View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20153_low_3 (Length: 764)

Name: NF20153_low_3
Description: NF20153
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20153_low_3
NF20153_low_3
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (282-742)||(12257855-12258318)
chr2 (544-745)||(12235117-12235317)
chr2 (573-745)||(11999822-11999994)
chr2 (570-745)||(7542654-7542829)
chr2 (282-478)||(7543242-7543438)
chr2 (267-474)||(14705432-14705639)
chr2 (279-475)||(12244341-12244537)
chr2 (573-745)||(12244974-12245146)
chr2 (315-476)||(12000300-12000461)
chr2 (579-744)||(16661566-16661731)
chr2 (278-478)||(12235763-12235963)
chr2 (574-745)||(14703836-14704007)
chr2 (573-745)||(16657085-16657257)
chr2 (573-745)||(43625841-43626010)
chr2 (345-474)||(16656604-16656733)
chr2 (340-471)||(16661065-16661196)
chr2 (274-475)||(43626288-43626489)
chr2 (264-319)||(12000786-12000841)
chr2 (573-616)||(39373417-39373460)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (573-745)||(13333024-13333196)
chr7 (580-745)||(10493949-10494114)
chr7 (572-745)||(8667847-8668020)
chr7 (573-744)||(8585274-8585445)
chr7 (580-742)||(8654881-8655043)
chr7 (572-745)||(6789940-6790113)
chr7 (579-744)||(8628961-8629126)
chr7 (252-474)||(27829256-27829478)
chr7 (580-745)||(3147700-3147865)
chr7 (573-745)||(1301892-1302064)
chr7 (579-745)||(8659791-8659957)
chr7 (282-476)||(17261359-17261553)
chr7 (340-475)||(3148339-3148474)
chr7 (258-475)||(6790378-6790595)
chr7 (592-745)||(8671217-8671370)
chr7 (351-439)||(7876844-7876932)
chr7 (282-442)||(8582664-8582824)
chr7 (260-439)||(8660248-8660427)
chr7 (340-475)||(8668433-8668568)
chr7 (282-442)||(8572591-8572751)
chr7 (579-714)||(17268398-17268533)
chr7 (340-474)||(13332149-13332283)
chr7 (344-433)||(8635502-8635591)
chr7 (251-439)||(1302315-1302503)
chr7 (348-439)||(8546679-8546770)
chr7 (340-475)||(8647669-8647804)
chr7 (579-714)||(17260700-17260835)
chr7 (345-479)||(8591362-8591496)
chr7 (340-474)||(8630197-8630331)
chr7 (573-741)||(8647309-8647474)
chr7 (282-476)||(17269067-17269261)
chr7 (377-442)||(8568839-8568904)
chr7 (340-474)||(8584535-8584669)
chr7 (340-474)||(10493000-10493134)
chr7 (580-714)||(27830450-27830584)
chr7 (282-442)||(8538805-8538965)
chr7 (569-681)||(8582192-8582304)
chr7 (620-745)||(8640164-8640286)
chr7 (340-475)||(8655317-8655452)
chr7 (573-742)||(8546063-8546232)
chr7 (345-439)||(8602738-8602832)
chr7 (354-442)||(8577290-8577378)
chr7 (569-616)||(8570868-8570915)
chr7 (344-442)||(8610665-8610763)
chr7 (342-439)||(8104069-8104166)
chr7 (569-606)||(8559900-8559937)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (572-746)||(9335458-9335632)
chr4 (572-741)||(35132878-35133047)
chr4 (282-483)||(35133414-35133615)
chr4 (340-475)||(9323063-9323198)
chr4 (340-475)||(9377542-9377677)
chr4 (573-714)||(30775711-30775852)
chr4 (340-475)||(9335035-9335169)
chr4 (364-475)||(30776085-30776196)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (573-745)||(28220379-28220551)
chr5 (340-474)||(42554186-42554320)
chr5 (268-475)||(28220915-28221122)
chr5 (591-659)||(42555530-42555598)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (251-478)||(34465158-34465385)
chr1 (260-475)||(4677459-4677674)
chr1 (574-745)||(34466362-34466533)
chr1 (573-717)||(4678126-4678270)
chr1 (572-745)||(15595467-15595638)
chr1 (340-442)||(15596060-15596162)
chr1 (583-668)||(52549098-52549183)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (579-745)||(43745275-43745441)
chr8 (252-442)||(12529869-12530059)
chr8 (279-474)||(43745793-43745985)
chr8 (574-681)||(12528996-12529103)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (579-715)||(28911040-28911176)
chr6 (405-439)||(28911318-28911352)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 282 - 742
Target Start/End: Original strand, 12257855 - 12258318
Alignment:
Q  282 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 381  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || || || || |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||| || ||| |    
T  12257855 ggaattgaccttggcacaacgtattcatgcgttgctgtttggcaggaacaatattgtcgagctgagatcattcacaacgatcaaggaaacagaacaacgc 12257954  T
Q  382 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaatttaaa 481  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |     
T  12257955 cttcttgtgttgcttttactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatcaagctgctgccaaccctcaacacactgtctttggtatttctat 12258054  T
Q  482 t-ttttcacttccttttatatacttaatat---tgttttgatatgattaat---gctgaagtgctgaataattgaatgttgagaattacaaatgttaatt 574  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||  |||   ||||||  ||||||||||   |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  12258055 tctttttacttccttt-atatacttgttataattgttttactatgattaataatgctgaagtactgaataatttaat--tgagaattacaaatgttaaat 12258151  T
Q  575 tttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatg 674  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12258152 ttc-cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagtagttcaagatgatataatgttgtggccatttaaagtcactgctggtgtcaatg 12258250  T
Q  675 acaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatct 742  Q
     |||||| |||||||| || |||||||||  ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  12258251 gcaaacccatgattacggtaaagtacaagaatcaagagaagcagctttgtgccgaggaagtatcatct 12258318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 544 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 12235317 - 12235117
Alignment:
Q  544 aattgaatgttgagaattacaaatgttaatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttg 643  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12235317 aattgaatgatgaaagttactaatgttaattttt-cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatgtgatgttg 12235219  T
Q  644 tggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatcta 743  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||  |||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  12235218 tggccattcaaggtcgctgctggtgtcaatgacaaacccatgattattgtcaagtacaagggtcgagagaagcagctatgtcccgaagaagtatcatcta 12235119  T
Q  744 tg 745  Q
    ||    
T  12235118 tg 12235117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 573 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 11999994 - 11999822
Alignment:
Q  573 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 672  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11999994 ttttttcagatgctaagaggttaattggttggaagtttagtgatcttgttgttcaagatgatggattgttatggccattcaaggtcactgctgatgtcaa 11999895  T
Q  673 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11999894 tgacaaaccaataattactgttaagtacaaaggccaggagaagcagctatgtgctgaagaagtatcatctatg 11999822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 570 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 7542829 - 7542654
Alignment:
Q  570 taatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgt 669  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||     
T  7542829 taatttttgtagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcctgttgttcaagatgatatactgttatggccattcaaggtgactgcgggtga 7542730  T
Q  670 caatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||   ||||||||| ||||||||||||    
T  7542729 caatgacagacccatgattaccgttaagtacaaggatcaggagaaacaactccatgctgaagaggtatcatctatg 7542654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 282 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 7543438 - 7543242
Alignment:
Q  282 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 381  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  7543438 ggaatagaccttggcacaacgtactcttgtgttgcagtatggcaggatcaacactatcgagttgaaatcattcacaacgaccaaggcaacagaacaacac 7543339  T
Q  382 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaattt 478  Q
    |||||| ||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7543338 cttcttttgttgctttcaccgaaaatcagaggttgatcggtgataatgctaagaatcaagctgcttccaaccctcaaaacactgtctttggtaattt 7543242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 267 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14705639 - 14705432
Alignment:
Q  267 gaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaag 366  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  14705639 gaaggatgtgctgtgggaatagaccttggtacaacgtactcatgtgttgcagtatggcaggaacaacattatcgagttgaaatcattcacaacgatcaag 14705540  T
Q  367 gcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgt 466  Q
    |||| | || ||| ||||||| ||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  14705539 gcaatagaacaactccttcttttgttgctttcaccgaaaatcagcggttgattggtgatgctgctaagaatcaagctgctgccaaccctcgaaacactgt 14705440  T
Q  467 ctttggta 474  Q
    ||||||||    
T  14705439 ctttggta 14705432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 279 - 475
Target Start/End: Original strand, 12244341 - 12244537
Alignment:
Q  279 gtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataa 378  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |  || ||||| ||||||||||| || || ||||||| || ||    
T  12244341 gtgggaatagaccttggtacaacgtattcatgtgttgcagtatggcaggaacaacactctcgtgttgaaatcattcacaacgatcagggcaacagaacaa 12244440  T
Q  379 caccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 475  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12244441 caccttcttgtgttgctttcactgaagatcaaaggtttattggtgatgctgctaaaaatcaagctgctgctaactctcaaaacactgtctttggtaa 12244537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 573 - 745
Target Start/End: Original strand, 12244974 - 12245146
Alignment:
Q  573 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 672  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||  | | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12244974 ttttttcagatgctaagagattaattggtaggaagtttagtgatcctattgttctggatgatgcattattatggccgttcaaggtcactgctggtgtcaa 12245073  T
Q  673 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12245074 tgacaaaccaataattactgttaactacaaaggccaggagaagcagctatgtgctgaagaagtatcatctatg 12245146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 315 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12000461 - 12000300
Alignment:
Q  315 gcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggt 414  Q
    |||||||||| ||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12000461 gcagtgtggctggaacaacactctcgagttgaaatcattcacaacgatcaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactgaaaatcaaaggt 12000362  T
Q  415 tgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaat 476  Q
    |  ||||||||||||| || || ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12000361 ttgttggtgatgctgctaaaaaccaagccgctgccaactctcaaaacactgtttttggtaat 12000300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 579 - 744
Target Start/End: Original strand, 16661566 - 16661731
Alignment:
Q  579 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16661566 cagatgctaagaggttaattggtaggaaatttagtgaccccgttgttcaaaaagatatactgttgtggccgttcaaggttattgctggtgttaatgacaa 16661665  T
Q  679 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctat 744  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| | ||||||||    
T  16661666 acctacgattagtgttaagtacaagggtcaggagaagctcctttgtgccgaggaaatctcatctat 16661731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 278 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 12235963 - 12235763
Alignment:
Q  278 tgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaata 377  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||||| || |||||||| | || |    
T  12235963 tgtggggatagaccttggtacaacatattcatgtgttgcagtatggcaggaacagcactctcgagttgagatcattcacaacgatcaaggcaatagaaca 12235864  T
Q  378 acaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaatt 477  Q
    || ||||||| ||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12235863 accccttcttttgttgctttcaccgaaaatcagaggttgattggtgatgctgctaagaatcaagctgcttccaacccgcaaaacaccgtctttggtaatt 12235764  T
Q  478 t 478  Q
    |    
T  12235763 t 12235763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 574 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 14704007 - 14703836
Alignment:
Q  574 ttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaat 673  Q
    |||| ||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  14704007 tttttcagatgctaagaggttgttgggaaggaagtttagcgatcctattgttcaagatgatatacttttatggccatttaaggtcactgctggagtcgat 14703908  T
Q  674 gacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || | ||| ||||||||||||||||||    
T  14703907 gacaaacccatgattacggttaagtacaaggatcaggagaagaagctctatgccgaagaagtatcatctatg 14703836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 573 - 745
Target Start/End: Original strand, 16657085 - 16657257
Alignment:
Q  573 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 672  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || || ||    
T  16657085 ttttttcagatgctaaaaggttaatcggtaggaagtttagtgatcctgttgttcaaaatgatatcatcttgtggccattcaaggtcattgccggagtgaa 16657184  T
Q  673 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    ||||||||| ||||||||  || |||| |||||||| ||||  ||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  16657185 tgacaaaccaatgattactcttcagtataagggtcaagagagccaattttgtgctgaggaaatatcatctatg 16657257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 573 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 43626010 - 43625841
Alignment:
Q  573 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 672  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    ||| ||  |    
T  43626010 tttttccagatgctaagaggttaatcggtaggaagtttagtgattctgttgttcaaaatgatatcatgttgtggccattcagggtca---ttggggtgga 43625914  T
Q  673 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    ||||||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  43625913 tgacaaaccaatgattattgtaaaatacaagggtcaagagaagcgtttttgtcctgaggaaatatcgtctatg 43625841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 345 - 474
Target Start/End: Original strand, 16656604 - 16656733
Alignment:
Q  345 gagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcag 444  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  16656604 gagatcatacacaatgaccagggaaacagaacaacaccttcttttgttgctttcactcatgatcaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatcaagttg 16656703  T
Q  445 ctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 474  Q
    | |  ||||| ||||||||  |||||||||    
T  16656704 ccgctaacccacaaaacaccatctttggta 16656733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 340 - 471
Target Start/End: Original strand, 16661065 - 16661196
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||||| | |||| |||||| ||| ||||    
T  16661065 gagttgagattatccacaacgatgaaggcaacaaaattacaccttcttttgttgcttttactgatgctcaaaggttggtcggtggtgctgctaaggatca 16661164  T
Q  440 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttg 471  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  16661165 agctgctatcaacccacaaaacaccgtctttg 16661196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 43626489 - 43626288
Alignment:
Q  274 gtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaa 373  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| | || |||||||  ||  || |  |  |||| ||||| || |||||||||||||| ||||     
T  43626489 gtgttgtgggaatagaccttggaacaacgtattcttgtattgctgtgtggcttgatgaaaacagaagagtagagattatccacaatgaccaaggaaacag 43626390  T
Q  374 aataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggt 473  Q
    ||  |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |   | ||||  |||||||||||||||||    
T  43626389 aactacaccttcttttgtttctttcactaaggaccaaaggttgattggtgatgctgctaagggtcaagctacctccgaccccgaaaacactgtctttggt 43626290  T
Q  474 aa 475  Q
    ||    
T  43626289 aa 43626288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12000841 - 12000786
Alignment:
Q  264 tatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagt 319  Q
    |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12000841 tatgaaggacttgctgtgggagtagacctcggcacaacatactcttgtgttgcagt 12000786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 573 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 39373460 - 39373417
Alignment:
Q  573 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgat 616  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39373460 ttttttcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttaatgat 39373417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 573 - 745
Target Start/End: Original strand, 13333024 - 13333196
Alignment:
Q  573 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 672  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13333024 ttttttcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatccggttgttcaaaatgatataatgttgtggccattcaaggttacttctggtgtcaa 13333123  T
Q  673 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||    
T  13333124 cgacaagcctatgattaccgctaagtgcaagggtcaagagaagcacttttgtgccgaggaaatatcatctatg 13333196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 580 - 745
Target Start/End: Original strand, 10493949 - 10494114
Alignment:
Q  580 agatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaa 679  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10493949 agatgctaagaggttaattggcaggaagtttagtgatccggttgttcaaaacgatataatgttgtggccattcaaggttacttcaggtgtcaatgacaaa 10494048  T
Q  680 cctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||    
T  10494049 cctatgattaccgctaagtacaagggtcaagagaagcacttttgtgccgaggaaatatcatctatg 10494114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 572 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 8668020 - 8667847
Alignment:
Q  572 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtca 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |    
T  8668020 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgaccccgttgttcaaagagatatattgttgtggccattcaaggttatttctggtgtta 8667921  T
Q  672 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  8667920 atgacaaacctatgattactgttaagtacaagggtcaagagaagcacttttgtgctgaggaaatatcttctatg 8667847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 573 - 744
Target Start/End: Original strand, 8585274 - 8585445
Alignment:
Q  573 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 672  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||    
T  8585274 ttttttcagatgccaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcccgttgttcaaaatgatataatgttgtggccattcaaggttatctctggtgttaa 8585373  T
Q  673 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctat 744  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||| ||||||||||    
T  8585374 tgacaaacctatgattactgttaagtacaagggtcaagaaaagaacctatgtgctgaggaaatatcatctat 8585445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 580 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 8655043 - 8654881
Alignment:
Q  580 agatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaa 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  8655043 agatgctaagaggttaattggtaggaagtatagtgatcctattgttcaaaaggatatcatgttgtggccattcatggttacttctggtgttaatgacaaa 8654944  T
Q  680 cctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatct 742  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  8654943 cccatgattactgttaagtacaaaggtcaagagaagcaattttgtgctgaggaaatatcatct 8654881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 572 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 6790113 - 6789940
Alignment:
Q  572 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtca 671  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6790113 attttttcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgattctgttgttcaaaatgatatgatgttttggccattcaaggtcattgctggcgtca 6790014  T
Q  672 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    ||||||| || ||||||   ||| |||| |||||| |||||||||| || |||| ||| ||||| || ||||||    
T  6790013 atgacaagcccatgattgttgttgagtataagggtgaggagaagcaactatgtgttgaggaagtttcgtctatg 6789940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 579 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 8629126 - 8628961
Alignment:
Q  579 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 678  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||| | ||||||||    
T  8629126 cagatgccaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcctgttgttcaaaaggatatcatgttctggccattcaaggttatttctggtcttaatgacaa 8629027  T
Q  679 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctat 744  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||| ||||||||||    
T  8629026 gcctatgattgctgttaagtacaagggtcaagagaagaacctatgtgctgaggaaatatcatctat 8628961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 252 - 474
Target Start/End: Original strand, 27829256 - 27829478
Alignment:
Q  252 atggctaaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||   |  ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||||   | |||| ||||| |    
T  27829256 atggcgaaaaagtatgaagggctttctgtgggaattgacctaggtacaacgtactcgtgcgttgcagcgtggcaggatcaacacaacagagtggagatta 27829355  T
Q  352 ttcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaa 451  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||    
T  27829356 ttcacaatgaacaaggcaacaagacaacaccttcttgtgttgctttcacggacaaacagaggttgattggtgatgctgctaagaaccaagctgcttccaa 27829455  T
Q  452 ccctcaaaacactgtctttggta 474  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  27829456 ccctcaaaacactatctttggta 27829478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 580 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 3147865 - 3147700
Alignment:
Q  580 agatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaa 679  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |   || || |||||||||    
T  3147865 agatgcaaagaggttaattggtaggaagtttggtgattctgttgttcaaaatgatatgatgttgtggccattcaaggtcatttgcggagtgaatgacaaa 3147766  T
Q  680 cctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    || |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  3147765 cccatgatttcggttaagtgcaagggacaggagaagcacctatgtgctgaagaaatctcatctatg 3147700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 573 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 1302064 - 1301892
Alignment:
Q  573 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 672  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||    
T  1302064 ttttttcagatgctaagagattaattggtaggaagtttagtgattcagttgttcaaaaagacatgatgttgtggccattcaaggtcatcgccggtgtgaa 1301965  T
Q  673 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    |||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||| |  || ||| |||||||||||    
T  1301964 tgacaaacccgtgattgttgttaagtacaagggtcaggagaagcacttttgcgtggaggaaatatcatctatg 1301892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 579 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 8659957 - 8659791
Alignment:
Q  579 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 678  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  8659957 cagatgcaaagagattaattggtaggaagtttagtgattcagttgttcaaaaagacatgatgttgtggccattcaaggttatcgctggtgtgaacgacaa 8659858  T
Q  679 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    ||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||    
T  8659857 actcatgattaatgttcagtacaagggtcaggagaagcacttttgtgcggaggaaatatcatctatg 8659791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 282 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 17261553 - 17261359
Alignment:
Q  282 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 381  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||  ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  17261553 ggaatagaccttgggacgacatactcttgtgttgccgtatggcatgaagaacatggtagagttgagatcattcacaatgatcaaggaaacaaaattactc 17261454  T
Q  382 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaat 476  Q
    |||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||  | |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  17261453 cttcttttgttgcttttgctaaagatgaaaggttgatcggtgatgccgctaagaatcaagctgccataaacccagaaaacaccgtctttggtaat 17261359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 3148474 - 3148339
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3148474 gagttgagattattcacaatgaccaaggcaacaaaaccacaccttcttttgttgctttcactgatgatcaaaggttggttggtgatgctgctaagaatca 3148375  T
Q  440 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 475  Q
    |||  |    |||||| |||||||||| ||||||||    
T  3148374 agctcccacaaaccctgaaaacactgtttttggtaa 3148339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 258 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 6790595 - 6790378
Alignment:
Q  258 aaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcaca 357  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||||  ||  ||||     |||||||||| |||||||    
T  6790595 aaaaaatacgaaggatgtgctgtgggaatagacctgggaacaacatattcttgtgttggtgtgtggcttgatgaacacaatagagttgagattattcaca 6790496  T
Q  358 atgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctca 457  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||   |||||| ||    
T  6790495 atgaccaaggtaacaaaaccacaccttcttttgttgctttcaccgatgaccaaaggttgatcggtgatgctgctaagtatcaagctgccaccaacccgca 6790396  T
Q  458 aaacactgtctttggtaa 475  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  6790395 aaacactatcttcggtaa 6790378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 592 - 745
Target Start/End: Original strand, 8671217 - 8671370
Alignment:
Q  592 gttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaacctatgattacc 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8671217 gttaattggtaggaagtttagtgatccggttgttcaaagagatatattgttgtggccattcaaggttatttctggtgttaatgacaaacctatgattact 8671316  T
Q  692 gttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    || |||||| | ||||  ||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  8671317 gtcaagtacgaaggtctagagaagcaattttgtgctgaggaaatatcttctatg 8671370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 351 - 439
Target Start/End: Original strand, 7876844 - 7876932
Alignment:
Q  351 attcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7876844 attcacaatgaacaaggcaacagaacaacaccttcttttgttgctttcacgaatgatcaaaggttgattggtgatgctgccaaaaatca 7876932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 282 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8582824 - 8582664
Alignment:
Q  282 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 381  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |    || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  8582824 ggaattgaccttggtacaacctactcatgtgttggagtgtggcaggagcaaaacgatcgtgtggaaatcatacacaatgatcaaggaaacaaaacaacac 8582725  T
Q  382 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 442  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8582724 cttcttgtgttgcttttactaattctcaaagattgattggtgatgctgccaaaaatcaagc 8582664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 8660427 - 8660248
Alignment:
Q  260 aaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaat 359  Q
    |||||| |||||| ||| | | ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||| |||| | ||    ||||| ||||||||  ||||     
T  8660427 aaagtacgaaggacgtgctattggaatagaccttggaacaacctattcgtgtgttgctgtgtggctggagaatcacaatcgagtcgagatcatctacaac 8660328  T
Q  360 gaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8660327 gaccaaggaaacaaaacaacaccttcatttgttgctttcactgacgatcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatca 8660248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8668568 - 8668433
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8668568 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaaccgaataacaccttcttttgttgctttcaacaatgaacaaaggttgattggcgatgctgctaagaatca 8668469  T
Q  440 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 475  Q
    | | |||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  8668468 atctgctactaaccctgaaaacactatctttggtaa 8668433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8572751 - 8572591
Alignment:
Q  282 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 381  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||   || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||| |    
T  8572751 ggaattgaccttggcacgacttactcatgtgttggagtgtggcaggagcaaaatgatcgtgttgaaatcatacacaatgaccaaggaaacagaacaactc 8572652  T
Q  382 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 442  Q
    | |||||||||||||| |||||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8572651 cctcttgtgttgcttttactaattctcaaagattgatcggtgatgctgccaaaaatcaagc 8572591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 17268533 - 17268398
Alignment:
Q  579 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 678  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || || ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||    
T  17268533 cagatgctaagagactaattggtaggaagtttagtgatcctgtggtccaaaaagatataatgtcgtggccattcaaggtcattgcggatatgaatgacaa 17268434  T
Q  679 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaa 714  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||| | ||||||    
T  17268433 accaatgatttccctcaagtacaagggacgggagaa 17268398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 340 - 474
Target Start/End: Original strand, 13332149 - 13332283
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||  |||||||||| |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13332149 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaatagaactacaccttcttttgttgctttcaacaatgatcaaagattgattggtgatgctgccaagaatca 13332248  T
Q  440 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 474  Q
    | | ||    |||||| |||||||| |||||||||    
T  13332249 atctgccactaaccctgaaaacactatctttggta 13332283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 433
Target Start/End: Original strand, 8635502 - 8635591
Alignment:
Q  344 tgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaa 433  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8635502 tgagatcatccacaatgagcaagggaacagaatcacaccttcttgtgttgctttcactgacgcacaaaggttgattggtgatgctgccaa 8635591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 251 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1302503 - 1302315
Alignment:
Q  251 catggctaaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatc 350  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| || || || || || ||||| || ||||||| |||| | ||     |||| ||||||    
T  1302503 catggcgataaagtacgaaggacgtgctgttggaatagaccttggaactacttattcgtgtgttgctgtgtggctggagaatcacaatagagtagagatc 1302404  T
Q  351 attcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    ||  |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1302403 atctacaacgaccaaggcaacaaaacaacaccgtcttttgttgctttcaccgatgatcaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatca 1302315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 8546770 - 8546679
Alignment:
Q  348 atcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8546770 atcattcacaatgatcaaggaaacaaaacaacaccttcttgtgttgctttcacaaattcccaaaggctgattggtgatgctgccaaaaatca 8546679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8647804 - 8647669
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  8647804 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaacagaactacaccttcttttgttgctttcaccgatgatcaaaggttgattggtgatgccgctaaaaatca 8647705  T
Q  440 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 475  Q
     || |||   ||||||   |||||||||||||||||    
T  8647704 ggctgcttctaaccctaccaacactgtctttggtaa 8647669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 17260835 - 17260700
Alignment:
Q  579 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 678  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  || || ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||    
T  17260835 cagatgctaagagactagttggtaggaagtttagtgatcctgtggtccaaaaagatataatgtcgtggccattcaaggtcattgcggatatgaatgacaa 17260736  T
Q  679 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaa 714  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||| | ||||||    
T  17260735 accaatgatttccctcaagtacaagggacgggagaa 17260700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8591496 - 8591362
Alignment:
Q  345 gagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcag 444  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || |    
T  8591496 gagattattcacaatgatcaaggaaatagaattacaccttcttttgttgcttttactaatgatcaaaggttgattggtgatgctgcaaaaaaccaggctg 8591397  T
Q  445 ctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaattta 479  Q
    ||   |||||   |||||||||||| |||||||||    
T  8591396 cttctaacccagcaaacactgtcttcggtaattta 8591362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 340 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8630331 - 8630197
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||  | |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  8630331 gagttgagattattcacaatgatgaaggcaataaaatcacaccttccttcgttgcttttaccgatgatcaaaggttggttggtggtgctgctaaggatca 8630232  T
Q  440 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 474  Q
     || ||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8630231 ggctgccatcaacccacaaaacactgtctttggta 8630197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 573 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 8647474 - 8647309
Alignment:
Q  573 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 672  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||    ||| || ||    
T  8647474 tttttccagatgctaagaggttaatcggtaggaagttttttgattctgttgttcagaatgataagaagttgtggccattcaaggtca---ttggggtgaa 8647378  T
Q  673 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatc 741  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| | ||||||| |  ||||||||| ||| |||||||    
T  8647377 tgacaaacccatgattattgttaaatacaagggtgaagagaagcgttattgtgctgaggaaatatcatc 8647309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 282 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 17269261 - 17269067
Alignment:
Q  282 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 381  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||  |  |||||||||| || |||||||| |||||||||||||  || |    
T  17269261 ggaatagaccttgggacgacatactcatgtgttgctgtgtggcatgaagaacacggtagagttgagattatacacaatgatcaaggcaacaaaactactc 17269162  T
Q  382 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaat 476  Q
    | |||| |||||||||  |||||||| ||||||| || |||||| | || ||||||||||| ||  | |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  17269161 cgtcttttgttgcttttgctaaagatgaaaggtttatcggtgattccgctaagaatcaagctgccatgaacccagaaaacaccgtctttggtaat 17269067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8568904 - 8568839
Alignment:
Q  377 aacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8568904 aacaccttcttgtgttgctttcactaaatctcaaagattgattggtgatgctgccaaaaatcaagc 8568839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 474
Target Start/End: Original strand, 8584535 - 8584669
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  8584535 gagttgagattattcacaacgatgaaggcaataaaatcacaccttcctttgttgcttttaccgatgatcaaaggttggttggtggtgctgctaaggatca 8584634  T
Q  440 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 474  Q
     || ||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  8584635 ggctgctatcaacccagagaacactgtctttggta 8584669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 474
Target Start/End: Original strand, 10493000 - 10493134
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| || | ||  |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10493000 gagttgaaattattcacaatgatcaaggaaatagaactacaccttcttttgttgctttcaacaatgatcaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatca 10493099  T
Q  440 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 474  Q
    | | ||    |||||| ||||||| ||||||||||    
T  10493100 atctgccactaaccctgaaaacaccgtctttggta 10493134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 580 - 714
Target Start/End: Original strand, 27830450 - 27830584
Alignment:
Q  580 agatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaa 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| | |||||||  ||||||| |||||| |||| | ||| ||| ||  |||||    
T  27830450 agatgctaagaggttaattggtaggaagttcagcgatgatgttgttcaaaaagatataaacttgtggctattcaaagtcattactgatgtaaacaacaaa 27830549  T
Q  680 cctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaa 714  Q
    || ||| ||   |||||||||||| ||||||||||    
T  27830550 cccatgtttgttgttaagtacaagagtcaggagaa 27830584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8538965 - 8538805
Alignment:
Q  282 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 381  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||| |    || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  8538965 ggaattgaccttggcacgacctactcatgtgttggagtgtggcaggagcaaaacgatcgtgtggagatcatacacaacgatcaaggaaacaaaaccacac 8538866  T
Q  382 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 442  Q
    |||||||||||| ||| | |||   |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8538865 cttcttgtgttggttttagtaattctcaacgattgattggtgatgctgccaaaaatcaagc 8538805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 569 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 8582304 - 8582192
Alignment:
Q  569 ttaatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtg 668  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    |||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  8582304 ttaattttttcagatgcaaagaggttaattggaaggaaatatagtgattccattgttcaaaaggatatcaagttgtggcccttcaaggtcaccgcaggtg 8582205  T
Q  669 tcaatgacaaacc 681  Q
      |||||||||||    
T  8582204 ctaatgacaaacc 8582192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 620 - 745
Target Start/End: Original strand, 8640164 - 8640286
Alignment:
Q  620 gttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatc 719  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||| | ||||||| |     
T  8640164 gttgttcaaaatgatatgaagttgtggccattcaaggtca---ttggggtgaatgacaaacccacgattattgttaaatacaagggtgaagagaagcgtt 8640260  T
Q  720 tttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||    
T  8640261 tttgtgccgaggaaatatcatctatg 8640286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8655452 - 8655317
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||  ||  |||||||    
T  8655452 gagttgagattattcacaatgatcaaggcaatagaactacaccttctgttgttgctttcactgattatcaaaggttgattggcaatggagctgagaatca 8655353  T
Q  440 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 475  Q
    | | |||  ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  8655352 atctgctaccaaccccgaaaacactgtatttggtaa 8655317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 8546232 - 8546063
Alignment:
Q  573 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 672  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    |||||||  ||||| || |||||||||| || ||||||| | | ||||| ||    
T  8546232 tttttgcagatgcaaagaggttaattggaaggaaatatagtgattcctttgttcagaatgatctactgttgtggccctttaaggtcatttccggtgttaa 8546133  T
Q  673 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttg-tgctgaagaagtatcatct 742  Q
    ||||||||| |  |||   || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  8546132 tgacaaaccgacaattcttgtgaactacaagggtgaggaaaagca-ctttgttgctgaagaaatatcatct 8546063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 8602832 - 8602738
Alignment:
Q  345 gagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8602832 gagattattcacaatgatcaaggaaacagaactactccttcttttgttgcttttactgatgataaaaggttgatcggtgatgctgccaaaaatca 8602738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8577378 - 8577290
Alignment:
Q  354 cacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 442  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8577378 cacaatgatcaaggaaacagaaccactccttcttgtgttgcttttaccaattctcaaagattgattggcgatgctgccaaaaatcaagc 8577290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 8570915 - 8570868
Alignment:
Q  569 ttaatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgat 616  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8570915 ttaatttttgcagatgtaaagaggttaattggaaggaagtatagtgat 8570868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8610763 - 8610665
Alignment:
Q  344 tgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 442  Q
    |||||| || || ||||| ||||| |||| ||  || ||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  8610763 tgagataatccataatgagcaaggaaacagaaccactccttcttttgttgctttctctggtgatcaaaggttgataggtgatgctgctaaaaatcaagc 8610665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 8104166 - 8104069
Alignment:
Q  342 gttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||| |||| ||  ||||| |||| ||||||||||||| |   | |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8104166 gttgagatcattgctaatgatcaagggaacagaacgacaccgtcttatgttgctttcactgatagtgaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatca 8104069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 8559937 - 8559900
Alignment:
Q  569 ttaatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaa 606  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8559937 ttaatttttgcagatgcaaagaggttaattggaaggaa 8559900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 572 - 746
Target Start/End: Original strand, 9335458 - 9335632
Alignment:
Q  572 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtca 671  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |    
T  9335458 atttttgcagatgctaagagattaactggtaggaagtttagtgatctggttgttcaaagagatatattgttgtggccattcaaggttatttctggtgtta 9335557  T
Q  672 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgt 746  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  9335558 atgacaaacctatgattactgttaactacaagggtcaagagaagcacttttgtgctgaggaaatatcttctatgt 9335632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 572 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 35133047 - 35132878
Alignment:
Q  572 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtca 671  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  35133047 attttttcagatgctaaaaggttaattggtaggaagtttagtgatcctattgttcaagatgatatactgctatggccattcaaggtcactgccggtgtaa 35132948  T
Q  672 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatc 741  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || | ||| ||||||||||||||    
T  35132947 atgacaaacccatgattacggttaagtacaaggatgaggaaaagcaactctatgcggaagaagtatcatc 35132878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 282 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 35133615 - 35133414
Alignment:
Q  282 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 381  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||    
T  35133615 ggaatagacctcggaacaacgtattcatgtgttgcagtatggcaagaacaacactatcgagtcgaaatcattcacaacgatcaaagcaacaaaacaacac 35133516  T
Q  382 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaatttaaa 481  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||   | |||||||||| ||||||||||| ||    
T  35133515 cttcttgtattgctttcactaaggatcaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatcaagctgctgccaattttgaaaacactgtatttggtaatttcaa 35133416  T
Q  482 tt 483  Q
    ||    
T  35133415 tt 35133414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 9323063 - 9323198
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9323063 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaaccgaacaacaccttcttttgttgctttcaacaatgagcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatca 9323162  T
Q  440 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 475  Q
    | | |||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  9323163 atctgctactaaccctgaaaacactatctttggtaa 9323198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 9377542 - 9377677
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9377542 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaaccgaacaacaccttcttttgttgctttcaacaatgagcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatca 9377641  T
Q  440 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 475  Q
    | | |||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  9377642 atctgctactaaccctgaaaacactatctttggtaa 9377677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 573 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 30775852 - 30775711
Alignment:
Q  573 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 672  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||   | ||||||| ||    
T  30775852 ttttttcagatgctaaaaggttaattggtaggaaatttagcgaccctgttgttcaaaaagatattttgttgtggccattcaaggttgtttctggtgttaa 30775753  T
Q  673 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaa 714  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||| ||||||||    
T  30775752 tgacaaacccatgatttcccttaagttcaagggccaggagaa 30775711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 9335035 - 9335169
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9335035 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaaccgaacaacaccttcttttgttgctttcaacaatgagcaaaggttga-tggtgatgctgctaagaatca 9335133  T
Q  440 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 475  Q
    | | |||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  9335134 atctgctactaaccctgaaaacactatctttggtaa 9335169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 30776196 - 30776085
Alignment:
Q  364 aaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacac 463  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| | |||| |||||| ||| | || || ||| ||||||||||||||||    
T  30776196 aaggcagcaaaatcacaccttcttttgttgctttcactgatggtcaaaggttggtcggtgctgctgctaaggaccaggctgctatcaaccctcaaaacac 30776097  T
Q  464 tgtctttggtaa 475  Q
    ||||||||||||    
T  30776096 tgtctttggtaa 30776085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 573 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 28220551 - 28220379
Alignment:
Q  573 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 672  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||    ||    
T  28220551 ttttttcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgactctgttgttcaagatgatataaagttgtggccattcaaggtcatttccggaacgaa 28220452  T
Q  673 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
     |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||||    
T  28220451 cgacaaacccatgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatctcatctatg 28220379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 340 - 474
Target Start/End: Original strand, 42554186 - 42554320
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |  || |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  42554186 gagttgagattattcacaatgatcaaggcaacaaaacaacaccttcttttgttgcttttactcatcatgaaaggttgattggtgatgctgctaaggatca 42554285  T
Q  440 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 474  Q
    | | ||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  42554286 aaccgccaccaacccccaaaacactgtctttggta 42554320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 268 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 28221122 - 28220915
Alignment:
Q  268 aaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaagg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||| || || ||||| || || ||||| || |||||||| ||  ||||     | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28221122 aaggatgtgctgtgggaatagatcttggaacaacgtattcatgtgttgctgtgtggcaagatgaacacaatagggttgagattattcacaatgatcaagg 28221023  T
Q  368 caacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtc 467  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||   |||||| ||||| || |||    
T  28221022 caacaaaacaactccttcttttgttgctttcaccgatgatgaaaggttgattggcgatgctgctaaaaatcaaacggccaacaacccccaaaataccgtc 28220923  T
Q  468 tttggtaa 475  Q
    ||||||||    
T  28220922 tttggtaa 28220915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 591 - 659
Target Start/End: Original strand, 42555530 - 42555598
Alignment:
Q  591 ggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtca 659  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  42555530 ggttaattggtaggaagtttaatgattatgttgttcaaaatgacatgaagttgtggccattcaaggtca 42555598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 251 - 478
Target Start/End: Original strand, 34465158 - 34465385
Alignment:
Q  251 catggctaaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatc 350  Q
    |||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  |  |||| |||||     
T  34465158 catggcgaaaaaatgtgaaggacgtgctgtgggaatagaccttggcacaacctactcatgtgttgcagtatggcaggaacaacacagtagagtagagatt 34465257  T
Q  351 attcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtca 450  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||  ||    
T  34465258 attgacaatgaccaaggtaacacaaccacaccttcttttgttgcttttactcatgatcaaagattgatcggtaatgctgctaagaatcaaactgctacca 34465357  T
Q  451 accctcaaaacactgtctttggtaattt 478  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||    
T  34465358 acccacagaacactgtttttggtaattt 34465385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 260 - 475
Target Start/End: Original strand, 4677459 - 4677674
Alignment:
Q  260 aaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaat 359  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||||| |||| | ||   | |||| ||||| ||| |||||    
T  4677459 aaagtatgaaggacgtgctgtgggaatagatcttggaactacttattcatgtgttgctgtgtggctggagaatcacaacagagtggagattatttacaat 4677558  T
Q  360 gaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaa 459  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |||| || |||    
T  4677559 gaacaaggcaacaaaacaacaccttcttttgttgcttttactgatgatcaaaggttgattggtaatgctgctaagaatcaatctgccaccaactctgaaa 4677658  T
Q  460 acactgtctttggtaa 475  Q
    ||||||||||||||||    
T  4677659 acactgtctttggtaa 4677674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 574 - 745
Target Start/End: Original strand, 34466362 - 34466533
Alignment:
Q  574 ttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaat 673  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  | |||||||   ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  34466362 tttttcagatgctaagaggttaattggcagaaaatttagtgatcctgatgttcaaacagatatgatgttatggccattcaaagttattgctggtgttaat 34466461  T
Q  674 gacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    ||||| || |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||    
T  34466462 gacaagccaatgatttcccttaagtataagggtcaggagaagcacctatgtgctgaggaaatctcatctatg 34466533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 573 - 717
Target Start/End: Original strand, 4678126 - 4678270
Alignment:
Q  573 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||| | || || |||||||||||||| | |||||   ||||||  ||    
T  4678126 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaggtatagtgattctgttgttcaaaaagacatcatgttgtggccatttagggtcatcactggtgagaa 4678225  T
Q  673 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagca 717  Q
    ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4678226 tgataaaccgatgattagtgttaagtacaagggtcaagagaagca 4678270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 572 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 15595638 - 15595467
Alignment:
Q  572 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagtt-gttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtc 670  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||     
T  15595638 attttttcagatgctaagagattaatcagtaggaagtttagtgattctgtttgttcaaaatgatataaagttgtggccattcaaggtca---ttggtgtg 15595542  T
Q  671 aatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||   |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  15595541 aatgacaaacccatgattattgttaaatacaagggtcaagaaaagcgcttttgtgctgaggaaatatcgtctatg 15595467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 340 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15596162 - 15596060
Alignment:
Q  340 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15596162 gagtcgagattatccacaatgaccaaggaaacagaattacaccttcttttgtttctttcactaatgatcaaaggttgattggtgatgctgctaagagtca 15596063  T
Q  440 agc 442  Q
    |||    
T  15596062 agc 15596060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 583 - 668
Target Start/End: Original strand, 52549098 - 52549183
Alignment:
Q  583 tgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtg 668  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  52549098 tgctaagaggttaattggtaagaagtttagtgatcctgttgttcaagatgatatattgttatggtcattcaaggtcactgccggtg 52549183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 579 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 43745441 - 43745275
Alignment:
Q  579 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| | | ||  | ||||||||    
T  43745441 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttaatgattctgatgttcaaaatgatatgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaa 43745342  T
Q  679 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatg 745  Q
    |||  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||||    
T  43745341 acccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatctcatctatg 43745275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12530059 - 12529869
Alignment:
Q  252 atggctaaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||  || | | ||||| || || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||  |   || || || || |    
T  12530059 atggcaaaaaagtatgaaggagttgctataggaattgatcttggcacaacttactcatgtgttggagtatggcaagagcaaactgatcgtgtggaaataa 12529960  T
Q  352 ttcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 442  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12529959 ttcacaatgatcaaggaaacaaaacaacaccttcttgtgttgcttttactaattctcagagattgattggtcatgctgccaaaaatcaagc 12529869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 43745985 - 43745793
Alignment:
Q  279 gtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataa 378  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||  ||||     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||    
T  43745985 gtgggaatagaccttggaacaacgtattcgtgtgttgctgtgtggcaagatgaacaaaatagagttgagattattcacaatgatcaaggcaacaa---aa 43745889  T
Q  379 caccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 474  Q
    || |||||| ||||||||| ||| |  || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||   |||||||||||||||  |||||||||    
T  43745888 caacttcttttgttgcttttactgatcatgaaaggttgataggtgacgctgctaagaatcaaaccgccaccaaccctcaaaacaccatctttggta 43745793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 574 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 12529103 - 12528996
Alignment:
Q  574 ttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtga-tcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 672  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| || | | |||||  | |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  12529103 ttttgcagatgcaaagaggttaattggaagaaagtatagtgactcca-tagttcagaaggatcaactgttgtggccatttaaggtcactgctggtgctaa 12529005  T
Q  673 tgacaaacc 681  Q
    |||||||||    
T  12529004 tgacaaacc 12528996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 579 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 28911176 - 28911040
Alignment:
Q  579 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 678  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||  |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28911176 cagatgctaagaggataattgataggaagtttagtgatcccgttgttcaaaacgattcaatgttgtcgccgttcaaggtcattgccggtgtcaatgacaa 28911077  T
Q  679 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaag 715  Q
     || |||||  | || |||||||||| ||||||||||    
T  28911076 ccccatgatatctgtcaagtacaaggatcaggagaag 28911040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 28911352 - 28911318
Alignment:
Q  405 gatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28911352 gatcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatca 28911318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University