View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20220_low_6 (Length: 415)

Name: NF20220_low_6
Description: NF20220
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20220_low_6
NF20220_low_6
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (3-345)||(310387-310727)
scaffold0005 (4-345)||(215975-216306)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (3-345)||(6421661-6422002)
chr3 (3-345)||(6432101-6432442)
chr3 (3-345)||(16335809-16336150)
chr3 (3-345)||(10012595-10012935)
chr3 (3-345)||(25432219-25432559)
chr3 (13-345)||(12365-12695)
chr3 (4-345)||(55478412-55478751)
chr3 (5-345)||(20491414-20491752)
chr3 (3-345)||(4024760-4025099)
chr3 (136-345)||(8982682-8982890)
chr3 (136-345)||(1685815-1686023)
chr3 (136-345)||(8972099-8972307)
chr3 (143-345)||(12804794-12804995)
chr3 (3-127)||(8972423-8972546)
chr3 (3-127)||(8982978-8983101)
chr3 (3-127)||(9536712-9536835)
chr3 (3-127)||(9547038-9547161)
chr3 (3-127)||(1685619-1685742)
chr3 (3-127)||(4370954-4371077)
chr3 (3-127)||(4380673-4380796)
chr3 (3-123)||(5655994-5656113)
chr3 (206-325)||(17732274-17732393)
chr3 (206-325)||(19033505-19033624)
chr3 (205-345)||(2490167-2490308)
chr3 (205-345)||(4783588-4783729)
chr3 (208-345)||(4370364-4370502)
chr3 (208-345)||(4380110-4380248)
chr3 (205-345)||(5656459-5656600)
chr3 (205-345)||(9536261-9536402)
chr3 (205-345)||(9546683-9546824)
chr3 (205-345)||(19828851-19828992)
chr3 (205-345)||(20292488-20292629)
chr3 (205-345)||(51979338-51979477)
chr3 (205-345)||(18560276-18560418)
chr3 (205-345)||(13120546-13120687)
chr3 (205-345)||(20745640-20745781)
chr3 (206-345)||(49387932-49388071)
chr3 (205-345)||(13113417-13113559)
chr3 (206-345)||(24873836-24873975)
chr3 (226-325)||(11459426-11459524)
chr3 (206-325)||(24792822-24792941)
chr3 (205-345)||(24762893-24763034)
chr3 (8-148)||(10508530-10508668)
chr3 (223-319)||(11044776-11044872)
chr3 (209-325)||(21542838-21542954)
[»] chr7 (65 HSPs)
chr7 (3-345)||(9545885-9546226)
chr7 (3-345)||(9535602-9535943)
chr7 (3-345)||(32097739-32098080)
chr7 (3-345)||(32108176-32108517)
chr7 (3-345)||(42620539-42620879)
chr7 (40-345)||(22964652-22964955)
chr7 (3-345)||(14943670-14944007)
chr7 (3-345)||(15371263-15371600)
chr7 (136-345)||(16132556-16132764)
chr7 (136-345)||(16143120-16143328)
chr7 (136-345)||(46496251-46496459)
chr7 (136-345)||(46506863-46507071)
chr7 (3-345)||(2992278-2992617)
chr7 (3-341)||(14248902-14249238)
chr7 (205-345)||(5926041-5926182)
chr7 (205-345)||(6543991-6544132)
chr7 (205-345)||(6533692-6533833)
chr7 (3-127)||(5382177-5382300)
chr7 (3-127)||(5391815-5391938)
chr7 (3-127)||(5926712-5926835)
chr7 (3-127)||(6534083-6534206)
chr7 (3-127)||(6544382-6544505)
chr7 (3-127)||(8500626-8500749)
chr7 (3-127)||(8511096-8511219)
chr7 (3-127)||(43983054-43983177)
chr7 (3-127)||(46496691-46496814)
chr7 (3-127)||(46507303-46507426)
chr7 (3-125)||(26348511-26348632)
chr7 (3-125)||(26363546-26363667)
chr7 (3-127)||(16132276-16132399)
chr7 (3-127)||(16142825-16142948)
chr7 (3-127)||(44896894-44897017)
chr7 (3-127)||(44907297-44907420)
chr7 (3-127)||(11626726-11626848)
chr7 (204-345)||(14114644-14114785)
chr7 (204-345)||(14424294-14424435)
chr7 (205-345)||(43982460-43982601)
chr7 (242-345)||(19799060-19799164)
chr7 (153-345)||(5382500-5382692)
chr7 (153-345)||(5392154-5392346)
chr7 (153-345)||(26363901-26364093)
chr7 (205-345)||(8500091-8500232)
chr7 (205-345)||(8510561-8510702)
chr7 (205-345)||(11627201-11627342)
chr7 (153-345)||(26348881-26349073)
chr7 (205-345)||(27987847-27987989)
chr7 (205-345)||(24541456-24541597)
chr7 (205-345)||(44896531-44896672)
chr7 (205-345)||(44906882-44907023)
chr7 (206-345)||(13286360-13286499)
chr7 (206-345)||(12827937-12828076)
chr7 (206-345)||(31824074-31824213)
chr7 (205-345)||(19585109-19585250)
chr7 (1-320)||(9006291-9006607)
chr7 (244-345)||(25441505-25441606)
chr7 (206-345)||(5616073-5616212)
chr7 (206-345)||(41026895-41027034)
chr7 (261-345)||(45552555-45552639)
chr7 (226-345)||(10414814-10414933)
chr7 (206-345)||(42594707-42594846)
chr7 (209-322)||(12769498-12769612)
chr7 (205-325)||(40701322-40701442)
chr7 (206-325)||(33090557-33090675)
chr7 (3-60)||(12769739-12769796)
chr7 (220-292)||(17220204-17220276)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (3-345)||(24922361-24922702)
chr6 (3-345)||(24931397-24931738)
chr6 (3-345)||(14790962-14791303)
chr6 (3-345)||(3285205-3285545)
chr6 (4-345)||(29539817-29540156)
chr6 (3-345)||(20911660-20911982)
chr6 (136-345)||(12454321-12454529)
chr6 (136-345)||(26425913-26426121)
chr6 (111-345)||(23777828-23778061)
chr6 (136-345)||(18159086-18159294)
chr6 (136-345)||(31356828-31357036)
chr6 (136-345)||(31366556-31366764)
chr6 (122-345)||(18200631-18200853)
chr6 (136-345)||(18168904-18169106)
chr6 (3-345)||(27787929-27788268)
chr6 (204-345)||(20926108-20926249)
chr6 (205-345)||(16907686-16907827)
chr6 (205-345)||(16897033-16897174)
chr6 (3-127)||(12454630-12454753)
chr6 (3-127)||(16897523-16897646)
chr6 (3-127)||(16908176-16908299)
chr6 (3-127)||(18159638-18159761)
chr6 (3-127)||(18169450-18169573)
chr6 (3-127)||(31357137-31357260)
chr6 (3-127)||(31366865-31366988)
chr6 (205-345)||(1595789-1595930)
chr6 (205-345)||(17823444-17823585)
chr6 (205-345)||(12991134-12991276)
chr6 (226-345)||(7756036-7756156)
chr6 (205-345)||(26021762-26021903)
chr6 (205-325)||(30658721-30658841)
chr6 (205-345)||(18712766-18712907)
chr6 (205-345)||(24505986-24506127)
chr6 (226-325)||(24370897-24370996)
chr6 (206-345)||(34764681-34764820)
chr6 (205-325)||(16320663-16320784)
chr6 (205-325)||(16922941-16923062)
chr6 (206-325)||(8563801-8563920)
chr6 (206-345)||(24692191-24692330)
chr6 (205-306)||(26161291-26161391)
chr6 (205-325)||(9762040-9762160)
chr6 (3-47)||(18200873-18200917)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (3-345)||(38958097-38958438)
chr2 (3-345)||(38930761-38931102)
chr2 (3-345)||(45014091-45014432)
chr2 (3-345)||(17488049-17488390)
chr2 (3-345)||(24696864-24697204)
chr2 (4-345)||(45024168-45024508)
chr2 (3-345)||(44639277-44639617)
chr2 (136-345)||(2999200-2999408)
chr2 (177-345)||(29131524-29131691)
chr2 (88-345)||(24239591-24239852)
chr2 (205-345)||(9503566-9503707)
chr2 (205-345)||(9514932-9515073)
chr2 (3-127)||(2998976-2999099)
chr2 (3-127)||(5337414-5337537)
chr2 (3-127)||(5347267-5347390)
chr2 (3-127)||(9503040-9503163)
chr2 (3-127)||(9514406-9514529)
chr2 (3-127)||(18650795-18650918)
chr2 (3-127)||(18662913-18663036)
chr2 (3-127)||(4457772-4457895)
chr2 (3-127)||(4467397-4467520)
chr2 (153-345)||(15940050-15940241)
chr2 (205-345)||(22688253-22688394)
chr2 (205-345)||(4457245-4457386)
chr2 (205-345)||(4466870-4467011)
chr2 (205-345)||(5337947-5338088)
chr2 (205-345)||(5347843-5347984)
chr2 (205-345)||(16934859-16935000)
chr2 (205-345)||(17005519-17005660)
chr2 (205-345)||(32937981-32938122)
chr2 (206-342)||(15479323-15479459)
chr2 (205-345)||(4456181-4456322)
chr2 (205-345)||(18662446-18662587)
chr2 (153-345)||(18660705-18660897)
chr2 (205-345)||(3606492-3606632)
chr2 (205-311)||(12569952-12570059)
chr2 (207-345)||(573593-573732)
chr2 (271-345)||(28460989-28461063)
chr2 (206-345)||(22901437-22901576)
chr2 (205-345)||(18650376-18650517)
chr2 (244-345)||(27160547-27160648)
chr2 (244-345)||(27170916-27171017)
chr2 (206-345)||(22909363-22909502)
chr2 (261-345)||(45190121-45190205)
chr2 (206-345)||(23721293-23721432)
chr2 (205-292)||(45190235-45190323)
chr2 (4-143)||(72496-72633)
chr2 (205-325)||(40409606-40409725)
chr2 (206-325)||(16135701-16135820)
chr2 (94-185)||(28460903-28460990)
chr2 (206-345)||(19341649-19341785)
chr2 (183-249)||(72654-72719)
chr2 (3-47)||(24239519-24239564)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (3-345)||(27411507-27411848)
chr5 (3-345)||(32069799-32070140)
chr5 (136-345)||(26192704-26192912)
chr5 (136-345)||(26203264-26203472)
chr5 (136-345)||(11411665-11411873)
chr5 (133-345)||(22240371-22240582)
chr5 (205-345)||(33938433-33938573)
chr5 (205-345)||(33948833-33948973)
chr5 (205-345)||(8766278-8766419)
chr5 (4-345)||(23378945-23379288)
chr5 (3-127)||(18360854-18360977)
chr5 (3-127)||(18389811-18389934)
chr5 (3-127)||(21753020-21753143)
chr5 (3-127)||(21762307-21762430)
chr5 (3-127)||(33938894-33939017)
chr5 (3-127)||(33949294-33949417)
chr5 (3-127)||(8765726-8765849)
chr5 (207-345)||(20905318-20905456)
chr5 (3-127)||(11411469-11411592)
chr5 (3-127)||(26192362-26192485)
chr5 (3-127)||(26202966-26203089)
chr5 (156-345)||(20896285-20896473)
chr5 (3-130)||(22244288-22244414)
chr5 (205-345)||(20763693-20763834)
chr5 (205-345)||(21680872-21681013)
chr5 (205-345)||(21752400-21752541)
chr5 (205-345)||(21761823-21761964)
chr5 (205-345)||(22174083-22174224)
chr5 (205-345)||(27274962-27275103)
chr5 (205-345)||(37816912-37817053)
chr5 (153-345)||(18360431-18360623)
chr5 (153-345)||(18389431-18389623)
chr5 (205-345)||(13572493-13572634)
chr5 (205-325)||(18210656-18210777)
chr5 (205-345)||(30944627-30944768)
chr5 (205-345)||(30954049-30954190)
chr5 (205-345)||(31916145-31916286)
chr5 (205-345)||(37549402-37549543)
chr5 (205-345)||(37652200-37652341)
chr5 (205-306)||(206260-206362)
chr5 (205-345)||(4038761-4038902)
chr5 (205-325)||(18220006-18220127)
chr5 (205-345)||(19889123-19889264)
chr5 (205-345)||(37299612-37299753)
chr5 (205-345)||(42091301-42091444)
chr5 (206-345)||(20947145-20947284)
chr5 (206-345)||(20957534-20957673)
chr5 (4-278)||(31104835-31105111)
chr5 (206-345)||(19549047-19549187)
chr5 (3-128)||(21484395-21484518)
chr5 (245-345)||(34131268-34131369)
chr5 (350-398)||(29023876-29023924)
chr5 (4-47)||(20896585-20896628)
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (3-345)||(16252772-16253112)
chr4 (3-345)||(17985233-17985574)
chr4 (3-345)||(15668547-15668887)
chr4 (4-345)||(26330585-26330924)
chr4 (3-345)||(52498490-52498831)
chr4 (3-345)||(17160598-17160938)
chr4 (144-345)||(18106016-18106216)
chr4 (136-345)||(40921052-40921260)
chr4 (4-345)||(9836429-9836748)
chr4 (8-345)||(6406196-6406530)
chr4 (4-325)||(13403406-13403705)
chr4 (4-345)||(1292712-1293055)
chr4 (205-345)||(16248411-16248552)
chr4 (148-326)||(11476467-11476644)
chr4 (205-345)||(6691342-6691483)
chr4 (205-345)||(6701748-6701889)
chr4 (3-127)||(18105785-18105908)
chr4 (3-127)||(21845680-21845803)
chr4 (3-127)||(21855272-21855395)
chr4 (3-127)||(21901543-21901666)
chr4 (3-127)||(21911135-21911258)
chr4 (3-127)||(40921420-40921543)
chr4 (3-127)||(3487991-3488114)
chr4 (3-127)||(5293457-5293580)
chr4 (3-127)||(5303116-5303239)
chr4 (3-127)||(6691795-6691918)
chr4 (3-127)||(6702201-6702324)
chr4 (3-127)||(27681120-27681243)
chr4 (3-127)||(27690775-27690898)
chr4 (3-127)||(3497314-3497437)
chr4 (205-345)||(16472004-16472144)
chr4 (205-345)||(44888101-44888241)
chr4 (205-345)||(2828905-2829046)
chr4 (3-127)||(16249023-16249146)
chr4 (205-345)||(3488494-3488635)
chr4 (205-345)||(5294002-5294143)
chr4 (205-345)||(5303616-5303757)
chr4 (205-345)||(7847338-7847479)
chr4 (205-345)||(21845320-21845461)
chr4 (205-345)||(21854749-21854890)
chr4 (205-345)||(21901183-21901324)
chr4 (205-345)||(21910612-21910753)
chr4 (205-345)||(27681664-27681805)
chr4 (205-345)||(27691275-27691416)
chr4 (205-345)||(16628865-16629007)
chr4 (205-345)||(3497761-3497902)
chr4 (205-345)||(17829141-17829282)
chr4 (205-345)||(17838532-17838673)
chr4 (205-345)||(12865692-12865833)
chr4 (4-345)||(14601072-14601403)
chr4 (205-345)||(3606607-3606748)
chr4 (3-69)||(16241695-16241761)
chr4 (206-345)||(522795-522934)
chr4 (206-345)||(26457700-26457839)
chr4 (206-325)||(17421899-17422017)
chr4 (133-288)||(4417117-4417271)
chr4 (306-345)||(16241656-16241695)
chr4 (205-249)||(16211756-16211800)
chr4 (3-50)||(53946668-53946714)
chr4 (256-345)||(40883842-40883931)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (3-345)||(16154242-16154583)
chr1 (3-345)||(25018828-25019168)
chr1 (3-345)||(2115360-2115700)
chr1 (3-345)||(21885673-21886013)
chr1 (3-345)||(30549966-30550306)
chr1 (3-345)||(42033551-42033891)
chr1 (21-345)||(22406646-22406969)
chr1 (3-345)||(8539610-8539950)
chr1 (3-345)||(8604849-8605189)
chr1 (3-345)||(13964256-13964595)
chr1 (6-345)||(2370771-2371108)
chr1 (13-345)||(41544512-41544823)
chr1 (3-345)||(1968704-1969037)
chr1 (136-345)||(21457896-21458104)
chr1 (6-287)||(18382780-18383058)
chr1 (4-345)||(1186781-1187119)
chr1 (3-345)||(34822382-34822725)
chr1 (3-127)||(21458205-21458328)
chr1 (205-345)||(22960239-22960379)
chr1 (208-345)||(21782055-21782192)
chr1 (207-345)||(21822023-21822161)
chr1 (205-325)||(18097507-18097627)
chr1 (205-345)||(25867612-25867753)
chr1 (205-345)||(26194013-26194154)
chr1 (205-345)||(37011371-37011511)
chr1 (204-345)||(20311646-20311788)
chr1 (205-345)||(20328953-20329094)
chr1 (205-345)||(27065433-27065574)
chr1 (204-345)||(20308167-20308309)
chr1 (206-345)||(1975282-1975421)
chr1 (205-345)||(12418196-12418337)
chr1 (206-345)||(1982648-1982787)
chr1 (206-345)||(1990066-1990205)
chr1 (4-249)||(18062582-18062829)
chr1 (206-324)||(41207882-41208000)
chr1 (261-345)||(4950380-4950464)
chr1 (283-345)||(18381444-18381506)
chr1 (7-145)||(22956116-22956252)
chr1 (212-325)||(50940539-50940651)
chr1 (235-345)||(2371559-2371669)
chr1 (212-325)||(2653041-2653154)
chr1 (12-48)||(18097324-18097360)
chr1 (3-47)||(21782346-21782390)
chr1 (220-324)||(13404219-13404321)
chr1 (3-47)||(25823833-25823877)
chr1 (205-249)||(49332786-49332830)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (3-346)||(7729-8070)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (3-345)||(19744-20084)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (3-345)||(93221-93561)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (3-345)||(4579-4919)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (3-345)||(75086-75426)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (3-345)||(15208-15548)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (3-345)||(791096-791436)
chr8 (3-345)||(17268201-17268541)
chr8 (4-306)||(7757162-7757462)
chr8 (136-345)||(21988511-21988719)
chr8 (136-345)||(21998029-21998237)
chr8 (177-345)||(25034656-25034823)
chr8 (5-345)||(20098174-20098511)
chr8 (204-345)||(21446789-21446930)
chr8 (1-325)||(2690648-2690976)
chr8 (205-345)||(9325823-9325964)
chr8 (205-345)||(21203656-21203797)
chr8 (205-345)||(21214072-21214213)
chr8 (205-345)||(21333302-21333443)
chr8 (3-127)||(9325395-9325518)
chr8 (3-127)||(21203173-21203296)
chr8 (3-127)||(21213589-21213712)
chr8 (3-127)||(21333875-21333998)
chr8 (3-127)||(21988299-21988422)
chr8 (3-127)||(21997833-21997956)
chr8 (205-345)||(5758736-5758877)
chr8 (205-345)||(20531904-20532045)
chr8 (205-345)||(14894694-14894835)
chr8 (205-345)||(25506834-25506975)
chr8 (205-345)||(32008381-32008522)
chr8 (204-345)||(5867954-5868095)
chr8 (205-345)||(13673515-13673656)
chr8 (205-345)||(14882328-14882469)
chr8 (205-345)||(31992013-31992154)
chr8 (226-345)||(3967353-3967473)
chr8 (206-345)||(26362918-26363057)
chr8 (205-345)||(33774704-33774845)
chr8 (205-325)||(12842073-12842192)
chr8 (226-325)||(14436746-14436845)
chr8 (206-325)||(37295334-37295453)
chr8 (205-345)||(20707507-20707647)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (136-345)||(52325-52533)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (136-345)||(87324-87534)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (136-345)||(12734-12942)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (5-345)||(65048-65384)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (5-345)||(29130-29472)
[»] scaffold1705 (2 HSPs)
scaffold1705 (3-130)||(423-549)
scaffold1705 (205-325)||(16-137)
[»] scaffold0254 (2 HSPs)
scaffold0254 (205-345)||(8646-8787)
scaffold0254 (3-127)||(8211-8334)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (226-345)||(22143-22263)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (4-345)||(13177-13520)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (240-345)||(132352-132457)
[»] scaffold0014 (6 HSPs)
scaffold0014 (3-127)||(234357-234480)
scaffold0014 (205-345)||(234978-235119)
scaffold0014 (205-325)||(146081-146202)
scaffold0014 (133-345)||(167477-167688)
scaffold0014 (205-345)||(115094-115235)
scaffold0014 (205-345)||(154087-154228)
[»] scaffold0234 (3 HSPs)
scaffold0234 (240-345)||(22915-23020)
scaffold0234 (3-92)||(21524-21612)
scaffold0234 (177-239)||(21612-21673)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (207-345)||(10648-10786)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (7-345)||(199064-199390)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (205-345)||(112362-112503)
scaffold0031 (261-345)||(103163-103247)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (205-345)||(1437-1579)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (205-325)||(33438-33559)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (205-345)||(67106-67247)
scaffold0058 (205-345)||(58863-59004)
scaffold0058 (205-345)||(24372-24513)
scaffold0058 (205-345)||(57745-57886)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (205-345)||(53980-54121)
scaffold0018 (205-345)||(57932-58073)
[»] scaffold0590 (1 HSPs)
scaffold0590 (205-345)||(9630-9771)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (205-325)||(12455-12576)
[»] scaffold0809 (1 HSPs)
scaffold0809 (226-345)||(273-393)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (206-325)||(267494-267613)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (228-311)||(22754-22838)
[»] scaffold0764 (1 HSPs)
scaffold0764 (206-345)||(1377-1516)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (206-345)||(5093-5232)
scaffold0313 (206-345)||(19250-19389)
[»] scaffold1411 (1 HSPs)
scaffold1411 (205-345)||(207-349)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (3-73)||(56192-56262)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (205-345)||(18094-18235)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (3-249)||(1196-1431)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (226-345)||(13893-14012)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (208-345)||(41171-41309)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (270-345)||(396616-396691)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (4-73)||(15011-15080)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (221-273)||(28954-29006)
[»] scaffold1468 (1 HSPs)
scaffold1468 (205-249)||(767-811)


Alignment Details
Target: scaffold0005 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 310387 - 310727
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  310387 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 310486  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  310487 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagcttgaacattctgatcttcaagcaacattctgatctaacattctgacctcagtgttagatcatgaattc 310586  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  310587 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgt-ttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 310684  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  310685 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 310727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 216306 - 215975
Alignment:
Q  4 ctttattgctt-gattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |   ||| |||||  || ||||||||  ||| ||| || |||||||||| ||||    
T  216306 ctttattgctttgattgatccatgcaaacgtacttttctggacatttgttcatatcacaaatgacttgcatgttctt-gat-aatgttcttgagattctt 216209  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcg-----agcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatg 197  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  |      ||||| ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||     
T  216208 gacttgtataagaacaaccttctgacctctacttgaacattctgatcaactcactaagcaatattatgaactaactttctgacctcagagttagttcata 216109  T
Q  198 atttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatt 297  Q
    |   |||| |||||||||||||||||| ||||||||             |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  216108 aaaccaaa-tgtcctttgatttcttgaatcttggta-------------gttcatgtcttagtaaaatactcaagagcacaagttaaatacctaggaatt 216023  T
Q  298 aatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||    
T  216022 aatcaaagttcattaattccttaatcattaaggtgtattatctttaaa 215975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6422002 - 6421661
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6422002 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgtcttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 6421903  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6421902 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattctgacctcagtgttagatcatgaattc 6421803  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421802 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctatcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 6421704  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6421703 aagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 6421661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6432442 - 6432101
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6432442 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 6432343  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6432342 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattctgacctcagtgttagatcatgaattc 6432243  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  6432242 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagctgaataccaagaaattaatca 6432144  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6432143 aagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 6432101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 16335809 - 16336150
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16335809 cctttattgcttgattgattcatgcaaatgtactttccaggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 16335908  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  16335909 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattctgacctcagtgttagatcatgaattc 16336008  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16336009 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaatagcacaagttaaataccaaggaattaatca 16336107  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16336108 aagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 16336150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 10012595 - 10012935
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10012595 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcacatgtcacatgtgtcgtgcatgacctt-gatcaaagttcttgagactctt 10012693  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  10012694 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcaagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 10012793  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10012794 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaacattgttcctgtcttagtaaaacactcaagagtacaagttaaataccaaggaattaatca 10012892  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10012893 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 10012935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25432559 - 25432219
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25432559 cctttattgcttgattaatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgcattgcatgacctt-gatcaaagttcttgagattctt 25432461  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  25432460 ggcttgtataagaacaaccttctgatctatgcttgaacattctgatattcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 25432361  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25432360 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 25432262  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25432261 aagtccattaattctataatcatatttgtttattatctttaaa 25432219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Original strand, 12365 - 12695
Alignment:
Q  13 ttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttggcttgttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12365 ttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgtcttgcatgatctt-gatcaaagttcttgagactctcggcttgtata 12463  T
Q  113 agaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcct 212  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12464 agaacaacattctgatctctgcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttttgaccttagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcct 12562  T
Q  213 ttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatta 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12563 ttgatttcttgatttttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatta 12662  T
Q  313 attctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12663 attctttaatcatatttgtttattatctttaaa 12695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 4 - 345
Target Start/End: Original strand, 55478412 - 55478751
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  55478412 ctttattgcttgattgatccatgcaaaagtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacctt-gatcaaagttcttgagattcttg 55478510  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttca 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  55478511 gcttgtataagaacaaccttctgatctatgcttgaacattctgatattcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattca 55478610  T
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55478611 aa-tgtcctttgatttcttgaatcttggtatgatttaaaccttgttcccgtcttagtaaaacactcaatagcacaagttaaataccaagaaattaatcaa 55478709  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55478710 agtccattaattctctaatcatattggtttattatctttaaa 55478751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20491752 - 20491414
Alignment:
Q  5 tttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttgg 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20491752 tttattgctagattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacctt-gatcaaagttcttgagattcttgg 20491654  T
Q  105 cttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaa 204  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20491653 cttatataagaacaaccttctaatctatgcttgaacattctaatataagagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaa 20491554  T
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20491553 a-tgtcctttgatttattgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 20491455  T
Q  305 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20491454 gcccattaattctttaatcatattggttcattatctttaaa 20491414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 4024760 - 4025099
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  4024760 cctttattgcttgattgatccatgtaaatctactttcctgaacatatatcaatgtcacatgtgccttgcatgaactt-gatcaatgttcttgagattctt 4024858  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4024859 gttttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattatgatcttcgagcaacattctgatctaac-tttcgacctcagtgttagatcatgaattc 4024957  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4024958 aaa-tgtcctttaatttcttgattcttggtatgatttaaacattgttccagtcttagtaaaacactcaagagcagaagttaaataccaatgaattaatca 4025056  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4025057 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 4025099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8982890 - 8982682
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8982890 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 8982792  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8982791 atttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 8982692  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  8982691 tatctttaaa 8982682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Original strand, 1685815 - 1686023
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1685815 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 1685913  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1685914 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 1686013  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  1686014 tatctttaaa 1686023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8972307 - 8972099
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8972307 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 8972209  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8972208 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 8972109  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  8972108 tatctttaaa 8972099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 143 - 345
Target Start/End: Original strand, 12804794 - 12804995
Alignment:
Q  143 tctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12804794 tctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaa 12804892  T
Q  243 ccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatcttt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12804893 ccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatcttt 12804992  T
Q  343 aaa 345  Q
    |||    
T  12804993 aaa 12804995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8972546 - 8972423
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  8972546 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 8972448  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  8972447 ggcttgtataagaacaaccttctga 8972423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8983101 - 8982978
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  8983101 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 8983003  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  8983002 ggcttgtataagaacaaccttctga 8982978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 9536835 - 9536712
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  9536835 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 9536737  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  9536736 ggcttgtataagaacaaccttctga 9536712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 9547161 - 9547038
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  9547161 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 9547063  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  9547062 ggcttgtataagaacaaccttctga 9547038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 1685619 - 1685742
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||    
T  1685619 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgcgattctt 1685717  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  1685718 ggcttgtataagaacaaccttctga 1685742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4371077 - 4370954
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4371077 cctttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 4370979  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  4370978 ggcttgtataagaacaaccttctga 4370954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4380796 - 4380673
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4380796 cctttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 4380698  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  4380697 ggcttgtataagaacaaccttctga 4380673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 5655994 - 5656113
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5655994 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 5656092  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaacctt 123  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  5656093 ggcttgtataagaacaacctt 5656113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17732393 - 17732274
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  17732393 atgtcctttgatttcttatttcttggtatgaattaaaccttgttcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaaacaaag 17732294  T
Q  306 tccattaattctttaatcat 325  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  17732293 tccattaattccttaatcat 17732274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19033624 - 19033505
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  19033624 atgtcctttgatttcttatttcttggtatgaattaaaccttgttcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaaacaaag 19033525  T
Q  306 tccattaattctttaatcat 325  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  19033524 tccattaattccttaatcat 19033505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 2490167 - 2490308
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2490167 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 2490266  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  2490267 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 2490308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 4783588 - 4783729
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4783588 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 4783687  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  4783688 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 4783729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4370502 - 4370364
Alignment:
Q  208 gtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagt 306  Q
    ||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4370502 gtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagt 4370403  T
Q  307 ccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  4370402 ccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 4370364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4380248 - 4380110
Alignment:
Q  208 gtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagt 306  Q
    ||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4380248 gtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagt 4380149  T
Q  307 ccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  4380148 ccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 4380110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 5656459 - 5656600
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5656459 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5656558  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  5656559 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 5656600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9536402 - 9536261
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9536402 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 9536303  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  9536302 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 9536261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9546824 - 9546683
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9546824 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 9546725  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  9546724 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 9546683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 19828851 - 19828992
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19828851 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacacttaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 19828950  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  19828951 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 19828992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20292629 - 20292488
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20292629 aatgtcctttgatttcatgcatcttagtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 20292530  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||| ||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  20292529 agtctatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 20292488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 51979338 - 51979477
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51979338 aatgtcctttgatt-cttgtatcttggtattatttaaacattgttcctgtcttagtaaaacattcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaaa 51979436  T
Q  305 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  51979437 gtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 51979477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18560418 - 18560276
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaa-ttaatca 302  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18560418 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatttaatca 18560319  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  18560318 aagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 18560276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 13120546 - 13120687
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13120546 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcttgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 13120645  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    | |||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  13120646 aatccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 13120687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 20745640 - 20745781
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20745640 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagatcacaagttaaataccaaggaattaatgaa 20745739  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  20745740 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 20745781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 49387932 - 49388071
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  49387932 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 49388031  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  49388032 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 49388071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 13113417 - 13113559
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cac-tcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13113417 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcttgtcttagtaaaaacacctcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 13113516  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    || |||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  13113517 aaatccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 13113559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 24873836 - 24873975
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24873836 atgtcctttgattctttgtatcttggtataaattgaaacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 24873935  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||  || | |||  ||||| |||||||||||    
T  24873936 tccattaattccctattaataaaggtttgttatctttaaa 24873975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11459524 - 11459426
Alignment:
Q  226 tcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcat 325  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11459524 tcttgatatgatttaaacattgttcctctcttacttaaacactcaa-agcacaagttaaatatcaagaaattaatcaaagtccattaattccttaatcat 11459426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24792941 - 24792822
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  24792941 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgtttctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaat 24792842  T
Q  306 tccattaattctttaatcat 325  Q
    | ||||||||| ||||||||    
T  24792841 ttcattaattccttaatcat 24792822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24763034 - 24762893
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||| |||| | ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24763034 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaacattgtttctgtctgagtaaaaacattcaaaagcgcaagttaaataccaaagaattaatcaa 24762935  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||| |||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  24762934 agttcatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 24762893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Original strand, 10508530 - 10508668
Alignment:
Q  8 attgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttggctt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||| ||| |  ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  10508530 attgcttgattgatccatgaaaatgtacttttctggacatttattcatgtcacgtgtgacttgaatg-ctcttgat-aatgttcttgaaactcttggctt 10508627  T
Q  108 gtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgat 148  Q
    || |||  |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  10508628 gtgtaaagacaaccttctgaactctgcttgaacattatgat 10508668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 319
Target Start/End: Original strand, 11044776 - 11044872
Alignment:
Q  223 gattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattcttt 319  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  11044776 gattcttggtttgatttatactttgtttatgttttagttaaacactcaagaacacaaattagataccaagaaactaatcaaaattcattaattcttt 11044872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 325
Target Start/End: Original strand, 21542838 - 21542954
Alignment:
Q  209 tcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtcc 308  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| |||||||| || |||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||   | || |||| ||||| |    
T  21542838 tcctttaattgcttgcttcttggaatgatttatactttgtttatgtcttagttaaacactcaagaatacaaattaaatacagtgaaactaattaaagttc 21542937  T
Q  309 attaattctttaatcat 325  Q
    |||||| ||||||||||    
T  21542938 attaatcctttaatcat 21542954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 9545885 - 9546226
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9545885 cctttatttcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 9545984  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  9545985 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcaagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 9546084  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9546085 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 9546183  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9546184 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 9546226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 9535602 - 9535943
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9535602 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactatt 9535701  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  9535702 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcaagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 9535801  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9535802 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaacattgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaagaattaatca 9535900  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535901 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 9535943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32098080 - 32097739
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32098080 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacgtatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 32097981  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  32097980 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcaagcaacgttgtgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaaatc 32097881  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097880 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 32097782  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097781 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 32097739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32108517 - 32108176
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32108517 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacgtatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 32108418  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  32108417 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcaagcaacgttgtgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaaatc 32108318  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32108317 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgtttctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 32108219  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32108218 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 32108176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42620879 - 42620539
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  42620879 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattctcatgtcacatgtgccttgcatgatctt-gatcaaagttcttgagactctt 42620781  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  42620780 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttctagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 42620681  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  42620680 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacacttaagagcacagattaaataccaaagaattaatca 42620582  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42620581 aagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 42620539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 40 - 345
Target Start/End: Original strand, 22964652 - 22964955
Alignment:
Q  40 ctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22964652 ctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgatctt-gatcaaagttcttgagactcttggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaa 22964750  T
Q  140 cattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22964751 cattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttgctatgattt 22964849  T
Q  240 aaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatc 339  Q
    |||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  22964850 aaactttgtttctgtctaagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaagaattaatcaaagtccattaattttctaatcatattgatttattatc 22964949  T
Q  340 tttaaa 345  Q
    ||||||    
T  22964950 tttaaa 22964955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14944007 - 14943670
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  14944007 cctttattgcttaattgatccatgcaaatgtactttcctggacagatatccatgtcacatgtgccttgcatgacctt-gatcaatgttcttgagattctt 14943909  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||| ||| || ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||| |||| |||||||| ||     
T  14943908 ggcctgtataggaaaaaccttccgatctctgcttgaacattctgatctctgagcaacattctgatctatctttctgacctcaatgttcgatcatgaattg 14943809  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14943808 aaa-tgtcctttaatttcttgattcttagtatgatttaaacctt---cctgtcttactataacactcaagagcacaagttaaatacaaaggaaataatca 14943713  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14943712 aagtccattaattctttaatcatatcggtctattatctttaaa 14943670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15371600 - 15371263
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  15371600 cctttattgcttaattgatccatgcaaatgtactttcctggacaaatatacatgtcacatgtgccttgcatgacctt-gatcaatgttcttgagattctt 15371502  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||| ||| || ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||| |||| |||||||| ||     
T  15371501 ggcctgtataggaaaaaccttccgatctctgcttgaacattctgatctctgagcaacattctgatctatctttctgacctcaatgttcgatcatgaattg 15371402  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15371401 aaa-tgtcctttaatttcttgattcttagtatgatttaaacctt---cctgtcttactataacactcaagagcacaagttaaatacaaaggaaataatca 15371306  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15371305 aagtccattaattctttaatcatatcggtctattatctttaaa 15371263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Original strand, 16132556 - 16132764
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16132556 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 16132654  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16132655 attcaaaccttgttcctgtcttaataaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttat 16132754  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  16132755 tatctttaaa 16132764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Original strand, 16143120 - 16143328
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16143120 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 16143218  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16143219 attcaaaccttgttcctgtcttaataaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttat 16143318  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  16143319 tatctttaaa 16143328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 46496459 - 46496251
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46496459 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgaccttagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 46496361  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46496360 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttat 46496261  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  46496260 tatctttaaa 46496251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 46507071 - 46506863
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46507071 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgaccttagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 46506973  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46506972 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttat 46506873  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  46506872 tatctttaaa 46506863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 2992278 - 2992617
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||  |||||||| |||||||||||| ||  ||||| || |||||||||  |||     
T  2992278 cctttattgcttgattgatccatgcaagtttactttcctgcgcatttattcatgtcacgtgtgccttgcat-actcttgat-aatgttcttgagtttctg 2992375  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    | ||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||| |||||| |||    
T  2992376 gacttgtataagaacaacattctgaactctgcttgaacattctgatctctgcgcaacattctgaactaactttctgacctcatagttagttcatgaattc 2992475  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | |||| |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2992476 aaa-tgtcctttgatttcttgaatcttgatatgatttgaaacatgtttctgtcttagttaaaccctcaagagaacaagttaactaccaagaaattaatca 2992574  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2992575 aagtccattaattctttaatcataaaggtttattatctttaaa 2992617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 341
Target Start/End: Original strand, 14248902 - 14249238
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   || |||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||     
T  14248902 cctttatttcttgattgatccatgcaaatgtactttcttggacatttattaatttcacgtgtgccttgcatgatctt-gatcaatgttcttgagtttctg 14249000  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||| | |||||| | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| | ||| |||||| |||    
T  14249001 ggcttatataagaatagccttctgaactctgcttgaacattcttatctcttagcaacattctgaactaacttcctgaactcagagatagttcatgaattc 14249100  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14249101 aaa-tatcctttgatttcttgtatcttggaatgatttaatctttgttcctttcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccgagacattaatca 14249199  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctt 341  Q
     ||| |||||||||||||| ||||  |||| ||||||||    
T  14249200 tagttcattaattctttaagcataaaggttcattatctt 14249238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5926182 - 5926041
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926182 aatgtcctttgattttatgcatctttgtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5926083  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5926082 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 5926041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6544132 - 6543991
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6544132 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaa 6544033  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6544032 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 6543991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6533833 - 6533692
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6533833 aatgtcctttgattttatgcatctttgtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaa 6533734  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6533733 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 6533692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 5382177 - 5382300
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5382177 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 5382275  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  5382276 ggcttgtataagaacaaccttctga 5382300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 5391815 - 5391938
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5391815 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 5391913  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  5391914 ggcttgtataagaacaaccttctga 5391938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5926835 - 5926712
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5926835 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 5926737  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  5926736 ggcttgtataagaacaaccttctga 5926712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6534206 - 6534083
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6534206 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 6534108  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  6534107 ggcttgtataagaacaaccttctga 6534083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6544505 - 6544382
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6544505 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 6544407  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  6544406 ggcttgtataagaacaaccttctga 6544382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8500749 - 8500626
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  8500749 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 8500651  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  8500650 ggcttgtataagaacaaccttctga 8500626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8511219 - 8511096
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  8511219 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 8511121  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  8511120 ggcttgtataagaacaaccttctga 8511096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 43983177 - 43983054
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  43983177 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 43983079  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  43983078 ggcttgtataagaacaaccttctga 43983054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 46496814 - 46496691
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  46496814 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 46496716  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  46496715 ggcttgtataagaacaaccttctga 46496691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 46507426 - 46507303
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  46507426 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 46507328  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  46507327 ggcttgtataagaacaaccttctga 46507303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Original strand, 26348511 - 26348632
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  26348511 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 26348609  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttct 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  26348610 ggcttgtataagaacaaccttct 26348632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Original strand, 26363546 - 26363667
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  26363546 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 26363644  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttct 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  26363645 ggcttgtataagaacaaccttct 26363667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 16132276 - 16132399
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  16132276 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 16132374  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  16132375 ggcttgtataagaacaaccttctga 16132399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 16142825 - 16142948
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  16142825 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 16142923  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  16142924 ggcttgtataagaacaaccttctga 16142948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 44897017 - 44896894
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  44897017 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgaccacagttcttgagattctt 44896919  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  44896918 ggcttgtataagaacaaccttctga 44896894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 44907420 - 44907297
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  44907420 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgaccacagttcttgagattctt 44907322  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  44907321 ggcttgtataagaacaaccttctga 44907297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 11626726 - 11626848
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  11626726 cctttattgcttgattgatc-atgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 11626823  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  11626824 ggcttgtataagaacaaccttctga 11626848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 204 - 345
Target Start/End: Original strand, 14114644 - 14114785
Alignment:
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    ||||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14114644 aaatgtcctttgaatttttgtatcttggtatgacttaaactttgctcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccaagaaattaatcaa 14114743  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  14114744 agtccattaattcgttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 14114785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 204 - 345
Target Start/End: Original strand, 14424294 - 14424435
Alignment:
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    ||||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14424294 aaatgtcctttgaatttttgtatcttggtatgacttaaactttgctcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccaagaaattaatcaa 14424393  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  14424394 agtccattaattcgttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 14424435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43982601 - 43982460
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43982601 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 43982502  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  43982501 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 43982460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19799164 - 19799060
Alignment:
Q  242 accttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatct 340  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  19799164 accttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttattctttaatcatttttgtttattatct 19799065  T
Q  341 ttaaa 345  Q
    |||||    
T  19799064 ttaaa 19799060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 5382500 - 5382692
Alignment:
Q  153 gagcaacattctgatctaacattttgacct-cagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || |||  |||| |||||  |||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  5382500 gagcaacattctgatctaactttctgaacttcagaattagttcatggattcaa--tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcc 5382597  T
Q  252 tgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  5382598 tgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 5382692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 5392154 - 5392346
Alignment:
Q  153 gagcaacattctgatctaacattttgacct-cagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || |||  |||| |||||  |||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  5392154 gagcaacattctgatctaactttctgaacttcagaattagttcatggattcaa--tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcc 5392251  T
Q  252 tgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  5392252 tgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 5392346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 26363901 - 26364093
Alignment:
Q  153 gagcaacattctgatctaacattttgacct-cagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || |||  |||| |||||  |||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  26363901 gagcaacattctgatctaactttctgaacttcagaattagttcatggattcaa--tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcc 26363998  T
Q  252 tgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  26363999 tgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 26364093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8500232 - 8500091
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8500232 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 8500133  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  8500132 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 8500091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8510702 - 8510561
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8510702 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 8510603  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  8510602 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 8510561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 11627201 - 11627342
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11627201 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 11627300  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  11627301 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 11627342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 26348881 - 26349073
Alignment:
Q  153 gagcaacattctgatctaacattttgacct-cagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || |||  |||| |||||  |||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||||| |    
T  26348881 gagcaacattctgatctaactttctgaacttcagaattagttcatggattcaa--tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgtttc 26348978  T
Q  252 tgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  26348979 tgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 26349073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27987989 - 27987847
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27987989 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctatcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 27987890  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatat-tggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || |||||||| |   ||||||||||||||||    
T  27987889 agtccatttaatccttaatcatttaaagtttattatctttaaa 27987847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 24541456 - 24541597
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24541456 aatgtcctttgattttatgcatcttggtaagattcaaaccttgtttctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 24541555  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  24541556 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 24541597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44896672 - 44896531
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44896672 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagaacacaagttaaataccaaggaattaatcaa 44896573  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  44896572 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 44896531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44907023 - 44906882
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44907023 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagaacacaagttaaataccaaggaattaatcaa 44906924  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  44906923 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 44906882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 13286360 - 13286499
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13286360 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaagaaattaatcaaag 13286459  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    | ||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  13286460 ttcattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 13286499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 12827937 - 12828076
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12827937 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 12828036  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    | |||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  12828037 tgcattaattctttcatcatcaaggtttgttatctttaaa 12828076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31824213 - 31824074
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31824213 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 31824114  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    || |||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  31824113 tctattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 31824074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19585250 - 19585109
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||| ||||||||  ||  |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19585250 aatgtcatttgattttatgcatcttagtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaatactaaggaattaatcaa 19585151  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    | |||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  19585150 aatccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 19585109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9006607 - 9006291
Alignment:
Q  1 tacctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||  |||||||  ||| |||||||||  | ||||| || |||||||||| ||    
T  9006607 tacctttattgcttgattgatccatgccaatgtactttaatggacatttattcatgtcatgtgtaccttgcatgttc-ttgat-aatgttcttgagattc 9006510  T
Q  101 ttggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatc-----ttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatca 195  Q
    | ||||| | ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||     || |||||||||||| | ||||| || ||| ||||   |||| |||    
T  9006509 tgggcttttataagaacaatcttctgaactctgcttgaacattctgatcaactttttgagcaacattctaaactaactttctgaactcaaacttagttca 9006410  T
Q  196 tgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaa 295  Q
    | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||  ||| || || || ||||||||| | |||   |||||||||| ||    
T  9006409 ttaattc-aaatatcctttgatttcttgtatcttggtatgatttgaactttgtttttgtcttcgttaatcactcaagaacgcaa---aaataccaagaaa 9006314  T
Q  296 ttaatcaaagtccattaattcttta 320  Q
    |  |||||||| ||||||| |||||    
T  9006313 t--atcaaagtgcattaatccttta 9006291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25441606 - 25441505
Alignment:
Q  244 cttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatcttta 343  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||    
T  25441606 cttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaaggtttgttatcttta 25441507  T
Q  344 aa 345  Q
    ||    
T  25441506 aa 25441505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 5616073 - 5616212
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||| | || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  5616073 atgtcctttgattctttgtatcttggtattaatttatacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaat 5616172  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  5616173 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 5616212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41027034 - 41026895
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||||||  | || ||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41027034 atgtcctttgattctttgtgtcttggtatgaagtgaaactttttcctgtctcagtgaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 41026935  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  41026934 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 41026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 45552639 - 45552555
Alignment:
Q  261 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  45552639 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 45552555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10414933 - 10414814
Alignment:
Q  226 tcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcat 325  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | || ||||||||    
T  10414933 tcttggtattattcaaaccttgtttcgatcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaaataatcaaagtccatttaatccttaatcat 10414834  T
Q  326 attggtttattatctttaaa 345  Q
        ||||||||||||||||    
T  10414833 taaagtttattatctttaaa 10414814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42594846 - 42594707
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||| | || || ||||||||| | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42594846 atgtcctttgattctttgtatcttggtataaattgaaacttgttcctttcttagttaaccactcaagaacacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 42594747  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   | ||| |||||||||||    
T  42594746 tccattaattccttaatcatcaagttttgttatctttaaa 42594707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12769612 - 12769498
Alignment:
Q  209 tcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtc 307  Q
    |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||    
T  12769612 tcctttgatttcttgtatgttggtgtgatttaaaccttgtttctgtcttagtaaaaagactcaagagtacaagttaaataccaagaaaacaattaaagtc 12769513  T
Q  308 cattaattctttaat 322  Q
    |||||| || |||||    
T  12769512 cattaaatccttaat 12769498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40701442 - 40701322
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    |||||||||||||| |||| |||||    ||||||| || ||  |||||| ||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  40701442 aatgtcctttgattgcttgcttcttaaattgatttatactttactcctgttttagttaaacactaaagaacacaatttaaataccaaaaaattaatcaaa 40701343  T
Q  305 gtccattaattctttaatcat 325  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  40701342 gtttattaattctttaatcat 40701322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33090675 - 33090557
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||| || |||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  33090675 atgttctttgatttcttttatctttgtatgatttaaacgttgttcttgacttagtaaa-cattcaataacacaaattaaataccaataaattaatcaaag 33090577  T
Q  306 tccattaattctttaatcat 325  Q
    | ||| ||||| ||||||||    
T  33090576 ttcatcaattccttaatcat 33090557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12769796 - 12769739
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcac 60  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||||||||    
T  12769796 cctttatttcttgattgatccatgcagatgtactttattcgacatttactcatgtcac 12769739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 17220204 - 17220276
Alignment:
Q  220 cttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaag 292  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  17220204 cttgattcttggtttaatttatactttgttcatgtcttagttaatcactcaagaacacatattaaataccaag 17220276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 24922361 - 24922702
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24922361 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatctatgtcacatgtgccttgcatgtcctttgatcaaagttcttgagactctt 24922460  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  24922461 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattctgacctcagtgttagatcatgaattc 24922560  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24922561 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 24922659  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24922660 aagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 24922702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 24931397 - 24931738
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24931397 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatctatgtcacatgtgccttgcatgtcctttgatcaaagttcttgagactatt 24931496  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  24931497 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattctgacctcagtgttagatcatgaattc 24931596  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931597 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 24931695  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24931696 aagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 24931738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14791303 - 14790962
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14791303 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 14791204  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  14791203 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcaagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaaatc 14791104  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14791103 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggcatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 14791005  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14791004 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 14790962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3285545 - 3285205
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3285545 cctttatttcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacttttgatcaaagttcttgagactctt 3285446  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctt--agcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  3285445 ggcttttttaagaacaaccttctgatcttcgagc---aacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattctgacctcagtgttagatcatgaat 3285349  T
Q  201 tcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3285348 tcaaa-tgtcctttgatttcttgattattggtatgatataaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataacaaggagttaat 3285250  T
Q  301 caaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285249 caaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 3285205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29540156 - 29539817
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  29540156 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgctttgcatgacctt-gatcaaagttcttgagattcttg 29540058  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttca 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29540057 gcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcgagcaagattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattca 29539958  T
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29539957 aa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaactttgttcctgtcttagtataacactcaagagcacaagttaaataccaagtaattaatcaa 29539859  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29539858 agctcattaattctttaatcatattgatttattatctttaaa 29539817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20911982 - 20911660
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911982 cctttattgcttgattgattcatgcaaatgtactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 20911883  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||                   ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||    
T  20911882 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgcttgaacattc-------------------tgatctaactttctgacctcagtgttagatcataaattc 20911802  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911801 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 20911703  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911702 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 20911660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12454529 - 12454321
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12454529 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 12454431  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12454430 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 12454331  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  12454330 tatctttaaa 12454321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26426121 - 26425913
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26426121 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 26426023  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26426022 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttat 26425923  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  26425922 tatctttaaa 26425913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 111 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23778061 - 23777828
Alignment:
Q  111 taagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtc 210  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  23778061 taagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcaagcaacgttgtgatctaactttctgacctcagtgttagatcattaattcaaa-tgtc 23777963  T
Q  211 ctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23777962 ctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaacttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccat 23777863  T
Q  311 taattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23777862 taattctttaatcatattagtttattatctttaaa 23777828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18159294 - 18159086
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18159294 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 18159196  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18159195 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagtaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttat 18159096  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  18159095 tatctttaaa 18159086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31357036 - 31356828
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31357036 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgccctttgatttcttgattcttggtatg 31356938  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31356937 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaatagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 31356838  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  31356837 tatctttaaa 31356828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31366764 - 31366556
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31366764 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgccctttgatttcttgattcttggtatg 31366666  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31366665 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaatagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 31366566  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  31366565 tatctttaaa 31366556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18200853 - 18200631
Alignment:
Q  122 ttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttct 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||     
T  18200853 ttctgatctttgcttgaacattctaatctttgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgaattca 18200755  T
Q  222 tgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18200754 tgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaataacacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctctaa 18200655  T
Q  322 tcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18200654 tcatattggtttattatctttaaa 18200631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18169106 - 18168904
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169106 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 18169008  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| |      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18169007 attca------gttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagtaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttat 18168914  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  18168913 tatctttaaa 18168904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 27787929 - 27788268
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||  |||||||  |||||||||||||  ||| ||| || |||||| ||  ||      
T  27787929 cctttattgcttgattgatccatacaagtgtactttcctgaacatttattcatgtcatgtgtgccttgcatgctctt-gat-aatgttcttaagtttccg 27788026  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
     |||||| ||| || ||||||||||  |   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| |||    
T  27788027 agcttgtataataataaccttctgaaatcttcttgaacattctaatctttgagcaacattctgatctaactttatgaactcagagttagatcatgaattc 27788126  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27788127 aaa-tgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaacattgttcatgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccaagaaattaatca 27788225  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27788226 aaatccattaattctttaatcataaaggtttattatctttaaa 27788268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 204 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20926249 - 20926108
Alignment:
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20926249 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaatgtattaatcaa 20926150  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926149 attccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 20926108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16907827 - 16907686
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907827 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 16907728  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16907727 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 16907686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16897174 - 16897033
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16897174 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaatgaattaatcaa 16897075  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16897074 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 16897033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12454753 - 12454630
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  12454753 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 12454655  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  12454654 ggcttgtataagaacaaccttctga 12454630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16897646 - 16897523
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  16897646 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 16897548  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  16897547 ggcttgtataagaacaaccttctga 16897523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16908299 - 16908176
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  16908299 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 16908201  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  16908200 ggcttgtataagaacaaccttctga 16908176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18159761 - 18159638
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  18159761 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 18159663  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  18159662 ggcttgtataagaataaccttctga 18159638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18169573 - 18169450
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  18169573 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 18169475  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  18169474 ggcttgtataagaataaccttctga 18169450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 31357260 - 31357137
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  31357260 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 31357162  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||    
T  31357161 ggcttgtataagaactaccttctga 31357137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 31366988 - 31366865
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  31366988 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 31366890  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||    
T  31366889 ggcttgtataagaactaccttctga 31366865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1595930 - 1595789
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595930 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 1595831  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  1595830 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 1595789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17823585 - 17823444
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17823585 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcgtagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 17823486  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  17823485 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 17823444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 12991134 - 12991276
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12991134 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 12991233  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatat-tggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || |||||||| |   ||||||||||||||||    
T  12991234 agtccatttaatccttaatcatttaaagtttattatctttaaa 12991276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 345
Target Start/End: Original strand, 7756036 - 7756156
Alignment:
Q  226 tcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatca 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  7756036 tcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatcttcaatca 7756135  T
Q  325 tattggtttattatctttaaa 345  Q
    |    ||||||||||||||||    
T  7756136 ttaaagtttattatctttaaa 7756156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 26021762 - 26021903
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26021762 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctatcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatgaatcaa 26021861  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  26021862 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 26021903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Original strand, 30658721 - 30658841
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30658721 aatgtcctttgatttcatgtatcttggtattattcaaaccttgtttctgtcttagtaaaacactcaagagcacaaattaaataccaaggaattaatcaaa 30658820  T
Q  305 gtccattaattctttaatcat 325  Q
    |||| || | || ||||||||    
T  30658821 gtccctttaatccttaatcat 30658841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 18712766 - 18712907
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18712766 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgccttagtaaaaacattcaagagcacaacttaaataccaaggaattaatcaa 18712865  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||| ||    ||||||||||||||||    
T  18712866 agtccatttaatccttaataattaaagtttattatctttaaa 18712907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 24505986 - 24506127
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  |||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24505986 aatgtcctttgattttatgtatcttagtatgattcaaaccttgttcctgtcatagtgaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaa 24506085  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  24506086 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 24506127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 325
Target Start/End: Original strand, 24370897 - 24370996
Alignment:
Q  226 tcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcat 325  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24370897 tcttggtatgaattgaaacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcat 24370996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34764820 - 34764681
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  |||| |||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34764820 atgtcctttgattctttgtatcttcgtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 34764721  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  34764720 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 34764681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16320784 - 16320663
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  16320784 aatgtcctttgatttaatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacattcaagagcaccagctaaatacaaaggaattaatcaa 16320685  T
Q  304 agtccattaattctttaatcat 325  Q
    |||||||| | || ||||||||    
T  16320684 agtccatttaatccttaatcat 16320663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16923062 - 16922941
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaaca-ctcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16923062 aatgtcatttgatttcatgtatcttggtatgatttaaaccttgtttctatcttagtaaaaaaacttaagagcacaagttaaatactaaggacttaatcaa 16922963  T
Q  304 agtccattaattctttaatcat 325  Q
    |||||||| | || ||||||||    
T  16922962 agtccatttaatccttaatcat 16922941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Original strand, 8563801 - 8563920
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||| | || || ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8563801 atgtcctttgattctttgtatcttggtataaattgaaactttttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 8563900  T
Q  306 tccattaattctttaatcat 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  8563901 tccattacttccttaatcat 8563920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24692330 - 24692191
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  24692330 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgttcatgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaat 24692231  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    | | ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  24692230 ttcgttaattccttaatcattaaggtttgttatctttaaa 24692191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26161391 - 26161291
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26161391 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttttttctgtcttagtaaaaacactc--gagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 26161294  T
Q  304 agt 306  Q
    |||    
T  26161293 agt 26161291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Original strand, 9762040 - 9762160
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||  |||| |||| ||||| || || |||||| ||||  |||||||||||  || ||||||||    
T  9762040 aatgttctttgattgcttgcttcttggtttgatttatactatgtttctgtcttagttaatcaatcaagaacacatattaaataccaataaactaatcaaa 9762139  T
Q  305 gtccattaattctttaatcat 325  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  9762140 gtccattaatcttttaatcat 9762160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 18200917 - 18200873
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacat 47  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18200917 cctttattgctttattgatccatgcaaatgtactttcctggacat 18200873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 38958097 - 38958438
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38958097 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttacatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 38958196  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  38958197 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagcttgaacattaagatcttcgagcaacattctgatctaacattctgacctcagtgttagatcatgaattc 38958296  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38958297 -aaacgtcctttgatttattgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 38958395  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38958396 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 38958438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 38930761 - 38931102
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38930761 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 38930860  T
Q  103 -ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgattt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  38930861 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctcagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattctgacctcagtgttagatcataattc 38930960  T
Q  202 caaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatc 301  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38930961 --aaatgtcctttgatttattgattcttggtgtgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatc 38931058  T
Q  302 aaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38931059 aaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 38931102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 45014432 - 45014091
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45014432 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactctactggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 45014333  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  45014332 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgcctgaacattctgatcttcaagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 45014233  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45014232 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 45014134  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45014133 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 45014091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17488390 - 17488049
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17488390 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacgtatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaaattcttgagactctt 17488291  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  17488290 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcaagcaacgttctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 17488191  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17488190 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggagttaatca 17488092  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488091 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 17488049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 24696864 - 24697204
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24696864 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcccatgtcacatgtgccttgcatgatctt-gatcaaagttcttgagactctt 24696962  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  24696963 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctacttgaacattctgatcttcaagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 24697062  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24697063 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctatcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 24697161  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24697162 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 24697204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 4 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 45024508 - 45024168
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45024508 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactctactggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaatttcttgagactcttg 45024409  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||     
T  45024408 gcttgtttaagaacaaccttctgatctctgcctgaacattttgatcttcaagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc- 45024310  T
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45024309 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcttgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaatgaattaatcaa 45024210  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45024209 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 45024168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 44639277 - 44639617
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  44639277 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatatcacatgtgccttggatgacctt-gatcaatgttcttgagaatctt 44639375  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||    
T  44639376 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattatgatctctgagcaacattctgatctaactttctaacctcagtgttagatcatgaattc 44639475  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44639476 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaatcttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaaattaaataccaaagaattaatca 44639574  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44639575 aagtccattaattctttaatcataatggtttattatctttaaa 44639617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Original strand, 2999200 - 2999408
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2999200 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 2999298  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2999299 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 2999398  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  2999399 tatctttaaa 2999408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 29131524 - 29131691
Alignment:
Q  177 tgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagca 276  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29131524 tgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagca 29131622  T
Q  277 caagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29131623 caagataaataccaagaaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 29131691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 88 - 345
Target Start/End: Original strand, 24239591 - 24239852
Alignment:
Q  88 gttcttgagactcttggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttc-----gagcaacattctgatctaacattttgacct 182  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||   |     |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  24239591 gttcttgagattcttggcttgtataagaacaaccttctgacctctgcttgaacattctgattaactcgctgagcaacattctgaactaactttctgacct 24239690  T
Q  183 cagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagtt 282  Q
    ||| ||||| |||| |   | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24239691 cagagttagttcat-aaaaccaaatgtcctttgatttcttgaatcttggtataatttaaaccttattcatgtcttagtaaaacacttaagagcacaagtt 24239789  T
Q  283 aaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||    
T  24239790 aaataccaagaaaataatcaaagtccattaattccttaatcatcaaagtttattatctttaaa 24239852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 9503566 - 9503707
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9503566 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 9503665  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9503666 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 9503707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 9514932 - 9515073
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9514932 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 9515031  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9515032 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 9515073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 2998976 - 2999099
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  2998976 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 2999074  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  2999075 ggcttgtataagaacaaccttctga 2999099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 5337414 - 5337537
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5337414 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 5337512  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  5337513 ggcttgtataagaacaaccttctga 5337537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 5347267 - 5347390
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5347267 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 5347365  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  5347366 ggcttgtataagaacaaccttctga 5347390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 9503040 - 9503163
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  9503040 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 9503138  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  9503139 ggcttgtataagaacaaccttctga 9503163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 9514406 - 9514529
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  9514406 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 9514504  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  9514505 ggcttgtataagaacaaccttctga 9514529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18650918 - 18650795
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  18650918 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 18650820  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  18650819 ggcttgtataagaacaaccttctga 18650795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18663036 - 18662913
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  18663036 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 18662938  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  18662937 ggcttgtataagaacaaccttctga 18662913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4457895 - 4457772
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4457895 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 4457797  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  4457796 ggcttgtataagaacaaccttctga 4457772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4467520 - 4467397
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4467520 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 4467422  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  4467421 ggcttgtataagaacaaccttctga 4467397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15940241 - 15940050
Alignment:
Q  153 gagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcct 252  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||| |   |||| | |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  15940241 gagcaatattctgaactaactttctgacctcagagttagttcataaaaccaaa-tatcctttgatttcttgaatcttggtataaattaaaccttgttcct 15940143  T
Q  253 gtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||    
T  15940142 gtcttagtaaaacactcaagagcacaatttaaataccaagaaaataatcaaagtccattaattccttaatcatcaaagtttattatctttaaa 15940050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 22688253 - 22688394
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22688253 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 22688352  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  22688353 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 22688394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4457386 - 4457245
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4457386 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 4457287  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  4457286 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 4457245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4467011 - 4466870
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4467011 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 4466912  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  4466911 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 4466870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 5337947 - 5338088
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5337947 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5338046  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  5338047 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 5338088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 5347843 - 5347984
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5347843 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5347942  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  5347943 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 5347984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 16934859 - 16935000
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934859 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 16934958  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  16934959 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 16935000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 17005519 - 17005660
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17005519 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 17005618  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  17005619 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 17005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 32937981 - 32938122
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32937981 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 32938080  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  32938081 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 32938122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 206 - 342
Target Start/End: Original strand, 15479323 - 15479459
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15479323 atgtccttttatttcttgtttcttggtacgaattaaactttgttcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 15479422  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatcttt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||    
T  15479423 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatcttt 15479459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4456322 - 4456181
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456322 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctatcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 4456223  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  4456222 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 4456181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18662587 - 18662446
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18662587 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 18662488  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  18662487 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 18662446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18660897 - 18660705
Alignment:
Q  153 gagcaacattctgatctaacattttgacct-cagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || |||  |||| |||||  |||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||||| |    
T  18660897 gagcaacattctgatctaactttctgaacttcagaattagttcatggattcaa--tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgtttc 18660800  T
Q  252 tgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  18660799 tgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 18660705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 3606492 - 3606632
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3606492 aatgtcctttgatttcatgtatcttggtattattcaaaccttgttcatgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataacaaagaattaatcaaa 3606591  T
Q  305 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    || |||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  3606592 gttcatttaatcattaatcattaaagtttattatctttaaa 3606632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12570059 - 12569952
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12570059 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaatactaaggaattaatcaa 12569960  T
Q  304 agtccatt 311  Q
    ||| ||||    
T  12569959 agttcatt 12569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 573732 - 573593
Alignment:
Q  207 tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  573732 tgtcctttgattttatgcatcttgatatgattcaaaccttgttcttgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaaag 573633  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  573632 tccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 573593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 28460989 - 28461063
Alignment:
Q  271 agagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28460989 agagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagttcattaattctctaatcatattggtttattatctttaaa 28461063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22901576 - 22901437
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  22901576 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgattctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaataaattaatcatag 22901477  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  22901476 tccattaattctttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 22901437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18650517 - 18650376
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  18650517 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagaacacaaattaaatacaaaggaataaatcaa 18650418  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  18650417 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 18650376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 345
Target Start/End: Original strand, 27160547 - 27160648
Alignment:
Q  244 cttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatcttta 343  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||    
T  27160547 cttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaaggtttgttatcttta 27160646  T
Q  344 aa 345  Q
    ||    
T  27160647 aa 27160648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 345
Target Start/End: Original strand, 27170916 - 27171017
Alignment:
Q  244 cttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatcttta 343  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||    
T  27170916 cttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaaggtttgttatcttta 27171015  T
Q  344 aa 345  Q
    ||    
T  27171016 aa 27171017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 22909363 - 22909502
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || ||||||||| | | ||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  22909363 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgttcctatctcagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcatag 22909462  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  22909463 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 22909502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 45190205 - 45190121
Alignment:
Q  261 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  45190205 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 45190121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23721432 - 23721293
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || ||  |||||||||| |  || || ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23721432 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaatttgttcctgtctcggttaaccacccaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 23721333  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  23721332 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 23721293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45190323 - 45190235
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaag 292  Q
    |||||| ||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45190323 aatgtcttttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaag 45190235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Original strand, 72496 - 72633
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||| |||||||||  | ||||| |  |||||||||| ||| |    
T  72496 ctttattgcttgattgatccatgccaatgtactttactggacatttattcatgtcatgtgtaccttgcatgttc-ttgat-attgttcttgagattctgg 72593  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacatt 143  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||    
T  72594 gcttgtataagaacaaccttttgaactctgcttgaacatt 72633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Original strand, 40409606 - 40409725
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  |||||||  | |||||| ||| ||||| |||||||||||| || || |||||||||||| || || ||||     
T  40409606 aatgtcctttgattgcttgcttcttggattgatttattctttgttcttgtcttagttaaacactcaagaaca-aaattaaataccaagaaactattcaat 40409704  T
Q  305 gtccattaattctttaatcat 325  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  40409705 gtccattaatcctttaatcat 40409725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Original strand, 16135701 - 16135820
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| || ||  ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||| |    
T  16135701 atgtcctttaatttctggtatcttggtatgatttaaacttttttattgtcttagttaaacactcaagaacacaaattaaataccatgaaactaatcaatg 16135800  T
Q  306 tccattaattctttaatcat 325  Q
    | ||||||| | ||||||||    
T  16135801 ttcattaatccattaatcat 16135820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 28460903 - 28460990
Alignment:
Q  94 gagactcttggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcag 185  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||    ||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28460903 gagattcttggcttgtataagaacaacct----atctctgcttgaacattctgatttttgagcaacattctgatctaactttctgacctcag 28460990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19341785 - 19341649
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||| ||||| |  || ||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||    
T  19341785 atgtcctttgattgtttgtatcttgctatgaatcgaaacttattcctgtcttaattaaccactcaagagcacaagttaa---ccaacaaattaatcaaag 19341689  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  19341688 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 19341649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 72654 - 72719
Alignment:
Q  183 cagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgtt 249  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  72654 cagtgttagttcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaactttgtt 72719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 47
Target Start/End: Original strand, 24239519 - 24239564
Alignment:
Q  3 cctttattgctt-gattgatccatgcaaatgtactttcctggacat 47  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24239519 cctttattgctttgattgatccatgcaaatgttcttttctggacat 24239564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27411848 - 27411507
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27411848 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 27411749  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  27411748 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcaagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 27411649  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27411648 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaatagcacaagttaaataccaaggaattaatca 27411550  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27411549 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 27411507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32070140 - 32069799
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32070140 cctttattgtttgattgttccatgcaaatgtactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 32070041  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  32070040 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcaagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 32069941  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32069940 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 32069842  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32069841 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 32069799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Original strand, 26192704 - 26192912
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192704 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 26192802  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192803 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 26192902  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  26192903 tatctttaaa 26192912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Original strand, 26203264 - 26203472
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203264 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 26203362  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203363 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 26203462  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  26203463 tatctttaaa 26203472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Original strand, 11411665 - 11411873
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11411665 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgatttttggtatg 11411763  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11411764 attcaaacctcgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 11411863  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  11411864 tatctttaaa 11411873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 133 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22240582 - 22240371
Alignment:
Q  133 gcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22240582 gcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcaagaattcaaa-tgtcctttgatttcttaattcttggt 22240484  T
Q  233 atgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtt 332  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22240483 atgatttaaaccttgttcttatcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaaagtccattaattcgttaatcatattggtt 22240384  T
Q  333 tattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||    
T  22240383 tattatctttaaa 22240371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33938573 - 33938433
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33938573 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 33938474  T
Q  305 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33938473 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 33938433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33948973 - 33948833
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33948973 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 33948874  T
Q  305 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33948873 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 33948833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 8766278 - 8766419
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8766278 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 8766377  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8766378 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 8766419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 345
Target Start/End: Original strand, 23378945 - 23379288
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || || ||  || ||||  |||| ||||||||  ||| ||| || |||||||||  ||| |    
T  23378945 ctttattgcttgattgatcgatgcaaatgtactttacctgaaatttattcaagtcatgtgtgtcttgcatgttctt-gat-aatgttcttgagtttctag 23379042  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcg-----agcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatga 198  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||   |||||||||| |||||  |      ||||||||||| | ||||| || ||| ||||| ||||| ||||||    
T  23379043 gcttgtataaggacaaccttctgagctctacttgaacattttgatcaactcccttagcaacattctaaactaactttctgaactcagagttagttcatga 23379142  T
Q  199 tttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatta 298  Q
     |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23379143 attcaaa-tgtcctttgatttcttgtatcttggaatgatttaaacatttttcatgtcttagtaaaacattcaagagcacaagttaaataccaagaaatta 23379241  T
Q  299 atcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||||||||    
T  23379242 atcaaagtccattgattccttaatcatcaagttttattatctttaaa 23379288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18360977 - 18360854
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  18360977 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 18360879  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  18360878 ggcttgtataagaacaaccttctga 18360854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18389934 - 18389811
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  18389934 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 18389836  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  18389835 ggcttgtataagaacaaccttctga 18389811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21753143 - 21753020
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21753143 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 21753045  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  21753044 ggcttgtataagaacaaccttctga 21753020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21762430 - 21762307
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21762430 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 21762332  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  21762331 ggcttgtataagaacaaccttctga 21762307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 33939017 - 33938894
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  33939017 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 33938919  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  33938918 ggcttgtataagaacaaccttctga 33938894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 33949417 - 33949294
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  33949417 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 33949319  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  33949318 ggcttgtataagaacaaccttctga 33949294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 8765726 - 8765849
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  8765726 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 8765824  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  8765825 ggcttgtataagagcaaccttctga 8765849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 207 - 345
Target Start/End: Original strand, 20905318 - 20905456
Alignment:
Q  207 tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagt 306  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20905318 tgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaacattgttcccgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaaagt 20905417  T
Q  307 ccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||| | || ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  20905418 ccatttagtccttaatcattatagtttattatctttaaa 20905456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 11411469 - 11411592
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  11411469 cctttattgcttgattgatccatgtaaatgtacttttctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 11411567  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  11411568 ggcttgtataagaacaaccttctga 11411592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 26192362 - 26192485
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||  ||||    
T  26192362 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatggcc-ttgatcacagttcttgagtttctt 26192460  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  26192461 ggcttgtataagaacaaccttctga 26192485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 26202966 - 26203089
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||  ||||    
T  26202966 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatggcc-ttgatcacagttcttgagtttctt 26203064  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  26203065 ggcttgtataagaacaaccttctga 26203089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20896473 - 20896285
Alignment:
Q  156 caacattctgatctaacattttgacct-cagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgt 254  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || |||  |||| |||||| |||||   |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  20896473 caacattctgaactaactttttgaacttcagaattagttcatgaattcaac--gtcctttgatttcttctatcttggtatgacttaaaccttgttcttat 20896376  T
Q  255 attagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  20896375 atttgtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttagtccttaatcattaaagtttattatctttaaa 20896285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22244414 - 22244288
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  22244414 cctttattgattgattgatccatgcaaatgtaatttcctggacatatattcatatcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcagtgttcttgagattctt 22244316  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatct 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22244315 ggcttgtataagaacaaccttctgatct 22244288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20763834 - 20763693
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20763834 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcatgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagaaattaatcaa 20763735  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| |||| ||||||||    ||||||||||||||||    
T  20763734 agtccatttattccttaatcattaaagtttattatctttaaa 20763693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21681013 - 21680872
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21681013 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21680914  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  21680913 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 21680872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21752541 - 21752400
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21752541 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21752442  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  21752441 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 21752400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21761964 - 21761823
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21761964 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21761865  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  21761864 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 21761823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 22174083 - 22174224
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22174083 aatgtcctttgattttatgtatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 22174182  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  22174183 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 22174224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 27274962 - 27275103
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274962 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 27275061  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  27275062 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 27275103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37817053 - 37816912
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37817053 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 37816954  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  37816953 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 37816912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18360623 - 18360431
Alignment:
Q  153 gagcaacattctgatctaacattttgacct-cagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || |||  |||| |||||  |||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  18360623 gagcaacattctgatctaactttctgaacttcagaattagttcatggattcaa--tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcc 18360526  T
Q  252 tgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  18360525 tgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 18360431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18389623 - 18389431
Alignment:
Q  153 gagcaacattctgatctaacattttgacct-cagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || |||  |||| |||||  |||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  18389623 gagcaacattctgatctaactttctgaacttcagaattagttcatggattcaa--tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcc 18389526  T
Q  252 tgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  18389525 tgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 18389431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 13572493 - 13572634
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13572493 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatcaatcaa 13572592  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  13572593 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 13572634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Original strand, 18210656 - 18210777
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18210656 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 18210755  T
Q  304 agtccattaattctttaatcat 325  Q
    |||||||| | || ||||||||    
T  18210756 agtccatttaatccttaatcat 18210777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 30944627 - 30944768
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30944627 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 30944726  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  30944727 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 30944768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 30954049 - 30954190
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30954049 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 30954148  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  30954149 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 30954190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31916286 - 31916145
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31916286 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagaacacaagttaaataccaaggaattaatcaa 31916187  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  31916186 agtccatttaatccttaatcattaatgtttattatctttaaa 31916145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 37549402 - 37549543
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37549402 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcttgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 37549501  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  37549502 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 37549543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 37652200 - 37652341
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37652200 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcttgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 37652299  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  37652300 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 37652341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 306
Target Start/End: Original strand, 206260 - 206362
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  206260 aatgtcctttgatttcatgtatcttggtatgatttaaaccttattcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 206359  T
Q  304 agt 306  Q
    |||    
T  206360 agt 206362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 4038761 - 4038902
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    ||||||||||||||   ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4038761 aatgtcctttgattatatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaagcactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 4038860  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  4038861 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 4038902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Original strand, 18220006 - 18220127
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18220006 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcttgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 18220105  T
Q  304 agtccattaattctttaatcat 325  Q
    |||||||| | || ||||||||    
T  18220106 agtccatttaatccttaatcat 18220127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 19889123 - 19889264
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19889123 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttattcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaattaa 19889222  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  19889223 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 19889264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 37299612 - 37299753
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37299612 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaactttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacatgttaaataccaaggaattaatcaa 37299711  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  37299712 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 37299753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 42091301 - 42091444
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactc--aagagcacaagttaaataccaaggaattaatc 301  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42091301 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgatttaaacattgttcctgtcttagtaaaaacactataaagagcacaagttaaataccaaggaattaatc 42091400  T
Q  302 aaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  42091401 aaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 42091444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20947284 - 20947145
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20947284 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 20947185  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  20947184 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 20947145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20957673 - 20957534
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20957673 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 20957574  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  20957573 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 20957534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31105111 - 31104835
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||  |||| || || |||||| ||| ||| |    
T  31105111 ctttattgcttgattgatccataccaatgtactttactggacatttattcatgtcacgtgtaccttgcatgttcttt-at-aatgttcttcagattctag 31105014  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatc----ttc-gagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatga 198  Q
    |||||  ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  ||    ||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||| ||||||    
T  31105013 gcttgcataagaacaaccttatgaactctgcttgaacattctactcaactttctgagcaacattctgaactaactttctgaactcagagttagttcatga 31104914  T
Q  199 tttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcaca 278  Q
     ||  ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||  ||| || || || ||||||||| ||||    
T  31104913 att-taaatgtcatttgatttcttgtatcatggtatgatttaaactttgtttgtgtcttggttaatcactcaagaacaca 31104835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 19549047 - 19549187
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgat-tcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  19549047 atgtcctttgattctttgttatcttggtatgaattgaaacttgttcctgttttagttaaccactcaagagcacaggttaaataccaacaaattaatcaaa 19549146  T
Q  305 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||  |||||||    ||||| |||||||||||    
T  19549147 gtccattaatttcttaatcaacaaggtttgttatctttaaa 19549187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 21484395 - 21484518
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||  ||||||||| |||  ||| |||  |||| || || |||||||||| ||||    
T  21484395 cctttattgcttgattgatccatgcaaacgtacttttctagacatttattcatgtcacaagtgagttgtatgttcttt-at-aatgttcttgagattctt 21484492  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgat 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21484493 ggcttatttaagaacaaccttctgat 21484518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 345
Target Start/End: Original strand, 34131268 - 34131369
Alignment:
Q  245 ttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatcttta 343  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||    ||||||||||||||    
T  34131268 ttgttcatgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaaagttcatttaatccttaatcattaaagtttattatcttta 34131367  T
Q  344 aa 345  Q
    ||    
T  34131368 aa 34131369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 350 - 398
Target Start/End: Original strand, 29023876 - 29023924
Alignment:
Q  350 aagaaaataaacccgaatggagtatcgcttaaagttattacttttaaat 398  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29023876 aagaaaataaacctgaatggagtatcgcttaaagttattacttttaaat 29023924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 20896628 - 20896585
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacat 47  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  20896628 ctttattgcttgattgatccatgtagatgtactttactggacat 20896585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16253112 - 16252772
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16253112 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctt-gatcaaagttcttgagactctt 16253014  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  16253013 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 16252914  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252913 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaacattgttcctgtcttattaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 16252815  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252814 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 16252772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 17985233 - 17985574
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985233 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 17985332  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  17985333 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctacttgaacattctgatcttcaagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 17985432  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985433 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 17985531  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985532 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 17985574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15668887 - 15668547
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15668887 cctttattacttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttacataacctt-gatcaaagttcttgagattctt 15668789  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  15668788 ggcttgtataagaacaaccttctgatatctgcttgaacattctgatcttcgagcaacattctaatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 15668689  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15668688 aaa-tgtcctttgatttcttgattcctggtatgatttgaactttgttcctgtcttggtaaaacactcaagagcacaagttacataccaaggaattaatca 15668590  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15668589 aagtccattaattctataatcatattggtttattatctttaaa 15668547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26330924 - 26330585
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26330924 ctttattgcttaattgatccatgcagatgtactttcctgtacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacctt-gatcaaagttcttgagattcttg 26330826  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttca 203  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26330825 gcttgtataagaacatccttctgatctctgcttgaacattgtgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctccgtgttagatcatgaattca 26330726  T
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26330725 aattttc-tttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcatgtcttagtaaaacacgcaagatcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 26330627  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26330626 agtccattaattctctaatcatattggtttattatctttaaa 26330585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 52498831 - 52498490
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcc-tggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| | |    
T  52498831 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttccctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgac-ttcgaccaatgttcttgagattat 52498733  T
Q  102 tggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgattt 201  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  52498732 tggcttgcataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatctctgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaatt 52498633  T
Q  202 caaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatc 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52498632 caaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgttttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatc 52498534  T
Q  302 aaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  52498533 aaagttcattaattctttaataatattggttcattatctttaaa 52498490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17160938 - 17160598
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||    
T  17160938 cctttattgattgattgatccatgcaaatgtactttcctagatatatatccgtgtcacatgtgccttgcatgacctt-gatcaaagttctttacattctt 17160840  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  17160839 gacttgtataagaacaaccttctaatctctgtttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattctgacctcagtgttagatcatgaattc 17160740  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17160739 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgattgaaaccttgttcatgtcttagtgaaatactcaagagcgcaagttaaataccaatgaattaatca 17160641  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17160640 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 17160598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 144 - 345
Target Start/End: Original strand, 18106016 - 18106216
Alignment:
Q  144 ctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaac 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18106016 ctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaac 18106114  T
Q  244 cttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatcttta 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106115 cttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatcttta 18106214  T
Q  344 aa 345  Q
    ||    
T  18106215 aa 18106216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40921260 - 40921052
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40921260 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgaccttagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 40921162  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40921161 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttat 40921062  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  40921061 tatctttaaa 40921052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 345
Target Start/End: Original strand, 9836429 - 9836748
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  |||| ||  |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |      
T  9836429 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtattttcctgaacatttattcatgacatgtgtgtcttgcatgac-tttgatcaatgttcttaagattatgt 9836527  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttca 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   || |                 |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9836528 gcttgtataagaacaaccttctgatct---ctag-----------------gcaacattctgatctaactttctgacgtcagtgttagatcatgaattca 9836607  T
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9836608 aa-tgtcctttgatttcttgaatcttggtatgattaaaaccttgttcttgttttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 9836706  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9836707 agtccattaattctttaatcataaaggtttattatctttaaa 9836748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Original strand, 6406196 - 6406530
Alignment:
Q  8 attgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttggctt 107  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||  ||| ||| |  |||||| ||  ||| |||||    
T  6406196 attgcttaattgatccatgaaaatgtattttcctggacatttattcatgtcaagtgtgccttgcatgttctt-gat-attgttctttagtttctgggctt 6406293  T
Q  108 gtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaat 207  Q
    || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||| |||||| |||||| |    
T  6406294 gtataagaacaaccttctgaactctgcttaaacattatgatatctgagcaacattctgaactaactttttgaactcatagttagttcatgaattcaaa-t 6406392  T
Q  208 gtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtc 307  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  6406393 gtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaacattgttcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccaagaaattaatcaaagcc 6406492  T
Q  308 cattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||| || |||||   |||||||||||||||||    
T  6406493 cattaattcctttatcatcaaggtttattatctttaaa 6406530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 13403406 - 13403705
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  13403406 ctttattgcttgattgatccatgcaa-tgtactttccaggacatttaatcatgtcacatgtgccttgcatgacctt-gatcaatgttcttgagattcttg 13403503  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttca 203  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||                  ||  |||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13403504 gcttgtgcaagaacaacctcctgatct------------------ct--gagcaacattctgatctaactttctgacatgagtgttagatcatgaattca 13403583  T
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403584 aa-tgtcctttgatttcttgattcttgatatgatttatcttttatttctgtcttaataaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 13403682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1293055 - 1292712
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |   ||||||| | ||| ||||||||  ||| ||| || |||||||||| | |||    
T  1293055 ctttattgtttgattgatccatgcaaatgtacttttatggacatttgttcatgtcataagtgacttgcatgttctt-gat-aatgttcttgagattattg 1292958  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgat---cttc--gagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatga 198  Q
     ||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||   |||   |||||||||| ||| ||||| || |||| |||| ||||| |||| |    
T  1292957 acttgcataagaacaactttctgacctttgcttgaacattctgataaacttactgagcaacattatgaactaactttctgacttcagagttagttcat-a 1292859  T
Q  199 tttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatta 298  Q
       | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1292858 gaaccaaatgtcatttgatttcttgaatcttggtataatttaaaccttgttcatgtcttaataaaacactcaatatcacaagttaaataccaaggaatta 1292759  T
Q  299 atcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  1292758 atcaaagtccattaattccttaatcatcaaggtttattatctttaaa 1292712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16248552 - 16248411
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16248552 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 16248453  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16248452 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 16248411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11476644 - 11476467
Alignment:
Q  148 tcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttg 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  11476644 tcttcgagcaacattctgaactaactttctgaactcagagttagttcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgtatcttggtataatttataccttg 11476546  T
Q  248 ttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcata 326  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476545 ttcctatcttagtaaaacactcaagagtgcaagttaaataccaagaaattcatcaaagtccattaattctttaatcata 11476467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6691483 - 6691342
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6691483 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgatcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagggattaatcaa 6691384  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6691383 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 6691342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6701889 - 6701748
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6701889 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgatcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagggattaatcaa 6701790  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6701789 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 6701748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 18105785 - 18105908
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  18105785 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 18105883  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  18105884 ggcttgtataagaacaaccttctga 18105908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21845803 - 21845680
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21845803 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 21845705  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  21845704 ggcttgtataagaacaaccttctga 21845680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21855395 - 21855272
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21855395 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 21855297  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  21855296 ggcttgtataagaacaaccttctga 21855272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21901666 - 21901543
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21901666 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 21901568  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  21901567 ggcttgtataagaacaaccttctga 21901543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21911258 - 21911135
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21911258 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 21911160  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  21911159 ggcttgtataagaacaaccttctga 21911135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 40921543 - 40921420
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  40921543 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 40921445  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  40921444 ggcttgtataagaacaaccttctga 40921420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 3487991 - 3488114
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3487991 cctttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 3488089  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  3488090 ggcttgtataagaacaaccttctga 3488114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 5293457 - 5293580
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  5293457 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgaccacagttcttgagattctt 5293555  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  5293556 ggcttgtataagaacaaccttctga 5293580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 5303116 - 5303239
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  5303116 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgaccacagttcttgagattctt 5303214  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  5303215 ggcttgtataagaacaaccttctga 5303239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6691918 - 6691795
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6691918 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 6691820  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  6691819 ggcttgtataagaataaccttctga 6691795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6702324 - 6702201
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6702324 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 6702226  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  6702225 ggcttgtataagaataaccttctga 6702201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 27681120 - 27681243
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  27681120 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 27681218  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  27681219 ggcttgtataagaacaaccttctga 27681243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 27690775 - 27690898
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  27690775 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 27690873  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  27690874 ggcttgtataagaacaaccttctga 27690898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 3497314 - 3497437
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3497314 cctttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 3497412  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    
T  3497413 ggcttgtataagaacaatcttctga 3497437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16472144 - 16472004
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16472144 aatgtcctttgatttcttgtgtcttggtattatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaatacttaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 16472045  T
Q  305 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  16472044 gtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 16472004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44888241 - 44888101
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44888241 aatgtcctttgatttcatgtatcttggtattattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 44888142  T
Q  305 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  44888141 gtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 44888101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2829046 - 2828905
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2829046 aatgtcctttgatttcatgtatcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaa 2828947  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  2828946 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 2828905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16249146 - 16249023
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  16249146 cctttattgcttaatttatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 16249048  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  16249047 ggcttgtataagaacaaccttctga 16249023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 3488494 - 3488635
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3488494 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 3488593  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  3488594 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 3488635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 5294002 - 5294143
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5294002 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5294101  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  5294102 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 5294143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 5303616 - 5303757
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303616 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5303715  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  5303716 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 5303757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 7847338 - 7847479
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagta-aaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7847338 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgatttaatccttgttcctgtcttagtataaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 7847437  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  7847438 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 7847479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21845461 - 21845320
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21845461 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21845362  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  21845361 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 21845320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21854890 - 21854749
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21854890 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21854791  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  21854790 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 21854749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21901324 - 21901183
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21901324 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21901225  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  21901224 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 21901183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21910753 - 21910612
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21910753 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21910654  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  21910653 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 21910612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 27681664 - 27681805
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27681664 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 27681763  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  27681764 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 27681805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 27691275 - 27691416
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27691275 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 27691374  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  27691375 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 27691416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16629007 - 16628865
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttct-tgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16629007 aatgtcctttgatttttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 16628908  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  16628907 aagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 16628865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 3497761 - 3497902
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3497761 aatgtcctttgattttatgcatcttgttatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 3497860  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  3497861 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 3497902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 17829141 - 17829282
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17829141 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 17829240  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  17829241 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 17829282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 17838532 - 17838673
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17838532 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 17838631  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  17838632 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 17838673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12865833 - 12865692
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12865833 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaattttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 12865734  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  12865733 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 12865692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 345
Target Start/End: Original strand, 14601072 - 14601403
Alignment:
Q  4 ctttattgctt-gattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |   ||| |||||  || ||||||||  ||| ||| || |||||||||| ||||    
T  14601072 ctttattgctttgattgatccatgcaaacgtacttttctggacatttgttcatatcacaaatgacttgcatgttctt-gat-aatgttcttgagattctt 14601169  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcg-----agcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatg 197  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  |      ||||| ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||     
T  14601170 gacttgtataagaacaaccttctgacctctacttgaacattctgatcaactcactaagcaatattatgaactaactttctgacctcagagttagttcata 14601269  T
Q  198 atttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatt 297  Q
    |   |||| |||||||||||||||||| ||||||||             |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14601270 aaaccaaa-tgtcctttgatttcttgaatcttggta-------------gttcatgtcttagtaaaatactcaagagcacaagttaaatacctaggaatt 14601355  T
Q  298 aatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||    
T  14601356 aatcaaagttcattaattccttaatcattaaggtgtattatctttaaa 14601403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 3606607 - 3606748
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3606607 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttttttctgtcttagttaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaattaa 3606706  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  3606707 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 3606748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16241761 - 16241695
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgcctt 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16241761 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgcctt 16241695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 522795 - 522934
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||| | || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  522795 atgtcctttgattctttgtatcttggtataaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 522894  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  522895 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 522934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26457839 - 26457700
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  26457839 atgtcctttgattctttgtatctgggtatgaattgaaacttgttcctgtcttagttaaccacccaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcgaag 26457740  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    || |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  26457739 tctattaattctttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 26457700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Original strand, 17421899 - 17422017
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||| ||||| || || ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17421899 atgtcctttgattctttgtatcttgatatgaattgaaacttgttc-tgtcttagttaatcactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 17421997  T
Q  306 tccattaattctttaatcat 325  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  17421998 tccattaattccttaatcat 17422017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4417271 - 4417117
Alignment:
Q  133 gcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggt 232  Q
    |||||| |||||| ||||  || ||||||||| | ||||| || ||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  4417271 gcttgatcattctcatctctgaacaacattctaaactaactttctgaactcagtgttagttcatgaatccaaa-tgtcctttgattttttgtatcttggt 4417173  T
Q  233 atgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaatac 288  Q
    ||||| ||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4417172 atgatgtaaactttgttattgtcttagttaaacactcaagagtacaatttaaatac 4417117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16241695 - 16241656
Alignment:
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16241695 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 16241656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Original strand, 16211756 - 16211800
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgtt 249  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  16211756 aatgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaactttgtt 16211800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 50
Target Start/End: Original strand, 53946668 - 53946714
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatata 50  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53946668 cctttattgct-gatacatccatgcaaatgtactttcctggacatata 53946714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40883931 - 40883842
Alignment:
Q  256 ttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||  |||| || |||||| |||||| |||||||| |   | |||||||||||||||    
T  40883931 ttagttaaacactcaaaaacacaaattaaataccaaaaaattgataaaagtctattaatcctttaatcgtcgagatttattatctttaaa 40883842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16154583 - 16154242
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16154583 cctttattgcttgattgatccatgcaaatatactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 16154484  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  16154483 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcaagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgagttc 16154384  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16154383 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcatgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 16154285  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16154284 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 16154242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25019168 - 25018828
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25019168 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 25019069  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  25019068 ggcttgtttaagaacaaccttctaatctctgcttgaacattctgatcttcaagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 25018969  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25018968 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaatattg-tcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 25018871  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25018870 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 25018828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2115700 - 2115360
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2115700 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcccatgtcacatgtgccttgcatgatctt-gatcaaagttcttgagactctt 2115602  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||    
T  2115601 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacttcagtgttagatcatgaattc 2115502  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2115501 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 2115403  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2115402 aagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 2115360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21886013 - 21885673
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21886013 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgatctt-gatcaaagttcttgagactctt 21885915  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  21885914 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 21885815  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21885814 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttgctatgatttaaactttgtttctgtctaagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaagaattaatca 21885716  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21885715 aagtccattaattttctaatcatattgatttattatctttaaa 21885673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 30549966 - 30550306
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30549966 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacacatgtcacatgtgacttgcatgatctt-gatcaaagttcttgagactctt 30550064  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  30550065 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 30550164  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30550165 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggaatgataaaaacattgttcatgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 30550263  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30550264 aagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 30550306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42033891 - 42033551
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  42033891 cctttattgcttgattgatctatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgatctt-gatcaaagttcttgagattctt 42033793  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||    
T  42033792 ggcttgcataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcaatgttagatcatgaattc 42033693  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033692 aaa-tgtcctttgatttcttgatttttggtatgatttaaaccttgttcctatcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 42033594  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42033593 aagtccattaattctctaatcatattggtttattatctttaaa 42033551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 345
Target Start/End: Original strand, 22406646 - 22406969
Alignment:
Q  21 tccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttggcttgtttaagaacaac 120  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22406646 tccatgcaaatgtactcttctggacgtatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttggtcaaagttcttgagactcttggcttgtttaagaacaac 22406745  T
Q  121 cttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttc 220  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  22406746 cttctgatctctgcttgaacattctgatcttcaagcaacgttctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaaatc-aaatgtcctttgatttc 22406844  T
Q  221 ttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattcttta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22406845 ttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacacttaagagcacaagttaaataccaaggagttaatcaaagtccattaattcttta 22406944  T
Q  321 atcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22406945 atcatattggtttattatctttaaa 22406969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8539950 - 8539610
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  8539950 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatatgccttgcatgacctt-gatcaaagttcttgagattatt 8539852  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  8539851 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctaatcttcgagcaacattttgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 8539752  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8539751 aaa-tgtcctttgatttcttgattcctgatatgatttaaaccttgctcctgtcttagtgaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 8539653  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8539652 aagtccattaattctttaatcatattcgtttattatccttaaa 8539610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8605189 - 8604849
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  8605189 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatatgccttgcatgacctt-gatcaaagttcttgagattatt 8605091  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  8605090 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctaatcttcgagcaacattttgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 8604991  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8604990 aaa-tgtcctttgatttcttgattcctgatatgatttaaaccttgctcctgtcttagtgaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 8604892  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8604891 aagtccattaattctttaatcatattcgtttattatccttaaa 8604849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13964595 - 13964256
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  13964595 cctttattgcttgattgatccatgcaaatctactttcctaaacatatatcaatgtcacatgtgccttgcatgacctt-gatcaatgttcttgagattctt 13964497  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13964496 gttttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaac-tttcgacctcagtgttagatcatgaattc 13964398  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13964397 aaa-tgtcctttgatttcttgattcatggtatgatttaaaccttgttccagtcttagtaaaatactcacgagcagaagttaaataccaatgaattaatca 13964299  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964298 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 13964256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 345
Target Start/End: Original strand, 2370771 - 2371108
Alignment:
Q  6 ttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttggc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| | | |||    
T  2370771 ttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttccttgacatttattcatgtcacatgtgcattccatgacctt-gatcaatgttcttgagattttgggc 2370869  T
Q  106 ttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaa 205  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  2370870 ttgtataagaacaaccttttgatctatgcttgaacattttgatctctgagcaacattctgatctaactttatgacctcagtgttagatcatgaatccaaa 2370969  T
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2370970 -tgtcttttgatttcttgaatcttggtatgatttaaaccttgttcatgtcttactaaaacactcaagagtacaagttaaataccaaggaattaatcagag 2371068  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2371069 tccattaattctttaatcataaaggtttattatctttaaa 2371108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Original strand, 41544512 - 41544823
Alignment:
Q  13 ttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttggcttgttta 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||    
T  41544512 ttgatagatccatgcaaatgtactttcgtggacatatatccatgtcacatgtgtcttgcatgacctt-gatcaatgttcttgagattcttggtttgtgta 41544610  T
Q  113 agaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcct 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||                   ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41544611 agaacaaccttctaatctttgcttgaacattc-------------------tgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcct 41544690  T
Q  213 ttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatta 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41544691 ttgatttcttgatttttggtatgatttaaactttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagtaattaatcaaagtccatta 41544790  T
Q  313 attctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41544791 attctttaatcatatttgtttattatctttaaa 41544823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1969037 - 1968704
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  1969037 cctttattgcttgattgatccatgaatttgtactttcctagacatatatccatatcacatgtgccttgcatgacctta-atcaatgttcttgagattctt 1968939  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| |||    
T  1968938 ggcttgtataagaataaccttctgatctctgcttgaacattctgatctctgagcaacattctgatctaactttctgacctctgtgtaagatcatgaattc 1968839  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     ||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1968838 -aaatgtcctttgat-------ttcttggtatgatttaaactttgtttctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatca 1968747  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||| | |||||||||||    ||||||||||||||||    
T  1968746 aagtccatttaatctttaatcattaaagtttattatctttaaa 1968704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21458104 - 21457896
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21458104 tgaacattatgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 21458006  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21458005 gttcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 21457906  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  21457905 tatctttaaa 21457896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18383058 - 18382780
Alignment:
Q  6 ttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttggc 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  18383058 ttattgcttgattgatctatgcaa-tgtattttcctggacatttaaccatgtcacatgtgccttgcatgacctt-gatcaatgttcttgagattcttggc 18382961  T
Q  106 ttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaa 205  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  18382960 ttgtgtaagaacaactttctgatctctgcttgaacattctgatctctgaccaacattttgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgtattc-aa 18382862  T
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18382861 atgtcctttgatttcttgaatcttggtatgatttaaacctgatttctgtcttagtaaaatactcaagagcacaatttaaata 18382780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 345
Target Start/End: Original strand, 1186781 - 1187119
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||| |||| ||  ||||| |||||||||||| |||  ||| ||| || |||||||||  ||| |    
T  1186781 ctttattgtttgattgatacatgataatgtactttactgaacatttattcatgttacatgtgccttgtatgttctt-gat-aatgttcttgagtttctgg 1186878  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttca 203  Q
    |||||  ||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||| || ||| ||||  ||||| |||||| | ||    
T  1186879 gcttgcataagaacaaccttatgaaatctgcttgaacattctgaactatgagcaacattttgaactaactttctgaactcaaagttagttcatgaatcca 1186978  T
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1186979 aa-tgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaaccttgtttctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccaagaaattaatcaa 1187077  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||| ||||  ||||||||   |||||||||||||||||    
T  1187078 agtccatcaatttcttaatcattgaggtttattatctttaaa 1187119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34822725 - 34822382
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| || | ||  ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | | |||  |||  |||     
T  34822725 cctttattgcttgattgatccaagacaatgtactttactgaacctttattcatgtcacatgtgccttgcatgttctt-gataata-ttcacgagcttctg 34822628  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||  ||||||  |||||| ||||| || | | ||||| ||||| |||| |  ||    
T  34822627 ggcttgtataagaacaaccttctgaattatgcttgaacattctgaactatgagcaagtttctgaactaactttctcaactcagagttagttcataaagtc 34822528  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttg---at-tcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatta 298  Q
    ||| |||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  34822527 aaa-tgtcctttgatttcttgtatatatcttggtatgaattaaacattgttcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccaataaatta 34822429  T
Q  299 atcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  34822428 atcaaagtccattaattctttaatcatcaaggtttattatctttaaa 34822382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21458328 - 21458205
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21458328 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 21458230  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  21458229 ggcttgtataagaacaaccttctga 21458205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22960379 - 22960239
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22960379 aatgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaaa 22960280  T
Q  305 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    || |||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  22960279 gttcatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 22960239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21782192 - 21782055
Alignment:
Q  208 gtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtc 307  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21782192 gtcctttgatttcttctatcttggtctgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtc 21782093  T
Q  308 cattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  21782092 catttagtccttaatcattaaagtttattatctttaaa 21782055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 345
Target Start/End: Original strand, 21822023 - 21822161
Alignment:
Q  207 tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagt 306  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||      
T  21822023 tgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccggggaattaatcaaaac 21822122  T
Q  307 ccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||| | || ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  21822123 ccatttagtccttaatcattatagtttattatctttaaa 21822161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Original strand, 18097507 - 18097627
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18097507 aatgttctttgatttcttgtatcttggtattatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagaacacaagttaaatacaaaggaattaatcaaa 18097606  T
Q  305 gtccattaattctttaatcat 325  Q
    ||||||| | || ||||||||    
T  18097607 gtccatttaatccttaatcat 18097627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25867753 - 25867612
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25867753 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaatttaaataccaaggaattaatcaa 25867654  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||| ||| | |||||||||||    ||||||||||||||||    
T  25867653 agtcaatttaatctttaatcattaaagtttattatctttaaa 25867612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 26194013 - 26194154
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26194013 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcatgtcttagtaaaaacagtcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 26194112  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  26194113 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 26194154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37011511 - 37011371
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    ||||||||||| |||  ||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37011511 aatgtcctttgttttaatgtatcttggtattattcaaaccttgttcatgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 37011412  T
Q  305 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  37011411 gtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 37011371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 204 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20311788 - 20311646
Alignment:
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20311788 aaatgtcttttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggatttaatca 20311689  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  20311688 aagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 20311646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 20328953 - 20329094
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20328953 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaagccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaatacgaaggaattaatcaa 20329052  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  20329053 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 20329094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27065574 - 27065433
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||| ||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27065574 aatgtcttttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatgaatcaa 27065475  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  27065474 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 27065433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 204 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20308309 - 20308167
Alignment:
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20308309 aaatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcatgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaatgatttaatca 20308210  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  20308209 aagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 20308167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 1975282 - 1975421
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1975282 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 1975381  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  1975382 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 1975421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12418337 - 12418196
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | || || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12418337 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcatacttttttcctgtcttagttaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagaaattaatcaa 12418238  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  12418237 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 12418196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 1982648 - 1982787
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1982648 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagaacacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 1982747  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  1982748 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 1982787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 1990066 - 1990205
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1990066 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagaacacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 1990165  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  1990166 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 1990205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 18062582 - 18062829
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |   |||||||| | |  ||||||||  ||| ||| || |||||||||| ||| |    
T  18062582 ctttattgcttcattgatccatggagatgtactttcctggacatttgttcatgtcacgtatagcttgcatgttctt-gat-aatgttcttgagattctag 18062679  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttc-----gagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatga 198  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||  |     |||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18062680 gcttgtataagaacaaccttttgaactctgcttgaacattctgatcaactttatgagcaacattctgaactatctttttgaactcagagttagttcatga 18062779  T
Q  199 tttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgtt 249  Q
     ||| || |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  18062780 attc-aagtgtccttttatttcttgtatcttggtttgatttaaactttgtt 18062829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41208000 - 41207882
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41208000 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgtttctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 41207901  T
Q  306 tccattaattctttaatca 324  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  41207900 tccattaatcatttaatca 41207882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4950464 - 4950380
Alignment:
Q  261 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  4950464 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaagaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 4950380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 283 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18381506 - 18381444
Alignment:
Q  283 aaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18381506 aaataccaaggaattaatcaaagtccattaattatttaataataatggtttattatctttaaa 18381444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22956252 - 22956116
Alignment:
Q  7 tattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttggct 106  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||| ||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||    
T  22956252 tattgtttgattgattcatgaaaatgtactttcctagacatttattcatgtcacgtgtgacttgcatgatc-ttgat-aatgttcttgagattcttggct 22956155  T
Q  107 tgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattct 145  Q
    ||| |||||  | |||||||| ||  |||||||||||||    
T  22956154 tgtataagagaacccttctgaactctgcttgaacattct 22956116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 50940651 - 50940539
Alignment:
Q  212 tttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatt 311  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| |  |||||| ||| ||||| || |||||||||||||   ||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  50940651 tttgattacttgcttcttggtttgatttatatattgttcttgtcttagttaatcactcaagagcacgtattaaa-accaagaaactaatcaaagtccatt 50940553  T
Q  312 aattctttaatcat 325  Q
    ||||||||||||||    
T  50940552 aattctttaatcat 50940539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2371669 - 2371559
Alignment:
Q  235 gatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggttta 334  Q
    ||||||||||||  |  ||| ||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||  || |||    
T  2371669 gatttaaaccttcgttatgtcttagttaaacactctagagttcaaggtaaataccaaggaattaatcagagttccttaattccttaatcataaagggtta 2371570  T
Q  335 ttatctttaaa 345  Q
    |||| ||||||    
T  2371569 ttatttttaaa 2371559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 325
Target Start/End: Original strand, 2653041 - 2653154
Alignment:
Q  212 tttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatt 311  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||| | ||| | || ||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  2653041 tttgattacttgattcttggtctgatttgtactttgttcctctcttatttaatcactcaagcacacatattaaataccaagaaattaatcaaacttcatt 2653140  T
Q  312 aattctttaatcat 325  Q
    |||  |||||||||    
T  2653141 aatcttttaatcat 2653154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 48
Target Start/End: Original strand, 18097324 - 18097360
Alignment:
Q  12 cttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacata 48  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18097324 cttgattgatccatgcaactgtactttcctggacata 18097360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 21782390 - 21782346
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacat 47  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21782390 cctttattgcttgattgatccatgtagatgtactttactggacat 21782346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 324
Target Start/End: Original strand, 13404219 - 13404321
Alignment:
Q  220 cttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattcttt 319  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||| || || | |||  ||||| |||||||||||| | |  |||||||| ||||||| ||||    
T  13404219 cttgattcttggtttgatttatattttgttcctgtcttagttaatcattgaaggacacaaattaaataccaagaact--atcaaagttcattaatccttt 13404316  T
Q  320 aatca 324  Q
    |||||    
T  13404317 aatca 13404321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 47
Target Start/End: Original strand, 25823833 - 25823877
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacat 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  25823833 cctttattgcttgattgatccatgcaaacgtatttttatggacat 25823877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49332830 - 49332786
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgtt 249  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||    
T  49332830 aatgtcctttgatttcttgcatcttggtattatttaaactttgtt 49332786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 3 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8070 - 7729
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8070 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgtcttgcatgacctt-gatcaaagttcttgagactctt 7972  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||    
T  7971 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcttgaattc 7872  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7871 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaactttgttcctgtcttattaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 7773  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaat 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7772 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaat 7729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 19744 - 20084
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19744 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtacttttctggacatatacccatgtcatatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 19843  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  19844 ggcttgtttaaaaacaaccttctgatctcagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattctgacctcagtgttagatcatgaattc 19943  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19944 -aaatgtcctttgatttcttgattcttggtat-aattaaaccttgttcctgtcttagtaaatcactcaagagcacaggttaaataccaaggaattaatca 20041  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20042 aagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 20084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 93221 - 93561
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  93221 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctagacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctt-gatcaaagttctttagactctt 93319  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  93320 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcgagcaacattatgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 93419  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  93420 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgttttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcg 93518  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  93519 aagtccattaattctctaatcatattggtttattatctttaaa 93561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 4579 - 4919
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  4579 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacctt-gatcaaagttcttgtgattctt 4677  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  4678 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 4777  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaactttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 4876  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4877 aaatccattaattctctaatcatattggtttattatctttaaa 4919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Original strand, 75086 - 75426
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  75086 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcccatgtcacatgtgccttgcatgatctt-gatcaaagttcttgagactctt 75184  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  75185 ggcttgtataagaacaagcttatgatctgtgcttgaacattctgatcttagagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 75284  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75285 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 75383  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  75384 aagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 75426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15548 - 15208
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15548 cctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatatgccgtgcatgacctt-gatcaaagttcttgagactctt 15450  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  15449 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattttgatcttcaagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattc 15350  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15349 aat-tgtcctttgatttcttgattcttcgtatgatttaaacattgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 15251  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15250 aagtctattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 15208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 791436 - 791096
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  791436 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcccgtatcacatgtgccttgcatgat-tttgatcaaagttcttgagactctt 791338  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| | |||||||||| |||| |||    
T  791337 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgcttgaacattctgatcttcgagcaacattatgatctaactttctgacataagtgttagataatgaattc 791238  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  791237 aaa-tgtcctttgatttcttgattcttagtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 791139  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  791138 aagtccattaattctctaatcatattggtttattatctttaaa 791096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17268541 - 17268201
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  17268541 cctttgttgcttgattgatccatgcaaatgtaccttcctggaaatttatccatatcacatgtgccttgcatgatctt-gatcaatgttcttgagattctt 17268443  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    | ||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||    
T  17268442 gacttgtataagaacaattttctgatctctgcttgaacattctgatctctgagcaacattctgatctaactttctgacatcagtgttagatcatgaattc 17268343  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
     || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  17268342 caa-tgtcctttgatttcttgaatcttagtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagaacaagttaaataccaatgaataaatca 17268244  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17268243 aagtccattaattctttaatcataatggtttattatctttaaa 17268201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7757462 - 7757162
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  7757462 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctagacatatatccatgtctcatgtgccttgcatgacctt-gatcaatgttcttgagattcttg 7757364  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttca 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7757363 gcttgtataagaacaaccttctgatctctaattgaacattatgatctctgagcaacattctgatataactttctgacctcagagttagatcatgaattca 7757264  T
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757263 aa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcatgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 7757165  T
Q  304 agt 306  Q
    |||    
T  7757164 agt 7757162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Original strand, 21988511 - 21988719
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21988511 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 21988609  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21988610 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagaaattaatcaaagtccattaattctttattcatatttgtttat 21988709  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  21988710 tatctttaaa 21988719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Original strand, 21998029 - 21998237
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21998029 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 21998127  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21998128 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagaaattaatcaaagtccattaattctttattcatatttgtttat 21998227  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  21998228 tatctttaaa 21998237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25034823 - 25034656
Alignment:
Q  177 tgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagca 276  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25034823 tgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaacttgttcctgtcttactaaaacactcaagagca 25034725  T
Q  277 caagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25034724 caagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 25034656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20098511 - 20098174
Alignment:
Q  5 tttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttgg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||   | | ||    
T  20098511 tttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatttattcatgtcatgtgtgccttgcatgctctt-gatgat-gttcttgattttatggg 20098414  T
Q  105 cttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaa 204  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||| || ||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  20098413 cttgtataagaacaaccttcttaactctgcttgaatattctgatctctgagcaacattttgaactaactttctgaactcagagttagttcatgaattcaa 20098314  T
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  20098313 a-tgtccattgatttcttgaatcttggtatgatttaaaccttgttcttgttttagttaaacactcaagagcacaagttaaaaactaagaaattaatcaaa 20098215  T
Q  305 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||| |||| |||   ||||||||||| |||||    
T  20098214 gtccattaattccttaaccatcaaggtttattatccttaaa 20098174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 204 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21446930 - 21446789
Alignment:
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21446930 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaactttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21446831  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21446830 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 21446789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 2690648 - 2690976
Alignment:
Q  1 tacctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||  |||||||| |||| ||||||||   ||| || || |||||||||  ||    
T  2690648 tacctctattgcttgattgatccatgcaattgtacttttctggatacttattcatgtcacgtgtgacttgcatgtttttt-at-aatgttcttgagtttc 2690745  T
Q  101 ttggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaa-cattctgatc--ttc---gagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatc 194  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||  |||   |||||||||||||| ||||| || ||| ||||  ||||| ||    
T  2690746 ttggcttgtataagaccaaccttctgaactctgcttgaaacattctgatcaattcactgagcaacattctgaactaactttctgaactcaaagttagttc 2690845  T
Q  195 atgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaagg 293  Q
    || |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  2690846 ataaaatcaaa-tgtcctttgatttcttgaatcttggtataatttaaactttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaga 2690944  T
Q  294 aattaatcaaagtccattaattctttaatcat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2690945 aattaatcaaagtccattaattccttaatcat 2690976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 9325823 - 9325964
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9325823 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 9325922  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9325923 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 9325964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 21203656 - 21203797
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21203656 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21203755  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21203756 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 21203797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 21214072 - 21214213
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21214072 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21214171  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21214172 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 21214213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21333443 - 21333302
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21333443 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaagcactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21333344  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21333343 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaa 21333302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 9325395 - 9325518
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  9325395 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 9325493  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  9325494 ggcttgtataagaacaaccttctga 9325518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 21203173 - 21203296
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21203173 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 21203271  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  21203272 ggcttgtataagaacaaccttctga 21203296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 21213589 - 21213712
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21213589 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 21213687  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  21213688 ggcttgtataagaacaaccttctga 21213712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21333998 - 21333875
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21333998 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 21333900  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  21333899 ggcttgtataagaacaaccttctga 21333875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 21988299 - 21988422
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21988299 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgatc-ttgatcacagttcttgagattctt 21988397  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  21988398 ggcttgtataagaacaaccttctga 21988422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 21997833 - 21997956
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21997833 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgatc-ttgatcacagttcttgagattctt 21997931  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  21997932 ggcttgtataagaacaaccttctga 21997956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5758877 - 5758736
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5758877 aatgtcctttgatttcatgtatcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaagaattaatcaa 5758778  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  5758777 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 5758736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 20531904 - 20532045
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531904 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 20532003  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  20532004 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 20532045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 14894694 - 14894835
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14894694 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 14894793  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  14894794 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 14894835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25506975 - 25506834
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25506975 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 25506876  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  25506875 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 25506834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 32008381 - 32008522
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32008381 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 32008480  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  32008481 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 32008522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 204 - 345
Target Start/End: Original strand, 5867954 - 5868095
Alignment:
Q  204 aaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5867954 aaatgtcctttgatttcttgtaaattggtatgatttaaactttgttccggtcttagttaaacacttaagagcacaagttaaataccaagaaattaatcaa 5868053  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||| ||||| ||   ||||| |||||||||||    
T  5868054 agtccattaattccttaataatcaaggtttgttatctttaaa 5868095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13673656 - 13673515
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673656 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 13673557  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  13673556 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 13673515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 14882328 - 14882469
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14882328 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgtttctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 14882427  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  14882428 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 14882469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 31992013 - 31992154
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31992013 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttccagtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 31992112  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  31992113 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 31992154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3967473 - 3967353
Alignment:
Q  226 tcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatca 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  3967473 tcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatca 3967374  T
Q  325 tattggtttattatctttaaa 345  Q
    |    ||||||||||||||||    
T  3967373 ttaaagtttattatctttaaa 3967353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 26362918 - 26363057
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26362918 atgtcctttgattctttgtatcttggtataaattaaaacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 26363017  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  26363018 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 26363057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 33774704 - 33774845
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33774704 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaactttgttcatgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 33774803  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||   || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  33774804 agtccatttgatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 33774845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Original strand, 12842073 - 12842192
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  12842073 aatgtcctttgattt-ttgtatcttggtatgatttaaactttgttcctgtcttagttaaatactcaagagcacaaattaaataccaacaaattaatcaaa 12842171  T
Q  305 gtccattaattctttaatcat 325  Q
     || |||||||| ||||||||    
T  12842172 ttctattaattccttaatcat 12842192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14436845 - 14436746
Alignment:
Q  226 tcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcat 325  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14436845 tcttggtatgattttacacttgttcttgtcttagttaatcactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcat 14436746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37295453 - 37295334
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    ||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |    
T  37295453 atgtcatttgattttttgtatcttggtatgatttaaaatttgttcatgtcttagttaaacactcaagagtacaaattaaataccaagaaattaatcgagg 37295354  T
Q  306 tccattaattctttaatcat 325  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  37295353 tccattaattccttaatcat 37295334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20707647 - 20707507
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||    
T  20707647 aatgtcctttgatttcttgtatcttggtgcgatttaaactttgtttctgtcttagtaaaaacactcatgag--caagttaaataccaagaaaataatcaa 20707550  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatat-tggtttattatctttaaa 345  Q
    |||  ||||| || |||||||| |   ||||||||||||||||    
T  20707549 agttaattaagtccttaatcatttaaagtttattatctttaaa 20707507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 52533 - 52325
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52533 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 52435  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52434 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttat 52335  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  52334 tatctttaaa 52325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 87534 - 87324
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  87534 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaatgtctcctttgatttcttgattcttggtat 87435  T
Q  235 gatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggttta 334  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87434 gattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggttta 87335  T
Q  335 ttatctttaaa 345  Q
    |||||||||||    
T  87334 ttatctttaaa 87324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 136 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12942 - 12734
Alignment:
Q  136 tgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatg 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942 tgaacattctgatcttcgagtaacattctgatctaactttctgacctcagtgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatg 12844  T
Q  236 atttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 335  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12843 attcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaatttaaataccaatgatttaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttat 12744  T
Q  336 tatctttaaa 345  Q
    ||||||||||    
T  12743 tatctttaaa 12734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 65384 - 65048
Alignment:
Q  5 tttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttgg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||| ||| ||||| || |||||||  ||||  ||| ||| || |||| ||||  ||| ||    
T  65384 tttattgcttgattgttccatgtcaatgtactttattggacatttactcatgttacgtgtgcctctcatgttctt-gat-aatgttcatgagcttctggg 65287  T
Q  105 cttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaa 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| | ||| |||||| ||||| ||||| |||| ||  | |    
T  65286 cttgtataagaacaaccttctgaactctgcttgaacattctgaactatgagcaactttctgaaccaactttttgaactcagagttagttcat-ataacca 65188  T
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 304  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  65187 aatgtc-tttgatttcttgtatcttggtatgatttaaaccttgttcttgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaatatcaagaaattaatcaaa 65089  T
Q  305 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  65088 gtctattaattccttaatcatcaaggtttattatctttaaa 65048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 345
Target Start/End: Original strand, 29130 - 29472
Alignment:
Q  5 tttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttgg 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||   |||||||| ||| ||||||||  ||| ||| || ||| |||||| |||| |    
T  29130 tttattgcttgattga-ccatgcaaatgtacttttatggaaatttatttatgtcacaagtgacttgcatgttctt-gat-aatgttattgagattctttg 29226  T
Q  105 cttgtttaagaacaaccttctgatct-tagcttgaacattctgatcttc-----gagcaacattctgatctaacattt-tgacctcagtgttagatcatg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |     ||||||||||| || ||||  ||| |||||| || ||||| ||||     
T  29227 cttgtttaagaacaaccttctgatctctag-ttgaacattctgatcaactcattgagcaacattcggaactaatttttctgaccttagagttagttcata 29325  T
Q  198 atttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatt 297  Q
    |  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29326 aaatcaaa-tgtcctttgattacttgaatcttggtataatttaaaccttgttcatgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagaaatt 29424  T
Q  298 aatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  29425 aatcaaagtctattaattccttaatcattaaggtttattatctttaaa 29472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold1705
Description:

Target: scaffold1705; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 549 - 423
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  549 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgttacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagttcttgagattctt 451  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatct 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  450 ggcttgtataagaacaaccttctgatct 423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 137 - 16
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaagcactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 38  T
Q  304 agtccattaattctttaatcat 325  Q
    |||||||| | || ||||||||    
T  37 agtccatttaatccttaatcat 16  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 8646 - 8787
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8646 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgatcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagggattaatcaa 8745  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8746 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 8787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 8211 - 8334
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  8211 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 8309  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  8310 ggcttgtataagaataaccttctga 8334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 226 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22263 - 22143
Alignment:
Q  226 tcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatca 324  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22263 tcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatca 22164  T
Q  325 tattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22163 tattggtttattatctttaaa 22143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13520 - 13177
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttg 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || || ||  || ||||  |||| ||||||||  ||| ||| || |||||||||  ||| |    
T  13520 ctttattgcttgattgatcgatgcaaatgtactttacctgaaatttattcaagtcatgtgtgtcttgcatgttctt-gat-aatgttcttgagtttctag 13423  T
Q  104 gcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcg-----agcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatga 198  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||   |||||||||| |||||  |      ||||||||||| | ||||| || ||| ||||| ||||| ||||||    
T  13422 gcttgtataaggacaaccttctgagctctacttgaacattttgatcaactcccttagcaacattctaaactaactttctgaactcagagttagttcatga 13323  T
Q  199 tttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatta 298  Q
     |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13322 attcaaa-tgtcctttgatttcttgtatcttggaatgatttaaacatttttcatgtcttagtaaaacattcaagagcacaagttaaataccaagaaatta 13224  T
Q  299 atcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||||||||    
T  13223 atcaaagtccattgattccttaatcatcaagttttattatctttaaa 13177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 240 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 132457 - 132352
Alignment:
Q  240 aaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  132457 aaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatc 132358  T
Q  340 tttaaa 345  Q
    ||||||    
T  132357 tttaaa 132352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 6)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 234357 - 234480
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  234357 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcacagttcttgagattctt 234455  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctga 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  234456 ggcttgtataagaacaaccttctga 234480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 234978 - 235119
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  234978 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 235077  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  235078 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 235119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 146202 - 146081
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146202 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaacgttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 146103  T
Q  304 agtccattaattctttaatcat 325  Q
    |||||||| | || ||||||||    
T  146102 agtccatttaatccttaatcat 146081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 167688 - 167477
Alignment:
Q  133 gcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggt 232  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||  |||| || ||| ||||| ||||| |||| | | |||| |||||||||||||||||  |||  ||    
T  167688 gcttgaacattctgaactatgagcaacattttgaattaactttctgaactcagagttagttcataaatccaaa-tgtcctttgatttcttgtatctatgt 167590  T
Q  233 atgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtt 332  Q
    |||||||||   |||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||     
T  167589 atgatttaacatttgttcctgtcttagataaacacacaagagcacaagttaaataccaagaaattaatccaagtccattaattccttaatcatcaaggtc 167490  T
Q  333 tattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||    
T  167489 tattatctttaaa 167477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 115094 - 115235
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  115094 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgatttaatccttgttcatgtcttagtaaaaacactcaagaacacgagttaaataccaaggaattaatcaa 115193  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  115194 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 115235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 154087 - 154228
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  154087 aatgtcctttgttttcatgcatcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactaaagcgaacatgttaaataccaaggaattaattaa 154186  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  154187 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 154228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 240 - 345
Target Start/End: Original strand, 22915 - 23020
Alignment:
Q  240 aaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatc 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22915 aaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaatgtccattaattctataatcatattgttttattatc 23014  T
Q  340 tttaaa 345  Q
    ||||||    
T  23015 tttaaa 23020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 92
Target Start/End: Original strand, 21524 - 21612
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttct 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21524 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctagacatatatccatgtcacatgtgccttgcacgacc-ttgatcaaagttct 21612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 239
Target Start/End: Original strand, 21612 - 21673
Alignment:
Q  177 tgacctcagtgttagatcatgatttcaaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattt 239  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21612 tgacctctatgttagatcatgaattcaaa-tgtcctttgatttcttgattcttggtatgattt 21673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10786 - 10648
Alignment:
Q  207 tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagt 306  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||      
T  10786 tgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccggggaattaatcaaaac 10687  T
Q  307 ccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||| | || ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  10686 ccatttagtccttaatcattatagtttattatctttaaa 10648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 345
Target Start/End: Original strand, 199064 - 199390
Alignment:
Q  7 tattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttggct 106  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||| |||| ||||||||| ||| ||| || |||||||||| ||||||||    
T  199064 tattgtttgattgattcatgcaaatgtactttcctggatacttattcatgtcacgtgtgacttgcatgatctt-gat-aatgttcttgagattcttggct 199161  T
Q  107 tgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttcaaaa 206  Q
    | | |||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||       |||  ||  | ||||| |||||| || |  ||||| |||||| | ||||     
T  199162 tatataagagaaaccttctgaactctgcttgaacattctgatc-------aac--tcaaa-ctaactttttgaacttaaagttagttcatgaatgcaaa- 199250  T
Q  207 tgtcctttgatttcttgattctt-ggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  199251 tgtcctttgatttcttgtatctttggtaatattttaaccttgttcctgtcttagttaaacactcaagagaacaagttaaataccaagacattaatcaaag 199350  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||    
T  199351 tccattaatttctttatcattaaggtttattatctttaaa 199390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 112362 - 112503
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112362 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 112461  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  112462 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 112503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 345
Target Start/End: Original strand, 103163 - 103247
Alignment:
Q  261 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  103163 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 103247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 1437 - 1579
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttct-tgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1437 aatgtcctttgatttttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 1536  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  1537 aagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 1579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Original strand, 33438 - 33559
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33438 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 33537  T
Q  304 agtccattaattctttaatcat 325  Q
    |||||||| | || ||||||||    
T  33538 agtccatttaatccttaatcat 33559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 67106 - 67247
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67106 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcatgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 67205  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  67206 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 67247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 58863 - 59004
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  58863 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgtttctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaatgaattaatcaa 58962  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  58963 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 59004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 24372 - 24513
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    ||||||||||| |||  ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24372 aatgtcctttgcttttatgcatcttggtatgattaaaaccttgttcttgtcttagtaaaaacactcaagaccacaagttaaataccaaggaattaatcaa 24471  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  24472 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 24513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 57745 - 57886
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    ||||||||||| |||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  57745 aatgtcctttgcttttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctatcttagtaaaaacacttaagagcacaagttaaataccaatgaattaatcaa 57844  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  57845 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 57886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 54121 - 53980
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  54121 aatgtcctttgatttcttgtatcttggtgagatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaatagtacaagttaaataccaagaaaataatcaa 54022  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  54021 agtccattaagtccttaatcatttaagtttattatctttaaa 53980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 58073 - 57932
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  58073 aatgtcctttgatttcttgtatcttggtgagatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaatagtacaagttaaataccaagaaaataatcaa 57974  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  57973 agtccattaagtccttaatcatttaagtttattatctttaaa 57932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0590 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0590
Description:

Target: scaffold0590; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9771 - 9630
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9771 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgtttctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaatgaattaatcaa 9672  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  9671 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 9630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Original strand, 12455 - 12576
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  |   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12455 aatgtcctttgattttatccatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtcaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 12554  T
Q  304 agtccattaattctttaatcat 325  Q
    |||||||| | || ||||||||    
T  12555 agtccatttaatccttaatcat 12576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 345
Target Start/End: Original strand, 273 - 393
Alignment:
Q  226 tcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatca 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  273 tcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaaattaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatca 372  T
Q  325 tattggtttattatctttaaa 345  Q
    |    ||||||||||||||||    
T  373 ttaaagtttattatctttaaa 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Original strand, 267494 - 267613
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  267494 atgtcttttgatttcctgtttcttggtatgagttaaactttgtttctgtcttagttaaacactcaagaggacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 267593  T
Q  306 tccattaattctttaatcat 325  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  267594 tccattaattccttaatcat 267613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22838 - 22754
Alignment:
Q  228 ttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatt 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22838 ttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatt 22754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0764 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0764
Description:

Target: scaffold0764; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 1377 - 1516
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1377 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 1476  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  1477 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 1516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5232 - 5093
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5232 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 5133  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  5132 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 5093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19389 - 19250
Alignment:
Q  206 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaag 305  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19389 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 19290  T
Q  306 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  19289 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 19250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1411 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1411
Description:

Target: scaffold1411; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 207 - 349
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cac-tcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 302  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  207 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcttgtcttagtaaaaacacctcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 306  T
Q  303 aagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    || |||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  307 aaatccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Original strand, 56192 - 56262
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcat 73  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56192 cctttattgcttaattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcat 56262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18235 - 18094
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18235 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaacattgtttctgtcttagtaaaaacactaaagagcacaagttaaataccaatgaattaatcaa 18136  T
Q  304 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  18135 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 18094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 1196 - 1431
Alignment:
Q  3 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||  | ||||| || |||||||||| | |     
T  1196 cctttattgcttgattgatccattccaatgtactttgctggacatttattcatgtcacatgtaccttgcatgttc-ttgat-aatgttcttgagattatg 1293  T
Q  103 ggcttgtttaagaacaaccttctgatcttagcttgaacattctgatcttcgagcaacattctgatctaacattttgacctcagtgttagatcatgatttc 202  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||       |||| |||||| | |||||||||| ||||  ||| | |||||| |||    
T  1294 ggcttctataagaacaaccttctgaactctgcttgaacattttaat-------caactttctgagc-aacattttgaactcaaagttggttcatgaattc 1385  T
Q  203 aaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgtt 249  Q
     |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  1386 -aaatgtccattgatttcttgtatcttggtatgatttaaactttgtt 1431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14012 - 13893
Alignment:
Q  226 tcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcat 325  Q
    ||||||||| | || || ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14012 tcttggtataaattgaaacttgttcctgtcttagttgaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaaatccattaattccttaatcat 13913  T
Q  326 attggtttattatctttaaa 345  Q
       ||||| |||||||||||    
T  13912 caaggtttgttatctttaaa 13893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Original strand, 41171 - 41309
Alignment:
Q  208 gtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagta-aaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagt 306  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||| |||||| |||||| | | ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41171 gtcctttgatttcttgcatctacgtatgaattaaactttgttcatatcttaatttaaacactcaaaagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagt 41270  T
Q  307 ccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||    
T  41271 ccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaa 41309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 270 - 345
Target Start/End: Original strand, 396616 - 396691
Alignment:
Q  270 aagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    ||||||||||||||||    
T  396616 aagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaa 396691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 15080 - 15011
Alignment:
Q  4 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcat 73  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||| | || |||||||    
T  15080 ctttatttcttgattgatccatgcagatgtactttattggacatttactcatgtcacgtatgtcttgcat 15011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 273
Target Start/End: Original strand, 28954 - 29006
Alignment:
Q  221 ttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtattagtaaaacactcaaga 273  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||    
T  28954 ttgattcttgatatgatttatactttgttcctgtattagttaatcactcaaga 29006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1468 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1468
Description:

Target: scaffold1468; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 811 - 767
Alignment:
Q  205 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgtt 249  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||    
T  811 aatgtcctttgatttcttgcatcttggtattatttaaactttgtt 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University