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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20154_high_2 (Length: 458)

Name: NF20154_high_2
Description: NF20154
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20154_high_2
NF20154_high_2
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (211-436)||(41900056-41900281)
chr2 (211-434)||(41900250-41900473)
chr2 (238-434)||(41900442-41900638)
chr2 (236-401)||(41899851-41900016)
chr2 (213-403)||(41899897-41900087)
chr2 (238-326)||(41899830-41899918)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (238-403)||(24421256-24421421)
chr4 (238-403)||(24470494-24470659)
chr4 (237-380)||(24421327-24421470)
chr4 (238-402)||(24470302-24470466)
chr4 (237-380)||(24470253-24470396)
chr4 (235-365)||(24420526-24420656)
chr4 (236-380)||(24470444-24470588)
chr4 (247-403)||(24477393-24477549)
chr4 (236-403)||(24421112-24421279)
chr4 (253-403)||(24420536-24420686)
chr4 (235-365)||(24470970-24471100)
chr4 (265-403)||(24470952-24471090)
chr4 (238-403)||(24420680-24420845)
chr4 (236-361)||(24477579-24477704)
chr4 (304-412)||(24420335-24420443)
chr4 (236-403)||(24420824-24420991)
chr4 (247-389)||(24477599-24477741)
chr4 (304-392)||(24471183-24471271)
chr4 (236-347)||(24421072-24421183)
chr4 (247-386)||(24470407-24470546)
chr4 (236-403)||(24470636-24470803)
chr4 (241-403)||(24420632-24420794)
chr4 (238-403)||(24420920-24421085)
chr4 (237-306)||(24482187-24482256)
chr4 (307-386)||(24421369-24421448)
chr4 (307-386)||(24470275-24470354)
chr4 (307-377)||(24420466-24420536)
chr4 (236-386)||(24470732-24470881)
chr4 (307-377)||(24471090-24471160)
chr4 (349-403)||(24477075-24477129)
chr4 (238-338)||(24406496-24406596)
chr4 (121-149)||(24421318-24421346)
chr4 (121-149)||(24470377-24470405)
chr4 (121-149)||(24470569-24470597)
chr4 (262-306)||(24481851-24481895)
[»] scaffold0879 (6 HSPs)
scaffold0879 (236-403)||(4495-4662)
scaffold0879 (247-403)||(4458-4614)
scaffold0879 (236-347)||(4591-4702)
scaffold0879 (313-403)||(4428-4518)
scaffold0879 (238-403)||(4689-4854)
scaffold0879 (121-149)||(4428-4456)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (238-377)||(11879442-11879581)
chr1 (238-377)||(11902134-11902273)
chr1 (238-299)||(11901921-11901982)
chr1 (238-362)||(11902086-11902210)
chr1 (278-386)||(11879434-11879542)
chr1 (238-374)||(11902038-11902174)
chr1 (304-374)||(52821110-52821180)
chr1 (237-406)||(52821222-52821391)
chr1 (238-299)||(52821572-52821633)
chr1 (237-365)||(52821311-52821439)
[»] scaffold1918 (2 HSPs)
scaffold1918 (238-353)||(286-401)
scaffold1918 (238-331)||(425-518)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 211 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 41900281 - 41900056
Alignment:
Q  211 tctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41900281 tctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgcacaagtcaccaccacatccttctc 41900182  T
Q  311 cctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccatatgcatc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41900181 cctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcctccaccaccatatgcatc 41900082  T
Q  411 actacccctttcttatgtctacaact 436  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  41900081 gctacccctttcttatgtctacaact 41900056  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 211 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 41900473 - 41900250
Alignment:
Q  211 tctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  41900473 tctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctc 41900374  T
Q  311 cctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccatatgcatc 410  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  41900373 cttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatc 41900274  T
Q  411 actacccctttcttatgtctacaa 434  Q
    |||||||||||||||  |||||||    
T  41900273 actacccctttcttacatctacaa 41900250  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 238 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 41900638 - 41900442
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 337  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  41900638 tacaaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctaca 41900539  T
Q  338 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccatatgcatcactacccctttcttatgtctacaa 434  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| || || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41900538 aatctcctccacctccctctccatcaccacaacctaagtatgtctataagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaa 41900442  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 236 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41900016 - 41899851
Alignment:
Q  236 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| || ||||  ||    
T  41900016 tctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgta 41899917  T
Q  336 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccacc 401  Q
    ||| |||||||| || || || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  41899916 caagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccacc 41899851  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41900087 - 41899897
Alignment:
Q  213 tgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccc 312  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || || || || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||  ||||| |||    
T  41900087 tgcatcgctacccctttcttatgtctacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccc 41899988  T
Q  313 tcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || || || ||||| || ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||    
T  41899987 tcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccat 41899897  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 41899918 - 41899830
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccacc 326  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  41899918 tacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccacc 41899830  T

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Target: chr4 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24421421 - 24421256
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  24421421 tacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctata 24421322  T
Q  338 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    |   ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  24421321 agagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccat 24421256  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 403
Target Start/End: Original strand, 24470494 - 24470659
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 337  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  24470494 tacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctata 24470593  T
Q  338 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    |   ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  24470594 agagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccat 24470659  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 237 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24421470 - 24421327
Alignment:
Q  237 ctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctac 336  Q
    |||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  24421470 ctacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctac 24421371  T
Q  337 aaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgt 380  Q
    || || || || ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  24421370 aagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgt 24421327  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 402
Target Start/End: Original strand, 24470302 - 24470466
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||| |||||||| |    
T  24470302 tacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctata 24470401  T
Q  338 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccacca 402  Q
    |   ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  24470402 agagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccacca 24470466  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 380
Target Start/End: Original strand, 24470253 - 24470396
Alignment:
Q  237 ctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctac 336  Q
    |||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  24470253 ctacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctac 24470352  T
Q  337 aaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgt 380  Q
    || || || || ||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  24470353 aagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgt 24470396  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24420656 - 24420526
Alignment:
Q  235 atctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtct 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || || | ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  24420656 atctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgttt 24420557  T
Q  335 acaaatctcctccacctccctctccttcacc 365  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  24420556 acaaatctcctcccccaccatctccttcacc 24420526  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 380
Target Start/End: Original strand, 24470444 - 24470588
Alignment:
Q  236 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 335  Q
    |||||||||| || || |||||| | || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  24470444 tctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtcta 24470543  T
Q  336 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgt 380  Q
    ||| || || || ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  24470544 caagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgt 24470588  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24477549 - 24477393
Alignment:
Q  247 ccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctc 346  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||   |||||    
T  24477549 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctc 24477450  T
Q  347 cacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    | |  || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  24477449 ctctaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccat 24477393  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24421279 - 24421112
Alignment:
Q  236 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 335  Q
    |||||||||| || || |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  24421279 tctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtcta 24421180  T
Q  336 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    ||| || || ||||| || || || || ||||| ||||||||| ||||||| || || || |||||||    
T  24421179 caagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccat 24421112  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24420686 - 24420536
Alignment:
Q  253 ccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctc 352  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||  || || || ||||| || || || |||||||| || || ||||| ||||    
T  24420686 ccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctc 24420587  T
Q  353 cctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24420586 cttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccat 24420536  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 365
Target Start/End: Original strand, 24470970 - 24471100
Alignment:
Q  235 atctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtct 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || || || ||||| || || | ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  24470970 atctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgttt 24471069  T
Q  335 acaaatctcctccacctccctctccttcacc 365  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  24471070 acaaatctcctcccccaccatctccttcacc 24471100  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 403
Target Start/End: Original strand, 24470952 - 24471090
Alignment:
Q  265 tcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcac 364  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  || || || ||||| || || || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  24470952 tcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcac 24471051  T
Q  365 caccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24471052 cccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccat 24471090  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24420845 - 24420680
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 337  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||| | || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  24420845 tacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttaca 24420746  T
Q  338 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    | || || || || || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  24420745 agtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccat 24420680  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24477704 - 24477579
Alignment:
Q  236 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 335  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||| || ||  |||||||    
T  24477704 tctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtcta 24477605  T
Q  336 caaatctcctccacctccctctcctt 361  Q
    |||||| || || ||||| |||||||    
T  24477604 caaatcaccacctcctccgtctcctt 24477579  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 24420443 - 24420335
Alignment:
Q  304 ccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  24420443 ccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctccttatatttacaagtctccacctccaccat 24420344  T
Q  404 atgcatcac 412  Q
     | ||||||    
T  24420343 ctccatcac 24420335  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24420991 - 24420824
Alignment:
Q  236 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 335  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| |  || || || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24420991 tctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtata 24420892  T
Q  336 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
     || || || |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  24420891 taagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccat 24420824  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24477741 - 24477599
Alignment:
Q  247 ccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctc 346  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |    
T  24477741 ccacctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccac 24477642  T
Q  347 cacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatc 389  Q
    ||||||| ||||  || || ||||||||| |||| ||||||||    
T  24477641 cacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatc 24477599  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 392
Target Start/End: Original strand, 24471183 - 24471271
Alignment:
Q  304 ccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcc 392  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  || || |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  24471183 ccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctccttatatttacaagtctcc 24471271  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24421183 - 24421072
Alignment:
Q  236 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||| | |||||||| |||||||  || || || ||||| |||||||| ||| | ||    
T  24421183 tctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatata 24421084  T
Q  336 caaatctcctcc 347  Q
    ||| ||||||||    
T  24421083 caagtctcctcc 24421072  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 386
Target Start/End: Original strand, 24470407 - 24470546
Alignment:
Q  247 ccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctc 346  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || || |  ||  | ||||||||||| || || ||||| ||||| || || |    
T  24470407 ccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccac 24470506  T
Q  347 cacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaa 386  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  24470507 cacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaa 24470546  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Original strand, 24470636 - 24470803
Alignment:
Q  236 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 335  Q
    |||||||||| || || |||||||| || || || || || || ||| | || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  24470636 tctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtcta 24470735  T
Q  336 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    ||| || || || || || || || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  24470736 caagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccat 24470803  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24420794 - 24420632
Alignment:
Q  241 aagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaat 340  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||||||||| |  || ||||| || || || || || || || || ||||    
T  24420794 aagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaat 24420695  T
Q  341 ctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||||| || || || |||||||    
T  24420694 ctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 24420632  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24421085 - 24420920
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 337  Q
    |||||||| || || |||||||| || || || || || || ||||| || || ||||||||||  || ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  24421085 tacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctaca 24420986  T
Q  338 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    | || || || || || || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  24420985 agtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccat 24420920  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24482256 - 24482187
Alignment:
Q  237 ctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatcct 306  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||| ||||    
T  24482256 ctacaaatctccaccaccaccatctccatcaccaccacctccttatgtctataaatcaccaccacctcct 24482187  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24421448 - 24421369
Alignment:
Q  307 tctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaa 386  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  24421448 tctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaa 24421369  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 386
Target Start/End: Original strand, 24470275 - 24470354
Alignment:
Q  307 tctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaa 386  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  24470275 tctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaa 24470354  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24420536 - 24420466
Alignment:
Q  307 tctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 377  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  24420536 tctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccata 24420466  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 386
Target Start/End: Original strand, 24470732 - 24470881
Alignment:
Q  236 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 335  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| |  || || || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24470732 tctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtata 24470831  T
Q  336 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaa 386  Q
     || || || || ||||| ||||| || || || || ||||||||||||||    
T  24470832 taagtcaccacctcctccatctccctctcctcc-ccaccatatgtttacaa 24470881  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 377
Target Start/End: Original strand, 24471090 - 24471160
Alignment:
Q  307 tctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 377  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| | || || ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  24471090 tctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccata 24471160  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24477129 - 24477075
Alignment:
Q  349 cctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24477129 cctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccat 24477075  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24406596 - 24406496
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 337  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| || ||||| || || || ||| ||||||    
T  24406596 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacctccttatatctaca 24406497  T
Q  338 a 338  Q
    |    
T  24406496 a 24406496  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24421346 - 24421318
Alignment:
Q  121 tcacctcccccaccatatgtctataagag 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24421346 tcacctcccccaccatatgtctataagag 24421318  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 149
Target Start/End: Original strand, 24470377 - 24470405
Alignment:
Q  121 tcacctcccccaccatatgtctataagag 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24470377 tcacctcccccaccatatgtctataagag 24470405  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 149
Target Start/End: Original strand, 24470569 - 24470597
Alignment:
Q  121 tcacctcccccaccatatgtctataagag 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24470569 tcacctcccccaccatatgtctataagag 24470597  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24481895 - 24481851
Alignment:
Q  262 ccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatcct 306  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24481895 ccatcaccacctcctccatatgtgtacaagtcacccccacctcct 24481851  T

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Target: scaffold0879 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 6)
Name: scaffold0879
Description:

Target: scaffold0879; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Original strand, 4495 - 4662
Alignment:
Q  236 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 335  Q
    |||||||||| || || |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  4495 tctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtcta 4594  T
Q  336 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    ||| || || ||||| || || || || ||||| ||||||||| ||||||| || || || |||||||    
T  4595 caagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccat 4662  T

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Target: scaffold0879; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 4458 - 4614
Alignment:
Q  247 ccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctc 346  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || || |  || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  4458 ccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccac 4557  T
Q  347 cacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  4558 cacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccat 4614  T

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Target: scaffold0879; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 347
Target Start/End: Original strand, 4591 - 4702
Alignment:
Q  236 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||| | |||||||| |||||||  || || || ||||| |||||||| ||| | ||    
T  4591 tctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatata 4690  T
Q  336 caaatctcctcc 347  Q
    ||| ||||||||    
T  4691 caagtctcctcc 4702  T

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Target: scaffold0879; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 403
Target Start/End: Original strand, 4428 - 4518
Alignment:
Q  313 tcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||   ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  4428 tcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccat 4518  T

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Target: scaffold0879; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 403
Target Start/End: Original strand, 4689 - 4854
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 337  Q
    |||||||| || || |||||||| || || || || || || ||||| || || ||||||||||  || ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  4689 tacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctaca 4788  T
Q  338 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 403  Q
    | || || || || || || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  4789 agtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccat 4854  T

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Target: scaffold0879; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 149
Target Start/End: Original strand, 4428 - 4456
Alignment:
Q  121 tcacctcccccaccatatgtctataagag 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4428 tcacctcccccaccatatgtctataagag 4456  T

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Target: chr1 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 238 - 377
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879581
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 337  Q
    |||||||| |||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  338 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 377  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccata 11879581  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 377
Target Start/End: Original strand, 11902134 - 11902273
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 337  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||  || || || || || || ||||| ||    ||||    
T  11902134 tacaagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttccccgcccccaccatactattaca 11902233  T
Q  338 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 377  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  11902234 agtctcctccaccaccctcgccttccccaccgccaccata 11902273  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 299
Target Start/End: Original strand, 11901921 - 11901982
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccacc 299  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11901921 tacaagtccccaccaccgccgtctccctcaccacctcctccttatgtgtataagtcaccacc 11901982  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 362
Target Start/End: Original strand, 11902086 - 11902210
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 337  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| || || || || || ||||    
T  11902086 tacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtaca 11902185  T
Q  338 aatctcctccacctccctctccttc 362  Q
    | || || ||||| ||||| |||||    
T  11902186 agtcaccaccaccaccctcgccttc 11902210  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 386
Target Start/End: Original strand, 11879434 - 11879542
Alignment:
Q  278 cttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||  |||| ||||| || || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  11879434 cttatgagtacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctcctta 11879533  T
Q  378 tgtttacaa 386  Q
    ||| |||||    
T  11879534 tgtgtacaa 11879542  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 374
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902174
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 337  Q
    |||||||| |||||||||||| |  | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||  | || || ||||| ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  338 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctcc 374  Q
    | || || |||||||| || || ||||| || |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctcc 11902174  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 52821180 - 52821110
Alignment:
Q  304 ccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  52821180 ccttctccctcacctccaccaccttactactacaagtctcctccaccaccctctccctcacctccacctcc 52821110  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 52821391 - 52821222
Alignment:
Q  237 ctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctac 336  Q
    ||||||||| || |||||||| || || ||||| || || |||||    ||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||   |||     
T  52821391 ctacaagtcacctccaccaccctctccctcacctccacctccttactactacaagtcacctccaccaccttcaccttcacctcctccaccttactactat 52821292  T
Q  337 aaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccatatg 406  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || || || ||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  52821291 aaatctcctcctccaccctctccctcccctcctccaccttactattacaagtctcccccaccaccatatg 52821222  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 52821633 - 52821572
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccacc 299  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  52821633 tacaagtctccacctccaccttccccatcccctccacctccttatgtatacaagtcaccacc 52821572  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 52821439 - 52821311
Alignment:
Q  237 ctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctac 336  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||    ||||||||||| ||||  || |||||||||||||| || || ||   ||||    
T  52821439 ctacaagtccccaccaccaccctctccctcacctccacctccttactactacaagtcacctccaccaccctctccctcacctccacctccttactactac 52821340  T
Q  337 aaatctcctccacctccctctccttcacc 365  Q
    || || |||||||| || || ||||||||    
T  52821339 aagtcacctccaccaccttcaccttcacc 52821311  T

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Target: scaffold1918 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold1918
Description:

Target: scaffold1918; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 401 - 286
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 337  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||  | |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| | ||  | ||||    
T  401 tacaagtcacccccaccaccatcaccatcaccaccaccaccttacatttacaagtcaccaccgcctccctcaccgtcacctccaccatcttacatttaca 302  T
Q  338 aatctcctccacctcc 353  Q
    ||||||| ||||||||    
T  301 aatctccaccacctcc 286  T

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Target: scaffold1918; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 518 - 425
Alignment:
Q  238 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatg 331  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |||||  | |||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| ||||    
T  518 tacaagtcacccccacctccatcaccatcacctccaccaccttacatttacaagtcaccaccacctccatcaccgtcacctccaccaccatatg 425  T

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