View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20157_low_15 (Length: 203)

Name: NF20157_low_15
Description: NF20157
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20157_low_15
NF20157_low_15
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (18-184)||(29518495-29518661)
chr6 (18-184)||(29518912-29519078)
chr6 (18-184)||(32741171-32741337)
chr6 (18-184)||(2378118-2378284)
chr6 (28-184)||(3409251-3409407)
chr6 (17-184)||(35210196-35210363)
chr6 (18-184)||(3058218-3058384)
chr6 (18-184)||(3409652-3409818)
chr6 (18-184)||(14748342-14748504)
chr6 (18-174)||(2377756-2377912)
chr6 (18-176)||(2579872-2580030)
chr6 (18-183)||(1846741-1846906)
chr6 (18-184)||(3415450-3415618)
chr6 (18-174)||(2578443-2578598)
chr6 (18-170)||(16454913-16455065)
chr6 (28-184)||(26544041-26544197)
chr6 (16-176)||(10073989-10074149)
chr6 (18-174)||(16454577-16454733)
chr6 (27-174)||(16107680-16107827)
chr6 (18-184)||(1127352-1127518)
chr6 (26-176)||(10074371-10074521)
chr6 (18-170)||(2843560-2843713)
chr6 (18-174)||(5832027-5832182)
chr6 (18-175)||(2578835-2578991)
chr6 (26-171)||(2579500-2579645)
chr6 (20-176)||(10073618-10073772)
chr6 (21-173)||(6999799-6999951)
chr6 (18-176)||(593707-593867)
chr6 (33-173)||(1950200-1950340)
chr6 (18-174)||(2579109-2579261)
chr6 (68-171)||(32460630-32460733)
chr6 (22-176)||(10911565-10911720)
chr6 (19-174)||(16108065-16108208)
chr6 (51-170)||(9062383-9062501)
chr6 (24-181)||(5958613-5958766)
chr6 (16-176)||(12071689-12071849)
chr6 (17-176)||(12092481-12092640)
chr6 (44-176)||(6071132-6071264)
chr6 (16-176)||(12085032-12085191)
chr6 (57-176)||(8481927-8482045)
chr6 (21-176)||(31714671-31714823)
chr6 (18-172)||(17135069-17135223)
chr6 (60-161)||(2975567-2975668)
chr6 (103-156)||(35210498-35210551)
chr6 (64-108)||(22605301-22605345)
chr6 (25-72)||(3409405-3409452)
chr6 (57-108)||(11637760-11637811)
chr6 (93-139)||(14789279-14789325)
chr6 (35-169)||(30618634-30618766)
chr6 (64-108)||(21130103-21130147)
chr6 (26-84)||(10902438-10902496)
chr6 (58-100)||(11638053-11638095)
[»] chr2 (76 HSPs)
chr2 (18-184)||(36178605-36178771)
chr2 (20-184)||(37106180-37106344)
chr2 (18-184)||(14745667-14745833)
chr2 (12-186)||(41283469-41283643)
chr2 (18-184)||(5542625-5542791)
chr2 (18-180)||(37105920-37106082)
chr2 (22-184)||(5543002-5543164)
chr2 (18-174)||(6421387-6421543)
chr2 (21-176)||(962598-962753)
chr2 (24-174)||(15880265-15880415)
chr2 (18-176)||(42514649-42514807)
chr2 (18-169)||(15511495-15511646)
chr2 (18-176)||(35580724-35580881)
chr2 (18-158)||(36178171-36178311)
chr2 (18-160)||(6422126-6422268)
chr2 (18-174)||(6712978-6713135)
chr2 (25-174)||(36005887-36006035)
chr2 (25-184)||(14745300-14745460)
chr2 (19-176)||(38796619-38796778)
chr2 (20-171)||(33731653-33731804)
chr2 (21-176)||(40679632-40679787)
chr2 (18-174)||(40733519-40733675)
chr2 (23-176)||(37632602-37632755)
chr2 (28-184)||(1769884-1770040)
chr2 (37-172)||(28254258-28254391)
chr2 (23-184)||(7598601-7598754)
chr2 (20-176)||(28531316-28531472)
chr2 (69-184)||(36178320-36178435)
chr2 (29-165)||(40163383-40163520)
chr2 (18-174)||(40733885-40734040)
chr2 (17-176)||(7598228-7598387)
chr2 (21-163)||(23346250-23346391)
chr2 (32-174)||(5367457-5367599)
chr2 (19-176)||(29676903-29677065)
chr2 (18-114)||(6421793-6421889)
chr2 (69-176)||(16542449-16542556)
chr2 (18-168)||(29676543-29676687)
chr2 (68-176)||(31468800-31468904)
chr2 (28-176)||(12529038-12529186)
chr2 (88-173)||(31899496-31899581)
chr2 (18-122)||(3673122-3673226)
chr2 (18-176)||(30313178-30313335)
chr2 (25-176)||(16590888-16591034)
chr2 (18-174)||(29874023-29874179)
chr2 (64-168)||(37895107-37895211)
chr2 (22-104)||(3672773-3672855)
chr2 (60-173)||(31259658-31259774)
chr2 (58-176)||(33561491-33561609)
chr2 (98-176)||(38796298-38796376)
chr2 (22-114)||(6421688-6421780)
chr2 (59-176)||(30323464-30323581)
chr2 (31-123)||(36784273-36784365)
chr2 (58-176)||(37894732-37894850)
chr2 (119-176)||(36785664-36785721)
chr2 (44-176)||(29873563-29873695)
chr2 (18-173)||(9231252-9231407)
chr2 (45-175)||(31385738-31385868)
chr2 (71-160)||(28254165-28254254)
chr2 (68-176)||(33953821-33953929)
chr2 (20-173)||(3594180-3594333)
chr2 (22-112)||(35580443-35580534)
chr2 (69-173)||(12910231-12910335)
chr2 (18-86)||(31899102-31899170)
chr2 (69-176)||(41678419-41678527)
chr2 (128-174)||(6421306-6421352)
chr2 (35-176)||(33954279-33954419)
chr2 (58-134)||(30312831-30312907)
chr2 (63-122)||(25390313-25390372)
chr2 (58-109)||(28226404-28226455)
chr2 (114-161)||(42515031-42515078)
chr2 (77-134)||(2336666-2336723)
chr2 (140-176)||(3673085-3673121)
chr2 (58-106)||(8904498-8904546)
chr2 (58-105)||(28226726-28226772)
chr2 (60-109)||(13792536-13792585)
chr2 (140-176)||(3672719-3672755)
[»] chr1 (77 HSPs)
chr1 (18-184)||(44290824-44290991)
chr1 (18-184)||(44290458-44290624)
chr1 (18-184)||(41759475-41759641)
chr1 (17-184)||(3537598-3537765)
chr1 (18-176)||(41142372-41142531)
chr1 (19-176)||(41157375-41157532)
chr1 (18-174)||(26661522-26661678)
chr1 (21-184)||(48588491-48588654)
chr1 (18-176)||(41156991-41157149)
chr1 (22-184)||(3550712-3550871)
chr1 (21-174)||(17294579-17294733)
chr1 (27-174)||(37556113-37556260)
chr1 (18-176)||(29798199-29798357)
chr1 (18-176)||(31767161-31767319)
chr1 (18-174)||(34649440-34649596)
chr1 (17-176)||(34364507-34364666)
chr1 (17-176)||(34364925-34365084)
chr1 (18-176)||(5319965-5320123)
chr1 (18-168)||(14318875-14319025)
chr1 (18-184)||(45493974-45494145)
chr1 (18-184)||(50052024-50052189)
chr1 (26-175)||(40082408-40082556)
chr1 (18-174)||(11977282-11977438)
chr1 (50-182)||(32594748-32594880)
chr1 (16-185)||(32168696-32168854)
chr1 (20-176)||(3875333-3875489)
chr1 (16-172)||(9955911-9956069)
chr1 (33-179)||(38804370-38804516)
chr1 (41-174)||(26661921-26662054)
chr1 (16-176)||(37850598-37850758)
chr1 (18-176)||(45084382-45084534)
chr1 (18-176)||(22077495-22077653)
chr1 (27-173)||(37555733-37555878)
chr1 (25-189)||(24600321-24600484)
chr1 (22-176)||(66476-66630)
chr1 (18-176)||(39066201-39066358)
chr1 (97-184)||(3537226-3537313)
chr1 (82-176)||(41184489-41184583)
chr1 (24-176)||(24131994-24132143)
chr1 (56-184)||(44043810-44043943)
chr1 (26-170)||(5575110-5575252)
chr1 (24-175)||(22793279-22793431)
chr1 (29-176)||(66100-66247)
chr1 (18-151)||(22077110-22077243)
chr1 (26-166)||(5528762-5528902)
chr1 (28-176)||(30630648-30630796)
chr1 (28-174)||(45839629-45839779)
chr1 (20-176)||(22077831-22077986)
chr1 (17-176)||(19283454-19283613)
chr1 (18-105)||(11977015-11977102)
chr1 (28-176)||(44685456-44685605)
chr1 (17-176)||(21378058-21378199)
chr1 (18-176)||(1188588-1188746)
chr1 (18-106)||(50051689-50051776)
chr1 (19-161)||(44091909-44092051)
chr1 (16-176)||(1187361-1187522)
chr1 (58-134)||(10351202-10351278)
chr1 (29-149)||(4956218-4956340)
chr1 (144-185)||(50051777-50051818)
chr1 (18-93)||(41184408-41184486)
chr1 (129-176)||(35154150-35154197)
chr1 (117-176)||(50469180-50469239)
chr1 (110-176)||(4878803-4878869)
chr1 (82-127)||(41184152-41184197)
chr1 (16-105)||(47380165-47380254)
chr1 (18-77)||(4266798-4266855)
chr1 (16-176)||(5996870-5997029)
chr1 (61-121)||(35154046-35154106)
chr1 (111-186)||(4266875-4266950)
chr1 (19-135)||(9499020-9499136)
chr1 (58-94)||(12466365-12466401)
chr1 (144-176)||(22077248-22077280)
chr1 (108-167)||(30630912-30630972)
chr1 (124-176)||(47379891-47379943)
chr1 (57-103)||(9956212-9956258)
chr1 (58-94)||(31973375-31973411)
chr1 (40-176)||(50556451-50556587)
[»] chr5 (80 HSPs)
chr5 (18-185)||(6500442-6500608)
chr5 (18-176)||(40296315-40296473)
chr5 (22-184)||(18603124-18603286)
chr5 (18-184)||(27502036-27502202)
chr5 (18-184)||(32487386-32487551)
chr5 (18-183)||(41170627-41170792)
chr5 (19-179)||(36492218-36492378)
chr5 (18-184)||(6500815-6500980)
chr5 (18-176)||(15370099-15370257)
chr5 (18-173)||(3295345-3295498)
chr5 (22-184)||(624188-624350)
chr5 (18-176)||(3295015-3295172)
chr5 (32-176)||(13415774-13415918)
chr5 (18-173)||(25327938-25328093)
chr5 (18-184)||(9498655-9498820)
chr5 (18-176)||(41632782-41632940)
chr5 (18-174)||(42405598-42405752)
chr5 (18-169)||(11416977-11417128)
chr5 (27-174)||(26074614-26074761)
chr5 (18-175)||(299490-299647)
chr5 (22-166)||(34753029-34753173)
chr5 (18-176)||(12662652-12662810)
chr5 (25-174)||(26075168-26075318)
chr5 (27-176)||(26074155-26074304)
chr5 (18-174)||(1028517-1028673)
chr5 (18-174)||(6224198-6224354)
chr5 (17-176)||(35150007-35150165)
chr5 (18-176)||(36568569-36568725)
chr5 (18-184)||(623810-623976)
chr5 (20-150)||(15370428-15370558)
chr5 (22-164)||(33747783-33747925)
chr5 (41-179)||(29549278-29549416)
chr5 (38-184)||(5723811-5723957)
chr5 (19-174)||(24489207-24489360)
chr5 (44-174)||(26074807-26074938)
chr5 (26-171)||(38427553-38427697)
chr5 (26-176)||(26590918-26591068)
chr5 (20-174)||(300961-301107)
chr5 (18-174)||(35167838-35167994)
chr5 (18-173)||(2411010-2411165)
chr5 (18-173)||(35914852-35915007)
chr5 (101-184)||(7768842-7768925)
chr5 (44-175)||(36521922-36522053)
chr5 (81-174)||(42508614-42508707)
chr5 (18-90)||(26900017-26900089)
chr5 (58-173)||(36522277-36522392)
chr5 (96-174)||(26074320-26074398)
chr5 (58-176)||(31509623-31509742)
chr5 (39-173)||(41635212-41635346)
chr5 (19-174)||(13786002-13786157)
chr5 (51-162)||(31509745-31509857)
chr5 (58-109)||(13042606-13042657)
chr5 (18-89)||(38427306-38427377)
chr5 (95-174)||(39309686-39309764)
chr5 (17-118)||(13785631-13785732)
chr5 (40-92)||(795254-795306)
chr5 (38-105)||(9498343-9498410)
chr5 (40-119)||(36527117-36527196)
chr5 (81-174)||(42524719-42524811)
chr5 (58-118)||(32445943-32446003)
chr5 (62-109)||(13112604-13112651)
chr5 (136-186)||(5660288-5660338)
chr5 (116-173)||(6225047-6225104)
chr5 (51-139)||(19275566-19275653)
chr5 (58-96)||(13042784-13042822)
chr5 (58-96)||(13112782-13112820)
chr5 (134-176)||(35150747-35150789)
chr5 (134-176)||(35151038-35151080)
chr5 (20-118)||(42435486-42435583)
chr5 (22-74)||(24489583-24489635)
chr5 (58-109)||(36389016-36389067)
chr5 (64-94)||(5963765-5963795)
chr5 (44-122)||(9510546-9510624)
chr5 (127-184)||(22298956-22299014)
chr5 (42-78)||(795152-795189)
chr5 (22-86)||(5660340-5660405)
chr5 (64-105)||(34103625-34103666)
chr5 (18-71)||(35150810-35150863)
chr5 (141-173)||(13785732-13785764)
chr5 (64-108)||(41341523-41341567)
[»] chr8 (80 HSPs)
chr8 (18-184)||(3669679-3669845)
chr8 (16-184)||(3670052-3670220)
chr8 (20-174)||(3038292-3038446)
chr8 (25-184)||(30441073-30441236)
chr8 (26-174)||(34834878-34835026)
chr8 (18-174)||(34835211-34835367)
chr8 (28-176)||(45122067-45122215)
chr8 (20-184)||(20870575-20870741)
chr8 (26-184)||(1014253-1014411)
chr8 (18-176)||(6876862-6877021)
chr8 (17-176)||(9608745-9608904)
chr8 (16-174)||(25561813-25561972)
chr8 (19-174)||(33113368-33113523)
chr8 (18-174)||(40518071-40518229)
chr8 (26-184)||(1013879-1014037)
chr8 (20-174)||(40518584-40518738)
chr8 (18-174)||(34835476-34835633)
chr8 (18-174)||(34835742-34835899)
chr8 (18-174)||(37544490-37544646)
chr8 (18-162)||(45122638-45122782)
chr8 (18-173)||(147454-147609)
chr8 (22-169)||(9482608-9482755)
chr8 (18-176)||(9309355-9309512)
chr8 (18-176)||(45121910-45122068)
chr8 (22-151)||(9483191-9483320)
chr8 (17-174)||(30359273-30359430)
chr8 (18-174)||(1513915-1514071)
chr8 (21-169)||(70277-70425)
chr8 (18-176)||(8918764-8918922)
chr8 (24-182)||(40579512-40579670)
chr8 (18-176)||(5915872-5916025)
chr8 (20-176)||(5420651-5420807)
chr8 (22-174)||(30359611-30359763)
chr8 (21-176)||(41972158-41972316)
chr8 (18-176)||(45123006-45123164)
chr8 (16-184)||(6731896-6732055)
chr8 (22-166)||(18371998-18372142)
chr8 (18-176)||(9308977-9309139)
chr8 (28-173)||(32640542-32640682)
chr8 (25-174)||(45121663-45121811)
chr8 (19-172)||(18380020-18380171)
chr8 (18-169)||(6651510-6651652)
chr8 (22-169)||(18371665-18371807)
chr8 (18-182)||(32305478-32305635)
chr8 (28-176)||(4154678-4154824)
chr8 (28-176)||(147829-147968)
chr8 (25-176)||(9507777-9507933)
chr8 (39-153)||(9609108-9609222)
chr8 (98-184)||(41416251-41416335)
chr8 (63-173)||(43274824-43274934)
chr8 (58-174)||(8794113-8794229)
chr8 (18-101)||(40579269-40579352)
chr8 (72-172)||(18372988-18373085)
chr8 (27-176)||(12283873-12284021)
chr8 (104-173)||(18372785-18372854)
chr8 (18-94)||(8919144-8919220)
chr8 (68-174)||(18372656-18372758)
chr8 (18-176)||(9620678-9620834)
chr8 (104-173)||(18372342-18372411)
chr8 (18-98)||(41129066-41129146)
chr8 (86-173)||(3037776-3037865)
chr8 (18-176)||(4154281-4154438)
chr8 (27-172)||(43398077-43398225)
chr8 (103-166)||(25561729-25561792)
chr8 (71-171)||(20130454-20130553)
chr8 (44-176)||(5274775-5274907)
chr8 (35-99)||(20995433-20995497)
chr8 (18-82)||(43274635-43274699)
chr8 (38-95)||(16524446-16524503)
chr8 (132-173)||(18372485-18372526)
chr8 (84-140)||(18373236-18373292)
chr8 (77-173)||(40991756-40991852)
chr8 (18-65)||(3037969-3038016)
chr8 (35-122)||(40417733-40417820)
chr8 (22-76)||(18372288-18372342)
chr8 (68-105)||(12156708-12156745)
chr8 (119-176)||(20995502-20995559)
chr8 (99-176)||(33831978-33832055)
chr8 (77-118)||(11442911-11442952)
chr8 (144-176)||(18645713-18645745)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (18-176)||(1085616-1085774)
chr7 (18-184)||(37533011-37533176)
chr7 (17-176)||(7517580-7517739)
chr7 (18-185)||(37533364-37533531)
chr7 (18-176)||(23377-23535)
chr7 (21-182)||(29157559-29157720)
chr7 (18-174)||(30244272-30244428)
chr7 (18-169)||(11845198-11845349)
chr7 (18-174)||(6054562-6054718)
chr7 (18-176)||(40094774-40094932)
chr7 (18-174)||(45433243-45433399)
chr7 (18-176)||(22567039-22567196)
chr7 (26-176)||(36939741-36939891)
chr7 (47-176)||(7554025-7554154)
chr7 (29-174)||(45754718-45754862)
chr7 (21-184)||(14681502-14681663)
chr7 (28-168)||(19122740-19122879)
chr7 (18-174)||(30245079-30245231)
chr7 (18-176)||(24177435-24177593)
chr7 (20-170)||(34218036-34218186)
chr7 (18-174)||(45434638-45434794)
chr7 (18-174)||(47129097-47129253)
chr7 (18-176)||(118299-118459)
chr7 (57-176)||(22566702-22566820)
chr7 (18-176)||(8128441-8128599)
chr7 (18-171)||(30032572-30032725)
chr7 (19-176)||(36622960-36623117)
chr7 (20-173)||(9901648-9901799)
chr7 (56-176)||(16569196-16569316)
chr7 (56-176)||(16596346-16596466)
chr7 (22-176)||(40230295-40230449)
chr7 (41-173)||(24838724-24838857)
chr7 (50-176)||(1085280-1085407)
chr7 (21-173)||(20599317-20599471)
chr7 (27-176)||(36534795-36534942)
chr7 (18-176)||(41854635-41854792)
chr7 (20-155)||(37167808-37167937)
chr7 (18-134)||(30253534-30253646)
chr7 (24-173)||(41910592-41910749)
chr7 (20-130)||(28300255-28300366)
chr7 (55-176)||(43241495-43241616)
chr7 (18-95)||(47129450-47129527)
chr7 (88-176)||(28301613-28301701)
chr7 (103-176)||(30245494-30245567)
chr7 (103-176)||(30255339-30255412)
chr7 (19-93)||(28300569-28300644)
chr7 (106-176)||(30244701-30244771)
chr7 (108-176)||(36109007-36109075)
chr7 (20-88)||(37532753-37532821)
chr7 (71-171)||(44361517-44361616)
chr7 (58-109)||(21416181-21416232)
chr7 (59-107)||(23569043-23569091)
chr7 (19-75)||(30244453-30244509)
chr7 (12-75)||(30245256-30245319)
chr7 (58-176)||(4124128-4124246)
chr7 (18-75)||(30253671-30253728)
chr7 (139-187)||(14681276-14681324)
chr7 (29-108)||(40094424-40094503)
chr7 (126-176)||(40094502-40094552)
chr7 (31-93)||(45755010-45755072)
chr7 (64-109)||(21619091-21619136)
chr7 (18-121)||(37393114-37393216)
chr7 (124-174)||(36967335-36967385)
chr7 (58-176)||(37345916-37346036)
chr7 (18-134)||(15902342-15902457)
chr7 (64-108)||(27391815-27391859)
chr7 (27-81)||(4719305-4719359)
chr7 (17-66)||(7517767-7517816)
chr7 (17-66)||(7518033-7518082)
chr7 (69-109)||(27598052-27598092)
[»] chr4 (104 HSPs)
chr4 (21-176)||(25483336-25483491)
chr4 (18-184)||(41370349-41370515)
chr4 (20-184)||(50630755-50630919)
chr4 (18-184)||(55933122-55933288)
chr4 (19-174)||(36629239-36629394)
chr4 (21-176)||(54017596-54017751)
chr4 (19-176)||(1731646-1731803)
chr4 (18-179)||(50002423-50002584)
chr4 (21-176)||(3340807-3340962)
chr4 (19-174)||(39404400-39404555)
chr4 (18-176)||(10245920-10246077)
chr4 (20-174)||(39792860-39793014)
chr4 (28-176)||(52884695-52884844)
chr4 (18-176)||(36608659-36608817)
chr4 (18-187)||(39404007-39404176)
chr4 (28-161)||(54108928-54109060)
chr4 (19-174)||(34646648-34646803)
chr4 (18-176)||(44620660-44620817)
chr4 (38-184)||(49880152-49880297)
chr4 (19-173)||(50459724-50459878)
chr4 (18-166)||(54343006-54343147)
chr4 (19-176)||(22027960-22028117)
chr4 (18-167)||(44620362-44620511)
chr4 (18-174)||(36572021-36572177)
chr4 (28-176)||(52884887-52885038)
chr4 (18-176)||(22183262-22183420)
chr4 (35-176)||(4955332-4955473)
chr4 (18-167)||(44621011-44621160)
chr4 (18-158)||(18932747-18932887)
chr4 (17-176)||(49076828-49076986)
chr4 (18-157)||(54936215-54936353)
chr4 (18-176)||(22028367-22028527)
chr4 (25-176)||(32941128-32941279)
chr4 (17-173)||(49302907-49303065)
chr4 (12-170)||(20825842-20826000)
chr4 (18-177)||(54108537-54108694)
chr4 (19-175)||(16889535-16889691)
chr4 (18-176)||(2740700-2740856)
chr4 (16-175)||(16888812-16888971)
chr4 (23-170)||(20826223-20826370)
chr4 (47-161)||(45496820-45496934)
chr4 (17-176)||(3244448-3244607)
chr4 (21-176)||(4390102-4390257)
chr4 (67-176)||(2741071-2741180)
chr4 (18-122)||(23817679-23817783)
chr4 (53-185)||(6975489-6975621)
chr4 (58-174)||(41707503-41707618)
chr4 (21-176)||(34004586-34004739)
chr4 (16-174)||(43174508-43174667)
chr4 (18-176)||(49076449-49076604)
chr4 (18-176)||(3341128-3341286)
chr4 (30-174)||(19504707-19504842)
chr4 (19-174)||(45489331-45489485)
chr4 (21-176)||(51768061-51768216)
chr4 (34-176)||(54741194-54741334)
chr4 (21-176)||(3700365-3700512)
chr4 (20-130)||(18879852-18879962)
chr4 (18-136)||(43827480-43827597)
chr4 (24-125)||(31691203-31691306)
chr4 (68-163)||(54017750-54017845)
chr4 (39-174)||(40067045-40067181)
chr4 (18-176)||(28034229-28034387)
chr4 (18-155)||(48111696-48111833)
chr4 (18-154)||(3271806-3271947)
chr4 (44-171)||(760194-760320)
chr4 (35-134)||(15841383-15841482)
chr4 (87-176)||(10246347-10246436)
chr4 (124-184)||(50788087-50788147)
chr4 (110-168)||(44620304-44620362)
chr4 (44-176)||(23556890-23557022)
chr4 (18-170)||(45489712-45489864)
chr4 (18-84)||(43174233-43174299)
chr4 (110-176)||(44621426-44621492)
chr4 (58-109)||(11197293-11197344)
chr4 (58-173)||(34544107-34544225)
chr4 (20-151)||(39698944-39699077)
chr4 (110-174)||(44620946-44621011)
chr4 (22-96)||(41370738-41370812)
chr4 (88-176)||(11348396-11348484)
chr4 (58-170)||(15841023-15841134)
chr4 (58-109)||(10396198-10396249)
chr4 (58-109)||(10396483-10396534)
chr4 (18-113)||(11783551-11783646)
chr4 (22-63)||(23817457-23817498)
chr4 (57-109)||(922485-922537)
chr4 (69-108)||(1868119-1868158)
chr4 (27-66)||(19895406-19895445)
chr4 (60-118)||(11706584-11706641)
chr4 (64-110)||(51681604-51681650)
chr4 (147-184)||(18932887-18932924)
chr4 (62-122)||(2891864-2891924)
chr4 (18-62)||(11702297-11702341)
chr4 (153-185)||(18933103-18933135)
chr4 (128-176)||(45050601-45050649)
chr4 (22-98)||(50787996-50788072)
chr4 (58-109)||(11197003-11197054)
chr4 (78-121)||(45484774-45484817)
chr4 (58-132)||(31249896-31249970)
chr4 (58-100)||(41707279-41707321)
chr4 (135-176)||(11706636-11706677)
chr4 (28-65)||(19895533-19895570)
chr4 (80-113)||(29802604-29802637)
chr4 (139-184)||(41370693-41370738)
chr4 (58-94)||(34946151-34946187)
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (18-184)||(22304561-22304727)
chr3 (18-174)||(37990639-37990795)
chr3 (20-174)||(43346793-43346947)
chr3 (18-174)||(35946524-35946680)
chr3 (19-174)||(37990978-37991133)
chr3 (20-176)||(15772854-15773010)
chr3 (18-176)||(29644902-29645060)
chr3 (18-176)||(32589704-32589861)
chr3 (18-176)||(33803252-33803410)
chr3 (26-184)||(39934963-39935123)
chr3 (18-176)||(12114562-12114720)
chr3 (18-176)||(42342388-42342546)
chr3 (18-176)||(54017816-54017974)
chr3 (18-176)||(54018198-54018356)
chr3 (18-176)||(29644581-29644739)
chr3 (27-184)||(39389062-39389219)
chr3 (18-176)||(41359765-41359919)
chr3 (18-176)||(25739425-25739583)
chr3 (21-174)||(32462903-32463057)
chr3 (18-174)||(52634678-52634833)
chr3 (18-176)||(21832345-21832501)
chr3 (20-176)||(42342092-42342248)
chr3 (18-184)||(50612447-50612618)
chr3 (26-174)||(22303963-22304104)
chr3 (24-176)||(15773192-15773346)
chr3 (17-176)||(31190017-31190168)
chr3 (18-176)||(53577364-53577522)
chr3 (35-184)||(4823647-4823796)
chr3 (18-174)||(25755396-25755552)
chr3 (21-176)||(45395656-45395811)
chr3 (44-169)||(3135099-3135224)
chr3 (18-174)||(3135454-3135617)
chr3 (18-176)||(1634315-1634473)
chr3 (17-174)||(45901715-45901873)
chr3 (18-175)||(53117975-53118131)
chr3 (16-176)||(39914252-39914412)
chr3 (17-176)||(8327904-8328067)
chr3 (18-174)||(32462558-32462715)
chr3 (18-185)||(37726495-37726654)
chr3 (26-174)||(49336694-49336843)
chr3 (17-185)||(51886552-51886714)
chr3 (19-173)||(11661954-11662108)
chr3 (25-176)||(9240149-9240300)
chr3 (18-176)||(44160547-44160702)
chr3 (21-118)||(22303662-22303759)
chr3 (18-174)||(33175659-33175820)
chr3 (23-166)||(42584829-42584970)
chr3 (44-176)||(47964544-47964676)
chr3 (52-150)||(33362327-33362425)
chr3 (69-184)||(3384317-3384432)
chr3 (121-184)||(22304238-22304301)
chr3 (18-176)||(39336232-39336387)
chr3 (18-102)||(41359491-41359575)
chr3 (18-106)||(54017548-54017636)
chr3 (18-176)||(47964915-47965073)
chr3 (84-173)||(7767380-7767469)
chr3 (58-174)||(11661537-11661638)
chr3 (68-173)||(46546375-46546480)
chr3 (120-176)||(43346650-43346706)
chr3 (48-134)||(39336000-39336086)
chr3 (29-134)||(12749211-12749316)
chr3 (66-126)||(52634990-52635050)
chr3 (19-72)||(8328374-8328427)
chr3 (18-67)||(22304302-22304351)
chr3 (44-173)||(25317161-25317290)
chr3 (58-174)||(25991405-25991521)
chr3 (58-109)||(53596027-53596078)
chr3 (58-109)||(53596342-53596393)
chr3 (64-121)||(17731950-17732007)
chr3 (64-121)||(19033181-19033238)
chr3 (18-96)||(43978865-43978947)
chr3 (58-109)||(53596542-53596593)
chr3 (18-94)||(7766783-7766857)
chr3 (62-109)||(48127859-48127906)
chr3 (144-176)||(12747878-12747910)
chr3 (64-108)||(16871005-16871049)
chr3 (64-108)||(17735037-17735081)
chr3 (64-108)||(19036306-19036350)
chr3 (64-109)||(16143505-16143550)
chr3 (64-105)||(16869843-16869884)
chr3 (110-171)||(36986040-36986101)
chr3 (110-171)||(37011479-37011540)
chr3 (77-113)||(50329391-50329427)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (18-174)||(514-670)
scaffold0702 (18-184)||(147-308)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (22-174)||(1110-1262)
scaffold0391 (58-129)||(1731-1802)
scaffold0391 (125-176)||(3092-3143)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (27-176)||(5396-5546)
scaffold0734 (27-176)||(5777-5931)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (18-176)||(47360-47518)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (56-176)||(5357-5477)
scaffold0078 (25-176)||(4982-5133)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (60-176)||(17496-17614)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (99-174)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (44-174)||(39459-39588)
scaffold0113 (51-174)||(39840-39963)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (98-182)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (98-138)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 159; Significance: 7e-85; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29518661 - 29518495
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29518661 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518562  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518561 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 29518495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29519078 - 29518912
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29519078 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518979  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518978 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 29518912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 32741337 - 32741171
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32741337 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 32741238  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741237 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32741171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2378284 - 2378118
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2378284 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 2378185  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378184 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 2378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409251
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35210363 - 35210196
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35210363 aggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttac 35210264  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210263 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 35210196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3058384 - 3058218
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3058384 ggggacggtccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatact 3058285  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3058284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacttgcaaaccaaca 3058218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3409818 - 3409652
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409818 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 3409719  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409718 tataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 14748342 - 14748504
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  14748342 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatt 14748437  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14748438 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaatcaaca 14748504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2377912 - 2377756
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377912 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 2377813  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377812 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 2377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 2579872 - 2580030
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2579872 ggggaccttccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttact 2579971  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2579972 tataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2580030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1846906 - 1846741
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1846906 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttact 1846807  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  1846806 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttgcaacccaac 1846741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3415618 - 3415450
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctaga--acaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415618 ggggaccttccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 3415519  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3415518 cttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcacactcgcaaaccaaca 3415450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 2578443 - 2578598
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2578443 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttact 2578542  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2578543 tataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttg 2578598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16455065 - 16454913
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16455065 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctattact 16454966  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16454965 tataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcaca 16454913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26544197 - 26544041
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26544197 cacattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgt 26544098  T
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26544097 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 26544041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 10073989 - 10074149
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10073989 taggggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 10074088  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10074089 cttataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgca 10074149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16454733 - 16454577
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454733 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 16454634  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16454633 tataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacacttg 16454577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16107827 - 16107680
Alignment:
Q  27 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 126  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16107827 ccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 16107728  T
Q  127 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16107727 tttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacacttg 16107680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1127518 - 1127352
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1127518 ggggaccacccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttact 1127419  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1127418 tataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcacagttgcaaaccaaca 1127352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 176
Target Start/End: Original strand, 10074371 - 10074521
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10074371 tccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 10074470  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10074471 gttcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttgca 10074521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2843713 - 2843560
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-gggtcctcttac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2843713 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctcttac 2843614  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 170  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2843613 ttataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcaca 2843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 5832027 - 5832182
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  5832027 ggggaccgtctacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg-tggctttatgggtcctcttact 5832125  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5832126 tataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttg 5832182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Original strand, 2578835 - 2578991
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |    
T  2578835 ggggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctcttatt 2578934  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 175  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2578935 tataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggacatataaatcacacttgc 2578991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 171
Target Start/End: Original strand, 2579500 - 2579645
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2579500 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataaggt 2579599  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 171  Q
     | | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2579600 atccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 10073618 - 10073772
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10073618 ggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatggatcctcttactta 10073717  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10073718 taaggtgttcaacctttac--ttttctccgatgtgggacatataactaacacttgca 10073772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999951
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  6999799 gaccgtccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatat 6999898  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6999899 aaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 593707 - 593867
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca--ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  593707 ggggaccgtcaacatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggtttatgagtcctctta 593806  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  593807 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 593867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 173
Target Start/End: Original strand, 1950200 - 1950340
Alignment:
Q  33 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 132  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1950200 cgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaac 1950299  T
Q  133 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1950300 ctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 2579109 - 2579261
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||| ||||    ||    
T  2579109 ggggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagttatgggtttatggttcct----ct 2579204  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2579205 tataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttg 2579261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 171
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460733
Alignment:
Q  68 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  168 acac 171  Q
    ||||    
T  32460730 acac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10911720 - 10911565
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10911720 accgtccacatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttata 10911621  T
Q  122 aggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10911620 aggtgttcaacctttactttttttatctgatgtaggacatataactcacacttgca 10911565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16108208 - 16108065
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108208 gggaccgtccacatcgaggttataacaaccccacaagcaagagagacaccacac------------ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 16108121  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16108120 ataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttg 16108065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 170
Target Start/End: Original strand, 9062383 - 9062501
Alignment:
Q  51 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 150  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9062383 acaagtaagagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 9062481  T
Q  151 tgtgggacatataactcaca 170  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9062482 tgtgggacatataactcaca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 5958613 - 5958766
Alignment:
Q  24 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||    
T  5958613 cgtccacatcgaggttagaacaatcacacaag----agagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataag 5958708  T
Q  124 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacca 181  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5958709 gtgttcaacctttactgttttatccgatgtaacacatataactcacaattgcacacca 5958766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 12071689 - 12071849
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |      
T  12071689 taggggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtttatgagtcctttct 12071788  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
     |||||| |||||||| ||  | | || |||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  12071789 attataaagtgttcaaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttgca 12071849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 12092481 - 12092640
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    ||||||||  ||||||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  12092481 aggggaccacccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcac 12092580  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  12092581 ttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggacatctaacacacccttgca 12092640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6071264 - 6071132
Alignment:
Q  44 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 143  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  6071264 caaccatacaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttc 6071165  T
Q  144 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6071164 tattcaatgtgggacatataactcacacttgca 6071132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 12085032 - 12085191
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |      
T  12085032 taggagaccgttcgcatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttttatgagtcctttct 12085131  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
     |||||| |||||||| ||  ||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12085132 attataaagtgttcaaactccact-ttctatctgatgcaggacatataactcacacttgca 12085191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8482045 - 8481927
Alignment:
Q  57 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||    
T  8482045 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-gg 8481947  T
Q  157 acatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8481946 acatataactcacacttgca 8481927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31714823 - 31714671
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||    
T  31714823 gaccgtccacatcgaggctagagcaaccacacaagcgaaaaa-acgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctctca-ttat 31714726  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |    |||||||||  ||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  31714725 ataacgttcaacctccacttttctatccgatgtaggacatat-agtcacacttgca 31714671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 17135069 - 17135223
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| | |||| |  |||||||||| ||||||| ||    ||||| |||||||  ||||||| ||    
T  17135069 ggggaccgtccacatcaaggccggaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatgaatcctcttgct 17135168  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 172  Q
    |||||||| || ||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17135169 tataaggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2975668 - 2975567
Alignment:
Q  60 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 159  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||||    
T  2975668 agagacatcacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttacttttctatttgatgtgggaca 2975569  T
Q  160 ta 161  Q
    ||    
T  2975568 ta 2975567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35210551 - 35210498
Alignment:
Q  103 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210551 atgggtcctcttacttacaaggtattcaacctttactattttatccgatgtggg 35210498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Original strand, 22605301 - 22605345
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22605301 acaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22605345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3409452 - 3409405
Alignment:
Q  25 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac 72  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3409452 gtccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccacac 3409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 108
Target Start/End: Original strand, 11637760 - 11637811
Alignment:
Q  57 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11637760 aagagagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaatgggtttatgggt 11637811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 139
Target Start/End: Original strand, 14789279 - 14789325
Alignment:
Q  93 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 139  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14789279 caattggtttatgggtcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 14789325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 169
Target Start/End: Original strand, 30618634 - 30618766
Alignment:
Q  35 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 134  Q
    |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  30618634 aggcaagagcaaccacataagtaagagagacaccacatttttacccataaccttaagacaa-cggtttat-ggtcatcttacttataaagtgttcatcct 30618731  T
Q  135 ttactattttatccgatgtgggacatataactcac 169  Q
      ||| ||| | ||||||| |||| | ||||||||    
T  30618732 ccactttttcaaccgatgtaggacttctaactcac 30618766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Original strand, 21130103 - 21130147
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21130103 acaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggt 21130147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 84
Target Start/End: Original strand, 10902438 - 10902496
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 84  Q
    |||||||| |||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10902438 tccacatctaggtcagaacaaccatacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 10902496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 100
Target Start/End: Original strand, 11638053 - 11638095
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11638053 agagagacaccatactcttacccaaaatcctaaggcaatgggt 11638095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 76)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 36178605 - 36178771
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178605 ggggatcgtccacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 36178704  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36178705 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaactaaca 36178771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37106344 - 37106180
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37106344 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttactta 37106245  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106244 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 37106180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 14745667 - 14745833
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745667 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 14745766  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745767 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 14745833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Original strand, 41283469 - 41283643
Alignment:
Q  12 agcataggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcct 111  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41283469 agcatgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcct 41283568  T
Q  112 cttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacata 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41283569 cttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaacata 41283643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 5542625 - 5542791
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5542625 ggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 5542724  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542725 tataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5542791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37106082 - 37105920
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37106082 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttact 37105983  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacc 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37105982 tataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcaaacc 37105920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 184
Target Start/End: Original strand, 5543002 - 5543164
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5543002 accgtccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttata 5543101  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543102 aggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5543164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6421543 - 6421387
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6421543 ggggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 6421444  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421443 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 6421387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 962753 - 962598
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  962753 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttat 962654  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962653 aaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 962598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15880415 - 15880265
Alignment:
Q  24 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880415 cgtccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 15880316  T
Q  124 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15880315 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 15880265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42514807 - 42514649
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42514807 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggtcctcttact 42514708  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42514707 tataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttgca 42514649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 15511495 - 15511646
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15511495 ggggatcgtccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 15511594  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 169  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15511595 tataacgtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 35580724 - 35580881
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  35580724 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcact 35580822  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580823 tataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35580881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 158
Target Start/End: Original strand, 36178171 - 36178311
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  36178171 ggggaccgtctacatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggttcccttact 36178270  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178271 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6422268 - 6422126
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6422268 ggggacagtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaat 6422169  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 160  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6422168 tataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6713135 - 6712978
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6713135 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttac 6713036  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6713035 ttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 6712978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 36005887 - 36006035
Alignment:
Q  25 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36005887 gtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagg 36005986  T
Q  125 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36005987 tgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttg 36006035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Original strand, 14745300 - 14745460
Alignment:
Q  25 gtccacatcgaggctagaacaaccac-acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14745300 gtccacatcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaag 14745399  T
Q  124 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14745400 atgttcaaccattactattttattcgatgtgggacatataactcacagttgcaaaccaaca 14745460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Original strand, 38796619 - 38796778
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccaca--ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38796619 gggaccgtcgacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttac 38796718  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796719 ttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 38796778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33731804 - 33731653
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33731804 ggaccgtttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttactta 33731705  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 171  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33731704 taaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679787
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40679632 gaccgtccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttat 40679731  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40679732 aaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgca 40679787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40733675 - 40733519
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  40733675 ggggaccatccacatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttact 40733576  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40733575 tataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 40733519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 176
Target Start/End: Original strand, 37632602 - 37632755
Alignment:
Q  23 ccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37632602 ccgtccacatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataa 37632701  T
Q  123 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
      |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37632702 aatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 37632755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1770040 - 1769884
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | || || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1770040 cacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgt 1769941  T
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1769940 tcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacaccaaca 1769884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 172
Target Start/End: Original strand, 28254258 - 28254391
Alignment:
Q  37 gctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttt 136  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28254258 gctagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttt 28254355  T
Q  137 actattttatccgatgtgggacatataactcacact 172  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28254356 acttttctatccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7598754 - 7598601
Alignment:
Q  23 ccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 122  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  7598754 ccgtccacatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatgggtcctcttacttataa 7598663  T
Q  123 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7598662 ggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacaccaaca 7598601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 28531316 - 28531472
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28531316 ggaccatccacatcgaggctagagcaactgcataactgagagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttactta 28531415  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531416 taaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 28531472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 184
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178435
Alignment:
Q  69 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  169 cacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||    
T  36178420 cacttgcaaaccaaca 36178435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Original strand, 40163383 - 40163520
Alignment:
Q  29 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  40163383 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgggtcatcttacttataaggtgt 40163482  T
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataac 165  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40163483 tcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40734040 - 40733885
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| | |||||||||    
T  40734040 ggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgtagg-ttatgagccctcttact 40733942  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40733941 tataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 40733885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7598387 - 7598228
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  7598387 aggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttat 7598288  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  7598287 ttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttgca 7598228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23346391 - 23346250
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23346391 gaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggctatgggtttatgggccctctta-ttat 23346293  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 163  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  23346292 aaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5367599 - 5367457
Alignment:
Q  32 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 131  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  5367599 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaa 5367500  T
Q  132 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  5367499 cctttgctcttttatccgatctgggacatatatatcacacttg 5367457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29677065 - 29676903
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg-----tcctct 113  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||     ||||||    
T  29677065 gggaccatccacatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctct 29676966  T
Q  114 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
     || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29676965 cacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 29676903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6421889 - 6421793
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6421889 ggggaccgtccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542449
Alignment:
Q  69 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 168  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  169 cacttgca 176  Q
    ||||||||    
T  16542456 cacttgca 16542449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29676687 - 29676543
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  29676687 ggggaccgtccacatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaa------aaggcaatgagtttatgggttctctcact 29676594  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29676593 tataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 176
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468904
Alignment:
Q  68 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  168 acacttgca 176  Q
    |||||||||    
T  31468896 acacttgca 31468904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 12529038 - 12529186
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12529038 cacattgaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgt 12529137  T
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12529138 tcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgca 12529186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 173
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899581
Alignment:
Q  88 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3673226 - 3673122
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  3673226 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatggatcctcttact 3673127  T
Q  118 tataa 122  Q
    |||||    
T  3673126 tataa 3673122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30313335 - 30313178
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||| |||| | ||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  30313335 ggggatcgtcaaaatccaggccagagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcact 30313236  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30313235 tataa-gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataacacacgcttgca 30313178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16591034 - 16590888
Alignment:
Q  25 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          
T  16591034 gtccacattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttactt------ 16590941  T
Q  125 tgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16590940 tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttgca 16590888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 29874023 - 29874179
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||| ||||||| |||| | | ||||| ||||||   || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  29874023 ggggaccgcccacatccaggccaaagcaaccgcacaagtgggatagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaat 29874122  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29874123 tataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatataacacacacttg 29874179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 168
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895211
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatata 37895206  T
Q  164 actca 168  Q
    |||||    
T  37895207 actca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 3672855 - 3672773
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3672855 accgtccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 173
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259774
Alignment:
Q  60 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcc---gatgtggg 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||| |    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgag 31259757  T
Q  157 acatataactcacactt 173  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259758 acatataactcgcactt 31259774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Original strand, 33561491 - 33561609
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 157  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||| || |||| ||||||| |    
T  33561491 agagagatatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaa 33561590  T
Q  158 catataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33561591 catataactcacacttgca 33561609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Original strand, 38796298 - 38796376
Alignment:
Q  98 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796298 ggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 38796376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6421780 - 6421688
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 114  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  6421780 accgtccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323464
Alignment:
Q  59 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 158  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||  | | || |||| ||| ||||||    
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggac 30323482  T
Q  159 atataactcacacttgca 176  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  30323481 atataacacacacttgca 30323464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 123
Target Start/End: Original strand, 36784273 - 36784365
Alignment:
Q  31 atcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 123  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36784273 atcgaggcttgaataaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894850
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 157  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| || ||| | ||||||||    
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggga 37894831  T
Q  158 catataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  37894832 catataactcacatttgca 37894850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785721
Alignment:
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36785721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 176
Target Start/End: Original strand, 29873563 - 29873695
Alignment:
Q  44 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 143  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||  ||| ||     
T  29873563 caaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttc 29873662  T
Q  144 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  29873663 tatctgatgtgggacatgtaacacacccttgca 29873695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9231407 - 9231252
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| || |||  ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||| |    
T  9231407 ggggatcgtccacatcaaggttagaataaccgcataagttagagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatt 9231308  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    |||||  ||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  9231307 tataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactcatactt 9231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31385868 - 31385738
Alignment:
Q  45 aaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatttt 144  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  | | || |    
T  31385868 aaccacacaagtgaaagagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacctccatttttct 31385769  T
Q  145 atccgatgtgggacatataactcacacttgc 175  Q
    | |||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  31385768 aaccgatgtcagacttctaactcacacttgc 31385738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 160
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  71 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 160  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 176
Target Start/End: Original strand, 33953821 - 33953929
Alignment:
Q  68 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 167  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||||||||| ||||||||    
T  33953821 cacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactc 33953920  T
Q  168 acacttgca 176  Q
    ||| |||||    
T  33953921 acatttgca 33953929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Original strand, 3594180 - 3594333
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || | |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| | |||||    
T  3594180 ggaccgttcacatcgaggttagaataaacacactagtatgagagatatcacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctatcactta 3594279  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    ||| |||||| ||||  ||| || ||| || ||||  ||||| |||||||||||    
T  3594280 taaagtgttcgacctccacttttctattcgttgtgaaacatacaactcacactt 3594333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 112
Target Start/End: Original strand, 35580443 - 35580534
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| | | | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35580443 accgtccacatcgaggctaaaacaatcacataggga-gagagacgccacactctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctc 35580534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910231
Alignment:
Q  69 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||| | | |||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactca 12910236  T
Q  169 cactt 173  Q
     ||||    
T  12910235 aactt 12910231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Original strand, 31899102 - 31899170
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc 86  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31899102 ggggaccgttcacatcgaggttagaagaaccccacaagcaagagagatacctcactcttacccaaaacc 31899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 176
Target Start/End: Original strand, 41678419 - 41678527
Alignment:
Q  69 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataact 166  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||   || || |||| |||||| |||  ||||||||    
T  41678419 acactcttactcaaaaccttaaggcaaagg-tttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagacatatataact 41678517  T
Q  167 cacacttgca 176  Q
    ||||||||||    
T  41678518 cacacttgca 41678527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6421352 - 6421306
Alignment:
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6421352 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 6421306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 176
Target Start/End: Original strand, 33954279 - 33954419
Alignment:
Q  35 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 134  Q
    |||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | | |||||| ||| | | | |||||   |||| |||||    
T  33954279 aggccagaacaaccatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcgtaaggca-tagatttatgagtcatttaagttatataatgtttaacct 33954377  T
Q  135 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33954378 caacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgca 33954419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 30312907 - 30312831
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 134  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  30312907 agagagactacacacttttacccaaaaccttaaggaaataagtttatgggtcatctaagttataaagtgttcaacct 30312831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 122
Target Start/End: Original strand, 25390313 - 25390372
Alignment:
Q  63 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 122  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  25390313 gacaccacacttctacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcttcttagttataa 25390372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 28226455 - 28226404
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  28226455 agagagacaccacactcttacctaaaaccctaagacaatgtgtttatgggtc 28226404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42515078 - 42515031
Alignment:
Q  114 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 161  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42515078 tacttataaggtgtttaacctttacttttctatccgatgtgggacata 42515031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2336723 - 2336666
Alignment:
Q  77 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 134  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2336723 acccaaaatcttaaggcattgaatttatgggtcctctcacttataaagtgttcaacct 2336666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3673121 - 3673085
Alignment:
Q  140 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3673121 attttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 3673085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 8904546 - 8904498
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8904546 agagagacaccacacttttacccaaaaccatatggcaattggtttatgg 8904498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28226772 - 28226726
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  28226772 agagagacaccacactcttaccaaaaacc-taagacaatgggtttatg 28226726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 109
Target Start/End: Original strand, 13792536 - 13792585
Alignment:
Q  60 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  13792536 agagacatcacactcttacccaaaacctcaagtcaatgggtgtacgggtc 13792585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3672755 - 3672719
Alignment:
Q  140 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672755 attttattcgatgtgggacatataactcatacttgca 3672719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 77)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 44290824 - 44290991
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290824 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 44290923  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290924 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 44290991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 44290458 - 44290624
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290458 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 44290557  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290558 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 44290624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41759641 - 41759475
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  41759641 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttact 41759542  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41759541 tataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcaaaccaaca 41759475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 3537598 - 3537765
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3537598 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctcttac 3537697  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  3537698 tcataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacgtacaaaccaaca 3537765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41142531 - 41142372
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41142531 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttac 41142432  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142431 ttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41142372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41157532 - 41157375
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157532 gggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 41157433  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157432 ataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 41157375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 26661522 - 26661678
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26661522 ggggaccgtccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcact 26661621  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661622 tataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 26661678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 184
Target Start/End: Original strand, 48588491 - 48588654
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  48588491 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttat 48588590  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48588591 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttgcaaaccaaca 48588654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41157149 - 41156991
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41157149 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttact 41157050  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  41157049 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttgca 41156991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3550871 - 3550712
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3550871 accgtccacatcgaggctagaacaaccgta---gcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttata 3550775  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3550774 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgccaaccaaca 3550712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17294733 - 17294579
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaacca-cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294733 gaccgtccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 17294634  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294633 taaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 17294579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556113
Alignment:
Q  27 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatg 37556162  T
Q  127 ttcaacctttacta-ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556161 ttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 37556113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29798357 - 29798199
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29798357 ggggaccgtctatatcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 29798258  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29798257 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 29798199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 31767161 - 31767319
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  31767161 ggggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctcttact 31767260  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31767261 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgca 31767319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34649596 - 34649440
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||    
T  34649596 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcact 34649497  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649496 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34649440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34364666 - 34364507
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  34364666 agggaaccatccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctcttac 34364567  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364566 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 34364507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34365084 - 34364925
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34365084 agggaaccatccacatcgaggttagagcaactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttac 34364985  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364984 ttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 34364925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 5319965 - 5320123
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  5319965 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcact 5320064  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5320065 tataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 5320123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14319025 - 14318875
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  14319025 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttact 14318926  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14318925 tataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 45493974 - 45494145
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  45493974 ggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatcttact 45494073  T
Q  118 tataa----ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-aactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45494074 tatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttgcaaaccaaca 45494145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 50052024 - 50052189
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  50052024 ggggactgtccacatcgaggttagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatgggtcctcttact 50052122  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50052123 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttaaaaaccaaca 50052189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 40082556 - 40082408
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  40082556 tccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatga-tcctcttacttataaggt 40082458  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40082457 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgc 40082408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11977438 - 11977282
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||    
T  11977438 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttact 11977339  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977338 tataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 11977282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 182
Target Start/End: Original strand, 32594748 - 32594880
Alignment:
Q  50 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 149  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32594748 cacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctg 32594847  T
Q  150 atgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32594848 atgtaggacatataactcacacttgcaaaccaa 32594880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 32168696 - 32168854
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  32168696 taggggactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctct-- 32168793  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 185  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168794 ----taaggtgttcaacctttactattttatcc-----gggacatataactcacacttgcaaaccaacat 32168854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 3875333 - 3875489
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3875333 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 3875432  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3875433 taaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgca 3875489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9956069 - 9955911
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt-atgggtcctctt 114  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9956069 taggggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctctt 9955970  T
Q  115 acttataaggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacact 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9955969 acttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 179
Target Start/End: Original strand, 38804370 - 38804516
Alignment:
Q  33 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38804370 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaac 38804469  T
Q  133 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 179  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38804470 ctttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaac 38804516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 174
Target Start/End: Original strand, 26661921 - 26662054
Alignment:
Q  41 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  26661921 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactc 26662020  T
Q  141 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26662021 ttttatctgatatgggatatataactcacacttg 26662054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 37850598 - 37850758
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||  || | ||||||||||| ||||||    
T  37850598 taggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttatgggttctctta 37850697  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37850698 cttataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 37850758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45084534 - 45084382
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||    
T  45084534 ggggaccgtccgcatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaagacg------ttatgggtcctcttact 45084441  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45084440 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgca 45084382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 22077495 - 22077653
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  22077495 ggggaccgtccatatcgatgcttgaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttact 22077594  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22077595 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 22077653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555733
Alignment:
Q  27 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||| ||     
T  37555878 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggattta-aggtcctcttacttataatgta 37555780  T
Q  127 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37555779 ttcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Original strand, 24600321 - 24600484
Alignment:
Q  25 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||      
T  24600321 gtccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataata 24600420  T
Q  125 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacatattg 189  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24600421 tgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcaca-caacatattg 24600484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 66476 - 66630
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  66476 accgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttata 66575  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  66576 aggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 66630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 39066201 - 39066358
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |    
T  39066201 ggggaccgtc-acatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagt 39066299  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39066300 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgca 39066358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 184
Target Start/End: Original strand, 3537226 - 3537313
Alignment:
Q  97 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537226 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3537313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 176
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184583
Alignment:
Q  82 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 41184583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 176
Target Start/End: Original strand, 24131994 - 24132143
Alignment:
Q  24 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||    
T  24131994 cgtctacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaa-ccttaaggcaatgagtttatggatccccttatttataag 24132090  T
Q  124 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24132091 gtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgca 24132143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 184
Target Start/End: Original strand, 44043810 - 44043943
Alignment:
Q  56 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct------ttactattttatccg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |      |||||||||||| ||    
T  44043810 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattactattttattcg 44043909  T
Q  150 atgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44043910 atgtgggacatataact-acacttgcaaaccaaca 44043943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5575252 - 5575110
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5575252 tccacatcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttataaggt 5575155  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 170  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5575154 gttcaacctttactcttctatccgacgtgggacatataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22793431 - 22793279
Alignment:
Q  24 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa-tgggtttatgggtcctcttacttataa 122  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22793431 cgtccatattgaggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataa 22793332  T
Q  123 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 175  Q
     || |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22793331 agttttcaacctctacttttctatacgatgtgggacatataactcacacttgc 22793279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 176
Target Start/End: Original strand, 66100 - 66247
Alignment:
Q  29 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 128  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66100 acatcgaggccagaacaaccatacaagt--gagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 66197  T
Q  129 c-aacctttactattttatccgatgtgggacat-ataactcacacttgca 176  Q
    | |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  66198 caaacctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacacttgca 66247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 22077110 - 22077243
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22077110 ggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttact 22077209  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgat 151  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  22077210 tataaggtattcaacctttacttttctatccgat 22077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 5528762 - 5528902
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  5528762 tccacatcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagat 5528861  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5528862 gttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 30630648 - 30630796
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||  | || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30630648 cacatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgt 30630747  T
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
      |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30630748 caaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttgca 30630796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839629
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgt 45839680  T
Q  128 tc-----aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45839679 tcgattcaacctttatt-ttctatccgatgtgggacatataactcatacttg 45839629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 22077831 - 22077986
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22077831 ggaccgtccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaacctta-ggctatgagtttatgggtcctcttactta 22077929  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||| ||||||||||||| | || |||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22077930 taagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacacttgca 22077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 19283454 - 19283613
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |     
T  19283454 aggggacctcccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgatgagtttatgtgtcctctcat 19283553  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||| || ||| |||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19283554 ttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttgca 19283613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11977102 - 11977015
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11977102 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatg 11977015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44685605 - 44685456
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccac-acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 126  Q
    |||||||||| |||||| ||| | |||||  ||| ||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  44685605 cacatcgaggttagaactacccccacaagagagaaagacgtcacactgttacccaaa-cattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggtt 44685507  T
Q  127 ttcaa-cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44685506 ttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 44685456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 21378058 - 21378199
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||                  |||||||||||||||||||||    
T  21378058 aggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaatatagacgccacactctta------------------tgggtttatgggtcctcttac 21378139  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||| | ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21378140 ttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgca 21378199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 1188588 - 1188746
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||  |||||| |||  ||| |||||||| |||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||    
T  1188588 ggggaccgcacacatctaggtcagagcaaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcact 1188687  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||  | ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1188688 tataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 1188746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Original strand, 50051689 - 50051776
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  50051689 ggggaccgtccacatcgatgctagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaagataatgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44092051 - 44091909
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||  ||| |||| ||||||||||||||| || |||||   | | | ||||||||| |||| ||||    
T  44092051 gggaccgtctacatcgaggccagaacaacaaaacaagtgagaaagacgccacactcttacccacaatcttaaaatattagatttatgggttctctcactt 44091952  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 161  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||    
T  44091951 ataaagtgttcaacctttacttttacatctgatgtgtgacata 44091909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 1187361 - 1187522
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaa-gcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 114  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||| | | || |  ||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||     
T  1187361 taggggaccgtccacatctaggtcagaacaactataaaaagtgagagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctc 1187460  T
Q  115 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||  |||| |||||  ||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1187461 acttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgagacatataattcacacttgca 1187522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10351278 - 10351202
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  10351278 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacct 10351202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 4956340 - 4956218
Alignment:
Q  29 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacac--cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 126  Q
    ||||||||| || | ||| | ||||||||||||| | ||  |||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  4956340 acatcgaggttaaagcaatcgcacaagcaagagatagacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatg 4956241  T
Q  127 ttcaacctttactattttatccg 149  Q
    ||||||||||||| || ||||||    
T  4956240 ttcaacctttacttttctatccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Original strand, 50051777 - 50051818
Alignment:
Q  144 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051777 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 50051818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Original strand, 41184408 - 41184486
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagac---accacactcttacccaaaaccttaaggc 93  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41184408 ggggaccgtcgacatcgaggctggaacaaccgcacaagtaagagcgacaatatcacactcttacccaaaaccttaaggc 41184486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 176
Target Start/End: Original strand, 35154150 - 35154197
Alignment:
Q  129 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35154150 caacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 35154197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 176
Target Start/End: Original strand, 50469180 - 50469239
Alignment:
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50469180 ttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttgca 50469239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4878869 - 4878803
Alignment:
Q  110 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4878869 ctctcacttataaaatgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgca 4878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 41184152 - 41184197
Alignment:
Q  82 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41184152 aaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaagtgt 41184197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 47380165 - 47380254
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 105  Q
    |||||||||  ||||||| ||||| || |||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  47380165 taggggaccacccacatctaggcttgagcaaccagacaagtgagagagatgtcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 77
Target Start/End: Original strand, 4266798 - 4266855
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctta 77  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4266798 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaac--cacaagtaagagagacatcacactctta 4266855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 5996870 - 5997029
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| | ||||| |||||| |    
T  5996870 taggggactgcccacatctcggctagagcaaccacacaaatgagagagacaccacactctcactcaaaaccttaa-acaatggatatatggatcctctca 5996968  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
     ||||||  ||||||| |   ||| || || |  |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5996969 tttataaaatgttcaagcaccacttttctaacttatgtgggacatataacccacgcttgca 5997029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 121
Target Start/End: Original strand, 35154046 - 35154106
Alignment:
Q  61 gagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  35154046 gagacaccacactcttgccaaaaaccttaagacaatcagtttatgggccctcttacttata 35154106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 186
Target Start/End: Original strand, 4266875 - 4266950
Alignment:
Q  111 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacata 186  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  4266875 tcttacttctaatgtgttcaacatttactcttttatctaatgtaggacatataactcacatttgtaaaacaacata 4266950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9499136 - 9499020
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||  | |||| ||||  ||||| |||| ||| || |    
T  9499136 gggaccgtccacatataggataaaacaaccacacaagtaaaagtgacaccacacttttatccaaaatttgaaggtaatgaatttataggtcatctaacat 9499037  T
Q  119 ataaggtgttcaacctt 135  Q
    ||||  |||||||||||    
T  9499036 ataaaatgttcaacctt 9499020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 12466401 - 12466365
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12466401 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 12466365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 176
Target Start/End: Original strand, 22077248 - 22077280
Alignment:
Q  144 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077248 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 22077280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 167
Target Start/End: Original strand, 30630912 - 30630972
Alignment:
Q  108 tcctcttacttataaggtgttcaaccttt-actattttatccgatgtgggacatataactc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  30630912 tcctcttacttataaggtgttcagcctttaatttttttatccgatgtaagacatataactc 30630972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 176
Target Start/End: Original strand, 47379891 - 47379943
Alignment:
Q  124 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47379891 gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgggatatataactcacacttgca 47379943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Original strand, 9956212 - 9956258
Alignment:
Q  57 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  9956212 aagagagacatcacactcttacccaaaacattaagacaatgtgttta 9956258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 31973375 - 31973411
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 94  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973375 agagagacatcacactcttacccaaaatcttaaggca 31973411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 50556587 - 50556451
Alignment:
Q  40 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 139  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||  ||| |||||| || | |||| ||||||||  ||||||||||   ||    
T  50556587 agaacaatcacacaagtgagagagataccaaacttttattcaaaaccttaagaaaataggtttacggattctctcacttataaattgttcaacctccgct 50556488  T
Q  140 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
     || |||  |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  50556487 tttctatatgatgtgtgatatataacccacacttgca 50556451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 80)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6500608 - 6500442
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6500608 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaaaggtcctcttact 6500509  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500508 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaacat 6500442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 40296315 - 40296473
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296315 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 40296414  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296415 tataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 40296473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 184
Target Start/End: Original strand, 18603124 - 18603286
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603124 accgtccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 18603223  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18603224 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgaaaactaaca 18603286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 27502036 - 27502202
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27502036 ggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 27502135  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27502136 tataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 27502202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 32487551 - 32487386
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487551 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 32487452  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487451 tat-aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32487386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41170792 - 41170627
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170792 ggggaccgtctacaccgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41170693  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 183  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41170692 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattacaaaccaac 41170627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 36492218 - 36492378
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  36492218 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttactt 36492317  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 179  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492318 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 36492378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6500980 - 6500815
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  6500980 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtccttttatt 6500881  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500880 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaaca 6500815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15370257 - 15370099
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  15370257 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttact 15370158  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370157 tataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15370099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Original strand, 3295345 - 3295498
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3295345 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttact 3295443  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3295444 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 624350 - 624188
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  624350 accgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttata 624251  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  624250 acgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 624188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 3295015 - 3295172
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3295015 ggggactgtccacatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcttcttact 3295114  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3295115 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacacttgca 3295172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 176
Target Start/End: Original strand, 13415774 - 13415918
Alignment:
Q  32 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415774 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 13415873  T
Q  132 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415874 cctttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 13415918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25328093 - 25327938
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25328093 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttact 25327994  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25327993 tataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 9498655 - 9498820
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498655 ggggaccgtccacattgaggctagaccagc-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 9498753  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9498754 tataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagacatataactcacatttgcaaaccaaca 9498820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41632940 - 41632782
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41632940 ggggaccgtccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctcttact 41632841  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41632840 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttgca 41632782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 42405598 - 42405752
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  42405598 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagag--acaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtccttttact 42405695  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42405696 tgtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttg 42405752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 11416977 - 11417128
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11416977 ggggaccatccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttact 11417076  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11417077 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26074761 - 26074614
Alignment:
Q  27 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 126  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074761 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 26074662  T
Q  127 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26074661 ttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttg 26074614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 299647 - 299490
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  299647 ggggactgtccacatcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttact 299548  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  299547 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 299490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 166
Target Start/End: Original strand, 34753029 - 34753173
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34753029 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttata 34753128  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 166  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  34753129 aggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataact 34753173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 12662652 - 12662810
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  12662652 ggggaccgaccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttact 12662751  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12662752 tataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12662810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 26075168 - 26075318
Alignment:
Q  25 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26075168 gtccacatcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 26075267  T
Q  124 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26075268 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcacacttg 26075318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Original strand, 26074155 - 26074304
Alignment:
Q  27 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 126  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  26074155 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtg 26074254  T
Q  127 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26074255 ttcaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 26074304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 1028517 - 1028673
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  1028517 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttatgggtcctcttact 1028616  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028617 tataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 1028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6224354 - 6224198
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6224354 ggggaccgtccatattgaggctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttact 6224255  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6224254 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataactcacacttg 6224198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35150165 - 35150007
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  35150165 aggggacggtccacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttac 35150067  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150066 ttataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35150007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 36568569 - 36568725
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  36568569 ggggaccttccacatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttacgggtcatctcact 36568666  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36568667 tataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36568725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 623976 - 623810
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||  ||||||    
T  623976 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttact 623877  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  623876 tgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 623810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15370558 - 15370428
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15370558 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttactta 15370459  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccga 150  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  15370458 taaggtgttcaacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33747925 - 33747783
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33747925 accgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttata 33747826  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 164  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33747825 aagtatttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 179
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549416
Alignment:
Q  41 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttacta 29549377  T
Q  141 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 179  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29549378 ttttatctgatatggaacatataactcacacttgcaaac 29549416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 184
Target Start/End: Original strand, 5723811 - 5723957
Alignment:
Q  38 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||   || |||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5723811 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaactttta 5723910  T
Q  138 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723911 ttattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5723957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Original strand, 24489207 - 24489360
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  24489207 gggaccgcccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttacta 24489304  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24489305 ataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 24489360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 26074807 - 26074938
Alignment:
Q  44 caaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 142  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  26074807 caaccacacttgcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactctt 26074906  T
Q  143 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074907 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 26074938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 38427697 - 38427553
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |    
T  38427697 tccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctc-tacttataagat 38427599  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 171  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38427598 gttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 176
Target Start/End: Original strand, 26590918 - 26591068
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26590918 tccacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggt 26591017  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||| ||  || |||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  26591018 gttcaacctttacttttcgattcgatatggaacatttaaatcacacttgca 26591068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 301107 - 300961
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||        ||||||||||    
T  301107 ggaccgttcacgtcgagacttgaacagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggcaatggatt--------ctcttactta 301016  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  301015 taaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttg 300961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 35167838 - 35167994
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| || ||||    
T  35167838 ggggacagtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctact 35167937  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||| |||||    
T  35167938 tataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttg 35167994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2411165 - 2411010
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  2411165 ggggaccgtccatatcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgggttctcttact 2411066  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    || ||| |||||||| ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2411065 tacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactcacactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 35915007 - 35914852
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||| |||| | || ||| || | |||||||||||| |||||| ||||| |||| |  ||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  35915007 ggggaccgtccacattgaggtttgaccaatcatataagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggcaatggatttacgggtcttcttact 35914908  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35914907 tataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactcatactt 35914852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768842
Alignment:
Q  101 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttgaaaaccaaca 7768842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 175
Target Start/End: Original strand, 36521922 - 36522053
Alignment:
Q  44 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 143  Q
    |||||||||||   |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||  ||| ||     
T  36521922 caaccacacaaatgagagagatgacacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttc 36522021  T
Q  144 tatccgatgtgggacatataactcacacttgc 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36522022 tatctgatgtgggacatataactcacacttgc 36522053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508614
Alignment:
Q  81 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttg 42508614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Original strand, 26900017 - 26900089
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 90  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26900017 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 173
Target Start/End: Original strand, 36522277 - 36522392
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |  | | || ||||| ||||| ||    
T  36522277 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgaga 36522376  T
Q  158 catataactcacactt 173  Q
    ||||||||||||||||    
T  36522377 catataactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26074398 - 26074320
Alignment:
Q  96 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26074398 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31509742 - 31509623
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 156  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||| |    
T  31509742 agagagacactacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgag 31509643  T
Q  157 acatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31509642 acatataactcacacttgca 31509623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Original strand, 41635212 - 41635346
Alignment:
Q  39 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 138  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41635212 tagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttac 41635311  T
Q  139 tattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    | ||||||| |||| |  |||||||||||| ||||    
T  41635312 tcttttatctgatgggaaacatataactcatactt 41635346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Original strand, 13786002 - 13786157
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| || |  ||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||||||    
T  13786002 gggaccgtcgacaacgaggccagaacaatcataatagtgagagagacatcacactcttatccaaaatcttaagacaatagatttacgggtcatcttactt 13786101  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat-ataactcacacttg 174  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  13786102 ataaagtgttcaaccatcact-ttttatccgatgtgaaacataattactcacacttg 13786157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31509857 - 31509745
Alignment:
Q  51 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 149  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||    
T  31509857 acaagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccg 31509758  T
Q  150 atgtgggacatat 162  Q
    ||||| |||||||    
T  31509757 atgtgagacatat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 13042657 - 13042606
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13042657 agagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 13042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 38427377 - 38427306
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctta 89  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38427377 ggggaccgccaacatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 39309764 - 39309686
Alignment:
Q  95 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39309764 atgggtttatgg-tcctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttg 39309686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Original strand, 13785631 - 13785732
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||    
T  13785631 aggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccatacaaacgagagaaacaccacacttttacttaaaaccttaaggttatgggtttatagatcctattac 13785730  T
Q  117 tt 118  Q
    ||    
T  13785731 tt 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 92
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795306
Alignment:
Q  40 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 92  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 795306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Original strand, 9498343 - 9498410
Alignment:
Q  38 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 105  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9498343 ctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttactcaaatgcttaaggcaatgggtttatg 9498410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 119
Target Start/End: Original strand, 36527117 - 36527196
Alignment:
Q  40 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  36527117 agaacagccacacaagtgagagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggatcctctcactta 36527196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42524811 - 42524719
Alignment:
Q  81 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42524811 aaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttg 42524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 32446003 - 32445943
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32446003 agagagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcactt 32445943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 13112651 - 13112604
Alignment:
Q  62 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13112651 agacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 13112604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5660338 - 5660288
Alignment:
Q  136 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacata 186  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5660338 tactattttattcgatgtggaacatataactcacatttgcaaaccaacata 5660288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6225104 - 6225047
Alignment:
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6225104 cttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactcagactt 6225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19275653 - 19275566
Alignment:
Q  51 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 139  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19275653 acaagcgagacagacgccacaatcttacccaaaatcttaagacaatgaatttatgggtcttcttccttataa-gtgttcaacctctact 19275566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13042822 - 13042784
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13042822 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13042784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13112820 - 13112782
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13112820 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13112782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150747
Alignment:
Q  134 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35150747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151038
Alignment:
Q  134 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35151038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 42435583 - 42435486
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||  | |||||| |||||||||||    
T  42435583 ggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacacttatgagagagacatcacactctgattcaaaaccttaaggtaat-agattatggatcctcttactt 42435486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24489635 - 24489583
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactc 74  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24489635 accgttcatatcgaggttagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactc 24489583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 109
Target Start/End: Original strand, 36389016 - 36389067
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  36389016 agagaaacaccacactctgacccaaaaccctaaggcactgagtttatgggtc 36389067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 5963795 - 5963765
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963795 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 5963765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Original strand, 9510546 - 9510624
Alignment:
Q  44 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | | ||||| ||||  |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  9510546 caaccacacaagtaagagagacactatatttttacctaaaattttaaggcattaggtttatggctcctctcacttataa 9510624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Original strand, 22298956 - 22299014
Alignment:
Q  127 ttcaacctttactatttt-atccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22298956 ttcaacctttattatttttatctgatgtgagacatataacccacacatgcaaaccaaca 22299014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 78
Target Start/End: Original strand, 795152 - 795189
Alignment:
Q  42 aacaaccacacaa-gcaagagagacaccacactcttac 78  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  795152 aacaaccacacaaagcaagagagacaccacactcttac 795189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5660405 - 5660340
Alignment:
Q  22 accgtccacatc-gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||| ||||||||    
T  5660405 accgtccacatttgaggctagaacaaccacacaaacaagaaaaacaccatacttttatccaaaacc 5660340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 34103666 - 34103625
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 105  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  34103666 acaccacactcttattcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 34103625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 35150863 - 35150810
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccaca 71  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  35150863 ggggaccatccacatcgaggctaaaacaatcacactagtgagagagacaccaca 35150810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 173
Target Start/End: Original strand, 13785732 - 13785764
Alignment:
Q  141 ttttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13785732 ttttatccgatttgggacatataactcacactt 13785764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 41341567 - 41341523
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 108  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  41341567 acaccacattcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtgtatgggt 41341523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 80)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3669845 - 3669679
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3669845 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 3669746  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669745 tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3669679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3670220 - 3670052
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  3670220 tagggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcata 3670121  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670120 cttataaggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3670052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Original strand, 3038292 - 3038446
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3038292 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttactta 3038391  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038392 taaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3038446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30441236 - 30441073
Alignment:
Q  25 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta----t 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |    
T  30441236 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataatt 30441137  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441136 aaggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 30441073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34835026 - 34834878
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34835026 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggt 34834927  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34834926 gtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 34834878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34835367 - 34835211
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34835367 ggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 34835268  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34835267 tataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttg 34835211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122215
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 45122215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 20870575 - 20870741
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20870575 ggaccgtccatatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatgggtcctcttactta 20870674  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20870675 taagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaacatatataactcacacttgcaaaccaaca 20870741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 184
Target Start/End: Original strand, 1014253 - 1014411
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1014253 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggt 1014352  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014353 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttgcaaaccaaca 1014411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 6876862 - 6877021
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  6876862 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttatt 6876961  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac-atataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6876962 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgca 6877021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9608904 - 9608745
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  9608904 agggggccgtccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttac 9608805  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9608804 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 9608745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 174
Target Start/End: Original strand, 25561813 - 25561972
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25561813 taggggaccttccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctt 25561912  T
Q  115 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25561913 acttataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 25561972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Original strand, 33113368 - 33113523
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33113368 gggaccgtccgcattgagcctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 33113467  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33113468 ataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcaaacttg 33113523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40518229 - 40518071
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  40518229 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttact 40518130  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttac--tattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40518129 tataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttg 40518071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 184
Target Start/End: Original strand, 1013879 - 1014037
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1013879 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggt 1013978  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1013979 gttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgcaaaccaaca 1014037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40518738 - 40518584
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  40518738 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttattta 40518639  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40518638 taaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 40518584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34835633 - 34835476
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34835633 ggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 34835534  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835533 tataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34835899 - 34835742
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34835899 ggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 34835800  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835799 tataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 37544490 - 37544646
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  37544490 ggggatcgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttct 37544589  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37544590 tataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttg 37544646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 45122782 - 45122638
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45122782 ggggaccttccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttact 45122683  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45122682 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgcgggccatat 45122638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 147609 - 147454
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  147609 ggggaccacccacatcaatgctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatt 147510  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147509 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 169
Target Start/End: Original strand, 9482608 - 9482755
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482608 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 9482707  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9482708 aggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcac 9482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9309512 - 9309355
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9309512 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacatactga-gagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttact 9309414  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309413 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 9309355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 45121910 - 45122068
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45121910 ggggaccttccacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 45122009  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45122010 tataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 45122068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Original strand, 9483191 - 9483320
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9483191 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttata 9483290  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgat 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9483291 aggtgttcaacctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30359430 - 30359273
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  30359430 agggaaccatccacattgaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgc 30359331  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359330 ttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 30359273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 1513915 - 1514071
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  1513915 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttact 1514014  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1514015 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttg 1514071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 70277 - 70425
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  70277 gaccgtccgcattgaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttat 70376  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 169  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  70377 aagatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 8918764 - 8918922
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8918764 ggggaccgtccacatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttact 8918863  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8918864 tataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttgca 8918922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Original strand, 40579512 - 40579670
Alignment:
Q  24 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40579512 cgtccacatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataag 40579611  T
Q  124 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  40579612 gtgttcaacctttactattttatccaatatgaaacatataattcacacttggaaaccaa 40579670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5916025 - 5915872
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  5916025 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta-- 5915928  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
      ||| ||||| ||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5915927 --taaagtgttaaac-tttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 5915872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5420807 - 5420651
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5420807 ggacggtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 5420708  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5420707 taagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataatacacacttgca 5420651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30359763 - 30359611
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30359763 accgtccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttata 30359664  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30359663 aggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 30359611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41972316 - 41972158
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaa---aaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  41972316 gaccgtccatattgaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcact 41972217  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972216 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41972158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45123164 - 45123006
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  45123164 ggggaccgtccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatctta 45123065  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45123064 ctta--aggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 45123006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6732055 - 6731896
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  6732055 taggggatcatccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta 6731956  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6731955 ct---------ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaacaaca 6731896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 166
Target Start/End: Original strand, 18371998 - 18372142
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18371998 accgttcacattgaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttata 18372097  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18372098 aggtgttcaacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9309139 - 9308977
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacact---cttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9309139 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctctt 9309041  T
Q  115 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9309040 acttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttgca 9308977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Original strand, 32640542 - 32640682
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     |||    
T  32640542 cacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcggtcctcttaccta-----tgt 32640636  T
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32640637 tcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacactt 32640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 45121663 - 45121811
Alignment:
Q  25 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  45121663 gtccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataagg 45121762  T
Q  125 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45121763 tgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttg 45121811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Original strand, 18380020 - 18380171
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||    
T  18380020 gggactgtccacatcgaagctagaagaatcgcacaagcaagagg--caccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttactt 18380117  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18380118 ataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6651652 - 6651510
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||      
T  6651652 ggggaccatccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta-- 6651555  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 169  Q
           | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6651554 -------ttttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 6651510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 169
Target Start/End: Original strand, 18371665 - 18371807
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||      
T  18371665 accgtccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggca-tgggtttatgggtcttcttacttaa- 18371762  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 169  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18371763 ---tgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 18371807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32305635 - 32305478
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||| || | |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  32305635 ggggaccgtccacatcaaggttagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttact 32305536  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  32305535 tataaggtgttcaacctttactattttatcc-------gacatataactcacacttgcaaaccaa 32305478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 4154678 - 4154824
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  4154678 cacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgt 4154775  T
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4154776 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgca 4154824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 147968 - 147829
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||| | |||    
T  147968 cacattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg---------ttatatgttgt 147878  T
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  147877 tcaacatttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 147829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9507933 - 9507777
Alignment:
Q  25 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9507933 gtccacatcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataagg 9507834  T
Q  125 tgttcaacctttact---attttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 176  Q
    | |||||||||||||    |||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  9507833 tattcaacctttactgtacttttatccaatatggaggagatataactcacacttgca 9507777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609108
Alignment:
Q  39 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  139 tattttatccgatgt 153  Q
    | || |||| |||||    
T  9609122 ttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 98 - 184
Target Start/End: Original strand, 41416251 - 41416335
Alignment:
Q  98 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41416251 ggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact--cacttgcaaaccaaca 41416335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274934
Alignment:
Q  63 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat 162  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  163 aactcacactt 173  Q
    |||||||||||    
T  43274924 aactcacactt 43274934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794113
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 157  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  158 catataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||    
T  8794129 catataactcacacttg 8794113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 101
Target Start/End: Original strand, 40579269 - 40579352
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40579269 ggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatgggtt 40579352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 172
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373085
Alignment:
Q  72 ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 171  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacac 18373084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12284021 - 12283873
Alignment:
Q  27 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| ||| | |||||| |||| |     
T  12284021 ccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttacttttaagata 12283923  T
Q  127 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  12283922 ttcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataacttacacttgca 12283873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 173
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372854
Alignment:
Q  104 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 8919144 - 8919220
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 94  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8919144 ggggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggca 8919220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 174
Target Start/End: Original strand, 18372656 - 18372758
Alignment:
Q  68 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 167  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||    
T  18372656 cacactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatc 18372751  T
Q  168 acacttg 174  Q
    |||||||    
T  18372752 acacttg 18372758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 9620678 - 9620834
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||  ||||||||| || |||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  9620678 ggggaccgtccacatccaggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcact 9620775  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| ||| ||||| | |||| || |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  9620776 tataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgca 9620834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 173
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372411
Alignment:
Q  104 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 41129146 - 41129066
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 98  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41129146 ggggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatgg 41129066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 173
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037865
Alignment:
Q  86 cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacactt 173  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 4154281 - 4154438
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||| |||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  4154281 ggggaccacccacatctaggccagagcaaccaaacaattgagagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgggt-ctctcact 4154379  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4154380 tataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtaggacatataactcacatttgca 4154438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 172
Target Start/End: Original strand, 43398077 - 43398225
Alignment:
Q  27 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc---ttacttataag 123  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||| |||||||    
T  43398077 ccacatcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataag 43398176  T
Q  124 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 172  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  43398177 gtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  103 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 166  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130454
Alignment:
Q  71 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 170  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 20130455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5274907 - 5274775
Alignment:
Q  44 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 143  Q
    |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||  | |||||| ||||||||||| | || |||    
T  5274907 caacaacacaagcgatagagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttt 5274808  T
Q  144 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||| | |||| | |||||||||||| |||||||    
T  5274807 tattcaatgtagaacatataactcatacttgca 5274775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 20995433 - 20995497
Alignment:
Q  35 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggg 99  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20995433 aggccagagcaaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatggg 20995497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 43274635 - 43274699
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaa 82  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43274635 ggggaccgtccacatcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16524503 - 16524446
Alignment:
Q  38 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 95  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16524503 ctagagcaaccacacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaagcaa 16524446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 173
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372526
Alignment:
Q  132 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 18372526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 140
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373292
Alignment:
Q  84 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 140  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttacta 18373292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40991852 - 40991756
Alignment:
Q  77 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||| || ||  | ||||||||| | ||||||||||||    
T  40991852 acccaaaaccttgaggcattgggtttatgggtcctctcacttatgaagtgttcaacctccacttttctaagcaatgtgggacttctaactcacactt 40991756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 65
Target Start/End: Original strand, 3037969 - 3038016
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagac 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3037969 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagatagagagac 3038016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 122
Target Start/End: Original strand, 40417733 - 40417820
Alignment:
Q  35 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 122  Q
    |||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  40417733 aggcaagagcaatcacacaagtgagagagacaccacacttttatccaaaatcttaacgcaatggatttacgagtcatcttacttataa 40417820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 76
Target Start/End: Original strand, 18372288 - 18372342
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt 76  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18372288 accgtccacatcgagactaaagcaaccgcacaagcgagagagacaccacactctt 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 105
Target Start/End: Original strand, 12156708 - 12156745
Alignment:
Q  68 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12156708 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 12156745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995559
Alignment:
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 20995559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33832055 - 33831978
Alignment:
Q  99 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || | | | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  33832055 gtttataggtcctcttacttataaagtgttcaacttctacttttctcttcaacgtgagacatataactcacacttgca 33831978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 11442952 - 11442911
Alignment:
Q  77 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  11442952 acccaaaaccttaaggcattgagtttatgggtcctctcactt 11442911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 176
Target Start/End: Original strand, 18645713 - 18645745
Alignment:
Q  144 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18645713 tatccgatgtgagacatataactcacacttgca 18645745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 1085616 - 1085774
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085616 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 1085715  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085716 tataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1085774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 37533011 - 37533176
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37533011 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 37533109  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533110 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 37533176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7517739 - 7517580
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517739 aggggaccacccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 7517640  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517639 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 7517580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 37533364 - 37533531
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37533364 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttact 37533463  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37533464 tataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatataactcacacttacaaatcaacat 37533531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 23377 - 23535
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23377 ggggaccgtccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 23476  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23477 tataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgca 23535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29157720 - 29157559
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29157720 gaccgtccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttat 29157621  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29157620 aaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 29157559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30244428 - 30244272
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30244428 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 30244329  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244328 tataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 30244272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11845349 - 11845198
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11845349 ggggaccgtctacatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttact 11845250  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11845249 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6054718 - 6054562
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6054718 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttact 6054619  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6054618 tataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttg 6054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 40094774 - 40094932
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40094774 ggggaccgaccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttact 40094873  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40094874 tataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgca 40094932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45433399 - 45433243
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  45433399 ggggaccgaccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctcttact 45433300  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45433299 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttg 45433243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 22567039 - 22567196
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22567039 ggggaccatccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 22567138  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22567139 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgt-ggacatattactcacacttgca 22567196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 176
Target Start/End: Original strand, 36939741 - 36939891
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36939741 tccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggt 36939840  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36939841 gttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttgca 36939891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7554154 - 7554025
Alignment:
Q  47 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 146  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554154 ccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 7554055  T
Q  147 ccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554054 ccgatgtgggacatataactcacacttgca 7554025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754718
Alignment:
Q  29 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 45754763  T
Q  129 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45754762 caacatttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttg 45754718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14681663 - 14681502
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  14681663 gaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacttg--tgagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttac 14681566  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14681565 aaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaaca 14681502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122740
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgt 19122780  T
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19122779 tcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30245231 - 30245079
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30245231 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcgtcttact 30245136  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30245135 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 30245079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24177593 - 24177435
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24177593 ggggaccgtccacgtcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttact 24177494  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24177493 tataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatacttgca 24177435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 170
Target Start/End: Original strand, 34218036 - 34218186
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34218036 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 34218135  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 170  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34218136 taaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcaca 34218186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45434794 - 45434638
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  45434794 ggggaccgatcacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttact 45434695  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45434694 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 45434638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 47129253 - 47129097
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  47129253 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttatgggtcctcttact 47129154  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47129153 tataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 47129097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 118299 - 118459
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  118299 ggggaccgtccacatcaaagctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctctta 118398  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  118399 cttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgca 118459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 176
Target Start/End: Original strand, 22566702 - 22566820
Alignment:
Q  57 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22566702 aagagagac-ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggg 22566800  T
Q  157 acatataactcacacttgca 176  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  22566801 acatattactcacacttgca 22566820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 8128441 - 8128599
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  8128441 ggggactgttcacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttaca 8128540  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8128541 tataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 8128599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 30032725 - 30032572
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  30032725 ggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatggatactcttact 30032626  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 171  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30032625 tataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacac 30032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36623117 - 36622960
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  36623117 gggaccgtccacatcaaggtcagaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctactt 36623018  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36623017 ataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36622960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9901799 - 9901648
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||    
T  9901799 ggacagtccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgta 9901701  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9901700 taagatgttcaacctttactgttttatccgatgt-ggacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16569316 - 16569196
Alignment:
Q  56 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16569316 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16569217  T
Q  156 gacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16569216 gacatataactcacacttgca 16569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 16596346 - 16596466
Alignment:
Q  56 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16596346 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16596445  T
Q  156 gacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16596446 gacatataactcacacttgca 16596466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 40230295 - 40230449
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  40230295 accgtccacatagaggttagaataactacacttgcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttata 40230394  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    || |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40230395 agatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggacatataacttacacttgca 40230449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 173
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838857
Alignment:
Q  41 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc-tcttacttataaggtgttcaacctttact 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  140 attttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataacttacactt 24838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 176
Target Start/End: Original strand, 1085280 - 1085407
Alignment:
Q  50 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 149  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  1085280 cacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccg 1085379  T
Q  150 atgtgggacat-ataactcacacttgca 176  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||    
T  1085380 atatgggacataaaaactcacacttgca 1085407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20599471 - 20599317
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||    
T  20599471 gaccgttcacatcaaggttaaaacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttattt 20599372  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20599371 ataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacactt 20599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Original strand, 36534795 - 36534942
Alignment:
Q  27 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36534795 ccacatcgaggctggaacaaccacacttgt--gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtg 36534892  T
Q  127 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  36534893 ttcaacctctactgttttatccgaggtgggacatataagttacacttgca 36534942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41854792 - 41854635
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||| |||| ||    
T  41854792 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgct 41854693  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41854692 tataaggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttgca 41854635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37167937 - 37167808
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||      
T  37167937 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctcttact-- 37167840  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 155  Q
         |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37167839 ----ctgttcaacatttactattttatctgatgtgg 37167808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 30253646 - 30253534
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30253646 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttact 30253551  T
Q  118 tataaggtgttcaacct 134  Q
    |||||||| ||||||||    
T  30253550 tataaggtcttcaacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Original strand, 41910592 - 41910749
Alignment:
Q  24 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc--------ttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||| |||| |        ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  41910592 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacttgtgagagaaacaccacactcttaccaaaaatccaaaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctca 41910691  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41910692 gttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 130
Target Start/End: Original strand, 28300255 - 28300366
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-gggtcctcttactt 118  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28300255 ggaccgtccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggggttctcttactt 28300354  T
Q  119 ataaggtgttca 130  Q
    ||||||||||||    
T  28300355 ataaggtgttca 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241495
Alignment:
Q  55 gcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 154  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtg 43241517  T
Q  155 ggacatataactcacacttgca 176  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  43241516 gaacatataactcacacttgca 43241495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 47129527 - 47129450
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129527 ggggaccgtccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 47129450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 88 - 176
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301701
Alignment:
Q  88 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 28301701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245494
Alignment:
Q  103 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 30245494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255339
Alignment:
Q  103 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgca 30255339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 93
Target Start/End: Original strand, 28300569 - 28300644
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctta-cccaaaaccttaaggc 93  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28300569 gggatcgtccacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggc 28300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244701
Alignment:
Q  106 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 30244701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 176
Target Start/End: Original strand, 36109007 - 36109075
Alignment:
Q  108 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36109007 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgca 36109075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Original strand, 37532753 - 37532821
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532753 ggaccgtccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 171
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361616
Alignment:
Q  71 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 170  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 44361615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 109
Target Start/End: Original strand, 21416181 - 21416232
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21416181 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 21416232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 107
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569091
Alignment:
Q  59 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 30244509 - 30244453
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 75  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30244509 gggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30244453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 30245319 - 30245256
Alignment:
Q  12 agcataggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 75  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30245319 agcatgggggaccgtccacattgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Original strand, 4124128 - 4124246
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 157  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||  | | || || ||||||| |||    
T  4124128 agagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataaagtgtcaaacctcaaattttctaaccgatgtagga 4124227  T
Q  158 catataactcacacttgca 176  Q
    ||| ||| ||||| |||||    
T  4124228 catgtaattcacagttgca 4124246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 30253728 - 30253671
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 75  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30253728 ggggacagtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30253671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14681324 - 14681276
Alignment:
Q  139 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacatat 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14681324 tattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaatatat 14681276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Original strand, 40094424 - 40094503
Alignment:
Q  29 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  40094424 acatcggggctagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaactttaaagtaatgagtttatgggt 40094503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 176
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094552
Alignment:
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgca 40094552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 45755072 - 45755010
Alignment:
Q  31 atcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 93  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  45755072 atcgaggcttgaacaaccacacaagtaagggagacaccacacttttacccaaaattttaaggc 45755010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 109
Target Start/End: Original strand, 21619091 - 21619136
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21619091 acaccacacttttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 21619136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 37393216 - 37393114
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||    |||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| || |||||| |||| |||||||    
T  37393216 ggggatcgtccacatcgaggttagagcaaccacataagtggaagagacgccacacttttactcaaaacctcaaggcattgagtttat-ggtcatcttact 37393118  T
Q  118 tata 121  Q
    ||||    
T  37393117 tata 37393114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 174
Target Start/End: Original strand, 36967335 - 36967385
Alignment:
Q  124 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36967335 gtgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 36967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37346036 - 37345916
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 157  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || |||| ||| |  ||    
T  37346036 agagagacgtcacactcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttctatcagatatatga 37345937  T
Q  158 c--atataactcacacttgca 176  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  37345936 catatataactcacacttgca 37345916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15902457 - 15902342
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | | ||||| ||  | | |||    
T  15902457 ggggaccacccacatccaggc-agaacaatcacacaagtgagagcgacaccacacttttatccaaaaccttaagacaacgagcttatgtgtgatttcact 15902359  T
Q  118 tataaggtgttcaacct 134  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15902358 tataaagtgttcaacct 15902342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Original strand, 27391815 - 27391859
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27391815 acaccacactcttacctaaaaccttaaggcagtggatttatgggt 27391859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Original strand, 4719305 - 4719359
Alignment:
Q  27 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccca 81  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  4719305 ccacaacgaggctagagcaaccgcacaaacaagagaaataccacactcttaccca 4719359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 7517816 - 7517767
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca 66  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7517816 aggggaccacccatatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagaca 7517767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 7518082 - 7518033
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca 66  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7518082 aggggaccacccatatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagaca 7518033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27598092 - 27598052
Alignment:
Q  69 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27598092 acactcttacgcaaaaccctaagacaatgggtttatgggtc 27598052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 6e-76; HSPs: 104)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25483491 - 25483336
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25483491 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttat 25483392  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25483391 aagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 25483336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41370515 - 41370349
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370515 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41370416  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370415 tataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 41370349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 50630755 - 50630919
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630755 ggaccgcccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 50630854  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50630855 taatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacgcttgcaaaccaaca 50630919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 55933122 - 55933288
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933122 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 55933221  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933222 tataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaaca 55933288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36629394 - 36629239
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36629394 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 36629295  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629294 ataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 36629239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 54017596 - 54017751
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017596 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 54017695  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  54017696 aagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttgca 54017751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Original strand, 1731646 - 1731803
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  1731646 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttattt 1731745  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1731746 ataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgca 1731803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 50002584 - 50002423
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  50002584 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttact 50002485  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 179  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50002484 taaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaac 50002423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3340962 - 3340807
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3340962 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttat 3340863  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3340862 aaggtgctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttgca 3340807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 39404555 - 39404400
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39404555 gggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttactt 39404456  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39404455 ataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 39404400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10246077 - 10245920
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  10246077 ggggagcgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttat-ggtcctcttact 10245979  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10245978 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgca 10245920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Original strand, 39792860 - 39793014
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||    
T  39792860 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctctttctta 39792959  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39792960 taaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 39793014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884695
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 126  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  52884844 cacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtg 52884745  T
Q  127 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884744 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 36608659 - 36608817
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  36608659 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatggatcctcttact 36608758  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36608759 tatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgca 36608817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39404176 - 39404007
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  39404176 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttatgagtcctcttact 39404077  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacatat 187  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  39404076 tataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttgtacacaaacatat 39404007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108928
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 127  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 54108962  T
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacata 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108961 tcaacctttactattttatccgatgtgggacata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Original strand, 34646648 - 34646803
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  34646648 gggaccgtccacaacaaggctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagtt 34646747  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34646748 ataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34646803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44620817 - 44620660
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  44620817 ggggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttatgg-tttatgggtcctcttact 44620719  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620718 tataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttgca 44620660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 49880297 - 49880152
Alignment:
Q  38 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 137  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49880297 ctagaacaac-acataaacaagagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 49880199  T
Q  138 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49880198 ctattttattcaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 49880152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 50459878 - 50459724
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  50459878 gggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttactt 50459779  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50459778 ataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 54343006 - 54343147
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||    
T  54343006 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttact 54343098  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343099 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Original strand, 22027960 - 22028117
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22027960 gggactgtccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatatgtttatgggtcctcttactt 22028059  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22028060 ataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttgca 22028117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44620511 - 44620362
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  44620511 ggggaccgtccacatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttatt 44620412  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 167  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44620411 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36572177 - 36572021
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36572177 ggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttact 36572078  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36572077 tataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 36572021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 52885038 - 52884887
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagaga--caccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52885038 cacatcgaggctagatcaaccacacaaataagagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagg 52884939  T
Q  125 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884938 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 22183262 - 22183420
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22183262 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttact 22183361  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22183362 tataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgca 22183420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 176
Target Start/End: Original strand, 4955332 - 4955473
Alignment:
Q  35 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 134  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955332 aggctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacct 4955431  T
Q  135 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4955432 taactattttatccgatatgagacatataactcacacttgca 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44621160 - 44621011
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||    
T  44621160 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttact 44621061  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  44621060 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 158
Target Start/End: Original strand, 18932747 - 18932887
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18932747 ggggaccgtacacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatt 18932846  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 158  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18932847 tataaggtattcaacctttactattttatccgatgtaggac 18932887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 49076828 - 49076986
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  49076828 aggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggttatgggtttatgggttctcttac 49076927  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076928 -tataaggtgttcaacctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttgca 49076986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 54936353 - 54936215
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936353 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 54936255  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 157  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54936254 tacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 54936215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 22028367 - 22028527
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22028367 ggggaccgtccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttact 22028466  T
Q  118 tataaggtgttcaaccttta--ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
     |||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22028467 aataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttgca 22028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 32941128 - 32941279
Alignment:
Q  25 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  32941128 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataagg 32941227  T
Q  125 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32941228 tgttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttgca 32941279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 49303065 - 49302907
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49303065 aggggatcgtccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 49302966  T
Q  117 --ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  49302965 ttttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20826000 - 20825842
Alignment:
Q  12 agcataggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcct 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  20826000 agcatgggggactgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgct 20825901  T
Q  112 cttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 170  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20825900 cttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcaca 20825842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 54108694 - 54108537
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-ggtttatgggtcctcttac 116  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  54108694 ggggaccg-ccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttac 54108596  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  54108595 ttataaggtgttcaacctttactattttatcctatatgggac--ataactcacacttgcaa 54108537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Original strand, 16889535 - 16889691
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||    
T  16889535 gggaccgtccacatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttactt 16889634  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 175  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16889635 ataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactcacacttgc 16889691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2740856 - 2740700
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  2740856 ggggaccatccatatcgaggctagaacaaccaca--agtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttataggtcctcttact 2740759  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740758 tataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2740700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Original strand, 16888812 - 16888971
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  16888812 taggggaccgtctacatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctctta 16888911  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 175  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16888912 cttataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgc 16888971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20826370 - 20826223
Alignment:
Q  23 ccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20826370 ccgtccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataa 20826271  T
Q  123 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 170  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826270 cgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 45496934 - 45496820
Alignment:
Q  47 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45496934 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttat 45496835  T
Q  147 ccgatgtgggacata 161  Q
    |||||||||||||||    
T  45496834 ccgatgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 3244448 - 3244607
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3244448 aggggactgcccacatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 3244547  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3244548 ttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 3244607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 4390102 - 4390257
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | | | || |||||||||||||    
T  4390102 gaccgtccgcatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttat 4390201  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  4390202 aaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttgca 4390257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2741180 - 2741071
Alignment:
Q  67 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2741180 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  167 cacacttgca 176  Q
    ||||||||||    
T  2741080 cacacttgca 2741071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 122
Target Start/End: Original strand, 23817679 - 23817783
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23817679 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttact 23817778  T
Q  118 tataa 122  Q
    |||||    
T  23817779 tataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 185
Target Start/End: Original strand, 6975489 - 6975621
Alignment:
Q  53 aagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6975489 aagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatg 6975588  T
Q  153 tgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 185  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6975589 tgagacatataactcacatttgcaaactaacat 6975621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 174
Target Start/End: Original strand, 41707503 - 41707618
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41707503 agagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 41707601  T
Q  158 catataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707602 catataactcacacttg 41707618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 34004586 - 34004739
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34004586 gaccgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aatgagtttatgggtcctcttacttat 34004684  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34004685 aagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttgca 34004739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 43174667 - 43174508
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || |||||||| |||||||||    
T  43174667 tagggaaccgtccacatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctctta 43174568  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttact-attttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  43174567 cttataaggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactcacacttg 43174508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 49076449 - 49076604
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||| ||||||| | ||  |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  49076449 ggggaccgtccacatcgaggctataacaatcgcataagcgagacagacaccgccct--tacccaaa-ctttaagacaatgggtttataggtcctcttact 49076545  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076546 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgca 49076604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3341286 - 3341128
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||   |||||||||||||||||    
T  3341286 ggggaccgtctacatcgaggttaaaataaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttact 3341187  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3341186 tataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 3341128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504707
Alignment:
Q  30 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||         ||||||    
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttc 19504752  T
Q  130 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19504751 aacttttactattttatccgatatgggacatataactcatacttg 19504707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Original strand, 45489331 - 45489485
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||  || | |||||| | || |||||||||    
T  45489331 gggaccatccacatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa-cagtaggtttaagagttctcttactt 45489429  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  45489430 atatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttg 45489485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 51768061 - 51768216
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  51768061 gaccgtccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttat 51768160  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||| |||||| || ||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  51768161 aaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcacatttgca 51768216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 176
Target Start/End: Original strand, 54741194 - 54741334
Alignment:
Q  34 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 133  Q
    |||||||||||||| ||||  |  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54741194 gaggctagaacaacaacacgtg--agagagagactacactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 54741291  T
Q  134 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  54741292 tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttgca 54741334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3700512 - 3700365
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||        ||| ||||||||    
T  3700512 gaccgtccacatcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatgagt--------ccttttacttat 3700421  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3700420 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 3700365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18879962 - 18879852
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  18879962 ggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttataggtcatcttactta 18879863  T
Q  120 taaggtgttca 130  Q
    |||||||||||    
T  18879862 taaggtgttca 18879852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43827597 - 43827480
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  43827597 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttatt 43827499  T
Q  118 tataaggtgttcaaccttt 136  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  43827498 tataaggagttcaatcttt 43827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31691306 - 31691203
Alignment:
Q  24 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31691306 cgtccacatcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttata 31691207  T
Q  122 aggt 125  Q
    ||||    
T  31691206 aggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 163
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017845
Alignment:
Q  68 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 163  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40067181 - 40067045
Alignment:
Q  39 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac-cttta 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  40067181 tagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttttta 40067082  T
Q  138 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40067081 cacttttatccgatgtagaacatataactcacacttg 40067045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28034387 - 28034229
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||| || | ||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||    
T  28034387 ggggaccatccacatccagaccagagcaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcact 28034288  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28034287 tataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcgggacatataattcacacttgca 28034229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 48111696 - 48111833
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||   |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||    
T  48111696 ggggaccgtccacattgaggttagaaaaaccacatttgtgagagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtccttttact 48111795  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 155  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48111796 tataatgtgttcaacctttactcttttatccgaggtgg 48111833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3271947 - 3271806
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaa-gagagacac-cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3271947 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagacacacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctctta 3271848  T
Q  116 ctt---ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 154  Q
    |||   |||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||    
T  3271847 cttataataaggtgtttaacttttacttttctatctgatgtg 3271806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 760320 - 760194
Alignment:
Q  44 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 143  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| | | ||     
T  760320 caaccacacaaatgagagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagttctcaaccttcatttttc 760222  T
Q  144 tatccgatgtgggacatataactcacac 171  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  760221 tattcgatgtgggacatataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Original strand, 15841383 - 15841482
Alignment:
Q  35 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 134  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15841383 aggctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacct 15841482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246347
Alignment:
Q  87 ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttgca 10246347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 184
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788147
Alignment:
Q  124 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaaca 50788147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44620362 - 44620304
Alignment:
Q  110 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44620362 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactca 44620304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 176
Target Start/End: Original strand, 23556890 - 23557022
Alignment:
Q  44 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 143  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||  ||| ||     
T  23556890 caaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttc 23556989  T
Q  144 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  23556990 tatccgatgtaaaacatttaactcacacttgca 23557022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 170
Target Start/End: Original strand, 45489712 - 45489864
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||| || || |||||||    
T  45489712 ggggatcggccacatcgagactagaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaaccttaaactttaaggtttaaggatcatcttact 45489811  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 170  Q
    |||| | | ||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  45489812 tatatgatattcaatctttactcttttatccaatgtgatacatataactcaca 45489864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 43174299 - 43174233
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 84  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43174299 ggggaccgtccacatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44621492 - 44621426
Alignment:
Q  110 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44621492 ctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgca 44621426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11197344 - 11197293
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11197344 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 11197293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 34544225 - 34544107
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| || ||| ||||||| |    
T  34544225 agagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacctccacttttctattcgatgtgag 34544126  T
Q  157 --acatataactcacactt 173  Q
      | |||||||||||||||    
T  34544125 atatatataactcacactt 34544107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 151
Target Start/End: Original strand, 39698944 - 39699077
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt--aaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||  || |  | || ||||||| ||||||||||    
T  39698944 ggactgtccacatcgagactagaataaccgcacaagcaagagagatgctacactcttactcaaaaccttaaaacgacacggatttatggatcctcttact 39699043  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgat 151  Q
    || ||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  39699044 tagaatatgttcaacctttacttttatatccgat 39699077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 44621011 - 44620946
Alignment:
Q  110 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg-tgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44621011 ctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttg 44620946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 41370812 - 41370738
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 96  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||||    
T  41370812 accgtccacatcgaggttagaacaaccactcaagtaagagagacatcacatttttacctaaaatcttaaggcaat 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 176
Target Start/End: Original strand, 11348396 - 11348484
Alignment:
Q  88 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  11348396 taaggcaatgaatatatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcacaattgca 11348484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 170
Target Start/End: Original strand, 15841023 - 15841134
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 157  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||| |||  ||| || |||| ||| |||||    
T  15841023 agagagacaatacactcttacccaaaac-ttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatctgatatggga 15841121  T
Q  158 catataactcaca 170  Q
    ||||||| |||||    
T  15841122 catataattcaca 15841134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10396249 - 10396198
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396249 agagagacaccaccctcttacctaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10396534 - 10396483
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396534 agagagagaccacactcttatccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Original strand, 11783551 - 11783646
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 113  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  11783551 ggggaccacccacatctaggctagagcaactatacaagcgagagaaacgacacactcttacccaaaactttatggcaataggtgtatgggtcctct 11783646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 63
Target Start/End: Original strand, 23817457 - 23817498
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagag 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23817457 accgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagag 23817498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 922537 - 922485
Alignment:
Q  57 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  922537 aagagagacaccacactcttatccaaacccctaagacaatgggtttatgggtc 922485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1868158 - 1868119
Alignment:
Q  69 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1868158 acactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggt 1868119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 19895445 - 19895406
Alignment:
Q  27 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca 66  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19895445 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 19895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 118
Target Start/End: Original strand, 11706584 - 11706641
Alignment:
Q  60 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  11706584 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat-agtcctcttactt 11706641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 51681650 - 51681604
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  51681650 acaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtatatgagtcc 51681604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 184
Target Start/End: Original strand, 18932887 - 18932924
Alignment:
Q  147 ccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18932887 ccgatgtgggacatataactcagacttgcaaaccaaca 18932924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Original strand, 2891864 - 2891924
Alignment:
Q  62 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 122  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  2891864 agacatcacactttaacccaaaaccttaagacattaggtttatggatcctcttacttataa 2891924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Original strand, 11702297 - 11702341
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga 62  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11702297 ggggactgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga 11702341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Original strand, 18933103 - 18933135
Alignment:
Q  153 tgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933103 tgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 18933135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45050649 - 45050601
Alignment:
Q  128 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45050649 tcaacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttgca 45050601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 98
Target Start/End: Original strand, 50787996 - 50788072
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 98  Q
    |||||| |||| || | |||| |||||| | |||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50787996 accgtctacattgaagttagagcaaccaaataagcgacagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgg 50788072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11197054 - 11197003
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  11197054 agagagacacctcactcttacctaaaatcctaaggcaatgggtttaagggtc 11197003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 45484817 - 45484774
Alignment:
Q  78 cccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  45484817 cccaaaaccttaaggcattgggtttatgggttctctcacttata 45484774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 132
Target Start/End: Original strand, 31249896 - 31249970
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 132  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| | | | || | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31249896 agagagagaccacactttaacccaaaacttgacgtcattaggtttatgggtcctctaacttataaagtgttcaac 31249970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 100
Target Start/End: Original strand, 41707279 - 41707321
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  41707279 agagagataccacacttttacccaaaaccttaaggtaatgggt 41707321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 11706636 - 11706677
Alignment:
Q  135 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11706636 ttacttttttatccgatgtgggacatacaactcacccttgca 11706677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 19895570 - 19895533
Alignment:
Q  28 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagac 65  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19895570 cacatcgaagctagaacaaccacacaagcaagatagac 19895533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 29802637 - 29802604
Alignment:
Q  80 caaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29802637 caaaaccttaaggcattgggtttatgggtcctct 29802604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41370738 - 41370693
Alignment:
Q  139 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41370738 tattttatccgatatgggatatataactcactctttcaaaccaaca 41370693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 34946151 - 34946187
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34946151 agagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggca 34946187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22304727 - 22304561
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22304727 ggggactgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttact 22304628  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22304627 tataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacacttgcaaaccaaca 22304561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 37990639 - 37990795
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37990639 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 37990738  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37990739 tataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttg 37990795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Original strand, 43346793 - 43346947
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43346793 ggaccgtccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttactta 43346892  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43346893 taaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 43346947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35946680 - 35946524
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946680 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 35946581  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946580 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 35946524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Original strand, 37990978 - 37991133
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  37990978 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttactt 37991077  T
Q  119 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37991078 ataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttg 37991133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15773010 - 15772854
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15773010 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttactta 15772911  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15772910 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttgca 15772854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 29644902 - 29645060
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29644902 ggggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 29645001  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29645002 tataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgca 29645060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32589861 - 32589704
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589861 ggggaccgtccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 32589762  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32589761 tataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgca 32589704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 33803252 - 33803410
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33803252 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttact 33803351  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33803352 tatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattgca 33803410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 184
Target Start/End: Original strand, 39934963 - 39935123
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39934963 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggt 39935062  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39935063 gttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactctcacacttgcaaaccaaca 39935123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 12114562 - 12114720
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12114562 ggggaccgaccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 12114661  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12114662 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgca 12114720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 42342388 - 42342546
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  42342388 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttact 42342487  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342488 tataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgca 42342546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 54017816 - 54017974
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  54017816 ggggaccgcccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgagtcctcttact 54017915  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54017916 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 54017974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 54018198 - 54018356
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  54018198 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttact 54018297  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54018298 tataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttgca 54018356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 29644581 - 29644739
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29644581 ggggaccatccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttact 29644680  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29644681 tataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttgca 29644739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39389219 - 39389062
Alignment:
Q  27 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 126  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39389219 ccacatcaaggctagaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtg 39389120  T
Q  127 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39389119 ttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaaca 39389062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 41359765 - 41359919
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359765 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41359864  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  41359865 tataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtggg----ataactcacacttgca 41359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 25739425 - 25739583
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  25739425 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttact 25739524  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25739525 tatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 25739583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Original strand, 32462903 - 32463057
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32462903 gaccgtacacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttat 32463002  T
Q  121 aaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32463003 aaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 32463057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 52634833 - 52634678
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52634833 ggggacagtctacatcaaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt-ctcttact 52634735  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634734 tataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52634678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 21832345 - 21832501
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  21832345 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgccac--tcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttact 21832442  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21832443 tataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttgca 21832501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 42342092 - 42342248
Alignment:
Q  20 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42342092 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactta 42342191  T
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  42342192 taaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgca 42342248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 50612447 - 50612618
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt-----tatgggtcctc 112  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||     |||| ||||||    
T  50612447 ggggaccgtccacgtcgaggatggaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctc 50612546  T
Q  113 ttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50612547 ttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 50612618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 174
Target Start/End: Original strand, 22303963 - 22304104
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  22303963 tccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataag-- 22304060  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22304061 -----acctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 22304104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15773346 - 15773192
Alignment:
Q  24 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaag--agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  15773346 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttata 15773247  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    || |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773246 agatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15773192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31190168 - 31190017
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||    
T  31190168 aggggagcgtccaaatcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaac 31190077  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31190076 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgca 31190017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53577522 - 53577364
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||| |    
T  53577522 ggggaccatccacaccgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatt 53577423  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53577422 tttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 53577364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4823796 - 4823647
Alignment:
Q  35 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 134  Q
    ||||||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  4823796 aggctagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaactt 4823697  T
Q  135 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4823696 ttactattttatccgatgtgagacttataactcacacttgcaaaccaaca 4823647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25755552 - 25755396
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||    
T  25755552 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttact 25755453  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25755452 tataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 25755396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 45395656 - 45395811
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45395656 gaccctccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttat 45395755  T
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45395756 aacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgca 45395811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 169
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135224
Alignment:
Q  44 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattt 3135198  T
Q  144 tatccgatgtgggacatataactcac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3135199 tatccgatgtgggacatataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 3135454 - 3135617
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat--gggtcctctta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3135454 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggggtcctctta 3135553  T
Q  116 c-----ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |     | |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3135554 ctaatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttg 3135617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 1634315 - 1634473
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1634315 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccatata-gtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatgggtcctcttact 1634413  T
Q  118 tataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| ||||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634414 tataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1634473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45901873 - 45901715
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  45901873 aggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttac 45901774  T
Q  117 ttataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45901773 ttataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 45901715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Original strand, 53117975 - 53118131
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||    
T  53117975 ggggaccgttcacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcact 53118073  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  53118074 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgc 53118131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39914412 - 39914252
Alignment:
Q  16 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 115  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39914412 tagggggctgtctacatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctctta 39914313  T
Q  116 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39914312 tttataaggtgttcaacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 39914252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8328067 - 8327904
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaac----cacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    | |||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||    
T  8328067 aggggagcgtccacatcgaggctagaacaactgcactcacttgtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctc 8327968  T
Q  113 ttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8327967 ttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 8327904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 32462558 - 32462715
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||    
T  32462558 gggggccgtctacatcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagcaataggtttatggatcatcttact 32462657  T
Q  118 tataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32462658 tataaggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcacacttg 32462715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37726654 - 37726495
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |        |||||||||    
T  37726654 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaatggat--------cctcttact 37726563  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 185  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726562 tataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaacat 37726495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 174
Target Start/End: Original strand, 49336694 - 49336843
Alignment:
Q  26 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaa-gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 124  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49336694 tccacattgaggatagaacaaccgcacaaaaaaagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagg 49336793  T
Q  125 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49336794 tggtcaacctttacttttctatccgatgtgagacatgtaactcacacttg 49336843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 51886714 - 51886552
Alignment:
Q  17 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 116  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||      |||||| ||||||||||||||||||    
T  51886714 agggtaccgttcacatcgagattagaacaatcacacttgcaaaagagacatcacactcttatccaaaac------gcaatgagtttatgggtcctcttac 51886621  T
Q  117 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 185  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51886620 ttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaacat 51886552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11662108 - 11661954
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  11662108 gggactgttcacatcgaggctagaacaaccacacaatga-gagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcact 11662010  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  11662009 tttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacactt 11661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9240300 - 9240149
Alignment:
Q  25 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |   |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9240300 gtccacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataagg 9240201  T
Q  125 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||| | ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9240200 tgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 9240149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 44160547 - 44160702
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  44160547 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttatt 44160643  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  44160644 tataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttgca 44160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Original strand, 22303662 - 22303759
Alignment:
Q  21 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22303662 gaccgtctacatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 33175659 - 33175820
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac--tcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat---gggtcctc 112  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||| |||    
T  33175659 ggggactgcccacaccgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcacacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttattatgggttctc 33175758  T
Q  113 ttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33175759 ttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacacttg 33175820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Original strand, 42584829 - 42584970
Alignment:
Q  23 ccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 122  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  42584829 ccgtccacattgaaactagaacaaccgcataagtaagag--acaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataa 42584926  T
Q  123 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 166  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42584927 ggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggacatataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 176
Target Start/End: Original strand, 47964544 - 47964676
Alignment:
Q  44 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 143  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||  ||  ||     
T  47964544 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttc 47964643  T
Q  144 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47964644 tatccgatgcgggacatacaactcacacttgca 47964676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Original strand, 33362327 - 33362425
Alignment:
Q  52 caagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 150  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33362327 caagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatccga 33362425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 184
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384432
Alignment:
Q  69 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  169 cacttgcaaaccaaca 184  Q
    | |||||| |||||||    
T  3384417 cgcttgcacaccaaca 3384432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304238
Alignment:
Q  121 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 22304238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 39336232 - 39336387
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||  ||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||    
T  39336232 ggggaccatccacatccaggc-agagcaaccacacgagcgagagaggca--acactattatccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctctcact 39336328  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||| |||||||||||  |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39336329 tataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 39336387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 102
Target Start/End: Original strand, 41359491 - 41359575
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41359491 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgggttt 41359575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Original strand, 54017548 - 54017636
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 106  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017548 ggggaccgaccacatcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 47964915 - 47965073
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||| || | |||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| |||    
T  47964915 ggggaacgtccacatctaggccagaacaatcatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcact 47965014  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||   |||| |||||  ||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47965015 tatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaacatataactcacacttgca 47965073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 173
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767469
Alignment:
Q  84 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11661638 - 11661537
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11661638 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc---------------cctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtggga 11661554  T
Q  158 catataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661553 catataactcacacttg 11661537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 173
Target Start/End: Original strand, 46546375 - 46546480
Alignment:
Q  68 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||  ||  ||  |||| |||| |||||||||||||    
T  46546375 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactc 46546474  T
Q  168 acactt 173  Q
    ||||||    
T  46546475 acactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346650
Alignment:
Q  120 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 43346650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 134
Target Start/End: Original strand, 39336000 - 39336086
Alignment:
Q  48 cacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | | | |||||| |||||||||||    
T  39336000 cacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacct 39336086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12749316 - 12749211
Alignment:
Q  29 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 128  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  12749316 acatccagactagaacaaccacataagtaagagtgagtccacactcttatcaaaaaccttaatgcaattggtttatgggtcctcacacttataaagtgtt 12749217  T
Q  129 caacct 134  Q
    ||||||    
T  12749216 caacct 12749211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 52635050 - 52634990
Alignment:
Q  66 accacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52635050 accacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8328427 - 8328374
Alignment:
Q  19 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8328427 gggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22304351 - 22304302
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacac 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22304351 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25317290 - 25317161
Alignment:
Q  44 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 143  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||  ||| ||     
T  25317290 caaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctctcagttacaaagtgctcaacctccacttttc 25317191  T
Q  144 tatccgatgtgggacatataactcacactt 173  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25317190 catctggtgtgggacacataactcacactt 25317161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25991521 - 25991405
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 157  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||  |||| ||| || |||  |||||  |||||||||    
T  25991521 agagagagaccacactttaacccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaatgtttaacattaacttgtttatttgatgtggga 25991422  T
Q  158 catataactcacacttg 174  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25991421 catattactcacacttg 25991405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 53596078 - 53596027
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596078 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 53596393 - 53596342
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596393 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17732007
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 17732007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033238
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 19033238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Original strand, 43978865 - 43978947
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacact----cttacccaaaaccttaaggcaat 96  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  43978865 ggggacagtccacatcgaggttagaacaaacacacaagtgagagagacgccacactctagcttacccaaaaccttaaggcaat 43978947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 53596593 - 53596542
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53596593 agagagacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatgggtc 53596542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 7766783 - 7766857
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 94  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7766783 ggggaccatctacatcgaggctagaacaaccatacaag--tgagagacgccacaatcttacctaaaaccttaaggca 7766857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 109
Target Start/End: Original strand, 48127859 - 48127906
Alignment:
Q  62 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48127859 agacaccacactcttatccaaaacattaaagcaatgggtttatgggtc 48127906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 176
Target Start/End: Original strand, 12747878 - 12747910
Alignment:
Q  144 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747878 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12747910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Original strand, 16871005 - 16871049
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16871005 acacgacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 16871049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Original strand, 17735037 - 17735081
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17735037 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 17735081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Original strand, 19036306 - 19036350
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19036306 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 19036350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16143550 - 16143505
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16143550 acactacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgggtc 16143505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 105
Target Start/End: Original strand, 16869843 - 16869884
Alignment:
Q  64 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  16869843 acaccacactcttgctcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 16869884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 171
Target Start/End: Original strand, 36986040 - 36986101
Alignment:
Q  110 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 171  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36986040 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 36986101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 171
Target Start/End: Original strand, 37011479 - 37011540
Alignment:
Q  110 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 171  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37011479 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 37011540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 113
Target Start/End: Original strand, 50329391 - 50329427
Alignment:
Q  77 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50329391 acccaaaaccttaaggcattggatttatgggtcctct 50329427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 514 - 670
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  514 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 613  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  614 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 147 - 308
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||   |||| ||||||| ||||||||||    
T  147 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atgg-tttatgg-tcctcttact 241  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  242 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 121; Significance: 3e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 174
Target Start/End: Original strand, 1110 - 1262
Alignment:
Q  22 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  1110 accgtccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctttttcttata 1209  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1210 aggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttg 1262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 129
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1802
Alignment:
Q  58 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1731 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 176
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3143
Alignment:
Q  125 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 3143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5396
Alignment:
Q  27 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 125  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggt 5447  T
Q  126 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5446 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 5396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5931 - 5777
Alignment:
Q  27 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-----cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 121  Q
    ||||||||| | | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5931 ccacatcgaagtttgaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 5832  T
Q  122 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5831 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgca 5777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47518 - 47360
Alignment:
Q  18 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  47518 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttact 47419  T
Q  118 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  47418 tataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgca 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5357
Alignment:
Q  56 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 155  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5477 caagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgg 5378  T
Q  156 gacatataactcacacttgca 176  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  5377 aacatataactcacacttgca 5357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5133 - 4982
Alignment:
Q  25 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||     
T  5133 gtccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataaga 5034  T
Q  125 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 176  Q
    | || |||||||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5033 tattaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgca 4982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 176
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17614
Alignment:
Q  60 agagacaccacactcttacccaaaa--ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  158 catataactcacacttgca 176  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17596 catataactcacacttgca 17614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 174
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10267
Alignment:
Q  99 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 39588 - 39459
Alignment:
Q  44 caaccacacaagcaagagagacacc-acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 142  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  39588 caaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaa-cttaaggcaacatgtttatagttcctctcacttataaggagttcaacctccactttt 39490  T
Q  143 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 174  Q
     ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  39489 ctatgcg-tgtgagacatataactcacacttg 39459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 39963 - 39840
Alignment:
Q  51 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 150  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||  |||||| |||  ||||||   || ||| |||||||| | || |||||   ||| || |||||||    
T  39963 acaagcgagagagacaccacatttttaaccaaaattttaaggtaataagtttatatctcatctcacttataaagagtccaaccaccacttttctatccga 39864  T
Q  151 tgtgggacatataactcacacttg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39863 tgtgggacatataactcacacttg 39840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2953 - 2869
Alignment:
Q  98 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||  | |||||  || ||||||||| |||||||| ||||    
T  2953 ggtttatggatcctcttatatataaagtgttcaacctttacatttttaaacaatgtgaaacttataactcatacttgcaatccaa 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 138
Target Start/End: Original strand, 10406 - 10446
Alignment:
Q  98 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 138  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10406 ggtttatggatcctcttacatataaagtgttcaacctttac 10446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University