View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20193_low_16 (Length: 250)

Name: NF20193_low_16
Description: NF20193
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20193_low_16
NF20193_low_16
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (8-250)||(22072913-22073155)
chr7 (8-244)||(16219604-16219835)
chr7 (12-244)||(811018-811248)
chr7 (23-250)||(16056343-16056567)
chr7 (8-244)||(47831807-47832041)
chr7 (8-244)||(67745-67978)
chr7 (12-244)||(18005650-18005880)
chr7 (12-244)||(44014182-44014408)
chr7 (23-244)||(12901338-12901558)
chr7 (8-178)||(34200786-34200951)
chr7 (11-131)||(3564363-3564482)
chr7 (8-178)||(11995983-11996148)
chr7 (8-178)||(16495402-16495567)
chr7 (8-178)||(28505254-28505419)
chr7 (8-244)||(15754776-15755008)
chr7 (11-131)||(48273392-48273511)
chr7 (8-132)||(2280117-2280238)
chr7 (8-131)||(13647325-13647447)
chr7 (27-250)||(20220070-20220290)
chr7 (8-128)||(38227481-38227599)
chr7 (8-128)||(12698831-12698951)
chr7 (11-128)||(18456415-18456530)
chr7 (11-131)||(456321-456439)
chr7 (11-131)||(11972496-11972614)
chr7 (11-131)||(14949166-14949284)
chr7 (11-131)||(15376757-15376875)
chr7 (11-131)||(16232520-16232638)
chr7 (11-131)||(16410059-16410177)
chr7 (11-131)||(18640272-18640390)
chr7 (11-131)||(20385167-20385285)
chr7 (11-131)||(21189639-21189757)
chr7 (15-131)||(24275175-24275289)
chr7 (11-131)||(32125491-32125609)
chr7 (11-131)||(41522917-41523035)
chr7 (11-131)||(41525379-41525497)
chr7 (12-131)||(11393331-11393448)
chr7 (8-131)||(18430709-18430830)
chr7 (8-128)||(9509189-9509308)
chr7 (8-128)||(16386249-16386369)
chr7 (11-131)||(24702238-24702356)
chr7 (11-131)||(27216860-27216978)
chr7 (11-131)||(44116509-44116627)
chr7 (11-124)||(16213684-16213795)
chr7 (11-171)||(17061919-17062077)
chr7 (23-188)||(1867937-1868101)
chr7 (11-131)||(3386333-3386451)
chr7 (30-188)||(12255733-12255892)
chr7 (23-190)||(14044761-14044928)
chr7 (23-190)||(14354791-14354958)
chr7 (11-120)||(13869346-13869453)
chr7 (8-128)||(26211995-26212115)
chr7 (8-128)||(10589039-10589158)
chr7 (11-131)||(13831373-13831491)
chr7 (23-131)||(15144037-15144143)
chr7 (180-244)||(16324175-16324239)
chr7 (11-131)||(24704688-24704803)
chr7 (8-188)||(19486686-19486865)
chr7 (15-131)||(38898420-38898535)
chr7 (31-188)||(15008441-15008597)
chr7 (10-109)||(40443393-40443490)
chr7 (11-61)||(20110556-20110606)
chr7 (8-78)||(27847881-27847951)
chr7 (94-250)||(15113028-15113183)
chr7 (26-132)||(10063816-10063921)
chr7 (153-213)||(9389615-9389675)
chr7 (94-250)||(15116565-15116720)
chr7 (14-77)||(18154894-18154956)
chr7 (36-137)||(14036282-14036384)
chr7 (36-137)||(14346312-14346414)
chr7 (12-61)||(14932802-14932851)
chr7 (12-61)||(15356237-15356286)
chr7 (12-61)||(15360351-15360400)
chr7 (11-61)||(26356106-26356156)
chr7 (11-61)||(26358558-26358608)
chr7 (34-80)||(48991206-48991252)
chr7 (9-61)||(2832509-2832561)
chr7 (27-131)||(12756715-12756817)
chr7 (12-77)||(12187019-12187083)
chr7 (12-77)||(17138113-17138177)
chr7 (12-61)||(19649557-19649606)
chr7 (29-77)||(9177718-9177766)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (8-247)||(38855136-38855372)
chr8 (8-244)||(6520368-6520601)
chr8 (12-250)||(21285601-21285837)
chr8 (8-224)||(23760751-23760962)
chr8 (23-244)||(983289-983512)
chr8 (22-244)||(21673718-21673937)
chr8 (8-244)||(5866164-5866395)
chr8 (8-244)||(21490995-21491226)
chr8 (27-250)||(37116366-37116589)
chr8 (27-250)||(20498581-20498803)
chr8 (27-250)||(17266873-17267096)
chr8 (8-244)||(17140916-17141147)
chr8 (8-132)||(16092340-16092463)
chr8 (8-128)||(18818411-18818530)
chr8 (9-128)||(28649046-28649164)
chr8 (8-128)||(7372778-7372897)
chr8 (12-188)||(26355643-26355815)
chr8 (5-122)||(6759255-6759371)
chr8 (11-131)||(14409488-14409606)
chr8 (8-128)||(21919002-21919121)
chr8 (27-224)||(24353039-24353235)
chr8 (8-122)||(23406379-23406492)
chr8 (8-178)||(21249384-21249550)
chr8 (8-178)||(21255222-21255388)
chr8 (11-131)||(1484402-1484520)
chr8 (11-131)||(5853336-5853454)
chr8 (11-131)||(15203275-15203393)
chr8 (15-131)||(16413360-16413474)
chr8 (11-131)||(20403227-20403345)
chr8 (8-128)||(20536208-20536327)
chr8 (8-128)||(21923930-21924049)
chr8 (11-131)||(22001753-22001871)
chr8 (8-128)||(22626736-22626854)
chr8 (11-131)||(20046239-20046357)
chr8 (8-132)||(22875065-22875187)
chr8 (11-131)||(41598188-41598306)
chr8 (27-178)||(17439458-17439609)
chr8 (91-244)||(22364745-22364896)
chr8 (11-131)||(4483281-4483398)
chr8 (11-131)||(4542417-4542535)
chr8 (8-178)||(17612062-17612231)
chr8 (8-86)||(18879275-18879352)
chr8 (11-132)||(26219717-26219835)
chr8 (8-109)||(31971257-31971356)
chr8 (26-188)||(13508027-13508188)
chr8 (8-109)||(16199666-16199765)
chr8 (8-128)||(21395984-21396101)
chr8 (8-128)||(21790477-21790594)
chr8 (11-131)||(19896265-19896386)
chr8 (11-132)||(26225291-26225409)
chr8 (15-116)||(45290754-45290853)
chr8 (26-188)||(13597559-13597720)
chr8 (5-120)||(19937061-19937174)
chr8 (8-128)||(21389454-21389571)
chr8 (8-128)||(21778780-21778897)
chr8 (9-131)||(26223917-26224037)
chr8 (8-109)||(45131019-45131117)
chr8 (11-131)||(14823774-14823891)
chr8 (24-120)||(15070571-15070665)
chr8 (11-131)||(25484319-25484430)
chr8 (10-128)||(18678104-18678221)
chr8 (27-80)||(19154936-19154989)
chr8 (27-131)||(19801426-19801527)
chr8 (9-77)||(23648554-23648621)
chr8 (10-128)||(32121734-32121851)
chr8 (91-137)||(40492844-40492890)
chr8 (95-178)||(18862430-18862512)
chr8 (95-178)||(21383896-21383978)
chr8 (95-178)||(21387316-21387398)
chr8 (95-178)||(21411189-21411271)
chr8 (95-178)||(21805681-21805763)
chr8 (95-178)||(21827799-21827881)
chr8 (94-190)||(14103165-14103260)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (8-250)||(21329378-21329618)
chr5 (8-244)||(21502042-21502277)
chr5 (8-244)||(26011922-26012154)
chr5 (27-250)||(20026821-20027043)
chr5 (12-244)||(21565546-21565776)
chr5 (12-177)||(22959489-22959649)
chr5 (8-244)||(19660725-19660956)
chr5 (27-250)||(22178100-22178323)
chr5 (8-188)||(19668898-19669073)
chr5 (8-128)||(21729066-21729185)
chr5 (8-128)||(21808391-21808510)
chr5 (8-131)||(9077952-9078074)
chr5 (27-177)||(22144068-22144217)
chr5 (8-117)||(21997547-21997655)
chr5 (11-132)||(22412187-22412306)
chr5 (11-128)||(24529223-24529339)
chr5 (11-131)||(264812-264930)
chr5 (11-131)||(10732984-10733102)
chr5 (11-131)||(20909012-20909130)
chr5 (8-128)||(24493569-24493687)
chr5 (8-128)||(25421532-25421651)
chr5 (11-131)||(39363384-39363502)
chr5 (8-130)||(1096467-1096588)
chr5 (8-128)||(8286844-8286964)
chr5 (8-128)||(13025311-13025429)
chr5 (8-128)||(13095495-13095613)
chr5 (8-128)||(23390498-23390617)
chr5 (11-131)||(29329934-29330052)
chr5 (11-131)||(42245409-42245527)
chr5 (11-131)||(36154827-36154942)
chr5 (8-107)||(36314577-36314675)
chr5 (11-131)||(20902053-20902172)
chr5 (11-120)||(39245136-39245243)
chr5 (11-131)||(2154658-2154776)
chr5 (11-131)||(11581243-11581361)
chr5 (8-128)||(25431395-25431513)
chr5 (11-131)||(29345980-29346098)
chr5 (11-120)||(10775731-10775838)
chr5 (11-131)||(29348453-29348571)
chr5 (11-131)||(29350926-29351044)
chr5 (14-120)||(18319089-18319193)
chr5 (8-128)||(22075018-22075138)
chr5 (11-120)||(31061068-31061175)
chr5 (11-120)||(38619434-38619541)
chr5 (11-131)||(32027393-32027511)
chr5 (11-95)||(20918028-20918110)
chr5 (12-120)||(23064512-23064618)
chr5 (8-188)||(40725853-40726032)
chr5 (8-79)||(21293020-21293090)
chr5 (61-165)||(29448055-29448159)
chr5 (27-131)||(37723922-37724023)
chr5 (11-61)||(20806854-20806904)
chr5 (14-120)||(24067110-24067214)
chr5 (12-61)||(26704075-26704124)
chr5 (12-61)||(26973808-26973857)
chr5 (18-108)||(18418590-18418678)
chr5 (10-61)||(17517269-17517320)
chr5 (24-78)||(26732884-26732937)
chr5 (75-132)||(20766118-20766174)
chr5 (117-178)||(21741486-21741545)
chr5 (95-178)||(10753603-10753685)
chr5 (95-178)||(21871525-21871607)
chr5 (12-95)||(21873254-21873336)
chr5 (95-178)||(21875805-21875887)
chr5 (95-178)||(22120149-22120231)
chr5 (27-78)||(26740697-26740747)
chr5 (147-178)||(36314685-36314716)
chr5 (27-77)||(15796438-15796487)
chr5 (12-77)||(22032323-22032387)
chr5 (61-128)||(18356367-18356432)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (8-244)||(6010-6244)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (8-244)||(23019408-23019640)
chr6 (23-250)||(19668386-19668612)
chr6 (12-244)||(19652199-19652427)
chr6 (23-188)||(25644335-25644500)
chr6 (8-244)||(28496361-28496592)
chr6 (8-244)||(29808772-29809003)
chr6 (23-250)||(9098406-9098620)
chr6 (8-244)||(1561303-1561535)
chr6 (8-250)||(20109140-20109381)
chr6 (8-107)||(27333241-27333339)
chr6 (8-107)||(27393981-27394079)
chr6 (8-131)||(29060540-29060662)
chr6 (9-131)||(30676754-30676874)
chr6 (11-171)||(22782227-22782385)
chr6 (8-128)||(16496244-16496363)
chr6 (8-128)||(17287798-17287917)
chr6 (9-136)||(18409821-18409947)
chr6 (8-244)||(22080626-22080846)
chr6 (8-131)||(25629354-25629476)
chr6 (11-131)||(12742317-12742435)
chr6 (11-131)||(18334636-18334754)
chr6 (11-131)||(19005046-19005164)
chr6 (11-131)||(19858963-19859081)
chr6 (11-131)||(24422547-24422665)
chr6 (11-131)||(25656629-25656747)
chr6 (11-131)||(33861794-33861912)
chr6 (11-131)||(33864278-33864396)
chr6 (8-131)||(20593773-20593895)
chr6 (8-122)||(20076700-20076812)
chr6 (11-131)||(2291224-2291342)
chr6 (11-131)||(8055029-8055147)
chr6 (11-131)||(25754809-25754927)
chr6 (11-131)||(26924684-26924802)
chr6 (8-131)||(19303540-19303661)
chr6 (9-131)||(34963371-34963491)
chr6 (11-131)||(1540955-1541073)
chr6 (11-131)||(1595549-1595667)
chr6 (8-128)||(20360962-20361081)
chr6 (11-131)||(20556936-20557054)
chr6 (11-131)||(25688502-25688620)
chr6 (8-109)||(20638304-20638404)
chr6 (8-128)||(22780229-22780348)
chr6 (27-250)||(23076749-23076972)
chr6 (14-120)||(16448582-16448686)
chr6 (8-188)||(8227453-8227632)
chr6 (11-131)||(3852061-3852179)
chr6 (27-250)||(35008167-35008390)
chr6 (8-70)||(25714417-25714478)
chr6 (8-80)||(16920679-16920751)
chr6 (27-131)||(18456735-18456837)
chr6 (27-131)||(18461895-18461997)
chr6 (8-80)||(35245586-35245658)
chr6 (22-112)||(4185839-4185928)
chr6 (8-76)||(22831503-22831571)
chr6 (178-244)||(27333172-27333238)
chr6 (178-244)||(27393912-27393978)
chr6 (22-112)||(4186381-4186470)
chr6 (27-109)||(18821866-18821946)
chr6 (27-71)||(11185524-11185568)
chr6 (10-61)||(19848063-19848114)
chr6 (152-230)||(28103799-28103877)
chr6 (91-190)||(18696570-18696667)
chr6 (60-188)||(18706356-18706483)
chr6 (10-61)||(23992429-23992480)
chr6 (29-80)||(33443068-33443118)
chr6 (5-49)||(19008799-19008843)
chr6 (95-178)||(22949384-22949466)
chr6 (95-178)||(22953340-22953422)
chr6 (95-178)||(23871828-23871910)
chr6 (95-178)||(23875784-23875866)
chr6 (95-178)||(27325388-27325470)
chr6 (12-61)||(18907111-18907160)
chr6 (12-61)||(19862978-19863027)
chr6 (12-61)||(19873120-19873169)
chr6 (12-77)||(21766695-21766759)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (8-250)||(32538-32775)
scaffold0034 (27-109)||(51904-51985)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (23-250)||(10542-10767)
[»] chr3 (93 HSPs)
chr3 (8-244)||(15470927-15471157)
chr3 (8-244)||(14234487-14234723)
chr3 (12-244)||(16097332-16097562)
chr3 (12-241)||(12174152-12174376)
chr3 (12-244)||(16103784-16104013)
chr3 (8-178)||(13210283-13210448)
chr3 (27-250)||(37251048-37251270)
chr3 (8-128)||(18438534-18438653)
chr3 (27-250)||(22110232-22110454)
chr3 (11-132)||(27165250-27165370)
chr3 (8-130)||(14972854-14972975)
chr3 (27-188)||(52523669-52523831)
chr3 (8-128)||(12399209-12399328)
chr3 (11-119)||(53301562-53301669)
chr3 (22-165)||(32307691-32307830)
chr3 (26-132)||(42386428-42386533)
chr3 (8-128)||(23083363-23083482)
chr3 (11-131)||(29172627-29172745)
chr3 (8-131)||(25476384-25476506)
chr3 (11-128)||(24153211-24153326)
chr3 (11-132)||(36166598-36166716)
chr3 (11-131)||(6469178-6469296)
chr3 (11-131)||(9707651-9707769)
chr3 (11-131)||(17463178-17463296)
chr3 (11-131)||(17672626-17672744)
chr3 (8-128)||(20698437-20698556)
chr3 (8-128)||(26686887-26687006)
chr3 (11-131)||(28848655-28848773)
chr3 (11-131)||(34159326-34159444)
chr3 (11-131)||(45606951-45607069)
chr3 (11-131)||(55476491-55476609)
chr3 (11-126)||(55500942-55501055)
chr3 (8-109)||(11424781-11424880)
chr3 (11-131)||(7781391-7781509)
chr3 (11-131)||(8899094-8899212)
chr3 (8-128)||(13442274-13442393)
chr3 (11-131)||(16454325-16454443)
chr3 (8-128)||(17487856-17487975)
chr3 (8-128)||(17499338-17499457)
chr3 (11-131)||(38961935-38962053)
chr3 (12-112)||(49668094-49668193)
chr3 (27-171)||(43925977-43926121)
chr3 (11-131)||(13151834-13151953)
chr3 (11-131)||(13154299-13154418)
chr3 (10-131)||(13544024-13544143)
chr3 (12-112)||(9512924-9513023)
chr3 (12-112)||(9520899-9520998)
chr3 (11-131)||(10247767-10247885)
chr3 (15-131)||(12567564-12567678)
chr3 (11-131)||(15977515-15977633)
chr3 (11-131)||(17446699-17446816)
chr3 (11-131)||(40213720-40213838)
chr3 (8-171)||(43550482-43550644)
chr3 (8-128)||(43840932-43841051)
chr3 (22-128)||(14572603-14572707)
chr3 (13-131)||(16282855-16282971)
chr3 (11-73)||(28194693-28194755)
chr3 (11-120)||(12119780-12119887)
chr3 (11-120)||(15412429-15412536)
chr3 (11-132)||(21618449-21618567)
chr3 (8-188)||(24340665-24340844)
chr3 (13-131)||(41123892-41124005)
chr3 (11-131)||(50242822-50242940)
chr3 (26-132)||(23274705-23274810)
chr3 (11-120)||(8499518-8499625)
chr3 (8-188)||(37642207-37642386)
chr3 (11-132)||(10556985-10557105)
chr3 (11-112)||(44494809-44494908)
chr3 (27-131)||(53070697-53070799)
chr3 (11-70)||(17737236-17737294)
chr3 (22-128)||(14576835-14576939)
chr3 (11-61)||(45577950-45578000)
chr3 (117-213)||(1465329-1465423)
chr3 (27-136)||(12377940-12378050)
chr3 (70-188)||(2051141-2051260)
chr3 (118-244)||(49389517-49389642)
chr3 (8-188)||(22147467-22147646)
chr3 (27-131)||(606324-606428)
chr3 (22-165)||(1644642-1644780)
chr3 (10-61)||(46822267-46822318)
chr3 (168-250)||(43927291-43927373)
chr3 (10-61)||(12511059-12511110)
chr3 (12-77)||(856140-856204)
chr3 (12-77)||(23077530-23077594)
chr3 (9-61)||(14665398-14665450)
chr3 (9-61)||(14668554-14668606)
chr3 (95-178)||(14501207-14501290)
chr3 (95-178)||(19776007-19776089)
chr3 (95-178)||(37439421-37439503)
chr3 (29-79)||(13919350-13919399)
chr3 (12-61)||(15878119-15878168)
chr3 (12-60)||(26196500-26196548)
chr3 (9-61)||(30029841-30029893)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (8-247)||(39706173-39706409)
chr4 (23-244)||(12288096-12288316)
chr4 (27-250)||(13731-13953)
chr4 (8-178)||(15551817-15551982)
chr4 (27-250)||(53082032-53082254)
chr4 (23-188)||(52243136-52243302)
chr4 (27-250)||(46640336-46640558)
chr4 (11-132)||(54798752-54798872)
chr4 (8-128)||(7798774-7798893)
chr4 (8-128)||(52873369-52873488)
chr4 (23-188)||(43198495-43198661)
chr4 (12-165)||(12774011-12774160)
chr4 (11-132)||(14280316-14280435)
chr4 (11-131)||(16377522-16377639)
chr4 (8-128)||(7088877-7088996)
chr4 (8-128)||(12902757-12902876)
chr4 (11-131)||(18215318-18215436)
chr4 (11-131)||(44928923-44929042)
chr4 (11-131)||(12351-12469)
chr4 (8-128)||(7893703-7893822)
chr4 (11-131)||(15118396-15118514)
chr4 (11-131)||(44773131-44773249)
chr4 (11-131)||(52312510-52312628)
chr4 (12-244)||(8846360-8846606)
chr4 (5-131)||(19242693-19242817)
chr4 (9-131)||(19618216-19618336)
chr4 (11-131)||(1837553-1837671)
chr4 (11-131)||(3515007-3515125)
chr4 (8-128)||(16270238-16270356)
chr4 (11-131)||(18239463-18239581)
chr4 (11-131)||(44615288-44615406)
chr4 (11-131)||(50222383-50222501)
chr4 (11-131)||(51463912-51464030)
chr4 (13-131)||(14038653-14038770)
chr4 (8-101)||(3096293-3096385)
chr4 (11-124)||(23803316-23803427)
chr4 (8-128)||(6899891-6900009)
chr4 (8-128)||(16239972-16240090)
chr4 (46-244)||(16596686-16596879)
chr4 (8-128)||(44052829-44052948)
chr4 (10-128)||(22636437-22636554)
chr4 (11-132)||(8574867-8574985)
chr4 (15-120)||(15355380-15355483)
chr4 (15-128)||(23374361-23374473)
chr4 (11-131)||(44102214-44102332)
chr4 (9-131)||(14970751-14970871)
chr4 (8-80)||(17046487-17046559)
chr4 (117-244)||(15099457-15099582)
chr4 (117-244)||(15190424-15190549)
chr4 (27-109)||(6190481-6190563)
chr4 (11-70)||(7641286-7641344)
chr4 (11-70)||(12610950-12611008)
chr4 (8-109)||(14053323-14053422)
chr4 (8-120)||(15367690-15367800)
chr4 (8-120)||(15370018-15370128)
chr4 (8-120)||(15371202-15371312)
chr4 (8-120)||(15373483-15373593)
chr4 (8-120)||(15402703-15402813)
chr4 (8-120)||(16223532-16223642)
chr4 (27-131)||(21815629-21815731)
chr4 (89-135)||(15464926-15464972)
chr4 (14-120)||(20149832-20149936)
chr4 (10-131)||(22353835-22353955)
chr4 (200-246)||(14164739-14164785)
chr4 (95-178)||(630728-630810)
chr4 (95-178)||(3331970-3332052)
chr4 (95-178)||(13812763-13812845)
chr4 (95-178)||(14953915-14953997)
chr4 (95-178)||(25690146-25690228)
chr4 (202-244)||(12774189-12774231)
chr4 (200-246)||(14158034-14158080)
chr4 (9-61)||(20157527-20157579)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (8-244)||(922-1155)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (8-242)||(6611-6843)
scaffold0333 (8-242)||(13991-14223)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (8-244)||(12942-13173)
scaffold0138 (91-250)||(18118-18276)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (8-244)||(6535-6768)
scaffold0621 (23-250)||(8481-8709)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (12-244)||(22921756-22921986)
chr1 (27-250)||(21861450-21861672)
chr1 (27-250)||(21896139-21896358)
chr1 (8-244)||(33681010-33681241)
chr1 (8-188)||(22237630-22237805)
chr1 (27-250)||(50613996-50614219)
chr1 (27-250)||(50621824-50622047)
chr1 (24-178)||(20918620-20918769)
chr1 (9-131)||(50210212-50210333)
chr1 (27-250)||(50686630-50686853)
chr1 (8-178)||(14295507-14295672)
chr1 (27-250)||(16368167-16368388)
chr1 (12-188)||(20248283-20248454)
chr1 (11-128)||(34509783-34509899)
chr1 (23-244)||(52927869-52928076)
chr1 (22-165)||(21754059-21754198)
chr1 (27-250)||(41049916-41050138)
chr1 (27-188)||(35261023-35261180)
chr1 (8-171)||(45574846-45575008)
chr1 (11-131)||(13988866-13988984)
chr1 (11-131)||(21923335-21923453)
chr1 (11-131)||(23593779-23593897)
chr1 (23-187)||(16758664-16758828)
chr1 (11-130)||(31612313-31612430)
chr1 (10-131)||(21840766-21840885)
chr1 (11-131)||(21475131-21475249)
chr1 (8-128)||(27250731-27250850)
chr1 (11-131)||(29298137-29298254)
chr1 (11-131)||(433012-433128)
chr1 (11-123)||(22123119-22123230)
chr1 (8-128)||(22532269-22532388)
chr1 (11-131)||(29776688-29776806)
chr1 (8-111)||(20847173-20847275)
chr1 (8-128)||(21026680-21026799)
chr1 (9-131)||(16361915-16362035)
chr1 (11-171)||(21707167-21707325)
chr1 (11-171)||(21711709-21711867)
chr1 (8-120)||(13212917-13213027)
chr1 (9-77)||(20454606-20454673)
chr1 (5-120)||(15860064-15860177)
chr1 (5-120)||(21342090-21342203)
chr1 (117-244)||(35981575-35981700)
chr1 (27-189)||(16093825-16093987)
chr1 (11-120)||(16275419-16275526)
chr1 (11-120)||(21346961-21347068)
chr1 (8-84)||(38801433-38801508)
chr1 (9-128)||(22468698-22468816)
chr1 (117-244)||(49261448-49261573)
chr1 (116-244)||(20636956-20637082)
chr1 (61-178)||(22130863-22130975)
chr1 (12-229)||(21161720-21161932)
chr1 (14-120)||(40389157-40389261)
chr1 (12-61)||(21714546-21714595)
chr1 (9-128)||(20135188-20135306)
chr1 (29-178)||(26064959-26065107)
chr1 (84-178)||(51130639-51130729)
chr1 (9-61)||(24783160-24783212)
chr1 (95-178)||(1924914-1924996)
chr1 (95-178)||(20923928-20924010)
chr1 (94-131)||(12271639-12271676)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (8-244)||(12766-13000)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (88-250)||(8094-8255)
scaffold0556 (22-244)||(6826-7043)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (12-244)||(19268-19498)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (12-244)||(100378-100608)
scaffold0023 (12-244)||(40061-40291)
scaffold0023 (11-131)||(94411-94529)
scaffold0023 (11-131)||(44454-44573)
scaffold0023 (15-131)||(17484-17598)
scaffold0023 (8-81)||(119875-119948)
scaffold0023 (12-85)||(101503-101576)
scaffold0023 (12-61)||(38547-38596)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (12-244)||(25175854-25176084)
chr2 (13-244)||(28405981-28406211)
chr2 (27-244)||(7619-7835)
chr2 (23-244)||(18786789-18787009)
chr2 (12-176)||(7679589-7679750)
chr2 (11-131)||(22105412-22105531)
chr2 (27-244)||(23791292-23791509)
chr2 (27-250)||(23207296-23207518)
chr2 (11-128)||(298816-298933)
chr2 (8-188)||(23708561-23708738)
chr2 (8-128)||(23060513-23060632)
chr2 (8-178)||(23071905-23072070)
chr2 (27-249)||(25108906-25109128)
chr2 (11-131)||(6725995-6726113)
chr2 (8-132)||(22337115-22337238)
chr2 (8-128)||(23076442-23076561)
chr2 (11-131)||(571397-571515)
chr2 (11-131)||(18808943-18809061)
chr2 (11-131)||(23130862-23130980)
chr2 (11-131)||(23133329-23133447)
chr2 (11-131)||(23135590-23135708)
chr2 (11-131)||(23709576-23709694)
chr2 (11-131)||(23712057-23712175)
chr2 (11-131)||(26505379-26505497)
chr2 (11-131)||(26507857-26507975)
chr2 (11-131)||(34402566-34402684)
chr2 (11-131)||(39682313-39682431)
chr2 (9-131)||(32214965-32215085)
chr2 (11-131)||(24367774-24367892)
chr2 (11-131)||(28577099-28577217)
chr2 (8-178)||(19671830-19671998)
chr2 (8-126)||(22731238-22731355)
chr2 (8-109)||(38136-38235)
chr2 (14-131)||(21155104-21155219)
chr2 (11-131)||(24898239-24898358)
chr2 (11-131)||(24900722-24900841)
chr2 (11-131)||(24903199-24903318)
chr2 (11-131)||(24905676-24905795)
chr2 (11-131)||(24908151-24908270)
chr2 (11-131)||(32039542-32039660)
chr2 (8-86)||(23285865-23285942)
chr2 (13-131)||(43137301-43137417)
chr2 (8-128)||(23660023-23660141)
chr2 (11-131)||(45029898-45030016)
chr2 (8-128)||(20309108-20309225)
chr2 (27-178)||(20520145-20520295)
chr2 (8-128)||(22738182-22738300)
chr2 (8-131)||(23103396-23103516)
chr2 (11-131)||(24529573-24529691)
chr2 (8-87)||(8946657-8946735)
chr2 (27-188)||(22413078-22413240)
chr2 (9-130)||(22134208-22134326)
chr2 (11-131)||(38967374-38967493)
chr2 (8-72)||(23040247-23040310)
chr2 (8-128)||(23654388-23654507)
chr2 (27-109)||(32451949-32452031)
chr2 (94-250)||(22459442-22459598)
chr2 (14-70)||(24643054-24643109)
chr2 (27-188)||(24697548-24697709)
chr2 (27-137)||(23004767-23004878)
chr2 (15-128)||(25616192-25616304)
chr2 (29-79)||(23287384-23287433)
chr2 (29-78)||(26392403-26392451)
chr2 (95-178)||(1283666-1283748)
chr2 (95-178)||(30344776-30344858)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (22-244)||(5657-5876)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (12-250)||(1086-1322)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (12-241)||(2535-2762)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (23-244)||(10428-10647)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (22-244)||(129919-130139)
scaffold0010 (27-135)||(60710-60818)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (26-244)||(62216-62429)
scaffold0028 (11-131)||(136680-136798)
scaffold0028 (11-131)||(139149-139267)
scaffold0028 (11-131)||(144087-144205)
scaffold0028 (11-131)||(134211-134329)
scaffold0028 (11-131)||(141618-141736)
scaffold0028 (12-115)||(132662-132765)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (12-244)||(14584-14814)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (23-250)||(7957-8180)
scaffold0218 (55-176)||(29238-29354)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (12-244)||(160688-160917)
scaffold0001 (15-131)||(501088-501202)
scaffold0001 (11-120)||(85635-85742)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (23-244)||(22561-22776)
scaffold0037 (11-131)||(82072-82190)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (27-244)||(136254-136471)
scaffold0021 (27-244)||(144962-145179)
scaffold0021 (9-131)||(174767-174886)
scaffold0021 (8-78)||(121766-121835)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (12-188)||(45735-45909)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (27-250)||(6163-6386)
scaffold0420 (27-74)||(13793-13840)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (27-244)||(12587-12802)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (12-188)||(133-307)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (27-250)||(128850-129072)
scaffold0022 (31-250)||(78345-78562)
scaffold0022 (11-132)||(116430-116548)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (11-244)||(15664-15892)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (12-244)||(2691-2923)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (8-178)||(11292-11457)
scaffold0046 (8-244)||(1997-2228)
scaffold0046 (8-128)||(28414-28533)
scaffold0046 (8-64)||(4552-4608)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (9-131)||(3185-3306)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (31-250)||(38339-38558)
scaffold0139 (12-61)||(19980-20029)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (23-244)||(103525-103737)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (66-241)||(2108-2281)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (8-178)||(1025-1190)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (27-250)||(53429-53651)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (27-250)||(19765-19987)
scaffold0080 (8-128)||(39913-40031)
scaffold0080 (95-178)||(48939-49021)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (27-250)||(97024-97247)
scaffold0006 (27-250)||(106302-106525)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (11-132)||(44705-44825)
scaffold0122 (15-131)||(26064-26179)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (11-132)||(38700-38820)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (8-132)||(3149-3271)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (23-135)||(27744-27855)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (8-144)||(15763-15898)
scaffold0020 (199-244)||(15719-15764)
scaffold0020 (12-61)||(178898-178947)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (9-131)||(17214-17337)
scaffold0056 (27-131)||(79328-79430)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (23-135)||(16095-16206)
scaffold0357 (27-133)||(13147-13252)
scaffold0357 (27-79)||(2680-2732)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (10-132)||(39479-39599)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (10-132)||(75213-75333)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (27-132)||(1051-1155)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (8-128)||(4849-4968)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (8-178)||(34123-34288)
scaffold0175 (58-128)||(13141-13211)
scaffold0175 (8-61)||(273-326)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (8-128)||(51913-52032)
scaffold0011 (8-128)||(167980-168099)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (8-131)||(16113-16235)
scaffold0120 (8-128)||(32959-33077)
scaffold0120 (8-128)||(45928-46046)
scaffold0120 (8-70)||(17389-17450)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (23-178)||(25121-25275)
scaffold0123 (91-188)||(620-715)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (11-128)||(22886-23001)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (11-131)||(13392-13510)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (11-131)||(20747-20865)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (8-128)||(13211-13330)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (11-131)||(37821-37939)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (11-131)||(158494-158612)
scaffold0003 (11-131)||(339949-340065)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (8-135)||(8479-8605)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (29-244)||(7945-8161)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (8-131)||(16599-16721)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (10-131)||(10772-10891)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (11-131)||(4694-4812)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (8-128)||(3470-3589)
scaffold0292 (8-128)||(343-461)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (11-131)||(13947-14065)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (8-128)||(32942-33060)
scaffold0145 (6-131)||(9744-9867)
scaffold0145 (8-128)||(38761-38879)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (11-131)||(16784-16902)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (8-128)||(1851-1970)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (58-250)||(54-246)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (8-128)||(8535-8650)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (27-250)||(569-790)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (8-112)||(23901-24001)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (9-131)||(11286-11406)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (27-250)||(267679-267901)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (8-188)||(11464-11643)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (8-188)||(38198-38377)
scaffold0124 (95-178)||(24605-24690)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (8-128)||(1050-1169)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (8-132)||(4508-4630)
scaffold0228 (8-132)||(12090-12212)
scaffold0228 (8-132)||(22042-22164)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (11-131)||(40400-40518)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (8-132)||(25896-26018)
scaffold0026 (8-132)||(39858-39980)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (8-128)||(6123-6245)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (12-115)||(32102-32205)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (9-131)||(12293-12413)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (8-128)||(10427-10544)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (11-120)||(4214-4321)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (10-131)||(9241-9360)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (11-131)||(29931-30050)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (8-100)||(4712-4803)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (26-128)||(24304-24406)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (27-250)||(1678-1900)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (8-78)||(1289-1359)
scaffold0106 (8-80)||(7266-7338)
scaffold0106 (11-77)||(15291-15356)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (14-131)||(4300-4415)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (8-111)||(16282-16382)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (8-188)||(17969-18148)
scaffold0247 (11-120)||(2184-2291)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (11-131)||(106-224)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (8-128)||(1952-2071)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (8-128)||(20910-21030)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (8-80)||(51582-51654)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (8-87)||(13497-13575)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (8-79)||(32067-32137)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (11-131)||(12064-12176)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (8-109)||(15485-15584)
scaffold0114 (12-77)||(7295-7359)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (11-131)||(161133-161252)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (29-128)||(4545-4643)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (12-85)||(28813-28887)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (14-120)||(1336-1440)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (8-78)||(46995-47065)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (8-109)||(11464-11564)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (8-80)||(1098-1170)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (27-131)||(20423-20524)
scaffold0031 (8-128)||(128751-128869)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (11-74)||(5183-5246)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (8-75)||(4888-4954)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (27-112)||(2694-2780)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (66-188)||(225465-225585)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (12-61)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (12-61)||(36454-36503)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (72-131)||(3529-3588)
scaffold0327 (12-62)||(289-339)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (27-70)||(11982-12024)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (12-61)||(29558-29607)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (84-178)||(2398-2488)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (95-178)||(6-88)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (90-132)||(27911-27953)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (29-79)||(206575-206624)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (12-77)||(1881-1945)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (12-61)||(159-208)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (12-77)||(10575-10639)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (12-61)||(21871-21920)
scaffold0210 (12-61)||(29763-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (12-61)||(69794-69843)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (94-190)||(602-697)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073155
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggc 22073112  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22073113 ttactgaaacaacaacatcaagacaaacaacttagttccttac 22073155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16219835 - 16219604
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  16219835 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 16219740  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16219739 gaatgcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggc 16219641  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219640 ttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 16219604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811018
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 211  Q
    | ||||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811149 gcaagtcattaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttac 811051  T
Q  212 tgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  811050 tgaaactacaacagcaagataaataacttagtt 811018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056567
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa--caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  123 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  16056441 acatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatatcattcaggcttaccgaaacaacaa 16056539  T
Q  223 cagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||    
T  16056540 catcaagataaacaacttagtttcttac 16056567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47832041
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatc-atcatgatataacaatatc 47831905  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47831906 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattatacaattcaggc 47832004  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  47832005 ttactgaaacaacaacaacaagataaataacttagtt 47832041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67978
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 67843  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 206  Q
     |||| || |||||||||||||||  ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  67844 gaatgcaaatcaacaacatctcaat-atcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcagg 67940  T
Q  207 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  67941 ctcactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 67978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005880
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatg-gaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 210  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctta 18005846  T
Q  211 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18005847 ctgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 18005880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014408
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 210  Q
    | ||   | |||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  44014281 gcaa---atcaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggctta 44014375  T
Q  211 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44014376 ctgaaacaacaacagcaaga-taacaacttagtt 44014408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901558
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||| ||  || |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  122 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 221  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12901438 aacatcacaa-catcatacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcatataattcaagcttactgaaacaaca 12901535  T
Q  222 acagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||| ||||| |||||||||||||    
T  12901536 acaacaagataaacaacttagtt 12901558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34200951
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 34200884  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200885 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 34200951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564363
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 3564384  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3564383 tgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11995983
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||     
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatt 11996050  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996049 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 11995983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495567
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 16495500  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495501 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505254
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
      || ||| ||| |||   |||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505320 ggatataaatcagcaa---ctcaattatcaaac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 28505254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754776
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 15754910  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcagg 206  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||    ||||     
T  15754909 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagt 15754814  T
Q  207 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||    
T  15754813 cttactggaatattaacagcaagataaacaacttagtt 15754776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273511
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 48273490  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  48273491 tgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280117
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatc 2280142  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    ||||| || ||||||||||||||||    
T  2280141 aaatgcaaatcaacaacatctcaaa 2280117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647447
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatc 13647423  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  13647424 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13647447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220070
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||      
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca-- 20220194  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
     |||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  20220193 -tctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactggaacaacaaca 20220096  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| || |||||||||| |||||    
T  20220095 gtaagataagcaacttagtttcttac 20220070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227599
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38227578  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  38227579 aaatgcaagtcaacaacatct 38227599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12698951
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatat 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatat 12698929  T
Q  107 caaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||| || || ||| ||||||||    
T  12698930 caattgcaattcatcaacatct 12698951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456415
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 18456433  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || |||||||||||||||    
T  18456432 tgcaagtcaacaacatct 18456415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456439
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 456418  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  456419 tgcaagtcaacaacgtctcaa 456439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972614
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 11972593  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  11972594 tgcaagtcaacaacgtctcaa 11972614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949166
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14949187  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14949186 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14949166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376757
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15376778  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15376777 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15376757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232638
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16232617  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16232618 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16232638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410177
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16410156  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16410157 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16410177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640390
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18640369  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18640370 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18640390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385167
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20385188  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20385187 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20385167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189639
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21189660  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21189659 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21189639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275289
Alignment:
Q  15 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 24275272  T
Q  115 agtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||||| ||||||    
T  24275273 agtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125609
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32125588  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  32125589 tgcaagtcaacaacgtctcaa 32125609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523035
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41523014  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41523015 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41523035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525497
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41525476  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41525477 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41525497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393331
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11393351  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  11393350 gcaagtcaacaacgtctcaa 11393331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430830
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatc 18430806  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  18430807 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 18430830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509308
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatc 9509287  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  9509288 aattgcaattcatcaacatct 9509308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386249
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || ||||  ||| ||||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatct 16386249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702356
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 24702335  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24702336 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24702356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27216978
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 27216957  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  27216958 tgcaagtcaacaacgtctcaa 27216978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116627
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 44116606  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44116607 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44116627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213795
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16213781  T
Q  111 tgtaagtcaacaac 124  Q
    |  |||||||||||    
T  16213782 tccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061919
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatacaaaa-tagcatgacataataatatcaaa 17061980  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 171  Q
    || |||||| |||| ||||||  ||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17061979 tgcaagtcagcaacgtctcaattat-taacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867937
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || | ||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaa 1868004  T
Q  121 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    ||||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  1868003 caacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 1867937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386451
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | |||||||||    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaa 3386430  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3386431 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3386451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255733
Alignment:
Q  30 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  129 caaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    |||||| ||| | || || ||| |||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  12255792 caaacattcatatat-aattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacat 12255733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 190
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044928
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||| |||  | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaa-cagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaa 14044858  T
Q  121 -caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 190  Q
     ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14044859 tcaacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14044928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 190
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354958
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||| |||  | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaa-cagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaa 14354888  T
Q  121 -caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 190  Q
     ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14354889 tcaacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14354958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869453
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13869443  T
Q  111 tgtaagtcaa 120  Q
    || |||||||    
T  13869444 tgcaagtcaa 13869453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212115
Alignment:
Q  8 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 106  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatat 26212093  T
Q  107 caaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||| || || ||||||||||||    
T  26212094 caattgcaattcaacaacatct 26212115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589158
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatc 10589137  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||||||||||||    
T  10589138 aattgcaattcaacaacatct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831491
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaa 13831470  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13831471 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13831491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15144037
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaaca 15144046  T
Q  123 acatctcaa 131  Q
    |||||||||    
T  15144045 acatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324239
Alignment:
Q  180 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16324175 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtt 16324239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704803
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||   | || || |||| |||||||||    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaa---aacaagacataataatatcaaa 24704782  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24704783 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24704803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486686
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19486767  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| || ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  19486766 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 19486686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898420
Alignment:
Q  15 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 38898438  T
Q  115 agtcaa-caacatctcaa 131  Q
    |||||| |||||||||||    
T  38898437 agtcaatcaacatctcaa 38898420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008441
Alignment:
Q  31 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacct 15008500  T
Q  129 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    ||||||||| | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  15008499 caaacatcatatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 109
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443490
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 40443490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110606
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20110606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847881
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 78  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 250
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113183
Alignment:
Q  94 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagat 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |  ||||| |  |    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatat-aactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaact 15113126  T
Q  194 tatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
     ||| || |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  15113127 catataaatcagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttac 15113183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063816
Alignment:
Q  26 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 125  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaaca 10063823  T
Q  126 tctcaaa 132  Q
    |||||||    
T  10063822 tctcaaa 10063816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9389675 - 9389615
Alignment:
Q  153 aatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  9389675 aatgtatatacaattatataacattatcatcaatattagaatatacaatccaggcttactg 9389615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 250
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116720
Alignment:
Q  94 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagat 193  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||   ||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||| |  |    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatat-aactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaact 15116663  T
Q  194 tatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
     ||| |  |||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| |||||    
T  15116664 catatacatcagtcttactgaaacaataacagtaggataaacaacttagtttcttac 15116720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154894
Alignment:
Q  14 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggcag 18154894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 137
Target Start/End: Original strand, 14036282 - 14036384
Alignment:
Q  36 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaa 132  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  14036282 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaa 14036379  T
Q  133 catca 137  Q
    |||||    
T  14036380 catca 14036384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 137
Target Start/End: Original strand, 14346312 - 14346414
Alignment:
Q  36 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaa 132  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  14346312 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaa 14346409  T
Q  133 catca 137  Q
    |||||    
T  14346410 catca 14346414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932802
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 14932802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356237
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15356237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360351
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26356106
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26356106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358558
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26358558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 80
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991252
Alignment:
Q  34 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 80  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtat 48991252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832509
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 2832509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756715
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataac-aacagcaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgt 12756720  T
Q  127 ctcaa 131  Q
    |||||    
T  12756719 ctcaa 12756715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187083
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 12187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138113
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 17138113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649557
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19649557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 9177766 - 9177718
Alignment:
Q  29 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  9177766 tagaccgactcatgcagcttaattcaataataaacaacaacatatgcag 9177718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855136
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 38855274  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855273 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 38855176  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttcct 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38855175 ttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttcct 38855136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520601
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 6520466  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520467 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 6520564  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6520565 ttactgaaacaacaacagcaagataaataacttagtt 6520601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285837
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaat 21285699  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21285700 gcaaatcaacaacatctcaaacatcaaacatagt-tcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattatataattcaggcttac 21285798  T
Q  212 tgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||    
T  21285799 tgaaacaacaacaacaagataaagcacttagtttcttac 21285837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23760962 - 23760751
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||     
T  23760962 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg-taaatcatcatgatataacaatatt 23760867  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 206  Q
     |||  || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  23760866 gaattcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcagg 23760769  T
Q  207 cttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23760768 cttactgaaacaacaaca 23760751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983289
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa-caagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaa 983414  T
Q  121 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 220  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  983413 caacatcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcatataattcagacttactgaaacaac 983316  T
Q  221 aacagcaa---gacaaacaacttagtt 244  Q
    |||| |||   || |||||||||||||    
T  983315 aacaacaacatgataaacaacttagtt 983289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 21673718 - 21673937
Alignment:
Q  22 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  21673718 atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 21673816  T
Q  122 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaac 220  Q
    ||||||||||| ||| || || || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||    
T  21673817 aacatctcaaatatc-aatat-aatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaac 21673914  T
Q  221 aacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||| |||||  ||||||||||||    
T  21673915 aacaacaaga-taacaacttagtt 21673937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866164
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 5866297  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  5866296 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtc 5866201  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  5866200 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtt 5866164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491226
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||     
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatt 21491093  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  21491094 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataggcatcagtc 21491189  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  21491190 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtt 21491226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116589
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  37116465 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaaca 37116563  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| || |||||||||| |||||    
T  37116564 gtaagataagcaacttagtttcttac 37116589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498803
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  127 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||| |||||| |||||     
T  20498680 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtcttaccgaaacatcaacat 20498778  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||    
T  20498779 caagataaacaacttagtttcttac 20498803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266873
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||    |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  126 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    |||||||||||| | ||||  || ||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17266996 tctcaaacatcatatataat-tcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggctcactgaaacaacaacag 17266898  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttac 250  Q
     |||| || |||||||||| |||||    
T  17266897 taagataagcaacttagtttcttac 17266873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141147
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgacataataatatc 17141014  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  17141015 gaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtc 17141110  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  17141111 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtt 17141147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092340
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16092365  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  16092364 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 16092340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818411
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18818432  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  18818431 aattgtaagtcaacatcatct 18818411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28649046
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||    
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 28649066  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  28649065 aatgcaagtcaacaacatct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7372897
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7372876  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  7372877 aattgcaagtcaacatcatct 7372897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355643
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcacgatataacaatatcgaat 26355717  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    | || ||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26355716 gcaa-tcaacaacatctcagccatc-aacatattc-catttaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 26355643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759371
Alignment:
Q  5 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataat 6759353  T
Q  105 atcaaatgtaagtcaaca 122  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6759354 atcaaatgcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409488
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14409509  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14409508 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14409488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21919002
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21919023  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21919022 aattgcaattcaacaacatct 21919002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353235
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 24353136  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||||||||  | |  || |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24353137 atctcaaacatcgtata-caattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 24353235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 122
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406492
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23406477  T
Q  108 aaatgtaagtcaaca 122  Q
    || || |||||||||    
T  23406478 aattgcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249550
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatat 21249482  T
Q  107 caaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    | ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249483 cgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21249550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255388
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatat 21255320  T
Q  107 caaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    | ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255321 cgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21255388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484520
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 1484499  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1484500 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1484520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853336
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 5853357  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  5853356 tgcaagtcaacaacgtctcaa 5853336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203275
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15203296  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  15203295 tgtaagtcaacaacgtctcaa 15203275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413360
Alignment:
Q  15 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16413377  T
Q  115 agtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16413376 agtcaacaacgtctcaa 16413360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403345
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20403324  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20403325 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20403345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536327
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20536306  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20536307 aattgcaattcatcaacatct 20536327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923930
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| || | ||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatc 21923951  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || |||||||||||||||    
T  21923950 aattgcaagtcaacaacatct 21923930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001871
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22001850  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22001851 tgcaagtcaacaacgtctcaa 22001871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626854
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 22626833  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||  || ||||||||||||    
T  22626834 aaatacaaatcaacaacatct 22626854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046239
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 20046260  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20046259 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20046239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875187
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 22875162  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  22875163 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22875187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598306
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41598285  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41598286 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41598306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439458
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17439511  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17439510 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacatta 17439458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 244
Target Start/End: Original strand, 22364745 - 22364896
Alignment:
Q  91 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 190  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| || |||  |||||||| |    
T  22364745 catgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  191 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  22364843 aatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtt 22364896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483398
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4483377  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4483378 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4483398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542417
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||  || ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4542438  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4542437 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4542417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612062
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 17612133  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17612132 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 17612062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879275
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 86  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 18879275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219835
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||  || |||| |||| |||||||||    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaa-tagtatgacataataatatcaaa 26219813  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  26219814 tgcaagtcaacaacatctcaaa 26219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971356
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 31971354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508027
Alignment:
Q  26 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13508090  T
Q  126 tctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    ||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13508089 tctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13508027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199666
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa--caacatgacataataatatc 16199668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395984
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatc 21396005  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21396004 aaattcaattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790477
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatc 21790498  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21790497 aaattcaattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896386
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga---tataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | |||| ||||| ||||||||    |||| ||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatc 19896362  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19896363 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19896386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225291
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  || ||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acaatatacaaaa-cagtatgacataataatatcaaa 26225313  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  26225312 tacaagtcaacaacatctcaaa 26225291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290754
Alignment:
Q  15 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 45290756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597559
Alignment:
Q  26 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13597622  T
Q  126 tctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    || |||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13597621 tcccaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13597559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937061
Alignment:
Q  5 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||     
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataag 19937077  T
Q  105 atcaaatgtaagtcaa 120  Q
    |||||||| |||||||    
T  19937076 atcaaatgcaagtcaa 19937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389454
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778780
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224037
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| ||| |||||  ||||||| |||| |||||||    
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataac-aacagcaata-aagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatca 26224014  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  26224015 aatgcaagtcaacaacatctcaa 26224037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45131019
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatc 45131021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823891
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaa-caacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14823870  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14823871 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14823891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 120
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070665
Alignment:
Q  24 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484319
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataac-aacagc--------tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25484340  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  25484339 tgcaaatcaacaacgtctcaa 25484319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678104
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| ||||||||    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 18678123  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatct 128  Q
     || || ||||||||||||    
T  18678122 ttgcaattcaacaacatct 18678104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154936
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 80  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat 19154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801426
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgt 19801431  T
Q  127 ctcaa 131  Q
    |||||    
T  19801430 ctcaa 19801426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648621
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaac-aatagcaacataggcag 23648621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121851
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| ||||||||    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 32121832  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatct 128  Q
     || || ||||||||||||    
T  32121833 ttgcaattcaacaacatct 32121851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40492890 - 40492844
Alignment:
Q  91 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 137  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40492890 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18862512 - 18862430
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  18862512 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 18862430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 21383896 - 21383978
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21383896 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 21387316 - 21387398
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21387316 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21387398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 21411189 - 21411271
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21411189 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21411271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 21805681 - 21805763
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21805681 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21805763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21827881 - 21827799
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21827881 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21827799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14103260 - 14103165
Alignment:
Q  94 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 190  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14103260 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 14103165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329378
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcataatataacaatatc 21329520  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||  |||||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329519 gaattcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 21329421  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  21329420 ttactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttcttac 21329378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502042
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatg-taaatcagcatgatataacaatatc 21502179  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 206  Q
     |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  21502178 gaatgcaagtcatcatcatcttaaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcagg 21502080  T
Q  207 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21502079 cttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 21502042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011922
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaa-catgatataacaatatc 26012058  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  26012057 aaatgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattatatagttcaggc 26011959  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  26011958 ttactgaaacaacaataacaagataaacaacttagtt 26011922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026821
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaac-agttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20026944 atcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacatataattcaggcttactgaaacaactaca 20026847  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||    
T  20026846 acaagataaacaacttagtttcttac 20026821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565776
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 211  Q
    | |||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 21565743  T
Q  212 tgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21565744 tagaacaacaacaacaagataaacaacttagtt 21565776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959489
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaat 22959551  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatt 177  Q
    | || |||||||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959550 gcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 22959489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660725
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcttgatataatgatatc 19660858  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     ||| ||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  19660857 gaatataaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtc 19660762  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  19660761 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtt 19660725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178100
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||   || ||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  22178224 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcatataatttaggtttactgaaacaacaaca 22178126  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| || |||||||||| |||||    
T  22178125 gtaagataagcaacttagtttcttac 22178100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19669073
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatc 19668996  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19668997 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 19669073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729066
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21729087  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21729086 aattgcaattcaacaacatct 21729066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808391
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21808412  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21808411 aattgcaattcaacaacatct 21808391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078074
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 9078050  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || || ||||||||||||||||||    
T  9078051 aagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 177
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144217
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  127 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatt 177  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22144167 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacatt 22144217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997547
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 21997557  T
Q  108 aaatgtaagt 117  Q
    ||||| ||||    
T  21997556 aaatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412306
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-gataacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 22412284  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  22412285 tgcaagtcaacaacatctcaaa 22412306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529339
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaa 24529321  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || |||||||||||||||    
T  24529322 tgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264812
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 264833  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  264832 tgcaagtcaacaacgtctcaa 264812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732984
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10733005  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10733004 tgcaagtcaacaacgtctcaa 10732984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909130
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20909109  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20909110 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20909130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493687
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 24493666  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  24493667 aaatgcaagtcaacaacatct 24493687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421651
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25421630  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  25421631 aattgcaagtcaacagcatct 25421651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363502
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39363481  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  39363482 tgcaagtcaacaacgtctcaa 39363502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096588
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||| | |||| ||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatc 1096565  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctca 130  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  1096566 aaatgcaaatcaacaacatctca 1096588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286844
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaaccagcatgatataacaatat 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatat 8286866  T
Q  107 caaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||| || || ||| ||||||||    
T  8286865 caattgcaattcatcaacatct 8286844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025429
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||    
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatc 13025408  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13025409 aaatgcaagtcaacaacatct 13025429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095613
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||    
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatc 13095592  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13095593 aaatgcaagtcaacaacatct 13095613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390498
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23390519  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  23390518 aattgcaattcatcaacatct 23390498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330052
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 29330031  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29330032 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29330052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245409
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 42245430  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  42245429 tgcaagtcaacaacgtctcaa 42245409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154827
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 36154848  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  36154847 tgcaagtcaacaacgtctcaa 36154827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314675
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902053
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 20902075  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
     || ||||||||||| ||||||    
T  20902074 gtgcaagtcaacaacgtctcaa 20902053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245243
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39245233  T
Q  111 tgtaagtcaa 120  Q
    || |||||||    
T  39245234 tgcaagtcaa 39245243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154658
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 2154679  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  2154678 tgcaagtcaacaacgtctcaa 2154658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581243
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 11581264  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||| ||| ||||||    
T  11581263 tgcaagtcaataacgtctcaa 11581243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431513
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25431492  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || |||||||||||||||    
T  25431493 aattgcaagtcaacaacatct 25431513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346098
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29346077  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29346078 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29346098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775731
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaa 10775741  T
Q  111 tgtaagtcaa 120  Q
    || |||||||    
T  10775740 tgcaagtcaa 10775731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348571
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29348550  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29348551 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29348571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351044
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29351023  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29351024 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29351044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319089
Alignment:
Q  14 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 18319096  T
Q  114 aagtcaa 120  Q
    |||||||    
T  18319095 aagtcaa 18319089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075138
Alignment:
Q  8 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 106  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatat 22075116  T
Q  107 caaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||| || || ||||||||||||    
T  22075117 caattgcaattcaacaacatct 22075138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061175
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31061165  T
Q  111 tgtaagtcaa 120  Q
    || |||||||    
T  31061166 tgcaagtcaa 31061175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619541
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38619531  T
Q  111 tgtaagtcaa 120  Q
    || |||||||    
T  38619532 tgcaagtcaa 38619541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027511
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32027490  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |  ||||||||||| ||||||    
T  32027491 tccaagtcaacaacgtctcaa 32027511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918028
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 20918028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064618
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaat 23064609  T
Q  112 gtaagtcaa 120  Q
    | |||||||    
T  23064610 gcaagtcaa 23064618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726032
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaagcatcatgatataataatatc 40725951  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  40725952 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 40726032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21293020
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 79  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 165
Target Start/End: Original strand, 29448055 - 29448159
Alignment:
Q  61 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgta 158  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | || |||||||||| |    
T  29448055 aacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgt-aattcatgtaatgca 29448152  T
Q  159 tatacaa 165  Q
    |||||||    
T  29448153 tatacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37724023
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  |||||||||  || ||| ||||||    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattaaattcatcaacat 37724018  T
Q  127 ctcaa 131  Q
    |||||    
T  37724019 ctcaa 37724023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806854
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaa 20806854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067214
Alignment:
Q  14 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||     
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 24067207  T
Q  114 aagtcaa 120  Q
    |||||||    
T  24067208 aagtcaa 24067214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704124
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26704124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973857
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26973857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 18418590 - 18418678
Alignment:
Q  18 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||    
T  18418590 cttaatcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatca 18418678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517269
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 17517269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  24 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 78  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766118
Alignment:
Q  75 cagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766174 cagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 20766118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21741545 - 21741486
Alignment:
Q  117 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21741545 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 10753603 - 10753685
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  10753603 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 10753685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21871607 - 21871525
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21871607 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21871525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 95
Target Start/End: Original strand, 21873254 - 21873336
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga 95  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||    
T  21873254 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcagcataggcaggatacaacatcagcatga 21873336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21875887 - 21875805
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21875887 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21875805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22120231 - 22120149
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22120231 atataacaattacaaatgaacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22120149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 178
Target Start/End: Original strand, 36314685 - 36314716
Alignment:
Q  147 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314685 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 36314716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 77
Target Start/End: Original strand, 15796438 - 15796487
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  15796438 cttagaccgactcatgcagctta-atcaataataaacagcaacataggcag 15796487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032387
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 22032387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 128
Target Start/End: Original strand, 18356367 - 18356432
Alignment:
Q  61 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||    
T  18356367 aacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatct 18356432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6010
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 6146  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6145 gaatgcaagtcattaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 6047  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  6046 ttactgaaacaataacagcaagataaataacttagtt 6010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019640
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatc 23019504  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23019505 aaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattatatagttcaggc 23019603  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23019604 ttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 23019640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668612
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
Q  121 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 220  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  19668485 caacatcacaa-catcatacgtaat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatatacatcagacttactgaaacaac 19668582  T
Q  221 aacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19668583 aacagcaagataaacaacttagtttcttac 19668612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652427
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 211  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatctcaaacatc-aacataatc-catttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 19652394  T
Q  212 tgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    || ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19652395 tggaacaataacagcaagataaacaacttagtt 19652427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644500
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  123 acatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    ||||||||||||| || | ||||  ||| ||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacat 25644500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496361
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28496494  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  28496493 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtc 28496398  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  28496397 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtt 28496361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808772
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 29808905  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  29808904 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtc 29808809  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  29808808 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtt 29808772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098406
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  122 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 221  Q
    ||| || | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||            || ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  9098520 aacttcac-aacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatataattatataacattaa------------atcatataattcaggcttactgaaacaata 9098435  T
Q  222 acagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    || |||||| |||||| |||||| |||||    
T  9098434 actgcaagataaacaaattagtttcttac 9098406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561535
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1561401  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcagg 206  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||    ||||     
T  1561402 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagt 1561497  T
Q  207 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||    
T  1561498 cttactggaatattaacagcaagataaacaacttagtt 1561535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109381
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatc 20109236  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatataca--attatataacattaacaacaacattagattatacaattca 204  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||| |  | ||| |  |||    
T  20109237 aaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattgatatacatca 20109335  T
Q  205 ggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | ||||||  ||  ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20109336 gtcttactagaaagacatcagcaagataaacaacttagtttcttac 20109381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333241
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27333241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27393981
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060662
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 29060638  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  29060639 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676754
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 30676777  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  30676776 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 30676754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782385
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22782324  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 171  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  22782325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacacat-aattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496363
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 16496342  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||||||||||||    
T  16496343 aattgcaattcaacaacatct 16496363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287798
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatc 17287819  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  17287818 aattgcaagtcaacatcatct 17287798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409821
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||    
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatca 18409849  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 136  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18409848 aatgcaagtcaacaacatctcaatcatc 18409821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080626
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa-------------cataggcagtatgcaaaac-atcatgatataacaatatc 22080761  T
Q  108 aaatgta-agtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcag 205  Q
     |||| | ||  ||||||||||||||||||   |||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||    
T  22080760 gaatgcacag--aacaacatctcaaacatcgt-cataat-taatataatgtatatacatttatataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttag 22080665  T
Q  206 gcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  22080664 gcttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtt 22080626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629354
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattac-aacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatc 25629378  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  25629377 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742435
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12742414  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12742415 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12742435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334636
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18334657  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18334656 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18334636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005164
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19005143  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  19005144 tgcaagtcaacaacgtctcaa 19005164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858963
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19858984  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  19858983 tgcaagtcaacaacgtctcaa 19858963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422665
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24422644  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24422645 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24422665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656747
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25656726  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || |||| || ||| ||||||    
T  25656727 tgcaagttaataacgtctcaa 25656747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861912
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33861891  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  33861892 tgcaagtcaacaacgtctcaa 33861912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864396
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33864375  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  33864376 tgcaagtcaacaacgtctcaa 33864396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20593895
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 20593871  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  20593872 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 122
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076812
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaa-cagcatgacataataatatc 20076797  T
Q  108 aaatgtaagtcaaca 122  Q
    ||||| || ||||||    
T  20076798 aaatgcaaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291224
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2291245  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  2291244 tgcaagtcaacaacgtctcaa 2291224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055147
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8055126  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  8055127 tgcaagtcaacaacgtctcaa 8055147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754927
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25754906  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  25754907 tgcaaatcaacaacgtctcaa 25754927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924684
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 26924705  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26924704 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26924684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303540
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 19303564  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  19303563 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963491
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 34963468  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  34963469 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 34963491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540955
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaa 1540976  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1540975 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1540955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595667
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 1595646  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  1595647 tgcaattcaacaacgtctcaa 1595667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360962
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatc 20360983  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20360982 aattgcaattcatcaacatct 20360962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556936
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaa 20556957  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20556956 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20556936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688620
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 25688599  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  25688600 tgcaagtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638304
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 20638306  T
Q  108 aa 109  Q
    ||    
T  20638305 aa 20638304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780229
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatc 22780250  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  22780249 aattgcaagtcaacatcatct 22780229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076972
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | |||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  126 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
     || |||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23076849 acttaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacag 23076947  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttac 250  Q
     |||| || ||| |||||| |||||    
T  23076948 taagataagcaaattagtttcttac 23076972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448582
Alignment:
Q  14 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 16448589  T
Q  114 aagtcaa 120  Q
    |||||||    
T  16448588 aagtcaa 16448582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227453
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 8227534  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  8227533 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 8227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852061
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaa 3852082  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3852081 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3852061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008390
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | |||| ||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaaca 35008266  T
Q  126 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
     || |||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||| |||||    
T  35008267 acttaaacatcatatat-aattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaataacag 35008365  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttac 250  Q
     |||| || |||||||||| |||||    
T  35008366 taagataagcaacttagtttcttac 35008390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920679
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 80  Q
    ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtat 16920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456837
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  127 ctcaa 131  Q
    |||||    
T  18456833 ctcaa 18456837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18461997
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  127 ctcaa 131  Q
    |||||    
T  18461993 ctcaa 18461997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245658
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 80  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtat 35245658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4185928 - 4185839
Alignment:
Q  22 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  4185928 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatg 4185839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831571
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 76  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 22831571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27333238 - 27333172
Alignment:
Q  178 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  27333238 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtt 27333172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27393978 - 27393912
Alignment:
Q  178 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  27393978 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtt 27393912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 112
Target Start/End: Original strand, 4186381 - 4186470
Alignment:
Q  22 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  4186381 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatg 4186470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821866
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa 18821866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 71
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185568
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacat 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19848063
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 19848063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28103877 - 28103799
Alignment:
Q  152 taatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 230  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28103877 taatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 28103799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 190
Target Start/End: Original strand, 18696570 - 18696667
Alignment:
Q  91 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 190  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||    
T  18696570 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctccaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 188
Target Start/End: Original strand, 18706356 - 18706483
Alignment:
Q  60 aaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgt 157  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||||| | || || ||||||||||     
T  18706356 aaacagcaacataggcaatatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatcttaaacatcatatat-aattcatgtaatgc 18706452  T
Q  158 atatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  18706453 atatacatttatatgacattattaacaacat 18706483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 61
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992480
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaa 23992480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443118
Alignment:
Q  29 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtat 33443118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 19008799 - 19008843
Alignment:
Q  5 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctta 49  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008799 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 22949384 - 22949466
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22949384 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22949466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 22953340 - 22953422
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22953340 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22953422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 23871828 - 23871910
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23871828 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23871910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 23875784 - 23875866
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23875784 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23875866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27325470 - 27325388
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || | ||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  27325470 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattaatgcaatatatatataattatataacatta 27325388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 18907111 - 18907160
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907111 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcagcttagttaaataacaa 18907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863027
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19863027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873169
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19873169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 21766695 - 21766759
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21766695 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcag 21766759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32775
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatc 32634  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32635 aaatgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattatataattcaggc 32732  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  32733 ttactgaaacaataacaacaagataaacaacttagtttcttac 32775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51904
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||||  |||| || |||| ||||||||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa 51904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10767
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  123 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 222  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10641 acatctcaaacatcgaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaa 10739  T
Q  223 cagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10740 cagcaagataaacaacttagtttcttac 10767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 93)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 15470927 - 15471157
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  15470927 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 15471022  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  15471023 gaatgcaagtcatcaacatctcaaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcatataattcaggc 15471120  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15471121 ttactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtt 15471157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234723
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 14234585  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14234586 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattaaacaattcaggc 14234684  T
Q  208 ttactga--aacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  14234685 ttactgaacaacaacaacaacaagataaataacttagtt 14234723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097562
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 211  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 16097529  T
Q  212 tgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16097530 tggaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 16097562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174152
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12174278  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggctta 210  Q
    | ||   ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||    |||| ||||    
T  12174277 gcaa---aacaacaactcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatt-gattcatatgcatcagtctta 12174183  T
Q  211 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaactta 241  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  12174182 ctggaacaacaacagcaagctaaacaactta 12174152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16104013
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 211  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |  | |||    | || |||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacat-aattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggattagtcttac 16103980  T
Q  212 tgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16103981 tggaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 16104013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210283
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
     |||| || |||||||   || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210349 gaatgcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 13210283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251048
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37251171 atctcaa-catcataaataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcagacttactggaacaacaaca 37251074  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||    
T  37251073 gtaagataaacaacttagtttcttac 37251048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438653
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatc 18438632  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  18438633 aaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110232
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagc 22110356  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||| ||||| | | ||  ||||||||||  |||||| |||||| ||||||  |||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110355 atctcaa-catcatatagaat-tcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 22110258  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| || |||||||||| |||||    
T  22110257 gtaagataagcaacttagtttcttac 22110232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165370
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaa-caacatgatataccaatatcaaa 27165348  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    || |||||| ||| ||||||||    
T  27165349 tgcaagtcatcaatatctcaaa 27165370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14972975
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14972952  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctca 130  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  14972953 aaatgcaaatcaacaacatctca 14972975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523669
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  125 atctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    ||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399328
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 12399307  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  12399308 aaatgcaattcaacaacatct 12399328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301562
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 53301571  T
Q  111 tgtaagtca 119  Q
    || ||||||    
T  53301570 tgcaagtca 53301562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 32307691 - 32307830
Alignment:
Q  22 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  32307691 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaac 32307788  T
Q  122 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 165  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  32307789 aacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 32307830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386533
Alignment:
Q  26 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  126 tctcaaa 132  Q
    |||||||    
T  42386527 tctcaaa 42386533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083363
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatc 23083384  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || |||||||||||||||    
T  23083383 aattgcaagtcaacaacatct 23083363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172627
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29172648  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29172647 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29172627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476384
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaa-cagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 25476408  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  25476407 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153211
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 24153229  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || |||||||||||||||    
T  24153228 tgcaagtcaacaacatct 24153211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166716
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 36166694  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  36166695 tgcaagtcaacaacatctcaaa 36166716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469178
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6469199  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  6469198 tgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707651
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 9707672  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |  ||||||||||| ||||||    
T  9707671 tacaagtcaacaacgtctcaa 9707651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463296
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17463275  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  17463276 tgcaagtcaacaacgtctcaa 17463296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672744
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17672723  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  17672724 tgcaaatcaacaacgtctcaa 17672744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698437
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatc 20698458  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20698457 aattgcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687006
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 26686985  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  26686986 aattgcaagtcaacatcatct 26687006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848655
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 28848676  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  28848675 tgcaagtcaacaacgtctcaa 28848655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159444
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34159423  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  34159424 tgcaagtcaacaacgtctcaa 34159444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606951
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 45606972  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  45606971 tgcaagtcaacaacgtctcaa 45606951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476609
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55476588  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  55476589 tgcaagtcaacaacgtctcaa 55476609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55501039  T
Q  111 tgtaagtcaacaacat 126  Q
    || |||||||||||||    
T  55501040 tgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424781
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781391
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 7781412  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  7781411 tgcaaatcaacaacgtctcaa 7781391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899212
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8899191  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  8899192 tgcaagtcaacaacgtctcaa 8899212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442393
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13442372  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  13442373 aattgcaattcatcaacatct 13442393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454325
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16454346  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16454345 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16454325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17487975
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17487954  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  17487955 aattgcaattcatcaacatct 17487975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499457
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17499436  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  17499437 aattgcaattcatcaacatct 17499457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961935
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38961956  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  38961955 tgcaagtcaacaacgtctcaa 38961935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668094
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 49668095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 171
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926121
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 171  Q
    ||||||||||||| | |  || |||||||||| ||||||| ||||||    
T  43926076 atctcaaacatcatata-caattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151834
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13151856  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13151855 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13151834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154299
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13154321  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13154320 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13154299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544143
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 13544121  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13544122 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13544143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9513023
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9513022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9520998
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9520997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247767
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10247788  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10247787 tgcaagtcaacaacgtctcaa 10247767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567678
Alignment:
Q  15 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 12567661  T
Q  115 agtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||||| ||||||    
T  12567662 agtcaacaacgtctcaa 12567678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977633
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 15977612  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15977613 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446699
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17446720  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  17446719 tgcaagtcaacaacgtctcaa 17446699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213720
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || || ||||| |||| |||||||||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacaca-gcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaa 40213741  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  40213740 tgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550482
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatga-cagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatc 43550546  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 171  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  | ||| | || || ||| |||||||||||||||||||||    
T  43550545 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatat-aattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841051
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 43841030  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  43841031 aattgcaagtcaacatcatct 43841051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Original strand, 14572603 - 14572707
Alignment:
Q  22 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||  |||||||    
T  14572603 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaac 14572700  T
Q  122 aacatct 128  Q
    |||||||    
T  14572701 aacatct 14572707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282855
Alignment:
Q  13 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatg 16282874  T
Q  113 taagtcaacaacatctcaa 131  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  16282873 caagtcaacaacgtctcaa 16282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119780
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12119790  T
Q  111 tgtaagtcaa 120  Q
    || |||||||    
T  12119789 tgcaagtcaa 12119780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412536
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15412526  T
Q  111 tgtaagtcaa 120  Q
    || |||||||    
T  15412527 tgcaagtcaa 15412536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 21618449 - 21618567
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21618449 tcatcttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 21618545  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21618546 tgcaagtcaacaacatctcaaa 21618567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340665
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatc 24340746  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
     || | |||| |||||||||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  24340745 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 24340665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124005
Alignment:
Q  13 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 41123986  T
Q  113 taagtcaacaacatctcaa 131  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  41123987 caagtcaacaacgtctcaa 41124005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242940
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 50242919  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  50242920 tgcaaatcaacaacgtctcaa 50242940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274810
Alignment:
Q  26 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 125  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  126 tctcaaa 132  Q
    |||||||    
T  23274804 tctcaaa 23274810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499625
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 8499615  T
Q  111 tgtaagtcaa 120  Q
    || |||||||    
T  8499616 tgcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642207
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 37642288  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  37642287 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 37642207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557105
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||| || ||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaa 10557082  T
Q  111 tgtaagtcaa-caacatctcaaa 132  Q
    || ||| ||| ||||||||||||    
T  10557083 tgcaagccaatcaacatctcaaa 10557105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494908
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaa 44494906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070697
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || || || |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  127 ctcaa 131  Q
    |||||    
T  53070701 ctcaa 53070697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 70
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737294
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14576939 - 14576835
Alignment:
Q  22 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 121  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |||| |||||||| || ||||||||    
T  14576939 atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataac-aacagcaacatagacagtat-aaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 14576842  T
Q  122 aacatct 128  Q
    |||||||    
T  14576841 aacatct 14576835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577950
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45577950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1465423 - 1465329
Alignment:
Q  117 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 213  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  1465423 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattagaataaacaatccaggcttactg 1465329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378050
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa-tagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 12378038  T
Q  125 atctcaaacatc 136  Q
    | || |||||||    
T  12378039 aacttaaacatc 12378050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  70 ataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaat 166  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaat 2051163  T
Q  167 tatataacattaacaacaacat 188  Q
    ||||| ||||||  ||||||||    
T  2051162 tatatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389517
Alignment:
Q  118 caacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaac 217  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||    
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataat-tcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaac 49389544  T
Q  218 aacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49389543 aacaacaacaagataaacaacttagtt 49389517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147467
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 22147548  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  22147547 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606324
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  || ||| |||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagca--cataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaa 606332  T
Q  124 catctcaa 131  Q
    ||||||||    
T  606331 catctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1644780 - 1644642
Alignment:
Q  22 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 121  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||  || |||||    
T  1644780 atcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcattatataacaatatcgaatacaa-tcaac 1644684  T
Q  122 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 165  Q
    || |||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  1644683 aatatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 1644642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 61
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822318
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 46822318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 250
Target Start/End: Original strand, 43927291 - 43927373
Alignment:
Q  168 atataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    |||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||    
T  43927291 atatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttac 43927373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 61
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511110
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaa 12511110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856204
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataac-aatagcaacataggcag 856204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataac-aacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665450
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14665450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668606
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14668606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 14501207 - 14501290
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  14501207 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaattatataacatta 14501290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 19776007 - 19776089
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  19776007 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 19776089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37439503 - 37439421
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  37439503 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 37439421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 79
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  29 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 79  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878119
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 15878119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26196548 - 26196500
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 60  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  26196548 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Original strand, 30029841 - 30029893
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30029841 catcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 30029893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706173
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 39706311  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| ||||||  ||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39706310 gaatgcaagtcatgaacatcataaacatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcatataattcaggc 39706213  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttcct 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39706212 ttactaaaacaacaacagcaagataaacaacttaattcct 39706173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288096
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
Q  121 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 220  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12288217 caacatcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaac 12288120  T
Q  221 aacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  12288119 aacagcaagataaacaacttagtt 12288096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13731
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  127 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    |||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||| |||||     
T  13854 ctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacat 13756  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttac 250  Q
     |||| ||||||||||||| |||||    
T  13755 aaagataaacaacttagtttcttac 13731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15551982
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgatataataatatc 15551915  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
     || |||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551916 gaaggtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15551982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082032
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| |||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataac 53082157  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53082156 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 53082058  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| || |||||||||| |||||    
T  53082057 gtaagataagcaacttagtttcttac 53082032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243136
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-agttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
Q  121 caacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    ||||||||||||||| || | |||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52243203 caacatctcaaacattcatatataatc-caagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52243136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640336
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataac 46640460  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| |||| |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  46640459 atctc-aacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcatataattcaggtttactgaaacaataaca 46640362  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| || |||||||||| |||||    
T  46640361 gtaagataagcaacttagtttcttac 46640336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798752
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 54798774  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  54798773 tgcaagtcaacaacatctcaaa 54798752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798893
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7798872  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || |||||| ||||||||    
T  7798873 aattgcaagtcatcaacatct 7798893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873369
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 52873390  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  52873389 aattgcaagtcaacatcatct 52873369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198495
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  122 aacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    || |||||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 43198495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774160
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12774109  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 165  Q
      || |||||||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  12774110 acaa-tcaacaacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 12774160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280435
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 14280413  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  14280414 tgcaagtcaacaacatctcaaa 14280435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377522
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaa 16377543  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16377542 tgcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7088996
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7088975  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  7088976 aattgcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12902876
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 12902855  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || ||||| ||| ||||||||    
T  12902856 aattgtaattcatcaacatct 12902876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215318
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18215339  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18215338 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18215318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928923
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaa 44928944  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||| ||||||||||    
T  44928943 tgcaagtcaataacatctcaa 44928923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12351
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12372  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12371 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893822
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7893801  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  7893802 aattgcaagtcaacatcatct 7893822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118396
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15118417  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15118416 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15118396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773131
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44773152  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44773151 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44773131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312628
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 52312607  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  52312608 tgcaagtcaacaacgtctcaa 52312628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846606
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgata-------------- 97  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |                  
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgagataacaatatcgaat 8846458  T
Q  98 --taacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatta 195  Q
      |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |    
T  8846459 gctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattca 8846557  T
Q  196 tacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||    |||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  8846558 tatgcatcagtcttactggaacaacaactacaagataaacaacttagtt 8846606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242817
Alignment:
Q  5 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataat 19242790  T
Q  105 atcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19242791 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19242817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618216
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||    
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatca 19618239  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  19618238 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 19618216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837553
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaa 1837574  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1837573 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1837553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515125
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaa 3515104  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3515105 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3515125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270238
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 16270259  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  16270258 aaatgcaagttaacaacatct 16270238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239463
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18239484  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18239483 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18239463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615406
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 44615385  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44615386 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44615406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222383
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 50222404  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  50222403 tgcaagtcaacaacgtctcaa 50222383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463912
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 51463933  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  51463932 tgcaaatcaacaacgtctcaa 51463912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038770
Alignment:
Q  13 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 112  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
Q  113 taagtcaacaacatctcaa 131  Q
     ||||||||||||||||||    
T  14038752 caagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 101
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096385
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataac 101  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatgtaac 3096385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803316
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23803330  T
Q  111 tgtaagtcaacaac 124  Q
    || || ||||||||    
T  23803329 tgcaaatcaacaac 23803316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900009
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||||||    
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatagcataataatatc 6899988  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  6899989 aaatgcaagtcaacaacatct 6900009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239972
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataac-aatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 16239993  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  16239992 aaatgcaagtcaacaacatct 16239972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 244
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596879
Alignment:
Q  46 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||     
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaag 16596781  T
Q  146 ctcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||    |||| ||||||  ||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  16596782 -tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaatttataagcatcagtcttacttgaacattaacagcaaggtaaacaacttagtt 16596879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44052948
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44052927  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  44052928 aattgcaattcatcaacatct 44052948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636554
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 22636535  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatct 128  Q
     || || ||| ||||||||    
T  22636536 ttgcaattcatcaacatct 22636554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574867
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 8574889  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  8574888 tgtaattcaacaacatctcaaa 8574867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355380
Alignment:
Q  15 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15355386  T
Q  115 agtcaa 120  Q
    ||||||    
T  15355385 agtcaa 15355380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374361
Alignment:
Q  15 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 114  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| || |    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  115 agtcaacaacatct 128  Q
    | ||||||||||||    
T  23374374 attcaacaacatct 23374361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102332
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44102311  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || |||| |||||| ||||||    
T  44102312 tgcaagtaaacaacgtctcaa 44102332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970751
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaaca-gcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 14970774  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  14970773 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046559
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 80  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat 17046559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 244
Target Start/End: Original strand, 15099457 - 15099582
Alignment:
Q  117 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  15099457 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 15099554  T
Q  217 caacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||    
T  15099555 tgacaacatcaaggtaaataacttagtt 15099582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 244
Target Start/End: Original strand, 15190424 - 15190549
Alignment:
Q  117 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  15190424 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 15190521  T
Q  217 caacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||    
T  15190522 tgacaacatcaaggtaaataacttagtt 15190549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190563
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 6190563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641286
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 70
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611008
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053323
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatc 14053325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367800
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15367787  T
Q  108 aaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||| |||||||    
T  15367788 aaatgcaagtcaa 15367800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370128
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15370115  T
Q  108 aaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||| |||||||    
T  15370116 aaatgcaagtcaa 15370128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371312
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15371299  T
Q  108 aaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||| |||||||    
T  15371300 aaatgcaagtcaa 15371312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373593
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15373580  T
Q  108 aaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||| |||||||    
T  15373581 aaatgcaagtcaa 15373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402813
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15402800  T
Q  108 aaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||| |||||||    
T  15402801 aaatgcaagtcaa 15402813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223642
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16223629  T
Q  108 aaatgtaagtcaa 120  Q
     |||| |||||||    
T  16223630 taatgcaagtcaa 16223642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815629
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |  | |||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-actgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgt 21815634  T
Q  127 ctcaa 131  Q
    |||||    
T  21815633 ctcaa 21815629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15464972 - 15464926
Alignment:
Q  89 agcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15464972 agcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 15464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149936
Alignment:
Q  14 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataac-aacagcgacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 20149929  T
Q  114 aagtcaa 120  Q
    |||||||    
T  20149930 aagtcaa 20149936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353955
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  || |  | || ||||| |||||||||||||    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataac-aacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaa 22353933  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
     |  || |||||||| ||||||    
T  22353934 ttacaattcaacaacgtctcaa 22353955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 246
Target Start/End: Original strand, 14164739 - 14164785
Alignment:
Q  200 attcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttcc 246  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14164739 attcaggcttactagaacaacaacagcaagataaacaacttagttcc 14164785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 630810 - 630728
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  630810 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aatgcatgcaatatatatccaattatataacatta 630728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 3331970 - 3332052
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  3331970 atataacaattacaaatgcatgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 3332052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13812845 - 13812763
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  13812845 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 13812763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14953997 - 14953915
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  14953997 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 14953915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 25690146 - 25690228
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  25690146 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 25690228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 244
Target Start/End: Original strand, 12774189 - 12774231
Alignment:
Q  202 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12774189 tcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 12774231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 246
Target Start/End: Original strand, 14158034 - 14158080
Alignment:
Q  200 attcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttcc 246  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14158034 attcaggcttactagaacaacaacagcaagataaaaaacttagttcc 14158080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20157579 - 20157527
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20157579 catcatcgtcttaatcaacttatatagactcatgcaaattagttaaataacaa 20157527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 922
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||| |||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgc-agatcatcatgatataacaacatc 1057  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1056 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatt-tacaattcaggc 959  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  958 ttactgaaacaacaacaacaagataaataacttagtt 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6843
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatg-atgatataacaatatc 6709  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| |||| | || |||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  6710 gaatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagc 6808  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttag 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6809 ttactaaaacaacaacagcaagataaacaacttag 6843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14223
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatg-atgatataacaatatc 14089  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| |||| | || |||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  14090 gaatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagc 14188  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttag 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14189 ttactaaaacaacaacagcaagataaacaacttag 14223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13173
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12942 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-agcatgatataacaatatc 13037  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13038 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatccaattcaggc 13136  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13137 ttactgaaacaacaacagcaagataaataacttagtt 13173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18276 - 18118
Alignment:
Q  91 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 190  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18276 catgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  191 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
     |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||    
T  18177 aaacatataattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtttcttac 18118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6768
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6633  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 206  Q
     |||| || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  6634 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcagg 6731  T
Q  207 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6732 cttactgaaacaacaacagcaaga-taacaacttagtt 6768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8709
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  123 acatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatataca--attatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaa 219  Q
    |||||||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||| |  | ||| |  |||| ||||||| |||||    
T  8580 acatctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacatcagtcttactggaacaa 8678  T
Q  220 caacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    || |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8679 catcagcaagataaacaacttagtttcttac 8709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921756
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 210  Q
    | || |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aaca-aaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 22921790  T
Q  211 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22921789 ctgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 22921756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861450
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  127 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataatattcaggcttactgaaacaacaatag 21861475  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||    
T  21861474 caagataaacaacttagtttcttac 21861450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896139
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  127 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||||       
T  21896259 ctcaaacattcatatataat-tcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataatattcaggcttactgaaacaacaa--- 21896164  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||    
T  21896163 caagataaacaacttagtttcttac 21896139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 33681010 - 33681241
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  33681010 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 33681105  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| |||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |    
T  33681106 gaatgcaagtcgtcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtc 33681204  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33681205 ttactagaacaacaacaacaagataaacaacttagtt 33681241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Original strand, 22237630 - 22237805
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  22237630 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 22237725  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
     |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22237726 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacat 22237805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50613996
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50614121  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||||||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  50614120 atctcaaacatcttttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacg 50614022  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  50614021 gtaagacaaacaacttagtttcttac 50613996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621824
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50621949  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||||||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  50621948 atctcaaacatcttttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacg 50621850  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  50621849 gtaagacaaacaacttagtttcttac 50621824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918769
Alignment:
Q  24 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T
Q  124 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918719 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 20918769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210212
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||    
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 50210235  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  50210234 aatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686853
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||  ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaat-agttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaac 50686728  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50686729 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 50686827  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| || |||||||||| |||||    
T  50686828 gtaagataagcaacttagtttcttac 50686853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295507
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 14295574  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295573 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368167
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  126 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    |||| ||||||    || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16368289 tctc-aacatcgtttat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacag 16368192  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttac 250  Q
     |||| |||||||||| || |||||    
T  16368191 taagataaacaacttaatttcttac 16368167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248454
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    | || |||||||   || ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20248382 gcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacat 20248454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34509899
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaa 34509881  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || |||||||||||||||    
T  34509882 tgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52927869
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||               
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat----------- 52927989  T
Q  123 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 222  Q
     ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||||||    
T  52927988 -catctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 52927891  T
Q  223 cagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  52927890 tagcaagataaacaacttagtt 52927869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 21754059 - 21754198
Alignment:
Q  22 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21754059 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaac 21754156  T
Q  122 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 165  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  21754157 aacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 21754198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049916
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 41050040  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||| ||||| | ||||  ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| | | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41050039 atctcaa-catcatatataat-tcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 41049942  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| ||  ||| |||||||||||    
T  41049941 gtaagataagaaacctagttccttac 41049916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261023
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacat 35261085  T
Q  127 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    |||||||| ||| |||| || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacat-aattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacat 35261023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574846
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacc 45574910  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 171  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  ||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  45574909 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattat-taacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13988984
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13988963  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13988964 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13988984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923335
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21923356  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21923355 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21923335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593779
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23593800  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23593799 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23593779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758828
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  ||  |||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  121 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 187  Q
    ||||||| |||   ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  16758763 caacatcacaacattcatatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaaca 16758828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612430
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31612410  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctca 130  Q
    || |||||||||||||||||    
T  31612411 tgcaagtcaacaacatctca 31612430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840885
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 21840863  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  21840864 atgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475131
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21475152  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21475151 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21475131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250731
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 27250752  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  27250751 aattgcaattcatcaacatct 27250731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298254
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaa 29298233  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29298234 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29298254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433128
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||| ||||| || || || |||| |||||||||    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaa 433107  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  433108 tgcaagtcaacaacatctcaa 433128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123119
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  111 tgtaagtcaacaa 123  Q
    || ||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaa 22123119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532388
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 22532367  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
     | || || ||||||||||||    
T  22532368 cattgcaattcaacaacatct 22532388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776806
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaa 29776785  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29776786 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29776806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847173
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatc 20847177  T
Q  108 aaat 111  Q
    ||||    
T  20847176 aaat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026799
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||  |||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatc 21026778  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21026779 aattgcaattcaacaacatct 21026799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362035
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| |||||||    
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatca 16362012  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  16362013 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 16362035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707325
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||| |||||  ||||||| | || |||||||||    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaa 21707264  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 171  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21707265 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaa-tcatgtaatgcctatacaattatat 21707325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711867
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||| |||||  ||||||| | || |||||||||    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaa 21711806  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 171  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21711807 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaa-tcatgtaatgcctatacaattatat 21711867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212917
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13212930  T
Q  108 aaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||| |||||||    
T  13212929 aaatgcaagtcaa 13212917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860064
Alignment:
Q  5 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataat 15860080  T
Q  105 atcaaatgtaagtcaa 120  Q
    || ||||| |||||||    
T  15860079 attaaatgcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342203
Alignment:
Q  5 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataat 21342187  T
Q  105 atcaaatgtaagtcaa 120  Q
    |||||||| |||||||    
T  21342188 atcaaatgcaagtcaa 21342203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35981700 - 35981575
Alignment:
Q  117 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  35981700 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 35981603  T
Q  217 caacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
      |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  35981602 tgacaacatcaagataaataacttagtt 35981575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093825
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtc-aacaa 123  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || || |||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaa 16093890  T
Q  124 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt 189  Q
    |||||||||||||| |  | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  16093889 catctcaaacatcataggt-aattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275419
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacgacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 16275429  T
Q  111 tgtaagtcaa 120  Q
    || |||||||    
T  16275428 tgcaagtcaa 16275419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347068
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 21347058  T
Q  111 tgtaagtcaa 120  Q
    || |||||||    
T  21347059 tgcaagtcaa 21347068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801433
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa 84  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468698
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||| | |||||||| || | |||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatca 22468718  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    | || || ||||||||||||    
T  22468717 attgcaattcaacaacatct 22468698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 244
Target Start/End: Original strand, 49261448 - 49261573
Alignment:
Q  117 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  49261448 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataattt-atataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaattccggcttactggaa 49261545  T
Q  217 caacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||    
T  49261546 ggacaacatcaaggtaaataacttagtt 49261573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 244
Target Start/End: Original strand, 20636956 - 20637082
Alignment:
Q  116 gtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaa 215  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  20636956 gtcaacaacatcccaaata-caaacataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaatacaattcaggcttactgga 20637053  T
Q  216 acaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |  |||||| ||||  ||| |||||||||    
T  20637054 atgacaacatcaaggtaaataacttagtt 20637082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22130975 - 22130863
Alignment:
Q  61 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtata 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  22130975 aacagcaacataggcagtatccaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgcata 22130881  T
Q  161 tacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22130880 tacaattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161932
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca-aaacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatcgaat 21161817  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 211  Q
    | || ||| |||| ||   | |||| |||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||| | ||||| ||    
T  21161818 gcaattcatcaacttc-atatcatc-aacataaa-tcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcattggattaaacaaattaggctcac 21161914  T
Q  212 tgaaacaacaacagcaag 229  Q
    || |||| ||||||||||    
T  21161915 tggaacatcaacagcaag 21161932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389261
Alignment:
Q  14 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 113  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataac-aacagcgacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 40389254  T
Q  114 aagtcaa 120  Q
    |||||||    
T  40389255 aagtcaa 40389261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714595
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135306
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||  | ||| | || ||||| |||| |||||||    
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaac-aatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatca 20135286  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatct 128  Q
      || || ||||||||||||    
T  20135287 tgtgcaattcaacaacatct 20135306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065107
Alignment:
Q  29 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 127  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   ||||  |  ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaata-ccaatgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  128 tcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||| |||| | || || ||| |||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  26065058 tcaaagatcatatat-aattcaagtaatacatatacaaatatatcacatta 26065107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 51130639 - 51130729
Alignment:
Q  84 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51130639 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcagacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 51130729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783160
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaa 24783160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1924996 - 1924914
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1924996 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1924914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20924010 - 20923928
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  20924010 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 20923928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 131
Target Start/End: Original strand, 12271639 - 12271676
Alignment:
Q  94 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12271639 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa 12271676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 12766 - 13000
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 12864  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12865 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcatataattcaggc 12963  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12964 ttactggaacaacaacagcaagataaaccacttagtt 13000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 88 - 250
Target Start/End: Original strand, 8094 - 8255
Alignment:
Q  88 cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8094 cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 8192  T
Q  188 ttagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8193 ttagattatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagttccttac 8255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 6826 - 7043
Alignment:
Q  22 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||| || |||||    
T  6826 atcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaac 6924  T
Q  122 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 221  Q
    ||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||    |||| ||||||| |||||||    
T  6925 aa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 7020  T
Q  222 acagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  7021 acagcaagataaacaacttagtt 7043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19498
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 210  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggtta 19464  T
Q  211 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19465 ctgaaacaacaacatcaagataaacaacttagtt 19498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100608
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 210  Q
    | || |||||||||||||||| ||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaaatat-taacat-aattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggctta 100574  T
Q  211 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  100575 ctgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtt 100608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40061
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 210  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggctta 40095  T
Q  211 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  40094 ctgaaacaacaacatcaaggtaaacaacttagtt 40061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94529
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 94508  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  94509 tgcaagtcaacaacgtctcaa 94529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44573
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaa 44551  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  44552 atgcaagtcaacaacatctcaa 44573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17484
Alignment:
Q  15 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 17501  T
Q  115 agtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||||| ||||||    
T  17500 agtcaacaacgtctcaa 17484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119948
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 81  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 85  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38547
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaa 38547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25176084
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 210  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 25176050  T
Q  211 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25176051 ctgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 25176084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 244
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406211
Alignment:
Q  13 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 112  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  113 taagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttac 211  Q
     || |||||||||||||||| |||||   | || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  || | ||||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatatcaa--cttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttac 28406178  T
Q  212 tgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28406179 taaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 28406211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7619
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
Q  127 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  7736 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaa 7638  T
Q  226 caagacaaacaacttagtt 244  Q
    || || |||||||||||||    
T  7637 catgataaacaacttagtt 7619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786789
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaa-ccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaa 18786911  T
Q  121 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 220  Q
    |||| || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  18786910 caacgtcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatataatttaggcttactgaaacaac 18786813  T
Q  221 aacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  18786812 aacagcatgataaacaacttagtt 18786789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679750
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc-aat 7679686  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacat 176  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7679687 gtaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatataattatataacat 7679750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105531
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22105510  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22105511 tgcaagtcaacaacttctcaa 22105531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791509
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaac 23791390  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23791391 atctcaaacattatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 23791489  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagtt 244  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  23791490 acaagataaacaacttagtt 23791509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207518
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||| ||| | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23207395 atctcaa-cattataaataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttacttgaacaacaaca 23207492  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| || |||||||||| |||||    
T  23207493 gtaagataagcaacttagtttcttac 23207518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298816
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||     
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || ||||||||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatct 298816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708561
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23708642  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    || || || ||| | |||||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  23708641 aattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060632
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23060611  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || |||||||||||||||    
T  23060612 aattgcaagtcaacaacatct 23060632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071905
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 23071972  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
     ||| ||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071971 gaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109128
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||||||||   || |||||||     
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaat-agttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaat 25109004  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25109005 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 25109103  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttcctta 249  Q
    | |||| || |||||||||| ||||    
T  25109104 gtaagataagcaacttagtttctta 25109128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726113
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6726092  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  6726093 tgtaagtcaacaacgtctcaa 6726113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337238
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatc 22337213  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||    
T  22337214 aaatgcaagacaacaacatctcaaa 22337238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076561
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23076540  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || |||||||||| ||||    
T  23076541 aattgcaagtcaacaatatct 23076561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571515
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 571494  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  571495 tgcaagtcaacaacgtctcaa 571515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809061
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18809040  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18809041 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23130980
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23130959  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23130960 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23130980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133447
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23133426  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23133427 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23133447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135708
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23135687  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23135688 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23135708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709576
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23709597  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23709596 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23709576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712057
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23712078  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23712077 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23712057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505497
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26505476  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26505477 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26505497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26507975
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26507954  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26507955 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26507975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402566
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34402587  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  34402586 tgcaagtcaacaacgtctcaa 34402566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682431
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39682410  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  39682411 tgcaagtcaacaacgtctcaa 39682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214965
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 32214988  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  32214987 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 32214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367892
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24367871  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24367872 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24367892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577217
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 28577196  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||| ||||||| ||||||    
T  28577197 tgcaagccaacaacgtctcaa 28577217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19671998
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19671928  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
     || | |||| |||||||||||||   ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19671929 gaacgcaagtaaacaacatctcaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 19671998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731238
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22731257  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    || || || ||| ||||||    
T  22731256 aattgcaattcatcaacat 22731238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 38136
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155104
Alignment:
Q  14 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||     
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 21155122  T
Q  114 aagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  21155121 aagtcaacaacgtctcaa 21155104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898239
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24898261  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24898260 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24898239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900722
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24900744  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24900743 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24900722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903199
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24903221  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24903220 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24903199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905676
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24905698  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24905697 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24905676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908151
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24908173  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24908172 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24908151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039542
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32039563  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  32039562 tgcaagtcaacaacgtctcaa 32039542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23285942
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 86  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 23285942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137417
Alignment:
Q  13 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 43137398  T
Q  113 taagtcaacaacatctcaa 131  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  43137399 caagtcaacaacgtctcaa 43137417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660141
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||    
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatc 23660120  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  23660121 aaatgcaaatcaacaacatct 23660141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029898
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 45029919  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  45029918 tgcaagtcaacaacgtctcaa 45029898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309225
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 20309204  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  20309205 aaattcaattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520145
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 20520198  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||||| | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  20520197 atctcaaacatcatatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacatta 20520145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738182
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22738203  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  22738202 aattgcaattcatcaacatct 22738182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103396
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |  |||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacatgattatatc 23103420  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||  || ||| |||||||||||    
T  23103419 aaattcaattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529573
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 24529594  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || |||| |||||| ||||||    
T  24529593 tgcaagttaacaacgtctcaa 24529573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 87
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946735
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 87  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggcagtatacaaaac 8946735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413078
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataaca--atatcaaatgtaagtcaaca 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaaca 22413142  T
Q  123 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    ||||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  22413141 acatctc-aacatcataaat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134208
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||     
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcataatataacaatatcg 22134229  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctca 130  Q
    |||| || |||| |||||||||    
T  22134228 aatgcaa-tcaataacatctca 22134208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967493
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  || ||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaa 38967471  T
Q  111 tgtaagtcaa-caacatctcaa 131  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  38967472 tgcaagtcaatcaacatctcaa 38967493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacata 72  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654388
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatc 23654409  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  23654408 aattgcaattcatcaacatct 23654388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451949
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 32451949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459442
Alignment:
Q  94 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattaga 192  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |      
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatat-aactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaac 22459500  T
Q  193 ttatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    |  || |  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22459499 tcgtatacatcagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagtttcttac 22459442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643054
Alignment:
Q  14 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697548
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||| |||||||||    |||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 24697611  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    ||||||||| ||| | |  || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  24697610 atctcaaacttcatata-caattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 24697548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 137
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004878
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||   ||||  ||  || ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaa-tagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaac 23004865  T
Q  125 atctcaaacatca 137  Q
    |||||||||||||    
T  23004866 atctcaaacatca 23004878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616304
Alignment:
Q  15 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| |||||||| || |    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgca 25616290  T
Q  115 agtcaacaacatct 128  Q
    | ||||||||||||    
T  25616291 attcaacaacatct 25616304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 79
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  29 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 79  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  29 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 1283666 - 1283748
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1283666 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1283748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30344858 - 30344776
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  30344858 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 30344776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 5657 - 5876
Alignment:
Q  22 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  5657 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatg-aaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 5755  T
Q  122 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaac 220  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  5756 aacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaac 5853  T
Q  221 aacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||    
T  5854 aacaacaagataaa-aacttagtt 5876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1322
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 1184  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 211  Q
      | |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||| |  |||| |||||    
T  1185 acaggtcatcaacatttcaaacatcaaacat-aattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcatatacatcagtcttac 1283  T
Q  212 tgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    || |||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  1284 tggaacaacaacaacaagataaaaaacttagtttcttac 1322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2535
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||  |||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatg-taaatcatcatgttataacaatattgaat 2664  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 210  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  2663 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 2566  T
Q  211 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaactta 241  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2565 ctgaaacaacatcagcaagataaacaactta 2535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10428
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
Q  123 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 222  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||||||    
T  10548 acatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 10450  T
Q  223 cagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    || ||||| |||||||||||||    
T  10449 caacaagataaacaacttagtt 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 129919 - 130139
Alignment:
Q  22 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  129919 atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 130017  T
Q  122 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||    
T  130018 aacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 130116  T
Q  222 acagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  130117 acagcaagataaacaacttagtt 130139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60710
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaac 60721  T
Q  125 atctcaaacat 135  Q
    |||||||||||    
T  60720 atctcaaacat 60710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62429
Alignment:
Q  26 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||| |||| |   ||||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatg-aaaaacatcatggtataataatatcgaatgca---caacaaca 62311  T
Q  126 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattat-acaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  62312 tctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaaca 62409  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  62410 gcaagataaacaacttagtt 62429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136798
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 136777  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  136778 tgcaagtcaacaacgtctcaa 136798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139267
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 139246  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  139247 tgcaagtcaacaacgtctcaa 139267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144205
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 144184  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  144185 tgcaagtcaacaacgtctcaa 144205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134329
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 134308  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  134309 tgcaagtcaacaacgtctcaa 134329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141736
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 141715  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  141716 tgcaagtcaacaacgtctcaa 141736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 115
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132765
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaat 132761  T
Q  112 gtaa 115  Q
    ||||    
T  132762 gtaa 132765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14584
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||  |||||| |||    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaag-aaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 210  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggctta 14618  T
Q  211 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14617 ctgaaacaacaacagcaagatatacaacttagtt 14584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 7957
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||  || ||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaa 8082  T
Q  121 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 220  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||       
T  8081 caacatcacaa-catcatatataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaac--- 7987  T
Q  221 aacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7986 aacagcaagataaacaacttagtttcttac 7957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29238
Alignment:
Q  55 ataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaa 154  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||||||     
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaa-ctatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtac 29260  T
Q  155 tgtatatacaattatataacat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29259 tgtatatacaattatataacat 29238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160917
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 160786  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 211  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  160787 gcaa-tcaacaacatgtcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 160884  T
Q  212 tgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  160885 cgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtt 160917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501202
Alignment:
Q  15 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 501185  T
Q  115 agtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||||| ||||||    
T  501186 agtcaacaacgtctcaa 501202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85635
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 85645  T
Q  111 tgtaagtcaa 120  Q
    || |||||||    
T  85644 tgcaagtcaa 85635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22561
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  123 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 222  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   | ||| ||  |||| ||||||| |||| |||    
T  22677 acatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat--caatatgca--tcagtcttactggaacagcaa 22583  T
Q  223 cagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  22582 catcaagacaaacaacttagtt 22561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82190
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 82169  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  82170 tgcaaatcaacaacgtctcaa 82190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136254
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 136373  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaac 223  Q
    ||| ||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  136372 atcacat-catcgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaac 136275  T
Q  224 agcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  136274 agcaagataaacaacttagtt 136254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 144962
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 145081  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaac 223  Q
    ||| ||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  145080 atcacat-catcgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaac 144983  T
Q  224 agcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  144982 agcaagataaacaacttagtt 144962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174886
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  ||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatca 174863  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||  || |||||||||||||||    
T  174864 aattcaattcaacaacatctcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 78
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 78  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45735
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatctcaattatcaaacat-aattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacat 45735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6163
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6287 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 6189  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    |  ||| || |||||||||| |||||    
T  6188 gtgagataagcaacttagtttcttac 6163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13793
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  13840 cttagaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatagg 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12802
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  127 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    |||||| | | | | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||||  | || |||||||||||||||||||    
T  12686 ctcaaatacttatatat-aattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacattagacttactgaaacaacaacag 12783  T
Q  226 caagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  12784 caagataaacaacttagtt 12802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 133 - 307
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacat 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128850
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  126 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  128973 tctcaaacatcatatataat-tcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacag 128875  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttac 250  Q
     |||| || |||||||||| |||||    
T  128874 taagataagcaacttagtttcttac 128850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78562
Alignment:
Q  31 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatct 78442  T
Q  129 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaa 228  Q
    ||| ||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  78443 caa-catcgtttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaa 78540  T
Q  229 gacaaacaacttagttccttac 250  Q
    || || |||||||||| |||||    
T  78541 gataagcaacttagttgcttac 78562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116548
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataatcatatcaaa 116526  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  116527 tgcaagtcaacaacatctcaaa 116548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15892
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccatcatgatataataatatcgaa 15762  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggctta 210  Q
    ||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||  | |||| ||||    
T  15763 tgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattatttcataagaatcagtctta 15858  T
Q  211 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||| | ||  |||||||||  |||||||||||||    
T  15859 ctggatcattaacagcaaggtaaacaacttagtt 15892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2691
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  112 gtaagtcaacaacatctcaaacatca----aa--cataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattca 204  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    ||  ||||||   |||| || ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||  || |||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaaatatcagcttaattcataaa---atgt-atatatatacaat--tataccattaacaacaacaatagatcatattaaatca 2731  T
Q  205 ggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2730 ggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11457
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 11390  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11391 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatactattatataacatta 11457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2228
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 2095  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 207  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  2096 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagac 2191  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  2192 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtt 2228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28533
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 28512  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||||||||||||    
T  28513 aattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 64
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4608
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 64  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3185
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 3208  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  3207 aatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38558
Alignment:
Q  31 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T
Q  129 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaa 228  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||  ||||| |||||||   |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38438 caaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaa 38536  T
Q  229 gacaaacaacttagttccttac 250  Q
    || || |||||||||| |||||    
T  38537 gataagcaacttagtttcttac 38558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20029
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103525
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaa---aac 103641  T
Q  122 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 221  Q
    ||||      |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  103640 aaca------acatcatacataat-tcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaaca 103548  T
Q  222 acagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||| |||| ||| |||||||||    
T  103547 acaggaagataaagaacttagtt 103525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2108
Alignment:
Q  66 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 165  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||  |||| ||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcag-cataat-tcatataatgtatatacaa 2185  T
Q  166 ttatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaactta 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2184 ttatataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaactta 2108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1025
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1092  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1091 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53429
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
Q  127 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    |||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||| |||||     
T  53552 ctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacat 53454  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttac 250  Q
     |||| ||||||||||||| |||||    
T  53453 aaagataaacaacttagtttcttac 53429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19765
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||  ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  || ||||| | || ||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  19888 atctcag-catcataaataa-ctcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcatataattcatgcttactggaacaacaaca 19791  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| || |||||||||| |||||    
T  19790 gtaagataagcaacttagtttcttac 19765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40031
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 40010  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| | ||||| |||||||    
T  40011 aaatgcatgtcaataacatct 40031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 49021 - 48939
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  49021 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 48939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97247
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  97123 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaaca 97221  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| || |||||||||| |||||    
T  97222 gtaagaaaagcaacttagtttcttac 97247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106525
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  106401 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaaca 106499  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| || |||||||||| |||||    
T  106500 gtaagaaaagcaacttagtttcttac 106525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44705
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44727  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  44726 tgcaagtcaacaacatctcaaa 44705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26064
Alignment:
Q  15 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
Q  115 agtcaacaacatctcaa 131  Q
    | |||||||| ||||||    
T  26080 attcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38700
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 38722  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    || |||||| ||| ||||||||    
T  38721 tgcaagtcatcaatatctcaaa 38700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3149
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 3174  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  3173 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27744
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  123 acatctcaaacat 135  Q
    |||||||||||||    
T  27756 acatctcaaacat 27744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15763
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatc 15800  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataa 144  Q
     |||| |||||| || ||||  | |||||||||||||    
T  15799 gaatgcaagtcatcatcatcatatacatcaaacataa 15763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15764 - 15719
Alignment:
Q  199 aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15764 aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 15719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178947
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17214
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc--aaaaccagcatgatataacaatat 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| |||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatat 17239  T
Q  107 caaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  17238 caaatgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79328
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||  |||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
Q  127 ctcaa 131  Q
    |||||    
T  79332 ctcaa 79328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16095
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  123 acatctcaaacat 135  Q
    |||||||||||||    
T  16107 acatctcaaacat 16095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13252
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  127 ctcaaac 133  Q
    || ||||    
T  13246 ctgaaac 13252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39599
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 39576  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  39577 atgcaagtcaacaacatctcaaa 39599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75213
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 75236  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  75235 atgcaagtcaacaacatctcaaa 75213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1155
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
Q  127 ctcaaa 132  Q
    ||||||    
T  1150 ctcaaa 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 4849 - 4968
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 4947  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  4948 aaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34288
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaac-ccatcatgatataataatatc 34221  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34222 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcaagtaatatatatacaattatataacatta 34288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13211
Alignment:
Q  58 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  13141 acaaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Original strand, 273 - 326
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52032
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatc 52011  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  52012 aattgcaagtcaacatcatct 52032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167980
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 168001  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  168000 aattgcaattcatcaacatct 167980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16235
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatc 16211  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  16212 aaatgcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32959
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 32980  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||||||||||||    
T  32979 aattgcaattcaacaacatct 32959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46046
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 46025  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||||||||||||    
T  46026 aattgcaattcaacaacatct 46046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 70  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 178
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25275
Alignment:
Q  23 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||| ||||| |||| || ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaa 25218  T
Q  121 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25219 caacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaaatatatcacatta 25275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Original strand, 620 - 715
Alignment:
Q  91 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  620 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23001
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22983  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || |||||||||||||||    
T  22984 tgcaagtcaacaacatct 23001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13510
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13489  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13490 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20865
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20844  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20845 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13330
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13309  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  13310 aattgcaattcatcaacatct 13330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37939
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 37918  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  37919 tgcaagtcaacaacgtctcaa 37939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158494
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 158515  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  158514 tgcaagtcaacaacgtctcaa 158494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339949
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 339969  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  339968 t-caagtcaacaacatctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8605
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatc 8577  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 135  Q
    || || ||||||||||||||| ||||||    
T  8578 aattgcaagtcaacaacatcttaaacat 8605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7945
Alignment:
Q  29 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatc-agctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  127 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    || |||||| || | ||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| || |||| ||||||| |||    
T  8062 cttaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtctcactggaacaacatcag 7964  T
Q  226 caagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  7963 caagataaacaacttagtt 7945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16599
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 16623  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    
T  16622 aaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10891
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 10869  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  10870 atgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4812
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 4791  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4792 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3589
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 3568  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  3569 aattgcaattcatcaacatct 3589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 343 - 461
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||||||    
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacataggcagtatacaaaa-tagcatgacgtaataatatc 440  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || |||||||||||||||    
T  441 aattggaagtcaacaacatct 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14065
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14044  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14045 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33060
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 33039  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  33040 aaatgcaagttaacaacatct 33060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 131
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9867
Alignment:
Q  6 ggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaata 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| ||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataata 9841  T
Q  106 tcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||    
T  9842 tcaagtgcaagtcaacaacgtctcaa 9867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 38761 - 38879
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38858  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| || | ||||||||||    
T  38859 aaatgcaaataaacaacatct 38879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16902
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16881  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16882 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 1851 - 1970
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 1949  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  1950 aattgcaattcatcaacatct 1970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 250
Target Start/End: Original strand, 54 - 246
Alignment:
Q  58 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  54 acaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaat 151  T
Q  156 gtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | ||||||| |||||||||||||  |||||||| | || ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  152 gcatatacatttatataacattattaacaacatcaaatcatttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagtttcttac 246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8535
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacagcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatc 8556  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  8555 aattgcaagtcaacatcatct 8535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 569 - 790
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 666  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||| | ||||||| | || || |||||||||| ||||||| | |||| | ||||   | || || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  667 atc-ccaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 764  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    |  ||| ||||||||||||| |||||    
T  765 gttagataaacaacttagtttcttac 790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24001 - 23901
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  24001 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 23906  T
Q  108 aaatg 112  Q
     ||||    
T  23905 gaatg 23901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11406
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 11383  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  11384 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 11406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267901
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||| ||| | || |||  || ||||||||||||||||||| ||    
T  267778 atctc-aacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcatatcatccaggcttactgaaacaacagca 267875  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||  || |||||||||| |||||    
T  267876 gtaagctaagcaacttagtttcttac 267901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11643
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 11562  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  11563 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38198
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 38279  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  38278 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24690 - 24605
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata--caattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  24690 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataatttcatgcaatatatatatccaattatataacatta 24605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1050
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 1071  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  1070 aattgcaattcatcaacatct 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4630
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 4605  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4606 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 4630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12212
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 12187  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  12188 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 12212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22164
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 22139  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  22140 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40518
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaa 40497  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  40498 tgcaagtcaacaacgtctcaa 40518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26018
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||    
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-tatcatgacataataatatc 25993  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  25994 aaatgcaagtaaacaacatctcaaa 26018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Original strand, 39858 - 39980
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||    
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-tatcatgacataataatatc 39955  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  39956 aaatgcaagtaaacaacatctcaaa 39980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6123
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaata 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  106 tcaaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    |||| || || ||| ||||||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatct 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 115
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32205
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 111  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaat 32201  T
Q  112 gtaa 115  Q
    ||||    
T  32202 gtaa 32205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12293
Alignment:
Q  9 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || ||||| |||||||| | || |||||||    
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatca 12316  T
Q  109 aatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  12315 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 12293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10427
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||| ||||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatc 10448  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || |  || ||||||||||||    
T  10447 aatttcaattcaacaacatct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4321
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaa 4311  T
Q  111 tgtaagtcaa 120  Q
    || |||||||    
T  4312 tgcaagtcaa 4321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9360
Alignment:
Q  10 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaa 9338  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  9339 atgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 29931 - 30050
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatc-aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  29931 tcatcatcttaattgaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 30028  T
Q  110 atgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  30029 gtgtaagtcaacaacgtctcaa 30050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 100
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4803
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataa 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataa 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24304
Alignment:
Q  26 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  125 atct 128  Q
    ||||    
T  24307 atct 24304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1678
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||| |||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 1802  T
Q  125 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    ||||||| ||||| | ||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| | | || ||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  1801 atctcaa-catcatatataattt-atgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactggaacaacaata 1704  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttac 250  Q
    | |||| |  |||||||||| |||||    
T  1703 gtaagataggcaacttagtttcttac 1678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 78
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1359
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 78  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 1359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7338
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 80  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4415
Alignment:
Q  14 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||     
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 4397  T
Q  114 aagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || |||||||| ||||||    
T  4398 aaatcaacaacgtctcaa 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 111
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16382
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 16378  T
Q  108 aaat 111  Q
    ||||    
T  16379 aaat 16382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17969
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| || || |||||||||| ||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatc 18050  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 188  Q
     || | |||| |||||||||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  18049 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 17969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2184
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2194  T
Q  111 tgtaagtcaa 120  Q
    || |||||||    
T  2193 tgcaagtcaa 2184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 106 - 224
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 203  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  204 tgcaaatcaacaacgtctcaa 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2071
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatc 2050  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||||||||||||    
T  2051 aattgcaattcaacaacatct 2071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21030
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    |||||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51654
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 80  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 51654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 87
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13575
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 87  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaac 13575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 79
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32137
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 79  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 32137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12176
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-------aaacagcaacaca-gcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaa 12155  T
Q  111 tgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12156 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15485
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aagagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 15487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7359
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 7359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161133
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||||    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaa 161155  T
Q  111 tgtaagtcaa-caacatctcaa 131  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  161154 tgcaagtcaatcaacatctcaa 161133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 128
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4643
Alignment:
Q  29 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatct 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28813
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-aacagcaacataggcagtatgcaaa 85  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1336
Alignment:
Q  14 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 1343  T
Q  114 aagtcaa 120  Q
    |||||||    
T  1342 aagtcaa 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 78
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47065
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 78  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11464
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 11466  T
Q  108 aa 109  Q
    ||    
T  11465 aa 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 1098
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 80  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtat 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20423
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-tcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 20428  T
Q  127 ctcaa 131  Q
    |||||    
T  20427 ctcaa 20423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128869
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |   |  |   |||| |||||||| |||| ||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcaaca-aaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatc 128848  T
Q  108 aaatgtaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  128849 aaatgcaagtcaacaacatct 128869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5183
Alignment:
Q  11 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 74  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacatagg 5183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  8 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggc 75  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 112
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2780
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatg 2780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 188
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  66 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatataca 164  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaac-agcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatataca 225561  T
Q  165 attatataacattaacaacaacat 188  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||    
T  225562 attatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23892
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36503
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3529
Alignment:
Q  72 aggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 289 - 339
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa 62  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  289 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaaa 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 70
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  27 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29607
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaa 29607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2488 - 2398
Alignment:
Q  84 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2488 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatttaatgtatatacaattatataacatta 2398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 6 - 88
Alignment:
Q  95 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 178  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  6 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 132
Target Start/End: Original strand, 27911 - 27953
Alignment:
Q  90 gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 132  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 27953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  29 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 79  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 1881 - 1945
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 159 - 208
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  159 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataac-aatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21871
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 21871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29763
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 29763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69843
Alignment:
Q  12 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 61  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 69843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 697 - 602
Alignment:
Q  94 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 190  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  697 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University