View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20182_low_2 (Length: 499)

Name: NF20182_low_2
Description: NF20182
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20182_low_2
NF20182_low_2
[»] chr7 (122 HSPs)
chr7 (67-434)||(43281595-43281956)
chr7 (70-434)||(12841275-12841635)
chr7 (210-482)||(24598137-24598411)
chr7 (67-434)||(45836482-45836843)
chr7 (70-435)||(34869342-34869703)
chr7 (70-434)||(11593882-11594242)
chr7 (113-434)||(29650349-29650666)
chr7 (70-434)||(37617866-37618227)
chr7 (70-434)||(33349806-33350166)
chr7 (70-434)||(44855174-44855532)
chr7 (70-402)||(49029198-49029526)
chr7 (70-427)||(35906208-35906561)
chr7 (70-434)||(39906372-39906730)
chr7 (70-381)||(13859061-13859368)
chr7 (70-434)||(43491230-43491590)
chr7 (71-433)||(35558994-35559353)
chr7 (67-434)||(38606924-38607274)
chr7 (70-402)||(36651916-36652242)
chr7 (143-434)||(2885722-2886013)
chr7 (70-352)||(31005145-31005423)
chr7 (77-432)||(46355858-46356209)
chr7 (113-431)||(6374833-6375147)
chr7 (153-434)||(31682602-31682883)
chr7 (73-433)||(23404343-23404697)
chr7 (16-167)||(24598409-24598560)
chr7 (70-299)||(33072876-33073099)
chr7 (159-434)||(22349627-22349902)
chr7 (195-434)||(32631619-32631846)
chr7 (151-434)||(36869237-36869527)
chr7 (162-402)||(15682184-15682424)
chr7 (269-436)||(40979926-40980093)
chr7 (269-434)||(38900074-38900238)
chr7 (206-434)||(7273154-7273382)
chr7 (68-252)||(7272959-7273139)
chr7 (67-193)||(32630514-32630635)
chr7 (71-388)||(36136687-36137000)
chr7 (306-434)||(21078071-21078199)
chr7 (140-256)||(46014359-46014474)
chr7 (309-434)||(27648937-27649062)
chr7 (225-432)||(31681022-31681226)
chr7 (287-435)||(48919247-48919395)
chr7 (140-431)||(28627936-28628227)
chr7 (274-434)||(9210704-9210864)
chr7 (306-433)||(14057632-14057759)
chr7 (306-433)||(14367660-14367787)
chr7 (70-149)||(36869570-36869649)
chr7 (240-434)||(1011135-1011328)
chr7 (69-216)||(7189444-7189594)
chr7 (339-434)||(28208328-28208423)
chr7 (326-433)||(34035155-34035262)
chr7 (88-215)||(8492452-8492575)
chr7 (68-216)||(43282325-43282472)
chr7 (69-216)||(47848595-47848738)
chr7 (274-375)||(35922376-35922476)
chr7 (306-397)||(36239833-36239924)
chr7 (320-434)||(27893563-27893677)
chr7 (320-418)||(33103094-33103192)
chr7 (285-434)||(42187575-42187723)
chr7 (357-434)||(31869102-31869179)
chr7 (275-396)||(45601599-45601720)
chr7 (140-216)||(27021910-27021986)
chr7 (335-434)||(36101777-36101876)
chr7 (70-216)||(36514425-36514565)
chr7 (327-434)||(47652722-47652829)
chr7 (320-434)||(25731474-25731588)
chr7 (350-434)||(25891086-25891170)
chr7 (357-433)||(34745952-34746028)
chr7 (67-216)||(42187390-42187534)
chr7 (326-402)||(42969872-42969948)
chr7 (330-402)||(47852265-47852337)
chr7 (375-434)||(17907724-17907783)
chr7 (346-433)||(24177628-24177714)
chr7 (142-213)||(27893769-27893840)
chr7 (335-434)||(34341395-34341494)
chr7 (314-433)||(38103616-38103733)
chr7 (351-418)||(48515370-48515437)
chr7 (70-193)||(30200204-30200319)
chr7 (364-434)||(31840442-31840512)
chr7 (328-434)||(33073105-33073211)
chr7 (320-402)||(37976403-37976485)
chr7 (357-395)||(45558535-45558573)
chr7 (361-434)||(4604756-4604829)
chr7 (361-434)||(6807700-6807773)
chr7 (367-432)||(9796299-9796364)
chr7 (306-387)||(21517427-21517508)
chr7 (306-358)||(18795841-18795893)
chr7 (358-434)||(19119424-19119500)
chr7 (67-252)||(39811876-39812057)
chr7 (143-215)||(40169640-40169712)
chr7 (314-402)||(40415169-40415257)
chr7 (335-402)||(1569199-1569266)
chr7 (371-434)||(5418293-5418356)
chr7 (142-229)||(19262638-19262725)
chr7 (361-432)||(24777170-24777241)
chr7 (367-434)||(28708596-28708663)
chr7 (339-402)||(30814157-30814220)
chr7 (351-434)||(41483686-41483769)
chr7 (142-185)||(45558352-45558395)
chr7 (357-403)||(5336123-5336169)
chr7 (153-215)||(26742115-26742177)
chr7 (309-434)||(28355322-28355448)
chr7 (360-402)||(34029708-34029750)
chr7 (372-434)||(40630654-40630716)
chr7 (306-400)||(44951309-44951403)
chr7 (352-434)||(48515475-48515557)
chr7 (357-434)||(14593957-14594034)
chr7 (357-434)||(16013480-16013557)
chr7 (361-402)||(22174209-22174250)
chr7 (327-396)||(31834532-31834601)
chr7 (349-437)||(33732031-33732117)
chr7 (338-399)||(34926557-34926618)
chr7 (147-216)||(38920789-38920858)
chr7 (361-434)||(40008431-40008504)
chr7 (361-438)||(40138944-40139021)
chr7 (335-387)||(2882783-2882835)
chr7 (159-259)||(12966029-12966129)
chr7 (361-401)||(24376056-24376096)
chr7 (335-387)||(26741941-26741993)
chr7 (370-434)||(29312207-29312271)
chr7 (378-434)||(31005431-31005487)
chr7 (326-394)||(31859049-31859117)
chr7 (349-397)||(44401164-44401212)
[»] chr1 (121 HSPs)
chr1 (67-434)||(696188-696552)
chr1 (67-434)||(8391691-8392054)
chr1 (71-434)||(4001455-4001814)
chr1 (70-434)||(34792349-34792709)
chr1 (70-434)||(1210667-1211027)
chr1 (70-434)||(30202130-30202490)
chr1 (70-434)||(8671842-8672200)
chr1 (71-435)||(49347392-49347752)
chr1 (70-434)||(51440765-51441125)
chr1 (67-434)||(32082756-32083108)
chr1 (67-434)||(15085853-15086204)
chr1 (70-434)||(22090016-22090378)
chr1 (70-434)||(9592656-9593016)
chr1 (73-434)||(51601983-51602338)
chr1 (70-433)||(43240380-43240741)
chr1 (70-387)||(32231001-32231314)
chr1 (142-434)||(4029112-4029404)
chr1 (67-434)||(38807671-38808037)
chr1 (171-434)||(25979231-25979494)
chr1 (234-434)||(37311755-37311955)
chr1 (262-434)||(4415458-4415631)
chr1 (70-402)||(9509240-9509568)
chr1 (267-436)||(52921195-52921364)
chr1 (70-401)||(9599427-9599754)
chr1 (236-402)||(39318213-39318379)
chr1 (153-402)||(32404558-32404807)
chr1 (67-402)||(18469114-18469443)
chr1 (69-432)||(37462878-37463232)
chr1 (112-431)||(39140484-39140794)
chr1 (182-433)||(52561590-52561841)
chr1 (316-437)||(46423213-46423331)
chr1 (79-292)||(27847947-27848155)
chr1 (345-434)||(28090694-28090783)
chr1 (314-434)||(10200306-10200426)
chr1 (326-434)||(24020267-24020375)
chr1 (326-434)||(41560403-41560511)
chr1 (316-434)||(4707221-4707338)
chr1 (140-437)||(2544587-2544878)
chr1 (306-434)||(32079177-32079303)
chr1 (306-431)||(52532619-52532744)
chr1 (306-401)||(27520240-27520335)
chr1 (261-399)||(52878334-52878472)
chr1 (335-436)||(25715324-25715425)
chr1 (70-358)||(34827179-34827462)
chr1 (140-216)||(43423707-43423783)
chr1 (349-436)||(21769709-21769796)
chr1 (152-434)||(48431399-48431688)
chr1 (361-435)||(28533676-28533750)
chr1 (349-434)||(8796406-8796491)
chr1 (309-434)||(19936617-19936742)
chr1 (361-434)||(29577461-29577534)
chr1 (345-434)||(44941776-44941865)
chr1 (306-394)||(7762477-7762565)
chr1 (306-397)||(52739547-52739639)
chr1 (314-434)||(52832207-52832327)
chr1 (141-216)||(1661419-1661494)
chr1 (335-434)||(34444539-34444638)
chr1 (346-432)||(1290033-1290119)
chr1 (306-400)||(3818890-3818984)
chr1 (70-222)||(4379927-4380083)
chr1 (333-435)||(40568409-40568511)
chr1 (91-202)||(52561843-52561950)
chr1 (306-402)||(29128937-29129034)
chr1 (338-399)||(29808042-29808103)
chr1 (362-435)||(38877342-38877415)
chr1 (361-434)||(44751693-44751766)
chr1 (349-401)||(27072520-27072572)
chr1 (344-436)||(42337748-42337840)
chr1 (361-408)||(17269015-17269062)
chr1 (363-434)||(17640067-17640138)
chr1 (306-377)||(36623941-36624012)
chr1 (349-436)||(50257767-50257854)
chr1 (351-397)||(109030-109076)
chr1 (335-397)||(5338896-5338958)
chr1 (320-402)||(28511833-28511915)
chr1 (272-434)||(44905356-44905517)
chr1 (349-435)||(50806864-50806950)
chr1 (337-402)||(12930343-12930408)
chr1 (306-395)||(16142019-16142108)
chr1 (67-132)||(19936441-19936506)
chr1 (361-402)||(27704159-27704200)
chr1 (357-402)||(28528560-28528605)
chr1 (361-402)||(38869091-38869132)
chr1 (357-434)||(51584949-51585026)
chr1 (236-343)||(478762-478869)
chr1 (361-401)||(5113952-5113992)
chr1 (335-399)||(6025788-6025852)
chr1 (326-402)||(19908067-19908143)
chr1 (370-434)||(41165500-41165564)
chr1 (140-216)||(51812513-51812589)
chr1 (357-432)||(15437130-15437205)
chr1 (178-213)||(31274578-31274613)
chr1 (361-408)||(37294134-37294181)
chr1 (363-394)||(39797212-39797243)
chr1 (315-374)||(41611969-41612028)
chr1 (359-422)||(48861387-48861450)
chr1 (351-433)||(4590533-4590615)
chr1 (372-434)||(26299288-26299350)
chr1 (140-402)||(40416359-40416621)
chr1 (320-402)||(45510865-45510947)
chr1 (349-435)||(52160242-52160328)
chr1 (361-402)||(2429661-2429702)
chr1 (376-417)||(2728853-2728894)
chr1 (373-434)||(4318845-4318906)
chr1 (361-402)||(7083099-7083140)
chr1 (348-433)||(22175341-22175426)
chr1 (357-434)||(26016642-26016719)
chr1 (245-294)||(31979742-31979791)
chr1 (361-434)||(32111989-32112062)
chr1 (335-436)||(35828560-35828661)
chr1 (361-418)||(37429915-37429972)
chr1 (361-402)||(39123400-39123441)
chr1 (361-434)||(39525974-39526047)
chr1 (349-434)||(39896760-39896845)
chr1 (144-216)||(52073680-52073753)
chr1 (366-434)||(2914123-2914191)
chr1 (366-434)||(3777260-3777328)
chr1 (152-216)||(7921835-7921899)
chr1 (140-216)||(35828768-35828844)
chr1 (140-216)||(36340021-36340097)
chr1 (73-121)||(52442813-52442861)
[»] chr2 (101 HSPs)
chr2 (67-402)||(38429803-38430134)
chr2 (67-434)||(41197227-41197591)
chr2 (67-434)||(41763043-41763404)
chr2 (67-435)||(11992107-11992469)
chr2 (73-438)||(38452682-38453046)
chr2 (69-434)||(12734622-12734982)
chr2 (70-434)||(3865994-3866354)
chr2 (70-432)||(8180702-8181060)
chr2 (68-434)||(45367625-45367986)
chr2 (70-434)||(4807514-4807877)
chr2 (70-434)||(36183373-36183733)
chr2 (70-433)||(3243654-3244011)
chr2 (123-434)||(25834654-25834960)
chr2 (68-402)||(23997537-23997852)
chr2 (140-434)||(2610576-2610870)
chr2 (89-435)||(18424377-18424716)
chr2 (209-395)||(39029638-39029824)
chr2 (173-434)||(451648-451909)
chr2 (195-434)||(7326160-7326399)
chr2 (223-434)||(28508749-28508960)
chr2 (158-434)||(24583631-24583908)
chr2 (262-435)||(31959631-31959804)
chr2 (74-376)||(6237811-6238110)
chr2 (67-216)||(16097204-16097353)
chr2 (269-434)||(35643065-35643230)
chr2 (147-434)||(12141539-12141826)
chr2 (310-434)||(30306190-30306314)
chr2 (332-434)||(3635323-3635425)
chr2 (326-434)||(227363-227471)
chr2 (320-434)||(9496034-9496148)
chr2 (148-232)||(43238296-43238379)
chr2 (330-434)||(43573130-43573234)
chr2 (272-402)||(45543105-45543234)
chr2 (306-402)||(9996658-9996754)
chr2 (326-434)||(12882045-12882153)
chr2 (140-216)||(43752165-43752241)
chr2 (347-434)||(13443908-13443995)
chr2 (67-434)||(38434870-38435234)
chr2 (69-216)||(9556587-9556729)
chr2 (309-375)||(30743686-30743752)
chr2 (346-434)||(9531600-9531688)
chr2 (70-149)||(2610450-2610529)
chr2 (361-436)||(12474925-12475000)
chr2 (70-132)||(24583904-24583966)
chr2 (320-397)||(19336930-19337007)
chr2 (306-399)||(41545559-41545652)
chr2 (335-434)||(8197541-8197640)
chr2 (335-434)||(8202301-8202400)
chr2 (306-433)||(18959065-18959192)
chr2 (309-434)||(11412865-11412992)
chr2 (306-432)||(13149486-13149612)
chr2 (364-434)||(17670680-17670750)
chr2 (313-434)||(38328370-38328489)
chr2 (73-213)||(4598783-4598921)
chr2 (357-434)||(12489802-12489879)
chr2 (357-434)||(15025699-15025776)
chr2 (335-432)||(35755247-35755344)
chr2 (357-434)||(44437721-44437798)
chr2 (330-434)||(9394630-9394734)
chr2 (350-434)||(12520062-12520146)
chr2 (337-433)||(39709202-39709298)
chr2 (77-193)||(41545335-41545448)
chr2 (313-396)||(1400495-1400578)
chr2 (357-400)||(19334186-19334229)
chr2 (351-434)||(28960211-28960294)
chr2 (140-190)||(227310-227360)
chr2 (361-435)||(17429259-17429333)
chr2 (361-434)||(3481363-3481436)
chr2 (358-399)||(4598597-4598638)
chr2 (357-434)||(5758995-5759072)
chr2 (313-402)||(6219126-6219215)
chr2 (357-434)||(12470897-12470974)
chr2 (307-400)||(26670923-26671016)
chr2 (361-430)||(33504433-33504502)
chr2 (357-434)||(42543440-42543517)
chr2 (361-434)||(42549837-42549910)
chr2 (350-434)||(19863432-19863516)
chr2 (350-434)||(19867764-19867848)
chr2 (350-434)||(19872665-19872749)
chr2 (144-216)||(41330121-41330193)
chr2 (70-121)||(451931-451982)
chr2 (339-402)||(3720447-3720510)
chr2 (146-221)||(6218961-6219036)
chr2 (335-434)||(9556369-9556468)
chr2 (140-215)||(11412709-11412784)
chr2 (367-434)||(32541794-32541861)
chr2 (140-402)||(37481649-37481911)
chr2 (363-434)||(43832309-43832380)
chr2 (360-402)||(887097-887139)
chr2 (361-435)||(9647610-9647684)
chr2 (364-434)||(17626284-17626354)
chr2 (349-431)||(29159290-29159372)
chr2 (349-391)||(42149703-42149745)
chr2 (124-174)||(43832071-43832121)
chr2 (389-434)||(8560806-8560851)
chr2 (357-434)||(15015150-15015227)
chr2 (369-434)||(15222462-15222527)
chr2 (345-434)||(18790106-18790195)
chr2 (367-435)||(32443851-32443920)
chr2 (394-438)||(19629313-19629357)
chr2 (335-423)||(31254471-31254558)
[»] chr8 (93 HSPs)
chr8 (67-418)||(42854020-42854367)
chr8 (70-434)||(36545069-36545431)
chr8 (70-434)||(40813244-40813606)
chr8 (70-434)||(36565241-36565601)
chr8 (71-402)||(2796478-2796803)
chr8 (70-386)||(39946779-39947091)
chr8 (154-431)||(12491141-12491418)
chr8 (114-434)||(11523723-11524040)
chr8 (70-433)||(36394949-36395310)
chr8 (67-434)||(18125094-18125453)
chr8 (142-402)||(8932692-8932953)
chr8 (226-434)||(42469727-42469935)
chr8 (183-434)||(21121177-21121427)
chr8 (67-434)||(37077684-37078031)
chr8 (67-314)||(18751996-18752236)
chr8 (279-434)||(14742082-14742234)
chr8 (210-402)||(12025847-12026030)
chr8 (172-402)||(26904939-26905168)
chr8 (67-435)||(45419158-45419518)
chr8 (67-434)||(8879446-8879803)
chr8 (253-387)||(2027631-2027765)
chr8 (313-434)||(15215412-15215533)
chr8 (306-434)||(25473403-25473531)
chr8 (326-435)||(44529399-44529508)
chr8 (67-149)||(15215552-15215634)
chr8 (326-435)||(29520823-29520932)
chr8 (326-434)||(44047532-44047640)
chr8 (336-434)||(490519-490617)
chr8 (306-436)||(35914599-35914729)
chr8 (72-248)||(6510614-6510784)
chr8 (197-401)||(43904698-43904902)
chr8 (73-136)||(12492136-12492199)
chr8 (69-215)||(30113416-30113558)
chr8 (361-434)||(32569710-32569783)
chr8 (274-402)||(13589601-13589729)
chr8 (306-430)||(45041320-45041443)
chr8 (275-402)||(2216411-2216536)
chr8 (88-216)||(32043530-32043654)
chr8 (188-434)||(42584407-42584640)
chr8 (362-434)||(1928587-1928659)
chr8 (306-402)||(25300253-25300349)
chr8 (275-434)||(30559816-30559980)
chr8 (146-216)||(12796918-12796988)
chr8 (359-433)||(18473973-18474047)
chr8 (314-395)||(29735969-29736050)
chr8 (357-434)||(36042403-36042480)
chr8 (73-166)||(25288827-25288916)
chr8 (73-166)||(25300162-25300251)
chr8 (69-149)||(29735727-29735806)
chr8 (357-432)||(7531646-7531721)
chr8 (335-402)||(21425229-21425296)
chr8 (306-365)||(25288918-25288977)
chr8 (357-400)||(30456328-30456371)
chr8 (306-400)||(17491688-17491782)
chr8 (326-396)||(31715994-31716064)
chr8 (352-430)||(39702154-39702232)
chr8 (360-434)||(41035052-41035126)
chr8 (357-402)||(30812848-30812893)
chr8 (161-402)||(32930970-32931210)
chr8 (349-402)||(36143538-36143591)
chr8 (357-434)||(38901819-38901896)
chr8 (357-434)||(39953264-39953341)
chr8 (137-222)||(45512707-45512792)
chr8 (306-402)||(14459049-14459145)
chr8 (70-118)||(39760736-39760784)
chr8 (381-432)||(1335555-1335606)
chr8 (349-432)||(2518400-2518483)
chr8 (344-399)||(8255568-8255623)
chr8 (349-436)||(12611694-12611781)
chr8 (339-402)||(16035759-16035822)
chr8 (335-402)||(23492217-23492284)
chr8 (73-136)||(30748384-30748447)
chr8 (320-435)||(12966311-12966428)
chr8 (142-216)||(41971996-41972069)
chr8 (71-204)||(42493536-42493663)
chr8 (349-402)||(10824221-10824274)
chr8 (70-204)||(13171879-13172009)
chr8 (382-435)||(16971771-16971824)
chr8 (363-428)||(18741843-18741908)
chr8 (363-428)||(18746807-18746872)
chr8 (326-435)||(26363662-26363769)
chr8 (361-434)||(27556302-27556375)
chr8 (361-434)||(32276894-32276967)
chr8 (361-402)||(35646962-35647003)
chr8 (152-213)||(41444547-41444608)
chr8 (335-395)||(5908829-5908889)
chr8 (152-216)||(9695631-9695695)
chr8 (68-108)||(16252855-16252895)
chr8 (362-402)||(24558693-24558733)
chr8 (142-194)||(25985509-25985561)
chr8 (272-352)||(28269761-28269840)
chr8 (382-434)||(31309583-31309635)
chr8 (361-433)||(35362651-35362723)
[»] chr3 (100 HSPs)
chr3 (67-434)||(5168747-5169114)
chr3 (67-434)||(21992-22354)
chr3 (71-436)||(47233594-47233955)
chr3 (140-435)||(35033134-35033429)
chr3 (70-434)||(52138722-52139082)
chr3 (70-434)||(25191301-25191659)
chr3 (70-434)||(51447717-51448069)
chr3 (70-422)||(54278942-54279290)
chr3 (71-399)||(28245360-28245684)
chr3 (67-434)||(53519505-53519862)
chr3 (70-335)||(33272122-33272388)
chr3 (140-435)||(38850108-38850404)
chr3 (185-434)||(48508268-48508517)
chr3 (70-434)||(54128300-54128661)
chr3 (127-299)||(38060406-38060578)
chr3 (70-321)||(45728068-45728319)
chr3 (140-434)||(43694771-43695060)
chr3 (264-434)||(12096705-12096875)
chr3 (303-434)||(53262292-53262423)
chr3 (158-400)||(48953453-48953698)
chr3 (140-435)||(45289090-45289387)
chr3 (73-434)||(19676081-19676447)
chr3 (171-402)||(39235157-39235387)
chr3 (88-434)||(49503568-49503896)
chr3 (118-432)||(52678852-52679160)
chr3 (306-434)||(52156084-52156212)
chr3 (321-434)||(311309-311422)
chr3 (306-434)||(38060868-38060996)
chr3 (140-377)||(30294178-30294418)
chr3 (306-435)||(15296061-15296190)
chr3 (70-213)||(27917494-27917631)
chr3 (71-355)||(3186692-3186971)
chr3 (306-435)||(17022671-17022800)
chr3 (306-402)||(49042090-49042187)
chr3 (145-430)||(50960641-50960922)
chr3 (327-434)||(2133612-2133719)
chr3 (88-435)||(48734146-48734475)
chr3 (112-368)||(54425031-54425289)
chr3 (140-432)||(39600683-39600975)
chr3 (159-402)||(42510048-42510289)
chr3 (330-434)||(47555332-47555436)
chr3 (70-265)||(19736918-19737110)
chr3 (67-213)||(26490236-26490376)
chr3 (275-401)||(23534603-23534729)
chr3 (67-149)||(30345442-30345524)
chr3 (142-401)||(54365008-54365268)
chr3 (361-434)||(7895880-7895953)
chr3 (357-434)||(31454225-31454302)
chr3 (352-436)||(31566159-31566243)
chr3 (236-343)||(19162678-19162785)
chr3 (78-293)||(19757829-19758040)
chr3 (154-373)||(38430850-38431069)
chr3 (70-149)||(38850016-38850095)
chr3 (335-436)||(14415258-14415358)
chr3 (335-402)||(36304149-36304216)
chr3 (363-437)||(7278675-7278749)
chr3 (352-434)||(40273205-40273287)
chr3 (66-132)||(48953694-48953760)
chr3 (335-436)||(40106618-40106719)
chr3 (359-435)||(24778608-24778684)
chr3 (141-216)||(3987036-3987111)
chr3 (306-433)||(26490469-26490596)
chr3 (140-222)||(29600887-29600970)
chr3 (335-434)||(39208791-39208890)
chr3 (326-401)||(40116371-40116446)
chr3 (335-434)||(40991614-40991713)
chr3 (359-417)||(20208205-20208263)
chr3 (361-435)||(42026535-42026609)
chr3 (361-434)||(48532166-48532240)
chr3 (367-437)||(53214868-53214938)
chr3 (357-434)||(3987539-3987616)
chr3 (345-402)||(24541364-24541421)
chr3 (361-434)||(33271910-33271983)
chr3 (367-432)||(35481143-35481208)
chr3 (345-434)||(45374477-45374566)
chr3 (361-434)||(46148237-46148310)
chr3 (140-216)||(344929-345005)
chr3 (327-395)||(41842562-41842630)
chr3 (350-434)||(45486849-45486933)
chr3 (351-431)||(46367390-46367470)
chr3 (346-430)||(52927852-52927936)
chr3 (352-395)||(37598209-37598252)
chr3 (335-402)||(49841799-49841866)
chr3 (363-429)||(6988113-6988179)
chr3 (320-402)||(29601060-29601142)
chr3 (306-387)||(41482184-41482266)
chr3 (372-434)||(45834600-45834662)
chr3 (330-388)||(55384064-55384122)
chr3 (369-434)||(344772-344837)
chr3 (349-402)||(21862773-21862826)
chr3 (339-436)||(30797820-30797917)
chr3 (361-434)||(37083292-37083365)
chr3 (366-431)||(41529975-41530040)
chr3 (70-111)||(47542031-47542072)
chr3 (311-368)||(54422909-54422966)
chr3 (69-121)||(2341023-2341075)
chr3 (345-401)||(6780696-6780752)
chr3 (335-395)||(32052434-32052494)
chr3 (362-434)||(35420479-35420550)
chr3 (358-394)||(45373356-45373392)
[»] chr4 (142 HSPs)
chr4 (67-437)||(27450177-27450536)
chr4 (71-434)||(48174093-48174452)
chr4 (70-434)||(31959814-31960174)
chr4 (70-434)||(436151-436511)
chr4 (70-434)||(52569515-52569875)
chr4 (71-434)||(1777017-1777374)
chr4 (70-399)||(33227131-33227456)
chr4 (70-434)||(56375212-56375572)
chr4 (70-402)||(33190880-33191208)
chr4 (70-435)||(48622542-48622901)
chr4 (70-437)||(23906294-23906661)
chr4 (70-434)||(43433840-43434206)
chr4 (70-402)||(4440777-4441103)
chr4 (67-434)||(27983119-27983475)
chr4 (67-434)||(39100536-39100896)
chr4 (79-434)||(37797783-37798133)
chr4 (171-434)||(32479057-32479320)
chr4 (70-400)||(53707716-53708042)
chr4 (71-434)||(47265195-47265561)
chr4 (94-434)||(46582826-46583160)
chr4 (88-434)||(28236125-28236464)
chr4 (70-402)||(50286893-50287211)
chr4 (117-433)||(26037506-26037822)
chr4 (143-427)||(39708424-39708708)
chr4 (70-402)||(37773483-37773810)
chr4 (67-434)||(20601652-20602009)
chr4 (144-431)||(20192025-20192311)
chr4 (67-436)||(1793379-1793746)
chr4 (176-434)||(8286455-8286721)
chr4 (73-436)||(20591304-20591657)
chr4 (280-434)||(21528416-21528570)
chr4 (245-434)||(21236951-21237140)
chr4 (67-434)||(45204840-45205211)
chr4 (70-193)||(12494672-12494791)
chr4 (78-432)||(16002857-16003206)
chr4 (263-403)||(51811309-51811449)
chr4 (206-384)||(50679559-50679736)
chr4 (67-434)||(1211392-1211753)
chr4 (280-434)||(6957726-6957880)
chr4 (88-397)||(51421672-51421975)
chr4 (71-216)||(31458951-31459094)
chr4 (67-371)||(41009413-41009713)
chr4 (280-434)||(12494791-12494945)
chr4 (280-429)||(7947065-7947214)
chr4 (186-369)||(20821073-20821255)
chr4 (238-434)||(35690357-35690553)
chr4 (329-434)||(19969358-19969463)
chr4 (326-434)||(19154863-19154971)
chr4 (70-211)||(49987350-49987487)
chr4 (70-216)||(56224987-56225130)
chr4 (335-434)||(2589255-2589354)
chr4 (270-433)||(4548140-4548303)
chr4 (355-434)||(7066499-7066577)
chr4 (335-434)||(25575007-25575106)
chr4 (140-214)||(44047568-44047642)
chr4 (320-434)||(55007914-55008028)
chr4 (357-418)||(44360291-44360352)
chr4 (326-434)||(34208269-34208377)
chr4 (359-422)||(8598953-8599016)
chr4 (70-174)||(35690226-35690326)
chr4 (359-434)||(49939734-49939809)
chr4 (142-260)||(50662377-50662496)
chr4 (349-402)||(6958270-6958323)
chr4 (361-434)||(19061935-19062008)
chr4 (335-436)||(29209173-29209274)
chr4 (361-434)||(29399013-29399086)
chr4 (72-216)||(21106908-21107052)
chr4 (358-434)||(32633406-32633482)
chr4 (359-431)||(37042667-37042739)
chr4 (273-352)||(50862764-50862844)
chr4 (349-432)||(1095642-1095725)
chr4 (363-434)||(44719361-44719432)
chr4 (70-293)||(7092361-7092579)
chr4 (366-432)||(21359227-21359293)
chr4 (236-402)||(28351643-28351809)
chr4 (306-368)||(28550521-28550583)
chr4 (309-431)||(31459151-31459273)
chr4 (360-434)||(31961266-31961340)
chr4 (70-216)||(33709841-33709988)
chr4 (356-434)||(45209205-45209283)
chr4 (365-435)||(49738549-49738619)
chr4 (372-434)||(50238615-50238677)
chr4 (372-434)||(50238701-50238763)
chr4 (338-434)||(2557671-2557768)
chr4 (349-434)||(12443292-12443377)
chr4 (320-401)||(28486089-28486170)
chr4 (306-387)||(31043226-31043307)
chr4 (357-434)||(35555650-35555727)
chr4 (357-434)||(42285703-42285780)
chr4 (367-432)||(45184135-45184200)
chr4 (357-434)||(50869880-50869957)
chr4 (349-434)||(51438642-51438727)
chr4 (309-434)||(53540447-53540572)
chr4 (335-432)||(55388213-55388310)
chr4 (346-402)||(883392-883448)
chr4 (69-149)||(25967548-25967628)
chr4 (70-174)||(31403276-31403380)
chr4 (140-216)||(35555865-35555941)
chr4 (140-216)||(42639238-42639314)
chr4 (351-435)||(49686892-49686976)
chr4 (140-216)||(54470195-54470271)
chr4 (335-434)||(5306479-5306578)
chr4 (306-433)||(26024851-26024978)
chr4 (351-402)||(40018221-40018272)
chr4 (351-402)||(40932956-40933007)
chr4 (335-402)||(42639052-42639119)
chr4 (353-432)||(51550251-51550330)
chr4 (382-432)||(8598898-8598948)
chr4 (70-185)||(10775671-10775782)
chr4 (357-431)||(13262417-13262491)
chr4 (70-136)||(18966475-18966541)
chr4 (335-393)||(40420255-40420313)
chr4 (333-379)||(41729505-41729551)
chr4 (70-136)||(43070058-43070124)
chr4 (79-185)||(44360014-44360120)
chr4 (327-433)||(48609772-48609878)
chr4 (142-216)||(51252679-51252753)
chr4 (340-434)||(54963639-54963732)
chr4 (361-395)||(55029030-55029064)
chr4 (349-434)||(13805265-13805350)
chr4 (335-432)||(22873601-22873698)
chr4 (363-436)||(25755527-25755600)
chr4 (373-434)||(30634106-30634167)
chr4 (140-220)||(31897642-31897720)
chr4 (357-434)||(36556760-36556837)
chr4 (361-434)||(37488300-37488373)
chr4 (306-371)||(41009282-41009347)
chr4 (77-229)||(41192763-41192913)
chr4 (334-391)||(46749729-46749786)
chr4 (140-260)||(50680727-50680848)
chr4 (73-221)||(55578956-55579101)
chr4 (353-397)||(5367682-5367726)
chr4 (367-431)||(15661875-15661939)
chr4 (361-397)||(20105555-20105591)
chr4 (330-398)||(20131025-20131093)
chr4 (382-434)||(20654868-20654920)
chr4 (327-402)||(25257628-25257701)
chr4 (140-216)||(28497478-28497553)
chr4 (320-400)||(34233058-34233138)
chr4 (69-179)||(34233285-34233394)
chr4 (372-436)||(46236709-46236773)
chr4 (357-437)||(46372229-46372309)
[»] chr5 (82 HSPs)
chr5 (67-435)||(3301763-3302127)
chr5 (67-436)||(16347378-16347741)
chr5 (113-427)||(38684932-38685242)
chr5 (70-434)||(24178432-24178792)
chr5 (70-434)||(28976859-28977217)
chr5 (70-434)||(12492384-12492747)
chr5 (70-434)||(1275187-1275546)
chr5 (74-434)||(4496308-4496666)
chr5 (70-402)||(1287611-1287949)
chr5 (70-432)||(2075475-2075834)
chr5 (96-434)||(14665658-14665994)
chr5 (159-433)||(20456780-20457054)
chr5 (70-434)||(10639219-10639584)
chr5 (241-434)||(13561386-13561579)
chr5 (244-432)||(14911264-14911452)
chr5 (210-434)||(2915496-2915719)
chr5 (70-434)||(34272944-34273295)
chr5 (79-402)||(26884721-26885040)
chr5 (285-434)||(29816515-29816664)
chr5 (240-434)||(27970-28164)
chr5 (306-435)||(16913881-16914011)
chr5 (184-430)||(38501422-38501668)
chr5 (70-394)||(36215422-36215730)
chr5 (314-431)||(39040918-39041035)
chr5 (140-387)||(14749295-14749542)
chr5 (326-434)||(5558315-5558423)
chr5 (68-387)||(32516478-32516790)
chr5 (315-402)||(418066-418153)
chr5 (100-215)||(15168744-15168855)
chr5 (332-434)||(30213755-30213857)
chr5 (345-434)||(18855800-18855889)
chr5 (335-400)||(32442159-32442224)
chr5 (335-434)||(14667954-14668053)
chr5 (315-437)||(31220546-31220667)
chr5 (349-434)||(6788264-6788348)
chr5 (314-434)||(2090575-2090695)
chr5 (362-434)||(42272687-42272759)
chr5 (357-432)||(3442873-3442948)
chr5 (142-229)||(4026540-4026627)
chr5 (361-436)||(28186780-28186855)
chr5 (306-403)||(9235201-9235298)
chr5 (349-434)||(11675727-11675812)
chr5 (71-216)||(21952274-21952421)
chr5 (361-434)||(28411885-28411958)
chr5 (361-434)||(38132545-38132618)
chr5 (361-434)||(42576219-42576292)
chr5 (306-434)||(28276392-28276520)
chr5 (142-230)||(31636124-31636212)
chr5 (363-434)||(408494-408565)
chr5 (140-434)||(7359261-7359553)
chr5 (335-434)||(20367076-20367175)
chr5 (145-216)||(33667209-33667280)
chr5 (335-434)||(43475422-43475521)
chr5 (335-433)||(12576861-12576959)
chr5 (352-434)||(41894273-41894355)
chr5 (313-434)||(2393038-2393158)
chr5 (179-292)||(15986879-15986992)
chr5 (366-435)||(27386554-27386623)
chr5 (361-434)||(32366187-32366260)
chr5 (326-387)||(42504294-42504355)
chr5 (140-204)||(14667751-14667815)
chr5 (349-397)||(38657040-38657088)
chr5 (369-436)||(218050-218117)
chr5 (113-321)||(31906626-31906830)
chr5 (360-395)||(38684688-38684723)
chr5 (306-396)||(6889147-6889237)
chr5 (356-434)||(9121078-9121156)
chr5 (357-431)||(11002424-11002498)
chr5 (335-401)||(18350935-18351001)
chr5 (324-434)||(36551318-36551428)
chr5 (337-435)||(43557832-43557930)
chr5 (361-434)||(5860043-5860116)
chr5 (140-221)||(15489705-15489786)
chr5 (335-400)||(30588630-30588695)
chr5 (140-216)||(79501-79577)
chr5 (357-401)||(1525849-1525893)
chr5 (357-393)||(1935363-1935399)
chr5 (144-216)||(2712936-2713008)
chr5 (144-216)||(6859373-6859445)
chr5 (360-432)||(27800036-27800108)
chr5 (362-434)||(29922494-29922566)
chr5 (366-434)||(43423496-43423563)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (67-434)||(5258148-5258513)
chr6 (71-394)||(5631741-5632064)
chr6 (67-433)||(608078-608442)
chr6 (67-436)||(35043439-35043804)
chr6 (70-434)||(28085298-28085658)
chr6 (70-434)||(32755841-32756203)
chr6 (67-434)||(20427636-20427999)
chr6 (67-431)||(30031175-30031535)
chr6 (67-436)||(9706695-9707054)
chr6 (94-435)||(21351836-21352171)
chr6 (70-434)||(14030728-14031077)
chr6 (143-434)||(12890575-12890857)
chr6 (67-299)||(10099994-10100220)
chr6 (67-376)||(9593766-9594075)
chr6 (154-387)||(33496963-33497194)
chr6 (163-434)||(30679417-30679678)
chr6 (315-434)||(3206459-3206578)
chr6 (275-434)||(34143765-34143924)
chr6 (275-434)||(34156381-34156540)
chr6 (222-395)||(5080910-5081083)
chr6 (70-386)||(28026877-28027185)
chr6 (201-321)||(7133795-7133915)
chr6 (201-321)||(7136718-7136838)
chr6 (69-185)||(5080776-5080888)
chr6 (326-435)||(34934829-34934938)
chr6 (306-434)||(34505-34633)
chr6 (326-402)||(31819005-31819081)
chr6 (67-173)||(2065013-2065119)
chr6 (306-436)||(5095988-5096118)
chr6 (361-438)||(1615219-1615296)
chr6 (77-433)||(6055773-6056123)
chr6 (348-402)||(12119675-12119729)
chr6 (306-434)||(10098896-10099022)
chr6 (159-283)||(2689647-2689771)
chr6 (363-435)||(18130813-18130885)
chr6 (160-229)||(24665818-24665887)
chr6 (357-401)||(10453268-10453312)
chr6 (363-435)||(23888477-23888549)
chr6 (306-402)||(31818685-31818781)
chr6 (313-432)||(7492550-7492669)
chr6 (275-402)||(8364679-8364806)
chr6 (357-432)||(30789076-30789151)
chr6 (326-400)||(24665985-24666059)
chr6 (361-434)||(586059-586132)
chr6 (69-134)||(2689577-2689642)
chr6 (362-431)||(21886314-21886383)
chr6 (140-216)||(33084046-33084122)
chr6 (358-402)||(33084135-33084179)
chr6 (140-215)||(6641628-6641703)
chr6 (160-203)||(13674636-13674679)
chr6 (316-395)||(32080633-32080712)
chr6 (357-399)||(38976-39018)
chr6 (335-401)||(3210541-3210607)
chr6 (337-403)||(9568884-9568950)
chr6 (349-399)||(32097934-32097984)
chr6 (359-401)||(32949726-32949768)
chr6 (349-434)||(4245872-4245957)
chr6 (376-433)||(5053750-5053807)
chr6 (353-410)||(7080541-7080598)
chr6 (162-215)||(8364582-8364635)
chr6 (70-216)||(26291700-26291843)
chr6 (349-402)||(28891474-28891527)
chr6 (70-122)||(6293677-6293729)
chr6 (76-136)||(9568588-9568648)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (67-435)||(82640-83001)
scaffold0024 (348-431)||(48119-48202)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (70-434)||(31390-31750)
scaffold0018 (144-216)||(44086-44158)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (105-434)||(948-1271)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (69-395)||(86648-86968)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (262-436)||(16688-16862)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (73-434)||(4280-4629)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (220-434)||(4704-4918)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (70-193)||(25686-25805)
scaffold0157 (280-434)||(25532-25686)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (70-213)||(11817-11958)
scaffold0113 (195-418)||(11565-11786)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (306-434)||(485-613)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (306-434)||(14737-14865)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (361-434)||(28889-28962)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (306-418)||(58242-58354)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (142-397)||(7431-7685)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (346-432)||(16438-16524)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (349-433)||(160325-160409)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (363-428)||(3648-3713)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (314-394)||(39481-39561)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (358-434)||(163194-163270)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 122)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 43281595 - 43281956
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||    
T  43281595 gcggggatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccatt------agagagagtgggggtagcacctata 43281688  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43281689 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 43281788  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43281789 aggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 43281888  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||| ||| ||| |||||||||||    
T  43281889 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgt 43281956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12841635 - 12841275
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12841635 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccccatta----gagagagagtggaggtagcacctatagta 12841540  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  12841539 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 12841440  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||    
T  12841439 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaac 12841340  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  12841339 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12841275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 210 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598137
Alignment:
Q  210 tagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgaga 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  310 aaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaa 409  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccgactc-atttaa 24598213  T
Q  410 taggataagact---tagttgttgttgtataaacctttctcatctaattactaaactctttcttcatctccaagat 482  Q
    | ||||||||||   | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24598212 tgggataagacttggttgttgttgttgtataaacttgtctcatctaattactaaactctttcttcatctccaagat 24598137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 45836843 - 45836482
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45836843 gcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctata 45836748  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  45836747 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtt 45836648  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    |||||  | |||||||| | ||||||| || ||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  45836647 aggtt--atgaggtagagggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatag 45836550  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||  |||||||||||    
T  45836549 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 45836482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 70 - 435
Target Start/End: Original strand, 34869342 - 34869703
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34869342 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 34869437  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||  || |||||| |    
T  34869438 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaag 34869537  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  34869538 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 34869637  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  34869638 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgttgttgta 34869703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 11593882 - 11594242
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||     ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11593882 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatt----tgagagagagtgggggtagcacctatagta 11593977  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     |||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  11593978 gaaaagttggtagaaaatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 11594077  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  11594078 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 11594177  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  11594178 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 11594242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 113 - 434
Target Start/End: Original strand, 29650349 - 29650666
Alignment:
Q  113 ataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtag 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29650349 ataggattaggaatgacaccattc----gagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtag 29650444  T
Q  213 agagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaac 312  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29650445 agagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaac 29650544  T
Q  313 cattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatag 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |    
T  29650545 cattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 29650644  T
Q  413 gataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||| |||||||||||    
T  29650645 gataaggcttggttgttgttgt 29650666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 37617866 - 37618227
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37617866 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 37617961  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaa-taggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcag 268  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  37617962 gaaaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaa 37618061  T
Q  269 gttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||    
T  37618062 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 37618161  T
Q  369 cattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    || ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  37618162 cactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 37618227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33350166 - 33349806
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33350166 gagatgaggatgttgccttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccatta----gagagagagtgggggttgcacctatagta 33350071  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  33350070 gaaaagttgctagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 33349971  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |  ||||||    
T  33349970 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaac 33349871  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  33349870 actatagcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 33349806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 44855532 - 44855174
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  44855532 gagatcaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtggggatagtacctatagta 44855437  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  44855436 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 44855337  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||  |||    
T  44855336 ttaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgat--aac 44855239  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  44855238 actatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44855174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 402
Target Start/End: Original strand, 49029198 - 49029526
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49029198 gagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 49029293  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||||| ||| |||||| |    
T  49029294 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaag 49029393  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  49029394 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 49029493  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  49029494 actatggcgtcatttgatccatgtagccaaccc 49029526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 70 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 35906561 - 35906208
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35906561 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtggaggtagcacctatagta 35906466  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |    
T  35906465 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatggaggagagtcaag 35906366  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  35906365 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 35906266  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttg 427  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||    
T  35906265 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 35906208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 39906730 - 39906372
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39906730 gagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgagggtagcacctatagta 39906635  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  39906634 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagg--agtcaag 39906537  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| || | | |||||||||    
T  39906536 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaac 39906437  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  39906436 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 39906372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 70 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 13859368 - 13859061
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13859368 gagatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 13859273  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  13859272 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 13859173  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||    
T  13859172 ttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaac 13859073  T
Q  370 attatggcgtca 381  Q
    | ||||||||||    
T  13859072 actatggcgtca 13859061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 43491230 - 43491590
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||     | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43491230 gagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattg----gggagagagtaggggtaacacctatagta 43491325  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||    
T  43491326 taaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagagtcagg 43491425  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  43491426 tcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaac 43491525  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | ||||  || |||| || |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  43491526 actatgatgtaatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43491590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 35559353 - 35558994
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacc-tatagta 169  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  35559353 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatt----tgagagagagtgggggtagcaccttatagta 35559258  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| ||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  35559257 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 35559158  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  ||| || ||||||    
T  35559157 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttagtttatggtagaac 35559058  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| ||||  ||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  35559057 attatagcatcatttgatccatgtagcggacctcatttagtaagataaggcttagttgttgttg 35558994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 38606924 - 38607274
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||     |||||||||||||||| ||||||||    
T  38606924 gcggagatgataatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacatta-----agagagagtgggggtagcacctata 38607018  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  38607019 gtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtc 38607118  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    | |||| |||||| ||| ||||||||||||            ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38607119 acgttagaagagggagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 38607206  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||| | || |||| ||| |||||||||||    
T  38607207 aacactatggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgt 38607274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 402
Target Start/End: Original strand, 36651916 - 36652242
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||      ||||| || |||||  || | ||||||    
T  36651916 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta------gagagggtaggggtggcatccatagta 36652009  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||  ||||| |    
T  36652010 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaag 36652109  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||    
T  36652110 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 36652209  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36652210 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccc 36652242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 143 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2886013 - 2885722
Alignment:
Q  143 gagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaa 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  2886013 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtacgaa 2885914  T
Q  243 gagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagtt 342  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  2885913 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagtt 2885814  T
Q  343 gaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | | ||||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  2885813 ggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2885722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 352
Target Start/End: Original strand, 31005145 - 31005423
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31005145 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 31005240  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  31005241 gaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31005340  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaat 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||| || | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  31005341 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagttggatccaaat 31005423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 77 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 46356209 - 46355858
Alignment:
Q  77 ggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagt 176  Q
    |||||||| | || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||     ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  46356209 ggatgttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccat----cagagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagt 46356114  T
Q  177 tggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaag 276  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  46356113 tggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 46356014  T
Q  277 aggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatgg 376  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||  |||  ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| ||||     
T  46356013 aggtagaggaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaacactatgc 46355914  T
Q  377 cgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| | ||| |  |||||| ||| |||||||||    
T  46355913 catcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgtt 46355858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 113 - 431
Target Start/End: Original strand, 6374833 - 6375147
Alignment:
Q  113 ataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtag 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  6374833 ataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtag 6374928  T
Q  213 agagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaac 312  Q
    |||| ||| | ||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| |||||||    
T  6374929 agagaagaccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaac 6375028  T
Q  313 cattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatag 412  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||| |  | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |    
T  6375029 cattagaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 6375128  T
Q  413 gataagacttagttgttgt 431  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  6375129 gataaggcttggttgttgt 6375147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31682883 - 31682602
Alignment:
Q  153 gggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatca 252  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  31682883 gggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatca 31682784  T
Q  253 aatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaat 352  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  31682783 aatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccatat 31682684  T
Q  353 atgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     || ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  31682683 ttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31682602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 433
Target Start/End: Original strand, 23404343 - 23404697
Alignment:
Q  73 atgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23404343 atgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccatta----gggagagagtgggggtaacacttatagtagaa 23404438  T
Q  173 aagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggtta 272  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||  | |||  |||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  23404439 aagttgggagaaaataggcttagacagtttgg-catgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtca 23404537  T
Q  273 aaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacatt 372  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||   ||||||||||| ||   | ||| || ||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  23404538 aaagaggtagaagaagacctaggaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtttgatccaaatatggtgtatgatagaacatt 23404637  T
Q  373 atggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    |||| || |||| || | | |||||||||| | || ||||||||||  |||||||||||||    
T  23404638 atggtgtaattttatccgtatagccgaccc-acttgataggataaggtttagttgttgttg 23404697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24598560 - 24598409
Alignment:
Q  16 cactaactggttgttaggatttgacttagtctttaaatgttgatatattttgcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24598560 cactaactggttgttaggatttgacttagtctttaaatgttgatatattttgcagagacgaggatgttgtgttggatgagtggtaagtttagacatgata 24598461  T
Q  116 ggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatag 167  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  24598460 ggattaggaatgacaccattatagaaagagagagtgggggtatcacctatag 24598409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 299
Target Start/End: Original strand, 33072876 - 33073099
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33072876 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccatt------agagagagtgggggtagcacctatagta 33072969  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |    
T  33072970 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaag 33073069  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaa 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33073070 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa 33073099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 159 - 434
Target Start/End: Original strand, 22349627 - 22349902
Alignment:
Q  159 cacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaa 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22349627 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaatgga 22349726  T
Q  259 ggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatt 358  Q
    || |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| || |     
T  22349727 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaatttggta 22349826  T
Q  359 tttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| | ||||||| |||  ||||||||||    
T  22349827 tatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 22349902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 195 - 434
Target Start/End: Original strand, 32631619 - 32631846
Alignment:
Q  195 gatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32631619 gatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaa 32631718  T
Q  295 gaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgta 394  Q
    |||||            ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  32631719 gaaaa------------ccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatctatgta 32631806  T
Q  395 gccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  32631807 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 32631846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 151 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 36869527 - 36869237
Alignment:
Q  151 gggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagat 250  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |   |||||||||||||    
T  36869527 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagat 36869428  T
Q  251 caaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaa 350  Q
    |||||| ||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||  |||||  |||  ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  || |||    
T  36869427 caaatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaa 36869328  T
Q  351 atatgatttttgatagaacattatggcgtcatt-------tgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||||||||       |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  36869327 atttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 36869237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 162 - 402
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682424
Alignment:
Q  162 ctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggt 261  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||     
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  262 gagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgattttt 361  Q
     ||||| || ||||||||| ||  || ||||| |||||  ||  |||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  362 gatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccc 15682424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 269 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979926
Alignment:
Q  269 gttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  369 cattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 40979926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 269 - 434
Target Start/End: Original strand, 38900074 - 38900238
Alignment:
Q  269 gttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||| |||    
T  38900074 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgattgaa 38900173  T
Q  369 cattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  38900174 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccc-acttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38900238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 206 - 434
Target Start/End: Original strand, 7273154 - 7273382
Alignment:
Q  206 catgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattc 305  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | ||| | |||||||||   ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||  ||      
T  7273154 catgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactataa 7273253  T
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| | || |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |     
T  7273254 gagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccac 7273353  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| | ||||||| |||  ||||||||||    
T  7273354 ttagtgggataaggcttgattgttgttgt 7273382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Original strand, 7272959 - 7273139
Alignment:
Q  68 cggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||| |||||||||| |||    | ||||||  ||| ||| |||||||||    
T  7272959 cggagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacaccttta----gggagagaacgggagtatcacctatag 7273054  T
Q  168 taaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatca 252  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||   ||| |||||||||||||    
T  7273055 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaagagtagatca 7273139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 193
Target Start/End: Original strand, 32630514 - 32630635
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||     ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32630514 gcggagatgaggatgttgagctggatgagtggtaagactagacatgataggatt-aggatgataccatt----ggagagagagtgggggtagcacctata 32630608  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggctt 193  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32630609 gtagaaaagttggtagaaaataggctt 32630635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 388
Target Start/End: Original strand, 36136687 - 36137000
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaa 170  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||||||    |||||||||| |||||| |||||||||||     
T  36136687 agatgagaatgttgtgttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccatta----gagagagagttggggtagcacctatagtag 36136782  T
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggt 270  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | | |||||| ||| ||||||| | | |  ||||||   | ||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||| |    
T  36136783 aaaagatggtagaaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagat 36136882  T
Q  271 taaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaaca 370  Q
     | |||| ||||| |||||||||  ||||  ||  ||||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36136883 cagaagaagtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaaca 36136982  T
Q  371 ttatggcgtcatttgatt 388  Q
    |||| | || ||||||||    
T  36136983 ttatagggtaatttgatt 36137000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 306 - 434
Target Start/End: Original strand, 21078071 - 21078199
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  21078071 gagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgacttcat 21078170  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  21078171 ttagtgggataaggcttggttgttgttgt 21078199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 46014474 - 46014359
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaa 239  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |  |||    
T  46014474 agagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg-ttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcctaa 46014376  T
Q  240 gaagagtagatcaaatg 256  Q
    |||||||||||||||||    
T  46014375 gaagagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 309 - 434
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649062
Alignment:
Q  309 aaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaattta 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27649036  T
Q  409 ataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     | ||||||| ||| |||||||||||    
T  27649037 gtgggataaggcttggttgttgttgt 27649062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681022
Alignment:
Q  225 tagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaaga 324  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||| |   |||||||||||||||| ||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaatta---gagaaaccattagaaagga 31681130  T
Q  325 cttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttag 424  Q
     |||  ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||| ||| ||| |    
T  31681129 tttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttgg 31681030  T
Q  425 ttgttgtt 432  Q
    ||||||||    
T  31681029 ttgttgtt 31681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 287 - 435
Target Start/End: Original strand, 48919247 - 48919395
Alignment:
Q  287 agacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttga 386  Q
    ||||||| |||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||||    
T  48919247 agacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttga 48919346  T
Q  387 ttcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    | ||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  48919347 tccatgtagtcgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgta 48919395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28628227 - 28627936
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaa 239  Q
    |||||| |||| || ||| |||||| |||| ||| | |||| |||||| ||||| | |||||||| |||||| |||| | | | ||||||    | ||||    
T  28628227 agagagggagttggagtagcacctagagtagaaatgatggtggaaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaa 28628128  T
Q  240 gaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatga 339  Q
    | ||||||||||  ||| |||  |||||  | | |||||||||| |||||||||  ||||  ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  28628127 ggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatga 28628028  T
Q  340 gttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    |||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  28628027 gttggatgcaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210704
Alignment:
Q  274 aagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacatta 373  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||  ||  |||||||  |||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacatta 9210765  T
Q  374 tggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  9210764 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttgt 9210704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 306 - 433
Target Start/End: Original strand, 14057632 - 14057759
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||  || |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |     
T  14057632 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14057731  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14057732 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 306 - 433
Target Start/End: Original strand, 14367660 - 14367787
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||  || |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |     
T  14367660 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14367759  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14367760 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 36869649 - 36869570
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagag 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  36869649 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagag 36869570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 434
Target Start/End: Original strand, 1011135 - 1011328
Alignment:
Q  240 gaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatga 339  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||| ||  ||||||  ||||| ||| | ||| |||| |||||    
T  1011135 gaagagtagatcagataaaggagagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgagagaaattattaggaaatatttaaaggttaatga 1011234  T
Q  340 gttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     ||| |||||| |||| |||  ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  1011235 tttggatccaa-tatggtttaggatagaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 1011328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7189594 - 7189444
Alignment:
Q  69 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaag----agagagagtgggggtaacaccta 164  Q
    |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| | ||    ||||||||| |||||  ||||||    
T  7189594 ggagatgaggatgttgtgttgaatgaccggtaagattagacgagatagga-tatgaatgacaccattagagagagaaagagagagttggggtcgcaccta 7189496  T
Q  165 tagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||    
T  7189495 tagtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagag 7189444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208328
Alignment:
Q  339 agttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28208328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 34035262 - 34035155
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||| || ||| ||    
T  34035262 ttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttggt 34035163  T
Q  426 tgttgttg 433  Q
    ||||||||    
T  34035162 tgttgttg 34035155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8492575 - 8492452
Alignment:
Q  88 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaat 187  Q
    ||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||    | |||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8492575 tggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccatta----gggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaat 8492480  T
Q  188 aggcttggatggtttggacatgtagaga 215  Q
    |||||  | ||||||| || ||||||||    
T  8492479 aggctaaggtggtttgaacttgtagaga 8492452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Original strand, 43282325 - 43282472
Alignment:
Q  68 cggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatag 167  Q
    |||| |||||||||||| | | |||| ||||||||  ||||||||||| |||||  ||||||| |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43282325 cggatatgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagtctagacatgatatgattagaaatgacaacatt-tagagagagagagttggggtagcacctatag 43282423  T
Q  168 taaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    || |||||| ||| |||| ||||||| | ||  |||| |||||||||||    
T  43282424 tagaaaagtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagag 43282472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Original strand, 47848595 - 47848738
Alignment:
Q  69 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagt 168  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||| |  | ||| | |||||    |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  47848595 ggagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcagaagtgataacatta----gagagagagttggggtagcgcctatagt 47848690  T
Q  169 aaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    | ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  47848691 agaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagag 47848738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Original strand, 35922376 - 35922476
Alignment:
Q  274 aagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacatta 373  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| | || ||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35922376 aagaggtagaggaagacttaaaaaaaacttt-gagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacatta 35922474  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  35922475 tg 35922476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 36239924 - 36239833
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagcc 397  Q
    ||||||| ||||| ||| | |||||| | || |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36239924 gagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27893677 - 27893563
Alignment:
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataaga 419  Q
    ||||| |||||| | |||||| || | | ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||     
T  27893677 aaagatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataagg 27893578  T
Q  420 cttagttgttgttgt 434  Q
    ||| |||||||||||    
T  27893577 cttggttgttgttgt 27893563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 418
Target Start/End: Original strand, 33103094 - 33103192
Alignment:
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataag 418  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  33103094 aaagacttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataag 33103192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 434
Target Start/End: Original strand, 42187575 - 42187723
Alignment:
Q  285 gaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacatt-atggcgtcatt 383  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||| | |||||| | ||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  42187575 gaagacctaa-aaaattataagagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaat-tggtttatgatagaacatttatggcgtaatt 42187672  T
Q  384 tgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  42187673 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgttgt 42187723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31869179 - 31869102
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  31869179 tttttgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31869102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 396
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601720
Alignment:
Q  275 agaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattat 374  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||  ||  ||||||||||||  |||||  ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  375 ggcgtcatttgattcatgtagc 396  Q
    || || ||||||| ||||||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatccatgtagc 45601720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27021986 - 27021910
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  27021986 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagag 27021910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 36101876 - 36101777
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  36101876 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36101777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36514565 - 36514425
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || ||  ||||| ||||  || |||| |||||      |||||||| |||||| |||||||||||    
T  36514565 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacatta------gagagagttggggtagcacctatagta 36514472  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
     ||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  36514471 gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagag 36514425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Original strand, 47652722 - 47652829
Alignment:
Q  327 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagtt 426  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||    
T  47652722 tagaggttaataagtttgatccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 47652821  T
Q  427 gttgttgt 434  Q
    ||||||||    
T  47652822 gttgttgt 47652829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 25731588 - 25731474
Alignment:
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataaga 419  Q
    ||||| ||| |||| ||| | ||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||   |||||| ||||||||    
T  25731588 aaagatttacaggttaataaattggatccaaatatggtttcgaatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagcagacctcgtttaatgggataaga 25731489  T
Q  420 cttagttgttgttgt 434  Q
    ||| |||||||||||    
T  25731488 cttggttgttgttgt 25731474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 434
Target Start/End: Original strand, 25891086 - 25891170
Alignment:
Q  350 aatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||| ||| |||||||||||    
T  25891086 aatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgttgt 25891170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 433
Target Start/End: Original strand, 34745952 - 34746028
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  34745952 tttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 34746028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 42187390 - 42187534
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||  ||||  ||||  |||| || ||||| ||||||||    | |||||| ||||||||    
T  42187390 gcggagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgggatat-attagaaatggcagcattagaaagagag----tcggggtagcacctata 42187484  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
     || ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  42187485 atagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagag 42187534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 402
Target Start/End: Original strand, 42969872 - 42969948
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |  | ||||||| ||||||||||||||    
T  42969872 ttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccc 42969948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 402
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852337
Alignment:
Q  330 aggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || | | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccc 47852337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 375 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 17907783 - 17907724
Alignment:
Q  375 ggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  17907783 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagcaggataagacttggttgttgttgt 17907724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24177714 - 24177628
Alignment:
Q  346 tccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  24177714 tccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtca-ttgatccatgtagccaaccccacttagtaggataaagcttggttgttgttg 24177628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27893840 - 27893769
Alignment:
Q  142 agagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtaga 213  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  27893840 agagagagttgaggtaacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341395
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||| | | ||||| |||  ||||||||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataaggcttgtttgttgttgt 34341395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38103733 - 38103616
Alignment:
Q  314 attagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatagg 413  Q
    ||||| ||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||| || ||||||| | |||||||||||| | ||| | ||    
T  38103733 attaggaaatactaagagattaatgagttggatccaaatattgtttatgata-aacattatggtgtaatttgatcc-tgtagccgaccccagttagtggg 38103636  T
Q  414 ataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  38103635 ataagacttggttgttgttg 38103616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 418
Target Start/End: Original strand, 48515370 - 48515437
Alignment:
Q  351 atatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataag 418  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||    
T  48515370 atatggtttatgatagaacattatggcgtaattttattcatgtagccgccccaacttagtgggataag 48515437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30200319 - 30200204
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||| |||||  ||||||| ||||        |||||||  |||||||||||||||||    
T  30200319 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacatt--------agagagttagggtaacacctatagta 30200228  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggctt 193  Q
     ||||| |||| |||| |||||||    
T  30200227 gaaaagatggtggaaactaggctt 30200204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Original strand, 31840442 - 31840512
Alignment:
Q  364 tagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  31840442 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagcctaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31840512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 434
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073211
Alignment:
Q  328 agaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttg 427  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || | | | ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||| | ||||||| ||| ||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 33073204  T
Q  428 ttgttgt 434  Q
    || ||||    
T  33073205 ttattgt 33073211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 402
Target Start/End: Original strand, 37976403 - 37976485
Alignment:
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||| ||||    
T  37976403 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaattagatccatgtagccaaccc 37976485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 395
Target Start/End: Original strand, 45558535 - 45558573
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45558535 tttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtag 45558573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 4604756 - 4604829
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  4604756 tgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagacttggttcttgttgt 4604829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 6807700 - 6807773
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| | ||| | |||||||| || |||||||||||    
T  6807700 tgatagaacattatggcgtcgtatgattcatgtaggtgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgt 6807773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 432
Target Start/End: Original strand, 9796299 - 9796364
Alignment:
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9796299 aacattatgacgtaattcgattcatgtagccgacctcacttaatgggataagatttagttgttgtt 9796364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 21517508 - 21517427
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  21517508 gagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaatttgat 21517427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 358
Target Start/End: Original strand, 18795841 - 18795893
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatt 358  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18795841 gagaaactattcgaaaagatttagaggttaatgagttgaattcaaatatgatt 18795893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19119500 - 19119424
Alignment:
Q  358 ttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||| | || |||||||||||    
T  19119500 ttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaaaatttgttgttgttgt 19119424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 252
Target Start/End: Original strand, 39811876 - 39812057
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||    |||||||||| |||| | |||||||     
T  39811876 gcggatatgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacatta----gagagagagttggggcagcacctatc 39811971  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatca 252  Q
     || ||||  ||||  ||| | ||||| | | |||||| ||||||||||| |||   |||||| | || ||||| |||||||||||    
T  39811972 atagaaaaaatggtgaaaactcggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagagatgtagattctatagtaaggagagtagatca 39812057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 215
Target Start/End: Original strand, 40169640 - 40169712
Alignment:
Q  143 gagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagaga 215  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  40169640 gagagaattggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 40169712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 402
Target Start/End: Original strand, 40415169 - 40415257
Alignment:
Q  314 attagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||||||    
T  40415169 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccc 40415257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 402
Target Start/End: Original strand, 1569199 - 1569266
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  1569199 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatcgatgtagtcgaccc 1569266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 434
Target Start/End: Original strand, 5418293 - 5418356
Alignment:
Q  371 ttatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  5418293 ttatggcgtaatttgatccatgtagtcgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 5418356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19262725 - 19262638
Alignment:
Q  142 agagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagat 229  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||| | |||||||  ||||||||||| ||| | ||||||    
T  19262725 agagagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtagat 19262638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 432
Target Start/End: Original strand, 24777170 - 24777241
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| | ||||||  ||| |||||||||    
T  24777170 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaagcttggttgttgtt 24777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 434
Target Start/End: Original strand, 28708596 - 28708663
Alignment:
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||| ||||||    
T  28708596 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgt 28708663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814157
Alignment:
Q  339 agttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccc 30814157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 434
Target Start/End: Original strand, 41483686 - 41483769
Alignment:
Q  351 atatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| | || |||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||| | |||||||| || |||||||||||    
T  41483686 atatgatatatggtagaactttatggtgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgt 41483769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 185
Target Start/End: Original strand, 45558352 - 45558395
Alignment:
Q  142 agagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaa 185  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45558352 agagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaa 45558395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 403
Target Start/End: Original strand, 5336123 - 5336169
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccca 403  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5336123 tttttgattgaatactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccca 5336169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26742177 - 26742115
Alignment:
Q  153 gggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagaga 215  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || | ||||||| |||||||||||    
T  26742177 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagaga 26742115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 434
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355448
Alignment:
Q  309 aaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag-ccgacccaattt 407  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||| |||||| || ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||||| || |||| | ||||| | ||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccactt 28355421  T
Q  408 aataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | | ||||||| ||| |||||||||||    
T  28355422 agtgggataaggcttggttgttgttgt 28355448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 34029750 - 34029708
Alignment:
Q  360 ttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  34029750 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccc 34029708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Original strand, 40630654 - 40630716
Alignment:
Q  372 tatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||| ||| ||| |||||||||||    
T  40630654 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 40630716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 400
Target Start/End: Original strand, 44951309 - 44951403
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgac 400  Q
    |||||||| |||||||| | ||| | |||||| | ||  || ||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  44951309 gagaaacctttagaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgac 44951403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 434
Target Start/End: Original strand, 48515475 - 48515557
Alignment:
Q  352 tatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  48515475 tatgatttatgatagtacactatgacgtaatttgatccgtgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgt 48515557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Original strand, 14593957 - 14594034
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||| || || ||| | | ||||||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  14593957 tttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 14594034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Original strand, 16013480 - 16013557
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||| || || ||| | | ||||||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  16013480 tttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16013557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 402
Target Start/End: Original strand, 22174209 - 22174250
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  22174209 tgatagaacattatggcgttgtttgatccatgtagccgaccc 22174250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 396
Target Start/End: Original strand, 31834532 - 31834601
Alignment:
Q  327 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagc 396  Q
    ||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  31834532 tagaggtcaatggtttgactagaaatatgatttttgataggatattatggtctcatttgatccatgtagc 31834601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 437
Target Start/End: Original strand, 33732031 - 33732117
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtata 437  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  || | ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33732031 aaatatggtttatgatagaacattatggc--aatttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtata 33732117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926557
Alignment:
Q  338 gagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccga 399  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccga 34926557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 216
Target Start/End: Original strand, 38920789 - 38920858
Alignment:
Q  147 gagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||   |||||||| |||||||||||    
T  38920789 gagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagag 38920858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 40008504 - 40008431
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  40008504 tgatagaacattatgtcgttgtttgatccatgtagctgacctcacttaatgagataagacttggttgttgttgt 40008431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 40139021 - 40138944
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtataa 438  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |  |||||||||| | |||| ||||||||    
T  40139021 tgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgcgataagacttggctgttattgtataa 40138944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 2882835 - 2882783
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2882835 aatgagttggatcgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgat 2882783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 259
Target Start/End: Original strand, 12966029 - 12966129
Alignment:
Q  159 cacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaa 258  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||| || |||| | |||||||| ||||||||||| ||| ||||| || |  | ||||| |||||||||||| ||||    
T  12966029 cacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaagtgaa 12966128  T
Q  259 g 259  Q
    |    
T  12966129 g 12966129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24376096 - 24376056
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24376096 tgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgacc 24376056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26741993 - 26741941
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    ||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26741993 aatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgat 26741941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 434
Target Start/End: Original strand, 29312207 - 29312271
Alignment:
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  29312207 attatggcgtaatttgatccatgaagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29312271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 434
Target Start/End: Original strand, 31005431 - 31005487
Alignment:
Q  378 gtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  31005431 gtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31005487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 394
Target Start/End: Original strand, 31859049 - 31859117
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgta 394  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| | |||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  31859049 ttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 44401212 - 44401164
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagcc 397  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  44401212 aaatatgttttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 121)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 696188 - 696552
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  696188 gcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctata 696283  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  696284 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcatatggaggagagtc 696383  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  696384 aggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatag 696483  T
Q  367 aacatta-tggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  696484 aacactattggcgtcatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 696552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 8391691 - 8392054
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8391691 gcggagatgaagatgttgtgttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctata 8391786  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8391787 gtagaaaagttggtagaaaataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtc 8391886  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8391887 atgttaaaggaggtatatgaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttttgatag 8391986  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  8391987 aatactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtaggaaaagacttagtcgttgttgt 8392054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 71 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4001814 - 4001455
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaa 170  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4001814 agatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagtag 4001719  T
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4001718 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggt 4001619  T
Q  271 taaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaaca 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  4001618 taaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacc 4001519  T
Q  371 ttatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     |||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||| ||| ||| |||||||||||    
T  4001518 ctatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 4001455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34792709 - 34792349
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34792709 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaaaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 34792614  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  34792613 gaaaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 34792514  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||    
T  34792513 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaac 34792414  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  34792413 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 34792349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 1210667 - 1211027
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1210667 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 1210762  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  1210763 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 1210862  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  1210863 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 1210962  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  1210963 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 1211027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 30202490 - 30202130
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30202490 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 30202395  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||| |    
T  30202394 gaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaag 30202295  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  30202294 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 30202195  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  30202194 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30202130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 8671842 - 8672200
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8671842 gagataaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatt------agagagagtgggggtagcacctatagta 8671935  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  8671936 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 8672035  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  8672036 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 8672135  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | ||| |||||||||||| ||| ||||| |||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  8672136 actatagcgtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 8672200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 71 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 49347752 - 49347392
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaa 170  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||     |||||||||| |||||| || ||||||||     
T  49347752 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattg----gagagagagtaggggtagcatctatagtag 49347657  T
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  49347656 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 49347557  T
Q  271 taaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaaca 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||    
T  49347556 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 49347457  T
Q  371 ttatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  49347456 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 49347392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 51441125 - 51440765
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    |||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51441125 gagatgaggatgttgcattggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtaacacctatagta 51441030  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||| |||||| |    
T  51441029 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaag 51440930  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  51440929 ttaaaggaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 51440830  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  51440829 actacggcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 51440765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 32083108 - 32082756
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32083108 gcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctata 32083013  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32083012 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 32082913  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||            |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  32082912 aggttaaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatag 32082825  T
Q  367 aacattatggc-gtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||| ||| ||||||| |||||||    
T  32082824 aacactacggcagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttagtttttgttgt 32082756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 15085853 - 15086204
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15085853 gcggagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctata 15085948  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15085949 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtc 15086048  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||            ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15086049 agattaaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatag 15086136  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  15086137 aacactatgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15086204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 22090016 - 22090378
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22090016 gagatgaggatgctgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattaga--gagagagagtgggggtagcacctatagta 22090113  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |    
T  22090114 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaag 22090213  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  22090214 ttaaaaggggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 22090313  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | | | | ||||||| ||| |||||||||||    
T  22090314 actatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttgttgttgt 22090378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 9592656 - 9593016
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9592656 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 9592751  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  9592752 gaaaagtttgtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 9592851  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||  |||| || | | |||||||||    
T  9592852 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaac 9592951  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  9592952 actatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 9593016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 73 - 434
Target Start/End: Original strand, 51601983 - 51602338
Alignment:
Q  73 atgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaa 172  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||      ||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  51601983 atgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccatta------gagagagtgagggtagcacctatagtagaa 51602076  T
Q  173 aagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggtta 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  51602077 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 51602176  T
Q  273 aaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacatt 372  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||||     
T  51602177 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatc 51602276  T
Q  373 atggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  51602277 atggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 51602338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 43240741 - 43240380
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43240741 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattaga--gagagagagtgggggtagcacctatagta 43240644  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |    
T  43240643 gaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaag 43240544  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  43240543 ttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 43240444  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  43240443 actatggcgtcatttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttgttg 43240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 70 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 32231314 - 32231001
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32231314 gagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 32231219  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  32231218 gaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 32231119  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  || | | |||||||||    
T  32231118 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaac 32231019  T
Q  370 attatggcgtcatttgat 387  Q
    | ||||| || |||||||    
T  32231018 actatggtgtaatttgat 32231001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 434
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029404
Alignment:
Q  142 agagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaaga 241  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  242 agagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagt 341  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  342 tgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    || |||||||| || | | ||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 4029404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 38808037 - 38807671
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  38808037 gcggatatgaggatgttgtgttggat-agtggtaagaccagacgggatagaattagaaatgacaccattagagagagagagaatgggggtagcacctata 38807939  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| |||| ||| || |||||||| | |||||||||||||| || ||| ||| |||||    
T  38807938 gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaagaagagtagaccagatggaggagagtc 38807839  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    || | ||||||| |||  |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  38807838 agatcaaaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgatag 38807739  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  38807738 aacactatggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38807671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 171 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 25979494 - 25979231
Alignment:
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggt 270  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  25979494 aaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcaggt 25979395  T
Q  271 taaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaaca 370  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25979394 taaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaaca 25979295  T
Q  371 ttatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  25979294 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25979231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 234 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 37311955 - 37311755
Alignment:
Q  234 ttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37311955 ttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 37311856  T
Q  334 caatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||| ||| ||| ||||||||||    
T  37311855 caatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 37311756  T
Q  434 t 434  Q
    |    
T  37311755 t 37311755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 434
Target Start/End: Original strand, 4415458 - 4415631
Alignment:
Q  262 gagtcaggttaaaaga-ggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttt 360  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4415458 gagtcaggttaaaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgatttt 4415557  T
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| | | | ||||||| |||||||||||    
T  4415558 ttatagaacattatggcatcatttgatccatgtagccgactccatttagtggaaaaagacttggttgttgttgt 4415631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 402
Target Start/End: Original strand, 9509240 - 9509568
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||    |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9509240 gagatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccatta----gagagagagttggggtagcacctatagta 9509335  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||| | ||| ||||  | |||   ||||||||||| ||| ||| ||||||      
T  9509336 gaaaagatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggagagtcata 9509435  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    ||| |||||||||| |||||||||  ||||  ||  || |||| ||||| ||||| ||| ||   ||||||||  | ||||||||| ||| |||| ||||    
T  9509436 ttagaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtttatgattgaac 9509535  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  9509536 attatggcgtaattcgatccatgtagccgaccc 9509568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 267 - 436
Target Start/End: Original strand, 52921195 - 52921364
Alignment:
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  52921195 aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatag 52921294  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  52921295 aacactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 52921364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9599754 - 9599427
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||    ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9599754 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcatt----agagagagagttggagtaacacctatagta 9599659  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||| ||||||||||||||||| | ||||| || ||| || | ||  || | | |||||  || |||  |||||||||||| ||| ||| |||||||     
T  9599658 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcaga 9599559  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    | | |||||||||| |||||||||  ||||  |   ||||||| ||||| ||| | |||||| | ||||||||  ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  9599558 tcataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaac 9599459  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  9599458 gttatggcgtaatttgatccatgtagctgacc 9599427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 402
Target Start/End: Original strand, 39318213 - 39318379
Alignment:
Q  236 gtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtca 335  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  39318213 gtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtca 39318312  T
Q  336 atgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39318313 atgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccc 39318379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 32404807 - 32404558
Alignment:
Q  153 gggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatca 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| | |||||| | || ||||| ||||||||  |    
T  32404807 gggtaacacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaa 32404708  T
Q  253 aatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaat 352  Q
     ||| |||  |||||  | | |||||||||| |||||||||  ||||  ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||     
T  32404707 gatggaggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaac 32404608  T
Q  353 atgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32404607 atggtttatgatataacataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccc 32404558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 18469443 - 18469114
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||| |||| || | || ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||      |||||||| |||||||||||||||    
T  18469443 gcggagatgacgatgctgcgttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacacaatta------gagagagttggggtaacacctata 18469350  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| | ||| || ||||||||||| || | | |||||||||| ||| ||| |||   |||||||   | ||| |||||||| |||| ||| ||  |||||    
T  18469349 gtagagaagatgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtc 18469250  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
     | | ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  |||||||  |||| ||| | | |||||||||||||||| || |||||||  ||| |||| |    
T  18469249 ggatcaaaagaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatacaaatatagtttatgatcg 18469150  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  18469149 aacattatggtgtaatttggttcatgtagacgaccc 18469114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37463232 - 37462878
Alignment:
Q  69 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagt 168  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||      |||||||| |||||| ||||||||||    
T  37463232 ggagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccatta------gagagagttggggtagcacctatagt 37463139  T
Q  169 aaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcag 268  Q
    | |||||   ||||||||||||||| | |||||||| |   || |||| |||   ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| |    
T  37463138 agaaaagacagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcgg 37463042  T
Q  269 gttaaaa-gaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgataga 367  Q
     | |||| |||||||| ||  |||||  ||||  ||  ||||||| || || || || |||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| | |||||    
T  37463041 atcaaaaagaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgatc-aaatatggtttatcataga 37462943  T
Q  368 acattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  37462942 acattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 37462878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 431
Target Start/End: Original strand, 39140484 - 39140794
Alignment:
Q  112 gataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgta 211  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |    |||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  39140484 gataggattaggaatgaaaccattaca----gagagagttggcgtagcacctatagtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgta 39140579  T
Q  212 gagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaa 311  Q
    ||||| ||| |  || |||   | ||| ||||||||||||| ||| | | ||||||| ||| |||||||||| |||   |||| ||| | ||  ||||||    
T  39140580 gagagaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaagttat--gagaaa 39140674  T
Q  312 ccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaata 411  Q
    | ||||| ||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |     
T  39140675 ctattaggaaaaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtg 39140774  T
Q  412 ggataagacttagttgttgt 431  Q
    ||||||  ||| ||||||||    
T  39140775 ggataatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561590
Alignment:
Q  182 gaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggta 281  Q
    |||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||| |  ||||||     ||| ||||||||||||| ||| ||| |||| || ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  282 gatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtca 381  Q
    || |||||| ||  ||||  ||  |||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||  |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  382 tttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 316 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423213
Alignment:
Q  316 tagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggat 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaac---atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T
Q  416 aagacttagttgttgttgtata 437  Q
    ||| ||  ||||||||||||||    
T  46423234 aaggctcggttgttgttgtata 46423213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27848155 - 27847947
Alignment:
Q  79 atgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttg 178  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| |||||||||    |||||||||| | |||| ||||| | ||| ||||| ||    
T  27848155 atgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccatta----gagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatg 27848061  T
Q  179 gtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagag 278  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||  | ||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||| | | |||||    
T  27848060 gtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagag 27847961  T
Q  279 gtagatgaagacct 292  Q
    ||||| ||||||||    
T  27847960 gtagaggaagacct 27847947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28090783 - 28090694
Alignment:
Q  345 atccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  28090783 atccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28090694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 314 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10200426 - 10200306
Alignment:
Q  314 attagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatagg 413  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  | ||||| ||    
T  10200426 attagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttaatggg 10200327  T
Q  414 ataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||  ||| |||||||||||    
T  10200326 ataatgcttggttgttgttgt 10200306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24020375 - 24020267
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||  | ||||||| ||| ||    
T  24020375 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttggt 24020276  T
Q  426 tgttgttgt 434  Q
    |||||||||    
T  24020275 tgttgttgt 24020267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 434
Target Start/End: Original strand, 41560403 - 41560511
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||    
T  41560403 ttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggt 41560502  T
Q  426 tgttgttgt 434  Q
    |||||||||    
T  41560503 tgttgttgt 41560511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707221
Alignment:
Q  316 tagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggat 415  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  416 aagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  4707239 aaggcttggttgttgttgt 4707221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 437
Target Start/End: Original strand, 2544587 - 2544878
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaa 239  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||| |  ||||| | || ||||    
T  2544587 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaa 2544686  T
Q  240 gaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatga 339  Q
    | ||||||||||| ||| |||  |||||    |  ||||||||| |||||||||  ||||  ||  ||||||| ||     |||| || ||  |||||||    
T  2544687 ggagagtagatcagatggaggatagtca-aacactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactat-----aagatttggaaatcaatga 2544780  T
Q  340 gttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtata 437  Q
    |||| | | ||||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | ||| | | | ||| ||| ||||||||||||||    
T  2544781 gttggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgtata 2544878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 32079303 - 32079177
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||| |     
T  32079303 gagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaaca--ctggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccac 32079206  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||  | ||||||| ||| |||||||||||    
T  32079205 ttggtgggataaggcttggttgttgttgt 32079177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 52532744 - 52532619
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  52532744 gagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccac 52532645  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    ||| | ||| ||| ||| ||||||||    
T  52532644 ttagtgggaaaaggcttggttgttgt 52532619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 306 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27520335 - 27520240
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||| | |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  27520335 gagaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatgatagaacattatgatgtaatttgattcatgtagtcgacc 27520240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 52878472 - 52878334
Alignment:
Q  261 tgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttt 360  Q
    |||||||||| | |||||||| | |||||| || |||||| ||  ||| ||  |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||     
T  52878472 tgagtcaggtcataagaggtataggaagacttaggaaaattataagagtaattattataaaagatttagaggttaatgagttgaatccaactacgattta 52878373  T
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccga 399  Q
    ||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||||    
T  52878372 tgatagaactttatagtgtaatttgattcatgtaaccga 52878334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25715425 - 25715324
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  25715425 aatgagttgaaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25715326  T
Q  435 at 436  Q
    ||    
T  25715325 at 25715324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 34827462 - 34827179
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||   ||| |||||  ||||||   |||||  ||||||    | |||||| | | ||||| |    
T  34827462 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgatataagattagaaatgact--attatgtagagag----ttggggtagcgcatatagaa 34827369  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
      |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||||  | ||||||| ||||||| | ||| ||| |||| |||    
T  34827368 gtaaagatggtagaaaataggcttctttggtttggacatgtaaagagaagaccgatagatgctctagtaagaaaagtagattagatggaggagagtaagg 34827269  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagagg-tcaatgagttgaatccaaatatgatt 358  Q
    ||| || |  || | |||||||||  ||||  ||  ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  34827268 ttagaaaaaataaaggaagacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtttaatcagttgaatccaaatatgatt 34827179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 43423707 - 43423783
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  43423707 agagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagag 43423783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21769796 - 21769709
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| |  |||||| ||| |||||||||||||    
T  21769796 aaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgtat 21769709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 48431688 - 48431399
Alignment:
Q  152 ggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatc 251  Q
    |||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||   ||||||    | ||||  ||||| ||||    
T  48431688 ggggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatc 48431589  T
Q  252 aaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtc-------aatgagttga 344  Q
    | ||| |||  |||| | ||| |||||||||| ||||||| || ||||  ||  ||||||| ||||  ||||| |||||| |        |||||||||     
T  48431588 agatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgg 48431489  T
Q  345 atccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||| | |||||| ||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  48431488 atccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 48431399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 435
Target Start/End: Original strand, 28533676 - 28533750
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  28533676 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgta 28533750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 434
Target Start/End: Original strand, 8796406 - 8796491
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  8796406 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 8796491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 434
Target Start/End: Original strand, 19936617 - 19936742
Alignment:
Q  309 aaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaattta 408  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |   |||    
T  19936617 aaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactccgctta 19936716  T
Q  409 ataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     | |||||||||||  ||||||||||    
T  19936717 gtgggataagacttgattgttgttgt 19936742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 29577461 - 29577534
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  29577461 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29577534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941776
Alignment:
Q  345 atccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44941776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7762565 - 7762477
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgta 394  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  7762565 gagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatttatgta 7762477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 52739639 - 52739547
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgattt-ttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagcc 397  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  52739639 gagaaactattaggaaagatttttaggttaatgagttgaatccaaatataatttatggatagaacattatgacttaatttgattcatgtagcc 52739547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 434
Target Start/End: Original strand, 52832207 - 52832327
Alignment:
Q  314 attagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatagg 413  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||||  |||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||  ||  ||||||| ||||    
T  52832207 attagaaaagatttagaggttgataagttgaatacaaatattgtttcagatagaacattatgacgtaatttgatccatatagttgattcaatttagtagg 52832306  T
Q  414 ataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  52832307 ataagatttggttgttgttgt 52832327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 1661419 - 1661494
Alignment:
Q  141 gagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  1661419 gagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagag 1661494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444638
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || |||||||  ||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 34444638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 346 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290033
Alignment:
Q  346 tccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| | | | | ||||||| |||||||||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 1290033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3818984 - 3818890
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgac 400  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  3818984 gagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgac 3818890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 222
Target Start/End: Original strand, 4379927 - 4380083
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagaga--gagtg--ggggtaacacctat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||| ||||| | |||||||  |||||  |||||| || ||||    
T  4379927 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagagagagagtgagtgttggggtagcaactat 4380026  T
Q  166 agtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatc 222  Q
    |||| ||||| |||| |||| || | || | ||||||  |||||||||||| |||||    
T  4380027 agtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaagatc 4380083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 333 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568409
Alignment:
Q  333 tcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    ||||||||||| | | ||||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 40568412  T
Q  433 gta 435  Q
    |||    
T  40568411 gta 40568409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561843
Alignment:
Q  91 atgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaatagg 190  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| | || |||||||||||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccatta----gagagagagttggggtagcacctttagtagaaatgatgatagaaaatagg 52561855  T
Q  191 cttggatggttt 202  Q
    ||| | ||||||    
T  52561854 cttaggtggttt 52561843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 402
Target Start/End: Original strand, 29128937 - 29129034
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat-tcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||    
T  29128937 gagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgatcccatgtagccgaccc 29129034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 399
Target Start/End: Original strand, 29808042 - 29808103
Alignment:
Q  338 gagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccga 399  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29808042 gagttgaataaaaatatggtttttgataaaacactatggcgacatttgattcatgtagccga 29808103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877342
Alignment:
Q  362 gatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| | ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgtggttgta 38877342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 44751693 - 44751766
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  44751693 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44751766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072520
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgacc 27072520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 436
Target Start/End: Original strand, 42337748 - 42337840
Alignment:
Q  344 aatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    ||||||||| || | | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  42337748 aatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 42337840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17269062 - 17269015
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaattta 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17269062 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccattta 17269015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 17640138 - 17640067
Alignment:
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | | | |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  17640138 atagaacattatggcgtcgtttgattcatgttgtcaatccaacttagtgggataagacttagttgttattgt 17640067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36624012 - 36623941
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggc 377  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  36624012 gagaaactattagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggc 36623941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 436
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257854
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||||| ||| |||||||||||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgtat 50257854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 109076 - 109030
Alignment:
Q  351 atatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagcc 397  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  109076 atatgatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagcc 109030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 397
Target Start/End: Original strand, 5338896 - 5338958
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagcc 397  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5338896 aatgagttggatcgaaatgtgatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 5338958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 28511915 - 28511833
Alignment:
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  28511915 aaagacttggagattaatgagttggaccaaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaccc 28511833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 44905517 - 44905356
Alignment:
Q  272 aaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacat 371  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||| ||   |||||| || ||||| || ||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||     
T  44905517 aaaagaggtagatgaaaac-taaaaaaattataaaagaaactataagaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacac 44905419  T
Q  372 tatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| | ||||||   || | || ||||| |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  44905418 tatggcataatttgacctatttggctgaccctatttaataggataaggtttggttgttgttgt 44905356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 435
Target Start/End: Original strand, 50806864 - 50806950
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||| ||| ||||||||||||    
T  50806864 aaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgttgta 50806950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12930408 - 12930343
Alignment:
Q  337 tgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  12930408 tgagttggatccaaatatgatttatgatagaagattatgacgtaatttgatccgtgtagccaaccc 12930343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16142108 - 16142019
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||  |||||| |||| ||| |||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  16142108 gagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 132
Target Start/End: Original strand, 19936441 - 19936506
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacacc 132  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||| || ||||||||||    
T  19936441 gcggagatgagaatgttgtgttggatgagtggtaagactagatgggataggaataggaatgacacc 19936506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 402
Target Start/End: Original strand, 27704159 - 27704200
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27704159 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccc 27704200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 402
Target Start/End: Original strand, 28528560 - 28528605
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28528560 tttttgatagaccactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccc 28528605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 402
Target Start/End: Original strand, 38869091 - 38869132
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38869091 tgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccc 38869132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Original strand, 51584949 - 51585026
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  51584949 tttttgatagaacactatgacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 51585026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 343
Target Start/End: Original strand, 478762 - 478869
Alignment:
Q  236 gtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatc-attcgagaaaccattagaaaagacttagaggtc 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||||| |||| |||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||| ||||  ||||||||     
T  478762 gtaagaagagtagatcagatgaaagagagttaggtcaaaagagttagaggaagacct-acaaaatctataagagaaactattaggaaagttttagaggtt 478860  T
Q  335 aatgagttg 343  Q
    |||||||||    
T  478861 aatgagttg 478869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 401
Target Start/End: Original strand, 5113952 - 5113992
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5113952 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacc 5113992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 399
Target Start/End: Original strand, 6025788 - 6025852
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccga 399  Q
    ||||||||| ||  ||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6025788 aatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatgatggcgtcatttgatccatgtagccga 6025852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 19908143 - 19908067
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||| | ||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||    
T  19908143 ttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagccgaccc 19908067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 434
Target Start/End: Original strand, 41165500 - 41165564
Alignment:
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||| ||| ||| |||||||||||    
T  41165500 attatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 41165564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 51812513 - 51812589
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||||   || ||||| |||||||||||    
T  51812513 agagagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtgatttgggcatgtagagag 51812589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15437205 - 15437130
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| |  || | ||||||| ||| |||||||||    
T  15437205 tttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccaaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 15437130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31274613 - 31274578
Alignment:
Q  178 ggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtaga 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31274613 ggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaga 31274578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 37294181 - 37294134
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaattta 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  37294181 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccattta 37294134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 394
Target Start/End: Original strand, 39797212 - 39797243
Alignment:
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgta 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39797212 atagaacattatggcgtcatttgattcatgta 39797243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 374
Target Start/End: Original strand, 41611969 - 41612028
Alignment:
Q  315 ttagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattat 374  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  41611969 ttagaaaagatttagatgttaatgagttgaattcaaatatggtttatcatagaacattat 41612028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48861450 - 48861387
Alignment:
Q  359 tttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagactt 422  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||    
T  48861450 tttgatagagcattatgacgtcgtttgattcatgtcgccgaccccacttagtgggataagactt 48861387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4590615 - 4590533
Alignment:
Q  351 atatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||  || ||||||||||    
T  4590615 atatgatatgtgatagaacaatatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 4590533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Original strand, 26299288 - 26299350
Alignment:
Q  372 tatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||| ||||||    
T  26299288 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgctgttgt 26299350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 402
Target Start/End: Original strand, 40416359 - 40416621
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaa 239  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||| | |||||| | ||||||||||| ||| | ||||||    | ||||    
T  40416359 agagagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagattttgtagtaa 40416458  T
Q  240 gaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatga 339  Q
    | ||||||||||| ||| |||  |||||| | |  | ||  ||| |||||||||  ||||  ||  || |||| ||||  |||||  || || | |||||    
T  40416459 ggagagtagatcagatgcaggatagtcagatcaccaaagacagaagaagacctagaaaaactataagacaaactattaagaaagatctatagattaatga 40416558  T
Q  340 gttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||| | | ||||||||||    
T  40416559 gttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatgtgatccctttagccgaccc 40416621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 45510947 - 45510865
Alignment:
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||  || |||| |||| || ||||||||||||||    
T  45510947 aaagacttggaggctaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccc 45510865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 52160328 - 52160242
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||  ||||| | |||||| || | ||||||||||||    
T  52160328 aaatatgatatatgatagaatattatggtgacatttgatgcatatagccgacctcatttagtgggataaaacgtggttgttgttgta 52160242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2429702 - 2429661
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  2429702 tgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgaccc 2429661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 417
Target Start/End: Original strand, 2728853 - 2728894
Alignment:
Q  376 gcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataa 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  2728853 gcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttactaggataa 2728894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4318906 - 4318845
Alignment:
Q  373 atggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||| ||| ||| |||||||||||    
T  4318906 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 4318845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 402
Target Start/End: Original strand, 7083099 - 7083140
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7083099 tgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctgaccc 7083140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 433
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175426
Alignment:
Q  348 caaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||| |||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttggtgttg 22175426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Original strand, 26016642 - 26016719
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || | ||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  26016642 tttttggtagaacattgtggcgtcgtttgatacatgtagctgagcccacttagtggggtaagacttagttgttcttgt 26016719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31979791 - 31979742
Alignment:
Q  245 gtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaa 294  Q
    |||||||||||  |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31979791 gtagatcaaatagaggatagtcaggttacaagaggtagatgaagacctaa 31979742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 32112062 - 32111989
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || | ||| | ||| ||| ||| |||||||||||    
T  32112062 tgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgt 32111989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 35828661 - 35828560
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||  ||||||| |||  ||||||||||||||||   ||||||| |||||| |||||||   ||| | ||| ||||||| |||||||||||    
T  35828661 aatgagttggatggaaatatggtttacgatagaacattatggcaatatttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgggaaaagacttggttgttgttgt 35828562  T
Q  435 at 436  Q
    ||    
T  35828561 at 35828560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 37429972 - 37429915
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataag 418  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37429972 tgatagcacattgtggtgtaatttgatccatgtagccgaccccatttaatgggataag 37429915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 39123441 - 39123400
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  39123441 tgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccc 39123400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 39525974 - 39526047
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| | |||  || ||| |||||||||||    
T  39525974 tgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagctgaccctatttagtgggaccaggcttggttgttgttgt 39526047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 434
Target Start/End: Original strand, 39896760 - 39896845
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||| ||| | ||||| |||  ||||||||||    
T  39896760 aaatatggtttatgatataacattatggcgtaatttaattcatgtagtcgacctcattaaatggcataaggcttgattgttgttgt 39896845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52073753 - 52073680
Alignment:
Q  144 agagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaa-taggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52073753 agagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagag 52073680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2914191 - 2914123
Alignment:
Q  366 gaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  2914191 gaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2914123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3777328 - 3777260
Alignment:
Q  366 gaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||  ||| |||||||||||    
T  3777328 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataatgcttggttgttgttgt 3777260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Original strand, 7921835 - 7921899
Alignment:
Q  152 ggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  7921835 ggggtaaaacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttatgtggtttggacatgtagagag 7921899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35828844 - 35828768
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||    
T  35828844 agagagagagtttgagtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagagag 35828768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36340097 - 36340021
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||| || | |||||| |||||| ||||||    
T  36340097 agagagagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagag 36340021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 52442861 - 52442813
Alignment:
Q  73 atgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggatta 121  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||| |||||    
T  52442861 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaagataagatta 52442813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 101)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 67 - 402
Target Start/End: Original strand, 38429803 - 38430134
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  38429803 gcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggcagcacctata 38429898  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  38429899 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 38429998  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38429999 aggttaaaagaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 38430098  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38430099 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccc 38430134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 41197591 - 41197227
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  41197591 gcggagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagatagagtgagggtagcacctata 41197496  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  41197495 atagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 41197396  T
Q  267 aggtt-aaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgata 365  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||    
T  41197395 aggttaaaaaaaggtagagaaagacctaagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgata 41197296  T
Q  366 gaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || || ||||||| ||| |||||||||||    
T  41197295 gaacattatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttgatgggataaggcttggttgttgttgt 41197227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 41763404 - 41763043
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||    
T  41763404 gcggagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggg-taacacctata 41763310  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  41763309 gtagaaaagttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtc 41763210  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41763209 aggttaaaaaaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaatatgttttttgatag 41763111  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  41763110 aacacccgggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41763043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 67 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11992469 - 11992107
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||      ||||||||| ||||| ||||||||    
T  11992469 gcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccatta------gagagagtgagggtagcacctata 11992376  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  11992375 gtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtc 11992276  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11992275 gggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatag 11992176  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||| | | ||||| ||| ||||||||||||    
T  11992175 aacattatggcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgta 11992107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 73 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 38453046 - 38452682
Alignment:
Q  73 atgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaa 172  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  38453046 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctatagtagaa 38452947  T
Q  173 aagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggtta 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||    
T  38452946 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaaga-tagatcaaatggaggaaagtcaagtta 38452848  T
Q  273 aaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacatt 372  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||| |||| |    
T  38452847 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacact 38452748  T
Q  373 atggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtataa 438  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  38452747 atggtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtataa 38452682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 69 - 434
Target Start/End: Original strand, 12734622 - 12734982
Alignment:
Q  69 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12734622 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccatt------agagagagtgggggtagcacctatagt 12734715  T
Q  169 aaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcag 268  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12734716 agaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcag 12734815  T
Q  269 gttaaaaga-ggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgataga 367  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  12734816 gttaaaagagggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgataga 12734915  T
Q  368 acattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  12734916 acactatggtgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12734982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 3865994 - 3866354
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3865994 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatt----ggagagagagtgggggtagcacctatagta 3866089  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||      
T  3866090 aaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaa 3866189  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  3866190 ttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 3866289  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  3866290 actatgacatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 3866354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 70 - 432
Target Start/End: Original strand, 8180702 - 8181060
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8180702 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 8180797  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||| | || |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  8180798 gaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 8180897  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    ||||||| |||||| |||||| || |||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  8180898 ttaaaagcggtagaggaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 8180997  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    | ||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  8180998 actatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgtt 8181060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 68 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 45367986 - 45367625
Alignment:
Q  68 cggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatag 167  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  45367986 cggagatgatgatgttgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt----agagagagtg-gggggtagcacctatag 45367892  T
Q  168 taaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtca 267  Q
    || ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||     
T  45367891 tagaaaagttggtagaaaataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtct 45367792  T
Q  268 ggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgataga 367  Q
     ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45367791 agttaaaagaggtagaggaagactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgataga 45367692  T
Q  368 acattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| | |||||| ||||  ||||||||||    
T  45367691 acactatgacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataaaacttgtttgttgttgt 45367625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 4807514 - 4807877
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4807514 gagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagagagagagagtgggggtagcacctatagta 4807613  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| | ||| ||||||| |||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4807614 gaaaagttggtagaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaag 4807712  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||  | | |  ||||||||    
T  4807713 ttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgatagaac 4807812  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  4807813 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 4807877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 36183373 - 36183733
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  36183373 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaatta----gagagagagtaggggtagcacctatagta 36183468  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||  ||| | |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |    
T  36183469 gaaaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaag 36183568  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  36183569 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaac 36183668  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  36183669 actatggtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 36183733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 70 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 3244011 - 3243654
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3244011 gagataaggatgttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccatt------agagagagtgggggtagcacctatagta 3243918  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |    
T  3243917 aaaaagttgatggaaaataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaag 3243818  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||    
T  3243817 ttaaaagaggcagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaac 3243718  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  3243717 actatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 3243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 123 - 434
Target Start/End: Original strand, 25834654 - 25834960
Alignment:
Q  123 gaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatc 222  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25834654 gaatgacaccattaga--gagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 25834751  T
Q  223 cgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaa 322  Q
     || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||     
T  25834752 tgtggatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggag--gagttaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa-ctttaaagaaaccattagaaag 25834848  T
Q  323 gacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagactt 422  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| |||    
T  25834849 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 25834948  T
Q  423 agttgttgttgt 434  Q
     |||||||||||    
T  25834949 ggttgttgttgt 25834960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 68 - 402
Target Start/End: Original strand, 23997537 - 23997852
Alignment:
Q  68 cggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatag 167  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  23997537 cggagatgaagatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccatta----gagatagagtgggtgtagcacctatag 23997632  T
Q  168 taaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtca 267  Q
       |||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23997633 ---aaaatttggtagaaaatagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtca 23997729  T
Q  268 ggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgataga 367  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||            |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  23997730 ggttaaaagaggtggaagaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaa 23997817  T
Q  368 acattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23997818 acactatggcgttatttgattcatgtatccgaccc 23997852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 140 - 434
Target Start/End: Original strand, 2610576 - 2610870
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaa 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| | | ||||    
T  2610576 agagagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaa 2610675  T
Q  240 gaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatga 339  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2610676 gaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatga 2610775  T
Q  340 gttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| |||||||| || | | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  2610776 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 2610870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 89 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18424716 - 18424377
Alignment:
Q  89 ggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaata 188  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||      |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18424716 ggatgagtggtaagactagatatgatatgattaagaatgataccatt------agagagagtgggtgtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaata 18424623  T
Q  189 ggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaag 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||   ||||||||| |||||||| || | | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18424622 ggcttagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaagattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggtagaggaag 18424523  T
Q  289 acctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgatt 388  Q
    || || |||||  ||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||  |||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||     
T  18424522 acataggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtcatttgatc 18424423  T
Q  389 catgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||||| ||| ||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  18424422 catgta-ccgtccccacttagtgggataagacttggttgttgttgta 18424377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 209 - 395
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029824
Alignment:
Q  209 gtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgag 308  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  309 aaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtag 39029824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 173 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451648
Alignment:
Q  173 aagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggtta 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  273 aaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacatt 372  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||| |  | | |||||||||| |    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  373 atggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||| ||| ||| |||||||||||    
T  451709 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgt 451648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 195 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 7326399 - 7326160
Alignment:
Q  195 gatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaa 294  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||     
T  7326399 gatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacatag 7326300  T
Q  295 gaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgta 394  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7326299 gaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 7326200  T
Q  395 gccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| |||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  7326199 gccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 7326160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 223 - 434
Target Start/End: Original strand, 28508749 - 28508960
Alignment:
Q  223 cgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaa 322  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||     
T  28508749 cgtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaag 28508848  T
Q  323 gacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagactt 422  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| |||    
T  28508849 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 28508948  T
Q  423 agttgttgttgt 434  Q
     |||||||||||    
T  28508949 ggttgttgttgt 28508960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 158 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24583908 - 24583631
Alignment:
Q  158 acacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatga 257  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||     
T  24583908 acacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgg 24583809  T
Q  258 aggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatga- 356  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||  || ||||  | | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  24583808 aggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat-caaatttgag 24583710  T
Q  357 -tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     ||| |||||| ||| |||| ||| |||| ||  |||| |||||||| | |||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  24583709 ttttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataaggcttggttgttgttgt 24583631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 262 - 435
Target Start/End: Original strand, 31959631 - 31959804
Alignment:
Q  262 gagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgattttt 361  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  31959631 gagtcaggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttat 31959730  T
Q  362 gatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31959731 gatagaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgta 31959804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6238110 - 6237811
Alignment:
Q  74 tgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaa 173  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |     | ||||||||||   || |||||| |  ||| |    
T  6238110 tgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgacaccaat-----gggagagagtggacatagcacctaaaaaaaaga 6238016  T
Q  174 --agttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggtt 271  Q
      ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | | | ||||||||||||||||| ||| ||| ||| || ||     
T  6238015 taagttggtagaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtc 6237916  T
Q  272 aaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacat 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||  |   || ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||  ||| ||||||||||     
T  6237915 aaaagaggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacac 6237816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16097353 - 16097204
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||   |||| |||||  ||||||||| ||| | ||||  |||||||||||| ||||||||    
T  16097353 gcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagagagttagagtgggggtagcacctata 16097254  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16097253 atagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagag 16097204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 434
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643230
Alignment:
Q  269 gttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||    
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  369 cattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    || |||| | |||||| || |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  35643165 cactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 35643230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 434
Target Start/End: Original strand, 12141539 - 12141826
Alignment:
Q  147 gagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagt 246  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| | |||||||| || ||||| || ||| | |||||| |  | ||||| |||||    
T  12141539 gagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagt 12141638  T
Q  247 agatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatc-attcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaa 345  Q
    |||||| ||  |||  |||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||| | ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| |    
T  12141639 agatcagattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagaccta-gaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttgga 12141737  T
Q  346 tccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||| ||||| | || |||| |||  ||||||||||    
T  12141738 tccaaatatggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgttgt 12141826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 310 - 434
Target Start/End: Original strand, 30306190 - 30306314
Alignment:
Q  310 aaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaa 409  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||     
T  30306190 aaccattagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 30306289  T
Q  410 taggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||    
T  30306290 tgggataaggcttggttgttgttgt 30306314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 332 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635323
Alignment:
Q  332 gtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3635326  T
Q  432 tgt 434  Q
    |||    
T  3635325 tgt 3635323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 326 - 434
Target Start/End: Original strand, 227363 - 227471
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||    
T  227363 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggt 227462  T
Q  426 tgttgttgt 434  Q
    |||||||||    
T  227463 tgttgttgt 227471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 320 - 434
Target Start/End: Original strand, 9496034 - 9496148
Alignment:
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataaga 419  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||| |||     
T  9496034 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggacaagg 9496133  T
Q  420 cttagttgttgttgt 434  Q
    ||| |||||||||||    
T  9496134 cttggttgttgttgt 9496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43238379 - 43238296
Alignment:
Q  148 agtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgcc 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||    
T  43238379 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaaga-ccgtagatgcc 43238296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 330 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 43573234 - 43573130
Alignment:
Q  330 aggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgtt 429  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||    
T  43573234 aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 43573135  T
Q  430 gttgt 434  Q
    |||||    
T  43573134 gttgt 43573130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543105
Alignment:
Q  272 aaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacat 371  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||  ||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  372 tatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatctatgtagccgaccc 45543105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 9996754 - 9996658
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  9996754 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccc 9996658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12882153 - 12882045
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||  | ||| | ||||||| ||| ||    
T  12882153 ttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacctcacttagtgggataaggcttggt 12882054  T
Q  426 tgttgttgt 434  Q
    |||||||||    
T  12882053 tgttgttgt 12882045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43752241 - 43752165
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  43752241 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagag 43752165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 347 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13443995 - 13443908
Alignment:
Q  347 ccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||    
T  13443995 ccaaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttagttattgttgt 13443908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 38434870 - 38435234
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||||||| | |||||  || | |||||  ||||||| |||||    |||||||| | |||||| ||||||||    
T  38434870 gcggagatgaggatgttgcattggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacatta----gagagagaattggggtagcacctata 38434965  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggc-ttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagt 265  Q
    ||| ||||| |||| |||| ||| | |||| |||||||| |||||| |||| |||   ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| |||  |||    
T  38434966 gtagaaaagatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagt 38435065  T
Q  266 caggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgata 365  Q
    ||| | |  ||||| ||| | |||||||  ||||  |   ||||||| ||||  |||||  ||||| | |||| |||| ||| |||| || ||| ||||     
T  38435066 cagatcactagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttatgatt 38435165  T
Q  366 gaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | ||| | | ||||| ||| |||||||||||    
T  38435166 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 38435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9556729 - 9556587
Alignment:
Q  69 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagt 168  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| ||||    ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  9556729 ggagttgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacatt----agagagaaagttggggtaacacttatagt 9556634  T
Q  169 aaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    | ||||  |||| |||||||||||| | |||||| | |||||||||||    
T  9556633 agaaaa-atggtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagag 9556587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 375
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743752
Alignment:
Q  309 aaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatg 375  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatg 30743752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531600
Alignment:
Q  346 tccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9531600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 149
Target Start/End: Original strand, 2610450 - 2610529
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagag 149  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  2610450 gagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagagagagagag 2610529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12475000 - 12474925
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  12475000 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 12474925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24583966 - 24583904
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacacc 132  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  24583966 gagatgaagatgttgtgcgggatgagtggtaagactaaacatgatatgattaagaatgacacc 24583904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 19337007 - 19336930
Alignment:
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagcc 397  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19337007 aaagatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 19336930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 399
Target Start/End: Original strand, 41545559 - 41545652
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccga 399  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| | | |||||||| || |||||||    
T  41545559 gagaaaccattataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaacactatgacttaatttgatttatttagccga 41545652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8197640 - 8197541
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||  ||| |||||||||||    
T  8197640 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8197541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8202400 - 8202301
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||  ||| |||||||||||    
T  8202400 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8202301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 433
Target Start/End: Original strand, 18959065 - 18959192
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||| || || |||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| |     
T  18959065 gagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatcaaaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccac 18959164  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||| | ||||||| ||| ||| ||||||    
T  18959165 ttagtgggataaggcttggttattgttg 18959192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 309 - 434
Target Start/End: Original strand, 11412865 - 11412992
Alignment:
Q  309 aaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag---aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||   |||||||||| || ||||||| ||||||||||| |  |     
T  11412865 aaactattaggaaaga-ttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcac 11412963  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11412964 ttagtaggataaggcttggttgttgttgt 11412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 432
Target Start/End: Original strand, 13149486 - 13149612
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | | ||||||| ||| ||||||| |  |     
T  13149486 gagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacataatttgatccatatagccgatctcaa 13149585  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||    
T  13149586 ttaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670750
Alignment:
Q  364 tagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 17670750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 38328489 - 38328370
Alignment:
Q  313 cattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatag 412  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||   | |||||||| || |   |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| | |    
T  38328489 cattagaaaggatttagaggtcaatgaa--ggatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38328392  T
Q  413 gataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||| |||||||||||    
T  38328391 gataaggcttggttgttgttgt 38328370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4598921 - 4598783
Alignment:
Q  73 atgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaa 172  Q
    |||| ||||||| | |||||| ||||||||| |||||  ||||| ||| | ||||||  ||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||||  |    
T  4598921 atgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattcaaaatgacgacattaga--gagagagagttggggtagcacctatagtagta 4598824  T
Q  173 aagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtaga 213  Q
    ||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  4598823 aagatggtagaaactagactttggtggtttggacatataga 4598783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12489879 - 12489802
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  12489879 tttttgatataacactttggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12489802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Original strand, 15025699 - 15025776
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  15025699 tttttgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15025776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35755344 - 35755247
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  35755344 aatgggttggatccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgtt 35755247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 44437798 - 44437721
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  44437798 tttttgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44437721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 9394734 - 9394630
Alignment:
Q  330 aggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgtt 429  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||||| | |||| || ||||||||| |||| | ||  ||||||||||||| ||||||    
T  9394734 aggttaatgagttggatccgaatatggtttataatagagcattatggcttaattttatccatgtagccaaccccacttggtaggataagactttgttgtt 9394635  T
Q  430 gttgt 434  Q
    |||||    
T  9394634 gttgt 9394630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12520146 - 12520062
Alignment:
Q  350 aatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  12520146 aatatggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12520062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709202
Alignment:
Q  337 tgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||| | ||| ||||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttg 39709202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Original strand, 41545335 - 41545448
Alignment:
Q  77 ggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagt-aaaaaag 175  Q
    ||||||| || |||||||  |||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||    || ||||||| | |||||||||||||| | |||||||    
T  41545335 ggatgttatgttggatgaacggtatgattagatgaggtaggattaagaatgacaccatt----agggagagagcgagggtaacacctataataaaaaaag 41545430  T
Q  176 ttggtagaaaataggctt 193  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  41545431 ttggtagaaaatatgctt 41545448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1400578 - 1400495
Alignment:
Q  313 cattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagc 396  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||||| |||||||  |||||||    
T  1400578 cattaggaaagatttagaagttaatgagttgaatctaaatatgatttacgataaaatattatggcgtaatttgatcaatgtagc 1400495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 357 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19334229 - 19334186
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgac 400  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19334229 tttttgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgac 19334186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28960294 - 28960211
Alignment:
Q  351 atatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  28960294 atatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgtagtcgactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28960211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 190
Target Start/End: Original strand, 227310 - 227360
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaatagg 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  227310 agagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaatagg 227360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 435
Target Start/End: Original strand, 17429259 - 17429333
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||| ||| ||||||||||||    
T  17429259 tgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgta 17429333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 3481363 - 3481436
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||| | ||| ||| ||| |||||||||||    
T  3481363 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgt 3481436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 358 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4598638 - 4598597
Alignment:
Q  358 ttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccga 399  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4598638 ttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtaaccga 4598597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5759072 - 5758995
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  5759072 tttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcaggtagctgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 5758995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Original strand, 6219126 - 6219215
Alignment:
Q  313 cattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||| ||||| |||||| | | ||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  6219126 cattaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccc 6219215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12470974 - 12470897
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| || ||||||||    
T  12470974 tttttgatatatcactatggcgtcgtttgcttcatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggtggttgttgt 12470897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 400
Target Start/End: Original strand, 26670923 - 26671016
Alignment:
Q  307 agaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgac 400  Q
    |||||| ||||  ||||| |||||| | ||||||||| | | ||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||| ||||||||||||    
T  26670923 agaaactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccaaaatatgatttatgatagaatataatggtgtaatttgatccatgtagccgac 26671016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 430
Target Start/End: Original strand, 33504433 - 33504502
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttg 430  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||    
T  33504433 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Original strand, 42543440 - 42543517
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  42543440 tttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42543517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 42549910 - 42549837
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||  ||| |||||||||||    
T  42549910 tgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 42549837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 434
Target Start/End: Original strand, 19863432 - 19863516
Alignment:
Q  350 aatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| | ||| | ||||||  ||| |||||||||||    
T  19863432 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 19863516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 434
Target Start/End: Original strand, 19867764 - 19867848
Alignment:
Q  350 aatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| | ||| | ||||||  ||| |||||||||||    
T  19867764 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 19867848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 434
Target Start/End: Original strand, 19872665 - 19872749
Alignment:
Q  350 aatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| | ||| | ||||||  ||| |||||||||||    
T  19872665 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 19872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 41330121 - 41330193
Alignment:
Q  144 agagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41330121 agagagttgaggtaacacctttagtagaaaagatgatcaaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagag 41330193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 451982 - 451931
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggatta 121  Q
    |||||||| |||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  451982 gagatgagtatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgataggatta 451931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3720510 - 3720447
Alignment:
Q  339 agttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  3720510 agttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccc 3720447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 221
Target Start/End: Original strand, 6218961 - 6219036
Alignment:
Q  146 agagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagat 221  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| ||||| | || || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  6218961 agagttggggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagaggagat 6219036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 9556468 - 9556369
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| | | ||| | |||| || ||| |||||||||||    
T  9556468 aatgagttggatcaagatatggtttatgatagaacattagggtgtaatttgatacatgtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgt 9556369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 215
Target Start/End: Original strand, 11412709 - 11412784
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagaga 215  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||| |||||||||||| | | |||||| ||| ||||||    
T  11412709 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagaga 11412784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 32541861 - 32541794
Alignment:
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  32541861 aacactatggggtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataagataagaattgattgttgttgt 32541794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 37481911 - 37481649
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaa 239  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||| |||  ||||||| | |||||||  ||||||||||| |||   ||  ||    | || |    
T  37481911 agagagagagttggggtagttcctatagtaaaaaagatggttgaacctaggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtgaattttgtagtta 37481812  T
Q  240 gaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatc-attcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatg 338  Q
    | ||||||||||| ||| ||| |||| || | |   |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||  |||||  ||| | | ||||    
T  37481811 ggagagtagatcagatggaggggagttagatcactggaggtagatgaagacc-aagaaaaactattagagaaactattaagaaagatctagcgataaatg 37481713  T
Q  339 agttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  37481712 agttggataaaaatatggtatttgatagaaaattatggtgtcttttgattcatctagtcgaccc 37481649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 434
Target Start/End: Original strand, 43832309 - 43832380
Alignment:
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  43832309 atagaacattatgacggcatttgatccatgtagctgacccaacttagtttgataaggcttggttgttgttgt 43832380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 887139 - 887097
Alignment:
Q  360 ttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  887139 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccc 887097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 361 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 9647684 - 9647610
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||| | |||| || |||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  9647684 tgatggaacattatggcatcgtttgattcatgcaaccgatcccatttaatgagataaggcttggttgttgttgta 9647610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626354
Alignment:
Q  364 tagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||  | ||||||| ||| |||||||||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccgaaccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgt 17626354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 431
Target Start/End: Original strand, 29159290 - 29159372
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||||  | |||||   |||||||||| |||||||||    
T  29159290 aaatatgatatttgataaaatattatggcgtcgtttgatccatgtatccgattctatttagcgggataagactcagttgttgt 29159372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 42149745 - 42149703
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcat 391  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42149745 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcat 42149703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 174
Target Start/End: Original strand, 43832071 - 43832121
Alignment:
Q  124 aatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaa 174  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43832071 aatgacaacattagagagagagagagttggggtatcacctatagtaaaaaa 43832121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8560851 - 8560806
Alignment:
Q  389 catgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  8560851 catgtagccgacccaacttagtgggataagacttggttgttgttgt 8560806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Original strand, 15015150 - 15015227
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| |||| ||||||    
T  15015150 tttttgatagaacactctggtttcgtttgattcatgtagccgacgcaacttagtgggataaggcttggttgctgttgt 15015227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 434
Target Start/End: Original strand, 15222462 - 15222527
Alignment:
Q  369 cattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  15222462 cattatgtcttcatttgatccatgtagccaaccccacctagtaggataagacttggttgttgttgt 15222527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18790195 - 18790106
Alignment:
Q  345 atccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||  ||| || ||||| |||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||    
T  18790195 atccaaatatgatttatgatataccatcatgtcgtactttcatccatgtcgccgaccccatttagtgggagaaggcttagttgttgttgt 18790106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 435
Target Start/End: Original strand, 32443851 - 32443920
Alignment:
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaat-aggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | | ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  32443851 aacattatggcataatttgatccatgtagccgactccacttagtggggataagacttagttgttgttgta 32443920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 394 - 438
Target Start/End: Original strand, 19629313 - 19629357
Alignment:
Q  394 agccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtataa 438  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19629313 agccgacccaatttagtgggataagactttgttgttattgtataa 19629357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Original strand, 31254471 - 31254558
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagactta 423  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||    |||| | ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  31254471 aatgagttgaatagaaatatgatttatgacagaacattatggcacagtttggtacatgtagtcgacccaacttagt-ggataagactta 31254558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 93)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 67 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 42854367 - 42854020
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  42854367 gcggagatgacgatgttgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccat----cagagagagagtgggggtaacacctata 42854272  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    | | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  42854271 gcagagaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 42854172  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  42854171 aggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatat 42854072  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataag 418  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  42854071 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataag 42854020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 36545069 - 36545431
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36545069 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattaga--gagagagagtgggggtaacacctatagta 36545166  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  36545167 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaag 36545266  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  36545267 ttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 36545366  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  36545367 actatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36545431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 40813244 - 40813606
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40813244 gagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattaga--gagagagagtgggggtagcacctatagta 40813341  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  40813342 gaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 40813441  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  40813442 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttggtgtgtgatagaac 40813541  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  40813542 actatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgttgt 40813606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 36565601 - 36565241
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36565601 gagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 36565506  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |    
T  36565505 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaag 36565406  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  36565405 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 36565306  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||  |||||||||||    
T  36565305 actatggcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 36565241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 71 - 402
Target Start/End: Original strand, 2796478 - 2796803
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagatta--gacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagt 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2796478 agatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcgcctatagt 2796573  T
Q  169 aaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcag 268  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||     
T  2796574 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga----ctgtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcat 2796669  T
Q  269 gttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||    
T  2796670 gttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgatagaa 2796769  T
Q  369 cattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2796770 cagtatggcgtaatttgattcatgtagacgaccc 2796803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 70 - 386
Target Start/End: Original strand, 39946779 - 39947091
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||    
T  39946779 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattata----gaaagagtgggggtagcacctatagta 39946874  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |    
T  39946875 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaag 39946974  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    ||| |||||||||| || ||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  39946975 ttagaagaggtagaggacgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaac 39947074  T
Q  370 attatggcgtcatttga 386  Q
      |||||||||||||||    
T  39947075 gctatggcgtcatttga 39947091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 154 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491141
Alignment:
Q  154 ggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaa 253  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  254 atgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaata 353  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||     
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  354 tgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    || | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 12491141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 114 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11524040 - 11523723
Alignment:
Q  114 taggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttg-gatggtttggacatgtag 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||| |||||||    
T  11524040 taggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtag 11523945  T
Q  213 agagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaac 312  Q
    |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||    
T  11523944 agagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac 11523845  T
Q  313 cattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatag 412  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |    
T  11523844 cattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 11523745  T
Q  413 gataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||| |||||||||||    
T  11523744 gataaggcttggttgttgttgt 11523723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 70 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 36395310 - 36394949
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36395310 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 36395215  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttg-gatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcag 268  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  |||||     
T  36395214 gaaaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtcaa 36395115  T
Q  269 gttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| || | | ||||||||    
T  36395114 gttaaaagaggtataggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatttggtgtatgatagaa 36395015  T
Q  369 cattatggcgtca-tttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    || ||| | | || |||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  36395014 cactattgtggcattttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttg 36394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 18125094 - 18125453
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||    
T  18125094 gcggagatgagcatgttgcgctggatgagtgacaagacgagacatgataggattagaaatgacaccatt------agagagagtgggggtagcacctata 18125187  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  18125188 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtc 18125287  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
     |||| ||||||||||| | |||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18125288 gggtt-aaagaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaaaagtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatag 18125386  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    || | ||||| || |||||||  |||||| | |||| | ||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  18125387 aatactatggtgt-atttgatcaatgtagtcaacccgacttagtgggataaaacttggttgttgttgt 18125453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 8932692 - 8932953
Alignment:
Q  142 agagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgt-agatgccattgtaag 240  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||    
T  8932692 agagagagtgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatccgttaaatgccattgtaag 8932791  T
Q  241 aagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgag 340  Q
    ||||||| |||||||| | | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  8932792 aagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttaaaggttaatgag 8932891  T
Q  341 ttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||| ||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8932892 ttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccc 8932953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 226 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469727
Alignment:
Q  226 agatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagac 325  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| | ||||||| ||| ||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataaggcttggt 42469736  T
Q  426 tgttgttgt 434  Q
    |||||||||    
T  42469735 tgttgttgt 42469727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 183 - 434
Target Start/End: Original strand, 21121177 - 21121427
Alignment:
Q  183 aaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtag 282  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||    
T  21121177 aaaataggtttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtag 21121276  T
Q  283 atgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcat 382  Q
    | | ||||||||||||   ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||| ||    
T  21121277 agggagacctaagaaatctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 21121376  T
Q  383 ttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | ||| ||| ||| |||||||||||    
T  21121377 ttga-tcatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 21121427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 37077684 - 37078031
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||| |                   
T  37077684 gcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccattcggaagagagtgaggg--------------- 37077768  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
     || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  37077769 -tagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 37077865  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
     ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||   |    |||||    
T  37077866 gggtcaaaataggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatactttggaagatag 37077965  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||   || ||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  37077966 aaca--ctgacgtaatttgatccatgcagccgaccccacttaatgggataaaacttggttgttgttgt 37078031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18752236 - 18751996
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||    
T  18752236 gcggagatgagaatgttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccatt------agagagagtgggggtagcacctata 18752143  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||||| |    |||     
T  18752142 gtagaaaagttggtagaaaata-gcttagatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgccgttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatagtt 18752044  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaacca 314  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| | |||||||    
T  18752043 agattaaaagaggtagaggaatacctaaaaaaaccattagcgaaacca 18751996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 279 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 14742234 - 14742082
Alignment:
Q  279 gtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcg 378  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||    
T  14742234 gtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaat---atttttgatagaacactatggcg 14742138  T
Q  379 tcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  14742137 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 14742082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 210 - 402
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026030
Alignment:
Q  210 tagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgaga 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||            |    
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaaga------------a 12025934  T
Q  310 aaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattat---ggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  12025935 aaccattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccc 12026030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 172 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904939
Alignment:
Q  172 aaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggtt 271  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| | |  | || ||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  272 aaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacat 371  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||  ||| | ||| ||||     
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  372 tatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatccatatagtcgaccc 26904939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 435
Target Start/End: Original strand, 45419158 - 45419518
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| ||||   |||| ||||| ||||||||||||||      |||||| | |||||| ||||||||    
T  45419158 gcggagatgaagatgttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccatta------gagagaattggggtagcacctata 45419251  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  ||| | ||||| || |  ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  45419252 gtagaaaagatggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggcta--gtatgaagagtagatcagatggaggagagtc 45419349  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    || |   |||||||||| |||||||||  ||||  ||  ||||||| ||||| ||||  ||| |    ||||||||  |||||||| || ||| ||||||    
T  45419350 agatctgaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatag 45419449  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  45419450 aacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 45419518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8879803 - 8879446
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||| | |||  |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||| |||||| | ||||||||    
T  8879803 gcggagatgagaatgttgcacttgataagtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaatta----gagagagaatgggggaagcacctata 8879708  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||| |||    |||| | ||||||||||| ||||| ||| ||| | |||    
T  8879707 gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagagagaagacccg----tgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagggtc 8879612  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
     |||  |||||| | || | |||| || |||||  ||  |||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||     
T  8879611 gggtccaaagagcttgagggagacgtaggaaaactataagagaaaccattaaaaatgatttagaagtcaataagttgaatccaaatatggtttatgatat 8879512  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||   || ||| |||| || |||||||||||| | | ||| ||||||||  ||| |||||||||||    
T  8879511 aaca--ctgacgtaatttaatccatgtagccgactccacttattaggataaagcttggttgttgttgt 8879446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 253 - 387
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027765
Alignment:
Q  253 aatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaat 352  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||  || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  353 atgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    ||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgat 2027765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 313 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15215533 - 15215412
Alignment:
Q  313 cattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatag 412  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  15215533 cattagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtag 15215434  T
Q  413 gataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||| |||||||||||    
T  15215433 gataaggcttggttgttgttgt 15215412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 306 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 25473531 - 25473403
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| || | | |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  25473531 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 25473432  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  25473431 ttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25473403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 435
Target Start/End: Original strand, 44529399 - 44529508
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||    
T  44529399 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggt 44529498  T
Q  426 tgttgttgta 435  Q
    ||||||||||    
T  44529499 tgttgttgta 44529508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15215634 - 15215552
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagag 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  15215634 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagagagagagag 15215552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 326 - 435
Target Start/End: Original strand, 29520823 - 29520932
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||||  ||| ||    
T  29520823 ttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcccaccccatttagtgggataatgcttggt 29520922  T
Q  426 tgttgttgta 435  Q
    ||||||||||    
T  29520923 tgttgttgta 29520932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 44047640 - 44047532
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| | ||||||| ||| ||    
T  44047640 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggt 44047541  T
Q  426 tgttgttgt 434  Q
    |||||||||    
T  44047540 tgttgttgt 44047532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 434
Target Start/End: Original strand, 490519 - 490617
Alignment:
Q  336 atgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| |||  ||||||||||    
T  490519 atgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgt 490617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 306 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 35914729 - 35914599
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  || | ||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |     
T  35914729 gagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 35914630  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    ||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  35914629 ttagtgagataagacttggttgttgttgtat 35914599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6510784 - 6510614
Alignment:
Q  72 gatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaa 171  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||   |||| |||||  ||||||||||||   ||||||||||| |    || |||||||| || |    
T  6510784 gatgatgatgttgtgttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccattg--aagagagagagcg----tagcacctataataga 6510691  T
Q  172 aaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtag 248  Q
    ||||||||||||||| |   || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  6510690 aaagttggtagaaaacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaagagtag 6510614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 43904902 - 43904698
Alignment:
Q  197 tggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaaga 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||   | ||||||||| ||||||| ||| |||  |||||  ||| |||||||| | |||||||||  |    
T  43904902 tggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatcagatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaa 43904803  T
Q  297 aaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagc 396  Q
    | |  ||  |||||||  |||  | ||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43904802 atactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagc 43904703  T
Q  397 cgacc 401  Q
    |||||    
T  43904702 cgacc 43904698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12492199 - 12492136
Alignment:
Q  73 atgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccatta 136  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12492199 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccatta 12492136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30113558 - 30113416
Alignment:
Q  69 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagt 168  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||  ||||    |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30113558 ggagatgagaatgttgtgctagatgtttgttaagaatagatatgataagattatgaatgacattatta----gagagagagtcggggtaacacatatagt 30113463  T
Q  169 aaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagaga 215  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||   |||||||| ||| ||||||    
T  30113462 agaaaagatggtagaaaataggtttaattggtttgggcatatagaga 30113416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 32569783 - 32569710
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  32569783 tgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataagacttggttgttgttgt 32569710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 402
Target Start/End: Original strand, 13589601 - 13589729
Alignment:
Q  274 aagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacatta 373  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||  ||  ||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||    
T  13589601 aagaggtagatgaagacttagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaagattaatgagttgaatcaaaatatgattttaaatagaacaata 13589700  T
Q  374 tggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||  |||||||  |||||||| ||||    
T  13589701 tggcgcaatttgatctatgtagccaaccc 13589729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 45041443 - 45041320
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |     
T  45041443 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 45041345  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttg 430  Q
    ||| | ||||||| ||| |||||||    
T  45041344 ttagtgggataaggcttggttgttg 45041320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 402
Target Start/End: Original strand, 2216411 - 2216536
Alignment:
Q  275 agaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattat 374  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| |||  ||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  2216411 agaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactatta-agaagatttagagatcaatgagttggatcctaatatg-tttatgatagaacattat 2216508  T
Q  375 ggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
     | || ||||||| ||||||||||||||    
T  2216509 agtgtaatttgatccatgtagccgaccc 2216536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 216
Target Start/End: Original strand, 32043530 - 32043654
Alignment:
Q  88 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaat 187  Q
    |||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||  ||||||| |||||    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  32043530 tggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacatta----gagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtagaaact 32043625  T
Q  188 aggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    || ||| | |||||||| |||||||||||    
T  32043626 agactttggtggtttggccatgtagagag 32043654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 434
Target Start/End: Original strand, 42584407 - 42584640
Alignment:
Q  188 aggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaa 287  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| | | | |||||||   | ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||    
T  42584407 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatgaaggtttgtcagatcaaaagaggtagataaa 42584506  T
Q  288 gacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    ||||||            || |||| || || |||||  || |||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||     
T  42584507 gaccta------------gaaaaactataaggaaagatctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttga- 42584593  T
Q  388 tcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    || |||||||||||| | ||| | |||||||||||  ||||||||||    
T  42584594 tcttgtagccgaccccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 42584640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 362 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928587
Alignment:
Q  362 gatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 1928587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 402
Target Start/End: Original strand, 25300253 - 25300349
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||| | | |||||||  ||||||| |||||    
T  25300253 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctgaccc 25300349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 434
Target Start/End: Original strand, 30559816 - 30559980
Alignment:
Q  275 agaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattat 374  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||  ||  ||||||| || || ||||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  30559816 agagatagatgaagacttaaaaaaactataagagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattat 30559915  T
Q  375 ggcgtcatttgat-----tcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | ||| |||||||     | ||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  30559916 gacgtaatttgatccatgtaatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30559980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12796988 - 12796918
Alignment:
Q  146 agagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||| ||||||    
T  12796988 agagtggaggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagag 12796918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18474047 - 18473973
Alignment:
Q  359 tttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  18474047 tttgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttg 18473973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 395
Target Start/End: Original strand, 29735969 - 29736050
Alignment:
Q  314 attagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
    |||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  29735969 attagaaaagacttaatgattaacaagttgaatccaaatatgatttatgattgaactttatgacgtaatttgattcatgtag 29736050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Original strand, 36042403 - 36042480
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  36042403 tttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcggaccccaattaatgggaaaagatttggttgttgttgt 36042480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 166
Target Start/End: Original strand, 25288827 - 25288916
Alignment:
Q  73 atgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||   |||||||||| ||| |||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25288827 atgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccatt----agagagagtgtgggggtagcacctata 25288916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 166
Target Start/End: Original strand, 25300162 - 25300251
Alignment:
Q  73 atgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||   |||||||||| ||| |||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25300162 atgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccatt----agagagagtgtgggggtagcacctata 25300251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 149
Target Start/End: Original strand, 29735727 - 29735806
Alignment:
Q  69 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagag 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  || || ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  29735727 ggagatgaggatgttgtgttggatgaatggtaagactagacgagaaagaattaagaataacaccatt-tagagagagagag 29735806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 357 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7531721 - 7531646
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  7531721 tttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgtt 7531646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 402
Target Start/End: Original strand, 21425229 - 21425296
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  21425229 aatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccc 21425296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 365
Target Start/End: Original strand, 25288918 - 25288977
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgata 365  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  25288918 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgata 25288977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 357 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30456371 - 30456328
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgac 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30456371 tttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgac 30456328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17491782 - 17491688
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgac 400  Q
    ||||||| ||||  |||||||| ||| | ||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  17491782 gagaaactattaagaaagacttggagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtatgttgatccatgtagccgac 17491688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 396
Target Start/End: Original strand, 31715994 - 31716064
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagc 396  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31715994 ttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagc 31716064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 430
Target Start/End: Original strand, 39702154 - 39702232
Alignment:
Q  352 tatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttg 430  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||  ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  39702154 tatggtttttgatagaacattatggtatcatttgatctatgtagccgaccacatttagtgggataaaacttggttgttg 39702232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 41035126 - 41035052
Alignment:
Q  360 ttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| |||  ||||| ||  |||||||||||    
T  41035126 ttgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccaacctcatttgatataataaggctcggttgttgttgt 41035052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 30812893 - 30812848
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30812893 tttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaccc 30812848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 402
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931210
Alignment:
Q  161 cctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaagg 260  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| | |||| | || |||||||||||||| || | |||  ||||| |  | ||||| ||| ||||||| ||| |||    
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatctatagattctgtagtaaggagactagatcagatggagg 32931069  T
Q  261 tgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttt 360  Q
      |||||  | |  ||||| ||| |||||||||| ||||  ||  ||||||| ||||| ||||| || ||  | ||||||||| | | ||||||| | |     
T  32931070 atagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgta 32931168  T
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  32931169 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccc 32931210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 402
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143591
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccc 36143591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 38901896 - 38901819
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || | ||||||| |||  ||||||||||    
T  38901896 tttttgatataacactatggcggcatttgattcatgtagcggaccccatatagtgggataaggcttgattgttgttgt 38901819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 39953341 - 39953264
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  39953341 tttttgatgggacactatggagttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 39953264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45512792 - 45512707
Alignment:
Q  137 taaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatc 222  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||| |||| |||||||||| ||| || |||| |||||    
T  45512792 taaagagagggagttggggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaagatc 45512707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 402
Target Start/End: Original strand, 14459049 - 14459145
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||| | ||||||||  | | ||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  14459049 gagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccc 14459145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 39760784 - 39760736
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgatagga 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  39760784 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaggattagacaagatagga 39760736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 432
Target Start/End: Original strand, 1335555 - 1335606
Alignment:
Q  381 atttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  1335555 atttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataggacttagttgttgtt 1335606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2518483 - 2518400
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||||  || |||||||||    
T  2518483 aaatatgatttctgatagaacattatggcataatttgatccttgtagctgaccccacttagtaagataaggtttggttgttgtt 2518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8255623 - 8255568
Alignment:
Q  344 aatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccga 399  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8255623 aatccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccga 8255568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 436
Target Start/End: Original strand, 12611694 - 12611781
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    ||||||||| | || |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| || | ||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  12611694 aaatatgatatatgttagaactttatggtgtcgtttgatccatgtagccgatcccaattagtgggataaggcttggttgttgttgtat 12611781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16035822 - 16035759
Alignment:
Q  339 agttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  16035822 agttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagctgaccc 16035759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 402
Target Start/End: Original strand, 23492217 - 23492284
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  23492217 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtgtcatttaatccatgtagccgaccc 23492284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 136
Target Start/End: Original strand, 30748384 - 30748447
Alignment:
Q  73 atgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccatta 136  Q
    |||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  30748384 atgaggatgtttcgttggatgtgtggttagattagacatgataggattagaaatgacaacatta 30748447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12966428 - 12966311
Alignment:
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgat--agaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataa 417  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||| ||||||| | | ||||||| ||| |||||||| |  | ||||  |||||    
T  12966428 aaagatttagagattaatgagttgaattcaaatatggtttatgatagagagcattatgacataatttgatccatatagccgacactgtgtaatgagataa 12966329  T
Q  418 gacttagttgttgttgta 435  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  12966328 gacttggttgttgttgta 12966311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41972069 - 41971996
Alignment:
Q  142 agagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| | || | ||||||||||||||||||||    
T  41972069 agagagagttagggtaacaccta-agtagaaaagatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagag 41971996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42493663 - 42493536
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaa 170  Q
    |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| || ||| |||||   ||||||| ||||       |||||||| ||||||||||||||||||     
T  42493663 agatgaggatgttgcgttggttgtgtggtaagattagtcaagattggattgtaaatgacaacattg------gagagagttggggtaacacctatagtag 42493570  T
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttgg 204  Q
    ||||| | || |||| ||||||| | ||||||||    
T  42493569 aaaagattgtggaaactaggcttaggtggtttgg 42493536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10824274 - 10824221
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||||    
T  10824274 aaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccgaccc 10824221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13172009 - 13171879
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    |||||||| ||||||   |||||| || |||||| |||||  ||||||||||  |||||||  ||||    |||||||||| |||| | |||||||||||    
T  13172009 gagatgagaatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggataggattagaaatgacaagatta----gagagagagttggggaagcacctatagta 13171914  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttgg 204  Q
     ||||| |||| ||||||| |||| | ||||||||    
T  13171913 gaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgg 13171879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16971824 - 16971771
Alignment:
Q  382 tttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||    
T  16971824 tttgatccatgtagccgacccaatttagtgggattaggcttcgttgttgttgta 16971771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 428
Target Start/End: Original strand, 18741843 - 18741908
Alignment:
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgt 428  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||    
T  18741843 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 18741908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 428
Target Start/End: Original strand, 18746807 - 18746872
Alignment:
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgt 428  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||    
T  18746807 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 18746872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 435
Target Start/End: Original strand, 26363662 - 26363769
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| | | | || ||||||| ||||||| |||||| | | | | ||||||||||| ||    
T  26363662 ttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataagacttggt 26363759  T
Q  426 tgttgttgta 435  Q
    ||||||||||    
T  26363760 tgttgttgta 26363769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27556375 - 27556302
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | ||| | || |||  ||| |||||||||||    
T  27556375 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaagcttggttgttgttgt 27556302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 32276894 - 32276967
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || | ||| | ||||||  ||| |||||||||||    
T  32276894 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 32276967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 35647003 - 35646962
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  35647003 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccc 35646962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41444608 - 41444547
Alignment:
Q  152 ggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtaga 213  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |||| || | |||||||||||||||||    
T  41444608 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 395
Target Start/End: Original strand, 5908829 - 5908889
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| ||| |||||||    
T  5908829 aatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaaccttattgcgtaattggatccatgtag 5908889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Original strand, 9695631 - 9695695
Alignment:
Q  152 ggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||| | |||||||| |||||||||||    
T  9695631 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagag 9695695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 68 - 108
Target Start/End: Original strand, 16252855 - 16252895
Alignment:
Q  68 cggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattaga 108  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16252855 cggaaatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattaga 16252895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 402
Target Start/End: Original strand, 24558693 - 24558733
Alignment:
Q  362 gatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24558693 gatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccc 24558733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Original strand, 25985509 - 25985561
Alignment:
Q  142 agagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttg 194  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||    
T  25985509 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttg 25985561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28269840 - 28269761
Alignment:
Q  272 aaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaat 352  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||| ||  ||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28269840 aaaagaggtatatgaagacctagaaaaattataagagaaactattag-caagatttagaggttaatgagttggatccaaat 28269761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 434
Target Start/End: Original strand, 31309583 - 31309635
Alignment:
Q  382 tttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  31309583 tttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 31309635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 35362723 - 35362651
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| | ||| | ||| ||| ||| ||||||||||    
T  35362723 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 35362651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 100)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 5168747 - 5169114
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||     
T  5168747 gcggagatgaggatgttgcgctggatgataggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatg 5168846  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5168847 gtagaaaagttggtagaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtc 5168946  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5168947 tagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 5169046  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  5169047 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 5169114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 21992 - 22354
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21992 gcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccatta----gagagagagtgggggtagcacctata 22087  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  22088 gtagaaaagttggtagaaa-taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtc 22186  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22187 gggttaaaagaggtagaggaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 22286  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| | ||||||  ||| |||||||||||    
T  22287 aacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 22354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 71 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 47233955 - 47233594
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaa 170  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||    |||||||| ||| |||| |||||||||||     
T  47233955 agatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccatta----gagagagaatggaggtagcacctatagtag 47233860  T
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47233859 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggt 47233760  T
Q  271 taaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaaca 370  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47233759 taaaagatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggtttttgatagaaca 47233660  T
Q  371 ttatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  47233659 ctatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 47233594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 140 - 435
Target Start/End: Original strand, 35033134 - 35033429
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaa 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35033134 agagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccattgtaa 35033233  T
Q  240 gaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatga 339  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35033234 gaagagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga 35033333  T
Q  340 gttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  || || | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  35033334 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataaggcttggttgttgttgta 35033429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 52138722 - 52139082
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52138722 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 52138817  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |    
T  52138818 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaag 52138917  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  52138918 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 52139017  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||| ||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  52139018 actatgacgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52139082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 25191301 - 25191659
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||      |||||| |||||||| |||||||||||    
T  25191301 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcatta------gagagaatgggggtagcacctatagta 25191394  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||    
T  25191395 gaaaaattggaagaaaatagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccgg 25191494  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  25191495 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaac 25191594  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| || || | ||| | ||||||  ||| |||||||||||    
T  25191595 actatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 25191659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 51448069 - 51447717
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  51448069 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtaggg-tagcacctatagta 51447975  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  51447974 gaaaagttggtagaaaataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 51447875  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    ||||||||       ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  51447874 ttaaaaga-------gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 51447782  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  51447781 actatggcgtcatttgattcatgtagccggccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 51447717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 70 - 422
Target Start/End: Original strand, 54278942 - 54279290
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  54278942 gagatgaggatgttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccatta----gagagagagtaggggtagcacctatagta 54279037  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  54279038 gaaaagttggtagaaaataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 54279137  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  54279138 ttaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 54279237  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagactt 422  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||| || | |||||| ||||||||||    
T  54279238 actatggcgtcatttgatcaatgtagccgatcccacttaataagataagactt 54279290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 28245360 - 28245684
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaa 170  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||| |||||    ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28245360 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcatta----gagagagagtgggggtagcacctatagtag 28245455  T
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggt 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||    
T  28245456 aaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaagt 28245555  T
Q  271 taaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaaca 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | | ||||||||    
T  28245556 taaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaaca 28245655  T
Q  371 ttatggcgtcatttgattcatgtagccga 399  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28245656 ctatgacgtcatttgatccatgtagccga 28245684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 53519505 - 53519862
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||||    
T  53519505 gcggaaatgaggatgttgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgacaccatta----gacagagagtgggggtagcacctata 53519600  T
Q  167 ------gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaagg 260  Q
          ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  53519601 tatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggagg 53519700  T
Q  261 tgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttt 360  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||            ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  53519701 agagtcatgttaaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttt 53519788  T
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  53519789 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 53519862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 70 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33272388 - 33272122
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata--- 166  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||       
T  33272388 gagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattaga--gagagagagtgggggtagcacctatatat 33272291  T
Q  167 -gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagt 265  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| | |||||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  33272290 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctgtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggagagt 33272192  T
Q  266 caggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtca 335  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33272191 caagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 140 - 435
Target Start/End: Original strand, 38850108 - 38850404
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaa 239  Q
    |||||||||| | | ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | | | ||||    
T  38850108 agagagagagagagagtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaa 38850207  T
Q  240 gaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaa-gacttagaggtcaatg 338  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  38850208 gaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatg 38850307  T
Q  339 agttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    | |||||| ||||| || ||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  38850308 aattgaattcaaatttggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaaacttagttgttgttgta 38850404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 185 - 434
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508517
Alignment:
Q  185 aataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagat 284  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||     
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  285 gaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcattt 384  Q
    ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  385 gattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48508517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 54128300 - 54128661
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||    ||||||| || |||||| |||||||||||    
T  54128300 gagatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccatta----gagagagtgttggggtagcacctatagta 54128395  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||| | |||||||     ||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||     
T  54128396 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcaga 54128495  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattc-gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
    |  ||||||||||| |||||||||  ||||  |||  ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||    
T  54128496 tcgaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaa 54128595  T
Q  369 cattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  54128596 cattatggcataatttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 54128661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 299
Target Start/End: Original strand, 38060406 - 38060578
Alignment:
Q  127 gacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgta 226  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  38060406 gacaccgttagagagagagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgta 38060505  T
Q  227 gatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaa 299  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||    
T  38060506 gatgccgtcgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaa 38060578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 321
Target Start/End: Original strand, 45728068 - 45728319
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||   |||||||||  ||||||| ||||    |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45728068 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgacatcattt---agagagagagtgggggtagcacatatagta 45728164  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag-cagatccgtagatgccattgtaagaagag--tagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
     ||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||  | | || |||||| | ||||||||||||  || |||||||| ||| |||||    
T  45728165 gaaaagttggtagaaagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaagaagagtatatatcaaatggaggagagtc 45728264  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaa 321  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  45728265 atgttaaaagagatagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 45728319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 43695060 - 43694771
Alignment:
Q  140 agagagagagtggggg-taacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgta 238  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| | | |||    
T  43695060 agagagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgta 43694961  T
Q  239 agaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatg 338  Q
    |||||| |||||||||||||||      | ||||||||||||||| ||| | ||| |||||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43694960 agaagattagatcaaatgaagg------aagttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatg 43694867  T
Q  339 agttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
      ||| ||| |||   | ||| |||||||||| || | |||||||||||  |||||| |||||| ||||| | ||||||  ||  |||||||||||    
T  43694866 gattggatctaaactaggtttatgatagaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgggataaagctgggttgttgttgt 43694771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 264 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12096875 - 12096705
Alignment:
Q  264 gtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttga 363  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||    
T  12096875 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 12096776  T
Q  364 tagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  12096775 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12096705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 303 - 434
Target Start/End: Original strand, 53262292 - 53262423
Alignment:
Q  303 ttcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  53262292 ttcgagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccc 53262391  T
Q  403 aatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  53262392 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 53262423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 48953698 - 48953453
Alignment:
Q  158 acacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagca-gatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatg 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||| |||| | || ||| |||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  48953698 acacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatg 48953599  T
Q  257 aaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttaga--ggtcaatgagttgaatccaaatat 354  Q
     ||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  |||||| ||||| |||  ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  48953598 gaggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcattaaaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatat 48953499  T
Q  355 gatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgac 400  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  48953498 gatttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccgac 48953453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 45289387 - 45289090
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctat--agtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgt 237  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||| | |   ||||||    | ||    
T  45289387 agagagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagt 45289288  T
Q  238 aagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaat 337  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||| || ||| ||||| |||| ||||| ||| |||||  ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | |||    
T  45289287 aagaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaagatctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaat 45289188  T
Q  338 gagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  45289187 gagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 45289090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19676447 - 19676081
Alignment:
Q  73 atgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtg------ggggtaacacctata 166  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||   |||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||| |      |||||| ||||||||    
T  19676447 atgaggatgttgcattggatgagcggtaagactagatgggataagattaggagtgacaccattagagagagagagagagagtgttggggtagcacctata 19676348  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||| ||| | ||||||||  | |||  ||||| |||||| ||  ||| |||||    
T  19676347 gtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatcagatagaggagagtc 19676248  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    || | |||||||||| | |||||||||  ||||   |  ||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||    
T  19676247 agatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatgctgtatgatag 19676149  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||| | ||||||| ||| |||||| ||||    
T  19676148 agcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 19676081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 402
Target Start/End: Original strand, 39235157 - 39235387
Alignment:
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggt 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||   | ||| ||||||||||||| ||| |||  |||||| |    
T  39235157 aaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtcagat 39235256  T
Q  271 taaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaaca 370  Q
     |||||||||||| ||||||| || ||||  ||  || |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||    
T  39235257 caaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgatagaaca 39235356  T
Q  371 ttatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  39235357 ttatgtcgtga-ttgatccatgtagccgaccc 39235387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 49503896 - 49503568
Alignment:
Q  88 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaat 187  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||   |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  49503896 tggatgagtggtaagactagacgagataggattgggaatgacaccatta----gagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaat 49503801  T
Q  188 aggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaa 287  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||   |  ||  || ||||||||| ||| ||| ||||| | ||| |||| ||||| |||    
T  49503800 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccaatagatgttgtaatacaaacagtagatcagatggaggggagtctgattagaagatgtagaggaa 49503701  T
Q  288 gacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    |||||              |||||| ||||| ||||| |||  ||| |||||||||  |||||||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||    
T  49503700 gacct--------------agaaactattaggaaagatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgat 49503615  T
Q  388 tcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  49503614 ccatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49503568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 52679160 - 52678852
Alignment:
Q  118 attaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagc 217  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||   || || |||||| | ||||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||||     
T  52679160 attaaaaatgacaccattagaaagagagag--tggaaatagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagaga 52679063  T
Q  218 agatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccatta 317  Q
    |||   |||||||   | ||||||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  |   ||||||| ||||    
T  52679062 agacttgtagatgt--tggtaagaaaaatagatcggatggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaactaa--gagaaactatta 52678967  T
Q  318 gaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataa 417  Q
      ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||| |||| ||||||| |||| || | |||  ||||| || |||||    
T  52678966 tgaaagatttagaggttaatgagttgaattcaaatatgattcatgatataatattatagcgtaatttgatccatgcagtcaacctcatttagtaagataa 52678867  T
Q  418 gacttagttgttgtt 432  Q
     ||||||||||||||    
T  52678866 aacttagttgttgtt 52678852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 306 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 52156212 - 52156084
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |     
T  52156212 gagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatccatgtagccgaccccac 52156113  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| | ||||||| ||  |||||||||||    
T  52156112 ttagtgggataaggctcggttgttgttgt 52156084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 321 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 311422 - 311309
Alignment:
Q  321 aagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagac 420  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| |    
T  311422 aagatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 311323  T
Q  421 ttagttgttgttgt 434  Q
    || |||||||||||    
T  311322 ttggttgttgttgt 311309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 306 - 434
Target Start/End: Original strand, 38060868 - 38060996
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| |     
T  38060868 gagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 38060967  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| | |||||||| || |||||||||||    
T  38060968 ttagtgggataagaattggttgttgttgt 38060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30294418 - 30294178
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggaca---tgtagagagcagatccgtagatgccattg 236  Q
    |||||||||| | | ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||   ||||||||| |||   ||||||||||  |    
T  30294418 agagagagagagagagtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccg 30294319  T
Q  237 taagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaa 336  Q
    ||||||||||| || | || |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||  | ||  ||  || |||| |||| |||||| ||| |||||||    
T  30294318 taagaagagtaaattagattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaa 30294219  T
Q  337 tgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggc 377  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  30294218 tgagttggatctaagtatgatttatgataaaacactatggc 30294178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 306 - 435
Target Start/End: Original strand, 15296061 - 15296190
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |     
T  15296061 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccac 15296160  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    ||| | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  15296161 ttagtgggataaggcttggttgttgttgta 15296190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 213
Target Start/End: Original strand, 27917494 - 27917631
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||  ||||| ||||||| ||||||      |||| ||| |||||| |||||||||||    
T  27917494 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccatta------gagaaagttggggtagcacctatagta 27917587  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtaga 213  Q
     ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27917588 gaaaagatggtaggaaataggcttagatggtttggacatgtaga 27917631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 355
Target Start/End: Original strand, 3186692 - 3186971
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaa 170  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||||| | | |  |||| ||||| |||||||||||||||     || ||||||| |||| ||||||||||      
T  3186692 agatgagaatcttatgttggatgagcggtaagacttggcgggataagattaggaatgacaccattatg----gaaagagtggtggtagcacctatagtgg 3186787  T
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggt 270  Q
     |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| | ||||||| ||  ||   ||||||||    
T  3186788 gaaagttggtagaaaataggc-tagatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcagattgagaaaagtcaggt 3186886  T
Q  271 taaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatg 355  Q
     ||||||||| ||  || |||||||||||  ||  || ||| |||||||||  | ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  3186887 caaaagaggtggagaaatacctaagaaaactataagaaaaatcattagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaatatg 3186971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 306 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17022800 - 17022671
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||| | |  ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  17022800 gagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcatttaattcatgtagccgacctcat 17022701  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    ||| | ||||||| |||| || ||||||||    
T  17022700 ttagtgggataaggcttactttttgttgta 17022671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 306 - 402
Target Start/End: Original strand, 49042090 - 49042187
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttt-tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  49042090 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccc 49042187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 50960922 - 50960641
Alignment:
Q  145 gagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaaga 244  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| |     |||   | | |||||||    
T  50960922 gagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc----tatgttgtagaaagaaga 50960827  T
Q  245 gtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttga 344  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| | |  ||||||| ||| |||||||||  ||||   |  ||||||| ||||| ||||  |||||| | |||||||||     
T  50960826 gtagatcagatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttgg 50960727  T
Q  345 atccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttg 430  Q
    ||||||||||| | | | ||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||| |||| | ||| | ||||||| ||| |||||||    
T  50960726 atccaaatatggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 50960641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2133719 - 2133612
Alignment:
Q  327 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagtt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||| | ||| | ||||||| ||| |||    
T  2133719 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggcttggtt 2133620  T
Q  427 gttgttgt 434  Q
    ||||||||    
T  2133619 gttgttgt 2133612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 48734475 - 48734146
Alignment:
Q  88 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaat 187  Q
    |||||||||||||| | ||| |  |||| ||||| ||||||||||||||      ||||| || |||||| | | ||||||| || || |||||||||||    
T  48734475 tggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccatta------gagagtgttggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaaat 48734382  T
Q  188 aggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaa 287  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||| || | ||| || | |||||||||||| |||    
T  48734381 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagttagatcaaaagaggtagaggaa 48734282  T
Q  288 gacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    | |||             || |||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  48734281 ggcctt------------gaaaaactattagagaagatttaaaggtcaacgagttgggtccaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttgat 48734194  T
Q  388 tcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
     |||||||| ||||| | ||| | ||||||| |||  |||||||||||    
T  48734193 ccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgta 48734146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 54425289 - 54425031
Alignment:
Q  112 gataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgta 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||     ||| || ||||| || ||||||| ||||||||||| ||| || | |||| |||||||    
T  54425289 gataggattatgaatgacaccattaggaagagagtgag-----gtatcatctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgta 54425195  T
Q  212 gagagcagatccgtagatgccattgtaagaag-------agtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcatt 304  Q
    | ||| ||| | | ||||||| ||||||| ||       ||||||||| ||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||     
T  54425194 gggagaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctata 54425095  T
Q  305 cgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
     |||  ||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  54425094 agagggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatatggtttattatagaa 54425031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39600975 - 39600683
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaa 239  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||| | |||| | |||||| | |||||| |||| ||| | |||||| |  | |  |    
T  39600975 agagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtggttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcga 39600876  T
Q  240 gaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatga 339  Q
    | ||||||||||| ||  |||  |||||| ||  |||||||||| |||||||||  ||||  ||  ||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||    
T  39600875 ggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatga 39600776  T
Q  340 gttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| || ||||||| ||| || || |||| | ||  | ||||||||||| ||| |||||    
T  39600775 gttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccatctaaccaaccccactttgtgggataagacttggtttttgtt 39600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 42510289 - 42510048
Alignment:
Q  159 cacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaa 258  Q
    ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| |  |||||    | ||||| ||||||||||| ||| |    
T  42510289 cacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagatgga 42510192  T
Q  259 ggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatt 358  Q
    ||  |||||| | |  ||||| | | |||||||||  ||||  ||  ||||||||||||| ||||| || ||  | ||||||||| | | ||||||| ||    
T  42510191 ggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatggtt 42510092  T
Q  359 tttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42510091 tatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccc 42510048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 330 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555332
Alignment:
Q  330 aggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgtt 429  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||||||| ||| ||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 47555337  T
Q  430 gttgt 434  Q
    |||||    
T  47555336 gttgt 47555332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 265
Target Start/End: Original strand, 19736918 - 19737110
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagt-gggggtaacacctatagt 168  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| |||||  | ||| | |||||    |||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  19736918 gagatgatgatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcatta----gagagagagttgggggcagcacctatagt 19737013  T
Q  169 aaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagt 265  Q
    | ||||| |||||||||||||| || | |||||||  |||| |||||| ||| | |||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  19737014 agaaaagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt 19737110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 26490236 - 26490376
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||| |||||  ||||||  |||||      || ||||| | |||| ||||||||    
T  26490236 gcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcatta------gacagagttgaggtagcacctata 26490329  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtaga 213  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26490330 gtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtaga 26490376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23534729 - 23534603
Alignment:
Q  275 agaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |    |||||||||| ||||||||||||||    
T  23534729 agaggtagaggaagacccaaaaaaattataacagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggactgtaatatgatttatgatagaacattat 23534630  T
Q  375 ggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  23534629 ggcgtaatttgatccatgtagtcgacc 23534603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 149
Target Start/End: Original strand, 30345442 - 30345524
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagag 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||  | ||||||||||    
T  30345442 gcggagatgaggatgttgtgttggatgagcggtaagattggacatgatagaattatgaatgacactatttaagagagagagag 30345524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 54365268 - 54365008
Alignment:
Q  142 agagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatcc--gtagatgccattgtaa 239  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||  |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||   || |  |||||| | ||| |||    
T  54365268 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctattataa 54365170  T
Q  240 gaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatga 339  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||   |  ||||| ||| |||||||||  ||||  ||  ||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||     
T  54365169 ggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgt 54365070  T
Q  340 gttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    |||  | | ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  54365069 gttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgacc 54365008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 7895953 - 7895880
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  7895953 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 7895880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31454302 - 31454225
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  31454302 tttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31454225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 31566243 - 31566159
Alignment:
Q  352 tatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  31566243 tatggtttttgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 31566159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19162785 - 19162678
Alignment:
Q  236 gtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtca 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||   ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | |    
T  19162785 gtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaagagttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagatta 19162686  T
Q  336 atgagttg 343  Q
    ||||||||    
T  19162685 atgagttg 19162678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 293
Target Start/End: Original strand, 19757829 - 19758040
Alignment:
Q  78 gatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagt-gggggtaacacctatagtaaaaaagt 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||| |||||  | ||| | |||||    |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||     
T  19757829 gatgttgtgttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcatta----gagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaaga 19757924  T
Q  177 tggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaag 276  Q
    |||||||||||||| || | |||||||  |||| |||||| ||| | |||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||| |||| || | ||||     
T  19757925 tggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatcaaaa- 19758023  T
Q  277 aggtagatgaagaccta 293  Q
    ||||||| |||||||||    
T  19758024 aggtagaggaagaccta 19758040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 373
Target Start/End: Original strand, 38430850 - 38431069
Alignment:
Q  154 ggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaa 253  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||  || | | |||||   | ||| |||||||||||||     
T  38430850 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgtagagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcag 38430949  T
Q  254 atgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaata 353  Q
    ||| ||| ||||||  | |||||||||||| |||||| ||  ||||  |   ||||||| |||    |||  |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  38430950 atggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaaactattgtggaaggtttagaggttaatgagttggatccaaata 38431049  T
Q  354 tgatttttgatagaacatta 373  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  38431050 tggtttatgatagaacatta 38431069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 149
Target Start/End: Original strand, 38850016 - 38850095
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagag 149  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | | ||||||||||    
T  38850016 gagatgaggatgttgcgctggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagagagagagag 38850095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415258
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| | ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 14415260  T
Q  435 at 436  Q
    ||    
T  14415259 at 14415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 402
Target Start/End: Original strand, 36304149 - 36304216
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36304149 aatgagttggatcaaaatatggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccc 36304216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 437
Target Start/End: Original strand, 7278675 - 7278749
Alignment:
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtata 437  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||  ||||||||||||||||||    
T  7278675 atagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgtata 7278749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 352 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 40273287 - 40273205
Alignment:
Q  352 tatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||| |||  || |||||||||||    
T  40273287 tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgt 40273205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 48953760 - 48953694
Alignment:
Q  66 tgcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacacc 132  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  48953760 tgcggagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagattggatgagataggattaagaatgacacc 48953694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106618
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | |||||||  ||||||  ||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40106620  T
Q  435 at 436  Q
    ||    
T  40106619 at 40106618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24778684 - 24778608
Alignment:
Q  359 tttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| | ||||||||||    
T  24778684 tttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgttgta 24778608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 3987036 - 3987111
Alignment:
Q  141 gagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||  ||||||||||    
T  3987036 gagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagag 3987111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 433
Target Start/End: Original strand, 26490469 - 26490596
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||  |||||||| ||||||   |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||| || |     
T  26490469 gagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatgtgatttcatatagaatattatggcgtaatttgatccatatagtcgatcccac 26490568  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||| || ||||||||||  |||||||||    
T  26490569 ttagtaagataagacttgattgttgttg 26490596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 222
Target Start/End: Original strand, 29600887 - 29600970
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaatagg-cttggatggtttggacatgtagagagcagatc 222  Q
    ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29600887 agagagagagttgtcgtaacgcttatagtaaaaaagatggtagaaaataggttttagatggtttgggcatgtagagagaagatc 29600970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208890
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||| | ||| | ||||| | ||| |||||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgttgt 39208890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 40116446 - 40116371
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    |||||| | ||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  40116446 ttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacc 40116371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991713
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| | ||| |  |||||||||| | |||||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgttgttgt 40991713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 417
Target Start/End: Original strand, 20208205 - 20208263
Alignment:
Q  359 tttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataa 417  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  20208205 tttgatagaactttatggcatcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataa 20208263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 42026609 - 42026535
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  || |  |||||||||| ||| ||||||||    
T  42026609 tgatagaacattatggcgttatttgattcatttagccgaccccacatactgtgataagacttggttcttgttgta 42026535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 48532166 - 48532240
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattc-atgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  48532166 tgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48532240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 53214938 - 53214868
Alignment:
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtata 437  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  53214938 aacattctggcgtaatttgatccatgcagccgaccccatttagtcggataaggcttggttgttgttgtata 53214868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Original strand, 3987539 - 3987616
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  3987539 tttttgataggacactatggcgttgtttgattcatgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgt 3987616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541364
Alignment:
Q  345 atccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccc 24541364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33271983 - 33271910
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||| | |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  33271983 tgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaataagataaagcttagttgttgttgt 33271910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 432
Target Start/End: Original strand, 35481143 - 35481208
Alignment:
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  35481143 aacattatgacgtaatttgattcatttagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgtt 35481208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 45374566 - 45374477
Alignment:
Q  345 atccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  45374566 atccaactatggtttcggatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45374477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 46148237 - 46148310
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||  ||| ||| |||||||||||    
T  46148237 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgt 46148310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 345005 - 344929
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||   | |||||| |||||||||||    
T  345005 agagagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgttagaaaataggcttaagtagtttggtcatgtagagag 344929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41842630 - 41842562
Alignment:
Q  327 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
    ||||||| ||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  41842630 tagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtag 41842562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 45486933 - 45486849
Alignment:
Q  350 aatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| | ||| | ||||||  ||| |||||||||||    
T  45486933 aatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 45486849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 46367470 - 46367390
Alignment:
Q  351 atatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  46367470 atatgatatatgatagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagcctaccccacttaattggataaagcttggttgttgt 46367390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 52927936 - 52927852
Alignment:
Q  346 tccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttg 430  Q
    |||||||||| |||  || ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||    
T  52927936 tccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 52927852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 37598252 - 37598209
Alignment:
Q  352 tatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37598252 tatgatatatgatagaacattatggcgtcatttgactcatgtag 37598209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 402
Target Start/End: Original strand, 49841799 - 49841866
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  49841799 aatgagttggatcgaaatatggtatatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccc 49841866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 429
Target Start/End: Original strand, 6988113 - 6988179
Alignment:
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgtt 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||| | ||||||| ||||||||||    
T  6988113 atagatcattatggcgtcatttgatcaatgtagccgactccttttagtgggataaggcttagttgtt 6988179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 402
Target Start/End: Original strand, 29601060 - 29601142
Alignment:
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||    
T  29601060 aaagatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccc 29601142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 41482266 - 41482184
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttag-aggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | || | ||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41482266 gagaaactattaggaaagactttggagattaatgagttgaaccaaaatctggtttatgatagaacattatggcgtaatttgat 41482184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 45834662 - 45834600
Alignment:
Q  372 tatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  45834662 tatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45834600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 55384122 - 55384064
Alignment:
Q  330 aggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgatt 388  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  55384122 aggttaataagttgaatctaaatatgatttatgatagaacgttatgacgtaatttgatt 55384064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 344837 - 344772
Alignment:
Q  369 cattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| || |||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  344837 cattatggtgtaatttcatcgatgtagccgacccaacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 344772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21862826 - 21862773
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21862826 aaatatgatattggatagaagaatatggtgtcatttgatccatgtagccgaccc 21862773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797820
Alignment:
Q  339 agttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    ||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||| | ||| | | ||||| ||| |||||||||||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgtat 30797820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 37083365 - 37083292
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  37083365 tgatcgaacattatggcgtaatttggtccttgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 37083292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 431
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530040
Alignment:
Q  366 gaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 47542072 - 47542031
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacat 111  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  47542072 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacat 47542031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 54422966 - 54422909
Alignment:
Q  311 accattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  54422966 accattaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaa 54422909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2341075 - 2341023
Alignment:
Q  69 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggatta 121  Q
    ||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2341075 ggagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatgatagaatta 2341023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6780752 - 6780696
Alignment:
Q  345 atccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  6780752 atccaaatatgatttcagatagaacgttatgacgtaatttgatccctgtagccgacc 6780696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 32052494 - 32052434
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
    ||||||||||||  | ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  32052494 aatgagttgaatagagatatgatgtatgatagaacattattgcgtcatttggtccatgtag 32052434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 434
Target Start/End: Original strand, 35420479 - 35420550
Alignment:
Q  362 gatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||| |||||| ||||    
T  35420479 gatagaacattatggcgtaatttggtccatgtag-cgaccccatttagtgggataaggcttggttgttattgt 35420550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Original strand, 45373356 - 45373392
Alignment:
Q  358 ttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgta 394  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  45373356 ttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgta 45373392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 142)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 67 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 27450536 - 27450177
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    |||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||    
T  27450536 gcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaat----aatgacaccatta------gagagagtgggggtagcacctata 27450447  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  || ||    
T  27450446 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggagtagaatc 27450347  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27450346 aggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatga-ttttgatag 27450248  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtata 437  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  27450247 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgctgttgtata 27450177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 71 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 48174452 - 48174093
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaa 170  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||     
T  48174452 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtaacacctatagtag 48174357  T
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  48174356 aaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 48174257  T
Q  271 taaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaaca 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||| ||||    
T  48174256 taaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaaca 48174157  T
Q  371 ttatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  48174156 ttatggcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48174093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31960174 - 31959814
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31960174 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 31960079  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  31960078 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31959979  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  31959978 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 31959879  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  31959878 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31959814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 436151 - 436511
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  436151 gagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 436246  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  436247 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 436346  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||    
T  436347 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 436446  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  436447 actatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 436511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 52569875 - 52569515
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52569875 gagatcaggatgttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 52569780  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  52569779 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 52569680  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  52569679 ttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 52569580  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  52569579 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52569515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 71 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1777374 - 1777017
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaa 170  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||   || ||||||||||||    
T  1777374 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta------gagagagtggaaatagcacctatagtaa 1777281  T
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  1777280 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 1777181  T
Q  271 taaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaaca 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||    
T  1777180 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 1777081  T
Q  371 ttatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  1777080 gtatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 1777017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Original strand, 33227131 - 33227456
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33227131 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 33227226  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||| |    
T  33227227 gaaaagttggtagaaaataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaag 33227326  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  33227327 ttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 33227426  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccga 399  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33227427 actatgacgtcatttgatccatgtagccga 33227456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 56375212 - 56375572
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  56375212 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccatta----gagagagagtaggggtagcacctataata 56375307  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |    
T  56375308 gaaaagttggtagaaaacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaag 56375407  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  56375408 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 56375507  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  56375508 actatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgttgttgt 56375572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 70 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 33191208 - 33190880
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33191208 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 33191113  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||  |||||| |    
T  33191112 gaaaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaag 33191013  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||    
T  33191012 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 33190913  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    | |||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  33190912 actatgacgtcatttgacccatgtagccgaccc 33190880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 70 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 48622901 - 48622542
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  48622901 gagatgaggatgttgctttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatt------agagagagtgggggtagcacccatagta 48622808  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||| || |||||||||| ||| |||||| |    
T  48622807 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaag 48622708  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || | | |||||||||    
T  48622707 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaac 48622608  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  48622607 actatggcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 48622542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 70 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23906661 - 23906294
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagag--tgggggtaacacctatag 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  23906661 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatag 23906562  T
Q  168 taaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtca 267  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  23906561 tagaaaagtttgtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaaga--cgtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggagagtca 23906464  T
Q  268 ggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgataga 367  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||    
T  23906463 agttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 23906364  T
Q  368 acattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtata 437  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23906363 acactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtata 23906294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 43433840 - 43434206
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagag--agagagtgggggtaacacctatag 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  43433840 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatag 43433939  T
Q  168 taaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtca 267  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  43433940 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtca 43434039  T
Q  268 ggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgataga 367  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||  ||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||| |  ||||||    
T  43434040 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtaggataga 43434139  T
Q  368 acattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||| ||| || | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  43434140 acactacggcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43434206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 70 - 402
Target Start/End: Original strand, 4440777 - 4441103
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||| ||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      |||||||||||||| | |||||||||||    
T  4440777 gagattaggatgttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccatt------agagagagtgggggcagcacctatagta 4440870  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  4440871 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 4440970  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  4440971 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 4441070  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4441071 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccc 4441103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 27983119 - 27983475
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27983119 gcggagatgaggatattgtgctagatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgagggtagcacctata 27983214  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||       |||| ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  27983215 gtagaaaagttggtag-------gcttagatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtc 27983307  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||  |||| ||||    
T  27983308 aggttaaaagaggtagaggaagacataagaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaattggatcaaaatatggatttttatag 27983407  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||  || |||||||||||    
T  27983408 aacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccaattaatgggataaggtttggttgttgttgt 27983475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 39100896 - 39100536
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||    
T  39100896 gcggagatgaggatgttgcgccaaatgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacaccatt------agagagagtgggggtagcacctata 39100803  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | |  ||||    
T  39100802 gaagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatg-cgttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtc 39100704  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||||    
T  39100703 aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaaatattgtttatcatag 39100604  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||| || | || |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  39100603 aacattatggcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 39100536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 79 - 434
Target Start/End: Original strand, 37797783 - 37798133
Alignment:
Q  79 atgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttg 178  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  37797783 atgttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccatta----gagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttg 37797878  T
Q  179 gtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagag 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||     
T  37797879 gtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga- 37797977  T
Q  279 gtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcg 378  Q
     |||| ||||| ||| |||||  ||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||    
T  37797978 ttagaggaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacg 37798077  T
Q  379 tcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||||| | ||||||| ||| ||| |||||||    
T  37798078 tcatttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgttgt 37798133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 171 - 434
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479320
Alignment:
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  271 taaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaaca 370  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  371 ttatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | | | ||| ||| |||||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgt 32479320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 400
Target Start/End: Original strand, 53707716 - 53708042
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    ||| |||| |||||||||||    
T  53707716 gagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagag----tggaggtagcacctatagta 53707811  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||  ||||| |    
T  53707812 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaag 53707911  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  53707912 ttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 53708011  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgac 400  Q
    | |||| ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  53708012 actatgacgtcatttgatccatttagtcgac 53708042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 71 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 47265561 - 47265195
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaa 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||     
T  47265561 agatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattat----agagagagtgggggtaacacctatagtag 47265466  T
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcaga-------tccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtga 263  Q
    ||||| | |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| |||       |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| ||| ||    
T  47265465 aaaaggtagtagaaaataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgtcgtaagaagagtagactaaatggaggaga 47265366  T
Q  264 gtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttga 363  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||    
T  47265365 ttctagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatga 47265266  T
Q  364 tagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||  | ||| | ||||||| ||| ||| |||||||    
T  47265265 tagaacactatagtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttattgttgt 47265195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 46583160 - 46582826
Alignment:
Q  94 agtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggctt 193  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46583160 agtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccatt----cgagagagagtggggatagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt 46583065  T
Q  194 ggatggtttggacatgtagagagcaga-tccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacct 292  Q
     ||||| |||| ||||||||||  |||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  46583064 agatgggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacct 46582967  T
Q  293 aagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatg 392  Q
    | |||||  ||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  46582966 atgaaaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaccctatggcgtcatttgatccatg 46582867  T
Q  393 tagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||| |||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  46582866 tagcctaccc-acttagtaggataaggcttggttgttgttgt 46582826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 88 - 434
Target Start/End: Original strand, 28236125 - 28236464
Alignment:
Q  88 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaat 187  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28236125 tggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccatt------agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtggaaaat 28236218  T
Q  188 aggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaa 287  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| | | ||||||||||| |||||||||  || || ||| |||||||  |||||| |||    
T  28236219 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaagttaaaa-tggtagaggaa 28236317  T
Q  288 gacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    |||||| |||||  ||| |||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||||| || |||||||    
T  28236318 gacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaatattatggtgtaatttgat 28236417  T
Q  388 tcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
      ||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  28236418 ctatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28236464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 402
Target Start/End: Original strand, 50286893 - 50287211
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||| ||||     ||||||||||    
T  50286893 gagatgaggaagttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta--------gagagagggg-----acctatagta 50286979  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  50286980 gaaaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaag 50287079  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||| || ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||    
T  50287080 ttaaaagaggtagaagaagacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaac 50287179  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    | ||||| | |||||||| ||||||| ||||||    
T  50287180 actatgg-gccatttgatccatgtagtcgaccc 50287211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 117 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26037822 - 26037506
Alignment:
Q  117 gattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    | |||||||    
T  26037822 gattaggaattacatcattagagagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagag 26037723  T
Q  217 cagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccatt 316  Q
     ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||  ||||||| |||    
T  26037722 aagacctgtaaatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactatt 26037623  T
Q  317 agaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggata 416  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||| | |||||    
T  26037622 aggaaagatttagaggtgaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggata 26037523  T
Q  417 agacttagttgttgttg 433  Q
    ||  || ||||||||||    
T  26037522 aggtttggttgttgttg 26037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 143 - 427
Target Start/End: Original strand, 39708424 - 39708708
Alignment:
Q  143 gagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaa 242  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| |||  | |||||||| | |||||||    
T  39708424 gagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatgccgtcgtaagaa 39708523  T
Q  243 gagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagtt 342  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39708524 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 39708623  T
Q  343 gaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttg 427  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||| | ||| | ||||||||||| ||||    
T  39708624 ggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttggttg 39708708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 37773810 - 37773483
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtg-ggggtaacacctatagt 168  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||      ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  37773810 gagatgagaatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccatta------gagagagtaaggggtagcacctatagt 37773717  T
Q  169 aaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcag 268  Q
    | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  || ||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||     
T  37773716 agaaaagtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggatgagagtcaa 37773617  T
Q  269 gttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
T  37773616 tttaaaagaggtagatgaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttggtttatgatagaa 37773517  T
Q  369 cattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    || |||| | | |||||||  || ||||||||||    
T  37773516 cactatgacataatttgatctatatagccgaccc 37773483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20602009 - 20601652
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||  | ||||||||| ||| |||||||||||| ||    | |||||||||| | |||||| ||||    
T  20602009 gcggatatgaggatgttgcgctggatgagcgctaagacaatacatgatagaattgagaatgacaccacta----gggagagagtggagataacacttata 20601914  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| || | ||| ||| |||||    
T  20601913 gtagaaaagttggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggagagtc 20601814  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  |||||  ||  ||||||||||||| |||| |    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  20601813 aggtcaaaagaggtagaagaagacct-tgaaaactataagagaaaccattag-aaagtc----aggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatag 20601720  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| | || || | ||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  20601719 aacattatgacgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgggataagagttaattgttgttgt 20601652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 144 - 431
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192311
Alignment:
Q  144 agagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaag 243  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||    
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  244 agtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttg 343  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||| || ||||    
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  344 aatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
     |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| | ||| | ||||||  ||| ||||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttga-tcaagtagccgaccctacttagtgggataaagcttggttgttgt 20192311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 436
Target Start/End: Original strand, 1793379 - 1793746
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |  ||  |||| ||||| ||||||||||||||    | ||||||| ||||||| ||||||||    
T  1793379 gcggagatgaggatgttgtgttggatgaacggtaagacttaacgggataagattaggaatgacaccatta----gggagagagcgggggtagcacctata 1793474  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||   || |||| | | ||||||| ||||||||| ||| ||  |||||    
T  1793475 gtaaaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatggag--gagtc 1793572  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaacc----attagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttg 362  Q
       | ||||||||||||  |||||||   ||||  ||  ||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1793573 gtatcaaaagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatg 1793672  T
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| |  | ||| |  |||||| |||||||||||| ||||    
T  1793673 atagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 1793746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 176 - 434
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286721
Alignment:
Q  176 ttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaa 275  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  276 gagg--------tagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgataga 367  Q
    ||||        |||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  368 acattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 8286721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 73 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20591657 - 20591304
Alignment:
Q  73 atgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||   ||  |||| |||||||||||||||    | ||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  20591657 atgaggatgttgtgctggatgaatagtaagactagacggaattagattgagaatgacaccatta----gggagagagtgggggtagcacttatagtagaa 20591562  T
Q  173 aagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggtta 272  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||  | |||||| |  ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||      
T  20591561 aagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatgtc-gtgtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt-- 20591465  T
Q  273 aaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacatt 372  Q
      ||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||      
T  20591464 --agaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatg-gttatgatagaacaca 20591368  T
Q  373 atggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||  ||||||  |||| | |||||||||||  ||||||||||||    
T  20591367 atgacgtaatttgattcatatattcgaccctttttagtgggataagacttgattgttgttgtat 20591304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 280 - 434
Target Start/End: Original strand, 21528416 - 21528570
Alignment:
Q  280 tagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgt 379  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |     
T  21528416 tagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtgg 21528515  T
Q  380 catttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  21528516 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 21528570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 434
Target Start/End: Original strand, 21236951 - 21237140
Alignment:
Q  245 gtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttga 344  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  21236951 gtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgg 21237050  T
Q  345 atccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| | |||||||  || |||||||||||    
T  21237051 atccaaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgttgt 21237140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 45205211 - 45204840
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||  ||||||||   ||||||    
T  45205211 gcggagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccatta--acgagagagt-tgggggtagtgcctata 45205115  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttgga--tggtttggacatgtagagagcaga-------tccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatga 257  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||  |  |||||||  || |||||||| |||       || |||||||   ||||| ||||||||||||| |||     
T  45205114 gtagaaaagatggtagaaaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatgg 45205015  T
Q  258 aggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgat 357  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||| || |||||||||  ||||  ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||| |    
T  45205014 aggagag-cagatcaaaagaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggt 45204916  T
Q  358 ttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  45204915 ttatgatagaacatta-ggcgtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45204840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 193
Target Start/End: Original strand, 12494672 - 12494791
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12494672 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatt----agagagagagtgggggtagcacctatagta 12494767  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggctt 193  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  12494768 gaaaagttggtagaaaataggctt 12494791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 432
Target Start/End: Original strand, 16002857 - 16003206
Alignment:
Q  78 gatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagtt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||    ||| ||||| || |  ||||||| ||| |||||||    
T  16002857 gatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattata----gagtgagtgaggatggcacctatggtataaaagtt 16002952  T
Q  178 ggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaaga 277  Q
    | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||| ||| | |  ||| | || ||||||    
T  16002953 gatagaaaatagtcttagatggtt-gaacatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatggatgaaagttatgtcaaaaga 16003051  T
Q  278 ggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggc 377  Q
      |||| ||| |||  | ||||  ||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |    
T  16003052 aatagaggaataccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgatttatgataaaacactatgac 16003151  T
Q  378 gtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    || |||| || ||| ||  ||| || |||||||||||||  |||| |||||||||    
T  16003152 gtaatttaatccatataagcgatcccatttaataggatataacttggttgttgtt 16003206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 263 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 51811449 - 51811309
Alignment:
Q  263 agtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttg 362  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   || ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  51811449 agtcagattaaaagaagtagatgaagacctaagaaaatcatccgagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttg 51811350  T
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccca 403  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  51811349 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccca 51811309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 206 - 384
Target Start/End: Original strand, 50679559 - 50679736
Alignment:
Q  206 catgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattc 305  Q
    |||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||  |||     
T  50679559 catgtagaaagaagatc-gtagatgtcatcgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 50679657  T
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcattt 384  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| || | |||| ||||||||    
T  50679658 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1211753 - 1211392
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||       ||||||||||| | | ||||||||    
T  1211753 gcggatatgaggatgttgcactggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccattc------gagagagtgggagcagcacctata 1211660  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaatag--gcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgag 264  Q
    ||||| |||||||||| |||||   ||||  |||||||||  |||||||||| ||| |  |||||    | ||||||||||||||||| ||| ||  |||    
T  1211659 gtaaacaagttggtaggaaatatatgcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatggagtagag 1211560  T
Q  265 tcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgat 364  Q
    || | | ||||||| |||| |||||| || || ||  ||  || |||  ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  | || ||| | ||    
T  1211559 tcggatcaaaagagatagaggaagacataggagaactataagataaattattagaaaaaa-ttagaggtcaatgagttggatcca--tttggtttctcat 1211463  T
Q  365 agaacattatggcgtca-tttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1211462 agaacactaaggcgtaaatttgattcatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgttgttgt 1211392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 434
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957880
Alignment:
Q  280 tagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgt 379  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||| |||    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  380 catttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 6957880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 397
Target Start/End: Original strand, 51421672 - 51421975
Alignment:
Q  88 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaat 187  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||      ||||| || |||||| ||| ||||||| |  || || ||||||||    
T  51421672 tggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccatta------gagagtgttggggtagcacatatagtagattagatgatagaaaat 51421765  T
Q  188 aggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaa 287  Q
    |||||| | |||||||| ||| || |||| ||| | |||||||   |  || ||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| |||    
T  51421766 aggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagaggaa 51421865  T
Q  288 gacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    ||  ||  ||||  ||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51421866 gatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 51421965  T
Q  388 tcatgtagcc 397  Q
     |||||||||    
T  51421966 ccatgtagcc 51421975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Original strand, 31458951 - 31459094
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaa 170  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||| ||||| | |||| |||||||||||     
T  31458951 agatgaggatgttgcgttggttgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccat--tagagagacagagtcgaggtagcacctatagtag 31459048  T
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  31459049 aaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagag 31459094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41009713 - 41009413
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||    | |||| | |||||||| ||||||||    
T  41009713 gcggaaatgaggatgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcatta----gggagataatgggggtagcacctata 41009618  T
Q  167 gtaaaaaagttggt-agaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagt 265  Q
    ||| |||||||||| | ||||||| ||| |||||||||  |||||||| || |||   || |||||  | ||||||| | ||||||| ||| ||| ||||    
T  41009617 gtagaaaagttggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatggaggagagt 41009518  T
Q  266 caggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgata 365  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||  ||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  41009517 caggtcaaaagtggtagaggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatggtttatgata 41009419  T
Q  366 gaacat 371  Q
     |||||    
T  41009418 taacat 41009413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 280 - 434
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494945
Alignment:
Q  280 tagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgt 379  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| |||| |||    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  380 catttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||| || |||||||| ||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12494945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 280 - 429
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947214
Alignment:
Q  280 tagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgt 379  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||   ||    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgt 7947164  T
Q  380 catttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgtt 429  Q
     ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||    
T  7947165 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821073
Alignment:
Q  186 ataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatg 285  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||| |  ||| || ||||||| | ||| ||  || |||| | ||||||||||||||    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  286 aagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||| |||||  ||  ||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaac-attagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaac 20821073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 434
Target Start/End: Original strand, 35690357 - 35690553
Alignment:
Q  238 aagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaat 337  Q
    ||||||||| ||| | ||| |||  |||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||  ||  ||||||| ||||  ||| | |||||||| |||    
T  35690357 aagaagagtggattagatggaggaaagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaat 35690456  T
Q  338 gagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||  ||||||  | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  35690457 gagtttgatccaatcagggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgt 35690553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 434
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969463
Alignment:
Q  329 gaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgt 428  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||  |||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgt 19969457  T
Q  429 tgttgt 434  Q
    ||||||    
T  19969458 tgttgt 19969463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19154971 - 19154863
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| ||||| | ||| | ||||||| ||| ||    
T  19154971 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttggt 19154872  T
Q  426 tgttgttgt 434  Q
    |||||||||    
T  19154871 tgttgttgt 19154863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 211
Target Start/End: Original strand, 49987350 - 49987487
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||||| || |||  | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||    ||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  49987350 gagatgaggatgttgtgttgaatgtttagtaagactagacatgataggattagaaatgacaacatt----agatagagagtctgggtcacacctatagta 49987445  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgta 211  Q
     ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  49987446 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggtcatgta 49987487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Original strand, 56224987 - 56225130
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaaga---ttagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||| ||||| ||||||||||||       ||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  56224987 gagatgatgatgttgtggtggatgagtggtaagacactaagacatgatatgattaggaatgacaccat------aagagaaagttgggataatacctata 56225080  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||    
T  56225081 gtataaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgagtatgtagagag 56225130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Original strand, 2589255 - 2589354
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  2589255 aatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2589354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 433
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548303
Alignment:
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||| ||| ||| || |||||| |||||  ||| |||||| |||||||||    |||||||||||| ||||| ||| |||| || ||| |||||||||    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    | || ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||  ||| ||||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataatgcttggttgttgttg 4548303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 7066577 - 7066499
Alignment:
Q  355 gatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  7066577 gatttttgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 7066499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Original strand, 25575007 - 25575106
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  25575007 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25575106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44047642 - 44047568
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagag 214  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  44047642 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagag 44047568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 434
Target Start/End: Original strand, 55007914 - 55008028
Alignment:
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataaga 419  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| | | ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||     
T  55007914 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 55008013  T
Q  420 cttagttgttgttgt 434  Q
    ||| |||||||||||    
T  55008014 cttggttgttgttgt 55008028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 418
Target Start/End: Original strand, 44360291 - 44360352
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataag 418  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44360291 tttttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataggataag 44360352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34208377 - 34208269
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||   ||| | ||||||| ||| ||    
T  34208377 ttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttggt 34208278  T
Q  426 tgttgttgt 434  Q
    |||||||||    
T  34208277 tgttgttgt 34208269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8599016 - 8598953
Alignment:
Q  359 tttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagactt 422  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||    
T  8599016 tttgatagaacattatggcgtcgtttgattcatgtagccgacgccacttagtgggataagactt 8598953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Original strand, 35690226 - 35690326
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||    | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  35690226 gagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgacaccttt----aaagagagagttggggtagcacctatagta 35690321  T
Q  170 aaaaa 174  Q
     ||||    
T  35690322 gaaaa 35690326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 49939809 - 49939734
Alignment:
Q  359 tttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||  |||||||||||    
T  49939809 tttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 49939734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 260
Target Start/End: Original strand, 50662377 - 50662496
Alignment:
Q  142 agagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatgg-tttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaag 240  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||   |||||| | ||||||||    
T  50662377 agagagagtttgggcaacacctatagtagaaaagatggtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagacttgtagattctattgtaag 50662476  T
Q  241 aagagtagatcaaatgaagg 260  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  50662477 gagagtagatctaatgaagg 50662496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 6958323 - 6958270
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6958323 aaatatggttttggatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccc 6958270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19062008 - 19061935
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  || | ||||||| ||| |||||||||||    
T  19062008 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgttgt 19061935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 29209274 - 29209173
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||  ||||||| | | ||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  29209274 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagagcattatggcgttgtttgatcaatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgtttttgt 29209175  T
Q  435 at 436  Q
    ||    
T  29209174 at 29209173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 29399013 - 29399086
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| | ||| ||| ||| |||||||||||    
T  29399013 tgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 29399086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 216
Target Start/End: Original strand, 21106908 - 21107052
Alignment:
Q  72 gatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaa 171  Q
    ||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||  | |||||||| |    
T  21106908 gatgaggatgttgggttcgatgtgtggtaagactagacgtgatagaattagaaatgacaacattatatatagagagagttgaggtagtatctatagtaga 21107007  T
Q  172 aaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    || | | || |||||||||||| | | |||||| ||| |||||||    
T  21107008 aaggatagttgaaaataggcttaggtagtttgggcatctagagag 21107052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 32633482 - 32633406
Alignment:
Q  358 ttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||| ||| ||| |||||||||||    
T  32633482 ttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 32633406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37042739 - 37042667
Alignment:
Q  359 tttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||    
T  37042739 tttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgt 37042667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 352
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862844
Alignment:
Q  273 aaagaggtagatgaagacctaagaaaatcatt-cgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaat 352  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  |||   ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 50862844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 1095642 - 1095725
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  1095642 aaatatggtttatgatagaacattatggcgttatttgatcgatgtacccgaccccgtttagtgggataaggcttggttgttgtt 1095725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 44719432 - 44719361
Alignment:
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  44719432 atagagcattatggtgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgt 44719361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7092579 - 7092361
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||| |||| |||||||||  |||    ||||| ||||| ||  || |||||||||||    
T  7092579 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagtctagaagggatatgatt-agaatgacatgatt----agagacagagttggaatagcacctatagta 7092485  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||  || ||||||||||| ||   |||||||| ||| ||||||| |||   |||||||  || ||| ||||||||||||| ||| | | |||||||     
T  7092484 gaaaatatgatagaaaataggtttaagtggtttgggcatatagagagaagacatgtagatgttatagtatgaagagtagatcagatggatgagagtcaga 7092385  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagaccta 293  Q
      | ||||||| || |||||||||    
T  7092384 acataagaggtggaggaagaccta 7092361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21359293 - 21359227
Alignment:
Q  366 gaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  21359293 gaacattatggcgtaatttgattcatgcagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgtt 21359227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 402
Target Start/End: Original strand, 28351643 - 28351809
Alignment:
Q  236 gtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtca 335  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||  |||||| ||| ||||||||||  ||||||||  ||||  ||  ||||||| ||||  ||||| |||||| | |    
T  28351643 gtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaagatttagagatta 28351742  T
Q  336 atgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
     ||||||| ||||||||||  ||| |  |||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||||||    
T  28351743 ttgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccc 28351809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28550583 - 28550521
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28550583 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaa 28550521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Original strand, 31459151 - 31459273
Alignment:
Q  309 aaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaattta 408  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||| |||| |||||| | | |||| |||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||| | |||    
T  31459151 aaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccactta 31459250  T
Q  409 ataggataagacttagttgttgt 431  Q
     | ||||||| ||| ||||||||    
T  31459251 gtgggataaggcttggttgttgt 31459273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31961340 - 31961266
Alignment:
Q  360 ttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  31961340 ttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31961266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Original strand, 33709841 - 33709988
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggat-----taagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacaccta 164  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||     ||  |||| || |||||    |||||||||| |||||||||||||    
T  33709841 gagatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggataggattagaaatggcaacatta----gagagagagttggggtaacaccta 33709936  T
Q  165 tagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||| ||||| |||| |||| |||| || | |||||| | ||||| |||||    
T  33709937 tagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagag 33709988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 45209283 - 45209205
Alignment:
Q  356 atttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  45209283 atttatgatagaatattatggcgtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45209205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 49738619 - 49738549
Alignment:
Q  365 agaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  49738619 agaacattatggcggtgtttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgta 49738549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 50238677 - 50238615
Alignment:
Q  372 tatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  50238677 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 50238615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 50238763 - 50238701
Alignment:
Q  372 tatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  50238763 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 50238701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2557768 - 2557671
Alignment:
Q  338 gagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattat-ggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| || | ||||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  2557768 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattattggtgtaatttgatccatgtagccaactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2557671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 434
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443377
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |  |  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatcccaaatcgtaggataaggcttggttgttgttgt 12443377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 401
Target Start/End: Original strand, 28486089 - 28486170
Alignment:
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||   || ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  28486089 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagctgacc 28486170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 387
Target Start/End: Original strand, 31043226 - 31043307
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| || | |||||||    
T  31043226 gagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcataatttgat 31043307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 35555727 - 35555650
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||| ||| |||||| ||||    
T  35555727 tttttgatagtacagtatggcgtcgtttgattcatgtagccgactccatttagtgggacaaggcttggttgtttttgt 35555650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 42285780 - 42285703
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  42285780 tttttgatagaatactatggcattgtttgattcatgtagccaaccccacttagttggataagacttggttgttgttgt 42285703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 45184200 - 45184135
Alignment:
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  45184200 aacattatgacgtaattcgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgtt 45184135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 50869957 - 50869880
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  50869957 tttttggtagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 50869880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 434
Target Start/End: Original strand, 51438642 - 51438727
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||  | ||||||| ||| |||||||||||    
T  51438642 aaatatggtttataatataacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgt 51438727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 309 - 434
Target Start/End: Original strand, 53540447 - 53540572
Alignment:
Q  309 aaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaattta 408  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||| |   ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||| | | |    
T  53540447 aaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccaaccccactga 53540546  T
Q  409 ataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     | ||||||||||| |||||| ||||    
T  53540547 gtgggataagacttggttgttattgt 53540572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 55388310 - 55388213
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||| | |||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  55388310 aatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 55388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 883448 - 883392
Alignment:
Q  346 tccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||||||||    
T  883448 tccaaatataatttttgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccc 883392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25967628 - 25967548
Alignment:
Q  69 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagag 149  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||||| | ||||||||||    
T  25967628 ggaggtgaggatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgactacattagagagagagagag 25967548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 31403380 - 31403276
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||| ||||||| | || ||| ||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| | | ||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  31403380 gagatgatgatgttgagttgaatgtgtggtgagattagacgggataggattagaaatgacaacattagagacagatagagttggggtagcacctatagta 31403281  T
Q  170 aaaaa 174  Q
     ||||    
T  31403280 gaaaa 31403276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35555941 - 35555865
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| ||| |||||||    
T  35555941 agagagagagttcgggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagag 35555865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42639314 - 42639238
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42639314 agagagagagttagggttgcacctatagtagaaaagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagag 42639238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 435
Target Start/End: Original strand, 49686892 - 49686976
Alignment:
Q  351 atatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    ||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  49686892 atatgatatatgatggaatattatggcgtcgtttgaaccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgctgta 49686976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 54470195 - 54470271
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||   |||||||| |||||||||||    
T  54470195 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagag 54470271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Original strand, 5306479 - 5306578
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||| | ||  | ||||||| ||| |||||||||||    
T  5306479 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccacttggtgggataaggcttggttgttgttgt 5306578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26024978 - 26024851
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||| ||||  |||||  ||||| | ||||||||| ||| | | ||| ||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||  |     
T  26024978 gagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtagccgacctcac 26024879  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  26024878 ttagtgggataaggcttggttgttgttg 26024851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 40018272 - 40018221
Alignment:
Q  351 atatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  40018272 atatgatatatgatagaacattacggcgtcgtttgatccatgtagccgaccc 40018221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 40933007 - 40932956
Alignment:
Q  351 atatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  40933007 atatgatatatgatagaacattatggcggcgtttgatgcatgtagccgaccc 40932956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 42639119 - 42639052
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  42639119 aatgagttggatagaaatatggtatttgatagaacattatggcgtcgtgtaattcatgtagccaaccc 42639052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 51550330 - 51550251
Alignment:
Q  353 atgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||   | ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  51550330 atgacttttgatagaacattatgtcgtcatttgatttttgtagctgactgcacttagtgggataaggcttagttgttgtt 51550251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8598948 - 8598898
Alignment:
Q  382 tttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8598948 tttgattcatgtagccgatcccacttaatgggataagactttgttgttgtt 8598898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10775782 - 10775671
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||| | ||  ||||| || || ||||  ||||||| |||||    ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10775782 gagatgatgatgttgtgttggatgcgtggcaggaccagacaggaaagaattagaaatgacaacatta----gagagagtgttggggtaacacctatagta 10775687  T
Q  170 aaaaagttggtagaaa 185  Q
     ||||| |||||||||    
T  10775686 gaaaagatggtagaaa 10775671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 431
Target Start/End: Original strand, 13262417 - 13262491
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| | | ||| |  |||||| ||||||||||||    
T  13262417 tttttgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataaggcttagttgttgt 13262491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 18966475 - 18966541
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccatta 136  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||    
T  18966475 gagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagattagacaaaataggattataaatgacaacatta 18966541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 40420313 - 40420255
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgt 393  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||    
T  40420313 aatgagttgaatcctaatatggtttatgatagaacattacgacgtaatttgatacatgt 40420255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729505
Alignment:
Q  333 tcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgt 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgt 41729505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43070124 - 43070058
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccatta 136  Q
    |||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  43070124 gagatgatcatgttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacatta 43070058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 185
Target Start/End: Original strand, 44360014 - 44360120
Alignment:
Q  79 atgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttg 178  Q
    |||||||| |||||| |||||| || ||| |  ||||| ||||  |||||||  |||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  44360014 atgttgtgttggatgtgtggtaggactaggcgagatagaattagaaatgacaatattagatggagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatg 44360113  T
Q  179 gtagaaa 185  Q
    |||||||    
T  44360114 gtagaaa 44360120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 433
Target Start/End: Original strand, 48609772 - 48609878
Alignment:
Q  327 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagtt 426  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || | ||||||||||   | ||||||||||| |||| ||||  ||||| | |||||| ||||  ||    
T  48609772 tagaggttaatgagatgaatacaaatatgatttatgcttgaacattatgatataatttgattcatatagctgaccttatttagttggataaaacttgatt 48609871  T
Q  427 gttgttg 433  Q
    |||||||    
T  48609872 gttgttg 48609878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51252753 - 51252679
Alignment:
Q  142 agagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  51252753 agagagagttggggtagcacctctagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatgggcatgtagagag 51252679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 434
Target Start/End: Original strand, 54963639 - 54963732
Alignment:
Q  340 gttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| | ||||||| | | ||||||||||| ||||| | |||| || |||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  54963639 gttgaagcaaaatatggtatatgatagaacat-atggcctaattttatccatgtacctgacccaacttagtgggataagacttagttgttgttgt 54963732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 361 - 395
Target Start/End: Original strand, 55029030 - 55029064
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55029030 tgatagaacattatggcgtcatttgattaatgtag 55029064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13805350 - 13805265
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||||| | ||| |||||||||||    
T  13805350 aaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgt 13805265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22873698 - 22873601
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||||||  ||||||||||  || ||||||||||||||  ||| |||| || ||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||| || ||||||    
T  22873698 aatgagttggttccaaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataaggcttggtagttgtt 22873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 436
Target Start/End: Original strand, 25755527 - 25755600
Alignment:
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||| || ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  25755527 atagaacattatagtgtcatttgatccatgaagtcgatcccatttaatgggataaggcttggttgtttttgtat 25755600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 30634167 - 30634106
Alignment:
Q  373 atggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  30634167 atggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30634106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31897720 - 31897642
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcaga 220  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  31897720 agagagatagttggggtagcaccta--gtagaaaagatggtagaaactagacttgggtggtttgcgcatgtagagagcaga 31897642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 36556837 - 36556760
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||| ||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  36556837 tttttgataggacactatggcgttgtttgattcgtgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgt 36556760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 37488300 - 37488373
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  37488300 tgatagagcattatggcgtaatttgatccatgtagccagccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 37488373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41009347 - 41009282
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacat 371  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||    
T  41009347 gagaaacaattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgatataacat 41009282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 229
Target Start/End: Original strand, 41192763 - 41192913
Alignment:
Q  77 ggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagt 176  Q
    |||||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||  ||||||| | ||| |  |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||     
T  41192763 ggatgttgcgttggatgtgtggtatgattagacaggatacaattataaatgacagcgttaga--gagagagagttggggtagcacctacagtagaaaaga 41192860  T
Q  177 tggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagat 229  Q
    |||| |||| ||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | ||||||    
T  41192861 tggtggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagat 41192913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 391
Target Start/End: Original strand, 46749729 - 46749786
Alignment:
Q  334 caatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcat 391  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||    
T  46749729 caatgagttggattcaaatatgatttatgataaaatattatgacgtaatttgattcat 46749786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 50680727 - 50680848
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggttt-ggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgta 238  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||  | ||||||||||| ||    |||||| || | |||    
T  50680727 agagagagagttagggcaacacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagagagaaggcttgtagattccgtagta 50680826  T
Q  239 agaagagtagatcaaatgaagg 260  Q
    || |||||||||| ||||||||    
T  50680827 aggagagtagatccaatgaagg 50680848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Original strand, 55578956 - 55579101
Alignment:
Q  73 atgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaa 172  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||  | ||  |||| ||||| ||||||||| ||| |  | ||||||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  55578956 atgaggatgttgtgttgaataagtggtaagaggaaacgagataagattatgaatgacactatttt--atagagagagttggaataacacctatagtgaaa 55579053  T
Q  173 aagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagat 221  Q
    ||  |||||||||||| |||| | ||||| || |||||| |||| ||||    
T  55579054 aa-atggtagaaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaagat 55579101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 397
Target Start/End: Original strand, 5367682 - 5367726
Alignment:
Q  353 atgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagcc 397  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  5367682 atgatttttgatagaacacgatggtgtcgtttgattcatgtagcc 5367726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15661939 - 15661875
Alignment:
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||  || ||||||||    
T  15661939 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgt 15661875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20105591 - 20105555
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagcc 397  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20105591 tgataggacattatggcgtcatttgatccatgtagcc 20105555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 330 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 20131093 - 20131025
Alignment:
Q  330 aggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccg 398  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||    | ||||||||||||||||||    
T  20131093 aggttaatgagtttaatctaaatatgatttatgatagaacataataagataatttgattcatgtagccg 20131025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 434
Target Start/End: Original strand, 20654868 - 20654920
Alignment:
Q  382 tttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  20654868 tttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttagttgttgttgt 20654920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 25257701 - 25257628
Alignment:
Q  327 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||| |||||||||||||   | | ||| ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  25257701 tagagatcaatgagttgaagaaagacatgttttttgatagaacatt--ggcatcgtttgattcatgtagccgaccc 25257628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 28497478 - 28497553
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| | || ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  28497478 agagagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtagagag 28497553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34233138 - 34233058
Alignment:
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgac 400  Q
    |||||| ||||| | ||||||||  ||| ||||| | ||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  34233138 aaagacctagagattaatgagttagatcaaaataaggtttatgatagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagccgac 34233058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34233394 - 34233285
Alignment:
Q  69 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagt 168  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||  || |||| |||  || ||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  34233394 ggagatgatgatgttgtgttggatgtgtgataagactagatgtgataggattagaaacgacaacat--tagagatagagagttgggatagcacctatagt 34233297  T
Q  169 a-aaaaagttgg 179  Q
    | ||||||||||    
T  34233296 agaaaaagttgg 34233285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 372 - 436
Target Start/End: Original strand, 46236709 - 46236773
Alignment:
Q  372 tatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| || ||||||||||    
T  46236709 tatggcgtactttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggtggttgttgtat 46236773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 437
Target Start/End: Original strand, 46372229 - 46372309
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtata 437  Q
    ||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||| | || |||| ||| ||||||||||||||    
T  46372229 tttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccacttagttgggtaaggcttggttgttgttgtata 46372309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 82)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 67 - 435
Target Start/End: Original strand, 3301763 - 3302127
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  3301763 gcggagatggggatgttgcgcttgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccatta----gagagagagtgagggtagcccctata 3301858  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |  |||||||| ||| |||||    
T  3301859 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggaggagagtc 3301958  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3301959 aggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 3302058  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  3302059 aacactacggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 3302127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 67 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16347741 - 16347378
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||| |||||||    ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16347741 gcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccatta----gagagagagcgggggtagcacctata 16347646  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16347645 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 16347546  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||    
T  16347545 aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaatatggtttatgatag 16347446  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    ||||   |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  16347445 aaca--ctggcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgtat 16347378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 113 - 427
Target Start/End: Original strand, 38684932 - 38685242
Alignment:
Q  113 ataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtag 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38684932 ataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtag 38685027  T
Q  213 agagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaac 312  Q
    |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||    
T  38685028 agagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac 38685127  T
Q  313 cattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatag 412  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |    
T  38685128 cattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38685227  T
Q  413 gataagacttagttg 427  Q
    |||||| ||| ||||    
T  38685228 gataaggcttggttg 38685242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 24178432 - 24178792
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24178432 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 24178527  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  24178528 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 24178627  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| |  | | |||||||||    
T  24178628 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaac 24178727  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||   ||||| ||| |||||||||||    
T  24178728 actatggcatcatttgatctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgttgttgt 24178792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28977217 - 28976859
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28977217 gagatgagtatgttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccatt------agagagagtgggggtagcacctatagta 28977124  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |    
T  28977123 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaag 28977024  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  28977023 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 28976924  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  28976923 actatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28976859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12492747 - 12492384
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacaccta---ta 166  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||   ||    
T  12492747 gagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctactata 12492652  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12492651 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 12492552  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||    
T  12492551 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 12492452  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  12492451 aacactatggcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12492384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 1275187 - 1275546
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| || |||||||||||    
T  1275187 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggg-tagcacctatagta 1275281  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  1275282 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 1275381  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||| || |||||| |||||||||  ||||  ||| |||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  1275382 ttaacaggggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaac 1275481  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  1275482 attatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatagttgttgttgt 1275546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 74 - 434
Target Start/End: Original strand, 4496308 - 4496666
Alignment:
Q  74 tgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacat--gataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaa 171  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| |||    ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4496308 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacaccttta----gagagagagtgggggtagcacctatagtaga 4496403  T
Q  172 aaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggtt 271  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  4496404 aaagctggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 4496503  T
Q  272 aaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacat 371  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||     
T  4496504 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 4496603  T
Q  372 tatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  4496604 tatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 4496666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 70 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1287949 - 1287611
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagag------tgggggtaacacct 163  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||      |||||||| |||||    
T  1287949 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagagagagagagagagagtgggggtagcacct 1287850  T
Q  164 atagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtga 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  1287849 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaga 1287750  T
Q  264 gtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttga 363  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||    
T  1287749 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 1287650  T
Q  364 tagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1287649 tagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccc 1287611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 70 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2075834 - 2075475
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2075834 gagatgaggatgttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacatta----gagagagagtgggggtaacacctacagta 2075739  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  2075738 gaaaagttggtagacaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 2075639  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaa-gacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||    
T  2075638 ttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 2075539  T
Q  369 cattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||  ||||||||    
T  2075538 tactatggcgtcatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 96 - 434
Target Start/End: Original strand, 14665658 - 14665994
Alignment:
Q  96 tggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttgg 195  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |    
T  14665658 tggtaagcctagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttag 14665757  T
Q  196 atggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  14665758 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctagg 14665857  T
Q  296 aaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
    ||||  ||| ||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  | |||||| |||||||  ||||||    
T  14665858 aaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac--tctggcgtaatttgatctatgtag 14665955  T
Q  396 ccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  14665956 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 14665994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 159 - 433
Target Start/End: Original strand, 20456780 - 20457054
Alignment:
Q  159 cacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaa 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  20456780 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgga 20456879  T
Q  259 ggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatt 358  Q
    || |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| ||||     
T  20456880 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaatttgatg 20456979  T
Q  359 tttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| |||  |||||||||    
T  20456980 tatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 20457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 10639219 - 10639584
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatag-- 167  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| || |||||||||      
T  10639219 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtggggctagcacctatagac 10639314  T
Q  168 -----taaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtg 262  Q
         || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||      
T  10639315 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggagg-- 10639412  T
Q  263 agtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttg 362  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | ||    
T  10639413 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 10639512  T
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  | ||||||| ||| |||||||||||    
T  10639513 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttggttgttgttgt 10639584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 241 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561386
Alignment:
Q  241 aagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgag 340  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  341 ttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| |||  ||||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgt 13561386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 244 - 432
Target Start/End: Original strand, 14911264 - 14911452
Alignment:
Q  244 agtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttg 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14911264 agtagatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttg 14911363  T
Q  344 aatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
     |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |||||  || |||||||||    
T  14911364 gatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggtttggttgttgtt 14911452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 210 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915496
Alignment:
Q  210 tagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgaga 309  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||| ||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  310 aaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaa 409  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||     
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg-gttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 2915521  T
Q  410 taggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | ||||||| ||| ||| |||||||    
T  2915520 tgggataaggcttggttattgttgt 2915496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 34272944 - 34273295
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagag------tgggggtaacacct 163  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||     |||||| |||||||||||||| | ||||||||||      |||||||| |||||    
T  34272944 gagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagaca-----ggattaggaatgacaccattagagagagagagagagagagtgggggtagcacct 34273038  T
Q  164 atagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtga 263  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||| | | |||||||||| |||                  
T  34273039 ataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaagaagaggaga-------------- 34273124  T
Q  264 gtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttga 363  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||    
T  34273125 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 34273224  T
Q  364 tagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| |||  | ||| |  |||||| |||||||||||||||    
T  34273225 tagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggcttagttgttgttgt 34273295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 26885040 - 26884721
Alignment:
Q  79 atgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaa-aaaagtt 177  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||    |||| ||||||||| |  |||||||    
T  26885040 atgttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgag----ggtagcacctatagcaggaaaagtt 26884945  T
Q  178 ggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaaga 277  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||  |||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  26884944 ggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaaga 26884845  T
Q  278 ggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatcc-aaatatgatttttgatagaacattatgg 376  Q
    |||||| || || ||| |||||   |  || |||| ||||| ||||| |||||||| |||| || | |||| ||||||||||| |||||||||| || |     
T  26884844 ggtagaggatgagctaggaaaa--ctaagaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacga 26884747  T
Q  377 cgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  26884746 cgcaatttgatccatgtagccgaccc 26884721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 285 - 434
Target Start/End: Original strand, 29816515 - 29816664
Alignment:
Q  285 gaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcattt 384  Q
    ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||    
T  29816515 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 29816614  T
Q  385 gattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  29816615 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29816664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 240 - 434
Target Start/End: Original strand, 27970 - 28164
Alignment:
Q  240 gaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatga 339  Q
    ||||||||||||| |||   | ||||||| | ||||||||| || |||||||||  ||||  ||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  27970 gaagagtagatcagatgcgtgagagtcagatcaaaagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataa 28069  T
Q  340 gttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||| |||||||    
T  28070 gttggatccaaatatgatttctgatagaacactatggcataatttgatacatgtagctgaccccatttagttagataagacttggtttttgttgt 28164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 306 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16914011 - 16913881
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccga-cccaa 404  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  16914011 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccca 16913912  T
Q  405 tttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
     ||| | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  16913911 cttagtgggataaggcttggttgttgttgta 16913881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 38501668 - 38501422
Alignment:
Q  184 aaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtaga 283  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| | ||||||||||||||| | ||| ||| ||||| | | ||||||| | ||    
T  38501668 aaataggtttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatgga 38501569  T
Q  284 tgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatt 383  Q
    |||||||||| || ||  ||   |||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| | || ||     
T  38501568 tgaagacctaggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaata 38501469  T
Q  384 tgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttg 430  Q
    ||||  |||||||||| || | ||| | ||||||||||| |||||||    
T  38501468 tgatcgatgtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 394
Target Start/End: Original strand, 36215422 - 36215730
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||  |||| | |||| |||||| ||||| |||||||  |||||    | |||||||||| |||| || ||||||||    
T  36215422 gagatgagtatgttgcgctagatgagcagtaaaactagatatgatatgattatgaatgac--catta----gggagagagtggaggtagcatctatagta 36215515  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||||| | || ||||| || | |  |||| ||| | ||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  36215516 gaaaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaagagtagatcggatggaggagagtcagg 36215615  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    | |||||||||||          | |||||  ||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||| || |||||||||    
T  36215616 tcaaaagaggtag----------aggaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaattgaatccaaacatgacttatgatagaac 36215705  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgta 394  Q
    | ||||  || ||||||||||||||    
T  36215706 actatgatgtgatttgattcatgta 36215730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 314 - 431
Target Start/End: Original strand, 39040918 - 39041035
Alignment:
Q  314 attagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatagg 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||  || | |||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||    
T  39040918 attagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggg 39041017  T
Q  414 ataagacttagttgttgt 431  Q
    |||||||||  |||||||    
T  39041018 ataagacttgattgttgt 39041035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 387
Target Start/End: Original strand, 14749295 - 14749542
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaa 239  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | || ||| |  ||||||    
T  14749295 agagagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggattctgttgtaa 14749394  T
Q  240 gaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatga 339  Q
    | ||||| ||||| ||| ||| ||||||  | |  | ||| ||| |||||||||  ||||  ||  ||||||| || |  || ||  ||||| | || ||    
T  14749395 ggagagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatcaagaaggatctagagattaacga 14749494  T
Q  340 gttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    |||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14749495 gttggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 434
Target Start/End: Original strand, 5558315 - 5558423
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||    
T  5558315 ttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggt 5558414  T
Q  426 tgttgttgt 434  Q
    ||| |||||    
T  5558415 tgtcgttgt 5558423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 387
Target Start/End: Original strand, 32516478 - 32516790
Alignment:
Q  68 cggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatag 167  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||  |||  ||||||| |||||      |||||||| || ||||||| |||||    
T  32516478 cggagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacatta------gagagagttggagtaacacttatag 32516571  T
Q  168 taaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtca 267  Q
    || ||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||| |||| |||  | |   |||||| |  | ||| | ||||||||||  |||||||  | |||    
T  32516572 tagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatca 32516671  T
Q  268 ggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgataga 367  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||  ||||||| ||||||  ||| |||||| | ||  ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  32516672 gattacaagaggtagaggaagacctaa-aaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgataga 32516770  T
Q  368 acattatggcgtcatttgat 387  Q
    | |||||| ||| |||||||    
T  32516771 atattatgacgtaatttgat 32516790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 418153 - 418066
Alignment:
Q  315 ttagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  418153 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccc 418066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 215
Target Start/End: Original strand, 15168744 - 15168855
Alignment:
Q  100 aagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatgg 199  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    ||| |||   ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  15168744 aagattagacgagataggattaagaatgacaccatta----gagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctaaggtgg 15168839  T
Q  200 tttggacatgtagaga 215  Q
    ||||||||||| ||||    
T  15168840 tttggacatgttgaga 15168855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 332 - 434
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213857
Alignment:
Q  332 gtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    |||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||| |    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttt 30213854  T
Q  432 tgt 434  Q
    |||    
T  30213855 tgt 30213857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 434
Target Start/End: Original strand, 18855800 - 18855889
Alignment:
Q  345 atccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  18855800 atccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18855889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442159
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgac 400  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgac 32442159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Original strand, 14667954 - 14668053
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  14667954 aatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgtagttgt 14668053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 437
Target Start/End: Original strand, 31220546 - 31220667
Alignment:
Q  315 ttagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatagga 414  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||| ||| ||| || |||||||  ||    
T  31220546 ttagaaaagattttgagatcaatgagttggatctaaatatgatttttgatag-atattatgatgtcatttgatccatatagtcgatcctatttaatgaga 31220644  T
Q  415 taagacttagttgttgttgtata 437  Q
    ||||  || ||||||||||||||    
T  31220645 taaggtttggttgttgttgtata 31220667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 434
Target Start/End: Original strand, 6788264 - 6788348
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||| || ||||||||    
T  6788264 aaatatgatttatgatagaacattatagcgtaatttgattcatgtagccgacctcacttagtagga-aagacttggtggttgttgt 6788348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 434
Target Start/End: Original strand, 2090575 - 2090695
Alignment:
Q  314 attagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatagg 413  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| | | ||    
T  2090575 attaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccattgagtggg 2090674  T
Q  414 ataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  2090675 ataaggctttgttgttgttgt 2090695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 362 - 434
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272759
Alignment:
Q  362 gatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctaagttgttgttgt 42272759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3442948 - 3442873
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||| ||| |||||||||    
T  3442948 tttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 3442873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4026627 - 4026540
Alignment:
Q  142 agagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagat 229  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  4026627 agagagagttggggtaacacgtaaagtaaaaaagatggtggaaactagtcttaggtggtttggacatgtagagaggagacctgtagat 4026540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 28186855 - 28186780
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | | ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  28186855 tgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgcagccgaccctactcaatgggataaggcttggttgttgttgtat 28186780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 403
Target Start/End: Original strand, 9235201 - 9235298
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccca 403  Q
    ||||||| ||||  |||||  ||||| | |||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  9235201 gagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccca 9235298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 434
Target Start/End: Original strand, 11675727 - 11675812
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  11675727 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtagtttaatccatgtagccgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 11675812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Original strand, 21952274 - 21952421
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacac----ctata 166  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||  |||| |||||  ||||||| |||||  ||||||||| || ||||||||||    |||||    
T  21952274 agatgaggatgttgcgttgcatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacagcatta--aagagagagggttggggtaacacacacctata 21952371  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||| ||||| ||| ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  21952372 gtagaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagag 21952421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411958
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28411958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 38132545 - 38132618
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  38132545 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38132618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 42576219 - 42576292
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  42576219 tgatagaacataatggcgtaatttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42576292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 434
Target Start/End: Original strand, 28276392 - 28276520
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| || |||||||  ||| |||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||| || | |     
T  28276392 gagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactccac 28276491  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||   ||||||| ||| |||||||||||    
T  28276492 ttagcgggataaggcttggttgttgttgt 28276520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31636212 - 31636124
Alignment:
Q  142 agagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatg 230  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||    
T  31636212 agagaaagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtggatg 31636124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408494
Alignment:
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 408494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 7359553 - 7359261
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaa 239  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |  | ||||    
T  7359553 agagagagagttcaggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagagagaagatatgtagattctgtagtaa 7359455  T
Q  240 gaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaacca-ttagaaaagacttagaggtcaatg 338  Q
    | ||||||||||| ||| |||  |||||  | |  ||||| ||| |||  ||||  |||| |||  ||||||| | |||||||| |  ||||| | |||     
T  7359454 ggagagtagatcagatggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactatttagaaaa-atctagagattaata 7359356  T
Q  339 agttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||| ||| ||||||| |||  |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| | ||| | ||| ||||||| |||||||||||    
T  7359355 agttggatcgaaatatggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggacaagacttggttgttgttgt 7359261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Original strand, 20367076 - 20367175
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||| | ||  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  20367076 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccacttggtaggataaggcttggttgttgttgt 20367175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 216
Target Start/End: Original strand, 33667209 - 33667280
Alignment:
Q  145 gagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  33667209 gagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagag 33667280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Original strand, 43475422 - 43475521
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||||| || ||||||| || |||||| || | | ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  43475422 aatgagttggatcgaaatatgatttatggtagaacgttatggtgtaatttgatccacgtagccaactccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 43475521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 12576959 - 12576861
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||||||||||||  ||||||| | | ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||| | ||| | ||||||  ||| ||||||||||    
T  12576959 aatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattatggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaagcttggttgttgttg 12576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 434
Target Start/End: Original strand, 41894273 - 41894355
Alignment:
Q  352 tatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  41894273 tatgaattatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagactttgttgttgttgt 41894355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 434
Target Start/End: Original strand, 2393038 - 2393158
Alignment:
Q  313 cattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatag 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||  ||| | |||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||| || | ||||| |    
T  2393038 cattagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 2393137  T
Q  413 gataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||  ||| |||||||||||    
T  2393138 gataaagctt-gttgttgttgt 2393158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15986992 - 15986879
Alignment:
Q  179 gtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagag 278  Q
    |||||||||||| || | |||||||| | ||||||||| ||||  |||||| | || ||||| ||||| ||||||||| |||  |||||| | | |||||    
T  15986992 gtagaaaataggtttaggtggtttgggcgtgtagagagaagatatgtagattctatagtaaggagagtggatcaaatggaggatagtcagatcacaagag 15986893  T
Q  279 gtagatgaagacct 292  Q
    ||| ||||||||||    
T  15986892 gtaaatgaagacct 15986879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 366 - 435
Target Start/End: Original strand, 27386554 - 27386623
Alignment:
Q  366 gaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| | | ||||||||||||    
T  27386554 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgttgta 27386623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 32366187 - 32366260
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || | ||||||| ||| |||||||||||    
T  32366187 tgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtggccaaccccatgtagtgggataaggcttggttgttgttgt 32366260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 42504355 - 42504294
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  42504355 ttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42504294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 204
Target Start/End: Original strand, 14667751 - 14667815
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttgg 204  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  14667751 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttgg 14667815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 397
Target Start/End: Original strand, 38657040 - 38657088
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagcc 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  38657040 aaatatgatttatgatagaacattatgatgtcgtttgattcatgtagcc 38657088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 218117 - 218050
Alignment:
Q  369 cattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  || | ||||||||||| |||||| ||||||    
T  218117 cattatggcgtcattagatccatgtagccgaccccacctagtgggataagacttggttgttattgtat 218050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 321
Target Start/End: Original strand, 31906626 - 31906830
Alignment:
Q  113 ataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtag 212  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    | ||||||||| | || ||||||| | || |||||||||| | |||||  ||| ||| |||| |||||||||    
T  31906626 ataggattaggaatgacatcatta----gggagagagtgagagtgacacctacaatagaaaagttggtcggaaatattcttagatagtttagacatgtag 31906721  T
Q  213 agagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaac 312  Q
    | || |||| | ||||||| ||  ||| |||| ||||||| ||||| | || ||  || |||| | |||||  || |||||||||||| || ||| ||||    
T  31906722 atagaagatacatagatgcaatcataaaaagaatagatcagatgaatgagaatcgagtcaaaaaaagtagaataaaacctaagaaaattatacgaaaaac 31906821  T
Q  313 cattagaaa 321  Q
    |||||||||    
T  31906822 cattagaaa 31906830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 395
Target Start/End: Original strand, 38684688 - 38684723
Alignment:
Q  360 ttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38684688 ttgatagaacattatggcgttatttgattcatgtag 38684723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 396
Target Start/End: Original strand, 6889147 - 6889237
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagc 396  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||||   | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  6889147 gagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 6889237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 9121156 - 9121078
Alignment:
Q  356 atttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||| ||| ||||| |||||    
T  9121156 atttttgacagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgtcgttgt 9121078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11002498 - 11002424
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||    
T  11002498 tttttgatagaacactatggcattgtttgattcatgtagtcgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgt 11002424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18351001 - 18350935
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    ||||||||| ||  ||||||| | |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  18351001 aatgagttggatagaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccgacc 18350935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 434
Target Start/End: Original strand, 36551318 - 36551428
Alignment:
Q  324 acttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagactta 423  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |  |||| ||||| ||  | ||||||| |||||||||||||| | ||| |  |||||| |||     
T  36551318 acttagagattaatgagttgcatccaaatatggtttgtattagatcattacggtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttg 36551417  T
Q  424 gttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||    
T  36551418 gttgttgttgt 36551428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 43557930 - 43557832
Alignment:
Q  337 tgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | | | |||||  ||||||||||||| | ||| | ||||||| | | ||||||||||||    
T  43557930 tgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcctggttgttgttgta 43557832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 5860043 - 5860116
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | ||| | ||||||| |||  ||||||||||    
T  5860043 tgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 5860116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15489786 - 15489705
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagat 221  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||| |  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15489786 agagagagagttggggtagtacctattgtagaaaagatggttgaaactcagcttagatggtttgggcatgtagagagaagat 15489705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 400
Target Start/End: Original strand, 30588630 - 30588695
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgac 400  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||    
T  30588630 aatgagttggatcgaaatatggtttataatagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgac 30588695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 79501 - 79577
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||| |   || | ||||||||||||||||||||    
T  79501 agagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagag 79577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 401
Target Start/End: Original strand, 1525849 - 1525893
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1525849 tttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccgacc 1525893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 393
Target Start/End: Original strand, 1935363 - 1935399
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgt 393  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1935363 tttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgt 1935399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 2712936 - 2713008
Alignment:
Q  144 agagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  2712936 agagagttggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagag 2713008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 6859373 - 6859445
Alignment:
Q  144 agagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| || ||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||    
T  6859373 agagagttggggtagcacctatagtgaagaagatggtggaaaacaggcataggtggtttggacacgtagagag 6859445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 432
Target Start/End: Original strand, 27800036 - 27800108
Alignment:
Q  360 ttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  27800036 ttgatagaacattatggtataatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 27800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 434
Target Start/End: Original strand, 29922494 - 29922566
Alignment:
Q  362 gatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  | ||  | ||||||| ||| |||||||||||    
T  29922494 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttggtgggataagccttggttgttgttgt 29922566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 43423563 - 43423496
Alignment:
Q  366 gaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  43423563 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccttttagtgggataaggctt-gttgttgttgt 43423496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5258513 - 5258148
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5258513 gcggaggtgagaatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttaga--gagagagagtgggggtagcacctata 5258416  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5258415 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 5258316  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||      
T  5258315 atgttaaaagaggtagagaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatccaaatatggtttttgatta 5258216  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  5258215 aacactatggcgtcatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgttgt 5258148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 71 - 394
Target Start/End: Original strand, 5631741 - 5632064
Alignment:
Q  71 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaa 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5631741 agatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtaacacctatagtag 5631840  T
Q  171 aaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggt 270  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  5631841 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagat 5631940  T
Q  271 taaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaaca 370  Q
    ||||||||  | | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5631941 taaaagagacaaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataaca 5632040  T
Q  371 ttatggcgtcatttgattcatgta 394  Q
     |||| ||||||||||| ||||||    
T  5632041 ctatgacgtcatttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 67 - 433
Target Start/End: Original strand, 608078 - 608442
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||      ||||||||| ||||| ||||||||    
T  608078 gcggagatgaggatgttccgttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccatta------gagagagtgagggtatcacctata 608171  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  608172 gtagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 608271  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacc----taagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttg 362  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  608272 agattaaaagaggttgatgaagacctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttg 608371  T
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  608372 atagaatactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttg 608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 67 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 35043804 - 35043439
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||| ||||||| |||||  ||||| |    
T  35043804 gcggagatgaagatgttgcgctggatgattggtaagattagacatgataggattatgaatgacaccatta----gagggagagtgagggtagtacctaaa 35043709  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | |||||    
T  35043708 gtagaaaagttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtc 35043609  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35043608 aggttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatag 35043509  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||| || || | ||||   |||||| ||| |||||||||||||    
T  35043508 aacactatgacgtcatttgatcaatgtagctgatcccacttaaagagataaggcttggttgttgttgtat 35043439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 28085298 - 28085658
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28085298 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 28085393  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||    | ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |    
T  28085394 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaag 28085493  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  28085494 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 28085593  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  28085594 actatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28085658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 32755841 - 32756203
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32755841 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattaga--gagagagagtgggggtagcacctatagta 32755938  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  32755939 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 32756038  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  32756039 ttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 32756138  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| | || |||||||| | |||||||||    
T  32756139 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggggtaagacttggatgttgttgt 32756203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20427999 - 20427636
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20427999 gcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctata 20427904  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||    
T  20427903 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatagaggggagtc 20427804  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  20427803 aggttacaagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaa-atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttaatag 20427705  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggat-aagacttagttgttgttgt 434  Q
    || | ||||||| ||||| ||  ||||||||||||| | ||| | |||| ||||||| |||||||||||    
T  20427704 aatactatggcgacatttaatcaatgtagccgacccgacttagtgggataaagacttggttgttgttgt 20427636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 67 - 431
Target Start/End: Original strand, 30031175 - 30031535
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||||||    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30031175 gcggagatgaggttgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccatta----gagagggagtgggggtagcacctata 30031270  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30031271 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 30031370  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||    
T  30031371 aggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatag 30031470  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||| | ||||||| ||| ||||||||    
T  30031471 aacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 30031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 67 - 436
Target Start/End: Original strand, 9706695 - 9707054
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| |||| |||||||     
T  9706695 gcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatta----gagagagagtggaggtagcacctatt 9706790  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||      ||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||  |||||    
T  9706791 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttg------tagagagaagacccatagaagccgttgttagaagagtagatcaaatggagaagagtc 9706884  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
    |||||||||||||||   ||||  ||||| ||| |||| || ||||| |||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9706885 aggttaaaagaggtacgggaagggctaagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 9706984  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  9706985 aacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 9707054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 94 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21352171 - 21351836
Alignment:
Q  94 agtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggctt 193  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| | |||      |||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21352171 agtggtaagactagatatgataggattaggaataacatcgtta------gagagagtggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggctt 21352078  T
Q  194 ggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagaccta 293  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21352077 agatgatttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttagaagaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagaccta 21351978  T
Q  294 agaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgt 393  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||    
T  21351977 agaaaaccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgt 21351878  T
Q  394 agccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    ||||||||  | ||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  21351877 agccgacctcagttagtgagataagacttcgtcgttgttgta 21351836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 14030728 - 14031077
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggt-aagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagt 168  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14030728 gagatgaggatgttgcgatggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta----gagagatagtgggggtagcacctatagt 14030823  T
Q  169 aaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcag 268  Q
    | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||| |    
T  14030824 agaaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcgg 14030923  T
Q  269 gttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||            ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14030924 attaaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaacattagaaaagatttagaggtcaatgggttagatccaaatatgatttttgatagaa 14031011  T
Q  369 cattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     | |||  ||||||||||| ||| || ||||||| ||||| | ||||||   || |||||||||||    
T  14031012 tactataacgtcatttgatccatataaccgaccctatttagtgggataaagtttggttgttgttgt 14031077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 143 - 434
Target Start/End: Original strand, 12890575 - 12890857
Alignment:
Q  143 gagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaa 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||          || |||||||| | |||||||    
T  12890575 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgtac---------ccatagatgccgtcgtaagaa 12890665  T
Q  243 gagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagtt 342  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  12890666 gagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagacgtcaatgagtt 12890765  T
Q  343 gaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
      ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  12890766 agatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12890857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10100220 - 10099994
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||||||||||||      |||||||||||||||  ||| ||||    
T  10100220 gcggagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccatt------agagagagtgggggtcgcacatata 10100127  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10100126 gtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtc 10100027  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaa 299  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10100026 agtttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa 10099994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9594075 - 9593766
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagaga--gagtgggggtaacaccta 164  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||  |||| |||||| ||||      
T  9594075 gcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccat 9593976  T
Q  165 tagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgag 264  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||   ||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  9593975 tagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagag 9593876  T
Q  265 tcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgat 364  Q
    |||  |   |||||||||| |||||||||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  9593875 tcaaat--caagaggtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgat 9593778  T
Q  365 agaacattatgg 376  Q
    ||||||||||||    
T  9593777 agaacattatgg 9593766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 387
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497194
Alignment:
Q  154 ggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaa-taggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatca 252  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||  | |||||||||| ||||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaaga-ccgtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  253 aatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaat 352  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||| |||  ||||  ||| |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33497062 aatgaagg--agtcaagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  353 atgatttttgatagaacattatggcgtcatttgat 387  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgat 33497194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 434
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679678
Alignment:
Q  163 tatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtg 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||  |    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  263 agtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttg 362  Q
    ||||| |||| |||||||| | ||||||           ||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||  | | | ||    
T  30679517 agtcaagttataagaggtataggaagac----------tattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataagacttggttgttgttgt 30679678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206459
Alignment:
Q  315 ttagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatagga 414  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  415 taagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||| ||| |||||||    
T  3206478 taagacttggttattgttgt 3206459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143765
Alignment:
Q  275 agaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattat 374  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| |||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  375 ggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgt 34143765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156381
Alignment:
Q  275 agaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattat 374  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| |||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  375 ggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgt 34156381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 222 - 395
Target Start/End: Original strand, 5080910 - 5081083
Alignment:
Q  222 ccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaa 321  Q
    ||||||||||  | |||||||||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||  |||    
T  5080910 ccgtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcattcaaaa 5081009  T
Q  322 agacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
      | |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  5081010 ttatttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28027185 - 28026877
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||    ||||||||| |||||||  | |||    || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  28027185 gagacgaggatgttatgttggatgagtggtaagactagatggcataggattaggaatgacgtcgtta----gatagagaatgggg-tagcacctatagta 28027091  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | | ||||||||  | ||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||     
T  28027090 gaaaatgtggtagaaaataggcttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagatggaggagagtcaga 28026992  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||  || |||||||||  ||||| ||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||| ||||  |||    
T  28026991 ttagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaatatggtttatgat--aac 28026894  T
Q  370 attatggcgtcatttga 386  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  28026893 attacggcgtaatttga 28026877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Original strand, 7133795 - 7133915
Alignment:
Q  201 ttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaat 300  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||     
T  7133795 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7133894  T
Q  301 cattcgagaaaccattagaaa 321  Q
     ||| ||||||||||||||||    
T  7133895 tattagagaaaccattagaaa 7133915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Original strand, 7136718 - 7136838
Alignment:
Q  201 ttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaat 300  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||     
T  7136718 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7136817  T
Q  301 cattcgagaaaccattagaaa 321  Q
     ||| ||||||||||||||||    
T  7136818 tattagagaaaccattagaaa 7136838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 185
Target Start/End: Original strand, 5080776 - 5080888
Alignment:
Q  69 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagt 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  5080776 ggagatgaggatgttgcgctggataactggtaagattagacataataagattaggaatgacaccatt----agagaacgagtgggggtatcacctatagt 5080871  T
Q  169 aaaaaagttggtagaaa 185  Q
    | |||||||||||||||    
T  5080872 agaaaagttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 326 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 34934938 - 34934829
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagt 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||    
T  34934938 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggt 34934839  T
Q  426 tgttgttgta 435  Q
    ||||||||||    
T  34934838 tgttgttgta 34934829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34633 - 34505
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    ||||||||||||  |||||  || || | ||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |     
T  34633 gagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 34534  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  34533 ttagtgggataagacttggttgttgttgt 34505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 402
Target Start/End: Original strand, 31819005 - 31819081
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31819005 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccc 31819081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2065119 - 2065013
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||| || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  2065119 gcggagatgaggatgctaccctggatgagcggtaagactacatatgataggattagtaatgacaccattagaaaaagagagagtgggggaagcacctata 2065020  T
Q  167 gtaaaaa 173  Q
    || ||||    
T  2065019 gtgaaaa 2065013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 436
Target Start/End: Original strand, 5095988 - 5096118
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    |||||||  |||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || |     
T  5095988 gagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccac 5096087  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    ||| | |||||||  || |||||||||||||    
T  5096088 ttagtgggataaggtttggttgttgttgtat 5096118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 361 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1615296 - 1615219
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtataa 438  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1615296 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgtataa 1615219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 6056123 - 6055773
Alignment:
Q  77 ggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta-aaaaag 175  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  6056123 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccatta------gagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaa 6056030  T
Q  176 ttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaa 275  Q
     |  ||| ||||||| ||   |||||||  ||||||||||| |||   |||||||   | ||   || ||||||||| ||| | | ||||||  | ||||    
T  6056029 attataggaaataggttttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtgcaaatagtagatcagatggaagagagtcaaataaaaa 6055930  T
Q  276 gaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatg 375  Q
     ||||||| |||||||||  ||||   |  ||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||  | | | ||||||||||| |    
T  6055929 aaggtagaggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacg 6055830  T
Q  376 gcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
     ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||| |||| ||| ||||||    
T  6055829 acgtaatttgatgcatgtagccgaacc-atttaatgagataacacttggttattgttg 6055773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12119729 - 12119675
Alignment:
Q  348 caaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12119729 caaatatgatttttaatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgaccc 12119675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10099022 - 10098896
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| | | |||||||||| ||   ||||||||||| ||||||  |||||| |     
T  10099022 gagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccccac 10098925  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| | |||||||||||  ||||||||||    
T  10098924 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 10098896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 283
Target Start/End: Original strand, 2689647 - 2689771
Alignment:
Q  159 cacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaa 258  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||   ||||||||| |  |||||||||||||||| ||  |    
T  2689647 cacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagataga 2689746  T
Q  259 ggtgagtcaggttaaaagaggtaga 283  Q
    |  |||||| || ||||||||||||    
T  2689747 gtagagtcatgtcaaaagaggtaga 2689771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18130885 - 18130813
Alignment:
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18130885 atagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacctaatgggataaggcttagttgttgttgta 18130813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24665887
Alignment:
Q  160 acctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagat 229  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagat 24665887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 401
Target Start/End: Original strand, 10453268 - 10453312
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10453268 tttttgatagaacactatggcgtcttttgattcatgtagccgacc 10453312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23888549 - 23888477
Alignment:
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23888549 atagaacattatggtgtaatttgatccatgtagcagaccccacctaatgggataaggcttagttgttgttgta 23888477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 402
Target Start/End: Original strand, 31818685 - 31818781
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||| ||||| ||||  || ||| | ||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31818685 gagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagtatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccc 31818781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 432
Target Start/End: Original strand, 7492550 - 7492669
Alignment:
Q  313 cattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaatag 412  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| |||||   || ||||||||||| | ||| | |    
T  7492550 cattaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtgg 7492649  T
Q  413 gataagacttagttgttgtt 432  Q
    ||||||  || |||||||||    
T  7492650 gataaggattggttgttgtt 7492669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 402
Target Start/End: Original strand, 8364679 - 8364806
Alignment:
Q  275 agaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattat 374  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||  ||  ||||||| ||||  ||||| |||||  | ||| ||||| |   ||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  8364679 agaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattat 8364778  T
Q  375 ggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8364779 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccc 8364806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 357 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30789151 - 30789076
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  30789151 tttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttggttgttgtt 30789076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Original strand, 24665985 - 24666059
Alignment:
Q  326 ttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgac 400  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | | |||||||   ||||||||||    
T  24665985 ttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccgac 24666059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 586059 - 586132
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||  |||  ||||||||||    
T  586059 tgatagaacattatgacgtcatttgattcatggagccgacctcacttaatgggataaaccttgattgttgttgt 586132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 134
Target Start/End: Original strand, 2689577 - 2689642
Alignment:
Q  69 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccat 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| || | | |||||||||| ||||||||||||    
T  2689577 ggagatgaggatgttgtgatggatgagcagtaagactaaataggataggattaggaatgacaccat 2689642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 431
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886383
Alignment:
Q  362 gatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataaggcttagttgttgt 21886383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 33084046 - 33084122
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||  ||||||||||    
T  33084046 agagagagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagag 33084122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 402
Target Start/End: Original strand, 33084135 - 33084179
Alignment:
Q  358 ttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33084135 ttttgatagaatactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccc 33084179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6641703 - 6641628
Alignment:
Q  140 agagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagaga 215  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| | |||||| ||| ||||||    
T  6641703 agagatagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggttgtttgggcatctagaga 6641628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 203
Target Start/End: Original strand, 13674636 - 13674679
Alignment:
Q  160 acctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttg 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13674636 acctatagtaaaaaagatggtagaaaatagacttgcatggtttg 13674679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 395
Target Start/End: Original strand, 32080633 - 32080712
Alignment:
Q  316 tagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||| ||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32080633 tagaaaagacttggagcttaaggagttggattaaattatgatttatgatataacattatggcgtaatttgatacatgtag 32080712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 399
Target Start/End: Original strand, 38976 - 39018
Alignment:
Q  357 tttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccga 399  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38976 tttttgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccga 39018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3210607 - 3210541
Alignment:
Q  335 aatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    ||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  3210607 aatgagttggatggaaatatgagttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgacc 3210541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 403
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568950
Alignment:
Q  337 tgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccca 403  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagccaaccca 9568950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 399
Target Start/End: Original strand, 32097934 - 32097984
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccga 399  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  32097934 aaatatgatttatgatataacattatggcgtaaattgatacatgtagccga 32097984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32949768 - 32949726
Alignment:
Q  359 tttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacc 401  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  32949768 tttgatagaacattatgacgtcgtttgattcatgtaaccgacc 32949726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4245957 - 4245872
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| | || |||||| || ||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||| ||||    
T  4245957 aaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgt 4245872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 433
Target Start/End: Original strand, 5053750 - 5053807
Alignment:
Q  376 gcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  5053750 gcgtcgtttgatcaatgtagccgaccccatttagtaggataaggcttggttgttgttg 5053807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 410
Target Start/End: Original strand, 7080541 - 7080598
Alignment:
Q  353 atgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaat 410  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7080541 atgatttttgataggactctatgacgtaatttgattcatgtagctaacccaatttaat 7080598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 8364582 - 8364635
Alignment:
Q  162 ctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagaga 215  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  8364582 ctatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Original strand, 26291700 - 26291843
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggta-acacctatagt 168  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||||||  ||||| |||||| |||| |||||| || |||| |  || |||||||  ||||| ||||||||| |    
T  26291700 gagatgatgatgttgtgttgaatgtgtggtaagtctagacttgatagtattaggaatgatactattaga--gatagagagttagggtagacacctataat 26291797  T
Q  169 aaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    | ||||  ||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||    
T  26291798 agaaaatatggtagaaaatagacttaggtggtttg--catgtagagag 26291843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 402
Target Start/End: Original strand, 28891474 - 28891527
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgaccc 402  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||| |||||||    
T  28891474 aaatatgatttatgatagaacattatggtgtaatttaatacatgtaaccgaccc 28891527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 6293729 - 6293677
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaa 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||    
T  6293729 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaaaattagactagatatgattaa 6293677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 9568588 - 9568648
Alignment:
Q  76 aggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccatta 136  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  9568588 aggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgatagaattataaatgacaacatta 9568648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 67 - 435
Target Start/End: Original strand, 82640 - 83001
Alignment:
Q  67 gcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctata 166  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  82640 gcggagatgaggatgttgcactggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctata 82735  T
Q  167 gtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||| ||| |||||||| ||| ||||     
T  82736 gtagaaaagttggtagaaaatgggcttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagt- 82834  T
Q  267 aggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatag 366  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  82835 -ggttaagagaggtagaggaagacctaggaaaactata-gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatag 82932  T
Q  367 aacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgta 435  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  82933 aacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgttgta 83001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 48202 - 48119
Alignment:
Q  348 caaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgt 431  Q
    |||||||| | | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||| |||||| || ||||||||||||    
T  48202 caaatatggtgtatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtaggattaggcttagttgttgt 48119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 70 - 434
Target Start/End: Original strand, 31390 - 31750
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31390 gagattaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatta----gagagagagtgggggtagcacctatagta 31485  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcagg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  31486 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31585  T
Q  270 ttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaac 369  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||    
T  31586 ttaaaagatgtagaggaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 31685  T
Q  370 attatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    | | ||  |||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  31686 actgtgaagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44158 - 44086
Alignment:
Q  144 agagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagag 216  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  44158 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagag 44086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 105 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1271 - 948
Alignment:
Q  105 tagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttgg 204  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||      ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1271 tagacaggataggattatgaatgacaccatta------gagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg 1178  T
Q  205 acatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcatt 304  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||  |||    
T  1177 ccatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatt 1078  T
Q  305 cgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaa 404  Q
     |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  1077 agagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgacccca 978  T
Q  405 tttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  977 tttagtgggataaggcttggttgttgttgt 948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 86968 - 86648
Alignment:
Q  69 ggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagt 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| | |||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||| | | |  | |      ||    
T  86968 ggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacaccattagagagagagagagagagagagaga------gt 86875  T
Q  169 aaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcag 268  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  86874 agaaaagttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcag 86775  T
Q  269 gttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaa 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||   || ||||||||| |||||| || ||||||||| |   |||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  86774 gttaaaagaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgatagaa 86675  T
Q  369 cattatggcgtcatttgattcatgtag 395  Q
    || |||| ||| ||||||| |||||||    
T  86674 cactatgacgtaatttgatccatgtag 86648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 262 - 436
Target Start/End: Original strand, 16688 - 16862
Alignment:
Q  262 gagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgattttt 361  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16688 gagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggttttt 16787  T
Q  362 gatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgtat 436  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | | ||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  16788 gatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 16862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4629 - 4280
Alignment:
Q  73 atgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagtaaaa 172  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  4629 atgaggatgttgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggattataaatgacaccattaga--gagagagagtgggg-tggcacctatagtagaa 4533  T
Q  173 aagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggtta 272  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| || |||  |||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||    
T  4532 aagttggtaaaaaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaagtta 4433  T
Q  273 aaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacatt 372  Q
    |||||||||          || |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||| || ||| | |||||||| |    
T  4432 aaagaggta----------taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaacact 4343  T
Q  373 atggcgtcatttgattcatgtagccga-cccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||    
T  4342 atgacgttatttgatccatgtaggcgacccccatttaatgggataaggcttggttcttgttgt 4280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 220 - 434
Target Start/End: Original strand, 4704 - 4918
Alignment:
Q  220 atccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattaga 319  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| | || ||||| |||  ||||||||||||||    
T  4704 atccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattaga 4803  T
Q  320 aaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataaga 419  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||  | ||||||      
T  4804 aaggatttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataacg 4903  T
Q  420 cttagttgttgttgt 434  Q
    ||| |||||||||||    
T  4904 cttggttgttgttgt 4918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25805 - 25686
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25805 gagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccatt----agagagagagtgggggtagcacctatagta 25710  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggctt 193  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  25709 gaaaagttggtagaaaataggctt 25686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 280 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25532
Alignment:
Q  280 tagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgt 379  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||| |||| |||    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  380 catttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||| || |||||||| ||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11958 - 11817
Alignment:
Q  70 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagattagacatgataggattaagaatgacaccattataaagagagagagtgggggtaacacctatagta 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11958 gagatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcaga--gagagatagtgggggtagcacctatagta 11861  T
Q  170 aaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtaga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  11860 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtaga 11817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11786 - 11565
Alignment:
Q  195 gatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaa 294  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||| ||| |||||     
T  11786 gatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaatacctag 11687  T
Q  295 gaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgta 394  Q
    |||||  ||| |||||| | |||||||  | ||||| ||||||  |||| |||||||| ||   |||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  11686 gaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttg--gtttgatagagtactatgacgtcatttgatccatgta 11589  T
Q  395 gccgacccaatttaataggataag 418  Q
    |||||||| | ||| |||||||||    
T  11588 gccgaccccacttagtaggataag 11565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 306 - 434
Target Start/End: Original strand, 485 - 613
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  485 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 584  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||| | ||||||| |||  ||||||||||    
T  585 ttagtgggataaggcttgattgttgttgt 613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 434
Target Start/End: Original strand, 14737 - 14865
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| |     
T  14737 gagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccac 14836  T
Q  406 ttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
     || | ||||||  ||| |||||||||||    
T  14837 gtagtgggataaatcttggttgttgttgt 14865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28962 - 28889
Alignment:
Q  361 tgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  28962 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 58354 - 58242
Alignment:
Q  306 gagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaat 405  Q
    |||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| | | | ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  58354 gagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgacccaac 58255  T
Q  406 ttaataggataag 418  Q
    ||| | |||||||    
T  58254 ttagtgggataag 58242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 397
Target Start/End: Original strand, 7431 - 7685
Alignment:
Q  142 agagagagtgggggtaacacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttggatggtttggacatgtagagagcagatccgtagatgccattgtaaga 241  Q
    |||||||||  ||||| ||| || |||| ||||||| |||||||| | |||| | |||||||| ||||||||||| ||    ||||||| | |  |||||    
T  7431 agagagagtctgggtagcacgtaaagtacaaaagtttgtagaaaacacgcttagttggtttgggcatgtagagagaaggcatgtagatgtcttcataaga 7530  T
Q  242 agagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagatgaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattagaaaagacttagaggtcaatgagt 341  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||| | || ||||||| |  || ||||| ||||||||  ||  || |||| ||||||||||| | |||||||| | |||    
T  7531 agagtatatcagatggaggagagtgaagtcaaaagag-tgtatcaagacataagaaaactataagataaactattagaaaagattcagaggtcatttagt 7629  T
Q  342 tgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagcc 397  Q
    || || |||||||| ||   ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  7630 tggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagcc 7685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 346 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16438
Alignment:
Q  346 tccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgtt 432  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| | | | | ||||||| |||||||||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 16438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 160409 - 160325
Alignment:
Q  349 aaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttg 433  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||| | ||| ||| ||| ||||||||||    
T  160409 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 160325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 428
Target Start/End: Original strand, 3648 - 3713
Alignment:
Q  363 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgt 428  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||    
T  3648 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 3713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 314 - 394
Target Start/End: Original strand, 39481 - 39561
Alignment:
Q  314 attagaaaagacttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgta 394  Q
    ||||| ||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||    
T  39481 attaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacatgatggcgtaatttaatccatgta 39561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 358 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 163270 - 163194
Alignment:
Q  358 ttttgatagaacattatggcgtcatttgattcatgtagccgacccaatttaataggataagacttagttgttgttgt 434  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| | ||||| | | |||| ||||  ||||||||||    
T  163270 ttttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatatagccgactccatttagtggaataaaacttgattgttgttgt 163194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University