View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20182_low_3 (Length: 405)

Name: NF20182_low_3
Description: NF20182
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20182_low_3
NF20182_low_3
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (4-398)||(39811811-39812203)
chr2 (1-379)||(32246651-32247031)
chr2 (1-280)||(44312563-44312842)
chr2 (1-366)||(19344287-19344655)
chr2 (1-366)||(19349145-19349513)
chr2 (1-314)||(11098843-11099155)
chr2 (1-314)||(14291356-14291669)
chr2 (1-314)||(9296317-9296630)
chr2 (23-314)||(25398386-25398675)
chr2 (23-314)||(25403524-25403813)
chr2 (136-314)||(3491751-3491930)
chr2 (135-221)||(8040059-8040147)
chr2 (136-218)||(40738844-40738926)
chr2 (314-392)||(11098714-11098790)
chr2 (139-230)||(13569331-13569425)
chr2 (135-230)||(21629943-21630040)
chr2 (136-230)||(28259178-28259274)
chr2 (135-230)||(10445444-10445542)
chr2 (135-230)||(17865202-17865300)
chr2 (135-230)||(20522219-20522317)
chr2 (166-314)||(25407653-25407802)
chr2 (135-230)||(34682334-34682432)
chr2 (137-230)||(34388859-34388955)
chr2 (314-392)||(9296189-9296265)
chr2 (314-392)||(14291722-14291798)
chr2 (135-230)||(14699008-14699105)
chr2 (137-230)||(10707252-10707348)
chr2 (139-230)||(8390150-8390244)
chr2 (136-221)||(31056044-31056131)
chr2 (135-230)||(33528621-33528719)
chr2 (135-230)||(39482930-39483028)
chr2 (135-221)||(16940219-16940307)
chr2 (135-221)||(17010884-17010972)
chr2 (136-230)||(23078471-23078567)
chr2 (136-230)||(42039670-42039766)
chr2 (314-377)||(25409860-25409922)
chr2 (135-220)||(33118135-33118222)
chr2 (136-219)||(36757774-36757859)
chr2 (139-199)||(1345574-1345635)
chr2 (139-199)||(2838063-2838124)
chr2 (140-199)||(35215586-35215646)
chr2 (140-199)||(35217963-35218023)
chr2 (314-377)||(3491981-3492043)
chr2 (157-219)||(27149306-27149369)
chr2 (139-219)||(2869705-2869787)
chr2 (140-196)||(45332181-45332238)
chr2 (140-199)||(23452237-23452297)
chr2 (140-199)||(36558864-36558924)
chr2 (140-199)||(36561141-36561201)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (4-398)||(31109406-31109798)
chr7 (1-398)||(12396778-12397173)
chr7 (1-390)||(12406198-12406585)
chr7 (1-398)||(24024150-24024546)
chr7 (4-366)||(19992182-19992544)
chr7 (1-366)||(21812092-21812457)
chr7 (1-225)||(4866596-4866820)
chr7 (17-314)||(20357463-20357761)
chr7 (98-366)||(24266054-24266326)
chr7 (17-314)||(2057842-2058147)
chr7 (120-366)||(24261175-24261423)
chr7 (1-314)||(1533359-1533669)
chr7 (120-366)||(16884914-16885162)
chr7 (23-314)||(21639701-21639988)
chr7 (120-334)||(16880058-16880273)
chr7 (23-314)||(21645899-21646186)
chr7 (136-314)||(18408764-18408943)
chr7 (136-314)||(18413641-18413819)
chr7 (314-392)||(20357334-20357410)
chr7 (316-392)||(4873310-4873384)
chr7 (314-392)||(1533231-1533307)
chr7 (314-392)||(2058202-2058278)
chr7 (135-230)||(29159802-29159900)
chr7 (137-220)||(21983285-21983370)
chr7 (135-230)||(46516310-46516408)
chr7 (135-230)||(49091660-49091758)
chr7 (136-230)||(44848685-44848781)
chr7 (135-230)||(2647696-2647794)
chr7 (135-230)||(33332450-33332548)
chr7 (135-218)||(9190021-9190106)
chr7 (135-218)||(20284088-20284173)
chr7 (135-230)||(55947-56044)
chr7 (135-218)||(2580389-2580474)
chr7 (135-219)||(35960815-35960901)
chr7 (135-218)||(9185178-9185263)
chr7 (314-377)||(21640039-21640101)
chr7 (314-377)||(21646237-21646299)
chr7 (135-230)||(4796667-4796765)
chr7 (136-215)||(47263678-47263757)
chr7 (136-219)||(2479337-2479421)
chr7 (139-199)||(28617258-28617319)
chr7 (314-377)||(18408993-18409055)
chr7 (137-220)||(21988909-21988992)
chr7 (140-199)||(31155911-31155971)
chr7 (314-377)||(18413869-18413931)
chr7 (140-199)||(1049296-1049356)
chr7 (140-199)||(2935497-2935557)
chr7 (140-199)||(3035953-3036013)
chr7 (136-199)||(5817303-5817366)
chr7 (140-199)||(7351652-7351712)
chr7 (136-183)||(8153466-8153514)
chr7 (140-199)||(9027194-9027254)
chr7 (140-199)||(22108295-22108355)
chr7 (140-199)||(22137306-22137366)
chr7 (140-199)||(40550055-40550115)
chr7 (140-199)||(40552333-40552393)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-398)||(15044553-15044948)
chr5 (1-398)||(43592145-43592541)
chr5 (1-398)||(1456985-1457380)
chr5 (1-398)||(27449680-27450076)
chr5 (1-398)||(43598590-43598986)
chr5 (1-398)||(43604082-43604478)
chr5 (1-398)||(43609574-43609970)
chr5 (1-398)||(27444836-27445232)
chr5 (4-366)||(28807429-28807790)
chr5 (4-336)||(37556506-37556839)
chr5 (4-336)||(37561328-37561661)
chr5 (1-313)||(30631274-30631586)
chr5 (58-314)||(31180138-31180394)
chr5 (4-366)||(2785245-2785608)
chr5 (4-366)||(33791186-33791549)
chr5 (4-366)||(31396843-31397208)
chr5 (4-366)||(31401700-31402065)
chr5 (23-314)||(38192064-38192353)
chr5 (23-314)||(38219289-38219578)
chr5 (23-314)||(24135740-24136028)
chr5 (125-366)||(33768169-33768417)
chr5 (136-314)||(35387663-35387842)
chr5 (314-392)||(30631640-30631716)
chr5 (314-392)||(31180447-31180523)
chr5 (136-230)||(9353333-9353429)
chr5 (136-230)||(36932351-36932447)
chr5 (136-230)||(10281751-10281848)
chr5 (136-230)||(15464532-15464628)
chr5 (314-392)||(24136080-24136156)
chr5 (137-230)||(11916972-11917068)
chr5 (136-230)||(14520230-14520326)
chr5 (135-221)||(17003970-17004058)
chr5 (135-230)||(3880298-3880396)
chr5 (139-230)||(12084176-12084269)
chr5 (136-230)||(19588746-19588843)
chr5 (135-218)||(28832258-28832343)
chr5 (314-377)||(35387893-35387955)
chr5 (135-218)||(42127423-42127508)
chr5 (140-199)||(4410241-4410301)
chr5 (314-377)||(38219629-38219691)
chr5 (135-215)||(31300612-31300694)
chr5 (140-199)||(15552464-15552524)
chr5 (140-199)||(31179371-31179431)
chr5 (140-199)||(31542953-31543013)
chr5 (140-199)||(31545299-31545359)
chr5 (140-193)||(27910675-27910729)
chr5 (4-77)||(33768049-33768122)
chr5 (135-218)||(24553520-24553604)
chr5 (140-199)||(3373137-3373197)
chr5 (140-199)||(10749919-10749979)
chr5 (140-199)||(15354575-15354635)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (4-392)||(14737406-14737792)
chr6 (4-382)||(28184372-28184754)
chr6 (4-392)||(14742266-14742651)
chr6 (1-398)||(11856838-11857236)
chr6 (1-398)||(22010520-22010915)
chr6 (4-379)||(28155412-28155786)
chr6 (1-379)||(6438367-6438743)
chr6 (4-366)||(6005287-6005650)
chr6 (4-366)||(16838614-16838977)
chr6 (4-366)||(33330297-33330662)
chr6 (112-366)||(33335794-33336049)
chr6 (33-314)||(5674685-5674966)
chr6 (136-230)||(5757479-5757575)
chr6 (314-392)||(5674557-5674633)
chr6 (136-230)||(21356036-21356132)
chr6 (135-220)||(10077176-10077263)
chr6 (135-230)||(5572241-5572339)
chr6 (135-219)||(31086485-31086571)
chr6 (4-181)||(5343350-5343527)
chr6 (136-220)||(4629954-4630040)
chr6 (135-230)||(31979512-31979610)
chr6 (135-230)||(22963699-22963796)
chr6 (135-230)||(23824597-23824694)
chr6 (148-230)||(21801344-21801429)
chr6 (158-218)||(22709041-22709102)
chr6 (157-230)||(18232867-18232942)
chr6 (135-218)||(5017482-5017567)
chr6 (135-199)||(31936586-31936651)
chr6 (17-80)||(30125944-30126008)
chr6 (140-199)||(12195515-12195575)
chr6 (285-366)||(5343628-5343710)
chr6 (140-199)||(4816231-4816291)
chr6 (140-199)||(5273216-5273276)
chr6 (140-199)||(19704567-19704627)
chr6 (140-199)||(20915356-20915416)
chr6 (140-199)||(26932562-26932622)
chr6 (140-199)||(29754709-29754769)
chr6 (140-199)||(33309110-33309170)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (1-398)||(9224230-9224625)
chr4 (1-398)||(9229017-9229412)
chr4 (1-379)||(45347658-45348036)
chr4 (1-392)||(51520323-51520713)
chr4 (1-379)||(45357138-45357515)
chr4 (1-379)||(5732528-5732907)
chr4 (1-379)||(3813890-3814266)
chr4 (4-342)||(18855596-18855933)
chr4 (1-266)||(56146664-56146930)
chr4 (1-314)||(24741809-24742121)
chr4 (18-312)||(29760527-29760821)
chr4 (308-398)||(18712589-18712677)
chr4 (136-218)||(28468542-28468625)
chr4 (135-230)||(10047378-10047476)
chr4 (314-392)||(24742174-24742250)
chr4 (314-392)||(29760874-29760951)
chr4 (135-230)||(39245993-39246091)
chr4 (135-230)||(36315230-36315327)
chr4 (135-230)||(36329439-36329536)
chr4 (136-230)||(31985635-31985730)
chr4 (135-230)||(16623293-16623391)
chr4 (136-230)||(5396672-5396768)
chr4 (135-221)||(38152449-38152537)
chr4 (133-218)||(5269204-5269291)
chr4 (136-230)||(3796519-3796616)
chr4 (137-220)||(5143260-5143345)
chr4 (137-220)||(5147678-5147763)
chr4 (135-221)||(24333808-24333896)
chr4 (137-230)||(3777550-3777645)
chr4 (141-221)||(6743425-6743507)
chr4 (135-230)||(16630680-16630778)
chr4 (135-218)||(25862035-25862120)
chr4 (140-199)||(16931789-16931849)
chr4 (140-199)||(16934143-16934203)
chr4 (140-199)||(22780373-22780433)
chr4 (140-199)||(44599838-44599898)
chr4 (157-230)||(39774305-39774380)
chr4 (135-220)||(54867183-54867269)
chr4 (140-199)||(6765117-6765177)
chr4 (140-199)||(7941596-7941656)
chr4 (140-199)||(18709164-18709224)
chr4 (140-199)||(22782738-22782798)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (1-398)||(34885-35280)
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (4-379)||(25328120-25328493)
chr8 (1-398)||(7289749-7290145)
chr8 (4-379)||(39784665-39785039)
chr8 (1-314)||(6311164-6311477)
chr8 (4-366)||(35745261-35745624)
chr8 (1-314)||(36979246-36979558)
chr8 (1-313)||(33037724-33038035)
chr8 (1-314)||(30655509-30655827)
chr8 (1-314)||(4759991-4760304)
chr8 (17-314)||(18853083-18853382)
chr8 (18-314)||(18870477-18870772)
chr8 (120-366)||(10684116-10684364)
chr8 (19-314)||(10689058-10689354)
chr8 (136-314)||(1261871-1262050)
chr8 (136-218)||(26287902-26287985)
chr8 (136-218)||(26301159-26301242)
chr8 (136-218)||(26313153-26313236)
chr8 (136-314)||(31071146-31071326)
chr8 (314-398)||(6311532-6311614)
chr8 (314-392)||(18870348-18870424)
chr8 (314-392)||(30655880-30655956)
chr8 (302-379)||(25327994-25328070)
chr8 (135-221)||(26403240-26403328)
chr8 (314-392)||(10688927-10689003)
chr8 (314-392)||(18852954-18853030)
chr8 (136-230)||(4456028-4456124)
chr8 (314-392)||(33037595-33037671)
chr8 (139-230)||(7412344-7412437)
chr8 (136-230)||(19175755-19175851)
chr8 (314-392)||(4759861-4759938)
chr8 (135-230)||(23799577-23799675)
chr8 (135-218)||(4696609-4696694)
chr8 (314-377)||(1261758-1261820)
chr8 (135-230)||(5702483-5702581)
chr8 (139-230)||(6127224-6127318)
chr8 (138-199)||(9765852-9765914)
chr8 (314-389)||(36979611-36979683)
chr8 (135-218)||(19752407-19752492)
chr8 (314-375)||(31071035-31071095)
chr8 (140-199)||(43079877-43079937)
chr8 (140-199)||(43082248-43082308)
chr8 (136-202)||(6813683-6813750)
chr8 (314-377)||(26288121-26288183)
chr8 (314-377)||(26301378-26301440)
chr8 (314-377)||(26313372-26313434)
chr8 (314-377)||(7412569-7412629)
chr8 (166-199)||(18810982-18811015)
chr8 (140-199)||(44721118-44721178)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (4-398)||(41398107-41398498)
chr1 (34-398)||(41390485-41390843)
chr1 (4-379)||(25444931-25445305)
chr1 (4-379)||(44023716-44024088)
chr1 (4-379)||(39445369-39445742)
chr1 (4-379)||(1054854-1055227)
chr1 (1-314)||(24787280-24787596)
chr1 (112-366)||(43988314-43988572)
chr1 (23-314)||(24202686-24202973)
chr1 (240-379)||(25439738-25439875)
chr1 (136-314)||(19358760-19358939)
chr1 (136-314)||(19361349-19361528)
chr1 (136-314)||(19379989-19380168)
chr1 (136-230)||(26644898-26644994)
chr1 (135-221)||(47703946-47704034)
chr1 (136-230)||(19072928-19073025)
chr1 (136-230)||(19120818-19120915)
chr1 (315-392)||(24787151-24787226)
chr1 (135-230)||(16124516-16124614)
chr1 (135-230)||(27104372-27104470)
chr1 (136-230)||(3281708-3281804)
chr1 (135-221)||(9476260-9476348)
chr1 (135-221)||(13598397-13598485)
chr1 (135-221)||(29651810-29651898)
chr1 (314-377)||(24202573-24202635)
chr1 (136-228)||(37069770-37069864)
chr1 (135-221)||(775671-775759)
chr1 (135-218)||(47098837-47098922)
chr1 (136-230)||(13604624-13604720)
chr1 (136-230)||(21536570-21536666)
chr1 (135-218)||(32889438-32889523)
chr1 (139-199)||(47102874-47102935)
chr1 (140-199)||(9459419-9459479)
chr1 (140-199)||(9463246-9463306)
chr1 (140-199)||(16226386-16226446)
chr1 (314-377)||(19366112-19366174)
chr1 (4-78)||(43988607-43988681)
chr1 (314-377)||(19361237-19361298)
chr1 (140-199)||(23786058-23786118)
chr1 (4-32)||(41386618-41386646)
chr1 (140-199)||(51752582-51752642)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (1-398)||(22173018-22173413)
chr3 (1-379)||(18656298-18656677)
chr3 (1-314)||(7167113-7167425)
chr3 (4-314)||(28503780-28504080)
chr3 (4-366)||(2676939-2677303)
chr3 (4-366)||(2672783-2673147)
chr3 (4-366)||(24967977-24968340)
chr3 (120-366)||(8512202-8512450)
chr3 (120-366)||(8517082-8517330)
chr3 (17-314)||(2671502-2671800)
chr3 (69-311)||(8738982-8739224)
chr3 (69-311)||(9091220-9091462)
chr3 (33-314)||(8477263-8477545)
chr3 (179-314)||(28501613-28501750)
chr3 (118-314)||(40372712-40372908)
chr3 (120-366)||(32475470-32475717)
chr3 (120-366)||(32480328-32480575)
chr3 (136-314)||(26928507-26928687)
chr3 (136-314)||(32143321-32143501)
chr3 (136-230)||(1305949-1306044)
chr3 (314-392)||(7167478-7167555)
chr3 (314-392)||(28501483-28501560)
chr3 (314-392)||(28503650-28503727)
chr3 (136-230)||(8370477-8370573)
chr3 (136-230)||(27974943-27975039)
chr3 (314-392)||(2671373-2671449)
chr3 (314-392)||(8477598-8477674)
chr3 (135-230)||(18552873-18552971)
chr3 (314-392)||(40372583-40372659)
chr3 (4-184)||(10207803-10207983)
chr3 (135-230)||(21711222-21711319)
chr3 (136-314)||(27452958-27453138)
chr3 (136-230)||(16264350-16264446)
chr3 (136-218)||(27986449-27986533)
chr3 (137-230)||(36029094-36029190)
chr3 (139-230)||(1736295-1736389)
chr3 (314-392)||(8738850-8738926)
chr3 (314-392)||(9091088-9091164)
chr3 (136-230)||(30709780-30709877)
chr3 (136-218)||(33386669-33386753)
chr3 (135-230)||(3715992-3716090)
chr3 (135-230)||(40592772-40592870)
chr3 (135-230)||(48438213-48438311)
chr3 (135-230)||(6794704-6794801)
chr3 (135-230)||(26298987-26299085)
chr3 (135-218)||(1417493-1417578)
chr3 (136-230)||(25795781-25795878)
chr3 (135-230)||(47923896-47923994)
chr3 (135-218)||(37466290-37466375)
chr3 (136-218)||(39039995-39040079)
chr3 (135-230)||(40844651-40844748)
chr3 (135-218)||(3328359-3328444)
chr3 (136-202)||(4386947-4387014)
chr3 (135-230)||(24695154-24695252)
chr3 (314-375)||(1306179-1306239)
chr3 (140-199)||(38210569-38210629)
chr3 (140-199)||(50494198-50494258)
chr3 (140-203)||(53894055-53894119)
chr3 (157-218)||(3323693-3323755)
chr3 (140-199)||(458483-458543)
chr3 (140-199)||(6063444-6063504)
chr3 (140-199)||(10621528-10621588)
chr3 (136-183)||(39153357-39153405)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (4-342)||(9521-9855)
scaffold0355 (222-398)||(3671-3845)
scaffold0355 (4-78)||(28-102)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (4-379)||(232-605)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (4-366)||(2103-2466)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (4-366)||(148808-149171)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (120-366)||(14161-14409)
scaffold0197 (4-366)||(19017-19380)
[»] scaffold0188 (4 HSPs)
scaffold0188 (23-314)||(17869-18157)
scaffold0188 (136-314)||(23962-24141)
scaffold0188 (314-377)||(17756-17818)
scaffold0188 (314-377)||(23849-23911)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (120-204)||(181980-182064)
scaffold0009 (271-366)||(176829-176925)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (136-230)||(8420-8516)
scaffold0140 (140-199)||(22343-22403)
scaffold0140 (140-199)||(24618-24678)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (137-230)||(85684-85779)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (136-230)||(43962-44058)
scaffold0087 (136-230)||(36833-36929)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (135-221)||(5682-5770)
scaffold0006 (135-221)||(2491-2579)
scaffold0006 (136-230)||(133281-133377)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (1-168)||(300-466)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (135-230)||(10728-10826)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (136-218)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (139-230)||(17266-17360)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (140-199)||(269-329)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (166-199)||(11500-11533)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (4-32)||(34136-34164)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (140-199)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 39812203 - 39811811
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39812203 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaaga 39812104  T
Q  104 caagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 203  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812103 taagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgaaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 39812005  T
Q  204 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812004 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactat 39811905  T
Q  304 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39811904 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttctc-aacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgcta 39811811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 32246651 - 32247031
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaaca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246651 tggtaatctatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaaca 32246750  T
Q  101 agacaagcggtaaaggaa---agaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 197  Q
    ||| ||||   |||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246751 agataagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 32246850  T
Q  198 caatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32246851 caatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattataccctttggtattttcccactctca 32246950  T
Q  298 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  32246951 cactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 32247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 44312842 - 44312563
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  44312842 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaac 44312744  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312743 aagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 44312645  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  44312644 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 44312563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 19344287 - 19344655
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaa 98  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||      
T  19344287 tggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata-- 19344382  T
Q  99 caagacaagcggtaaagg--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 196  Q
    ||||| || || |||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19344383 caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaat 19344482  T
Q  197 ccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactc 294  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  19344483 ccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccc 19344581  T
Q  295 tcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  19344582 tcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19344655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 19349145 - 19349513
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaa 98  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||      
T  19349145 tggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata-- 19349240  T
Q  99 caagacaagcggtaaagg--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 196  Q
    ||||| || || |||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19349241 caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaat 19349340  T
Q  197 ccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactc 294  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  19349341 ccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccc 19349439  T
Q  295 tcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  19349440 tcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19349513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11099155 - 11098843
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaa 98  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  11099155 tggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaa 11099059  T
Q  99 caagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 198  Q
    ||||| |||    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11099058 caagataaggaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 11098961  T
Q  199 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactct 295  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||| | ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11098960 aatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 11098862  T
Q  296 cacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  11098861 cacaatatgaaccctaaaa 11098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 14291356 - 14291669
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaa 98  Q
    |||||||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||    
T  14291356 tggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaa 14291453  T
Q  99 caagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 198  Q
    ||||| ||||   ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291454 caagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 14291551  T
Q  199 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactct 295  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| |  || ||| ||||||||    
T  14291552 aatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactct 14291650  T
Q  296 cacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  14291651 cacaatatgaaccctaaaa 14291669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9296630 - 9296317
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaa 98  Q
    |||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||    
T  9296630 tggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaa 9296533  T
Q  99 caagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 198  Q
    ||||| ||||   ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9296532 caagaaaagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatcc 9296435  T
Q  199 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactct 295  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||| |||  |||||  |||||||||||||| |  || ||| ||||||||    
T  9296434 aatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttatacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactct 9296336  T
Q  296 cacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  9296335 cacaatatgaaccctaaaa 9296317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 25398386 - 25398675
Alignment:
Q  23 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaaga 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||   ||||||| ||    
T  25398386 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 25398481  T
Q  122 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 219  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25398482 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 25398580  T
Q  220 aggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| |||||||  |||||  ||||| |||||||| || || |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25398581 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25398675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 25403524 - 25403813
Alignment:
Q  23 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaaga 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||   ||||||| ||    
T  25403524 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 25403619  T
Q  122 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 219  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25403620 acaaacacaccaaa-aagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 25403718  T
Q  220 aggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| |||||||  |||||  ||||| |||||||| || || |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25403719 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25403813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Original strand, 3491751 - 3491930
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  3491751 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 3491850  T
Q  234 tagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||| | ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3491851 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 3491930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Original strand, 8040059 - 8040147
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8040059 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 8040147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 40738844 - 40738926
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40738844 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11098790 - 11098714
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11098790 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 11098714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 230
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569425
Alignment:
Q  139 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 13569425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 21629943 - 21630040
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21629943 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 21630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259178
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 28259178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10445542 - 10445444
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  10445542 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10445444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 17865202 - 17865300
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17865202 caagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 17865300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 20522219 - 20522317
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20522219 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaaga 20522317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407802
Alignment:
Q  166 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| |||||||  |||||  |    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtc 25407751  T
Q  264 ctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||| |||||||| || || |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25407752 ctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25407802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34682432 - 34682334
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  34682432 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 34682334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388955
Alignment:
Q  137 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 34388955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9296265 - 9296189
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9296265 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaatagacactttctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 9296189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Original strand, 14291722 - 14291798
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14291722 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactatctacaaagacgctcaaccc-tttggttccctcct 14291798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14699105 - 14699008
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  14699105 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaaga 14699008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707252
Alignment:
Q  137 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10707252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390150
Alignment:
Q  139 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaaga 8390150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056131
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 31056131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33528719 - 33528621
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  33528719 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 33528621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 39482930 - 39483028
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  39482930 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaaga 39483028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16940307 - 16940219
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16940307 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16940219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17010972 - 17010884
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17010972 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17010884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23078567 - 23078471
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  23078567 aagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttagaaagagttacaaga 23078471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039670
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttacgaagagttacaaga 42039670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Original strand, 25409860 - 25409922
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  25409860 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 25409922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 33118135 - 33118222
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 220  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  33118135 caagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaa 33118222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36757859 - 36757774
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  36757859 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaaagtgtttcaaa 36757774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1345635 - 1345574
Alignment:
Q  139 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1345635 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatcca 1345574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2838124 - 2838063
Alignment:
Q  139 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2838124 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatcca 2838063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215646
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35215646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218023
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35218023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Original strand, 3491981 - 3492043
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  3491981 acccaaggtgtttacaatgttttttcc-aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 3492043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27149369 - 27149306
Alignment:
Q  157 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 219  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  27149369 ccaatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgatacaaa 27149306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2869787 - 2869705
Alignment:
Q  139 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 219  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  2869787 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 2869705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Original strand, 45332181 - 45332238
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 196  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45332181 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaat 45332238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 23452237 - 23452297
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23452237 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 23452297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 36558864 - 36558924
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36558864 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36558924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 36561141 - 36561201
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36561141 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36561201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31109798 - 31109406
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109798 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 31109700  T
Q  104 caagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 203  Q
     || |   ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109699 taaacaagaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatat 31109600  T
Q  204 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31109599 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttgatattttcccactctcacactat 31109500  T
Q  304 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31109499 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatatggttccctcctttgcta 31109406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 12396778 - 12397173
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  12396778 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaac 12396876  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12396877 aagataagcggtaaagggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 12396975  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  12396976 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcctttaatctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactatcac 12397075  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12397076 aatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 12397173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Original strand, 12406198 - 12406585
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  12406198 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaac 12406296  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12406297 aagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatcca 12406395  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga-ctctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12406396 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcac 12406495  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctc 390  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12406496 aatatgaaccctaaaagccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctc 12406585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24024546 - 24024150
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||    
T  24024546 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcc-tatgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaa 24024449  T
Q  99 caagacaagcggtaaaggaaagaacaaaa-caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 197  Q
    ||||| ||||   ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024448 caagataagcaagaaaaggaagaacaaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 24024349  T
Q  198 caatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024348 caatatgagaaagtgttacaaaatgttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctca 24024249  T
Q  298 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgct 397  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24024248 cacgatgaaccctaaaacccacggtgattacaatgttttt-ccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 24024151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 19992182 - 19992544
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||    
T  19992182 taatcaatgagaacaaatggcttccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaag 19992279  T
Q  103 acaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 201  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992280 ataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 19992379  T
Q  202 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992380 atgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacac 19992478  T
Q  301 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||    
T  19992479 tatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccccaacctaagaaacactcacatcaaag 19992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21812457 - 21812092
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattcca-aagcataaac 99  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||    
T  21812457 tggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagttaacaagcataaac 21812360  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 198  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21812359 aagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatcc 21812260  T
Q  199 aatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tc-aagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctc 296  Q
    |||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21812259 aatatgtg-aagtcttacaaaaggttccaagactctagcttgtcaaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctc 21812162  T
Q  297 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  21812161 acactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgtttttccccaacctaagaaacactctcatcaaag 21812092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 4866596 - 4866820
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaa-ccacacaaga-gattccaaagcataaa 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||    
T  4866596 tggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaa 4866694  T
Q  99 caagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 198  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866695 caagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 4866793  T
Q  199 aatatgagaaagtgttacaaaaggtta 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4866794 aatatgagaaagtgttacaaaaggtta 4866820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20357761 - 20357463
Alignment:
Q  17 caaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaa 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||   |||    
T  20357761 caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaa 20357664  T
Q  115 ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 214  Q
     | |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357663 aggaagaacaaaatacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 20357565  T
Q  215 acaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaa 312  Q
    ||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20357564 acaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctttacacaagaacatgccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaa 20357465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24266326 - 24266054
Alignment:
Q  98 acaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 195  Q
    |||||| || || |||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266326 acaagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 24266227  T
Q  196 tccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccact 293  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||      
T  24266226 tccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaac 24266128  T
Q  294 ctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  24266127 ctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 24266054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Original strand, 2057842 - 2058147
Alignment:
Q  17 caaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaa----caagacaagcgg 110  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||  || || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    ||||| ||||      
T  2057842 caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaa 2057941  T
Q  111 taaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaa 209  Q
    |||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2057942 taaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaa 2058040  T
Q  210 gtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaa 306  Q
    |||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| | || | ||| |||||||||||| ||||||    
T  2058041 gtgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaa 2058139  T
Q  307 ccctaaaa 314  Q
    ||||||||    
T  2058140 ccctaaaa 2058147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 120 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24261423 - 24261175
Alignment:
Q  120 gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 219  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24261423 gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 24261324  T
Q  220 ag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 317  Q
    || ||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||    
T  24261323 agagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatccc 24261225  T
Q  318 aaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||  |||||||| |||||    
T  24261224 aagatgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 24261175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1533669 - 1533359
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaac-agccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||  |||    
T  1533669 tggtaatcaatgagaaaaaa--gtttccaagc-aacaacaacaaaaccagccccagtctagtgtagagcaacaccaca-aagagaatacaaagca--aac 1533576  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 198  Q
    || | ||||   |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1533575 aatataagcaagaaag-aaagaacaaacacacc-aataagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 1533478  T
Q  199 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacac-ataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactc 294  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||| | ||||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1533477 aatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgttttcccactc 1533379  T
Q  295 tcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  1533378 tcacaatatgaaccctaaaa 1533359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 366
Target Start/End: Original strand, 16884914 - 16885162
Alignment:
Q  120 gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 219  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  16884914 gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaa 16885013  T
Q  220 aggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggt-attttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 317  Q
      ||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||||||  |||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||  || |||    
T  16885014 gagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatccc 16885112  T
Q  318 aaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||  |||||||| |||||    
T  16885113 aagatgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 16885162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 21639701 - 21639988
Alignment:
Q  23 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaaga 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||  ||||| | |||||||  ||||||| ||||   ||||||| ||    
T  21639701 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 21639794  T
Q  122 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 219  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  21639795 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaa 21639893  T
Q  220 aggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21639894 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 21639988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 120 - 334
Target Start/End: Original strand, 16880058 - 16880273
Alignment:
Q  120 gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 219  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  16880058 gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaa 16880157  T
Q  220 aggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggt-attttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 317  Q
      ||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||||||  |||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||  || |||    
T  16880158 gagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatccc 16880256  T
Q  318 aaggtgattacaatgtt 334  Q
    ||| |||||||||||||    
T  16880257 aagatgattacaatgtt 16880273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 21645899 - 21646186
Alignment:
Q  23 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaaga 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||  ||||| | |||| ||  ||||||| ||||   ||||||| ||    
T  21645899 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaaaca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 21645992  T
Q  122 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 219  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  21645993 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaa 21646091  T
Q  220 aggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21646092 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 21646186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Original strand, 18408764 - 18408943
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  18408764 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 18408863  T
Q  234 tagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    || | | ||||| |||||||  |||||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18408864 taacttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18408943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Original strand, 18413641 - 18413819
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  18413641 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 18413739  T
Q  234 tagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||  | ||||| |||||||  |||||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18413740 tagattgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18413819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20357410 - 20357334
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20357410 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 20357334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 316 - 392
Target Start/End: Original strand, 4873310 - 4873384
Alignment:
Q  316 ccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4873310 ccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcct 4873384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1533307 - 1533231
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1533307 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 1533231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Original strand, 2058202 - 2058278
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2058202 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 2058278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 29159802 - 29159900
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  29159802 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 29159900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 220
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983370
Alignment:
Q  137 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 220  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 21983370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46516408 - 46516310
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  46516408 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 46516310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 49091660 - 49091758
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  49091660 caagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 49091758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848685
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 44848685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2647794 - 2647696
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2647794 caagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 2647696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33332548 - 33332450
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  33332548 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 33332450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9190106 - 9190021
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9190106 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9190021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Original strand, 20284088 - 20284173
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  20284088 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 20284173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 55947 - 56044
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  55947 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 56044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Original strand, 2580389 - 2580474
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  2580389 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 2580474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Original strand, 35960815 - 35960901
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 219  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  35960815 caagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9185263 - 9185178
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9185263 caagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Original strand, 21640039 - 21640101
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21640039 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 21640101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Original strand, 21646237 - 21646299
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21646237 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 21646299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4796765 - 4796667
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  4796765 caagattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaaga 4796667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263757
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga--gcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta 47263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 219
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479421
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 2479421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28617319 - 28617258
Alignment:
Q  139 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28617319 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatcca 28617258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Original strand, 18408993 - 18409055
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  18408993 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 18409055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 220
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21988992
Alignment:
Q  137 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 220  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggag--gagagcaactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaa 21988992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155971
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Original strand, 18413869 - 18413931
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  18413869 acccaaggtgtttacattgtttttccc-aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 18413931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 1049296 - 1049356
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1049296 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 1049356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2935557 - 2935497
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2935557 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 2935497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3036013 - 3035953
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3036013 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 3035953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5817366 - 5817303
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5817366 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctactctgggg-agagagcagctctccaatcca 5817303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 7351652 - 7351712
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7351652 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatcca 7351712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8153514 - 8153466
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  8153514 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 8153466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 9027194 - 9027254
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9027194 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatcca 9027254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22108355 - 22108295
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22108355 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22108295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22137366 - 22137306
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22137366 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22137306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40550115 - 40550055
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40550115 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40550055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40552393 - 40552333
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40552393 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40552333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 15044553 - 15044948
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044553 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaaca 15044652  T
Q  101 agacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 200  Q
    ||| ||||   ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044653 agataagcaagaaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaa 15044751  T
Q  201 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044752 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 15044851  T
Q  301 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15044852 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 15044948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 43592145 - 43592541
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  43592145 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaac 43592244  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| ||| | |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592245 aagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 43592343  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||      
T  43592344 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctctt 43592443  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  43592444 aatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 43592541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 1457380 - 1456985
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  1457380 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaac 1457281  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| |||    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457280 aagataagaaagaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 1457183  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga-ctctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1457182 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcac 1457083  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1457082 aatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 1456985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 27449680 - 27450076
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  27449680 tggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaac 27449779  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| ||| | |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449780 aagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 27449878  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||      
T  27449879 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctctt 27449978  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27449979 aatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 27450076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 43598590 - 43598986
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  43598590 tggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaac 43598689  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| ||| | |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598690 aagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 43598788  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||      
T  43598789 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctctt 43598888  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  43598889 aatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 43598986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 43604082 - 43604478
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  43604082 tggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaac 43604181  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| ||| | |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604182 aagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 43604280  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||      
T  43604281 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctctt 43604380  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  43604381 aatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 43604478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 43609574 - 43609970
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  43609574 tggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaac 43609673  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| ||| | |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609674 aagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 43609772  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||      
T  43609773 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctctt 43609872  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  43609873 aatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 43609970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 27444836 - 27445232
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  27444836 tggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaac 27444935  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| ||| | |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27444936 aagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 27445034  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||      
T  27445035 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctctt 27445134  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27445135 aatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 27445232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28807790 - 28807429
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaa--ccacacaa-gagattccaaagcataaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||| |  ||| |||||||||    
T  28807790 taatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaa-gcataaaca 28807693  T
Q  101 agacaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807692 agataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 28807593  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 299  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807592 atatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 28807495  T
Q  300 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  28807494 ctatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaacactctcatcaaag 28807429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 37556839 - 37556506
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||    
T  37556839 taatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaa 37556742  T
Q  102 gacaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 200  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556741 gataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 37556642  T
Q  201 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556641 tatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 37556543  T
Q  300 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttt 336  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37556542 ctatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttt 37556506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 37561661 - 37561328
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||    
T  37561661 taatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaa 37561564  T
Q  102 gacaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 200  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561563 gataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 37561464  T
Q  201 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561463 tatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 37561365  T
Q  300 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttt 336  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37561364 ctatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttt 37561328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 30631274 - 30631586
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | | ||||  ||||||||||||    
T  30631274 tggtaatctatgagaacaaatggttttcaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaac 30631372  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| |||    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631373 aagataagtaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgactcagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 30631470  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30631471 atatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctca 30631570  T
Q  298 cactatgaaccctaaa 313  Q
    || |||||||||||||    
T  30631571 caatatgaaccctaaa 30631586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 314
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180394
Alignment:
Q  58 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 156  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||    ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-gaaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcag 31180235  T
Q  157 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  31180236 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacaca- 31180334  T
Q  255 aaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  31180335 agacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccataaaa 31180394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 2785245 - 2785608
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  |||    
T  2785245 taatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caa 2785340  T
Q  102 gacaagcggtaaagg--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    || || || |||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785341 gataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 2785439  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2785440 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagctttactcatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctca 2785538  T
Q  298 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  2785539 cactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 2785608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 33791186 - 33791549
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||| |  ||| |||||  |||    
T  33791186 taatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaa-gcata--caa 33791281  T
Q  102 gacaagcggtaaagg--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    || || || |||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33791282 gataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatcca 33791380  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33791381 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctca 33791479  T
Q  298 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  33791480 cactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33791549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31397208 - 31396843
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  |||    
T  31397208 taatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacatcc-taagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caa 31397113  T
Q  102 gacaagcggtaaaggaaagaaca-aaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 200  Q
    || || || |||| ||||  | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397112 gataaacgataaaagaaaacaaacaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 31397013  T
Q  201 tatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacaca--taaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctc 296  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||    || ||| |||||| |||||||||||| |||||||||  |||    
T  31397012 tatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaaccctaga-tctaccctttggcattttcccatcctc 31396914  T
Q  297 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  31396913 acactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 31396843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31402065 - 31401700
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  |||    
T  31402065 taatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caa 31401970  T
Q  102 gacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    || || || |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31401969 gataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatcca 31401871  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacaca--taaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactct 295  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||    || |||  ||||| |||||||||||| |||||||||  ||    
T  31401870 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaactctaga-tctaccctttggcattttcccatcct 31401772  T
Q  296 cacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  31401771 cacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 31401700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 38192064 - 38192353
Alignment:
Q  23 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaaga 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||   ||||||| ||    
T  38192064 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 38192159  T
Q  122 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 219  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38192160 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 38192258  T
Q  220 aggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| |||||||  |||||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38192259 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 38192353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 38219289 - 38219578
Alignment:
Q  23 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaaga 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||   ||||||| ||    
T  38219289 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 38219384  T
Q  122 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 219  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38219385 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 38219483  T
Q  220 aggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| |||||||  |||||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38219484 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 38219578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 24135740 - 24136028
Alignment:
Q  23 gtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaa 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||  ||| | | |||||||  ||||||| ||||   ||| | |||||    
T  24135740 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccaca--agataatacaaagca--aacaagataagctagaaaaggaagaa 24135835  T
Q  123 caaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 220  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||     
T  24135836 caaacacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgttacaaag 24135934  T
Q  221 ggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    ||||||||| |   |||| | ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  24135935 ggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatgtgaaccctaaaa 24136028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 125 - 366
Target Start/End: Original strand, 33768169 - 33768417
Alignment:
Q  125 aaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  33768169 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagt 33768268  T
Q  224 tacaagactctagc-cttcaagctttacacataaacaaagcctagattctacccttt--ggtattttccc-actc--tcacactatgaaccctaaaaccc 317  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||  | ||||||||| || |   |||||||||||||   || |||    
T  33768269 tacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttcggttattttccctacccctccacactatgaaccaataatccc 33768367  T
Q  318 aaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  33768368 aaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33768417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Original strand, 35387663 - 35387842
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  35387663 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 35387762  T
Q  234 tagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||| | ||||| |||||||  || ||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35387763 tagcttgcaagc-ttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 35387842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Original strand, 30631640 - 30631716
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30631640 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcct 30631716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Original strand, 31180447 - 31180523
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31180447 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 31180523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353333
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 9353333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932351
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36932351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281848
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10281848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464628
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 15464628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Original strand, 24136080 - 24136156
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24136080 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactttctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 24136156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916972
Alignment:
Q  137 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 11916972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520326
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 14520326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17004058 - 17003970
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  17004058 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaag 17003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 3880298 - 3880396
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3880298 caagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3880396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12084176
Alignment:
Q  139 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 12084176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588843
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19588843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Original strand, 28832258 - 28832343
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  28832258 caagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 28832343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Original strand, 35387893 - 35387955
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35387893 acccaaggtgattacaatgttttttccaa-cccaagagaccctctctacaaagacactcaaccc 35387955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42127508 - 42127423
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||    
T  42127508 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaa 42127423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410241
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 4410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Original strand, 38219629 - 38219691
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  38219629 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 38219691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31300694 - 31300612
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 215  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||    
T  31300694 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatccactaagatgaaagtgtta 31300612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552464
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 15552464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179431
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31179431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542953
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31542953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545299
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31545299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910675
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 193  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27910675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 77
Target Start/End: Original strand, 33768049 - 33768122
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccaca 77  Q
    ||||| |||||  ||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33768049 taatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccaca 33768122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24553604 - 24553520
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||    
T  24553604 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagcagc-ctccactccactaagatgaaagtgttacaa 24553520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 3373137 - 3373197
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3373137 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 3373197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10749979 - 10749919
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10749979 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 10749919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 15354575 - 15354635
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15354575 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 15354635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14737792 - 14737406
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa--gagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||    
T  14737792 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaa 14737694  T
Q  102 gacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 201  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737693 gataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 14737595  T
Q  202 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737594 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacact 14737495  T
Q  302 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14737494 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcct 14737406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 4 - 382
Target Start/End: Original strand, 28184372 - 28184754
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaa--tggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184372 taatcaatgagaacaaaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaa 28184471  T
Q  102 gacaagcggtaaag-gaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 200  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28184472 gataagcggtaaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaa 28184570  T
Q  201 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184571 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaacactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 28184670  T
Q  301 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatg--tttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28184671 tatgaaccctaaaacccaaggtgattactatgtttttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagaccctcaacccatttg 28184754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 4 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14742651 - 14742266
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  14742651 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaag 14742553  T
Q  103 acaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 202  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742552 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaata 14742454  T
Q  203 tgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742453 tgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 14742354  T
Q  303 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14742353 tgaaccctaaaacccaaagtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacacttaaccca-ttggttccctcct 14742266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 11856838 - 11857236
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  11856838 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaac 11856936  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaa---caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 196  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11856937 aagacaagcgataaaaggaagaacaaaaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaat 11857035  T
Q  197 ccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga-ctctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactct 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11857036 ccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 11857135  T
Q  296 cacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatg 395  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11857136 cacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttg 11857233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22010915 - 22010520
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22010915 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaac 22010817  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010816 aagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 22010718  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22010717 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttgatatttccccactctcac 22010618  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22010617 aatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 22010520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28155786 - 28155412
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||    
T  28155786 taatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacag-cctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaa 28155689  T
Q  102 gacaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 200  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155688 gataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 28155589  T
Q  201 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155588 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatttagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacac 28155490  T
Q  301 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  28155489 tatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 28155412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 6438367 - 6438743
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||    
T  6438367 tggtaatcaatgagaaccaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaac 6438464  T
Q  100 aagacaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 198  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438465 aagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 6438564  T
Q  199 aatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6438565 aatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctca 6438662  T
Q  298 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  6438663 cactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 6438743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 6005287 - 6005650
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  |||    
T  6005287 taatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caa 6005382  T
Q  102 gacaagcggtaaagg--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    || || || |||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005383 gataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 6005481  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6005482 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctca 6005580  T
Q  298 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  6005581 cactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 6005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 16838614 - 16838977
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  |||    
T  16838614 taatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caa 16838709  T
Q  102 gacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    || || || |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838710 gataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatcca 16838808  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16838809 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctca 16838907  T
Q  298 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  16838908 cactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 16838977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33330662 - 33330297
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacac-aagagattccaaagcataaaca 100  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |  ||| |||||| ||    
T  33330662 taatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-ca 33330566  T
Q  101 agacaagcggt--aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 198  Q
    ||| || |  |  |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330565 agataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 33330467  T
Q  199 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctc 296  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  33330466 aatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctc 33330368  T
Q  297 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  33330367 acactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33330297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 112 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33336049 - 33335794
Alignment:
Q  112 aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagt 211  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  33336049 aaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt 33335951  T
Q  212 gttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 309  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33335950 gttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccc 33335852  T
Q  310 taaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  33335851 taaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33335794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5674966 - 5674685
Alignment:
Q  33 caacaacaacaaaac-agccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acac 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||  ||||| | ||||   |||| |||||||||| ||||    
T  5674966 caacaacaacaaaaccagccctagtctagtgtagagcaacaccaca-aagagaatacaaagca--aacaatataagcaagaaag-aaagaacaaacacac 5674871  T
Q  131 cgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag 229  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5674870 caaaga-gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 5674772  T
Q  230 --actctagccttcaagctttacac-ataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
      ||  |||| | ||||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5674771 aaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 5674685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757479
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 5757479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5674633 - 5674557
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5674633 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 5674557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356132
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttactaagagttacaaga 21356132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10077263 - 10077176
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 220  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10077263 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 10077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5572339 - 5572241
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5572339 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 5572241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31086571 - 31086485
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31086571 caagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 31086485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Original strand, 5343350 - 5343527
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacac-aagagattccaaagcataaaca 100  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||| |  ||| |||||  ||    
T  5343350 taatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--ca 5343445  T
Q  101 agacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggaga 181  Q
    ||| || || |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5343446 agataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 220
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630040
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 220  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaa 4630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 31979512 - 31979610
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  31979512 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaaga 31979610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 22963699 - 22963796
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22963699 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 22963796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23824694 - 23824597
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23824694 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 23824597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801344
Alignment:
Q  148 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaaga 21801344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Original strand, 22709041 - 22709102
Alignment:
Q  158 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22709041 caatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 18232867 - 18232942
Alignment:
Q  157 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18232867 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 18232942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5017567 - 5017482
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5017567 caagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Original strand, 31936586 - 31936651
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31936586 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30126008 - 30125944
Alignment:
Q  17 caaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa 80  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  30126008 caaatggtctccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaa 30125944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195575
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 12195575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 366
Target Start/End: Original strand, 5343628 - 5343710
Alignment:
Q  285 tttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||  |||||||| |||||    
T  5343628 tttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 5343710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 4816231 - 4816291
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4816231 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 4816291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 5273216 - 5273276
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5273216 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 5273276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 19704567 - 19704627
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19704567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 19704627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 20915356 - 20915416
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20915356 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 20915416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 26932562 - 26932622
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26932562 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 26932622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 29754709 - 29754769
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29754709 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 29754769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33309170 - 33309110
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33309170 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 33309110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9224625 - 9224230
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  9224625 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaac 9224527  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224526 aagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9224428  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9224427 atatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcac 9224328  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9224327 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatg-ttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 9224230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9229412 - 9229017
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  9229412 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaac 9229314  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229313 aagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9229215  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga-ctctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9229214 atatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcac 9229115  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9229114 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatg-ttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 9229017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45348036 - 45347658
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaaca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45348036 tggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaaca 45347937  T
Q  101 agacaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347936 agataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatcca 45347838  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagac-tctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347837 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagacctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcac 45347738  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  45347737 actatgaaccctaaaccccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagagacactctcatcaaaggcacacaccccat 45347658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 51520323 - 51520713
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  51520323 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaac 51520422  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| ||| | |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520423 aagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 51520521  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||      
T  51520522 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctctt 51520621  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51520622 aatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcct 51520713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45357515 - 45357138
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaaca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45357515 tggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaaca 45357416  T
Q  101 agacaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357415 agataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatcca 45357317  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357316 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 45357217  T
Q  300 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  45357216 ctatgaaccctaaaccccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 45357138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 5732528 - 5732907
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||  |||    
T  5732528 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aac 5732625  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaa----caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 195  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732626 aagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 5732725  T
Q  196 tccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactct 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5732726 tccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactct 5732824  T
Q  296 cacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  5732825 cacactataaacccttaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 5732907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 3813890 - 3814266
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaa-ccacacaa-gagattccaaagcataaa 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||| |  ||| |||||||    
T  3813890 tggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaa 3813988  T
Q  99 caagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 198  Q
    ||||| ||||   ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3813989 caagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 3814087  T
Q  199 aatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814088 aatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcac 3814186  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| || |||||    
T  3814187 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaacactctcatcaaagacacacaccccat 3814266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 18855596 - 18855933
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||    
T  18855596 taatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaag 18855693  T
Q  103 acaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 201  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855694 ataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 18855793  T
Q  202 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 300  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855794 atgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacac 18855891  T
Q  301 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 342  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855892 tatgaacccacaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 18855933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 56146930 - 56146664
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  56146930 tggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaac 56146831  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| ||| | |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146830 aagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 56146732  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagccta 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  56146731 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaacccta 56146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 24741809 - 24742121
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaa 98  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  24741809 tggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaa 24741905  T
Q  99 caagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 198  Q
    ||||| ||||   ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24741906 caagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 24742003  T
Q  199 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactct 295  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24742004 aatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 24742102  T
Q  296 cacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  24742103 cacaatatgaaccctaaaa 24742121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 312
Target Start/End: Original strand, 29760527 - 29760821
Alignment:
Q  18 aaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaagg 116  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||| ||||   |||||    
T  29760527 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacaaccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaagg 29760624  T
Q  117 aaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 215  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29760625 aa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtta 29760722  T
Q  216 caaaaggttacaagactc--tagccttcaagctttacacat-aaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaa 312  Q
    |||| ||||||||||  |  |||||| ||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29760723 caaagggttacaagaaacaatagcctgcaagctt-acacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaa 29760821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 308 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18712677 - 18712589
Alignment:
Q  308 cctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18712677 cctaaaacccaaggtgataacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 18712589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28468625 - 28468542
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28468625 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 10047378 - 10047476
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10047378 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10047476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Original strand, 24742174 - 24742250
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24742174 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 24742250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Original strand, 29760874 - 29760951
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29760874 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 29760951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 39245993 - 39246091
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39245993 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 39246091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36315327 - 36315230
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36315327 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36315230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36329536 - 36329439
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36329536 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36329439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31985730 - 31985635
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31985730 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 31985635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16623391 - 16623293
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16623391 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16623293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396672
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaaga 5396672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38152537 - 38152449
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gagaaagtgttacaaaag 221  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  38152537 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5269291 - 5269204
Alignment:
Q  133 aacaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5269291 aacaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796519
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3796519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 220
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143345
Alignment:
Q  137 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 220  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaa 5143345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 220
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147763
Alignment:
Q  137 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 220  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaa 5147763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Original strand, 24333808 - 24333896
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    |||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  24333808 caagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777645
Alignment:
Q  137 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 3777645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743425
Alignment:
Q  141 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16630778 - 16630680
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16630778 caaggttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16630680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25862120 - 25862035
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25862120 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagagagcggccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 25862035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931849
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16931849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934203
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16934203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780433
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22780433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599898
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 44599898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39774380 - 39774305
Alignment:
Q  157 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa-aggttacaaga 230  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  39774380 ccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaataggttacaaga 39774305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 54867183 - 54867269
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  54867183 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtct-ggggagagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaaa 54867269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6765177 - 6765117
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6765177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6765117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7941656 - 7941596
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7941656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 7941596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 18709164 - 18709224
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18709164 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatcca 18709224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 22782738 - 22782798
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782738 ttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22782798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 35280 - 34885
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  35280 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaac 35182  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35181 aagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 35083  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga-ctctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35082 atatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcac 34983  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  34982 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatg-ttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 34885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 4 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25328493 - 25328120
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  25328493 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagataccaaaacataaacgaga 25328395  T
Q  104 caagcggtaaaggaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 202  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328394 taaacggtaaaggaaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 25328296  T
Q  203 tgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |    
T  25328295 tgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaaca 25328196  T
Q  303 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25328195 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccat 25328120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7290145 - 7289749
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||    
T  7290145 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaac 7290046  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| ||| | |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7290045 aagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 7289947  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7289946 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctatattctaccctttggtgtttccccactctcac 7289847  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7289846 aatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 7289749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 4 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39785039 - 39784665
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39785039 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaaga 39784940  T
Q  104 caagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 202  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784939 taagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 39784840  T
Q  203 tgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacact 301  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784839 tgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacact 39784742  T
Q  302 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||| || |||||    
T  39784741 atgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagagactctctcatcaaaggcacacaccccat 39784665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 6311164 - 6311477
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  6311164 tggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaac 6311263  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| ||||   ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311264 aagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 6311361  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6311362 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacaca-agacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctca 6311460  T
Q  298 cactatgaaccctaaaa 314  Q
    ||  |||||||||||||    
T  6311461 caagatgaaccctaaaa 6311477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 35745261 - 35745624
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  |||    
T  35745261 taatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caa 35745356  T
Q  102 gacaagcggtaaagg--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    || || || |||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745357 gataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 35745455  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35745456 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctca 35745554  T
Q  298 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  35745555 cactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 35745624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 36979246 - 36979558
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaa 98  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  36979246 tggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaa 36979342  T
Q  99 caagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 198  Q
    ||||| ||||   ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979343 caagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 36979440  T
Q  199 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactct 295  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36979441 aatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 36979539  T
Q  296 cacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  36979540 cacaatatgaaccctaaaa 36979558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33038035 - 33037724
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaa--aacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataa 97  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  33038035 tggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aa 33037939  T
Q  98 acaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 197  Q
    |||||| ||||   ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037938 acaagataagcaagaaaagaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 33037841  T
Q  198 caatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactct 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||||||    
T  33037840 caatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctacccatatgtgtttccccactct 33037742  T
Q  296 cacactatgaaccctaaa 313  Q
    |||| |||||||||||||    
T  33037741 cacaatatgaaccctaaa 33037724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 30655509 - 30655827
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcataa 97  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  30655509 tggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacatagagataacaaagcataa 30655606  T
Q  98 acaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaa----caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 193  Q
    |||||| ||||   ||||||| ||||||||    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655607 acaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaaaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 30655704  T
Q  194 aatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttccc 290  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  30655705 aatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttcccc 30655803  T
Q  291 actctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  30655804 actctcacaatatgaaccctaaaa 30655827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4760304 - 4759991
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaa 98  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  4760304 tggtaatcaatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaa 4760207  T
Q  99 caagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 198  Q
    ||||| ||||   ||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4760206 caagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacatc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 4760109  T
Q  199 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactct 295  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| |  || ||| ||||||||    
T  4760108 aatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactct 4760010  T
Q  296 cacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  4760009 cacaatatgaaccctaaaa 4759991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18853382 - 18853083
Alignment:
Q  17 caaatggtctccaagccaacaacaacaaaaca-gccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaa 114  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||  || || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||   |||    
T  18853382 caaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa 18853284  T
Q  115 ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 213  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18853283 ggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgt 18853186  T
Q  214 tacaaaa-ggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccct 310  Q
    ||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18853185 tacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattttaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccct 18853087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18870772 - 18870477
Alignment:
Q  18 aaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaagg 116  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||  || || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||   |||||    
T  18870772 aaatggtttccaagcaaacaacaa-aaaac-gccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg 18870676  T
Q  117 aaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 215  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18870675 aa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgtta 18870578  T
Q  216 caaaa-ggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaa 312  Q
    ||||| |||||||||  ||  |||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18870577 caaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaa 18870479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 120 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10684364 - 10684116
Alignment:
Q  120 gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 219  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10684364 gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 10684265  T
Q  220 ag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 317  Q
    || ||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||    
T  10684264 agagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatccc 10684166  T
Q  318 aaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  10684165 aaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 10684116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10689354 - 10689058
Alignment:
Q  19 aatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaagg 116  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||    |||||    
T  10689354 aatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacaaccctagtgtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaagg 10689257  T
Q  117 aaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 215  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10689256 aa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtta 10689159  T
Q  216 caaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaa 312  Q
    || | |||||||||  ||  |||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| | || | ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10689158 cagagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaa 10689060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1262050 - 1261871
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  1262050 aagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 1261951  T
Q  234 tagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||| | ||||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1261950 tagcttgcaagc-ttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 1261871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 26287902 - 26287985
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26287902 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 26301159 - 26301242
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26301159 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 26313153 - 26313236
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26313153 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31071326 - 31071146
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-act 232  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |      
T  31071326 aagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaa 31071227  T
Q  233 ctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
     |||| | ||||| |||||||  |||||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31071226 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 31071146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 314 - 398
Target Start/End: Original strand, 6311532 - 6311614
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6311532 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcctttgcta 6311614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18870424 - 18870348
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18870424 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 18870348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Original strand, 30655880 - 30655956
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30655880 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 30655956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25328070 - 25327994
Alignment:
Q  302 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25328070 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccat 25327994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26403328 - 26403240
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26403328 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10689003 - 10688927
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10689003 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 10688927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18853030 - 18852954
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18853030 acccaaggtgattacaatatttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 18852954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456124
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 4456124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33037671 - 33037595
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33037671 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctctacgaagacactcaaccc-tttggttccctcct 33037595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 230
Target Start/End: Original strand, 7412344 - 7412437
Alignment:
Q  139 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  7412344 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 7412437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175755
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 19175755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4759938 - 4759861
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4759938 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagactctctctacaaagacactcaaccc-tttggttacctcct 4759861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23799675 - 23799577
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23799675 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 23799577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4696694 - 4696609
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4696694 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1261820 - 1261758
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1261820 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccc 1261758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5702581 - 5702483
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5702581 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 5702483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 230
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127318
Alignment:
Q  139 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 6127318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  138 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 389
Target Start/End: Original strand, 36979611 - 36979683
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccct 389  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36979611 acccaaggtgattacaatgttttccc--aacctaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccct 36979683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19752492 - 19752407
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19752492 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 19752407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31071095 - 31071035
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 375  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  31071095 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 31071035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079877
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082248
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43082248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 202
Target Start/End: Original strand, 6813683 - 6813750
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 202  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6813683 aagattgttaacccagttcggtccaatataacctacactaggggagagagcagctctccaatccaata 6813750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Original strand, 26288121 - 26288183
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26288121 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26288183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Original strand, 26301378 - 26301440
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26301378 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26301440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Original strand, 26313372 - 26313434
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26313372 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26313434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Original strand, 7412569 - 7412629
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||| |||||||||||   || |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  7412569 acccaaggtgtttacaatgttt---cccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 7412629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18811015 - 18810982
Alignment:
Q  166 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18811015 cctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 18810982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44721178 - 44721118
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44721178 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatcca 44721118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 4 - 398
Target Start/End: Original strand, 41398107 - 41398498
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagc---caacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaa--ccacacaa-gagattccaaagcataa 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||    
T  41398107 taatcaatgagaacatatggtctccaagcaaacaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataa 41398205  T
Q  98 acaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 197  Q
    |||||| |||     |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398206 acaagataag-----aaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 41398298  T
Q  198 caatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398299 caatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctca 41398398  T
Q  298 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgct 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41398399 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgct 41398497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 34 - 398
Target Start/End: Original strand, 41390485 - 41390843
Alignment:
Q  34 aacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaa--ccacacaa-gagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacac 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||     |||||| ||||||||||     
T  41390485 aacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag-----aaggaa-gaacaaaacat 41390577  T
Q  131 cgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390578 cgag-aagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga 41390676  T
Q  231 ctctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390677 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 41390776  T
Q  331 tgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41390777 tgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaatccatttggttccctcctttgcta 41390843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 4 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25445305 - 25444931
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| || ||||||||    
T  25445305 taatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcgtaaacaag 25445208  T
Q  103 acaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 201  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445207 ataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 25445108  T
Q  202 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445107 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-gctaccctttggtattttcccactctcacac 25445009  T
Q  301 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  25445008 tatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 25444931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44024088 - 44023716
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||    
T  44024088 taatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaag 44023991  T
Q  103 acaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 202  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023990 ataaatggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 44023891  T
Q  203 tgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacact 301  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023890 tgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacact 44023793  T
Q  302 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  44023792 atgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 44023716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 379
Target Start/End: Original strand, 39445369 - 39445742
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 102  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||    
T  39445369 taatcaatgtgaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaag 39445466  T
Q  103 acaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 201  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445467 ataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 39445566  T
Q  202 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 300  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445567 atgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacac 39445664  T
Q  301 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  39445665 tatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 39445742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1055227 - 1054854
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 102  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||    
T  1055227 taatcaatgtgaacaaatgtcttccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaag 1055130  T
Q  103 acaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 201  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1055129 ataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaat 1055030  T
Q  202 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 300  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055029 atgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacac 1054932  T
Q  301 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  1054931 tatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 1054854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24787596 - 24787280
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagc--caacaacaacaaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcat 95  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||||  ||  |||| ||||||||||||||| |||||  |||||||     
T  24787596 tggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca- 24787499  T
Q  96 aaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 195  Q
     ||||||| ||||   ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24787498 -aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggggagagcagctctccaa 24787401  T
Q  196 tccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccact 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  24787400 tccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcattacacaagaacaaatcctagattctaccctttggtgtttcccaact 24787301  T
Q  294 ctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  24787300 ctcacaatatgaaccctaaaa 24787280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 112 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43988572 - 43988314
Alignment:
Q  112 aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagt 211  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  43988572 aaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt 43988473  T
Q  212 gttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacaca--taaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaac 307  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||    || ||| |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  43988472 gttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaaccctaga-tctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaac 43988374  T
Q  308 cctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  43988373 ccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 43988314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24202973 - 24202686
Alignment:
Q  23 gtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaa 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||| | |||||||  ||||||| ||||   ||||||| |||    
T  24202973 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-gaa 24202879  T
Q  123 caaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 220  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  24202878 caaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaag 24202780  T
Q  221 ggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    ||||||||| |   |||| | ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24202779 ggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 24202686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 240 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25439875 - 25439738
Alignment:
Q  240 tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcc 339  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25439875 tcaagctttacacatgaacaaaccctagag-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttcc 25439777  T
Q  340 caaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    | |||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  25439776 c-aacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 25439738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19358939 - 19358760
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  19358939 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 19358840  T
Q  234 tagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||| | ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  19358839 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 19358760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19361528 - 19361349
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  19361528 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 19361429  T
Q  234 tagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||  | ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  19361428 tagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 19361349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19380168 - 19379989
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  19380168 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 19380069  T
Q  234 tagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||  | ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  19380068 tagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 19379989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644898
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 26644898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47704034 - 47703946
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47704034 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 47703946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073025
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19073025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120915
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19120915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24787226 - 24787151
Alignment:
Q  315 cccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24787226 cccaaggtgattataatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 24787151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16124614 - 16124516
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16124614 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16124516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27104470 - 27104372
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  27104470 caagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 27104372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281804
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 3281804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Original strand, 9476260 - 9476348
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  9476260 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaag 9476348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Original strand, 13598397 - 13598485
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13598397 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Original strand, 29651810 - 29651898
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29651810 caagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24202635 - 24202573
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24202635 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccc 24202573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 228
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069864
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaa 228  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa 37069864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Original strand, 775671 - 775759
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  775671 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 47098922 - 47098837
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  47098922 caagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 47098837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604624
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaaga 13604624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21536666 - 21536570
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaata-tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| |  || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  21536666 aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagagttacaaga 21536570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Original strand, 32889438 - 32889523
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  32889438 caagattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 32889523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 47102935 - 47102874
Alignment:
Q  139 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  47102935 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatcca 47102874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459479
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9459479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463306
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9463306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226386
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16226386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19366174 - 19366112
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  19366174 acccaaggtgtttacaatatttttcccaa-cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 19366112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 43988681 - 43988607
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac 78  Q
    ||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  43988681 taatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcacaaccacac 43988607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19361298 - 19361237
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  19361298 acccaaggtgtttacaatgttttccc--aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 19361237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23786118 - 23786058
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23786118 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 23786058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 32
Target Start/End: Original strand, 41386618 - 41386646
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagc 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386618 taatcaatgagaacaaatggtctccaagc 41386646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 51752642 - 51752582
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51752642 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 51752582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22173413 - 22173018
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||     
T  22173413 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaat 22173315  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173314 aagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 22173216  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||      
T  22173215 atatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcct 22173116  T
Q  299 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  22173115 aatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctactttgcta 22173018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 18656298 - 18656677
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||  |||    
T  18656298 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aac 18656395  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaa----caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 195  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656396 aagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 18656495  T
Q  196 tccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactct 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18656496 tccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactct 18656594  T
Q  296 cacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  18656595 cacactataaacccttaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 18656677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 7167113 - 7167425
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaac 99  Q
    |||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  7167113 tggtaatctatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaac 7167210  T
Q  100 aagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| ||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167211 aagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 7167308  T
Q  200 atatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctc 296  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7167309 atatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctc 7167407  T
Q  297 acactatgaaccctaaaa 314  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  7167408 acaatatgaaccctaaaa 7167425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28504080 - 28503780
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  28504080 taatctatgagaa-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaag 28503983  T
Q  103 acaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 202  Q
    |         |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28503982 a---------aaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaata 28503894  T
Q  203 tgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  28503893 tgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa 28503794  T
Q  301 tatgaaccctaaaa 314  Q
    ||||||||||||||    
T  28503793 tatgaaccctaaaa 28503780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2677303 - 2676939
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||| |||    
T  2677303 taatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caa 2677207  T
Q  102 gacaagcggt--aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    || || |  |  |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677206 gataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 2677108  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2677107 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctca 2677009  T
Q  298 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  2677008 cactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 2676939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2673147 - 2672783
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||| |||    
T  2673147 taatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caa 2673051  T
Q  102 gacaagcggt--aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    || || |  |  |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2673050 gataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 2672952  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2672951 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctca 2672853  T
Q  298 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  2672852 cactatgaaccttaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 2672783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 24967977 - 24968340
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  |||    
T  24967977 taatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caa 24968072  T
Q  102 gacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    || || || |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  24968073 gataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggagagagtagctctccaatcca 24968171  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  24968172 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaacccgaga-tctaccctttggtactttcccatcctca 24968270  T
Q  298 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  24968271 cactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 24968340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 120 - 366
Target Start/End: Original strand, 8512202 - 8512450
Alignment:
Q  120 gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8512202 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 8512301  T
Q  220 ag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 317  Q
    || ||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||    
T  8512302 agagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatccc 8512400  T
Q  318 aaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  8512401 aaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 8512450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 120 - 366
Target Start/End: Original strand, 8517082 - 8517330
Alignment:
Q  120 gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8517082 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 8517181  T
Q  220 ag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 317  Q
    || ||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||    
T  8517182 agagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatccc 8517280  T
Q  318 aaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  8517281 aaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 8517330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2671800 - 2671502
Alignment:
Q  17 caaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaa 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||   |||    
T  2671800 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaa 2671702  T
Q  115 ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 213  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2671701 ggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 2671604  T
Q  214 tacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 311  Q
    |||||| |||||||||  ||  |||  | ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2671603 tacaaagggttacaagaaacaatagattgcaagc-ttacacaagaccaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaacccta 2671505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8739224 - 8738982
Alignment:
Q  69 aaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcc 167  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739224 aaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcc 8739128  T
Q  168 taatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||||  |||||  ||    
T  8739127 taatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccc 8739029  T
Q  265 tagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 311  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8739028 tagattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaacccta 8738982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9091462 - 9091220
Alignment:
Q  69 aaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcc 167  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091462 aaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcc 9091366  T
Q  168 taatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacataaacaaagcc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||||  |||||  ||    
T  9091365 taatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccc 9091267  T
Q  265 tagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 311  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9091266 tagattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaacccta 9091220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Original strand, 8477263 - 8477545
Alignment:
Q  33 caacaacaacaaaac-agccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acac 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||| |||||| |||| | | |||||||  ||||||| ||||   |||| |||||||||| ||||    
T  8477263 caacaacaacaaaaccagccctagactagtgtagaacaacaccaca-aagataatacaaagca--aacaagataagcaagaaag-aaagaacaaacacac 8477358  T
Q  131 cgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag 229  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8477359 c-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 8477457  T
Q  230 --actctagccttcaagctttacac-ataaacaaagcctagattctaccctttggtattt-tcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
      ||  |||| | ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8477458 aaacaatagcttgcaagc-ttacacaataaacaagacctagattctaccctttggtgtttcccccactctcacaatatgaaccctaaaa 8477545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501613
Alignment:
Q  179 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28501651  T
Q  277 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28501650 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 28501613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40372908 - 40372712
Alignment:
Q  118 aagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 216  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40372908 aagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 40372810  T
Q  217 aaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    ||| ||||||||| |   |||| | ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| |  || ||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  40372809 aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcataatatgaaccctaaaa 40372712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 366
Target Start/End: Original strand, 32475470 - 32475717
Alignment:
Q  120 gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 219  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  32475470 gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaa 32475568  T
Q  220 aggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggt-attttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 317  Q
      ||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||||||  |||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||  || |||    
T  32475569 gagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatccc 32475667  T
Q  318 aaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||  |||||||| |||||    
T  32475668 aagatgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 32475717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 366
Target Start/End: Original strand, 32480328 - 32480575
Alignment:
Q  120 gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 219  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  32480328 gaacaaaacaccaaccaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaa 32480426  T
Q  220 aggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggt-attttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 317  Q
      ||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||||||  |||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||  || |||    
T  32480427 gagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatccc 32480525  T
Q  318 aaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||  |||||||| |||||    
T  32480526 aagatgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 32480575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26928687 - 26928507
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--act 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |      
T  26928687 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 26928588  T
Q  233 ctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
     |||| | ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26928587 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 26928507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Original strand, 32143321 - 32143501
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-act 232  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |      
T  32143321 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaa 32143420  T
Q  233 ctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
     |||| | ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  32143421 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 32143501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 1305949 - 1306044
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  1305949 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 1306044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Original strand, 7167478 - 7167555
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7167478 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 7167555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28501560 - 28501483
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28501560 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcatcccttttggttccctcct 28501483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28503727 - 28503650
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28503727 acccaaggtgattacaatatttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaacccttttggttccctcct 28503650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370477
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8370477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974943
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 27974943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2671449 - 2671373
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2671449 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 2671373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Original strand, 8477598 - 8477674
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8477598 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 8477674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18552971 - 18552873
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18552971 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 18552873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40372659 - 40372583
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40372659 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 40372583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 10207803 - 10207983
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||| |||    
T  10207803 taatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caa 10207899  T
Q  102 gacaagcggt--aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagag 184  Q
    || || |  |  |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10207900 gataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 21711222 - 21711319
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  21711222 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 21711319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453138
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-act 232  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |      
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaa 27453057  T
Q  233 ctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
     |||| | ||||| |||||||  |||||  ||||  |||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  27453058 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaattcctattttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 27453138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264446
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 16264446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986449
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029190
Alignment:
Q  137 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 36029190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736295
Alignment:
Q  139 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 1736295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8738926 - 8738850
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8738926 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagatactctctacaaagacactcaaccca-ttggttccctcct 8738850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9091164 - 9091088
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcct 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9091164 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagatactctctacaaagacactcaaccc-tttggttccctcct 9091088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709780
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaaga 30709780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3716090 - 3715992
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3716090 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3715992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40592870 - 40592772
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40592870 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 40592772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 48438213 - 48438311
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  48438213 caagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 48438311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6794801 - 6794704
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  6794801 caagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 6794704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 26298987 - 26299085
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26298987 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 26299085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1417578 - 1417493
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-agaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  1417578 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaa 1417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795878
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaaga 25795878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47923994 - 47923896
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  47923994 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaagagttacaaga 47923896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Original strand, 37466290 - 37466375
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  37466290 caagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 37466375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39040079 - 39039995
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39040079 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 40844651 - 40844748
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40844651 caagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 40844748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3328444 - 3328359
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||||    
T  3328444 caagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaa 3328359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4387014 - 4386947
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 202  Q
    ||||||||| |||||||| ||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4387014 aagattgtttacccagtttagttcagtatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccaata 4386947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24695252 - 24695154
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| |||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24695252 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 24695154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 375
Target Start/End: Original strand, 1306179 - 1306239
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 375  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  1306179 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 1306239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210569
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatcca 38210569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494198
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 50494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 203
Target Start/End: Original strand, 53894055 - 53894119
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 203  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53894055 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatat 53894119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3323755 - 3323693
Alignment:
Q  157 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  3323755 ccaatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 3323693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 458543 - 458483
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  458543 ttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 458483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 6063444 - 6063504
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| |||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6063444 ttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6063504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 10621528 - 10621588
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621528 ttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 10621588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 183
Target Start/End: Original strand, 39153357 - 39153405
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  39153357 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 39153405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9855 - 9521
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  9855 taatcaatgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagccctaagctagtatatagcaaaaccacacaagagctaacaa-gcataaacaaga 9757  T
Q  104 caagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 203  Q
     ||||   ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9756 taagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 9659  T
Q  204 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9658 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactat 9560  T
Q  304 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9559 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 9521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 222 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 3845 - 3671
Alignment:
Q  222 gttacaagactctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3845 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 3747  T
Q  322 tgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctatgcta 398  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3746 tgattacaatgttttt-cctaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgcta 3671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 102 - 28
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102 taatcaatgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 379
Target Start/End: Original strand, 232 - 605
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||    
T  232 taatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaag 329  T
Q  103 acaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 201  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  330 ataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 429  T
Q  202 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 300  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  430 atgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacac 527  T
Q  301 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 379  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  528 tatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2466 - 2103
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  |||    
T  2466 taatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caa 2371  T
Q  102 gacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    || || || |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2370 gataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatcca 2272  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcc-tagattctaccctttggtattttcccactctc 296  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||| |||||||  |||    
T  2271 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacaca-agacaaaaccataga-tctaccctttggtaatttcccaacctc 2174  T
Q  297 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  2173 acactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 149171 - 148808
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  |||    
T  149171 taatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caa 149076  T
Q  102 gacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    || || || |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  149075 gataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatcca 148977  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcc-tagattctaccctttggtattttcccactctc 296  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||| |||||||  |||    
T  148976 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacaca-agacaaaaccataga-tctaccctttggtaatttcccaacctc 148879  T
Q  297 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  148878 acactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 148808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 120 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14409 - 14161
Alignment:
Q  120 gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 219  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14409 gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 14310  T
Q  220 ag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 317  Q
    || ||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||    
T  14309 agagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatccc 14211  T
Q  318 aaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  14210 aaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 14161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19380 - 19017
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 101  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  |||    
T  19380 taatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caa 19285  T
Q  102 gacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    || || || |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19284 gataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaataca 19186  T
Q  200 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctca 297  Q
    ||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |  ||| |||||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  19185 atatgtgagtgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-tctaccctttggtaatttcccaacctca 19087  T
Q  298 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  19086 cactatgaacccataattccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18157 - 17869
Alignment:
Q  23 gtctccaagccaacaacaacaaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaag 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||| ||||||  ||||| | |||||||  ||||||| ||||   ||||||| |    
T  18157 gtctccaagc-aacaacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-g 18064  T
Q  121 aacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18063 aacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 17965  T
Q  219 aaggttacaag-actctagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    | ||||||||| |   |||| | ||||| |||||||  |||||  | ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17964 agggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 17869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24141 - 23962
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  24141 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 24042  T
Q  234 tagccttcaagctttacacataaacaaagcctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 314  Q
    |||| | ||||| |||||||  |||||  | ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24041 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 23962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17818 - 17756
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  17818 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 17756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23911 - 23849
Alignment:
Q  314 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23911 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 23849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 182064 - 181980
Alignment:
Q  120 gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 204  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182064 gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 176925 - 176829
Alignment:
Q  271 ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 366  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  176925 ctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 176829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8420
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22403 - 22343
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22403 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24678 - 24618
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24678 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 24618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85779
Alignment:
Q  137 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 85779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43962
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 43962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36929 - 36833
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36929 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5770
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5682 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Original strand, 2491 - 2579
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2491 caagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133281
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaaga 133281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 466 - 300
Alignment:
Q  1 tggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataa 97  Q
    |||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||||   |||||| ||    
T  466 tggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccacacaaagagataataaagca-aa 369  T
Q  98 acaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 168  Q
    |||||| ||||   |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  368 acaagataagctagaaag-aaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 10728 - 10826
Alignment:
Q  135 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  10728 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45337
Alignment:
Q  136 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 218  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 230
Target Start/End: Original strand, 17266 - 17360
Alignment:
Q  139 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 230  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17266 attgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 17360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 269
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 199
Target Start/End: Original strand, 11500 - 11533
Alignment:
Q  166 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500 cctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 34164 - 34136
Alignment:
Q  4 taatcaatgagaacaaatggtctccaagc 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164 taatcaatgagaacaaatggtctccaagc 34136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 69292 - 69352
Alignment:
Q  140 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  69292 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatcca 69352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University