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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF20228_low_5 (Length: 524)
Name: NF20228_low_5
Description: NF20228
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF20228_low_5 |
 | |
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Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 489; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 513
Target Start/End: Original strand, 36166610 - 36167106
Alignment:
| Q |
17 |
attataccacatcacacagcataattgctgagattatttaaagtaagtgaagctgttaatgaattaataaattattatacatgattagtatagtataagt |
116 |
Q |
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| T |
36166610 |
attataccacatcacacagcataattgcagagattatttaaagtaagtgaagctgttaatgaattaataaattattatacatgattagtatagtataagt |
36166709 |
T |
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| Q |
117 |
gatgtgatgaaattgagtgatatcaatattatatatgttgctgacctgtacgcgttttggcgtccatttgtataatatcatgtgaccaaatgatgccata |
216 |
Q |
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| T |
36166710 |
gatgtgatgaaattgagtgatatcaatattatatatgttgctgacctgtacgcgttttggtgtccatttgtataatatcatgtgaccaaatgatgccata |
36166809 |
T |
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| Q |
217 |
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316 |
Q |
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| T |
36166810 |
ataaaaccaaaaacagaaacaattttagggtccaattattcagaaaattgtattgctcaattcagaaaagtttctcgtgacatttcaaattatttattaa |
36166909 |
T |
|
| Q |
317 |
tataaaaattgaatttgaattgtttgtctgtatatatgaaaatgaaaacacattttacagacccctttcaattttattatatatccgaaggataaaatga |
416 |
Q |
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| T |
36166910 |
tataaaaattgaatttgaattgtttgtctgtatatatgaaaatgaaaacacattttacagacccctttcaattttattatatatccgaaggataaaatga |
36167009 |
T |
|
| Q |
417 |
aatatcgtccattatgcctgccagtatttatccatttttattaatcacatgtgtatgttctttcgtatgattttatctgttacctatttactttctt |
513 |
Q |
| |
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| T |
36167010 |
aatatcgtccattatgcctgccagtatttatccatttttattaatcacatgtgtatgttctttcgtatgattttatctgttacctatttactttctt |
36167106 |
T |
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