View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20185_high_1 (Length: 572)

Name: NF20185_high_1
Description: NF20185
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20185_high_1
NF20185_high_1
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (11-555)||(25419471-25420016)
chr6 (12-530)||(5373190-5373706)
chr6 (191-333)||(34825518-34825660)
chr6 (191-333)||(33461361-33461503)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (344-555)||(2006198-2006410)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (11-354)||(20078241-20078584)
chr8 (22-420)||(25574051-25574449)
chr8 (191-335)||(2998222-2998366)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (191-333)||(37193798-37193940)
chr3 (266-354)||(10544849-10544937)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (22-420)||(26359694-26360092)
chr2 (22-420)||(18498030-18498428)
[»] scaffold0779 (1 HSPs)
scaffold0779 (36-420)||(5467-5851)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 555
Target Start/End: Original strand, 25419471 - 25420016
Alignment:
Q  11 gaagaacccagaaagaaacataaaccagtggttgatcttcttgtatctacacaacctgcccagtctgcatcaacatagcctaaaatttgtgcttctgatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25419471 gaagaacccagaaagaaacataaatcagtggttgatcttcttgtatctacacaacctgcccagtctgcatcaacatagcctaaaatttgtgcttctgatt 25419570  T
Q  111 ttcatggaaatataagaccaagatcaggagcattttttaggtatcttagaattctacatgcaactttataatgagcagtggtaggagcattgagaaactg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25419571 ttcttggaaatataagaccaagaccaggagcatttttgaggtatcttagaattctacatgcagctttataatgagcagtgataggagcattaagaaactg 25419670  T
Q  211 gctcaattgttgagtagctagtgagatatcaggtctggtagtatttaagtaaaataatcttccaatgagcctcctataacaagacacatatgcaaaaggt 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25419671 gctcaactgttgagtagctagtgagatatcaagtcttgtagtacttaagtaaaataatcttccaatgagcctcctgtaacaagacacatctgcaaaaggt 25419770  T
Q  311 ttgcttgtgtcttgatgcaattttactgaagtgtctaaaggtgtaggagcaggcttggcacctaaaagacctgaggaatcaagcaagtccaagcagtatt 410  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25419771 tagcttgtgtcttgatgcaattttactgaagtgtctaaaggtgtaggagcaggcttggcacctaaaagacctgaggaatcaagcaagtccaagcagtatt 25419870  T
Q  411 ttctttgggaaac--agactccttctttggaatgagccacctctaattccnnnnnnntacttgagtatccctaaatctttgattttgaattgattgtcaa 508  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25419871 ttctttggaaaacatagattccttctttggaatgagccacctctaa-tcccaaaaaatacttgagtatccctaaatctttgattttgaattgattgtcaa 25419969  T
Q  509 ggatgtacttgattctttgaaactcaatgagggaagtaccagctaat 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25419970 ggatgtacttgattctttgaaactcaatgacggaagtaccagctaat 25420016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 530
Target Start/End: Original strand, 5373190 - 5373706
Alignment:
Q  12 aagaacccagaaagaaacataaaccagtggttgatcttcttgtatctacacaacctgcccagtctgcatcaacatagcctaaaatttgtgcttctgattt 111  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||   |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  5373190 aagaacccagaaagaaacaaaatccagtagttgacctt---gtatccgcacaacctgcccaatctgcatcaacataacctaagatttgcgcttctgattt 5373286  T
Q  112 tcatggaaatataagaccaagatcaggagcattttttaggtatcttagaattctacatgcaactttataatgagcagtggtaggagcattgagaaactgg 211  Q
    ||  || || | ||||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  5373287 tctagggaacagaagaccaagactaggagcatttttgagatatcttaggattctacatgcagctttgtagtgactagtagtaggagcattgagaaactga 5373386  T
Q  212 ctcaattgttgagtagctagtgagatatcaggtctggtagtatttaagtaaaataatcttccaatgagcctcctataacaagacacatatgcaaaaggtt 311  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || |    
T  5373387 ctcaactgttgagtggctagtgaaatgtcaggtcttgtagtgtttaaatacgtcaaccttccaatgagcctcctgtaacaagacacatttgtaaatggct 5373486  T
Q  312 tgcttgtgtcttgatgcaattttactgaagtgtctaaaggtgtaggagcaggcttggcacctaaaagacctgaggaatcaagcaagtccaagcagtattt 411  Q
    | || |||||| | ||||| |||| |||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || |  || |||||    
T  5373487 tactagtgtctaggtgcaactttaatgaagtatctagaggtgtagaagtaggtttggcacctagaagacctgaggattcaagcaaatcaagacaatattt 5373586  T
Q  412 tctttgggaa--acagactccttctttggaatgagccacctctaattccnnnnnnntacttgagtatccctaaatctttgattttgaattgattgtcaag 509  Q
    ||| || |||  | ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||       || || || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  5373587 tctctgtgaaatagagactccttctttagaatgagcaacctttaa-tcccaaaaaatattttagaatccctaagtctttgattttaaactgattatcaag 5373685  T
Q  510 gatgtacttgattctttgaaa 530  Q
    |||  |||| ||||| |||||    
T  5373686 gatacacttaattctatgaaa 5373706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34825660 - 34825518
Alignment:
Q  191 gtaggagcattgagaaactggctcaattgttgagtagctagtgagatatcaggtctggtagtatttaagtaaaataatcttccaatgagcctcctataac 290  Q
    ||||||||||| | |||||| || | ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| |  || |  | |||||||||||| ||||| ||||    
T  34825660 gtaggagcatttaaaaactgactgagttgttgagttgctagtgtgatatctggtcttgtagtattgagatagagaagtcttccaatgagtctcctgtaac 34825561  T
Q  291 aagacacatatgcaaaaggtttgcttgtgtcttgatgcaattt 333  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  34825560 aagacacatcagcaaaaggtttgctattgtcttggtgcaattt 34825518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33461503 - 33461361
Alignment:
Q  191 gtaggagcattgagaaactggctcaattgttgagtagctagtgagatatcaggtctggtagtatttaagtaaaataatcttccaatgagcctcctataac 290  Q
    ||||||||||| | |||||| || | ||||||||| |||| || |||||  ||||| |||||||| |  || |  | |||||||||||| ||||| ||||    
T  33461503 gtaggagcatttaaaaactgactgagttgttgagttgctaatgtgatatttggtcttgtagtattgagatagagaagtcttccaatgagtctcctgtaac 33461404  T
Q  291 aagacacatatgcaaaaggtttgcttgtgtcttgatgcaattt 333  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  33461403 aagacacatcagcaaaaggtttactgttgtcttggtgcaattt 33461361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 344 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 2006410 - 2006198
Alignment:
Q  344 tctaaaggtgtaggagcaggcttggcacctaaaagacctgaggaatcaagcaagtccaagcagtattttctttgggaa--acagactccttctttggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  2006410 tctaaaggtgtaggagcaggcttggcacctaaaagacctgaggaatcaagcaagtccaagcagtattttctttgggaaatagagattccttctttggaat 2006311  T
Q  442 gagccacctctaattccnnnnnnntacttgagtatccctaaatctttgattttgaattgattgtcaaggatgtacttgattctttgaaactcaatgaggg 541  Q
    |||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2006310 gagccacctctaa-acccaaaaaatacttgagtatccctaaatctttgattttgaattgactgccaaggatgtgcttgattctttgaaactcaatgaggg 2006212  T
Q  542 aagtaccagctaat 555  Q
    |||| |||||||||    
T  2006211 aagtgccagctaat 2006198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20078584 - 20078241
Alignment:
Q  11 gaagaacccagaaagaaacataaaccagtggttgatcttcttgtatctacacaacctgcccagtctgcatcaacatagcctaaaatttgtgcttctgatt 110  Q
    |||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  | |||||| | ||||||      
T  20078584 gaagaacctaaaaagaaacaaaatccagttgtggatcttctggaatccacacaacctgcccaatctgcatccacatatctaagaatttgggtttctgaag 20078485  T
Q  111 ttcatggaaatataagaccaagatcaggagcattttttaggtatcttagaattctacatgcaactttataatgagcagtggtaggagcattgagaaactg 210  Q
     ||  | ||| |  ||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |  ||||| |  ||| ||||||| || | | | || |||||||| |  || ||    
T  20078484 ctctagaaaagaagagaccaagaccaggatcatttttaagatatctcaatattcttctggcagctttatagtgtgtaatagttggagcatttaagaattg 20078385  T
Q  211 gctcaattgttgagtagctagtgagatatcaggtctggtagtatttaagtaaaataatcttccaatgagcctcctataacaagacacatatgcaaaaggt 310  Q
     ||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||| || |||||||  || || ||||||||||| | |||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  20078384 actcaactgttgagtagccaaagaaatatctggtcttgtggtatttagatacaacaatcttccaatcaacctcctgtagcaagacacatcttcaaaaggt 20078285  T
Q  311 ttgcttgtgtcttgatgcaattttactgaagtgtctaaaggtgt 354  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20078284 tgacttgtgtcttgatgcaattttattgaagtatctaaaggtgt 20078241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 420
Target Start/End: Original strand, 25574051 - 25574449
Alignment:
Q  22 aaagaaacataaaccagtggttgatcttcttgtatctacacaacctgcccagtctgcatcaacatagcctaaaatttgtgcttctgattttcatggaaat 121  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||| ||||||||  |||  || ||     
T  25574051 aaagaaacagaatccagttgttgatcttctggaatccacacaaccagcccaatctgcatcaacatatccaagtatttgagcttctgaacttctagggaag 25574150  T
Q  122 ataagaccaagatcaggagcattttttaggtatcttagaattctacatgcaactttataatgagcagtggtaggagcattgagaaactggctcaattgtt 221  Q
    | |||||||||| || ||  ||| || || ||||| |   ||||||| ||| |||| || || | | | || |||| ||| | |||||| |||| |||||    
T  25574151 aaaagaccaagaccaagattattcttaagatatctcaatgttctacaagcagctttgtagtgtgtaatagttggagaattcaaaaactgactcagttgtt 25574250  T
Q  222 gagtagctagtgagatatcaggtctggtagtatttaagtaaaataatcttccaatgagcctcctataacaagacacatatgcaaaaggtttgcttgtgtc 321  Q
    |||||||||  || || || ||||| || || ||||  || |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||   || |||||    
T  25574251 gagtagctaaagaaatgtctggtctagtggtgtttagatacagcaatctaccaatgagcctcctgtagcaagacacatcttcaaagggtgcactggtgtc 25574350  T
Q  322 ttgatgcaattttactgaagtgtctaaaggtgtaggagcaggcttggcacctaaaagacctgaggaatcaagcaagtccaagcagtattttctttggga 420  Q
    |||||||| ||| |  ||||| || ||||||||||  ||||| || | |||||| ||||| || || ||||| || ||||  || ||||||||||||||    
T  25574351 ttgatgcagtttaatagaagtatccaaaggtgtagatgcaggtttagaacctaagagaccagaagagtcaagtaaatccagacaatattttctttggga 25574449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2998366 - 2998222
Alignment:
Q  191 gtaggagcattgagaaactggctcaattgttgagtagctagtgagatatcaggtctggtagtatttaagtaaaataatcttccaatgagcctcctataac 290  Q
    ||||||||||| | |||||| || | ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| |  || |  | |||||||||||| ||||| ||||    
T  2998366 gtaggagcatttaaaaactgactgagttgttgagttgctagtgtgatatctggtcttgtagtattgagatagagaagtcttccaatgagtctcctgtaac 2998267  T
Q  291 aagacacatatgcaaaaggtttgcttgtgtcttgatgcaatttta 335  Q
    |||||||||   |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  2998266 aagacacatcaacaaagggtttgctattgtcttggtgcaatttta 2998222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37193940 - 37193798
Alignment:
Q  191 gtaggagcattgagaaactggctcaattgttgagtagctagtgagatatcaggtctggtagtatttaagtaaaataatcttccaatgagcctcctataac 290  Q
    ||||||||||| | |||||| || | ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| |  || |  | |||||||||||| ||||| ||||    
T  37193940 gtaggagcatttaaaaactgactgagttgttgagttgctagtgtgatatctggtcttgtagtattgagatagagaagtcttccaatgagtctcctgtaac 37193841  T
Q  291 aagacacatatgcaaaaggtttgcttgtgtcttgatgcaattt 333  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  37193840 aagacacatcagcaaaaggtttgctattgtcttggtgcaattt 37193798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10544937 - 10544849
Alignment:
Q  266 aatcttccaatgagcctcctataacaagacacatatgcaaaaggtttgcttgtgtcttgatgcaattttactgaagtgtctaaaggtgt 354  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||    
T  10544937 aatctaccaatgagcctcctatagcaaggcacgtcagcaaaaggtttgatattgtcttgatgcaattttgttgaagtatctaagggtgt 10544849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 420
Target Start/End: Original strand, 26359694 - 26360092
Alignment:
Q  22 aaagaaacataaaccagtggttgatcttcttgtatctacacaacctgcccagtctgcatcaacatagcctaaaatttgtgcttctgattttcatggaaat 121  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||| ||||||||  |||  || ||     
T  26359694 aaagaaacagaattcagttgttgatcttctggaatccacacaaccagcccaatctgcatcaacatatccaagtatttgagcttctgaacttctagggaag 26359793  T
Q  122 ataagaccaagatcaggagcattttttaggtatcttagaattctacatgcaactttataatgagcagtggtaggagcattgagaaactggctcaattgtt 221  Q
    | |||||||||| | |||  ||| || || ||||| |   ||||||| ||| |||| || || | | | || |||| ||| | |||||| |||| |||||    
T  26359794 aaaagaccaagaccgggattattcttaagatatctcaatgttctacaagcagctttgtagtgtgtaatagttggagaattcaaaaactgactcagttgtt 26359893  T
Q  222 gagtagctagtgagatatcaggtctggtagtatttaagtaaaataatcttccaatgagcctcctataacaagacacatatgcaaaaggtttgcttgtgtc 321  Q
    |||||||||  || || || ||||| || || ||||  || |  |||||  ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||   || |||||    
T  26359894 gagtagctaaagaaatgtctggtctagtggtgtttagatacagcaatctatcaatgagcctcctgtagcaagacacatcttcaaagggtgcactggtgtc 26359993  T
Q  322 ttgatgcaattttactgaagtgtctaaaggtgtaggagcaggcttggcacctaaaagacctgaggaatcaagcaagtccaagcagtattttctttggga 420  Q
    |||||||| ||| |  ||||| || ||||||||||  ||||| || | |||||| ||||| || || ||||| || ||||  || ||||||||||||||    
T  26359994 ttgatgcagtttaatagaagtatccaaaggtgtagatgcaggtttagaacctaagagaccagaagagtcaagtaaatccagacaatattttctttggga 26360092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 420
Target Start/End: Original strand, 18498030 - 18498428
Alignment:
Q  22 aaagaaacataaaccagtggttgatcttcttgtatctacacaacctgcccagtctgcatcaacatagcctaaaatttgtgcttctgattttcatggaaat 121  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||| ||||||||  |||  || ||     
T  18498030 aaagaaacagaatccagctgttgatcttctggaatccacacaaccagcccaatctgcatcaacatatccaagtatttgagcttctgaacttctagggaag 18498129  T
Q  122 ataagaccaagatcaggagcattttttaggtatcttagaattctacatgcaactttataatgagcagtggtaggagcattgagaaactggctcaattgtt 221  Q
    | |||||||||| || ||  ||| || || ||||| |   ||||||| ||| |||| || ||   | | || |||| ||| | |||||| |||| |||||    
T  18498130 aaaagaccaagaccaagattattcttaagatatctcaatgttctacaagcagctttgtagtgtttaatagttggagaattcaaaaactgactcagttgtt 18498229  T
Q  222 gagtagctagtgagatatcaggtctggtagtatttaagtaaaataatcttccaatgagcctcctataacaagacacatatgcaaaaggtttgcttgtgtc 321  Q
    |||||||||  || || || ||||| || || ||||  || |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||   || |||||    
T  18498230 gagtagctaaagaaatgtctggtctagtggtgtttagatacagcaatctaccaatgagcctcctgtagcaagacacatcttcaaagggtgcactggtgtc 18498329  T
Q  322 ttgatgcaattttactgaagtgtctaaaggtgtaggagcaggcttggcacctaaaagacctgaggaatcaagcaagtccaagcagtattttctttggga 420  Q
    |||||||| ||| |  ||||| || ||||||||||  ||||| || | |||| | ||||| || || ||||| || ||||  || ||||||||||||||    
T  18498330 ttgatgcagtttaatagaagtatccaaaggtgtagatgcaggtttagaacctgagagaccagaagagtcaagtaaatccagacaatattttctttggga 18498428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0779 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0779
Description:

Target: scaffold0779; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 5851 - 5467
Alignment:
Q  36 cagtggttgatcttcttgtatctacacaacctgcccagtctgcatcaacatagcctaaaatttgtgcttctgattttcatggaaatataagaccaagatc 135  Q
    |||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||| ||||||||  |||  ||||| | |||||||||| |    
T  5851 cagttgttgatcttctggaatccacacaaccagcccaatctgcatcaacatatccaagtatttgagcttctgaacttctaggaaagaaaagaccaagacc 5752  T
Q  136 aggagcattttttaggtatcttagaattctacatgcaactttataatgagcagtggtaggagcattgagaaactggctcaattgttgagtagctagtgag 235  Q
    ||||  ||| || || ||||| |   ||||||| ||| |||| || || | | | || || | ||| | || ||| |||| ||||||||||||||| ||     
T  5751 aggattattcttaagatatctcaatgttctacaagcagctttgtagtgtgtaatagttggggaattcaaaagctgactcagttgttgagtagctagagaa 5652  T
Q  236 atatcaggtctggtagtatttaagtaaaataatcttccaatgagcctcctataacaagacacatatgcaaaaggtttgcttgtgtcttgatgcaatttta 335  Q
    || || ||||| || || ||||  || |  |||||  ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||   || ||||||||||||| ||| |    
T  5651 atgtctggtctagtggtgtttagatacatcaatctatcaatgagcctcctgtagcaagacacatcttcaaagggtgcactggtgtcttgatgcagtttaa 5552  T
Q  336 ctgaagtgtctaaaggtgtaggagcaggcttggcacctaaaagacctgaggaatcaagcaagtccaagcagtattttctttggga 420  Q
      ||||| || ||||||||||  ||||| || | |||| | ||||| || || ||||| || ||||  || ||||||||||||||    
T  5551 tagaagtatccaaaggtgtagatgcaggtttagaaccttagagaccagaagagtcaagtaaatccagacaatattttctttggga 5467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University