View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20210_low_1 (Length: 310)

Name: NF20210_low_1
Description: NF20210
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20210_low_1
NF20210_low_1
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (19-295)||(2046-2322)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (19-295)||(33974-34250)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (19-295)||(7341244-7341520)
chr8 (19-295)||(30304230-30304506)
chr8 (19-295)||(32377528-32377804)
chr8 (19-295)||(32431485-32431761)
chr8 (19-295)||(8422476-8422752)
chr8 (19-295)||(35965365-35965641)
chr8 (19-295)||(43370932-43371208)
chr8 (19-295)||(43688791-43689067)
chr8 (19-292)||(2145619-2145897)
chr8 (19-294)||(45455542-45455817)
chr8 (19-295)||(7169065-7169332)
chr8 (124-295)||(1115937-1116108)
chr8 (19-227)||(22581061-22581269)
chr8 (143-295)||(39751772-39751924)
chr8 (22-125)||(45116582-45116685)
chr8 (37-125)||(44321173-44321261)
chr8 (21-104)||(13781580-13781663)
chr8 (21-130)||(17316787-17316896)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (19-295)||(43622755-43623031)
chr7 (19-294)||(30787705-30787980)
chr7 (19-295)||(45764544-45764820)
chr7 (19-295)||(617369-617645)
chr7 (19-295)||(18106553-18106829)
chr7 (19-295)||(42500572-42500848)
chr7 (19-295)||(47062048-47062324)
chr7 (19-295)||(43827227-43827502)
chr7 (40-295)||(8400751-8401006)
chr7 (19-187)||(15067162-15067330)
chr7 (183-295)||(15060778-15060890)
chr7 (30-125)||(1297321-1297416)
chr7 (22-150)||(16795719-16795847)
chr7 (34-125)||(43378943-43379034)
chr7 (22-125)||(16794236-16794339)
chr7 (22-125)||(40445188-40445291)
chr7 (30-125)||(45172540-45172635)
chr7 (22-125)||(46791660-46791763)
chr7 (22-125)||(47867122-47867225)
chr7 (19-68)||(12116989-12117038)
chr7 (22-138)||(8193903-8194019)
chr7 (24-125)||(40794258-40794359)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (19-295)||(19072277-19072553)
chr4 (19-295)||(49565084-49565360)
chr4 (19-295)||(3404955-3405231)
chr4 (19-295)||(9891187-9891463)
chr4 (18-295)||(41024364-41024641)
chr4 (19-295)||(4769299-4769575)
chr4 (19-295)||(38463457-38463733)
chr4 (19-295)||(44049775-44050051)
chr4 (19-295)||(4976920-4977196)
chr4 (19-295)||(11502671-11502947)
chr4 (19-295)||(4978578-4978850)
chr4 (19-279)||(21471974-21472235)
chr4 (112-295)||(51643211-51643394)
chr4 (21-263)||(6182875-6183117)
chr4 (185-295)||(18580117-18580224)
chr4 (22-125)||(32716628-32716731)
chr4 (22-98)||(4617919-4617995)
chr4 (22-125)||(1591168-1591271)
chr4 (22-125)||(17916521-17916624)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (19-295)||(3949908-3950184)
chr3 (19-295)||(6742052-6742328)
chr3 (19-295)||(8159603-8159879)
chr3 (19-295)||(30946262-30946538)
chr3 (19-295)||(13746341-13746617)
chr3 (19-295)||(16445785-16446061)
chr3 (19-295)||(36816136-36816412)
chr3 (19-295)||(14399720-14399996)
chr3 (76-295)||(9428510-9428729)
chr3 (19-295)||(48249487-48249763)
chr3 (19-295)||(7841636-7841911)
chr3 (19-294)||(46991866-46992141)
chr3 (19-295)||(6504575-6504851)
chr3 (19-294)||(77640-77915)
chr3 (19-295)||(7838761-7839037)
chr3 (19-295)||(21954859-21955134)
chr3 (19-252)||(29908027-29908259)
chr3 (19-252)||(29949193-29949425)
chr3 (19-252)||(29998347-29998579)
chr3 (19-101)||(28610539-28610621)
chr3 (248-295)||(29930533-29930580)
chr3 (248-295)||(29979687-29979734)
chr3 (22-118)||(9556387-9556483)
chr3 (22-125)||(2284680-2284783)
chr3 (37-125)||(4120432-4120520)
chr3 (22-125)||(12491422-12491525)
chr3 (38-125)||(40467847-40467934)
chr3 (22-125)||(51548156-51548259)
chr3 (22-125)||(33940190-33940293)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (19-295)||(212061-212337)
chr2 (19-295)||(5348332-5348608)
chr2 (19-295)||(41561177-41561453)
chr2 (19-295)||(10623074-10623350)
chr2 (19-295)||(27274980-27275256)
chr2 (19-295)||(38946928-38947204)
chr2 (19-295)||(39795135-39795411)
chr2 (24-295)||(3802191-3802462)
chr2 (19-295)||(24750823-24751100)
chr2 (19-295)||(1098446-1098722)
chr2 (19-295)||(24604709-24604985)
chr2 (19-294)||(45476524-45476798)
chr2 (19-295)||(43948902-43949178)
chr2 (19-295)||(12907112-12907388)
chr2 (19-295)||(34920402-34920678)
chr2 (19-295)||(41007600-41007876)
chr2 (19-295)||(9655321-9655597)
chr2 (19-295)||(436476-436753)
chr2 (46-295)||(28354549-28354798)
chr2 (50-295)||(11692466-11692711)
chr2 (22-211)||(7264229-7264418)
chr2 (21-291)||(17996794-17997064)
chr2 (19-103)||(24941270-24941354)
chr2 (22-150)||(28423097-28423225)
chr2 (33-103)||(3353915-3353985)
chr2 (62-142)||(21535507-21535587)
chr2 (258-295)||(7264197-7264234)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (19-295)||(3947081-3947357)
chr1 (19-295)||(3984278-3984554)
chr1 (19-295)||(20350621-20350897)
chr1 (19-295)||(44466747-44467023)
chr1 (19-295)||(38774735-38775011)
chr1 (19-295)||(29355308-29355584)
chr1 (19-295)||(5079100-5079376)
chr1 (19-295)||(41455002-41455278)
chr1 (19-295)||(13630581-13630857)
chr1 (19-295)||(37016079-37016355)
chr1 (19-295)||(50116383-50116659)
chr1 (19-295)||(12649199-12649475)
chr1 (19-295)||(38691559-38691835)
chr1 (19-295)||(46974329-46974605)
chr1 (19-295)||(13174946-13175222)
chr1 (19-295)||(51663423-51663699)
chr1 (19-295)||(21942984-21943260)
chr1 (19-213)||(19498084-19498277)
chr1 (21-289)||(32106276-32106533)
chr1 (201-295)||(44619905-44619999)
chr1 (135-289)||(26466006-26466160)
chr1 (22-125)||(36360143-36360246)
chr1 (255-295)||(7980068-7980108)
chr1 (30-125)||(7403953-7404048)
chr1 (22-125)||(28863225-28863328)
chr1 (22-125)||(45472687-45472790)
chr1 (22-98)||(20240037-20240113)
chr1 (107-204)||(25231558-25231655)
chr1 (30-98)||(27283402-27283470)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (19-295)||(1611371-1611647)
chr6 (19-295)||(31147487-31147763)
chr6 (19-295)||(29287573-29287844)
chr6 (22-295)||(18607161-18607434)
chr6 (19-221)||(28357557-28357759)
chr6 (19-295)||(21357970-21358243)
chr6 (19-295)||(23961952-23962225)
chr6 (222-295)||(28251061-28251134)
chr6 (220-295)||(24220333-24220408)
chr6 (22-125)||(9095463-9095566)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (19-295)||(37819497-37819773)
chr5 (19-295)||(7020500-7020776)
chr5 (19-295)||(28885028-28885304)
chr5 (19-295)||(11032072-11032348)
chr5 (19-295)||(38858810-38859086)
chr5 (19-295)||(34078945-34079221)
chr5 (18-295)||(27866464-27866741)
chr5 (19-295)||(7799626-7799902)
chr5 (19-295)||(4202559-4202835)
chr5 (19-295)||(18536956-18537232)
chr5 (19-295)||(1036516-1036792)
chr5 (19-295)||(25895717-25895997)
chr5 (19-295)||(13566727-13566987)
chr5 (21-289)||(20287439-20287708)
chr5 (58-289)||(20286180-20286410)
chr5 (22-125)||(11819551-11819654)
chr5 (22-125)||(27013292-27013395)
chr5 (22-125)||(42343826-42343928)
chr5 (45-150)||(25053043-25053148)
chr5 (37-125)||(43295549-43295637)
chr5 (22-125)||(6553124-6553227)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (19-295)||(15977-16253)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (19-295)||(17234-17510)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (143-295)||(12427-12580)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (19-56)||(25566-25603)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (22-125)||(28509-28612)


Alignment Details
Target: scaffold0494 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2322 - 2046
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2322 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 2223  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2222 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 2123  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2122 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 2046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34250 - 33974
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34250 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 34151  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34150 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 34051  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34050 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 33974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7341520 - 7341244
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341520 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 7341421  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341420 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 7341321  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341320 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 7341244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 30304230 - 30304506
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304230 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 30304329  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304330 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 30304429  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304430 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 30304506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 32377528 - 32377804
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377528 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 32377627  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377628 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 32377727  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377728 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 32377804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 32431485 - 32431761
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431485 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 32431584  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431585 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 32431684  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431685 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 32431761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 8422476 - 8422752
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8422476 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatataatggatgttggatgag 8422575  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422576 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 8422675  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422676 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 8422752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 35965365 - 35965641
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35965365 acctcaaatattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 35965464  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35965465 cccaaaagatatcttcaactgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 35965564  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965565 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 35965641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 43371208 - 43370932
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43371208 acctcaaacgttgacatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 43371109  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  43371108 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagctgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgactt 43371009  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43371008 cttgtcagctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 43370932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 43688791 - 43689067
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  43688791 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggattttggatgag 43688890  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| ||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43688891 cccaaaagatatcttcgattatagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcccccaacttcgaaattagaaattgcaacggctt 43688990  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43688991 cttatcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 43689067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 292
Target Start/End: Original strand, 2145619 - 2145897
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  2145619 acctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgag 2145718  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  2145719 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacaactt 2145818  T
Q  219 cttgtcacccc-----tatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 292  Q
    ||||||||| |     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145819 cttgtcacctctattatatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 2145897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45455817 - 45455542
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45455817 acctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgttggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaaattttaaacaacttaacggatgttggatgag 45455718  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    |||||||||||| ||  || ||  ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45455717 cccaaaaaatatatttgattgtggtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 45455618  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 294  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45455617 tttgtcacctctatttgcctttcatatttgttgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatatggt 45455542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7169332 - 7169065
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7169332 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagttcataaccaaaatcgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 7169233  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||        
T  7169232 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcatccaactttgagattatatattgcaacg---- 7169137  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7169136 -----cacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatggaatgtggtc 7169065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 124 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1116108 - 1115937
Alignment:
Q  124 aaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgt 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1116108 aaaacatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgt 1116009  T
Q  224 cacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1116008 cacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacatttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtc 1115937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22581269 - 22581061
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  22581269 acctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgcaggtggagtccataaccaaaaccgttagaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgag 22581170  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||| ||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22581169 cccaaaagatattttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggatt 22581070  T
Q  219 cttgtcacc 227  Q
    |||||||||    
T  22581069 cttgtcacc 22581061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 295
Target Start/End: Original strand, 39751772 - 39751924
Alignment:
Q  143 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 242  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39751772 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtgaagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaatggtttcttgtcacctctatttgccttcca 39751871  T
Q  243 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39751872 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 39751924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 45116685 - 45116582
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  45116685 tcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtcc 45116586  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  45116585 aaaa 45116582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 44321261 - 44321173
Alignment:
Q  37 ctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  44321261 ctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 44321173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 104
Target Start/End: Original strand, 13781580 - 13781663
Alignment:
Q  21 ctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaat 104  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| | |||||||||    
T  13781580 ctcaaacaacggcattcgatagatgttggttttgtaagtggagtccatgaccaaaacggtcggaaaagtgttgagcaatttaat 13781663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17316896 - 17316787
Alignment:
Q  21 ctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcc 120  Q
    |||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||| ||| | | ||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||  ||| |||||     
T  17316896 ctcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtatgtgaaattcatgatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaacttaaatgattgtgggtgagct 17316797  T
Q  121 caaaaaatat 130  Q
    ||||||||||    
T  17316796 caaaaaatat 17316787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 43622755 - 43623031
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622755 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 43622854  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622855 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 43622954  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622955 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 43623031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30787980 - 30787705
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787980 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 30787881  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787880 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 30787781  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787780 cttgtcacccctatttgctttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 30787705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 45764820 - 45764544
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764820 acctcaaacattggcatcctatacatgctggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 45764721  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764720 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 45764621  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45764620 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcgcatttgtcatgcaatgtggtc 45764544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 617369 - 617645
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  617369 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaatcgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 617468  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  617469 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggttt 617568  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617569 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 617645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18106829 - 18106553
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18106829 acctcaaacattagcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 18106730  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106729 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 18106630  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106629 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 18106553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 42500848 - 42500572
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42500848 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 42500749  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42500748 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 42500649  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500648 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 42500572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47062324 - 47062048
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  47062324 acctcaaacattggcatcttgtacattttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaattttttaaacaacttaacggatgttggatgag 47062225  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47062224 cccgaaagatatcttcaattgtagtactttcactttgtgtt-ttgagtaataagtatagttgtgctcttccaacttcgagattagatattgcaacggctt 47062126  T
Q  219 cttgtc-acccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47062125 cttgtcaacctctatttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 47062048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 43827227 - 43827502
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43827227 acctcaaacattggcatcttgtacacgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 43827326  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43827327 cccaaaagatattttcaattgtagtactttcactttgtgttcttgtgaaataagtatagttgtgctcattcaacttcgaga-tagatattgcaacggctt 43827425  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  43827426 cttgtcacctctatttgccttccatatttgctgacgttcattgtacacttgcttgatatttgtcatgcaatgtggtc 43827502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8401006 - 8400751
Alignment:
Q  40 tacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatag 139  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8401006 tacatgttggttttgtaggtgaaatccataaccaaaaccgttagaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaaaatatctttaattg 8400907  T
Q  140 tattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcctt 239  Q
    || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  8400906 tagtactttcactttgtgttcttgagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgccgtcttgtcacctctatttgcctt 8400807  T
Q  240 ccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  8400806 ccatatttgttgacgttcaatgtacacttgcttgatatttgtcatccaatgtggtc 8400751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15067330 - 15067162
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15067330 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtatgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 15067231  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067230 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 15067162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15060890 - 15060778
Alignment:
Q  183 ctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060890 ctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 15060791  T
Q  283 atgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||    
T  15060790 atgcaatgtggtc 15060778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 1297416 - 1297321
Alignment:
Q  30 tggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 125  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  1297416 tggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagttggaaaaatgttaaacaactttatcgatgttggatgagtccaaaa 1297321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Original strand, 16795719 - 16795847
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||| || |||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||    
T  16795719 tcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacatggaatccattatcaaaacagttggaaaattgttaaacaattttaccgatgttggatgagtcc 16795818  T
Q  122 aaaaaatatcttcaatagtattactttca 150  Q
    |||| |  |||| || ||| |||||||||    
T  16795819 aaaataagtcttgaacagttttactttca 16795847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 125
Target Start/End: Original strand, 43378943 - 43379034
Alignment:
Q  34 atcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 125  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  43378943 atcctatacaagttggttttgtatgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 43379034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 16794236 - 16794339
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  |||||| |||||| ||    
T  16794236 tcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttactgatgtttgatgagtcc 16794335  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  16794336 aaaa 16794339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 40445188 - 40445291
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| | |||||| ||  ||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  40445188 tcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacatggaatccattatcaaaacagtcagaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtcc 40445287  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  40445288 aaaa 40445291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Original strand, 45172540 - 45172635
Alignment:
Q  30 tggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 125  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || || | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  45172540 tggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatcaattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45172635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 46791763 - 46791660
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||| ||||||| || || |  ||||||||||||| ||    
T  46791763 tcaaacaatggcattctatacaagttagttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaataactttactgatgttggatgagtcc 46791664  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  46791663 aaaa 46791660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 47867122 - 47867225
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| | ||  ||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  47867122 tcaaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggagtccattatcaaagcagtcagaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtcc 47867221  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  47867222 aaaa 47867225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Original strand, 12116989 - 12117038
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccat 68  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12116989 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccat 12117038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 138
Target Start/End: Original strand, 8193903 - 8194019
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||| | |||||| || |||||||| |||||||| || |   |||||||||||| ||    
T  8193903 tcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaatgcattatcaaaacagtcggaaaattattaaacaactttaccaatgttggatgagtcc 8194002  T
Q  122 aaaaaatatcttcaata 138  Q
    |||| || |||| ||||    
T  8194003 aaaatatgtcttgaata 8194019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 40794359 - 40794258
Alignment:
Q  24 aaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaa 123  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||   |||||  || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||    
T  40794359 aaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggaatccattctcaaaatagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaa 40794260  T
Q  124 aa 125  Q
    ||    
T  40794259 aa 40794258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 19072277 - 19072553
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072277 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 19072376  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072377 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 19072476  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072477 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 19072553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 49565084 - 49565360
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565084 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 49565183  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565184 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 49565283  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565284 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 49565360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3405231 - 3404955
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3405231 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgtttgaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 3405132  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405131 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 3405032  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3405031 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtc 3404955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9891463 - 9891187
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9891463 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 9891364  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9891363 tccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 9891264  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891263 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 9891187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 18 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41024641 - 41024364
Alignment:
Q  18 cacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatga 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024641 cacctcaaacattggcctcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatga 41024542  T
Q  118 gcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41024541 gcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacgact 41024442  T
Q  218 tcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024441 ttttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 41024364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4769575 - 4769299
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4769575 acctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 4769476  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4769475 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatcagaaattgcaacggctt 4769376  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769375 cttgtcacctctatttgccttccatatttgtagacattcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 4769299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 38463457 - 38463733
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  38463457 acctcaaacattagcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgag 38463556  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  38463557 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgactt 38463656  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38463657 cttgtcacctctatttgccttccgtatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcagtgtggtc 38463733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44050051 - 44049775
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44050051 acctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 44049952  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44049951 cccaaaagatatcttcgattgtagtagtttcactttgtgttattgagtaataagtatagctgcgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagctt 44049852  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44049851 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcgttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 44049775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4977196 - 4976920
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  4977196 acctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgag 4977097  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  4977096 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgctctttagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacgactt 4976997  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4976996 cttgtcacctctatttgcattccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 4976920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11502947 - 11502671
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  11502947 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgtttgatgag 11502848  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11502847 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttctctttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcttccaacttcgagattagatattgcaacggctt 11502748  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11502747 cttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtttacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtc 11502671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 4978578 - 4978850
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || |||||| |||    
T  4978578 acctcaaacattgacatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttcgaaaattgttaaacaacttaacagacgttggaagag 4978677  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4978678 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacggctt 4978777  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978778 cttgtcacc----tttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 4978850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21472235 - 21471974
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtctt-gtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatga 117  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21472235 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggtgtttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatga 21472136  T
Q  118 gcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggct 217  Q
    |||||||| |||||||  ||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  21472135 gcccaaaagatatctttgattttagtactttcactttgtgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaaatattgcaacgact 21472036  T
Q  218 tcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacattt 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21472035 tcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacattt 21471974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 112 - 295
Target Start/End: Original strand, 51643211 - 51643394
Alignment:
Q  112 ggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 211  Q
    |||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51643211 ggatgagcccaaaagatatctttgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 51643310  T
Q  212 acggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51643311 acggcgtcttgtcaactctatttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgctttacatttgtcatgcaatgtggtc 51643394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6183117 - 6182875
Alignment:
Q  21 ctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcc 120  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  6183117 ctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtagatggagttcataatcaaaactgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcc 6183018  T
Q  121 caaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttct 220  Q
    ||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | | | |||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| |  | |||    
T  6183017 caaaatatgtcttgaatagtagtactttcaatttgtgttatggtgaaataaacatagttgtgttcctccaattttgagattagatattgcatcaccgtct 6182918  T
Q  221 tgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgta 263  Q
    ||||||| || |||| |||  |||||| |||| ||||||||||    
T  6182917 tgtcacctctgtttgacttgaatattttttgatgttcattgta 6182875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Original strand, 18580117 - 18580224
Alignment:
Q  185 cctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 284  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18580117 cctcaaacttcgagattaaatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg---tccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 18580213  T
Q  285 gcaatgtggtc 295  Q
    |||||| ||||    
T  18580214 gcaatgaggtc 18580224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 32716731 - 32716628
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  32716731 tcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtcc 32716632  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  32716631 aaaa 32716628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 4617995 - 4617919
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 98  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  4617995 tcaaacaatggcgtcctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaa 4617919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 1591271 - 1591168
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  1591271 tcaaacaatggcattctatacaagttggttttctacgtggaatccattatcaaaacagtcgaaaaattgttaaacaactttactgatgttggatgagtcc 1591172  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  1591171 aaaa 1591168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 17916624 - 17916521
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| |||||| |||||||   |||| ||||||||| | ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  17916624 tcaaacaatggcattctatacaaaatggttttgtacgtgaaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtcc 17916525  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  17916524 aaaa 17916521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3950184 - 3949908
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950184 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 3950085  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950084 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 3949985  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949984 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 3949908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6742328 - 6742052
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742328 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 6742229  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742228 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 6742129  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742128 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 6742052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 8159603 - 8159879
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159603 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 8159702  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159703 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 8159802  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159803 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 8159879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 30946262 - 30946538
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946262 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 30946361  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946362 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 30946461  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946462 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 30946538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 13746341 - 13746617
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13746341 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 13746440  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746441 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 13746540  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746541 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 13746617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16446061 - 16445785
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16446061 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 16445962  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16445961 cccaaaatatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 16445862  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445861 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 16445785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 36816136 - 36816412
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36816136 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 36816235  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816236 cccaaaagatatcttcgattgtattactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 36816335  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816336 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 36816412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14399996 - 14399720
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14399996 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 14399897  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14399896 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaaattcgagattagatattgcaacggctt 14399797  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399796 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 14399720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 76 - 295
Target Start/End: Original strand, 9428510 - 9428729
Alignment:
Q  76 accgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtat 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428510 accgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtat 9428609  T
Q  176 agttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcac 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428610 agttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcac 9428709  T
Q  276 atttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9428710 atttgtcatgcaatgtggtc 9428729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 48249487 - 48249763
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48249487 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 48249586  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  48249587 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtgataagtatagttgtgctcatccaacatagagattagatattgcaacggctt 48249686  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249687 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 48249763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 7841636 - 7841911
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  7841636 acctcaaacattggcatcctctacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgaa 7841735  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7841736 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagt-tagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 7841834  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841835 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 7841911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 46991866 - 46992141
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  46991866 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 46991965  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  46991966 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacataaagattagatattgcaacggctt 46992065  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 294  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46992066 cttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcatatttgtcatgcaatgtggt 46992141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 6504575 - 6504851
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  6504575 acctcaaacattggcatcctgtacatgttggttatgtaggtggagtccataaccaaaacggttggaaaattgttaaaaaacttaacggatgttggatgag 6504674  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6504675 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgaggttagatattgcaacggctt 6504774  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504775 cttgtcacctctatgtgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 6504851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 77640 - 77915
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  77640 acctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgttaaacaacttaacaaatgttggatgag 77739  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  77740 cccaaaagatatcttcgatggtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgactt 77839  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 294  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77840 cttgtcacctctatttgcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 77915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7839037 - 7838761
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  7839037 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccatgaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgtcggatgag 7838938  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7838937 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttatgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggctt 7838838  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838837 cttgccacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 7838761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 21954859 - 21955134
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21954859 acctcaaatattggcatcctgtacatgttcgttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 21954958  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    |||||||  ||||||| || ||  ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21954959 cccaaaaggtatcttcgattgtggtactttcactttgttttcttgagaaataagtatagttgtggtcctccaacttcgagatta-atattgcaacggctt 21955057  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955058 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 21955134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29908259 - 29908027
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29908259 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 29908160  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  29908159 cccaaaagatatcttcgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgcaacgactt 29908061  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 252  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29908060 cttgtcacctttatttgccttccatatttgttga 29908027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29949425 - 29949193
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29949425 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 29949326  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  29949325 cccaaaagatatcttcgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgcaacgactt 29949227  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 252  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29949226 cttgtcacctttatttgccttccatatttgttga 29949193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29998579 - 29998347
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29998579 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 29998480  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  29998479 cccaaaagatatcttcgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgcaacgactt 29998381  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 252  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29998380 cttgtcacctttatttgccttccatatttgttga 29998347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 101
Target Start/End: Original strand, 28610539 - 28610621
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaattt 101  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28610539 acctcaaacattgacatcttctacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaaccattt 28610621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29930580 - 29930533
Alignment:
Q  248 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29930580 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 29930533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29979734 - 29979687
Alignment:
Q  248 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29979734 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 29979687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Original strand, 9556387 - 9556483
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  9556387 tcaaacaatgacatcctgtacaagttggttttgtacgtgaaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttacggatgttggatgag 9556483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 2284680 - 2284783
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||  || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  2284680 tcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaatagtcggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtcc 2284779  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  2284780 aaaa 2284783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 125
Target Start/End: Original strand, 4120432 - 4120520
Alignment:
Q  37 ctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  4120432 ctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacggtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 4120520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12491525 - 12491422
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||| | ||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  12491525 tcaaacaatgacattctatacaagttgattttgtacgcggaatccattatcaaaacagttggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtcc 12491426  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  12491425 aaaa 12491422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 125
Target Start/End: Original strand, 40467847 - 40467934
Alignment:
Q  38 tatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 125  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  40467847 tatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40467934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 51548156 - 51548259
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  |||||||||| || ||    
T  51548156 tcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggataagtcc 51548255  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  51548256 aaaa 51548259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 33940293 - 33940190
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || |  ||| |||||||| | || |  ||||||||||||| ||    
T  33940293 tcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgagaaagtgttaaacgactttaccgatgttggatgagtcc 33940194  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  33940193 aaaa 33940190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 212061 - 212337
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212061 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 212160  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212161 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 212260  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212261 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 212337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5348608 - 5348332
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348608 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 5348509  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348508 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 5348409  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348408 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 5348332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41561453 - 41561177
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561453 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 41561354  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561353 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 41561254  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561253 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 41561177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 10623074 - 10623350
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10623074 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttagatgag 10623173  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623174 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 10623273  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623274 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 10623350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 27274980 - 27275256
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27274980 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 27275079  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275080 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 27275179  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275180 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 27275256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38947204 - 38946928
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38947204 acctcaaacattggcatcttatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 38947105  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38947104 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggttt 38947005  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38947004 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtc 38946928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39795411 - 39795135
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39795411 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 39795312  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39795311 cccaaaaaatatcttcaatagtattactatcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 39795212  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795211 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 39795135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 24 - 295
Target Start/End: Original strand, 3802191 - 3802462
Alignment:
Q  24 aaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3802191 aaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggaagttggatgagcccaa 3802290  T
Q  124 aaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802291 aaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctccttcaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgt 3802390  T
Q  224 cacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802391 cacccctatttgccttccatatttgttgaagttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 3802462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24751100 - 24750823
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctata-catgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24751100 acctcaaacattggcatcctataacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatga 24751001  T
Q  118 gcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggct 217  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24751000 gcccaaaagatatctttgatcgtattactttcactttgtattcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggct 24750901  T
Q  218 tcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750900 tcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 24750823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 1098446 - 1098722
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1098446 acctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 1098545  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| ||||||||  | ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1098546 cccaaaagatatcttcggttgtagtactttcactttgtgttcttgaataataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 1098645  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098646 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 1098722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 24604709 - 24604985
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  24604709 acctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgag 24604808  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24604809 cccaaaagatatctttgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 24604908  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604909 cttgtcacctctatttgtcttccctatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 24604985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45476798 - 45476524
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  45476798 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgag 45476699  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45476698 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 45476599  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476598 cttgtcacctctatttgccttccata-ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 45476524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 43948902 - 43949178
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43948902 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 43949001  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  43949002 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctctaacttcgagattagataacgcaacggctt 43949101  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949102 cttgtcacctatatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 43949178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 12907112 - 12907388
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12907112 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtgaagtccataaccaaatccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 12907211  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
     |||||| |||| ||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12907212 tccaaaagatattttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatttgaaattgcaacggctt 12907311  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907312 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 12907388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 34920402 - 34920678
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  34920402 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaatattgttaaacaacttaacagatgttggatgag 34920501  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34920502 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtataagtgtgctcctccaacttcgaaattagatattgcaacggctt 34920601  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34920602 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgaatttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 34920678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 41007600 - 41007876
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  41007600 acctcaaacattggcatcctgtacatgttagttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttgagaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgag 41007699  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41007700 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 41007799  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007800 cttgtcacctctatttgccttacatatttgttgacgttcattttagacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 41007876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9655597 - 9655321
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9655597 acctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 9655498  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  9655497 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataaatatagttgtgctccttcaacttcgacattagatattgcaacgactt 9655398  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9655397 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttacttcacatttttcatgcaatgtggtc 9655321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 436753 - 436476
Alignment:
Q  19 acctcaaac-attggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatga 117  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  436753 acctcaaaccattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaaaagatgttagatga 436654  T
Q  118 gcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggct 217  Q
    |||||||| |||||||  || ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  436653 gcccaaaagatatcttagattgtagtactttcactatgtgttcttgaataataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggct 436554  T
Q  218 tcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  436553 tcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacaattgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 436476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 46 - 295
Target Start/End: Original strand, 28354549 - 28354798
Alignment:
Q  46 ttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattac 145  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||    
T  28354549 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtac 28354648  T
Q  146 tttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatat 245  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  28354649 tttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctatatttgacttccatat 28354748  T
Q  246 ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28354749 ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtc 28354798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Original strand, 11692466 - 11692711
Alignment:
Q  50 tcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttc 149  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| || ||||    
T  11692466 tcttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattcttaaacaacttaacggatgttggatgggcccaaaatatatcttctattgtagtaatttc 11692565  T
Q  150 aagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgt 249  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11692566 actttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaatttcgagattaaatattgcaacggcttcttgtcaactctatttgccttccatatttgt 11692665  T
Q  250 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692666 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 11692711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7264418 - 7264229
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||     
T  7264418 tcaaacattggcatcctatacatgttaattttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtttaactacttaatggatgttggatgagcct 7264319  T
Q  122 aaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264318 aaaaaatatcttcaatggtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 7264229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 291
Target Start/End: Original strand, 17996794 - 17997064
Alignment:
Q  21 ctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcc 120  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  17996794 ctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaatattgttaaacaacgtaacggatgttggatgagcc 17996893  T
Q  121 caaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttct 220  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  | |||    
T  17996894 taaaagatatcttcaatagtagtactttcactttgtgttcttgagaaataaacacagttgtgctcctccaactttgagattagaaactacaacatcgtct 17996993  T
Q  221 tgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 291  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  17996994 tgtcacctctatttgacttccatatttgttgacgttcattgtatacttgcttgatatttggcatgcaatgt 17997064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Original strand, 24941270 - 24941354
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaa 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24941270 acctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaa 24941354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Original strand, 28423097 - 28423225
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| ||||||| | |||| |||||| |||||||||||  |||| | |||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  28423097 tcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaacccattatcaaaacagtcgggaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtcc 28423196  T
Q  122 aaaaaatatcttcaatagtattactttca 150  Q
    |||| || |||| |||||| | |||||||    
T  28423197 aaaatatgtcttgaatagtttgactttca 28423225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 103
Target Start/End: Original strand, 3353915 - 3353985
Alignment:
Q  33 catcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaa 103  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  3353915 catcctgtacatgttggttttataggtggagtccatgatcaaaacagtcgaaaaattgttaaacaatttaa 3353985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21535587 - 21535507
Alignment:
Q  62 agtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtat 142  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||  |||   |||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  21535587 agtccataaccaaaactgttggaaaattgttaaccaacctaactgattgaggatgagcccaaaatatgtcttgaatagtat 21535507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7264234 - 7264197
Alignment:
Q  258 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7264234 attgcacacttgcttcacaattgtcatgcaatgtggtc 7264197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 3947081 - 3947357
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947081 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 3947180  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947181 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 3947280  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947281 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 3947357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3984554 - 3984278
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984554 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 3984455  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984454 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 3984355  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984354 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 3984278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20350897 - 20350621
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350897 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 20350798  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350797 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 20350698  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350697 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 20350621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44467023 - 44466747
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467023 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 44466924  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466923 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 44466824  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466823 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 44466747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 38774735 - 38775011
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774735 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 38774834  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774835 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 38774934  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774935 cttgtcacccatatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 38775011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 29355308 - 29355584
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29355308 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 29355407  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355408 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 29355507  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355508 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 29355584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5079376 - 5079100
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5079376 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccgtaaccaaaaccgtttgaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 5079277  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079276 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 5079177  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079176 cttgtcacccctatctgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 5079100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41455278 - 41455002
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41455278 acctcaaacattggcatcctttacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 41455179  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455178 cccaaaatatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 41455079  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455078 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 41455002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13630857 - 13630581
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13630857 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 13630758  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13630757 cccaaaatatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 13630658  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630657 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 13630581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37016355 - 37016079
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37016355 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 37016256  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37016255 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 37016156  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016155 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 37016079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 50116383 - 50116659
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  50116383 acctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttagatgag 50116482  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  50116483 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgacattagatattgcaacggctt 50116582  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116583 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 50116659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 12649199 - 12649475
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12649199 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 12649298  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||    
T  12649299 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatagatattagatattgcaacgactt 12649398  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649399 cttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 12649475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 38691559 - 38691835
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  38691559 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgag 38691658  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38691659 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatcgagattagatattgcaacggctt 38691758  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691759 cttgtcatctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 38691835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 46974605 - 46974329
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  46974605 acctcaaacattggcatcttgtacctgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaagattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 46974506  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  46974505 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacgactt 46974406  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46974405 cttgtcacctttatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtc 46974329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13175222 - 13174946
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  13175222 acctcaaacattggcatcttgtacatgatggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgctggaaatttgttaaacaacttagcggatgttggatgag 13175123  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    | ||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13175122 cacaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgaaattagaaattgcaacggctt 13175023  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175022 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgattttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 13174946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51663699 - 51663423
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  51663699 acctcaaacactggcattttatacatgttggttttgtaggtagagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaaaggatgttggatgag 51663600  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  51663599 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgactaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgactt 51663500  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51663499 attgtcacctctatttgccttccatttttgttgacgttcaatgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 51663423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 21942984 - 21943260
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  21942984 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggaatccataaccaaaaccgttgaaaatttgttaaacaacttaacgaatgatggatgag 21943083  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  21943084 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgtttttgagaaataagcatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagttt 21943183  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21943184 cttgtcgcctctatttgccttccatatttgttgacgtttattgtacacttgtttgacatttgtcatgcaatgtggtc 21943260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 19498084 - 19498277
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19498084 acctcaaacattggcatcttgtacatgtttgttttgtgggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 19498183  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaac 213  Q
    ||| |||| ||||||  || ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19498184 ccc-aaaagtatctttgattgtagtactttcactttgtgttttttagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaac 19498277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 289
Target Start/End: Original strand, 32106276 - 32106533
Alignment:
Q  21 ctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcc 120  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||           ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  32106276 ctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaa-----------ttgttaaacaacttaatggatgttggatgagct 32106364  T
Q  121 caaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttct 220  Q
     |||| || |||||||||||| ||||||||  ||||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |  | |||    
T  32106365 taaaatatgtcttcaatagtagtactttcactttgtgttctggtgaaataaacatagttgtgctcctccaactttgagattatataatgcatcatcgtct 32106464  T
Q  221 tgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 289  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| | ||||||| ||||||    
T  32106465 tgtcacctctgttcgacttccatatttgttgatgttaattgcatacttgcttgatatttgtcttgcaat 32106533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 295
Target Start/End: Original strand, 44619905 - 44619999
Alignment:
Q  201 tagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44619905 tagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgcacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 44619999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 289
Target Start/End: Original strand, 26466006 - 26466160
Alignment:
Q  135 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 234  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  | | || | ||| || | |    
T  26466006 aatagtagtactttcattttgtgttcttgagaaataaacatagttgtgctccttcaactttgagattagaaactgcaacaccgttttttaacctctgtat 26466105  T
Q  235 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 289  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  26466106 gacttccatatttattgacgttcattgtatacttgcttgatatttgtcatgcaat 26466160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 36360143 - 36360246
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  36360143 tcaaacagtgacattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagttggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtcc 36360242  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  36360243 aaaa 36360246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 295
Target Start/End: Original strand, 7980068 - 7980108
Alignment:
Q  255 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980068 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 7980108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7404048 - 7403953
Alignment:
Q  30 tggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 125  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  7404048 tggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 7403953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28863328 - 28863225
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||| | |||||| || | |||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||    
T  28863328 tcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtagaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaattttacgaatgttggatgagtcc 28863229  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  28863228 aaaa 28863225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 45472790 - 45472687
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||  ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  45472790 tcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtgggatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtcc 45472691  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  45472690 aaaa 45472687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 20240113 - 20240037
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 98  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||| | ||  ||||||||||||||||    
T  20240113 tcaaacaatgacatcctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaagcagtcagaaaattgttaaacaa 20240037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25231655 - 25231558
Alignment:
Q  107 atgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaga 204  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||| ||||||||  || |||| | | | |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25231655 atgttggatgaacccaaaatatgtctttaattgtagtactttcactttttgttatggtgaaataaacatagttgtgctcctccaattttgagattaga 25231558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27283470 - 27283402
Alignment:
Q  30 tggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 98  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||  |  ||||| || |||||||||||||||||    
T  27283470 tggcatcctatacaagttggttttgtgcgtggaatccaatattaaaacagtcggaaaattgttaaacaa 27283402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 1611371 - 1611647
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611371 acctcaaacattggcatcctataaatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 1611470  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611471 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 1611570  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611571 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 1611647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31147763 - 31147487
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  31147763 acctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgtatgag 31147664  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31147663 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 31147564  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31147563 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcaaatttatcatgcaatgtggtc 31147487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 29287573 - 29287844
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29287573 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaatt-ttaaacaaattaacggatgttggatgag 29287671  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |||    
T  29287672 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgatattaga----gcaacgactt 29287767  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29287768 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtc 29287844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18607434 - 18607161
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  18607434 tcaaatattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgagccc 18607335  T
Q  122 aaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttctt 221  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  18607334 aaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtattgttgtgctcctccaacttaaaaattagatattgcaacggcttctt 18607235  T
Q  222 gtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607234 atcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 18607161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28357759 - 28357557
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28357759 acctcaaacatttgcatcctatacatgttggtcttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 28357660  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357659 cccaaaagatatcttcaattgtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 28357560  T
Q  219 ctt 221  Q
    |||    
T  28357559 ctt 28357557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 21357970 - 21358243
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21357970 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 21358069  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21358070 cccaaaatatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacggctt 21358169  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21358170 cttgtcacctctatttgccttccatatttgt---ctatcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtc 21358243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 23961952 - 23962225
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23961952 acctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 23962051  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23962052 cccaaaatatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacggctt 23962151  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23962152 cttgtcacctctatttgccttccatatttgt---ctatcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtc 23962225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 222 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28251134 - 28251061
Alignment:
Q  222 gtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251134 gtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 28251061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 220 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24220408 - 24220333
Alignment:
Q  220 ttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  24220408 ttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgtttattttacacttacttgatatttgtcatgcaatgtggtc 24220333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 9095566 - 9095463
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  9095566 tcaaacaatgacattctatacaagttggctttgtacgtggaatccatgatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtcc 9095467  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  9095466 aaaa 9095463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 37819497 - 37819773
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37819497 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 37819596  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819597 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 37819696  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819697 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 37819773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 7020500 - 7020776
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7020500 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 7020599  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020600 cccaaaagatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 7020699  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020700 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 7020776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 28885028 - 28885304
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28885028 acctcaaacattggcatccaatacatgttggtttcgtacgtggaatccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 28885127  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885128 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 28885227  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885228 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 28885304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 11032072 - 11032348
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11032072 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 11032171  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11032172 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggttt 11032271  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032272 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 11032348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 38858810 - 38859086
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38858810 acctcaaacattggcatcctatatatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 38858909  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38858910 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 38859009  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38859010 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 38859086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34079221 - 34078945
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34079221 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 34079122  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079121 cccaaaagatatcttcaattgtattactttcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 34079022  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079021 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 34078945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 295
Target Start/End: Original strand, 27866464 - 27866741
Alignment:
Q  18 cacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatga 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27866464 cacctcaaacattggcctcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatga 27866563  T
Q  118 gcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggct 217  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27866564 gcccaaaagatatcttcaattgtattactttcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaaaggtt 27866663  T
Q  218 tcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866664 tcttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 27866741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 7799626 - 7799902
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7799626 acctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccttaaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 7799725  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7799726 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 7799825  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799826 cttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 7799902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 4202559 - 4202835
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4202559 acctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaactgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 4202658  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4202659 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 4202758  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4202759 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtc 4202835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 18536956 - 18537232
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18536956 acctcaaacattagcatcttgtacatgttagttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 18537055  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18537056 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 18537155  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537156 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 18537232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1036792 - 1036516
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1036792 acctcaaacattggcatcctatacatgttgattttgtaggttgagtccgtaaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttagatgag 1036693  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1036692 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 1036593  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1036592 cttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtgtcacatttgtcatgcaatgtggtc 1036516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 25895717 - 25895997
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25895717 acctcaagcattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgag 25895816  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac----ttcgagattagaaattgcaacg 214  Q
    ||||||| |||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | || |||||| |||||||||    
T  25895817 cccaaaagatatcttcgattgtagtactctcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatatatagatattagatattgcaacg 25895916  T
Q  215 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895917 gcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 25895997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 13566727 - 13566987
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||                |||| ||||||||||||| ||||     
T  13566727 acctcaaacattggcatcctagacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaacc----------------acaacttaatggatgttgaatgat 13566810  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566811 cccaaaagatatcttcaattgtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 13566910  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566911 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 13566987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20287708 - 20287439
Alignment:
Q  21 ctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaat-ttaatggatgttggatgagc 119  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  20287708 ctcaaacataggcatcttgtacatgttggtttggtaggtggagtccataaccagaaccgttggaaaattgttaaaaaaacttaacggatgttggatgagc 20287609  T
Q  120 ccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 219  Q
     ||||| || |||||||||||| |||||| |   | |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  | ||    
T  20287608 gcaaaatatgtcttcaatagtagtactttgaccatttgttcttgagaaataaacataattgtgctcctccaactttgagattagaaactggaaccccgtc 20287509  T
Q  220 ttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 289  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||    
T  20287508 ttgtcacctctgtttgactttcatatttattgacgttcattatatacttgcttgatatttgtcatacaat 20287439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 58 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20286410 - 20286180
Alignment:
Q  58 gtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtg 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| | |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  |||||    
T  20286410 gtggagtccataaccaaaactgttggaaaattcataa-caactaagcggatgttggatgagcccaaaatatgtcttcaatagtagtactttcattttgtg 20286312  T
Q  158 ttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttc 257  Q
    || ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    |||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20286311 ttattgagaaataaagataattgtgctcctccaactttgagattagaaactgcaccacagtcttgtcacctctgtttgacttccatatttgttgatgttc 20286212  T
Q  258 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 289  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20286211 attgtatacttgcttgatatttgtcatgcaat 20286180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11819654 - 11819551
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||| ||    
T  11819654 tcaaacaatagcatcctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgattttggatgagtcc 11819555  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  11819554 aaaa 11819551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 27013292 - 27013395
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| || || | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  27013292 tcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtggaatctattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtcc 27013391  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  27013392 aaaa 27013395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 42343928 - 42343826
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| ||    
T  42343928 tcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtatgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaatatact-gatgttggatgagtcc 42343830  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  42343829 aaaa 42343826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25053148 - 25053043
Alignment:
Q  45 gttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtatta 144  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||  || || ||| ||||||||| |||||| || |||| |||||| | |    
T  25053148 gttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagccggaaaattgttaaacagctttatcgatattggatgagtccaaaatatgtcttgaatagtttga 25053049  T
Q  145 ctttca 150  Q
    ||||||    
T  25053048 ctttca 25053043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 43295637 - 43295549
Alignment:
Q  37 ctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  43295637 ctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 43295549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 6553227 - 6553124
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  || |||||||||| ||    
T  6553227 tcaaacaatggcattctatacaaattggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgaagttggatgagtcc 6553128  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  6553127 aaaa 6553124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Original strand, 15977 - 16253
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15977 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggaagttggatgag 16076  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16077 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 16176  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16177 cttgtcacccctatttgcgttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 16253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17510 - 17234
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  17510 acctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgag 17411  T
Q  119 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 218  Q
    || |||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17410 cctaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatatttcaacggctt 17311  T
Q  219 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17310 cttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtc 17234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12580 - 12427
Alignment:
Q  143 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc-ttcc 241  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||     
T  12580 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttcttgtcacctctatttgcctttcg 12481  T
Q  242 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12480 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 12427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Original strand, 25566 - 25603
Alignment:
Q  19 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgta 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25566 acctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgta 25603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 28509 - 28612
Alignment:
Q  22 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 121  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||| || || || || ||||| | |||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||    
T  28509 tcaaacaatgacattctatacaagttggttttttatgtagaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaattttaccgatgttggatgagtcc 28608  T
Q  122 aaaa 125  Q
    ||||    
T  28609 aaaa 28612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University