View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20148_low_32 (Length: 343)

Name: NF20148_low_32
Description: NF20148
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20148_low_32
NF20148_low_32
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (30-328)||(1659477-1659774)
chr8 (30-328)||(36803435-36803733)
chr8 (30-299)||(14029973-14030240)
chr8 (98-319)||(6337431-6337651)
chr8 (142-328)||(37400259-37400448)
chr8 (106-328)||(1656815-1657026)
chr8 (106-328)||(14032709-14032920)
chr8 (106-328)||(6334757-6334967)
chr8 (106-328)||(413872-414088)
chr8 (106-328)||(36798367-36798579)
chr8 (106-270)||(36798645-36798808)
chr8 (106-328)||(1656540-1656753)
chr8 (106-270)||(1657092-1657257)
chr8 (30-202)||(417113-417285)
chr8 (106-270)||(37403690-37403850)
chr8 (158-328)||(37403909-37404074)
chr8 (228-328)||(417018-417118)
chr8 (106-328)||(416742-416957)
chr8 (222-328)||(414207-414313)
chr8 (106-270)||(414376-414536)
chr8 (106-328)||(14032983-14033195)
chr8 (106-328)||(36798092-36798304)
chr8 (106-270)||(14032477-14032641)
chr8 (98-328)||(27276109-27276329)
chr8 (106-328)||(37400510-37400723)
chr8 (106-326)||(6334479-6334692)
chr8 (106-270)||(6335035-6335201)
chr8 (109-279)||(24513149-24513310)
chr8 (222-279)||(23712891-23712948)
chr8 (30-83)||(6337672-6337725)
chr8 (30-83)||(24516648-24516701)
chr8 (106-181)||(37404252-37404322)
chr8 (30-76)||(12877314-12877360)
chr8 (38-83)||(27276343-27276388)
[»] scaffold0035 (5 HSPs)
scaffold0035 (30-328)||(83674-83973)
scaffold0035 (106-328)||(80732-80943)
scaffold0035 (106-328)||(80456-80670)
scaffold0035 (106-270)||(81009-81174)
scaffold0035 (106-328)||(83390-83609)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (30-328)||(5094433-5094734)
chr7 (98-328)||(24050922-24051146)
chr7 (30-318)||(39751798-39752086)
chr7 (106-328)||(5097460-5097676)
chr7 (106-328)||(39754543-39754754)
chr7 (106-328)||(5094795-5095013)
chr7 (106-328)||(24056939-24057155)
chr7 (106-270)||(5097229-5097394)
chr7 (106-328)||(5097737-5097948)
chr7 (106-267)||(24058473-24058631)
chr7 (106-328)||(39754817-39755030)
chr7 (106-270)||(39754310-39754476)
chr7 (246-328)||(24058694-24058776)
chr7 (106-181)||(24058818-24058892)
chr7 (30-83)||(24050844-24050897)
chr7 (30-83)||(24058920-24058973)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (30-328)||(25922547-25922846)
chr4 (99-328)||(23317471-23317699)
chr4 (30-319)||(22161931-22162221)
chr4 (98-328)||(50997566-50997792)
chr4 (106-328)||(22159255-22159466)
chr4 (106-328)||(23314810-23315021)
chr4 (106-328)||(54397896-54398110)
chr4 (106-328)||(23314533-23314747)
chr4 (106-270)||(23315088-23315251)
chr4 (106-328)||(25920711-25920931)
chr4 (106-326)||(22158979-22159191)
chr4 (106-270)||(22159532-22159698)
chr4 (106-258)||(25920994-25921135)
chr4 (106-268)||(50995748-50995902)
chr4 (222-321)||(43433050-43433150)
chr4 (252-328)||(51754549-51754625)
chr4 (106-208)||(54398171-54398263)
chr4 (30-83)||(23317718-23317771)
chr4 (30-83)||(45698611-45698664)
chr4 (30-83)||(50997811-50997864)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (98-328)||(36215621-36215850)
chr2 (30-328)||(40322302-40322599)
chr2 (30-328)||(8264879-8265178)
chr2 (98-277)||(2386748-2386926)
chr2 (106-328)||(2382321-2382532)
chr2 (109-328)||(40325299-40325512)
chr2 (106-328)||(36213508-36213721)
chr2 (106-328)||(36215342-36215555)
chr2 (106-328)||(2382047-2382259)
chr2 (106-328)||(40322660-40322879)
chr2 (106-328)||(8265241-8265462)
chr2 (106-259)||(2382599-2382748)
chr2 (106-270)||(40325076-40325237)
chr2 (106-258)||(36213782-36213924)
chr2 (30-83)||(2386946-2386999)
chr2 (30-83)||(36215870-36215923)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (98-328)||(27261855-27262084)
chr5 (30-328)||(28392578-28392879)
chr5 (30-328)||(31170498-31170795)
chr5 (98-328)||(41873706-41873935)
chr5 (106-328)||(27264773-27264984)
chr5 (106-328)||(31173240-31173451)
chr5 (106-328)||(28395882-28396098)
chr5 (106-328)||(28395608-28395819)
chr5 (106-328)||(27265046-27265259)
chr5 (106-319)||(27262145-27262353)
chr5 (114-270)||(28395377-28395531)
chr5 (106-270)||(41880481-41880645)
chr5 (106-270)||(31173008-31173173)
chr5 (106-270)||(27264549-27264707)
chr5 (106-328)||(41880708-41880923)
chr5 (106-319)||(28392940-28393150)
chr5 (136-328)||(31173513-31173700)
chr5 (222-321)||(20893495-20893595)
chr5 (30-83)||(27261782-27261835)
chr5 (30-83)||(41873631-41873684)
chr5 (222-321)||(20913953-20914053)
chr5 (222-273)||(20921642-20921694)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (30-328)||(3808434-3808732)
chr3 (100-328)||(44175007-44175234)
chr3 (100-328)||(44181707-44181934)
chr3 (106-328)||(44177960-44178171)
chr3 (106-328)||(44184646-44184857)
chr3 (136-328)||(3805904-3806091)
chr3 (106-328)||(44175295-44175513)
chr3 (106-328)||(37975563-37975775)
chr3 (106-270)||(44177729-44177894)
chr3 (105-328)||(7165758-7165973)
chr3 (106-270)||(3806157-3806318)
chr3 (136-328)||(44178233-44178420)
chr3 (106-328)||(33706897-33707109)
chr3 (106-328)||(44181995-44182214)
chr3 (106-328)||(3808160-3808375)
chr3 (106-270)||(44184415-44184577)
chr3 (106-328)||(3805607-3805819)
chr3 (136-322)||(37975314-37975495)
chr3 (222-328)||(44184922-44185028)
chr3 (146-328)||(37981845-37982024)
chr3 (106-243)||(37975837-37975968)
chr3 (142-258)||(33706546-33706655)
chr3 (30-76)||(44174932-44174978)
chr3 (30-76)||(44181632-44181678)
chr3 (235-270)||(37977564-37977599)
chr3 (30-83)||(37975206-37975259)
chr3 (30-66)||(37982039-37982075)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (106-326)||(13848375-13848594)
chr6 (106-328)||(13845774-13845987)
chr6 (106-328)||(13845499-13845712)
chr6 (106-270)||(13846051-13846211)
chr6 (106-328)||(13848098-13848311)
chr6 (30-80)||(13848619-13848669)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (30-295)||(25650513-25650781)
chr1 (98-328)||(8026948-8027177)
chr1 (106-328)||(8029633-8029844)
chr1 (106-270)||(8029401-8029567)
chr1 (105-328)||(8275195-8275413)
chr1 (106-328)||(8029908-8030122)
chr1 (106-279)||(25644866-25645030)
chr1 (222-321)||(21779230-21779330)
chr1 (222-321)||(21824974-21825073)
chr1 (30-83)||(8026876-8026929)
[»] scaffold0265 (2 HSPs)
scaffold0265 (222-321)||(2848-2947)
scaffold0265 (222-321)||(7737-7836)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1659774 - 1659477
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnngcagtgacttataacctagctttagtaaaaat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1659774 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagcgagcaattttttttttttttgcagtgacttataacctagctttagtaaaaat 1659675  T
Q  130 aataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||    
T  1659674 aataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga-ttttttatattgtaaatatc 1659576  T
Q  230 attcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1659575 attcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaatcgaattttgacttattttaggtactatct 1659477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36803733 - 36803435
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnn-gcagtgacttataacctagctttagtaaaaa 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  36803733 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaatttttatttttttttgctgtgacttataatttagctttagtaaaaa 36803634  T
Q  129 taataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||    
T  36803633 taataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga-ttttttatattgtaaatat 36803535  T
Q  229 cattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| || |||||    
T  36803534 ctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaaccaaattatgatttattttagataatatct 36803435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 14029973 - 14030240
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnngcagtgacttataacctagctttagtaaaaat 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||              ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14029973 aatacattttttatgaattaaattcgaatgcaaaaatatgttattagtgagcaattttttttttttt-gcagtgacttataatttagctttagtaaaaat 14030071  T
Q  130 aataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||    
T  14030072 aataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga-ttttttatattgtaaatatc 14030170  T
Q  230 attcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaac 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14030171 tttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaac 14030240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6337651 - 6337431
Alignment:
Q  98 gcagtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 197  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6337651 gcagtgacttataatttaactttagtaaaaataataataatcattttatgtgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 6337552  T
Q  198 cattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatca 297  Q
    |||||||||||       |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6337551 cattcaattga-ttttttatattgtaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatca 6337453  T
Q  298 actgaattttgacttattttag 319  Q
    ||  |||| ||| |||||||||    
T  6337452 accaaattatgatttattttag 6337431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 328
Target Start/End: Original strand, 37400259 - 37400448
Alignment:
Q  142 tttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattct----ttt 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||    |||    
T  37400259 tttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgatttttt-atattgtaaatatcattctttctttt 37400357  T
Q  238 atataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37400358 atatagattcatacttttatatagattcgatgaactagaacattgtttcatttgtgatcaaccgaattttgacttattttagatactatct 37400448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 1656815 - 1657026
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  1656815 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 1656904  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  1656905 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 1657003  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  1657004 atgatttattttaggtactatct 1657026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14032920 - 14032709
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  14032920 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 14032831  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  14032830 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 14032732  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  14032731 atgatttattttaggtactatct 14032709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 6334757 - 6334967
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||    
T  6334757 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aataa-ttcattcaat 6334845  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  6334846 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttataattttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 6334944  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  6334945 atgatttattttaggtactatct 6334967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 413872 - 414088
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  413872 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaa-aatcattttatatgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 413966  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||    
T  413967 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatccaccgaatt 414065  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  414066 atgatttattttaggtactatct 414088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 36798367 - 36798579
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |   |||||||||||    
T  36798367 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatttttcttaaaaaaaaatga---attcattcaat 36798457  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  36798458 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttaaacttttatgtagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 36798556  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||| ||||||||    
T  36798557 atgatttattttagatactatct 36798579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 36798645 - 36798808
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||| | | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  36798645 ttataacctagctttagtatataaaaaaaaaatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaa-aaaaattaattcattcaat 36798743  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36798744 tgatttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 36798808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 1656540 - 1656753
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  1656540 ttataacctagctttagaaaaaaaaa----aatcattttatatgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 1656631  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||    
T  1656632 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatccaccgaatt 1656730  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  1656731 atgatttattttaggtactatct 1656753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 1657092 - 1657257
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagta--aaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattca 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  1657092 ttataacctagctttagtataaaaaaaaaaataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaa-aaaaaagaattcattca 1657190  T
Q  204 attgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    |||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1657191 attgatttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 1657257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 417285 - 417113
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnn-gcagtgacttataacctagctttagtaaaaa 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  417285 aataaattttttatgaattaaattgaaatgcaaaaatatgttattagtgagcaaattttttttttttttgcagtgacttataatttagctttagtaaaaa 417186  T
Q  129 taataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  417185 taataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagt-aatctttcttaaaaaataataataaattcattc 417113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37403850 - 37403690
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||    
T  37403850 ttataacctaggtttagtaaaaaaaaaaa-aatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaa--aaaaaaaaattcattcaat 37403754  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37403753 tga-ttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 37403690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37404074 - 37403909
Alignment:
Q  158 tatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37404074 tatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaattgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatatttttat 37403980  T
Q  258 atagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37403979 atagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaattatgatttattttaggtactatct 37403909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 417118 - 417018
Alignment:
Q  228 tcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  417118 tcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaccgaaatttgacttattttaggtgctatc 417019  T
Q  328 t 328  Q
    |    
T  417018 t 417018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 416957 - 416742
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||| | |    
T  416957 ttataacctagttttagtaaaaaaaaaaa--atcattttat--gtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaaaaatatgaa--tcatttatt 416864  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||    
T  416863 tgatttttt-atattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaaccaaatt 416765  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||| || |||||    
T  416764 atgatttattttagataatatct 416742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 222 - 328
Target Start/End: Original strand, 414207 - 414313
Alignment:
Q  222 taaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  414207 taaatatcattcttttatataaatttatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaattatgatttattttaggt 414306  T
Q  322 actatct 328  Q
    |||||||    
T  414307 actatct 414313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 414376 - 414536
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  414376 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaa-aatcattttatatgtgtatatttataaaatagtaaatatttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 414470  T
Q  206 tga-nnnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    |||        ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  414471 tgattttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 414536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14033195 - 14032983
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||     |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  14033195 ttataacctagctttagtgaaaaaaa-----atcattttatgtgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 14033105  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| || |||||    
T  14033104 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctataacaatgtttcatttgtgatccaccgaatt 14033006  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  14033005 atgatttattttaggtactatct 14032983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 36798092 - 36798304
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||     |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  36798092 ttataacctagctttagtgaaaaaaa-----atcattttatgtgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 36798182  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||    
T  36798183 tgatttttt-atatttttaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatccaccgaatt 36798281  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  36798282 atgatttattttaggtactatct 36798304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14032641 - 14032477
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagta---aaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattc 202  Q
    |||||||||||||||||||   |||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |   ||||||||    
T  14032641 ttataacctagctttagtataaaaaaaaaaaaaaaacattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaaaaatga---attcattc 14032545  T
Q  203 aattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    ||||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14032544 aattgatttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 14032477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27276329 - 27276109
Alignment:
Q  98 gcagtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || || || |      |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| | ||||    
T  27276329 gcagtgacttataacctagctttagaaagaaaaaaaaaa------ttatatgtgtatatttatgaaataataaatctttcttaaaaaa--ata-tgaatt 27276239  T
Q  198 cattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatca 297  Q
    |||||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27276238 cattcatttgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataatgtcatacatttatatagactcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatca 27276140  T
Q  298 actgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    || ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  27276139 accgaattatgatttattttaagtactatct 27276109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 37400510 - 37400723
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataata-ataaattcattcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||     
T  37400510 ttataacctagctttagtaaaaaaaa-----atcattttat--gtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa-aatatatgaat-cattcat 37400600  T
Q  205 ttgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaat 304  Q
    ||||       ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||    
T  37400601 ttgatttttt-atattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttatgatcaaccaaat 37400699  T
Q  305 tttgacttattttaggtactatct 328  Q
    | ||| ||||||||| || |||||    
T  37400700 tatgatttattttagataatatct 37400723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 326
Target Start/End: Original strand, 6334479 - 6334692
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    |||||||||||||||||| | || || ||  |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  6334479 ttataacctagctttagtgagaaaaaaaa--atcattttatgtgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 6334572  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||| || |||||    
T  6334573 tgatttttt-atattttaaatttcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacgacaatgtttcatttgtgatccaccgaatt 6334671  T
Q  306 ttgacttattttaggtactat 326  Q
     ||| ||||||||||||||||    
T  6334672 atgatttattttaggtactat 6334692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 6335035 - 6335201
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttctt-aaaaaataataataaattcattcaa 204  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  6335035 ttataacccagctttagtataaaaaaaataaatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaaaaaaaaatgaattcattcaa 6335134  T
Q  205 ttga-nnnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    ||||        ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6335135 ttgattttttttatattttaaatatcatccttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 6335201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 279
Target Start/End: Original strand, 24513149 - 24513310
Alignment:
Q  109 taacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| |||||||||||||||    
T  24513149 taacctagctttagtaaaaaaaa----aatcattttatatgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaattga 24513240  T
Q  209 nnnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaaca 279  Q
           ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24513241 tttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaaca 24513310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23712948 - 23712891
Alignment:
Q  222 taaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaaca 279  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23712948 taaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaaca 23712891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6337725 - 6337672
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6337725 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaa 6337672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 24516701 - 24516648
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24516701 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaa 24516648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 37404322 - 37404252
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  37404322 ttataacctagctttagtaaaaaaaa-----atcattttatatgtgtatagttatgaagtagtaaatttttcttaa 37404252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 76
Target Start/End: Original strand, 12877314 - 12877360
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattag 76  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12877314 aatacattatttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattag 12877360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27276388 - 27276343
Alignment:
Q  38 ttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27276388 ttttatgaaataatttggaatgctaaaatatgttattagtgagcaa 27276343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 5)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 83973 - 83674
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnn--gcagtgacttataacctagctttagtaaaa 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||                | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  83973 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagcgagcaattttttttttttttttggagtgacttataacctagctttagtaaaa 83874  T
Q  128 ataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaata 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||    
T  83873 ataataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga-ttttttatattgtaaata 83775  T
Q  228 tcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  83774 tcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaatcgaattttgacttattttaggtactatc 83675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 80732 - 80943
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  80732 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 80821  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  80822 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 80920  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  80921 atgatttattttaggtactatct 80943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 80456 - 80670
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  80456 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaat---cattttatatgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 80548  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||    
T  80549 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatccaccgaatt 80647  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  80648 atgatttattttaggtactatct 80670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 81009 - 81174
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagta--aaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattca 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  81009 ttataacctagctttagtataaaaaaaaaaataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaa-aaaaaagaattcattca 81107  T
Q  204 attgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    |||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81108 attgatttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 81174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 83609 - 83390
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataa----attcatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    ||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    | |||||    
T  83609 ttataacctagctttagtaaaaaaaa----aattattttat--gtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaaaaataaaaatatgaatcatt 83516  T
Q  202 caattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactg 301  Q
    || ||||       ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||      
T  83515 catttgatttttt-atattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaacca 83417  T
Q  302 aattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    |||| ||| ||||||||| || |||||    
T  83416 aattatgatttattttagataatatct 83390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 328
Target Start/End: Original strand, 5094433 - 5094734
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnn----gcagtgacttataacctagctttagtaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||                  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5094433 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaattttttttttttttttttgcagtgacttataacctagctttagtaa 5094532  T
Q  126 aaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||    
T  5094533 aaataataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga-ttttttatattgtaaa 5094631  T
Q  226 tatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtacta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5094632 tatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaccgaattttgacttattttaggtacta 5094731  T
Q  326 tct 328  Q
    |||    
T  5094732 tct 5094734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 98 - 328
Target Start/End: Original strand, 24050922 - 24051146
Alignment:
Q  98 gcagtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24050922 gcagtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgt-----tatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 24051016  T
Q  198 cattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatca 297  Q
    |||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24051017 cattcaattgatttttt-atattgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatca 24051115  T
Q  298 actgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24051116 atcgaattttgacttattttaggtactatct 24051146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 318
Target Start/End: Original strand, 39751798 - 39752086
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnn-gcagtgacttataacctagctttagtaaaaa 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39751798 aatacattttttatgaattaaattgaaatgcaaaaatatgttattagtgagcaatttttatttttttttgcagtgacttataatttagctttagtaaaaa 39751897  T
Q  129 taataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||    
T  39751898 taataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga-ttttttatattgtaaatat 39751996  T
Q  229 cattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttatttta 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  39751997 ctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactgcaacaatgtttcatttgtgatcaaccaaattatgatttatttta 39752086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5097676 - 5097460
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  5097676 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaat---cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaaaaa--atgaattcattcaat 5097582  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  5097581 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 5097483  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  5097482 atgatttattttaggtactatct 5097460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39754754 - 39754543
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  39754754 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 39754665  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  39754664 tgatttttt-atattttaaatatcatttttttatataaatttatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 39754566  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  39754565 atgatttattttaggtactatct 39754543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 5094795 - 5095013
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |    
T  5094795 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaa--atcattttat--gtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaaaaaaaataaaatcattcatt 5094890  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||    
T  5094891 tgatttttttatattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaaccaaatt 5094990  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||| || |||||    
T  5094991 atgatttattttagataatatct 5095013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24057155 - 24056939
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||| |    
T  24057155 ttataacctagctttagtaaaaaaaataa--atcattttatatgtatatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa-aatatgaa--tcattcatt 24057061  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||    
T  24057060 tgatttttt-atattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgttttatttgtgatcaaccaaatt 24056962  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  24056961 atgatttattttaggtactatct 24056939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5097394 - 5097229
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagta--aaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattca 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  5097394 ttataacctagctttagtataaaaaaaaaaataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaa-aaaaaagaattcattca 5097296  T
Q  204 attgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    |||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5097295 attgatttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 5097229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5097948 - 5097737
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  5097948 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttataagtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 5097859  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  5097858 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatcaaccgaatt 5097760  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  5097759 atgatttattttaggtactatct 5097737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24058631 - 24058473
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataa--tcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||    
T  24058631 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaaaaaaatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattca 24058536  T
Q  204 attgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcga 267  Q
    |||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24058535 attga-ttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcga 24058473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39755030 - 39754817
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||    ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  39755030 ttataacctagctttagtgaaaaaaa----aatcattttatgtgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 39754939  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| || |||||    
T  39754938 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtcatccaccgaatt 39754840  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     | | ||||||||||||||||||    
T  39754839 ataatttattttaggtactatct 39754817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39754476 - 39754310
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagta----aaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcatt 201  Q
    |||||||||||||||||||    |||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || ||||||||    
T  39754476 ttataacctagctttagtataaaaaaaaaaaaaaaattattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaaaaa--atgaattcatt 39754379  T
Q  202 caattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
     ||||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39754378 gaattgatttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 39754310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24058776 - 24058694
Alignment:
Q  246 tcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24058776 tcattcttttttatagattcgatgaactacaacatcgtttcatttgtgatcaaccgaattatgatttattttaggtactatct 24058694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24058892 - 24058818
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  24058892 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaa-aatcattttatatgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaa 24058818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 24050844 - 24050897
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24050844 aatacattttttatgcattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaa 24050897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 24058973 - 24058920
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||    
T  24058973 aatatattttttatgaaataatttggaattcaaaattatgttattagtgagcaa 24058920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25922846 - 25922547
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnn--gcagtgacttataacctagctttagtaaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||                ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25922846 aatatattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaattttttttttttttttgcagtgacttataacctagctttagtaaaa 25922747  T
Q  128 ataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaata 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||| |||||||    
T  25922746 ataataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataaaaataaattcattcaattga-ttttttatattgtaaata 25922648  T
Q  228 tcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25922647 tcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaccaaattttgacttattttaggtactatc 25922548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23317699 - 23317471
Alignment:
Q  99 cagtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattc 198  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23317699 cagtgacttataatttagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattc 23317600  T
Q  199 attcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaa 298  Q
    ||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23317599 attcaattga-ttttttatattgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaa 23317501  T
Q  299 ctgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    |  |||| ||| ||||||||| || |||||    
T  23317500 ccaaattatgatttattttagataatatct 23317471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22162221 - 22161931
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnn--gcagtgacttataacctagctttagtaaaa 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||                ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22162221 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaattttttatttttttttgcagtgacttataatttagctttagtaaaa 22162122  T
Q  128 ataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaata 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||    
T  22162121 ataataataatcattttatgtgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga-ttttttatattgtaaata 22162023  T
Q  228 tcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttag 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  22162022 tctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaaccaaattatgatttattttag 22161931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 50997792 - 50997566
Alignment:
Q  98 gcagtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 197  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50997792 gcagtgacttataatttagctttagtaaaaaaaaaaat---cattttatatgtgtataattatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 50997696  T
Q  198 cattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatca 297  Q
    |||||||||||       |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50997695 cattcaattgatttttt-atattgtaaatatcattattttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatca 50997597  T
Q  298 actgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    ||  |||| ||| ||||||||| || |||||    
T  50997596 accaaattatgatttattttagataatatct 50997566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 22159255 - 22159466
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  22159255 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 22159344  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  22159345 tgagttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttataattttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 22159443  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  22159444 atgatttattttaggtactatct 22159466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 23314810 - 23315021
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    ||| ||||||||||||    
T  23314810 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttttttaaaaa----aatgaattcattcaat 23314899  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||    
T  23314900 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatatagattagatgaactacaacattgtttcattagtgatcaaacgaatt 23314998  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  23314999 atgatttattttaggtactatct 23315021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 54397896 - 54398110
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||   |||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  54397896 ttataacctagctttattaaaaaaaaaaat---cattttatatgtgtataattatgaagtagtacatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 54397988  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  54397989 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatcaaccgaatt 54398087  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  54398088 atgatttattttaggtactatct 54398110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 23314533 - 23314747
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||   |||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  23314533 ttataacctagctttagtgaaaaaaaaaat---cattttatgtgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 23314625  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||    
T  23314626 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatccaccgaatt 23314724  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  23314725 atgatttattttaggtactatct 23314747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 23315088 - 23315251
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  23315088 ttataacctagctttagtataaaaaaaaa-aatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaa-aaaaatgaattcattcaat 23315185  T
Q  206 tga-nnnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    |||        ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23315186 tgattttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 23315251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 25920711 - 25920931
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataa-tcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| |||||||||||    
T  25920711 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaaaaaatcattttatatgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaa 25920806  T
Q  205 ttgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttat--ataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactga 302  Q
    ||||       ||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || | ||||||||||||||||| ||    
T  25920807 ttgatttttt-atattttaaatatcattcttttttttataaattcatacttttatataaattcgacgacctacagcaatgtttcatttgtgatcaaccga 25920905  T
Q  303 attttgacttattttaggtactatct 328  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25920906 attatgatttattttaggtactatct 25920931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 326
Target Start/End: Original strand, 22158979 - 22159191
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||   |||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  22158979 ttataacctagctttagtgaaaaaaaaaat---cattttatgtgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 22159071  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||| || |||||    
T  22159072 tgatttttt-atattttaaatttcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacgacaatgtttcatttgtgatccaccgaatt 22159170  T
Q  306 ttgacttattttaggtactat 326  Q
     ||| ||||||||||||||||    
T  22159171 atgatttattttaggtactat 22159191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 22159532 - 22159698
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttctt-aaaaaataataataaattcattcaa 204  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  22159532 ttataacccagctttagtataaaaaaaataaatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaaaaaaaaatgaattcattcaa 22159631  T
Q  205 ttga-nnnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    ||||        ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22159632 ttgattttttttatattttaaatatcatccttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 22159698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 258
Target Start/End: Original strand, 25920994 - 25921135
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  25920994 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 25921083  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttata 258  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25921084 tga-ttttttatattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttata 25921135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 50995748 - 50995902
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||||| | |    ||| ||||||||||||    
T  50995748 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaat---cattttatatatgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagata----aatgaattcattcaat 50995840  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgat 268  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50995841 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgat 50995902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 43433150 - 43433050
Alignment:
Q  222 taaatatcattcttttatataaattcatact-tttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttagg 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  43433150 taaatattattcttttatataaattcatactatttatctagatttgatgaactacaacaatgttttatttgtgatcaaccgaattatgatttattttagg 43433051  T
Q  321 t 321  Q
    |    
T  43433050 t 43433050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 328
Target Start/End: Original strand, 51754549 - 51754625
Alignment:
Q  252 ttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  51754549 ttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaattatgatttattttaggtactatct 51754625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 208
Target Start/End: Original strand, 54398171 - 54398263
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  54398171 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 54398260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 23317771 - 23317718
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  23317771 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttatcagtgagcaa 23317718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 45698611 - 45698664
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45698611 aatacattttttatgaattaaattgaaatgcaaaaatatgttattagtgagcaa 45698664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 50997864 - 50997811
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  50997864 aatacattttttatgaattaaattggaatgtaaaaatatgttattagtgagcaa 50997811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 98 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36215850 - 36215621
Alignment:
Q  98 gcagtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36215850 gcagtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 36215751  T
Q  198 cattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatca 297  Q
    |||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36215750 cattcaattga-ttttttatattgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatca 36215652  T
Q  298 actgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36215651 accgaattttgacttattttaggtactatct 36215621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 328
Target Start/End: Original strand, 40322302 - 40322599
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnngcagtgacttataacctagctttagtaaaaat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||              ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40322302 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaattttttttttttttgcagtgacttataatttagctttagtaaaaat 40322401  T
Q  130 aataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatc 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||    
T  40322402 aataataataattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga-ttttttatattgtaaatatc 40322500  T
Q  230 attcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40322501 attcttttatataaatgcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaccgaattttgacttattttaggtaccatct 40322599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 328
Target Start/End: Original strand, 8264879 - 8265178
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnn--gcagtgacttataacctagctttagtaaaa 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||                ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8264879 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaattttttttttttttttgcagtgacttataacctagctttagtaaaa 8264978  T
Q  128 ataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaata 227  Q
    |||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||    
T  8264979 ataataatcatcattttgaatatgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaataataataaattcattcaattgatttttt-atattgtaaata 8265077  T
Q  228 tcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatc 327  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8265078 tcattattttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaccgaattttgacttattttaggtactatc 8265177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2386926 - 2386748
Alignment:
Q  98 gcagtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 197  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2386926 gcagggacttataatttagctttagtaaaaataataataatcattttatatgggtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaataataataaatt 2386827  T
Q  198 cattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaa 277  Q
    |||||||||||       |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2386826 cattcaattga-ttttttatattggaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaa 2386748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 2382321 - 2382532
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  2382321 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 2382410  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  2382411 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 2382509  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  2382510 atgatttattttaggtactatct 2382532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40325512 - 40325299
Alignment:
Q  109 taacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga 208  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| |||||||||||||||    
T  40325512 taacctagctttagtaaaaaaaaaaa-aatcattttatatgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaattga 40325418  T
Q  209 nnnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttg 308  Q
           ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||    
T  40325417 tttttt-atattttaaatatcatttttttttataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaattatg 40325319  T
Q  309 acttattttaggtactatct 328  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  40325318 atttattttaggtactatct 40325299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 36213508 - 36213721
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||  |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  36213508 ttataacctagctttagtaaaaaaaa----aatcattttatatgtgtataattatgaagtagtaaacttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 36213599  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  36213600 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatcaaccgaatt 36213698  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  36213699 atgatttattttaggtactatct 36213721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36215555 - 36215342
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||  ||||||| |    
T  36215555 ttataacctagctttagtaaaaaaaa----aatcattttat--gtgtatatttatgaaatagtaattctttcttaaaaaaaaatatgaa--tcattcatt 36215464  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||    
T  36215463 tgatttttt-atattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaaccaaatt 36215365  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||| || |||||    
T  36215364 atgatttattttagataatatct 36215342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 2382047 - 2382259
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  2382047 ttataacctagctttagtaaaaaaaa-----atcattttatgggtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 2382137  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||    
T  2382138 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatccaccgaatt 2382236  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  2382237 atgatttattttaggtactatct 2382259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 40322660 - 40322879
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataa--tcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattca 203  Q
    |||||||||||| |||||||||| || || ||  |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||  |||||||    
T  40322660 ttataacctagcattagtaaaaaaaaaaaaaaaatcattttat--gtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaaaaatatgaa--tcattca 40322755  T
Q  204 attgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaa 303  Q
     ||||       ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||    
T  40322756 tttgatttttt-atattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaaccaaa 40322854  T
Q  304 ttttgacttattttaggtactatct 328  Q
    || ||| ||||||||| || |||||    
T  40322855 ttatgatttattttagataatatct 40322879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 8265241 - 8265462
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataa--tcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataata-ataaattcattc 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || || ||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||| |||||    
T  8265241 ttataacctagcttttgtaaaaaaaaaaaaaaaatcattttat--gtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaaaaaaatatgaat-cattc 8265337  T
Q  203 aattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactga 302  Q
    | ||||       ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   |    
T  8265338 atttgatttttt-atattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaatcaa 8265436  T
Q  303 attttgacttattttaggtactatct 328  Q
    ||| ||| ||||||||| || |||||    
T  8265437 attatgatttattttagataatatct 8265462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 259
Target Start/End: Original strand, 2382599 - 2382748
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  2382599 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaat---cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaa-aaaaatgaattcattcaat 2382694  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatat 259  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2382695 tgatttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcataattttatat 2382748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40325237 - 40325076
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||  | || || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  40325237 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaaaaaaaaatt-atttgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaaaaa--atgaattcattcaat 40325141  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40325140 tgatttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 40325076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 258
Target Start/End: Original strand, 36213782 - 36213924
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  36213782 ttataacctagctttagttaaaaaaa-----atcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 36213872  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttata 258  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36213873 tga-ttttttatattttaaatatcattcttttatataaatttatatttttata 36213924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 2386999 - 2386946
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  2386999 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattattgagcaa 2386946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 36215923 - 36215870
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  36215923 aatacatttttcatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaa 36215870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 98 - 328
Target Start/End: Original strand, 27261855 - 27262084
Alignment:
Q  98 gcagtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261855 gcagtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 27261954  T
Q  198 cattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatca 297  Q
    |||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27261955 cattcaattga-ttttttatattgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatca 27262053  T
Q  298 actgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27262054 atcgaattttgacttattttaggtactatct 27262084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 30 - 328
Target Start/End: Original strand, 28392578 - 28392879
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnn----gcagtgacttataacctagctttagtaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||                  ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28392578 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaattttttttttttttttttgcagtgacttataatttagctttagtaa 28392677  T
Q  126 aaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||    
T  28392678 aaataataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga-ttttttatattgtaaa 28392776  T
Q  226 tatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtacta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  28392777 tatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaccgaattttaacttattttaggtacta 28392876  T
Q  326 tct 328  Q
    |||    
T  28392877 tct 28392879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 328
Target Start/End: Original strand, 31170498 - 31170795
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnngcagtgacttataacctagctttagtaaaaat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||              ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  31170498 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaatattttttttttttgcagtgacttataatttagctttagtagaaat 31170597  T
Q  130 aataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatc 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||    
T  31170598 aataataattattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga-ttttttatattgtaaatatc 31170696  T
Q  230 attcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| || |||||    
T  31170697 tttcttttatataaattcatatttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaaccaaattatgatttattttagataatatct 31170795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 98 - 328
Target Start/End: Original strand, 41873706 - 41873935
Alignment:
Q  98 gcagtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 197  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41873706 gcagggacttataatttagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 41873805  T
Q  198 cattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatca 297  Q
    |||||||||||       |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41873806 cattcaattga-ttttttatattgtaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatca 41873904  T
Q  298 actgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    ||  |||| ||| ||||||||| || |||||    
T  41873905 accaaattatgatttattttagataatatct 41873935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27264984 - 27264773
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  27264984 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 27264895  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  27264894 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 27264796  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  27264795 atgatttattttaggtactatct 27264773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31173451 - 31173240
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  31173451 ttataacctagctttagtaaaaaaaattat------tttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 31173362  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  31173361 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatatagattcgatgaactaaaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 31173263  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  31173262 atgatttattttaggtactatct 31173240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28396098 - 28395882
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  28396098 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaa-aatcattttatatgtgtataattatgaaatagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 28396004  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||    
T  28396003 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatccaccgaatt 28395905  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  28395904 atgatttattttaggtactatct 28395882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28395819 - 28395608
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  28395819 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 28395730  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||    
T  28395729 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatatacattcaatgaactacaacattgtttcatttgtgagcaaacaaatt 28395631  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  28395630 atgatttattttaggtactatct 28395608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27265259 - 27265046
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  27265259 ttataacctagctttagtaaaaaaaa----aatcattttatatgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 27265168  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||    
T  27265167 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatccaccgaatt 27265069  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| |||||||||||| |||||    
T  27265068 atgatttattttaggtattatct 27265046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 319
Target Start/End: Original strand, 27262145 - 27262353
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataa-tcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||| ||||||     
T  27262145 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaaaaaatcattttat--gtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaaaaa--atgaat-cattcat 27262239  T
Q  205 ttgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaat 304  Q
    ||||       ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||    
T  27262240 ttgatttttt-atattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaaccaaat 27262338  T
Q  305 tttgacttattttag 319  Q
    | ||| |||||||||    
T  27262339 tatgatttattttag 27262353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28395531 - 28395377
Alignment:
Q  114 tagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnn 213  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||||         
T  28395531 tagctttagtaaaaaaaaaaaaaatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaa--aaaaatgaattcattcaattgattttt 28395434  T
Q  214 nnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
      ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28395433 ttatattttaaatatcattcttttatataaatgcatacttttatatagattcgatga 28395377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41880645 - 41880481
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagta-aaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  41880645 ttataacctagctttagtataaaaaaaaaaaaatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaa-aaaaatgaattcattcaa 41880547  T
Q  205 ttgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    || |       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41880546 ttaatttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatatttttatatagattcgatga 41880481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31173173 - 31173008
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagta--aaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattca 203  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  31173173 ttataacatagctttagtataaaaaaaaaaaaaatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaa-aaaaatgaattcattca 31173075  T
Q  204 attgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    |||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31173074 attgatttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttacatagattcgatga 31173008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27264707 - 27264549
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||    
T  27264707 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaa--atcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaa---aaaaaaaaattcattcaat 27264613  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27264612 tga-ttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 27264549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41880923 - 41880708
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||| ||||||    
T  41880923 ttataacctagctttagtgaaaaaaaaaa--atcattttatgtgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattctttcaat 41880830  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  | |||||    
T  41880829 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatcccccgaatt 41880731  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  41880730 atgatttattttaggtactatct 41880708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 319
Target Start/End: Original strand, 28392940 - 28393150
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataat-cattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataata-ataaattcattca 203  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||    
T  28392940 ttataacctaactttagtgaaaaaaataataattcattttat--gtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa-aatatatgaat-cattca 28393035  T
Q  204 attgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaa 303  Q
     |||        ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||    
T  28393036 tttg-tttttttatattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttttgatcaaccaaa 28393134  T
Q  304 ttttgacttattttag 319  Q
    || ||| |||||||||    
T  28393135 ttatgatttattttag 28393150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31173700 - 31173513
Alignment:
Q  136 aatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattctt 235  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| |||||||||||||||       ||||  ||||||||||||||    
T  31173700 aatcattttatgtgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaattgatttttt-atattttaaatatcattctt 31173606  T
Q  236 ttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31173605 ttttataaattcatacttttacatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatccaccgaattatgatttattttaggtactatct 31173513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Original strand, 20893495 - 20893595
Alignment:
Q  222 taaatatcattcttttatataaattcatact-tttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttagg 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  20893495 taaatattattcttttatataaattcatactatttatctagattcgatgaactacaacaatgttttatttgtgatcaaccgaattatgatttattttagg 20893594  T
Q  321 t 321  Q
    |    
T  20893595 t 20893595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 27261782 - 27261835
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27261782 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaa 27261835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 41873631 - 41873684
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41873631 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaa 41873684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20914053 - 20913953
Alignment:
Q  222 taaatatcattcttttatataaattcatact-tttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttagg 320  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |  | |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  20914053 taaatattattcttttatataatttcatactatttatctagattcgatgaactacaaaaaaaaattatttgtaatcaaccgaattatgatttattttagg 20913954  T
Q  321 t 321  Q
    |    
T  20913953 t 20913953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20921694 - 20921642
Alignment:
Q  222 taaatatcattcttttatataaattcatact-tttatatagattcgatgaact 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20921694 taaatattattcttttatataaattcatactatttatctagattcgatgaact 20921642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3808732 - 3808434
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnn-gcagtgacttataacctagctttagtaaaaa 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3808732 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaatatttttttttttttgcagtgacttataacctagctttagtaaaaa 3808633  T
Q  129 taataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatat 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||    
T  3808632 taataataataattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga-ttttttatattgtaaatat 3808534  T
Q  229 cattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3808533 tattattttatataaattcatacttttatatagattcgattaactacaacattgtttcatttgtgatcaatcgaattttgacttattttaggtactatct 3808434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 328
Target Start/End: Original strand, 44175007 - 44175234
Alignment:
Q  100 agtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattca 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44175007 agtgacttataatttagctttagtaataataataatattcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattca 44175106  T
Q  200 ttcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaac 299  Q
    |||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44175107 ttcaattgatttttt-atattgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaac 44175205  T
Q  300 tgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44175206 cgaattttgacttattttaggtactatct 44175234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 328
Target Start/End: Original strand, 44181707 - 44181934
Alignment:
Q  100 agtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattca 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44181707 agtgacttataatttagctttagtaataataataatattcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattca 44181806  T
Q  200 ttcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaac 299  Q
    |||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44181807 ttcaattgatttttt-atattgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaac 44181905  T
Q  300 tgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44181906 cgaattttgacttattttaggtactatct 44181934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44178171 - 44177960
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  44178171 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 44178082  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  44178081 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 44177983  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  44177982 atgatttattttaggtactatct 44177960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44184857 - 44184646
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  44184857 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 44184768  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  44184767 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 44184669  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| |||||||||||| |||||    
T  44184668 atgatttattttaggtattatct 44184646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 328
Target Start/End: Original strand, 3805904 - 3806091
Alignment:
Q  136 aatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattctt 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||       ||||  ||||||||||||||    
T  3805904 aatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaattgatttttt-atattttaaatatcattctt 3805998  T
Q  236 ttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  3805999 ttatataaatttatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaattatgatttattttatgtactatct 3806091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 44175295 - 44175513
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |    
T  44175295 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaa--atcattttat--gtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaaaaaaaataatatcattcatt 44175390  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||    
T  44175391 tgatttttttatattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaaccaaatt 44175490  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||| || |||||    
T  44175491 atgatttattttagataatatct 44175513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 37975563 - 37975775
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  37975563 ttataacctagctttagtaaaaaaaa-----atcattttatatgtatatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 37975653  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  37975654 tgatttttt-atatttaaaatatcattcttttatataaatttatacttttttataaattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 37975752  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  37975753 atgatttattttaggtactatct 37975775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44177894 - 44177729
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagta--aaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattca 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  44177894 ttataacctagctttagtataaaaaaaaaaataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaa-aaaaaagaattcattca 44177796  T
Q  204 attgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    |||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44177795 attgatttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 44177729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 7165973 - 7165758
Alignment:
Q  105 cttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataata-ataaattcattca 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||    
T  7165973 cttataacctagctttagttcaaa--ataaaaatcattttat--gtgtatatttatgaaatagtaaatcttt--taaaaaa-aatatatgaattcattca 7165881  T
Q  204 attgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaa 303  Q
     ||||       ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7165880 tttgattttt--atattttaaatatcattctttaatataaattcatacttttatttagatttgatgaactacaacaatatttcatttgtgataaactgaa 7165783  T
Q  304 ttttgacttattttaggtactatct 328  Q
    || ||| ||||||||||||||||||    
T  7165782 ttgtgatttattttaggtactatct 7165758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 3806157 - 3806318
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataa-tcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| |||| ||||||    
T  3806157 ttataacctagctttagtaaaaaaaataaaaaatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaa---aaaaattaattaattcaa 3806253  T
Q  205 ttgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3806254 ttga-ttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 3806318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44178420 - 44178233
Alignment:
Q  136 aatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattctt 235  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| |||||||||||||||       ||||  ||||||||||||||    
T  44178420 aatcattttatatgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaattgatttttt-atattttaaatatcattctt 44178326  T
Q  236 ttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44178325 ttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatccaccgaattatgatttattttaggtactatct 44178233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33707109 - 33706897
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  33707109 ttataacctagctttagtaaaaaaaa-----atcattttatatgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 33707019  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  33707018 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctgcaacaatgtttcatttgtgatcaaccgaatt 33706920  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     | | |||||||||||| |||||    
T  33706919 ataatttattttaggtattatct 33706897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 44181995 - 44182214
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataa----attcatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    | |||||    
T  44181995 ttataacctagctttagtaaaaaaaa----aatcattttat--gtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaaaaaaaaaaatatgaatcatt 44182088  T
Q  202 caattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactg 301  Q
    || ||||       ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||      
T  44182089 catttgatttttt-atattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaacca 44182187  T
Q  302 aattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    |||| ||| ||||||||| || |||||    
T  44182188 aattatgatttattttagataatatct 44182214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3808375 - 3808160
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataa-attcattcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | |||||||     
T  3808375 ttataacctagctttagtaaaaaaaa-----atcattttat--gtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaaaaaaaatatgaatcattcat 3808283  T
Q  205 ttgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaat 304  Q
    ||||       ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||    
T  3808282 ttgatttttt-atattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttttgatcaaccaaat 3808184  T
Q  305 tttgacttattttaggtactatct 328  Q
    | ||| ||||||||| || |||||    
T  3808183 tatgatttattttagataatatct 3808160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44184577 - 44184415
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataa-taatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  44184577 ttataacctagctttagtaaaaaaaaaaaataat-attttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaa--aaaaatgaattcattcaa 44184481  T
Q  205 ttgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44184480 ttgatttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcaatga 44184415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 3805607 - 3805819
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  3805607 ttataacctagctttagtaaaaaaaa-----atcattttatatgtgtataattatgaagtagtacatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 3805697  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  3805698 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatacattcgatgacctacgacaatgtttcatttgtgatcaaccgaatt 3805796  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     | | ||||||||||||||||||    
T  3805797 ataatttattttaggtactatct 3805819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 322
Target Start/End: Original strand, 37975314 - 37975495
Alignment:
Q  136 aatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattctt 235  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| |||||||||||||||       ||||  ||||||||||||||    
T  37975314 aatcattttatatgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaattgatttttt-atattttaaatatcattctt 37975408  T
Q  236 ttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggta 322  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  37975409 ttttataaattcatacttttatatagattcgataacctacaacaatgtttcatttgtgatcaaccgaattatgatttattttaggta 37975495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 222 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44185028 - 44184922
Alignment:
Q  222 taaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggt 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||    
T  44185028 taaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatccaccgaattatgatttattttaggt 44184929  T
Q  322 actatct 328  Q
    |||||||    
T  44184928 actatct 44184922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37982024 - 37981845
Alignment:
Q  146 tatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaat 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||| ||||       ||||   ||||||| |||||||||||||||    
T  37982024 tatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaaaaatatgaa--tcattcatttgatttttt-atatttaaaatatctttcttttatataaat 37981928  T
Q  246 tcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||| | | ||||||||| || |||||    
T  37981927 tcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatcaaccaaattataatttattttagataatatct 37981845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 243
Target Start/End: Original strand, 37975837 - 37975968
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  37975837 ttataacctagctctagtaaaaaaaaaaat---cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttctt-aaaaataa-aatgaattcattcaat 37975931  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataa 243  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37975932 tga-ttttttatattttaaatatcattcttttatataa 37975968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33706655 - 33706546
Alignment:
Q  142 tttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatat 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    ||| |||||||||||||||       ||||  ||||||||||||||||||||    
T  33706655 tttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatcttt--taaaaaa----aatgaattcattcaattgatttttt-atattttaaatatcattcttttatat 33706563  T
Q  242 aaattcatacttttata 258  Q
    ||||| |||||||||||    
T  33706562 aaatttatacttttata 33706546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 76
Target Start/End: Original strand, 44174932 - 44174978
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattag 76  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44174932 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattag 44174978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 76
Target Start/End: Original strand, 44181632 - 44181678
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattag 76  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44181632 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattag 44181678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 270
Target Start/End: Original strand, 37977564 - 37977599
Alignment:
Q  235 tttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37977564 tttatataaattcatacttttatatagattcgatga 37977599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 37975206 - 37975259
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||    
T  37975206 aatatattttttatgaaataatttggaattcaaaattatgttattagtgagcaa 37975259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 37982075 - 37982039
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaat 66  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37982075 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaat 37982039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 106 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13848594 - 13848375
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13848594 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 13848495  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13848494 tga-ttttttatattgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaatattgtttcatttgtgatcaaccgaatt 13848396  T
Q  306 ttgacttattttaggtactat 326  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13848395 ttgacttattttaggtactat 13848375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 13845774 - 13845987
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  13845774 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 13845863  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttata--tagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaa 303  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  13845864 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaa 13845962  T
Q  304 ttttgacttattttaggtactatct 328  Q
    || ||| ||||||||||||||||||    
T  13845963 ttatgatttattttaggtactatct 13845987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 13845499 - 13845712
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  13845499 ttataacctagctttagtaaaaaaaa----aatcattttatatgtgtataattatgaagtagtaattttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 13845590  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  13845591 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatcaaccgaatt 13845689  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| |||||||||||| |||||    
T  13845690 atgatttattttaggtattatct 13845712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 13846051 - 13846211
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  13846051 ttataaactagctttagtaaaaaaaaaaa-aatcattttttatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaa--aaaaatgaattcattcaat 13846147  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13846148 tga-ttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttaaatagattcgatga 13846211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13848311 - 13848098
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||| |    
T  13848311 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttat--gtgtataattatgaaatagtaaatctttcttaaaaaaaaaaaaaaatatcattcatt 13848220  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||  ||||    
T  13848219 tgatttttttatattttaaatatctttcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacaatgtttta-ttgtgatcaaccaaatt 13848121  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| |||| |||| || |||||    
T  13848120 atgatttatattagataatatct 13848098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 13848669 - 13848619
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgag 80  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  13848669 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgag 13848619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25650781 - 25650513
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaannnnnnnnnnnnnn----gcagtgacttataacctagctttagtaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||                  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25650781 aatacattttttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaaatttttttttttttttttgcagtgacttataacttagctttagtaa 25650682  T
Q  126 aaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattgannnnnnnatatcgtaaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||    
T  25650681 aaataataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaattga-ttttttatattgtaaa 25650583  T
Q  226 tatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgat 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25650582 tatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgat 25650513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 328
Target Start/End: Original strand, 8026948 - 8027177
Alignment:
Q  98 gcagtgacttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaatt 197  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8026948 gcagtgacttatgatttagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatcttttttaaaaaataataataaatt 8027047  T
Q  198 cattcaattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatca 297  Q
    |||||||||||       |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8027048 cattcaattga-ttttttatattgtaaatatctttcttttatataaattcatacttctatatagattcgatgaactacaacaatgtttcatttgtgatca 8027146  T
Q  298 actgaattttgacttattttaggtactatct 328  Q
    ||  |||| ||| ||||||||| || |||||    
T  8027147 accaaattatgatttattttagataatatct 8027177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8029844 - 8029633
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  8029844 ttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa----aatgaattcattcaat 8029755  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  8029754 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatatagattcgatgaactacaacattgtttcatttgtgatcaaacgaatt 8029656  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  8029655 atgatttattttaggtactatct 8029633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8029567 - 8029401
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagta---aaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattc 202  Q
    |||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||    
T  8029567 ttataacctagctttagtatataaaaaaaaaataatcattttatatgtgtatatttatgaaatagtaaatatttcttaaaaaa-aaaaaagaattcattc 8029469  T
Q  203 aattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 270  Q
    ||||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8029468 aattgatttttttatattttaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatga 8029401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8275413 - 8275195
Alignment:
Q  105 cttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaa-taataa-taaattcattc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||    
T  8275413 cttataacctagctttagtaaaaaaaat------cattttatatgtgtatatttatcaattagtaaatctttcttaaaaaaataataaatgaatttattc 8275320  T
Q  203 aattgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactga 302  Q
    | ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  8275319 atttgaatattt-atattttaaatatcattcttttatataaatttatacttttatctagattcaatgaactacaacaatatttaattcgtgatcaactga 8275221  T
Q  303 attttgacttattttaggtactatct 328  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  8275220 attgtgatttattttaggtattatct 8275195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8030122 - 8029908
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||   |||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  8030122 ttataacctagctttagtgaaaaaaaaaat---cattttatgtgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 8030030  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaatt 305  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||    
T  8030029 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacgtttatatagattcgatgacctacaacaatgtttcatttgtgatccaccgaatt 8029931  T
Q  306 ttgacttattttaggtactatct 328  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  8029930 atgatttattttaggtactatct 8029908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 25644866 - 25645030
Alignment:
Q  106 ttataacctagctttagtaaaaataataataatcattttatatgtgtgtatttatgaaatagtaaatctttcttaaaaaataataataaattcattcaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||| ||||||||||||    
T  25644866 ttataacctagctttagtaaaaaaaa----aatcattttatatgtgtataattatgaagtagtaaatttttcttaagaaa----aatgaattcattcaat 25644957  T
Q  206 tgannnnnnnatatcgtaaatatcattcttttatataaattcatacttttatatagattcgatgaactacaaca 279  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25644958 tgatttttt-atattttaaatatcattcttttttataaattcatacttttatatagattcgatgacctacaaca 25645030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Original strand, 21779230 - 21779330
Alignment:
Q  222 taaatatcattcttttatataaattcatact-tttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttagg 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  21779230 taaatattattcttttatataaattcatactatttatctagattcgatgaactacaacaatgttttatttatgatcaaccgaactatgatttattttagg 21779329  T
Q  321 t 321  Q
    |    
T  21779330 t 21779330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21825073 - 21824974
Alignment:
Q  222 taaatatcattcttttatataaattcatact-tttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttagg 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |  | ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  21825073 taaatattattcttttatataaattcatactatttatctagattcgatgaactacaaaaaaaaat-atttgtgatcaaccgaattatgatttattttagg 21824975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 8026876 - 8026929
Alignment:
Q  30 aatatattttttatgaattaaattggaatgccaaaatatgttattagcgagcaa 83  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8026876 aatacattatttatgaattaaattggaatgcaaaaatatgttattagtgagcaa 8026929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Original strand, 2848 - 2947
Alignment:
Q  222 taaatatcattcttttatataaattcatact-tttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttagg 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |  | ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  2848 taaatattattcttttatataaattcatactatttatctagattcgatgaactacaaaaaaaaat-atttgtgatcaaccgaattatgatttattttagg 2946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Original strand, 7737 - 7836
Alignment:
Q  222 taaatatcattcttttatataaattcatact-tttatatagattcgatgaactacaacattatttcatttgtgatcaactgaattttgacttattttagg 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |  | ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  7737 taaatattattcttttatataaattcatactatttatctagattcgatgaactacaaaaaaaaat-atttgtgatcaaccgaattatgatttattttagg 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University