 attacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44293534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31286612 - 31286507
Alignment:
Q  132 aatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttcca 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  31286612 aatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttcta 31286524  T
Q  231 tgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||    
T  31286523 tgggtaccctagttgtc 31286507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 247
Target Start/End: Original strand, 33187450 - 33187502
Alignment:
Q  196 tgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33187450 tgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 33187502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9779982 - 9779915
Alignment:
Q  161 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttc 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9779982 ggataccacttaaaaatgtgtttacgtggctaatatatatttgttgggttaattagccaccatttttc 9779915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 10919364 - 10919313
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaat 121  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10919364 ttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 110
Target Start/End: Original strand, 12891401 - 12891440
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacc 110  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12891401 tttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacc 12891440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 157
Target Start/End: Original strand, 15611671 - 15611758
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 157  Q
    ||||| ||| |||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||| || |||||||||||||    
T  15611671 tttttactaaattatctttaaagaacggtggataacttacctactaaccaataaaaataaacaatttattgatgaggtcaagatagtt 15611758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29730787 - 29730728
Alignment:
Q  173 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatg 232  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  29730787 aaaatgtacttacgtggctaatgtttattgggtggataaattacctaccgtttttccatg 29730728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 100
Target Start/End: Original strand, 23994849 - 23994879
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23994849 ttttttctagattacctttgaagaatggtgg 23994879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 161
Target Start/End: Original strand, 24215809 - 24215855
Alignment:
Q  115 aaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  24215809 aaccaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatg 24215855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 247
Target Start/End: Original strand, 31844818 - 31844852
Alignment:
Q  213 ttacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31844818 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 31844852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38718242 - 38718170
Alignment:
Q  176 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg--gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||||    
T  38718242 atgtgcttatgtggctaatgtatatcggttgggagtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtc 38718170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 52368013 - 52368051
Alignment:
Q  209 taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52368013 taaattacccatcatttttccataggtaccctagttgtc 52368051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Original strand, 32448754 - 32448807
Alignment:
Q  195 gtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  32448754 gtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 32448807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 47772334 - 47772306
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47772334 ttttttctagattacctttgaagaatggt 47772306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32984258 - 32984080
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984258 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 32984159  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32984158 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 32984080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24080082 - 24079904
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24080082 ttttttgtagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24079983  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24079982 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 24079904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 43328708 - 43328886
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328708 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43328807  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43328808 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 43328886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31831136 - 31830959
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31831136 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31831037  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattg-gttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31831036 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 10646124 - 10646302
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646124 ttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10646223  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10646224 ttaaaaatgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10646302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 37956422 - 37956600
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37956422 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 37956521  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  37956522 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtc 37956600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40435334 - 40435156
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40435334 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccac 40435235  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40435234 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 40435156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 41862221 - 41862399
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41862221 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 41862320  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  41862321 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtc 41862399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 9013685 - 9013862
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9013685 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 9013784  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9013785 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 9013862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 9734256 - 9734432
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9734256 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cac 9734354  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9734355 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 9734432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17718905 - 17718725
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17718905 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggatacc 17718806  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17718805 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtc 17718725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 5946048 - 5946226
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5946048 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 5946147  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  5946148 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtc 5946226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 6365987 - 6366165
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6365987 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccac 6366086  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  6366087 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtc 6366165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9303755 - 9303577
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303755 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 9303656  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggt-tgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9303655 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 9303577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33730822 - 33730644
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33730822 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33730723  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33730722 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 33730644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45236746 - 45236568
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45236746 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 45236647  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  45236646 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtc 45236568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 74 - 247
Target Start/End: Original strand, 32114254 - 32114428
Alignment:
Q  74 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32114254 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaa 32114353  T
Q  174 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32114354 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 32114428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33981844 - 33981666
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33981844 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33981745  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  33981744 ttaaaaatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtc 33981666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37301506 - 37301328
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37301506 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccac 37301407  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37301406 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 37301328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 37419941 - 37420119
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37419941 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactac 37420040  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37420041 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtc 37420119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 41653896 - 41654074
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41653896 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccac 41653995  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41653996 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 41654074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 233
Target Start/End: Original strand, 2714550 - 2714714
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2714550 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccac 2714649  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2714650 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg 2714714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 72 - 241
Target Start/End: Original strand, 25185902 - 25186072
Alignment:
Q  72 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25185902 ttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccactt 25186001  T
Q  172 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtacccta 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25186002 aaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtacccta 25186072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29048584 - 29048429
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29048584 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccac 29048485  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29048484 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 29048429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 35628773 - 35628956
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35628773 tatggttttttttagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaat 35628872  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  35628873 accacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtc 35628956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 2275914 - 2276091
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2275914 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2276013  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  2276014 tt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggtagactagttgtc 2276091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13356301 - 13356123
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13356301 ttttttttagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 13356202  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  13356201 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtc 13356123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 41231947 - 41232125
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41231947 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 41232046  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||    
T  41232047 ttaaaaatgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtc 41232125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13760829 - 13760649
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13760829 ttttttcaagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccat 13760730  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgg--gtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  13760729 ttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtgtaccctagttgtc 13760649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 22878392 - 22878570
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22878392 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccac 22878491  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22878492 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtc 22878570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44088624 - 44088446
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44088624 ttttttctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 44088525  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||    
T  44088524 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctaattgtc 44088446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45066773 - 45066601
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45066773 ttttttatagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 45066674  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtacccta 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45066673 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccatgggtacccta 45066601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 25248040 - 25248212
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248040 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25248133  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||    
T  25248134 tttaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtc 25248212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 41639915 - 41640093
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  41639915 ttttttttagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgc 41640014  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  41640015 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtc 41640093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 233
Target Start/End: Original strand, 45258511 - 45258675
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  45258511 ttttttttagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccat 45258610  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgg 233  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45258611 ttaaaaatgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 45258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 247
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033109
Alignment:
Q  125 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccat 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  224 ttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtc 12033109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 244
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904252
Alignment:
Q  118 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  217 ccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3904225 ccaccattcttccatgggtaccctagtt 3904252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42701471 - 42701301
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42701471 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccac 42701372  T
Q  170 tta---aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtacc 238  Q
    |||   ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  42701371 ttaaaaaaaatgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggtacc 42701301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 31940316 - 31940480
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  31940316 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 31940407  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  31940408 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 31940480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 247
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981647
Alignment:
Q  135 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  234 gtaccctagttgtc 247  Q
     |||||||||||||    
T  41981634 ataccctagttgtc 41981647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4447465 - 4447298
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||            
T  4447465 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-------- 4447374  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4447373 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 4447298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 10378310 - 10378477
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||            
T  10378310 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-------- 10378401  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10378402 ---aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 10378477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 117501 - 117332
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          
T  117501 gattttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 117408  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
         || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| || |||||||| ||||||||||    
T  117407 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtc 117332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 3211207 - 3211373
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||            
T  3211207 ttttttctaaattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg-------- 3211297  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3211298 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtc 3211373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39915993 - 39915887
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39915993 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 39915894  T
Q  170 ttaaaaa 176  Q
    |||||||    
T  39915893 ttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 247
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336273
Alignment:
Q  138 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggta 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  237 ccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||    
T  31336263 ccctagttgtc 31336273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 41843254 - 41843410
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||            
T  41843254 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatg-------- 41843345  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggta 236  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  41843346 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 41843410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 9713690 - 9713852
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  9713690 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccc---aaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 9713778  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  9713779 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 9713852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33897012 - 33896846
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33897012 ttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccac 33896914  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     ||||||  ||           ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33896913 ctaaaaagatg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtc 33896846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40458942 - 40458777
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  40458942 ttttttctcaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 40458851  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  40458850 ---aatatgtgtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 40458777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4975576 - 4975412
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||             
T  4975576 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 4975486  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg-ttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
      || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  4975485 --aatatgtgcttatatggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttg 4975412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 171
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981535
Alignment:
Q  90 aagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 2379141 - 2379308
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||            
T  2379141 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg-------- 2379232  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||    
T  2379233 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtc 2379308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3490569 - 3490402
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  3490569 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttaccac 3490470  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3490469 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtc 3490402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31149060 - 31148953
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31149060 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gataccac 31148962  T
Q  170 ttaaaaatg 178  Q
    |||||||||    
T  31148961 ttaaaaatg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27243309 - 27243218
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  27243309 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27254884 - 27254793
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  27254884 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32373892 - 32373733
Alignment:
Q  74 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 173  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           |    
T  32373892 ttctaaattacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------a 32373804  T
Q  174 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  32373803 atatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccatggataacctagtt 32373733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26196486 - 26196320
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26196486 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccac 26196388  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  26196387 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtc 26196320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9509575 - 9509406
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||       
T  9509575 tatggttttttctaaattacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg--- 9509479  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
            || ||||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||    
T  9509478 --------aatatgtgtttatgtggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 9509406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33622635 - 33622470
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  | ||||||| ||||||||||            
T  33622635 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttat-gggtcaaaatagttcatg-------- 33622545  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  33622544 ---aatatgtggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcat-ggtagcctagttgtc 33622470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Original strand, 38631653 - 38631744
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38631653 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg 38631744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649837
Alignment:
Q  81 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 180  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||           || |||||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatg-----------aatatgtg 40649902  T
Q  181 cttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||||    
T  40649901 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggtagcctagtt 40649837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 160
Target Start/End: Original strand, 164728 - 164812
Alignment:
Q  75 tctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 160  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||    
T  164728 tctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttg-tggtggagtctaaatagttcat 164812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41425503 - 41425434
Alignment:
Q  176 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||  ||||||| ||||||||    
T  41425503 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattatccataattcttttatgggtagcctagttg 41425434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 116
Target Start/End: Original strand, 39901573 - 39901620
Alignment:
Q  69 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaa 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39901573 attttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttacccactaa 39901620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 105
Target Start/End: Original strand, 12032953 - 12032988
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12032953 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 12032988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 247
Target Start/End: Original strand, 39901674 - 39901736
Alignment:
Q  186 gtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  39901674 gtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtc 39901736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 5882507 - 5882685
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882507 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 5882606  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5882607 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 5882685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14891560 - 14891383
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14891560 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 14891461  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14891460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 2892189 - 2892367
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2892189 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2892288  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2892289 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 2892367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 8615241 - 8615419
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615241 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 8615340  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8615341 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtc 8615419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22551242 - 22551064
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22551242 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 22551143  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22551142 ctaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 22551064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 24168092 - 24168270
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24168092 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24168191  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24168192 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 24168270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26377385 - 26377207
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377385 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26377286  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26377285 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 26377207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11988977
Alignment:
Q  82 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgc 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  182 ttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 11988977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34528050 - 34527865
Alignment:
Q  63 tttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 162  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34528050 tttatggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatgg 34527951  T
Q  163 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34527950 ataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 34527865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18101674 - 18101498
Alignment:
Q  72 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18101674 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactt 18101575  T
Q  172 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18101574 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtc 18101498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19415714 - 19415536
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19415714 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccac 19415615  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19415614 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 19415536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 28947088 - 28947266
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28947088 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccac 28947187  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28947188 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 28947266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 960085 - 959907
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  960085 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccac 959986  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  959985 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 959907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2594033 - 2593855
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2594033 ttttttctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2593934  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2593933 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtc 2593855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7345293 - 7345115
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7345293 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 7345194  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  7345193 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtctaccttagttgtc 7345115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7393767 - 7393589
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7393767 ttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 7393668  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  7393667 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtc 7393589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 599893 - 600071
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  599893 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 599992  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  599993 ttaaaaatgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 600071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 16703367 - 16703539
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16703367 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 16703466  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtacccta 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  16703467 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtatccta 16703539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 1970712 - 1970890
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  1970712 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 1970811  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  1970812 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactttagttgtc 1970890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10508089 - 10507911
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10508089 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10507990  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  10507989 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtc 10507911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341791
Alignment:
Q  82 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccacta--accaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  180 gcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtc 22341791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19281241 - 19281058
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19281241 tatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaat 19281142  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  19281141 atcacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtc 19281058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30743632 - 30743457
Alignment:
Q  67 tgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  30743632 tgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggatac 30743533  T
Q  167 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtacccta 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| |||||||    
T  30743532 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggatacccta 30743457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33452753 - 33452575
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33452753 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccac 33452654  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33452653 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtc 33452575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5294989 - 5294804
Alignment:
Q  63 tttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 162  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5294989 tttaagattttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgg 5294890  T
Q  163 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5294889 ataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtc 5294804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5299541 - 5299356
Alignment:
Q  63 tttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 162  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5299541 tttaagattttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgg 5299442  T
Q  163 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5299441 ataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtc 5299356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24224252 - 24224073
Alignment:
Q  70 ttttttctagatt-acctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24224252 ttttttctagatttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatacca 24224153  T
Q  169 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  24224152 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtc 24224073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30467784 - 30467656
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30467784 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 30467685  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgt 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30467684 ttaaacatgtgcttatgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 7167583 - 7167750
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7167583 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccac 7167682  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167683 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 7167750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261932
Alignment:
Q  101 gtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  201 tggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtc 23261932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28949015 - 28948848
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||            
T  28949015 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-------- 28948924  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  28948923 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 28948848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Original strand, 13329382 - 13329545
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||              
T  13329382 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca---------- 13329471  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagt 243  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||    
T  13329472 -taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagt 13329545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 247
Target Start/End: Original strand, 15965425 - 15965601
Alignment:
Q  61 cttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 160  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  15965425 cttttctggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcat 15965524  T
Q  161 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |           || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  15965525 g-----------aatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 15965601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 4487528 - 4487693
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  4487528 ttttttttaaatttcctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 4487619  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  4487620 ---aatatgtactcatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 4487693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 151
Target Start/End: Original strand, 929660 - 929741
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  929660 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 3291009 - 3291176
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||              
T  3291009 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca---------- 3291098  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||||| || |||| |||||    
T  3291099 -taaatatgtgcttatgtggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtc 3291176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 1398554 - 1398721
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||            
T  1398554 ttttttctaaattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatg-------- 1398645  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||| |||| ||||||||||    
T  1398646 ---aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtc 1398721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 3786750 - 3786915
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||            
T  3786750 ttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatg-------- 3786841  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  3786842 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttg 3786915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1939669 - 1939579
Alignment:
Q  75 tctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 165  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  1939669 tctaaattatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 375894 - 375797
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  375894 ttttttttagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacc 375797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 13844847 - 13844943
Alignment:
Q  80 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 176  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  13844847 attacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcataaataccacctaaaaa 13844943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 247
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661902
Alignment:
Q  176 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 18661902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 247
Target Start/End: Original strand, 34262342 - 34262398
Alignment:
Q  192 aatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34262342 aatgtttattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 34262398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11743125 - 11743070
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaa 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  11743125 ttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaa 11743070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 375786 - 375730
Alignment:
Q  192 aatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  375786 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccttaattgtc 375730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24913171 - 24913099
Alignment:
Q  176 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| || |||| ||| | ||||||||    
T  24913171 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgagtagcttagttgtc 24913099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 72)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 24253383 - 24253561
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253383 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24253482  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24253483 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 24253561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43326560 - 43326384
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43326560 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43326461  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43326460 ttaaaaatgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttg 43326384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40886216 - 40886034
Alignment:
Q  62 ttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40886216 ttttatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 40886117  T
Q  162 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40886116 gataccactt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 40886034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3466862 - 3466684
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3466862 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 3466763  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  3466762 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtc 3466684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 6901800 - 6901978
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6901800 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 6901899  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6901900 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 6901978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15398663 - 15398485
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15398663 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 15398564  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  15398563 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtc 15398485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 39932575 - 39932758
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932575 tatggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 39932674  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39932675 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtc 39932758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 7722050 - 7722228
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7722050 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 7722149  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg-ttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  7722150 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 7722228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 35626039 - 35626217
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35626039 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 35626138  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35626139 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtc 35626217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 739885 - 739707
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  739885 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 739786  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  739785 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 739707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 5184973 - 5185151
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5184973 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 5185072  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5185073 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtc 5185151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18479849 - 18479675
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18479849 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 18479750  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  18479749 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagt 18479675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 27938898 - 27939077
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27938898 ttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27938997  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatggg-taccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27938998 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtc 27939077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 12648798 - 12648976
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12648798 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 12648897  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12648898 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 12648976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43262364 - 43262186
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43262364 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43262265  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43262264 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 43262186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2484473 - 2484295
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2484473 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactac 2484374  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2484373 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 2484295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 15683792 - 15683970
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15683792 ttttttctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 15683891  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  15683892 ttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtc 15683970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27501236 - 27501058
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501236 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27501137  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27501136 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 27501058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 25831522 - 25831699
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  25831522 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaa 25831620  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||    
T  25831621 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtc 25831699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27278658 - 27278476
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatag----ttcatggata 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  27278658 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggata 27278559  T
Q  166 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27278558 ccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtc 27278476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 80 - 247
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939076
Alignment:
Q  80 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  180 gcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    | |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 31939076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 5137716 - 5137894
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5137716 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 5137815  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattg-gttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||||||||    
T  5137816 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccattaataccctagttgtc 5137894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13504922 - 13504745
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504922 tttttctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 13504823  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13504822 taaaaatgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtc 13504745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 80 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40279029 - 40278861
Alignment:
Q  80 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40279029 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgt 40278930  T
Q  180 gcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||    
T  40278929 gcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtc 40278861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28424974 - 28424798
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28424974 ttttttctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 28424877  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  28424876 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtc 28424798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 890907 - 891084
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  890907 ttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccac 891006  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  891007 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtc 891084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789298
Alignment:
Q  106 ttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  206 ggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 29789298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 77 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756490
Alignment:
Q  77 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  177 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatt-tttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtc 38756490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 40110235 - 40110412
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40110235 ttttttctatattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatagataccac 40110333  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  40110334 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatgagtatcctaattgtc 40110412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 115 - 247
Target Start/End: Original strand, 34451296 - 34451429
Alignment:
Q  115 aaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaat 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  34451296 aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaat 34451395  T
Q  214 tacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34451396 tacccaccattcttccatggataccctagttgtc 34451429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 763724 - 763902
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  763724 ttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcac 763823  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| ||  |||| ||| |||||||||    
T  763824 ttaaaaatgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtc 763902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 33617586 - 33617753
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  33617586 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-------- 33617677  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33617678 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtc 33617753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 231
Target Start/End: Original strand, 4149695 - 4149847
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||    
T  4149695 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggg----------ttatggataccac 4149784  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4149785 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 4149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9424768 - 9424595
Alignment:
Q  64 ttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 163  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||      
T  9424768 ttatggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-- 9424671  T
Q  164 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
             || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  9424670 ---------aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 9424595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31294170 - 31293992
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||| |||| |||||||    
T  31294170 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccac 31294071  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| |||||| |||  | |||  |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31294070 ttaaaaatatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtc 31293992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38015684 - 38015519
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  38015684 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 38015593  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  38015592 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 38015519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 208
Target Start/End: Original strand, 40632500 - 40632629
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  40632500 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc-- 40632597  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 208  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632598 -------ggtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 40632629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 19295731 - 19295898
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||         
T  19295731 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtat----- 19295825  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  19295826 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 19295898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23195418 - 23195251
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  23195418 ttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 23195327  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||    
T  23195326 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtc 23195251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 27503380 - 27503547
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  27503380 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 27503471  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||||    
T  27503472 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtc 27503547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 5497274 - 5497441
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||            
T  5497274 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-------- 5497365  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  5497366 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 5497441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 13957671 - 13957838
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  13957671 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 13957762  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  13957763 ---aatatgcgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 13957838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 6973064 - 6973229
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||            
T  6973064 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 6973155  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  6973156 ---aatatgtgcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 6973229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12558199 - 12558090
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  12558199 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gataccac 12558101  T
Q  170 ttaaaaatgtg 180  Q
    |||||||||||    
T  12558100 ttaaaaatgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42658832 - 42658671
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  42658832 ttttttcaaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 42658741  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtacccta 241  Q
       || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  42658740 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 42658671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 2585463 - 2585630
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  2585463 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccat 2585562  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     ||||||  ||           ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2585563 ctaaaaagttg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtc 2585630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36365620 - 36365462
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||       
T  36365620 tatggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--- 36365524  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgg 233  Q
            || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||    
T  36365523 --------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctttcatgg 36365462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9374672 - 9374507
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||            
T  9374672 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-------- 9374581  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  9374580 ---aatatgtgtttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 9374507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24167954 - 24167787
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24167954 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 24167855  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24167854 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtc 24167787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38638080 - 38637913
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  38638080 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaa 38637981  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38637980 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtc 38637913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36472454 - 36472348
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36472454 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 36472355  T
Q  170 ttaaaaa 176  Q
    || ||||    
T  36472354 tttaaaa 36472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1402675 - 1402511
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1402675 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 1402576  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
      ||||| |||           ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1402575 ccaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 1402511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18327343 - 18327179
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18327343 ttttttctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 18327244  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18327243 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccttagtt 18327179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 14971979 - 14972146
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||            
T  14971979 ttttttttaaattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-------- 14972070  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  14972071 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 14972146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 42247952 - 42247865
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 157  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42247952 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 42247865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36948633 - 36948493
Alignment:
Q  95 tggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 194  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  36948633 tggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggata-----------tgtgcttatgtggctaat 36948546  T
Q  195 gtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  36948545 gtgtattggtagggtaaattacccaccattcttgcatgagtaccctagctgtc 36948493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120132
Alignment:
Q  80 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaat 5120132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 247
Target Start/End: Original strand, 27390605 - 27390765
Alignment:
Q  77 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27390605 tagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27390704  T
Q  177 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||           |||||  ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27390705 ggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 27390765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656573
Alignment:
Q  96 ggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatg 3656624  T
Q  196 tgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||    
T  3656623 tgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttg 3656573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33624105 - 33623942
Alignment:
Q  74 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||| |             
T  33624105 ttctaaattacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggt--------- 33624015  T
Q  174 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  33624014 --atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtc 33623942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 40686900 - 40687066
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  40686900 ttttttctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccat 40686999  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40687000 ctaaaaa-gtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtc 40687066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 6206885 - 6207029
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||            
T  6206885 ttttttttaaattacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatg-------- 6206976  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatt 224  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6206977 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 6207029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9171193 - 9171111
Alignment:
Q  72 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagata 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9171193 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 9171111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9527192 - 9527124
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaattt 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9527192 gattttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 233
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492767
Alignment:
Q  103 aatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattg 202  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  203 gtt-gggtaaattacccaccatttttccatgg 233  Q
    ||| |||||||||||||| |||| || |||||    
T  38492736 gttggggtaaattacccatcattctttcatgg 38492767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 612900 - 612760
Alignment:
Q  95 tggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 194  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||             ||||||||||||||||    
T  612900 tggtgggtaatttaaccaccaacca-tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgata-------------tgcttatgtggctaat 612815  T
Q  195 gtgtattggttgg--gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  612814 gtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtc 612760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940411
Alignment:
Q  93 aatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300962
Alignment:
Q  80 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag 151  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaatttatcggtggagtcaag 15300962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 129
Target Start/End: Original strand, 28756082 - 28756138
Alignment:
Q  73 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatga 129  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  28756082 tttctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatga 28756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9171108 - 9171069
Alignment:
Q  177 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9171108 tgtgcttatgtggttaatgtgtattgattgggtaaattac 9171069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20207154 - 20207088
Alignment:
Q  102 taatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  20207154 taatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggatacca 20207088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 129
Target Start/End: Original strand, 27584386 - 27584447
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtggg--taatttacccactaaccaatgaaaatga 129  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  27584386 ttttttctatatttcctttgaagaatggtgggtatagtttacccaccaaccagtgaaaatga 27584447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 128)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 62 - 247
Target Start/End: Original strand, 9798458 - 9798644
Alignment:
Q  62 ttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9798458 ttttatggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 9798557  T
Q  162 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9798558 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 9798644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 34276548 - 34276726
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34276548 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 34276647  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34276648 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 34276726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21366789 - 21366612
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366789 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 21366690  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21366689 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 21366612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 66 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22618697 - 22618517
Alignment:
Q  66 atgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22618697 atgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggata 22618599  T
Q  166 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22618598 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 22618517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 53854616 - 53854433
Alignment:
Q  64 ttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53854616 ttatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 53854517  T
Q  164 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  53854516 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtc 53854433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 6019929 - 6020107
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6019929 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 6020028  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6020029 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 6020107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 23437593 - 23437771
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437593 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23437692  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23437693 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtc 23437771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32366841 - 32366663
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366841 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 32366742  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32366741 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 32366663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Original strand, 44984763 - 44984940
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44984763 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 44984862  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44984863 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 44984940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Original strand, 237478 - 237653
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  237478 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacac 237577  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  237578 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 237653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 397403 - 397581
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  397403 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 397502  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  397503 ttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 397581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18462194 - 18462016
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18462194 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 18462095  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18462094 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 18462016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 29478361 - 29478539
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29478361 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 29478460  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  29478461 ttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtc 29478539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31532316 - 31532138
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31532316 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31532217  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31532216 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 31532138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 42085208 - 42085386
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42085208 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 42085307  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42085308 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtc 42085386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 51363008 - 51363185
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51363008 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 51363107  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  51363108 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtc 51363185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 146610 - 146432
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146610 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 146511  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||    
T  146510 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtc 146432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2826862 - 2826685
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2826862 ttttttctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2826763  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2826762 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtc 2826685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26091439 - 26091261
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26091439 ttttttctaaattatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26091340  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26091339 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 26091261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 39077546 - 39077724
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39077546 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 39077645  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  39077646 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtc 39077724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41702640 - 41702462
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41702640 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 41702541  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41702540 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 41702462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 53461997 - 53461819
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53461997 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 53461898  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  53461897 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 53461819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 54575121 - 54574943
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54575121 ttttttctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccac 54575022  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54575021 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 54574943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42766027 - 42765845
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42766027 tatggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gat 42765929  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42765928 accacttaaaaatgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtc 42765845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 6285308 - 6285486
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6285308 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccac 6285407  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6285408 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 6285486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43471876 - 43471698
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43471876 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccac 43471777  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  43471776 ttaaaaatgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 43471698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 47344657 - 47344835
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47344657 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47344756  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47344757 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtc 47344835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 49881244 - 49881062
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49881244 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 49881145  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-----taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  49881144 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtc 49881062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 55056440 - 55056262
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55056440 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaac 55056341  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  55056340 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccttgttgtc 55056262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 407755 - 407931
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  407755 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cac 407853  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  407854 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 407931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 41949383 - 41949563
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41949383 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 41949482  T
Q  170 ttaaaaatgtgct--tatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  41949483 ttaaaaatgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtc 41949563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 233
Target Start/End: Original strand, 27373077 - 27373241
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27373077 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 27373176  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27373177 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 27373241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 247
Target Start/End: Original strand, 42222291 - 42222470
Alignment:
Q  69 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42222291 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgatacca 42222390  T
Q  169 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  42222391 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtc 42222470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 50457996 - 50457813
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50457996 tatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggat 50457897  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50457896 accacttaaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtc 50457813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19387869 - 19387691
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19387869 ttttttctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccac 19387770  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19387769 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 19387691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 45797480 - 45797658
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45797480 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 45797579  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  45797580 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtc 45797658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 56023179 - 56023001
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  56023179 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccac 56023080  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  56023079 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtc 56023001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Original strand, 23609081 - 23609266
Alignment:
Q  63 tttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 162  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23609081 tttatggttttttctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacgg 23609180  T
Q  163 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23609181 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtc 23609266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31972515 - 31972339
Alignment:
Q  72 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31972515 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactt 31972416  T
Q  172 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  31972415 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtc 31972339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14017555 - 14017379
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14017555 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 14017456  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14017455 tt--aagtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtc 14017379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 246
Target Start/End: Original strand, 50534630 - 50534809
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50534630 gattttttttagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 50534729  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  50534730 acttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgt 50534809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Original strand, 54607958 - 54608137
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54607958 tatggttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtat 54608057  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  54608058 accacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggataccctagt 54608137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 2243459 - 2243637
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2243459 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccac 2243558  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2243559 ttaaaaatgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 2243637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 3170627 - 3170805
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3170627 ttttttctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 3170726  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  3170727 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtc 3170805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3692391 - 3692213
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||    
T  3692391 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccac 3692292  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3692291 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 3692213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29777438 - 29777260
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  29777438 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccac 29777339  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  29777338 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtc 29777260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31070254 - 31070077
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31070254 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcat-gataccac 31070156  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31070155 ttaaaaatgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 31070077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 31914199 - 31914376
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31914199 ttttttttagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31914298  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31914299 ttaaaaatgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 31914376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 41560329 - 41560507
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41560329 ttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 41560428  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41560429 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtc 41560507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 48313558 - 48313734
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48313558 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccac 48313656  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || ||||| ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48313657 tt-aaaatatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 48313734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 55519828 - 55520006
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55519828 ttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccac 55519927  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  55519928 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 55520006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 55776046 - 55776223
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55776046 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccac 55776144  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||    
T  55776145 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtc 55776223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 55840224 - 55840401
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55840224 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccac 55840322  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||    
T  55840323 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtc 55840401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 38591669 - 38591843
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38591669 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccat 38591768  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38591769 t----aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 38591843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22468951 - 22468788
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22468951 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccac 22468852  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatg 232  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22468851 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccatg 22468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 42033176 - 42033354
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42033176 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 42033275  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42033276 ttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 42033354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 50234001 - 50234179
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  50234001 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccac 50234100  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  50234101 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtc 50234179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Original strand, 35446507 - 35446683
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  35446507 ttttttctagattaccttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcac 35446605  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35446606 ttaaaaatgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35446683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 53834237 - 53834057
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53834237 gattttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggatacc 53834138  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  53834137 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 53834057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Original strand, 1932764 - 1932939
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1932764 ttttttctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccac 1932863  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1932864 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtaccctagtt 1932939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47662283 - 47662105
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  47662283 ttttttctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccac 47662184  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47662183 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 47662105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 54086411 - 54086587
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  54086411 ttttttctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccgc 54086508  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54086509 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 54086587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Original strand, 48657826 - 48657997
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48657826 tttttttagattacctttgaagaatggtgggt------cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 48657919  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48657920 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 48657997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 50536805 - 50536628
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50536805 ttttttttagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccac 50536706  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 246  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  50536705 ttaaaaatatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgt 50536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39587960 - 39587796
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39587960 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 39587861  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgg 233  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39587860 ttaaaaatgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccatgg 39587796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 71 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33897675 - 33897504
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33897675 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33897576  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtacccta 241  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  33897575 taaaaatatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggtacccta 33897504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41632187 - 41632010
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  41632187 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggatatcgc 41632089  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  41632088 ttaaaaatgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtc 41632010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 54424983 - 54425160
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54424983 ttttatctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 54425082  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  54425083 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccat-ggtacactagttgtc 54425160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 54805799 - 54805617
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  54805799 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccac 54805700  T
Q  170 ttaaaaatgtg----cttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  54805699 ttaaaaatgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtaccctagatgtc 54805617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48259691 - 48259528
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48259691 ttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccac 48259592  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgg 233  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48259591 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 48259528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Original strand, 51951681 - 51951860
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  51951681 gattttttctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatc 51951780  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  51951781 agttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgtgtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtc 51951860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36533001 - 36532833
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36533001 ttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttac------accac----aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 36532912  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36532911 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 36532833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 48654815 - 48654999
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  48654815 ttttttttagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccac 48654914  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggcta------atgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  48654915 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtc 48654999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 109 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728310
Alignment:
Q  109 cccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-g 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  208 gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  52728348 gtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtc 52728310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9998101 - 9997934
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||            
T  9998101 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatg-------- 9998010  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9998009 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 9997934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Original strand, 54715036 - 54715200
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||            
T  54715036 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatg-------- 54715127  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
       || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54715128 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 54715200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45633949 - 45633782
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  45633949 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 45633858  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  45633857 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 45633782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15060466 - 15060292
Alignment:
Q  63 tttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 162  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  15060466 tttatggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg- 15060368  T
Q  163 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
              || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  15060367 ----------aatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 15060292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 34835178 - 34835345
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  34835178 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccat 34835277  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835278 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 34835345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38547771 - 38547604
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38547771 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 38547672  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38547671 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtc 38547604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 43890929 - 43891096
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||            
T  43890929 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatg-------- 43891020  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  43891021 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtc 43891096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Original strand, 46720026 - 46720195
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  46720026 ttttttctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggataccac 46720125  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 246  Q
     |||||| |||  |||       |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46720126 ctaaaaaggtg-atat-------atgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 46720195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37239260 - 37239095
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  37239260 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 37239169  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  37239168 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttg 37239095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5117608 - 5117464
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  5117608 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 5117517  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatt 224  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5117516 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 5117464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20352012 - 20351845
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  20352012 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 20351921  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||    
T  20351920 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtc 20351845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 34552320 - 34552487
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||            
T  34552320 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatg-------- 34552411  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  34552412 ---aatatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 34552487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27398773 - 27398607
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27398773 ttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27398674  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 246  Q
    ||||||||||            ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27398673 ttaaaaatgt-----------aaatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcattggtaccctagttgt 27398607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31881489 - 31881319
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||       
T  31881489 tatggttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--- 31881393  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
            || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| || |||||||| ||||||||    
T  31881392 --------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttg 31881319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 54216906 - 54216742
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  54216906 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-------- 54216815  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
       || |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  54216814 ---aatatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggataccctagtt 54216742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14335271 - 14335165
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14335271 ttttttctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccac 14335172  T
Q  170 ttaaaaa 176  Q
     ||||||    
T  14335171 ctaaaaa 14335165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 22620594 - 22620759
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  22620594 ttttttctaaattatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 22620685  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||    
T  22620686 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttg 22620759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Original strand, 27580120 - 27580226
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27580120 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27580219  T
Q  170 ttaaaaa 176  Q
     ||||||    
T  27580220 ctaaaaa 27580226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 247
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595866
Alignment:
Q  154 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtc 35595866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 244
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509472
Alignment:
Q  124 aaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccacca 222  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  223 tttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  42509451 ttcttccatgagtaccctagtt 42509472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 47811907 - 47812074
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||            
T  47811907 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatg-------- 47811998  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||    
T  47811999 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtc 47812074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 54216314 - 54216481
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  54216314 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 54216405  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | |||| || |||||||| ||||||||||    
T  54216406 ---aatatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagttgtc 54216481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 117 - 207
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  117 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa-gatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1662429 - 1662323
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1662429 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 1662330  T
Q  170 ttaaaaa 176  Q
     ||||||    
T  1662329 ctaaaaa 1662323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 247
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344966
Alignment:
Q  149 aagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggtaaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtc 35344966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 52688350 - 52688515
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||            
T  52688350 ttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg-------- 52688441  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  52688442 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 52688515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4486751 - 4486607
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||            
T  4486751 ttttttctaaattatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-------- 4486660  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatt 224  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4486659 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 4486607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 46708908 - 46708744
Alignment:
Q  73 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||               
T  46708908 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 46708820  T
Q  173 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| || ||| | || ||||||||||    
T  46708819 aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtc 46708744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 247
Target Start/End: Original strand, 49014090 - 49014266
Alignment:
Q  61 cttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 160  Q
    |||||| | |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  49014090 cttttaaggttttttttaaatcacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcat 49014189  T
Q  161 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |           || |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||||    
T  49014190 g-----------aatatgtacttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtc 49014266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6371419 - 6371252
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||    
T  6371419 ttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttaccac 6371320  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6371319 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtc 6371252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Original strand, 42557583 - 42557666
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42557583 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 33289704 - 33289865
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||       
T  33289704 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac--- 33289800  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtacccta 241  Q
            |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  33289801 --------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 33289865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 247
Target Start/End: Original strand, 573807 - 573971
Alignment:
Q  73 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 172  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  573807 tttctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 573906  T
Q  173 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||| |||           ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  573907 aaaaagtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtc 573971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27873718 - 27873574
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||            
T  27873718 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatg-------- 27873627  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatt 224  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27873626 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 27873574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 52461367 - 52461529
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  52461367 ttttttctaaattacctttgaa---tggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 52461455  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||    
T  52461456 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttg 52461529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3293193 - 3293102
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3293193 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11972299 - 11972208
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11972299 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Original strand, 43231504 - 43231601
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43231504 ttttttctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 43231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Original strand, 33048990 - 33049060
Alignment:
Q  178 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33048990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 33049060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 247
Target Start/End: Original strand, 27872607 - 27872747
Alignment:
Q  97 gtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 196  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           |||||    
T  27872607 gtggataatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgt 27872695  T
Q  197 gtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27872696 ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtc 27872747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33558114 - 33558021
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  33558114 gattttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg 33558021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 49058038 - 49057933
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| || ||| || ||||||||| |||||||     
T  49058038 ttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccat 49057939  T
Q  170 ttaaaa 175  Q
    ||||||    
T  49057938 ttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 17555667 - 17555617
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17555667 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259707
Alignment:
Q  174 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtc 48259707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206583
Alignment:
Q  80 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag----atagttcatggataccacttaaaa 175  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 18206583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 247
Target Start/End: Original strand, 42558270 - 42558364
Alignment:
Q  146 gtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||    
T  42558270 gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtg--------gctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagtt 42558361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 236
Target Start/End: Original strand, 49304602 - 49304671
Alignment:
Q  167 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggta 236  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  49304602 cacttaaaaatgtatttatgtggctgatgtttattggttgaataaattacccaccaattttctatgggta 49304671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51981613 - 51981513
Alignment:
Q  106 ttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 205  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51981613 ttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtgggattaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 51981525  T
Q  206 -gggtaaattac 216  Q
     |||||||||||    
T  51981524 ggggtaaattac 51981513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Original strand, 16738569 - 16738715
Alignment:
Q  80 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-tagttcatggataccacttaaaaatg 178  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||  | ||||  | ||   ||||| ||||||  || |||||||||    
T  16738569 attacctttataaaatggtgggtaacttacccacgaactaatgaaaatgagcatttt--tagtggcattaattgtagtttatggatgtcatttaaaaatg 16738666  T
Q  179 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccattttt 227  Q
    |  |||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  16738667 tatttatgtggcttatgtttattggttaggtcaattatccaccattttt 16738715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18206553 - 18206515
Alignment:
Q  209 taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18206553 taaattacccatcatttttccatgggtaccttagttgtc 18206515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291808
Alignment:
Q  183 tatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||||| || |||| |||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtc 3291808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Original strand, 29066865 - 29066910
Alignment:
Q  183 tatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttc 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  29066865 tatgtggctaatgtttattggttggataaattattcaccatttttc 29066910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14335144 - 14335104
Alignment:
Q  207 ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  14335144 ggtaaattacccaccattctttcatgggtactctagttgtc 14335104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 47105148 - 47105108
Alignment:
Q  119 aatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttca 159  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47105148 aatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttca 47105108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 81)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6594639 - 6594461
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594639 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 6594540  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594539 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 6594461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 746466 - 746644
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  746466 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 746565  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  746566 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 746644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Original strand, 23901780 - 23901957
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23901780 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 23901879  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23901880 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 23901957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 247
Target Start/End: Original strand, 4034586 - 4034770
Alignment:
Q  64 ttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4034586 ttatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatgga 4034685  T
Q  164 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4034686 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 4034770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2325070 - 2324892
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325070 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2324971  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  2324970 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtc 2324892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 10424595 - 10424773
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424595 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10424694  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10424695 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 14660446 - 14660624
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660446 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 14660545  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14660546 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 14660624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 17600836 - 17601014
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17600836 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 17600935  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17600936 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 17601014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27651215 - 27651037
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651215 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27651116  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27651115 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 27651037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 38997101 - 38997279
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38997101 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 38997200  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38997201 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 38997279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 45370990 - 45371168
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45370990 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccac 45371089  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45371090 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 45371168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Original strand, 6430473 - 6430648
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430473 ttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 6430572  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6430573 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 6430648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 61 - 247
Target Start/End: Original strand, 34518359 - 34518545
Alignment:
Q  61 cttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 160  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34518359 cttttatgttttttt-tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcat 34518457  T
Q  161 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  34518458 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtc 34518545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 11184972 - 11185150
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11184972 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 11185071  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11185072 ttaaaaatgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 11185150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13815399 - 13815221
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815399 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 13815300  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  13815299 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtc 13815221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 26710345 - 26710523
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26710345 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26710444  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26710445 ttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 26710523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 40635218 - 40635396
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40635218 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 40635317  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40635318 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 40635396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10244768 - 10244585
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244768 tatggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 10244669  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10244668 accacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtc 10244585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1092132 - 1091954
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1092132 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 1092033  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1092032 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 1091954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 27400403 - 27400581
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27400403 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27400502  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27400503 ttaaaaatgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 27400581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 5726129 - 5726307
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5726129 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccac 5726228  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5726229 ttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 5726307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 32327361 - 32327539
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32327361 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 32327460  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  32327461 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtc 32327539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2914324 - 2914141
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2914324 tatgattttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggat 2914225  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  2914224 accacttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtc 2914141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7892869 - 7892691
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7892869 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccac 7892770  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg-ttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  7892769 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtc 7892691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 27024415 - 27024593
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024415 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 27024514  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27024515 ttaaaaatatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtc 27024593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 40037143 - 40037320
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40037143 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 40037242  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40037243 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattttt-catgggtaccctagttgtc 40037320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33427828 - 33427653
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33427828 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 33427729  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  33427728 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtaccctagtt 33427653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 4609626 - 4609804
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4609626 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 4609725  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4609726 ttaaaaatgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtc 4609804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 32948446 - 32948623
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32948446 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccac 32948544  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||    
T  32948545 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtc 32948623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37621051 - 37620870
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggg---tcaagatagttcatggatac 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  37621051 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggatac 37620952  T
Q  167 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg-ttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37620951 cacttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 37620870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14697718 - 14697540
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14697718 ttttttttagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccac 14697619  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggt-tgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14697618 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 14697540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 40735464 - 40735642
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40735464 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 40735563  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||    
T  40735564 ttaaaaatgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtc 40735642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 32608380 - 32608535
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32608380 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccac 32608479  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32608480 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 32608535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37255513 - 37255340
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37255513 ttttttctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 37255419  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37255418 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 37255340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856439
Alignment:
Q  84 cctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 183  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  184 atgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtc 32856439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 9444683 - 9444871
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacc-------cactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 162  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9444683 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatgg 9444782  T
Q  163 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccacc---atttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||    
T  9444783 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtc 9444871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 247
Target Start/End: Original strand, 11159625 - 11159799
Alignment:
Q  73 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 172  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11159625 tttcttgattacctttgaaaaatggtgg-taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccactta 11159723  T
Q  173 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg-ttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11159724 aaaatgtgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 11159799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Original strand, 15925080 - 15925255
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15925080 ttttttctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 15925179  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || ||| | ||||||||||    
T  15925180 ttaaaaatatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagataccctagtt 15925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8433097 - 8432941
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8433097 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccac 8432998  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccattt 225  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8432997 tttaaaatatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattt 8432941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 223
Target Start/End: Original strand, 12842101 - 12842257
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12842101 gattttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggatacc 12842200  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccat 223  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12842201 aattaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat 12842257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 194
Target Start/End: Original strand, 42899904 - 42900039
Alignment:
Q  59 ttcttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttc 158  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42899904 ttcttatatggttttttctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttc 42900003  T
Q  159 atggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42900004 atggataccacttaaaaatgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 247
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295013
Alignment:
Q  121 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattaccca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  220 ccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtc 25295013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 39103047 - 39103214
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||            
T  39103047 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatg-------- 39103138  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39103139 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 39103214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35158222 - 35158053
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          
T  35158222 gattttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 35158129  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
         || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  35158128 -----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 35158053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Original strand, 41172459 - 41172605
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  | |||||||    
T  41172459 tttttttaaattacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccact 41172558  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41172559 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 145282 - 145449
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||       
T  145282 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac--- 145378  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  145379 --------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 145449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21735070 - 21734903
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||            
T  21735070 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatg-------- 21734979  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21734978 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 21734903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12333665 - 12333500
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||         
T  12333665 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat----- 12333571  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||||    
T  12333570 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtc 12333500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 1229635 - 1229806
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |        ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1229635 ttttttctagattacctttaaagaatggtaggtaatttgtc--------aatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccac 1229726  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatggg-taccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  1229727 ttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattacccaccattcttccatgggttacccaagttgtc 1229806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43899145 - 43898976
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||       
T  43899145 tatggttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg--- 43899049  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
            || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  43899048 --------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 43898976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 29687036 - 29687208
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||       
T  29687036 tatggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--- 29687132  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
            || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  29687133 --------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 29687208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 44481828 - 44481995
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44481828 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 44481927  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44481928 ctaaaaaggtg-----------aaagtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctggttgtc 44481995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28641468 - 28641295
Alignment:
Q  64 ttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 163  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||      
T  28641468 ttatggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-- 28641371  T
Q  164 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
             || || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||||||    
T  28641370 ---------aatatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtc 28641295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 447740 - 447636
Alignment:
Q  144 gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctag 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  447740 gggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctag 447641  T
Q  243 ttgtc 247  Q
    |||||    
T  447640 ttgtc 447636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 35126780 - 35126945
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35126780 ttttttctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 35126879  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35126880 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatagataccctagttg 35126945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 4258490 - 4258656
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||            
T  4258490 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgt-gggtcaagatagttcatg-------- 4258580  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||    
T  4258581 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtc 4258656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 247
Target Start/End: Original strand, 27331294 - 27331469
Alignment:
Q  66 atgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |      
T  27331294 atgattttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaa-- 27331391  T
Q  166 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
         || | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||| || |||||||| |||| |||||    
T  27331392 -----tatatatgtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtc 27331469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39301367 - 39301200
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  39301367 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 39301276  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||| || ||||||||||    
T  39301275 ---aatatgtgcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtc 39301200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19428597 - 19428431
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacc-tttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||           
T  19428597 ttttttctaaattaccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatg------- 19428505  T
Q  169 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  19428504 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 19428431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13543784 - 13543627
Alignment:
Q  80 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  13543784 attacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 13543696  T
Q  180 gcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  13543695 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 13543627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27765032 - 27764868
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||            
T  27765032 ttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-------- 27764941  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  27764940 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaaccatcatcttt-catgggtagcctagttg 27764868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 149
Target Start/End: Original strand, 12814614 - 12814693
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814614 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 12730061 - 12730226
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||              
T  12730061 ttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 12730150  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||    
T  12730151 -taaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttg 12730226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28566868 - 28566703
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||            
T  28566868 ttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatg-------- 28566777  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||    
T  28566776 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttg 28566703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 3266294 - 3266387
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  3266294 gattttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 3266387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 247
Target Start/End: Original strand, 12827137 - 12827240
Alignment:
Q  144 gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctag 242  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||    
T  12827137 gggttaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccacaggtgctctag 12827235  T
Q  243 ttgtc 247  Q
    |||||    
T  12827236 ttgtc 12827240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 34249265 - 34249432
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||            
T  34249265 ttttttttaaattatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-------- 34249356  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  34249357 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 34249432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014861
Alignment:
Q  141 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 28014861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40544246 - 40544155
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40544246 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 43356099 - 43356263
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  43356099 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 43356187  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg-ttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||| || ||||| || ||||||||||    
T  43356188 ---aatatgtgcttatgtggctaatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtc 43356263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2688899 - 2688732
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||            
T  2688899 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg-------- 2688808  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||    
T  2688807 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtc 2688732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2000507 - 2000417
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  2000507 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcat 2000417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Original strand, 3711664 - 3711798
Alignment:
Q  101 gtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||| |||||||||||||    
T  3711664 gtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgcggctaatgtgtat 3711752  T
Q  201 tggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  3711753 tggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 3711798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Original strand, 8056626 - 8056717
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| || |||| || |||||||||||||    
T  8056626 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg 8056717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 166
Target Start/End: Original strand, 30545821 - 30545917
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 166  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || || |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30545821 ttttttttagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatac 30545917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28020002 - 28019959
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020002 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 28019959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38985439 - 38985342
Alignment:
Q  77 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 176  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38985439 tagattacatttga-gaacggtgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgat-atgtcaagatagttcatggataccacctaaaaa 38985342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 10176559 - 10176625
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaattt 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  10176559 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattt 10176625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 247
Target Start/End: Original strand, 3266399 - 3266454
Alignment:
Q  193 atgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  3266399 atgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagttgtc 3266454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 108
Target Start/End: Original strand, 1897130 - 1897168
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattta 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1897130 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataattta 1897168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17799345 - 17799296
Alignment:
Q  152 atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  17799345 atagttcatgaataccacttaaaaatatgaatatgtggctaatgtttatt 17799296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 114)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Original strand, 47257787 - 47257972
Alignment:
Q  63 tttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 162  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47257787 tttatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatga 47257886  T
Q  163 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47257887 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 47257972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38416907 - 38416727
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38416907 gattttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 38416808  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38416807 acttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 38416727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47809778 - 47809599
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47809778 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47809679  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt--gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47809678 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 47809599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7855295 - 7855117
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7855295 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccac 7855196  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7855195 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 7855117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 24100284 - 24100461
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24100284 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccac 24100382  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24100383 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 24100461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28048573 - 28048395
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28048573 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 28048474  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt-ggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28048473 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 28048395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40131140 - 40130962
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40131140 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccac 40131041  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40131040 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtc 40130962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 41464353 - 41464531
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41464353 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 41464452  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  41464453 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtc 41464531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 49330038 - 49330216
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330038 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 49330137  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  49330138 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtc 49330216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 51170214 - 51170036
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51170214 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 51170115  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  51170114 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtc 51170036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40804693 - 40804513
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40804693 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggatacc 40804594  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40804593 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 40804513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 22399098 - 22399275
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22399098 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccac 22399197  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22399198 tt-aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 22399275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32234578 - 32234401
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32234578 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 32234479  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  32234478 tt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtc 32234401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29626008 - 29625836
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29626008 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 29625909  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtacccta 241  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29625908 ttaaaaatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtacccta 29625836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 2666001 - 2666179
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2666001 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2666100  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  2666101 ttaaaactgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtc 2666179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27067159 - 27066981
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27067159 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 27067060  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  27067059 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtc 27066981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 40419836 - 40420014
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40419836 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 40419935  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40419936 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtc 40420014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 42291843 - 42292021
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42291843 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 42291942  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42291943 ttgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtc 42292021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43612228 - 43612050
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43612228 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccac 43612129  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43612128 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 43612050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 55453425 - 55453247
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55453425 ttttttctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 55453326  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  55453325 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtc 55453247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 62 - 247
Target Start/End: Original strand, 39053387 - 39053573
Alignment:
Q  62 ttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39053387 ttttatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatg 39053486  T
Q  162 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||||||    
T  39053487 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatttttttatggatactctagttgtc 39053573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39634752 - 39634575
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39634752 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccac 39634654  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39634653 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtc 39634575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 40643801 - 40643979
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  40643801 ttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcat 40643900  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40643901 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 40643979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 78 - 247
Target Start/End: Original strand, 48609732 - 48609902
Alignment:
Q  78 agattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 177  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609732 agattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 48609831  T
Q  178 gtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48609832 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 48609902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48739414 - 48739236
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48739414 ttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccac 48739315  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48739314 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 48739236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 74 - 247
Target Start/End: Original strand, 52628959 - 52629132
Alignment:
Q  74 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52628959 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 52629058  T
Q  174 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  52629059 aaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtaccctagttgtc 52629132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20754579 - 20754396
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20754579 tatggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggat 20754480  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20754479 atcacttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtc 20754396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 43125832 - 43125987
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43125832 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 43125931  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatt 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43125932 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 43125987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 44806680 - 44806863
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44806680 tatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggat 44806779  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  44806780 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtc 44806863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35748492 - 35748314
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35748492 ttttttttagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35748393  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  35748392 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtc 35748314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 37313400 - 37313578
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  37313400 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 37313499  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  37313500 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaggtgtc 37313578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 37324542 - 37324720
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37324542 ttttttctaaattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 37324641  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37324642 ttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 37324720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 46134357 - 46134535
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46134357 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46134456  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||| ||||||| |||||    
T  46134457 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtc 46134535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 51102559 - 51102381
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51102559 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 51102460  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  51102459 ttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtc 51102381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 51452931 - 51452754
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51452931 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 51452832  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||    
T  51452831 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat-ggtaccctaattgtc 51452754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 52638843 - 52639021
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  52638843 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccac 52638942  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  52638943 ttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtc 52639021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 59 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 53943779 - 53943591
Alignment:
Q  59 ttcttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttc 158  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53943779 ttcttttatggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttc 53943680  T
Q  159 atggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  53943679 atggataccacttaaaaatatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttgtc 53943591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7755487 - 7755310
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7755487 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccac 7755388  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  7755387 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtc 7755310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 247
Target Start/End: Original strand, 43183917 - 43184091
Alignment:
Q  74 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  43183917 ttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaa 43184016  T
Q  174 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43184017 aaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtc 43184091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 44222830 - 44223008
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44222830 ttttttctaaattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccac 44222929  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44222930 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 44223008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 59 - 247
Target Start/End: Original strand, 18946893 - 18947082
Alignment:
Q  59 ttcttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttc 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18946893 ttcttatatgattttttctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttc 18946992  T
Q  159 atggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18946993 atggataccagttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtc 18947082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Original strand, 35594122 - 35594299
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  35594122 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcac 35594221  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35594222 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35594299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41293498 - 41293322
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  41293498 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccact 41293399  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  41293398 t-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtc 41293322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 43021715 - 43021894
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-ggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  43021715 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaatacca 43021814  T
Q  169 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  43021815 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtc 43021894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 235
Target Start/End: Original strand, 52215077 - 52215243
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52215077 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 52215176  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  52215177 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatgggt 52215243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Original strand, 36368935 - 36369114
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36368935 tatggttttttctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 36369034  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||    
T  36369035 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccacca-tcttccatgggtgctctagtt 36369114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 24376574 - 24376729
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24376574 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 24376673  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatt 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24376674 ttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccatt 24376729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 63 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 51146403 - 51146220
Alignment:
Q  63 tttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 162  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51146403 tttatggttttttctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgg 51146304  T
Q  163 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  51146303 ataccacttaaaaatttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttg 51146220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 41732529 - 41732707
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41732529 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccac 41732628  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  41732629 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtc 41732707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 53832665 - 53832487
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  53832665 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaa 53832566  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  53832565 ttaaaaaggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgtgttccctagttgtc 53832487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 247
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126165
Alignment:
Q  92 gaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 191  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  192 aatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtc 46126165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47895001 - 47894823
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47895001 ttttttttagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47894902  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47894901 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 47894823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 217
Target Start/End: Original strand, 53637842 - 53637990
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  53637842 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccac 53637941  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacc 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  53637942 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5560213 - 5560028
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaat-----gagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5560213 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggat 5560114  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggc--taatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5560113 accacttaaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 5560028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 41216456 - 41216634
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41216456 ttttttctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccac 41216555  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  41216556 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtc 41216634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 46949379 - 46949538
Alignment:
Q  73 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 172  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46949379 tttctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccactta 46949477  T
Q  173 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgg 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46949478 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggataaattacccaccattcttccatgg 46949538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 54159169 - 54159001
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  54159169 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccac 54159070  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||         |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54159069 ttaaaaatgtgctta---------tgtgtattggttggggtaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtc 54159001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 55379986 - 55380153
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55379986 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 55380085  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55380086 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 55380153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 25641647 - 25641812
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||              
T  25641647 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 25641736  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  25641737 -taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 25641812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 42589831 - 42589996
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  42589831 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 42589922  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  42589923 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 42589996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48547010 - 48546843
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  48547010 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaa-atagttcatggataccac 48546913  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||  || ||   ||||   |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48546912 ttaaaaatgtgcttatgtg--tattg---attg---gggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtc 48546843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 129 - 247
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864668
Alignment:
Q  129 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagtaaattacccaccattcttc 52864649  T
Q  229 catgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||    
T  52864650 catgggtaccctagttgtc 52864668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 49130579 - 49130747
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||            
T  49130579 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatg-------- 49130670  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtct 248  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  49130671 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtct 49130747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 53115448 - 53115615
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53115448 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 53115547  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||| |||           ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53115548 ttaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtc 53115615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 55000348 - 55000181
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||            
T  55000348 ttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg-------- 55000257  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  55000256 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 55000181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34279891 - 34279726
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  34279891 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 34279800  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||    
T  34279799 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttg 34279726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 208
Target Start/End: Original strand, 37758930 - 37759068
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  37758930 ttttttctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccac 37759029  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759030 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggg 37759068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 54707390 - 54707225
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||            
T  54707390 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 54707299  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  54707298 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 54707225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31286967 - 31286796
Alignment:
Q  66 atgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||        
T  31286967 atgattttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 31286872  T
Q  166 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
           || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| || |||| ||| ||||||||||    
T  31286871 -------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtc 31286796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38156802 - 38156635
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||            
T  38156802 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 38156711  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  38156710 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 38156635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 51415970 - 51416137
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||         
T  51415970 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat----- 51416064  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||||    
T  51416065 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtc 51416137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Original strand, 51143816 - 51143985
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  51143816 gattttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggatacc 51143915  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || |||||| |||           ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51143916 acctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtc 51143985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 54401188 - 54401349
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  54401188 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 54401279  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtacccta 241  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  54401280 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 54401349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 25353555 - 25353722
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25353555 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 25353654  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25353655 ctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 25353722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550470
Alignment:
Q  136 tgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatggg 234  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  235 taccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||    
T  33550482 taccctagttgtc 33550470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41635970 - 41635803
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||            
T  41635970 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 41635879  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||    
T  41635878 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtc 41635803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47511110 - 47510943
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  47511110 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 47511019  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||||    
T  47511018 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtc 47510943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39141296 - 39141141
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||         
T  39141296 ttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 39141202  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgg 233  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| || |||||    
T  39141201 ----atatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcatgg 39141141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 40022070 - 40022240
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||       
T  40022070 tatgattttttctaaattacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--- 40022166  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
            || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||| | ||||||    
T  40022167 --------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagcgtagttg 40022240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30251671 - 30251504
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30251671 ttttttctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 30251572  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30251571 ctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 30251504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42998958 - 42998792
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42998958 ttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 42998860  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42998859 ctaaaaaggtg-----------aatgcttattggttgggataaattacccaccatttttccatgagtaccttagttgtc 42998792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 247
Target Start/End: Original strand, 45058876 - 45059051
Alignment:
Q  62 ttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  45058876 ttttatggttttttttaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 45058975  T
Q  162 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
               || |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| || |||||| | ||||||||||    
T  45058976 -----------aatatgtgcttatgttgctaatgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatgggcagcctagttgtc 45059051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 37028724 - 37028889
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||            
T  37028724 ttttttttaaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatg-------- 37028815  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  37028816 ---aatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 37028889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41882161 - 41882063
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41882161 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182131
Alignment:
Q  118 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 47182131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17665694 - 17665550
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  17665694 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 17665603  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatt 224  Q
       || || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17665602 ---aatatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 17665550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21597318 - 21597151
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  21597318 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccaa 21597219  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg-ttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  21597218 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggtttgggtaaattatccactatttttccatgggtactttagttgtc 21597151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 24688115 - 24688282
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||            
T  24688115 ttttttctaaattacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-------- 24688206  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  24688207 ---aatatgtgtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtc 24688282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43176908 - 43176741
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  43176908 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccac 43176809  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||            |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43176808 ctaaaaaggtg-----------gatgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtc 43176741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2228105 - 2227995
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  2228105 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcac 2228006  T
Q  170 ttaaaaatgtg 180  Q
    || ||||||||    
T  2228005 ttcaaaatgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28576282 - 28576184
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28576282 ttttttctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 51224207 - 51224043
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  51224207 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 51224117  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||    
T  51224116 ---aatatgtgcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttg 51224043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 50732083 - 50731986
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  50732083 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50731986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 168
Target Start/End: Original strand, 50780773 - 50780870
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  50780773 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50780870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 48726168 - 48726070
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  48726168 ttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggatacca 48726070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402810
Alignment:
Q  78 agattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaat 47402813  T
Q  178 gtg 180  Q
    |||    
T  47402812 gtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44946099 - 44946014
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatag 155  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44946099 ttttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatag 44946014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 52756214 - 52756070
Alignment:
Q  97 gtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc----ta 192  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || |||||||||||||||    ||    
T  52756214 gtgggttatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatta 52756126  T
Q  193 atgtgtattgg-ttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  52756125 atgtgtattggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 52756070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 40165653 - 40165819
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| || |||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40165653 ttttttctaaattatctttgaaaaataatgg-taatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 40165751  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40165752 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccctggttgtc 40165819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 52434134 - 52434216
Alignment:
Q  64 ttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaa-tttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  52434134 ttatggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 247
Target Start/End: Original strand, 177161 - 177329
Alignment:
Q  69 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| | || ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  177161 attttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatacaa 177260  T
Q  169 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    | |||||| |||           ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  177261 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggagcaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtc 177329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Original strand, 48752086 - 48752161
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 145  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  48752086 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8847827 - 8847718
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||||  || ||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||||    
T  8847827 tttttttaaattacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccact 8847728  T
Q  171 taaaaatgtg 180  Q
    ||||||||||    
T  8847727 taaaaatgtg 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48534122 - 48534012
Alignment:
Q  125 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccat 223  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  48534122 aatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcat 48534034  T
Q  224 ttttccatgggtaccctagttg 245  Q
    | || |||||||| ||||||||    
T  48534033 tctttcatgggtagcctagttg 48534012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429230
Alignment:
Q  164 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtc 30429230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Original strand, 41609098 - 41609178
Alignment:
Q  100 ggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 180  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| || |||| || || ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41609098 ggtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg 41609178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Original strand, 37741436 - 37741487
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaat 121  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37741436 ttttttttagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 51942586 - 51942543
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51942586 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccac 51942543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44946010 - 44945938
Alignment:
Q  176 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||| || |||| ||| ||||||||||    
T  44946010 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtc 44945938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 244
Target Start/End: Original strand, 52434251 - 52434344
Alignment:
Q  141 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccc 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  52434251 gtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccatttttctataggtaccc 52434339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43260882 - 43260842
Alignment:
Q  207 ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  43260882 ggtaaattacccactatttttccatggataccctagttgtc 43260842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 50731965 - 50731917
Alignment:
Q  200 ttggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50731965 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 50731917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 247
Target Start/End: Original strand, 50780891 - 50780939
Alignment:
Q  200 ttggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50780891 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 50780939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 247
Target Start/End: Original strand, 48752226 - 48752282
Alignment:
Q  192 aatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  48752226 aatgtttattggttgggataaattacccacaatttttccatagatatcctagttgtc 48752282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13943 - 13765
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13943 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 13844  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13843 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 13765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 94)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25894098 - 25893920
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25894098 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25893999  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25893998 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 25893920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33423456 - 33423278
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423456 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33423357  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33423356 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 33423278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33839896 - 33839718
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839896 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33839797  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33839796 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtc 33839718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 49171543 - 49171365
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49171543 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 49171444  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  49171443 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 49171365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 66 - 241
Target Start/End: Original strand, 15877548 - 15877724
Alignment:
Q  66 atgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877548 atgactttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 15877647  T
Q  166 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtacccta 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15877648 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 15877724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20166001 - 20165817
Alignment:
Q  64 ttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20166001 ttatgcttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 20165902  T
Q  164 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20165901 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtc 20165817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23393234 - 23393054
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393234 gattttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 23393135  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23393134 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 23393054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 17855430 - 17855608
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17855430 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactac 17855529  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17855530 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 17855608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22979828 - 22979650
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22979828 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 22979729  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22979728 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 22979650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 27018118 - 27018296
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27018118 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccac 27018217  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27018218 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 27018296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33696002 - 33695824
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33696002 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33695903  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33695902 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 33695824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 35355890 - 35356068
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35355890 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 35355989  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35355990 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 35356068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47067158 - 47066980
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47067158 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47067059  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47067058 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 47066980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45690277 - 45690100
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45690277 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 45690178  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45690177 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 45690100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 46913111 - 46913291
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913111 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46913210  T
Q  170 ttaaaaa--tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46913211 ttaaaaatgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 46913291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Original strand, 31586850 - 31587025
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31586850 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 31586949  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  31586950 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtaccctagtt 31587025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 33411262 - 33411440
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411262 ttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33411361  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  33411362 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtc 33411440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35328250 - 35328072
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35328250 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35328151  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35328150 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 35328072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 62 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37846205 - 37846019
Alignment:
Q  62 ttttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  37846205 ttttatggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatg 37846106  T
Q  162 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37846105 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 37846019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47740512 - 47740334
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  47740512 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 47740413  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47740412 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 47740334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2341843 - 2341664
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2341843 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaac 2341744  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccat-gggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2341743 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtc 2341664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 40670565 - 40670743
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40670565 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 40670664  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40670665 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtc 40670743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 45482660 - 45482838
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45482660 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 45482759  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45482760 ttaaaaatatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 45482838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 10028490 - 10028670
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10028490 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 10028589  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatggg--taccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  10028590 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtataccctagttgtc 10028670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 89 - 247
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389536
Alignment:
Q  89 gaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  189 gctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 36389536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 33332791 - 33332968
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33332791 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccac 33332889  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33332890 ttaaaaatatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtc 33332968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48609858 - 48609680
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  48609858 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccac 48609759  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48609758 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtc 48609680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 5712170 - 5712348
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5712170 ttttttctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccac 5712269  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5712270 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtc 5712348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26579898 - 26579720
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26579898 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccac 26579799  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26579798 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 26579720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 247
Target Start/End: Original strand, 31625702 - 31625883
Alignment:
Q  66 atgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31625702 atgattttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggata 31625801  T
Q  166 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31625802 ccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 31625883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5183991 - 5183831
Alignment:
Q  85 ctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5183991 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 5183892  T
Q  185 tgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5183891 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagtt 5183831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35757201 - 35757023
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35757201 ttttttctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccac 35757103  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt--gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35757102 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtc 35757023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41991041 - 41990870
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41991041 gattttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 41990942  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg-ttgggtaaattacccaccatttttccatgggtacc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41990941 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggtacc 41990870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 19563449 - 19563627
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  19563449 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 19563548  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  19563549 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtc 19563627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45063536 - 45063360
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45063536 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccac 45063437  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||    
T  45063436 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtc 45063360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Original strand, 43499487 - 43499662
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43499487 ttttttttagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43499586  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43499587 ttaaaaatatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagtt 43499662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 93 - 247
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29447017
Alignment:
Q  93 aatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  193 atgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29446963 atgtgtattggttggagtaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 29447017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 33870247 - 33870422
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  33870247 ttttttctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccat 33870346  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||||    
T  33870347 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca---ttctatgggtactctagttgtc 33870422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31429661 - 31429478
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31429661 tatggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggat 31429562  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  31429561 accacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtc 31429478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 35767483 - 35767654
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35767483 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggta-------ccccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35767575  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35767576 ttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 35767654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33720217 - 33720070
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33720217 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccac 33720118  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattac 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33720117 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Original strand, 10618295 - 10618468
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||    
T  10618295 tatggttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-------atagttcatgaat 10618387  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10618388 accacttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 10618468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 120 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076530
Alignment:
Q  120 atgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattaccc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  219 accatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  30076558 atcattcttccatggataccctagttgtc 30076530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28234068 - 28233939
Alignment:
Q  119 aatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28234068 aatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaactacc 28233969  T
Q  218 caccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||    
T  28233968 cacctttctttcatgggtaccctagttgtc 28233939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35752204 - 35752037
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  35752204 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 35752113  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  35752112 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 35752037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46817591 - 46817426
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||            
T  46817591 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 46817500  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  46817499 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 46817426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24923194 - 24923027
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||            
T  24923194 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-------- 24923103  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || || |||||||| ||||||||||    
T  24923102 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtc 24923027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 43489220 - 43489387
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  43489220 ttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 43489311  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||    
T  43489312 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtc 43489387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36817015 - 36816850
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  36817015 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 36816924  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  36816923 ---aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttg 36816850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 37127939 - 37128106
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||              
T  37127939 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 37128028  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  37128029 -taaatatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 37128106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44003540 - 44003373
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  44003540 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 44003441  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44003440 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 44003373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 46898186 - 46898019
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||        
T  46898186 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata---- 46898091  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  46898090 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtc 46898019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564495
Alignment:
Q  86 tttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  186 gtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatt 224  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatt 44564495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26941702 - 26941541
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  26941702 ttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 26941611  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtacccta 241  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||| ||||    
T  26941610 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 26941541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 48085860 - 48086021
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  48085860 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 48085951  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtacccta 241  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||    
T  48085952 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagccta 48086021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 2332021 - 2332188
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||            
T  2332021 ttttttctaaattatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatg-------- 2332112  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2332113 ---aatatgtgcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtc 2332188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 21718119 - 21718285
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  21718119 ttttttctaaattacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 21718210  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  21718211 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccattattttt-catgggtagcctagttgtc 21718285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 24228543 - 24228710
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  24228543 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 24228634  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg-ttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||| |||||    
T  24228635 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtc 24228710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 33393330 - 33393497
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33393330 ttttttctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 33393429  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     ||||||           || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33393430 ctaaaaa-----------ggttaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 33393497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 247
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405528
Alignment:
Q  132 aatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttcca 230  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  231 tgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||  |||||||||    
T  44405512 tgggtattctagttgtc 44405528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7876495 - 7876331
Alignment:
Q  73 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||               
T  7876495 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----------- 7876407  T
Q  173 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||||    
T  7876406 aatatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtc 7876331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 247
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904385
Alignment:
Q  135 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgg 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||      
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  234 gtaccctagttgtc 247  Q
    ||| ||||||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtc 41904385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 7257383 - 7257550
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  7257383 ttttttctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccac 7257482  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7257483 ctaaaaaggtg-----------aatgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtc 7257550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 245
Target Start/End: Original strand, 29610631 - 29610802
Alignment:
Q  64 ttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 163  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||      
T  29610631 ttatggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg-- 29610728  T
Q  164 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
             || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| || |||||||| | ||||||    
T  29610729 ---------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcatagttg 29610802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47906934 - 47906763
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  47906934 tatggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 47906838  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggt-aaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
            || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||    
T  47906837 --------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaaattacccatcattttttcatggatagcctagttg 47906763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Original strand, 29098753 - 29098915
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||             
T  29098753 ttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat--------- 29098843  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 246  Q
          || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||    
T  29098844 ------atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgt 29098915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16482953 - 16482847
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16482953 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggataccac 16482854  T
Q  170 ttaaaaa 176  Q
     ||||||    
T  16482853 ctaaaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47460944 - 47460775
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    |||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47460944 gattttttttagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 47460845  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    || ||||||  ||           ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47460844 acctaaaaagatg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtc 47460775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 498365 - 498193
Alignment:
Q  63 tttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 162  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||     
T  498365 tttatggttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg- 498267  T
Q  163 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
              || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||| || ||||||||    
T  498266 ----------aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatggctagcctagttg 498193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15644116 - 15643949
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15644116 ttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccac 15644017  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15644016 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattgattggggtaaattacccaccattttttcatgggtacactagttgtc 15643949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45502986 - 45502819
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| || |||||||           |||||||     
T  45502986 ttttttctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaa-----------gataccat 45502898  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||    
T  45502897 ttaaaaatatgcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtc 45502819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32556776 - 32556640
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||            
T  32556776 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg-------- 32556685  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattac 216  Q
       || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32556684 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 39453651 - 39453558
Alignment:
Q  64 ttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 157  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39453651 ttatggttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 39453558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 39866665 - 39866758
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39866665 gattttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 245
Target Start/End: Original strand, 26371049 - 26371216
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||          
T  26371049 gattttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg------ 26371142  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
         || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||    
T  26371143 -----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttg 26371216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25037678 - 25037516
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  25037678 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-------- 25037587  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctag 242  Q
       || |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||| || |||||||| |||||    
T  25037586 ---aatatgtgcttatgtggctgatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctag 25037516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 39323618 - 39323776
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||        
T  39323618 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata---- 39323713  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||||    
T  39323714 ---------------tgtggctaatgtgtattggttgggtaaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtc 39323776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Original strand, 41855061 - 41855228
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||              
T  41855061 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttca---------- 41855150  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt-ggttgggtaaattacccaccatttttccatgggtac-cctagttgt 246  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  41855151 -taaatatatgcttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatggatactcctagttgt 41855228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 169
Target Start/End: Original strand, 29863017 - 29863116
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  29863017 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggataccac 29863116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 44659846 - 44660010
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||            
T  44659846 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-------- 44659936  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttg 245  Q
       || || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||  ||||||| ||||||||    
T  44659937 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggtagcctagttg 44660010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45237703 - 45237536
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||            
T  45237703 ttttttctaaattacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatg-------- 45237612  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
       || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||  ||||||| | ||||||||    
T  45237611 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtc 45237536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 247
Target Start/End: Original strand, 46103127 - 46103289
Alignment:
Q  74 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||           |    
T  46103127 ttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------a 46103214  T
Q  174 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| || ||||||||  |||||||||    
T  46103215 atatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggtagtctagttgtc 46103289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7720673 - 7720574
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | | | |||| |||||||||||||||||||||    
T  7720673 ttttttcttgattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggataccac 7720574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Original strand, 33455098 - 33455189
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33455098 ttttttctaaattacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 33455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 35484638 - 35484806
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaa-tttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||           
T  35484638 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg------- 35484730  T
Q  169 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
        || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| || |||| || |||||||| |||| |||||    
T  35484731 ----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattgtc 35484806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448508
Alignment:
Q  80 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 179  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T
Q  180 g 180  Q
    |    
T  38448508 g 38448508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30077106 - 30077043
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaa 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30077106 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 35557732 - 35557798
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaattt 136  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35557732 ttttttttagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443605
Alignment:
Q  108 acccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-g 206  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||           ||||| |||||||| |    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgg 37443646  T
Q  207 ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37443645 ggtaaattacccaccatttttttatgggtaccctagttgtc 37443605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 131
Target Start/End: Original strand, 35823292 - 35823353
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagc 131  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35823292 ttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21649549 - 21649442
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaa-tggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || || |  | ||||||||| ||||||||||    
T  21649549 ttttttttagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaatttattagtagatttaagatagtttatggatacca 21649450  T
Q  169 cttaaaaa 176  Q
    | ||||||    
T  21649449 cctaaaaa 21649442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456218
Alignment:
Q  116 accaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatacttcttaaaaat 26456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39453557 - 39453485
Alignment:
Q  176 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  39453557 atgtgtttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 39453485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 105
Target Start/End: Original strand, 42272153 - 42272188
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42272153 ttttttctagattacctttgaagaatggtggctaat 42272188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39737 - 39559
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39737 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 39638  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  39637 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 39559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2048
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1871 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 1970  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1971 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 2048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11312 - 11136
Alignment:
Q  71 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312 tttttctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 11214  T
Q  171 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11213 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 11136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2618 - 2438
Alignment:
Q  65 tatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 164  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2618 tatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggat 2519  T
Q  165 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagtt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  2518 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagtt 2438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 75425 - 75247
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  75425 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccac 75326  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  75325 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtc 75247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 278007 - 278187
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata--cc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  278007 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacccc 278106  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  278107 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 278187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 81 - 247
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176833
Alignment:
Q  81 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  181 cttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtc 176833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19035 - 18857
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19035 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccac 18936  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18935 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtc 18857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 222
Target Start/End: Original strand, 32562 - 32715
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  32562 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccat 32661  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccacca 222  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32662 ttaaaaatgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4773 - 4599
Alignment:
Q  68 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 167  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||      ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4773 gattttttctagattaactttgaataatggtgggtaa------caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggatacc 4680  T
Q  168 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4679 acttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 4599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 3089 - 3258
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  3089 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcac 3179  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  3180 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatggataccttagttgtc 3258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20647 - 20480
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20647 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccac 20548  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20547 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 20480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Original strand, 7084 - 7259
Alignment:
Q  63 tttatgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 161  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7084 tttatggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 7183  T
Q  162 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
               || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  7184 -----------aatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 7259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 14745 - 14912
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14745 ttttgtctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccac 14844  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14845 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtc 14912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 103 - 269
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  103 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaataccac 202  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg-ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 247  Q
     |||||| |||           |||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203 ctaaaaaggtg-----------aatgttaattggttgaggtaaatt-cccaccatttttccatgggtaccctagttgtc 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4725 - 4618
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4725 ttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacca 4626  T
Q  169 cttaaaaa 176  Q
     |||||||    
T  4625 tttaaaaa 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Original strand, 3393 - 3500
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 168  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3393 ttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacca 3492  T
Q  169 cttaaaaa 176  Q
     |||||||    
T  3493 tttaaaaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Original strand, 17907 - 18043
Alignment:
Q  70 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||| ||| || ||| ||||       
T  17907 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatac--- 18003  T
Q  170 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattac 216  Q
            |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18004 --------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19327
Alignment:
Q  80 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag----atagttcatggataccacttaaaa 175  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 19327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University